門(もん、英: phylum, division、複数形: phyla、羅: phylum, divisio)は、生物分類のリンネ式階層分類における基本的分類階級のひとつであり、またその階級に属するタクソンのことである。生物全体はおよそ100の門に分類されているが、この数字は分類学者によって大きく異なる。界の下・綱の上に位置しており、門の下に亜門(あもん、英: subphylum, subdivision)を置く場合もある。

## 位置

門はリンネが『自然の体系』で用いた分類階級ではなく、19世紀以降に綱をさらにグループ化する階級として導入された。必要に応じて(界)・亜界・下界・上枝・枝・亜枝・下枝・上門・(門・亜門)・下門・上綱・(綱)などを適宜使う。

後生動物では慣例的に、基本的な体制が共通しているタクソンが門とされ、約30の門に分類されている。たとえば、ヒトは脊索動物門に属する。

## 呼称

従来、英語などでは門を、動物学では phylum と呼び、植物学では国際植物命名規約(現在の国際藻類・菌類・植物命名規約)に基づき division と呼んだ。東京規約(国際植物命名規約の1994年の版)から、植物学でも phylum と呼ぶことが認められたが、現在でも division と呼ぶことが多い。

植物学の命名規約では1905年のウィーン規則以来divisionと呼んでいたが、藻類や菌類は原生動物と密接な関係があり、同じ階級に対して複数の用語が使われる煩わしさが指摘されていた。これを動物学で用いられているphylumに統一しようという提案は1974年にはじめてなされ、以降数回にわたって国際植物学会議における議題に上がっているが、様々な理由から可決されなかった。その1つには、過去にphylumとdivisionを同時に別の階級として利用した例があり、その扱いが考慮されていないというものがあった。またphylumは系統関係を強く示唆する語であって階級の名としては相応しくない、わざわざ動物学の不適切な用語に合わせる必要はないというものもあった。最終的に1993年の東京会議で、phylumとdivisionを等価なものとしてどちらも利用可能とし、仮に同時に別の階級として利用した場合には既存の規定通り正式発表されたと見なさない、とする変更が可決された。

phylum の語源はギリシア語の phylai で、原義は古代ギリシアの都市国家において血縁に基づき決められた投票グループのことである。ヘッケルが Generelle Morphologie der Organismen (1866) で導入した語であるが、概念としてはキュヴィエが用いた embranchement「分岐」と同義である。division の原義は「分ける」である。

## 命名法

門・亜門に対する命名法は一般にあまり強く規制されていない。国際藻類・菌類・植物命名規約、国際動物命名規約、国際原核生物命名規約のいずれでも、優先権を必ずしも守る必要がなく、タイプの名前を元にして作る必要もない。国際藻類・菌類・植物命名規約では、タイプの名前を元にして命名する場合には属名を元にして語尾を統一することが規定されているが、説明的な名前の場合にはその必要はない。なお、植物学では上門・下門はほとんど使われない。国際動物命名規約や国際原核生物命名規約にはそもそも門以上の階級に対する規定はないため統一語尾は存在しないが、慣例的にほとんどは -a で終わり、とくに動物は -zoa、細菌は -bacteria、古細菌は -archaeota が多い。国際原核生物命名規約では、2015年と2018年に門に対する規定の提案が提出されており、タイプ綱の語幹に語尾 -otaを付ける(綱名が -bacteria の場合は -bacteriota となる)ことが提案されている。

