文化部の機能は文化的活動の支援である。意匠局（文化的活動に必要な物品、例えばペンキや工具の管理）、催事局（寮内イベントの支援）、新聞局（吉田寮新聞の発行）、食堂局（寮自治会と食堂使用者との連絡）、電算局（電気機器の管理）、情報局（学内情報収集）、言語支援局（寮内多言語化の推進）からなる。
庶務部の機能は名簿や現金、郵便物等の管理である。印刷機係（輪転機の使用料金の徴収）、自動車係（駐車場の車の管理）、郵便・荷物局（郵便物の仕分け）、宿泊係（寮外者の宿泊台帳の管理）、集金係（寮費の徴収）、寄宿料・負担区分係（寮費の提出）、名簿係（寮生名簿の提出）、大会計（寮自治会の会計）からなる。
他の寮内組織には執行委員会（外交等）、評議会（総会の開催等）、監察委員会（会計監査、退寮処分）、選挙管理委員会、入寮選考委員会などがある。執行委員会、評議会、監察委員会は相互に抑制し合う権力分立の関係にある。
門限や消灯時刻、起床時刻など明文化された生活規則は少ない。その代わり、吉田寮自治会は寮生に対して、寮生活で問題が起きたときは当事者同士で対等に話し合い解決するよう求めており、これが基本的な生活規則となる。寮生を対等にするための取り組みとして「後輩は先輩に敬語を使用しないでよい」というタメ口文化が存在する。
歴史.
旧寄宿舎時代.
第三高等中学校寄宿舎の竣工.
旧寄宿舎の開舎.
自彊会結成.
一時閉鎖事件.
旧寄宿舎の再開と、自治の始まり.
自彊会の衰退、以文会の発展.
自彊会は最初の数年間、旧寄宿舎の「自治」を主導していた。しかし時間が経つにつれて現役舎生の自彊会会員は減少し、その影響力も必然的に弱まっていった。自彊会自体もやがて活動を停止した。
寄宿舎移転問題.
寄宿舎の移転は三代目京大総長菊池大麓の意向だったといわれる。菊池は青少年の健全な育成に切磋琢磨が必要であることには同意していたが、少なくとも新寄宿舎は「切磋団体」である以前に、学生とくに優秀な学生の福利厚生施設にしたいと考えていた。寄宿舎が入舎選考権を持つことにも否定的だった。
戦前の吉田寮.
新寄宿舎（吉田寮）の開舎.
沢柳事件.
スペインかぜ集団感染.
京都学連事件.