Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021
Autor: Peña Mejia, Yerson Gerardo
Asesor: Saavedra Trujillo, Carlos Humberto
Fecha: 2022-02-10
Programa: Bogotá - Medicina - Especialidad en Medicina Interna
Facultad: Facultad de Medicina

Resumen: Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021.
Objetivos Investigar la prevalencia de coinfección y/o infección secundaria en pacientes hospitalizados con coronavirus 2 (SARS-CoV-2) y síndrome respiratorio agudo severo confirmado.
Métodos Se realizó un estudio observacional retrospectivo de pacientes hospitalizados con SARS-CoV-2 confirmado por PCR y antígeno (marzo-2020 a marzo 2021). En el Hospital Universitario Nacional de Colombia (HUN) se recibieron en total 3793 casos presuntivos IRA Grave por COVID-19(SARS CoV-2) de los cuales 1206 (32%) se confirmaron positivos, 1189 (31%) fueron negativos y 1398 (36%) no tenían datos completos por lo que fueron excluidos; de los anteriores cumplieron criterios de inclusión 952 pacientes se hizo un muestreo probabilístico por conveniencia con una muestra representativa de 161 pacientes, se analizaron los datos demográficos, microbiológicos y los resultados clínicos de los pacientes.
Resultado Se incluyeron 952 pacientes hospitalizados con diagnostico confirmado de COVID-19 en hospitalización general y/o UCI durante el periodo de marzo 2020 a marzo 2021, se documentaron 389  casos de infección bacteriana secundaria (IBS) confirmadas, en la UCI 318 (40.77%) mientras que en Hospitalización General 71(41.52%); de los aislamientos  que se interpretaron como procesos infecciosos encontramos en primer lugar  enterobacterias con más frecuencia K.pneumoniae (n:193), E.coli (n:105), entre otras; en segundo lugar los bacilos gramnegativos no fermentadores  P.aeruginosa (n:80); en tercer lugar S. aureus (n: 58). El 42.2% de los aislamientos eran multiresistentes con prevalencia betalactamasas tipo AMPc (13%).La mortalidad general fue del 26.7%.
Conclusiones Encontramos alta prevalencia de IBS 40.8% en los pacientes con COVID-19 y se presentó de manera igual en pacientes críticamente enfermos hospitalización en UCI  que en los no críticamente enfermos en hospitalización general con COVID-19; se documentaron 43.75 % de neumonías asociadas a la ventilación mecánica (NAV), así como también se evidenciaron 29.17% de bacteriemias asociadas a dispositivo, un dato que supone una estrecha relación de dispositivos invasivos con la presentación eventos infecciosos y mortalidad, sin embargo el diagnóstico de IBS no tuvo influencia en la supervivencia de los pacientes. 
Palabras llave: Coinfección bacteriana, infección bacteriana secundaria; Coronavirus, SARS-CoV-2. (Texto tomado de la fuente)

Infecciones Asociadas a la COVID-19
en pacientes hospitalizados. 2021
Yerson Gerardo Peña Mejia
Universidad Nacional de Colombia
Facultad Medicina, Departamento de Medicina Interna
Ciudad, Colombia
2022Infecciones Asociadas a la COVID-19
en pacientes hospitalizados. 2021
Yerson Gerardo Peña Mejia
Estudiante Posgrado de Medicina Interna
Universidad Nacional de Colombia
Trabajo de grado presentado como requisito parcial para optar al título de:
Especialista en Medicina interna
Director:
Carlos Humberto Saavedra Trujillo MD, MSc
Especialista Infectología
Magister Epidemiologia Clínica
Profesor Titular
Departamento Medicina Interna
Co investigador:
Zaira Alejandra Peña Mejia
Estudiante VII Semestre Medicina
Universidad Nacional de Colombia
Cogestores del proyecto:
Andrea García Moncayo, MD
José Leonardo Enciso, MD
Universidad Nacional de Colombia
Facultad Medicina, Departamento de Medicina Interna
Ciudad, Colombia
2022Dedicatoria:
A Dios primero que todo por darme la perseverancia para seguir
adelante en todo este proceso, a mi familia que son el centro de mi
vida y mi motor, los amo.Declaración de obra original
Yo declaro lo siguiente:
He leído el Acuerdo 035 de 2003 del Consejo Académico de la Universidad Nacional.
«Reglamento sobre propiedad intelectual» y la Normatividad Nacional relacionada al
respeto de los derechos de autor. Esta disertación representa mi trabajo original, excepto
donde he reconocido las ideas, las palabras, o materiales de otros autores.
Cuando se han presentado ideas o palabras de otros autores en esta disertación, he
realizado su respectivo reconocimiento aplicando correctamente los esquemas de citas y
referencias bibliográficas en el estilo requerido.
He obtenido el permiso del autor o editor para incluir cualquier material con derechos de
autor (por ejemplo, tablas, figuras, instrumentos de encuesta o grandes porciones de
texto).
Por último, he sometido esta disertación a la herramienta de integridad académica, definida
por la universidad.
Yerson Gerardo Peña Mejia
Fecha: 09/02/2022Agradecimientos
Al Dr. Leonardo Enciso Olivera y la Dra. Andrea García Moncayo quien
fuesen mis colaboradores más cercanos, al Servicio de Infectología por
permitirme trabajar en este hermoso proyecto que beneficiara a la
comunidad en general.Contenido VIII
Resumen
Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021.
Objetivos Investigar la prevalencia de coinfección y/o infección secundaria
en pacientes hospitalizados con coronavirus 2 (SARS-CoV-2) y síndrome
respiratorio agudo severo confirmado.
Métodos Se realizó un estudio observacional retrospectivo de pacientes
hospitalizados con SARS-CoV-2 confirmado por PCR y antígeno (marzo-2020 a
marzo 2021). En el Hospital Universitario Nacional de Colombia (HUN) se
recibieron en total 3793 casos presuntivos IRA Grave por COVID-19(SARS CoV-
2) de los cuales 1206 (32%) se confirmaron positivos, 1189 (31%) fueron negativos
y 1398 (36%) no tenían datos completos por lo que fueron excluidos; de los
anteriores cumplieron criterios de inclusión 952 pacientes se hizo un muestreo
probabilístico por conveniencia con una muestra representativa de 161 pacientes,
se analizaron los datos demográficos, microbiológicos y los resultados clínicos de
los pacientes.
Resultado Se incluyeron 952 pacientes hospitalizados con diagnostico confirmado
de COVID-19 en hospitalización general y/o UCI durante el periodo de marzo 2020
a marzo 2021, se documentaron 389 casos de infección bacteriana secundaria
(IBS) confirmadas, en la UCI 318 (40.77%) mientras que en Hospitalización
General 71(41.52%); de los aislamientos que se interpretaron como procesos
infecciosos encontramos en primer lugar enterobacterias con más frecuencia
K.pneumoniae (n:193), E.coli (n:105), entre otras; en segundo lugar los bacilos
gramnegativos no fermentadores P.aeruginosa (n:80); en tercer lugar S. aureus
(n: 58). El 42.2% de los aislamientos eran multiresistentes con
prevalencia betalactamasas tipo AMPc (13%).La mortalidad general fue del 26.7%.
Conclusiones Encontramos alta prevalencia de IBS 40.8% en los pacientes con
COVID-19 y se presentó de manera igual en pacientes críticamente enfermos
hospitalización en UCI que en los no críticamente enfermos en hospitalización
general con COVID-19; se documentaron 43.75 % de neumonías asociadas a la
ventilación mecánica (NAV), así como también se evidenciaron 29.17% de
bacteriemias asociadas a dispositivo, un dato que supone una estrecha relación deX Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021
dispositivos invasivos con la presentación eventos infecciosos y mortalidad, sin
embargo el diagnóstico de IBS no tuvo influencia en la supervivencia de los
pacientes.
Palabras llave: Coinfección bacteriana, infección bacteriana
secundaria; Coronavirus, SARS-CoV-2.Contenido XII
Abstract
Infections associated with COVID-19 in hospitalized patients. 2021.
Objectives: To investigate the prevalence of coinfection and/or secondary infection in
patients hospitalized with confirmed coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and severe acute
respiratory syndrome.
Methods: A retrospective observational study of hospitalized patients with SARS-CoV-2
confirmed by PCR and antigen was conducted (March-2020 to March 2021). In the National
University Hospital of Colombia (HUN) a total of 3,793 presumptive cases of Severe ARI
due to COVID-19 (SARS CoV-2) were received, of which 1,206 (32%) were confirmed
positive, 1,189 (31%) were negative, and 1,398 (36%) did not have complete data so they
were excluded; Of the above, 952 patients met the inclusion criteria. A probabilistic
convenience sampling was carried out with a representative sample of 161 patients. The
demographic, microbiological and clinical results of the patients were analyzed.
Results: 952 hospitalized patients with a confirmed diagnosis of COVID-19 in general
hospitalization and/or ICU were included during the period from March 2020 to March 2021,
389 cases of confirmed secondary bacterial infection (SBI) were documented, in the ICU
318 (40.77% ) while in General Hospitalization 71 (41.52%); Of the isolates that were
interpreted as infectious processes, we first found Enterobacteriaceae, most frequently
K.pneumoniae (n:193), E.coli (n:105), among others; in second place the non-fermenting
gram-negative bacilli P.aeruginosa (n:80); in third place S. aureus (n: 58). 42.2% of the
isolates were multiresistant with a prevalence of cAMP-type beta-lactamases (13%).
Overall mortality was 26.7%.
Conclusions: We found high prevalence of IBS 40.8% in patients with COVID-19 and it
was presented in the same way in critically ill patients hospitalized in the ICU as in non-
critically ill patients in general hospitalization with COVID-19; 43.75% of pneumonia
associated with mechanical ventilation (NAV) were documented, as well as 29.17% of
device-associated bacteremia, a fact that implies a close relationship of invasive devices
with the presentation of infectious events and mortality, however the diagnosis of IBS had
no influence on patient survival.
