Maskrio/nya-ir-miracl-id-preprocessed huggingface dataset:
Transporter monokarboksilat
MCT8 terutama mendifusikan T3, selain T4, rT3, dan T2, namun tidak mentransport Leu, Phe, Trp or Tyr, asam laktat, maupun asam amino aromatik.
Transporter monokarboksilat
Cacat pada SLC16A2 mengakibatkan sindrom Allan-Herndon-Dudley, keterlambatan perkembangan seluruh sistem tubuh, cacat pada sistem saraf, "central hypotonia", "spastic quadriplegia", "dystonic movements", "rotary nystagmus", gangguan penglihatan dan pendengaran. Perkembangan jaringan otak yang tidak semestinya, jika terkait dengan cacat MCT8 biasanya terjadi akibat rasio sitoplasma T3 yang berlebih atau kekurangan.
Transporter monokarboksilat
Selain MCT8, terdapat pencerap yang memiliki daya ikat kuat terhadap T4, yaitu OATP1C1 dan "L-type amino acid transporters".
Transporter monokarboksilat
MCT9 () adalah MCT sepanjang 509 AA.
Transporter monokarboksilat
MCT10 () adalah MCT dengan panjang 515 AA yang mendifusikan L-triptofan, L-tirosina, L-fenilalanina, D-fenilalanina, L-dopa pada otot lurik, ginjal, jantung, plasenta, epitelium usus halus.
Transporter monokarboksilat
Gen MCT10 tersandi pada kromosom 6q21–q22 memiliki kesamaan genetik dengan MCT8 sehingga juga merupakan transporter T3.
Transporter monokarboksilat
MCT11 () adalah MCT dengan panjang 471 AA. Kemungkinan Met-1 atau Met-25 sebagai aktivator MCT11 masih dalam penelitian.
Transporter monokarboksilat
MCT12 () adalah MCT dengan panjang 486 AA dengan ekspresi tertinggi pada ginjal, disusul pada retina, kornea, paru, testis, dan yang terlemah pada otak dan hati.
Transporter monokarboksilat
Cacat pada SLC16A12 merupakan penyebab "cataract juvenile" yang disertai mikrokornea dan glukosuria. Glukosuria renal ditandai dengan peningkatan rasio glukosa di dalam urin tanpa adanya hiperglisemia dan kelainan morfologis pada ginjal.
Transporter monokarboksilat
MCT13 () adalah MCT dengan panjang 426 AA yang berfungsi sebagai katalis.
Transporter monokarboksilat
MCT14 () adalah MCT dengan panjang 510 AA yang berfungsi sebagai katalis dengan dua isomer.
After the quake
Beberapa cerita dalam buku ini diadaptasi ke dalam berbagai bentuk media seperti film, pertunjukan teater, dan novel audio yang disiarkan di radio BBC.
After the quake
Cerpen yang diangkat menjadi film oleh adalah "All God's Children Dance". Film ini disutradarai oleh Robert Logevall dan mulai ditayangkan di Amerika Serikat pada bulan November 2007. Selain di Amerika Serikat, film ini juga dirilis di Jerman (7 Februari 2008), Perancis (8 September 2008), dan Belanda (6 November 2008). Film ini memenangkan "Special Jury Prize" dalam Festival Film Internasional CineVegas (CineVegas International Film Festival) pada tahun 2007 dan dirilis dalam bentuk DVD dengan judul "K-Town Super Frog" di Amerika Serikat dan "O gios tou...Theou" di Yunani.
After the quake
Pertunjukan teater berjudul "after the quake" digelar oleh sutradara Frank Galati dengan menggabungkan cerita "Honeypie" dan "Super-frog Saves Tokyo" menjadi satu cerita yang utuh. Pertunjukan berdurasi 90 menit tersebut diadakan pada tanggal 12 Oktober sampai 2 Desember 2007.
Gaero dari Baekje
Gaero dari Baekje (?-475, bertahta tahun 455-475) adalah raja kedua puluh satu kerajaan Baekje, salah satu dari Tiga Kerajaan Korea. Ia adalah putra tertua dari raja kedua puluh kerajaan Biyu. Ia wafat di medan perang karena ibukota Baekje, yang sekarang adalah wilayah Seoul jatuh ke tangan kerajaan saingan dari bagian utara, Goguryeo.
