// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/samtools[P]htslib/regidx.c
// Function: regidx_init
regidx_t *regidx_init(const char *fname, regidx_parse_f parser, regidx_free_f free_f, size_t payload_size, void *usr_dat)
{
    if ( !parser )
    {
        if ( !fname ) parser = regidx_parse_tab;
        else
        {
            int len = strlen(fname);
            if ( len>=7 && !strcasecmp(".bed.gz",fname+len-7) )
                parser = regidx_parse_bed;
            else if ( len>=8 && !strcasecmp(".bed.bgz",fname+len-8) )
                parser = regidx_parse_bed;
            else if ( len>=4 && !strcasecmp(".bed",fname+len-4) )
                parser = regidx_parse_bed;
            else if ( len>=4 && !strcasecmp(".vcf",fname+len-4) )
                parser = regidx_parse_vcf;
            else if ( len>=7 && !strcasecmp(".vcf.gz",fname+len-7) )
                parser = regidx_parse_vcf;
            else
                parser = regidx_parse_tab;
        }
    }

    kstring_t str = KS_INITIALIZE;
    htsFile *fp = NULL;
    int ret;
    regidx_t *idx = (regidx_t*) calloc(1,sizeof(regidx_t));
    if (!idx) return NULL;
    idx->free  = free_f;
    idx->parse = parser;
    idx->usr   = usr_dat;
    idx->seq2regs = khash_str2int_init();
    if (!idx->seq2regs) goto error;
    idx->payload_size = payload_size;
    if ( payload_size ) {
        idx->payload = malloc(payload_size);
        if (!idx->payload) goto error;
    }

    if ( !fname ) return idx;

    fp = hts_open(fname,"r");
    if ( !fp ) goto error;

    while ((ret = hts_getline(fp, KS_SEP_LINE, &str)) > 0 ) {
        if ( regidx_insert(idx, str.s) ) goto error;
    }
    if (ret < -1) goto error;

    ret = hts_close(fp);
    fp = NULL;
    if ( ret != 0 ) {
        hts_log_error("Close failed .. %s", fname);
        goto error;
    }
    ks_free(&str);
    return idx;

