Применение гомоплазии в морфологических наборах данных часто можно избежать путём точнейшего определения характерных признаков и увеличения их количества: в предыдущем примере, используя в качестве признаков крылья с перьями , крылья с хитиновым экзоскелетом и кожистые крылья как характерные признаки, можно избежать эволюционно ложного объединения трех перечисленных групп животных на основе гомоплазии. При анализе супердеревьев (баз данных, включающих большее число таксонов исследуемой клады), применение неточных признаков может стать неизбежным, поскольку в обратном случае признаки могут стать неприменимыми для всех многочисленных таксонов. Скажем, такой признак, как наличие крыльев, не может быть применен для анализа филогении настоящих многоклеточных животных (Eumetazoa), так как большинству видов этого таксона данный признак не присущ. Таким образом, осторожный выбор и определение характерных признаков является другим важным элементом кладистического анализа. При ошибочном определении корневого вида и набора признаков, никакие методы построения кладограмм не смогут дать в результате филогенетической системы, которая соответствует эволюционной реальности.

Вопрос: При анализе чего применение неточных признаков может стать неизбежным?
Ответ: При анализе супердеревьев (баз данных, включающих большее число таксонов исследуемой клады) применение неточных признаков может стать неизбежным, поскольку в обратном случае признаки могут стать неприменимыми для всех многочисленных таксонов. Например, такой признак, как наличие крыльев, не может быть применен для анализа филогении настоящих многоклеточных животных (Eumetazoa), так как большинству видов этого таксона данный признак не присущ.

Вопрос: Что является важным элементом кладистического анализа?
Ответ: Осторожный выбор и определение характерных признаков является важным элементом кладистического анализа. При ошибочном определении корневого вида и набора признаков, никакие методы построения кладограмм не смогут дать в результате филогенетическую систему, которая соответствует эволюционной реальности.

Вопрос: Признак наличие крыльев не может быть применен для анализа филогении каких животных?
Ответ: Признак наличие крыльев не может быть применен для анализа филогении настоящих многоклеточных животных (Eumetazoa), так как большинству видов этого таксона данный признак не присущ.

Вопрос: В каком случае методы построения кладограмм не смогут дать в результате филогенетической системы, которая соответствует эволюционной реальности?
Ответ: В случае ошибочного определения корневого вида и набора признаков, методы построения кладограмм не смогут дать в результате филогенетической системы, которая соответствует эволюционной реальности.

Вопрос: Как можно избежать применения гомоплазии в морфологических наборах данных?
Ответ: Точнейшее определение характерных признаков и увеличение их количества - это один из способов избежать применения гомоплазии в морфологических наборах данных. При анализе супердеревьев (баз данных, включающих большее число таксонов исследуемой клады) применение неточных признаков может стать неизбежным, поскольку в обратном случае признаки могут стать неприменимыми для всех многочисленных таксонов. Например, такой признак, как наличие крыльев, не может быть применен для анализа филогении настоящих многоклеточных животных (Eumetazoa), так как большинству видов этого таксона данный признак не присущ.