芸予諸島は広島県本土（本州）と愛媛県本土（四国）の間に位置する。広島県（旧備後国を含む）呉市から東の島と、愛媛県旧越智郡島嶼部および若干の付属島嶼、大小数百の島から成る。目安としては、東端が広島県福山市鞆の浦と愛媛県今治市を結ぶ線、西端が能美島・倉橋島までである。西に防予諸島、東に笠岡諸島がある。
ただし東西共に境界は曖昧である。西端部では広島湾奥部は含まないが、湾口部の島々は含むことがあり、最大で山口広島県境の甲島まで含む場合がある。東端部は鞆の浦から今治市を結ぶ線までとされるが、その外側の魚島群島や四阪島、来島群島の比岐島を含む場合も多い。かつては下蒲刈島から大崎上島・大三島の周辺のみの狭いエリアを芸予諸島と呼ぶことがあった。
芸予諸島をより細かく分ける場合、西側から安芸群島（江田島周辺のみ）・蒲刈群島・下大崎群島・上大崎群島・関前諸島・来島群島・越智諸島・芸備群島・上島諸島・備後群島とする。なお、芸備群島の一部と備後群島は厳密に言えば旧備後国に属している。
平成の大合併の結果、芸予諸島の島々からなる市町村の多くは、本州・四国本土を中心とする広島県呉市・尾道市、愛媛県今治市などに組み込まれた。現在、芸予諸島に市役所・町役所・村役所を置く自治体には江田島市・大崎上島町・上島町がある。
自然環境.
芸予諸島に非常に多くの島が密集していることで、芸備地方の歴史の在り方に種々の影響を及ぼしてきた。
元々陸地として繋がっていたものを、航路として用いるため開削したところも存在する。例えば、呉市本土と倉橋島の海峡である音戸の瀬戸には日宋貿易の航路として用いるため平清盛が沈む夕日を扇で招いて1日で開削したとの伝承「日招き伝説」が残る（実際に掘削したかは不明）。
気候は瀬戸内海式気候である。丘陵地で温暖な気候を活かした農業が展開されている。
植生で特徴的なのは、ほぼ広葉樹の代償植生で占められている点である。これはこの地で古くから製塩業が盛んで、製塩の際に熱源を必要としたことから燃料用に大量に木々が伐採されたことによりはげ山となり、そこで繁殖力旺盛なアカマツが植えられていったことによる。