両親とは探偵稼業を始める前に死別しているらしいことが、『仮面舞踏会』中の金田一の台詞から窺える。生涯独身であったとされ、『犬神家の一族』で野々宮珠世の美しさに目を引かれる場面では「およそ女色に心を動かしたことのない金田一耕助」とも表現されている。しかし、決して朴念仁というわけではなく、『獄門島』の鬼頭早苗と『女怪』の持田虹子に対して想いを寄せているが、いずれも実ることはなかった。
『夜歩く』のお静や『仮面城』の戦災孤児・三太など、関係者を事件解決後に引き受けあるいは引き取っている場合があるが、その後どうなったかが描写されることはなく、「家族」と呼べる存在になったかどうかは明確でない。
警察から高い信頼を受けており、ことに「警視庁の古狸」と異名をとる等々力警部は公私共に付き合いのある大親友である。同じく「岡山県警の古狸」と異名をとる磯川警部とも、事件があれば助力を受け合う旧知の仲である。ほか、等々力警部の部下である新井刑事や、アパートの所轄・緑ヶ丘署の島田警部補、筆者の住居の所轄・成城署の山川警部補なども金田一の手腕に一目置いており、複数の作品にたびたび登場している。
元・愚連隊上がりの多門修という冒険好きの若者を冤罪から救ったことがあり（『支那扇の女』など）、この多門は金田一を慕って、たびたび捜査の助手を務めている（『雌蛭』には多門六平太という多門修とほぼ同じ経歴の人物が登場しており、同一人物と思われる）。同郷の後輩で「新日報社」社会部の宇津木慎介記者（『女王蜂』）や「毎朝新聞」文化部の宇津木慎策記者（『白と黒』『夜の黒豹』など）は、金田一が必要とする調査を請け負う見返りに特ダネにつながる情報を金田一から提供されるという協力関係にある。
記録者.