Şablon:Biyolojik veritabanı bilgi kutusu

| Bilgi | Detay |
| --- | --- |
|  | |
| **İçerik** | |
| **Açıklama** | GenBank, NIH genetik dizi veritabanı |
| **Yakalanan veri türleri** | Nükleotid Dizisi, Protein dizisi |
| **Organizmalar** | hepsi |
| **İletişim** | |
| **Araştırma merkezi** | NCBI |
| **Birincil alıntı** | PMID 21071399 |
| **Erişim** | |
| **Veri formatı** | XML ASN.1 Genbank formatı |
| **İnternet sitesi** | NCBI |
| **İndirme bağlantısı** | ncbi ftp |
| **Web hizmeti bağlantısı** | eutils soap |
| **Araçlar** | |
| **Web** | BLAST |
| **Bağımsız** | BLAST |
| **Diğer** | |
| **Lisans** | Kamu malı-ABD Hükûmeti |
| **Yer imi konulabilir varlıklar** | evet |

Şablon belgelemesi [ gör ] [ değiştir ] [ geçmiş ] [ temizle ] Bu şablon şu Lua modülünü kullanıyor: Modül:InfoboxImage Bu şablon ikidilli kullanıma uygundur. Başka bir projede üretilen bu şablon, Türkçe Vikipedi'ye uyarlanması sırasında Türkçeleştirilmiş ancak özgün İngilizce parametreleri de korunmuştur. Bu nedenle hem İngilizce hem de Türkçe parametreler kullanılabilir. Biyolojik bir veritabanını tanımlamak için kullanılan bilgi kutusu . Her veritabanı için, veritabanının hala kullanımda olup olmadığını, bir web servisinin veya sql erişiminin mevcut olup olmadığını, belirli bir organizmaya özgü olup olmadığını vb. bilmek istiyoruz. Lütfen maddenin altına Kategori:Biyolojik veritabanları eklemeyi unutmayın . Alanlar İçerik başlık : başlık, örneğin FusariumDB açıklama : kısa açıklama örn: Fusarium için siber altyapı kapsam : Şunlardan biri olabilir : Nükleotid Dizisi, RNA dizisi, Protein dizisi, Yapı, Genomik (omurgasız), Metabolik ve Sinyal Yolları, İnsan ve diğer Omurgalı Genomları, İnsan Genleri ve Hastalıkları, Mikroarray Verileri ve diğer Gen İfadeleri, Proteomik Kaynaklar, Diğer Moleküler Biyoloji, Organel, Bitki, İmmünolojik... organizma : bu veritabanına özgü bir veya daha fazla organizma İletişim merkez : araştırma merkezi. örn. NCBI laboratuvar : laboratuvar yazar : bu veritabanının yazar(lar)ı alıntı : veritabanını tanımlayan bir makalenin birincil alıntısı (alternatif olarak PubMed ID için pmid= kullanın, ancak ikisini birden kullanmayın) pmid : Veritabanını tanımlayan bir makale için PMID (alternatif olarak alıntı= kullanın, ancak ikisini birden kullanmayın) yayıntarihi : yayın tarihi Erişim standart : MI'lar, Veri formatları, Terminolojiler format : Veri formatları sql : veritabanı genel bir SQL sunucusu olarak mevcutsa (belgelere işaret eden bir URL olabilir) webhizmeti : bu veritabanı için bir web hizmeti varsa ( WSDL dosyasına işaret eden bir URL olabilir) sparql : eğer varsa sparql uç noktası(ları) indirme : indirme alanı, FTP sitesi... Araçlar webuygulaması : Web uygulama(ları) bağımsız : Bağımsız araç(lar) Diğer sürümleme : Sürümleme politikası/geçmiş dosyalara erişim lisans : veri için lisans sıklık : Veri yayınlama sıklığı kürasyon : Kürasyon politikası sürüm : yayınlanan sürüm yer imi : Bu veritabanındaki varlığa yer imi koyabilir misiniz (http GET yöntemi) Model {{ Biyolojik veritabanı bilgi kutusu | başlık = | logo = | açıklama = | kapsam = | organizma = | merkez = | laboratuvar = | yazar = | alıntı = | yayıntarihi = | standart = | format = | url = | indirme = | webhizmeti = | sql = | sparql = | webuygulaması = | bağımsız = | lisans = | sürümleme = | sıklık = | kürasyon = | yerimi = | sürüm = }} Örnek {{ Biyolojik veritabanı bilgi kutusu | başlık = [[ GenBank ]] | yazar = | merkez = [[ National Center for Biotechnology Information | NCBI ]] | organizma = hepsi | açıklama = GenBank, NIH genetik dizi veritabanı | kapsam = Nükleotid Dizisi, Protein dizisi | url = [ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ NCBI ] | indirme = [ ftp://ftp.ncbi.nih.gov/ ncbi ftp ] | webhizmeti = [ http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/ eutils ]< br />[ http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/eutils.wsdl soap ] | lisans = Kamu malı-ABD Hükûmeti | pmid = 21071399 | logo = [[ File : US-NLM-NCBI-Logo.svg | 60px ]] | bağımsız = [[ BLAST ]] | webuygulaması = [[ BLAST ]] | format = [[ XML ]]< br />[[ Abstract Syntax