また、おそらくは明治時代初頭までは、ヤマザクラの咲く季節には祝島の周囲にたくさんのクジラが見られたとされており、出産と子育てに使用されていた可能性がある。大村秀雄は考察材料から鯨種をコククジラと推定して同種の瀬戸内海への回遊と繁殖を示唆したが、実際に周防灘や伊予灘や芸予諸島等を重点的に利用していた鯨種は厳密には不明である。
近年にも、まれに周辺でクジラや他のイルカが見られる事もある。
歴史.
万葉集にも登場するなど、古代から栄えた歴史を持つが、高度経済成長期から人口が流出。現在は漁業と有機農業で生計を立てる過疎地域である。
万葉集では「伊波比島」（いはひしま）と表記され、
と、航海の安全を祈願する歌が登場している。また、位置から見ても、祝島と上関港は、奈良時代から近畿と九州の国東半島を結ぶ最短の航路上にあたり、海上交通の要衝となる寄港地であったとされている。このため、船の安全を祈願する神霊の島と崇められてきたという。
また、いわゆる源平合戦といわれる治承・寿永の乱で、平家の水軍の将・平景清の墓と言い伝えられる石塚が島内に存在し、「平家塚」と呼ばれている。
地域.
夏は台風の進路にあたるためその強風や、豊後水道を北上する冬の強風や荒波の直撃から住居を守るために、石を積み、土や漆喰、セメント（モルタル）などで固めた、一見石垣のように見える練塀（ねりべい）と呼ばれる塀が、軒下で屋根と連結され、住居の周囲を覆っている。塀と塀の間にはさほど広くない路地が迷路のように入り組み、城壁のような練塀の景観が異彩を放ち、祝島集落の独特の情緒を醸し出す。
産業.
昔から漁業が盛んで、現在でも漁業を中心とする半農半漁を営む島である。漁業、農業、遊漁、観光などが、島民の主な収入源となっている。
祝島市場（旧・祝島漁協）は祝島の経済の要であり、海産物のみならず、「祝島びわ産直グループ」のビワやビワ茶、あるいは、みかん、寒干し大根などの委託販売をする。祝島漁協は島民の屋台骨を支え、島おこしと生活権を守ってきた重要な団体であったが、合併などにより漁協は山口県漁協祝島支店に改組され、通信販売部門は現在祝島市場が担っている。
漁業.