フラッシュバルブ式の大便器に設置される場合は負圧発生時に薬液が上水への逆流を防止するためバキュームブレーカ以降に薬剤供給装置の連通管が取付られ大概はバキュームブレーカ下部に連通管連結カップリングアダプターが組込まれてその下に便器への洗浄管が接続され、フラッシュバルブ閉止（便器洗浄終了）時にバキュームブレーカから配管への吸気と同時に薬剤供給装置から便器に薬液を排出する。
薬剤供給装置の芳香用の芳香剤はかぐわしい香りの香料が使用されて、薬剤供給装置内に香料がセットされて芳香スリットから香りを発散するものと、便器洗浄薬液に香料が添加されたものがありこの場合、便器洗浄時に便器から出てきた薬液で芳香した後も洗浄後便器溜水部に溜まった薬液によってトイレ内を芳香するものがある。
尿中のカルシウム分は、細菌の働きによって水に溶けない成分に変化し、これに腐敗有機物が複雑に混ざり合うことで、小便器排水管系にスケール（尿石）として強固に付着する。特に、ホテル、オフィスビル、百貨店、駅などのように多数の小便器が併設される場所では、各小便器を、床スラブ下に設けた共通の横引き管に連通し、この横引き管を経由させて排水竪管へと排水を導いている。小便器排水管系の中でも、排水竪管に至るまでの横引き管において尿石の付着量が多い。このことから水洗便器用薬剤供給装置は男性用トイレでは尿の排泄に使用する小便器のみに設置される事が多いが女性用トイレでは実質上大便器が小便器の役割を果たしており尿の排泄に晒される頻度が極端に高く大便器内や大便器排水路の尿石付着も著しくなることから大便器に設置される他、より衛生面や快適性、配管保護を重視する施設では男性用トイレの大便器にも設置される。また設置される便器も施設の全ての便器に設置される場合や、利用者が多いフロアの便器のみに設置される場合がある。
水洗便器用薬剤供給装置が設置してあるトイレにおいては薬剤供給装置付近やフラッシュバルブ付近に「この便器は薬剤で洗浄しています」とか「この便器は水か流れた後に薬剤が流れます」や「みなさまに安心してトイレをご利用頂くために便器内に薬剤を供給しています」等の啓発表示されていることがある。
作動原理.
また、洗浄管内や便器内通水路部内に残留した薬液は次回の洗浄開始時に便器から出てきて便器の表面が隅々まで薬剤で洗浄がなされる。