// File: /workspace/github_c_makefile_star2_O0/samtools[P]htslib/sam.c
// Function: sam_format1_append
static int sam_format1_append(const bam_hdr_t *h, const bam1_t *b, kstring_t *str)
{
    int i, r = 0;
    uint8_t *s, *end;
    const bam1_core_t *c = &b->core;

    if (c->l_qname == 0)
        return -1;
    r |= kputsn_(bam_get_qname(b), c->l_qname-1-c->l_extranul, str);
    r |= kputc_('\t', str); // query name
    r |= kputw(c->flag, str); r |= kputc_('\t', str); // flag
    if (c->tid >= 0) { // chr
        r |= kputs(h->target_name[c->tid] , str);
        r |= kputc_('\t', str);
    } else r |= kputsn_("*\t", 2, str);
    r |= kputll(c->pos + 1, str); r |= kputc_('\t', str); // pos
    r |= kputw(c->qual, str); r |= kputc_('\t', str); // qual
    if (c->n_cigar) { // cigar
        uint32_t *cigar = bam_get_cigar(b);
        for (i = 0; i < c->n_cigar; ++i) {
            r |= kputw(bam_cigar_oplen(cigar[i]), str);
            r |= kputc_(bam_cigar_opchr(cigar[i]), str);
        }
    } else r |= kputc_('*', str);
    r |= kputc_('\t', str);
    if (c->mtid < 0) r |= kputsn_("*\t", 2, str); // mate chr
    else if (c->mtid == c->tid) r |= kputsn_("=\t", 2, str);
    else {
        r |= kputs(h->target_name[c->mtid], str);
        r |= kputc_('\t', str);
    }
    r |= kputll(c->mpos + 1, str); r |= kputc_('\t', str); // mate pos
    r |= kputll(c->isize, str); r |= kputc_('\t', str); // template len
    if (c->l_qseq) { // seq and qual
        uint8_t *s = bam_get_seq(b);
        if (ks_resize(str, str->l+2+2*c->l_qseq) < 0) goto mem_err;
        char *cp = str->s + str->l;

        // Sequence, 2 bases at a time
        nibble2base(s, cp, c->l_qseq);
        cp[c->l_qseq] = '\t';
        cp += c->l_qseq+1;

        // Quality
        s = bam_get_qual(b);
        i = 0;
        if (s[0] == 0xff) {
            cp[i++] = '*';
        } else {
            add33((uint8_t *)cp, s, c->l_qseq); // cp[i] = s[i]+33;
            i = c->l_qseq;
        }
        cp[i] = 0;
        cp += i;
        str->l = cp - str->s;
    } else r |= kputsn_("*\t*", 3, str);

    s = bam_get_aux(b); // aux
    end = b->data + b->l_data;

    while (end - s >= 4) {
        r |= kputc_('\t', str);
        if ((s = (uint8_t *)sam_format_aux1(s, s[2], s+3, end, str)) == NULL)
            goto bad_aux;
    }
    r |= kputsn("", 0, str); // nul terminate
    if (r < 0) goto mem_err;

    return str->l;

 bad_aux:
    hts_log_error("Corrupted aux data for read %.*s flag %d",
                  b->core.l_qname, bam_get_qname(b), b->core.flag);
    errno = EINVAL;
    return -1;

 mem_err:
    hts_log_error("Out of memory");
    errno = ENOMEM;
    return -1;
}

