La est une altération des fonctions ou de la santé d'un organisme vivant, comme l'homme (Homo sapiens).
L'étude des causes des maladies constitue l'. 
Le traitement des maladies constitue la .
La maladie entraîne des anomalies morphologiques étudiées par la morphologie pathologique ou .
Ces anomalies morphologiques peuvent être macroscopique ( visible à l'œil nu) ou microscopique ( visible uniquement au microscope). Elles peuvent intéresser la cellule (), le tissu () ou l'organe ().
Maladie.
La est une altération des ou des d'un . Elle s'oppose à la . 
Causes des maladies.
Les maladies ont des dont l' constitue l'. L'étude de ce réseau complexe de causalités est à l'origine de l'émergence de la médecine scientifique et de la médecine expérimentale. Ces causes peuvent être endogènes ou exogènes. 
Les causes endogènes sont liés à l'organisme lui-même. Elles sont en grande partie génétique et liées au . Celui-ci produit un qui peut être anormal et entraîner une ou une à une maladie apparemment acquise. 
Les causes exogènes ou sont extérieurs à l'organisme. Ce peut être: 
Association endogène-exogène
Il existe une interaction constante entre le génotype, le phénotype et l'. C'est cette interaction qui est au cœur du déclenchement de processus pathologiques.
Niveaux d'organisation.
Les niveaux d'organisation d'un organisme sont : 
Accueil
Processus pathologiques.
Les maladies sont à l'origine de processus anormaux ou processus pathologiques, étudiés par la . Le déploiement de la maladie dans le corps humain crée à chaque niveau d'organisation de l'organisme des anomalies de fonction et des anomalies de structure. 
Anomalies des fonctions.
Les fonctions d'un niveau d'organisation sont étudiées par la . 
Les anomalies de fonction d'un peuvent être à l'origine d'une insuffisance fonctionnelle, qui peuvent être à l'origine de . 
Chacun de ces niveaux d'organisation est susceptible d'être altéré au cours de la maladie et des processus pathologiques. 
Classement des maladies.
Les maladies sont classés en fonction de leur étiologie :

Biophilosophie
La biophilosophie est une branche de la philosophie qui traite des problèmes , et liés à la } et aux .
La biophilosophie est l'étude des s nécessaires à la pratique de l'étude des phénomènes vivants (ou biologie) ou créés par elle. 
= Chapitres =

Génétique des populations
La génétique des populations est la partie de la génétique qui s'intéresse à la diversité génétique des populations humaines.

Génétique des populations/Le génome humain

Les cinquante dernières années ont été le cadre d’une incroyable bouleversement scientifique lié à la découverte de l’ADN, le support de l’information génétique, et aux mécanismes régulant son expression. Cette révolution a eu des retombées dans l’ensemble des sciences de la vie. 
Son application à l’étude des populations humaines a bouleversé la génétique des populations et ouvert une nouvelle fenêtre sur l’histoire humaine. Ce nouveau champ scientifique, l’archéogénétique, offre un nouveau regard sur l’origine des populations humaines habitant aujourd’hui la terre. Elle permet aussi de retrouver de lointains cousins comme l’homme de Néanderthal, des peuples disparus comme les Tainos ou des ancêtres comme ce chasseur du néolithique retrouvé dans la glace. 
Les polymorphismes 
Peu de temps après la découvertes de l’ADN, il est rapidement apparu que le support de l’information génétique était le siège de nombreuses variations interindividuelles : les polymorphsimes. Dés 1985, le prix Nobel français créait le CEPH, le centre d’études des polymorphsimes humains, basé à l’hôpital Saint-Louis de Paris. Historiquement, ces polymorphismes ont été détectés par des enzymes qui coupaient l’ADN selon des séquences très spécifiques pour former des petits fragments. 
La variabilité de l’ADN pouvaient être détectés en faisant migrer ces fragments dans un champ électrique. Il s’agissait des RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism). Ces polymorphismes ont vite constitué des bornes, des repères qui ont permis aux chercheurs de se repérer sur l’ADN et ont ouvert la voie à l’identification de gènes responsables de maladies génétiques. La succession de ces marqueurs sur une même région de chromosome forme un haplotype. Un groupe humain défini par un même haplotype forme un haplogroupe.
L’horloge moléculaire et la dérive génétique
Les flux génétiques 
Les haplogroupes permettent ainsi de repérer des flux génétiques selon lesquels diffusent tels ou tels marqueurs. Ces flux suivent les isthmes et les détroits comme l’isthme de Suez ou le détroit de Gibraltar ou de Behring ou sont divisé par des obstacles comme l’Himalaya. Sur longue période, seuls ces flux comptent.

Génétique des populations/L'étude mitochondriale

Les mitochondries sont de petits corpuscules situés dans toutes les cellules humaines. Elles jouent un rôle très important de fournisseur de la cellule en énergie. Probablement, dérivés de bactéries ayant colonisées les cellules il y a très longtemps, les mitochondries possèdent leur propre ADN et se repliquent isolément. 
Lors de la fécondation de l’ovule, seul le noyau du spermatozoïde pénêtre l’ovule, qui se transforme ainsi en œuf initial (appelé le zygote). Nos mitochondries sont donc transmises par nos mères selon une lignée maternelle, dite matrilinéaire. L’étude de l’ADN mitochondrial permet ainsi de remonter la lignée allant de notre mère à notre grand-mère maternelle, puis à sa grand-mère maternelle et ainsi de suite. 
La transmission maternelle et l’absence de recombinaison ont permis une différentation de la séquence de l’ADNmt humain par l’accumulation successive de nouvelles mutations le long des lignées maternelles. Au fil du temps, ce processus de divergence génétique a donné naissance à des unités monophylétiques appelées « haplogroupes ». 
Comme ce processus de différenciation moléculaire s’est déroulé pendant et après le processus de colonisation humaine et de diffusion dans les différents continents et régions, les haplogroupes et les sous-haplogroupes tendent à être restreints à une aire géographique particulière ou à un groupe de populations. 
L’Eve mitochondriale 
L’étude de l’ADN mitochondrial a également permis de retrouver des caractéristiques de l’ADN mitochondrial communes à l’ensemble des hommes, issues d’une hypothétique Eve mitochondrial. L’évocation de cette ancêtre commune a suscité une controverse considérable.
Out of Africa
Les données récentes de biologie moléculaire montre que l’homme moderne est issu d’une migration récente à partir d’Afrique (l’hypothèse Out of Africa).
Cette sortie s’est déroulée selon deux routes :
- une route Sud le long de la côte asiatique
- une route Nord à travers le proche-orient vers l’Asie centrale. 
Ces deux migrations ont une même origine africaine. 
Le groupe mtDNA Eurasie/Océanie consiste en deux macrohaplogroupes, mais ces deux voies ne recoupent pas ces deux macrohaplogroupes. 
Pour la plus grande partie de l’histoire de l’évolution humaine, et en particulier pour le processus récent de diffusion à partir d’Afrique vers les autres continents, l’évolution relativement récente de l’ADN mitochondrial (mtADN) s’est déroulé dans un contexte de petites populations fondatrices. Les effets fondateurs et les dérives génétiques ont joué un rôle majeur pour déterminer les fréquences des haplotyopes, donnant naissance aux haplogroupes et sous-haplogroupes. Ceux-ci sont souvent restreints à des aires géographiques spécifiques et des groupes précis de population.

Génétique des populations/Le chromosome Y