この時期、ルソーは度重なる誹謗中傷に対して自分の弁明をしなければと考え、回想録を書こうと考える。スイスでの流転やヒュームへの不信と確執は『告白』（）を書き始める契機となった。
晩年.
しかし、ルソーの病状は好転しては悪化したりを繰り返していて、この旅のさなかでも極度の不安に陥ることがしばしばあった。
その死後、フランス革命が勃発、かれは革命の功績者と讃えられ、栄誉の殿堂パンテオンに合祀されている。
思想.
社会契約説.
先駆のトマス・ホッブズやジョン・ロックと並びルソーは、近代的な「社会契約（）説」の論理を提唱した主要な哲学者の一人である。
ルソーは、自然状態の人間について次のように語っている。
理性によって人々が道徳的諸関係を結び、理性的で文明的な諸集団に所属することによって、その抑圧による不自由と不平等の広がる社会状態が訪れたとして、社会状態を規定する（「堕落」）。自然状態の自由と平和を好意的に描き、社会状態を堕落した状態と捉えるが、もはや人間はふたたび文明を捨てて自然に戻ることができないということを認めて思弁を進める。
言語論.
『言語起源論』は、『人間不平等起源論』とともに構想されたルソーの著作であり、言語の起源を音声（音声言語）に求める。そしてエクリチュール（書かれたもの）については、情念から自然に発声される詩や歌を文字で表そうとする試みが、あくまでもその根源であるとする。そして歴史的な過程の中で言語からは情念が失われ（「堕落」）、理性的で合理的な説得の技術が重要となり、そしてそれは政治的な権力に代わったと、ルソーは考える。
文明論.