大宰府の緒方惟栄はかつて平家の家人であったが、朝廷からの院宣を受け取り、平家を匿うことはできないと退去を求める。苦難の道行きの末筥崎にたどり着いた平家だったが、周囲は敵ばかりであり、絶望した清経は入水自殺を遂げる。その死を見たびわは静御前らとともに、隠棲していた母に出会う。母との対話の中で自分にできることは「祈る」ことであると気づいたびわは、平家のいる西を目指す。一方頼朝によって派遣された源義経は法皇と対立した義仲を討ち、一ノ谷の戦いで平家を打ち破る。
平家は屋島に逃れるが、維盛はひとり一門を離れ、滝口入道のもとで出家、びわとの束の間の再会の後に補陀落渡海を遂げる。資盛は法皇に赦免願いの手紙を書くが返事は来ず、代わりに伊子の手紙を携えたびわが資盛のもとに訪れた。びわは祈りをこめて平家を語るため、すべてを見届ける覚悟を決めていた。頼朝は平家を根絶やしにすることを決め、義経の攻撃によって屋島は陥落、平家の軍は壇ノ浦に追い詰められる（壇ノ浦の戦い）。
戦は当初船軍に長ける平家方が優勢であったが、イルカの大群の襲来とともに風向きが変化、援軍も到着し源氏方が優勢となる。これまでと悟った時子は、安徳天皇を抱いて入水する。徳子もそれを追って入水するが、びわによって制止される。しかし知盛ら平家の人々は次々に海中に没していった。
戦後、後白河法皇はひとり、出家した徳子の元を訪れる（大原御幸）。
スタッフ.
監督の山田尚子が京都アニメーション以外で作品を手掛けるのは初となる。また、キャラクター原案の高野文子も、アニメーション作品のキャラクター原案を務めるのは本作が初である。
内容.
これまでに発表してきた楽曲のなかからウェブサイトやはがきによる投票で収録曲を厳選し、全曲リアレンジと歌い直しをして収録された。
フラチオカルブ
調製.
フラチオカルブは、ブタノールをホスゲン、メチルアミン、二塩化硫黄およびカルボフランと反応させることで得られる。
性質.
フラチオカルブは水に不溶の無色の固体である。有効成分として黄色液体になることもある。
使用.
フラチオカルブは、トウモロコシ、菜種、[[モロコシ|ソルガム]]、テンサイ、ヒマワリ、などの地面に生息する昆虫に対する[[殺虫剤]]として使用される。 [[コリンエステラーゼ]]阻害剤である。
認可.