ベイコンはバークリーが採った政策に最も反対する者の中から指導者となり、インディアンとの戦いを志願した者の中から「将軍」に選ばれた。作戦計画の費用を負担することも約束していた。インディアンに対する作戦実行の間、総督はベイコンを反逆者と宣言した。
ベイコンとバージニア議会.
反乱の影響と評価.
ベイコンの反乱は奥地にいた農夫たちの間の不満の結果であり、法律を自分達のものにして政府の腐敗と抑圧に反抗した。バージニア住民の多くが負債を抱えていた。紙幣の力を頼んで借金することはイギリス政府に止められ、商人階級に対する不満が更に募った。反乱の支持者の多くは年季奉公者や奴隷であり、バージニアの人口の大半を占めていた。
歴史家達は、ベイコンが政権を掴んだ間に成した最も重要な改革は武器を取る権利を認めたことであり、普通のものが敵対的なインディアンから自分を守るだけでなく、専制的な政治に反抗できたということであると指摘してきた。バークリーが権力を回復したあとで、直ぐにこの権利を撤廃した。ベイコンの反乱は、後に植民地の人々の武器を持つ権利の主張について動機のひとつとなった可能性があると、歴史家のミラーは主張している。やはり歴史家のスティーブン・サンダース・ウェブは、ベイコンの反乱がイギリス内戦に根源を持つ革命であり、アメリカの独立に繋がるものだったと指摘した。
しかし、ベイコン自身には民主化の動機などはなく、目的はむしろインディアンの征服であり、その支持者には有産・有力者も多かった。先住民に対しては、バークリーのほうが一貫して妥協的だったことも無視できない。近年の歴史家はより距離を置いた視点から反乱を見る傾向にあり、圧政への抵抗や独立革命の起源として理想化するのではなく、頑迷で利己的な二人のリーダー（ベイコンとバークリー）の権力闘争という評価をしている。特権に反対する運動が、インディアン征服の急先鋒と結びつくという、その後の米国史で繰り返される悲劇の原型との見方も存在する。