山鹿義昌（平馬）→山鹿義甫→山鹿義一＝山鹿義著→山鹿義都＝伊織義肥＝山鹿義勉＝山鹿義質
赤穂藩.
しかし赤穂城は、広大な不等辺多角形で、本丸が南東に偏っており、「城は小さくまろく左右対称に作るべし」「堅固を前うしろにて致す心得のこと」という山鹿流の縄張りとは大きく異なる。
また、浅野長直は赤穂に流刑時代の素行お預かりを担当している。
創作・巷説と考察.
芝居の赤穂浪士といえば「山鹿流陣太鼓」（越後流の働事太鼓）が有名だが、実際には「一打ち二打ち三流れ」という「山鹿流の陣太鼓」というものは存在せず物語の中の創作である。また、大石が「ダンダラの中に黒右二つ巴（赤穂大石氏家紋）」が描かれた薄い平太鼓を叩いているが、山鹿流の兵学にタンバリンのような平太鼓の記載はない。さらに、大将が自ら家祖の紋を撥にて叩くのは不吉である。
押太鼓というのは広い戦場での合図のために用いるため、川中島絵巻や屏風（山鹿流では「車懸りは敵方の備え立て三段四段なるに用ふれば功大なり」と記す）に描かれているような「長胴太鼓」で非常に大きい。とても一人の人間が左手だけでぶら下げて持てるものではない。また、実践では大将は指図はするが、自分で太鼓を叩いたりはしない（「旗本や諸手の可作法の事」）。赤穂義士側の史料では討ち入りでは「太鼓はなく鉦が鳴らされた」と書かれている。
素行の年譜や日記において、赤穂義士の名は一人も書かれていない。また反対に、『堀部武庸日記』『赤城盟伝』など義士の著作や書簡、及び『堀内伝右衛門覚書』『波賀朝栄（ともひさ）覚書』ら義士から聞き取りした文献に、山鹿流や素行の記述は皆無である。
中興の祖・窪田清音.
山鹿流を軸に甲州流軍学、越後流、長沼流を兼修した窪田清音の兵学門人は三千人。近代兵器が出現後も、清音は山鹿流の伝統的な武士道徳重視の講義をしたが、石岡久夫の研究によると、清音が著した五十部の兵書のうち晩年の「練兵新書」、「練兵布策」、「教戦略記」などは練兵主義を加え、山鹿流を幕末の情勢に対応させようとした大きな傾向があるという。この窪田兵学門人の英才である若山勿堂の山鹿流門下から、勝海舟、板垣退助、土方久元、佐々木高行、谷干城、清岡道之助ら幕末、明治に活躍した逸材が輩出された。