// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/genometools[P]genometools/src/extended/condenseq.c
// Function: condenseq_io
static int condenseq_io(GtCondenseq *condenseq,
                        FILE* fp,
                        GtIOFunc io_func,
                        GtError *err)
{
  int had_err = 0;
  int file_format = GT_CONDENSEQ_VERSION;
  GtUword idx;
  had_err = gt_condenseq_io_one(condenseq->orig_len);
  if (!had_err)
    had_err = gt_condenseq_io_one(file_format);
  if (!had_err && file_format != GT_CONDENSEQ_VERSION) {
    gt_error_set(err, "condenseq index is format version %d, current is "
                 "%d -- please re-encode",
                 file_format, GT_CONDENSEQ_VERSION);
    had_err = -1;
  }
  if (!had_err)
    had_err = gt_condenseq_io_one(condenseq->orig_num_seq);
  if (!had_err)
    had_err = gt_condenseq_io_one(condenseq->lds_nelems);
  if (!had_err) {
    if (condenseq->lds_nelems == 0) {
      gt_warning("compression of condenseq did not succeed in finding any "
                 "compressable similarities, maybe the input is to small or "
                 "the chosen parameters should be reconsidered.");
    }
    if (condenseq->links == NULL) {
      condenseq->links = gt_calloc((size_t) condenseq->lds_nelems,
                                   sizeof (*condenseq->links));
      condenseq->lds_allocated = condenseq->lds_nelems;
    }

    had_err = gt_condenseq_io_one(condenseq->uds_nelems);
  }

  if (!had_err) {
    gt_assert(condenseq->uds_nelems > 0);

    if (condenseq->uniques == NULL) {
      condenseq->uniques = gt_malloc(sizeof (*condenseq->uniques) *
                                     condenseq->uds_nelems );
      condenseq->uds_allocated = condenseq->uds_nelems;
    }
  }

  for (idx = 0; !had_err && idx < condenseq->lds_nelems; idx++) {
    had_err = condenseq_linkentry_io(&condenseq->links[idx], fp, io_func, err);
  }

  for (idx = 0; !had_err && idx < condenseq->uds_nelems; idx++) {
    had_err = condenseq_uniqueentry_io(&condenseq->uniques[idx], fp, io_func,
                                       err);
  }
  if (!had_err && condenseq->orig_num_seq > (GtUword) 1) {
    condenseq->ssptab = gt_intset_io(condenseq->ssptab, fp, err);
    if (condenseq->ssptab == NULL)
      had_err = 1;
  }
  if (!had_err)
    had_err = gt_condenseq_io_one(condenseq->id_len);
  if (!had_err) {
    if (condenseq->id_len == GT_UNDEF_UWORD) {
      condenseq->sdstab = gt_intset_io(condenseq->sdstab, fp, err);
      if (condenseq->sdstab == NULL)
        had_err = 1;
    }
  }
  if (!had_err)
    had_err = gt_condenseq_io_one(condenseq->ids_total_len);
  if (!had_err) {
    condenseq->orig_ids = gt_realloc(condenseq->orig_ids,
                                     (size_t) condenseq->ids_total_len);
    had_err = io_func(condenseq->orig_ids, sizeof (*condenseq->orig_ids),
                      (size_t) condenseq->ids_total_len, fp, err);
  }
  return had_err;
}

