南イタリアの収入源は、自治を制限した南イタリア諸都市からの徴税と、ジェノヴァ、ヴェネツィア、ピサなどの北イタリアの貿易都市の商人からの融資だった。年ごとに徴収される直接税、新たに制定された間接税が国庫に収入をもたらした。他方、北イタリア貿易都市がシチリアの港で有していた特権を廃して国家貿易に着手し、オートヴィル朝以前の王権や東ローマ帝国の類似の制度をもとに、産業の独占を行い、収入の増加を図った。また、フリードリヒはシチリア統治の初期時代から収入を商人からの借金の返済に充てており、治世末期には財政の大部分を商人からの借金に依存する構図が完成していたと考えられている。
しかし、国庫収入の増大を目指したフリードリヒの政策は長期的な経済発展には直結せず、農業の疲弊と都市経済の停滞をもたらした側面もある。
都市工業の衰退と北イタリア商人の台頭の結果、南イタリアに北・中部イタリアから製品を輸入し、食料と原材料を輸出する経済構造が確立された。
学芸との関わり.
施政.
フリードリヒは理知によって説明できない事象を一切信じようとせず、そのために同時代人の中には彼を嫌悪する者もいた。フリードリヒの元では神明裁判は禁止され、また彼が発布した法令の多くは現代にも影響を及ぼしている。
薬剤師の誕生.
彼が発布した法令の多くは現代にも影響を及ぼしている。法令の一つに、役に立たない（あるいは人体に危険な）薬を売りつけようとしていい加減な診断をする医師に対して、医師が薬剤師を兼ねることを禁止した法令がある。この法令によって医薬分業という制度が生まれ、医薬分業は現在でも欧米諸国では広く一般的な制度となっている。
生物.
フリードリヒは異国の動物を愛しており、彼の宮廷は動物を伴って移動していた。動物園（）で飼われていた動物には、猟犬、キリン、チーター、ヤマネコ、ヒョウ、外国の鳥、ゾウが含まれていた。