訪問者のない不思議な洋館「シャドーハウス」。そこには、貴族の真似事をする顔のない一族「シャドー」と、それに仕え「顔」役を務める「生き人形」たちが暮らしていた。
生き人形の少女・エミリコは顔のない主・ケイトの役に立とうと、日々奮闘中。
こどものシャドーは部屋から出ることが禁じられているが、エミリコは大掃除を通じて他の生き人形と交流を持ち、またケイトから多くのことを教わって成長した。そして、エミリコの前向きな明るさは、ケイトをはじめとして、かかわった人々を少しずつ変化させていく。
やがて、こどものシャドーたちがその資質を試される「お披露目」の日がやってきた。様々な試練を乗り越え、エミリコとケイトは無事「お披露目」を突破、成人したシャドーとして扱われるようになるが、同時にこの館の異質さも少しずつ明らかになっていく。
登場人物.
声の項はテレビアニメ版の声優。
「こどもたちの棟」の住人.
「こどもたちの棟」の生き人形.
　オスカル
オスカーの生き人形の新人。
　マーチ
マチルダの生き人形の新人。おっとりしている。手先が器用。
　ルル
　ダン
ダニーの生き人形の新人。利口ではない。
　キャンディ
　ステラの生き人形の新人。
研究班.
オリバー・オリー組が班長を務める班。『知識の探求』が活動理念。非常にマイペースな者が多く所属している。すす取りの間や香水など様々な物を発明・開発している模様。星つきが所属しているため、大掃除の免除（喜びの会のみ参加）、一般の生き人形より食事が豪華、次期星つきの候補など優遇されている。また研究活動中は生き人形も自由に行動・発言が許されている。
星つき.
「こどもたちの棟」の管理を任されているシャドーと生き人形。数は四対で固定されている模様で、生き人形は首元に星のブローチをつける。元々はただ「お呼ばれ」が確定したペアのことだったが、トマスがバーバラを新リーダーに任じて以降制度が変わり、こどもたちの教育係を意味するものとなった。
「こどもたちの棟」の中では権力者だが、エドワードをはじめとした「おじい様と共にある棟」の住人には逆らえない。「こどもたちの棟」と「おじい様と共にある棟」を行き来することが出来る。新たに「星つき」になるには現「星つき」からの推薦が必要。
おじい様と共にある棟（大人たち）.