// File: chhylp123[P]hifiasm/horder.cpp
// Function: debug_sub_cov(kvec_pe_hit*, unsigned long, unsigned long, unsigned long, ma_utg_t*, asg_t*, unsigned long, unsigned long)
void debug_sub_cov(kvec_pe_hit *hits, uint64_t sidx, uint64_t eidx, uint64_t ulen, ma_utg_t *u, asg_t* r_g,
uint64_t rid, uint64_t i_cnt)
{
    uint64_t i, offset, beg, end, rs, re;
    uint64_t p0s, p0e, p1s, p1e, span_s, span_e, cnt = 0;
    rs = re = (uint64_t)-1;
    for (i = offset = 0; i < u->n; i++)
    {
        end = offset + ((u->a[i] != (uint64_t)-1?r_g->seq[u->a[i]>>33].len:GAP_LEN));
        offset += (u->a[i] != (uint64_t)-1? (uint32_t)u->a[i]:GAP_LEN);
        beg = offset;

        if(u->a[i] == (uint64_t)-1) beg -= GAP_LEN;
        if(end <= beg && i + 1 < u->n && u->a[i+1] == (uint64_t)-1)
        {
            end = beg + GAP_LEN;
        }
        if(rid == i)
        {
            rs = beg;
            re = end;
        }
    }

    for (i = sidx; i < eidx; i++)///keep all hic hits that contain interval we want
    {
        if(get_hit_suid(*hits, i) != get_hit_euid(*hits, i)) continue;
        p0s = get_hit_spos(*hits, i);
        p0e = get_hit_spos_e(*hits, i);
        p1s = get_hit_epos(*hits, i);
        p1e = get_hit_epos_e(*hits, i);

        span_s = MIN(MIN(p0s, p0e), MIN(p1s, p1e));
        span_s = MIN(span_s, ulen-1);
        span_e = MAX(MAX(p0s, p0e), MAX(p1s, p1e));
        span_e = MIN(span_e, ulen-1) + 1;

        //if(span_e - span_s <= ulen*BREAK_CUTOFF)//need it or not?
        {
            if(span_s <= rs && span_e >= re) cnt++;
        }
    }

