// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/genometools[P]genometools/src/extended/squarealign.c
// Function: evaluate_crosspoints_from_2dimtab
static void evaluate_crosspoints_from_2dimtab(
                                       GtUword **E,
                                       GtUword *Ctab,
                                       const GtScoreHandler *scorehandler,
                                       const GtUchar *useq,
                                       GtUword ustart,
                                       GtUword ulen,
                                       const GtUchar *vseq,
                                       GtUword vstart,
                                       GtUword vlen,
                                       GtUword rowoffset)

{
  GtUword gapcost, idx, jdx;

  gt_assert(E && Ctab);
  gapcost = gt_scorehandler_get_gapscore(scorehandler);
  idx = ulen;
  jdx = vlen;
  while (jdx > 1 || idx > 0)
  {
    if (idx > 0 && jdx > 0 && E[idx][jdx] == E[idx-1][jdx-1] +
                                   gt_scorehandler_get_replacement(scorehandler,
                                                             useq[ustart+idx-1],
                                                            vseq[vstart+jdx-1]))
    {
      idx--;
      jdx--;
      Ctab[jdx] = idx + rowoffset;
    }
    else if (idx > 0 && E[idx][jdx] == E[idx-1][jdx] + gapcost)
    {
      idx--;
      /*continue*/
    }
    else if (jdx > 0 && E[idx][jdx] == E[idx][jdx-1] + gapcost)
    {
      jdx--;
      Ctab[jdx] = idx + rowoffset;
    }
    else
      gt_assert(false);
  }
}

// Assembly:
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