ウイルスには現在のところ門・亜門などの階級は存在しない。

## 一覧

### 真核生物ドメイン

真核生物ドメイン(Domain Eukarya)の門(phylum)一覧。

#### 動物界

動物界(Kingdom Animalia)の門(phylum)一覧。

| 上位分類 (亜界・上門) | | | | 門 | 胚発生等 | | 特徴 | 代表例 | 種類 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
|  | |  | | 海綿動物門(Porifera) | 無胚葉 | 器官が 明確には 分化せず | 内壁に多くの穴(孔)を持つ | カイメン、カイロウドウケツ | 5000以上 |
| 平板動物門(Placozoa) | 平板 | センモウヒラムシ | 1 |
| 真正 後生 動物 |  | 刺胞動物門(Cnidaria) | 2胚葉 | 消化管は 出入口が 同じ | 刺胞(cnidocyte)を持つ | クラゲ、サンゴ | 約11000 |
| 有櫛動物門(Ctenophora) | 8列の櫛板(櫛板列)を持つ | クシクラゲ | 約100 |
| 左右 相称 動物 | 旧口 動物 | 冠輪 動物 | 扁形動物門(Platyhelminthes) | 3胚葉 | 扁形 | プラナリア、キュウチュウ、サナダムシ | 約25000 |
| 無腸動物門(Acoelomorpha) | 器官退化? | 無腸 | ナイカイムチョウウズムシ | 約400 |
| 菱形動物門(Rhombozoa) | 1つの軸細胞が繊毛細胞に囲まれている | ニハイチュウ | 75 |
| 直泳動物門(Orthonectida) | 生殖細胞などを繊毛が囲んでいる | キリオキンクタ | 約20 |
| 紐形動物門(Nemertea) | 消化管は 出口と 入口を 持つ | 紐状 | ヒモムシ | 約1200 |
| 顎口動物門(Gnathostomulida) | クチクラ性の固い顎 | ハプログナチア | 約100 |
| 腹毛動物門(Gastrotricha) | 腹部の2本の粘着腺 | イタチムシ、オビムシ | 約700 |
| 輪形動物門(Rotifera) | ゴブレット(杯)型の胴体、触手冠 | ワムシ | 約2000 |
| 内肛動物門(Entoprocta) | 触手冠の内側にある肛門 | スズコケムシ | 約150 |
| 外肛動物門(Bryozoa) | 触手冠、群体、多形化 | チゴケムシ、コケムシ | 約8000 |
| 箒虫動物門(Phoronida) | 口の周囲の触手冠、U字型の消化管 | ホウキムシ | 11 |
| 腕足動物門(Brachiopoda) | 肉茎と触手冠 | ホオズキガイ、シャミセンガイ | 約300 |
| 星口動物門(Sipuncula) | 陥入吻 | ホシムシ | 約250 |
| ユムシ動物門(Echiura) | スプーン状の口吻 | ユムシ | 約140 |
| 毛顎動物門(Chaetognatha) | クチクラ質で細長い | ヤムシ | 約100 |
| 有輪動物門(Cycliophora) | 袋状の胴体と、繊毛で覆われた円形の口(繊毛冠) | パンドラムシ | 3以上 |
| 微顎動物門(Micrognathozoa) | アコーディオン状の胴体 | リムノグナシア | 1 |
| 環形動物門(Annelida) | 環状の体節 | ミミズ、ゴカイ | 17000以上 |
| 軟体動物門(Mollusca) | 筋肉質の軟体と外套膜 | 貝類、イカ、タコ | 約112000 |
| 脱皮 動物 | 線形動物門(Nematoda) | 線形 | 回虫 | 80000以上 |
| 類線形動物門(Nematomorpha) | 線形動物に似た生態 | ハリガネムシ | 約320 |
| 鰓曳動物門(Priapulida) | 円筒状 | エラヒキムシ | 16 |
| 胴甲動物門(Loricifera) | 胴部の殻、傘のような付属肢 | コウラムシ | 約120 |
| 動吻動物門(Kinorhyncha) | 計11の体節 | トゲカワ | 約150 |
| 緩歩動物門(Tardigrada) | 頭部1つと胴体4つの体節 | クマムシ | 1000以上 |
| 有爪動物門(Onychophora) | キチン(クチクラ)質の爪 | カギムシ | 約200 |
| 節足動物門(Arthropoda) | キチン(クチクラ)質の外骨格による体節 | 昆虫類、甲殻類 | 1134000以上 |
| 新口動物 | | 珍渦虫動物門 (Xenoturbellida) | 繊毛に覆われた後口動物 | チンウズムシ | 6 |
| 棘皮動物門(Echinodermata) | 棘皮を持つ | ウニ、ヒトデ、クモヒトデ、ナマコ | 約7000 |
| 半索動物門(Hemichordata) | 口盲管(半索)を持つ | ギボシムシ | 約100 |
| 脊索動物門(Chordata) | 脊索・脊椎を持つ | ホヤ、脊椎動物 | 100000以上 |

