なお、ブライトに代わる艦長としてビーチャが艦長代理として実質的な艦長職に就任する。
タイガーバウムでの邂逅.
キケロ潜入.
ネオ・ジオン内紛.
また、ネオ・ジオンと協力関係にあり、火星で生産したMSを輸送、ひいてはネオ・ジオンに加勢するためにはるばる火星圏から向かってきたジオンマーズの地球派遣艦隊は、この内乱に巻き込まれることを嫌って、どちらの陣営にも属していないグループを回収して火星に撤退している。
終戦.
戦後処理とその後の影響.
また、これとは別にハマーンの妹セラーナ・カーン外務次官を中心とする穏健派勢力は、連邦政府との和平交渉に臨んだとされている。しかし和平交渉は決裂、セラーナは追撃してきた強硬派との戦闘で行方不明になったという。
エゥーゴ所属部隊は地球連邦軍の正規部隊として組み入れられる形で発展的に解散した（主にロンド・ベル隊に配属されたと言われている）。
カラバは、ハヤトが第一次ネオ・ジオン抗争で戦死し、アムロ・レイは第一次ネオ・ジオン抗争に参戦せず地球連邦軍のロンド・ベル隊に属している。
なお、主人公ジュドーはこれらの政治的動きにかかわることなく、ルーとともにグリプス戦役後中断していた木星エネルギー輸送船団に参加。生きていたリィナや仲間に見送られつつ「巣立って」いった。
第二次ネオ・ジオン抗争
第二次ネオ・ジオン抗争（だいにじネオ・ジオンこうそう）は、映画『機動戦士ガンダム 逆襲のシャア』で描かれた地球連邦軍と新生ネオ・ジオンによる架空の戦争。「シャアの反乱」、「アクシズ戦争」または資料によっては「第二次ネオ・ジオン戦争」と呼称されている。
背景.
一方、シャアは反地球連邦組織やハマーンのネオ・ジオンの残党らを糾合し、さらにアナハイム・エレクトロニクスに新型MSなどを製造させるなど軍備の増強を進めていた。
経過.
ネオ・ジオンの蜂起.
開戦.
リ・ガズィに搭乗したアムロ・レイは5thルナ落としを阻止する際にシャアのサザビーと交戦していた。戦闘で圧倒されたアムロはモビルスーツの性能差を痛感し、自身が開発に関与していたνガンダムを受領するため、アナハイム・エレクトロニクスのフォン・ブラウン工場へ赴いた。
偽りの和平交渉.
アクシズ落とし.
終戦.