知力も運動能力も平凡な男子高校生・多華宮仄は突然「塔の魔女」に魔法によって襲撃される。そこに学園の「姫様」と呼ばれる火々里綾火が現れ、同じく魔法によって助けられる。彼は、あらゆる破壊と再生を司る火の魔法「ファイアクラフト」白姫エヴァーミリオンが自分の中に封印されており、「塔の魔女」がその力を狙い、住んでいる冬月市の「工房の魔女」が彼を守っていると教えられる。
工房の魔女としてはエヴァーミリオンの力を封印し悪用を防ぐことが目的と教えられるが、綾火の目的とはそれとは微妙に異なり、多華宮仄が平凡な日常を送ることこそが一番大事であることを繰り返し強調する。またそれを守るために工房の魔女全体とは優先させることが微妙にズレた行動を取り、時に対立もする。
多華宮仄は自分の中にエヴァーミリオンがなぜ封印されているか知らず、数年前からの記憶がない。また、綾火もなぜ多華宮仄を守らなくてはいけないかの理由が分からず、同じ時期からの記憶がないことが判明する。
終わりの魔女の一人、宝月かざねと仄の母、多華宮小町は学生時代に友人であり、小町が怪我をしたときにかざねは自分の血の力で彼女を助けた。かざねの力は強大なため余計なトラブルを招かぬよう以後は関係を断っていたのだが、数年後に小町の息子、仄火にその力が受け継がれていたことが判明する。かざねはその力を制御できるようにと仄火をあちこちの武者修行に連れ回すことになった。
すべては綾火に普通の生活をさせてあげたいという仄の願いから出た行動であり、かざねもそれに理解を示し、彼の処分を避け日常生活を送らせるために冬月市の工房の魔女となる決意をする。かざねは火々里家の当主となり綾火を養子として迎えた。そしてファイアクラフトは封印され、二人の記憶も封印されたというのが最初の顛末であった。やがて記憶がないまま綾火は仄を見つけ出し、同じ高校生活を送ることを希望する。かざねはその願いを聞き入れ冬月高校の理事長となる。
火々里火陽の部下の暗躍により封印は解かれ復活する。仄と綾火はかざねを含む多くの魔女の力も借りて火陽と対峙し、ファイアクラフトの力を使って彼女の呪いを癒し、すべての因縁に決着をつける。
ある日、仄は綾火を二人の思い出の場所へと誘う。そこで彼女も過去の出来事と仄が自分にしてくれたことをすべて思い出すのだった。
登場人物.
工房の魔女.