更に藤原京の発掘調査の結果、藤原京は想定以上に広い範囲に及んでその南端は飛鳥の北部地域を含む可能性が指摘され、藤原京（新益京）も本来は「京」としては飛鳥との連続性を持つ地域であったとみられ、後に条坊制の整備とともに独立した空間として確立されたと考えられている。
飛鳥京.
また、永らく日本の政治・文化の中心地であったので、宮殿や豪族の邸宅などがたちならび、帰化系の人々も段々と付近に居住するようになり、なかでものちに有力氏族に成長した阿智使主（あちのおみ）を氏祖とする東漢氏がはやくから飛鳥にちかい檜隈に居をかまえていた。
また、古事記にしるされる允恭天皇の遠飛鳥宮、日本書紀にしるされる顕宗天皇の近飛鳥八釣宮については、前者がこの地で後者が河内飛鳥とする説、前者が河内飛鳥で後者がこの地とする説、両者ともに河内飛鳥とする説とがある。
なお、斉明と天武の間の天智天皇・弘文天皇（大友皇子）の両代では飛鳥をはなれ近江大津に近江宮がおかれた。
天香久山
歴史的風土特別保存地区と国の名勝に指定されている。
概要.
耳成山
概要.
この山は中新世に噴出した火山岩が侵食されてその一部のみが残存した侵食地形である。瀬戸内火山帯に属する独立峰であり流紋岩より形成される。
山口神社の山号は耳成山であるが、登山口の鳥居には「耳無山」と刻されている。この神社の祭神は高御産霊神（たかみむすびのかみ）と大山祗神（おおやまつみのかみ）の二柱であるが、明治時代以前は農耕神・水の神を祀る天神社であったとされ、雨乞いの神事が行われたという記録も残されている。
歴史.
天然の山ではなく、古代に造営された上円下方墳との説がある。大和三山が二等辺三角形をなし、かつその事実が古くより知られていた事、古事記や日本書紀において古い時代の記述が無く、ようやく日本書紀において允恭天皇の時代以降に記述が見られる事が根拠として提示される。その規模の大きさから全くのゼロから造営された古墳でなく、既存の天然山を改造したという説もあり、火山と見られるのに噴火口が無い事から、噴火口を埋めるなどの造成をした（その際に大和三山の山頂が二等辺三角形をなすように調整された）とも考えられている（もちろん上述の通り、火山岩が侵食された侵食地形というのが通説である）。
かつては天神山とも呼ばれ天神山城があったとされる。
登山.