また、すべてのコマンドが常に表示されておらず、場面によって使用できるコマンドが限られている事も特徴である。そのため、ある人物から話を聞きださなければならない場面などでは「ばしょいどう」コマンドが表示されず、全ての情報を聞き出した後に「ばしょいどう」コマンドが表示されるなど、ストーリーの流れを遮らない配慮がなされている。
「しらべる」コマンドの後に「どこ?」コマンドを選択することにより、表示画面内に指の形をしたカーソルが登場し、カーソルを上下左右に動かす事で画面内の一部を調べることが出来るようになっている。
ゲームを終了する際は「そうさやめる」コマンドを選択することで、ディスクカードにセーブデータが保存できるようになっている。
また、ゲーム上の演出として、登場人物が重要な手がかりを話した際や意外な情報を話した際などには音が鳴るようになっている。それ以外にも、ストーリー設定や登場人物のセリフ、音楽などでホラーをイメージさせる演出がなされている。
ディスクシステム版で後編を始める際には、一度前編にディスクを挿入し「ちょうささいかい」を選択しないとプレイできないようになっている（後編のみを挿入した場合はエラーメッセージが表示される）。Wiiのバーチャルコンソールでは、後編をプレイする際には前編クリア後のタイトル画面で「ちょうささいかい」を選ぶとプレイが可能となっている。
コマンド一覧.
以下のコマンドを使用してゲームを進行していく。それぞれのコマンドの後にはさらにサブコマンドやカーソルが表示される場合がある。ただし、必ずしも下記用途の通りに使用されるとは限らず、状況に応じて選択肢の意味を適切に解釈しなければならないケースが度々発生する。例えば「そうさやめる」を会話相手への心理的揺さぶりとして使用したり、「みせる」は必ずしも所持品に対して行われるものではない場合がある。
設定.
ストーリー.