中央大学名誉教授であり、当時、京都産業大法科大学院教授も務めた渥美東洋は「日本の社会や経済が大混乱に陥る可能性があるとき以外は指揮権を発動してはならない」と指揮権について極めて慎重に扱うべきとした。法務大臣が国会や記者会見などでは具体的な事件に関する質問を受けた時は「個別の事件についての答弁は差し控えたい」として、政治的な圧力を疑われないように検察の判断を尊重するコメントを述べることが殆どであり、指揮権発動について極めて抑制的に考えられている。しかし、造船疑獄での指揮権発動以降、法務大臣と検事総長の間には常に緊張感が漂っていると言われている。ある検事総長経験者は、もし、指揮権が発動されたら指揮には従わず、辞表を出す覚悟だったと証言している。元検察幹部は、指揮権発動があるとすれば大臣との間に「誤解」が生じてしまっているということ、双方の立場をわきまえた上で大臣に極力情報を上げるようにすることが、造船疑獄以降、組織が得てきた教訓だと思うと述べている。
例.
強制捜査中止.
個別事件における検察官の強制捜査を中止させること。
不起訴処分.
個別事件において検察官に不起訴処分をさせること。
しかし、「起訴独占主義」の例外である検察審査会の強制起訴制度や裁判所の付審判制度で起訴されるという形で法務大臣の意に反した起訴がされることがあるため、万能ではない。また、指揮権発動の唯一の例である造船疑獄では、与党幹事長は逮捕を含めた強制捜査を免れたものの罪状が変わった上で在宅起訴はされている（後述）。
強制捜査督励.
個別事件において強制捜査を督励すること。
強制捜査中止とは逆に法務大臣が特定人物の逮捕や事件捜査を督励することを俗に「逆指揮権」「逆指揮権発動」と呼ばれる。
下級審無罪判決確定.
個別事件において下級審で無罪判決が出た場合、検察官に上訴をさせずに無罪判決を確定させる。
具体例.
指揮権が発動された例.
指揮権発動に準ずる例.
指揮権発動が疑われたり、可能性が考慮された例.
ルーニー・マーラ
生い立ち.
キャリア.
私生活.
女子名人戦
旧女子名人戦.
黄龍士佳源杯.
軍艦教授所
明石区検察庁
エンジニアリングウッド
品質と強度.
つまり、鉄骨の代わりに木を使って柱や梁等の躯体部分をも施工可能になる。
種類.
日本農林規格（JAS）における「集成材」も参照されたい。