探偵明智小五郎の少年助手、小林芳雄はある夕方、麹町の探偵事務所の近くの人通りの少ない通りで、怪しい老人に出会う。老人は小林がやって来るのを待ち受けていたと語り、覗きからくりを小林に見せた。その中には深い森の中の西洋の城のような丸い塔のある黒い建物があり、そのまわりには一匹の、人間ほどの大きさのあるカブトムシが鹿を襲う光景が映し出されていた。老人はこの光景を覚えておくように、実際に同じ山や森や城やカブトムシが存在する、その時に恐ろしいことが起こると予言して、その場を立ち去っていった。
数日後、真夜中の銀座通りで、母子家庭の山村志郎という少年が巨大なカブトムシの化け物を目撃する。志郎は警邏中の警官に抱きつき、警官はカブトムシを追跡し、発砲したが、カブトムシはそれをものともせっず、前方から来た客を乗せた一台の自動車に飛びつき、乗り越えて数寄屋橋をわたり、そのまま姿を消してしまった。
その二週間後、荻窪の高橋太一郎という昭和鉄工会社の社長の屋敷に、友人の木村の使いと称する村瀬という男を出迎える。実は村瀬は木村の会社の社員ではなく、高橋に自分たちが建造している鉄塔王国への一千万円の寄付を依頼しに来たのであった。それを拒絶するならば、高橋の次男の賢二を王国の近衛兵にするべく誘拐すると脅迫し、二週間前の銀座でのカブトムシの戦車のことを持ち出した。
事態を重く見た高橋家では警察に連絡するだけではなく、長男の壮一の勧めにより私立探偵の明智小五郎に事件を依頼すべきだ、ということになり、書生の広田を明智の事務所に派遣した。ところが、明智の旅行中を狙った賊が明智になりすましており、小林を事務所の地下の落とし穴に突き落とし、広田もその中に落とされてしまう。偽の明智はその後、高橋家を訪問し、賢二を都内の親戚の家に預けるべきだと提案し、高橋氏を車内で麻酔薬入りの葉巻で眠らせ、賢二誘拐に成功するかと思われたが、落とし穴から脱出した小林に自動車の車輪をパンクさせられ、逃げ出してしまった。