Nepovirus

Nepovirus là một chi virus thuộc bộ Picornavirales, trong họ Secoviridae, thuộc phân họ Comovirinae. Thực vật đóng vai trò là vật chủ tự nhiên. Hiện có 55 loài trong chi này.

Không giống như các chi Comovirus và Fabavirus trong phân họ Comovirinae, các virus thuộc chi Nepovirus lây truyền qua tuyến trùng (nematode).

Phân loại 
Chi này bao gồm các loài sau đây, được liệt kê theo tên khoa học và theo sau là tên virus đại diện của loài đó:

 Nepovirus aegaeum, Artichoke Aegean ringspot virus
 Nepovirus aeonii, Aeonium ringspot virus
 Nepovirus alphaparis, Paris nepovirus 1
 Nepovirus alphavitis, Grapevine nepovirus A
 Nepovirus americaense, Cassava American latent virus
 Nepovirus anatoliense, Grapevine Anatolian ringspot virus
 Nepovirus anemones, Anemone nepovirus A
 Nepovirus arabis, Arabis mosaic virus
 Nepovirus armeniacae, Apricot latent ringspot virus
 Nepovirus arracaciae, Arracacha virus A
 Nepovirus australiaense, Lucerne Australian latent virus
 Nepovirus avii, Cherry leaf roll virus
 Nepovirus betae, Beet ringspot virus
 Nepovirus betaparis, Paris polyphylla secovirus 1
 Nepovirus betasolani, Potato virus B
 Nepovirus bulgariense, Grapevine Bulgarian latent virus
 Nepovirus cari, Caraway yellows virus
 Nepovirus carolinense, Horse nettle virus
 Nepovirus cerasiferae, Myrobalan latent ringspot virus
 Nepovirus chromusivum, Grapevine chrome mosaic virus
 Nepovirus cichorii, Chicory yellow mottle virus
 Nepovirus cucumis, Melon mild mottle virus
 Nepovirus cycas, Cycas necrotic stunt virus
 Nepovirus cynarae, Artichoke yellow ringspot virus
 Nepovirus deformationis, Grapevine deformation virus
 Nepovirus foliumflabelli, Grapevine fanleaf virus
 Nepovirus fontinalis, Common water moss secovirus
 Nepovirus glycinis, Soybean latent spherical virus
 Nepovirus hibisci, Hibiscus latent ringspot virus
 Nepovirus italiaense, Artichoke Italian latent virus
 Nepovirus lonchitis, Tomato fern secovirus
 Nepovirus lycopersici, Tomato ringspot virus
 Nepovirus maculanulatum, Mulberry ringspot virus
 Nepovirus manihotis, Cassava green mottle virus
 Nepovirus mirae, Prunus mira virus A
 Nepovirus mori, Mulberry mosaic leaf roll associated virus
 Nepovirus myrtilli, Blueberry leaf mottle virus
 Nepovirus nicotianae, Tobacco ringspot virus
 Nepovirus nigranuli, Tomato black ring virus
 Nepovirus oleae, Olive latent ringspot virus
 Nepovirus persicae, Peach rosette mosaic virus
 Nepovirus petuniae, Petunia chlorotic mottle virus
 Nepovirus poaceae, Poaceae Liege nepovirus A
 Nepovirus pratensis, Red clover nepovirus A
 Nepovirus ribis, Blackcurrant reversion virus
 Nepovirus rubi, Raspberry ringspot virus
 Nepovirus sichuanense, Green Sichuan pepper nepovirus
 Nepovirus solani, Potato black ringspot virus
 Nepovirus stenotaphri, Stenotaphrum nepovirus
 Nepovirus theobromatis, Cocoa necrosis virus
 Nepovirus trifolii, Crimson clover latent virus
 Nepovirus tunisiaense, Grapevine Tunisian ringspot virus
 Nepovirus usolani, Potato virus U
 Nepovirus vaccinii, Blueberry latent spherical virus
 Nepovirus vittariae, Shoestring fern secovirus

Cấu trúc 
Các virus trong chi Nepovirus không có màng bọc, có hình học icosahedral (hai mươi mặt) và đối xứng T=pseudo3. Đường kính khoảng 28-30 nm. Bộ gen là tuyến tính và phân đoạn, gồm hai phần (bipartite), dài khoảng 23,9kb.

Chu trình sống 
Sự nhân lên của virus diễn ra trong tế bào chất. Virus xâm nhập vào tế bào vật chủ thông qua việc thâm nhập trực tiếp. Quá trình nhân lên tuân theo mô hình nhân lên của virus RNA sợi dương. Quá trình phiên mã cũng theo phương thức của virus RNA sợi dương. Virus thoát ra khỏi tế bào vật chủ bằng cách di chuyển qua ống dẫn hướng (tubule-guided viral movement). Thực vật đóng vai trò là vật chủ tự nhiên. Virus được lây truyền qua vật trung gian (tuyến trùng, bọ ve và bọ trĩ).

Bộ gen 
Nepovirus được phân loại là virus nhóm IV theo hệ thống phân loại Baltimore, và do đó chứa bộ gen RNA sợi đơn dương, tuyến tính, gồm hai phần (bipartite). Hai đoạn bộ gen được bao bọc riêng biệt trong hai hạt icosahedral khác nhau. Mỗi đoạn bộ gen tạo ra một chuỗi polypeptide khác nhau, chuỗi này trải qua một loạt các bước (như phân giải protein và các sửa đổi sau dịch mã khác) để tạo ra một protein chức năng.

RNA1 
Đoạn đầu tiên (RNA1) có chiều dài khoảng 8.000 nucleotide và xuất hiện dưới dạng một bản sao duy nhất trong mỗi virion loại B. Nó mã hóa các protein quan trọng trong quá trình nhân lên và là gen đầu tiên được kích hoạt.

RNA2 
Đoạn thứ hai (RNA2) có chiều dài khoảng 4.000–7.000 nucleotide và thường xuất hiện dưới dạng một bản sao duy nhất trong mỗi virion loại M. Nó mã hóa các protein quan trọng trong việc lây truyền giữa các tế bào và trốn tránh sự bảo vệ của tế bào.

Tham khảo

Liên kết ngoài 
 Viralzone: Nepovirus trên 
 ICTV
 UniProt Taxonomy

Nepovirus
Chi virus