ノーザンブロッティングによって異なる組織、器官、環境ストレスのレベル、または感染の有無、何らかの処理の有無などによってある特定の遺伝子の発現がどのように変動しているかを解析することができる。例えば、がん細胞において、通常の細胞と比べてがん遺伝子が過剰発現されていて、逆にがん抑制遺伝子の発現は下がっていることを示すのに、ノーザンブロッティングが用いられてきた。他の例として、移植された臓器の拒絶反応における遺伝子の発現変化を調べるのに用いられたこともある。ある特定の条件における遺伝子発現のパターンから、その遺伝子の機能を推測することもできる。RNAはまずそのサイズによって分離されるが、一つのプローブを用いてサイズの異なる複数のRNAが検出されれば、同一遺伝子における選択的スプライシングの存在、または共通するを持つ複数の遺伝子の存在などが示唆されることになる。突然変異体における遺伝子の欠失や転写後修飾の異常によってRNAサイズの違いが生じる場合もあるが、これもノーザンブロッティングによって検出が可能である。同一遺伝子の中でも異なる標的配列に対して複数のプローブを設計することで、変異体においてRNAのどの部分で欠失が起こっているかを調べることもできる。
利点と欠点.
デバッグ
デバッグ（）とは、コンピュータプログラムや電気機器中のバグ・欠陥を特定して取り除き、動作を仕様通りのものとするための作業である。“”は「〜から離れて／分離して／除去して」といった否定の意味を持つ接頭辞であり、「虫」を意味する英語名詞“”と結びついた複合語が“”である。
語源.
その逸話は以下のようなものである。ホッパーがある初期のコンピュータに携わっていたとき、蛾がリレーの中に入って動作不良を起こすのを見た。ここから、プログラムからエラーを取り除く作業を指してデバッグという語が使われ始めたと信じている者もいる。ホッパーによればバグという語はそれ以前にも使われており、実際にその場面に遭遇したのがおもしろかったという。
ツール.