公衆便所は不特定多数の人間が使用するため、様々な問題が発生することがある。公衆便所は汚れるのが非常に早いため、掃除が重要になってくる。このことから、専門の清掃業者を雇って掃除を行っている場合もあり、消耗品などと共に維持に費用が掛かる。また一部の公衆トイレ・公園トイレなどは男女別でなかったり、和式便器である、長期間掃除が行われていないために不潔であったり、落書きなどで汚されている場合があるなど様々な理由で、存在していても利用し辛い場合もある。また、男性の大便用や女性用の個室は、未成年や周辺の禁煙指定に我慢できない喫煙者による隠れた喫煙に悪用されることがしばしあったが、最近は煙探知機の設置が進んだ、喫煙率が低下したこと、未成年者の喫煙が年齢確認やたばこ自動販売機の撤去で減ったことなどもあり喫煙に悪用されることは少なくなった。しかし、個室にカメラなどを設置して盗撮や覗きを行う者(多くは男性)もいるほか、強姦が起こることもあるなど犯罪の場になることもある。
個人商店等の小規模店舗の便所では床面積の制約からやむを得ずトイレをひとつだけ男女共用のものとして供している場合もある。
多機能トイレ.
多目的型トイレとも呼ばれる。公共交通機関その他では、バリアフリー対策の一環として、車椅子の使用者、高齢者、障害者、乳幼児連れ等のために、ベビーカーや車椅子、介助者などもはいることの出来る十分な広さ、手すり、おむつ交換台、ベビーチェア、フィッティングボード、オストメイトのパウチ洗浄のための汚物流し、非常ボタン、聴覚障害者のための非常用フラッシュライトその他の設備がある、多機能トイレが設置されている。また、鉄道駅や鉄道車両、空港などの交通施設では、出入口のドアが押しボタン式自動ドアとなる場合もある。
仮設トイレ.
建設現場やイベント会場、山頂といった場所や、災害時の避難所などには電話ボックスほどの四角い小さな簡易の便所が設置されることがある。これは排泄物を溜めるタンクが下に存在していることから、汲み取り式便所とよく似た原理であったりするが、近年では水洗式のものもある。また、「携帯便所」と呼ばれる使い捨ての携帯製品も存在し、非常用として使われる。仮説トイレは洋式が少ないことが災害後の避難所の質の問題として取り上げられることも多い。
公立学校のトイレおよび職場のトイレ.