一方、籠訴が成功したことが領内に知れ渡るや、意気上がった領民たちは大規模な集会を開いて国替阻止の示威運動を展開した。大勢でかがり火を焚き、幟を立て気勢を上げるさまは、さながら一揆のようであったと記されている。しかし幕府からの反応が一向に無かったことから、一部の領民たちは藩境を越え近隣の諸藩に国替え阻止を愁訴する方法を取る。仙台藩には、およそ三百人の庄内領民が越境愁訴したことから、驚いた仙台伊達家では藩主伊達斉邦が幕府に伺書を提出した。その内容は、庄内領民への同情を示しつつ理不尽な領地替えを命じた幕府を厳しく批判するものであった。また、同じく庄内領民が殺到した会津藩も幕府に伺書を提出しているほか、水戸藩でも同藩の軍用掛である山国喜八郎が「無理に国替えを強行すれば、決死の庄内領民が江戸に上り何をしでかすか判らない。決して小事と侮ることのないように」と藩主徳川斉昭に進言するなど、領民たちの国替え阻止運動は大藩をも動かすに至った。
こうした情勢のなか、大御所徳川家斉の喪が明け、政治の実権が将軍である徳川家慶の手に移ると領地替えを巡る状況は大きな転機を迎える。
家慶は、それまで家斉の元で権勢を振るっていた西の丸派の重臣、林忠英、水野忠篤、美濃部茂育を解任するなど、大御所政治の旧弊払拭に着手していたが、家斉の存命中から問題になっていた三方領知替えについても再考しはじめる。すでに庄内領民による越訴の件が江戸市中で評判になっており、御三家の水戸藩や御三卿の田安家など将軍家一門からも庄内藩に同情する声が上がったためである。
御主意書の大まかな内容は以下の通りである。
家慶は、水野の反対を受けると、庄内領内へ御庭番を派遣し現地の実情を探るとともに、矢部に庄内藩江戸留守居役をはじめとする関係者の取り調べを命じる。
転封中止の報は早馬によって庄内津々浦々に知らされ、折からのお盆と時期が重なったこともあり、道行く人に酒や赤飯がふるまわれ武士町民百姓も一緒になって盛大に祝ったと記されている。