コンタミネーションの影響はスペクトルの正体不明のピークや収率の大幅な低下など、通常は負の結果をもたらすことが多い。が、ごく稀には新規な化学反応の発見などのセレンディピティにつながることもある（反応容器のわずかな汚れが予期せぬ触媒として働いた例がある）。
古生物学.
古生物学、特に微化石を扱う微古生物学では、主に試料間での混入（クロス・コンタミネーション）を指していう。試料処理の段階における器具の洗浄不良等により発生する他の試料からの混入は、地層の同定や古環境分析を行う上で致命的な失敗をもたらす。
製造検査過程.
言語学.
文献学・書誌学.
その他の分野.
ガソリンスタンドなどでは、ローリーからタンクへ、タンクから車への「誤給油」「油種混入」の意味で主に略語（コンタミ）を使用している。
燃料系の運送会社でこの種の事故が起きた場合（灯油タンクにガソリン混入、軽油タンクに灯油混入等が多い）、石油元売会社・燃料販売会社・
県税事務所・都道府県消防を巻き込む大事件となり、最終的にタンクローリー乗務員をはじめ運送会社が存亡の危機に追い込まれる事もあり、業界では忌み嫌われる事故でもある。
米穀業界では、米に「異物(石・虫・ガラス等)」が混入してしまうケースと「異品種の米(品種・年度・産地等)」が混入してしまうケースをコンタミネーション（コンタミ）と呼んでいる。
油圧では油圧回路中に混入した異物をコンタミネーション（コンタミ）と呼び、作動油の劣化と並んで、作動油を管理するうえで重要なテーマとなっている。コンタミは装置の製造過程で混入・残留したもの（溶接のスパッタ、切削加工による金属片、パッキン類の破片、塗装片、ウエスの繊維等）、装置の運転中に内部で発生したもの（部品の摩耗・破損による金属粉・金属片、パッキン類の破片、作動油から発生したスラッジ等）と、外部から侵入したもの（注油・保守時に混入するごみ、装置周辺の粉塵等）とに大別できる。こうした固形物のほか、水分もまた作動油に大きな影響を与えるコンタミである。
化学メーカーでは製品への異物混入を総じてコンタミネーション（コンタミ）と呼び、生産ラインの部品や触媒などから製品のパッキング時に混入するウエスの繊維や工具類、ヒトの体毛に至るまで表示されている成分以外は全てコンタミとなる。
クロス・コンタミネーション.