幕末になって、講談師（氏名は不明）がこれらの伝記や十返舎一九作の滑稽話『東海道中膝栗毛』などを参考にして『水戸黄門漫遊記』を創作したと考えられている。内容は、「天下の副将軍」こと光圀がお供の俳人を連れて諸国漫遊して世直しをするというもので、大変な人気作となった。江戸幕府（徳川幕府）の職制に副将軍職はないが、水戸徳川家には参勤交代がなく江戸定府であったことから、家臣の中には「いったん将軍にことあるときは、水戸家当主が代わって将軍職を務める」と思いこんで「副将軍」という者もいたという。この講談話の始まりについては、一橋慶喜を将軍職に就けるため、父である水戸斉昭が裏で動いて、水戸徳川家は「天下の副将軍」であるという話を世間に広めようとしたのだという説がある。
明治になると、大阪の講釈師玉田玉知がお供を俳人ではなく家臣の佐々木助三郎（介三郎、助さん）と渥美格之進（格さん、または厚見角之丞など）の二人とする話に膨らませて、さらに人気の題材となっていった。助・格は、『東海道中膝栗毛』が持つ「弥次・喜多」の魅力を取り入れたものと思われる。明治初期の黄門物の講談は東京と大阪では演じられる筋が大きく異なっていたが、助・格を従えた大阪式のものが主流になっていったという。
徳川幕府が衰退した幕末から維新後の明治、大正、昭和の第二次世界大戦前にかけて、江戸時代と比べ徳川氏への評価が著しく低下したにもかかわらず、黄門物がもてはやされた。この背景には、実在の光圀が天皇を敬ったり楠木正成を忠臣として称えたりして、『大日本史』編纂や水戸学が尊王論や天皇制・南朝正閏論に多大な影響を及ぼしていることと関連していると考えられる。幕末から戦前の黄門物の講談・小説などでは、湊川神社へ楠木正成の墓参に行くなどの尊王論的色彩が強かった。大戦後の映画やテレビドラマではそのような尊王色は払拭されていった。
時代劇の定番として.
明治末期に日本でも映画製作が始まると、時代劇映画の定番として『水戸黄門漫遊記』ももてはやされ、戦前から戦後にかけて数十作が製作された。尾上松之助をはじめとして、山本嘉一、大河内傳次郎、市川右太衛門ら時代劇の大スターたちが黄門を演じている。黄門が老け役であることを嫌った大河内や市川のために、若侍との一人二役が設定された。
TBS版.