Les frais liés à la structure sociétaire.
Les frais d’établissement.
Ce sont les dépenses engagées à l’occasion d’opérations qui conditionnent l’existence ou développement d’entreprises mais dont le montant ne peut être rapporté à des productions de biens ou de services déterminés.
Il y a des frais particuliers pour les sociétés : les frais spécifiques à la constitution de la société, frais de rédaction et publication des statuts, frais des droits d’apports.
Ces frais de constitution ou d’augmentation de capital peuvent être déduits par la société soit en totalité lors de l’exercice au cour duquel ces frais sont engagés soit de manière échelonnée selon l’amortissement linéaire sur 5 ans maximum.
Les frais d’emprunt.
Il n’y a pas de différence entre entreprises individuelles et sociétés.
Ces entreprises peuvent déduire des intérêts d’emprunt courus pendant l’exercice.
Les frais liés aux emprunts obligataires.
Pour emprunter, les sociétés peuvent voir des établissements de crédit classique ou recourir à l’emprunt obligataire. Dans ce cas l’entreprise se finance en émettant sur le marché des obligations à un taux donné. Ces emprunts supposent des frais particuliers pour l’organisme émetteur. Notamment des frais de publicité. Outre ces frais, les sociétés peuvent assurer le succès de l’émission d’obligations en versant des primes :
Sur le point de vue fiscal, ces deux primes sont abordées "article 39 I 1 ter" distinguant deux hypothèses :
Les intérêts des comptes courants d’associés.
Les dividendes versés aux actionnaires ou associés en rémunération de leurs parts ou actions ne sont pas déductibles.
Dans certains cas, les associés ou actionnaires ne vont pas souscrire au capital de la société mais vont mettre à disposition de la société des sommes sur un compte courant moyennant le versement d’intérêts.
Différents avantages :
Cela implique un risque de sous-capitalisation des sociétés.
Il faut éviter que la pratique de compte courants n’aboutisse à une sous-capitalisation des entreprises. Un compte courant d’associé ne peut être que créditeur. Pour lutter contre cela, le code prévoit un mécanisme général applicable à toute société.
Ce mécanisme montre que la déductibilité des intérêts versés au titre de compte courants d’associés à 2 conditions :
Ce mécanisme est doublé d’une troisième condition spécifique aux sociétés.
L’état de la législation avant LF 2006.
L’art 212 pose un 3 condition spécifique aux sociétés : lorsque l’ensemble des sommes mises à disposition d’une société par ses associés ou actionnaires dirigeants ou majoritaires, excèdent 1,5, le montant du capital social, les intérêts correspondant à l’excédent ne seront pas déductibles.
Le problème de cet article, il prévoyait une exception en présence de comptes courants d’une société mère. La lecture combinée des art 212 et 145 implique que la condition que les sommes placées sur les comptes n’excèdent pas 1,5 fois du capital social ne s’appliquaient aux relations entre société mère et filiale. 
Le problème est de savoir : est-ce que la référence à l’art 145 vise les sociétés mères françaises ou toutes les sociétés mère quel que soit leur statut et nationalité soumises à l’ IS en France ?
Si on interprète l’art 145 comme concernant que les sociétés passibles de l’ IS en France, une société mère étrangère de l’union ne pourrait bénéficier de l’exonération de la 3 condition. Dans cette hypothèse, on est en présence d’une violation de la liberté d’établissement et de circulation des capitaux.
Certains juges du fonds estimaient que cette combinaison était contraire au droit européen.
Le CE montre un article similaire à l’art 212 en Allemagne étant censuré en 2002 par la cour de justice. Cet art institue une différence de traitement selon que la filiale française verse des intérêts à une société mère étrangère ou une autre imposée en France.
Le CE observe que cet art 212 viole les stipulations des clauses de non-discrimination de conventions fiscales bilatérales sous le modèle OCDE.
On est confronté à l’obligation de totalement réformé le mécanisme de lutte contre la sous-capitalisation.
Le nouveau dispositif de l’art 212 applicable aux exercices du 01.01.2007.
Le législateur profite de l’occasion pour réformer le mécanisme.
Il étend le champ d’application de celui-ci.
La réforme devait simplifier l’état du droit.
Art 39 I 3 n’est pas modifié.
