// File: chhylp123[P]hifiasm/inter.cpp
// Function: worker_for_ctg_trans_alignment(void*, long, int)
static void worker_for_ctg_trans_alignment(void *data, long i, int tid)
{
	ctdat_t *c = (ctdat_t*)data;
	utepdat_t *s = c->s; 
	// ul_vec_t *q = &(c->qry_sc->a[i]); 

	s->hab[tid]->num_read_base++; 
	s->hab[tid]->num_correct_base += direct_ctg_trans_chain(s->buf[tid], i, &(s->ll[tid]), &(s->gdp[tid]), &(s->sps[tid]), &(s->hab[tid]->hap), s->uu, s->uopt, G_CHAIN_BW, s->opt->diff_ec_ul, UG_SKIP, i, &(s->hab[tid]->clist.chainDP), 
	c->qry, c->qry_sc, c->ref, c->ref_sc, c->gfa, c->bub, c->ta, s->rg, c->soff, c->is_exact);
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
pushq %r15
pushq %r14
pushq %r13
pushq %r12
pushq %rbx
subq $0xe8, %rsp
movq %rdi, -0x30(%rbp)
movq %rsi, -0x38(%rbp)
movl %edx, -0x3c(%rbp)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x80(%rax), %rax
movslq -0x3c(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq 0xf0(%rax), %rcx
addq $0x1, %rcx
movq %rcx, 0xf0(%rax)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x78(%rax), %rax
movslq -0x3c(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rdi
movq -0x38(%rbp), %rax
movl %eax, %esi
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x88(%rax), %rdx
movslq -0x3c(%rbp), %rax
imulq $0x68, %rax, %rax
addq %rax, %rdx
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x90(%rax), %rcx
movslq -0x3c(%rbp), %rax
imulq $0xc0, %rax, %rax
addq %rax, %rcx
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x68(%rax), %r8
movslq -0x3c(%rbp), %rax
imulq $0x18, %rax, %rax
addq %rax, %r8
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x80(%rax), %rax
movslq -0x3c(%rbp), %r9
movq (%rax,%r9,8), %r9
addq $0x9040, %r9            # imm = 0x9040
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x30(%rax), %rax
movq %rax, -0x88(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x28(%rax), %rax
movq %rax, -0x80(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movsd 0x68(%rax), %xmm0
movq -0x38(%rbp), %rax
movq %rax, -0x78(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x80(%rax), %rax
movslq -0x3c(%rbp), %r10
movq (%rax,%r10,8), %rax
addq $0x48, %rax
addq $0x18, %rax
movq %rax, -0x70(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq %rax, -0x68(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq %rax, -0x60(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %r13
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %r12
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x28(%rax), %r15
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x30(%rax), %r14
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %rbx
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %r11
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x48(%rax), %r10
movq -0x48(%rbp), %rax
movq 0x50(%rax), %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq -0x88(%rbp), %rax
movq %rax, (%rsp)
movq -0x80(%rbp), %rax
movq %rax, 0x8(%rsp)
movq -0x78(%rbp), %rax
movq $0x10, 0x10(%rsp)
movq $0x5, 0x18(%rsp)
movq %rax, 0x20(%rsp)
movq -0x70(%rbp), %rax
movq %rax, 0x28(%rsp)
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rax, 0x30(%rsp)
movq -0x60(%rbp), %rax
movq %rax, 0x38(%rsp)
movq -0x58(%rbp), %rax
movq %r13, 0x40(%rsp)
movq %r12, 0x48(%rsp)
movq %r15, 0x50(%rsp)
movq %r14, 0x58(%rsp)
movq %rbx, 0x60(%rsp)
movq %r11, 0x68(%rsp)
movq %r10, 0x70(%rsp)
movq %rax, 0x78(%rsp)
callq 0x2e3980
movl %eax, %eax
movl %eax, %ecx
movq -0x50(%rbp), %rax
movq 0x80(%rax), %rax
movslq -0x3c(%rbp), %rdx
movq (%rax,%rdx,8), %rax
addq 0xf8(%rax), %rcx
movq %rcx, 0xf8(%rax)
addq $0xe8, %rsp
popq %rbx
popq %r12
popq %r13
popq %r14
popq %r15
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)