本項ではかつて同一地域に存在した宇治郡山科町（やましなちょう）についても述べる。
概要.
東山により京都盆地から、音羽山や醍醐山（笠取山）などにより近江盆地からは隔てられている。昔から京都と東国とを結ぶ交通の要衝であった。
かつては、滋賀県との府県境の農村だったが、現在はベッドタウンとして他地域からの移入者も多く、名神高速道路の京都東ICなどもあり、京都市東部の玄関口として発展している。
東側は滋賀県大津市との県境に接しており、大津との結び付きも強い。
また、南側は伏見区醍醐地区と接しており、山科区と同一の生活圏や経済圏を形成している。山科区と醍醐地区との繋がりは、伏見区中心部と醍醐地区の繋がりよりも深いと言われる。
地理.
地域.
区を構成する町：京都市山科区の町名を参照。
歴史.
古代.
山科周辺は古くから交通が盛んであり、東山を越える日ノ岡峠、大津宿へ抜ける逢坂関が東海道の要所として知られていた。山科は東海道の街道町であり江戸時代には特に栄えた。また、逢坂から南へ抜ける奈良街道（奈良に都があったころの北陸道）、東山を日ノ岡の南で越える渋谷街道（東国と六波羅探題を結んだ）や滑石街道、大岩街道など数多くの街道があった。
栗栖野の台地には縄文時代から人が住み弥生時代の大規模な集落跡も見つかっている。特に旧石器時代後期から室町時代にかけての遺跡が重なっている中臣遺跡は重要な遺跡である。
中世.
室町時代から戦国時代まで.
しかし城郭都市のようになった本願寺の存在と門徒たちの勢いを恐れた細川晴元は、京都市内をほぼ勢力下に置いた日蓮宗徒らと結託して一向宗に打撃を加えようとした。
この後本拠を失った本願寺勢力は大坂（石山本願寺）に移っている。山科本願寺は廃墟と化したが、今も高い土塁の跡が区内各地に残存している。
近世.
江戸時代.
江戸時代は山科や四宮、そして髭茶屋追分（現在の大津市追分）までが東海道(三条通の開通に伴い、今は旧街道・旧三条通りなどと呼ばれる)の街道筋として一続きの町となり、飛脚や参勤交代をはじめ多くの人々が行き交った。
髭茶屋追分からは京都を通らず大津宿と伏見宿、大坂を直接つなぐ伏見街道（大津街道）が山科盆地を南へ走っていた。
京都に住んでいる天皇のため、禁裏御料地として宮中に献上する作物を栽培したほか、近郊農村として京都の市民に野菜などを供給された。