// File: chhylp123[P]hifiasm/gfa_ut.cpp
// Function: integer_normalize_ovlp(ul_resolve_t*, unsigned int, ul2ul_item_t*, ul2ul_idx_t*)
void integer_normalize_ovlp(ul_resolve_t *uidx, uint32_t qid, ul2ul_item_t *o, ul2ul_idx_t *ul2)
{
    ul2ul_t *z; uint64_t k; ul2ul_item_t *t;
    for (k = 0; k < o->n; k++) {
        assert(ul2->item_idx[o->a[k].hid] != (uint32_t)-1);
        z = get_ul_o(ul2, ulg_id(*ul2, o->a[k].hid), ulg_type(*ul2, o->a[k].hid), 
                                                            ulg_id(*ul2, qid), ulg_type(*ul2, qid));
        // assert(z && z->hid == qid);
        // if(o->a[k].is_rev == z->is_rev && (*z).qs == o->a[k].ts && (*z).qe == o->a[k].te && 
        //     (*z).ts == o->a[k].qs && (*z).te == o->a[k].qe) {
        //     fprintf(stderr, "good::[M::%s] fn::%u(%c), fqs::%u, fqe::%u, fts::%u, fte::%u, rn::%u(%c), rqs::%u, rqe::%u, rts::%u, rte::%u\n", __func__, 
        //         o->a[k].hid, "+-"[o->a[k].is_rev], o->a[k].qs, o->a[k].qe, o->a[k].ts, o->a[k].te, 
        //         z->hid, "+-"[z->is_rev], z->qs, z->qe, z->ts, z->te);
        // } else {
        //     fprintf(stderr, "bad::[M::%s] fn::%u(%c), fqs::%u, fqe::%u, fts::%u, fte::%u, rn::%u(%c), rqs::%u, rqe::%u, rts::%u, rte::%u\n", __func__, 
        //         o->a[k].hid, "+-"[o->a[k].is_rev], o->a[k].qs, o->a[k].qe, o->a[k].ts, o->a[k].te, 
        //         z->hid, "+-"[z->is_rev], z->qs, z->qe, z->ts, z->te);
        // }
        // continue;
        if(z && o->a[k].hid < qid) continue;
        if(!z) {
            t = get_ul_ovlp(ul2, ulg_id(*ul2, o->a[k].hid), ulg_type(*ul2, o->a[k].hid));
            assert(t);
            kv_pushp(ul2ul_t, *t, &z); 
            (*z).hid = qid; 
            (*z).qs = o->a[k].ts; (*z).qe = o->a[k].te; 
            (*z).ts = o->a[k].qs; (*z).te = o->a[k].qe;
            (*z).qs_k = o->a[k].ts_k; (*z).qe_k = o->a[k].te_k; 
            (*z).ts_k = o->a[k].qs_k; (*z).te_k = o->a[k].qe_k;
            (*z).is_rev = o->a[k].is_rev; (*z).is_del = o->a[k].is_del;
            (*z).is_ct = o->a[k].is_ct;
            if(!((*z).is_del)) {
                t->cn++;
            }
        } else {
            if((o->a[k].qe - o->a[k].qs) >= (z->te - z->ts)) {
                (*z).qs = o->a[k].ts; (*z).qe = o->a[k].te;
                (*z).ts = o->a[k].qs; (*z).te = o->a[k].qe;
                (*z).qs_k = o->a[k].ts_k; (*z).qe_k = o->a[k].te_k; 
                (*z).ts_k = o->a[k].qs_k; (*z).te_k = o->a[k].qe_k;
                (*z).is_rev = o->a[k].is_rev; (*z).is_del = o->a[k].is_del;
                (*z).is_ct = o->a[k].is_ct;
            } else {
                o->a[k].qs = (*z).ts; o->a[k].qe = (*z).te;
                o->a[k].ts = (*z).qs; o->a[k].te = (*z).qe;
                o->a[k].qs_k = (*z).ts_k; o->a[k].qe_k = (*z).te_k;
                o->a[k].ts_k = (*z).qs_k; o->a[k].te_k = (*z).qe_k;
                o->a[k].is_rev = (*z).is_rev; o->a[k].is_del = (*z).is_del;
                o->a[k].is_ct = (*z).is_ct;
            }
        }
    }
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x70, %rsp
movq %rdi, -0x8(%rbp)
movl %esi, -0xc(%rbp)
movq %rdx, -0x18(%rbp)
movq %rcx, -0x20(%rbp)
movq $0x0, -0x30(%rbp)
movq -0x30(%rbp), %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
cmpq 0x8(%rcx), %rax
jae 0x338359
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x30(%rax), %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movq (%rcx), %rcx
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rcx
movl (%rcx), %ecx
cmpl $-0x1, (%rax,%rcx,4)
je 0x337c92
jmp 0x337cb1
leaq 0x60649(%rip), %rdi     # 0x3982e2
leaq 0x5e519(%rip), %rsi     # 0x3961b9
movl $0x1a2d, %edx           # imm = 0x1A2D
leaq 0x60661(%rip), %rcx     # 0x39830d
callq 0x2130
movq -0x20(%rbp), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movq -0x20(%rbp), %rcx
cmpq 0x18(%rcx), %rax
jb 0x337cf3
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movq -0x20(%rbp), %rcx
subq 0x18(%rcx), %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
