Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
Autor: Remolina Bonilla, Yuly Andrea
Asesor: Camino, Jorge (Thesis advisor)
Fecha: 2014
Programa: Bogotá - Medicina - Especialidad en Anestesiología y Reanimación
Facultad: Facultad de Medicina

Resumen: Objetivo: Identificar la etiología viral en los pacientes adultos con infección respiratoria aguda grave (IRAG) admitidos en instituciones de vigilancia centinela en Bogotá durante el año 2012. Métodos: Estudio descriptivo de corte transversal en el que se emplearon técnicas de micromatrices moleculares para identificación viral en muestras de aspirado o hisopado nasofaríngeo de pacientes adultos con IRAG notificados al sistema de vigilancia epidemiológica y se realizó descripción de características clínicas y desenlaces clínicos relevantes como mortalidad, necesidad de UCI, ventilación mecánica y estancia hospitalaria. Resultados: Se analizaron 91 pacientes con IRAG y en 63 (69.2%) se logró identificación viral. La patología más frecuente encontrada fue el EPOC en el 24.2% de los pacientes. Los virus que se aislaron con más frecuencia fueron Influenza y Bocavirus en 30.8% y 28.6% de los casos, respectivamente. La mortalidad fue de 15.4%, ingreso a UCI ocurrió en 42.9%, requerimiento de ventilación mecánica en 36.3% y la estancia hospitalaria promedio fue de 9.9 días. El uso de antibiótico ocurrió en 90.1% de los pacientes. Conclusión: La prevalencia de la etiología viral en las infecciones respiratorias agudas graves, en este estudio fue alta, con desenlaces clínicos adversos, con requerimiento de cuidado intensivo y mortalidad elevada.

Etiología viral en adultos con
infección respiratoria aguda grave en
Colombia
Yuly Andrea Remolina Bonilla
Universidad Nacional de Colombia
Facultad de Medicina, Departamento de Medicina Interna
Bogotá, Colombia
2014Etiología viral en adultos con
infección respiratoria aguda grave en
Colombia
Yuly Andrea Remolina Bonilla
Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de:
Especialista en Medicina Interna
Director:
Dr. Jorge Alberto Cortés Luna
Grupo de Investigación:
Enfermedades Infecciosas
Universidad Nacional de Colombia
Facultad de Medicina, Departamento de Medicina Interna
Bogotá, Colombia
2014A mi familia
Quienes son el pilar fundamental de mi vida y
les debo todo:
A mi madre y mi padre, por sus esfuerzos
para permitir que cumpla mis sueños.
A mi hermano por el apoyo incondicional.Agradecimientos
Agradecimiento especial al profesor Jorge Cortes por sus útiles enseñanzas y por
haberme permitido hacer parte de este proyecto de investigación.
A mi amiga María Mercedes, por ser mi compañera de este proyecto y su apoyo en la
realización del mismo.
A Anita Montañez, Hernán Vargas y Liliana Díaz, por el acompañamiento y apoyo
durante este proyecto.
A la Universidad Nacional de Colombia y departamento de Medicina Interna, por
permitirme alcanzar un logro más en mi proyecto de vida.
A Stellita porque sin su acompañamiento y asesoría, esto no sería una realidad.
Al semillero de investigación, por la ayuda brindada durante la recolección de datos.Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia IX
Resumen
Objetivo: Identificar la etiología viral en los pacientes adultos con infección respiratoria
aguda grave (IRAG) admitidos en instituciones de vigilancia centinela en Bogotá durante
el año 2012. Métodos: Estudio descriptivo de corte transversal en el que se emplearon
técnicas de micromatrices moleculares para identificación viral en muestras de aspirado
o hisopado nasofaríngeo de pacientes adultos con IRAG notificados al sistema de
vigilancia epidemiológica y se realizó descripción de características clínicas y
desenlaces clínicos relevantes como mortalidad, necesidad de UCI, ventilación mecánica
y estancia hospitalaria. Resultados: Se analizaron 91 pacientes con IRAG y en 63
(69.2%) se logró identificación viral. La patología más frecuente encontrada fue el EPOC
en el 24.2% de los pacientes. Los virus que se aislaron con más frecuencia fueron
Influenza y Bocavirus en 30.8% y 28.6% de los casos, respectivamente. La mortalidad
fue de 15.4%, ingreso a UCI ocurrió en 42.9%, requerimiento de ventilación mecánica en
36.3% y la estancia hospitalaria promedio fue de 9.9 días. El uso de antibiótico ocurrió en
90.1% de los pacientes. Conclusión: La prevalencia de la etiología viral en las
infecciones respiratorias agudas graves, en este estudio fue alta, con desenlaces clínicos
adversos, con requerimiento de cuidado intensivo y mortalidad elevada.
Palabras clave (DeCS): Infecciones del sistema respiratorio/epidemiología, Infecciones
del sistema respiratorio/etiología, Análisis por micromatrices, Vigilancia epidemiológica,
Neumonía/etiología, Neumonía/epidemiologíaX Resumen y Abstract
Abstract
Objective: To identify the viral etiology in adult patients with severe acute respiratory
infection (SARI) admitted to sentinel surveillance institutions in Bogotá in 2012. Methods:
Cross sectional study in which microarray molecular techniques for viral identification
were used on nasopharyngeal samples of adult patients reported SARI surveillance
system and further description of clinical features and relevant clinical outcomes such as
mortality, need for critical care, use of mechanical ventilation and hospital stay was
performed. Results: 91 patients with SARI were analyzed and 63 (69.2%) achieved viral
identification. The most frequent pathology found was COPD in 24.2% patients. The
viruses isolated more frequently were influenza and bocavirus in 30.8% and 28.6% of
cases, respectively. Mortality was 15.4%, admission to ICU was 42.9%, the requirement
for mechanical ventilation was 36.3%, and the average hospital stay was 9.9 days.
