ジムは箱の中身を見て驚いた。なんと、小箱の中に入っていたのは、大海賊フリント船長の財宝の隠し場所を描いた宝島の地図だったのである。早速、グランとともにパイオニア号（樽に小さなマストと帆がつき、蒸気機関や小型砲まで搭載した小さいながら本格的なもの）に乗って宝探しに出かける。しかし、途中でシルバー船長率いる海賊船（ポークソテー号）に捕まってしまう。
ジムたちは海賊島に連れていかれて奴隷商人に売られてしまい、小屋の中に押し込まれるが、そこには先客がいた。フリント船長の孫娘キャシーである。ジムとグランはなんとか奴隷商人の所から抜け出し、宝の地図を取り返すが、すぐにキャシーに取られてしまう。ジムはポークソテー号へ密航し、宝の地図を狙うシルバー船長、そしてシルバーと組んだキャシーと共に海賊島から脱出。
ジムとキャシー、そしてシルバー一味は呉越同舟となり、力を合わせて追っ手の装甲艦グラタン号を返り討ちにするが、ポークソテー号も深く傷つき、嵐にあって船は真っ二つ。ジムと皆はばらばらになってしまう。一夜明けると島に流れ着いたが、そここそ目的地宝島であった。
そして、宝の隠された山への尾根筋で、ジムと、キャシーを人質にしたシルバーの最後の戦いがはじまる。
主題歌・挿入歌.
全て、作詞：石井浩一／作曲：山本直純。
映像ソフト.
LD.
DVD.
その他.
予告編には、ジム一行の乗るパイオニア号の前にクジラが現れる場面があるが、本編では使用されなかった。
オープニングアニメーションはひこねのりおも担当している。
福山庸治
概略.
柳生蔵人
ランドマーク
ランドマーク（）は、地理学上において目印となる建造物などの特徴物を指す。元来の意味としては、探検家などが、一定の地域を移動中に、またそこに戻ってくるための目印である。
概説.
このようなランドマークは、方向を見定める場合の手軽な道案内としての役割、その都市のイメージを決定付けるものである。どこまでも同じようなビルの続く街では人間は方向感覚を失ってしまうものであり、その都市の印象が残らない。ランドマークはその都市の顔となり、住民に親しまれるとともに、来訪者に強い印象を与える。