Gaero dari Baekje
Ia berusaha untuk menguatkan kontrol aristokrasi di dalam kerajaan dengan menseleksi para pejabat dari klan Yeo yang merupakan klannya, dengan tanggungan klan Hae dan Jin yang berkuasa.
Gaero dari Baekje
Pada tahun 469, ia memerintahkan serangan mendadak dimana kota Cheongmongnyeon (청목령, 靑木嶺 ; dekat yang modern adalah Kaesong) yang dirampas oleh Goguryeo. Pada tahun 472, ia mengirimkan seorang duta besar yang memberikan upeti kepada Wei Utara meminta bantuan dalam melawan serangan dari Goguryeo. Namun, uang muka tersebut ditolak oleh Kerajaan Wei, yang berusaha menghindari perang dengan Goguryeo yang memiliki kekuatan militer yang lebih besar pada saat itu, saat berperang dengan dinasti-dinasti dari Selatan.
Gaero dari Baekje
Pada awal tahun 470, menurut riwayat "Samguk Sagi", Raja Jangsu dari Goguryeo mengirimkan seorang biarawan Buddha yang bernama Dorim, yang sebenarnya merupakan seorang pengintai Goguryeo. Dorim menggunakan keranjingan Gaero di dalam permainan baduk untuk mengambil hatinya dan membujuk raja untuk mengabaikan pertahanan negara untuk mendukung pekerjaan umum.
Gaero dari Baekje
Pada tahun 475, Jangsu melancarkan serangan dengan 30,000 pasukan dan menyerbu pertahanan Baekje dalam 7 hari, merampas bukit di Sungai Han termasuk ibukota. Gaero dibawa ke Benteng Gunung Acha dan dibunuh oleh 2 orang yang telah membelot ke Goguryeo dari Baekje. Sekutu Baekje, Silla mengirimkan 10,000 pasukan, namun mereka tiba terlambat.
Gaero dari Baekje
Ia merupakan yang terakhir memerintah Baekje dari jantung bersejarah di bukit Sungai Han. Setelah kematiannya, Hae Gu, yang menindas klan Hae, memimpin sebuah revolusi berdarah.
Komando Jihad
Komando Jihad adalah kelompok ekstrimis Islam Indonesia yang ada dari tahun 1968 sampai dibubarkan melalui aksi pembersihan oleh anggota intelijen pada pertengahan tahun 1980-an.
Komando Jihad
Pada tanggal 28 Maret 1981 lima anggota Komando Jihad naik ke pesawat Garuda Indonesia yang sedang melakukan penerbangan domestik di Indonesia dan menyandera 57 penumpang yang sedang dalam penerbangan ke Bangkok setelah pengisian bahan bakar di Malaysia. Dengan bersenjatakan senapan mesin dan dinamit, mereka menuntut: pembebasan 20 tahanan politik; supaya semua "pejabat Yahudi dan kaum militer Israel" segera diusir dari Indonesia; dan bahwa mereka diberikan 1,5 juta dolar. Setelah empat hari, pasukan komando Indonesia menyerbu pesawat tersebut, menewaskan empat dari lima pembajak, dan menangkap yang kelima. Pilot pesawat, Herman Rante dan Achmad Kirang, seorang anggota pasukan komando Indonesia meninggal dalam serbuan tersebut. Namun semua penumpang dan awak lainnya selamat.
Beop dari Baekje
Beop dari Baekje (? - 600, bertahta tahun 599 - 600) adalah raja kedua puluh sembilan kerajaan Baekje, salah satu dari Tiga Kerajaan Korea. Ia adalah putra tertua dari Raja Hye. Ia memerintah pada saat kekuatan merosot, kehilangan wilayah Seoul pada saingannya, kerajaan Silla.
Beop dari Baekje
Ia dikatakan memilih namanya, yang diterjemahkan sebagai "raja hukum" atau "raja dharma", untuk menegaskan identifikasi kepercayaannya pada agama Buddha.
