李卓吾の童心説は激しい批判を浴びたが、命脈が絶えたわけではない。文学において受け継がれていった。すなわち明末に袁宏道ら公安派の唱えた性霊説はこの童心説を受けたものである。これは人間の自然な心の発露を文学によって表現しようとする考えで、その後は清の袁枚に引き継がれた。後継者としては水滸伝の補作者馮夢竜がいるが、馮夢竜は李卓吾と異なり明王朝の価値観に挑戦せず、俗文学を通じて穏やかに思想を説いていると増井経夫は述べている。
真っ向から士大夫的価値観に挑戦した李卓吾の姿勢を継ぐものは明・清を通じて現れなかった。しかし現在の我々がすでに知っているように、儒教は中国が近代化する過程において支配イデオロギーの座から滑り落ち、五四運動においては「人を喰う」教えとして批判にさらされた。ここにいたって、儒教批判の先駆者として李卓吾は漸く顕彰されるのである。中華人民共和国が政権を獲得した後も、儒教が批判にさらされる中で李卓吾は善人として持て囃された。現在、顧炎武・黄宗羲・王夫之と並んで明末清初を代表する思想家の一人として数えられている。
日本との関係.
現代日本ではほとんど知られていない李卓吾だが、江戸の中頃から幕末にかけて日本でも多くの思想家に読まれていた。
野山獄中に於いて李卓吾の『焚書』を読んで非常に感激したという吉田松陰は李卓吾に深い思い入れを持っていた。吉田松陰は獄死する一年ほど前から李卓吾に関心を寄せ、彼が中国の史書から言葉を抜き出したというノートには李卓吾に関係するもの（『焚書』や『続蔵書』など）が多く残され、その印象を入江杉蔵や品川弥二郎をはじめとする多くの門下生へと書き送ったという。『焚書』の抄録については、これを形見として残し実読を勧める旨記された書簡とともに高杉晋作に届けるよう久坂玄瑞に命じたことが知られている。
吉田松陰は、李卓吾の時代や思想とは異質性はあったものの、その思想の中から自らを投影しその文章などを自己表現の一つとした。