さらに、蘇我氏は、葛城を拠点としていた尾張氏を経由することで安閑天皇・宣化天皇と接近することができたとし、実際に、安閑の勾金橋宮が蘇我の地の付近に存在しており、安閑期には大臣になっていないとはいえ、既に有力豪族の一派となっていたとする説も存在する。
仏教が伝来した際にそれをいち早く取り入れたのも蘇我氏であったとされる。これは、朝廷の祭祀を任されていた連姓の物部氏、中臣氏を牽制する為の目的もあったと推察される。
全盛期.
稲目は欽明天皇とほぼ同時期に没し、二大勢力の構図は次代の蘇我馬子まで引き継がれるが、用明天皇崩御後に後継者をめぐる争いがあった。蘇我氏は、小姉君の子ながらも物部氏に擁立されていた穴穂部皇子を暗殺し、戦いで物部守屋を討ち滅ぼすと、蘇我氏以外からは大連に任じられることもなくなり、政権は蘇我氏の一極体制となる。
ここから崇峻天皇の暗殺や、推古天皇への葛城県の割譲の要求、蝦夷による天皇をないがしろにするふるまい、入鹿による上宮王家（山背大兄王）の討滅、叔父で専制政治に反対する境部摩理勢の失脚などの専横ぶりが伝えられており、蘇我氏三代にわたって権力を欲しいがままにしたとされているが、馬子の死後に蘇我氏に対する皇族や諸豪族の反感が高まって蘇我氏の政治基盤が動揺し、それを克服しようとして入鹿による強権政治に繋がった、という見方も少なからずある。これは『日本書紀』等による蘇我氏に否定的な記述に対する反論である。
蝦夷と入鹿・物部大臣は、蝦夷の母・太媛の存在や、丁未の乱での勝利から、物部氏の氏神である石上神宮の祭祀にも大きく介入したと考えられており、特に、物部氏の衰退から物部首氏（春日氏系）や物部馬古連公の台頭までの期間に、物部大臣が中心となって、祭祀実務担当者の任免を伴う組織の改変が行われたといわれる。これは、『新撰姓氏録』や『紀氏家牒』に記されているように、斉明朝（実際は皇極朝）に、蝦夷が物部首氏の祖・武蔵臣に物部首の氏姓を与えたことからも推察できる。
大化の改新から壬申の乱まで.
また、蘇我氏出身の女性が天皇の妃となることも引き続き行われ、蘇我氏の血を引く皇族は、奈良時代の半ばに至るまで重要な地位を占めた。