error:
    ks_free(&str);
    if ( fp ) hts_close(fp);
    regidx_destroy(idx);
    return NULL;
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x70, %rsp
movq %rdi, -0x10(%rbp)
movq %rsi, -0x18(%rbp)
movq %rdx, -0x20(%rbp)
movq %rcx, -0x28(%rbp)
movq %r8, -0x30(%rbp)
cmpq $0x0, -0x18(%rbp)
jne 0x2eae6
cmpq $0x0, -0x10(%rbp)
jne 0x2e9be
leaq -0x435(%rip), %rax      # 0x2e580
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x2eae4
movq -0x10(%rbp), %rdi
callq 0x41b0
movl %eax, -0x34(%rbp)
cmpl $0x7, -0x34(%rbp)
jl 0x2ea00
movq -0x10(%rbp), %rsi
movslq -0x34(%rbp), %rax
addq %rax, %rsi
addq $-0x7, %rsi
leaq 0xbec26(%rip), %rdi     # 0xed60c
callq 0x4500
cmpl $0x0, %eax
jne 0x2ea00
leaq 0x2a9(%rip), %rax       # 0x2eca0
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x2eae2
cmpl $0x8, -0x34(%rbp)
jl 0x2ea36
movq -0x10(%rbp), %rsi
movslq -0x34(%rbp), %rax
addq %rax, %rsi
addq $-0x8, %rsi
leaq 0xc26dd(%rip), %rdi     # 0xf10f9
callq 0x4500
cmpl $0x0, %eax
jne 0x2ea36
leaq 0x273(%rip), %rax       # 0x2eca0
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x2eae0
cmpl $0x4, -0x34(%rbp)
jl 0x2ea69
movq -0x10(%rbp), %rsi
movslq -0x34(%rbp), %rax
addq %rax, %rsi
addq $-0x4, %rsi
leaq 0xbebb5(%rip), %rdi     # 0xed607
callq 0x4500
cmpl $0x0, %eax
jne 0x2ea69
leaq 0x23d(%rip), %rax       # 0x2eca0
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x2eade
cmpl $0x4, -0x34(%rbp)
jl 0x2ea9c
movq -0x10(%rbp), %rsi
movslq -0x34(%rbp), %rax
addq %rax, %rsi
addq $-0x4, %rsi
leaq 0xc1bc7(%rip), %rdi     # 0xf064c
callq 0x4500
cmpl $0x0, %eax
jne 0x2ea9c
leaq 0x3fa(%rip), %rax       # 0x2ee90
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x2eadc
cmpl $0x7, -0x34(%rbp)
jl 0x2eacf
movq -0x10(%rbp), %rsi
movslq -0x34(%rbp), %rax
addq %rax, %rsi
addq $-0x7, %rsi
leaq 0xc1b8c(%rip), %rdi     # 0xf0644
callq 0x4500
cmpl $0x0, %eax
jne 0x2eacf
leaq 0x3c7(%rip), %rax       # 0x2ee90
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x2eada
leaq -0x556(%rip), %rax      # 0x2e580
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x2eadc
jmp 0x2eade
jmp 0x2eae0
jmp 0x2eae2
jmp 0x2eae4
jmp 0x2eae6
leaq -0x50(%rbp), %rdi
xorl %esi, %esi
movl $0x18, %edx
callq 0x4250
movq $0x0, -0x58(%rbp)
movl $0x1, %edi
movl $0x60, %esi
callq 0x42f0
movq %rax, -0x68(%rbp)
cmpq $0x0, -0x68(%rbp)
jne 0x2eb25
movq $0x0, -0x8(%rbp)
jmp 0x2ec88
movq -0x20(%rbp), %rcx
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x20(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rcx
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x28(%rax)
movq -0x30(%rbp), %rcx
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x30(%rax)
callq 0x2e820
movq %rax, %rcx
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x68(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
jne 0x2eb69
jmp 0x2ec5e
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %eax, %ecx
movq -0x68(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x38(%rax)
cmpq $0x0, -0x28(%rbp)
je 0x2eba3
movq -0x28(%rbp), %rdi
callq 0x4650
movq %rax, %rcx
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x40(%rax)
movq -0x68(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x40(%rax)
jne 0x2eba1
jmp 0x2ec5e
jmp 0x2eba3
cmpq $0x0, -0x10(%rbp)
jne 0x2ebb7
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rax, -0x8(%rbp)
jmp 0x2ec88
movq -0x10(%rbp), %rdi
leaq 0xc3f2f(%rip), %rsi     # 0xf2af1
callq 0x1b150
movq %rax, -0x58(%rbp)
cmpq $0x0, -0x58(%rbp)
jne 0x2ebd7
jmp 0x2ec5e
jmp 0x2ebd9
movq -0x58(%rbp), %rdi
movl $0x2, %esi
leaq -0x50(%rbp), %rdx
callq 0x1dfd0
movl %eax, -0x5c(%rbp)
cmpl $0x0, %eax
jle 0x2ec09
movq -0x68(%rbp), %rdi
movq -0x40(%rbp), %rsi
callq 0x2dcb0
cmpl $0x0, %eax
je 0x2ec07
jmp 0x2ec5e
jmp 0x2ebd9
cmpl $-0x1, -0x5c(%rbp)
jge 0x2ec11
jmp 0x2ec5e
movq -0x58(%rbp), %rdi
callq 0x1d270
movl %eax, -0x5c(%rbp)
movq $0x0, -0x58(%rbp)
cmpl $0x0, -0x5c(%rbp)
je 0x2ec4b
movq -0x10(%rbp), %rcx
movl $0x1, %edi
leaq 0xc24c7(%rip), %rsi     # 0xf1102
leaq 0xc24cc(%rip), %rdx     # 0xf110e
movb $0x0, %al
callq 0x1b030
jmp 0x2ec5e
leaq -0x50(%rbp), %rdi
callq 0x2dd50
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rax, -0x8(%rbp)
jmp 0x2ec88
leaq -0x50(%rbp), %rdi
callq 0x2dd50
cmpq $0x0, -0x58(%rbp)
je 0x2ec77
movq -0x58(%rbp), %rdi
callq 0x1d270
movq -0x68(%rbp), %rdi
callq 0x2e860
movq $0x0, -0x8(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
addq $0x70, %rsp
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)