主人公の「シンタロー」が迷い込んだ不思議な島「パプワ島」での生活を描いたギャグ漫画。シンタローが島に住む謎の少年「パプワくん」や島の奇妙な生物達（作中では「ナマモノ」と呼ぶ）に振り回されて様々なトラブルに会う、というのが毎回のパターンである。連載の後半では少年漫画らしいバトル描写中心の展開になった。
また、連載中を通して女性キャラクターがたった一人しか登場しないことも特徴（なお、性別が「メス」だと思われるキャラクターは数名〈匹〉いるが、女性キャラらしい人物は一人だけである）。同性愛をモチーフにしたギャグが頻出するが、いわゆる下ネタは皆無という珍しい作風になっている。
連載開始時のエピソード.
あらすじ.
アニメ.
テレビ朝日系列と他系列のクロスネット局では、山形放送（当時日本テレビ系列優先ネットのクロスネット局）のみでの放送にとどまった。
さらに、系列外局では、番組販売扱いの遅れネットという形で宮崎放送（TBS系列、テレビ朝日系列クロスネット局のテレビ宮崎がフジテレビ系列優先のため）・テレビ岩手（日本テレビ系列）で、本放送終了後にチューリップテレビ・山陰放送（いずれもTBS系列）・高知放送（日本テレビ系列）で、それぞれ放送された。
主題歌.
CDシングルは、いずれも日本コロムビアから発売された。なお主題歌はカラオケに入っているが、「ん」から始まる珍しい曲に入る形になっている。
映像ソフト.
発売元はいずれもポニーキャニオン。現在は廃盤となっている。
ベストフィールドより発売。
フロンティアワークスより発売。
OVA「南国少年パプワくん 星降る夜に会いましょう」.
カセットブック.
アニメイトカセットコレクション（ムービック）
オリジナルストーリーによるボイスドラマのカセットテープである。出演声優はテレビアニメ版と同じ。現在は、全巻廃盤となっている。
ゲーム.
いずれもアニメ終了後に発売。なお、主人公はSFC版ではシンタロー、GB版ではパプワになっている。
概要.
『南国少年パプワくん』の続編にあたる。不思議な島の不思議な生物たちが巻き起こす騒動を描くギャグ漫画で、同性愛めいた要素を下ネタ抜きに描写する独特のギャグ、中盤以降に頻出するバトル展開など、前作をほぼ踏襲したような作風になっている。