電位依存性陰イオンチャネルは、イオンチャネルと付くものの、実のところ親水性の比較的小さな分子をも通過させられる。このため、電位依存性陰イオンチャネルが存在することによって、膜の内外でのイオンや親水性の小分子の交換が促進される。また、電位依存性陰イオンチャネルはミトコンドリアにおいて、他のタンパク質や他の分子との相互作用の調節にも関与している。なお、ミトコンドリア外膜の電位依存性陰イオンチャネルが閉鎖されると、ミトコンドリアの機能は抑制されると考えられている。
細胞の代謝の調節への関与.
少し巨視的に、細胞レベルで見てみると、ミトコンドリア外膜の電位依存性陰イオンチャネルは、細胞における代謝の調節を行っている。まず、真核生物においてATPの大部分は、ミトコンドリアにADPやピルビン酸などが供給されることによって、ミトコンドリア内で作られている。そして、ATPやADPやピルビン酸やリンゴ酸などと言った代謝物質が、ミトコンドリア外膜を通過する際に、この電位依存性陰イオンチャネルが利用されるのである。このことからも明らかなように、ミトコンドリア外膜の電位依存性陰イオンチャネルは、ミトコンドリアにおいて、様々な代謝経路に関わっていることが判る。さらに、ミトコンドリア外膜の電位依存性陰イオンチャネルには、真核生物の細胞質の側（ミトコンドリアの外）でATPを利用して基質をリン酸化する酵素、例えば、ヘキソキナーゼ、、クレアチンキナーゼなどが結合することが知られている。特に、ミトコンドリア外膜の電位依存性陰イオンチャネルに結合したヘキソキナーゼは、細胞質の側で行われている解糖系と、ミトコンドリア内部で行われている酸化的リン酸化とのバランスを取る役割をしているのではないかと推測されている。
アポトーシスの際の動作.
既述の通り、ミトコンドリア外膜の電位依存性陰イオンチャネルが閉鎖されるとミトコンドリアの機能は抑制されると考えられるわけだが、真核生物の細胞がアポトーシスする際、ミトコンドリア外膜の電位依存性陰イオンチャネルは閉鎖されることが知られている。
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