২০১৬ সালে চন্ডীগডে় দ্বিতীয় আন্তর্জাতিক যোগা দিবসে যোগা ক্ষেত্রে উন্নয়ন এবং প্রচারে অসামান্য অবদানের জন্য এই পুরস্কার ঘোষণা করা হয়। এরপর থেকে প্রতি বছরই এই পুরস্কার প্রদান করা হচ্ছে।
योग के संवर्धन और विकास में उल्लेखनीय योगदान के लिए प्रधानमंत्री पुरस्कार की स्थापना और घोषणा 21 जून, 2016 को दूसरे अंतर्राष्ट्रीय योग दिवस के अवसर पर चंडीगढ़ में आयोजित कार्यक्रम के दौरान की गई थी। तब से यह पुरस्कार इस क्षेत्र में योगदान देने वाले प्रमुख व्यक्तियों को दिया जाता है।