Beop dari Baekje
Pemerintahan Beop yang sebentar itu kebanyakan diingat atas larangannya terhadap segala pembunuhan, termasuk berburu dan menjagal. Ia memerintahkan pembebasan elang dan membakar peralatan untuk memancing dan berburu. Menurut riwayat "Samguk Yusa", larangan tersebut didirikan pada bulan lunar kedua belas tahun 599.
Beop dari Baekje
Ia memulai konstruksi kuil Wangheungsa, yang diselsaikan dimasa pemerintahan pewaris kerajaannya.
Bahasa Kuanua
Bahasa Kuanua adalah bahasa yang dituturkan oleh suku Tolai yang tinggal di Semenanjung Gazelle, East New Britain, Papua Nugini. Tidak seperti banyak bahasa lain di Papua Nugini, Kuanua tidak berada dalam bahaya kepunahan. Bahasa ini unik karena tidak memiliki fonem 's'.
Bahasa Kuanua
Kuanua masuk kedalam rumpun bahasa Austronesia.
Philolaos
Philolaos adalah seorang filsuf yang termasuk ke dalam Mazhab Phytagoras. Selain sebagai filsuf, ia juga dikenal sebagai dokter dan juga penulis. Ia adalah filsuf pertama dari Mazhab Phytagoras yang mengeluarkan karya tertulis.
Philolaos
Namanya disebut-sebut di dalam koleksi-koleksi teori medis sejak awal abad ke-5 SM. Selain itu, terdapat keterangan tentang dirinya dari sebuah papirus yang terdapat di "British Museum". Hanya ada sedikit fragmen dari tulisannya yang masih tersimpan hingga kini. Salah satu karyanya yang terkenal adalah "Perihal Alam" ("On Nature").
Philolaos
Philolaos berasal dari Kroton. Ia lahir sekitar tahun 470 SM. Setelah sekolah mazhab Phytagoras di Kroton hancur dan anggotanya tercerai-berai, ia pergi dan menetap di Thebes. Kemudian ia pergi lagi dan menetap di Targentum. Kedua murid Sokrates yang mendampingi saat-saat terakhirnya, diketahui juga sebagai murid Philolaos.
Philolaos
Philolaos menyatakan bahwa ada dua prinsip di dalam segala yang ada. Kedua prinsip tersebut disebutnya "yang terbatas" dan "yang tak terbatas". Walau berbeda, keduanya dipersatukan oleh "keteraturan". Dengan demikian, segala sesuatu berasal dari elemen-elemen berbeda yang dipersatukan oleh "keteraturan" tersebut.
Philolaos
Selain itu, segala sesuatu yang ada juga dapat dikenal dengan angka-angka. Alasannya adalah bahwa bila segala sesuatu yang ada terbatas, maka ia dapat dipisahkan satu dengan yang lain. Bila sesuatu dapat dipisah-pisahkan, berarti sesuatu itu akan selalu dapat dihitung. Karena itu, segala "yang terbatas" yang manusia ketahui selalu akan dapat dihitung.
Philolaos
Mengenai alam semesta, Philolaos berpendapat bahwa hal pertama yang menjadi "teratur" adalah apa yang disebut "tungku api". "Tungku api" ini terletak di pusat alam semesta. Dengan demikian, alam semesta dipandang sebagai suatu kesatuan. Ke-ada-an dimulai dari pusatnya, "tungku api", lalu mengembang ke segala arah. Philolaos berpendapat bahwa "tungku api" ini merupakan dunia dewa-dewi. Kemudian di sekelilingnya terdapat langit, matahari, bulan, bumi, dan benda-benda lain yang terbentuk dari api yang bersumber dari "tungku api".
Philolaos
Ada empat prinsip dari manusia, yakni otak, jantung, pusar, dan alat kelamin. Kepala adalah tempat berpikir. Jantung adalah tempat jiwa dan tempat merasakan segala sesuatu. Pusar adalah tempat pertumbuhan awal manusia. Alat kelamin adalah tempat benih kehidupan dan perkembang-biakan manusia. Otak adalah inti dari manusia yang membedakannya dengan makhluk hidup lain.
