初公開時、「世界初の長編アニメビジョン」と宣伝で謳われていた。これは、大画面（ビスタ・サイズ）での公開に合わせ、作画に通常より大きい背景やセル画を用いたアニメビジョン方式（アニメーションとビスタ・サイズを合わせた造語）が初めて採用されたことを指している。
製作時、裏テーマとして「映画を盗め」というものがあったといい、様々な映画のパロディが指摘できないほど散りばめられている。
特別ゲストとして、エジプト警察署長役に三波春夫、アメリカ合衆国大統領役に赤塚不二夫、ソ連書記長役に梶原一騎が出演している。
原点回帰.
後年の作品では不二子以外でマドンナ的な役柄となる女性オリジナルキャラクターの登場がほぼ恒例となっているが、本作にはそれに該当する人物は存在せず、不二子がヒロインとしてルパンとの関係にも焦点が当てられ、その存在についても物語のキーポイントの一つとなっている。
クローンを扱った作品として.
あらすじ.
ある日、一人の男が処刑された。その男が「ルパン三世」であることは、鑑識の結果、事実だった。だが、銭形という警部だけはその事実を信じなかった。
銭形は、狂気に取り付かれたかのような勢いでルパンが埋葬されているドラキュラ城へ車で赴き、「物事には、限りってものがあるんだ」とルパンの遺体に自らの手でとどめを刺そうとするが、遺体は爆発してしまう。その時、爆発の衝撃で引っくり返った銭形の目の前に、先ほど爆発したはずのルパン本人が現れた。そのルパンの言葉によると処刑されたのは偽者であるらしく、銭形はとりあえずと言わんばかりにルパンを逮捕しようとするも、逃げられてしまう。
自分が本当に本物なのか迷いつつもルパンは不二子の依頼を受け新たな仕事へ出発、次元と共にエジプトにあるピラミッドから「ある石」を盗み出した。その石は、人間に永遠の生命を与えるとの言い伝えがある「賢者の石」と呼ばれるものだった。