Diversités agro-morphologique et génétique de variétés locales de sorgho (Sorghum bicolor [L.] Moench) du Burkina Faso. Eléments pour la valorisation des ressources génétiques locales

Au Burkina Faso, les paysans gerent une grande diversite varietale de sorgho dans differentes conditions agro-ecologiques. Le but de cette etude est de decrire et analyser les diversites agro-morphologique et genetique de varietes locales de sorghos collectees en 2003 et 2004 dans trois regions agricoles du Burkina Faso (le Centre-nord, le Centre-ouest et la Boucle du Mouhoun), d'identifier les forces majeures qui influent sur leurs evolutions et de proposer des methodes de gestion et de valorisation de la diversite. Deux approches a la fois agro-morphologique et genetique ont servi a caracteriser la diversite inter-varietale et intra-varietale. La caracterisation inter varietale a ete conduite avec 124 varietes locales a l'aide de 28 caracteres agro-morphologiques et 29 marqueurs microsatellites. Quatre vingt quatorze pour cent (94,4 %) des varietes locales appartiennent a la race botanique Guinea composee de deux sous races : les gambicum 96,6 % et les margaritiferum 3,4 %. Les Bicolor et Durra-Bicolor representent chacun 0,8 %. Quatre pour cent (4 %) des varietes n'ont pu etre rattaches a un groupe botanique ; ceux-ci seraient des hybrides de Guinea. Les varietes a grains blancs representent 74,2 %, celles a grains oranges 13,7 %, et celles a grains rouges 12,1 %. La plus grande part de la diversite est expliquee par le facteur variete, significatif pour tous les caracteres, en particulier pour le cycle (R² = 0,84) et le poids de 1000 grains (R² = 0,79). En dehors de la duree de cycle, les facteurs " village et zone agro-ecologique " ont une faible influence sur la diversite agro-morphologique, structuree en cinq groupes dont un groupe de sorghos precoces a grain rouge. Ces groupes ont ete discrimines sur les criteres de vitrosite du grain, de longueur de cycle et de panicule ainsi que de poids de 1000 grains. Le taux de polymorphisme genetique est de 79,3 %, avec une diversite allelique de 4,9 alleles par locus et une diversite genetique de 0,37. La diversite genetique a l'instar de la diversite agro-morphologique est aleatoirement repartie et ne respecte aucun critere. Les Guinea margaritiferum apparaissent genetiquement distincts des Guinea gambicum. Les varietes a grain rouge constituent un groupe genetiquement homogene. La differenciation genetique est faible entre les villages (Fst=0,06) et entre les zones agro-ecologiques (Fst=0,04). C'est plutot la couleur de grain avec un Fst=0,08 qui apparait comme le principal facteur de structuration. La caracterisation intra-varietale a ete realisee avec dix varietes a grain blanc de la race Guinea gambicum, choisies parmi les 124 varietes de la caracterisation inter-varietale. Ces varietes presentent des cycles differents, et sont soumises a des modes de gestion differents dans les espaces agraires. Onze caracteres agro-morphologiques et douze marqueurs microsatellites ont servi a caracteriser la variabilite de 25 panicules par variete. Les niveaux de diversite intra-varietale different de maniere plus ou moins importante entre les varietes. Les plus faibles variances agro-morphologiques ont ete observees au sein des varietes precoces, et les plus fortes variances au sein des varietes tardives. Les varietes precoces sont nettement discriminees des varietes tardives et intermediaires sur les criteres de duree de cycle, de longueur de panicule, de productivite et de poids moyen de 1000 grains. Le taux de polymorphisme genetique est de 100 %, avec une diversite allelique de 5,7 alleles par locus, et une diversite genetique de 0,53. Les plus fortes valeurs de polymorphisme comme de diversite genetique sont observees au sein des varietes tardives. La differenciation genetique globale est forte (Fst=0,39). Genetiquement les varietes precoces constituent un groupe a part, bien differencie des varietes de cycles intermediaire et tardif, entre lesquelles la differenciation est faible (Fst=0,06). Le taux d'allogamie est de 22 %. Cette etude a montre que les niveaux de diversite agro-