「古代ローマ」の時代には、少し合理的な科学手法も、いくつか考案され、「病人の出た家は、焼き払うか、あるいは、煙でいぶすべきである。」といった対策が成されていたが、この根拠も、「悪い霊や、悪魔を追い払えば病気にかからなくなる」といった感じで、このようにして、「病気」「結果」「因果関係」などを、きちんと考えていく学問についてである。
中世から近世.
顕微鏡が発明され、具体的に「病原菌」というものが見えるようになってからは、「病気は、細菌が引きおこすものである」との一時的な結論に到った。
この時代には、病気になった患者の血液などを、顕微鏡で観察して「病原菌」を発見し、その「ワクチン」を作る事が、一連の流れになっていた。
この時代に起きたのが、有名な「野口英世」博士の死亡の原因となった、「病原菌」と「ウイルス」の違いである。
「野口英世」博士は、黄熱病が発生した時に「患者のいる場所へ医者がいかなくて、どうするのだ。」との信念から、患者の多くいる地域へ渡航した。
当時の医学の常識どおり、顕微鏡を使い、黄熱病の原因となっているであろう「病原菌」（本当は、さらに小さいウイルスが原因であった。）らしき物を発見し、そのワクチンを作って、効果を確認する為に、自分自身に、ワクチンを使ってみた。
ワクチンとは、イギリスの医学者、エドワード・ジェンナーが発見した医学の処置法の事であって、詳細は、「非常に弱い、同種の病気にかかった者は、体の中に”抗体”が作られ、同じ病気にかかっても、人間自身の持つ免疫によって、自然に治癒される」という仕組みの事で、つまりは、薬ではなく、「実際に、軽く病気にかかる事」を意味している。
その為に、「ワクチン」の作成に失敗していれば、その病気にかかって、あるいは、命を落とす事になる、とても危険な行為でもあった。
これが、原因で、「野口英世」博士は、黄熱病にかかって死亡してしまう。
この後に、「電子顕微鏡」が作られるようになると、その「野口英世」博士の発見した「ワクチン」用の「病原菌」の、さらに、中に、非常に小さな「ウイルス」が発見されて、それが原因であった事がわかった。
（つまり、病気の直接の原因ではなかった方の、大きな方の「細菌」の「ワクチン」を作っていたので、死亡した。）
この顕微鏡と「病原菌」の発見のみが、「病因学」の主だった時代には、別の問題も起こった。