5 points de ce mécanisme :
 son entrée en vigueur au 01.01.2007
 art 212 est silencieux pour la condition de libération du capital social
 le champ d’application de la réforme : l’ancien dispositif concernait les comptes courants d’associés ou dirigeants. La nouvelle disposition s’applique aux intérêt rémunérant les sommes laissées ou mise à dispositions d’entreprises soumises à l’ IS par d’autres entreprises qui leur sont liées directement ou indirectement. Pour les entreprises débitrices d’intérêts, sont soumises à l’ IS et des établissements stables de société étrangère installée en France. Pour les sociétés créditrices, le nouveau dispositif s’applique aux avances mises à disposition d’entreprises qui sont en lien de parenté avec celle versant l’avance.
Un lien de parenté dans 2 cas : la relation mère fille soit la relation de sœurs.
En revanche, le champ d’application de l’art 212 est aussi diminué sur certains points.
En effet, la nouveauté ne vise pas les personnes physiques associées à l’entreprise emprunteuse. De même, cet art 212 prévoit qu’il ne s’applique pas aux avances accordées par des entreprises dont l’activité est purement financière.
Le ratio de niveau d’endettement. Pour que l’entreprise soit considérée comme sous capitalisée, on doit constater que le montant moyen des sommes laissées ou mises à disposition par toutes les entreprises apparentées est supérieur à 1,5 fois du montant des capitaux propres des sociétés à l’ouverture ou clôture de l’exercice.
Le ratio de couverture des intérêts. Pour une sous-capitalisation, il faut que les intérêts versés à l’ensemble des entreprises apparentées soit d’un montant supérieur à 25% du résultat courant avant impôt.
Le ratio de montants d’intérêts reçus de sociétés liés. Pour la sous-capitalisation, l’entreprise doit avoir verser un montant d’intérêts à les entreprises liées supérieur à celui des intérêts reçus des mêmes entreprises liées. Ce 3 ration veut exclure les entreprises qui ont une mission de centrale de trésorerie au sein d’un groupe sans avoir le statut d’établissement de crédit.
L’entreprise peut renverser cette présomption en démontrant que le ratio d’endettement de son groupe est supérieur à son propre ratio d’endettements.
L’avantage est double : 
Les personnes physiques ne sont plus concernées par l’"art 212".
La sanction de la non déductibilité en cas de sous-capitalisation n’est plus définitive.
Les impôts.
Pour les entreprises soumises à l’IR/IS, sont déductible du bénéfice brut les impôts, taxes et cotisations sociales se rapportant à l’exploitation de l’entreprise. Cela vise surtout la taxe professionnelle, les taxes foncières, la TVA non récupérée et droits d’enregistrements.
Pour les sociétés, l'IS n’est pas une charge déductible pour la société. En revanche, les sociétés sont soumises à l’imposition particulière. C’est l’imposition forfaitaire annuelle (IFA).
L’IFA constitue une imposition distincte de l’IS.
Traditionnellement l’IFA frappe le CA TTC de la société. Peu importe que la société réalise des bénéfices ou pas. 
L’imposition est due par les sociétés existantes au premier janvier et doit être versée au plus tard au 15 mars de l’année d’imposition.
L’IFA est intrinsèquement à l’IS.
Deux hypothèses :
L’IFA est déductible de l’IS dû pendant l’année d’exigibilité de l’IFA et les deux années suivantes.
L’IFA fait l’objet de deux réformes.
Loi 26.07.2005 sur la confiance et modernisation de l’économie. Cette réforme a pour objet de prévoir une exonération d’IFA quand le CA est inférieur à . Ce barème est modifié par la LF 2006 dont l’apport ne se limite pas à revisiter le barème.
Le CA n’est plus TTC mais HT.
Une aggravation du montant d’imposition.
Le législateur a supprimé totalement le mécanisme d’imputation de l’IFA sur le montant de l’IS. Quel que soit l’hypothèse l’IFA devient une charge définitive des sociétés et ne peut plus venir en diminution de la cotisation de l’IS.
Dans le cadre de mesures transitoires, on prévoit que les IFA de 2004/05 pourront être imputées jusqu’au 31.12.2006 ou 2007.
Les traitements et rémunérations des dirigeants.
En matière de société, on distingue les sommes versées aux organes de direction et celles versées aux organes d’administration.
Les salaires.
La déduction de rémunération.
La personne physique du dirigeant est distincte de la personne morale de la société, il n’y a aucun obstacle juridique ou fiscal à reconnaître l’existence d’un salaire.
Le principe : les rémunérations versées aux dirigeants sont déductibles pour la société quand elles correspondent à un travail effectif. Quand la rémunération est excessive ou ne correspond pas à un travail effectif sera requalifiée de bénéfices distribués.
