マクドナルドは、長崎でもキリスト教徒である旨をはっきりと公言していた。禁教化時代の長崎ではキリシタン改めの踏み絵も行われていたが、マクドナルドは聖公会会員であったので、少しも躊躇することなく真鍮製の画像を踏みつけた。
また、抑留されていたマクドナルドは、自分の箱から本を持ってきてくれるように役人たちに頼んだが、当初その要求は拒絶されたが、お祈りの恰好をして礼拝について伝えた。すると、役人たちは聖書を持ってきてくれ、マクドナルドは聖書を傍らに置き、礼拝の本であることを彼らに教えた。その後、役人たちは、マクドナルドの頼みに応じて聖書を置く棚を造ってくれたが、彼らもその本を敬っているかのようで、それを丁重に取り扱い、頭の上に持ち上げたとその時の模様を伝えている。当時の幕府の役人は、カトリックには厳格であったが、プロテスタントには寛大であったらしく、インディアンの祖国であると信じていたマクドナルド側の日本を敬う人物像も合わせて、ごく短期間であったが、日本滞在中はかなり優遇され、聖書や祈祷書の所持を許可された待遇で、日本の青年に英語を教えた。
帰国.
帰国後.
帰国後は日本の情報を米国に伝えた。日本が未開社会ではなく高度な文明社会であることを伝え、のちのアメリカの対日政策の方針に影響を与えた。日本ではただの英語教師としてしか記憶されていないが、アメリカの歴史ではかなりの重要性を占める人物として、研究や紹介の書籍が多く公刊されている（Wikipedia英語版を参照）。
日本での経過.
（本人の口述書による）
通詞との交流.
教え子.
大阪市立瓜破東小学校
大阪市立瓜破東小学校（おおさかしりつ うりわりひがししょうがっこう）は、大阪府大阪市平野区にある公立小学校。
大阪市教育委員会から「帰国した子どもの教育センター校」に指定されている。日本語の学習指導が必要な帰国児童は、普段は居住地の学校に通学しながら、週数回同校に通って日本語の指導を受ける。また帰国児童の所属校からの教育相談もおこなっている。
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