// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/genometools[P]genometools/src/core/encseq.c
// Function: gt_encseq_builder_add_encoded_generic
static void gt_encseq_builder_add_encoded_generic(GtEncseqBuilder *eb,
                                                  const GtUchar *str,
                                                  GtUword strlen,
                                                  const char *desc,
                                                  bool copy)
{
  GtUword i, offset;
  gt_assert(eb && str);
  if (eb->plainseq == NULL) {
    if (!copy) {
      eb->plainseq = (GtUchar*) str;
      eb->own = false;
    } else {
      eb->plainseq = gt_malloc((size_t) strlen * sizeof (GtUchar));
      eb->allocated = (size_t) (strlen * sizeof (GtUchar));
      memcpy(eb->plainseq, str, (size_t) strlen * sizeof (GtUchar));
      eb->own = true;
    }
    eb->seqlen = strlen;
    eb->firstseq = false;
    eb->nof_seqs++;
    if (eb->wdestab) {
      gt_assert(desc);
      gt_str_append_cstr(eb->destab, desc);
      gt_str_append_char(eb->destab, '\n');
      /* store description separator position, if not first description */
      if (eb->wsdstab) {
        GT_STOREINARRAY(&eb->sdstab, GtUword, 128,
                        gt_str_length(eb->destab)-1);
      }
      eb->firstdesc = false;
    }
  } else {
    if (!eb->own) {
      GtUchar *theirseq = eb->plainseq;
      eb->plainseq = gt_malloc((size_t) eb->seqlen * sizeof (GtUchar));
      eb->allocated = (size_t) (eb->seqlen * sizeof (GtUchar));
      memcpy(eb->plainseq, theirseq, (size_t) eb->seqlen);
    }
    /* store separator position if needed */
    if (eb->wssptab && !eb->firstseq) {
      GT_STOREINARRAY(&eb->ssptab, GtUword, 128, eb->seqlen);
    }
    /* from the second sequence on, add a separator before adding symbols */
    if (!eb->firstseq) {
      eb->plainseq = gt_dynalloc(eb->plainseq, &eb->allocated,
                                 (eb->seqlen + strlen+1) * sizeof (GtUchar));
      eb->plainseq[eb->seqlen] = (GtUchar) GT_SEPARATOR;
      offset = eb->seqlen+1;
      eb->seqlen += strlen+1;
    } else {
      eb->plainseq = gt_dynalloc(eb->plainseq, &eb->allocated,
                                 strlen * sizeof (GtUchar));
      offset = 0;
      eb->seqlen = strlen;
      eb->firstseq = false;
    }
    /* append description to in-memory description table */
    if (eb->wdestab) {
      gt_assert(desc);
      gt_str_append_cstr(eb->destab, desc);
      gt_str_append_char(eb->destab, '\n');
      eb->firstdesc = false;
      /* store description separator position, if not first description */
      if (eb->wsdstab) {
        GT_STOREINARRAY(&eb->sdstab, GtUword, 128,
                        gt_str_length(eb->destab)-1);
      }

    }
    for (i=0;i < strlen; i++) {
      eb->plainseq[offset+i] = str[i];
    }
    eb->nof_seqs++;
    eb->own = true;
  }
  if (eb->minseqlen == GT_UNDEF_UWORD || strlen < eb->minseqlen)
    eb->minseqlen = strlen;
  if (eb->maxseqlen == GT_UNDEF_UWORD || strlen > eb->maxseqlen)
    eb->maxseqlen = strlen;
}

// Assembly:
subq $0x58, %rsp
movb %r8b, %al
movq %rdi, 0x50(%rsp)
movq %rsi, 0x48(%rsp)
movq %rdx, 0x40(%rsp)
movq %rcx, 0x38(%rsp)
andb $0x1, %al
movb %al, 0x37(%rsp)
cmpq $0x0, 0x50(%rsp)
je 0x126c71
cmpq $0x0, 0x48(%rsp)
jne 0x126ca9
movq 0x8d360(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x373e4(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x60c72(%rip), %rdx     # 0x1878fb
leaq 0x63670(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e9c7(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x2323, %r9d           # imm = 0x2323
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x126cab
movq 0x50(%rsp), %rax
cmpq $0x0, (%rax)
jne 0x126f25
testb $0x1, 0x37(%rsp)
jne 0x126cd9
movq 0x48(%rsp), %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movb $0x0, 0x68(%rax)
jmp 0x126d34
movq 0x40(%rsp), %rdi
shlq $0x0, %rdi
leaq 0x5e975(%rip), %rsi     # 0x18565e
movl $0x2329, %edx           # imm = 0x2329
callq 0xd2e0
movq %rax, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq 0x40(%rsp), %rcx
shlq $0x0, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x60(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq 0x48(%rsp), %rsi
movq 0x40(%rsp), %rdx
shlq $0x0, %rdx
callq 0xb500
movq 0x50(%rsp), %rax
movb $0x1, 0x68(%rax)
movq 0x40(%rsp), %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movb $0x0, 0x6e(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x10(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6a(%rax)
