本作の物語の時間軸は前作の半年後。プレイアブルキャラは国立半蔵学院や元秘立蛇女子学園の抜け忍集団・焔紅蓮隊の他、死塾月閃女学館や秘立蛇女子学園の新メンバーなど新規キャラクターが追加された。
前作に登場した秘立蛇女子学園のメンバーは、蛇女子学園の出資者にして黒幕である道元を斬り、他の選抜メンバーと共に学園に追われる抜忍になっており、秘立蛇女子学園から新たな選抜メンバーが登場する。また、新たな勢力・死塾月閃女学館の選抜メンバーは、伝説の忍「半蔵」のライバルであった「黒影」の弟子達で、半蔵学院に「学炎祭」を仕掛けることになった。
登場人物.
秘伝忍法動物のカットインは登場しないが、ゲーム中のキャラ紹介に「秘伝動物」という項目がある。ただし一部の秘伝忍法ではエネルギーなどの形で攻撃に使われる。
若宮社
若宮社（わかみやしゃ）は日本各地にある神社。字名付きで呼ばれるものもある。
杉本なつみ
来歴.
学生時代の部活動では、バンドを組んでおりベースを担当していた。就職活動では後述の音楽を深く嗜んでいたこともあって、テレビ局を志望しておらず、ラジオ局もしくはレコード会社を志望していた。
しかし、テレビ局のアナウンス試験を受験した結果合格した。
井口玲音
経歴.
神奈川県横浜市の出身、埼玉県で育つ。西武台高校、淑徳大学国際コミュニケーション学部卒。高校時代は女子初となる生徒会長を務めた。大学時代はチアリーダー部を結成しキャプテンを務めた。その時の顧問が北野大教授であった。「ミス淑徳」、テレビ朝日アスク卒業生。
烏帽子島
烏帽子島（えぼししま）は、日本の島の名前。
破滅ミサイル
真部分群
ケル・アベル
アベルが最初に手掛けた作品はロシア出身のバレエ振付師であったジョージ・バランシンの作品で、コペンハーゲンの王立劇場とロンドンのにて発表された。
プロット.
作中の描写について.
また、ギャグそのものは英語の両義性による駄洒落が多い。
奈良県立吉野工業高等学校
東小雪
経歴.
東京ディズニーリゾートでの同性挙式.