どのジョブでも、無条件で、武器（弓と竪琴を除く）を左右の手にそれぞれ装備することができる。同様に、盾を装備できるジョブにおいては両手に盾を装備することも可能である。
前作では、防具に「重量」が設定されていたが、本作ではそれがなくなっている。
魔法.
従来の単体・全体だけでなく、新たにモンスターの種類（いわゆる「グループ」）ごとに魔法の対象を絞れるようにもなった。ただし、これは対象範囲可変型の魔法にのみ当てはまる（本作ではフレアもこれに含まれる）。後のシリーズではこれは採用されていない。
召喚魔法.
本作で初登場となった魔法系列。使うとその場に召喚獣（本作の攻略本では、「精霊」と名づけられている）が現れ、特殊な行動を行う。その効果は攻撃・回復・補助などさまざまである。
本作における召喚魔法は、召喚魔法それ自体の名前と呼び出される召喚獣の名前が異なる。以下を参照。
※「」内は召喚魔法のエフェクト後に表示されるコメントである。
乗り物.
本作では多種多様な乗り物が登場する。
バグ.
特定の状況によって引き起こされる想定外の挙動として、代表的なものを以下に挙げる。
モンスターからのドロップによってアイテム所持数がオーバーフローした際に、アイテムやジョブのアドレスが書き換えられてしまうなどの様々なバグが発生する。故意にこのバグを誘発させることによって、通常では非常に入手困難なアイテムの入手やキャラクターを通常より早くレベルアップさせることなども可能。これの応用で、戦闘中にアイテム欄を埋め尽くしオーバーフローを引き起こすことも可能である。なお、このバグが発生するプログラムは樋口勝久が担当していた。
戦闘中アイテムウィンドウを開くことによって一部補助魔法の効果がリセットされる（対象はウィンドウを開いた後の行動によって変化する）。
ジョブ.
※ジョブの外国語表記に関する情報は以下の脚注を参照。
※本節に出てくるアビリティについて、詳しくはアビリティシステムの記事を参照。
「エウレカ」で得られるジョブ.
設定.
ストーリー.
突如として大地震が世界を襲った。世界の光の源であるクリスタルは地中に引きずり込まれ、闇の魔物が解き放たれていく。
クリスタルの啓示を受け、少年たちは、まだ見ぬ世界へと冒険の旅に出た。新しい仲間との出会いと別れ、そして、大地震が生んだ魔物どもとの戦い。