Philolaos
Menurut Philolaos, penyakit disebabkan oleh empedu, darah, dan lendir. Ketiga unsur itu adalah prinsip dari segala penyakit. Ia mengatakan bahwa darah menggumpal ketika daging di dalam tubuh semakin padat. Sedangkan darah akan menjadi lebih cair ketika pembuluh darah bercabang. Lendir merupakan persenyawaan air hujan. Kemudian empedu dianggap sebagai cairan dari daging. Penyakit muncul ketika terjadi situasi yang terlalu dingin atau terlalu panas terhadap ketiga zat tersebut.
Philolaos
Philolaos memandang jiwa sebagai yang terpenjara di dalam tubuh. Jiwa adalah percampuran dan harmoni antara elemen-elemen berbeda yang terdapat di dalam tubuh. Akan tetapi, berbeda dengan para filsuf mazhab Phytagoras lainnya, ia berpendapat bahwa jiwa akan menghilang bersama dengan tubuh.
Mel Raido
Mel Raido (lahir 1977) adalah aktor campuran Spanyol dan Yunani.
Mel Raido
Ia belajar di Webber Douglas Academy of Dramatic Art antara tahun 1996 dan 1999.
Jansenisme
Istilah Jansenisme berasal dari seorang bernama Cornelius Otto Jansen, yang merupakan seorang teolog Katolik Flemish yang lahir pada tahun 1585.
Jansenisme
Jansen adalah seorang direktur sekaligus profesor eksegese dan juga merupakan rektor Seminari Saint Pulcherie di Louvain. Ia meninggal karena penyakit pes pada tahun 1638 saat sedang bertugas sebagai Uskup Ypres, Belgia. Setalah Jansen meninggal, sejumlah materi perkuliahan yang diajarkannya diterbitkan.
Jansenisme
Hasil studi melalui tulisan-tulisan Jansen tentang Santo Agustinus banyak menyedot perhatian orang. Karyanya yang berjudul Augustinus tersebut terdiri dari tiga bagian dan diterbitkan pada tahun 1640. Dalam karyanya itu, Jansen menyajikan analisis yang saksama tentang pemikiran-pemikiran Agustinus mengenai doktrin pre-determinasi dan kedosaan manusia, dan rahmat keselamatan Allah melalui Yesus Kristus. Hal inilah yang menyebabkan bukunya yang berjudul Augustinus ini dimasukkan dalam Indeks Buku-buku Terlarang oleh Paus Urbanus VIII pada tahun 1643.
Jansenisme
Selain itu, pada tahun 1653 dalam bullanya Cum Occasione, Paus Innocentius X mengutuk proposisi-proposisi yang berasal dari Jansen, khususnya yang berkaitan dengan doktrin pre-determinasi. Pandangan Jansen mengenai pre-determinasi dianggap sebagai bidaah, termasuk tindakan Paus Klemens XI pada 1713 yang mengutuk karya-karya Jansenis.
Jansenisme
Kaum Jansenis memiliki prinsip yang teguh bahwa absolusi hanya diberikan kepada orang-orang yang sungguh-sungguh mampu membuktikan pertobatannya. Mereka juga berpandangan bahwa komuni harus diterima dengan penuh khidmat dan hormat. Jansenisme juga menganjurkan praktik-praktik kemiskian/kesederhanaan, matiraga dan askese yang kuat untuk memperoleh kesucian.
Jansenisme
Selama abad XVIII, para pengikut Jansen mengalami penganiayaan berat di Prancis. Walaupun ditentang keras, gerakan Jansenisme tetap bertahan di bawah kepemimpinan tokoh-tokoh seperti Antoine Arnauld dan Jean Du Vergier dan Blaise Pascal (1623-1662).
Komaruddin Hidayat
Prof. Dr. Komaruddin Hidayat () adalah rektor Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta untuk masa jabatan dua periode, 2006-2010 dan 2010-2015. Selain sebagai akademisi, ia juga menjadi penulis kolom di beberapa media massa. Kemampuan inteletualitasnya ia tunjukkan dengan menjadi peneliti di beberapa lembaga kajian dan penelitian.
