Epidémiologie moléculaire du rotavirus du groupe A associé aux gastroentérites chez les enfants de moins de 5 ans dans la ville de Yaoundé (Cameroun)

Le rotavirus est la premiere cause de gastroenterites grave chez les enfants de moins de 5 ans. La gravite et la mortalite de la maladie sont majorees dans les pays a revenus faibles d’Asie du sud et d’Afrique subsaharienne. Au Cameroun, la forte prevalence des rotaviroses, associees aux specificites genotypiques locales du virus, soulignent l’importance de disposer de donnees epidemiologiques sur le virus. Cette etude visait a contribuer a une meilleure connaissance des principales souches de rotavirus responsables des gastroenterites chez les enfants de moins de 5 ans dans la ville de Yaounde. Il s’agit d’une etude descriptive transversale d’une duree de 4 mois, dans 8 formations sanitaires de la ville de Yaounde. Les echantillons de selles d’enfants de moins de 5 ans, hospitalises pour gastroenterite ont ete preleves. La recherche du rotavirus s’est faite avec le kit ELISA Oxoid ProSpec TTM, et la determination des genotypes du virus s’est faite par RT - PCR. Cent trente echantillons de selles d’enfants souffrant de gastroenterite ont ete collectes. 66,1% de ces echantillons provenaient des hopitaux FCB/CME, du CHE et de HDE. Le rotavirus a ete isole chez 30% des enfants, dont 40% avait entre 6 et 11 mois. Le CHE (6,9%) et l’HGY (0%) avaient respectivement la prevalence la plus elevee et la plus basse de la ville. Un nombre eleve de combinaisons genotypiques a ete isole, parmi lesquels predominaient G1P[8] (31%) suivit de G3P[6] (28%) et de G4P[6] (13 %). Les genotypes mixtes G1P[6][8], G2P[6][8], et G1G3P[8] representaient 22% des isolats. Un type G (3%) est reste indetermine durant cette etude. © 2015 International Formulae Group. All rights reserved. Mots cles: Epidemiologie moleculaire, rotavirus, genotypes, gastroenterite, enfants, Yaounde English Title: Molecular epidemiology of group A rotavirus associated to gastroenteritis in children less than 5 years in Yaounde (Cameroon) English Abstract Rotavirus is the leading cause of severe gastroenteritis in children less than 5 years. Severity and mortality of this disease are majored in low-income countries of South - Asia and sub - Saharan Africa. In Cameroon, the high prevalence of rotaviruses associated to local genotypic specificities of virus enhances the importance of epidemiological database on the virus. This study aimed at contributing to a better knowledge of the main rotavirus strains responsible for gastroenteritis in children less than 5 years in Yaounde. We carried out a descriptive and cross sectional study during 4 months, in 8 health centers in Yaounde. Stool specimens were collected from children less than 5 years old, hospitalized for gastroenteritis. Rotavirus was detected with ELISA kit Oxoid ProSpecTTM, and genotypes determined by RT - PCR. One hundred and twenty seven stool specimens were collected during the study. FCB/CME, CHE, HDE provided 66.1% of specimens collected. Rotavirus was isolated in 30% of children, and 40% of these children were between 6 to 11 months old. The CHE (6. 9%) and the HGY (0%) had respectively the highest and the lowest prevalence of the town. A large number of genotype has been isolated and G1P[8] (31%) were predominant, followed by G3P[6] (28%) and G4P[6] (13%). Mixt genotypes G1P[6][8], G2P[6][8], and G1G3P[8] represented 22% of isolates. One G - type remained untypable. © 2015 International Formulae Group. All rights reserved. Keywords: Molecular epidemiology, rotavirus, genotypes, gastroenteritis, children, Yaounde