Antibiotics were used in 90.1% of patients. Conclusion: The prevalence of viral etiology of
severe acute respiratory infections in this study was high, with adverse clinical outcomes,
with intensive care requirement and high mortality.
Key words (MeSH): Respiratory tract infections/etiology, Respiratory tract
infections/epidemiology, Microarray analysis, Public Health Surveillance,
Pneumonia/viral, Pneumonia/etiologyEtiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 11
Contenido
Pág.
Resumen ......................................................................................................................... IX
1. Introducción ............................................................................................................... 12
2. Materiales y métodos ................................................................................................ 13
2.1 Escenario de estudio .......................................................................................... 13
2.2 Diseño de estudio ............................................................................................... 13
2.3 Selección de la muestra ..................................................................................... 14
2.4 Procesamiento de micromatrices........................................................................ 14
2.5 Variables y definiciones ...................................................................................... 15
2.6 Análisis estadístico ............................................................................................. 16
3. Resultados ................................................................................................................. 17
3.1 Virus identificados .............................................................................................. 18
3.2 Comparación entre pacientes con o sin identificación viral ................................. 19
3.3 Hallazgos microbiológicos adicionales ............................................................... 21
3.4 Desenlaces ........................................................................................................ 21
4. Discusión ................................................................................................................... 24
5. Conclusión ................................................................................................................. 28
6. Figuras y tablas ......................................................................................................... 29
Figura 1. Flujograma de pacientes ........................................................................... 29
Tabla 1. Características de los pacientes ................................................................. 30
Tabla 2. Características clínicas comparativas de pacientes según grupo ............... 30
Tabla 3. Virus aislados ............................................................................................. 31
Tabla 4. Desenlaces ................................................................................................. 32
Bibliografía .................................................................................................................... 3312 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
1. Introducción
La infección respiratoria aguda es una de las principales causas de
hospitalización y muerte en el mundo, a pesar de lo cual la identificación del
agente etiológico de ésta no se logra en la mayoría de los casos y es tratada de
manera empírica y con alta frecuencia de forma exitosa, con terapia
antimicrobiana. Sin embargo, el papel de los virus, como etiología de estas
infecciones se está identificando con mayor claridad, especialmente después de
la pandemia durante el año 2009 por un nuevo subtipo de influenza A H1N1 (1).
También se ha identificado que la presencia de virus no necesariamente implica
un curso clínico más benigno, ni la ausencia de respuesta inflamatoria sistémica o
complicaciones (2).
Debido a las implicaciones para la salud pública, se han incrementado los
esfuerzos en fortalecer y mejorar los procesos de vigilancia epidemiológica de la
infección respiratoria. Bajo esta iniciativa, los países desarrollaron sistemas de
vigilancia a través del seguimiento de casos de enfermedad similar a influenza y
de aquellos con infección respiratoria aguda grave (IRAG), la cual se define
clínicamente con pacientes con fiebre, tos o dolor de garganta, dificultad para
respirar y necesidad de hospitalización(3). El objetivo fundamental de la vigilancia
ha sido el de proveer información sobre virus circulantes, susceptibilidad de
influenza a los antivirales disponibles, así como favorecer y definir las
necesidades de vacunación en las diferentes poblaciones.
Se desconoce el verdadero impacto de las infecciones virales en las infecciones
respiratorias que requieren hospitalización y que se encuentran bajo vigilancia
epidemiológica hoy en día (4). El objetivo de este estudio es el de identificar la
etiología viral en los pacientes adultos con IRAG admitidos en instituciones de
Bogotá durante el año 2012, así como describir las características y el desenlace
clínico de estos pacientes.Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 13
2. Materiales y métodos
2.1 Escenario de estudio
Este estudio fue realizado en Bogotá, capital de Colombia, una ciudad localizada
en los Andes en América del Sur, cerca de la línea ecuatorial, a 2.600 metros
sobre el nivel del mar. Las instituciones participantes fueron 7 hospitales de tercer
nivel que realizaron vigilancia centinela de IRAG durante el año 2012. Dichos
hospitales debían remitir a la Secretaría Distrital de Salud todas las muestras
respiratorias de pacientes con infección respiratoria aguda grave, definida como
aquella infección respiratoria que puede tener origen viral y/o bacteriano y que
para su manejo requiere tratamiento intrahospitalario y el cuadro clínico incluye:
instauración inferior a 14 días con fiebre mayor de 38°C, dificultad respiratoria,
tos, hipoxia, compromiso sistémico; dependiendo de la severidad del cuadro (5).
La toma de muestra se realizó a través de aspirado o hisopado nasofaríngeo. Las
muestras eran remitidas junto con un formato de recolección de información
epidemiológica básica obligatoria a través del Sistema de Vigilancia
Epidemiológica nacional (Sivigila). Las muestras eran enviadas en medio para
trasporte viral al Laboratorio de Salud Pública de la Secretaría Distrital de Salud,
donde fueron guardados a 4-8 grados centígrados en neveras destinadas para el
efecto.
