前述の通り、高速バス乗り場は原則としてバスタ新宿に集約されたが、以下の一部の路線や便については従来通りの場所での発着を継続している。乗降場の分布をバスタ新宿開業後の存続の有無と東京側の運行会社ごとに区分すると、以下のようになる。
新宿駅西口バスターミナル.
東京空港交通の以下の路線が新宿駅西口から出発する。
また、成田空港発・羽田空港発（一部を除く）の到着便の降車場としても使用される。
東急歌舞伎町タワー.
廃止された乗降場.
以下ののりばは、特記なき限りバスタ新宿開業に伴い高速バスの停留所としては廃止された。
新宿駅JR高速バスターミナル.
「新宿駅JR高速バスターミナル」は東京都渋谷区千駄ヶ谷五丁目の、NTTドコモ代々木ビル向かい（JR代々木駅東口北側）にあったバスターミナル。「新宿駅新南口（代々木）」とも案内された。ジェイアールバス関東が運営するバスターミナルで、JRバス各社と共同運行会社が発着した。
概要.
施設.
上記の通り元々一時的に設置されたバスターミナルであり、JRの線路と道路に挟まれた場所に設けられたバスターミナルであることから、ホーム数が少なく、基本的には乗車のみの取扱いとしており、新宿行きの路線は東京ディズニーリゾート発便を除いて新宿駅東口（ルミネエスト前降車場または新宿アルタ向かい降車場）停車となっていた。
待合室と小規模な売店の他、ジェイアールバス関東新宿営業支店が入居しており、JR高速バスの予約・発券を受け持つ窓口があった。ジェイアールバス関東担当便の中央高速バス路線やジェイアール東海バスの渋谷・新宿ライナー静岡号・渋谷・新宿ライナー浜松号は旧・新宿高速バスターミナルに発着していたため、予約・発券業務も同ターミナルで行っていた。
旧・新宿高速バスターミナル.
ヒルトン東京.
西新宿にあるホテルヒルトン東京の正面玄関前に日本中央バスの乗降場があった。最寄駅は大江戸線都庁前駅、丸ノ内線西新宿駅。なお、東京空港交通が運行する新宿地区発着の空港連絡バスは引き続き停車する。
高速バス西新宿.