変形に伴い、艦内においても構造ブロックが著しく変動されるため、初めてのトランスフォーメーションの際は、推進ブロック（強攻型の脚部）内に再建されたばかりの市街地は壊滅的な被害を受け、事前通達の不十分から民間人の住民にも多くの犠牲者を出す。艦内市街地のストリートが、短時間とはいえ外界（宇宙空間）に直接繋がり、艦内の構造物やエアカーが吸い出される様子が描かれている。その後、市街復旧の際にブロックの移動にあわせた区画整理が行われ、建物の中にいれば安全を確保できるようになり、市街地の各箇所にはシェルターが設置される。変形発動の際には事前に「変形警報」が発令され、住民も次第に要領に慣れたため被害は減少していく。しかし、初変形時の艦内の損害はゼントラーディ軍の空襲より甚大であり、住民にはより実感的な戦争の脅威だったともいわれる。そのため、変形警報発令時には文字通り蜘蛛の子を散らすようにシェルターへ避難し、わずか数分間で市街地はゴーストタウンの様相と化す。また、艦体ブロックの移動に伴い一時的に出口のない閉鎖空間になる区画も存在し、変形時に住民が内部に閉じ込められる事態がしばしば発生する。
ダイダロス・アタック.
不採用案.
以下は、初期の企画段階で設定されていながら本編中で使用されず、不採用となった戦法や兵装である。これらのなかには、形を変えて描かれているものや、後継作品においてアイデアを転用されたものも存在する。
劇場版.
主砲発射の際に両肩の砲身のみでなく、両腕のアームドと脚部のカバーを前方に展開し、この作品独自の発射体勢で主砲を発射する（テレビ版、劇場版のように、砲身のみでの発射も可能）。メインブリッジは緊急時の脱出艇となっており、分離して単独で飛行することが可能である。
地球に侵攻してきたマルドゥーク艦隊の旗艦に対して浮上し、主砲にて先制攻撃するもののまるで通用せず、反撃にて、被弾直前に離脱したメインブリッジ以外の艦体は大破する。離脱したメインブリッジも、着陸の際に破損し、マクロスは事実上全壊する。
マクロスと接合する艦艇.
プロメテウス.
ダイダロス.
漫画『超時空要塞マクロス THE FIRST』におけるマクロス進宙前のエピソードでは、グローバルの奇策でもって艦首を追尾していた改アクラ級潜水艦クリリスクにぶつけ沈める。
劇場版には登場しない。
アームド級宇宙空母.