Evaluation de la capacité du Tomato yellow leaf curl virus à maintenir des ADNs satellites

Les virus du genre Begomovirus (famille Geminiviridae) sont frequemment detectes en association avec des ADN satellites appelees alphasatellite et betasatellite qui font la moitie de la taille du genome viral. L’alphasatellite est autonome pour sa replication et depend du virus pour son mouvement et son encapsidation tandis que le betasatellite est dependant de ces fonctions virales. L’alphasatellite a rarement ete montre comme ayant un impact sur le virus assistant, contrairement au betasatellite qui augmente la virulence de son virus assistant. En dehors des begomovirus tels que le Cotton leaf curl virus (CLCuV) qui ont besoin d’un betasatellite pour initier une infection symptomatique dans leur hote naturel, la plupart des begomovirus peuvent causer des symptomes, meme sans les satellites avec lesquels ils sont parfois detectes. Le Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), un des virus les plus dommageables dans le monde a rarement ete detecte associe a des ADN satellites. Les souches mediterraneennes qui sont aussi les plus invasives, n’ont jamais ete detectees avec des ADN satellites, bien qu’elles soient capables en conditions artificielles de les assister avec pour consequence une considerable augmentation de la virulence en cas de co-inoculation avec un betasatellite. Le risque potentiel d’association de satellites avec le TYLCV-Mld a ete evalue en testant divers facteurs potentiellement impliques dans le maintien de l’association TYLCV-satellite: (i) l'accumulation relative intra-plante du TYLCV et des satellites, (ii) la frequence de co-infection au niveau cellulaire du TYLCV et des satellites, et (iii) l'efficacite de transmission des satellites par le vecteur Bemisia tabaci. Trois satellites precedemment isoles sur coton au Burkina Faso ont ete montres comme pouvant etre assistes par le TYLCV dans des plantes de tomate: Cotton leaf curl Gezira betasatellite (CLCuGB), Cotton leaf curl Gezira alphasatellite (CLCuGA) et Okra leaf curl Burkina Faso alphasatellite (OLCBFA). La quantification par PCR quantitative des ADN du TYLCV et des trois satellites entre 11 et 150 jours apres inoculation (dpi) revele qu’en general, les satellites ont une accumulation superieure a celle du virus, et que, contrairement aux alphasatellites qui n’ont aucun impact, le betasatellite affecte l’accumulation du TYLCV-Mld. Bien que le rapport des quantites de virus/satellites varie au cours du temps, les satellites sont maintenus avec le TYLCV-Mld au temps tardif de 150 dpi et sont transmis par B. tabaci a 32 et 150 dpi. Le TYLCV-IL interagit differemment avec le CLCuGB car son accumulation n’est pas affectee dans les plantes coinfectees.L’estimation par la technique FISH a 18 et 32 dpi de la frequence d’association des molecules au niveau cellulaire montre que plus de la moitie des cellules infectees sont coinfectees par le TYLCV et un satellite. Ce resultat est coherent avec la frequence observee d’ADN satellite dans les plantes. Cependant, on observe de maniere inattendue un nombre important de cellules ne semblant contenir que le betasatellite, ce qui pose des questions sur le fonctionnement des associations virus/satellites. Comme la multiplicite d'infection (MOI) des begomovirus et des satellites est attendue pour etre un facteur determinant de l’efficacite de la co-infection cellulaire, deux variants equi-competitifs de TYLCV ont ete prepares afin de determiner ce parametre. Enfin, des amorces PCR permettant la detection generique de betasatellites ont ete dessinees pour etre utilisees dans le diagnostic par l'Agence francaise pour l'alimentation, l'environnement et la sante et securite au travail (ANSES). Outre les consequences agronomiques d’un maintien possible des satellites avec le TYLCV, les resultats de cette etude donnent un apercu novateur sur les interactions entre les begomovirus et les satellites, au niveau de la plante, au niveau cellulaire et moleculaire.