中華民国旅券は、台湾地区で居住権を持つ者に対して自動的に交付されるものではない。台湾地区で中華民国戸籍に登録され中華民国旅券を持つ者のみが、台湾内での出入境管理から除外される。それ以外の中華民国旅券の所持人は、台湾への到着時に上陸査証（; ） を発給されるか、または入境を拒否される。台湾地区で中華民国戸籍に登録されている公民にのみ発給されるは、投票などの公民権を行使する際に用いられる。海外華僑の旅券は、台湾地区で中華民国戸籍に登録されている公民の旅券とは異なり、もっぱら各国の中華民国大使館、領事館、台北経済文化代表処など中華民国の在外機構のみが発給し、台湾地区にて発給されることはない。海外華僑の旅券には、華僑であることを示す特別な印が付される。ただし兵役に就いている者は除外される。中華民国戸籍を有する旅券の所持人には、中華民国国民身分証の統一番号（）を持つ者も含まれる。英国旅券を持つ者が、必ずしも英国の居住権を保有しているわけではないことに似ている。
現在中華民国政府は、大陸籍と台湾籍の二重籍を認めておらず、中華人民共和国旅券を取得（大陸籍を取得）した場合、「台湾地区・大陸地区人民関係条例」（両岸条例）により、中華民国旅券は無効となり、台湾籍を喪失する。ただしこの場合も国内法上中華民国の国民としては扱われる。
様式.
中華民国旅券の表紙をめくると、最初のページには以下の要請文が印刷されている。
戸籍のある国民のパスポート規定.
台湾地区に戸籍のある国民は、以下の書類を持って、台北の領事局、高雄、花蓮、嘉義、台中の各支局でパスポートを申請することができる。
利用の制約.
マレーシア.
ジョージア.
ジョージアは、台湾人の入国を一切認めておらず、トランジットで立ち寄ることも禁止している。
大陸地区（香港、マカオ含む）への旅行に関して.
台湾・大陸地区間の移動は台湾・大陸地区両当局とも自国領域とみなしているため、台湾地区との往来は「渡航」と扱われない。
台湾人が大陸地区（中華人民共和国政府支配地域）を来往するには、中華民国旅券のほかに、台湾居民来往大陸通行証またはという旅行文書も取得しなければならない。