地下鉄サリン事件において土谷正実が中心となったサリン製造プロジェクトに関与した殺人及び殺人未遂の容疑で警察から特別指名手配されていた。
逮捕.
その時点では、捜査員が菊地であると確信出来なかったことから、千代田区霞が関の警視庁への身柄送致が行われた後、捜査官が照合作業を行った結果、女性が菊地本人であると確認し、警視庁が殺人及び殺人未遂容疑で、菊地に対する逮捕令状を執行し、通常逮捕を行った。
サリン事件について「当時は何を作っていたか知らなかった」、VX事件について「事件にかかわったかどうかわからない」と容疑を一部否認し、東京都庁小包爆弾事件では黙秘をした。サリン事件とVX事件については、不起訴処分となった。
また、地下鉄サリン事件直後、教団への強制捜査が迫ったため、林泰男と逃亡したとか東京都八王子市のマンションに潜伏していたなどの報道があったが、当時、強制捜査の行われている山梨県西八代郡上九一色村にある、オウム真理教の施設内で通常の生活をしていたため、それらは正しくないと否定している。
マスメディアで「走る爆弾娘」の異名で呼ばれていたことに関しては、地下鉄サリン事件で指名手配同様に寝耳に水であり、中川に依頼されて、八王子市のマンションに薬品を運んだ事実があったが、それが爆弾の原材料として使われたらしいことに、この時初めて気が付いたという。
裁判.
一審.
控訴審.
この無罪判決については、「不合理ではないか」「いや、極めて真っ当だ」と、メディアの評価は分かれた。裁判員裁判の存在意義にまで議論が及んだほか、産経新聞だけは無罪判決が出た後もなお、元捜査機関職員の言葉を引用し「菊地元信者は教祖の側近中の側近で、女性信者の頂点にいたとされる」という誤った記事を掲載した。
二審判決は以下のような認定の上、無罪判決を下している。
江川紹子は、「いつ、どこで、何をした」という「基本情報が全く報じられなかった」報道の在り方と捜査のずさんさ、菊地が捜査員に語ったプライバシーに関わる事柄が、マスメディアに筒抜けになったことで、菊地が捜査に不信感を抱き、多くを語らなくなった事実を、厳しく批判している。
登場人物.
（※）キャストはドラマCDからのもの
漫画.
もじくん
羽根田治
人物.