一方、瞬間式は使う瞬間に水を温めて噴出する方式である。噴出する温水の量は貯湯式よりも少ないため、TOTOのワンダーウェーブ洗浄のように少ない温水で効果的に洗浄できるように工夫がなされていることが多い。使う時の瞬間消費電力は大きくなるが、温水を溜めておく必要がないためトータルの電力消費量は抑えられる上、お湯切れしないのが特徴。上位機種やタンクレストイレ一体型に比較的多く使われているタイプである。
ホテルのユニットバスに設置可能なタイプでは、浴槽や洗面に使う給湯配管を使って湯水を混合して適温になるようにしたタイプも作られている。この場合、電源を電池式としたり、さらには電源を必要としないものも存在している。
多彩な機能.
当節の冒頭にも書いた通り、「おしり」「ビデ」の他にも様々な機能が搭載されている。例えば、TOTOでは、「おしりソフト」や「ワイドビデ」などが上位機種に搭載されている。
暖房便座.
温水洗浄便座の場合、便座カバーを取付けても温水で濡れる可能性があるため便座カバーは取付けないことも多い（最新の便座は取付できない）。冬場など便座がむき出しの場合、冷たさを感じるため便座を温める機能が一般的に付いている（前述したホテル用の無電源タイプには搭載していない）。節電に対応すべく使用する時に限り温める機能を持った商品も存在する（パナソニックなど）。なお、温水洗浄機能がない「暖房便座」も一部メーカーでは発売している。
脱臭・除菌.
用便時の臭気を取り除く脱臭機能が付くタイプがある。オゾン、酸素による脱臭が一般的で脱臭カートリッジに臭気を吸収する。また、INAXの製品ではシャープの開発した「除菌イオン」（プラズマクラスター）を使った脱臭が行われている。さらに、TOTOの一部製品には、次亜塩素酸を発生させた「きれい除菌水」で、便器内を除菌したり、トイレ空間を消臭する機能が付属したものや、パナソニックの一部製品では、用便時の脱臭機能とは別に、便器内や周辺の壁の脱臭や、便器内の除菌も行う「ナノイー」が採用された機種もある。各社共、便座には抗菌素材を採用したものが多い。
乾燥.