Pour la société, la rémunération n’est plus déductible.
Pour le dirigeant, la rémunération n’est plus un salaire et perd le forfait de 10% de frais professionnels.
Le fisc contrôle le montant de la rémunération et veille à la régularité des décisions fixant ses rémunérations. De même, il vérifie que les remboursements de frais versé au dirigeant constate des opérations réelles. Le fisc impose la règle de : non cumul des indemnités forfaitaires pour frais d’emploi avec des remboursements de frais.
Le traitement fiscal des rémunérations des dirigeants de société.
Le régime fiscal de ces rémunérations varie selon le type de société.
Les organes des sociétés anonymes simplifiées.
La direction est assumée par le président du conseil d’administration, le directeur général ou les membres du directoire. Tous ceux ci sont assimilés à des salariés. Leur rémunération quelqu’en soit la forme sont imposables dans cette catégorie et les fait bénéficier du forfait de 10% pour frais professionnels.
Pour les SARL, le régime fiscal est distingué selon un gérant majoritaire ou minoritaire. Le gérant minoritaire est assimilé au salarié. Le gérant majoritaire relève de l’art 62 CGI : prévoit la catégorie spécifique mais proche des traitements et salaires. Le gérant majoritaire est celui qui détient personnellement ou par le conjoint ou enfants, plus de la moitié du capital de la société.
Pour les sociétés de personnes et assimilés. 
Les sociétés de personnes relevant de l’IR : les sommes que s’allouent les associés de société de personnes au titre de rémunération ne sont pas déductibles des bénéfices sociaux. Ces sommes sont considérées comme des avances au titre des BIC, BNC, BA. Si le gérant est un tiers non associé, sa rémunération reste un traitement et salaire.
Pour les sociétés de personnes relevant de l’IS : les rémunérations versées aux dirigeants obéissent au régime de gérants majoritaire de SARL
Les jetons de présence.
Pour les organes d’administration, il y a possibilité pour les sociétés de verser des rémunérations en contrepartie de l’activité des membres des conseils d’administration ou conseil de surveillance.
Les jetons de présence ordinaires sont imposables entre les mains de leur bénéficiaire dans la catégories de revenus de capitaux mobiliers.
Les jetons de présence supplémentaire attribué aux administrateurs exerçant des fonctions de direction sont imposables dans la catégorie des traitement set salaires.
Pour la déductibilité des jetons de présence, il s’agit de sommes fixes annuelles et indépendantes des résultats de l’entreprise.
Donc ce sont des rémunérations présentant un caractère déductible. Toutefois, le législateur se méfie de possible distributions déguisées de bénéfices prenant la forme de jetons de présence.
Art 210 /7 : les jetons de présence alloués aux membres du conseil d’administration ou conseil de surveillance sont déductibles de l’assiette de l’impôt dans la limite de 5 % du produit obtenu en multipliant la moyenne de rémunération déductible par le nombre des membres composant le conseil. Cet article précise qu’on retient al moyenne des seuls salariés les mieux rémunérés de la société donc les 10 ou 5 salariés les mieux payés quand l’effectif total excède ou non 200 salariés.
Si la société emploie au total moins de 5 personnes, la déduction des jetons de présence est limité à par membre du conseil d’administration ou de surveillance.
L’exercice de déduction des jetons de présence est celui au cours duquel la décision de le verser a été prise.
Ce dispositif ne concerne que les jetons de présence et non les remboursements de frais versés aux administrateurs. Ces remboursement sont intégralement déductibles.
Les avantages en nature et dépenses somptuaires.
Pour les sociétés, les avantages accordés aux dirigeants ou employés sont déductible de l’assiette de l’IS à la condition d’une part que l’avantage ne soit pas excessif et d’autre part qu’il corresponde à un travail effectif.
Les avantages en nature versés aux dirigeants doivent être mentionnés sur un état récapitulatif séparé.
L’art 39-4 sur les dépenses somptuaires s’appliquent aussi aux sociétés.
Le régime particulier de l’avoir fiscal.
pour compenser les doubles impositions économiques résultant de versements de dividendes, le législateur met en place le système d’avoir fiscal.
C’est un revenu à déclarer équivalent à 50% du montant des dividendes versées et un crédit d’impôt du même montant.
