Multinuclear metal-binding ability of a carotene
Shinnosuke Horiuchi; Yuki Tachibana; Mitsuki Yamashita; Koji Yamamoto; Kohei Masai; Kohei Takase; Teruo Matsutani; Shiori Kawamata; Yuki Kurashige; Takeshi Yanai; Tetsuro Murahashi; Nature Communications 6 (2015) 6742–; doi:10.1038/ncomms7742

data_1548303
_publ_section_title
;
 Multinuclear metal-binding ability of a carotene
;
_journal_name_full               'Nature Communications'
_journal_page_first              6742
_journal_paper_doi               10.1038/ncomms7742
_journal_volume                  6
_journal_year                    2015
_chemical_formula_moiety
'C80 H112 Pd10, 2(C32 H12 B F24), 2(C4 H10 O)'
_chemical_formula_sum            'C152 H146 B2 F48 O2 Pd10'
_chemical_formula_weight         4002.30
_chemical_name_systematic
;
 ?
;
_space_group_crystal_system      triclinic
_space_group_IT_number           2
_space_group_name_Hall           '-P 1'
_space_group_name_H-M_alt        'P -1'
_symmetry_space_group_name_Hall  '-P 1'
_symmetry_space_group_name_H-M   'P -1'
_atom_sites_solution_hydrogens   geom
_atom_sites_solution_primary     direct
_atom_sites_solution_secondary   difmap
_audit_creation_method           SHELXL-2014
_cell_angle_alpha                86.8710(10)
_cell_angle_beta                 84.9510(10)
_cell_angle_gamma                66.9300(10)
_cell_formula_units_Z            2
_cell_length_a                   19.4381(11)
_cell_length_b                   21.7533(12)
_cell_length_c                   22.0547(13)
_cell_measurement_reflns_used    18978
_cell_measurement_temperature    123(2)
_cell_measurement_theta_max      27.46
_cell_measurement_theta_min      3.02
_cell_volume                     8544.5(8)
_computing_cell_refinement       'RAPID AUTO'
_computing_data_collection       'RAPID AUTO (Rigaku, ????)'
_computing_data_reduction        'RAPID AUTO'
_computing_molecular_graphics    'CrystalStructure 4.0'
_computing_publication_material  'CrystalStructure 4.0 (Rigaku, 2010)'
_computing_structure_refinement  'SHELXL-2014 (Sheldrick, 2014)'
_computing_structure_solution    'SHELXS97 (Sheldrick, 2008)'
_diffrn_ambient_temperature      123(2)
_diffrn_detector_area_resol_mean 10.000
_diffrn_measured_fraction_theta_full 0.981
_diffrn_measured_fraction_theta_max 0.981
_diffrn_measurement_device_type  'Rigaku R-AXIS RAPID'
_diffrn_measurement_method       \w
_diffrn_radiation_type           MoK\a
_diffrn_radiation_wavelength     0.71075
_diffrn_reflns_av_R_equivalents  0.0567
_diffrn_reflns_av_unetI/netI     0.0995
_diffrn_reflns_Laue_measured_fraction_full 0.981
_diffrn_reflns_Laue_measured_fraction_max 0.981
_diffrn_reflns_limit_h_max       23
_diffrn_reflns_limit_h_min       -23
_diffrn_reflns_limit_k_max       25
_diffrn_reflns_limit_k_min       -26
_diffrn_reflns_limit_l_max       26
_diffrn_reflns_limit_l_min       -26
_diffrn_reflns_number            61706
_diffrn_reflns_point_group_measured_fraction_full 0.981
_diffrn_reflns_point_group_measured_fraction_max 0.981
_diffrn_reflns_theta_full        25.242
_diffrn_reflns_theta_max         25.351
_diffrn_reflns_theta_min         3.019
_diffrn_source                   'fine-focus sealed tube'
_exptl_absorpt_coefficient_mu    1.123
_exptl_absorpt_correction_T_max  0.9459
_exptl_absorpt_correction_T_min  0.7981
_exptl_absorpt_correction_type   multi-scan
_exptl_absorpt_process_details   'ABSCOR (Rigaku, 1995)'
_exptl_crystal_colour            yellow
_exptl_crystal_density_diffrn    1.556
_exptl_crystal_density_method    'not measured'
_exptl_crystal_description       block
_exptl_crystal_F_000             3952
_exptl_crystal_size_max          0.210
_exptl_crystal_size_mid          0.120
_exptl_crystal_size_min          0.050
_platon_squeeze_details
;
The cell contains 4 diethyl ether molecules which have been
treated as a diffuse contribution to the overall scattering without
specific atom positions by SQUEEZE/PLATON.
