// File: chhylp123[P]hifiasm/horder.cpp
// Function: update_sc_lay(sc_lay_t*, h_covs*)
void update_sc_lay(sc_lay_t *sl, h_covs *b)
{
    uint64_t k, l, i, pidx, cidx;
    lay_t *s = NULL;
    lay_t *p = NULL;
    for (k = 1, l = 0; k <= b->n; ++k) 
    {   
        if (k == b->n || (b->a[k].s != b->a[l].s)) 
        {
            s = &(sl->a[b->a[l].s]);
            for (i = l, pidx = 0; i < k; i++){
                cidx = b->a[i].dp;
                kv_pushp(lay_t, *sl, &p);
                kv_init(*p);
                p->n = p->m = (cidx - pidx + 1)<<1;
                MALLOC(p->a, p->n);
                memcpy(p->a, s->a + (pidx<<1), sizeof(*(p->a))*p->n);
                pidx = cidx + 1;
            }

            if(pidx >= (s->n>>1)) fprintf(stderr, "ERROR-update\n");
            cidx = (s->n>>1)-1;
            kv_pushp(lay_t, *sl, &p);
            kv_init(*p);
            p->n = p->m = (cidx - pidx + 1)<<1;
            MALLOC(p->a, p->n);
            memcpy(p->a, s->a + (pidx<<1), sizeof(*(p->a))*p->n);
            free(s->a); s->n = s->m = 0;
            l = k;
        }
    }

    for (i = k = 0; i < sl->n; i++){
        if(!sl->a[i].a) continue;
        sl->a[k] = sl->a[i];
        sl->a[i].a = NULL; sl->a[i].n = sl->a[i].m = 0;
        if(sl->a[k].n == 2){
            sl->a[k].a[0] >>= 1; sl->a[k].a[0] <<= 1;
            sl->a[k].a[1] >>= 1; sl->a[k].a[1] <<= 1; sl->a[k].a[1]++;
        }
        k++;
    }
    sl->n = k;
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x60, %rsp
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movq %rsi, -0x10(%rbp)
movq $0x0, -0x40(%rbp)
movq $0x0, -0x48(%rbp)
movq $0x1, -0x18(%rbp)
movq $0x0, -0x20(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq -0x10(%rbp), %rcx
cmpq 0x8(%rcx), %rax
ja 0x248ba1
movq -0x18(%rbp), %rax
movq -0x10(%rbp), %rcx
cmpq 0x8(%rcx), %rax
je 0x24888a
movq -0x10(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x10(%rbp), %rcx
movq (%rcx), %rcx
imulq $0x18, -0x20(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rcx
cmpq (%rcx), %rax
je 0x248b8e
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x10(%rbp), %rcx
movq (%rcx), %rcx
imulq $0x18, -0x20(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rcx
imulq $0x18, (%rcx), %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rax
movq %rax, -0x28(%rbp)
movq $0x0, -0x30(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
cmpq -0x18(%rbp), %rax
jae 0x248a10
movq -0x10(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x28(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq %rax, -0x38(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
cmpq 0x10(%rcx), %rax
jne 0x248944
movq -0x8(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
je 0x24890e
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
shlq %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
jmp 0x248919
movl $0x2, %eax
movq %rax, -0x50(%rbp)
jmp 0x248919
movq -0x50(%rbp), %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
imulq $0x18, 0x10(%rax), %rsi
callq 0x2360
movq %rax, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rdx
movq 0x8(%rdx), %rcx
movq %rcx, %rsi
addq $0x1, %rsi
movq %rsi, 0x8(%rdx)
imulq $0x18, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x10(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq $0x0, (%rax)
movq -0x38(%rbp), %rcx
subq -0x30(%rbp), %rcx
addq $0x1, %rcx
shlq %rcx
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdi
shlq $0x2, %rdi
callq 0x2270
movq %rax, %rcx
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq -0x40(%rbp), %rax
movq (%rax), %rsi
movq -0x30(%rbp), %rax
shlq %rax
shlq $0x2, %rax
addq %rax, %rsi
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdx
shlq $0x2, %rdx
callq 0x2180
movq -0x38(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x28(%rbp)
jmp 0x2488bb
movq -0x30(%rbp), %rax
movq -0x40(%rbp), %rcx
movq 0x8(%rcx), %rcx
shrq %rcx
cmpq %rcx, %rax
jb 0x248a3c
movq 0x17b5b5(%rip), %rax    # 0x3c3fe0
movq (%rax), %rdi
leaq 0x1460ea(%rip), %rsi    # 0x38eb1f
movb $0x0, %al
callq 0x22a0
movq -0x40(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
shrq %rax
subq $0x1, %rax
movq %rax, -0x38(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
cmpq 0x10(%rcx), %rax
jne 0x248ab3
movq -0x8(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
je 0x248a7d
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
shlq %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
jmp 0x248a88
movl $0x2, %eax
movq %rax, -0x58(%rbp)
jmp 0x248a88
movq -0x58(%rbp), %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq -0x8(%rbp), %rax
imulq $0x18, 0x10(%rax), %rsi
callq 0x2360
movq %rax, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rdx
movq 0x8(%rdx), %rcx
movq %rcx, %rsi
addq $0x1, %rsi
movq %rsi, 0x8(%rdx)
imulq $0x18, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x10(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq $0x0, (%rax)
movq -0x38(%rbp), %rcx
subq -0x30(%rbp), %rcx
addq $0x1, %rcx
shlq %rcx
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x8(%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdi
shlq $0x2, %rdi
callq 0x2270
movq %rax, %rcx
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq -0x40(%rbp), %rax
movq (%rax), %rsi
movq -0x30(%rbp), %rax
shlq %rax
shlq $0x2, %rax
addq %rax, %rsi
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdx
shlq $0x2, %rdx
callq 0x2180
movq -0x40(%rbp), %rax
movq (%rax), %rdi
callq 0x2210
movq -0x40(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x10(%rax)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0x20(%rbp)
jmp 0x248b90
movq -0x18(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x18(%rbp)
jmp 0x248840
movq $0x0, -0x18(%rbp)
movq $0x0, -0x28(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
cmpq 0x8(%rcx), %rax
jae 0x248d07
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x28(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
cmpq $0x0, (%rax)
jne 0x248bdd
jmp 0x248cf6
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rcx
imulq $0x18, -0x28(%rbp), %rax
addq %rax, %rcx
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movq (%rcx), %rdx
movq %rdx, (%rax)
movq 0x8(%rcx), %rdx
movq %rdx, 0x8(%rax)
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x28(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq $0x0, (%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x28(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
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movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x28(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq $0x0, 0x8(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
cmpq $0x2, 0x8(%rax)
jne 0x248cea
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movl (%rax), %ecx
shrl %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movl (%rax), %ecx
shll %ecx
movl %ecx, (%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movl 0x4(%rax), %ecx
shrl %ecx
movl %ecx, 0x4(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movl 0x4(%rax), %ecx
shll %ecx
movl %ecx, 0x4(%rax)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x18, -0x18(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movl 0x4(%rax), %ecx
addl $0x1, %ecx
movl %ecx, 0x4(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x18(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x28(%rbp)
jmp 0x248bb1
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popq %rbp
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nopl (%rax)