臨床現場では一般的な診断名であるが、正当な臨床単位であることを確立するデータは不足している。適応障害とうつ病とを区別できるような、生物学的データによる証拠は存在しない。
治療.
一般に適応障害は長く続かず、時間経過と共に消失する。自然に軽快することも多い。そうした事実は、治療に関する研究の不足を示唆している。
心理療法.
心理療法の有用性は、臨床的な証拠に強く裏付けられている。対人関係療法や問題解決療法、他にも個々の心理療法の有効性は報告されているが、そうした心理療法同士で比較した研究はない。一方、抑うつや不安を伴う適応障害に対する、抗うつ薬などの医薬品の使用は適切なエビデンスがないため避けるべきである。
認知行動療法.
適応障害への認知行動療法は有効であり、ストレスを感じる出来事や問題に対し、心理的苦痛が軽減する解釈・思考方法（認知）と対処行動（行動）を習得できるよう、支援が行われる。
治療者は、心理教育や認知再構成法、リフレーミングやマインドエクササイズ、リハーサルやロールプレイング、コーチングやガイダンス、リラクセーション法や活動スケジュール表、問題解決法などの認知行動療法の諸技法を用いて、患者をサポートする。これらを通して、ストレスが軽減される思考方法や対処行動を患者と治療者が協同で模索・練習していき、機能的な思考方法（「現状や他者の行動を肯定的にとらえる」・「自分自身を責めずに認める」・「自分が考えているほど、周りは自分のことを何とも思っていないことを把握する」など）や対処行動（「抱え込まずに相談する」など）を身につけられるようサポートする。
また、人間関係における適応をサポートするため、人とうまく接するための社会的スキルを育成するソーシャルスキルトレーニング (SST) やアサーショントレーニングを用いた支援も行われる。
なお、適切なストレス管理を支援していくことも治療目標の一つであり、気分転換法（「ストレス管理#技法」を参照）の発見なども症状緩和の一助になるとされる。
環境調整.
適応障害はその診断基準にある通りストレスが原因であるため、それが除去されれば症状は改善される可能性がある。例えば、人事異動で部署を変えたり、引っ越したりするなど、現在の環境を変えることで病状が改善される可能性がある。