2.2 Diseño de estudio
Este es un estudio de tipo descriptivo de corte transversal, que establece la
prevalencia de virus en pacientes adultos con IRAG de menos de 15 días de
evolución en Bogotá durante el año 2012 a través de técnicas de microarreglos y14 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
además describe características clínicas y desenlaces como mortalidad,
requerimiento de unidad de cuidados intensivos, necesidad de ventilación
mecánica y tiempo de estancia hospitalaria. Los criterios de ingreso fueron el de
tener una muestra respiratoria tomada en el año 2012 en uno de los hospitales
que realizaban la vigilancia centinela, tener más de 18 años en el momento de
toma de la muestra. Se consideró como criterio de exclusión la no disponibilidad
de historia clínica completa en la institución que tomó la muestra. El estudio fue
aprobado por los comités de investigación y ética de las instituciones
participantes. En una institución se solicitó consentimiento informado para
acceder a la historia clínica institucional.
2.3 Selección de la muestra
Durante el año 2012 se recolectaron un total de 288 muestras de aspirado o
hisopado narofaríngeo de pacientes adultos de los 7 hospitales. Se realizó una
selección aleatoria considerando como único criterio de inclusión pacientes
mayores de 18 años con IRAG reportados al sistema de vigilancia en dicho año.
Se consideró a priori una prevalencia de 25%, con peor resultado aceptable de
20%, poder de 90% y nivel de confianza de 95%. La muestra calculada fue de
117 muestras respiratorias. Sin embargo, dada la posibilidad de procesar hasta
150 pruebas moleculares se amplió la muestra a 150 pacientes. Posteriormente
se realizó una revisión de las historias clínicas y recolección de información en
cada hospital correspondiente, previa aprobación y autorización por los comités
de investigación y ética institucionales.
2.4 Procesamiento de micromatrices
Para la identificación de los virus implicados se empleó la técnica de
micromatrices, a través del equipo CLART Pneumovir elaborado por Genómica
(6). Esta técnica permite la detección y caracterización de los virus que afectan a
los humanos que con más frecuencia causan síntomas respiratorios. Los virus
analizados incluyen: Virus Sincitial Respiratorio A y B, virus de la Influenza A
(H1N1, H3N2, H1N1v), B y C, Parainfluenza 1, 2, 3 4A y 4B, Metapneumovirus A
y B, Adenovirus, Enterovirus, Rhinovirus, Coronavirus subtipo 229E y Bocavirus.
Este kit está basado en la amplificación de fragmentos específicos del genomaEtiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 15
viral, a través de la técnica de PCR (reacción cadena polimerasa) reversa o PCR
con detección de hibridización utilizando sondas de captura específicas (7).
2.5 Variables y definiciones
Se obtuvieron variables de historias clínicas de pacientes como edad, género,
comorbilidades como enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC), diabetes
mellitus, falla cardiaca, acordes con las definiciones internacionales conocidas.
Además se identificaron variables al ingreso como respuesta inflamatoria
sistémica (SIRS) definida como frecuencia cardíaca mayor a 90 latidos por
minuto, frecuencia respiratoria mayor a 20 respiraciones por minuto, leucocitosis
mayor a 12.000 células por mililitro o leucopenia menor a 4.000 células por
mililitro y presencia de fiebre; neumonía la cual incluye pacientes con IRAG con
hallazgos radiológicos de consolidación o infiltrados alveolares; se aplicó el
puntaje para neumonía conocido como CURB 65 con criterios de edad mayor
igual a 65 años, alteración del estado de conciencia, BUN mayor a 20mg/dl,
frecuencia respiratoria mayor a 30 respiraciones por minuto y presión arterial
sistólica menor de 90 mm Hg o diastólica menor a 60 mm Hg,(8) y se estableció
neumonía grave como aquellos pacientes con neumonía quienes cumplían
criterios mayores y menores de ATS/IDSA: choque, requerimiento de ventilación
mecánica, trombocitopenia (plaquetas menor 100.000), PaO /FiO < 250,
2 2
compromiso multilobar, alteración de la conciencia, leucopenia (menor a 4.000) y
BUN mayor a 20mg/dl. (9) También se estableció choque al ingreso como
presión arterial sistólica menor de 90 mm Hg o presión arterial diastólica menor a
60 mm Hg. En las instituciones en los cuales se realizaron pruebas de
identificación de antígenos virales, estas se realizaron de acuerdo al protocolo
institucional y se interpretaron localmente en cada hospital. Se definió
colonización de la vía aérea como la presencia de microorganismos en la muestra
de Gram o en el cultivo de la vía aérea. La toma de Gram y cultivo de esputo u
otra muestra respiratoria se realizó de acuerdo a la decisión del médico
institucional.16 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
2.6 Análisis estadístico
Se utilizó el test de chi cuadrado o el test exacto de Fisher para comparar
variables categóricas y la prueba de t de Student o la prueba U de Mann-Whitney
para comparar variables continuas según el caso. El análisis de las variables se
realizó con el programa Stata (ver. 11.0), considerándose valores significativos
de P con resultados menores a 0.05. Para el análisis de los desenlaces se
utilizaron riesgos relativos con sus correspondientes intervalos de confianza del
95%.Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 17
3. Resultados
Durante el año 2012 se recolectaron en Bogotá 288 muestras de secreciones
respiratorias a través del sistema de vigilancia centinela de pacientes mayores de
18 años. A través de un muestreo aleatorio, se seleccionaron 150 casos de IRAG
de aquellos remitidos con muestra de origen respiratorio. De los 150 casos
seleccionados, en 7 casos no fue posible encontrar las historias clínicas, 5
historias pertenecían a pacientes menores de 18 años y en 39 pacientes no se
obtuvo consentimiento informado. Se realizó la revisión de las historias 99
pacientes con IRAG reportados al sistema de vigilancia, que pertenecían a 7
instituciones hospitalarias de la ciudad de Bogotá en el año 2012, con la siguiente
distribución: Hospital Universitario Clínica San Rafael 45 (45.5%), Fundación
Cardio Infantil 23 (23.2, Hospital de Suba 10 (10.1%), Hospital el Tunal 9 (9.1%),
Hospital Santa Clara 6 (6%), , Hospital Universitario San Ignacio 3 (3%),y
Hospital Occidente de Kennedy 3 (3%). De los 99 pacientes, 8 tuvieron un
tiempo de evolución superior a 14 días, siendo descartados del análisis final
(Figura 1).
