成氏は幕府軍に敗れて鎌倉を棄て、下総国古河城に拠り、古河公方と呼ばれた。関東管領上杉氏はこれに対抗するために扇谷上杉家家宰の太田道真・道灌父子に岩槻城、河越城、江戸城を築かせた。江戸城は豊島氏の本拠の石神井城に近く、太田氏がこの地に進出したことは豊島氏の権益を著しく害し、豊島氏と太田氏が対立するようになったと考えられている。
戦国時代・江戸時代.
幕臣豊島氏.
泰経の子の康保が後北条氏に仕え、その子孫の経忠が武田氏次いで徳川氏に仕えて旗本になった。経忠の子の忠次は遠江国や近江国の天領代官となっている。忠次の孫の泰盈は豊島氏の事績を残すべく、「豊島氏系図」を編纂している。泰盈の家系はその後、幕末まで続いている。ただし、この旗本豊島氏と石神井豊島氏との系譜の信憑性については疑問とされている。
将軍家継の生母月光院に仕えた絵島の父が忠次の四男の家系（白井家）の旗本白井久俊である。絵島は大奥年寄となり権勢を振るったが、江島生島事件で流罪となり、その兄の勝昌は連座して死罪となった。
布川豊島氏.
戦国時代に下総国布河城（茨城県利根町）によった布河（布川）豊島氏の祖の豊島頼継は泰経の子で豊島氏の再興を図ったと称しているが、布川豊島氏の系図には誤謬が多く、布川豊島氏と武蔵豊島氏との関係ははっきりしない。同氏は千葉氏の重臣原氏との関係が深く、小弓公方足利義明に居城を追われた原胤隆が死去したのも布河城であった。
その他.
その他に上州長尾氏や忍城主成田氏に仕えた豊島氏もあり、北条氏滅亡の際に滅びている。系図類では泰経や泰明の子孫とされるが、疑問があり、石神井豊島氏との実際の系譜関係は不明である。
さらに清和源氏頼親流の宇野氏（大和源氏）の支族の豊島氏もあり、摂津国豊島郡（現在の大阪府池田市、箕面市、豊中市一帯）を本拠地とした。
庶流.
その他、滝野川氏、練馬氏、小具氏、平塚氏、白子氏、庄氏など多数の庶流がいる。
系譜.
豊島氏の系図には江戸時代に作成された発祥から旗本時代まで続く「金輪寺本豊島家系図」と「泰盈本豊島家系図」「豊島宮城系図」がある。しかしながら、江戸時代に作成された系図類に共通の問題であるが、史実との矛盾点が非常に多く、信憑性の点で疑問が多い。