電子の伝達によって得られたエネルギーは、ミトコンドリアマトリックスから膜間空間にプロトンを汲み出すのに用いられ、このとき輸送されたプロトンによりミトコンドリア内膜の内外に、ΔΨと呼ばれる電気化学的ポテンシャル（プロトンによって生じるpH差および電荷の差）が作り出される。これがプロトン駆動力の原動力となり、ATP合成酵素がマトリックス側に戻るプロトンを利用して、ADPと無機リン酸からATPを合成する（酸化的リン酸化）ことが可能となる。
一連のプロセスを経ず、酸素に直接渡される電子もわずかに存在し、酸化ストレスをもたらし病気や老化を引き起こすと考えられている超酸化フリーラジカルを形成する。
電子の伝達経路は、以下の通りである。
電子伝達は以下の手順で行われる。
好気的な電子伝達は以下の手順で行われる。
収支式は
嫌気的な電子伝達は以下の手順で行われる。
収支式は
電子伝達は以下の手順で行われる。
複合体IV.
電子伝達は以下の手順で行われる。
プロトン濃度勾配の生成.
また、プロトン濃度勾配を用いて、ATPの膜外への放出や共輸送によって膜内に物質を取り込むこともできる。
ミトコンドリアの役割.
ミトコンドリアの遺伝子の欠落.
ミトコンドリアは自身の環状DNAを持ち、多くのタンパク質合成を行なえるが、内部で働くタンパク質の一部などは、宿主である細胞のタンパク質生産に依存しているものがある。
光合成における電子伝達系.
光合成の電子伝達鎖は、上述の酸化鎖と多くの点で似ている。これらは可動の脂質可溶キャリア（キノン）と可動の水可溶キャリア（シトクロム等）を用いる。
細菌における電子伝達鎖.
フマル酸脱水素酵素
細菌や古細菌等の原核生物では、電子供与体や電子受容体は種類がさらに多いため、状況はより複雑である。一般的な細菌の電子伝達鎖は、以下のようなものである。
 電子供与体→ 脱水素酵素
電子供与体.
今日の生物圏では、最も一般的な電子供与体は有機分子である。有機分子をエネルギー源として用いる生物は、有機栄養生物と呼ばれる。動物、菌類、原生成物等の有機栄養生物と植物、菌類等の光合成生物で、全ての生物の大多数を占める。
この種の代謝は、有機分子の利用よりも先立っているはずであり、エネルギー源としての無機の電子供与体の利用は、特に進化学の分野で興味が持たれている。
脱水素酵素.