Keywords: Bacterial coinfection, bacterial secondary infection; Coronavirus, SARS-CoV-
2.XII Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021
Contenido
Pág.
Resumen ............................................................................................................................. VI
Lista de figuras .................................................................................................................. IX
Lista de tablas ................................................................................................................... XV
Lista de Símbolos y abreviaturas .................................................................................. XVI
Introducción ........................................................................................................................ 1
1. Justificación .................................................................................................................. 19
2. Pregunta de Invesgación ..................................................................................................
3. Marco Teórico ............................................................................................................... 25
3.1 Contexto Actual ..................................................................................................... 25
3.2 Estructura del Virus .............................................................................................. 26
3.3 Bases Teoricas: Coinfección e Infección Bacteriana Secundaria....................... 27
3.2 Antecedentes de Investigación ............................................................................ 28
3.3 Resistencia ........................................................................................................... 30
4. Métodos ......................................................................................................................... 33
4.1 Objetivos .............................................................................................................. 33
4.1.1 Objetivos General................................................................................................. 33
4.1.2 Objetivos Específicos ........................................................................................... 33
4.2 Definición de Sujetos de Estudio ......................................................................... 33
4.2.1 Diseño del estudio.. .............................................................................................. 33
4.2.2 Población.. ............................................................................................................ 33
4.2.3 Sitio de Investigación ........................................................................................... 33
4.3 Criterios de Inclusión ............................................................................................ 33
4.4 Criterios de Exclusión .......................................................................................... 33
4.5 Variables del estudio ............................................................................................ 34
4.6 Tamaño de Muestra ............................................................................................. 34
4.7 Análisis Estadístico .............................................................................................. 35
4.8 Consideraciones Eticas ........................................................................................ 36
5. Resultados Descriptivos ............................................................................................. 37
5.1 Caracteristicas de la Población............................................................................ 37
5.2 Perfil microbiológico ......................................................................................... ….38
5.3 Dispositivos asociados a Infección ...................................................................... 40
5.4 Uso de Antibióticos .............................................................................................. 41
5.5 Resistencia ............................................................................................................ 42
5.6 Complicaciones .................................................................................................... 43
6. Discusion y Conclusiones ...................................................................................... 44Contenido XII
6.1 Discusión
…………………………………….………………………………………………47
6.2 Conclusión ……………………………………………………………………………….….49
Anexo: Tabla de Variables ............................................................................................... 51
Bibliografía ........................................................................................................................ 55Contenido VIII
Lista de figuras
Pág.
Figura 1. Muestreo de pacientes.
Figura 2. Grafica de distribución de eventos por día.
Figura 3. Microorganismos aislados en Hospitalización General.
Figura 4. Microorganismos aislados en Unidad de Cuidado Intensivo.
Figura 5. Aislamiento de Cándida en UCI.
Figura 6. Caracterización de Antibióticos usados.Contenido VIII
Lista de tablas
Pág.
Tabla 1. Descripción de la población.
Tabla 2. Distribución de IBS según servicio de hospitalización.
Tabla 3. Infecciones nosocomiales por género.
Tabla 4. Tipo de IBS en Hospitalización general.
Tabla 5. Tipo de IBS en Unidad de Cuidado Intensivo
Tabla 6. Dispositivo asociado a IBS.
Tabla 7. Principales características, comorbilidades, datos biológicos.
Tabla 8. Total, de antibióticos utilizados por paciente.
Tabla 9. Tipo de Resistencia.
Tabla 10. Patrón resistencia K.pneumoniae, E.coli, P.aeuriginosa, S.aureus.
Tabla 11. Mortalidad General
Tabla 12. Mortalidad en Infección IBS.
Tabla 13. Mortalidad en UCI
Tabla 14. Mortalidad en Hospitalización.Contenido VIII
Lista de Símbolos y abreviaturas
Símbolos con letras latinas
Abreviatura Término
Ab Acinectobacter baumannii
AC Anticuerpos.
ACE2: Enzima convertidora de angiotensina 2 .
ARN Ácido ribonucleico.
CE Escherichia coli
DE Desviaciones Estándar
DM Diabetes Mellitus.
E Envoltura.
Enfermedad Pulmonar Obstructiva
EPOC
Crónica.
ERC Enfermedad Renal Crónica.
GA Estreptococo del grupo A
H1N1 Influenza virus A subtipo H1N1.
HE Hemaglutinina-esterasa
Hi Haemophilus influenzae
HTA Hipertensión Arterial.
Hospital Universitario Nacional de
HUN
Colombia
IBS Infección Bacteriana Secundaria
IC Intervalo de confianza
IgM Inmunoglobulina M
Instituto Nacional de Salud de
INS
Colombia
Infección piel y tejidos blandos.
IPTB
ISQ-ISQ Infección del sitio de incisión quirúrgica
Infección sintomática de tracto urinario
ITSU-AC
asociada a catéterContenido XII
Abreviatura Término
Infección de torrente sanguíneo
ITS-AC
asociada a catéter central
JHU Johns Hopkins University.
Kp Klebsiella.pneumoniae
M Membrana.
Mcat Moraxella catarrhalis
MERS- Síndrome Respiratorio de Oriente
CoV.A Medio
MDR Multidrogoresistente
n Total
N Nucleocápside
NA No alcanzado
Neumonía asociadas a ventilación
NAV
mecánica
NEU1 Neumonía definida clínicamente
PA Pseudomonas aeruginosa
OMS Organización Mundial de la Salud
PCR Reacción en Cadena de la Polimerasa
PP Posición Prona
Antígeno recombinante de la espícula
RBD S1
S1.
S Proteína espiga.
Sa Staphylococcus aureus
Staphylococcus aureus meticilino
SAMS
sensible
Staphylococcus aureus meticilino
SAMR
resistente
SARS- Síndrome Respiratorio Agudo Severo
CoV.2 coronavirus 2
VMI Ventilación Mecánica Invasiva
UCI Unidad de Cuidados Intensivos.
.X Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021
VII
IIntroducción
La Pandemia de la COVID-19 es un desafío mayor para los médicos que laboran en
unidades de cuidados intensivos, ya que se enfrentan a diario a los peores desenlaces de
la enfermedad, en especial a la mortalidad de la misma, la cual se ve afectada por las
coinfecciones bacterianas de sus pacientes. Antes de esta pandemia estaban identificados
seis tipos de coronavirus que provocan infección a humanos, de estos el SARS CoV y el
MERS-CoV.A fueron causantes de los dos últimos brotes pandémicos uno en el 2002 y el
otro en el 2012 respectivamente (1). No obstante, en diciembre 2019 en la ciudad de
Wuhan, capital de la provincia de Hubei en China se identificó un nuevo coronavirus como
agente causal de casos de síndrome respiratorio agudo severo al que denominaron SARS-
CoV-2; por su secuenciación genética diferente a los otros seis tipos de coronavirus (2).
Este nuevo virus inició una epidemia en ese país y generó una emergencia sanitaria
mundial llamada pandemia de la COVID-19, la cual está en curso y aún representa gran
morbimortalidad. Para hacer frente a esta situación, se ha llevado a cabo diferentes
estrategias orientadas a la contención y mitigación del virus, además de numerosos
procesos de investigación dirigidos a la atención de la enfermedad, los cuales permiten un
mejor conocimiento de la misma y un manejo clínico orientado en la evidencia (3).
Investigaciones sobre la evolución de la enfermedad han mostrado la presencia de
infecciones bacterianas asociadas a la neumonía por SARS-CoV-2, las cuales constituyen
un factor de riesgo para los desenlaces fatales de la enfermedad. En el estudio de Kim y
col, donde evaluaron 1217 muestras, 116 de las cuales dieron positivo para SARS-CoV-2,2 Introducción
de estos, 24 fueron positivos para al menos otro patógeno respiratorio (4). En Qingdao
China, un estudio en 30 pacientes con infección respiratoria aguda grave por coronavirus
2 (SARS-CoV-2), se encontró que el 80% de ellos tenía anticuerpos (AC) IgM al menos
para un patógeno respiratorio, los más frecuentes fueron virus de la influenza A (60,00%)
y el virus de la influenza B (53,33%), seguidos de Mycoplasma pneumoniae (23,33%) y
Legionella pneumophila (20,00%) (5).
Múltiples estudios describen en sus hallazgos que un número importante de pacientes con
la COVID-19, en sus estados más graves desarrollan coinfecciones por bacterias y/u otros
microorganismos, incluidos virus. Este fenómeno desencadena peores resultados en la
atención, como más tiempo de estancia hospitalaria, presencia de resistencia
antimicrobiana, complicaciones mayores y desenlaces fatales (6), datos que deben
tomarse en cuenta para mejorar las futuras atenciones. Dentro de los microorganismos
más frecuentemente identificados en infecciones hospitalarias se encuentran
Staphylococcus aureus, Enterococcus spp, los bacilos no fermentadores y las
enterobacterias (7).
Si bien, la evidencia para respaldar la asociación de coinfección bacteriana e IBS a la
COVID-19 es limitada, se han realizado estudios que describen que la presencia de estás
va hasta el 44,4%, con una mortalidad mayor al 50% de los pacientes que se encontraban
en UCI, una alta frecuencia de uso de antibióticos en dicha enfermedad y elevada
resistencia a los mismos (7). Las recomendaciones actuales en la atención de la
enfermedad no apoyan la prescripción de antimicrobianos de entrada en estos pacientes,
se contempla en algunos casos su uso, en especial en pacientes con COVID-19 grave que
presenten neumonía, sepsis o sospecha de sobreinfección bacteriana. (8) Considerando
lo anterior se precisa con urgencia estudios de este tipo para soportar intervenciones
apropiadas, guías y protocolos de antimicrobianos específicas para la pandemia. El
objetivo del presente estudio es describir la frecuencia de coinfecciones e infecciones
secundarias bacterianas en 952 pacientes con la COVID-19 durante la hospitalización.
