評価.
当時の皇族軍人は実質的権限を発揮しないのが通例になっていたが、実戦・実務経験豊富な博恭王はお飾りの皇族軍人ではなく、「潮気のある」一流の海軍軍人としての風格を持っていた。自ら率先して最前線に立ち、常に部下将兵を鼓舞し苦楽を共にするのを厭わない姿勢や、操艦の名手として関門海峡のような「船の難所」でも難無く艦を操るその実力は海軍内でも評価されていた。皇族風を吹かせない人柄や、軍人としての実力・けじめを持ち合わせていたにもかかわらず、昭和期の海軍トップとしては強引さや軽率さが目立ったとして批判的な評価が戦後は多かった。
。伏見宮を軍令部総長にした経緯は、陸軍内部の派閥争いが深刻なものになったため元老西園寺公望に相談の上で閑院宮に参謀総長に就いてもらった。その先例に倣って海軍も伏見宮に軍令部総長に就いてもらったと昭和天皇は述べており伏見宮本人に対する不満も述べてはいない（「昭和天皇独白録」）。
海軍の頂点として.
東郷平八郎とは『宮様と神様（殿下と神様）』と呼ばれ、海軍内で神格化されていた。博恭王は大艦巨砲主義者であったので、博恭王の威光を利用した艦隊派の台頭を招くことに繋がった。これについて井上成美は、皇族が総長に就くことで、意見の硬直化を招いたことを「明治の頭で昭和の戦争をした」と称して批判している。博恭王の総長退任時に及川古志郎海相に意見を求められた井上は、「もともと皇族の方はこういう重大事に総長になるようには育っておられない」「宮様が総長だと次長が総長のような権力を持つことになる」と手厳しく批判している。これらのことから、海軍内の条約派を追放し、日米開戦の元凶になった一因となったとして、戦後は批判的な評価を受けることが多い。実際に、博恭王を軍令部長に担いだのは「艦隊派」であり、その運動の中心となったのは艦隊派のシンボル東郷平八郎とその腹心、小笠原長生である。半藤一利は、親独派で日米開戦論者であった伏見宮が海軍で日米開戦についてもっとも責任が重い皇族軍人としている。
しかしながら日独伊三国同盟には米内光政海軍大臣、山本五十六次官らを一貫して支持して反対の姿勢を示した。