// File: myudelson[P]hmm-scalable/HMMProblemAGK.cpp
// Function: HMMProblemAGK::toFile(char const*)
void HMMProblemAGK::toFile(const char *filename) {
	FILE *fid = fopen(filename,"w");
	if(fid == NULL) {
		fprintf(stderr,"Can't write output model file %s\n",filename);
		exit(1);
	}
    
    // write solved id
    writeSolverInfo(fid, this->p);
    
	fprintf(fid,"Null skill ratios\t");
	for(NPAR m=0; m<this->p->nO; m++)
		fprintf(fid," %12.10f%s",this->null_obs_ratio[m],(m==(this->p->nO-1))?"\n":"\t");
	NCAT k, g;
    NPAR i,j,m;
	std::map<NCAT,std::string>::iterator it;
	for(g=0;g<this->p->nG; g++) {
		it = this->p->map_group_bwd->find(g);
		fprintf(fid,"%d\t%s\n",g,it->second.c_str());
		fprintf(fid,"Ag\t");
		for(i=0; i<this->p->nS; i++)
			for(j=0; j<this->p->nS; j++)
				fprintf(fid,"%12.10f%s",this->Ag[g][i][j],(i==(this->p->nS-1) && j==(this->p->nS-1))?"\n":"\t");
    }
	for(k=0;k<this->p->nK;k++) {
		it = this->p->map_skill_bwd->find(k);
		fprintf(fid,"%d\t%s\n",k,it->second.c_str());
		fprintf(fid,"PI\t");
		for(i=0; i<this->p->nS; i++)
			fprintf(fid,"%12.10f%s",this->pi[k][i],(i==(this->p->nS-1))?"\n":"\t");
		fprintf(fid,"Ak\t");
		for(i=0; i<this->p->nS; i++)
			for(j=0; j<this->p->nS; j++)
				fprintf(fid,"%12.10f%s",this->A[k][i][j],(i==(this->p->nS-1) && j==(this->p->nS-1))?"\n":"\t");
		fprintf(fid,"B\t");
		for(i=0; i<this->p->nS; i++)
			for(m=0; m<this->p->nO; m++)
				fprintf(fid,"%12.10f%s",this->B[k][i][m],(i==(this->p->nS-1) && m==(this->p->nO-1))?"\n":"\t");
	}
	fclose(fid);
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0xe0, %rsp
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movq %rsi, -0x10(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x10(%rbp), %rdi
leaq 0x21964(%rip), %rsi     # 0x5058a
callq 0x5370
movq %rax, -0x18(%rbp)
cmpq $0x0, -0x18(%rbp)
jne 0x2ec5c
movq 0x2c39b(%rip), %rax     # 0x5afd8
movq (%rax), %rdi
movq -0x10(%rbp), %rdx
leaq 0x21941(%rip), %rsi     # 0x5058c
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movl $0x1, %edi
callq 0x5390
movq -0x48(%rbp), %rax
movq -0x18(%rbp), %rdi
movq 0x88(%rax), %rsi
callq 0xbc70
movq -0x18(%rbp), %rdi
leaq 0x21933(%rip), %rsi     # 0x505ae
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movb $0x0, -0x19(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x19(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b9(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2ed1a
movq -0x48(%rbp), %rcx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq 0x18(%rcx), %rax
movsbq -0x19(%rbp), %rdx
movsd (%rax,%rdx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x50(%rbp)
movsbl -0x19(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b9(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2ece5
leaq 0x20cc6(%rip), %rax     # 0x4f9a5
movq %rax, -0x60(%rbp)
jmp 0x2ecf2
leaq 0x21f8e(%rip), %rax     # 0x50c7a
movq %rax, -0x60(%rbp)
jmp 0x2ecf2
movsd -0x50(%rbp), %xmm0
movq -0x58(%rbp), %rdi
movq -0x60(%rbp), %rdx
leaq 0x21c5c(%rip), %rsi     # 0x50962
movb $0x1, %al
callq 0x5440
movb -0x19(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x19(%rbp)
jmp 0x2ec86
leaq -0x30(%rbp), %rdi
callq 0x170b0
movl $0x0, -0x24(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movl -0x24(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
cmpl 0x8bc(%rcx), %eax
jge 0x2eecf
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x88(%rax), %rax
movq 0x928(%rax), %rdi
leaq -0x24(%rbp), %rsi
callq 0x27d20
movq %rax, -0x38(%rbp)
movq -0x38(%rbp), %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0x70(%rbp)
movl -0x24(%rbp), %eax
movl %eax, -0x64(%rbp)
leaq -0x30(%rbp), %rdi
callq 0x17160
movq %rax, %rdi
addq $0x8, %rdi
callq 0x5110
movq -0x70(%rbp), %rdi
movl -0x64(%rbp), %edx
movq %rax, %rcx
leaq 0x2182c(%rip), %rsi     # 0x505cb
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movq -0x18(%rbp), %rdi
leaq 0x21d2b(%rip), %rsi     # 0x50adc
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movb $0x0, -0x25(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2eebf
movb $0x0, -0x26(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x26(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2eeb0
movq -0x48(%rbp), %rcx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0x80(%rbp)
movq 0x90(%rcx), %rax
movslq -0x24(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
movsbq -0x25(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
movsbq -0x26(%rbp), %rdx
movsd (%rax,%rdx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x78(%rbp)
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2ee75
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x26(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2ee75
leaq 0x20b39(%rip), %rax     # 0x4f9a5
movq %rax, -0x88(%rbp)
jmp 0x2ee85
leaq 0x21dfe(%rip), %rax     # 0x50c7a
movq %rax, -0x88(%rbp)
jmp 0x2ee85
movsd -0x78(%rbp), %xmm0
