後鳥羽上皇による承久の乱は鎌倉幕府の勝利に終わったものの、鎌倉幕府が朝廷より征夷大将軍としての任命を受けて成立している以上、朝敵とされれば政権としての正当性を失いかねず、摂家将軍は安定性を欠いていた。実際、頼経が傀儡であることを嫌い幕府の実権を北条氏から奪取しようとしたことは、幕府及び北条氏が摂家将軍に見切りをつける大きな要因となった。その点、宮将軍は鎌倉幕府と朝廷を結びつける役割を果たし、幕府の存在自体を正当化させる上で非常に大きな意義を持った。
宮将軍と両統迭立問題.
一方で、後嵯峨天皇の段階になって宮将軍が成立した背景には朝廷側の事情も存在していた事実が近年指摘されている。
これまで宮騒動及び摂家将軍制の終焉について、九条頼経と北条氏の対立という幕府側の問題だけで語られる傾向があったが、近年になって同時並行的に承久の乱で佐渡国に流された順徳上皇の関係者（生母の修明門院や皇子の忠成王ら）が後嵯峨天皇を排除して皇位を自己の系統に奪還するために頼経の父である元関白の九条道家に接近しており、土御門上皇系の皇統（後嵯峨天皇）・西園寺家と順徳上皇系の皇統（忠成王）・九条家の対立に発展していた朝廷内部の事情が明らかにされている。こうした状況下で後嵯峨上皇は幕府との連携を強化することで、順徳上皇系に対する牽制を図ろうとしたと考えられ、幕府側から申し入れられた宮将軍の構想は渡りに船であったと言える。
最後の将軍となった久明親王の息子の守邦親王は、後深草上皇の孫王にあたるため、本来であれば「守邦王」である筈であるが、将軍宣下の翌日に親王宣下を受けている。天皇や院との猶子関係の無い孫王が親王宣下を受けることは惟康親王の先例によるものと思われるが、守邦の場合は孫王身分のまま親王宣下を受けており、極めて特殊な事例であった。また、孫王でありながら鎌倉で生まれ、幕府滅亡後に恐らく鎌倉で没したと推定され、京都の地に一度も足を踏み入れることなく生涯を終えたという点でも極めて特殊な存在であった。