伊邪那岐命・伊邪那美命はさまざまな神々を生み出したが、火の神火之迦具土神を出産した際に伊邪那美命は火傷で死ぬ。そのため伊邪那岐命は怒って火之迦具土神を十拳剣で切り殺した（この剣からしたたった血からまた神々が生まれる）。伊邪那岐命は伊邪那美命に再び会うため黄泉の国へ赴くが、伊邪那美命は変わり果てた姿になっていたため、おののいた伊邪那岐命は逃げた。伊邪那岐命は黄泉のケガレを清めるために禊ぎをしたが、このときもさまざまな神々が生まれた。最後に生まれた天照大御神（日の神、高天原を支配）・月読命（月の神、夜を支配）・須佐之男命（海を支配）は三貴神と呼ばれ、伊邪那岐命に世界の支配を命じられた。
神産み.
大八洲国やその他の小さな島々を産んだ伊邪那岐命・伊邪那美命は次に神々を産んだ。ここで産まれた神は家宅を表す神および風の神・木の神・野の神といった自然にまつわる神々である。
火神被殺.
伊邪那岐命は伊邪那美命の死に涕泣したが、この涙から神がまた生まれた。
伊邪那岐命は伊邪那美命を出雲国と伯伎国（伯耆国）の境にある比婆（ひば）の山（現在の島根県安来市域内）に葬った。妻を失った怒りから伊邪那岐命は火之迦具土神を十拳剣で切り殺した。この剣に付着した血からまた神々が生まれる。なお、この十拳剣の名前を「天之尾羽張（あめのをはばり）」、別名を「伊都之尾羽張（いつのをはばり）」という。
また、殺された迦具土神の体からも神々が生まれた。
黄泉の国.
伊邪那岐命は伊邪那美命を取り戻そうと黄泉国へ赴いた。
黄泉に着いた伊邪那岐命は、戸越しに伊邪那美命に「あなたと一緒に創った国土はまだ完成していません。帰りましょう」と言ったが、伊邪那美命は「黄泉の国の食べ物を食べてしまったので、生き返ることはできません」と答えた（注：黄泉の国のものを食べると、黄泉の住人になるとされていた。これを「黄泉竈食ひ（よもつへぐい）」という）。さらに、伊邪那美命は「黄泉神と相談しましょう。お願いですから、私の姿は見ないで下さいね。」といい、家の奥に入った。
おののいた伊邪那岐命は逃げようとしたが、伊邪那美命は自分の醜い姿を見られたことを恥じて、黄泉醜女（よもつしこめ）に伊邪那岐命を追わせた。