// File: myudelson[P]hmm-scalable/HMMProblemSlicedA.cpp
// Function: HMMProblemSlicedA::doLagrangeStep(FitBitSlicedA*)
NUMBER HMMProblemSlicedA::doLagrangeStep(FitBitSlicedA *fb) {
	NPAR nS = this->p->nS, nO = this->p->nO, nZ = this->p->nZ;
	NPAR i,j,m,z;
    
    NUMBER  ll = 0;
	NUMBER * b_PI = init1D<NUMBER>((NDAT)nS);
    NUMBER   b_PI_den = 0;
	NUMBER *** b_A     = init3D<NUMBER>((NDAT)nZ, (NDAT)nS, (NDAT)nS);
	NUMBER **  b_A_den = init2D<NUMBER>((NDAT)nZ, (NDAT)nS);
	NUMBER ** b_B     = init2D<NUMBER>((NDAT)nS, (NDAT)nO);
	NUMBER *  b_B_den = init1D<NUMBER>((NDAT)nS);
	// compute sums PI
    
    NUMBER buf = 0;
    if( fb->pi != NULL ) {
        // collapse PI
        for(i=0; i<nS; i++) {
            buf = -fb->pi[i]*fb->gradPI[i]; /*negatie since were going against gradient*/
            b_PI_den += buf;
            b_PI[i] += buf;
        }
        // divide PI
        for(i=0; i<nS; i++)
            fb->pi[i] = (b_PI_den>0) ? (b_PI[i] / b_PI_den) : fb->pi[i];
    }
    // collapse A
    for(z=0; z<nZ; z++)
        for(i=0; i<nS; i++) {
            if( fb->A != NULL ) {
                for(j=0; j<nS; j++){
                    buf = -fb->A[z][i][j]*fb->gradA[z][i][j]; /*negatie since were going against gradient*/
                    b_A_den[z][i] += buf;
                    b_A[z][i][j] += buf;
                }
            }
        }
    // collapse B
    for(i=0; i<nS; i++) {
        if( fb->B != NULL ) {
            for(m=0; m<nO; m++) {
                buf = -fb->B[i][m]*fb->gradB[i][m]; /*negatie since were going against gradient*/
                b_B_den[i] += buf;
                b_B[i][m] += buf;
            }
        }
    }
    // divide A, B
    for(i=0; i<nS; i++) {
        if( fb->pi != NULL )
            fb->pi[i] = (b_PI_den>0) ? (b_PI[i] / b_PI_den) : fb->pi[i];
        if( fb->A != NULL )
            for(z=0; z<nZ; z++)
                for(j=0; j<nS; j++)
                    fb->A[z][i][j] = (b_A_den[z][i]>0) ? (b_A[z][i][j] / b_A_den[z][i]) : fb->A[z][i][j];
        if( fb->B != NULL )
            for(m=0; m<nO; m++)
                fb->B[i][m] = (b_B_den[i]>0) ? (b_B[i][m] / b_B_den[i]) : fb->B[i][m];
    }
    // scale
    if( !this->hasNon01Constraints() ) {
        if( fb->pi != NULL ) projectsimplex(fb->pi, nS);
        for(i=0; i<nS; i++) {
            for(z=0; z<nZ; z++)
                if( fb->A != NULL ) projectsimplex(fb->A[z][i], nS);
            if( fb->B != NULL ) projectsimplex(fb->B[i], nS);
        }
    } else {
        if( fb->pi != NULL ) projectsimplexbounded(fb->pi, this->getLbPI(), this->getUbPI(), nS);
        for(i=0; i<nS; i++) {
            for(z=0; z<nZ; z++)
                if( fb->A != NULL ) projectsimplexbounded(fb->A[z][i], this->getLbA()[z][i], this->getUbA()[z][i], nS); // tag is current slice
            if( fb->B != NULL ) projectsimplexbounded(fb->B[i], this->getLbB()[i], this->getUbB()[i], nO);
        }
    }
    // compute LL
    computeAlphaAndPOParam(fb->xndat, fb->x_data);
    ll = HMMProblemSlicedA::getSumLogPOPara(fb->xndat, fb->x_data);

	free(b_PI);
	free3D<NUMBER>(b_A, nZ, nS);
	free2D<NUMBER>(b_A_den, nZ);
	free2D<NUMBER>(b_B, nS);
	free(b_B_den);
    
    return ll;
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0xb0, %rsp
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movq %rsi, -0x10(%rbp)
movq -0x8(%rbp), %rax
movq %rax, -0x60(%rbp)
movq 0x88(%rax), %rcx
movb 0x8b8(%rcx), %cl
movb %cl, -0x11(%rbp)
movq 0x88(%rax), %rcx
movb 0x8b9(%rcx), %cl
movb %cl, -0x12(%rbp)
movq 0x88(%rax), %rax
movb 0x8c8(%rax), %al
movb %al, -0x13(%rbp)
xorps %xmm0, %xmm0
movsd %xmm0, -0x20(%rbp)
movsbl -0x11(%rbp), %edi
callq 0xc410
movq %rax, -0x28(%rbp)
xorps %xmm0, %xmm0
movsd %xmm0, -0x30(%rbp)
movsbl -0x13(%rbp), %edi
movsbl -0x11(%rbp), %esi
movsbl -0x11(%rbp), %edx
callq 0x11310
movq %rax, -0x38(%rbp)
movsbl -0x13(%rbp), %edi
movsbl -0x11(%rbp), %esi
callq 0xf580
movq %rax, -0x40(%rbp)
movsbl -0x11(%rbp), %edi
movsbl -0x12(%rbp), %esi
callq 0xf580
movq %rax, -0x48(%rbp)
movsbl -0x11(%rbp), %edi
callq 0xc410
movq %rax, -0x50(%rbp)
xorps %xmm0, %xmm0
movsd %xmm0, -0x58(%rbp)
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
je 0x4a566
movb $0x0, -0x14(%rbp)
movsbl -0x14(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a4f4
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movq %xmm0, %rax
movabsq $-0x8000000000000000, %rcx # imm = 0x8000000000000000
xorq %rcx, %rax
movq %rax, %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x58(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
mulsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x58(%rbp)
movsd -0x58(%rbp), %xmm0
addsd -0x30(%rbp), %xmm0
movsd %xmm0, -0x30(%rbp)
movsd -0x58(%rbp), %xmm0
movq -0x28(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
addsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movb -0x14(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x14(%rbp)
jmp 0x4a477
movb $0x0, -0x14(%rbp)
movsbl -0x14(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a564
movsd -0x30(%rbp), %xmm0
xorps %xmm1, %xmm1
ucomisd %xmm1, %xmm0
jbe 0x4a52c
movq -0x28(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
divsd -0x30(%rbp), %xmm0
movsd %xmm0, -0x68(%rbp)
jmp 0x4a543
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x68(%rbp)
movsd -0x68(%rbp), %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movb -0x14(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x14(%rbp)
jmp 0x4a4f8
jmp 0x4a566
movb $0x0, -0x17(%rbp)
movsbl -0x17(%rbp), %eax
movsbl -0x13(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a68d
movb $0x0, -0x14(%rbp)
movsbl -0x14(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a67e
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x18(%rax)
je 0x4a66f
movb $0x0, -0x15(%rbp)
movsbl -0x15(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a66d
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x15(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movq %xmm0, %rax
movabsq $-0x8000000000000000, %rcx # imm = 0x8000000000000000
xorq %rcx, %rax
movq %rax, %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x60(%rax), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x15(%rbp), %rcx
mulsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x58(%rbp)
movsd -0x58(%rbp), %xmm0
movq -0x40(%rbp), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
addsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movsd -0x58(%rbp), %xmm0
movq -0x38(%rbp), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x15(%rbp), %rcx
addsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movb -0x15(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x15(%rbp)
jmp 0x4a5a1
jmp 0x4a66f
jmp 0x4a671
movb -0x14(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x14(%rbp)
jmp 0x4a57e
jmp 0x4a680
movb -0x17(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x17(%rbp)
jmp 0x4a56a
movb $0x0, -0x14(%rbp)
movsbl -0x14(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a76d
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x20(%rax)
je 0x4a75e
movb $0x0, -0x16(%rbp)
movsbl -0x16(%rbp), %eax
movsbl -0x12(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a75c
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x16(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movq %xmm0, %rax
movabsq $-0x8000000000000000, %rcx # imm = 0x8000000000000000
xorq %rcx, %rax
movq %rax, %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x68(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x16(%rbp), %rcx
mulsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x58(%rbp)
movsd -0x58(%rbp), %xmm0
movq -0x50(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
addsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movsd -0x58(%rbp), %xmm0
movq -0x48(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x16(%rbp), %rcx
addsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movb -0x16(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x16(%rbp)
jmp 0x4a6b4
jmp 0x4a75e
jmp 0x4a760
movb -0x14(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x14(%rbp)
jmp 0x4a691
movb $0x0, -0x14(%rbp)
movsbl -0x14(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a9ab
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
je 0x4a7e2
movsd -0x30(%rbp), %xmm0
xorps %xmm1, %xmm1
ucomisd %xmm1, %xmm0
jbe 0x4a7b4
movq -0x28(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
divsd -0x30(%rbp), %xmm0
movsd %xmm0, -0x70(%rbp)
jmp 0x4a7cb
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x70(%rbp)
movsd -0x70(%rbp), %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x18(%rax)
je 0x4a8e7
movb $0x0, -0x17(%rbp)
movsbl -0x17(%rbp), %eax
movsbl -0x13(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a8e5
movb $0x0, -0x15(%rbp)
movsbl -0x15(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a8d6
movq -0x40(%rbp), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
xorps %xmm1, %xmm1
ucomisd %xmm1, %xmm0
jbe 0x4a877
movq -0x38(%rbp), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x15(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movq -0x40(%rbp), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
divsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x78(%rbp)
jmp 0x4a8a0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x15(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x78(%rbp)
movsd -0x78(%rbp), %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x15(%rbp), %rcx
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movb -0x15(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x15(%rbp)
jmp 0x4a809
jmp 0x4a8d8
movb -0x17(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x17(%rbp)
jmp 0x4a7f5
jmp 0x4a8e7
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x20(%rax)
je 0x4a99c
movb $0x0, -0x16(%rbp)
movsbl -0x16(%rbp), %eax
movsbl -0x12(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4a99a
movq -0x50(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
xorps %xmm1, %xmm1
ucomisd %xmm1, %xmm0
jbe 0x4a94d
movq -0x48(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x16(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movq -0x50(%rbp), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
divsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x80(%rbp)
jmp 0x4a96d
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x16(%rbp), %rcx
movsd (%rax,%rcx,8), %xmm0
movsd %xmm0, -0x80(%rbp)
movsd -0x80(%rbp), %xmm0
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x16(%rbp), %rcx
movsd %xmm0, (%rax,%rcx,8)
movb -0x16(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x16(%rbp)
jmp 0x4a8fa
jmp 0x4a99c
jmp 0x4a99e
movb -0x14(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x14(%rbp)
jmp 0x4a771
movq -0x60(%rbp), %rdi
callq 0x1a4e0
testb $0x1, %al
jne 0x4aa6b
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
je 0x4a9d8
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rdi
movsbl -0x11(%rbp), %esi
callq 0x7980
movb $0x0, -0x14(%rbp)
movsbl -0x14(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4aa66
movb $0x0, -0x17(%rbp)
movsbl -0x17(%rbp), %eax
movsbl -0x13(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4aa32
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x18(%rax)
je 0x4aa26
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rdi
movsbl -0x11(%rbp), %esi
callq 0x7980
jmp 0x4aa28
movb -0x17(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x17(%rbp)
jmp 0x4a9ec
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x20(%rax)
je 0x4aa57
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rdi
movsbl -0x11(%rbp), %esi
callq 0x7980
jmp 0x4aa59
movb -0x14(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x14(%rbp)
jmp 0x4a9dc
jmp 0x4abe5
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
je 0x4aab8
movq -0x60(%rbp), %rdi
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq %rax, -0x90(%rbp)
callq 0x1a6b0
movq -0x60(%rbp), %rdi
movq %rax, -0x88(%rbp)
callq 0x1a770
movq -0x90(%rbp), %rdi
movq -0x88(%rbp), %rsi
movq %rax, %rdx
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
callq 0x87e0
movb $0x0, -0x14(%rbp)
movsbl -0x14(%rbp), %eax
movsbl -0x11(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4abe3
movb $0x0, -0x17(%rbp)
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movsbl -0x13(%rbp), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jge 0x4ab6f
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x18(%rax)
je 0x4ab60
movq -0x60(%rbp), %rdi
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rax
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, -0xa0(%rbp)
callq 0x43820
movq -0x60(%rbp), %rdi
movsbq -0x17(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, -0x98(%rbp)
callq 0x43860
movq -0xa0(%rbp), %rdi
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callq 0x87e0
jmp 0x4ab62
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movb %al, -0x17(%rbp)
jmp 0x4aad0
movq -0x10(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x20(%rax)
je 0x4abd4
movq -0x60(%rbp), %rdi
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
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movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, -0xb0(%rbp)
callq 0x1a730
movq -0x60(%rbp), %rdi
movsbq -0x14(%rbp), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rax
movq %rax, -0xa8(%rbp)
callq 0x1a7f0
movq -0xb0(%rbp), %rdi
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movq (%rax,%rcx,8), %rdx
movsbl -0x12(%rbp), %ecx
callq 0x87e0
jmp 0x4abd6
movb -0x14(%rbp), %al
addb $0x1, %al
movb %al, -0x14(%rbp)
jmp 0x4aabc
jmp 0x4abe5
movq -0x60(%rbp), %rdi
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callq 0x5380
movsd -0x20(%rbp), %xmm0
addq $0xb0, %rsp
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)