// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/ugobas[P]tnm/mutation.c
// Function: Optimize_coeff
float Optimize_coeff(float *C_size_opt, float *C_stab_opt, float *C_dist_opt,
		     float *MSD_mut, float *MSD_cross,
		     float *A_mut, float *A_nomut,float *A_cross,float *offset,
		     float *pred_mut_3, float *pred_mut_2,
		     float *pred_mut_tot_2, 
		     int Na, int *n_cont_mut, float *Force, float *Force_coeff,
		     float *pred_mut_Cart, int N_Cart, 
		     float *pred_mut_Tors, int N_axes,
		     char *AAwt, int *Posmut, char *AAmut, int Nmut,
		     int **clist, int **cnum, struct interaction *Int_list,
		     struct residue *seq, int Nres, atom *atoms, int *resatom,
		     struct Reference Ref_kin,
		     int *kin_atom, struct Normal_Mode NM, float *sigma2,
		     float **B3, float *B_pred,
		     float *str_diff_3, float *str_diff_2)
{
  float y_max=-1000; float DE=0;
  ini_fit=1;

  // Initialize parameters
  float C_size=*C_size_opt, C_stab=*C_stab_opt, C_dist=*C_dist_opt;

  printf("Optimizing mutation coefficients\n");
  int ifit=0, j, n_fail=0;
  for(int it=0; it<200; it++){
    float x[3], y[3], yy, *C_move, *C_move_opt;
    if(ifit==0){C_move=&C_size; C_move_opt=C_size_opt; ifit=1;}
    else{C_move=&C_dist; C_move_opt=C_dist_opt; ifit=0;}
    if(it==0){
      y_max=Pred_mut_str(C_size, C_stab, C_dist, &DE, MSD_mut, MSD_cross,
			 A_mut, A_nomut, A_cross, offset,
			 pred_mut_3, pred_mut_2, pred_mut_tot_2, Na,
			 n_cont_mut, Force, Force_coeff,
			 pred_mut_Cart, N_Cart, pred_mut_Tors, N_axes, 
			 AAwt,Posmut,AAmut,Nmut,clist,cnum,Int_list,seq,Nres,
			 atoms, resatom, Ref_kin, kin_atom, NM, sigma2,
			 B3, B_pred, str_diff_2, str_diff_3);
      printf("%d cc: %.4g Weights: %.3g %.3g %.3g\n",
	     -1,y_max,C_size/scale_C,C_stab/scale_C,C_dist/scale_C);
    }
    x[1]=*C_move; y[1]=y_max; int j_max=1;
    float x_min=0, x_max=x[1]*100;
    for(j=0; j<=2; j+=2){
      if(j==0){x[0]=x[1]*0.85;}
      else if(j==2){x[2]=x[1]*1.15;}
      *C_move=x[j];
      y[j]=Pred_mut_str(C_size, C_stab, C_dist, &DE, MSD_mut, MSD_cross,
			A_mut, A_nomut, A_cross, offset,
			pred_mut_3, pred_mut_2, pred_mut_tot_2, Na,
			n_cont_mut, Force, Force_coeff,
			pred_mut_Cart, N_Cart, pred_mut_Tors, N_axes, 
			AAwt,Posmut,AAmut,Nmut,clist,cnum,Int_list,seq,Nres,
			atoms, resatom, Ref_kin, kin_atom, NM, sigma2,
			B3, B_pred, str_diff_3, str_diff_2);
      if(y[j] > y_max){y_max=y[j]; j_max=j;}
    }
    // Determine new value of x and test its score
    *C_move=Find_max_quad(x[0], x[1], x[2], y[0], y[1], y[2], x_min, x_max);
    if(*C_move==x[j_max]){yy=y_max;}
    else{
      yy=Pred_mut_str(C_size, C_stab, C_dist, &DE, MSD_mut, MSD_cross, 
		      A_mut, A_nomut, A_cross, offset,
		      pred_mut_3, pred_mut_2, pred_mut_tot_2, Na,
		      n_cont_mut, Force, Force_coeff,
		      pred_mut_Cart, N_Cart, pred_mut_Tors, N_axes, 
		      AAwt,Posmut,AAmut,Nmut,clist,cnum,Int_list,seq,Nres,
		      atoms, resatom, Ref_kin, kin_atom, NM, sigma2,
		      B3, B_pred, str_diff_3, str_diff_2);
    }
    printf("%d cc: %.4g Weights: %.3g %.3g %.3g\n",
	   it,yy,C_size/scale_C,C_stab/scale_C,C_dist/scale_C);
    if(yy > y_max){
      n_fail=0; y_max=yy;
    }else if(j_max!=1){
      n_fail=0; *C_move=x[j_max];
    }else{
      // Score does not improve. If two consecutive failures, exit.
