御翼はヒロインというよりも賑やかしという位置づけに置かれ、甘やかされがちな桜姫に対するストッパーであると同時に、純真で幼いキャラクターとして設定された。彼女の純真さの表現するため、温泉の場面の立ち絵を全裸にする予定だったが、立ち絵にモザイクを入れるのはどうかということになり、腰にタオルを巻いたデザインに変更された。その一方で、他のスタッフからユーザーの人気が出ないのではないかと懸念されることもあった。
歌夜も設定やデザインの変更があったキャラクターであり、当初は何十年も前から四方山を見守る存在として設定されていたが、設定が重すぎると判断され、親戚である羽に設定が割り振られた。また当初は、歌夜の高祖母が祭りの審判である大婆様として登場する予定で、一部のボイスの収録まで行われていたが、台詞が多すぎるということで、大婆様の役割も羽に割り振られた。また、歌夜の祖父である誠太郎も、設定上の存在となった。最終的に歌夜は、かわいさよりも面白さを優先したトラブルメーカーに仕上がった。
静波と夏葉は、人気が出るようにデザインされており、初期案がほぼそのまま通った。一方、彼女たちの物語の内容は型破りにするという方針が立てられ、終盤の展開は夏葉のヒロイズムを強調した内容となっている。
主人公である優太は、桜姫を甘やかす存在として仕上がったキャラクターであり、椎原は「ヒロインに対して恋人ではなくお母さんの気分を味わえるゲームになってしまいました(笑)」とインタビュー内で振り返っている。また、初期案では優太の家にある開かずの間に桜姫の母・妃咲が家政婦として隠れ住んでいるという設定や、上坂邸の温泉が最終決戦の地への入り口となる設定があったが、物語のバランスが崩れるおそれがあったことから、没となった。優太のペットであるブライアントは、歌夜が買い与えたというエピソードから発展して作られたキャラクターであり、当時近鉄バファローズに所属していたラルフ・ブライアント（プロ野球選手）にちなんで名付けられた。ブライアントはミニキャラを担当した犬・よしきによるデザインに影響される形で、桜姫のへっぽこぶりを強調するキャラクターに仕上がった。
妃咲は桜姫のけなげさや、祭の多重構造を表現するために作られたキャラクターでもあり、下原は彼女の立ち位置をタキシード仮面にたとえている。