以上の表音本則は「現代かなづかい」からの最も特徴的な部分であり、これらの本則には例外事項がほとんどない。「現代仮名遣い」における「現代語の音韻に従って書き表す」とは、「イ」の音を「い」で綴り、「ゐ」「ひ（ハ行転呼音）」の場合は「イ」の音であるから「い」とつづる、という意味であるが、歴史的仮名遣と比較するため以上のようにまとめる。
「現代仮名遣い」では「現代かなづかい」より許容範囲が広い。この使い分けは「現代仮名遣い」では中等教育から指導される。
長音表記.
長音の場合、さらに複雑な規則がある。
伸ばした音の母音を添えるのが原則であり、長音符「ー」は用いない。ただし志向形と助動詞「う」に関して後述するが、「かあさん」「しい」「つうしん」の「あ」「い」「う」は、この表記が長音を表す音韻表記である限り、該当母音が長音であることを表す長音記号であると言え、広義には長音記号を用いているとも解釈できる。
オ列長音表記.
形容詞の場合は本則通りであるが、「ありがたし／ありがとう」に見られるように語幹が変化している。これは「現代かなづかい」や「現代仮名遣い」では「語幹が変化するものもある」と説明される。歴史的仮名遣までは、語幹が変化するものはサ変「す／する」カ変「来（く）／来る」など特殊な例であったが、現代仮名遣いでは正則活用にも現れる。特例表記がなぜ存在するかについて、次で述べるように「志向形（名称は時枝文法による）」の形を導入し、その活用形から長音ではないと解釈する。また「こおり」「とお」の問題も長音ではないと解釈すれば、例外を適用せず原則だけで説明できる。
オ列長音は長音か助動詞か.
ここで一つの問題が生じる。「笑おう」の「う」は助動詞か否かという問いである。同じ表音本則の「つうしん」も「笑おう」も「こううん」の「う」と同様の意識でつづられるものだが、歴史的仮名遣では表音よりもこの点の差異、助動詞という語意識を重視する。だから歴史的仮名遣では「笑はう」となり「う」の長音は表さず、助動詞だけを表している。長音を表すようにすることで、助動詞「う」が接続して初めて「ワラオー」になったということが、表記からはわからなくなるからである。
以上の助動詞の問題、表音的ではない問題の解釈を解決するために、長音表音本則は以下のように解釈する（以下は廣田の説明によった）。
助動詞「う」.