現代でも、第一や第三の説を発表する科学者は多い。自然科学者の間では一般的には、アレクサンドル・オパーリンなどによる物質進化を想定した仮説（化学進化説）が広く受け入れられている。
しかし、生物が実際に（もう一度、無機物質から）発生するところは、（日々自然現象が膨大に起きており、自然を観察している人類も膨大な数いるのにもかかわらず）今まで一度も自然界で観察されたこともなく、また説が唱えられて以降、実験室でそれを再現しようと、非常に多くの科学者によって、実験室で太古の地上や海中の環境を想定した条件をととのえて、ほとんど無数の実験が行われたのにもかかわらず、「無機物から生命体と呼べるものが誕生するプロセス」は再現されていない。
このように、生命の起源に関して、どの仮説か妥当なのか決定的な解答は得られておらず、様々な立場、角度から研究や議論が続いており、新たな仮説が立てられることも続いている。
なお、自然科学においては、単に「生命の起源」と言っても、そこには「生命とは何か（生命の定義）」、「生命はどこから・どのように誕生したのか（狭義の生命の起源）」、「は何か？」、「生命はどのように多様性を獲得したのか（種の起源）」、などの問題・テーマも関連してくることになる。
この項では生命起源論を歴史に沿って追うこととし、中でも自然哲学や自然科学における様々な学説に重点を置いて説明することにする。
超自然説.
古来、様々な宗教の経典で「神が世界や生き物を造った」とされている。学術的には（神話学や文化人類学などでは）、宗教経典類に登場する「神が世界（や生き物を）を創造した」とする記述や、民話や民間伝承などで語られる類似の話なども含めて、「神話」や「創世神話」と分類している。
これら「生命は神による天地創造以来連綿と続いている」とする説は「生命永久説」とも言う。
アリストテレスの説.
自然発生説をめぐる研究の歴史.
パラケルスス、ファン・ヘルモント.
レディの実験.
レディはこれによって、ハエのたからない魚にはウジが発生しないことを証明した。もっとも、彼が証明しようとしたことは「ウジはハエが卵を生むことによって生まれている」ということであって、生命の起源については単純に「生命というのは卵から生じる」と考えていたともされる。また、寄生虫については自然発生するとしていた。
顕微鏡の発明.