// File: chhylp123[P]hifiasm/Correct.cpp
// Function: get_pe_diff(overlap_region*, unsigned long*, unsigned long, overlap_region*, unsigned long*, unsigned long, long)
int64_t get_pe_diff(overlap_region *q, uint64_t *qmask, uint64_t qmask_n, overlap_region *t, uint64_t *tmask, uint64_t tmask_n, int64_t bd)
{
    int64_t s, e; overlap_region *z;
    pe_cigar_iter_t qi, ti;
    z = q; if(!(z->w_list.n)) return 0;
    s = z->w_list.a[0].x_start; e = z->w_list.a[z->w_list.n-1].x_end+1;
    s += bd; e -= bd; if(s >= e) return 0;
    memset(&qi, 0, sizeof(qi));
    qi.z = q; qi.qs = s; qi.qe = e; 
    qi.qi = q->w_list.a[0].x_start;
    qi.ti = q->w_list.a[0].y_start;
    qi.wi = 0; qi.wn = q->w_list.n;
    qi.tot = 0; qi.ci = 0; qi.lc = -1; qi.cql = qi.ctl = 0;
    qi.qis = qi.qie = qi.qi; 
    qi.tis = qi.tie = qi.ti; 
    qi.lerr = -1;

    z = t; if(!(z->w_list.n)) return 0;
    s = z->w_list.a[0].x_start; e = z->w_list.a[z->w_list.n-1].x_end+1;
    s += bd; e -= bd; if(s >= e) return 0;
    memset(&ti, 0, sizeof(ti)); 
    ti.z = q; ti.qs = s; ti.qe = e; 
    ti.qi = t->w_list.a[0].x_start;
    ti.ti = t->w_list.a[0].y_start;
    ti.wi = 0; ti.wn = t->w_list.n;
    ti.tot = 0; ti.ci = 0; ti.lc = -1; ti.cql = ti.ctl = 0;
    ti.qis = ti.qie = ti.qi; 
    ti.tis = ti.tie = ti.ti; 
    ti.lerr = -1;

    while((!citer_end(qi)) && (!citer_end(ti))) {
        if(qi.qi == ti.qi) {///check if it is been masked

        } else if((qi.lc == 0) && (ti.lc == 0)) {///check if it is been masked

        }

        if(qi.qi < ti.qi) {

        } if(ti.qi < qi.qi) {

        } else {//qi.qi == ti.qi

        }
    }
    return 0;
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x170, %rsp            # imm = 0x170
movq 0x10(%rbp), %rax
movq %rdi, -0x10(%rbp)
movq %rsi, -0x18(%rbp)
movq %rdx, -0x20(%rbp)
movq %rcx, -0x28(%rbp)
movq %r8, -0x30(%rbp)
movq %r9, -0x38(%rbp)
movq -0x10(%rbp), %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x48(%rax)
jne 0x7e127
movq $0x0, -0x8(%rbp)
jmp 0x7e45a
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movslq (%rax), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movq -0x50(%rbp), %rcx
movq 0x48(%rcx), %rcx
subq $0x1, %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x4(%rax), %eax
addl $0x1, %eax
cltq
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq 0x10(%rbp), %rax
addq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq 0x10(%rbp), %rcx
movq -0x48(%rbp), %rax
subq %rcx, %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
cmpq -0x48(%rbp), %rax
jl 0x7e18f
movq $0x0, -0x8(%rbp)
jmp 0x7e45a
leaq -0xd8(%rbp), %rdi
xorl %esi, %esi
movl $0x88, %edx
callq 0x2100
movq -0x10(%rbp), %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0xd0(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rax, -0xc8(%rbp)
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movslq (%rax), %rax
movq %rax, -0xd8(%rbp)
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movslq 0x8(%rax), %rax
movq %rax, -0xc0(%rbp)
movq $0x0, -0x98(%rbp)
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x48(%rax), %rax
movq %rax, -0x90(%rbp)
movq $0x0, -0x88(%rbp)
movq $0x0, -0x68(%rbp)
movq $-0x1, -0x80(%rbp)
movq $0x0, -0x70(%rbp)
movq $0x0, -0x78(%rbp)
movq -0xd8(%rbp), %rax
movq %rax, -0xb0(%rbp)
movq %rax, -0xb8(%rbp)
movq -0xc0(%rbp), %rax
movq %rax, -0xa0(%rbp)
movq %rax, -0xa8(%rbp)
movq $-0x1, -0x60(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x48(%rax)
jne 0x7e27c
movq $0x0, -0x8(%rbp)
jmp 0x7e45a
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movslq (%rax), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movq -0x50(%rbp), %rcx
movq 0x48(%rcx), %rcx
subq $0x1, %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x4(%rax), %eax
addl $0x1, %eax
cltq
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq 0x10(%rbp), %rax
addq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq 0x10(%rbp), %rcx
movq -0x48(%rbp), %rax
subq %rcx, %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
cmpq -0x48(%rbp), %rax
jl 0x7e2e4
movq $0x0, -0x8(%rbp)
jmp 0x7e45a
leaq -0x160(%rbp), %rdi
xorl %esi, %esi
movl $0x88, %edx
callq 0x2100
movq -0x10(%rbp), %rax
movq %rax, -0xe0(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0x158(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rax, -0x150(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movslq (%rax), %rax
movq %rax, -0x160(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movslq 0x8(%rax), %rax
movq %rax, -0x148(%rbp)
movq $0x0, -0x120(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x48(%rax), %rax
movq %rax, -0x118(%rbp)
movq $0x0, -0x110(%rbp)
movq $0x0, -0xf0(%rbp)
movq $-0x1, -0x108(%rbp)
movq $0x0, -0xf8(%rbp)
movq $0x0, -0x100(%rbp)
movq -0x160(%rbp), %rax
movq %rax, -0x138(%rbp)
movq %rax, -0x140(%rbp)
movq -0x148(%rbp), %rax
movq %rax, -0x128(%rbp)
movq %rax, -0x130(%rbp)
movq $-0x1, -0xe8(%rbp)
movq -0xd8(%rbp), %rcx
xorl %eax, %eax
cmpq -0xc8(%rbp), %rcx
movb %al, -0x161(%rbp)
jge 0x7e3f4
movq -0x160(%rbp), %rax
cmpq -0x150(%rbp), %rax
setge %al
xorb $-0x1, %al
movb %al, -0x161(%rbp)
movb -0x161(%rbp), %al
testb $0x1, %al
jne 0x7e400
jmp 0x7e452
movq -0xd8(%rbp), %rax
cmpq -0x160(%rbp), %rax
jne 0x7e412
jmp 0x7e427
cmpq $0x0, -0x80(%rbp)
jne 0x7e425
cmpq $0x0, -0x108(%rbp)
jne 0x7e425
jmp 0x7e425
jmp 0x7e427
movq -0xd8(%rbp), %rax
cmpq -0x160(%rbp), %rax
jge 0x7e439
jmp 0x7e439
movq -0x160(%rbp), %rax
cmpq -0xd8(%rbp), %rax
jge 0x7e44b
jmp 0x7e44d
jmp 0x7e44d
jmp 0x7e3c3
movq $0x0, -0x8(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
addq $0x170, %rsp            # imm = 0x170
popq %rbp
retq
nopw (%rax,%rax)