De los 91 pacientes analizados, 50 (55%) eran del género femenino; la edad
promedio fue de 50.6 años, con edad mínima de 18 y máxima de 95 años. La
comorbilidad más frecuentemente encontrada fue la EPOC en un 24.2% de los
casos, seguida de tabaquismo en un 14.3%. Aunque 15% de los pacientes tenían
antecedente de hospitalización en los últimos 3 meses (Tabla 1), tan solo un
paciente venía de una institución de cuidado crónico. Se identificó
inmunosupresión en 5 (5.5%) de los pacientes (uso de esteroides en un paciente
con fibrosis pulmonar idiopática y otro con lupus eritematoso sistémico, un
paciente con infección por el virus de inmunodeficiencia humana, y 2 pacientes
con trasplante; uno con trasplante hepático y otro con trasplante cardíaco). En 318 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
(3.3%) pacientes se identificó una neoplasia activa, (tumor maligno de colon,
neoplasia trofoblástica gestacional y cáncer metastásico a hueso y sistema
nervioso central con primario desconocido). Las hepatopatías, 3 pacientes
(3.3%), fueron de origen alcohólico, cirrosis biliar primaria pos trasplante hepático
e infección crónica por hepatitis C.
El promedio del tiempo de evolución de enfermedad fue de 5.1 días, con duración
mínima de horas y máxima de 14 días (tabla 2). Los hallazgos radiológicos
evaluados y descritos en la historia clínica por el médico tratante, fueron los
siguientes por orden de frecuencia: infiltrados intersticiales en 37.6% de los
pacientes, infiltrados de ocupación alveolar en 31.4%, consolidación en 30.2%,
compromiso multilobar en 24.4% y presencia de derrame pleural al ingreso en
16.3% de los pacientes. Se identificaron 28 (30.8%) pacientes con dos criterios
del síndrome de respuesta inflamatoria sistémica, 27 (29.7%) con tres criterios y
11 (12.1%) con 4 criterios. En total, 66 pacientes se presentaron con respuesta
inflamatoria sistémica (72.5%). Se identificó neumonía en 38 pacientes (41.7%),
15 de los cuales requirieron ventilación mecánica. El puntaje CURB 65 en estos
pacientes fue de 0 en 13 (34.2% de los pacientes con neumonía) pacientes, 1 en
15 pacientes (39.5%), 2 en 7 pacientes (18.4%) y 3 en 3 pacientes (7.9%). La
presencia de choque al ingreso se encontró en 11 (12.1%) pacientes. Se
identificó hiponatremia en 21 (23.1%) de los pacientes y en relación al trastorno
de la oxigenación, se reportó trastorno moderado de la oxigenación, definido
como PaFi menor de 220 en 11 (12.1%) de los pacientes y trastorno severo de la
oxigenación, definido como PaFi menor de 160 en 20 (22%) de los pacientes.
El uso de antibióticos en pacientes con IRAG se realizó en 82 casos (90.1%), con
un rango entre 1 y 7 antibióticos por paciente, con promedio de 2.3 antibióticos
por paciente, siendo el grupo de betalactámicos el de más frecuente uso. El uso
de oseltamivir se realizó en 72.5% de los casos (66 pacientes), con uso mínimo
de 1 día y máximo de 10 días, con días promedio de uso de 4.2.
3.1 Virus identificados
Se identificó al menos un virus en 63 pacientes (tabla 3). El virus que con más
frecuencia se aisló fue Influenza, en 28 pacientes (30.8%), de los cuales 21Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 19
(75%) fueron Influenza A y 7 (25%) Influenza B, el segundo aislamiento más
frecuente fue el Bocavirus con un 28.6% (26 pacientes) y el tercer aislamiento por
orden de frecuencia fue el Adenovirus en 17 (18.7%) de los pacientes (tabla 3).
En el grupo de pacientes clasificados como infección viral mixta (26 pacientes), se
encontraron 7 pacientes con coinfección por 3 virus, teniendo los 7
combinaciones distintas, 1 paciente con Bocavirus, Coronavirus e Influenza, 1
paciente con Bocavirus, Influenza y Adenovirus, 1 paciente con Bocavirus,
Influenza y Rhinovirus, 1 paciente con Adenovirus, Metapneumovirus y
Rhinovirus, 1 paciente con Bocavirus, Influenza y Parainfluenza, 1 paciente con
Adenovirus, Parainfluenza y VSR, 1 paciente con Adenovirus, Influenza y
Parainfluenza, y 19 pacientes con infección por 2 virus, siendo la coinfección
entre Bocavirus e Influenza la más frecuente, con 6 pacientes, seguida de 2
pacientes con influenza y VSR, 2 pacientes con Adenovirus y Bocavirus, 2
pacientes con Adenovirus e Influenza, 2 pacientes con Bocavirus y
Metapneumovirus, 1 paciente con Bocavirus y VSR, 1 paciente con Influenza y
Metapneumovirus, 1 paciente con Adenovirus y Metapneumovirus, 1 pacientes
con Adenovirus y Rhinovirus, y finalmente, 1 paciente con Parainfluenza y
Rhinovirus.
