寺社奉行の脇坂安董は、松平康任に対抗し幕府権力の掌握を狙っていた老中水野忠邦に出石藩の騒動と康任の関係を報告した。康任を失脚させるため、水野忠邦と脇坂安董は「左京が仙石家の乗っ取りを策謀している」として将軍家斉に言上した。出石藩の騒動については娘の喜代姫経由で家斉の耳にも達しており、家斉はこの騒動を寺社奉行、町奉行、公事方勘定奉行で構成される評定所が裁定すること、その責任者を脇坂安董とすることを決めた。
裁定.
その後.
仙石小太郎は八丈島に向かうために立ち寄った三宅島で発病し、病没した。小太郎の荷物は皆盗まれ、寝巻きしか残っていなかったという。また左京の娘は白湯文字と呼ばれる私娼に零落したという。
松平康任が隠居した後、子の康爵が跡を継いだが、石見浜田から陸奥棚倉に懲罰転封された。南町奉行を解任された筒井政憲は左遷されるが、後に復権し川路聖謨と共に対ロシア外交の責任者となる。
康任を失脚させた水野忠邦は老中首座となり、天保の改革を推し進める。脇坂安董は寺社奉行から老中に就任する。騒動解決で名を上げた川路聖謨は出世の契機となった。
文芸作品.
仙石騒動は、江戸時代の講談や実録本、歌舞伎などの題材として用いられた。ただし、史実と異なり、「処刑された人物が黒、構い無しとされた人物は白である。登場人物を善玉・悪玉に分けて御家騒動の基本的構図を定める。その後、手許の史料から善悪（主に悪）の逸話を抜き出して御家騒動の筋にはめ込んで行き、その上にいくらかの創作を加えていった」 という内容であった。