藤田は「将軍義昭とその関係者一行の逗留によって、あたかも鞆の浦周辺には幕府が成立したかの様相を呈していた」と評している。だが、義昭とその周辺は鞆に下向し、依然として政治的な勢力であったものの、鞆にいた義昭には朝廷との関わりがなかった。この時の義昭は「天下人」として天下を掌握できておらず、また朝廷を庇護する存在でもなかった。そのため、鞆幕府の呼称を用いない研究者もいる。
財政.
鞆幕府の財政は、備中国の御料所からの年貢の他、足利将軍の専権事項であった五山住持の任免権を行使して礼銭を獲得できたこと、日明貿易を通して足利将軍家と関係の深かった宗氏や島津氏からの支援もあり、困難な状態ではなかったといわれている。
毛利氏との関係.
毛利氏は将軍である義昭を擁立したことで、信長と対決する上での大義名分を得て、各地の大名を糾合することができた。毛利氏単独では、信長との戦いで勝機が見いだせず、多くの大名を味方に引き入れる必要があったが、「毛利氏のために合力してほしい」と頼んでも応諾してくれる可能性は低かった。だが、義昭を擁立した結果、毛利氏は信長との戦いを「将軍家に忠義を尽くすための戦い」とすることができ、これを内外に宣明し、大名らの共感を得られるようになった。義昭は「天下諸侍の御主」であり、主君に忠義を尽くすことは、武家社会の根幹を成す基本原理でもあった。そして、この「将軍家のために」というスローガンは毛利氏のみならず、反信長陣営共通のスローガンとなった。
毛利氏は義昭を擁立したことによって、毛利氏の名を広く大名らに知らしめるに至り、その名声を一気に高め、これは信長と戦ううえで大きな利点となった。毛利氏が信長と戦うにあたっては、各地の反信長勢力とともに戦わねばならず、そのために毛利氏の知名度を上げる必要があり、義昭の存在は大きな役割を果たした。事実、小早川隆景が後年、「公方様（義昭）が下向したことにより、毛利を知らなかった遠国の大名たちまでが、毛利に挨拶に来るようになった」、と述懐している。