鎌倉時代中期に「遊行上人」と呼ばれた一遍は、熊野権現の神託により念仏の信仰を深め、身分の上下や貴賤の別、穢れの有無、また善人・悪人の区別、さらには信心の有無をさえ問うことなく、万人は阿弥陀仏によって救われるのであり、その喜びは念仏によってあらわされるべきだと説いた。北は陸奥国江刺から南は薩摩国・大隅国に至る諸国を遍歴し、「南無阿弥陀仏決定往生六十万人」と刷られた札を配り、阿弥陀仏への感謝を踊りで表現する踊念仏を通じて民衆や武士に教えをひろめた。この教えは、その場に居合わせた人がつくる集団という意味で当初は「時衆」と呼ばれた。これが今日の時宗である。一遍は生前に自らの著作を全部焼いてしまったが、死後、弟子たちが『一遍上人語録』としてその教義をまとめた。
一遍没後、他阿弥陀仏（真教）があらわれ、遍歴をつづけながら時衆をまとめていったが、その後、他阿弥陀仏の直系（遊行派）と奥谷派、六条派、四条派、一向派など他の諸派 のあいだに様々な確執や緊張をともないながら、時宗の教団が確立されていった。こうした状況は、一遍や他阿弥陀仏同様、当時は各地を遍歴する聖が多数いてみずからの教えをひろめていた事実を反映している。時宗の本山は神奈川県藤沢市の清浄光寺である。
法華宗.
一遍の活躍と同じころ、古くからの法華信仰をもとに、新しい救いの道をひらいたのが日蓮である。はじめ天台教学を学んだ日蓮は、やがて法華経（妙法蓮華経）を釈迦の正しい教えとして選び、「南無妙法蓮華経」という題目をとなえること（唱題）の重視を説いた。『立正安国論』を著し、鎌倉での辻説法などで他宗を激しく攻撃しながら 国難の到来を予言した日蓮は、いく度か幕府の迫害を受けたものの、権力に屈せず、かれのひらいた法華宗（日蓮宗）は関東の武士層や商工業者を中心に広まっていった。なお、幕府による迫害のうち最大のものが龍ノ口の大法難であった
日蓮の教えには旧仏教的な要素が多くふくまれ、「われ日本の柱とならん」と述べて、法華信仰に依拠しなければ国が滅ぶと鎌倉幕府にせまったのも鎮護国家の思想のなごりを示す現象といえる。法華宗の本山は日蓮に深く帰依した南条時光により寄進された日蓮正宗である
禅宗の広がりと幕府による保護.
日本達磨宗と臨済宗.