// File: chhylp123[P]hifiasm/ecovlp.cpp
// Function: init_cns_g(cns_gfa*, char*, unsigned long, unsigned int)
void init_cns_g(cns_gfa *cns, char *s, uint64_t sl, uint32_t rid)
{
    uint32_t m0 = cns->m, m1 = sl + 2, k; cns_t *p;
    if ((*cns).m < (m1)) { ///equal to kv_resize()
        (*cns).m = (m1); 
        (--((*cns).m), ((*cns).m)|=((*cns).m)>>1, ((*cns).m)|=((*cns).m)>>2, ((*cns).m)|=((*cns).m)>>4, ((*cns).m)|=((*cns).m)>>8, ((*cns).m)|=((*cns).m)>>16, ++((*cns).m)); 
        (*cns).a = (cns_t*)realloc((*cns).a, sizeof(cns_t) * (*cns).m); 
        if((*cns).m > m0) {
            memset((*cns).a + m0, 0, sizeof(cns_t)*((*cns).m-m0));
        }
    }
    (*cns).n = 0; (*cns).si = 0; (*cns).ei = 1; (*cns).off = 2;

    p = &((*cns).a[(*cns).n++]); p->arc.nou = p->arc.n = p->c = p->f = p->sc = 0; ///beg
    p = &((*cns).a[(*cns).n++]); p->arc.nou = p->arc.n = p->c = p->f = p->sc = 0; ///end
    (*cns).bb0 = (*cns).n;

    for (k = 0; k < sl; k++) {
        p = &((*cns).a[(*cns).n++]); p->arc.nou = p->arc.n = p->f = 0;
        p->c = seq_nt6_table[(uint32_t)(s[k])]; p->sc = 1;
        
        if(k + 1 < sl) insert_cns_arc(cns, k + (*cns).off, k + 1 + (*cns).off, 1, 1, rid);

        if(k > 0) insert_cns_arc(cns, k + (*cns).off, k - 1 + (*cns).off, 0, 1, rid);
    }
    
    if(sl) {
        insert_cns_arc(cns, (*cns).si, 0 + (*cns).off, 1, 1, rid); insert_cns_arc(cns, 0 + (*cns).off, (*cns).si, 0, 1, rid);
        insert_cns_arc(cns, sl - 1 + (*cns).off, (*cns).ei, 1, 1, rid); insert_cns_arc(cns, (*cns).ei, sl - 1 + (*cns).off, 0, 1, rid);
    } else {
        insert_cns_arc(cns, (*cns).si, (*cns).ei, 1, 1, rid); 
        insert_cns_arc(cns, (*cns).ei, (*cns).si, 0, 1, rid);
    }

    // prt_cns_arc(cns, 0, __func__);
    // prt_cns_arc(cns, 1, __func__);

