日本仏教では、密教と別の大きな系統として、浄土教系の仏教がある。日本の浄土教の祖といえる法然は、諸行をすべて捨てて「称名」のみを選択し、念仏に専念した。一心に阿弥陀の名を唱える念仏は、バクティ・ヨーガの道と同じ考え方である。日蓮もまたバクティ・ヨーガの流れにあり、マントラ・ヨーガ行者であるともいえる。一遍の踊念仏もバクティとの共通性が深い。明恵はインド仏教のヨーガ瞑想法が達した最高境地を表した『華厳経』を拠り所に、ヨーガ瞑想法を中心とする修行を行った。道元は禅宗として禅を仏教の本道から独立させようとする考えに異を唱え、ブッダへの回帰を目指し禅の教えを説いた。
また、ヒンドゥー系ヨーガで強調されたカルマ・ヨーガ（行為のヨーガ）は、日本ではかなり独自の発展を遂げた。世俗の諸芸道を修行の道と同置して宗教的な意味を与え、芸道や武道の「道」に邁進することが悟りの修行であるとした。こうした教えは、日本では特に禅宗の道元が強調し、さらに江戸初期の鈴木正三が一段深化させ、すべての職業の実践を悟りへの道に結び付けた。
このように、日本には仏教の修行法としてヨーガが伝わり、長い伝統を持つが、日本ではそれはほとんど認識されていない。インド思想研究者の保坂俊司は、明治・大正の日本人が、脱亜入欧・西洋近代化を目指し、仏教などの既存の日本の文化との連続性を断とうとした行動が、近代以降に日本に入ったインド思想やヨーガと仏教の伝統に連続性があっても自覚できず、訳語の不適当・曖昧さゆえに、翻訳元の本来の意味や内容を正確に把握できないという弊害をもたらしたと指摘している。哲学者の井上哲次郎は、欧米の思想の翻訳の際に仏教関連用語を意図的に避けており、そのため瞑想関連の訳語には混乱がみられる。こうした事情のため、日本人はインド思想やヨーガ（ヨガ）と日本の仏教や伝統精神の連続性・関連性をほとんど自覚していない。
近代ヨーガの受容.
精神世界の潮流.
メディアでの紹介と普及.
こうしてヨーガは、一定の支持者を獲得していた。この頃のヨーガは、中高年を対象にした単発ポーズを行うソフトなヨーガか、インドから直輸入した本格的なヨーガであった。
オウム真理教.