En cinco pacientes a los que se realizó panel viral, hubo resultados positivos con
detección de anticuerpos para Influenza A (2 pacientes), Virus Sincitial
Respiratorio (2 pacientes) y Adenovirus (1 paciente). Sin correlación ni
correspondencia con la técnica empleada en este estudio, pues en dichos
pacientes se obtuvieron: 4 Bocavirus, 1 Influenza A H3N2 y 1 negativo. Se obtuvo
un aislamiento mixto (Bocavirus - Influenza) en un paciente con panel viral con
influenza A. El negativo fue en el paciente con panel positivo para Adenovirus.
3.2 Comparación entre pacientes con o sin identificación
viral
No se encontraron diferencias en la comorbilidad entre los pacientes con
identificación versus aquellos sin ésta, excepto para la frecuencia de diabetes
mellitus (p <0.03). Se identificó diabetes como comorbilidad en el 4.8% de los20 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
pacientes con virus vs. 20.8% en los que no se identificó un virus. De los
pacientes con neumonía, 2 de ellos no tenían muestra o la PCR no amplificó, en 8
pacientes (33.3%) no se identificó un virus y 28 pacientes (44.4%) se identificó
un virus. La neumonía fue clasificada como grave en 62.5% de pacientes sin
virus identificado y en 60.1% de aquellos con un virus identificado (p>0.05). No
se observaron diferencias estadísticamente significativas entre los grupos con
virus identificado o sin él en relación a SIRS, 74.6% vs. 66.7%, neutropenia
durante hospitalización 5% vs. 4.2%, o choque 12.7% vs. 8.7%, respectivamente.
De los 22 pacientes con IRAG con antecedente de EPOC, en 16 (72.7%) se
logró identificación viral, 5 de los cuales eran mixtos. La detección tuvo la
siguiente distribución: 6 con Bocavirus, 4 con Adenovirus, 3 con Influenza A, 3
con Parainfluenza, 3 con Virus Sincitial Respiratorio, 2 con Metapneumovirus, 1
con Coronavirus y 1 con Rhinovirus. El tabaquismo activo fue presentado en 13
pacientes de los 91 pacientes, de los cuales 9 (69.2%) cursaron con infección
viral, siendo el Bocavirus el más frecuentemente aislado, en un 33.3%. En
pacientes con insuficiencia cardíaca congestiva, a 8 (88.9%) se les identificó
virus, un aislamiento mixto; 3 pacientes con Bocavirus, 2 con Adenovirus, 2 con
Influenza, 1 con Parainfluenza y 1 con Virus Sincitial Respiratorio. Los pacientes
inmunosuprimidos (5 pacientes), todos tuvieron identificación viral, 4 con un solo
aislamiento y uno con mixto, así: 3 con Influenza A, 2 con Bocavirus y 1 con
Adenovirus. En cuanto a cáncer, el paciente con la neoplasia con primario
desconocido, pero sospecha de origen pulmonar, presentó aislamiento viral de
influenza A y virus respiratorio sincitial. Los pacientes con hepatopatía (3
pacientes), en todos se logró identificación viral, 2 con Adenovirus y uno con
Influenza A.
Las embarazadas se han reconocido como un grupo de riesgo en infecciones
respiratorias por influenza (10) , en este estudio, de los 91 casos de IRAG, se
identificaron 11 (12.1%) mujeres embarazadas, la totalidad provenían del hogar,
en su mayoría sin comorbilidad conocida y 2 de ellas tenían tabaquismo activo, 4
cumplieron con criterios de neumonía, todas con neumonía grave y 1 caso
ingresó en choque. A 8 pacientes (72.7%) se les identificó virus, 2 (18.2%) sin
virus y 1 no amplificó o no se encontró muestra. Los virus encontrados fueron: 4
casos Adenovirus, 4 casos Influenza, 2 casos Bocavirus, 1 Metapneumovirus, 1
Parainfluenza y dentro de estos, 3 casos con aislamiento mixto.Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 21
3.3 Hallazgos microbiológicos adicionales
Durante la hospitalización se tomaron hemocultivos a 33 pacientes (36,3%). Estos
fueron positivos en 3 casos (10% de los hemocultivos), con identificación de dos
casos de bacteriemia por Streptococcus del grupo viridans y en un caso por
Staphylococcus aureus. Se tomó Gram de esputo a 22 pacientes (24%). Este
identificó microorganismos en 15 casos (68% de los que tenían Gram),
identificando flora diversa con cocos Grampositivo y bacilos o coco-bacilos Gram
negativos. En total el cultivo de esputo fue positivo en 13 pacientes, con
identificación de Heamophilus influenzae en 7 casos, Streptococcus pneumoniae,
Moraxella catarrhalis, H. parinfluenzae, Klebsiella pneumoniae cada uno en 2
pacientes, y S. aureus, Bordetella pertussis, Stenotrophomonas maltophilia, cada
uno en un caso. Se identificó más de un microorganismo en 4 casos. Se observó
una mayor frecuencia de toma de muestra de Gram entre los pacientes con
EPOC (41% vs. 18.8%, p=0.03) y una mayor frecuencia de identificación de
colonización de la vía aérea entre estos pacientes (31.8% de colonización vs.