    (*cns).bn = (*cns).n; (*cns).bb1 = (*cns).n;
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x30, %rsp
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movq %rsi, -0x10(%rbp)
movq %rdx, -0x18(%rbp)
movl %ecx, -0x1c(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movl %eax, -0x20(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
addq $0x2, %rax
movl %eax, -0x24(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movl -0x24(%rbp), %ecx
cmpq %rcx, %rax
jae 0x24c913
movl -0x24(%rbp), %eax
movl %eax, %ecx
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
addq $-0x1, %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
shrq %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
orq 0x8(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
shrq $0x2, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
orq 0x8(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
shrq $0x4, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
orq 0x8(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
shrq $0x8, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
orq 0x8(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
shrq $0x10, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
orq 0x8(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
imulq $0x28, 0x8(%rax), %rsi
callq 0x2360
movq %rax, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movl -0x20(%rbp), %ecx
cmpq %rcx, %rax
jbe 0x24c911
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rdi
movl -0x20(%rbp), %eax
imulq $0x28, %rax, %rax
addq %rax, %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movl -0x20(%rbp), %ecx
subq %rcx, %rax
imulq $0x28, %rax, %rdx
xorl %esi, %esi
callq 0x2100
jmp 0x24c913
movq -0x8(%rbp), %rax
movq $0x0, (%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movl $0x0, 0x18(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movl $0x1, 0x1c(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movl $0x2, 0x20(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rdx
movq (%rdx), %rcx
movq %rcx, %rsi
addq $0x1, %rsi
movq %rsi, (%rdx)
imulq $0x28, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $0x7, %ecx
orl $0x0, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $-0x5, %ecx
orl $0x0, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $-0x4, %ecx
orl $0x0, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x18(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rdx
movq (%rdx), %rcx
movq %rcx, %rsi
addq $0x1, %rsi
movq %rsi, (%rdx)
imulq $0x28, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $0x7, %ecx
orl $0x0, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $-0x5, %ecx
orl $0x0, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $-0x4, %ecx
orl $0x0, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x18(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movl %eax, %ecx
movq -0x8(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x28(%rax)
movl $0x0, -0x28(%rbp)
movl -0x28(%rbp), %eax
cmpq -0x18(%rbp), %rax
jae 0x24cb2e
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rdx
movq (%rdx), %rcx
movq %rcx, %rsi
addq $0x1, %rsi
movq %rsi, (%rdx)
imulq $0x28, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $-0x5, %ecx
orl $0x0, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x18(%rax)
movq -0x10(%rbp), %rax
movl -0x28(%rbp), %ecx
movsbl (%rax,%rcx), %eax
movl %eax, %eax
movl %eax, %ecx
leaq 0x177bc1(%rip), %rax    # 0x3c4650
movzbl (%rax,%rcx), %edx
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $0x3, %edx
andl $-0x4, %ecx
orl %edx, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x30(%rbp), %rax
movl (%rax), %ecx
andl $0x7, %ecx
orl $0x8, %ecx
movl %ecx, (%rax)
movl -0x28(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, %eax
cmpq -0x18(%rbp), %rax
jae 0x24caec
movq -0x8(%rbp), %rdi
movl -0x28(%rbp), %esi
movq -0x8(%rbp), %rax
addl 0x20(%rax), %esi
movl -0x28(%rbp), %edx
addl $0x1, %edx
movq -0x8(%rbp), %rax
addl 0x20(%rax), %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
movl $0x1, %r8d
movl %r8d, %ecx
callq 0x26ca80
cmpl $0x0, -0x28(%rbp)
jbe 0x24cb1e
movq -0x8(%rbp), %rdi
movl -0x28(%rbp), %esi
movq -0x8(%rbp), %rax
addl 0x20(%rax), %esi
movl -0x28(%rbp), %edx
subl $0x1, %edx
movq -0x8(%rbp), %rax
addl 0x20(%rax), %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
xorl %ecx, %ecx
movl $0x1, %r8d
callq 0x26ca80
jmp 0x24cb20
movl -0x28(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
jmp 0x24ca22
cmpq $0x0, -0x18(%rbp)
je 0x24cbe9
movq -0x8(%rbp), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %esi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x20(%rax), %edx
addl $0x0, %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
movl $0x1, %r8d
movl %r8d, %ecx
callq 0x26ca80
movq -0x8(%rbp), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x20(%rax), %esi
addl $0x0, %esi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
xorl %ecx, %ecx
movl $0x1, %r8d
callq 0x26ca80
movq -0x8(%rbp), %rdi
movq -0x18(%rbp), %rax
subq $0x1, %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movl 0x20(%rcx), %ecx
addq %rcx, %rax
movl %eax, %esi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x1c(%rax), %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
movl $0x1, %r8d
movl %r8d, %ecx
callq 0x26ca80
movq -0x8(%rbp), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x1c(%rax), %esi
movq -0x18(%rbp), %rax
subq $0x1, %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movl 0x20(%rcx), %ecx
addq %rcx, %rax
movl %eax, %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
xorl %ecx, %ecx
movl $0x1, %r8d
callq 0x26ca80
jmp 0x24cc30
movq -0x8(%rbp), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %esi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x1c(%rax), %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
movl $0x1, %r8d
movl %r8d, %ecx
callq 0x26ca80
movq -0x8(%rbp), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x1c(%rax), %esi
movq -0x8(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %edx
movl -0x1c(%rbp), %r9d
xorl %ecx, %ecx
movl $0x1, %r8d
callq 0x26ca80
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movl %eax, %ecx
movq -0x8(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x24(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movl %eax, %ecx
movq -0x8(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x2c(%rax)
addq $0x30, %rsp
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)