明治以来一貫して国有地である土地は、登記されたことがないため地番が付されない。たとえば皇居や宮内庁には住居表示はあるが地番はなく、京都大学本部も国立大学法人化されるまで地番がなかった（所在地は「京都市左京区吉田本町」）。この場合、最も近い「地番のついた」土地の番号を用いて「○○町××番地先国有無番地」とする。明治以来一貫して国有地である土地上の建物の所在（住所）は、すべて「国有無番地」である（例：国立館山海上技術学校の所在地は「館山市大賀無番地」）。番外地という表現も、国有地に地番が付されないことに起因するものである。
地番の表現.
※以前は番地と枝番の間を「の」で繋げていたが、現在は「の」を廃止した自治体が多い。
地番整理.
市街地や区画整理済みの住宅地域などでまとまった区域ごとに地番を付け直し、これに枝番を併用して土地の所有者区分を明確化させるという手段が執られることがある。これを地番整理という。
日本における地番整理は、道路や鉄道・河川などで囲まれた広範な土地区画（街区）ごとに地番を与え、さらに所有者区分ごとに枝番を付ける方法のものが主流である。その点で住居表示との類似性があるが、住居表示実施済みの地域とは異なり「登記上の地番区域表記と、一般的な住所表記との不統一が起こらない」という利点がある。
しかしその半面、地番整理導入地区には町名・地番の表示物（「住居表示に関する法律」における街区案内図・街区表示板・住居番号板の類）の設置義務がないため、地域によっては「市販地図などを参照しない限り、地域外の者がすぐに目的地へたどり着けない」といった問題を抱える。これを解消するため、住居番号板と同じ様式の地番・枝番表示板を自治体が独自に設置した例（愛媛県今治市）がある。
地番の重複.
耕地と山地に重複地番を振った場合、それぞれ耕地番、山地番と呼び分けられてきたが、登記事項のシステム化にあたっては「山/耕」の識別情報を付与せねばならず、オンライン申請の障害となるばかりでなく、家宅捜索の際に重複した地番の無関係な住民に対して捜索を行ってしまうなど、各種のトラブルの原因ともなったことから、山地番に一定の値を足して重複しない番号とする形での解消が進められている。
里道・水路.
公図が作成された当時に、道・水路だった土地に対して、現在は「道」・「水」と表示される。
西田畿多郎