Pour les sociétés, ce taux d’avoir fiscal n’avait cessé de diminuer (10% pour 2004)
Parallèlement à l’avoir fiscal, les sociétés étaient également redevable d’un précompte mobilier qui s’appliquaient quand les sociétés versaient des dividendes non imposées à l’IS.
Dans cette hypothèse, il n’y avait pas double imposition économique mais le mécanisme d’avoir fiscal était maintenu au profit du bénéficiaire des dividendes. En contrepartie de ce maintien, la société versant les dividendes devait acquitter un précompte immobilier égale à 50% des montants des dividendes.
La société bénéficiaire des dividendes profitait d’un avoir fiscal complémentaire pour aboutir à un montant équivalent au précompte mobilier.
La LF 2005 a totalement supprimé le système d’avoir fiscal (et son corollaire le precompre mobilier).
Il en résulte que les dividendes de source française perçus par une société n'ont plus aucun avoir fiscal attaches a ceux-ci. À la différence de la situation des personnes physiques pour qui la suppression de l'avoir fiscal a été compensée par l'institution d'un abattement de 40% des dividendes reçus, aucun abattement n'est prévu pour les dividendes reçus par une société (À noter toutefois que cela n'affecte pas les sociétés détenant plus de 5% du capital de la société distributrice, puisque les dividendes ainsi reçus sont exonérés à hauteur de 95% en vertu d'un autre régime particulier appelé régime mère-fille).
À titre exceptionnel en 2005, l’état continue à percevoir un précompte mobilier de 25%.
Les déficits.
en pure théorie, un déficit n’apparaît pas comme une charge mais en pratique le déficit d’un exercice peut être reporté sur les résultats d’autres exercices. On les considère comme une charge fiscalement.
Deux mécanismes :
Les conditions de l’option.
Ce mécanisme marche pour les sociétés soumises à l’IS. Il favorise l’investissement par un allègement des charges fiscales au moment de l’investissement. La société doit soulever une option. Elle ne peut être exercée au titre d’un exercice au cours duquel intervient une cession, cessation totale d’entreprise ou fusion de société.
Il faut ensuite que le bénéfice de l’exercice de report est été effectivement imposé.
L’imputation en arrière des déficits ne peut se faire que dans la limite de la fraction non distribuée des bénéfices. Le législateur a clairement la volonté de pénaliser les sociétés qui distribuent leur bénéfices au détriment de leur capacité d’autofinancement.
Le mécanisme.
Le déficit constaté au cours d’un exercice est imputé sur les bénéfices des 3 exercices précédents en commençant par le plus ancien. La base d’imputation est égale au montant avant impôt des bénéfices soumis à l’impôt. Ce montant sera diminué des distributions prélevées de ces mêmes bénéfices et des bénéfices ayant donner lieu à un paiement d’impôts aux moyens de crédits d’impôt.
Le mécanisme aboutit à un excédent d’impôt concernant l’exercice de report.
Le report fait apparaître un crédit d’impôt.
Cela fait ressortir de façon rétroactive, un trop perçu d’impôt lequel fait naître une créance fiscale.
L’excédent d’impôt fait naître au profit de l’entreprise, une créance égale au produit du déficit imputé par le taux de l’IS applicable à l’exercice déficitaire.
L’article dispose que cette créance est remboursée au terme de 5 années après al clôture de l’exercice au cours duquel l’option a été exercée. Au terme du délai de 5 ans, la créance qui n’est pas utilisé par la société pour acquitter l’IS est rembourser par le fisc. Dans certaines hypothèses ce délai est trop long car la société doit avoir fait l’objet d’une liquidation. Dans la LF 2004, l’article 220 est modifié et prévoit pour les sociétés en redressement ou liquidation, une possibilité de remboursement anticipé de la créance de report en arrière de déficit. Cette faculté de remboursement concerne les créances de report nées du 01.01.2004 ou existant à cette date.
Est elle transmissible quand la société qui en est titulaire est absorbée par une autre.
Le principe est que cette créance est intransmissible et insaisissable. Mais en cas de fusion, ou apports partiel d’actifs, cette créance contre le fisc est transmise de la société apporteuse à celle bénéficiaire lorsqu’il y a agrément de l’administration fiscale. Si l’administration refuse l’agrément et qu’il n’y a pas liquidation de la société, le fisc n’est pas tenu de rembourser la créance quand le délai de 5 ans n’est pas respecté.
Pour les taux d’imposition applicables à l’exercice de report, on tient compte des taux en vigueur à l’époque qu’il s’agisse du taux normal ou des taux de faveur.