心が物事に捉われていなければ、素早く動けるが、素早いことが重要なのではないと説く。素早く動かなければ、という思いも、また心が捉われている証しであり、心が止まっている状態であるとする。
名を呼ばれて、反射的に「お?」と応じるのが、「不動智」の状態であり、思いをめぐらした末に「ご用は」と応えるのが、「迷い」＝心が止まっている状態であると説明している。
心の置所.
この問題に対する答えとして、沢庵は、どこにも置かないことが仏法の境地であるとし、必要に応じるためには一ヶ所に定めるなとする。孟子の「放心を求めよ」も間違いではないが、仏法の境地の前では、まだ低い段階（俗的境地）であると認知している。
本心妄心.
「本心」とは、一ヶ所に心が留まらず、広がった状態を指し、「妄心」とは、一ヶ所に心が留まり、固まっている（止まっている）状態であると説明する。水と氷で例えており、溶かした水だからこそ、幅広く役立つと説く。
有心の心、無心の心.
前者は「妄心」と同意で、後者は「本心」と同意であると説明している。
水面に浮かんだひょうたんを捺（な）着＝手で押したところで横に横にと転がり逃げ、さらに押したところで逃げられ、一ヶ所に止まらない事象を引用して、高い境地に達した人は、このひょうたんの如く、止まるところはないと説く。
「応（まさ）に住する所無くしてその心を生ず」と読むとしている。心を止めないまま、やろうと思わなければならないことを説く。
孟子の「放心を求めよ」の言葉（俗的境地）からさらに高い仏法的境地に至るためにはと考察する。
急水上打毬子、念々不停留.
「急流に投げた毬は少しも止まらない」という言葉から一つの所に止まらないことを示す。
前後際断.
以前と今を切り離し、心を止めぬことを示す。
敬の一字.
この言葉は心法を表したものであるとし、自心を治めることを説く。
影響.
『不動智神妙録』の思想は、他書にも影響が見られ、『願立剣術物語』第四十段目の「迷いたる目を頼み、敵の打つを見て、それに合わんとはかるは、雲に印の如くなり」は当書の「無明住地煩悩」で説かれている事と同じであり、他にも「ものに取り付き、止まるところに閉じられ、氷となり、水の自由なる理を知らず」も当書の「本心妄心」で説かれている事と同じである。
太阿記