宇宙中を旅して回り、修繕の仕事をやっていた主人公の空は、大江戸万星博覧会で、修繕をしている最中にトラブルに巻き込まれ、真選組に身を寄せていた。一方警察庁長官、松平片栗虎は「自分の額に『バカ』と描いた犯人を捜して欲しい」と真選組に依頼するも、真選組は博覧会の警備で忙しく、同時に松平の依頼も空の保護もままならなかったため、万事屋に託すが空は記憶を失っていた。自分の記憶を取り戻す為に空は万事屋で居候し、大江戸の人々と馴染んでいくのであった。
エンディングルートによっては空が万事屋で仕事を続けるなどパラレルワールドだが、銀時ルートでの高杉の台詞やたまと九兵衛が未登場であることから、紅桜編と芙蓉編の間の話と解釈できる。
ゲーム内容.
前述の通り、マルチエンディングが採用されており、主に選んだ選択肢で特定のキャラのエンディングルートが決まる。数種類ミニゲームも用意されており、フルボイス仕様である。その為、登場人物はいままでの銀魂のゲーム作品では最も少ないが、坂本、じい、星海坊主など、名前のみ登場するキャラもいる。
ドゥーニャとデイジー
ストーリー.
イスラム教徒の家庭で育ったドゥーニャ、自由奔放な地元娘デイジーは大の親友同士。しかしドゥーニャは見合い話のためモロッコへ帰郷することに。さらにデイジーが妊娠して父親がいるモロッコに行くことに。
いろは丸
概要.
なお「いろは丸想像図」（画：岡部澄雄、高知県立坂本龍馬記念館蔵）には外輪船が描かれている。いろは丸の再現を盛り込んだ福山市営渡船「平成いろは丸」の建造基本計画でも、いろは丸は外輪船として検討されている（ただし平成いろは丸は安全性・効率性のため外輪は装備しないとされた）。一方、勝海舟の『海軍歴史』はスクリュー船だったとしている。
船体調査からスクリュー船の可能性が指摘されているが、未だ不明とされ今後詳細な調査が必要とされている。
年譜.
いろは丸沈没事件.
経緯.