「真名本」は、本文が漢字（真名）で書かれている。ただし漢文ではなく、変体漢文体という擬漢文体で記されている。
漢字の文章には訓点（博士家系の乎古止点）が振られ、それでも補えない場合には小さいカタカナの注意書きで読みやすくしてある。
妙本寺本.
この祖本はその奥書に「日向国臼杵院右筆四位公日助」と記されており、ここから来歴を知ることができる。これによると、日向国（宮崎県）の日助という日蓮宗の僧侶が書写したものである。日助は日向国の臼杵郡本東寺（延岡市）の住僧だったと推定されている。日助が何をもとに写本を作成したかは不明。
「妙本寺本」は、勉誠出版が写真版を、角川書店が活字版を、平凡社が注釈付き訓読版（東洋文庫）を、それぞれ刊行している。
本門寺本.
「本門寺本」は「訓読本」のベースになったことがわかっており、この点で歴史的価値が認められている。このほか「本門寺本」からは、「日尭筆副本」、「内閣文庫蔵本」、「静嘉堂文庫蔵本」、「国会図書館蔵本」などが派生している。
大石寺本（訓読本）.
「大石寺本」は、漢字の「真名本」をもとに抄出し、読み下したものの総称である。大石寺（静岡県富士宮市）に伝わることからこの名がある。ただし肝心の「大石寺本」そのものは所在不明になっている。そのため、「大石寺本」と言った場合には、原本の大石寺本そのものを指す場合と、大石寺本系の諸本を指す場合がある。
大石寺本（訓読本）系統は、原型である真名本から、物語全体のテーマ性を損なわないように注意しつつ、文章量を減らして読みやすくするように改編されている。そのための手法として、本文の削除や要約、語句の変更、表現の置き換え、独自のカナ表記などが行われている。また、ストーリーの本筋とは関係がない唱導譚が割愛されている。この結果として、読者にとって場面展開が把握しやすく、よりドラマティックな読み物になっている。
大石寺本系の諸本.
仮名本.
このうち「乙類」はより古い様式を残すもので、「甲類」は、「乙類」を基に作られた諸本で、内容も大きく改変されているものがある。乙類の中でも最も古いテキストを伝えているのが「太山寺本」である。
「太山寺本」以外では、「仮名本」は各諸本が相互に影響しあっており、系統は非常に複雑である。