この時期からプラトンに傾倒したようで、フィレンツェの大司教が、プラトニックの異端（当時はまだアウグスティヌスのキリスト教の信仰が強く、ギリシアの学問は異教徒の学問と考えられもしていた）に向かって逸脱する可能性を心配し、ボローニャで医学とトマス・アクィナス（おそらくキリスト教と異教徒の学問を真剣に考えた人だから）の仕事両方を研究するようにアドバイスした。
またフィチーノは後にも『ニコマコス倫理学』を大いに利用し、アリストテレスは否定していない。
プラトン・アカデミーの筆頭.
また、コジモが創立した私的なサークル、プラトン・アカデミーの中心となり、同サークルの活動によりポリツィアーノ、ピコ・デラ・ミランドラらに直接的に影響を与えた。
著名人として.
ロレンツォ没後.
思想.
フィチーノの人間観は次のようなものである。人間の魂は肉体に捕らえられている。人間の肉体と魂の一部（五感など）は動物と共通であるが、理性と知性を持つ点で動物と異なる。理性は五感から受け取った物事を分析、判断し、また想像力を働かせる能力である。また、知性は直接真理、イデアに到達し神の領域に近づく能力である。この意味で、人間は動物と神の中間にあり、様々な葛藤にさいなまれる不安定な存在であるが、理性によって現世で正しいことを行うとともに、知性によって真理と一体化することができる。
「フィチーノは瞑想に加えて学問的研鑽を積むことによって、人間は完成の域に近づき、現世の幸福のみならず来世での幸福も実現すると考えたのである。」「神が人間に向かうのではなく、人間が主体的に自らを高めることによって近づくのだ。人間はその能力を神の愛によって与えられたとする。」
占星術・自然魔術.
厳格なキリスト教の立場からは異端ともみなされかねない思想であったが、フィチーノ自身は神話や魔術、プラトン哲学はキリスト教と一致するものと考えていた。
またフィチーノはゾロアスターを東方の三博士の一人とみなすという奇抜な推論をしたようである。
またフィチーノは最近では自然魔術（自然の諸物の間の対立と調和・反感と共感・分離と結合を明らかにするもの）の祖と考えられるようになってきているようである。
魂の不死.