.1. Justificación
Estimar la prevalencia de coinfección bacteriana e IBS en pacientes con Covid-19 plantea
obtener una influencia importante en el refinamiento empírico de pautas de manejo de
antibióticos para pacientes con COVID-19 de la UCI. Poder identificar los microorganismos
prevalentes en las coinfecciones, describir los tratamientos utilizados o las medidas
profilácticas empleadas para las infecciones bacterianas secundarias permite establecer
el grupo de antibióticos pertinentes en la población descrita, además de establecer sus
perfiles de resistencia.
Revisando la literatura médica actual y los datos presentados anteriormente, la
enfermedad de la COVID-19 aún presenta gran impacto en la mortalidad y especial en la
de unidades de cuidados intensivos, es por esto que se necesitan estudios más amplios
para evaluar todos los factores que en ella influyen, y en este caso la prevalencia real de
coinfección bacteriana junto con su impacto y riesgo en mortalidad, así como pronóstico
en pacientes críticamente enfermos con neumonía grave por SARS-CoV-2 en las unidades
de cuidados intensivos del hospital universitario nacional. Además, en el país no hay
muchos estudios hasta el momento que describan estos datos en la población, el presente
análisis planteado permitiría ser la base para otras hipótesis de investigación en Colombia.
Las infecciones bacterianas asociadas a las neumonías virales han demostrado una
importante causa de morbimortalidad; la mayoría de las muertes en el brote de influenza
de 1918 tuvieron una infección bacteriana posterior, particularmente por Streptococcus
pneumoniae (9). Y a pesar de la importancia probada de las coinfecciones en la gravedad
de las enfermedades respiratorias, no se hicieron muchos estudios durante los grandes
brotes anteriores de infecciones respiratorias, prueba de ello fueron los pobres registros
en la pandemia de influenza H1N1 2009 a pesar de su gran asociación (10-13). No
obstante, la actual pandemia de COVID-19 ha marcado un punto diferente en este aspecto,4 Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. Multicéntrico. 2020
dado que desde hace mucho tiempo ninguna enfermedad abarcó una población tan
grande, permitiendo que todos los países del mundo realicen estudios para encontrar
evidencia científica que permita tratar esta enfermedad, en ese contexto es importante
realizar estudios para objetivar la prevalencia de las mismas en la población colombiana.
La pandemia de la COVID-19 -Síndrome Respiratorio Agudo Severo coronavirus 2 (SARS-
CoV-2) cobró la vida de 2.316.702 personas de un total de 106.136.103 pacientes
confirmados con la infección a nivel mundial (Letalidad de 2.18%) afectando a 192 países
al 07 de febrero de 2021, en ese momento Colombia se encontraba en el décimo primer
lugar de morbilidad y décimo segundo lugar de mortalidad. (13). A la fecha actual (15 enero
de 2022) la Pandemia se ha extendido a 204 países, cobrando la vida de 5.531.843
personas de un total de 324.196.758 pacientes confirmados con la infección (Letalidad de
1.7%), con un total de 9600.798.680 total de dosis de vacunas administradas. (14).
Según el Instituto Nacional de Salud de Colombia (INS), al inicio del estudio (7 de febrero
2021) se habían confirmado 2.157.216 casos, con 55.993 fallecidos, con una letalidad de
3,1%, mayor que la letalidad mundial, al 15 de enero 2022 hay 5.511.479 casos
confirmados y 130.860 fallecidos, con una tasa de letalidad de 2.37%, permaneciendo
mayor que la letalidad mundial. (15)
Debido a las comorbilidades los mayores de 60 años son los más afectados y representan
las frecuencias más altas en los estados más graves de la enfermedad, requiriendo
hospitalizaciones por más tiempo y manejo en unidades de cuidados intensivos. (16)
La evidencia médica describe que las infecciones pulmonares de origen viral a menudo
van seguidas de la aparición de infecciones secundarias, lo que conlleva complicaciones
clínicas y resultados negativos de la enfermedad; Los datos iniciales encontrados de
infecciones bacterianas secundarias reflejan que un número significativo de pacientes
hospitalizados por coronavirus, desarrollan coinfecciones bacterianas secundarias como
neumonías y otras sepsis, evidencia para concluir que son un factor de riesgo sustancial
para los resultados adversos de la COVID-19. En China, un estudio retrospectivo encontró
que el 96% de los pacientes con infecciones bacterianas secundarias presentaron
desenlaces fatales y en Cuba, en una serie de 13 casos la coinfección bacteriana fue de
69,2% (7). Se han documentado la coinfección bacteriana en pacientes críticamente
enfermos con influenza con porcentajes tan altos como 20-30% (11-12) y esto asociado aCapítulo 1 5
mayor gravedad de enfermedad, con aumento de gasto de los recursos sanitarios y
aumento en el riesgo de mortalidad. (13)
La infección por coronavirus trae por si sola implícita un riesgo de muerte no despreciable
en los adultos mayores y con mayor comorbilidad, esta combinación de factores pueden
acarrear complicaciones que llevan a estas poblaciones a presentar tiempos de estancia
hospitalaria más prolongados, exponiéndose tanto a estados de inmunosupresión como a
mayor riesgo de susceptibilidad a microorganismos del ambiente nosocomial y en
consecuencia desarrollar coinfecciones bacterianas, en especial en estancias en unidades
de cuidados intensivos. (16)
La mayoría de los casos de COVID-19 se encuentran en estados leves-moderados de la
enfermedad, el principal porcentaje de presentación de coinfecciones bacterianas e IBS es
en pacientes con las formas severas de la COVID-19 incrementando el riesgo de
desenlace fatal; acorde a descrito en diferentes publicaciones. En muchos de estos casos
se tomó la decisión de utilizar métodos empíricos para el tratamiento de estas llevando al
uso excesivo de antibióticos y la posterior resistencia bacteriana tan perjudicial en todos
los aspectos. (7-11,16)2. Pregunta de Investigación
¿Cuál es la prevalencia de coinfección e infección bacteriana secundaria en
pacientes hospitalizados con la COVID-19?
P: Pacientes mayores de 18 años hospitalizados con la COVID-19
I: Coinfección o Infección secundaria asociada
C: Ausencia de coinfección o Infección secundaria asociada
O: Prevalencia de coinfección o Infección secundaria asociada, antibioticoterapia
utilizada, resistencia bacteriana, mortalidad.
T: Marzo 2020-Marzo 20213. Marco Teórico
3.1 CONTEXTO ACTUAL
En diciembre de 2019 en la ciudad de Wuhan, China se evidenció la presencia de un nuevo
coronavirus a partir de un brote respiratorio. Este virus fue denominado por el Comité
internacional de taxonomía viral como Coronavirus-2 generador de Síndrome Agudo
Respiratorio Severo (SARS-CoV-2) en la ciudad de Wuhan, donde rápidamente se elevó
la tasa de contagios, extendiéndose a todo el mundo, además de las complicaciones
múltiples y la mortalidad, lo que llevó a una emergencia internacional de salud pública en
las semanas siguientes hasta ser declarado pandemia el 11 de marzo del 2020 mundial
por la OMS con una categoría de muy alto riesgo (1).
La familia Coronaviridae era desconocida hasta las epidemias previas originadas por los
virus SARS-CoV y MERS-CoV en 2003 y 2012 con las cuales ha cobrado atención; su fácil
dispersión y la capacidad de causar neumonías atípicas severas en los enfermos,
provocando un gran porcentaje de mortalidad también los puso en la mira. Desde
diciembre 2019 aparece este nuevo tipo de virus perteneciente a esta familia denominado
SARS-CoV 2 causante de la Enfermedad COVID-19 que ha provocado las peores crisis
sanitarias y socioeconómicas de los últimos tiempos a nivel mundial (17).
La pandemia de la COVID-19 -Síndrome Respiratorio Agudo Severo coronavirus 2 (SARS-
CoV-2) cobró la vida de 2.316.702 personas de un total de 106.136.103 pacientes
confirmados con la infección (Letalidad de 2.18%) afectando a 192 países datos del 07 de
febrero de 2021, momento dónde inicio el estudio, en ese momento Colombia se
encontraba en el décimo primer lugar de morbilidad y décimo segundo lugar de mortalidad.
(14). Actualmente a fecha del 15 de enero de 2022 la Pandemia se ha extendido a 204
países, cobrando la vida de 5.531.843 personas de un total de 324.196.758 pacientes
confirmados con la infección, (Letalidad de 1.7%). La enfermedad al inicio de la pandemia10 Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados.2021.
fue mayor en países como Estado Unidos, India, Brasil y Reino Unido con 27.004.715,
10.826.363, 9.524.640 y 3.957.177 número de casos respectivamente, actualmente
continúan predominando los mismos países con mayor número de casos en total (Estados
Unidos 65236475, India 36582129, Brasil 22815827, Reino Unido 14967817 y Francia
13240304) (12). Por otra parte, los países que desde el inicio de la pandemia presentan
mayor número de fallecidos por la enfermedad son Estado Unidos, Brasil, México, India y
Reino Unido con 463.437, 231.534, 166.200, 154.996 y 112.681 muertes respectivamente
según el Centro de recursos sobre el coronavirus de Johns Hopkins University (JHU),
tendencia que a enero 2022 continua similar (Estados Unidos 869212, Brasil 620609, India,
485350, Rusia 319911 y México 300912 muertes). (14)
Según el Instituto Nacional de Salud de Colombia (INS), al inicio del estudio se habían
confirmado 2.157.216 casos, con 55.993 fallecidos, con una letalidad de 3,1%, mayor que
la letalidad mundial; a la terminación del estudio hay 5.511.479 casos confirmados y
130.860 fallecidos, con una tasa de letalidad de 2.37%, permaneciendo mayor que la
letalidad mundial. (15) Actualmente la mayor frecuencia de fallecimientos se encuentra
entre los 60 a 80 años, en el sexo masculino con el 60,8% y entre las principales
comorbilidades asociadas a los fallecidos en orden de mayor a menor están la Hipertensión
Arterial (HTA), Diabetes Mellitus (DM), Obesidad, Enfermedades respiratorias,
Enfermedad renal y Cardiaca continua igual inclinación que al inicio de la pandemia.
