長岡藩の中心領域となった現在の長岡市域は、戦国時代には越後守護代長尾氏（のち上杉氏）の一族古志長尾家が古志郡蔵王の蔵王堂城（現長岡市西蔵王）に拠って治めていた。その古志長尾家の景信が御館の乱により戦死した後は、上杉家の直接支配を受けることとなる。
築城.
災害.
戊辰戦争.
廃城以後.
構造.
堀直寄は長岡城の縄張りを「苧引形兜城（おびきがたかぶとじょう）」と呼び、また長岡城は信濃川と栖吉川が周囲を囲むように自然の外郭を形成し、さらに城の東側の江筋より水を引いて幾重にも堀を巡らしていたために「八文字の浮島城」ともいった。
立地.
西に信濃川があり、南北と東を東山山地に源流がある赤川（現在の柿川）が三方を囲むように流れ、信濃川と合流している。北に広大な沼であった八丁沖を天然の守りにしていた。ただし、守備側は天領であった小千谷との境にある朝日山、榎峠を確保することが必須条件で、攻守ともにこの南方高地を制圧した側が城を手にすると言われていた。
規模.
『長岡市史』によると城内の広さ、堀や土手については以下のとおり
施設.
内郭と外郭の堀は土橋が掛けられ、城門に通じた。本丸の一部にしか石垣はなく、他は土塁で周囲を囲んでいた。天守はなく、本丸北西の三階櫓を代用としていた。
裏門に塩門、門、不明門（あかずのもん）、太鼓門があり、また外郭に町口門、坂口門、千手口門、高橋口門、長町口門、神田口門、四郎丸口門、今朝白口門が存在した。太鼓門見通しおよび千手口門見通しは積雪を測量する場所とされた。
中心部の本丸から南西の方向に二の丸が延び、北の方向に三の丸があった。後に三の丸には城外にあった馬場が移設され、馬術や弓術の藩主への御覧が三の丸において行われていた。また、三の丸は太鼓門見通し及び千手口門見通しと同様に積雪を測量する場所とされ、この他に下場札前と御厩が積雪を測量する場所とされ、三尺積雪すると除雪させた。
城内に建設された神社.
この他、城内には稲荷神社と八幡神社が創建され、八幡神社は千手町に移転した。
城絵図.
現存するものとして、国立公文書館内閣文庫に『諸国城郭絵図 越後国古志郡之内長岡城之図』（正保城絵図）、長岡市安禅寺文書に『延宝年中長岡城下図』、国立国会図書館に『日本古城絵図 北陸道之部 越後国長岡城図』『日本古城絵図 北陸道之部 越後国長岡之城図』がある。
三津浜