豊臣政権や江戸幕府は、天下普請として政権が直轄する城の築城を、各地の大名に請け負わせた。このことにより、織豊系城郭の技術が諸大名に広まり、各地に織豊系城郭の要素を取り入れた城が多く現れた。
江戸時代.
江戸時代以降の城は、軍事拠点としての意義が縮小し、政治を執り行う政庁としての役割が強くなる。藩の御用金や年貢米を保管するための蔵が城内に設けられ、これらを守ることが城の主な機能となった。また藩の財政を司る勘定所が設置され、歳出と歳入の計画の立案と記録が行われた。
幕末.
明治新政府樹立後に築かれた城も存在している。千葉県の松尾城がこれにあたり、横矢掛かりを重視した稜堡式を取り入れ、役所と藩知事邸を分離するなど特徴の多い城郭であった。これらの新期城郭は廃藩置県により工事が中止になったものがほとんどである。
近代以降.
廃城令.
なお、明治時代から太平洋戦争終結に至るまで軍事施設として近代要塞（東京湾要塞、虎頭要塞など）や野戦陣地（西南戦争、硫黄島の戦い、沖縄戦など）が構築された。これらを「日本の城」に含めるかは議論がある。
城郭建築保存運動.
復興と復元.
第二次大戦期の現存建築の損失.
コンクリートを使って近現代に復元された天守なども経年劣化が進んだり、耐震性不足が露呈したりしている。このため大坂城で溶液を流し込んでコンクリートを再アルカリ化させて強度を増すなど延命・補修が行われている。
構造.
地勢による分類.
他に水域である海、湖、河川に面した特徴から水城といった分類もされている。
縄張.
築城に際しての基本設計を縄張（なわばり）あるいは径始・経始（けいし）といい、その中心は曲輪の配置にあった。“縄張”の語源も曲輪の配置を実地で縄を張って検証したことに由来するとされる。近世に入ると、軍学者たちにより、様々な分類・分析がなされた。縄張の基本的な形式としては、曲輪を本丸・二の丸・三の丸と同心円状に配置する「輪郭式（りんかくしき）」、山や海・川を背後に置き（後堅固）本丸がその方向に寄っている「梯郭式（ていかくしき）」、尾根上などに独立した曲輪を連ねる「連郭式（れんかくしき）」などがあるが、実際にはそれらの複合形を取ることが多い。
奄美群島・沖縄県のグスク.
アイヌのチャシ.