以上のキャラクターはそれぞれの記事を参照。
本作のボスキャラクターは一部を除きセリフがある。
スーパーマリオサンシャイン.
敵キャラクター（サンシャイン）.
以上のキャラクターはそれぞれの記事を参照。
スーパーマリオギャラクシー.
敵キャラクター（ギャラクシー）.
以上のキャラクターはそれぞれの記事を参照。
以上のキャラクターはそれぞれの記事を参照。
以上のキャラクターの詳細はそれぞれの記事を参照。
以上のキャラクターの詳細はそれぞれの記事を参照。
敵キャラクター（オデッセイ）.
以上のキャラクターの詳細はそれぞれの記事を参照。
今作では色が金色に変更された。
羽が生えたクリボー。キャプチャーすると、ボタン連打で空を飛べるようになるが、一定の高さまでしか上がれない。
でかワンワン
サイズの大きいワンワン。
植木鉢のようなものを被っており、一回帽子を当てるだけではキャプチャーできない。植木鉢の下は玉ねぎのような見た目をしている。
戦車の敵。キャプチャーすると自身が砲弾を撃てるようになり、BGMが変化する。
シマハナチャン
ロス島などに生息する生き物。体が長く伸びる性質を持っている。
ビューゴー
風を吹いて、プレイヤーを落下させようとしてくる。キャプチャーすることで、自身がトゲゾー等を吹き飛ばせる。
タコのようなキャラクター。水に触れることで、周りの水分を補給する。水を吹いて攻撃してきて、キャプチャーすることでその能力を得られる。
バブル
溶岩の敵。基本プレイヤーに向かって攻撃はしてこなく、その場で動くのみ。キャプチャーすることで、普段行くことのできない溶岩地帯を移動できる。
ツックン
クッパ城などに登場。くちばしをつき出して攻撃してくる。
本作では羽の生えた個体のみ登場。プレイヤーが近づくと、接近してくる。飛び方はパタクリボーと同じ。
マグナムキラー
大きなキラー。壁に当たっても爆発することなく進んでくる。
ブル
ラグビー選手の見た目をしたカメ。プレイヤーを見つけるとタックル攻撃をしてくる。
ガマネー
擬態しているが、帽子などで攻撃すると姿を表し、逃げていく。キャプチャーするとコインを吐き出す攻撃ができるが、自身の保持コイン数が減る。
ジャンゴ
ウツボ
赤茶色の見た目をした巨大な魚。地面や壁から体を出して攻撃してくる。
ティラノサウルス