// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/DReichLab[P]adna/hts.c
// Function: update_loff
static void update_loff(hts_idx_t *idx, int i, int free_lidx)
{
	bidx_t *bidx = idx->bidx[i];
	lidx_t *lidx = &idx->lidx[i];
	khint_t k;
	int l;
	uint64_t offset0 = 0;
	if (bidx) {
		k = kh_get(bin, bidx, idx->n_bins + 1);
		if (k != kh_end(bidx))
			offset0 = kh_val(bidx, k).list[0].u;
		for (l = 0; l < lidx->n && lidx->offset[l] == (uint64_t)-1; ++l)
			lidx->offset[l] = offset0;
	} else l = 1;
	for (; l < lidx->n; ++l) // fill missing values
		if (lidx->offset[l] == (uint64_t)-1)
			lidx->offset[l] = lidx->offset[l-1];
	if (bidx == 0) return;
	for (k = kh_begin(bidx); k != kh_end(bidx); ++k) // set loff
		if (kh_exist(bidx, k))
			kh_val(bidx, k).loff = kh_key(bidx, k) < idx->n_bins? lidx->offset[hts_bin_bot(kh_key(bidx, k), idx->n_lvls)] : 0;
	if (free_lidx) {
		free(lidx->offset);
		lidx->m = lidx->n = 0;
		lidx->offset = 0;
	}
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x50, %rsp
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movl %esi, -0xc(%rbp)
movl %edx, -0x10(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x28(%rax), %rax
movslq -0xc(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, -0x18(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x30(%rax), %rax
movslq -0xc(%rbp), %rcx
shlq $0x4, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x20(%rbp)
movq $0x0, -0x30(%rbp)
cmpq $0x0, -0x18(%rbp)
je 0x8d06
movq -0x18(%rbp), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0xc(%rax), %esi
addl $0x1, %esi
callq 0xb090
movl %eax, -0x24(%rbp)
movl -0x24(%rbp), %eax
movq -0x18(%rbp), %rcx
cmpl (%rcx), %eax
je 0x8cae
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movl -0x24(%rbp), %ecx
imulq $0x18, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq (%rax), %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movl $0x0, -0x28(%rbp)
movl -0x28(%rbp), %ecx
movq -0x20(%rbp), %rdx
xorl %eax, %eax
cmpl (%rdx), %ecx
movb %al, -0x31(%rbp)
jge 0x8cdc
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movslq -0x28(%rbp), %rcx
cmpq $-0x1, (%rax,%rcx,8)
sete %al
movb %al, -0x31(%rbp)
movb -0x31(%rbp), %al
testb $0x1, %al
jne 0x8ce5
jmp 0x8d04
movq -0x30(%rbp), %rdx
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movslq -0x28(%rbp), %rcx
movq %rdx, (%rax,%rcx,8)
movl -0x28(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
jmp 0x8cb5
jmp 0x8d0d
movl $0x1, -0x28(%rbp)
jmp 0x8d0f
movl -0x28(%rbp), %eax
movq -0x20(%rbp), %rcx
cmpl (%rcx), %eax
jge 0x8d5f
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movslq -0x28(%rbp), %rcx
cmpq $-0x1, (%rax,%rcx,8)
jne 0x8d52
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movl -0x28(%rbp), %ecx
subl $0x1, %ecx
movslq %ecx, %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rdx
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movslq -0x28(%rbp), %rcx
movq %rdx, (%rax,%rcx,8)
jmp 0x8d54
movl -0x28(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
jmp 0x8d0f
cmpq $0x0, -0x18(%rbp)
jne 0x8d6b
jmp 0x8e5c
movl $0x0, -0x24(%rbp)
movl -0x24(%rbp), %eax
movq -0x18(%rbp), %rcx
cmpl (%rcx), %eax
je 0x8e28
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movl -0x24(%rbp), %ecx
shrl $0x4, %ecx
movl %ecx, %ecx
movl (%rax,%rcx,4), %eax
movl -0x24(%rbp), %ecx
andl $0xf, %ecx
shll %ecx
shrl %cl, %eax
andl $0x3, %eax
cmpl $0x0, %eax
jne 0x8e18
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movl -0x24(%rbp), %ecx
movl (%rax,%rcx,4), %eax
movq -0x8(%rbp), %rcx
cmpl 0xc(%rcx), %eax
jae 0x8df6
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movl -0x24(%rbp), %ecx
movl (%rax,%rcx,4), %edi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x8(%rax), %esi
callq 0xc430
movl %eax, %ecx
movq -0x48(%rbp), %rax
movslq %ecx, %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
jmp 0x8dfe
xorl %eax, %eax
movq %rax, -0x40(%rbp)
jmp 0x8dfe
movq -0x40(%rbp), %rcx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movl -0x24(%rbp), %edx
imulq $0x18, %rdx, %rdx
addq %rdx, %rax
movq %rcx, 0x8(%rax)
jmp 0x8e1a
movl -0x24(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x24(%rbp)
jmp 0x8d72
cmpl $0x0, -0x10(%rbp)
je 0x8e5c
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdi
callq 0x2040
movq -0x20(%rbp), %rax
movl $0x0, (%rax)
movq -0x20(%rbp), %rax
movl $0x0, 0x4(%rax)
movq -0x20(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
addq $0x50, %rsp
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)