医学においては人体の多数の臓器群は、その機能に基づいて大別されて、それぞれがひとつのまとまったシステム（系）として理解されており、栄養（消化）等々の一連の機能を「消化器系」、循環機能（血液やリンパ液などの体液を体内で循環させ、それによって、酸素、栄養素、白血球などの免疫細胞 等々等々も各臓器に輸送し、不要となった物質を泌尿器系に輸送し、また臓器や組織どうしが一種の要請や命令を伝え合うホルモンや「メッセージ物質」と呼んでもよいさまざまな微量物質のやりとりを可能にすること）を担う「循環器系」、呼吸機能（とりこむべき酸素と廃棄すべき二酸化炭素の交換を行うこと）を担う「呼吸器系」、血液から不要な物質を濾過・選別し尿として体外に排出する機能を担う「泌尿器系」、生殖機能（子孫を残す機能）を担う「生殖器系」、内分泌機能（血流中にホルモンなどの微量物質を放出すること）を担う「内分泌器系」、体内外の環境変化やストレスなどの情報に応じて生体各部を調節する「神経系」、感覚機能（体外/体内の（物理的な）感覚情報を受け取ること）を担う「感覚器系」、身体運動機能（身体を支え、動かすこと）を担う「運動器系」（骨、関節、靭帯、筋肉などを含む）などに分類されている。
なお、ここ数十年の医学的研究によって、臓器に指令を出しているのは神経系だけではなくて、人体の各臓器ひとつひとつや組織や細胞群がそれぞれ、他の臓器に対して要請や命令として機能する微量物質、いわば「メッセージ物質」と呼べるようなものを放出しており、人体の総体としてはそちらのほうがむしろ中心的、主であることが理解されるようになってきている。例えば脂肪細胞が食欲をコントロールするような微量物質を放出している、脂肪細胞のほうが主体となって脳に対して命令を出している、ということが、ここ数十年で理解されるようになってきている。また臓器が臓器に対して直接に（脳を一切 介さず）要請や命令を出すようなやりとりが大量に行われていることも判ってきている。
社会学.
社会学において、「機能」はあるシステムの目的に対し何らかのかたちで貢献するか否かという視点から捉えたシステム全体または一部の作用をさす。
システム工学、ソフトウェア工学.