足利氏の嫡流は正室所生の三男義氏が継ぎ、子孫に足利将軍家の他、吉良氏・今川氏・斯波氏・渋川氏・一色氏などが出た。なお、その内の一人今川貞世（了俊）は自著『難太平記』の中で、義兼は「（系譜上のまたいとこである源為朝に似て）身丈八尺もあり、力も勝れていた。実は為朝の子といい、義康が赤子の頃から育てた。世を憚って隠したのでこれを知る人はついになかった」と記している。
足利頼氏
生涯.
元服と家督相続.
幕府における活動.
 建長八年八月小十一日己巳。雨降。相州御息被加首服。号相模三郎時利、後改時輔、加冠足利三郎利氏、後改頼氏
深堀太郎殿　　　　　　　　　　　（『肥前深堀家文書』より）
晩年に関する研究史.
 弘長元年七月大廿九日己丑。武藏前司。筑前入道行善。常陸入道行日等。放生會之時可參候于廻廊之由。可相觸之旨。被仰下云々。随兵之中。在國輩四人辞退請文。昨日自小侍所。付武藤少卿景頼之間。今日披露。此外條々有其沙汰云々。
（中略）
（以下省略）
（『吾妻鏡』より）
 四月…（中略）…同廿四日治部大輔源頼氏弘長二年壬戌御逝去、此時為一切経会料所被寄進阿知波郷了、
（『瀧山寺縁起』「温室番帳」より）
死後.
頼氏の死後、足利氏嫡流の家督は側室（家臣・上杉重房の娘）との間に生まれたとされる家時が跡を継いだとされる。それまで足利氏の歴代当主は、代々北条氏一門の女性を正室に迎え、その間に生まれた子が嫡子となり、たとえその子より年長の子（兄）が何人あっても、彼らは皆庶子として扱われ家を継ぐことができないという決まりがあったが、家時はその例外として跡を継ぐことができた。