しかし、藤田は悲願の日本一を達成してもマスメディアからは冷淡な反応を示され、「（選手が）活躍しているのは、みんな、長嶋が伊東で鍛え上げた選手だ」と言い、藤田より長嶋の功績を称賛するものが多かった。藤田はこうした状況でも冷静に対応していたが、オーナーの正力亨までもがマスメディアの誘導尋問に乗って長嶋へラブコールを始めると、さすがに堪忍袋の緒が切れ、藤田が単身でオーナー室へ乗り込んで「私のことが不服なら、ユニフォームを脱いだって良いんです!」と啖呵を切ると、それ以降は正力の長嶋へのラブコールは止んだという。
巨人を退団後は再びNHK野球解説者、報知新聞客員解説委員となる。東海大学野球部の練習の見学に来た際に酒井勉（東海大学、のパ・リーグ新人王）に対し「酒井君の腰の回転はサイドスローに向いてるよ」と転向を勧めた。
巨人監督退任後.
監督退任後はNHK野球解説者を務めた。には野球殿堂入り表彰を受けた。同年からは沢村栄治賞選考委員を務め、別所毅彦の死去によって委員長に推薦されたほか、別所が務めていた巨人軍OB会長職をからまで就くなど、幅広く活躍した。
オフには、千葉ロッテマリーンズから監督就任要請を受けていたが、就任に至らなかった。
頃から体調を崩して療養する日々が増えるが、には愛媛マンダリンパイレーツのアドバイザリースタッフを務めたほか、王が福岡ダイエーホークス監督として現場に復帰した際には、王の代理として世界少年野球推進財団の活動にも参加し、協賛行事で行われた日米オールスターゲームでは監督を務めたこともある。
に原が監督を解任されたことに抗議して、広岡達朗と共に読売新聞・報知新聞の購読を打ち切った。同年、山下大輔が横浜ベイスターズ監督に就任した際の会見で、目標とする監督として別当薫と共に藤田の名を挙げている。両者とも、山下にとっては慶応義塾大学の先輩にあたる。
人物.
現役時代の颯爽とした姿やスマートな外見、物腰、そして慶応義塾大学出身であることから「球界の紳士」と呼ばれていた。指導者として、日本海軍連合艦隊司令長官だった山本五十六の「やってみせ、言って聞かせて、させてみて、褒めてやらねば人は動かじ」を座右の銘としていた。「誰だって怒られるよりは褒められた方が嬉しい。選手だって同じ」を座右の銘としていた。