// Assembly:
pushq %rbp
movq %rsp, %rbp
subq $0x60, %rsp
movq %rdi, -0x10(%rbp)
movq %rsi, -0x18(%rbp)
movq %rdx, -0x20(%rbp)
movl $0x0, -0x28(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq %rax, -0x40(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movzwl 0x12(%rax), %eax
cmpl $0x0, %eax
jne 0x3d9dc
movl $0xffffffff, -0x4(%rbp) # imm = 0xFFFFFFFF
jmp 0x3df7d
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %rdi
movq -0x40(%rbp), %rax
movzwl 0x12(%rax), %eax
subl $0x1, %eax
movq -0x40(%rbp), %rcx
movzbl 0xf(%rcx), %ecx
subl %ecx, %eax
movslq %eax, %rsi
movq -0x20(%rbp), %rdx
callq 0x47a10
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movzwl 0x10(%rax), %edi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x39000
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
cmpl $0x0, 0x8(%rax)
jl 0x3da8d
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movq -0x40(%rbp), %rcx
movslq 0x8(%rcx), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rdi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x38fa0
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
jmp 0x3daa8
movq -0x20(%rbp), %rdx
leaq 0xb5223(%rip), %rdi     # 0xf2cbb
movl $0x2, %esi
callq 0x47a10
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq (%rax), %rdi
addq $0x1, %rdi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x457a0
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movzbl 0xe(%rax), %edi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x39000
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
cmpl $0x0, 0x14(%rax)
je 0x3db92
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movzwl 0x12(%rcx), %ecx
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x48(%rbp)
movl $0x0, -0x24(%rbp)
movl -0x24(%rbp), %eax
movq -0x40(%rbp), %rcx
cmpl 0x14(%rcx), %eax
jae 0x3db90
movq -0x48(%rbp), %rax
movslq -0x24(%rbp), %rcx
movl (%rax,%rcx,4), %edi
shrl $0x4, %edi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x39000
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x48(%rbp), %rax
movslq -0x24(%rbp), %rcx
movl (%rax,%rcx,4), %eax
andl $0xf, %eax
movl %eax, %eax
movl %eax, %ecx
leaq 0xb499c(%rip), %rax     # 0xf250e
movsbl (%rax,%rcx), %edi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movl -0x24(%rbp), %eax
addl $0x1, %eax
movl %eax, -0x24(%rbp)
jmp 0x3db30
jmp 0x3dba6
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x2a, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
cmpl $0x0, 0x1c(%rax)
jge 0x3dbe1
movq -0x20(%rbp), %rdx
leaq 0xb50ec(%rip), %rdi     # 0xf2cbb
movl $0x2, %esi
callq 0x47a10
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
jmp 0x3dc47
movq -0x40(%rbp), %rax
movl 0x1c(%rax), %eax
movq -0x40(%rbp), %rcx
cmpl 0x8(%rcx), %eax
jne 0x3dc0e
movq -0x20(%rbp), %rdx
leaq 0xb50c2(%rip), %rdi     # 0xf2cbe
movl $0x2, %esi
callq 0x47a10
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
jmp 0x3dc45
movq -0x10(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rax
movq -0x40(%rbp), %rcx
movslq 0x1c(%rcx), %rcx
movq (%rax,%rcx,8), %rdi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x38fa0
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
jmp 0x3dc47
movq -0x40(%rbp), %rax
movq 0x20(%rax), %rdi
addq $0x1, %rdi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x457a0
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
movq 0x28(%rax), %rdi
movq -0x20(%rbp), %rsi
callq 0x457a0
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x40(%rbp), %rax
cmpl $0x0, 0x18(%rax)
je 0x3de0e
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movl 0x14(%rcx), %ecx
shll $0x2, %ecx
movl %ecx, %ecx
addq %rcx, %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movzwl 0x12(%rcx), %ecx
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
movq -0x20(%rbp), %rdi
movq -0x20(%rbp), %rax
movq (%rax), %rsi