jmp 0x337d08
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movl %eax, -0x50(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movl %eax, %edx
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %rsi
movl $0x1, %eax
xorl %ecx, %ecx
cmpq %rsi, %rdx
cmovael %ecx, %eax
movl %eax, -0x4c(%rbp)
movl -0xc(%rbp), %eax
movq -0x20(%rbp), %rcx
cmpq 0x18(%rcx), %rax
jb 0x337d58
movl -0xc(%rbp), %eax
movq -0x20(%rbp), %rcx
subq 0x18(%rcx), %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
jmp 0x337d5f
movl -0xc(%rbp), %eax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movl -0x4c(%rbp), %edx
movl -0x50(%rbp), %esi
movq -0x40(%rbp), %rdi
movq -0x58(%rbp), %rax
movl %eax, %ecx
movl -0xc(%rbp), %eax
movl %eax, %r9d
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %r10
movl $0x1, %r8d
xorl %eax, %eax
cmpq %r10, %r9
cmovael %eax, %r8d
callq 0x337160
movq %rax, -0x28(%rbp)
cmpq $0x0, -0x28(%rbp)
je 0x337db7
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
cmpl -0xc(%rbp), %eax
jae 0x337db7
jmp 0x338348
cmpq $0x0, -0x28(%rbp)
jne 0x338079
movq -0x20(%rbp), %rax
movq %rax, -0x60(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movq -0x20(%rbp), %rcx
cmpq 0x18(%rcx), %rax
jb 0x337e04
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movq -0x20(%rbp), %rcx
subq 0x18(%rcx), %rax
movq %rax, -0x68(%rbp)
jmp 0x337e19
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movq %rax, -0x68(%rbp)
movq -0x60(%rbp), %rdi
movq -0x68(%rbp), %rsi
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl (%rax), %eax
movl %eax, %edx
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x18(%rax), %r8
movl $0x1, %eax
xorl %ecx, %ecx
cmpq %r8, %rdx
cmovael %ecx, %eax
movslq %eax, %rdx
callq 0x3370e0
movq %rax, -0x38(%rbp)
cmpq $0x0, -0x38(%rbp)
je 0x337e5e
jmp 0x337e7d
leaq 0x4eb37(%rip), %rdi     # 0x38699c
leaq 0x5e34d(%rip), %rsi     # 0x3961b9
movl $0x1a3f, %edx           # imm = 0x1A3F
leaq 0x60495(%rip), %rcx     # 0x39830d
callq 0x2130
jmp 0x337e7f
movq -0x38(%rbp), %rax
movq 0x8(%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rcx
cmpq 0x10(%rcx), %rax
jne 0x337ee3
movq -0x38(%rbp), %rax
cmpq $0x0, 0x10(%rax)
je 0x337ead
movq -0x38(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
shlq %rax
movq %rax, -0x70(%rbp)
jmp 0x337eb8
movl $0x2, %eax
movq %rax, -0x70(%rbp)
jmp 0x337eb8
movq -0x70(%rbp), %rcx
movq -0x38(%rbp), %rax
movq %rcx, 0x10(%rax)
movq -0x38(%rbp), %rax
movq (%rax), %rdi
movq -0x38(%rbp), %rax
imulq $0x28, 0x10(%rax), %rsi
callq 0x2360
movq %rax, %rcx
movq -0x38(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
movq -0x38(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movq -0x38(%rbp), %rdx
movq 0x8(%rdx), %rcx
movq %rcx, %rsi
addq $0x1, %rsi
movq %rsi, 0x8(%rdx)
imulq $0x28, %rcx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x28(%rbp)
movl -0xc(%rbp), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, (%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0xc(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x4(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x10(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x8(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x4(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0xc(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x8(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x10(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x1c(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x14(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x20(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x18(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x14(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x1c(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x18(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x20(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %dl
andb $0x3f, %dl
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x3f, %dl
andb $-0x40, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %dl