Komaruddin Hidayat
Sejak kecil Komar dekat dengan dunia Islam utamanya pesantren. Komarudin merupakan Alumni pesantren modern Pabelan, Magelang (1969) dan Pesantren al-Iman, Muntilan (1971). Setelah lulus dari pesantren, ia melanjutkan studi sarjana muda (BA) di bidang Pendidikan Islam (1977) dan sarjana lengkap (Drs.) di bidang Pendidikan Islam (1981) di IAIN Jakarta.
Komaruddin Hidayat
Komar melanjutkan studi doktoral ke luar negeri. Ia Meraih doktor di bidang Filsafat Barat di Middle East Techical University, Ankara, Turkey (1990).
Komaruddin Hidayat
Pada 17 Oktober 2006, dalam rapat senat yang dipimpin oleh Azyumardi Azra, di Auditorium utama UIN Syarif Hidayatullah, Komar terpilih sebagai rektor universitas tersebut. Ia memenangi pemilihan suara atas dua kandidat lainnya yakni Prof. Dr. Masykuri Abdillah dan Prof. Dr. Suwito.
Komaruddin Hidayat
Komar merupakan kolumnis di beberapa media massa seperti "Harian Kompas" dan "Seputar Indonesia" dan "Republika". Selaku akademisi, Komar menjadi Dosen pada Fakultas Pasca Sarjana IAIN Jakarta (sejak 1990), dosen pada Fakultas Pasca Sarjana Universitas Indonesia (sejak 1992), dosen Sekolah Tinggi Filsafat (STF) Driyarkara (sejak 1993).
Komaruddin Hidayat
Selain sebagai dosen, ia juga sebagai Dewan Redaksi majalah Ulumul Qur`an (sejak 1991), Dewan Redaksi Jurnal Studia Islamika (sejak 1994), Dewan Editor dalam penulisan "Encylopedia of Islamic World", dan Direktur pada Pusat Kajian Pengembangan Islam Kontemporer, UIN Syarif Hidayatullah Jakarta (sejak 1995). Sejak tahun 1990, ia merupakan salah satu peneliti tetap Yayasan Wakaf Paramadina, Jakarta.
Komaruddin Hidayat
Komaruddin lahir di keluarga miskin di Muntilan. Meski keadaan tidak menguntungkan, ia memiliki motivasi kuat dalam meraih pendidikan yang terbaik. Untuk meraih keberhasilan, Komar memiliki motivasi besar yang dilatarbelakangi empat hal. Empat hal inilah yang menjadi titik balik bagi hidupnya. Pertama, kondisi kampung halaman yang menyedihkan. Kedua, wafatnya ibu sejak kecil. Ketiga, sosok neneknya, Qomariyah, yang arif dan menanamkan semangat kehidupan yang besar. Keempat, hadirnya sosok Kiai Hamam Ja’far dan kondisi pesantren yang menjadi latar sosial tempat dirinya tumbuh menjadi sosok yang dewasa.
Komaruddin Hidayat
Nenek Komar adalah orang yang arif. Ia menggantikan peran ibu yang telah meninggalkannnya sejak kecil. Selain kagum terhadap neneknya, Komar juga mendapat dorongan motivasi dari Kiai Hamam Ja’far di Pesantren Pabelan, Magelang. Komar menilai, sosok Kiai Hamam yang sudah dianggap sebagai ayahnya itu seperti sosok Nabi Musa. Yakni, figur pemimpin, panutan, dan pemberi petunjuk yang selalu bersikap keras untuk menaklukkan ketimpangan dan kemiskinan.
Komaruddin Hidayat
Kiai Hamam mengajarkan Komar bahwa manusia punya hak untuk merdeka, untuk hidup. Kiai Hamam menunjukkan semangat dan etos kerja tinggi yang ditunjukkan Nabi ketika hijrah. Komar juga mendapat pesan bahwa prinsip hidup harus seperti air. Kalau menggenang saja, ia akan menjadi sumber penyakit, sementara apabila mengalir, ia akan menjadi bersih.