    // if(cnt != i_cnt) fprintf(stderr, "cnt-%lu, i_cnt-%lu\n", cnt, i_cnt);
    fprintf(stderr, "******cnt-%lu, i_cnt-%lu\n", cnt, i_cnt);
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x140, %rsp            # imm = 0x140
movq 0x18(%rbp), %rax
movq 0x10(%rbp), %rax
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movq %rsi, -0x10(%rbp)
movq %rdx, -0x18(%rbp)
movq %rcx, -0x20(%rbp)
movq %r8, -0x28(%rbp)
movq %r9, -0x30(%rbp)
movq $0x0, -0x98(%rbp)
movq $-0x1, -0x60(%rbp)
movq $-0x1, -0x58(%rbp)
movq $0x0, -0x40(%rbp)
movq $0x0, -0x38(%rbp)
movq -0x38(%rbp), %rax
movq -0x28(%rbp), %rcx
movl 0x10(%rcx), %ecx
cmpq %rcx, %rax
jae 0x237bd2
movq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0xa0(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
cmpq $-0x1, (%rax,%rcx,8)
je 0x237ad4
movq -0x30(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movq -0x28(%rbp), %rcx
movq 0x18(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
movq (%rcx,%rdx,8), %rcx
shrq $0x21, %rcx
movl (%rax,%rcx,8), %eax
andl $0x7fffffff, %eax       # imm = 0x7FFFFFFF
movl %eax, -0xa4(%rbp)
jmp 0x237ae1
movl $0x64, %eax
movl %eax, -0xa4(%rbp)
jmp 0x237ae1
movq -0xa0(%rbp), %rax
movl -0xa4(%rbp), %ecx
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
cmpq $-0x1, (%rax,%rcx,8)
je 0x237b23
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movl %eax, -0xa8(%rbp)
jmp 0x237b30
movl $0x64, %eax
movl %eax, -0xa8(%rbp)
jmp 0x237b30
movl -0xa8(%rbp), %eax
movl %eax, %eax
addq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
cmpq $-0x1, (%rax,%rcx,8)
jne 0x237b67
movq -0x48(%rbp), %rax
subq $0x64, %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
cmpq -0x48(%rbp), %rax
ja 0x237ba5
movq -0x38(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq -0x28(%rbp), %rcx
movl 0x10(%rcx), %ecx
cmpq %rcx, %rax
jae 0x237ba5
movq -0x28(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
cmpq $-0x1, 0x8(%rax,%rcx,8)
jne 0x237ba5
movq -0x48(%rbp), %rax
addq $0x64, %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
movq 0x10(%rbp), %rax
cmpq -0x38(%rbp), %rax
jne 0x237bbf
movq -0x48(%rbp), %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movq %rax, -0x60(%rbp)
jmp 0x237bc1
movq -0x38(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x38(%rbp)
jmp 0x237a76
movq -0x10(%rbp), %rax
movq %rax, -0x38(%rbp)
movq -0x38(%rbp), %rax
cmpq -0x18(%rbp), %rax
jae 0x238132
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
shlq %rax
movq -0x8(%rbp), %rdx
movl $0x40, %ecx
subq 0x48(%rdx), %rcx
shrq %cl, %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
shlq $0x5, %rdx
addq %rdx, %rcx
movq 0x8(%rcx), %rdx
shlq %rdx
movq -0x8(%rbp), %rsi
movl $0x40, %ecx
subq 0x48(%rsi), %rcx
shrq %cl, %rdx
movq %rdx, %rcx
cmpq %rcx, %rax
je 0x237c48
jmp 0x238121
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
movq %rax, -0x68(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
shrq $0x3f, %rax
cmpq $0x0, %rax
je 0x237d34
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
addq $0x1, %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
shlq $0x5, %rdx
addq %rdx, %rcx
movq 0x18(%rcx), %rcx
shrq $0x20, %rcx
cmpq %rcx, %rax
jb 0x237d19
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
addq $0x1, %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
shlq $0x5, %rdx
addq %rdx, %rcx
movq 0x18(%rcx), %rcx
shrq $0x20, %rcx
subq %rcx, %rax
movq %rax, -0xb0(%rbp)
jmp 0x237d24
xorl %eax, %eax
movq %rax, -0xb0(%rbp)
jmp 0x237d24
movq -0xb0(%rbp), %rax
movq %rax, -0xb8(%rbp)
jmp 0x237d7b
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
shlq $0x5, %rdx
addq %rdx, %rcx
movq 0x18(%rcx), %rcx
shrq $0x20, %rcx
addq %rcx, %rax
subq $0x1, %rax
movq %rax, -0xb8(%rbp)
movq -0xb8(%rbp), %rax
movq %rax, -0x70(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
movq %rax, -0x78(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x8(%rax), %rax
shrq $0x3f, %rax
cmpq $0x0, %rax
je 0x237e72
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
