Molecular study of the quasispecies evolution of a typical pigeon paramyxovirus type 1 after serial passages in pigeons by contact

The quasispecies nature of a typical pigeon paramyxovirus type 1 (pPMV-1) was, for the first time, studied under conditions close to the natural infectious environment. The virus was serially passaged in pigeons by successive contacts. Viral heterogeneity was analysed in the kidneys and brain of five pigeons from the last contact, by reverse transcriptase-polymerase chain reactions performed on RNA directly extracted from the organ and targeting the P and HN genes of the virus. The viral diversity following in vivo passage was found to be different from that in the inoculum, but demonstrated the reality of the quasispecies concept for pPMV-1 strains. Moreover, some aberrant genomic RNAs comprising insertions in the P gene editing site or deletions in the HN gene were also detected, with possible consequences for the pathogenicity and infectivity of the virus. La nature en quasi-espèces d'un paramyxovirus de type 1-variant pigeon typique (pPMV-1) a été pour la première fois étudiée dans des conditions proches de l'infection naturelle. Le virus a subi plusieurs passages chez le pigeon par contacts successifs. L'hétérogénéité virale a été analysée dans les reins et le cerveau de 5 pigeons prélevés lors du dernier contact, par rétro-transcription suivie d'amplification génique (RT-PCR) directement à partir des ARNs extraits de ces organes et en ciblant les gènes viraux P et HN. Bien que la diversité virale consécutive aux passages in vivo se soit révélée différente de celle présente dans l'inoculum, la réalité du concept de quasi-espèces pour les souches pPMV-1 est démontrée. De plus, ont été détectés des ARNs génomiques aberrants présentant des insertions au niveau du site d’édition du gène P ou des délétions dans le gène HN, avec des conséquences possibles sur la pathogénicité et l'infectivité virales. Zum erstenmal wurde die Natur der Quasispezies eines typischen Paramyxovirus Typ 1 (pPMV-1) unter Bedingungen, die der natürlichen Infektionsumgebung sehr nahe kamen, untersucht. Das Virus wurde durch aufeinanderfolgenden Kontakt in Tauben serienpassagiert. Die Virusheterogenität wurde in den Nieren und Gehirnen von fünf Tauben aus dem letzten Kontakt analysiert. Dabei richtete sich die RT-PCR mit der direkt aus den Organen extrahierten RNS auf die P- und HN-Gene des Virus. Die Virusvielfalt nach den in vivo-Passagen unterschied sich von der des Inokulums, aber spiegelte die Realität des Quasispezieskonzepts für pPMV-1-Stämme wieder. Darüber hinaus wurden einige abweichende Genom-RNS, die Insertionen an der Bearbeitungsstelle des P-Gens oder Deletionen im HN-Gen beinhalteten, entdeckt, was Konsequenzen für die Pathogenität und Infektiosität des Virus haben kann. La naturaleza de cuasiespecies de un típico paramixovirus tipo 1 de la palomas (pPMV-1) fue estudiada por primera vez bajo condiciones similares a las del entorno donde se da la infección natural. El virus fue pasado seriadamente en palomas por contacto. La heterogeneidad viral fue analizada en los riñones y cerebro de cinco palomas del último contacto, mediante RT-PCRs de ARN directamente extraído de los órganos y amplificando los genes P y HN del virus. La diversidad viral tras pases in vivo fue diferente respecto a la del inóculo, pero demostró la realidad del concepto de cuasiespecies para las cepas pPMV-1. Además, algunos ARNs genómicos aberrantes con inserciones en el punto de edición del gen P o delecciones en el gen HN fueron también detectados, con posibles consecuencias para la patogenicidad e infectividad de los virus.