Komaruddin Hidayat
Berkat motivasi tersebut, Komar merantau ke Jakarta pada usia 18 tahun sehingga akhirnya beberapa capaian ia raih, antara lain mendapat kesematan belajar di luar negeri dan menjadi rektor universitas. Ia juga telah berkeliling ke 30 negara dalam rangka seminar dan studi komparatif untuk masalah kebudayaan dan pengembangan keagamaan dengan berbagai universitas dan NGO.
Komaruddin Hidayat
Berikut biografi lengkap Komarudin Hidayat.
Biofilm
Biofilm adalah kumpulan sel mikroorganisme, khususnya bakteri, yang melekat di suatu permukaan dan diselimuti oleh pelekat karbohidrat yang dikeluarkan oleh bakteri. Biofilm terbentuk karena mikroorganisme cenderung menciptakan lingkungan mikro dan relung ("niche") mereka sendiri. Biofilm memerangkap nutrisi untuk pertumbuhan populasi mikroorganisme dan membantu mencegah lepasnya sel-sel dari permukaan pada sistem yang mengalir. Permukaan sendiri adalah habitat yang penting bagi mikroorganisme karena nutrisi dapat terjerap pada permukaan sehingga kandungan nutrisinya dapat lebih tinggi daripada di dalam larutan. Konsekuensinya, jumlah dan aktivitas mikroba pada permukaan biasanya lebih tinggi daripada di air.
Biofilm
Hingga tahun 1980-an, mode pertumbuhan dengan biofilm lebih dianggap sebagai sesuatu yang menarik saja dan bukan sebagai suatu studi ilmiah yang serius. Namun, bukti-bukti yang terkumpul kemudian menunjukkan bahwa pembentukan biofilm lebih disukai oleh mikroorganisme, dan hampir semua permukaan yang terkena kontak dengan mikrob dapat mendukung pembentukan biofilm sehingga memengaruhi kehidupan manusia. Atas dasar tersebut, studi mengenai biofilm menjadi lebih intensif. Selain bakteri, mikroorganisme lainnya seperti alga dan khamir (fungi bersel satu) juga dapat membentuk biofilm, namun biofilm bakteri adalah yang paling banyak dipelajari dan dirujuk sebagai contoh.
Biofilm
Asal usul biofilm dapat ditelusuri hingga 3,5 miliar tahun yang lalu berdasarkan fosil biofilm yang ditemukan di Afrika bagian selatan dan Australia Barat. Fosil biofilm tersebut berbentuk stromatolit (Bahasa Yunani "stroma", "tempat tidur", dan "lithos", "batu") yaitu kubah bergaris-garis yang tersusun dari batuan sedimen yang sangat mirip dengan kerak berlapis-lapis, yang sekarang ini terbentuk pada dasar rawa berair asin dan beberapa laguna laut hangat oleh koloni bakteri dan sianobakteri. Biofilm terbentuk karena prakarsa koloni bakteri dan sianobakteri yang melekat pada batuan tersebut. Sampai saat ini, fosil tersebut adalah fosil organisme hidup tertua yang diketahui sehingga biofilm diperkirakan sudah ada pada awal mula kehidupan di bumi.
Biofilm
Komposisi biofilm terdiri dari sel-sel mikroorganisme, produk ekstraseluler, detritus, polisakarida sebagai bahan pelekat, dan air yang adalah bahan penyusun utama biofilm dengan kandungan hingga 97%.Polisakarida (polimer dari monosakarida atau gula sederhana) yang diproduksi oleh mikrob untuk membentuk biofilm termasuk eksopolisakarida (EPS) yaitu polisakarida yang dikeluarkan dari dalam sel. EPS yang disintesis oleh sel mikrob berbeda-beda komposisi dan sifat kimiawi dan fisikanya. Beberapa adalah makromolekul yang bersifat netral, namun mayoritas bermuatan karena keberadaan asam uronat (Asam D-glukuronat), Asam D-galakturonat, dan Asam D- manuroniat. Ada biofilm yang bersifat kaku karena EPS-nya terdiri dari ikatan ß-1,4 atau ß-1,3 glikosida (ikatan monosakarida monomer penyusun polisakarida) seperti EPS "xanthan gum" yang dihasilkan oleh "Xanthomonas campestris" tetapi ada juga yang bersifat fleksibel karena memiliki ikatan α-1,2 atau α-1,6 glikosida yang banyak ditemukan pada dekstran Beberapa contoh EPS selain "xanthan gum" adalah asam kolanat yang diproduksi oleh "Escherichia coli", alginat oleh "P. aeruginosa", dan galaktoglukan oleh "Vibrio cholerae". Bahan-bahan penyusun biofilm yang lain contohnya adalah protein, lipid, dan lektin.
