この一連の争いは、細川氏の内部にも大きな影響をもたらした。細川晴元は義晴・義藤父子、細川氏綱、六角定頼に為す術もなく、三好長慶とその舎弟の力を借りざるを得なかった。その一方、長慶は弟たちと協力し、京から義晴を退去させた自身の力量を見て、父の仇敵である晴元からの独立を考えるようになった。また、『細川両家記』には長慶がこの頃に範長から名を改めたことに関連して、政長・政生父子を晴元が成敗しない場合、自身が晴元を討ち果たす、内々の協議で決定したことが記されている。
三好長慶との対立.
これにより、政長や晴元の側近らが大勢討ち死にした。政生は榎並城を捨てて逃げ、山崎まで到達していた六角勢も退却した。晴元もまた三宅城を脱出し、京に戻った。
一方、この時期の出来事として、義晴の娘（義輝・義昭の妹と推定）が若狭国の武田元栄（後の義統）に嫁いだことが知られている。具体的な時期は不明なため、義晴の没後であった可能性もあるが、三好長慶の台頭に対抗しつつ京都へ帰還を果たすためには若狭武田氏との関係強化が欠かせないと判断した義晴が、史上初めて足利将軍家の子女を守護大名家に嫁がせる決断をしたとも考えられる。
最期.
その一方で、義晴の死の直後に奉公衆の進士晴舎から上野の横瀬成繁に充てられた書状には、義晴が「自害」したと記されており、病状の悪化によって進退窮まった義晴が自ら命を絶った可能性もある。義晴は前々より、辰の日の辰の刻に死ぬと宣言しており、死の数日前から家臣を集め、今後のことを話していたという（『万松院殿穴太記』）。
偏諱を受けた人物.
武家.
「晴」の字.
※三淵氏（三淵晴恒・三淵晴員（細川幽斎の実父）ほか）に関してはもともと「晴」の字を代々用いる家柄であるため上に含めない。
蛍光ペン
特徴.
蛍光ペンの色には主に、黄色、黄緑色、オレンジ色、ピンク色、水色（空色）、紫色などがある。このうち特に黄色などの淡い色は、複写機のコピーに写りにくい性質があるが、これは複写機の読み取り機能や濃度設定にも左右される。