本節で解説するキャラクターは基本的に“キャラクター”としての内容を記載。本編未登場の種族に関しては本編節同様現実の細胞についても簡易的に解説している。
はたらく細菌.
こちらは体内の細菌を擬人化している。いわゆる悪玉菌から善玉菌まで様々な細菌を有害無害問わず扱う。
舞台はとある女子高生の体内。初期は主に腸内細菌の陣取り合戦が描かれていたが、次第に口内や皮膚の表面などを舞台としたストーリーも描かれるようになる。他作品に比べると宿主の日頃の行動（食べる物や体の手入れなど）がダイレクトに物語に影響しており、掲載誌の趣向で美容に関連する話題も取り扱う。
『はたらく細菌』のキャラクター.
本編とは異なり、細菌は人間に近い容姿で描かれている。細胞も本編同様に擬人化されて登場するが、頻度は多くない。
はたらかない細胞.
はたらく細胞BLACK.
細胞が働く劣悪な環境（不健康・不摂生な成人男性の体内）をブラック企業に喩え、喫煙・飲酒・カフェインがもたらす影響やED・円形脱毛症・水虫・淋病・胃潰瘍・狭心症・痛風・心筋梗塞・痔・糖尿病・うつ病・がんなどを取り上げている。コミカルな本編や他のスピンオフ作品に比べ、レギュラーキャラクターでさえ途中で死んでいくなど全編を通してシリアスかつ殺伐とした雰囲気、青年漫画ならではの題材と描写が特徴である。
はたらく細胞フレンド.
はたらく血小板ちゃん.
『はたらく血小板ちゃん』のキャラクター.
女性の健康問題を扱っている。
はたらく細胞イリーガル.
はたらく細胞マッスル.
はたらく細胞 猫.
はたらく細胞 おくすり.
書誌情報.
スピンオフ漫画.
原作者の清水茜が監修を務める。
関連書籍.
ノベライズ.
講談社の児童書レーベル、講談社KK文庫および講談社青い鳥文庫からそれぞれ別個に刊行された小中学生向けノベライズ。ほぼ漫画本編のエピソードを再構成しており、文章による詳細な状況描写が独自に加えられたりしている。
図鑑.
テレビアニメ.
TOKYO MXほかにて放送。ナレーションは能登麻美子。
製作.
反響.
複数のテレビ番組で特集され、全国の学校の授業で『はたらく細胞』のアニメが鑑賞されている様子や、受験勉強にも役立つと話題になっているなどと紹介された
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