防空識別圏境界が近づくと、ロシア政府から不審船追跡におけるロシア側海域通過の許可が下りた。同時にロシア側による不審船追跡が開始され、ロシア側からも停船命令が発せられた。後にロシア側の責任者は「この不審船が、もしもロシア領海に侵入していれば、即座に撃沈するつもりだった」と語っている。
命がけの突入計画.
逃走.
事件の影響.
追跡の際、海上保安庁の船艇の速力が不審船や護衛艦に比べて大幅に劣り、有事に対応できないことが判明したため、海上自衛隊との連携強化に加え、以降に新造される巡視船艇の能力が大幅に向上されるようになった。また、海上自衛隊も高速艦艇の整備を行った。
九州南西海域工作船事件
概要.
これを受けて、巡視船は漁業法違反（立入検査忌避）容疑で上空や海面への威嚇射撃を行ったが、なおも不審船が逃走を続けたため、警告を発した後に海上保安庁法に基づいて、機関砲による船体射撃を行った。
事件発生直後は「九州南西海域不審船事件」などと表現されていたが、沈没した不審船を海底から引き上げた結果、北朝鮮の工作船であることが判明し、現在では「九州南西海域工作船事件」と称される。
事件の経過.
米軍情報と不審電波.
不審船の発見.
海上保安庁と自衛隊の出動.
通報を受けた海上保安庁は、これを捕捉すべく追尾することとし、第十管区（鹿児島）、第十一管区（那覇）本部の稼動可能な航空機および巡視船艇を出動させた。
海面や空中への威嚇射撃と船体への射撃.
不審船からの反撃と銃撃戦.
このRPG発射の様子は、上空を飛んでいた海上保安庁機の採証装置（赤外線カメラ）に映像として記録された。「あまみ」から撮影していたビデオ映像にも、画面は真っ暗だったが、飛翔体が「あまみ」の上を通過した音が記録されており、これはRPGの弾体が通過した音と推定されている。
自爆・沈没.
その後の捜査で、爆発の直前に不審船から北朝鮮本国に「党よ、この子は永遠にあなたの忠臣になろう」「マンセー」とのメッセージを含んだ電波が発信されたことが判明しており、自爆したものと推測された。
事件後.
漂流者の発見.
船体の引き上げ.
工作・犯罪関連者の検挙と指名手配.