// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/genometools[P]genometools/src/core/encseq.c
// Function: gt_encseq_builder_build
GtEncseq* gt_encseq_builder_build(GtEncseqBuilder *eb, GT_UNUSED GtError *err)
{
  GtEncseq *encseq = NULL;
  const GtEncseqAccessType sat = GT_ACCESS_TYPE_DIRECTACCESS;
  Gtssptaboutinfo *ssptaboutinfo;
  GtUword i, lastnonspecialrangelength = 0;
  GtSpecialcharinfo samplespecialcharinfo =
    {0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0};

  gt_assert(eb->plainseq);
  sequence2specialcharinfo(&samplespecialcharinfo, eb->plainseq,
                           eb->seqlen, eb->alpha, eb->logger);
  encseq = determineencseqkeyvalues(sat,
                                    eb->seqlen,
                                    eb->nof_seqs,
                                    0,
                                    0,
                                    samplespecialcharinfo.wildcardranges,
                                    0,
                                    eb->minseqlen,
                                    eb->maxseqlen,
                                    false,
                                    false,
                                    NULL,
                                    gt_alphabet_ref(eb->alpha),
                                    true,
                                    eb->logger);
  encseq->specialcharinfo = samplespecialcharinfo;
  encseq->plainseq = eb->plainseq;
  encseq->headerptr.characterdistribution
    = initcharacterdistribution(eb->alpha);
  encseq->filenametab = gt_str_array_new();
  gt_str_array_add_cstr(encseq->filenametab, "generated");
  encseq->numofdbfiles = 1UL;
  encseq->hasplainseqptr = !(eb->own);
  if (eb->wdestab) {
    encseq->hasallocateddestab = true;
    encseq->destab =
                  gt_malloc((size_t) gt_str_length(eb->destab) * sizeof (char));
    memcpy(encseq->destab,
           gt_str_get_mem(eb->destab),
           (size_t)  gt_str_length(eb->destab) * sizeof (char));
    encseq->destablength = gt_str_length(eb->destab);
  }
  /* create `new style' SSP tab */
  if (eb->nof_seqs > 1UL && eb->wssptab) {
    encseq->hasallocatedssptab = true;
    encseq->satsep = determineoptimalsssptablerep(eb->seqlen, eb->nof_seqs-1);
    ssptaboutinfo = ssptaboutinfo_new(eb->seqlen,eb->nof_seqs, &encseq->ssptab);
    gt_assert(ssptaboutinfo != NULL);
    for (i = 0; i < eb->seqlen; i++) {
      if (eb->plainseq[i] == (GtUchar) GT_SEPARATOR)
        ssptaboutinfo_processseppos(ssptaboutinfo, i);
      ssptaboutinfo_processanyposition(ssptaboutinfo, i);
    }
    GT_FREEARRAY(&eb->ssptab, GtUword);
    ssptaboutinfo_finalize(ssptaboutinfo);
    ssptaboutinfo_delete(ssptaboutinfo);
  }
  for (i = 0; i < eb->seqlen; i++) {
    if (!GT_ISSPECIAL(eb->plainseq[i])) {
      encseq->headerptr.characterdistribution[eb->plainseq[i]]++;
      lastnonspecialrangelength++;
    } else {
      if (lastnonspecialrangelength > 0) {
        if (lastnonspecialrangelength
              > encseq->specialcharinfo.lengthoflongestnonspecial) {
          encseq->specialcharinfo.lengthoflongestnonspecial =
                                                  lastnonspecialrangelength;
        }
        lastnonspecialrangelength = 0;
      }
    }
  }
  if (lastnonspecialrangelength > 0) {
    if (lastnonspecialrangelength
          > encseq->specialcharinfo.lengthoflongestnonspecial) {
      encseq->specialcharinfo.lengthoflongestnonspecial =
                                              lastnonspecialrangelength;
    }
  }
  if (eb->wsdstab) {
    encseq->hasallocatedsdstab = true;
    encseq->sdstab = eb->sdstab.spaceGtUword;
  }
  ALLASSIGNAPPENDFUNC(sat, encseq->satsep);
  encseq->mappedptr = NULL;
  encseq->ssptabmappedptr = NULL;
  encseq->accesstype_via_utables = false;
  eb->created_encseq = true;
  gt_encseq_builder_reset(eb);
  return encseq;
}

// Assembly:
pushq %rbx
subq $0x120, %rsp            # imm = 0x120
movq %rdi, 0x118(%rsp)
movq %rsi, 0x110(%rsp)
movq $0x0, 0x108(%rsp)
movl $0x0, 0x104(%rsp)
movq $0x0, 0xe8(%rsp)
leaq 0x78(%rsp), %rdi
xorl %esi, %esi
movl $0x70, %edx
callq 0xb2d0
movq 0x118(%rsp), %rax
cmpq $0x0, (%rax)
jne 0x127892
movq 0x8c777(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x367fb(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x6021e(%rip), %rdx     # 0x187a90
