鎌倉時代後期.
南北朝時代.
室町時代.
九州における南朝方の勢いが盛んになると頼尚の子は北朝方と南朝方に分かれそれぞれに味方した。しかし、北朝方についた少弐冬資が、新たに九州探題として派遣された今川貞世（了俊）により水島の陣で謀殺されると、南朝方についた少弐頼澄の下で一致団結し反今川勢力として活動した。南朝の勢力が衰退し、今川貞世が帰国した後は、代わって九州探題に就任した渋川氏の援護と称して周防の大内氏が北九州にたびたび侵攻するようになり、少弐氏は豊後の大友氏や対馬の宗氏と結び抵抗し、一時は大内盛見を討ち取って勝利をしたこともあったが、その後はたびたび敗北し、少弐満貞、少弐資嗣、少弐教頼などが戦死している。
戦国時代.
この時代も肥前北部の綾部には肥前守護で九州探題であった渋川氏が健在であったので肥前南部に移る。
当時の肥前南部は九州千葉氏が支配していたが、その内紛に乗じて同氏の領地を奪い、さらに大内氏が中央での政争や出雲の尼子氏との抗争に忙殺されている隙をついて一度は勢力を取り戻した。だが、今度は家臣の龍造寺家兼の台頭と謀反（一説には龍造寺氏は九州千葉氏の旧臣ともいう）にあって次第に衰退してゆく。少弐資元は、大内氏の侵攻に耐えられなくなって遂に大内義隆に降伏した。しかし、義隆に欺かれて自害を余儀なくされ、少弐氏は一時、滅亡した。
滅亡.
系譜.
系図
庶家.
少弐氏は、肥前・筑前・豊前に多くの所領の得ていて庶流家を生み出している。
鎌倉時代の庶流は、
室町以降の庶流は、
少弐氏の従属勢力.
少弐支族.
馬場氏…三根郡中野城主
横岳氏…三根郡西島城主
筑紫氏（支族ではないとする系図もある）…養父郡勝尾城主
朝日氏…養父郡朝日山城主
出雲氏
鍋島氏（偽の家系図と説あり。）
筑前国の国人(国衆).
古くからの譜代の国衆が多い。しかし、少弐満貞の死後、少弐嘉頼が対馬に亡命したため、大内氏の筑前の実効支配がはじまる。そのため、室町後期以降は、大内氏に従う国衆が多い。
宗氏（筑前国→対馬国守護代）
宗像氏（宗像大宮司家）
饗庭氏（足利氏家臣の饗庭氏とは別の一族）
肥前国の国人(国衆).
肥前国は、現在は佐賀県と長崎県に分かれる。古くからの譜代の国人と、少弐氏が筑前国を失って肥前に逃れた後に従った国人も含まれる。
佐賀県.
九州千葉氏（肥前千葉氏）
龍造寺氏
高木氏