18.8%, p=0.2). Se identificó colonización bacteriana junto con identificación viral
en 14 pacientes (15.3%).
3.4 Desenlaces
Las complicaciones evaluadas fueron el desarrollo de derrame pleural el cual
ocurrió en un 12.5% del grupo sin virus y en 19% del grupo con virus, el
requerimiento de toracostomía cerrada sucedió en 4.2% de los pacientes sin
aislamiento viral y en 3.2% de los pacientes con infección viral, la infección
intrahospitalaria en 8.3% y 3.2%, respectivamente y complicación de enfermedad
de base en 25% de pacientes sin virus versus 38.1% con virus, estas diferencias
no fueron estadísticamente significativas. Los pacientes con neumopatía crónica
fueron los que más presentaron complicación de patología de base (77.3% vs.
25.5%, RR: 3.8; IC95%: 2.3 – 6.4).
Fallecieron un total de 14 (15.4%) pacientes, 2 de ellos sin muestra adecuada o
con PCR que no amplificó, por lo que se analizó este desenlace en 12 pacientes.
Fallecieron 4 (16.7%) casos del grupo sin virus y 8 (12.7%) del grupo con
infección viral (P= 0.6, RR 0.76; IC95% 0.25-2.30). El requerimiento de
ventilación mecánica ocurrió en un total de 33 pacientes (36.3%), con modalidad22 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
invasiva en 24 (26.4%) pacientes, modalidad no invasiva en 13 (14.3%)
pacientes, y uso de ambas en 4 (3.6%) pacientes. Este desenlace ocurrió en 7
pacientes (29.2%) en el grupo sin virus identificado y en 23 pacientes (36.5%) con
virus identificado (P = 0.5, RR 1.25; IC95% 0.62-2.53). El tiempo de ventilación
mecánica promedio fue de 7 días, con duración mínima de 1 día y máxima de 20
días. El ingreso a UCI ocurrió en un total de 39 (42.9%) pacientes, 3 de ellos con
PCR que no amplificó o sin muestra adecuada, 9 pacientes (37.5%) en el grupo
sin aislamiento virológico y 27 pacientes (42.9%) del grupo con identificación viral
(P = 0.6, RR 1.14; IC95% 0.63-2.06). El reingreso a la unidad ocurrió en 1 caso
perteneciente al grupo de identificación viral, con identificación de influenza
AH1N1. El tiempo promedio de estancia en UCI fue de 8.4 días con un rango
entre 1 y 21 días. La estancia en UCI fue en promedio de 3.8 días con un rango
entre 1 y 21 días, en el grupo de detección de virus y de 2.8 días en promedio,
con una rango entre 1 y 13 días, en aquellos sin identificación viral (P>0.05). La
estancia hospitalaria promedio en el grupo de pacientes con IRAG fue de 9.9
días, con un rango entre 1 y 45 días. En pacientes sin y con aislamiento
virológico fue de 10.6 vs 9.8 días, respectivamente (P = 0.6). En el grupo sin
identificación viral, estancia tuvo un rango entre 1 y 45 días, mientras que en el
grupo con detección viral el rango de estancia fue entre 1 y 28 días.
De los 8 pacientes que fallecieron pertenecientes al grupo de infección viral, se
presentaron los siguientes aislamientos: 5 pacientes con Bocavirus, 4 con
Influenza (todos correspondieron a influenza A), 3 con Metapneumovirus y 1 con
VSR. El fallecimiento ocurrió en 19.2% de los pacientes a los que se les aisló
Bocavirus, 14.3% de aquellos con identificación de influenza, 50% de los de
identificación de Metapneumovirus y 20% de los que se identificó VSR. Así
mismo, 5 de los casos (62.5%) de mortalidad de grupo de virus, tuvieron
identificación viral de 2 o más virus (P = 0.19, RR 2.4; IC95% 0.62-9.0, al
comparar contra los que tuvieron identificación de un solo virus. En la evaluación
del resto de desenlaces en pacientes con infección viral mixta, no se encontraron
diferencias estadísticamente significativas que pudieran permitir afirmar mayor
morbilidad en pacientes con aislamiento de más virus.
De los cuatro casos de mortalidad por Influenza, no se encontraron diferencias
significativas (p = 0.7350) ni asociaciones entre infección por este virus y aumento
de casos de muerte (RR 1.25 (IC 0.34- 4.6)). Se analizó la administración de
oseltamivir, antiviral específico para la Influenza, en pacientes con infección porEtiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 23
dicho virus y se obtuvo que de los 28 pacientes a 6 (21.4%) no se le administró.
No se observaron diferencias en mortalidad o estancia hospitalaria entre los que
recibieron o no oseltamivir (P = 0.85 y P = 0.16, respectivamente).