      n_fail++; *C_move=x[j_max];
    }
    *C_move_opt=*C_move;
    if(n_fail>=2){
      printf("%d consecutive decreases, exiting\n", n_fail); break;
    }
  } // end iterations
  // Recompute
  y_max=Pred_mut_str(*C_size_opt, *C_stab_opt, *C_dist_opt, &DE,
		     MSD_mut, MSD_cross,
		     A_mut, A_nomut, A_cross, offset,
		     pred_mut_3, pred_mut_2, pred_mut_tot_2, Na,
		     n_cont_mut, Force, Force_coeff,
		     pred_mut_Cart, N_Cart, pred_mut_Tors, N_axes, 
		     AAwt,Posmut,AAmut,Nmut,clist,cnum,Int_list,seq,Nres,
		     atoms, resatom, Ref_kin, kin_atom, NM, sigma2,
		     B3, B_pred, str_diff_3, str_diff_2);
  printf("mut_pred_score: %.4g  Weights: %.3g %.3g %.3g\n",
  	 y_max, *C_size_opt/scale_C, *C_stab_opt/scale_C, *C_dist_opt/scale_C);

  return(y_max);
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
pushq %r15
pushq %r14
pushq %r13
pushq %r12
pushq %rbx
subq $0x5a8, %rsp            # imm = 0x5A8
movq 0x200(%rbp), %rax
movq 0x1f8(%rbp), %rax
movq 0x1f0(%rbp), %rax
movq 0x1e8(%rbp), %rax
movq 0x1e0(%rbp), %rax
leaq 0x110(%rbp), %rax
movq %rax, -0xc8(%rbp)
movq 0x108(%rbp), %rax
leaq 0xd8(%rbp), %rax
movq %rax, -0xc0(%rbp)
movq 0xd0(%rbp), %rax
movq 0xc8(%rbp), %rax
movl 0xc0(%rbp), %eax
movq 0xb8(%rbp), %rax
movq 0xb0(%rbp), %rax
movq 0xa8(%rbp), %rax
movq 0xa0(%rbp), %rax
movl 0x98(%rbp), %eax
movq 0x90(%rbp), %rax
movq 0x88(%rbp), %rax
movq 0x80(%rbp), %rax
movl 0x78(%rbp), %eax
movq 0x70(%rbp), %rax
movl 0x68(%rbp), %eax
movq 0x60(%rbp), %rax
movq 0x58(%rbp), %rax
movq 0x50(%rbp), %rax
movq 0x48(%rbp), %rax
movl 0x40(%rbp), %eax
movq 0x38(%rbp), %rax
movq 0x30(%rbp), %rax
movq 0x28(%rbp), %rax
movq 0x20(%rbp), %rax
movq 0x18(%rbp), %rax
movq 0x10(%rbp), %rax
movq %rdi, -0x30(%rbp)
movq %rsi, -0x38(%rbp)
movq %rdx, -0x40(%rbp)
movq %rcx, -0x48(%rbp)
movq %r8, -0x50(%rbp)
movq %r9, -0x58(%rbp)
movss 0x26f2e(%rip), %xmm0    # 0x7eb18
movss %xmm0, -0x5c(%rbp)
xorps %xmm0, %xmm0
movss %xmm0, -0x60(%rbp)
movl $0x1, 0x34323(%rip)     # 0x8bf24
movq -0x30(%rbp), %rax
movss (%rax), %xmm0
movss %xmm0, -0x64(%rbp)
movq -0x38(%rbp), %rax
movss (%rax), %xmm0
movss %xmm0, -0x68(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movss (%rax), %xmm0
movss %xmm0, -0x6c(%rbp)
leaq 0x2a026(%rip), %rdi     # 0x81c55
movb $0x0, %al
callq 0x10d0
movl $0x0, -0x70(%rbp)
movl $0x0, -0x78(%rbp)
movl $0x0, -0x7c(%rbp)
cmpl $0xc8, -0x7c(%rbp)
jge 0x5888a
cmpl $0x0, -0x70(%rbp)
jne 0x57c7d
leaq -0x64(%rbp), %rax
movq %rax, -0xa0(%rbp)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq %rax, -0xa8(%rbp)
movl $0x1, -0x70(%rbp)
jmp 0x57c9a
leaq -0x6c(%rbp), %rax
movq %rax, -0xa0(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq %rax, -0xa8(%rbp)
movl $0x0, -0x70(%rbp)
cmpl $0x0, -0x7c(%rbp)
jne 0x57ff3
movq -0xc0(%rbp), %rax
movq -0xc8(%rbp), %rsi
movss -0x64(%rbp), %xmm0
movss -0x68(%rbp), %xmm1
movss -0x6c(%rbp), %xmm2
movq -0x48(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x190(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rdx
movq -0x58(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0xd0(%rbp)
movq 0x10(%rbp), %r8
movq 0x18(%rbp), %r9
movq 0x20(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x188(%rbp)
movq 0x28(%rbp), %r10
movq 0x30(%rbp), %r11
movq 0x38(%rbp), %rbx
movl 0x40(%rbp), %r14d
movq 0x48(%rbp), %r15
movq 0x50(%rbp), %r12
movq 0x58(%rbp), %r13
movq 0x60(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0xd8(%rbp)
movl 0x68(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0xdc(%rbp)
movq 0x70(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0xe8(%rbp)
