「全身墨染めの黒装束」「その中には鎖帷子を纏い、顔には墨を塗っている」「背中に忍刀」「夜陰に紛れて敵地に侵入する」という印象で描かれることが多いが、黒は夜に像が浮いて見えることから、紺色もしくは柿の熟したような色の衣装を使用していたとされる。つまり創作（小説など）の装束だと言える。また、「専用の」装束などを着用することは稀で、黒装束については、歌舞伎などに登場させる際に黒子のように観客に対して「見えない存在であること」を表現したものが後に、現実にもそのような格好で活動していたと誤認されたとする説もある。
柿渋色やクレ色の装束.
現存する「忍び装束」とされる物も、ほとんどが柿色系統の柿渋色やクレ色である。黒色よりも柿渋色やクレ色の方が安価に製造できたからとする説もある。この衣装は、元々は甲賀地方（現在の滋賀県南東部）や伊賀地方（現在の三重県西部）で使われていた山着、野良着が元とする説がある。そのため着ていて怪しまれる可能性が低いとされる。
変装.
本来の潜入工作（スパイ活動）をするには状況に合った服装（町中では町人の格好、屋敷などに侵入する場合には使用人の格好など）、すなわち変装を用いる。特に虚無僧・出家・山伏・商人・放下師（ほうかし、大道芸人、奇術師）・猿楽・常の形（つねのなり、武士や農民）の七つは「七方出の術（七化）」と呼ばれる。活動終了後・発覚後は戦うよりも逃げることに重点を置いていたため、通常は重い鎖帷子は着用しない。 漫画表現では、鎖帷子を簡略に描いたことから、網シャツのようなものを着たキャラクターデザインに発展した。背中に刀を背負うと動くとき邪魔になるため、通常は普通の武士のように腰に下げるが、床下などに潜むときは狭い所でも動き易くするため、また刀自体を盾代わりとするために背負った。
忍術.
忍術とは忍者が用いる術であるが、現存する忍術書は全て江戸期以降のものである。
印.
忍者には精神統一・護身・祈願のための修法である印が存在する。
摩利支天の法