// Assembly:
subq $0x38, %rsp
movq %rdi, 0x30(%rsp)
movq %rsi, 0x28(%rsp)
movq %rdx, 0x20(%rsp)
movq %rcx, 0x18(%rsp)
movl $0x0, 0x14(%rsp)
movl $0x1, 0x10(%rsp)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x30(%rsp), %rdi
addq $0x78, %rdi
movq 0x28(%rsp), %rcx
movq 0x18(%rsp), %r8
movl $0x8, %esi
movl $0x1, %edx
callq *%rax
movl %eax, 0x14(%rsp)
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13f94b
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x28(%rsp), %rcx
movq 0x18(%rsp), %r8
leaq 0x10(%rsp), %rdi
movl $0x4, %esi
movl $0x1, %edx
callq *%rax
movl %eax, 0x14(%rsp)
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13f97d
cmpl $0x1, 0x10(%rsp)
je 0x13f97d
movq 0x18(%rsp), %rdi
movl 0x10(%rsp), %edx
leaq 0x40be35(%rip), %rsi    # 0x54b79e
movl $0x1, %ecx
movb $0x0, %al
callq 0xd88c0
movl $0xffffffff, 0x14(%rsp) # imm = 0xFFFFFFFF
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13f9af
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x30(%rsp), %rdi
addq $0x80, %rdi
movq 0x28(%rsp), %rcx
movq 0x18(%rsp), %r8
movl $0x8, %esi
movl $0x1, %edx
callq *%rax
movl %eax, 0x14(%rsp)
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13f9de
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x30(%rsp), %rdi
addq $0x70, %rdi
movq 0x28(%rsp), %rcx
movq 0x18(%rsp), %r8
movl $0x8, %esi
movl $0x1, %edx
callq *%rax
movl %eax, 0x14(%rsp)
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13fa77
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x70(%rax)
jne 0x13fa03
leaq 0x40bdea(%rip), %rdi    # 0x54b7e6
movb $0x0, %al
callq 0x1267d0
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x8(%rax)
jne 0x13fa4c
movq 0x30(%rsp), %rax
movq 0x70(%rax), %rdi
movl $0x20, %esi
leaq 0x40b520(%rip), %rdx    # 0x54af44
movl $0x1d9, %ecx            # imm = 0x1D9
callq 0xe83c0
movq %rax, %rcx
movq 0x30(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq 0x30(%rsp), %rax
movq 0x70(%rax), %rcx
movq 0x30(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x68(%rax)
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x30(%rsp), %rdi
addq $0x98, %rdi
movq 0x28(%rsp), %rcx
movq 0x18(%rsp), %r8
movl $0x8, %esi
movl $0x1, %edx
callq *%rax
movl %eax, 0x14(%rsp)
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13fb1d
jmp 0x13fa84
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x98(%rax)
ja 0x13facb
movq 0x4fc506(%rip), %rax    # 0x63bfa0
movq (%rax), %rdi
leaq 0x3d656f(%rip), %rsi    # 0x516013
leaq 0x40b918(%rip), %rdx    # 0x54b3c3
leaq 0x40bdd4(%rip), %rcx    # 0x54b886
leaq 0x40b48b(%rip), %r8     # 0x54af44
movl $0x1e1, %r9d            # imm = 0x1E1
movb $0x0, %al
callq 0x199f0
callq 0x19370
jmp 0x13facd
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
jne 0x13fb1b
movq 0x30(%rsp), %rax
imulq $0x28, 0x98(%rax), %rdi
leaq 0x40b457(%rip), %rsi    # 0x54af44
movl $0x1e5, %edx            # imm = 0x1E5
callq 0xe80f0
movq %rax, %rcx
movq 0x30(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq 0x30(%rsp), %rax
movq 0x98(%rax), %rcx
movq 0x30(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x90(%rax)
jmp 0x13fb1d
movq $0x0, 0x8(%rsp)
xorl %eax, %eax
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
movb %al, 0x7(%rsp)
jne 0x13fb48
movq 0x8(%rsp), %rax
movq 0x30(%rsp), %rcx
cmpq 0x70(%rcx), %rax
setb %al
movb %al, 0x7(%rsp)
movb 0x7(%rsp), %al
testb $0x1, %al
jne 0x13fb52
jmp 0x13fb8f
movq 0x30(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdi
movq 0x8(%rsp), %rax
shlq $0x5, %rax
addq %rax, %rdi
movq 0x28(%rsp), %rsi
movq 0x20(%rsp), %rdx
movq 0x18(%rsp), %rcx
callq 0x142dc0
movl %eax, 0x14(%rsp)
movq 0x8(%rsp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0x8(%rsp)
jmp 0x13fb26
movq $0x0, 0x8(%rsp)
xorl %eax, %eax
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
movb %al, 0x6(%rsp)
jne 0x13fbbd
movq 0x8(%rsp), %rax
movq 0x30(%rsp), %rcx
cmpq 0x98(%rcx), %rax
setb %al
movb %al, 0x6(%rsp)
movb 0x6(%rsp), %al
testb $0x1, %al
jne 0x13fbc7
jmp 0x13fc01
movq 0x30(%rsp), %rax
movq 0x10(%rax), %rdi
imulq $0x28, 0x8(%rsp), %rax
addq %rax, %rdi
movq 0x28(%rsp), %rsi
movq 0x20(%rsp), %rdx
movq 0x18(%rsp), %rcx
callq 0x142f20
movl %eax, 0x14(%rsp)
movq 0x8(%rsp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0x8(%rsp)
jmp 0x13fb98
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13fc51
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq $0x1, 0x80(%rax)
jbe 0x13fc51
movq 0x30(%rsp), %rax
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movq 0x28(%rsp), %rsi
movq 0x18(%rsp), %rdx
callq 0x197520
movq %rax, %rcx
movq 0x30(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x28(%rax)
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x28(%rax)
jne 0x13fc4f
movl $0x1, 0x14(%rsp)
jmp 0x13fc51
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13fc80
movq 0x20(%rsp), %rax
movq 0x30(%rsp), %rdi
addq $0x58, %rdi
movq 0x28(%rsp), %rcx
movq 0x18(%rsp), %r8
movl $0x8, %esi
movl $0x1, %edx
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movl %eax, 0x14(%rsp)
cmpl $0x0, 0x14(%rsp)
jne 0x13fccf
movq 0x30(%rsp), %rax
cmpq $-0x1, 0x58(%rax)
jne 0x13fccd
movq 0x30(%rsp), %rax
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callq 0x197520
movq %rax, %rcx
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cmpq $0x0, 0x20(%rax)
jne 0x13fccb
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movq 0x30(%rsp), %rdi
addq $0x60, %rdi
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movl $0x8, %esi
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movq 0x30(%rsp), %rax
movq 0x60(%rax), %rsi
leaq 0x40b226(%rip), %rdx    # 0x54af44
movl $0x204, %ecx            # imm = 0x204
callq 0xe8540
movq %rax, %rcx
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movq 0x20(%rsp), %rax
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movl %eax, 0x14(%rsp)
movl 0x14(%rsp), %eax
addq $0x38, %rsp
retq
nopl (%rax)