je 0x126f20
jmp 0x126d6d
cmpq $0x0, 0x38(%rsp)
jne 0x126dad
movq 0x8d25c(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x372e0(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x521e9(%rip), %rdx     # 0x178f76
leaq 0x6356c(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e8c3(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x2332, %r9d           # imm = 0x2332
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x126daf
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
movq 0x38(%rsp), %rsi
callq 0x18fb0
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
movl $0xa, %esi
callq 0x194d0
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6c(%rax)
je 0x126f17
jmp 0x126de6
jmp 0x126de8
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x38(%rax), %rax
addq $0x0, %rax
movq 0x50(%rsp), %rcx
cmpq 0x30(%rcx), %rax
jb 0x126e95
movq $0x80, 0x18(%rsp)
xorl %eax, %eax
cmpq 0x18(%rsp), %rax
jbe 0x126e4e
movq 0x8d1bb(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x3723f(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x4a46e(%rip), %rdx     # 0x17129c
leaq 0x634cb(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e822(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x2338, %r9d           # imm = 0x2338
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x126e50
movq 0x18(%rsp), %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
addq 0x30(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x30(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x28(%rax), %rdi
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x30(%rax), %rsi
shlq $0x3, %rsi
leaq 0x5e7df(%rip), %rdx     # 0x18565e
movl $0x2338, %ecx           # imm = 0x2338
callq 0xd730
movq %rax, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x28(%rax)
jmp 0x126e97
movq 0x50(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x28(%rax)
jne 0x126edb
movq 0x8d12e(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x371b2(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x60a89(%rip), %rdx     # 0x187944
leaq 0x6343e(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e795(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x2338, %r9d           # imm = 0x2338
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x126edd
jmp 0x126edf
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
callq 0x19a00
movq %rax, %rdx
subq $0x1, %rdx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x28(%rax), %rax
movq 0x50(%rsp), %rsi
movq 0x38(%rsi), %rcx
movq %rcx, %rdi
addq $0x1, %rdi
movq %rdi, 0x38(%rsi)
movq %rdx, (%rax,%rcx,8)
jmp 0x126f17
movq 0x50(%rsp), %rax
movb $0x0, 0x6d(%rax)
jmp 0x1273cb
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x68(%rax)
jne 0x126f97
movq 0x50(%rsp), %rax
movq (%rax), %rax
movq %rax, 0x10(%rsp)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdi
shlq $0x0, %rdi
leaq 0x5e70d(%rip), %rsi     # 0x18565e
movl $0x233f, %edx           # imm = 0x233F
callq 0xd2e0
movq %rax, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rcx
shlq $0x0, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x60(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq 0x10(%rsp), %rsi
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdx
callq 0xb500
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6b(%rax)
je 0x1270dc
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6e(%rax)
jne 0x1270dc
jmp 0x126fb7
jmp 0x126fb9
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x50(%rax), %rax
addq $0x0, %rax
movq 0x50(%rsp), %rcx
cmpq 0x48(%rcx), %rax
jb 0x127066
movq $0x80, 0x8(%rsp)
xorl %eax, %eax
cmpq 0x8(%rsp), %rax
jbe 0x12701f
movq 0x8cfea(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x3706e(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x4a29d(%rip), %rdx     # 0x17129c
leaq 0x632fa(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e651(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x2345, %r9d           # imm = 0x2345
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x127021
movq 0x8(%rsp), %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
addq 0x48(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x48(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x40(%rax), %rdi
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x48(%rax), %rsi
shlq $0x3, %rsi
leaq 0x5e60e(%rip), %rdx     # 0x18565e
movl $0x2345, %ecx           # imm = 0x2345
callq 0xd730