(11,17)
3.2 ESTRUCTURA DEL VIRUS
Los coronavirus pertenecen a la familia Coronaviridae en la subfamilia Coronavirinae, con
cuatro géneros: los Alfacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus y
Deltacoronavirus, de los anteriores géneros, los patógenos para el ser humano son los alfa
y betacoronavirus (17). Son virus ARN monocatenarios positivos que tienen forma esférica
y unas proteínas en forma de punta proyectadas desde su membrana que asemejan una
forma de corona solar de dónde viene su nombre. Son virus de ARN positivo de cadena
sencilla de 26–32 kilobases de tamaño, constituyendo uno de los genomas más grandes
conocidos para un virus de ARN (17). Su estructura se caracteriza por estar envuelto por
una bicapa lipídica derivada de la membrana de la célula huésped y está conformada porCapítulo 3 11
4 proteínas estructurales (proteína espiga (S), membrana (M), envoltura (E) y
nucleocápside (N)) y una hemaglutinina-esterasa (HE) (17). La proteína S en la superficie
es responsable de la entrada del virus a las células huésped por medio de sus 2
subunidades S1 y S2. La subunidad S1 actúa como puente entre el virus y los receptores
celulares y la subunidad S2 se encarga de la fusión entre la membrana viral y celular (18-
20). El RBD S1 ata fuertemente al ser humano al receptor ACE2 para fundirse en la
membrana de las células en especial las del epitelio respiratorio y digestivo. (19 -21) Es
por esto que la proteína S es indispensable para la neutralización mediada por anticuerpos,
además dar información a nivel atómico para orientar desarrollo de vacunas (21-25).
3.3 BASES TEORICAS: COINFECCION E INFECCION BACTERIANA
SECUNDARIA
Un metanálisis dónde se evaluaron 24 estudios de pacientes con COVID-19 confirmado
(17 de coinfección bacteriana y 7 de infección bacteriana secundaria) en países como
Estados Unidos, China, Tailandia, Singapur y España, se encontró coinfección en 3,5% e
infección secundaria en 14,3% de los pacientes con COVID-19. La infección bacteriana
notificada fue de 6,9% (IC del 95%) pero varió de 5,9% en los pacientes hospitalizados
hasta 8,1% en los pacientes en estado crítico en hospitalización en UCI. Más de 70% de
los pacientes recibieron antibióticos principalmente de amplio espectro, a pesar de una
tasa baja general de infecciones bacterianas (26).
En la revisión de Chao-Ping Wu y otros, describen que la leucocitosis neutrofílica es el
sello distintivo de la neumonía bacteriana asociada, mientras que los pacientes con
COVID-19 suelen presentar un recuento normal de glóbulos blancos con linfopenia. No
obstante, no son los únicos aspectos se debe apoyar para el diagnóstico en la evolución
cínica y estudios microbiológicos: fiebre nueva o recrudescente; nueva aparición o cambio
en el carácter del esputo; nueva leucocitosis o nueva neutrofilia (o ambas); nuevos
hallazgos de imagen relevantes; y requisitos de oxígeno nuevos o en aumento. Además
de los elementos de riesgo como catéteres venosos centrales permanentes o catéteres del
tracto urinario (27).
Es necesario comprender mejor la prevalencia de la coinfección y la infección secundaria
en general, pero adquiere mayor importancia en la COVID-19 dada la alta morbilidad y
mortalidad de esta enfermedad. Se cree que la coinfección y o Infección bacteriana12 Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados.2021.
secundaria tienen un efecto negativo en la salud, ya que muchos agentes patógenos
coinfectantes o superinfectantes pueden interactuar directamente entre sí o indirectamente
a través de los recursos del huésped o del sistema inmunológico (28). Las interacciones
dentro de huéspedes coinfectados pueden alterar la transmisión, la progresión clínica y el
control de múltiples enfermedades infecciosas (29-30).
La coinfección se define como la existencia de infección bacteriana confirmada por
laboratorio, mediante cultivo de secreción orotraqueal, lavado broncoalveolar o
hemocultivos, el uso de paneles moleculares para virus y bacterias y/o métodos de
detección de antígenos, la cual se presenta dentro de las primeras 48 horas del diagnóstico
de la infección por SARS-COV-2/COVID-19.(31-32) Infección secundaria, superinfección
o sobreinfección se define como la aparición de infección bacteriana luego de 48 horas del
ingreso, en presencia de al menos un cultivo positivo de muestra respiratoria (aspirado
endotraqueal, lavado broncoalveolar), muestras de sangre, orina o resultado de pruebas
moleculares como PCR multiplex y en un contexto clínico compatible con infección.(8)
3.4 ANTECEDENTES DE INVESTIGACIÓN
Se está volviendo evidente a nivel mundial que las infecciones bacterianas asociadas y/o
secundarias ocurren en muchos pacientes con COVID-19 y pueden estar asociadas con
mayor complicación o resultados fatales de la enfermedad.
Zhou y col, describieron 191 pacientes con COVID-19, el 15% presentó coinfecciones
bacterianas, incluido el 50% de los no sobrevivientes, resaltando que 27/28 pacientes con
COVID-19 con coinfecciones fallecieron. Además, encontraron que al 95% de los
pacientes se les administró antibióticos. (33) Otro estudio similar al inicio de la pandemia
es el Zhu, X. et al, donde se utilizó PCR en tiempo real para detectar 39 patógenos
diferentes causantes de coinfecciones en COVID-19. Encontraron que 243 (94,2%)
pacientes estaban coinfectados con al menos 1 de los patógenos. Las coinfecciones
bacterianas fueron predominantes (91,8%) sobre las infecciones virales (31,5%) y fúngicas
(23,3%) (32).
Según el metanálisis de Lansbury et al, dónde incluyeron 30 estudios que incluyeron total
de 3834 pacientes, encontró que el 7% (IC 95%) de los pacientes hospitalizados conCapítulo 3 13
COVID-19 tenían una coinfección bacteriana, además una mayor proporción de pacientes
de UCI tenían coinfecciones bacterianas que los pacientes en entornos mixtos sala
genera/UCI (14%, IC del 95%: 5-26, I 2 = 74,7% versus 4%, IC del 95%: 1 -9, I 2 = 91,7%).
Los patógenos bacterianos más frecuentes fueron Mycoplasma, Pseudomonas aeruginosa
y Haemophilus influenzae. La proporción combinada con una coinfección viral fue del 3%
(IC del 95%: 1-6, n = 1014, I 2 = 62 · 3%), siendo el virus sincitial respiratorio y la influenza
A los más comunes. Las coinfecciones fúngicas fueron mínimas. (34)
En el estudio de cohorte de Song et al, con una población de 89 pacientes se presentó
coinfección en 18 pacientes. Se detectó en 6 pacientes coinfección con Kp (Klebsiella
pneumoniae), en 5 pacientes coinfección con CE (E. coli), en 4 pacientes coinfección con
Mcat (Moraxella catarrhalis), también en 4 pacientes coinfección con Hi (Haemophilus
influenzae), en 2 pacientes co- infección con Ab (Acinetobacter baumannii), en 2 pacientes
coinfección con Sa (Staphylococcus aureus), en 1 paciente coinfección con PA
(Pseudomonas aeruginosa), y en 1 paciente coinfección con GAS (estreptococo del grupo
A). Además 6 pacientes contrajeron coinfección con más de dos bacterias (28).
De Francesco et al, encontró en un estudio retrospectivo, que de 443 individuos infectados
con SARS-CoV-2, 242 individuos tuvieron una positividad para patógenos atípicos
(anticuerpos positivos contra Mycoplasma y / o Chlamydia, p <0,0001). Las proporciones
de pacientes críticos con COVID-19 con coinfección por patógenos atípicos fueron más
altas que las de pacientes infectados solo con SARS-CoV-2 (13,2% vs 5,9%, p = 0,01),
sumado también que fueron más propensos a desarrollar complicaciones y tuvieron una
tasa de mortalidad ligeramente más alta en comparación con el grupo de únicamente
infección SARS-CoV-2. Más de las tres cuartas partes de los pacientes recibieron
tratamiento con antibióticos y más de la mitad de los pacientes (266, 60%) recibieron
tratamiento antiviral (35).
En el estudio multicéntrico de Feng y col, las infecciones bacterianas secundarias se
asociaron significativamente con la gravedad del resultado. Este estudio incluyó a 476
pacientes con COVID-19 divididos en 3 grupos (moderada, grave y críticamente enfermos).
Los pacientes críticamente enfermos tenían el mayor porcentaje de coinfección bacteriana
(34,5%) en comparación con los pacientes de los grupos moderada y gravemente
enfermos (3,9% y 8,3%, respectivamente) (36).14 Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados.2021.
