一、関役所、同駒口、取るべからざるの事。
 一、忠節人立て置く外、廉がましき侍生害させ、或ひは追矢すべき事。
 一、公事等の儀、能々念を入れ、穿鑿せしめ、落着すべき事。
 一、国諸侍に懇に扱ひ、さすが油断なき様、気遣ひすべき事。
 一、第一慾を構ふにつきて、諸人不足たるの条、内籍続にをひては、
 　　皆々に支配せしめ、人数を抱ふべき事
 一、本国より奉公望みの者これあらば、相改め、抱へ侯ものゝかたへ相届け、
 　　其の上において、扶持すべきの事。
 一、城々普請丈夫にすべきの事、
 一、鉄炮・玉薬・兵粮蓄ふべきの事。
 一、進退の郡内請取、道を作るべき事。
 一、堺目入組、少々領中を論ずるの間、悪の儀、これあるべからざるの事。
 右定めの外、悪き扱ひにおいては、罷り上り、直に訴訟申し上ぐべく候なり。
現代語訳
一方、織田信忠は旧・武田家の生き残り・残党たちの追討、捜索を開始した。そして、織田軍は領内をくまなく捜索し、そのうちの一つ、旧・武田家の残党が逃げ込んだ恵林寺を包囲した。
その後、織田軍は武田方の有力武将の首を差し出してきた農民に対して報奨金として黄金を提示した。これを見た農民達は武田家の名のある者、有力者、元武将たちを探して、それを見つけては殺し、その首を織田方に献上した。
ここでは、武田家一門とその譜代家臣、および甲斐の国衆は厳しく追及・処断されたが、上野・信濃・駿河の国衆についてはあまり追及されなかったようである。例外は、諏訪一族のうち織田氏に抵抗した諏訪越中守ら、跡部勝資と縁戚関係にある朝比奈信置・信良ら、織田・徳川から離反した飯羽右衛門尉・菅沼刑部丞・菅沼伊豆守などである。
この事実から、織田信長は事後の支配のため、武田の本国である甲斐の有力者は滅ぼし、それ以外はおおむねそのまま温存して、織田政権に組み込もうとしたと考えられる。
なお、『徳川実紀』では「家康は信長の命令にそむいて武田家臣たちをかくまった」と記述されているが、これは信長の出した国掟の内容と矛盾する。
戦後.
滝川一益、北条氏政のその後の動きは神流川の戦いを、徳川家康、氏政、真田昌幸のその後の動きは天正壬午の乱を参照。
なお徳川家康が召抱えた武田の遺臣達は、天正壬午の乱や軍制再編などで、徳川家に貢献した。特に依田信蕃は信濃・甲斐に家康を手引きし、その占領に貢献している。