La pathologie moléculaire du cancer du poumon est surtout celle de l'adénocarcinome pulmonaire. Elle est conditionnée par le développement des thérapeutiques ciblées.Thérapies ciblées du cancer pulmonaire : tests moléculaires à partir d’échantillons cytologiques
= Mutations d'EGFR = 
= Mutations de KRAS =
= Séquençage ciblée=
= Translocations =

Oncogénétique diagnostique/KRAS
KRAS
= Types tumoraux =
= Thérapeutique ciblée =

Oncogénétique diagnostique/EGFR
EGFR
Le gène est situé sur le bras court du chromosome 7 (7p11.2). Il comporte 28 exons et code pour une protéine transmembranaire comportant un site extra-membranaire (récepteur) et un domaine cytoplasmique avec une activité tyrosine kinase.
L’EGFR fait partie de la famille de récepteurs tyrosine kinase HER/erbB comprenant quatre protéines (EGFR/HER-1, HER-2/neu, HER-3, HER-4) avec une structure moléculaire similaire. 
La liaison du ligand avec l’EGFR entraîne une activation du système tyrosine kinase et une transduction du signal en aval contrôlant la prolifération, l’apoptose, l’angiogenèse, l’invasion tumorale et la métastatisation. 
= Adénocarcinome pulmonaire =
Les mutations de l’EGFR sont présentes dans environ 10% des carcinomes pulmonaires non à petites cellules (CNPC). Elles sont plus fréquentes dans les adénocarcinomes (15-20%), en particulier chez les patients de sexe féminin, non fumeurs et d’origine asiatique (environ 40-50%).
Enjeux.
Les mutations de l’EGFR sont associées à un meilleur pronostic (survie globale de 37 mois).
Il s’agit majoritairement de mutations des exons 18-21 avec dans 90% des cas des délétions de l’exon 19 (associées à 70-100% de réponses aux TKI) ou des mutations ponctuelles dans l’exon 21 (associées à 20-70% de réponses aux TKI).
Les cellules cancéreuses avec ces mutations de l’EGFR ont une sensibilité augmentée aux TKI, d’une part, parce que leur survie dépend de cette voie de signalisation et, d’autre part, parce que les TKI ont vraisemblablement une plus grande affinité avec l’EGFR muté.
Mutations.
= Thérapeutique ciblée =

Oncogénétique diagnostique/TP53
TP53
Oncogénétique diagnostique/Cancer du col utérin

Cancer du col utérin
Oncogénétique diagnostique/Cancer de l'endomètre

Cancer de l'endomètre
Oncogénétique diagnostique/Cancer de l'ovaire

Cancer de l'ovaire
= BRACs - BRAC1 - BRAC2 =
Thérapeutique ciblée.
= Documents =

Oncogénétique diagnostique/BRAF
Le gène , situé sur le chromosome 7, code pour la B-Raf.
= Mutations principales =
= Thérapeutique ciblée =
Le ZELBORAF® (vemurafenib) ou le TAFINLAR® (dabrafenib) sont indiquées comme inhibiteurs de cette protéine mutée.
= Types tumoraux =
Les mutations affectant le gène BRAF sont les plus fréquemment retrouvées dans le mélanome. La substitution de la valine en position 600 (V600) par un glutamate (V600E) ou par une lysine (V600K) est celle qui est principalement retrouvée, elle conduit à une activation de BRAF.

Oncogénétique diagnostique/NRAS
NRAS
= Thérapeutique ciblée =

Oncogénétique diagnostique/Mélanome
Mélanome
Dans le mélanome, plusieurs types de mutations de la voie MEK ou des voies collatérales (CKIT) sont retrouvées. 
Les mutations affectant le gène BRAF sont les plus fréquentes. La substitution de la valine en position 600 par un glutamate (V600E) ou par une lysine (V600K) est celle qui est principalement retrouvée, elle conduit à une activation de BRAF. 
Le (ZELBORAF®) ou le (TAFINLAR®) indiqués dans le traitement du mélanome agissent comme inhibiteurs de cette mutation.

Oncogénétique diagnostique/Cancer du sein

Cancer du sein
= Statut HER2 =
FISH HER2.
= Statut BRCAs =
Chez les patientes ayant une tumeur porteuse d'une mutation somatique ou constitutionnelle de l'un des gènes BRCA, BRCA1 ou BRCA2, l'/Olaparib/ allonge la durée de rémission et diminue la mortalité par rapport à un traitement convetionnel.
= Statut PD-L1 =

Oncogénétique diagnostique/Cancer du sein/Olaparib

A renommer
Oncogénétique diagnostique/Olaparib
L' (Lynparza) est un anticancéreux de la classe des Oncogénétique diagnostique/inhibiteurs de PARP/, efficace chez les patients présentant des mutations héréditaires des gènes BRCA1 ou BRCA2, essentiellement sur le cancer de l'ovaire, le cancer du sein et le cancer de la prostate3.
= Indications =
Cancer du sein.
Chez les patientes ayant une tumeur porteuse d'une mutation somatique ou constitutionnelle de l'un des gènes BRCA, BRCA1 ou BRCA2, l'/Olaparib/ allonge la durée de rémission et diminue la mortalité par rapport à un traitement convetionnel.
Cancer de l'ovaire.
Dans le cancer de l'ovaire BRCA-muté, il allonge en traitement d'entretien la durée de rémission et diminue la mortalité à trois ans.
Cancer du pancréas.
Dans le cancer du pancréas BRCA muté métastatique, il allonge la durée de rémission de quelques mois. Toutefois, les cancer du pancréas avec mutations de BRCA sont rares.
Cancer de la prostate.
Dans le cancer de la prostate on observe une prolongation de la survie d'environ trois mois chez des patients traités à l'olaparib ayant subi une castration, bénéficiant d'un traitement hormonal ( ou ) et chez qui on observe une progression de la maladie.

Oncogénétique diagnostique/Inhibiteurs de PARP

Les agissent en inhibant les (PARP). 
Les mutations des gènes BRCA1 et BRCA2 sont susceptibles de prédisposer génétiquement au développement de certaines formes de cancer résistant à d'autres formes de traitement. 
Ces cancers BRCA-mutés peuvent présenter une sensibilité particulière aux poly(ADP-ribose) polymérases lorsque ces enzymes deviennent indispensables à la nécessaire à la . 
Dans ce cas, les inhibiteurs de PARP peuvent cibler spécifiquement les cellules cancéreuses et de ce fait présenter une efficacité optimale comme traitement anticancéreux. 
Ainsi l'Olaparib présente une efficacité en cas de mutations des BRCA dans les modèles tumoraux suivants : 
- le cancer du sein HER2 négatif
- le cancer de l'ovaire
- le cancer du pancréas métastatique
- le cancer de la prostate

Oncogénétique diagnostique/Séquençage haut débit

Le séquençage haut débit (NGS)
Oncogénétique diagnostique/Séquençage de l'ADN

Le consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné.
= Méthode de Sanger =
= Séquençage haut-débit =
Les constructeurs.
= Bioinformatique =
= Séquençage du génome tumoral =

Systèmes sensoriels/Système somatosensoriel