自然界の物質に浸透して、主に鉱石・液体の状態となり、更に時間の経過に伴い、気化（瘴気）・結晶化する性質を持つ。基本色は水色だが、フェイゾンの濃度に比例して、突然変異の誘発因子レベルも強くなり、濃度が高まると赤もしくは黒に変色する。
フェイゾンに耐性を持たない生命体は、接触や被曝しただけで死亡するが、フェイゾンを照射・注入された生命体がその毒性に耐えた場合、筋肉や質量の増幅・特殊能力の強化や発現・形態変化など、遺伝子レベルで急速に突然変異を生じて強靭に進化する。しかし過激な変異現象の過程で内部組織が退化してしまう事例もあり、身体や脳の委縮・寿命の低下など、非常に不安定な性質も持つ種が多い。
また知能を持つ生命体が被曝した場合は、「フェイゾン病」と呼ばれる攻撃性の増幅や知能の低下などのように異常で破壊的な精神障害を引き起こす場合もある。これは治療法が未確立なため、被爆に対して注意を払い、長期被曝を防ぐ以外に対処法は存在しない。
エネルギー資源.
またフェイゾンエネルギーをベースとした攻撃は、それ以外の攻撃に高い耐性を持つフェイゾン生命体に対しても、非常に有効な攻撃手段となる。
一方でその分子構造上、特定の高周波エネルギーがすり抜けてしまう事（ノバビーム）や、鉱石の結合剤となる高濃度のフェイゾン放射線を容易に熱源探知（サーモバイザー）されてしまう等、欠点も挙げられる。
ハイパーモード.
威力は桁違いで、当時最高の攻撃力を持つアイスビームさえ受け付けなかったメトロイドプライムにダメージを与えている。
こちらのハイパーモードはアームキャノンのみならず、スーツの防御力や一部の装備も大きく強化される。
また、洗脳されたパイレーツは自身を汚染しているフェイゾンを活性化させ、同じくハイパーモードを発動してくる。
フェイゾン生命体.