旅を続けていくうち、錬金術の基本原理である等価交換の法則を無視してわずかな代価で莫大な錬成を行うことができるようになるという「賢者の石」の噂を聞いたエルリック兄弟は、この賢者の石を使って自分たちの本当の身体を取り戻そうと研究を進めていくが、やがて「賢者の石の精製には大量の人間の命が必要」という驚くべき事実にたどり着く。一旦は絶望に暮れるが、アルの身体を取り戻したいエドは「ホムンクルス」と呼ばれる者たちに導かれ、人間の命を使って賢者の石の錬成を行うことを決意する。しかし、エドは錬成の直前で「やはり人間の命を使うことはできない」とあきらめてしまう。
その後、人間の命を使わずに賢者の石を錬成する方法を探すうち、アル自体が賢者の石として錬成され、所属していた軍からも追われる立場となってしまう。エルリック兄弟の行く手には、まだいくつもの苦難が待ち受けていた。
用語.
基本的に設定は原作と大きな差異は無い。ここでは原作と違う物を挙げる。その他のものは、原作の用語欄（鋼の錬金術師#用語）を参照。
登場人物.
以上の人物については各個別項目を参照。
エド、アル以外の登場人物については鋼の錬金術師の登場人物一覧 (アニメ)を参照。
主題歌.
メディア展開.
コンピューターゲームシリーズ.
ラジオ.
木剣
木剣（ぼっけん）
中村邦夫
人物.
関連項目.
 
塩谷良美
ステーション (ボーダフォン)
解説.
カスケード (ジャグリング)
カスケードは、トスジャグリングの技の一つ。奇数個の道具を扱う。
ひつぎのみこ
ボーダフォンプリペイドサービス
ボーダフォンハッピータイム
ボーダフォンモバイルオフィス
ボーダフォンライブ
セイナス
株式会社セイナスは、かつて広島市に存在した企業。医薬品、衛生材料、化粧品の卸売事業を中心としていた。現在は東邦ホールディングスの傘下「セイエル」となっている。
ひつぎ
ひつぎ
ボーダフォンハッピーボーナス
ジェイソン・ベイ
ラリー・ウォーカーの引退後、カナダ人最高の打者と評されるようになった。
妹のローレン・ベイはソフトボールカナダ代表の投手であり、オリンピックではアテネと北京に出場している。
経歴.
プロ入りとエクスポズ傘下時代.
メッツ傘下時代.
パドレス時代.
パイレーツ時代.
レッドソックス時代.
メッツ時代.
マリナーズ時代.
シリアルナンバー