河上に批判された山本ではあったが、依然として彼は自らの原点である『貧乏物語』の影響下にあった。『貧乏物語』では奢侈財生産に使われている資本を生活必需品生産のために使うよう主張していたが、山本も資本家が「国民と共に消費し皇運を翼賛する精神」で浪費を抑制し、資本を蓄積してより多くの労働者に職を与えるべきと考えていた。その背景としてはグスタフ・カッセルらの「資本の希少性」の議論があり、山本は希少な資本を効率的に使うために経済計算が重要性について触れている。また、市場価格や利子から算出される経済計算が社会主義ではどのように行われているのかを分析する必要性があると主張していた。
社会主義計算論争.
帰国後の山本は世界最初期の経済計算論争の体系的研究書である『経済計算：計画経済の基本問題』を執筆する。これは欧州でのルートヴィヒ・フォン・ミーゼスやブルツクスの議論を紹介したもので、社会主義経済における生産費や生産物価格の基準について論じたものであった。当時は経済計算について広く知られておらず、小泉信三によれば簿記の本だと思って書店に買い付けに来た銀行員もいたという。『経済計算』の中で、生産費や生産物価格の基準は市場価格によって決まるとしており、社会主義では市場が存在しないため適切な経済計算が行えず、効率的な経済運営は不可能であると論じたミーゼスの主張を紹介。山本もこれに賛同した。試験的に価格を定め、過不足が生じれば価格を上下させて均衡を図る「競争的社会主義」に対しても、無数の生産財が無数の完成品に結合されることを考えると、完成財価格から遡って生産財価格を決めることは困難であると主張した。そして実現可能な社会主義経済について、国家の中央部が自信なさげに決めた価格を強行し、労働選択の自由と消費の自由が剥奪された経済、すなわち恐怖政治であると予想している。