En la investigación retrospectiva de Damien Contou y colaboradores, se evaluaron 92
pacientes que entraron a UCI por SARS-CoV2, entre ellos el 28% fueron considerados
coinfectados con una bacteria; entre las bacterias identificadas se encontraron
Staphylococcus aureus sensible a meticilina ( n = 10/32, 31%), Haemophilus influenzae (
n = 7/32, 22%), Streptococcus pneumoniae ( n = 6/32, 19%), Enterobacteriaceae ( n =
5/32, 16%), Pseudomonas aeruginosa ( n = 2/32, 6%), Moraxella catarrhalis ( n = 1/32,
3%) y Acinetobacter baumannii ( n = 1/32, 3%). Entre las 24 bacterias patógenas aisladas
del cultivo, 2 (8%) y 5 (21%) fueron resistentes a la cefalosporina de tercera generación ya
la combinación amoxicilina-clavulanato, respectivamente. (37)
En Barcelona el estudio de la García y colaboradores, encontró que de 989 pacientes, 51
se diagnosticaron con superinfecciones bacterianas adquiridas en el hospital, en su
mayoría causadas por Pseudomonas aeruginosa y Escherichia coli, en 43 pacientes
(4,7%), con un tiempo medio (DE) desde el ingreso hospitalario hasta el diagnóstico de
superinfección de 10,6 (6,6) días. Los pacientes con coinfecciones adquiridas en la
comunidad y sobreinfecciones adquiridas en el hospital tuvieron peores resultados. (38)
3.5 RESISTENCIA
Para el inicio de la pandemia no se había desarrollado ningún tratamiento antiviral por lo
que la estrategia del desarrollo de vacunas fue una carrera contrarreloj para lograr
disminuir las tasas de infección con el objetivo de mejorar la efectividad en la prevención
de COVID-19 en la población general. (39,40). Esta ausencia de tratamiento podría haber
sido otro factor asociado que llevó a los médicos a recetar antimicrobianos de amplio
espectro con más frecuencia, por consiguiente, deben reforzarse con prioridad los
enfoques de administración de antimicrobianos durante la pandemia de COVID-19 y en
especial en los pacientes críticamente enfermos.(41) Aunque al inicio de la pandemia la
evidencia en impacto del consumo excesivo o sin indicación clara de antibióticos era
limitada, (42) a inicios del 2022, ya hay estudios investigativos que plantean este impacto.
(41,43).
Según miembros de la Unidad de Resistencia a los Antibióticos y Patógenos de Roma (31),
la incidencia de coinfecciones bacterianas en casos de COVID-19 es menor que en
pandemias de influenza anteriores. Sin embargo, las tasas de coinfección aumentan en los
pacientes ingresados en UCI, Mycoplasma pneumoniae, Staphylococcus aureus,Capítulo 3 15
Legionella pneumophila, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus y Klebsiella spp. son
las principales especies aisladas, aunque también se notifican coinfecciones por
Mycobacterium tuberculosis -COVID-19. Las superinfecciones por bacterias resistentes a
los antibióticos ocurren en el 1,3% de los pacientes en la UCI por lo que se debe controlar
la prescripción frecuente de antibióticos de amplio espectro, los principios de
administración de antimicrobianos deben reconsiderarse para evitar el desarrollo y la
transmisión de organismos resistentes a los medicamentos (7, 31).4. Métodos
4.1 Objetivos
4.1.1 Objetivo General:
Determinar la prevalencia de coinfección y/o infección secundaria en pacientes con la
COVID-19/SARS CoV2 hospitalizados en el periodo de marzo del 2020 a marzo del 2021.
.
4.1.2 Objetivos Específicos:
 Describir las características sociodemográficas de los pacientes diagnosticados
con la COVID-19 en hospitalización.
 Establecer la presencia de coinfección o infección secundaria en pacientes
hospitalizados con COVID-19 a través de cultivo de secreción orotraqueal, lavado
broncoalveolar o hemocultivos, paneles moleculares y/o métodos de detección de
antígenos.
 Identificar la prevalencia de coinfección o infección secundaria del paciente COVID-
19 al ingreso y/o durante el tiempo de hospitalización.
 Describir los antibióticos de uso frecuente y su perfil de resistencia en los pacientes
hospitalizados con la COVID-19.
 Determinar los tiempos de evolución de la COVID-19 entre los pacientes que
presentan coinfección y los que presentan infección secundaria durante la estancia
hospitalaria.18 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
4.2 Definición de Sujetos de Estudio
 Coinfección: Se define coinfección a la infección adquirida en la comunidad
diagnosticada en las primeras 48 horas del ingreso hospitalario por COVID-
19 y antes de siete días desde el inicio de los síntomas de COVID-19.
 Infección bacteriana secundaria: Se define como la infección adquirida a
partir de las 48 horas del ingreso hospitalario y más de siete días desde el
inicio de los síntomas de COVID-19.
4.2.1 Diseño del estudio
 Estudio de corte transversal descriptivo retrospectivo.
4.2.2 Población
 Población Objeto: Pacientes con la COVID-19 en Bogotá D.C
 Población a Estudio: Pacientes con la COVID-19 hospitalizados en Hospital
Universitario Nacional de Colombia
 Población disponible: Pacientes que cumplan los criterios de inclusión
4.2.3 Sitio de Investigación
Hospital Universitario Nacional de Colombia
4.3 Criterios de Inclusión
 Pacientes mayores de 18 años
 Pacientes hospitalizados en el centro médico de estudio
 Pacientes hospitalizados con la COVID-19 Confirmado por Antígeno, PCR
 Pacientes hospitalizados con infección por COVID-19 demostrada por criterios
último consenso COVID-19 Asociación Colombiana Infectología: Sospecha Clínica
alta (Contacto con paciente con diagnóstico de SARS CoV-2/COVID-19, Viaje o
residencia en áreas con presencia de caso terciario): Cuadro Clínico Compatible
(con al menos dos síntomas fiebre mayor 38ºC, tos, dificultad respiratoria,
onicofagia, fatiga) + anormalidades en tomografía o Radiografía de tóraxcompatibles con COVID-19 ( Parches de vidrio esmerilado periférico, bilateral y
bibasal) (8).
4.4 Criterios de Exclusión
 Pacientes con datos clínicos insuficientes o incompletos
 Pacientes con pérdida en el Seguimiento (remisión a otras instituciones)
 Pacientes con previa infección o infección bacteriana secundaria antes del
diagnóstico de la COVID -19.
 Pacientes hospitalizados con la COVID-19 y con preexistencia de inmunosupresión
asociada.
4.5 Variables del Estudio
 Se definieron las siguientes variables en el estudio: Sociodemográficas como edad
y sexo, fecha de ingreso y egreso al hospital y variables clínicas como
comorbilidades, desenlace, coinfección, IBS, microorganismo aislado,
susceptibilidad antimicrobiana, antibiótico, ubicación, número de eventos
infecciosos, dispositivo asociado.
4.6 Tamaño de la Muestra
Tipo de Muestreo: Muestreo por conveniencia
La población blanco son los todos pacientes hospitalizados con COVID-19 en
hospitalización general y/o UCI del Hospital Universitario Nacional de Colombia,
demostrada por criterios último consenso COVID-19 Asociación Colombiana Infectología.
En el periodo del estudio (marzo 2020- marzo 2021) en el Hospital Universitario Nacional
de Colombia (HUN) se recibieron en total 3793 casos presuntivos IRA Grave por COVID-
19(SARS CoV-2) de los cuales 1206 (32%) se confirmaron positivos, 1189 (31%) fueron
negativos y 1398 (36%) no tenían datos completos por lo que fueron excluidos; de los
anteriores cumplieron criterios de inclusión 952 pacientes20 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
Se calculó una muestra probabilística a través de frecuencias con un resultado de 161
casos para representatividad del estudio para evaluar las características demográficas,
microorganismos, marcadores de mal pronóstico, uso de antibióticos y los resultados
clínicos; teniendo en cuenta que, de acuerdo a la literatura, que muestra que la frecuencia
de coinfección es de 4% y la infección secundaria es de hasta 15%, con estos datos se
puede terminar la varianza en una población determinada. Cálculo realizado por fórmula
simplificada Dr. Jorge Hernando Donado Gómez MD. Ms. 2012. (Ver Ecuación 1)
(1)
Se aleatorizó la muestra mediante la distribución tipo Bernoulli generando un numero
aleatorio por medio de software Excel y estableciendo un umbral de probabilidad de
pertenencia a la muestra.
Los datos se obtuvieron revisando las historias clínicas de los pacientes hospitalizados
durante marzo 2020 a marzo 2021 para obtener los datos de las variables a estudiar.
La recolección de los datos se realizó en una hoja digital de Excel a partir de las historias
clínicas de los pacientes.
4.7 Análisis Estadístico
 Tipo Análisis univariado-descriptivo: Se realizó un análisis descriptivo de las
variables cuantitativas y cualitativas. En las variables cuantitativas se realizó
estadística descriptiva de acuerdo con la distribución de las variables analizadas. Las
variables categóricas se reportan como números absolutos y porcentajes. Así mismo,
se calculó tiempos de estancia hospitalaria, tiempo de diagnósticos de COVID- 19 y
asilamiento para clasificación de Coinfección/IBS.4.8 Consideraciones Éticas
Durante el desarrollo de este estudio no se realizó ninguna intervención en las variables
demográficas y fisiológicas de los participantes, por lo cual este trabajo de investigación
se considera de riesgo mínimo según la resolución No 8430 de 1993 de la legislación
colombiana y del Comité de Ética al cual será sometido a revisión.
La manipulación y revisión de la información de los participantes se realizó
exclusivamente por los investigadores del estudio y se mantendrá absoluta
confidencialidad respecto a la identidad y estado de salud. Este protocolo sé sometió
y aprobó por el Comité de ética de la Universidad Nacional de Colombia.22 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
5. Resultados Descriptivos
5.1 Características de la población
Para el periodo de la investigación el mayor porcentaje de pacientes que habían sido
atendidos con sospecha de SARS-COV2 COVID-19 en el Hospital Universitario Nacional
de Colombia fueron los ambulatorios 1520 (40,59%), en hospitalización general
1407(37.58%) mientras que en Unidad de Cuidado Intensivo se atendieron 817 (21,82%)
pacientes teniendo en cuenta que es un centro de remisión a nivel Nacional para atención
de pacientes críticos con COVID-19. Para este momento se contaba con una
infraestructura de 168 Camas Hospitalización General y 47 Camas de Hospitalización en
Cuidado Intensivo e Intermedio.
