旅立ち編のクリア後に選択可能（一作目には存在しない）。「シナリオ」と付いているが、シナリオはオマケ程度でバトルがメインとなる。各地で開かれている大会に参加し、トロフィーを狙うのが目的。トロフィーの獲得数に応じて新たなパーツなどが手に入る。
『GX』と『激闘』は特殊で、選択ではなく旅立ち編のエンディングからそのまま激闘編へ移行し、旅立ち編へ戻る事が出来ない。旅立ち編を遊びたい場合はセーブデータを消し、新しくゲームを始める必要がある。
シナリオモードというよりはスコアアタックに近いシステムになっており、ハイスコアなども記録される。スコアは以下のように計算される。
また、以上のルールに加えて特殊なルールが存在する大会もあり、特に制限のないルールはノンリミットバトルと呼ばれる。
アーケードモード.
「アーケードモード」という名称が使われているが、このゲームシリーズがアーケードゲームとして稼動したことはない。
VSモード.
携帯型ゲーム機向け（『GX』、『激闘!』）の場合は各プレイヤーのカートリッジのパーツ取得状況を使用する（実際はシナリオモードをクリアしていればパーツを大体網羅できるため大きな差は生まれない）。対戦の他にも余分なパーツを他のプレイヤーと交換する機能も用意されている。
用語説明.
劇中設定に関する用語.
一部用語は初出の作品の項へ記載。敵組織の用語は登場人物の項も参照。
『カスタムロボBR』.
カスタムロボ バトルレボリューション#コマンダーに関わる用語の項目と重複するものも多く、そちらも参照。
登場キャラクター.
『カスタムロボ バトルレボリューション』の登場キャラクターは「カスタムロボ バトルレボリューション#登場人物」を参照。
闇組織ドレッド.
下っ端は黒い服装にサングラスで目元を隠しているのが特徴。
秘密結社ゴライアス.
メンバーのほとんどが忍者装束を着ている。下っ端の制服は全身タイツに覆面というデザインで、これを嫌がってドレッドのほうに入団した者もいる。
ロクドウの使用したジェイムスン、及び専用フィールドとしてゴライアスハザードが『激闘!』旅立ち編のグレートロボカップの最中に発生した事件の途中、地下三階へ向かう際の最後のゲートキーパープログラムとしてロクドウの名前と共に登場している。
ニカイドウ・グループ.