その後、尼（妻）は諸国を行脚し神仏に詣でた。ある時山中を通り過ぎると、腰の曲がった八十ばかりの老婆に出会う。その老婆の話から、この山奥に七十ばかりの尼が住んでいると知り、山に分け入ると小さな庵があった。
尼（妻）は庵に住む老尼に会い、人が生きる意味やこの世の悲しみ、苦しみからどうすれば逃れられるかなどについて問い、老尼はそれに答える。そうした問答を重ねた末、心と仏と衆生は同じであり、夢に見た骸骨も自分に教えを垂れた仏の化身だったのだと尼（妻）は悟り、老尼を師として朝夕仕えたのち、大往生を遂げたのだった。
解説.
若い女が恋しい夫の死んだ後、各所を遍歴し、「ただ何事も夢なり」と世の無常を感じて出家する。『薄雪物語』などのように、恋人や妻を失った悲しみに堪えず出家遁世に至る物語は他にもあるが、本作は骸骨の登場、死体の腐乱し白骨四散する様子、出家後の老尼との問答といった場面を加えている。形の上では御伽草子の系列に含まれるとされている。
『二人比丘尼』は話の内容から、以下の三つに大きく分けることができる。
本作の内容は正三独自の創作というわけではなく、もとになったものがあるとすでに指摘されている。①は南北朝時代の成立といわれている『幻中草打画』、②は蘇東坡の作といわれる『九相詩』、③はこれも『幻中草打画』に構想を得たものである。これらに須田弥兵衛の妻という若い女を話の芯に据えることで、話をまとめている。本文には弥兵衛妻などの詠んだ和歌を交える。
①は一休宗純の作とされる『一休骸骨』から、③はこれも一休作とされる『一休二人比丘尼』から想を得たものと言われてきたが、『幻中草打画』の本文冒頭が本作の冒頭と酷似し、また『幻中草打画』の後半がやはり旅の尼僧と庵に住む老尼との問答になっており文章にも似た部分があるなど、正三の『二人比丘尼』は直接には、この『幻中草打画』をもとにしているとの指摘がある。
本文について.
正三著の『二人比丘尼』の本文は「写本系」と「刊本系」の二つの系統が伝わる。
この二つの系統にはそれぞれ本文に大きな相違があり、それは主に②と③の部分であるが、特に③の尼（弥兵衛妻）と老尼との問答から巻末にかけての部分は、改作といってもよいほどの激しい相違を見せている。『須田弥兵衛妻物語』の巻末は以下のように終わる。