鎌倉時代の『宮寺縁事抄』によると男山には石清水八幡宮の創建前に「石清水寺」があったという。石清水八幡宮境内からは創建年代以前の瓦が複数発見されている。
また、元々男山の麓に鎮座していたのは和気氏の氏寺であった神願寺（和気清麻呂の墓があったと伝わる）であったが、空海ゆかりの高雄山寺を神護寺に改めて新たな氏寺にした際に元の神願寺に八幡神を勧請することで新たな位置付けを与えようとして行教や清和天皇の後見人である藤原良房に働きかけたとする説もあるが、神願寺の位置については諸説あるために現時点では可能性に留まる。
また、東寺（教王護国寺）・清水寺・比叡山延暦寺・仁和寺・鹿苑寺（金閣寺）・慈照寺（銀閣寺）・相国寺・大安寺など多くの寺院と深い関係を持った。
江戸時代まで護国寺や極楽寺、弁天堂を始め「男山四十八坊」と呼ばれる塔頭・宿坊が参道に軒を連ねたといい、寛永の三筆である松花堂昭乗も当社に仕える社僧であったことが知られる。豊蔵坊は将軍家の祈願所とされ、東照大権現（徳川家康）像が祀られていた。
当宮の神仏分離・廃仏毀釈は当宮の神職であった森本信徳と谷村光訓の2人が中心となって進められ、同年には神宮寺であった護国寺は廃寺とされた。護国寺住職の道基は護国寺本尊の薬師如来像と十二神将像を淡路島の東山寺に移している。八幡宮本殿に置かれていた本尊・僧形八幡神坐像、観音堂の千手観音像、愛染堂の愛染明王像、極楽寺の本尊・阿弥陀三尊像、そして八幡宮の旧社殿は男山の東山麓にある善法律寺に移されている。
境内.
上院（山上）.
社殿は「八幡造」と呼ばれる独特の構造である。楼門から奥へと舞殿・幣殿・本殿が続き、いずれも国宝に指定されている。
下院（山麓）.
山麓には主要社殿として頓宮が鎮座する。この頓宮は祭事における神輿の待機所で、他の神社での御旅所に相当する。
祭事.
文化財.
国宝.
建造物
重要文化財.
建造物
美術工芸品
焼失した文化財
レッドブル・ホーリーライド.
現地情報.
所在地
交通アクセス
付属施設
巴基斯坦
ダッカ事件
ダッカ事件（ダッカじけん）
バングラデシュの首都ダッカで発生したテロ事件。
概要.
路線データ.
一般国道の路線を指定する政令に基づく起終点および重要な経過地は次のとおり。
路線状況.
通称.
地理.
交差する道路.