leaq 0x60224(%rip), %rcx     # 0x187a9d
leaq 0x5ddde(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x23bb, %r9d           # imm = 0x23BB
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x127894
movq 0x118(%rsp), %rax
movq (%rax), %rsi
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdx
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x70(%rax), %rcx
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x78(%rax), %r8
leaq 0x78(%rsp), %rdi
callq 0x128060
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq %rax, 0x58(%rsp)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq %rax, 0x60(%rsp)
movq 0xa8(%rsp), %rax
movq %rax, 0x68(%rsp)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x18(%rax), %rbx
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movq %rax, 0x70(%rsp)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x70(%rax), %rdi
callq 0x109130
movq 0x58(%rsp), %rsi
movq 0x60(%rsp), %rdx
movq 0x68(%rsp), %r9
movq 0x70(%rsp), %r11
movq %rax, %r10
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x78(%rax), %rax
xorl %edi, %edi
xorl %ecx, %ecx
movl %ecx, %r8d
movq %r8, %rcx
movq $0x0, (%rsp)
movq %rbx, 0x8(%rsp)
movq %r11, 0x10(%rsp)
movl $0x0, 0x18(%rsp)
movl $0x0, 0x20(%rsp)
movq $0x0, 0x28(%rsp)
movq %r10, 0x30(%rsp)
movl $0x1, 0x38(%rsp)
movq %rax, 0x40(%rsp)
callq 0x117270
movq %rax, 0x108(%rsp)
movq 0x108(%rsp), %rdi
addq $0x178, %rdi            # imm = 0x178
leaq 0x78(%rsp), %rsi
movl $0x70, %edx
callq 0xb500
movq 0x118(%rsp), %rax
movq (%rax), %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x290(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x70(%rax), %rdi
callq 0x1286a0
movq %rax, %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0xf8(%rax)
callq 0x1b020
movq %rax, %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x1f8(%rax)
movq 0x108(%rsp), %rax
movq 0x1f8(%rax), %rdi
leaq 0x6461f(%rip), %rsi     # 0x18c048
callq 0x1b180
movq 0x108(%rsp), %rax
movq $0x1, 0x50(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movb 0x68(%rax), %cl
xorb $-0x1, %cl
movq 0x108(%rsp), %rax
andb $0x1, %cl
movb %cl, 0x298(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6a(%rax)
je 0x127b2d
movq 0x108(%rsp), %rax
movb $0x1, 0x208(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
callq 0x19a00
movq %rax, %rdi
shlq $0x0, %rdi
leaq 0x5dbc1(%rip), %rsi     # 0x18565e
movl $0x23d8, %edx           # imm = 0x23D8
callq 0xd2e0
movq %rax, %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x200(%rax)
movq 0x108(%rsp), %rax
movq 0x200(%rax), %rax
movq %rax, 0x48(%rsp)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
callq 0x199b0
movq %rax, 0x50(%rsp)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
callq 0x19a00
movq 0x48(%rsp), %rdi
movq 0x50(%rsp), %rsi
movq %rax, %rdx
shlq $0x0, %rdx
callq 0xb500
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x58(%rax), %rdi
callq 0x19a00
movq %rax, %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x210(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
cmpq $0x1, 0x10(%rax)
jbe 0x127d02
movq 0x118(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6b(%rax)
je 0x127d02
movq 0x108(%rsp), %rax
movb $0x1, 0x209(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdi
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x10(%rax), %rsi
subq $0x1, %rsi
callq 0x11b530
movl %eax, %ecx
movq 0x108(%rsp), %rax
movl %ecx, 0x4(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x8(%rax), %rdi
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x10(%rax), %rsi
movq 0x108(%rsp), %rdx
addq $0x240, %rdx            # imm = 0x240
callq 0x11b750
movq %rax, 0xf8(%rsp)
cmpq $0x0, 0xf8(%rsp)
jne 0x127c06
movq 0x8c403(%rip), %rax     # 0x1b3fd8
movq (%rax), %rdi
leaq 0x36487(%rip), %rsi     # 0x15e066
leaq 0x5fecf(%rip), %rdx     # 0x187ab5
leaq 0x5feb0(%rip), %rcx     # 0x187a9d
leaq 0x5da6a(%rip), %r8      # 0x18565e
movl $0x23e3, %r9d           # imm = 0x23E3
movb $0x0, %al
callq 0xb890
callq 0xb2e0
jmp 0x127c08
movq $0x0, 0xf0(%rsp)
movq 0xf0(%rsp), %rax
movq 0x118(%rsp), %rcx
cmpq 0x8(%rcx), %rax
jae 0x127c88
movq 0x118(%rsp), %rax
movq (%rax), %rax
movq 0xf0(%rsp), %rcx
movzbl (%rax,%rcx), %eax
cmpl $0xff, %eax
jne 0x127c5d
movq 0xf8(%rsp), %rdi
movq 0xf0(%rsp), %rsi
callq 0x11ba00
