軍人恩給の復活により、井上の生活は一応安定したが、恩給のみでの生活は楽ではなかった。この時期、矢野志加三中将は日平産業の社長を務め、実業界で一定の地位を築いていた。矢野は、井上の生活を心配して、井上を一流会社の顧問に推薦したいと再三打診したが、井上は頑なに拒否した。また、戦後のこの時期までに井上と接触した旧部下有志（主に、第四艦隊長官時代の幕僚と、兵学校長時代の教官・教え子）の協力による金銭援助すらも、井上は全て断っていた。
人物.
山本善雄少将によれば、「（井上が）面白味がない、人間的に冷たいと言う人がいるがそれは違うと思う。公務の時には表に出ない内面の優しさや温かさを、女が敏感に感じ取っている。だからあれだけ芸者たちに慕われるんだ」という。千早正隆中佐は「井上は日本海軍で稀に見る軍政家であり、そして教育家であった」と評価する。井上の支那方面艦隊参謀長時代・海軍次官時代の部下で、戦後第二復員省総務局に所属していた中山定義中佐によると、ある日井上が、ボストンバッグに長井名産らしい小ぶりのミカンを詰め込んで、中山の職場に慰問に来てくれた。この際の井上は、きちんとした背広を着て、あまり貧乏くさくはなく、なかなか元気そうであった。中山は、元の大将・中将で、旧部下の復員官にこのような気配りをしてくれたのは井上だけだったと言う。
戦略.
軍務局長の井上と米内光政海軍大臣、山本五十六海軍次官の海軍省の要職にいた三人は「海軍省の左派トリオ」と呼ばれ、「日独伊三国同盟」に反対していた。
井上は、三国同盟締結の得失を次のように考えていたという。
井上が三国同盟に強力に反対した最大の理由は、ドイツが提案してきた条約案に自動参戦義務条項 「独国または伊国が戦争状態に入った場合は、日本は自動的に戦争に加担する」があったためである。ただし、井上は日独防共協定には肯定的であった。満州事変以後の国際的孤立状態からの脱出と共産主義に反対の立場からである。
奥宮正武（太平洋戦争時、第二航空戦隊参謀等）は「とかく、頭のよい人は、実戦のさいには、粘り強さに欠ける例が多かった。井上中将もその一人であった」「(米内を補佐して）終戦工作に献身した事は高く評価すべき」と評している。
教育思想.