元長は河内の畠山義堯や大和国人らと結び、来たるべき対決に備えた。一方の晴元は、茨木長隆らの進言により、敵対を続けてきた将軍義晴との和睦を企てていた。高国という対抗者が消えた以上、晴元には将軍・幕府に帰順して京兆家家督になる可能性が開けたのである。堺公方義維への背信である。元長はあくまで義維を推戴しようとし、畠山義堯も元長に同調したが、阿波勢の庇護を受ける身の上だった晴元にとっては、畿内を基盤とする幕府の権力者の地位は魅力的で、元長に対抗する力を手に入れられるのである。
堺公方の崩壊について、細川晴元が京兆家の家督を獲得すると、足利義晴を廃して義維を将軍に立てようとする三好元長に対して、義晴の支持基盤の固さから義晴と和睦して将軍として擁して義維は「弟」としてその下に統合しようと考える柳本賢治・松井宗信・木沢長政の路線対立があったと考えられる。この問題は元長の子である三好長慶が畿内の実権を握った後も残され、四国に多くいる義維派の支持を引き留めるために義維を庇護し続ける一方で、畿内の政治的安定のために義輝を将軍として擁立し続ける必要がある、という相反した行動を取り続けることになったとされる。
足利義維（義冬）のその後.
阿波国平島に逃げ戻った義維は、名を義冬と改めた。
なお、三好元長ら四国に基盤を持つ家臣に支持された義維（義冬）を擁立する主張と柳本賢治・松井宗信・木沢長政ら畿内に基盤を持つ家臣に支持された現実的に世間から支持を得ている義晴との和解を望む主張の対立は細川政権・三好政権を通じて、課題として残された。
元長の子である三好長慶が義維（義冬）を擁して、義晴の後継者である足利義輝と対立しながらも遂に義輝から義維（義冬）への将軍交代に踏み切れなかった理由としては、京都とその周辺では義晴・義輝父子の権威が依然として認められ続けて、その権威を否定することが困難であったからと考えられている。
その後の義冬及び、その後裔の阿波公方のことは、それらの項目に譲る。
「堺幕府」論.