// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/genometools[P]genometools/src/match/reads2twobit.c
// Function: gt_reads2twobit_process_sequence_line
static inline void gt_reads2twobit_process_sequence_line(
    GtReads2TwobitEncodeState *state, const char *line)
{
  GtUword j = 0;
  GtTwobitencoding nextcode;
  char c;
  while (true)
  {
    c = line[j++];
    if (!state->invalid_mode && (nextcode = state->char2code[(unsigned char)c])
        != GT_READS2TWOBIT_CODE_UNDEF)
    {
      if (!state->use_rle)
      {
        GT_READS2TWOBIT_WRITECODE(state->current, nextcode, state->seqlen);
      }
      else
      {
        if (nextcode != state->prevcode)
        {
          if (state->seqlen > 0)
          {
            gt_assert(state->current.globalpos > 0);
            gt_hplstore_set(state->hplengths, state->current.globalpos - 1UL,
                state->hplength);
            state->hsum += state->hplength;
            state->nofh++;
            state->hplength = 0;
          }
          GT_READS2TWOBIT_WRITECODE(state->current, nextcode, state->seqlen);
          state->prevcode = nextcode;
        }
        else
        {
          state->hplength += 1;
        }
      }
      state->exp_qlen++;
    }
    else
    {
      if (c == '\0')
        break;
      if (!isspace(c))
      {
        if (!state->invalid_mode)
          gt_reads2twobit_switch_to_invalid_mode(state);
        state->invalid_total_length++;
        state->seqlen++;
        state->exp_qlen++;
      }
    }
  }
}

// Assembly:
subq $0x28, %rsp
movq %rdi, 0x20(%rsp)
movq %rsi, 0x18(%rsp)
movq $0x0, 0x10(%rsp)
movq 0x18(%rsp), %rax
movq 0x10(%rsp), %rcx
movq %rcx, %rdx
addq $0x1, %rdx
movq %rdx, 0x10(%rsp)
movb (%rax,%rcx), %al
movb %al, 0x7(%rsp)
movq 0x20(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x8f1(%rax)
jne 0x2a60fc
movq 0x20(%rsp), %rax
movzbl 0x7(%rsp), %ecx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, 0x8(%rsp)
cmpq $-0x1, %rax
je 0x2a60fc
movq 0x20(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x960(%rax)
jne 0x2a5efd
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x808(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x808(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x858(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x858(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x828(%rax), %rcx
shlq $0x2, %rcx
orq 0x8(%rsp), %rcx
movq 0x20(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x828(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rcx
movw 0x830(%rcx), %ax
addw $0x1, %ax
movw %ax, 0x830(%rcx)
movzwl %ax, %eax
cmpl $0x20, %eax
jne 0x2a5eda
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x828(%rax), %rcx
movq 0x20(%rsp), %rdx
movq 0x820(%rdx), %rax
movq %rax, %rsi
addq $0x8, %rsi
movq %rsi, 0x820(%rdx)
movq %rcx, (%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movw $0x0, 0x830(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x828(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x8(%rsp), %rcx
movq 0x838(%rax,%rcx,8), %rdx
addq $0x1, %rdx
movq %rdx, 0x838(%rax,%rcx,8)
jmp 0x2a60e0
movq 0x8(%rsp), %rax
movq 0x20(%rsp), %rcx
cmpq 0x968(%rcx), %rax
je 0x2a60c9
movq 0x20(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x808(%rax)
jbe 0x2a5fe3
jmp 0x2a5f29
movq 0x20(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x858(%rax)
ja 0x2a5f70
movq 0x396061(%rip), %rax    # 0x63bfa0
movq (%rax), %rdi
leaq 0x2700ca(%rip), %rsi    # 0x516013
leaq 0x2df87a(%rip), %rdx    # 0x5857ca
leaq 0x2df890(%rip), %rcx    # 0x5857e7
leaq 0x2df052(%rip), %r8     # 0x584fb0
movl $0x260, %r9d            # imm = 0x260
movb $0x0, %al
callq 0x199f0
callq 0x19370
jmp 0x2a5f72
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x970(%rax), %rdi
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x858(%rax), %rsi
subq $0x1, %rsi
movq 0x20(%rsp), %rax
movzbl 0x978(%rax), %edx
callq 0x4d1440
movq 0x20(%rsp), %rax
movzbl 0x978(%rax), %eax
movl %eax, %ecx
movq 0x20(%rsp), %rax
addq 0x980(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x980(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x988(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x988(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movb $0x0, 0x978(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x808(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x808(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x858(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x858(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x828(%rax), %rcx
shlq $0x2, %rcx
orq 0x8(%rsp), %rcx
movq 0x20(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x828(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rcx
movw 0x830(%rcx), %ax
addw $0x1, %ax
movw %ax, 0x830(%rcx)
movzwl %ax, %eax
cmpl $0x20, %eax
jne 0x2a6098
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x828(%rax), %rcx
movq 0x20(%rsp), %rdx
movq 0x820(%rdx), %rax
movq %rax, %rsi
addq $0x8, %rsi
movq %rsi, 0x820(%rdx)
movq %rcx, (%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movw $0x0, 0x830(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x828(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x8(%rsp), %rcx
movq 0x838(%rax,%rcx,8), %rdx
addq $0x1, %rdx
movq %rdx, 0x838(%rax,%rcx,8)
movq 0x8(%rsp), %rcx
movq 0x20(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x968(%rax)
jmp 0x2a60de
movq 0x20(%rsp), %rax
movzbl 0x978(%rax), %ecx
addl $0x1, %ecx
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jmp 0x2a60e0
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x818(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
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jmp 0x2a6188
movsbl 0x7(%rsp), %eax
cmpl $0x0, %eax
jne 0x2a610b
jmp 0x2a618d
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movq (%rax), %rax
movsbl 0x7(%rsp), %ecx
movslq %ecx, %rcx
movzwl (%rax,%rcx,2), %eax
andl $0x2000, %eax           # imm = 0x2000
cmpl $0x0, %eax
jne 0x2a6186
movq 0x20(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x8f1(%rax)
jne 0x2a6141
movq 0x20(%rsp), %rdi
callq 0x2a67c0
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x900(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x900(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x808(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x808(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x818(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x818(%rax)
jmp 0x2a6188
jmp 0x2a5dc7
addq $0x28, %rsp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)