Notation One | ASN.1 ]]< br /> Genbank formatı | yerimi = evet }} XSLT ile hızlı üretim Aşağıdaki XSLT stil sayfası https://gist.github.com/768553 bir PubMed makalesinden bir taslak oluşturmak için kullanılabilir. xsltproc ile örnek $ xsltproc --novalid \ > pubmed4biodb.xsl \ > "http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=pubmed&id=19846593&retmode=xml" {{Biyolojik veritabanı bilgi kutusu |başlık = REBASE-- DNA kısıtlaması ve modifikasyonu için bir veritabanı: enzimler, genler ve genomlar. |logo =[[File:Database.png]] |açıklama = REBASE-- DNA kısıtlaması ve modifikasyonu için bir veritabanı: enzimler, genler ve genomlar. |kapsam = |organizma = |merkez = |laboratuvar = New England Biolabs, Inc, 240 County Road, Ipswich, MA 01938, USA. |yazar = Richard J Roberts |pmid = 19846593 (...) İzleme kategorisi Kategori:Hatalı biçimlendirilmiş pmid ile biyolojik veritabanı bilgi kutusu kullanan sayfalar (0) Biyolojik veri tabanları için bilgi kutusu Şablon parametreleri Bu şablon, parametrelerin blok biçimlendirilmesini tercih eder. Parametre Açıklama Tür Durum box_width box_width açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı Ad başlık ad açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı logo logo açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı logo_boyut logo_boyut açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı logo_dik logo_dik açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı logo_alt logo_alt açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı logo_altyazı logo_altyazı açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı ekrangörüntüsü ekrangörüntüsü açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı daraltılabilir daraltılabilir açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı resim_boyutu resim_boyutu açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı alt alt açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı altyazı altyazı açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı Açıklama açıklama açıklama yok Örnek Kısa bir açıklama Bilinmiyor isteğe bağlı Kapsam kapsam açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı organizma organizma açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı merkez merkez açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı laboratuvar laboratuvar açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı yazar yazar açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı alıntı alıntı açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı pmid pmid açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı yayıntarihi yayıntarihi açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı standart standart açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı format format açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı url url açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı indirme indirme açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı webhizmeti webhizmeti açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı sql sql açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı sparql sparql açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı webuygulaması webuygulaması açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı bağımsız bağımsız açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı lisans lisans açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı sürümleme sürümleme açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı sıklık sıklık açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı sürüm sürüm açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı kürasyon kürasyon açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı yerimi yerimi açıklama yok Bilinmiyor isteğe bağlı Yukarıdaki belgeleme içeriği Şablon:Biyolojik veritabanı bilgi kutusu/belge sayfasından yansıtılmaktadır . ( değiştir | geçmiş ) Kullanıcılar denemelerini bu şablonun deneme tahtası ( oluştur | yansıtma ) ve test senaryosu ( oluştur ) sayfalarında yapabilirler. Lütfen kategorileri /belge alt sayfasına ekleyin. Bu şablon ile ilgili alt sayfalar için buraya tıklayınız .