addq $0x1, %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
shlq $0x5, %rdx
addq %rdx, %rcx
movq 0x18(%rcx), %rcx
movl %ecx, %ecx
cmpq %rcx, %rax
jb 0x237e57
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
addq $0x1, %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
shlq $0x5, %rdx
addq %rdx, %rcx
movq 0x18(%rcx), %rcx
movl %ecx, %ecx
subq %rcx, %rax
movq %rax, -0xc0(%rbp)
jmp 0x237e62
xorl %eax, %eax
movq %rax, -0xc0(%rbp)
jmp 0x237e62
movq -0xc0(%rbp), %rax
movq %rax, -0xc8(%rbp)
jmp 0x237eb8
movq -0x8(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
shlq $0x5, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
andq 0x50(%rcx), %rax
movq -0x8(%rbp), %rcx
movq 0x10(%rcx), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rdx
shlq $0x5, %rdx
addq %rdx, %rcx
movq 0x18(%rcx), %rcx
movl %ecx, %ecx
addq %rcx, %rax
subq $0x1, %rax
movq %rax, -0xc8(%rbp)
movq -0xc8(%rbp), %rax
movq %rax, -0x80(%rbp)
movq -0x68(%rbp), %rax
cmpq -0x70(%rbp), %rax
ja 0x237eda
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rax, -0xd0(%rbp)
jmp 0x237ee5
movq -0x70(%rbp), %rax
movq %rax, -0xd0(%rbp)
movq -0xd0(%rbp), %rax
movq %rax, -0xd8(%rbp)
movq -0x78(%rbp), %rax
cmpq -0x80(%rbp), %rax
ja 0x237f0a
movq -0x78(%rbp), %rax
movq %rax, -0xe0(%rbp)
jmp 0x237f15
movq -0x80(%rbp), %rax
movq %rax, -0xe0(%rbp)
movq -0xd8(%rbp), %rax
movq -0xe0(%rbp), %rcx
cmpq %rcx, %rax
ja 0x237f5a
movq -0x68(%rbp), %rax
cmpq -0x70(%rbp), %rax
ja 0x237f3f
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rax, -0xe8(%rbp)
jmp 0x237f4a
movq -0x70(%rbp), %rax
movq %rax, -0xe8(%rbp)
movq -0xe8(%rbp), %rax
movq %rax, -0xf0(%rbp)
jmp 0x237f8a
movq -0x78(%rbp), %rax
cmpq -0x80(%rbp), %rax
ja 0x237f71
movq -0x78(%rbp), %rax
movq %rax, -0xf8(%rbp)
jmp 0x237f7c
movq -0x80(%rbp), %rax
movq %rax, -0xf8(%rbp)
movq -0xf8(%rbp), %rax
movq %rax, -0xf0(%rbp)
movq -0xf0(%rbp), %rax
movq %rax, -0x88(%rbp)
movq -0x88(%rbp), %rax
movq -0x20(%rbp), %rcx
subq $0x1, %rcx
cmpq %rcx, %rax
ja 0x237fbc
movq -0x88(%rbp), %rax
movq %rax, -0x100(%rbp)
jmp 0x237fcb
movq -0x20(%rbp), %rax
subq $0x1, %rax
movq %rax, -0x100(%rbp)
movq -0x100(%rbp), %rax
movq %rax, -0x88(%rbp)
movq -0x68(%rbp), %rax
cmpq -0x70(%rbp), %rax
jb 0x237ff0
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rax, -0x108(%rbp)
jmp 0x237ffb
movq -0x70(%rbp), %rax
movq %rax, -0x108(%rbp)
movq -0x108(%rbp), %rax
movq %rax, -0x110(%rbp)
movq -0x78(%rbp), %rax
cmpq -0x80(%rbp), %rax
jb 0x238020
movq -0x78(%rbp), %rax
movq %rax, -0x118(%rbp)
jmp 0x23802b
movq -0x80(%rbp), %rax
movq %rax, -0x118(%rbp)
movq -0x110(%rbp), %rax
movq -0x118(%rbp), %rcx
cmpq %rcx, %rax
jb 0x238070
movq -0x68(%rbp), %rax
cmpq -0x70(%rbp), %rax
jb 0x238055
movq -0x68(%rbp), %rax
movq %rax, -0x120(%rbp)
jmp 0x238060
movq -0x70(%rbp), %rax
movq %rax, -0x120(%rbp)
movq -0x120(%rbp), %rax
movq %rax, -0x128(%rbp)
jmp 0x2380a0
movq -0x78(%rbp), %rax
cmpq -0x80(%rbp), %rax
jb 0x238087
movq -0x78(%rbp), %rax
movq %rax, -0x130(%rbp)
jmp 0x238092
movq -0x80(%rbp), %rax
movq %rax, -0x130(%rbp)
movq -0x130(%rbp), %rax
movq %rax, -0x128(%rbp)
movq -0x128(%rbp), %rax
movq %rax, -0x90(%rbp)
movq -0x90(%rbp), %rax
movq -0x20(%rbp), %rcx
subq $0x1, %rcx
cmpq %rcx, %rax
ja 0x2380d2
movq -0x90(%rbp), %rax
movq %rax, -0x138(%rbp)
jmp 0x2380e1
movq -0x20(%rbp), %rax
subq $0x1, %rax
movq %rax, -0x138(%rbp)
movq -0x138(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x90(%rbp)
movq -0x88(%rbp), %rax
cmpq -0x58(%rbp), %rax
ja 0x23811f
movq -0x90(%rbp), %rax
cmpq -0x60(%rbp), %rax
jb 0x23811f
movq -0x98(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x98(%rbp)
jmp 0x238121
movq -0x38(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x38(%rbp)
jmp 0x237bda
movq 0x18bea7(%rip), %rax    # 0x3c3fe0
movq (%rax), %rdi
movq -0x98(%rbp), %rdx
movq 0x18(%rbp), %rcx
leaq 0x1563fb(%rip), %rsi    # 0x38e549
movb $0x0, %al
callq 0x22a0
addq $0x140, %rsp            # imm = 0x140
popq %rbp
retq
nop