しかし、各個人のカード資産が大きく影響するシステム（特に、ロケテストではアンコモンながら製品版ではスーパーレアに変更された「かすめ取り」やロケテストではスターターに封入されていたが製品版では排出専用となった「イカロスウイング」などによる初期格差と、それによるトレード弊害）や、一部の心ないプレイヤーによる初心者狩り（例えば、「蟻デッキ」に代表されるハメ技的なプレーや、「梅田コンボ」と呼ばれる、妨害カードを大量に積んだロックデッキによる嫌がらせプレー）の横行などにより、ブームは長期的なものとはならなかった。運営面においても、発売当時としては全く新しいタイプのゲームであったことから、高い維持費や設置面積の大きさ、メンテナンス性（特にデッキリーダーの構造）が洗練されていない点などが災いした。
なお、カードリリース終了発表と同時期に、本作をアナログのボードゲームとしても遊べるようにするためのキットが発売された（下記#グッズを参照）。マップ、駒、手札ホルダーなどがセットになっており、特に手札ホルダーは、相手には原作同様にカード属性だけが見えるような工夫が凝らされている。
バージョンアップ概要.
筐体概要.
また、これらの機器とは別にスターターパック・ICカード・カードスリーブの販売機が設置されている。
カードの種類.
カードは以下に分類される。
プレイモード.
初期ライフと戦闘敗北時に失われるライフに優遇措置がある。
画面上に若葉マークが表示される。
途中入場・途中退場.
双方に利点はあるが、初期のバージョンでは配置モンスターが長時間ボードに残るようになっており、配置モンスター数で強くなるカードを使用すると対策が非常に難しいという点で先にプレイしていた側が有利になる傾向が高かった。バージョンアップにつれて配置モンスターの寿命を短くしたり、配置モンスターで強くなる程度を軽くする、カウンターカードを追加することで対策がとられている。
このシステムが、「対戦している」という感覚を希薄にし、カードコンプリートした者から順にゲームから離脱するようになるなど、プレイ人口を伸ばすことを阻害する要因となった。
なお、魔導競技会モードでは途中入場できない。
関連商品.
グッズ.
セガダイレクト専売のグッズがある。
パソコン向けオンラインゲーム.
開発はGPコアエッジ。