利用には、運賃（乗車券）・特急料金（新幹線特急券）に加え、「グランクラス料金」と呼ばれる特別料金が必要となる。なお、グランクラスは、制度上はグリーン車（特別車両）の一種であり、特別車両券の券面上は「グリーン券」の表示となっている。列車ごとのアテンダントサービス提供の有無、東北・北海道新幹線の新青森駅（JR東日本・JR北海道の管理境界駅）または北陸新幹線の上越妙高駅（JR東日本・JR西日本の管理境界駅）で下車せず通過利用する場合とで加算額は異なっている。
JR東日本・JR西日本では株主に対し株主優待として運賃・料金が割引（但し割引率は両社で異なる）となる株主優待券を発行しているが、グランクラスの利用は運賃のみが割引の対象となり、新幹線特急料金・グランクラス料金は割引対象外となっている。
また、日本国の国会議員に支給される、俗に言う「JR無料パス」（正式名称は『特殊乗車券』）でもグランクラスの利用は運賃のみが無料となり、新幹線特急料金・グランクラス料金は全額が必要となる。
さらに、JR東日本・JR西日本・JR北海道の社員に配布される「職務乗車証」やその家族に配布される「家族社員証」でも、グランクラスは割引対象とならず、社員本人は乗車券のみ無料で新幹線特急料金・グランクラス料金は全額が必要となる。（社員家族は乗車券のみ半額となり新幹線特急料金・グランクラス料金は全額が必要となる）
利用率.
車内設備・サービス.
「つるぎ」の全列車、ほか一部の列車ではグランクラスのサービス自体が行われないことがある。当該列車には時刻表にグランクラスの車両に立ち入ることができない旨が注記されている。
車内設備.
車内サービス.
車内設備は、毛布・スリッパ・アイマスクといったアメニティグッズ、新聞や雑誌が用意されている。
アテンダントによるサービスのある列車では、東北・北海道・北陸の各新幹線の沿線の食材を用いた軽食と茶菓、飲料（ソフトドリンクおよびアルコール類・おつまみ類）が無料で提供される。
なお、ワゴンサービスによる車内販売はグランクラスでは行われないため、土産物や車内販売限定商品などの購入を希望する際は、アテンダントを介して取り寄せてもらう。
ストローについて.
車外サービス.