室町から戦国期にかけて、久慈郡は糠部南部氏の勢力下に置かれ代官が派遣され、他の諸氏と同様に戦国期までの事跡は不詳であるが、室町後期には九戸郡一帯は久慈氏の統治下にあった。
年代の伝えはないが、久慈政継は、三戸南部氏の代官として出羽大曲に駐在し、平賀・大曲両郡の所領を管理中、堺に合戦、討死した。弟の久慈信継により遺領を相続するが、成長の後久慈治継へ退き、晩年双親のため銀春山長久寺を建立する。
信実以降は、八戸氏、新田氏、九戸氏、東氏、中館氏、出ル町氏などと婚姻関係を結んでいるが、戦国期になると、九戸氏との関係が深くなっていった。
系譜.
 七戸氏　本名南部　久慈　　新田
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　加賀美遠光
 　　　　　　　　　　　　　　秋山光朝　　小笠原長清　　 　南部光行　　加賀美光経　於曽経行　大弐局
 　　　　　　　　　　　　 一戸行朝　南部実光　波木井実長　七戸太郎三郎　四戸宗清　九戸行連
 　　　　　　　　　　　　（一戸氏）（三戸氏）（八戸氏） 　　　　　朝清　（四戸氏） （九戸氏）
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　久慈太郎　　　七戸三郎　　　　久慈五郎　
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　光興（義清）　　光継　　　　　　光治　
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　久慈尾張　 　　（七戸氏）　　　久慈刑部　　
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　継治　 　　　　　　　　　　　 清朝　　
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　久慈大煩　　久慈下野　　　　　　　　 久慈助六
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　治長　　　　治広　　　　　　　　　　治広　　
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　治慶
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　宗治
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　朝治　
 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　治国
 　　　　　　　　南部守行　　　　　　　　信治
 　遠江守　大膳大夫　　　　　興次郎　　　　治行
 　　　　　彦三郎　彦次郎　　左衛門尉　　　治政
 　　　　　　　　　彦次郎　　　　　　　　　備前守
 　　　　　　　　　通継　　　　　　　　　信実