都内の大学に通う青年・雨宮瀑（あまみや たき）は、唯一の肉親であった母を喪い、遺言に従って新宿に小さな事務所を構える「賽木超心理学研究所」に入所する。「超心理学」とは人間の精神が物質に与える作用を精査する研究で、いわば超能力や超常現象を科学的手法によって検証する学問である。オカルトまがいにも見える研究に戸惑いながらも瀑は所長である賽木の下で働き始めるが、ほどなくして瀑の前に自身と生き写しの男が現れ不可解な投身自殺を遂げる。死んだ男は瀑と生後すぐに離別した双子の兄・漣（れん）であった。存在すら知らなかった兄との再会に瀑は当惑するが、遺体の解剖結果はさらなる衝撃を瀑に与えた。漣の身体から見つかった異常は弟である瀑にも認められ、双子の兄弟には共に頭蓋の中に脳が無かった。しかしデカルトの金言の如く、脳が無くとも思考する自分は確かに存在している。自らの存在の謎を解明するため、瀑は脳と意識を巡る謎を探求することを決意する。
「世界とは意識か？」
膨大な無意識が意識を形作るように、この世界は無数の並行世界が作り出すものなのだろうか。
レインマンの能力を駆使しての追跡戦の後、漣は今一度並行世界にその姿を消した。
羽田国際空港を目指し飛行していた旅客機が、航路を外れて都心に墜落した。並行世界と意識を繋いで墜落直前の機内の様子を窺った瀑は、乗客達が一様に「絶望」をその表情に浮かべる光景を目の当たりにする。旅客機が落ちたのは漣が追跡戦の際に現出させた古墳であり、まるで避けようのない悲愴な運命を悟ったような乗客達の「絶望」の表情は、あるいは漣の予言した世界の破滅を感得したものであったのかもしれない。偶然から未来を感得する能力に長けた人間達が旅客機に乗り合わせたことにより、図らずも彼らの意識の力が旅客機を墜落させた。本当に世界に危機が迫っているとすれば全人類レベルの予知が現れるはずであり、旅客機の墜落はその一端であるのかもしれない。