印刷料金を入金する。基本的に前払い。事前にメールやFAXで見積もりを出してもらうと良い。印刷料金は窓口で払う、銀行振込、ゆうちょ銀行の普通為替を送る、クレジットカード決済などの方法がある。
納品.
完成した同人誌が納品される。自宅送り、イベント搬入、書店搬入などがある。送料や搬入代がかかるが、印刷料金と一緒に計算される。
原稿.
同人誌印刷所に入稿する原稿は、受け付けてすぐに作業にかかれる完全原稿であることが前提である。印刷所によって細かい規定があるので、原稿作成前に確認しておくのが望ましい。
紙原稿.
原稿のサイズは、印刷所が指定した規格寸法のものであることが望ましい。さらに原稿用紙の大きさも統一してあることが望ましい。原稿の各ページには極力全ページにノンブルが打ってある必要がある。
白黒原稿の場合、インクが黒ではなく濃いグレーである場合があるので注意を要する（特にインクジェットプリンターで打ち出した文字の場合）。スクリーントーンの網点が黒ではなくグレーの場合もあるので注意を要する。
カラー原稿の場合、厚いイラストボードに描かれていると、シリンダー形のイメージスキャナに対応できない場合がある（フラットベッド型なら対応できる）。
デジタル原稿.
料金.
同人誌印刷所の印刷料金は、その印刷所で最低限の装丁の同人誌を納品するための基本料金がベースになっている。製本される本のサイズと、ページ数（表紙含む）、印刷部数によって、基本料金の額が段階的に定められている。基本料金には、大まかに以下のものが含まれて計算されている。
基本料金に追加料金を加えることによって、様々な追加装丁をプラスすることが出来る。主なものは以下の通り。
基本料金とは別に、セットものと呼ばれる印刷商品もある。これは、印刷所が指定した装丁で入稿される原稿に、基本料金から計算するよりも割安な価格で受注するというものである。セット商品には印刷所によって色々なものがあり、セット商品が多いことを売りにしている印刷所もある。
製版.
印刷.
印刷された紙は製本され、化粧断ちをして規定のサイズに仕上げられる。品質検査を行ったのち、梱包されて納品される。
他の印刷商品.
同人誌印刷所では、同人誌の他にも様々な印刷商品を取り扱っている。これらのものも、同人誌即売会で販売されたり配布される。