#### 植物界

植物界(Kingdom Plantae)の門(division)一覧。

| 上位分類 (亜界) | | 門 | 綱 | 門(従来版) | | | |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| アーケ プラスチダ Archae- plastida | 紅色植物門 Rhodophyta | | 真正紅藻綱 Florideophyceaeなど | | | | |
| イデユコゴメ綱 Cyanidiophyceae | | | | |
| 灰色植物門 Glaucophyta | | | | | | |
| 緑色 植物 亜界  Viridi- plantae | 緑藻植物門  Chlorophyta | 緑藻綱 Chlorophyceae | | | | |
| トレボウクシア藻綱 Trebouxiophyceae | | | | |
| アオサ藻綱 Ulvophyceae | | | | |
| プラシノ藻綱 (ペディノ藻、クロロデンドロン藻、ミクロモナス藻) | | | | |
| ストレプト植物門 Streptophyta | 車軸藻綱 Charophyceae、接合藻綱Zygnematophyceae、等 | | | | |
| 陸上植物 (有胚植物)  Embryophyta | ゼニゴケ植物門(苔類) Marchantiophyta | | | |
| マゴケ植物門(蘚類)Bryophyta | | | |
| ツノゴケ植物門Anthocerotophyta | | | |
| 維管束 植物  Tracheo- phyta | ヒカゲノカズラ植物門 Lycopodiophyta | | |
| 真葉植物  Euphyllo- phyta | シダ植物門 Pteridophyta | |
| 種子植物  Spermato- phyta | 裸子植物門 Gymnospermae |
| 被子植物門 Angiospermae |

#### 菌界

菌界(Kingdom Fungi)の門(phylum)一覧。

#### 原生生物界

原生生物界(Kingdom Protista)の門(phylum)一覧。

### 古細菌ドメイン

古細菌(アーキア)ドメイン(Domain Archaea)の門(phylum)一覧。

| 上位分類 (界・上門) | 門 | 細胞機構等 | | 特徴 | 代表例 | 種類 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| ユーリ古細菌界 Euryarchaeota | ユーリ古細菌門 Euryarchaeota | Zリングによる細胞分裂 | DNAPolD,BI | 9綱を含み多様 | Pyrococcus furiosus, Halobacterium salinarum, Methanobrevibacter smithii, Thermoplasma acidophilum | 539 |
| DPANN群またはユーリ古細菌界 | ナノ古細菌門 Nanoarchaeota | Zリングによる細胞分裂 |  | 寄生性 | Nanobdella aerobiophila | 1 |
| プロテオ古細菌界 Proteoarchaeota | クレン古細菌門 Crenarchaeota | ESCRT複合体による細胞分裂 | DNAPolBI,BII、RNApolG | 大半が好熱菌 | Sulfolobus acidocaldarius, Pyrobaculum islandicum | 69 |
| タウム古細菌門 Thaumarchaeota | ESCRT複合体による細胞分裂 | DNAPolBII,D、TopIB | 中温性が多い。大半は亜硝酸菌で残りも好気性菌が占める。 | Nitrososphaera viennensis, Nitrosopumilus maritimus | 6 |

