しかし反対意見も少なくなかった。とくに守旧派の幕府体制にこだわる人々には「日本国」という意識が乏しく、惣船印は徳川の「中黒」 を用いればよいではないかとする意見も少なくなかった。しかし開明的な藩主たちの後押しを得て、「日の丸」が日本国の惣船印に定められたのである。
海事史学者の石井謙治は「斉彬提唱説」を取り上げつつも、日の丸が江戸幕府の御用船旗に用いられた事実から、日の丸が日本船の船印に提唱されたのは自然のこととしている。
海事学者の安達裕之は、上記の説を俗説に過ぎないとしている。『水戸藩史料』等の幕閣や斉昭の書簡・仕様帳といった当時の史料から、安達が考察した日の丸制定の経緯は次のようになる。
また、石井行夫は安達説を踏襲しつつ、「鳳凰丸」が「昇平丸」よりも早く日の丸を掲げるため公試の一部を省略したこと、浦賀奉行から提出された日の丸の試案が存在したことを取り上げている。
国旗としての汎用化.
賊軍の旗.
明治・大正から昭和初期・終戦まで.
明治維新により国家体制が一新した日本だが、国旗の変更は行われずそのまま使用が継続された。
商船規則.
陸軍御国旗.
海軍御国旗.
国旗としての使用と法律制定の検討.
日章旗抹消事件.
占領下における日章旗の掲揚禁止.
国旗国歌法以前の法令による扱い.
国旗国歌法の成立.
教育現場の日章旗掲揚をめぐる国会議事.
日章旗のデザイン.
正式規格.
特例の日章旗.
日章旗と軍用の旗.
税関旗.
日章旗の造形に関する逸話.
安津素彦の著作『国旗の歴史』に、「明治時代にイギリスまたはフランス、オランダが日の丸の意匠を買い取ろうとした」という記述がある。
国民感情.
積極的な掲揚.
第二次世界大戦後、祝祭日や国際試合などでは積極的に掲揚されている。
なお、天皇誕生日などの一般参賀での国旗は皇居外苑周辺で配布されているが、これはあくまで民間の一般社団法人国旗協会の「皇居参賀協力委員会」で提供しており、行政機関である宮内庁は無関係である。
公共施設
官公庁や公共施設では、祝祭日以外にもよく日常掲揚される。
国旗の取り扱いについては各自治体が定めており、都道府県旗や市町村旗と同じ高さか、一段高く掲揚される。