タイトルの通り、時代劇『水戸黄門』のテレビ漫画＝アニメ版である。内容も一般的な『水戸黄門』の形式を踏襲しており、ほぼ毎回「旅先で悪徳役人や悪代官、盗賊が民衆を困らせようと悪事を働く→黄門一行が懲らしめる」という、多くの水戸黄門作品と同様のストーリー展開だった。それまで多く製作された各種映画・ドラマ版とは直接の関連はないが、ストーリーの様式や徳川家紋入りの印籠を見せて平伏させるなど、パナソニック ドラマシアター（旧ナショナル劇場）版の水戸黄門からの強い影響が見られる。
黄門様が印籠の葵の御紋のアップをバックに立ち、助さんと格さんの口上が流れるシーンなどで流れるBGMは、『宇宙戦士バルディオス』と同じモチーフである。
脚本構成の伊東恒久は「『水戸黄門』というと、大人のもの（年齢層高めの視聴者中心）。アニメならではのリアリティを出すため、この企画はまずそのイメージを崩すところから始まった」と話している。
放映状況・視聴手段.
登場人物.
放送局.
系列は当時のもの。
海外放送.
旧設医科大学
光学活性
証如
生涯.
※年齢は、数え年。日付は文献との整合を保つため、いずれも旧暦（宣明暦）表示を用いる（生歿年月日を除く）。
宗主としての活動.
本願寺の住職として証如は、報恩講をはじめ、歴代住職の命日法要などの各種行事を取り仕切った。各地域の帰依者へも法宝物を授与し、全国の門徒と宗教的な繋がりを結んだ。門徒側も宗教役による勤仕が求められていた。
寺内では、領主として寺内町を統治しており、近隣の領主との交渉も行った。寺内町から年貢・地子を収得する一方、外部権力から寺内町の諸公事免許などの特権を得ていた。検断行為もしており、寺内町での紛争における自力救済行為を取り締まるなど、証如の支配は戦国大名の領主支配との共通性も見出されている。
証如の側近.
実従：蓮如の二十七子。没前の証如から後事を託された。実従の日記『私心記』は、証如の日記である『天文日記』とともに、大坂本願寺における証如の動向を伝える史料として使われている。
下間頼玄：頼秀、頼盛兄弟の父。頼玄の一流は、本願寺の僧俗両面にわたり重要な役割を果たした下間氏の嫡流であった。
下間頼秀、下間頼盛：頼秀と頼盛は兄弟。享禄の錯乱に深く関与し、天文初期の細川晴元勢との争いでは、頼秀が指揮をとったとされる。