En el periodo del estudio (marzo 2020- marzo 2021) en el Hospital Universitario Nacional
de Colombia (HUN) se recibieron en total 3793 casos presuntivos IRA Grave por COVID-
19(SARS CoV-2) de los cuales 1206 (32%) se confirmaron positivos, 1189 (31%) fueron
negativos y 1398 (36%) no tenían datos completos por lo que fueron excluidos; de los
anteriores cumplieron criterios de inclusión 952 pacientes ver Figura 1. Se encontró una
proporción mucho más alta de hombres 68.1% como se observa en la Tabla 1. La mediana
de edad de la población fue de 59.33 (DE 13.1) con una edad mínima de 19 años y máxima
de 90 años.
Pacientes sospechosos
Figura 1. Muestreo de pacientes COVID-19:
n:3793
Descartados COVID-19:
n:1189
Descartados ausencia de
datos:
n:1398
Confirmados COVID-19:
n:1209
Descartados por infecciones
previas:
n:218
Descartados ausencia de
datos:
n:35
Confirmados COVID-19 para
Análisis:
n:952Tabla 1. Descripción de la población
N %
Hombre 649 68.17
Mujer 303 31.82
Edad Promedio 59.33 (DE 13.1)
Edad Hombres Promedio 58.7 (DE 13.33)
Edad Mujeres Promedio 60.6 (DE 12.70)
Mortalidad General 258 26.6
Mortalidad Hombre 163 17.1
Mortalidad Mujer 94 9.8
Mortalidad UCI 239 30
Mortalidad
18 10
Hospitalización General
Fuente Propia
Características de la población estudiada
Se documentaron 389 casos de infección bacteriana secundaria (IBS) confirmadas, en la
UCI 318 (40.77%) mientras que en Hospitalización General 71(41.52%) como se puede
ver en la Tabla 2.
Tabla 2. Distribución de IBS según servicio de hospitalización.
Servicio donde adquirió IBS Reporte Final IBS
Confirmado % Descartado % Total %
Hospitalización General 71 41.52 100 58.4 171 100
UCI 318 40.77 463 59.2 781 100
Total 389 40.9 563 59.1 952 100
Fuente Propia
Interpretación Pearson chi2(1) = 0.0327 Pr = 0.856
En cuanto a la distribución de IBS entre géneros se presenta en la Tabla. 3.
Tabla 3. Infecciones nosocomiales por género.
Reporte Final IBS
Género Confirmado % Descartado % Total
Mujer 124 40.92 179 59.08 303 100
Hombre 265 40.9 384 59.1 649 100
Total 389 40.9 563 59.1 952 100
Fuente Propia
Pearson chi2(1) = 0.0001 Pr = 0.993.24 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
El Tiempo de estancia hospitalaria si la IBS era confirmada tuvo una mediana 19.9 días
(DE 11.89) con una estancia mínima de 0 y máxima de 79 días; mientras que para las
infecciones descartadas fue de 20.6 días (DE 12.8) con una estancia mínima de 0 días y
máxima de 67 días sin diferencias estadísticamente significativas.
Como se puede ver en la Figura 2. después del día 5 de estancia hospitalaria hay un
incremento gradual de los casos confirmados para IBS teniendo un pico máximo al día 14
que finalmente va disminuyendo después del día 20 de estancia hospitalaria.
25
20
15
10
5
0
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90
Confirmada Descartada
Fuente Propia.
Relación de estancia hospitalaria y aparición de infecciones.
Figura 2. Grafica de distribución de eventos
5.2 Perfil Microbiológico
5.2.1 Aislamiento Microbiológico
En hospitalización general las IBS que se presentaron con mayor frecuencia fueron
infección urinaria asociada a catéter 54 (35%), neumonía 44(28.5%) e infección de torrente
sanguíneo asociada a catéter central 31 (22.08%) como se presenta en las Tablas 4.Tabla 4. Tipo de IBS en Hospitalización general
IBS n %
ISTU-AC 54 35.07
NEU1 44 28.57
ITS-AC 33 22.08
ISQ-ISQ 19 12.99
IPTB 2 1.3
Total 154 100
ITSU-AC: Infección sintomática de tracto urinario asociada a catéter, ITS-AC: Infección de torrente sanguíneo asociada a
catéter central, NEU1: Neumonía definida clínicamente, ISQ-ISQ: Infección del sitio de incisión quirúrgica; NAV1: Neumonía
asociada a ventilación IPTB: Infección piel y tejidos blandos.
En unidad de cuidado intensivo las infecciones que se presentaron con mayor frecuencia
fueron Neumonía asociada a ventilación mecánica 326(43.75%) e infección de torrente
sanguíneo asociada a catéter central 224(29.17 %) teniendo en cuenta la necesidad de
ventilación mecánica por el compromiso respiratorios y dispositivos de acceso central para
monitorización continua y administración de medicamentos como se presenta en las
Tablas 5.
Tabla 5. Tipo de IBS en Unidad de Cuidado Intensivo
IBS n %
NAV1 326 43.75
ITS-AC 224 29.17
ISTU-AC 175 22.79
SINU 24 3.13
ISQ-ISQ 5 0.65
IPTB 2 0.52
Total 768
ITSU-AC: Infección sintomática de tracto urinario asociada a catéter, ITS-AC: Infección de torrente sanguíneo asociada a
catéter central, NEU1: Neumonía definida clínicamente, ISQ-ISQ: Infección del sitio de incisión quirúrgica NAV1: Neumonía
asociada a ventilación IPTB: Infección piel y tejidos blandos, SINU: Sinusitis.
Al describir los hallazgos según las especies de microorganismos que principalmente se
aislaron en los cultivos de las muestras estudiadas que fueron tratados como agentes
infecciosos por la presentación clínica encontramos enterobacterias en primer lugar
K.pneumoniae (n:193), E.coli (n:105); en segundo lugar los Bacilos gramnegativos No
fermentadores P.aeruginosa (n:80); en tercer lugar S.aureus (n: 58).26 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
El aislamiento más prevalente en hospitalización general fue de K.Pneumoniae 26(23.4%)
seguido de E.coli 23(20.7) y P.aeruginosa 16(14.41%); en la UCI el aislamiento más
frecuente fue K.Pneumoniae 167(23%) ver Figura 3,4.
Fuente Propia
Composición microbiana de pacientes en hospitalización general.
Figura 3. Microorganismos aislados en Hospitalización GeneralFuente Propia.
Composición microbiana de pacientes en Unidad de Cuidados Intensivos.
Figura 4. Microorganismos aislados en Unidad de Cuidado Intensivo
Figura 5. Aislamiento de Cándida en UCI28 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
5.2.2 Dispositivo asociado a infección
El 85% de los pacientes tuvieron aislamiento en los dispositivos, en su mayoría 46.5%
correspondía a la ventilación mecánica, mientras que el 26.44% fueron por sonda vesical
y el 23% por catéter venoso central (CVC). Ver Tabla 6.
Tabla 6. Dispositivo asociado a IBS
Dispositivo n %
Ventilación Mecánica 378 46.5
Sonda Vesical 215 26.44
CVC 188 23.1
Herida Quirúrgica 19 2.3
Catéter periférico 13 1.5
Total 813
Fuente propia.
IBS: Infección Bacteriana Secundaria CVC: Catéter Venoso Central
De los 952 pacientes confirmados como positivos para COVID-19 en hospitalización
general y/o UCI, se tomó un muestreo probabilístico con representatividad de 161
pacientes que se aleatorizado mediante el método tipo Bernoulli para evaluar las
características demográficas, microorganismos, marcadores de mal pronóstico, uso de
antibióticos y los resultados clínicos de los pacientes infectados. Las características
clínicas principales, comorbilidades, datos biológicos al ingreso al Hospital Universitario
Nacional de Colombia; los resultados se detallan en la Tabla 7.Tabla 7. Principales características, comorbilidades, datos biológicos.
Total %
n 161
Hipertensión 64 (39.8)
Sobrepeso 52 (32.3)
Diabetes Mellitus 46 (28.6)
Hipotiroidismo 22 (13.7)
Cardiopatía Isquémica 14 (8.7)
EPOC 10 (6.2)
Enfermedad Renal Crónica 9 (5.6)
Infección Bacteriana Secundaria 143 (88.8)
Sin Coinfección / IBS 17 (10.55)
Coinfección Bacteriana 1 (0.62)
Mortalidad General 73 (45.3)
Fuente propia.
EPOC: Enfermedad pulmonar obstructiva crónica, UCI: Unidad de Cuidado Intensivo IBS: Infección Bacteriana Secundaria
Mortalidad General a 50 días.
5.3 Uso de Antibióticos
Los 161 pacientes recibieron tratamiento empírico, 106 (65.8%) recibieron un único
antibiótico como ve en la Tabla 8; con predilección durante la hospitalización a la
administración de Cefepime 49 (32.1%) como se observa en la Figura 6.
Tabla 8. Total, de antibióticos utilizados por paciente.
Numero de Antibióticos n %
1 106 65.8
2 30 18.6
3 10 6.2
0 8 5.0
4 4 2.5
5 3 1.9
Fuente propia.
Número total de antibióticos usados por cada paciente.30 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
Fuente propia
Figura 5. Caracterización de Antibióticos usados.
5.4 Resistencia
De las bacterias Gram negativas aisladas en los cultivos 23 (21.3%) presentaban
producción de betalactamasas tipo AMP-C y 14 (13%) producción de enzimas tipo
carbapenemasas; de los Staphylococcus aureus 11 (6.8%), 8 (4.9%) eran sensibles a
oxacilina mientras que 3 (1.85%) presentaban resistencia a meticilina ver Tabla 9; ver
Teniendo en cuenta la clasificación de la OMS para resistencia bacteriana un hallazgo
relevante de los aislamientos obtenidos fue que 68 (42.2%) eran multiresistentes. Ver
Tabla 9.
