スギ黒点枝枯病もスギの重要な病害であり、（子嚢菌門ズキンタケ綱）によって引き起こされる。小枝先端部に褐色病斑が生じてその病斑が拡大、数年で主枝に達し、主枝を一周するとそれより上部が赤褐色になって枯れてしまう。特に東北地方において重要病害であり、樹齢を問わず発生し、ときに著しい成育阻害を起こす。
昆虫・ダニ.
その他.
ニホンジカはスギの枝葉を食べ、またニホンノウサギは苗木を食害する。ツキノワグマやニホンジカが樹皮をはいでしまうことがある（熊剥ぎ、鹿剥ぎ）。
著名な個体.
屋久杉.
天然記念物.
人間との関わり.
木材.
古木の材には鶉杢（うずらもく）や笹杢（ささもく）など特異な模様が生じることがあり、指物や和家具などの材料として珍重される。また、水土中に埋没して火山灰などによって青黒褐色に変色した材は神代杉（じんだいすぎ）とよばれ、工芸品などに利用される。
樹皮・枝葉などの利用.
スギの樹皮は屋根の材料とされることがあり、このような屋根葺きは「杉皮葺き」とよばれる。また、樹皮は垣根などに利用されることもある。
葉から抽出された精油は、化粧品の香料や医薬品に利用されることがある。
山奥では古くは茶に不自由であったため、スギを茶外茶として利用することがあり、「杉茶」とよばれる。
古くは、飢饉時にスギの内樹皮を食用としたことがあった。
観賞用.
スギは、庭木や生垣、盆栽、いけばなに用いられることもある。ただし、下記のようにスギは神聖視されることもあるため、屋敷や生垣にすると家が滅びたり福が入らなくなるとされ、植栽が避けられることもある。スギの園芸品種は多く作出されており、例として以下のようなものがある。
植林.
生産地ごとに材の特徴や生産・管理方法に違いがあり、床柱の北山杉、酒樽の吉野杉、造船の飫肥杉、仏壇の屋久杉など産地によって用途を使い分けられることもあったが、現在でも地域名を冠して「…杉」とよばれブランド化されている。スギの産地名を冠したものとして以下のような例がある。