er pyruvat omdannes til acetylcoa i mitokondriematrixen
Mitokondriel matrix -- Efter glycolyse aktiveres citronsyre cyklus ved produktion af acetyl-CoA. Oxideret af pyruvat med pyruvatdehydrogenase i matricen producerer CO, acetyl-CoA og NADH. Beta oxidation af fedtsyrer fungerer som en alternativ katabolisk vej, der producerer acetyl-CoA, NADH, og FADH. Produktionen af acetyl-CoA begynder citronsyrecyklussen, mens de fremstillede co-enzymer anvendes i elektrontransportkæden.