বাহিনীতে উল্লেখযোগ্য অবদানের জন্য ২০০৯-এ বিশিষ্ট সেবা মেডেল এবং ২০১৫-য় অতি বিশিষ্ট সেবা মেডেলে ভূষিত হন তিনি।
वाइस एडमिरल अतुल कुमार जैन को विशिष्ठ सेवा के लिये वर्ष 2009 में विशिष्ठ सेवा मेडल और 2015 में अति विशिष्ठ सेवा मेडल से सम्मानित किया गया था।