本作独自のシステムとして「連携」がある。コマンドから「連携」を選ぶと、最初に選んだ技や魔法に応じて仲間達が続けて攻撃する。特定の技が揃うと専用の連携技が出る事もある。但し、連携には「連携ゲージ」を消費する。ゲージはターン経過で回復。
また、演出面もドラグロから進化しており、敵にはダメージアニメーションが追加された他、攻撃の演出に応じて視点が移動したりフィールドが開けると言った要素もある。人間タイプのボスは攻撃時に声を発するようになった。
アドベンチャーパート.
ドラグロ同様、イベントシーンはアベンチャーゲームのように進行する。
多数の選択肢が存在し、展開が多少変わる事はあるが、ストーリーそのものは一本道である。この状態ではいつでもセーブが可能であり、ロードの際は最後に通過したセーブポイント（その都度画面に表示される）から再開する事になる。また、常にメニューを開けるので、イベントを挟む連戦の場合はこれを利用して回復する事が出来る。
コンバート.
本シリーズの全ソフト共通のシステム。
ドラグロ及び死者の呼ぶ館のセーブデータを読み込ませることで、隠しアイテムやイベントなどを出現させることができる。特に死者の呼ぶ館のミニゲーム「百物語」をクリアした状態をコンバートすると、隠しダンジョンが出現する。
また、ドラグロに関しては同じ世界が舞台でジャンルも同じRPGである為、引き継げるアイテムが多い。それらのアイテムはコンバート時のデータで必ずしも所持している必要は無く、それまでの周回で一度でも手に入れた事があれば引き継がれる。しかし一部重要アイテムは引き継がれない。
生成・合成.
どちらも有料である。また、前者はレアなアイテムを生成すると以降の料金が上がってしまう。
辞典システム.
ナンパ.