富士吉田市内には北口本宮冨士浅間神社が上吉田に、この小室浅間神社が下吉田にあるため、北口本宮の呼称「本宮」に対して当神社を「下宮」と呼称しているとの誤解を招きやすい。現代では北口本宮を「上浅間（かみせんげん）」や「上浅（かみせん）」、小室浅間神社を「下浅間（しもせんげん）」や「下浅（しもせん）」と呼ぶことが定着してしまっていることもそれに拍車をかけている。
しかし、本来「下浅間」とは冨士山下宮小室浅間神社ではなく北口本宮冨士浅間神社を指している。
このことから、吉田口二合目の小室浅間神社（現・冨士御室浅間神社旧本宮）が「上浅間」、そこから勧請した上吉田の北口本宮が「下浅間」と呼ばれ、それとは別に下吉田の「下ノ宮浅間」があることがわかる。
上述のことから、「下浅間」と「下宮浅間」は別の存在であったが、下宮浅間から北口本宮に上吉田の氏子地域を譲ったこと、富士河口湖町勝山が管理する二合目の冨士御室浅間神社との関係が薄くなり、いつしか「上浅間」と呼ばれなくなったことで、代わりに北口本宮が上吉田の浅間神社「上浅間」、下吉田の浅間神社が「下浅間」と呼ばれるようになり、明治に小室浅間神社と改称したことなどから、近代以降に「下浅間」と「下宮浅間」が混同されていった。
祭事.
流鏑馬祭り.
山梨県無形民俗文化財に指定されている。
境内では流鏑馬に使う神馬が飼育されている。この馬は日本中央競馬会から奉納されたものである。
かつて、自家で馬を飼育していない家では、馬を飼育する地内の家や他村の農家などに依頼し祭礼の期間だけ馬を借り受けていた。時代の流れと共に、馬を飼育している家もなくなり、現在では神社で馬を飼育して使用している。
筒粥祭.
また、筒粥神事の後には囲炉裏から釜を外し、燠（おき）の上で「カツノキ」と呼ばれるヌルデの樹で作られた駒を乗せ、その焼き具合で天候を占う「テリフリ占い」も行われる。こちらの結果も晴雨占標として公表される。
筒粥神事にも世襲の「占人」一族（葭之池温泉一門）があり、神社の主な祭儀が占い神事で、それぞれに世襲の一族が代々奉仕していることが大変珍しい。
御更衣祭.
御神馬.
終身制で天寿を全うした歴代御神馬は神馬社に合祀されている。
神馬舎では御神馬以外にも木曽馬、ポニーなどが複数飼育されている。
摂末社.
大塔宮社・雛鶴社.