プレイヤーは、オープンワールドで再現されたホグワーツの内部や周辺の地域を自由に探索できる。ホグワーツ内には様々な謎や仕掛けがあり、それを解くのがやり込み要素の一つになっている。周辺の地域にはホグズミードを始めとした村や集落があり、広大な大自然が広がっている。マップには、敵クリーチャーとしてモンスター・闇の魔法使い・密猟者などが徘徊しており、戦って倒すことができる。
ファストトラベルは、「煙突飛行粉」を使って行う。フィールドに設置された煙突飛行粉に近づくことでファストトラベルを解放でき、解放後はいつでもマップ上からその煙突飛行粉を選択してファストトラベルができる。
クエスト.
呪文.
呪文は、メインクエストの進行上で習得するか、ホグワーツの教授たちが主人公に出す課題をクリアすることで習得する。呪文は「必須呪文」「制御呪文」「攻撃呪文」「強制呪文」「万能呪文」「変身術」「許されざる呪文」というカテゴリで分類されており、〇×△□の各ボタンに割り当てて使用する。
「変身術」は必要の部屋でのみ発動可能。「許されざる呪文」は戦闘時のみ発動可能。
戦闘時は呪文にクールタイムが発生し、一度発動するとクールタイムが終わるまで再発動できない。クールタイムの長さは呪文によって異なり、強力な呪文ほどクールタイムが長い傾向にある。
必要の部屋.
物語中盤で解放される、主人公専用の部屋。魔法薬調合台や植木鉢、家具などのオブジェクトを自由に配置でき、壁や床・天井などもカスタマイズできる。物語を進めて飼育場を解放すると、そこで捕獲した魔法生物を飼育することができる。
オブジェクトは「出現呪文」で呼び出し、その際には「呪文クラフト」が必要になる。呪文クラフトは、ホグズミードの学術書専門店で購入するか、マップ上にある宝箱で入手する。また、オブジェクトを呼び出す時には「ムーンストーン」を消費する。ムーンストーンは、マップ上にある鉱石を壊すことで入手できる
一度配置したオブジェクトは、変化呪文を使えば色やデザインを変えたり、場所を移動することができる。また、エバネスコの呪文でオブジェクトを消すことも可能。
装備品.