しかし、疫病は更に激しくなり、天皇も病に伏した。馬子は自らの病が癒えず、再び仏法の許可を奏上した。天皇は馬子に限り許した。馬子は三尼を崇拝し、寺を営んだ。ほどなくして、天皇は崩御した。殯宮で葬儀が行われ、馬子は佩刀して誄言（しのびごと）を奉った。守屋は「猟箭がつきたった雀鳥のようだ」と笑った。守屋が身を震わせて誄言を奉ると、馬子は「鈴をつければよく鳴るであろう」と笑った。『日本書紀』の本文には、「由是、二臣微生怨恨（これによって馬子と守屋は恨み合うようになった）」とあるため、後述の皇位継承問題も含めて、2人の対立は崇仏論争は関係ないとする説も存在する。
敏達天皇の次には馬子の推す用明天皇（欽明天皇の子、母は馬子の妹）が即位した。守屋は敏達天皇の異母弟・穴穂部皇子と結んだ。
丁未の乱.
迹見赤檮が大木に登っている守屋を射殺した。寄せ手は攻めかかり、守屋の軍は敗北して逃げ散った。戦いにおいて守屋の一族は尽く殺害された。
八尾市南太子堂には迹見赤檮が物部守屋を射たときの矢を埋めたとされる鏑矢塚、その南西には弓を埋めたとされる弓代塚がある（迹見赤檮発箭地史蹟、とみのいちいはっせんちしせき）。
子孫.
伝暦、御記、太子物、『今昔物語』、『扶桑略記』、『元亨釈書』等では子孫縁者が奴婢とされたとの説が受け入れられている。これに対し『日本書紀』によると奴（奴隷等の使用人、奴国、委奴などに使われた蔑称）との記述のみのため、後世の脚色だとする神野清一の異説があるが、『日本書紀』に脚色が入る可能性は想定していない。
『聖徳太子伝暦』では「子孫資財」としている。通説では丁未の乱で物部の子孫が絶えず、奴婢に零落して生き続けたからこそ美化された伝説でなく、奴婢として記録に残ったという。
奈良時代の僧で孝謙上皇に寵愛されて太政大臣禅師、法王になった道鏡は、守屋の末裔と称している。戦国時代の近江の戦国大名浅井氏も守屋の末裔と称した。
また信濃の守矢氏も守屋の次男の武麿を養子にとったと称した。さらに長門の厚東氏も守屋の子孫と称した。
先代旧事本紀における記述.
関連伝承.