// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/genometools[P]genometools/src/extended/seqid2seqnum_mapping.c
// Function: fill_mapping
static int fill_mapping(GtSeqid2SeqnumMapping *mapping, GtBioseq *bioseq,
                        GtSeqCol *seqcol, GT_UNUSED GtError *err)
{
  GtUword i, j, nof_sequences, nof_files;
  int had_err = 0;
  gt_error_check(err);
  gt_assert(mapping && (bioseq || seqcol) && !(bioseq && seqcol));
  if (bioseq) {
    nof_files = 1;
  } else {
    gt_assert(seqcol);
    nof_files = gt_seq_col_num_of_files(seqcol);
  }
  for (j = 0; !had_err && j < nof_files; j++) {
    if (bioseq)
      nof_sequences = gt_bioseq_number_of_sequences(bioseq);
    else {
      gt_assert(seqcol);
      nof_sequences = gt_seq_col_num_of_seqs(seqcol, j);
    }
    for (i = 0; !had_err && i < nof_sequences; i++) {
      char *desc;
      if (bioseq)
        desc = gt_cstr_dup(gt_bioseq_get_description(bioseq, i));
      else
        desc = gt_seq_col_get_description(seqcol, j, i);
      had_err = handle_description(mapping, desc, i, j, err);
      gt_free(desc);
    }
  }
  return had_err;
}

// Assembly:
subq $0x58, %rsp
movq %rdi, 0x50(%rsp)
movq %rsi, 0x48(%rsp)
movq %rdx, 0x40(%rsp)
movq %rcx, 0x38(%rsp)
movl $0x0, 0x14(%rsp)
cmpq $0x0, 0x38(%rsp)
je 0xeb2d0
movq 0x38(%rsp), %rdi
callq 0xc270
testb $0x1, %al
jne 0xeb298
jmp 0xeb2d0
movq 0xc8d39(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x72dbd(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x73398(%rip), %rdx     # 0x15e648
leaq 0x8f157(%rip), %rcx     # 0x17a40e
leaq 0x8f088(%rip), %r8      # 0x17a346
movl $0xa2, %r9d
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0xeb2d2
jmp 0xeb2d4
cmpq $0x0, 0x50(%rsp)
je 0xeb2fc
cmpq $0x0, 0x48(%rsp)
jne 0xeb2ec
cmpq $0x0, 0x40(%rsp)
je 0xeb2fc
cmpq $0x0, 0x48(%rsp)
je 0xeb334
cmpq $0x0, 0x40(%rsp)
je 0xeb334
movq 0xc8cd5(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x72d59(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x8f107(%rip), %rdx     # 0x17a41b
leaq 0x8f0f3(%rip), %rcx     # 0x17a40e
leaq 0x8f024(%rip), %r8      # 0x17a346
movl $0xa3, %r9d
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0xeb336
cmpq $0x0, 0x48(%rsp)
je 0xeb349
movq $0x1, 0x18(%rsp)
jmp 0xeb39c
jmp 0xeb34b
cmpq $0x0, 0x40(%rsp)
jne 0xeb38b
movq 0xc8c7e(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x72d02(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x8f01b(%rip), %rdx     # 0x17a386
leaq 0x8f09c(%rip), %rcx     # 0x17a40e
leaq 0x8efcd(%rip), %r8      # 0x17a346
movl $0xa7, %r9d
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0xeb38d
movq 0x40(%rsp), %rdi
callq 0x14a950
movq %rax, 0x18(%rsp)
movq $0x0, 0x28(%rsp)
xorl %eax, %eax
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
movb %al, 0x7(%rsp)
jne 0xeb3c3
movq 0x28(%rsp), %rax
cmpq 0x18(%rsp), %rax
setb %al
movb %al, 0x7(%rsp)
movb 0x7(%rsp), %al
testb $0x1, %al
jne 0xeb3d0
jmp 0xeb514
cmpq $0x0, 0x48(%rsp)
je 0xeb3e9
movq 0x48(%rsp), %rdi
callq 0x10d180
movq %rax, 0x20(%rsp)
jmp 0xeb441
jmp 0xeb3eb
cmpq $0x0, 0x40(%rsp)
jne 0xeb42b
movq 0xc8bde(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x72c62(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x8ef7b(%rip), %rdx     # 0x17a386
leaq 0x8effc(%rip), %rcx     # 0x17a40e
leaq 0x8ef2d(%rip), %r8      # 0x17a346
movl $0xae, %r9d
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0xeb42d
movq 0x40(%rsp), %rdi
movq 0x28(%rsp), %rsi
callq 0x14a9e0
movq %rax, 0x20(%rsp)
movq $0x0, 0x30(%rsp)
xorl %eax, %eax
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
movb %al, 0x6(%rsp)
jne 0xeb468
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq 0x20(%rsp), %rax
setb %al
movb %al, 0x6(%rsp)
movb 0x6(%rsp), %al
testb $0x1, %al
jne 0xeb475
jmp 0xeb4ff
cmpq $0x0, 0x48(%rsp)
je 0xeb49b
movq 0x48(%rsp), %rdi
movq 0x30(%rsp), %rsi
callq 0x10c710
movq %rax, %rdi
callq 0x7c400
movq %rax, 0x8(%rsp)
jmp 0xeb4b4
movq 0x40(%rsp), %rdi
movq 0x28(%rsp), %rsi
movq 0x30(%rsp), %rdx
callq 0x14abc0
movq %rax, 0x8(%rsp)
movq 0x50(%rsp), %rdi
movq 0x8(%rsp), %rsi
movq 0x30(%rsp), %rdx
movq 0x28(%rsp), %rcx
movq 0x38(%rsp), %r8
callq 0xebb60
movl %eax, 0x14(%rsp)
movq 0x8(%rsp), %rdi
leaq 0x8ee64(%rip), %rsi     # 0x17a346
movl $0xb8, %edx
callq 0xdab0
movq 0x30(%rsp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0x30(%rsp)
jmp 0xeb44a
jmp 0xeb501
movq 0x28(%rsp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0x28(%rsp)
jmp 0xeb3a5
movl 0x14(%rsp), %eax
addq $0x58, %rsp
retq
nopl (%rax)