De las pacientes embarazadas, una falleció (9%), tres de ellas (27.3%)
requirieron manejo en UCI y ventilación mecánica y su promedio de
hospitalización fue de 7.4 días.24 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
4. Discusión
Las infecciones respiratorias agudas, son un diagnóstico común y aparentemente
sencillo de realizar, sin embargo, la determinación de su agente causal es más
compleja, pues las estrategias diagnósticas actuales son limitadas y poco
disponibles en sitios de atención primario o incluso en instituciones hospitalarias
en gran parte del mundo (11). El rol de los virus y su prevalencia en este
escenario es tema de debate y discusión, con hallazgos diversos a nivel mundial,
con resultados en estudios de Nueva Zelanda, España y más recientemente en el
Reino Unido, con prevalencia de 28% (12), 18% (13) y 44% (14),
respectivamente. En América Latina los estudios en adultos son escasos, con
datos chilenos de prevalencia del 10% (15) y venezolanos del 18% (16) en
pacientes con sospecha de neumonía. En nuestro estudio se identificaron los
virus como los agentes causales más frecuentes de infección respiratoria aguda
que requirió hospitalización (IRAG) durante el año 2012, encontrándose en la
mayoría de los casos, además de alta tasa de coinfección viral y ofreciendo un
alto grado de morbilidad, incremento en las estancias y requerimientos de manejo
en unidad de cuidados intensivos y necesidad de ventilación mecánica.
El concepto de IRAG, empleado en este estudio, es conocido como de gran
utilidad desde el punto de vista de vigilancia epidemiológica, como vigilancia
sindrómica o por síndromes (17), sin embargo, los resultados acá encontrados,
indican que también es de interés clínico y puede ser de gran utilidad en este
campo, pues parece ser una herramienta capaz de identificar pacientes
potencialmente graves y con alta tasa de complicaciones, por lo que se podría
considerar su empleo rutinario durante el desempeño del clínico. Así mismo, los
retos actuales de la vigilancia epidemiológica de las infecciones del tracto
respiratorio por virus, son lograr la identificación temprana y rápida de los agentesEtiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 25
etiológicos, especialmente al inicio de los brotes y el manejo óptimo y oportuno de
grandes cantidades de muestras (17). Nuestro estudio sugiere que utilizando
tecnología molecular es posible realizar el seguimiento de los virus circulantes en
estos grupos de pacientes. En contraste con la definición epidemiológica utilizada,
un índice neumonía como CRUB-65 no fue de utilidad, pues sólo 10 casos (26%)
tenían criterios según este puntaje de hospitalización en pisos generales y
ninguno en unidad de cuidados intensivos, contrastando con la alta frecuencia de
requerimiento de UCI de nuestros pacientes, lo cual está acorde con lo
encontrado en la literatura acerca de la aplicación de esta escala, en casos de
neumonía viral durante la pandemia del 2009 por el virus de influenza AH1N1,
con resultados que resaltan su pobre valor al momento de predecir severidad o
necesidad de admisión en la UCI (18). Otras escalas como la PSI (pneumonia
severity index) que igualmente subestima el riesgo de estos pacientes (19),
demostrando imprecisión para clasificar pacientes de alto y bajo riesgo (20). Esto
establece una diferencia marcada de estratificación de severidad, entre la
neumonía causada por Influenza y la causada por otros agentes etiológicos,
dejando ver la importancia del juicio clínico en este escenario (21). La aplicación
de estas escalas en neumonía viral diferente a Influenza aún no se ha evaluado.
Se identificó una mortalidad relativamente elevada, tanto en pacientes con
neumonía adquirida en la comunidad como en aquellos sin ella. Un estudio
realizado en Estados Unidos identificó una baja tasa de mortalidad entre
pacientes con hospitalización por infección viral, sin embargo cuando existía
coinfección bacteriana aumentaba la morbimortalidad (22), así que se deberá
considerar esta variable en nuestros pacientes. En países con estaciones se ha
correlacionado la presencia de influenza con alta mortalidad por infección
respiratoria, usualmente en el contexto de neumonía adquirida en la comunidad
(23). Este patrón estacional de las infecciones respiratorias agudas,
especialmente las virales por Influenza, esta modulado por la temperatura y
humedad y factores del huésped como niveles séricos de vitamina D (24).
Colombia está ubicado en la zona tropical, careciendo de estaciones, sin
embargo, es reconocido un aumento de estas infecciones durante la época de
lluvias en países pertenecientes a estas latitudes, fundamentalmente por
Influenza y Virus Sincitial Respiratorio (25), por lo que es importante mantener la
vigilancia epidemiológica, en particular durante las épocas de circulación viral,
con la posibilidad de mejorar las estrategias de control y prevención, como
vacunación oportuna. Así mismo, en este contexto llama la atención la26 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
identificación de Bocavirus en adultos y la alta mortalidad relacionada; este virus
había sido identificado primordialmente en niños menores de 5 años con un
amplio intervalo de prevalencia 0.9-33% (26), descrito por primera vez en el 2005,
perteneciente a la familia Parvoviridae, su rol en las infecciones respiratorias
agudas, aún no es claro debido a su aislamiento tanto en individuos enfermos
como sanos (4), el papel de la carga viral e infección persistente (26), y su
frecuente coinfección con otros virus, que hacen considerar la posibilidad que el
Bocavirus requiera intermediarios o sea uno, para producir infección en los
humanos (27).
En cuanto a técnicas de identificación de antígenos virales en secreciones
respiratorias empleadas en muestras directas, existen las técnicas inmunológicas,
como el panel viral, de uso relativamente común en nuestro medio, no obstante,
no es de utilidad diagnóstica, dada su baja sensibilidad y especificidad y que sólo
identifica de 4 a 5 virus respiratorios (Influenza, Parainfluenza, VSR, Adenovirus).