movl 0x78(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0xec(%rbp)
movq 0x80(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0xf8(%rbp)
movq 0x88(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x100(%rbp)
movq 0x90(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x108(%rbp)
movl 0x98(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0x10c(%rbp)
movq 0xa0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x118(%rbp)
movq 0xa8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x120(%rbp)
movq 0xb0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x128(%rbp)
movq 0xb8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x130(%rbp)
movl 0xc0(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0x134(%rbp)
movq 0xc8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x140(%rbp)
movq 0xd0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x148(%rbp)
movq 0x108(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x150(%rbp)
movq 0x1e0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x158(%rbp)
movq 0x1e8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x160(%rbp)
movq 0x1f0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x168(%rbp)
movq 0x200(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x170(%rbp)
movq 0x1f8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x180(%rbp)
movq %rsp, %rdi
movq %rdi, -0x178(%rbp)
addq $0xf0, %rdi
movl $0x1a, %ecx
rep  movsq (%rsi), %es:(%rdi)
movq -0x190(%rbp), %rsi
movq -0x188(%rbp), %rdi
movq -0x180(%rbp), %rcx
movups (%rax), %xmm3
movups 0x10(%rax), %xmm4
movups 0x20(%rax), %xmm5
movq -0x178(%rbp), %rax
movups %xmm5, 0xd8(%rax)
movups %xmm4, 0xc8(%rax)
movups %xmm3, 0xb8(%rax)
movq %rcx, 0x1e0(%rax)
movq -0x170(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1d8(%rax)
movq -0x168(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1d0(%rax)
movq -0x160(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1c8(%rax)
movq -0x158(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1c0(%rax)
movq -0x150(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0xe8(%rax)
movq -0x148(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0xb0(%rax)
movq -0x140(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0xa8(%rax)
movl -0x134(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0xa0(%rax)
movq -0x130(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x98(%rax)
movq -0x128(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x90(%rax)
movq -0x120(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x88(%rax)
movq -0x118(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x80(%rax)
movl -0x10c(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0x78(%rax)
movq -0x108(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x70(%rax)
movq -0x100(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x68(%rax)
movq -0xf8(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x60(%rax)
movl -0xec(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0x58(%rax)
movq -0xe8(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x50(%rax)
movl -0xdc(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0x48(%rax)
movq -0xd8(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x40(%rax)
movq -0xd0(%rbp), %rcx
movq %r13, 0x38(%rax)
movq %r12, 0x30(%rax)
movq %r15, 0x28(%rax)
movl %r14d, 0x20(%rax)
movq %rbx, 0x18(%rax)
movq %r11, 0x10(%rax)
movq %r10, 0x8(%rax)
movq %rdi, (%rax)
leaq -0x60(%rbp), %rdi
callq 0x58c00
movss %xmm0, -0x5c(%rbp)
movss -0x5c(%rbp), %xmm0
cvtss2sd %xmm0, %xmm0
movss -0x64(%rbp), %xmm1
