// File: myudelson[P]hmm-scalable/HMMProblem.cpp
// Function: HMMProblem::setGradB(FitBit*)
void HMMProblem::setGradB (FitBit *fb){
    if(this->p->block_fitting[2]>0) return;
    NDAT t, ndat = 0;
	NPAR o, o0, i;//, j;
    struct data* dt;
    for(NCAT x=0; x<fb->xndat; x++) {
        dt = fb->x_data[x];
        if( dt->cnt!=0 ) continue;
        ndat += dt->n;
//        for(t=0; t<dt->n; t++) { // old
        for(t=0; t<dt->n; t++) { // Levinson MMFST
            o  = this->p->dat_obs[ dt->ix[t] ];//->get( dt->ix[t] );
            o0 = this->p->dat_obs[ dt->ix[0] ];//->get( dt->ix[t] );
            if(o<0) // if no observation -- skip
                continue;
            for(i=0; i<this->p->nS; i++)
                fb->gradB[i][o] -= dt->alpha[t][i] * dt->beta[t][i] / safe0num(dt->p_O_param * fb->B[i][o]); // old
//            for(j=0; j<this->p->nS; j++)
//                if(t==0) {
//                    fb->gradB[j][o] -= (o0==o) * fb->pi[j] * dt->beta[0][j];
//                } else {
//                    for(i=0; i<this->p->nS; i++)
//                        fb->gradB[j][o] -= ( dt->alpha[t-1][i] * fb->A[i][j] * dt->beta[t][j] /*+ (o0==o) * getPI(dt,j) * dt->beta[0][j]*/ ) / safe0num(dt->p_O_param); // Levinson MMFST
//                }
        }
    }
    if( this->p->Cslices>0 ) // penalty
        fb->addL2Penalty(FBV_B, this->p, (NUMBER)ndat);
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x40, %rsp
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movq %rsi, -0x10(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rax, -0x38(%rbp)
movq 0x88(%rax), %rax
movsbl 0x983(%rax), %eax
cmpl $0x0, %eax
jle 0x1c1d0
jmp 0x1c39e
movl $0x0, -0x18(%rbp)
movl $0x0, -0x2c(%rbp)
movl -0x2c(%rbp), %eax
movq -0x10(%rbp), %rcx
cmpl 0xe8(%rcx), %eax
jge 0x1c36c
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0xf0(%rax), %rax
movslq -0x2c(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, -0x28(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
cmpl $0x0, 0x4(%rax)
je 0x1c217
jmp 0x1c35e
movq -0x28(%rbp), %rax
movl (%rax), %eax
addl -0x18(%rbp), %eax
movl %eax, -0x18(%rbp)
movl $0x0, -0x14(%rbp)
movl -0x14(%rbp), %eax
movq -0x28(%rbp), %rcx
cmpl (%rcx), %eax
jge 0x1c35c
movq -0x38(%rbp), %rax
movq 0x88(%rax), %rcx
movq 0x870(%rcx), %rcx
movq -0x28(%rbp), %rdx
movq 0x10(%rdx), %rdx
movslq -0x14(%rbp), %rsi
movslq (%rdx,%rsi,4), %rdx
movb (%rcx,%rdx), %cl
movb %cl, -0x19(%rbp)
movq 0x88(%rax), %rax
movq 0x870(%rax), %rax
movq -0x28(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movslq (%rcx), %rcx
movb (%rax,%rcx), %al
movb %al, -0x1a(%rbp)
movsbl -0x19(%rbp), %eax
cmpl $0x0, %eax
jge 0x1c28e
jmp 0x1c34e
movb $0x0, -0x1b(%rbp)
movq -0x38(%rbp), %rcx
movsbl -0x1b(%rbp), %eax
movq 0x88(%rcx), %rcx
movsbl 0x8b8(%rcx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x1c34c
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x28(%rax), %rax
movslq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x1b(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x30(%rax), %rax
movslq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x1b(%rbp), %rcx
mulsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x40(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movsd 0x48(%rax), %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movsbq -0x1b(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x19(%rbp), %rcx
mulsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
callq 0x9a40
movsd -0x40(%rbp), %xmm1
divsd %xmm0, %xmm1
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x68(%rax), %rax
movsbq -0x1b(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x19(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
subsd %xmm1, %xmm0
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movb -0x1b(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x1b(%rbp)
jmp 0x1c292
jmp 0x1c34e
movl -0x14(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x14(%rbp)
jmp 0x1c22a
jmp 0x1c35e
movl -0x2c(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x2c(%rbp)
jmp 0x1c1de
movq -0x38(%rbp), %rax
movq 0x88(%rax), %rax
movsbl 0x42(%rax), %eax
cmpl $0x0, %eax
jle 0x1c39e
movq -0x38(%rbp), %rax
movq -0x10(%rbp), %rdi
movq 0x88(%rax), %rdx
cvtsi2sdl -0x18(%rbp), %xmm0
movl $0x3, %esi
callq 0xf200
addq $0x40, %rsp
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)