発進シークエンスはアニメ版とは異なり、発進口がヤマトの第三主砲の直下（旧戦艦大和の短艇格納庫付近。リメイク版におけるコスモゼロ格納庫もこの場所）にあり、舷側がスライドして横方向へ発進する。収容は舷側から触手状の着艦マニピュレーターが繰り出され、機体を絡める形で強制着艦させる方式である。
PSゲームシリーズでの設定.
PS用ゲーム『宇宙戦艦ヤマト 遥かなる星イスカンダル』制作時に、一部登場メカのリデザインが行われたが、本機も宮武の手によって新しい設定画が描かれている。基本的なデザインは変わらないが、全体的にステルス要素を若干加えた調整がなされている。ディテール面では、コックピット左右前方の上下面に上下方向へのマニューバノズルが追加されているほか、翼端のマニューバノズルや翼端灯、胴体のエアブレーキなどの設定も追加されている。また、機体下部垂直尾翼は引き込み式ではなく、折りたたみ式に変更されている。
リメイクアニメシリーズでの設定.
旧作のコスモゼロとの外見上の相違点は、主翼の下反角が翼の根本ではなく途中から付けられていることや、PS版デザインと同じく上下面のマニューバノズルが追加されていることなど。翼下ハードポイントに懸架しているタンク状構造物は「高機動ユニット」と設定されている。艦上戦闘機として開発されたため、機首・主翼・垂直尾翼が折り畳み可能になっている。また、コスモゼロの外観上の特徴とも言える機首・垂直尾翼・主翼に存在する突起状の部分については、コスモファルコン編隊のステルス制御用の各種アンテナが内蔵されているという指揮官機・電子戦機の要素を踏まえた解釈となっている。さらに、機首先端の各種複合アンテナには流体制御システムを内蔵し、太陽系標準環境における全領域航行を可能とする。
機体中央に円形のノズルを持つ主エンジン、その両側に副エンジンを搭載する。単独での大気圏離脱能力がある。基本的に単座だが、後部に予備シートが収納されており、複座にも対応している。
ブラックバード.
帝星ガトランティスとの総力戦に際し、地球連邦防衛軍がコスモゼロにガミラス軍の月面防御用ドローンの自律機動システムを導入して無人化した、改修機である。機体諸元は前述の自律機動システムや後述の量産型波動コアを搭載したこと以外はコスモゼロと同一であり、波動実験艦「銀河」に搭載されている。