TITL shelxl    P -1         R = 0.09
CELL   19.4381   21.7533   22.0547     86.87     84.95     66.93
SPGR P-1
Q101 0.345 0.945 0.415 !       3.48 eA-3
Q102 0.578 0.132 0.510 !       3.44 eA-3
Q103 0.509 0.774 0.571 !       3.27 eA-3
Q104 0.415 0.313 0.351 !       2.97 eA-3
Q105 0.741 0.953 0.657 !       2.81 eA-3
Q106 0.815 0.429 0.890 !       2.71 eA-3
Q107 0.333 0.399 0.273 !       2.58 eA-3
Q108 0.172 0.132 0.265 !       2.48 eA-3
Q109 0.256 0.483 0.196 !       2.43 eA-3
Q110 0.300 0.993 0.344 !       2.36 eA-3
Q111 0.464 0.822 0.501 !       2.14 eA-3
Q112 0.546 0.728 0.571 !       2.10 eA-3
Q113 0.784 0.923 0.734 !       2.06 eA-3
Q114 0.303 0.453 0.274 !       2.02 eA-3
Q115 0.625 0.088 0.571 !       2.02 eA-3
Q116 0.849 0.389 0.906 !       1.94 eA-3
Q117 0.620 0.642 0.648 !       1.93 eA-3
Q118 0.898 0.358 0.984 !       1.79 eA-3
Q119 0.301 0.952 0.380 !       1.72 eA-3
Q120 0.225 0.531 0.188 !       1.70 eA-3
Q121 0.254 0.437 0.227 !       1.69 eA-3
Q122 0.781 0.967 0.702 !       1.65 eA-3
Q123 0.378 0.860 0.453 !       1.63 eA-3
Q124 0.535 0.226 0.472 !       1.56 eA-3
C125 0.640 0.126 0.055 !       1.56 eA-3
Q126 0.881 0.814 0.805 !       1.55 eA-3
Q127 0.916 0.792 0.828 !       1.53 eA-3
Q128 0.813 0.483 0.868 !       1.52 eA-3
Q129 0.333 0.351 0.304 !       1.47 eA-3
Q130 0.499 0.173 0.451 !       1.47 eA-3
Q131 0.898 0.407 0.955 !       1.46 eA-3
Q132 0.750 0.766 0.109 !       1.44 eA-3
Q133 0.664 0.994 0.601 !       1.43 eA-3
Q134 0.415 0.923 0.469 !       1.38 eA-3
Q135 0.302 0.500 0.234 !       1.34 eA-3
Q136 0.124 0.118 0.220 !       1.34 eA-3
Q137 0.258 0.103 0.312 !       1.30 eA-3
C138 0.778 0.374 0.516 !       1.30 eA-3
Q139 0.583 0.743 0.615 !       1.29 eA-3
C140 0.877 0.399 0.639 !       1.26 eA-3
Q141 0.234 0.579 0.140 !       1.26 eA-3
C142 0.707 0.092 0.134 !       1.25 eA-3
C143 0.784 0.361 0.397 !       1.24 eA-3
Q144 0.291 0.421 0.311 !       1.24 eA-3
C145 0.231 0.680 0.540 !       1.23 eA-3
Q146 0.613 0.680 0.595 !       1.23 eA-3
C147 0.876 0.394 0.539 !       1.23 eA-3
C148 0.615 0.093 0.040 !       1.22 eA-3
C149 0.630 0.178 0.077 !       1.21 eA-3
Q150 0.614 0.493 0.110 !       1.21 eA-3
C151 0.593 0.641 0.931 !       1.20 eA-3
Q152 0.936 0.296 0.000 !       1.19 eA-3
Q153 0.548 0.680 0.608 !       1.19 eA-3
Q154 0.810 0.893 0.703 !       1.17 eA-3
C155 0.790 0.287 0.524 !       1.15 eA-3
Q156 0.395 0.392 0.266 !       1.15 eA-3
C157 0.797 0.314 0.469 !       1.15 eA-3
C158 0.290 0.642 0.500 !       1.15 eA-3
Q159 0.826 0.802 0.765 !       1.15 eA-3
Q160 0.192 0.062 0.327 !       1.15 eA-3
C161 0.829 0.328 0.436 !       1.14 eA-3
Q162 0.561 0.133 0.562 !       1.14 eA-3
C163 0.090 0.609 0.351 !       1.14 eA-3
Q164 0.755 0.296 0.338 !       1.13 eA-3
Q165 0.765 0.384 0.352 !       1.13 eA-3
C166 0.836 0.367 0.531 !       1.12 eA-3
