// File: chhylp123[P]hifiasm/Overlaps.cpp
// Function: gen_contig_trans_func(ma_ug_t*, ma_ug_t*, ma_ug_t*, scaf_res_t*, scaf_res_t*, asg_t*, bubble_type*, ug_opt_t*, kv_u_trans_t*, unsigned char, ma_ug_t**, scaf_res_t**)
kv_u_trans_t *gen_contig_trans_func(ma_ug_t *ref, ma_ug_t *hu0, ma_ug_t *hu1, scaf_res_t *cp0, scaf_res_t *cp1, asg_t *sg, bubble_type *bu, ug_opt_t *opt, kv_u_trans_t *bd, uint8_t is_sep, ma_ug_t **rmg, scaf_res_t **rms)
{

    kv_u_trans_t *os; CALLOC(os, 1);
    if(is_sep) {
        gen_contig_trans(opt, sg, hu1, cp1, hu0, cp0, ref, bd, hu0->u.n, 0, bu, os);
        gen_contig_trans(opt, sg, hu0, cp0, hu1, cp1, ref, bd, 0, hu0->u.n, bu, os);
    } else {
        ma_ug_t *mg = merge_utgs(hu0, hu1); scaf_res_t *ms = merge_scaf_res(cp0, cp1);
        gen_contig_self(opt, sg, mg, ms, ref, bd, hu0->u.n, bu, os, 0);
        if(!rmg) ma_ug_destroy(mg); 
        else (*rmg) = mg;
        if(!rms) destroy_scaf_res_t(ms);
        else (*rms) = ms;
    }

    kt_u_trans_t_idx(os, hu0->u.n + hu1->u.n);
    update_ctg_trans_cc(os);
    return os;
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
pushq %r15
pushq %r14
pushq %rbx
subq $0x78, %rsp
movq 0x38(%rbp), %rax
movq 0x30(%rbp), %rax
movb 0x28(%rbp), %al
movq 0x20(%rbp), %rax
movq 0x18(%rbp), %rax
movq 0x10(%rbp), %rax
movq %rdi, -0x20(%rbp)
movq %rsi, -0x28(%rbp)
movq %rdx, -0x30(%rbp)
movq %rcx, -0x38(%rbp)
movq %r8, -0x40(%rbp)
movq %r9, -0x48(%rbp)
movl $0x1, %edi
movl $0x30, %esi
callq 0x2140
movq %rax, -0x50(%rbp)
cmpb $0x0, 0x28(%rbp)
je 0x1304f2
movq 0x18(%rbp), %rdi
movq -0x48(%rbp), %rsi
movq -0x30(%rbp), %rdx
movq -0x40(%rbp), %rcx
movq -0x28(%rbp), %r8
movq -0x38(%rbp), %r9
movq -0x20(%rbp), %r14
movq 0x20(%rbp), %rbx
movq -0x28(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movl %eax, %r11d
movq 0x10(%rbp), %r10
movq -0x50(%rbp), %rax
xorl %r15d, %r15d
movq %r14, (%rsp)
movq %rbx, 0x8(%rsp)
movl %r11d, 0x10(%rsp)
movl $0x0, 0x18(%rsp)
movq %r10, 0x20(%rsp)
movq %rax, 0x28(%rsp)
callq 0x2ffb30
movq 0x18(%rbp), %rdi
movq -0x48(%rbp), %rsi
movq -0x28(%rbp), %rdx
movq -0x38(%rbp), %rcx
movq -0x30(%rbp), %r8
movq -0x40(%rbp), %r9
movq -0x20(%rbp), %r14
movq 0x20(%rbp), %rbx
movq -0x28(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movl %eax, %r11d
movq 0x10(%rbp), %r10
movq -0x50(%rbp), %rax
xorl %r15d, %r15d
movq %r14, (%rsp)
movq %rbx, 0x8(%rsp)
movl $0x0, 0x10(%rsp)
movl %r11d, 0x18(%rsp)
movq %r10, 0x20(%rsp)
movq %rax, 0x28(%rsp)
callq 0x2ffb30
jmp 0x130594
movq -0x28(%rbp), %rdi
movq -0x30(%rbp), %rsi
callq 0x12fb30
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq -0x38(%rbp), %rdi
movq -0x40(%rbp), %rsi
callq 0x1300a0
movq %rax, -0x60(%rbp)
movq 0x18(%rbp), %rdi
movq -0x48(%rbp), %rsi
movq -0x58(%rbp), %rdx
movq -0x60(%rbp), %rcx
movq -0x20(%rbp), %r8
movq 0x20(%rbp), %r9
movq -0x28(%rbp), %rax
movq (%rax), %r11
movq 0x10(%rbp), %r10
movq -0x50(%rbp), %rax
xorl %ebx, %ebx
movq %r11, (%rsp)
movq %r10, 0x8(%rsp)
movq %rax, 0x10(%rsp)
movl $0x0, 0x18(%rsp)
callq 0x2ffd20
cmpq $0x0, 0x30(%rbp)
jne 0x13056a
movq -0x58(%rbp), %rdi
callq 0xcd6f0
jmp 0x130575
movq -0x58(%rbp), %rcx
movq 0x30(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
cmpq $0x0, 0x38(%rbp)
jne 0x130587
movq -0x60(%rbp), %rdi
callq 0x13c50
jmp 0x130592
movq -0x60(%rbp), %rcx
movq 0x38(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
jmp 0x130594
movq -0x50(%rbp), %rdi
movq -0x28(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x30(%rbp), %rcx
addq (%rcx), %rax
movl %eax, %esi
callq 0x104540
movq -0x50(%rbp), %rdi
callq 0x127a10
movq -0x50(%rbp), %rax
addq $0x78, %rsp
popq %rbx
popq %r14
popq %r15
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)