室町幕府の政務を掌握し事実上幕府を主導していた足利直義（尊氏の弟）とは、政治的に親しい関係にあり、直義は頻繁に光厳の御所に参上して政治に関する意見を交換していたという。直義の正月の院参（上皇の御所に参ること）は毎年の恒例行事となっていた。直義が高師直の御所巻によって失脚した際には、光厳は、直義を政務に復帰させ師直を執事に復帰させており、その他幕府政治に関わるものとして、足利直冬治罰の院宣を発給したり、土岐周済追討軍を激励するなどもしていた。
前年の高師直による南朝の本拠地である吉野襲撃によって、南朝はほとんど壊滅状態になり、京都周辺では戦乱が止んだ。また光厳が計画する皇位継承（→#直仁親王について）も順調に進んでいた。そのような中で、光厳はこのように述懐したのである。
正平一統と三上皇拉致.
出家と帰京.
晩年・崩御.
晩年、光厳は持明院統の相続に関する処分を行った。光厳は、異例の形で即位した後光厳天皇を持明院統の庶流の天皇として、直仁の皇位継承が困難になると改めて崇光を正嫡とし、持明院統の経済的中核であった長講堂領を崇光に譲った。
その他の活動としては、四条隆蔭の出家に際して自ら戒師を務めるなどしている。隆蔭は光厳のもっとも信任する側近の一人であり、隆蔭の剃髪直前に光厳は隆蔭を一品に推挙していた。しかし結果的に叙位が叶わなかったために、隆蔭は自発的に剃髪に至った。この出家儀礼には、光厳にとっては来世も隆蔭との主従関係を約束する意味があり、隆蔭にとっては来世でも忠節を誓う意味があったとされる。
その際、通徹より僧伽梨を与えられたという。
第一条には、
第二条には、
遺偈は次の句であった。
貞和徳政.
また、光厳の徳政（ここでは単に「良い政治」という意味である）と歩調を合わせ、足利直義が主導する室町幕府でも徳政が行われていた。以下、光厳院政の政治機構、訴訟制度、および室町幕府との関係などを説明する。
政治機構.