前作同様、隊列はメニュー画面で変更が可能。システムは変わっておらず、「上」に配置したキャラクターほど敵の攻撃を受けやすい。移動中は最前衛（一番上）のプレイヤーキャラクターのみが表示される。ただし、最前衛のキャラクターが石化している場合は次の（石化していない）キャラクターに表示が切り替わる。
前作では肉とお金しか落とさなかったが、倒した敵がアイテムを落とすシステムが追加された。本作では、装備品を身に付けている敵がその装備品を直接落とすシステムになっている。したがって、侍や人型メカなどの、人間、メカ系の敵（アイテムで攻撃してくる敵）は、前作では肉を落とさないため倒しても所持金以外の報酬がなかったが、本作では肉こそ落とさないがドロップアイテムを狙えるようになった（肉とアイテムを落とすモンスターは、どちらか一方しか落とさない）。
敵とのエンカウントが歩数に依存しているため、見た目はランダムエンカウントに見えるが、実際はランダム性はないため、セーブおよびリセットを繰り返したとしてもエンカウントを避けることは不可能になっている。
設定.
ストーリー.
世界設定.
登場人物.
プレイヤーキャラクター.
ノンプレイヤーキャラクター.
新しき神.
秘宝を手にして強大な力を得たことで、人々に「新しき神」と呼ばれるようになった者たち。
音楽.
当初は植松伸夫が『ファイナルファンタジーIV』と並行して本作の作曲も行う予定だったが、予定を変更し、当時スクウェアに入社したばかりの伊藤賢治が本作の楽曲の半数を制作することとなった。
伊藤は幼少時からピアノを習ってきたものの、打ち込みの経験がなかったため、入社してからの数か月間は機材をそろえながらコンピュータによる作曲について勉強した。
植松は楽曲制作にあたり、ファイナルファンタジーシリーズとの差別化を意識していた。
メモリの容量に制約があったことから、河津は曲目と使用場面を想定したうえで植松と伊藤に楽曲の発注を行った。
曲目一覧.
曲名（使用される主な場面）
なお、ゲームに収録されているものとは順番が異なる。
関連書籍.
ゲームボーイ版、いずれもNTT出版より刊行。
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三重県高等学校一覧（みえけんこうとうがっこういちらん）は、三重県の高等学校の一覧。
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