movq -0x80(%rbp), %rdi
movq -0x88(%rbp), %rdx
leaq 0x21ac7(%rip), %rsi     # 0x50963
movb $0x1, %al
callq 0x5440
movb -0x26(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x26(%rbp)
jmp 0x2edde
jmp 0x2eeb2
movb -0x25(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x25(%rbp)
jmp 0x2edbc
jmp 0x2eec1
movl -0x24(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x24(%rbp)
jmp 0x2ed2a
movl $0x0, -0x20(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movl -0x20(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
cmpl 0x8c0(%rcx), %eax
jge 0x2f27d
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x88(%rax), %rax
movq 0x948(%rax), %rdi
leaq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x27d20
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0x98(%rbp)
movl -0x20(%rbp), %eax
movl %eax, -0x8c(%rbp)
leaq -0x30(%rbp), %rdi
callq 0x17160
movq %rax, %rdi
addq $0x8, %rdi
callq 0x5110
movq -0x98(%rbp), %rdi
movl -0x8c(%rbp), %edx
movq %rax, %rcx
leaq 0x21674(%rip), %rsi     # 0x505cb
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movq -0x18(%rbp), %rdi
leaq 0x21669(%rip), %rsi     # 0x505d2
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movb $0x0, -0x25(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2f029
movq -0x48(%rbp), %rcx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0xa8(%rbp)
movq 0x38(%rcx), %rax
movslq -0x20(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
movsbq -0x25(%rbp), %rdx
movsd (%rax,%rdx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0xa0(%rbp)
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2efe8
leaq 0x209c6(%rip), %rax     # 0x4f9a5
movq %rax, -0xb0(%rbp)
jmp 0x2eff8
leaq 0x21c8b(%rip), %rax     # 0x50c7a
movq %rax, -0xb0(%rbp)
jmp 0x2eff8
movsd -0xa0(%rbp), %xmm0
movq -0xa8(%rbp), %rdi
movq -0xb0(%rbp), %rdx
leaq 0x2194e(%rip), %rsi     # 0x50963
movb $0x1, %al
callq 0x5440
movb -0x25(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x25(%rbp)
jmp 0x2ef74
movq -0x18(%rbp), %rdi
leaq 0x21aac(%rip), %rsi     # 0x50ae0
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movb $0x0, -0x25(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2f14b
movb $0x0, -0x26(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x26(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2f13c
movq -0x48(%rbp), %rcx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0xc0(%rbp)
movq 0x40(%rcx), %rax
movslq -0x20(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
movsbq -0x25(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
movsbq -0x26(%rbp), %rdx
movsd (%rax,%rdx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0xb8(%rbp)
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2f0fb
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x26(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2f0fb
leaq 0x208b3(%rip), %rax     # 0x4f9a5
movq %rax, -0xc8(%rbp)
jmp 0x2f10b
leaq 0x21b78(%rip), %rax     # 0x50c7a
movq %rax, -0xc8(%rbp)
jmp 0x2f10b
movsd -0xb8(%rbp), %xmm0
movq -0xc0(%rbp), %rdi
movq -0xc8(%rbp), %rdx
leaq 0x2183b(%rip), %rsi     # 0x50963
movb $0x1, %al
callq 0x5440
movb -0x26(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x26(%rbp)
jmp 0x2f061
jmp 0x2f13e
movb -0x25(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x25(%rbp)
jmp 0x2f03f
movq -0x18(%rbp), %rdi
leaq 0x21483(%rip), %rsi     # 0x505d9
movb $0x0, %al
callq 0x5440
movb $0x0, -0x25(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2f26d
movb $0x0, -0x27(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x27(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b9(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x2f25e
movq -0x48(%rbp), %rcx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0xd8(%rbp)
movq 0x48(%rcx), %rax
movslq -0x20(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
movsbq -0x25(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
movsbq -0x27(%rbp), %rdx
movsd (%rax,%rdx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0xd0(%rbp)
movsbl -0x25(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2f21d
movq -0x48(%rbp), %rcx
movsbl -0x27(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b9(%rcx), %ecx
subl $0x1, %ecx
cmpl %ecx, %eax
jne 0x2f21d
leaq 0x20791(%rip), %rax     # 0x4f9a5
movq %rax, -0xe0(%rbp)
jmp 0x2f22d
leaq 0x21a56(%rip), %rax     # 0x50c7a
movq %rax, -0xe0(%rbp)
jmp 0x2f22d
movsd -0xd0(%rbp), %xmm0
movq -0xd8(%rbp), %rdi
movq -0xe0(%rbp), %rdx
leaq 0x21719(%rip), %rsi     # 0x50963
movb $0x1, %al
callq 0x5440
movb -0x27(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x27(%rbp)
jmp 0x2f183
jmp 0x2f260
movb -0x25(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x25(%rbp)
jmp 0x2f161
jmp 0x2f26f
movl -0x20(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x20(%rbp)
jmp 0x2eed6
movq -0x18(%rbp), %rdi
callq 0x52c0
addq $0xe0, %rsp
popq %rbp
retq
nop