Este estudio corroboró estos datos evidenciados en la no correspondencia de los
resultados de panel viral realizados a los pacientes comparados con la técnica de
microarreglos, por lo que se necesitan técnicas basadas en la identificación de
ácidos nucleicos, como la implementada en este estudio, con las cuales se
pueden obtener resultados más rápidos y precisos para el diagnóstico de
infección viral con el propósito de ofrecer manejo médico apropiado y dirigido
(28), ya que el uso de antibiótico en infecciones respiratorias agudas, se hace de
forma indiscriminada y excesiva, con datos en la literatura mundial de empleo de
estos en más de la mitad de infecciones respiratorias (29), este estudio determinó
su uso en más del 90% de los casos, siendo las infecciones de origen viral su
mayoría. Se deberán emplear estrategias adicionales como la medición
procalcitonina para identificar pacientes que realmente se beneficien de esta
terapia (30).
Este estudio posee varias limitaciones. Aunque el estudio se realizó en varias
instituciones, se tiene información de solo una ciudad en Colombia. Una limitación
importante es que se trata de un estudio retrospectivo, por lo que no se pudo
controlar mejor la toma de muestra tanto para estudio viral como para estudio
bacteriano, limitaciones en información relevante como el antecedente de
vacunación previa contra influenza o neumococo, así como en medición de la
comorbilidad. Se obtuvo una muestra menor a la esperada, aunque la
prevalencia de infección viral fue más alta de la esperada. En conjunto estasEtiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 27
limitaciones generan dificultades para establecer comparaciones
estadísticamente significativas entre los grupos, así como evaluar correctamente
el impacto de la comorbilidad y la coinfección bacteriana en los desenlaces,
especialmente en relación al papel de neumococo (31). Entre otras limitaciones
se encuentran, la dificultad de definir el verdadero rol de algunos virus en
infecciones respiratorias, pues en la literatura se ha descrito la detección de
estos, especialmente Bocavirus y Rhinovirus, en sujetos asintomáticos (4), y el
uso empírico de antibiótico terapia en la mayoría de casos, sin empleo de
herramientas adicionales confirmatorias de infección bacteriana.28 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
5. Conclusión
La etiología viral en las infecciones respiratorias agudas graves, es superior a lo
considerado usualmente, con desenlaces clínicos adversos, con requerimiento de
cuidado intensivo y mortalidad elevada. Se necesitan más estudios,
especialmente de tipo prospectivo para precisar el papel de los virus con mayor
exactitud, definir mejor los diagnósticos clínicos (bronquitis, neumonía, etc.) y con
esto poder realizar intervenciones de tipo terapéutico dirigidas.Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 29
6. Figuras y tablas
Figura 1. Flujograma de pacientes30 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
Tabla 1. Características de los pacientes
N de % de
Variable pacientes pacientes
Edad promedio (años) 91 50.6
Género femenino 50 55.0%
Procedencia del hogar 90 98.9%
EPOC 22 24.2%
Hospitalización previa 14 15.4%
Tabaquismo 13 14.3%
Embarazo 11 12.1%
Diabetes Mellitus 9 9.9%
Insuficiencia cardíaca 9 9.9%
Inmunosupresión 5 5.5%
Enfermedad renal
crónica 4 4.4%
Enfermedad
cerebrovascular 4 4.4%
Hepatopatía crónica 3 3.3%
Cáncer 3 3.3%
Alcoholismo 2 2.2%
Tabla 2. Características clínicas comparativas de
pacientes según grupo
% de % de
Variable pacientes sin pacientes con
virus (n) virus (n)
Número de pacientes 24 63
Tiempo de evolución (promedio
días) 5.1 5.3
Tos 75.0% (18) 87.3% (55)
Fiebre 70.8% (17) 71.4% (45)
Expectoración 62.5% (15) 52.4% (33)
Estertores 25.0% (6) 39.7% (25)
Antibiótico previo 29.2% (7) 17.5% (11)
Alteración de conciencia 8.7% (2) 6.5% (4)
FC (latidos/min) 96.3 98.6Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 31
FR (respiraciones/min) 20.9 20.6
TAS (mmHg) 122.7 118.0
TAD (mmHg) 72.6 71.1
Temperatura (°C) 37.2 36.7
Neutropenia durante
hospitalización 4.2% (1) 5.0% (3)
SIRS ≥2 66.7% (16) 74.6% (47)
Neumonía 33.3% (8) 44.4% (28)
Neumonía severa 62.5% (15) 60.1% (38)
Choque 8.7% (2) 12.7% (8)
Tabla 3. Virus aislados
N de % de
Virus aislado pacientes pacientes
Virus 63 69.2%
Influenza 28 30.8%
Bocavirus 26 28.6%
Influenza A 21 23.1%
Adenovirus 17 18.7%
Influenza A H1N1 7 7.7%
Influenza B 7 7.7%
Metapneumovirus 6 6.6%
Parainfluenza 6 6.6%
Virus sincitial
respiratorio 5 5.5%
Rhinovirus 5 5.5%
Influenza A H2N3 2 2.2%
Coronavirus 2 2.2%
Aislamiento mixto 26 41.3%32 Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia
Tabla 4. Desenlaces
% de % de Intervalo
pacientes pacientes de
Desenlace sin virus con virus RR confianza
Muerte 16.7% 12.7% 0.76 0.25-2.30
Ventilación mecánica 29.2% 36.5% 1.25 0.62-2.53
Ingreso a UCI 37.5% 42.9% 1.14 0.63-2.06
Estancia hospitalaria (días
promedio) 10.6 9.8 - -Etiología viral en adultos con infección respiratoria aguda grave en Colombia 33
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