Q167 0.098 0.109 0.179 !       1.11 eA-3
C168 0.210 0.618 0.533 !       1.11 eA-3
C169 0.852 0.352 0.399 !       1.10 eA-3
Q170 0.439 0.796 0.562 !       1.10 eA-3
C171 0.939 0.670 0.516 !       1.10 eA-3
Q172 0.616 0.399 0.064 !       1.09 eA-3
C173 0.231 0.664 0.493 !       1.09 eA-3
Q174 0.411 0.429 0.959 !       1.09 eA-3
C175 0.393 0.915 0.985 !       1.09 eA-3
C176 0.360 0.782 0.928 !       1.09 eA-3
C177 0.138 0.750 0.483 !       1.09 eA-3
Q178 0.308 0.431 0.241 !       1.09 eA-3
Q179 0.332 0.626 0.843 !       1.09 eA-3
C180 0.947 0.599 0.554 !       1.08 eA-3
C181 0.195 0.679 0.586 !       1.08 eA-3
C182 0.135 0.726 0.522 !       1.08 eA-3
Q183 0.692 0.509 0.771 !       1.08 eA-3
C184 0.106 0.554 0.375 !       1.08 eA-3
C185 0.450 0.820 0.053 !       1.07 eA-3
C186 0.196 0.726 0.515 !       1.07 eA-3
C187 0.890 0.524 0.623 !       1.07 eA-3
Q188 0.482 0.190 0.475 !       1.07 eA-3
Q189 0.602 0.619 0.709 !       1.06 eA-3
C190 0.436 0.365 0.050 !       1.06 eA-3
C191 0.183 0.670 0.515 !       1.05 eA-3
Q192 0.446 0.898 0.446 !       1.05 eA-3
C193 0.906 0.775 0.475 !       1.05 eA-3
Q194 0.814 0.875 0.798 !       1.05 eA-3
C195 0.842 0.415 0.661 !       1.04 eA-3
Q196 0.766 0.804 0.124 !       1.04 eA-3
Q197 0.355 0.873 0.477 !       1.04 eA-3
C198 0.559 0.673 0.843 !       1.03 eA-3
C199 0.125 0.772 0.564 !       1.03 eA-3
;
_refine_diff_density_max         2.987
_refine_diff_density_min         -1.669
_refine_diff_density_rms         0.169
_refine_ls_extinction_coef       .
_refine_ls_extinction_method     none
_refine_ls_goodness_of_fit_ref   0.878
_refine_ls_hydrogen_treatment    constr
_refine_ls_matrix_type           full
_refine_ls_number_parameters     1825
_refine_ls_number_reflns         30707
_refine_ls_number_restraints     505
_refine_ls_restrained_S_all      0.880
_refine_ls_R_factor_all          0.1524
_refine_ls_R_factor_gt           0.0878
_refine_ls_shift/su_max          0.001
_refine_ls_shift/su_mean         0.000
_refine_ls_structure_factor_coef Fsqd
_refine_ls_weighting_details
'w=1/[\s^2^(Fo^2^)+(0.1488P)^2^] where P=(Fo^2^+2Fc^2^)/3'
_refine_ls_weighting_scheme      calc
_refine_ls_wR_factor_gt          0.2325
_refine_ls_wR_factor_ref         0.2673
_reflns_Friedel_coverage         0.000
_reflns_Friedel_fraction_full    .
_reflns_Friedel_fraction_max     .
_reflns_number_gt                12546
_reflns_number_total             30707
_reflns_threshold_expression     'I > 2\s(I)'
_cod_data_source_file            ncomms7742-s3.cif
_cod_data_source_block           2
_cod_database_code               1548303
_shelx_estimated_absorpt_t_min   0.798
_shelx_estimated_absorpt_t_max   0.946
_shelxl_version_number           2014-1
_shelx_res_checksum              44976
_shelx_hkl_checksum              98835
_shelx_fab_checksum              32613