Molecular phylogeny of the Platyhelminthes

The phylum Platyhelminthes has traditionally been considered the most basal bilaterian taxon. The main dif- ficulty with this placement is the lack of convincing synapomorphies for all Platyhelminthes, which suggest that they are polyphyletic. Recent molecular findings based on 18S rDNA sequence data and number and type of Hox genes strongly suggest that the majority of Platyhelminthes are members of the lophotrochozoan protostomes, whereas the Acoelomorpha (Acoela + Nemertodermatida) fall outside of the Platyhelminthes as the most basal bilaterian taxon. Here we review phylum-wide analyses based on complete ribosomal and other nuclear genes addressed to answer the main issues facing systematics and phylogeny of Platyhelminthes. We present and discuss (i) new corroborative evi- dence for the polyphyly of the Platyhelminthes and the basal position of Acoelomorpha; (ii) a new consensus internal tree of the phylum; (iii) the nature of the sister group to the Neodermata and the hypotheses on the origin of parasit- ism; and (iv) the internal phylogeny of some rhabditophoran orders. Some methodological caveats are also introduced. The need to erect a new phylum, the Acoelomorpha, separate from the Platyhelminthes (now Catenulida + Rhabditophora) and based on present and new morphological and molecular characters is highlighted, and a proposal made. Resume : Le phylum des plathelminthes est traditionellement considere comme le taxon le plus basal des organismes bilateraux. Le probleme principal avec ce positionnement est l'absence de synapomorphies convaincantes pour tous les plathelminthes, ce qui laisse croire que le groupe est polyphyletique. Des observations moleculaires recentes basees sur des sequencages de l'ADNr 18S et sur le nombre et les types de genes Hox fournissent de forts indices que la plupart des plathelminthes font partie des protostomiens lophotrochozoaires, tandis que les acoelomorphes (acoeles + nemerto- dermatides) sont exclus des plathelminthes et forment le taxon le plus basal des organismes bilateraux. Nous faisons la synthese des analyses faites a l'echelle du phylum et basees sur l'etude des genes complets des ribosomes et d'autres genes nucleaires afin de repondre aux principales questions qui concernent la systematique et la phylogenie des plathel- minthes. On trouvera donc ici une presentation et une discussion de (i) nouveaux indices qui corroborent la polyphylie des plathelminthes et la position basale des acoelomorphes; (ii) un nouvel arbre consensus interne du phylum; (iii) l'identite du groupe soeur des neodermates et les hypotheses sur l'origine du parasitisme et ( iv) la phylogenie in- terne de quelques ordres de rhabditophores. Un certain nombre de mises en garde methodologiques sont aussi formu- lees. Nous mettons en evidence la necessite de creer un nouveau phylum, les acoelomorphes, distinct des plathelminthes, qui comprend maintenant les catenulides et les rhabditophores, d'apres des caracteristiques morphologi - ques et moleculaires, actuelles et nouvelles. Nous en faisons la proposition. (Traduit par la Redaction) Baguna and Riutort 193 Before cladism: An alternative phylogenetic hypothesis for the phylum Platyhelminthes