Avian Influenza Virus Prevalence in Migratory Waterfowl in the United States, 2007–2009

SUMMARY We analyzed 155,535 samples collected for surveillance of avian influenza viruses (AIVs), in the United States from 2007 to 2009, from migratory waterfowl (ducks, geese, and swans). The goal was to elucidate patterns of prevalence by flyway and functional groups to determine targets for future surveillance. Apparent prevalence of AIV was highest in the Pacific Flyway in 2007–2008 (14.2% and 14.1%, respectively), in the Mississippi Flyway in 2009 (16.8%), and lowest each year in the Atlantic Flyway (range, 7.3%–8.9%). Dabbling ducks had higher apparent prevalence of AIV (12.8%–18.8%) than diving ducks (3.9%–6.0%) or geese and swans (3.6%–3.9%). We observed highest apparent prevalence in hatch-year waterfowl (15.6%–18.9%). We further analyzed 117,738 of the 155,535 samples to test the hypothesis mallard (Anas platyrhynchos) had highest prevalence of AIV. We compared apparent prevalence and odds ratios for seven species of ducks and one species of goose commonly collected across the United States. Mallards had highest apparent prevalence (15%–26%) in half of comparisons made, whereas American green-winged teal (Anas creeca, 12%–13%), blue-winged teal (Anas discors, 13%–23%), northern pintail (Anas acuta, 16%–22%), or northern shoveler (Anas clypeata, 15%) had higher apparent prevalence in the remaining comparisons. The results of our research can be used to tailor future surveillance that targets flyways, functional groups, and species with the highest probability of detecting AIV. RESUMEN Prevalencia del virus de la influenza aviar en aves acuáticas migratorias en los Estados Unidos, 2007–2009. Se analizaron 155,535 muestras recolectadas para la vigilancia de los virus de influenza aviar (AIV), en los Estados Unidos desde el año 2007 al año 2009, procedentes de aves acuáticas migratorias (patos, gansos y cisnes). El objetivo fue determinar los patrones de prevalencia por vías migratorias y por grupos funcionales para determinar los objetivos de vigilancia en el futuro. La prevalencia aparente de influenza aviar fue más alta en la ruta migratoria del Pacífico durante los años 2007 y 2008 (14.2% y 14.1%, respectivamente), en la ruta migratoria del Mississippi en el 2009 (16.8%), y la más baja de cada año fue la ruta migratoria del Atlántico (rango 7.3%–8.9%). Los patos chapoteadores mostraron la mayor prevalencia aparente del virus de influenza aviar (12.8%–18.8%) en comparación con los patos buceadores (3.9%–6.0%) o gansos y cisnes (3.6%–3.9%). Se observó mayor prevalencia aparente en aves acuáticas de un año de edad (15.6%–18.9%). Posteriormente, se analizaron 117,738 de las 155,535 muestras para probar la hipótesis de que los ánades reales (Anas platyrhynchos) mostraban la mayor prevalencia de virus de influenza aviar. Se compararon la prevalencia aparente y las razones de momios para siete especies de patos y una especie de ganso comúnmente recolectados en los Estados Unidos. Los ánades reales tenían una mayor prevalencia aparente (15%–26%) en la mitad de las comparaciones realizadas, mientras que la cerceta común (Anas creeca, 12%–13%), el pato media luna (Anas discors, 13%–23%), ánade rabudo (Anas acuta, 16%–22%), o pato cuchara (Anas clypeata, 15%) tuvieron mayor prevalencia aparente en las comparaciones restantes. Los resultados de esta investigación se pueden utilizar para adaptar la vigilancia futura que se enfoque en las vías migratorias, grupos funcionales, y las especies con mayor probabilidad de detectar al virus de la influenza aviar.