その一方で強化外骨格をまとった「サイボーグ忍者」としてスネークの前にたびたび姿を現した。
一度はサイボーグ忍者としてスネークと交戦し、戦闘の途中で薬が切れた禁断症状から発狂して行方不明となったが、リキッド・スネークの操るメタルギアREXと対峙するスネークを援護するため参戦。グレイ・フォックスはスネークに、「ナオミの両親を殺したのは俺だ。本当の仇はこの俺だ」と打ち明ける。そして、REXの攻撃で腕を切断される致命傷を負いながらも、スネークにナオミへ遺言を伝えるよう懇願し、最期はREXに踏み潰され死亡した。
さらにこの際にスネークに残した「俺たちは政治や戦争の道具なんかじゃない。戦うことでしか自分を表現できなかったが、いつも自分の意思で戦ってきた。」という言葉はスネーク自身やその後の彼の進む道に対して大きな影響を及ぼした。
スネークはナオミに、「俺（グレイ・フォックス）のことは忘れて、自分の人生を精一杯生きろ…」と嘘の遺言を伝え、ナオミにとってのグレイ・フォックスは、彼女の人生の最期まで「良き兄」であり続けることとなった。
『メタルギアソリッド インテグラル』では、グレイ・フォックスが受けたVR訓練として、いくつかのミッションでサイボーグ忍者を操作できる。スネークとは異なる超人的な動きが可能で、ステルス迷彩等、オリジナルの要素がある。VR訓練での標的はスネークになっている。
REXに踏み潰されそうになったグレイ・フォックスは、スネークに「スティンガーを撃ち込め！」と叫び、スネークはそれに従ってスティンガーをREXに撃つ。REXは破壊されたが、スネークはこの時の衝撃で頭を打って気を失い、そのあとリキッドとの一騎打ちに移る。
ビッグ・シェル占拠事件（プラント編）.
担当声優.
『メタルギアソリッド』では、日本語版は塩沢兼人、英語版はグレッグ・イーグルスが担当した。
船員
船員（せんいん、）とは、船舶に乗り組んで海上で働く人々の総称。船乗り（ふなのり）とも。古くは船方（ふなかた）とも言った。
世界の船乗りの概説.
世界の統計、船員の数.
（船員の全部ではなく、一部ではあるが）
供給国.
需要.
需給関係.
今後オフィサーの供給は漸増してゆくと予測されているが、その増加量は今後の需要の増加に追いついていない、と見られている。
日本海洋事業のように船員を派遣する企業もある。