divss 0x445a2(%rip), %xmm1    # 0x9c55c
cvtss2sd %xmm1, %xmm1
movss -0x68(%rbp), %xmm2
divss 0x44591(%rip), %xmm2    # 0x9c55c
cvtss2sd %xmm2, %xmm2
movss -0x6c(%rbp), %xmm3
divss 0x44580(%rip), %xmm3    # 0x9c55c
cvtss2sd %xmm3, %xmm3
leaq 0x29c90(%rip), %rdi     # 0x81c77
movl $0xffffffff, %esi       # imm = 0xFFFFFFFF
movb $0x4, %al
callq 0x10d0
movq -0xa0(%rbp), %rax
movss (%rax), %xmm0
movss %xmm0, -0x84(%rbp)
movss -0x5c(%rbp), %xmm0
movss %xmm0, -0x90(%rbp)
movl $0x1, -0xac(%rbp)
xorps %xmm0, %xmm0
movss %xmm0, -0xb0(%rbp)
movss 0x1e080(%rip), %xmm0    # 0x760b0
mulss -0x84(%rbp), %xmm0
movss %xmm0, -0xb4(%rbp)
movl $0x0, -0x74(%rbp)
cmpl $0x2, -0x74(%rbp)
jg 0x58404
cmpl $0x0, -0x74(%rbp)
jne 0x5807d
movss -0x84(%rbp), %xmm0
cvtss2sd %xmm0, %xmm0
movsd 0x292a5(%rip), %xmm1    # 0x81310
mulsd %xmm1, %xmm0
cvtsd2ss %xmm0, %xmm0
movss %xmm0, -0x88(%rbp)
jmp 0x580a6
cmpl $0x2, -0x74(%rbp)
jne 0x580a4
movss -0x84(%rbp), %xmm0
cvtss2sd %xmm0, %xmm0
movsd 0x29271(%rip), %xmm1    # 0x81308
mulsd %xmm1, %xmm0
cvtsd2ss %xmm0, %xmm0
movss %xmm0, -0x80(%rbp)
jmp 0x580a6
movq -0xc0(%rbp), %rax
movq -0xc8(%rbp), %rsi
movslq -0x74(%rbp), %rcx
movss -0x88(%rbp,%rcx,4), %xmm0
movq -0xa0(%rbp), %rcx
movss %xmm0, (%rcx)
movss -0x64(%rbp), %xmm0
movss -0x68(%rbp), %xmm1
movss -0x6c(%rbp), %xmm2
movq -0x48(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x258(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rdx
movq -0x58(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x198(%rbp)
movq 0x10(%rbp), %r8
movq 0x18(%rbp), %r9
movq 0x20(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x250(%rbp)
movq 0x28(%rbp), %r10
movq 0x30(%rbp), %r11
movq 0x38(%rbp), %rbx
movl 0x40(%rbp), %r14d
movq 0x48(%rbp), %r15
movq 0x50(%rbp), %r12
movq 0x58(%rbp), %r13
movq 0x60(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1a0(%rbp)
movl 0x68(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0x1a4(%rbp)
movq 0x70(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1b0(%rbp)
movl 0x78(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0x1b4(%rbp)
movq 0x80(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1c0(%rbp)
movq 0x88(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1c8(%rbp)
movq 0x90(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1d0(%rbp)
movl 0x98(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0x1d4(%rbp)
movq 0xa0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1e0(%rbp)
movq 0xa8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1e8(%rbp)
movq 0xb0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1f0(%rbp)
movq 0xb8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x1f8(%rbp)
movl 0xc0(%rbp), %ecx
movl %ecx, -0x1fc(%rbp)
movq 0xc8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x208(%rbp)
movq 0xd0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x210(%rbp)
movq 0x108(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x218(%rbp)
movq 0x1e0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x220(%rbp)
movq 0x1e8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x228(%rbp)
movq 0x1f0(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x230(%rbp)
movq 0x1f8(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x238(%rbp)
movq 0x200(%rbp), %rcx
movq %rcx, -0x248(%rbp)
movq %rsp, %rdi
movq %rdi, -0x240(%rbp)
addq $0xf0, %rdi
movl $0x1a, %ecx
rep  movsq (%rsi), %es:(%rdi)
movq -0x258(%rbp), %rsi
movq -0x250(%rbp), %rdi
movq -0x248(%rbp), %rcx
movups (%rax), %xmm3
movups 0x10(%rax), %xmm4
movups 0x20(%rax), %xmm5
movq -0x240(%rbp), %rax
movups %xmm5, 0xd8(%rax)