shrb $0x6, %dl
andb $0x1, %dl
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x1, %dl
shlb $0x6, %dl
andb $-0x41, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %dl
shrb $0x7, %dl
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x1, %dl
shlb $0x7, %dl
andb $0x7f, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %al
shrb $0x6, %al
andb $0x1, %al
cmpb $0x0, %al
jne 0x338074
movq -0x38(%rbp), %rax
movl 0x1c(%rax), %ecx
addl $0x1, %ecx
movl %ecx, 0x1c(%rax)
jmp 0x338346
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x8(%rax), %eax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movq (%rcx), %rcx
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rcx
subl 0x4(%rcx), %eax
movq -0x28(%rbp), %rcx
movl 0x10(%rcx), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rdx
subl 0xc(%rdx), %ecx
cmpl %ecx, %eax
jb 0x3381fe
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0xc(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x4(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x10(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x8(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x4(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0xc(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x8(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x10(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x1c(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x14(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x20(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x18(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x14(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x1c(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movl 0x18(%rax), %ecx
movq -0x28(%rbp), %rax
movl %ecx, 0x20(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %dl
andb $0x3f, %dl
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x3f, %dl
andb $-0x40, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %dl
shrb $0x6, %dl
andb $0x1, %dl
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x1, %dl
shlb $0x6, %dl
andb $-0x41, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %dl
shrb $0x7, %dl
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x1, %dl
shlb $0x7, %dl
andb $0x7f, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
jmp 0x338344
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0xc(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0x4(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0x10(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0x8(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0x4(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0xc(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0x8(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0x10(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0x1c(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0x14(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0x20(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0x18(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0x14(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0x1c(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rdx
addq %rdx, %rax
movl %ecx, 0x20(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %dl
andb $0x3f, %dl
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x3f, %dl
andb $-0x40, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %dl
shrb $0x6, %dl
andb $0x1, %dl
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x1, %dl
shlb $0x6, %dl
andb $-0x41, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
movq -0x28(%rbp), %rax
movb 0x24(%rax), %dl
shrb $0x7, %dl
movq -0x18(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
imulq $0x28, -0x30(%rbp), %rcx
addq %rcx, %rax
movb 0x24(%rax), %cl
andb $0x1, %dl
shlb $0x7, %dl
andb $0x7f, %cl
orb %dl, %cl
movb %cl, 0x24(%rax)
jmp 0x338346
jmp 0x338348
movq -0x30(%rbp), %rax
addq $0x1, %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
jmp 0x337c5f
addq $0x70, %rsp
popq %rbp
retq
nop