特殊列車（とくしゅれっしゃ）とは、通常の旅客や貨物の輸送とは異なる、特殊な使命を持った列車である。その多くは臨時列車であるが、排雪列車の一部などはあらかじめダイヤに組み込まれているものもある。目的に応じて専用の事業用車を使用して運転されることも多い。
特殊列車の種類.
お召列車.
天皇、皇后、皇太后が使うために特別に運行される列車。
団体列車.
特定集団（団体）が旅行する際に、一般客の乗る普通の旅客列車と別に設定されて貸しきる列車。
試運転列車.
試運転列車（しうんてんれっしゃ）とは、その名のとおり、車両の試運転のために運転される列車である。
主として以下のような目的で運転される。
回送列車.
回送列車は厳密には特殊列車ではないが、非営業列車の一種である関係上、特殊列車と位置付けられる場合もあるため、便宜上記載する。
排雪列車.
救援列車.
救援列車（きゅうえんれっしゃ）とは、事故の際の救援および復旧作業のために運転される列車である。救援用の資材を積載した救援車が使用される。また、車両故障などのために自走できなくなった列車を牽引するために機関車が単独で現場に向かう場合や、取り残された乗客を輸送するために代わりの車両を送り込む場合も救援列車として扱われる。
工事列車.
工事列車（こうじれっしゃ）とは、線路の工事のために運転される列車である。営業運転ではない事業用の列車であり、以前は定期列車に位置づけられるものもあったが、近年は臨時列車として運行されるため、略して工臨（こうりん）とも呼ばれる。通常は、線路の保守を担当する事業者（JRであれば各旅客鉄道会社）が運行するものを指し、工事現場までレールや資材を運搬する列車や、バラストを撒くための列車などがある。
工事用資材輸送の列車と言ってもその解釈は広く、直接工事現場へ輸送するものではないバラスト輸送や、工事列車用貨車を検査のために回送する列車も工事列車として取り扱われることがある。橋梁の架け替えのためのクレーン車（鉄道では操重車と呼ぶ）を現場まで牽引する列車などもその一種である。
配給列車.