Tabla 9. Tipo de Resistencia
Resistencia n %
Multiresistente 68 42.2
Sin resistencia 52 32.3
Única 23 14.3
Sin aislamiento 18 11.2
Fuente propia.Se documentaron patrones de resistencia para las bacterias de mayor representatividad
epidemiológica: K.pneumoniae productora de carbapenemasas 5(12%), E.coli productora
de enzimas tipo BLEE 6(30%), P.aeuriginosa productora de carbapenemasas 4(33%),
S.aureus SAMR 3(1.85%) descritos en la Tabla 10.
Tabla 10. Patrón resistencia K. pneumoniae, E. coli, P. aeruginosa, S. aureus
Microorganismo Patrón Resistencia
n %
Natural 27 65.8
KPC 5 12.1
K.pneumoniae
AMP-C 4 9.7
n:41
BLEA 3 7.3
BLEE 2 4.8
BLEE 6 30
Natural 5 25
E. coli
AMP-C 5 25
n:20
KPC 2 10
BLEA 2 10
Natural 6 50
P.aeruginosa
n:12 KPC 4 33
AMP-C 2 17
S. aureus SAMS 8 4.9
n:11 SAMR 3 1.85
Fuente propia.
Descripción de resistencia para cada Microorganismo de importancia epidemiológica.
5.5 Complicaciones
En cuanto mortalidad general fue del 26.7% ver Tabla 11; según el servicio de
hospitalización donde se localizaba el paciente en la UCI se presentó en 239 (30.3%)
mientras que hospitalización general 18(10%), la discriminación si se Descartaba o se
Confirmaba la infección IBS se muestra en la Tabla 12.32 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
Tabla 11. Mortalidad General
Mortalidad General Vivo % Muerte % Total
UCI 542 69.6 239 30.6 781
Hospitalización General 153 90 18 10.5 171
Total 695 73.2 257 26.7 952
Fuente propia.
Mortalidad según sitio de hospitalización
Tabla 12. Mortalidad en Infección IBS.
Mortalidad Vivo % Muerte % Total
Descartada 405 72.2 158 27.7 563
Confirmada 290 74.7 99 25.26 389
Total 695 73.2 257 26.7 952
Fuente Propia.
Pearson chi2(1) = 0.7139 Pr = 0.398
Encontramos también que la mortalidad en UCI con IBS fue del 28% mientras que la
mortalidad en hospitalización general fue de 12.8% como se ve en la Tabla 13,14.
Tabla 13. Mortalidad en UCI
Mortalidad UCI Vivo % Muerte % Total
Descartada 313 67.9 150 32 463
Confirmada 229 72 89 27.99 318
Total 542 69.6 239 30.3 781
Fuente Propia.
Descripción de mortalidad en UCI
Tabla 14. Mortalidad en Hospitalización.
Mortalidad Hospitalización Vivo % Muerte % Total
Descartada 92 92 8 8 100
Confirmada 61 87.1 10 12.8 71
Total 153 90 18 10 171
Fuente Propia.
Descripción de mortalidad en hospitalización general6. Discusión y Conclusión
6.1 Discusión
Mostramos una cohorte de pacientes con COVID-19 centrándonos en describir las
coinfecciones y las infecciones bacterianas secundarias adquiridas en el
hospital. Teniendo en cuenta lo anterior la presencia de infecciones bacterianas asociadas
a la neumonía por SARS-CoV2, constituyen un factor de riesgo para desenlaces fatales de
la enfermedad desencadenando peores resultados en la atención, como más tiempo de
estancia hospitalaria, presencia de resistencia antimicrobiana, complicaciones mayores
entre otras (6).
Dentro de las características demográficas de nuestra población se encontró mayor
prevalencia de hombres 68%. Similar con la epidemiologia nacional y mundial (14,15), el
promedio de edad global fue edad 59.3 años asociada a múltiples comorbilidades entre las
que se destacan la presentación de hipertensión y sobrepeso hallazgo que es igual al
encontrado en otros estudios como el metanálisis de Peckham y colaboradores, donde se
encontró de 3.111.714 casos, la mayoría de los pacientes eran hombres y además
presentaban casi tres veces la probabilidad de requerir una unidad de cuidado intensivo
(OR=2,84; IC95%=2,06-3,92) y mayor probabilidad de morir (OR=1,39; IC95%=1,31-1,47)
en comparación con las mujeres (38, 44).
En un meta-análisis dónde se evaluaron 24 estudios de pacientes con COVID-19
confirmado en países como Estados Unidos, China, Tailandia, Singapur y España, se
encontró coinfección en 3,5% (26), en nuestro estudio no se pudo encontrar prevalencia
de coinfección bacteriana en la población del Hospital Universitario Nacional ya que la
población es de pacientes referenciados de otras instituciones así como uso previo de
antibioticoterapia por lo que no su pudo confirmar la misma; los hallazgos en lo que
respecta a IBS tienen alta prevalencia fue 40.8% de los pacientes con COVID-19 y se
presentó de manera igual en pacientes críticamente enfermos que en los no enfermos,
pudiéndose deber a la preocupación del personal de salud por identificar el proceso
infeccioso asociado, obteniendo un sobre registro de las mismas (26); probablemente
estos resultados se obtuvieron debido a que el centro hospitalario donde se realizó este
estudio es de cuarto nivel de atención y centro de referencia nacional para pacientes por
SARS.COV.2, resaltando que dentro de los pacientes del total de la base de datos34 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
recolectada ninguno es de atención inicial de urgencias del hospital donde se realizó el
estudio.
En el primer y segundo pico de la pandemia la mortalidad en Unidades de Cuidados
intensivos se aumentó, como describe Ferrando, C, y colaboradores (2020), con un estudio
multicéntrico donde se estudiaron 663 pacientes encontrando una mortalidad global en
UCI del 31% (203 pacientes) (45), Zhou y col (2020) encontraron que de 191 pacientes
con COVID-19, 28 presentó coinfecciones bacterianas de los cuales 27 (95%)
fallecieron.(33) El presente estudio también ocupó el tiempo de primer y segundo pico de
la pandemia en el país, mostrando una mortalidad general de 26.7% la cual consideramos
tiene relación con el alto porcentaje de pacientes de la muestra se encontraban en la UCI.
Del total de los pacientes que se encontraron en UCI fallecieron el 30%. En la literatura la
asociación de IBS y hospitalización en UCI indica una mayor probabilidad de mortalidad,
se documentó que en pacientes con ingresos a la UCI con infección por COVID-19 la
mortalidad combinada podría presentarse de 10- 68% y podría ascender hasta el 53,2 %
de los pacientes que requirieron atención en la UCI y no pudieron recibirla debido a
limitaciones de recursos. (46,47). En nuestro estudio encontramos infección bacteriana
secundaria en el 41.52% en los pacientes admitidos a la UCI y aunque la gravedad de la
enfermedad se correlaciona negativamente, también lo hace la IBS, sin embargo un
hallazgo relevante en nuestra investigación fue que la mortalidad no fue afectada por la
IBS; por lo que se necesitan estudios más amplios para evaluar todos los factores que en
ella influyen, en este caso la prevalencia de coinfección e infección bacteriana secundaria
junto con su impacto y riesgo en mortalidad. (48).
Es de anotar que en nuestra población de estudio se documentaron 43.75 % de neumonías
asociadas a la ventilación mecánica (NAV), así como también se evidenciaron 29.17% de
bacteriemias asociadas a dispositivo, un dato que supone una estrecha relación de
dispositivos invasivos con la presentación eventos infecciosos y mortalidad, estos
hallazgos coinciden con otros estudios donde se evaluó sobreinfección del tracto
respiratorio, la infección del torrente sanguíneo y choque séptico. (45, 48, 49). Por otro
lado se ha demostrado la posición prona (PP) mejora la supervivencia del paciente en
pacientes con síndrome de dificultad respiratoria aguda (SDRA) (56-58); sin embargo se
ha establecido como factor de riesgo el SDRA para NAV (59 ), relacionada a la inflamación
pulmonar que puede conducir a una alteraciones inmunológicas afectando la respuestahumoral y celular (60 ). Se ha relacionado la posición prona con el aumento del riesgo de
microaspiraciones, aunque los efectos puntuales de la pronación en comparación con la
gravedad de la inflamación pulmonar subyacente sigue siendo un hallazgo que se
encuentra en estudio ( 61). Otro factor de riesgo reconocido para NAV es la terapia
antimicrobiana de amplio espectro previa determinada en múltiples estudios y encontrada
en nuestra investigación (62).
La incidencia de infecciones bacterianas asociadas a la COVID-19 varía entre las
diferentes regiones geográficas (4,5). Dentro de los microorganismos más frecuentemente
identificados en infecciones hospitalarias se encuentran Staphylococcus
aureus, Enterococcus spp, los bacilos no fermentadores y las enterobacterioides, (7)
también una alta prevalencia de asociación con virus de la influenza A (60,00%) y el virus
de la influenza B (53,33%), seguidos de Mycoplasma pneumoniae (23,33%) y Legionella
pneumophila. (5,38). Las especies detectadas con mayor frecuencia
fueron Enterobacterales, Klebsiella pneumoniae (46%), seguido de Escherichia coli (31%),
Gram negativos no fermentadores Pseudomonas aeruginosa (22%) y Gram positivos
Staphylococcus aureus (15%), tampoco se detectó ningún virus, especialmente ningún
virus de influenza entre los pacientes a los que se les realizo paneles que detectan virus
de la influenza.
