セルとの闘いの後、タイムパトロールとなった未来の青年トランクスが、神龍に願い事をして「自分と一緒に戦ってくれる強い人」を呼び出す。
それがプレイヤーが操作する主人公自身であった。主人公はトランクスと共にタイムパトロールとして歴史を改変する邪悪な存在と闘い、そして悟空たち伝説の戦士らとも協力し、歴史の改変を食い止めることになる。
序章.
トランクスが使ったドラゴンボールにより、神龍の願いによって呼び出された主人公。手始めにトランクスから手合わせをされ、実力を見込まれた後に歴史改変を食い止める「タイムパトロール」に勧誘される。
サイヤ人編.
何者かによってラディッツの力が強化された結果、ピッコロの魔貫光殺砲はかわされ、悟空だけが貫かれた。そして力を使い果たしたピッコロもまたラディッツの反撃によって倒され、歴史が変わってしまう。凶暴化でパワーアップし、悟飯の攻撃をかわして殺そうとするラディッツから駆けつけた主人公が悟飯を守る。悟空たちと共闘してラディッツを弱らせ、ピッコロが倒すことにより大きな改変は食い止められた。
ベジータとナッパの来襲する時代では大量に増えた栽培マンたちが大幅に強化され、天津飯やヤムチャたちは為すすべもなく死亡し、さらには大猿となったベジータとナッパの2人との戦いを強いられ、界王拳で応戦する悟空は窮地に陥る。栽培マンとの戦いに到着した主人公はナッパや大量の栽培マンを倒すが、歴史通りピッコロたちが殺される。悔しく思いながらも生き残った悟飯とクリリンを守りながら駆けつけた悟空と協力し、手強くなっていくベジータを撃破した。とどめを刺そうとするクリリンを止めた主人公に悟空は感謝し、ベジータも再戦を約束し去って行った。
フリーザ編.
セルゲーム編.