安政の大獄において、東西両京都町奉行と連携して多くの人物を捕らえさせた長野に、渡辺も協力した。渡辺から長野に渡された志士たちの探査報告書は多数にのぼった。
鵜飼吉左衛門・鵜飼幸吉父子が安島帯刀や日下部伊三治に送った密書に、除奸計画や西郷隆盛による彦根城襲撃の計画などが書かれていたことを知った長野は渡辺にこれを伝え、それを受けて大坂や伏見、その他間道の探索や、船への乗り込み調査がなされ、さらに西国筋に隠密も放たれた。西郷は後に僧・月照とともに入水したが、それを長野に伝えたのも渡辺だった。
小松寺の僧・麟孝の捜索の際に和州路や江州路、丹州路から大坂まで捜索網を手配したことも渡辺は長野に告げている。
宿泊していた宿屋に脅迫文が投げ込まれ、身の危険を感じた長野は、渡辺の上司である京都西町奉行小笠原長常とは夜中に会うこととし、宿には戻らず渡辺の家に泊まることもあった
暗殺.
桜田門外の変で大老・井伊直弼が暗殺された後、大獄でいわゆる「志士」の捕縛に関わった者が何人も殺害されたことを受け、渡辺たち大獄に協力した京都町奉行所の役人は「御用召し」の名目で転勤することになった。
殺害後、渡辺たちは切断された首を京都の粟田口にさらされた。渡辺の首は「横ビンよりはすにかけ二寸五分程の深さに切込み、疵壱ヶ所柘榴のごとく口明き、いかにもいやらしき事にござ候」という有様だった。
死後.
加納繁三郎
加納 繁三郎（かのう しげさぶろう、 生没年不詳）は、江戸幕府の幕臣。京都東町奉行所の与力で、幕末の京都の政局に一時携わった。
人物.
安政の大獄の際には、京都西町奉行所の与力・渡辺金三郎とともに長野主膳に協力して志士を捕縛し、情報も提供した。当時の京都東町奉行の岡部豊常は、容疑者逮捕に意欲的でなかったため、主膳は主に岡部配下の加納と接触していた。
桜田門外の変の後.
加納は、主膳に協力して多くの志士を捕縛したことで、彼らの恨みを買った。
井伊直弼が桜田門外の変で暗殺された後、渡辺金三郎は石部宿で暗殺され（江州石部事件）、梟首された京都粟田口の刑場には、渡辺とともに長野主膳、島田左近の「大逆謀に与し」、国を憂える者たちを罪に落としたと、立て札で名指しされた。