La identificación de K. pneumoniae es importante en los aislamientos bacterianos
intrahospitalarios, debido a la alta resistencia que presenta a carbapenémicos; esto
teniendo en cuenta los informes de K. pneumoniae documentados en pacientes de
cuidados intensivos como Saavedra, C, y colaboradores (2018), en Bogotá, Colombia, (50)
; Giovanetti y colaboradores (2017) Cesar, Colombia, (51) donde registraron resistencia
para K. pneumoniae y E. coli aislados en UCI con una prevalencia del 28.3% y del 21.8%
respectivamente, y para servicios diferentes a UCI presentaron una resistencia del
43.1% para K. pneumoniae y del 17% para E. coli . Otro estudio en el 2015 por Gómez JF
y Sánchez JA, en una UCI de la ciudad de Pereira, Colombia, se evidenció la
presencia de bacterias BLEE, con el 32% para E. coli y el 16% para K. pneumoniae,
observándose que, aunque estas prevalencias son diferentes no están alejadas a
nuestros hallazgos (52).36 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigación
Antes de la pandemia por COVID-19 la resistencia a los antimicrobianos era la crisis de
salud ya instaurada en él planeta. Donde las instituciones de salud a nivel mundial
lideradas por la OMS han hecho de la resistencia a los antimicrobianos una prioridad, pero
la aparición y el desarrollo de la pandemia ha puesto en sobre avisó de la nueva probable
pandemia que se adviene como una amenaza creciente para la humanidad, teniendo en
cuenta que las infecciones virales de por sí traen una carga de enfermedad importante,
sino que también abren el camino para infecciones bacterianas secundarias que pueden
ser potencialmente mortales (42). Así la experiencia adquirida sobre infecciones
bacterianas durante la pandemia de Influenza H1N1 en 2009, dónde se presentaron en
alto porcentaje en los casos graves, (9) llevo a considerar al inicio de esta pandemia por
COVID-19 la administración de antibioterapia empírica en la gran mayoría de pacientes
aumentando considerablemente la probabilidad de resistencia microbiana. En nuestra
investigación se identificó que el 65.8% de los pacientes recibió al menos un antibiótico,
llama la atención que el 42.2% de los aislamientos presentaba multiresistencia y el patrón
de resistencia más común hallado para las bacterias Gram negativas fueron la
presentación de betalactamasas tipo AMPc con el 21.3% de los aislamientos. Durante la
pandemia de COVID-19, se informó una mayor utilización de antimicrobianos,
destacándose la necesidad de adherirse a los principios de administración razonable de
antibióticos para optimizar las estrategias de indicación, duración y descontinuación o
desescalonamiento de antibióticos. (53-54) Se demostró que cefepime es el antibiótico
más utilizado durante nuestra investigación y se deben tener en cuenta las consecuencias
a largo plazo del uso liberal de antibióticos de amplio espectro (55). Estos hallazgos deben
hacer reconsiderar cambiar los principios de administración de antimicrobianos para evitar
el desarrollo y la transmisión de organismos resistentes a los medicamentos, como
evidenciaron también Gonzalez-Zorn, 2021 y Zavala-Flores y Salcedo-Matienzo, 2020 que
asocian la COVID-19 a resistencias antimicrobianas emergentes. (41,43)
La principal limitación de este estudio fue su carácter retrospectivo por sesgos de
información y selección ya que los datos se recolectaron de la historia clínica, datos
faltantes en las variables y por ser centro de referencia por lo que tampoco se pudo
determinar la prevalencia de coinfección. Otra limitación es el bajo acceso a diagnósticos
por biología molecular, sin embargo, se encontró considerable infección asociada con
cultivos e interpretados por la clínica, eso debería ser sometido a discusión dándole
importancia al resultado de los cultivos sumando a otros hallazgos clínicos y paraclínicos.6.2 Conclusión
La alta prevalencia de infecciones documentadas en el estudio puede estar relacionada
con que es un hospital universitario con alta afluencia de personal, la rotación de personal
no entrenado para responder a la demanda de pacientes hospitalizados y la necesidad del
personal médico en documentar IBS, que finalmente pudo intervenir tanto en el sobre
registro como en la presentación de infecciones; así como también a la severidad de la
presentación enfermedad, sin embargo la mortalidad general de nuestro estudio que fue
del 26.6% manteniéndose por debajo de la publicada por el Ministerio de salud que es de
29%(63).
Un dato importante de mencionar fue la supervivencia especialmente en pacientes en
hospitalización general ya que el 10% se presentó mortalidad y en los pacientes
críticamente enfermos fue del 30%.
Otro punto a resaltar es la gran frecuencia de microorganismo multidrogoresistentes
registrados llevándonos a pensar en nuevas estrategias para mejorar factores preventivos
para el desarrollo de las mismas; es de considerar que el estudio mostró cuando se podría
sospechar infección bacteriana entre el día 5 y el día 14 de estancia hospitalaria donde se
obtuvo más registro de las mismas, lo que nos llevaría a implementar estrategias
preventivas en estos días críticos.
En conclusión la confección y la infección bacteriana secundaria son un problema relevante
en pacientes con la COVID-19/SARS-COV-2 por el aumento de la morbimortalidad sumado
a la elevada frecuencia de VMI por SDRA por lo que es prioridad conocer los factores
relacionados a esta para implementar estrategias preventivas eficaces para prevenir NAV,
diagnóstico y tratamiento temprano de coinfecciones e IBS, así como también el uso
responsable antibióticos evitando la inducción de gérmenes multidrogoresistentes (MDR).38 Infecciones Asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. 2021 Título de la tesis o trabajo de investigaciónA. Anexo: Cuadro Operativo de
Variables
Variable Definición Resultado Naturaleza Escala Tipo de variable
Identificación Número de HC Número Cualitativa Nominal Independiente
Edad del Caso en
Edad el momento de la Número Cuantitativa Razón Independiente
notificación
Masculino
Sexo Sexo del Caso Cualitativa Nominal Independiente
Femenino
Fecha de ingreso a Fecha Ingreso a
dd/mm/aaaa Cuantitativa Razón Independiente
hospital Hospital
Fecha de Fecha
diagnóstico de Diagnostico dd/mm/aaaa Cuantitativa Razón Independiente
COVID-19 COVID
Fecha de PCR o
Fecha de la
Antígeno Positivo dd/mm/aaaa Cuantitativa Razón Independiente
Prueba
para COVID-19
Fecha egreso de Fecha de egreso
dd/mm/aaaa Cuantitativa Razón Independiente
hospital de Hospital
Enfermedades -Diabetes Mellitus
Comorbilidad1 Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes (DM)
Enfermedades -Hipertensión
Comorbilidad2 Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes arterial (HTA)
-Enfermedad
Enfermedades pulmonar
Comorbilidad3 Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes obstructiva
crónica (EPOC)40 Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. Multicéntrico.2020 Cuadro Operativo de Variables
Enfermedades
Comorbilidad4 -Hipotiroidismo Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes
Enfermedades -Cardiopatía
Comorbilidad5 Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes isquémica (CI)
Enfermedades -Insuficiencia
Comorbilidad6 Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes renal Crónica
Enfermedades
Comorbilidad7 -Obesidad Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes
Enfermedades -Cardiopatía
Comorbilidad Cualitativa Nominal Independiente
preexistentes isquémica (CI)
Estado al egreso de
Estado del
UCI/Hospitalización Vivo Cualitativa Nominal Independiente
paciente
General
Muerto
Existencia de
infección
bacteriana,
micótica, virus
confirmada por
laboratorio.
Mediante cultivo
de secreción
orotraqueal,
lavado
broncoalveolar o
hemocultivos, SI
Coinfección paneles Cualitativa Nominal Independiente
moleculares para NO
bacterias y/o
métodos de
detección de
antígenos, la cual
se presenta
dentro de las
primeras 48 horas
del diagnóstico de
la infección por
SARS-CoV-
2/COVID-19
Infección SI
Aparición de
bacteriana Cualitativa Nominal Independiente
infección
secundaria NO
bacteriana,Anexo A. Cuadro Operativo de Variables 41
micótica, virus
luego de las 48
horas del ingreso,
en presencia de
al menos un
cultivo positivo de
muestra
respiratoria
(aspirado
endotraqueal,
lavado
broncoalveolar),
muestras de
sangre, orina o
resultado de
pruebas
moleculares como
PCR multiplex y
en un contexto
clínico compatible
con infección.
Microorganismo Tipo de
Nombre Cualitativa Nominal Independiente
aislado microorganismo
ausencia
Susceptibilidad Resistencia a
resistencia única Cualitativa Nominal Independiente
antimicrobiana Antibiótico
multiresistencia
Tiempo promedio
Tiempo promedio
entre el ingreso a
Tpegreso1 total de días de Cuantitativa Razón Dependiente
hospitalización y
Hospitalización
fecha de Egreso
Tiempo promedio
entre el
aislamiento Tiempo promedio
Tpegreso1 Cuantitativa Razón Dependiente
microbiológico en en días
hospitalización y
fecha de Egreso
Antibiótico Tipo de antibiótico Nombre Cualitativa Nominal Independiente
Tiempo promedio
Tiempo promedio
T rango terapéutico en el uso de Cuantitativa Razón Dependiente
en días
antimicrobiano42 Infecciones asociadas a la COVID-19 en pacientes hospitalizados. Multicéntrico.2020 Cuadro Operativo de Variables
Ubicación del
paciente Hospitalización
Ubicación General/UCI/UCI Cualitativa Nominal Independiente
Hospitalización N
general/ UCI
Numero de
eventos
infecciosos
Eventos identificados al
Numero Cuantitativa Nominal Independiente
Infecciosos ingreso durante la
internación y
hasta el egreso
del paciente
Tipo de
dispositivo
asociado:
Catéter Venoso
Central, Catéter
Dispositivo
Periférico, Catéter Nombre Cualitativa Nominal Independiente
asociado
Arterial, Sonda
vesical, Tubo
Orotraqueal,
Catéter PEEC,
Cánula
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