他に記載種を含まないものとして10門以上

### 細菌(バクテリア)ドメイン

細菌(バクテリア)ドメイン(Domain Bacteria)の門(phylum)一覧。

| 上位分類 | | 門 | グラム染色 | | 特徴 | 代表例 | 種類 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| 真正細菌 Bacteria | FCB | フィブロバクター門 Fibrobacteres | 外膜あり | グラム陰性 |  |  | 6 |
| クロロビウム門 Chlorobi |  | 緑色硫黄細菌 | 17 |
| バクテロイデス門 Bacteroides |  |  | 2344 |
| ゲンマティモナス門 Gemmatimonadetes |  |  | 4 |
| PVC | プランクトミケス門 Planctomycetes | 核膜様構造。ペプチドグリカン欠損。TtsZ欠損 |  | 106 |
| ウェルコミクロビウム門 Verrucomicrobia | 核膜様構造 |  | 61 |
| クラミジア門 Chlamydiae | ペプチドグリカン欠損。FtsZ欠損。ATP合成酵素を欠損し、寄生性。 | クラミジア・トラコマチス | 15 |
| レンティスファエラ門 Lentisphaerae | 核膜様構造 |  | 6 |
|  | アキドバクテリウム門 Acidobacteria |  |  | 62 |
|  | アクウィフェクス門 Aquificae | 16S rRNA系統解析において、真正細菌の中でも早くに分岐したとされる。好気性菌が多い。好熱性は真正細菌の中で最も高い。 |  | 30 |
|  | カルディセリクム門 Caldiserica |  |  | 3 |
|  | クリシオゲネス門 Chrysiogenetes |  |  | 4 |
|  | デフェリバクター門 Deferribacteres |  |  | 12 |
|  | ディクチオグロムス門 Dictyoglomi |  |  | 2 |
|  | エルシミクロビウム門 Elusimicrobia |  |  | 2 |
|  | フソバクテリウム門 Fusobacteria |  |  | 48 |
|  | ニトロスピラ門 Nitrospira |  |  | 10 |
|  | プロテオバクテリア門 Proteobacteria |  | 大腸菌 | 7068 |
|  | スピロヘータ門 Spirochetes | 細いらせん状、鞭毛が菌体内に存在する特徴がある。 | 梅毒トレポネーマ | 194 |
|  | シネルギステス門 Synergistetes |  |  | 28 |
|  | サーモデスルフォバクテリウム門 Thermodesulfobacteria |  |  | 12 |
|  | テルモトガ門 Thermotogae | 16S rRNA系統解析において、真正細菌の中でも早くに分岐したとされる。嫌気性。好熱性が高い。 | Thermotoga maritima | 52 |
| テ ッ ラ バ ク テ リ ア | シアノバクテリア門 Cyanobacteria | 酸素発生型光合成細菌。一部の種はシストを形成する。 | ユレモ | 2654 ※ICN準拠 他はICNB準拠 ※2008年現在 |
| アルマティモナス門 Armatimonadetes | 好気化学合成従属栄養の小群。 |  | 4 |
| デイノコックス・テルムス門 Deinococcus-Thermus | 系統による | 放射性耐性菌や好熱菌を含む。 | Deinococcus radiodurans | 127 |
| クロロフレクサス門 Chloroflexi | 外膜無し | リポ多糖を含む外膜を欠く。一部は出芽胞子を形成する。 | 緑色非硫黄細菌 | 54 |
| マイコプラズマ門 Mycoplasmatota | グラム陰性 | 細胞壁を欠く。 |  | 223 |
| 放線菌門 Actinobacteria | グラム陽性 | 多くはいわゆる放線菌で、好気環境に生息し気菌糸と分節胞子を形成する。GC含量が55%以上のものが多い。 | ビフィズス菌、結核菌 | 4107 |
| フィルミクテス門 Firmicutes | 内性胞子を形成する種が多い。GC含量が放線菌に比べ低く、25~55%のものが多い。 | 枯草菌 | 3251 |