設定の再構築に伴い、旧作では設定のみの存在だった者や続編から登場したために共演しなかった者などにも、本作では改めて設定が起こされ、本編へ登場している。また、旧作と異なり、異星人キャラクターの多くにフルネームが設定されている。また、表記されている年齢は地球人の年齢に換算したものである。
ヤマト乗組員.
戦術科.
航空隊.
艦内常装は男女とも黒地に黄色いラインの軽装航空服にフライトジャケット。
甲板部（運用/掌帆）.
艦内常装は男女とも濃いオレンジ地に黒のライン（男女とも矢印状）のツナギにベストにキャップ。
航海科.
艦内常装は男子は白地に緑のライン、女子は黄緑地に黒のライン。
船務科.
艦内常装は男女とも黄色地に黒のライン。
技術科.
艦内常装は男子は白地に青のライン、女子は青地に黒のライン。
機関科.
主計科.
艦内常装は男女ともオレンジ地に黒のライン。
衛生科.
艦内常装は男性は水色地に黒のライン（矢印ではなく、服そのものの形状も他の科とは大きく異なっている）、女性はベージュピンク地に黒のライン（他の科と同じ服の上にワンピース状の上着を着用している。真琴のユニフォームも他の女性クルーと同じ仕様であるが、ジッパーを外してセパレートにすることでオリジナリティーを出している）、共に胸にMEDICマーク。
保安部.
艦内常装は男女ともライトグレー地に黒のライン。
空間騎兵隊.
地球.
国連宇宙局 / 国連統合軍 → 地球連邦政府 / 地球連邦防衛軍.
国連宇宙軍軍人.
イスカンダル.
大ガミラス帝星.
大マゼラン銀河サレザー恒星系を拠点とする軍事星間国家。大小マゼランの統一を成し遂げ、天の川銀河まで版図を拡大しつつある。
旧作の物語序盤と同様に、一部の人物に肌が青くない者が存在するのは、「ガミラスが植民地化した惑星の人々を帝国へ取り込んでおり、肌が青くないシュルツなどは植民地出身の二級市民」という設定が追加されたためである。
デスラー親衛隊.
政府（ガミラス）.
駐地球大使館.
帝星国防軍.
ガミラスの国軍。最高司令官は総統が兼任している。
銀河方面軍.
冥王星前線基地.
反体制派.
デスラー政権に反旗を翻す勢力。現体制に不満を持つ点は共通だが、思想や求めるものは異なる。
ディッツ派.
帝星ガトランティス.
軍.
グタバ遠征軍.
ジレル.