movq 0xf8(%rsp), %rdi
movq 0xf0(%rsp), %rsi
callq 0x11bb30
movq 0xf0(%rsp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0xf0(%rsp)
jmp 0x127c14
jmp 0x127c8a
movq 0x118(%rsp), %rax
cmpq $0x0, 0x40(%rax)
je 0x127ce6
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x40(%rax), %rdi
leaq 0x5d9b2(%rip), %rsi     # 0x18565e
movl $0x23e9, %edx           # imm = 0x23E9
callq 0xdab0
movq 0x118(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x48(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x50(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x40(%rax)
jmp 0x127ce8
movq 0xf8(%rsp), %rdi
callq 0x11bb80
movq 0xf8(%rsp), %rdi
callq 0x11bbb0
movq $0x0, 0xf0(%rsp)
movq 0xf0(%rsp), %rax
movq 0x118(%rsp), %rcx
cmpq 0x8(%rcx), %rax
jae 0x127df2
movq 0x118(%rsp), %rax
movq (%rax), %rax
movq 0xf0(%rsp), %rcx
movzbl (%rax,%rcx), %eax
cmpl $0xfe, %eax
jge 0x127d8e
movq 0x108(%rsp), %rax
movq 0xf8(%rax), %rax
movq 0x118(%rsp), %rcx
movq (%rcx), %rcx
movq 0xf0(%rsp), %rdx
movzbl (%rcx,%rdx), %ecx
movq (%rax,%rcx,8), %rdx
addq $0x1, %rdx
movq %rdx, (%rax,%rcx,8)
movq 0xe8(%rsp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0xe8(%rsp)
jmp 0x127dd7
cmpq $0x0, 0xe8(%rsp)
jbe 0x127dd5
movq 0xe8(%rsp), %rax
movq 0x108(%rsp), %rcx
cmpq 0x1c8(%rcx), %rax
jbe 0x127dc9
movq 0xe8(%rsp), %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x1c8(%rax)
movq $0x0, 0xe8(%rsp)
jmp 0x127dd7
jmp 0x127dd9
movq 0xf0(%rsp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, 0xf0(%rsp)
jmp 0x127d0e
cmpq $0x0, 0xe8(%rsp)
jbe 0x127e2f
movq 0xe8(%rsp), %rax
movq 0x108(%rsp), %rcx
cmpq 0x1c8(%rcx), %rax
jbe 0x127e2d
movq 0xe8(%rsp), %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x1c8(%rax)
jmp 0x127e2f
movq 0x118(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x6c(%rax)
je 0x127e67
movq 0x108(%rsp), %rax
movb $0x1, 0x20a(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movq 0x28(%rax), %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x218(%rax)
jmp 0x127e69
jmp 0x127e6b
movq 0x108(%rsp), %rax
testb $0x1, 0x28(%rax)
je 0x127ea7
movq 0x8dc78(%rip), %rcx     # 0x1b5af8
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x110(%rax)
movq 0x8dc5a(%rip), %rcx     # 0x1b5af0
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x118(%rax)
jmp 0x127ed3
movq 0x8dc3a(%rip), %rcx     # 0x1b5ae8
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x110(%rax)
movq 0x8dc1c(%rip), %rcx     # 0x1b5ae0
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x118(%rax)
movq 0x8dc2e(%rip), %rcx     # 0x1b5b08
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x120(%rax)
movq 0x8dc10(%rip), %rcx     # 0x1b5b00
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x128(%rax)
movq 0x8dc12(%rip), %rcx     # 0x1b5b18
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x140(%rax)
movq 0x8dbf4(%rip), %rcx     # 0x1b5b10
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x148(%rax)
xorl %edi, %edi
callq 0x13e930
testb $0x1, %al
jne 0x127f3b
jmp 0x127fd0
movq 0x108(%rsp), %rax
movl 0x4(%rax), %eax
cmpq $0x7, %rax
jae 0x127fa8
movq 0x108(%rsp), %rax
movslq 0x4(%rax), %rcx
leaq 0x8db71(%rip), %rax     # 0x1b5ad0
imulq $0x70, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x58(%rax), %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x160(%rax)
movq 0x108(%rsp), %rax
movslq 0x4(%rax), %rcx
leaq 0x8db44(%rip), %rax     # 0x1b5ad0
imulq $0x70, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq 0x50(%rax), %rcx
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x168(%rax)
jmp 0x127fce
movq 0x108(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x160(%rax)
movq 0x108(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x168(%rax)
jmp 0x127ffc
movq 0x8db51(%rip), %rcx     # 0x1b5b28
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x160(%rax)
movq 0x8db33(%rip), %rcx     # 0x1b5b20
movq 0x108(%rsp), %rax
movq %rcx, 0x168(%rax)
movq 0x108(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x10(%rax)
movq 0x108(%rsp), %rax
movq $0x0, 0x18(%rax)
movq 0x108(%rsp), %rax
movb $0x0, 0x3a9(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rax
movb $0x1, 0x69(%rax)
movq 0x118(%rsp), %rdi
callq 0x127670
movq 0x108(%rsp), %rax
addq $0x120, %rsp            # imm = 0x120
popq %rbx
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)