軍旗は、指揮官・部隊長の所在を明示する目的や、軍隊・部隊の精神的支柱として古くから用いられており、一例として古代ローマ（ローマ軍）の各軍団は固有の軍旗を有していた。世界において軍旗はその軍隊の象徴であると同時に、その国の国旗に準じ国家等を表す重要な存在である。
かつては演習地や戦場において、部隊長（連隊長）のあるところには常に軍旗（連隊旗）が掲げられ、部隊拠点の所在を明示していたが、戦術の変化や兵器および通信機器の進歩により意味を失った。また連隊長や連隊本部の所在を敵に示してしまい攻撃の格好の標的となること、上述の事情から軍旗の死守に拘泥することで臨機応変な戦闘行動や俯瞰的な作戦指揮を阻害すること、そして万一奪取されるなどの事態が起きた場合に将兵の士気に関わることなどから、列強各国の戦闘教義が進化した第二次世界大戦以降は概ね戦場に掲げられることは少なくなっている。現代では単に軍隊・部隊のシンボルとして、パレード（観兵式・観閲式）や栄誉礼などの儀式（式典）・行事のみで使用されることが多い。
同様の物として、日本の警察機動隊で使われる「隊長旗」（伝令が保持し、周囲に隊長の居場所を知らせる）がある。
歴史.
少なくとも青銅器時代以降には、軍隊を示す紋章（フィールドサイン）が戦争で使用されていた。フィールドサインとしての旗の使用は、中国やインドあたりのアジアの鉄器時代に登場したのが明らかになっている。
軍旗の使用は中世の頃に一般的になり、盾の上に示された紋章を補完するものとして紋章と共に発展した。また像に関しては、中世の騎士は兜の上に取り付けることもあった。
大日本帝国陸軍.
「軍旗」および「軍旗の意匠の旭日旗」は、五芒星（五光星）や桜星（桜花）とともに、明治最初期から「帝国陸軍の象徴」として国民に広く知られており、戦争画・写真、軍歌、メディア（新聞・ラジオ放送・ニュース映画など）、兵営公開イベントを兼ねた軍旗祭などを通して一般市民からも親しまれていた存在であった（#軍旗の意匠）。　
なお、制式・正式の名称は「軍旗」であるが「連隊旗（聯隊旗）」の通称・呼称も採用当時から多々使用されている。
軍旗の扱い.