addq $0x2, %rsi
movq -0x40(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %eax
shll %eax
cltq
addq %rax, %rsi
callq 0x3f730
cmpl $0x0, %eax
jge 0x3dd04
jmp 0x3df51
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
movq -0x20(%rbp), %rcx
addq (%rcx), %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rdi
movq -0x58(%rbp), %rsi
movq -0x40(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %edx
callq 0x455c0
movq -0x58(%rbp), %rax
movq -0x40(%rbp), %rcx
movslq 0x18(%rcx), %rcx
movb $0x9, (%rax,%rcx)
movq -0x40(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %ecx
addl $0x1, %ecx
movq -0x58(%rbp), %rax
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movl 0x14(%rcx), %ecx
shll $0x2, %ecx
movl %ecx, %ecx
addq %rcx, %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movzwl 0x12(%rcx), %ecx
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movl 0x18(%rcx), %ecx
addl $0x1, %ecx
sarl %ecx
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x50(%rbp)
movl $0x0, -0x24(%rbp)
movq -0x50(%rbp), %rax
movzbl (%rax), %eax
cmpl $0xff, %eax
jne 0x3ddbb
movq -0x58(%rbp), %rax
movl -0x24(%rbp), %ecx
movl %ecx, %edx
addl $0x1, %edx
movl %edx, -0x24(%rbp)
movslq %ecx, %rcx
movb $0x2a, (%rax,%rcx)
jmp 0x3ddd9
movq -0x58(%rbp), %rdi
movq -0x50(%rbp), %rsi
movq -0x40(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %edx
callq 0x47ad0
movq -0x40(%rbp), %rax
movl 0x18(%rax), %eax
movl %eax, -0x24(%rbp)
movq -0x58(%rbp), %rax
movslq -0x24(%rbp), %rcx
movb $0x0, (%rax,%rcx)
movl -0x24(%rbp), %ecx
movq -0x58(%rbp), %rax
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x58(%rbp)
movq -0x58(%rbp), %rcx
movq -0x20(%rbp), %rax
movq 0x10(%rax), %rax
subq %rax, %rcx
movq -0x20(%rbp), %rax
movq %rcx, (%rax)
jmp 0x3de29
movq -0x20(%rbp), %rdx
leaq 0xb4ea8(%rip), %rdi     # 0xf2cc1
movl $0x3, %esi
callq 0x47a10
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movl 0x14(%rcx), %ecx
shll $0x2, %ecx
movl %ecx, %ecx
addq %rcx, %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movzwl 0x12(%rcx), %ecx
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movl 0x18(%rcx), %ecx
addl $0x1, %ecx
sarl %ecx
movslq %ecx, %rcx
addq %rcx, %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movslq 0x18(%rcx), %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x30(%rbp)
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %rax
movq -0x18(%rbp), %rcx
movslq 0x40(%rcx), %rcx
addq %rcx, %rax
movq %rax, -0x38(%rbp)
movq -0x38(%rbp), %rax
movq -0x30(%rbp), %rcx
subq %rcx, %rax
cmpq $0x4, %rax
jl 0x3dedc
movq -0x20(%rbp), %rsi
movl $0x9, %edi
callq 0x3ea70
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
movq -0x30(%rbp), %rdi
movq -0x30(%rbp), %rax
movb 0x2(%rax), %al
movq -0x30(%rbp), %rdx
addq $0x3, %rdx
movq -0x38(%rbp), %rcx
movq -0x20(%rbp), %r8
movzbl %al, %esi
callq 0x3eae0
movq %rax, -0x30(%rbp)
cmpq $0x0, %rax
jne 0x3deda
jmp 0x3df0a
jmp 0x3de86
movq -0x20(%rbp), %rdx
leaq 0xb208e(%rip), %rdi     # 0xeff75
xorl %eax, %eax
movl %eax, %esi
callq 0x38ef0
orl -0x28(%rbp), %eax
movl %eax, -0x28(%rbp)
cmpl $0x0, -0x28(%rbp)
jge 0x3defe
jmp 0x3df51
movq -0x20(%rbp), %rax
movq (%rax), %rax
movl %eax, -0x4(%rbp)
jmp 0x3df7d
movq -0x18(%rbp), %rax
movzwl 0x12(%rax), %ecx
movq -0x18(%rbp), %rax
movq 0x38(%rax), %r8
movq -0x18(%rbp), %rax
movzwl 0x10(%rax), %r9d
movl $0x1, %edi
leaq 0xb4d96(%rip), %rsi     # 0xf2cc5
leaq 0xb4da2(%rip), %rdx     # 0xf2cd8
movb $0x0, %al
callq 0x1b030
callq 0x4050
movl $0x16, (%rax)
movl $0xffffffff, -0x4(%rbp) # imm = 0xFFFFFFFF
jmp 0x3df7d
movl $0x1, %edi
leaq 0xb4d68(%rip), %rsi     # 0xf2cc5
leaq 0xb3c4c(%rip), %rdx     # 0xf1bb0
movb $0x0, %al
callq 0x1b030
callq 0x4050
movl $0xc, (%rax)
movl $0xffffffff, -0x4(%rbp) # imm = 0xFFFFFFFF
movl -0x4(%rbp), %eax
addq $0x60, %rsp
popq %rbp
retq
nopw %cs:(%rax,%rax)