次に、即位前の神武天皇が熊野から大和に侵攻する場面で神武天皇を助けた高倉下の夢に高御産巣日神が登場する。
巻十五の「顕宗紀」では阿閉事代が任那に派遣され壱岐及び対馬に立ち寄った際に名前が登場し、月神と日神の祖であり天地を創造した功績があったとされている。また、『延喜式』「祝詞」・「出雲国神賀詞」では「神王高御魂命」とされている。
系譜.
『古事記』では万幡豊秋津師比売命が天照大御神（あまてらすおおみかみ）の御子神の天忍穂耳命（あめのおしほみみのみこと）と結婚して生まれたのが天孫邇邇芸命（ににぎのみこと）である。このことから高御産巣日神は天孫邇邇芸命の外祖父に相当する。
のちの皇室は高御産巣日神の血を引いているとされる（前述）が、記紀神話、特に日本書紀での高皇産霊尊は天照大神より優位に立って天孫降臨を司令する。このため、高皇産霊尊が本来の皇祖神だとする説がある。
奴奈川神社には高御産巣日神は意支都久振為命を産み、その神が卑都久振為命を産み、同神が沼河比売を産んだとされる伝承がある。また葛城国造・宇佐国造・賀茂県主の遠祖である天活玉命の父であるとされる。
祀る神社.
造化三神のうち、高御産巣日神と神産巣日神は、その活動が皇室・朝廷に直接的に大いに関係していると考えられたため、神祇官八神として八神殿の第一と第二神殿で祀られた。
宮中以外で祭る主な神社は以下の通り。
本因坊道的
生涯.
造化の三神
天之御中主神
天之御中主神（あめのみなかぬしのかみ、あまのみなかぬしのかみ）は、日本神話の天地開闢において登場する神である。
神名は天の真中を領する神を意味する。『古事記』では神々の中で最初に登場する神であり、別天津神にして造化三神の一柱。『日本書紀』の正伝には記述がなく、異伝（第一段の第四の一書）に天御中主尊（あめのみなかぬしのみこと）として記述されている。『古事記』『日本書紀』共にその事績は何も記されていない。そのため天之御中主神は中国の思想の影響により創出された観念的な神であるとされるが、これに否定的な論もある。