ジョーンズは、ネーション・オブ・イスラム（）を人種差別主義、かつ性差別主義であると見做しており、サンフランシスコので近接している位置に所在していることもあって、ネーション・オブ・イスラムと人民寺院の間で暴力を伴う抗争が発生することを危惧していた。彼は、教団のサンフランシスコ本部での火災について、ネーション・オブ・イスラムが原因であると主張し緊張を煽った。人民寺院信者のアル・ミルズが、ネーション・オブ・イスラムの構成員の写真を撮影したことで口論となった後、ジョーンズは警告を発するために、屈強なアフリカ系アメリカ人の人民寺院警備員をネーション・オブ・イスラムのモスクに送り込んだ。
アンジェラ・デイヴィスとアメリカインディアン運動.
デイヴィスは、人民寺院お気に入りのアフリカ系アメリカ人共産主義者と見做されていた。デイヴィスは人民寺院を訪れ、彼女の為に集会を行った。彼女は、ジョーンズのサンフランシスコのアパートメントで、ジョーンズと人民寺院の代表補佐官と頻繁に会話を交わしている。デイヴィスとの関係は、ジョーンズの政治的信任をより強化した。
離反者と陰謀.
ボブ・ヒューストンとジョイス・ショー.
ティモシー・ストーンとその家族.
教団は、しばしば政府機関や他の人々による陰謀の標的であると見做されており、これらの陰謀を教団の文献の中に含めることもあった。
教団はまた、脱走した元信者のアル・ミルズ（旧名：エルマー・マートル）とジェニー・ミルズ（旧名：ディアナ・マートル）を取り巻く陰謀を見た。ミルズ夫妻が脱会する前から、ジョーンズは自身をウラジーミル・レーニンの生まれ変わりであると主張していており、かつてジェニーに対して「レーニンは弾丸を体に持ったまま死んだ。私もそうするだろう」と話していた。教団は「転換委員会」（）の分派として、「マートル委員会」（）を結成し、まだ教団信者であった娘の助けを得て、夫妻の家に侵入して文書を盗むなどの活動を行った。最終的に、夫妻はストーンら他の教団離反者たちとの会合を主催し始めた。