平安時代後期には常陸国から源義清・清光子孫が盆地各地に土着し甲斐源氏の勢力として広まり、盆地中央から北西部は甲斐源氏の惣領である武田信義とその子孫である一条忠頼や板垣兼信、武田有義らが土着した。『吾妻鏡』に拠れば信義ら甲斐源氏の一族は治承・寿永の乱において活躍し源頼朝の鎌倉幕府創設に参画するが、やがて頼朝の粛清を受け衰微する。
甲斐源氏の一族は源氏氏神である八幡信仰をはじめ仏教を信仰し、鎌倉期には時宗や日蓮宗、禅宗など新仏教にも帰依しており、山梨県内には願成寺や大聖寺、放光寺や法善寺など甲斐源氏一族に関係する諸寺院や諸仏が分布している。
一蓮寺の前身は一条忠頼の居館で、忠頼は源頼朝より謀殺されたと言われ、一蓮寺は忠頼夫人が菩提を弔うために建立された尼寺であったという（『甲斐国志』）。
中世の一蓮寺.
時宗の僧は戦場における死者の回向や軍使、死体処理など陣僧としての役割を果たし、『太平記』に拠れば南北朝期の観応の擾乱においては、時宗に帰依していたとされる高師冬が須沢城（南アルプス市大嵐）において上杉憲顕と戦った際には一蓮寺の陣僧が随行していたという。
武田氏による城下町整備により、一蓮寺や城下東部の甲斐善光寺（甲府市善光寺）の門前町は武田城下町に内包された。晴信（信玄）期には一蓮寺において、京都から下向した公家を招いての和歌会も行われている。
近世の一蓮寺.
近世には武田氏の滅亡後、甲斐を統治した徳川氏や豊臣系大名により一条小山に甲府城が築城され、一蓮寺は現在の甲府市太田町に移転する。甲府城跡の発掘調査においては墓石や石臼など寺院に関係すると見られる遺物も出土している。
近現代の一蓮寺.
稲積神社.
一蓮寺を描いた絵画.
右図の女性は縦縞の着物姿で左向き、左手に煙草入れ、右手に煙管を持っている。その背景には赤い鳥居が連なった光景が描かれており、正木稲荷であると見られている。中央図の女性は花柄の振袖姿で、左を向き左手で右を指している。背景には一蓮寺境内が描かれており、左側には和歌が記されている。
三種の図のうち、甲州文庫本と個人所蔵本一種では左図の女性の着物の縞模様が甲州文庫本では粗雑であることが指摘されるが、一方で個人所蔵本一種では改印・商標の枠が欠損している。図像・和歌の内容の比較から二種の前後関係は不明。
文化財.
甲府市指定有形文化財.
一蓮寺過去帳