中小私鉄.
津軽鉄道.
津軽中里方面を奇数、津軽五所川原方面を偶数として付番している。各々の番台の列車の始発時刻が早い順に付番していく。
小湊鉄道.
上総中野方面を奇数、五井方面を偶数として付番している。
東京モノレール.
関東鉄道.
千の位は行先を表している。
竜ヶ崎方面を奇数、佐貫方面を偶数として連番で付番されている。
箱根登山鉄道.
強羅方面を奇数、小田原方面を偶数として付番している。
早雲山方面を奇数、強羅方面を偶数として付番している。
大井川鐵道.
大井川本線では千頭方面を奇数、金谷方面を偶数として付番する。各々の番台の列車の始発時刻が早い順に付番していく。
井川線では井川方面を奇数、千頭方面を偶数として付番する。
遠州鉄道.
東海交通事業.
三岐鉄道.
三岐線では西藤原方面を奇数、近鉄富田方面を偶数とし、各々の番台について始発時刻が早い列車から順に付番する。
北勢線では阿下喜方面を奇数、西桑名方面を偶数として付番する。
北大阪急行電鉄.
南北線
和歌山電鐵.
貴志方面を奇数、和歌山方面を偶数として付番する。
紀州鉄道.
一畑電車.
北松江線は松江しんじ湖温泉方面を奇数、電鉄出雲市方面を偶数として、大社線は川跡方面を奇数、出雲大社前方面を偶数として付番する。各々の番台について始発時刻が早い列車から順に付番する。
高松琴平電気鉄道.
琴平・長尾線では琴電琴平・長尾方面を奇数、高松築港方面を偶数として付番する。志度線では琴電志度方面を奇数、瓦町方面を偶数として付番する。
神戸電鉄.
島原鉄道.
島原外港方面を奇数、諫早方面を偶数として付加する。
熊本電気鉄道.
第三セクター.
旧国鉄から転換された路線は現在も JR各社と同様の付番形式を採っている場合が多い。
IGRいわて銀河鉄道・青い森鉄道.
青森方面を奇数、盛岡方面を偶数として付番する。
首都圏新都市鉄道（つくばエクスプレス）.
千の位は種別を表す。
百の位は運行区間を表す。
鹿島臨海鉄道大洗鹿島線.
上り水戸方面を偶数、下り鹿島神宮方面を奇数として付番する
真岡鐵道真岡線.
上り下館方面を偶数、下り茂木方面を奇数として付番する
しなの鉄道.
富山ライトレール.
えちぜん鉄道.
長良川鉄道.