movq %rax, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x40(%rax)
jmp 0x127068
movq 0x50(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x40(%rax)
jne 0x1270ac
movq 0x8cf5d(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x36fe1(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x60894(%rip), %rdx     # 0x187920
leaq 0x6326d(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e5c4(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x2345, %r9d           # imm = 0x2345
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x1270ae
jmp 0x1270b0
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x40(%rax), %rax
movq 0x50(%rsp), %rsi
movq 0x50(%rsi), %rcx
movq %rcx, %rdi
addq $0x1, %rdi
movq %rdi, 0x50(%rsi)
movq %rdx, (%rax,%rcx,8)
jmp 0x1270dc
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6e(%rax)
jne 0x12715d
movq 0x50(%rsp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq 0x50(%rsp), %rsi
addq $0x60, %rsi
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdx
addq 0x40(%rsp), %rdx
addq $0x1, %rdx
shlq $0x0, %rdx
callq 0x7f2b0
movq %rax, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq (%rax), %rax
movq 0x50(%rsp), %rcx
movq 0x8(%rcx), %rcx
movb $-0x1, (%rax,%rcx)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0x20(%rsp)
movq 0x40(%rsp), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
addq 0x8(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x8(%rax)
jmp 0x1271a7
movq 0x50(%rsp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq 0x50(%rsp), %rsi
addq $0x60, %rsi
movq 0x40(%rsp), %rdx
shlq $0x0, %rdx
callq 0x7f2b0
movq %rax, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq $0x0, 0x20(%rsp)
movq 0x40(%rsp), %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movb $0x0, 0x6e(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6a(%rax)
je 0x12736a
jmp 0x1271b8
cmpq $0x0, 0x38(%rsp)
jne 0x1271f8
movq 0x8ce11(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x36e95(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x51d9e(%rip), %rdx     # 0x178f76
leaq 0x63121(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e478(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x2357, %r9d           # imm = 0x2357
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x1271fa
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
movq 0x38(%rsp), %rsi
callq 0x18fb0
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
movl $0xa, %esi
callq 0x194d0
movq 0x50(%rsp), %rax
movb $0x0, 0x6d(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6c(%rax)
je 0x127368
jmp 0x12723a
jmp 0x12723c
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x38(%rax), %rax
addq $0x0, %rax
movq 0x50(%rsp), %rcx
cmpq 0x30(%rcx), %rax
jb 0x1272e6
movq $0x80, (%rsp)
xorl %eax, %eax
cmpq (%rsp), %rax
jbe 0x1272a0
movq 0x8cd69(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x36ded(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x4a01c(%rip), %rdx     # 0x17129c
leaq 0x63079(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e3d0(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x235e, %r9d           # imm = 0x235E
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x1272a2
movq (%rsp), %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
addq 0x30(%rax), %rcx
movq %rcx, 0x30(%rax)
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x28(%rax), %rdi
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x30(%rax), %rsi
shlq $0x3, %rsi
leaq 0x5e38e(%rip), %rdx     # 0x18565e
movl $0x235e, %ecx           # imm = 0x235E
callq 0xd730
movq %rax, %rcx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x28(%rax)
jmp 0x1272e8
movq 0x50(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x28(%rax)
jne 0x12732c
movq 0x8ccdd(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x36d61(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x60638(%rip), %rdx     # 0x187944
leaq 0x62fed(%rip), %rcx     # 0x18a300
leaq 0x5e344(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x235e, %r9d           # imm = 0x235E
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x12732e
jmp 0x127330
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
callq 0x19a00
movq %rax, %rdx
subq $0x1, %rdx
movq 0x50(%rsp), %rax
movq 0x28(%rax), %rax
movq 0x50(%rsp), %rsi
movq 0x38(%rsi), %rcx
movq %rcx, %rdi
addq $0x1, %rdi
movq %rdi, 0x38(%rsi)
movq %rdx, (%rax,%rcx,8)
jmp 0x127368
jmp 0x12736a
movq $0x0, 0x28(%rsp)
movq 0x28(%rsp), %rax
cmpq 0x40(%rsp), %rax
jae 0x1273b1
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