平安時代に平氏が台頭すると、蓮池にある蒲田津という港は貿易船が出入りする地となった。この時代に当地を治めた平家家臣の蓮池氏の一族が四国の土佐国に移り、蓮池城（土佐市）を築いたとされている。まもなく平氏が滅亡したあとも、平氏の残党がここに移り住んだとも伝えられている。
中世には、九州北部を中心に版図を広げた少弐氏の影響下に入り、これに臣従する犬塚氏と小田氏が城を築いた。このうち小田氏が蓮池に築いた「小田城」が、後の蓮池城である。戦国時代になると少弐氏、大内氏、大友氏などの勢力争いに巻き込まれ、やがてその争いの中から台頭した龍造寺氏が犬塚氏と小田氏を破って蓮池一帯を制した。戦国時代後期には龍造寺氏の家臣だった鍋島氏が主家をしのぐようになり、蓮池城は鍋島氏の居城となって江戸時代を迎えた。
古代には海に面して港があった.
筑後川の河口に近い佐賀平野一帯は溝渠（クリーク）が縦横に走り、クリーク地形と呼ばれている。現代では河道改修と築堤によって流路が整備されているが、かつてこのあたりは蛇行する筑後川とその支流が有明海と連なって汽水域を形成していた。現在の蓮池地区の東方には「中津江」或いは「境江湖（さかいえご）」と呼ばれる水域もあった。
史料によれば、この一帯で最も早くから形成されていた集落の一つが「蒲田郷」である。蒲田郷は、奈良時代に成立した『肥前国風土記』や平安時代の『和名類聚抄』に名が見え、「蒲田」「蒲田郷」と記されている。奈良時代には、現在の佐賀江の川筋にあたる位置が海岸線だったと考えられており、そこに「蒲田津」と呼ばれる船着場があった。蒲田津は平忠盛（平清盛の父）による日宋貿易で利用されていた。現在の蒲田津地区は蓮池町東部（蓮池町小松）の佐賀江と城原川の合流点西岸付近に位置している。
平家と蓮池.