Virus chikungunya et traitement antiviral

Les Alphavirus sont des virus a ARN enveloppes, d’un diametre de 70 nm, a structure icosaedrique a symetrie de type T=4 (Choi et al. 1991; Cheng et al. 1995; Garoff et al. 2004). Ces virus, dont la repartition est mondiale, sont capables d’infecter une grande varietes d’animaux vertebres (mammiferes, oiseaux, poissons). Ces virus sont des arbovirus, c’est-a_dire des virus transmis par des arthropodes. Dans le cas des Alphavirus, la vectorisation est faite par des moustiques appartenant a plusieurs especes. A ce jour, 29 especes d’Alphavirus ont ete identifies, dont au moins 6 sont pathogenes pour l’Homme. Chez l’Homme, certains Alphavirus sont responsables d'encephalites, d'arthrites, de fievres, d'eruptions cutanees et peuvent etre fatals (Thiruvengadam et al. 1965; Pialoux et al. 2006). Le premier Alphavirus isole fut l'Encephalite Equine de l'Ouest (WEEV), en 1930 (Meyer et al. 1931). Les virus de l'encephalite de l'Est (VEEV) et le virus de l'Encephalite Equine du Venezuela (VEEV) furent isoles respectivement en 1933 et 1938 (Gibbs EP. 1976 ; Beck et al. 1938 ; Kubes et al. 1939). Le Virus Sindbis isole en Egypte en 1952 (Taylor et al. 1955), fut le premier Alphavirus responsables d’arthrites a etre isole. La mise en evidence de l'existence du CHIKV se fera 1952 en Tanzanie (Robinson 1955) (Lumsden 1955). Suivent alors les decouvertes de l'ensemble des autres Alphavirus. Le South Elephent Seal virus (SESV), identifie en 2000 sur l'ile australienne de Macquarie, est a l’heure actuelle le dernier Alphavirus decouvert. La phylogenetique des souches de Chikungunya permet d’identifier des clades differents pour les souches d’Afrique de l’Est, de l’Ouest ou d’Asie, et l’analyse phylogenetique est tres proche du O’Nyong-Nyong (Powers et al. 2000), Le sequencage de differents isolats de l’epidemie de 2005, a permis de mettre en evidence chez certains d’entre eux une mutation dans la glycoproteine de l'enveloppe plus precisement dans E1, (Schuffenecker et al. 2006). Cette mutation entraine la substitution d'une arginine en position 226 au lieu de la valine (A226V), est un element cle pour determiner le choix d'un nouveau vecteur pour la transmission ou Aedes albopictus (qui le transmet sur l'ile de La Reunion) par rapport au vecteur Aedes aegypti (Tsetsarkin et al. 2007). Cette mutation a ensuite ete egalement trouvee en Inde en 2007. (Arankalle et al. 2007; Kumar et al. 2008; Santhosh et al. 2008). Le tableau clinique classique debute souvent par l’apparition brutale d’une forte fievre (40°C) pendant 3 / 10 jours accompagnee de frissons intermittents (Deller et al.1967). La fievre est, dans certains cas, bi-phasique, c’est-a-dire qu’elle diminue durant un ou deux jours, avant de remonter brutalement. Elle est generalement suivie d’erythemes, de courbatures douloureuses ou myalgies et douleurs musculaires (Ozden et al. 2007) en particulier celles impliquant la douleur au niveau des extremites (poignes, phalanges et chevilles) (Robinson 1955; Jadhav et al. 1965; Thiruvengadam et al. 1965). Egalement migraine, eruptions cutanees maculo-papuleuses parfois prurigineuses. L'eruption touchant le thorax et le visage les mains et les pieds, chez les enfants ont ete observees des eruptions de type bulleux accompagne par un detachement cutane (Talarmin et al. 2007). L'evolution de la maladie regresse progressivement. Il n’y a aucun traitement antiviral efficace contre le CHIKV. Le traitement est donc essentiellement symptomatique et compose d'antalgiques non salicyles, de paracetamol et d'anti-inflammatoires non steroidiens. Ce travail se compose de deux parties : 1 partie sur l’etude phylogenetique du CHIKV et 1 partie sur l'etude des molecules antivirales. [. ]