Variabilités de la taille de portée des ovins

Ce travail de recherche a ete mene dans l’equipe MODGEN du departement GenPhySE, 1388 UMR de l’INRA. Il avait pour perspectives de modeliser les variabilites de la taille de portee des ovins pour une meilleure evaluation genetique et de proposer des modeles d’analyse adoptes a ce type de caractere.Les objectifs de l’etude etaient d'identifier, et d'analyser les facteurs environnementaux et genetiques des variabilites des tailles de portee des brebis et de proposer une methode adaptee pour canaliser les caracteres discrets qui prenne en compte conjointement des objectifs sur la moyenne et sur la variabilite du caractere. La these s’appuyait sur des donnees issues de la chaine nationale de controle de performances en relation avec des organismes de selection ovin qui sont particulierement interesses par les resultats de ces recherches (CORAM). Choix des races. Nous avons considere trois races dont les frequences de la taille de portee sont plus ou moins elevees. La race Romane connue par sa forte prolificite ainsi des effectifs controles importants a permis des analyses precises. Les deux autres races choisies sont la race Suffolk et la race Rouge de l’Ouest qui ont servi a tester les modeles sur des populations comportant de moins en moins de portees multiples. La taille de portee des ovins consideree comme une variable continue. Au cours de l’etude, nous avons identifie et hierarchise les facteurs de variation environnementaux du niveau de prolificite et de de sa variance pour trois races ovines (Suffolk, Rouge de l’Ouest et Romane). Si les facteurs de variation environnementaux du niveau de prolificite etaient deja bien connus, peu de donnees concernaient les facteurs de variation environnementaux de la variance. Nous avons egalement estime les parametres genetiques du niveau de prolificite et de sa variance, ils sont coherents entre eux. Les heritabilites estimees sur la moyenne sont faibles, en coherences entre les trois races et avec des etudes anterieures. La non homogeneite des correlations estimees par le modele a deux etapes peut s’expliquer par la relation structurelle entre la moyenne et la variance sur l’echelle observee qui n'est pas prise en compte dans ce type d'analyse. A l'echelle d'une race, cette relation depend de l’ecart specifique entre les seuils; elle est differente de la relation moyenne – variance observee pour l’ensemble des races et qui est calculee sur des donnees brutes. La taille de portee des ovins consideree comme une variable discrete Nous avons montre l’existence d’une variabilite d’origine genetique dans les trois races etudiees et nous avons montre que le modele a seuils homothetique [HTM] s’ajustait mieux aux donnees et qu'il permettait de calculer conjointement l’effet genetique sur la moyenne et sur la variance. Nous avons aussi montre les limites de ce modele et nous avons propose une solution afin de donner un cadre plus general a son utilisation et l’utiliser dans les evaluations genetiques. Nous avons egalement identifie un critere de selection pertinent qui permet de selectionner les individus de meme moyenne ayant des variances differentes. Nous avons propose le modele a seuils independants [ITM] ou le modele multi caracteres avec contrainte, ce modele considere que chaque realisation est un caractere. Nous avons montre la faisabilite de ce modele sur les trois races. Ceci nous a permis de mettre en evidence les problemes lies a la convergence du programme utilise, et nous avons propose d’implementer ce modele en modifiant le programme TM.