前作より収録路線数は少ないが区間の種類が分かれており、運行距離が『新幹線 山陽新幹線編』の次に長い。また上り・下りの運転が可能のため、前作よりボリューム感が増した。シリーズ初の運転の進行状況を中断できるセーブ機能や、指定された途中駅からプレイ可能ができる機能が追加された。
収録路線・車両.
※（）内路線は作中表記はないものの、作中で走行する路線。
ゲーム内容.
問題点.
電車でGO! FINAL.
これまでの作品と比べてグラフィック・音声面共に大幅に進化し、列車の拳動もより実物に近いものとなった。『電車でGO!』としてはこれまでで最大のボリュームである。例えば、モーター音や駅、車内メロディやベル、自動音声放送などの忠実な再現や各車両毎に加速やブレーキ性能、応答性などを可能な限り再現しているなど、より現実に近い感覚で運転が楽しめるようになった。また不自然な曲線や天候（時間帯含め）の表現も大幅に改良され、列車の所要時間も現実のものと近い仕様となった。ただし、駅間距離の短縮は違和感のない範囲でこれまで同様に存在する。
なおPSP用ソフトとして、以下の作品が路線別ごとに発売されている。
その名の通り本体（ツーハンドル型コントローラー）とモニタを接続するだけでプレイできる家庭用ゲーム機である。
再販版の本体カラーは新カラーバージョン
ゲーム内容.
前作とは異なり、路線をクリアした後、新たに運転ができる時刻表が追加される場面もあったが、本作ではお金を設けたダイヤを購入して運転ができるようになった。一部は特定のダイヤをクリアした後情報が解禁されるのもある。
場所に故意に長時間停車すると減点されると共に運転指令所からコールがあり、発車させると「異常ありません」と応答する。
発車メロディやベル、ブザーが流れた後に電車を発車する際の「ドアが閉まります。ご注意ください」というアナウンスが流れるようになる（東海道線では「〇番乗り場から、△△△[種別]・□□□行きが発車します」というアナウンスが流れる）。
駅や停車関連のサウンドでは以下のようなサウンドが流される。