movups %xmm4, 0xc8(%rax)
movups %xmm3, 0xb8(%rax)
movq %rcx, 0x1e0(%rax)
movq -0x238(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1d8(%rax)
movq -0x230(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1d0(%rax)
movq -0x228(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1c8(%rax)
movq -0x220(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x1c0(%rax)
movq -0x218(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0xe8(%rax)
movq -0x210(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0xb0(%rax)
movq -0x208(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0xa8(%rax)
movl -0x1fc(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0xa0(%rax)
movq -0x1f8(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x98(%rax)
movq -0x1f0(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x90(%rax)
movq -0x1e8(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x88(%rax)
movq -0x1e0(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x80(%rax)
movl -0x1d4(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0x78(%rax)
movq -0x1d0(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x70(%rax)
movq -0x1c8(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x68(%rax)
movq -0x1c0(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x60(%rax)
movl -0x1b4(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0x58(%rax)
movq -0x1b0(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x50(%rax)
movl -0x1a4(%rbp), %ecx
movl %ecx, 0x48(%rax)
movq -0x1a0(%rbp), %rcx
movq %rcx, 0x40(%rax)
movq -0x198(%rbp), %rcx
movq %r13, 0x38(%rax)
movq %r12, 0x30(%rax)
movq %r15, 0x28(%rax)
movl %r14d, 0x20(%rax)
movq %rbx, 0x18(%rax)
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movslq -0x74(%rbp), %rax
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jbe 0x583f4
movslq -0x74(%rbp), %rax
movss -0x94(%rbp,%rax,4), %xmm0
movss %xmm0, -0x5c(%rbp)
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movl %eax, -0xac(%rbp)
jmp 0x583f6
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addl $0x2, %eax
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jmp 0x58047
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callq 0x5cf00
movq -0xa0(%rbp), %rax
movss %xmm0, (%rax)
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movss (%rax), %xmm0
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jp 0x58481
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movq %rcx, -0x2f8(%rbp)
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jmp 0x5884b
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movss (%rax), %xmm0
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cmpl $0x2, -0x78(%rbp)
jl 0x5887a
movl -0x78(%rbp), %esi
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movb $0x0, %al
callq 0x10d0
jmp 0x5888a
jmp 0x5887c
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addl $0x1, %eax
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jmp 0x57c4b
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movl %r14d, 0x20(%rax)
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movq %rdi, (%rax)
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divss 0x439b0(%rip), %xmm1    # 0x9c55c
cvtss2sd %xmm1, %xmm1
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movss (%rax), %xmm3
divss 0x43988(%rip), %xmm3    # 0x9c55c
cvtss2sd %xmm3, %xmm3
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movb $0x4, %al
callq 0x10d0
movss -0x5c(%rbp), %xmm0
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popq %rbx
popq %r12
popq %r13
popq %r14
popq %r15
popq %rbp
retq
nopl (%rax)