Biofilm
Struktur dari suatu biofilm adalah unik tergantung dari lingkungan tempatnya berada, contohnya adalah kandungan nutrisi dan keadaan fisik. Selain itu, di alam, sangat jarang terdapat biofilm yang hanya terdiri dari satu spesies, biasanya biofilm tersusun dari beberapa spesies dalam lapisan-lapisan yang berbeda.
Biofilm
Biasanya mikroorganisme fotosintetik ada di permukaan paling atas, mikroorganisme kemoorganotrof anaerob fakultatif di bagian tengah, sedangkan di bagian dasar adalah mikroorganisme anaerob pereduksi sulfat. Pada bagian atas, cahaya matahari lebih mudah didapat sehingga dapat digunakan untuk fotosintesis, sedangkan bagian tengah dapat dihuni oleh mikrob kemoorganotrof fakultatif anaerob karena dapat mentolerir kandungan udara yang sedikit serta banyak dapat mengakses bahan organik sebagai sumber energinya.
Biofilm
Pada bagian dasar, tidak terdapat kandungan udara sehingga mikrob anaerob pereduksi sulfat dapat tumbuh dan energi dengan cara mereduksi sulfat. Pemodelan habitat mikrob-mikrob tersebut dapat diamati menggunakan Kolom Winogradsky. Struktur biofilm yang lebih kompleks dapat berbentuk empat dimensi (x,y,z, dan waktu) dengan agregat sel, pori-pori, dan saluran penghubung. Tergantung dari kondisi lingkungannya, biofilm dapat menjadi sangat besar dan tebal sehingga dapat dilihat dengan mata telanjang contohnya pada lingkungan air laut dapat terbentuk stromatolit. Struktur dan ukuran biofilm sangat bergantung pada konsentrasi substrat.
Biofilm
Komunikasi antarsel penting bagi perkembangan dan pemeliharaan biofilm. Pelekatan suatu sel pada suatu permukaan adalah hasil dari sinyal untuk mengekspresikan gen-gen pembentuk biofilm. Gen-gen ini mengkodekan protein-protein untuk mensitensis sinyal komunikasi antarsel dan memulai pembentukan polisakarida. Pada bakteri gram negatif seperti "Pseudomonas aeruginosa", molekul sinyal yang utama adalah komponen yang disebut homoserin lakton yang berfungsi sebgai agen kemostatik untuk mengumpulkan sel-sel "P. aeruginosa" yang berdekatan (melalui mekanisme quorum sensing) dan membentuk biofilm.
Biofilm
Ada 5 tahap pembentukan biofilm yaitu:
Biofilm
Pemicu pembentukkan biofilm salah satunya adalah kondisi lingkungan yang kurang menguntungkan atau mencekam. Contohnya adalah produksi EPS oleh "Escherichia coli" berupa asam dan "P. aeruginosa" saat ketersediaan nutrisi menipis.
Biofilm
Selain keterbatasan nutrisi, faktor lain yang memicu pembentukan biofilm adalah quorum sensing, yaitu mekanisme untuk memastikan jumlah sel mencukupi sebelum suatu spesies melakukan respon biologi khusus. Jadi, setiap sel mikrob akan menghasilkan molekul sinyal untuk berkomunikasi dengan sel yang lain, bila jumlah sel mikrob tersebut cukup banyak, maka molekul sinyal terseut juga cukup banyak untuk memicu pembentukkan biofilm oleh keseluruhan bakteri tersebut. Molekul-molekul sinyal tersebut berbeda untuk tiap jenis mikrob dan memiliki peranannya masing-masing.
Berikut ini adalah tabel daftar molekul sinyal yang berperan dalam quorum sensing untuk membentuk biofilm dan akibatnya bila molekul sinyal tersebut tidak ada: