奥宮正武（当時海軍少佐、第二航空戦隊参謀）は作戦失敗の主因を『日本軍航空兵力の不足（一、日本陸軍の航空機が洋上作戦に不向きで、作戦可能機が著しく少なかった。二、海軍航空部隊がソロモン群島方面作戦とニューギニア方面作戦に従事して充分な数を集められなかった）』と指摘している。
陸軍.
第十八軍司令官安達二十三中将の所感は以下の通り。
高松宮宣仁親王（軍令部大佐、昭和天皇弟宮）は以下のように敗戦を分析している。
ラバウルを訪問していた南方軍参謀吉川正治少佐によれば、第八方面軍の航空幕僚は「海軍機の直衛の場合は、船団掩護の見地から心配である」と心配していたという。
もともとこの輸送作戦は航空の劣勢から無理があり、天皇の意向を受けた大本営陸海軍部のニューギニア方面作戦重視という観点から、成功可能性よりも必要性を優先させたものであった。
また作戦失敗の直接原因として直掩の戦闘機隊が中高度に配置されていたため、低空から進入する連合軍機に対処できなかったことも指摘される。遭難時を考慮して、もっと接岸航路をとるべきだったという意見もあった。
その後.
井本熊男第八方面軍参謀は、当時の南東方面戦局と大本営の認識について以下のように判断している。
また東部ニューギニア方面の連合国軍陸海軍航空部隊および艦船部隊に打撃を加えるべく、連合艦隊（司令長官山本五十六大将、参謀長宇垣纏中将）の主導によりい号作戦が実施されることになった。軍令部作戦課長山本親雄によれば「い号作戦について軍令部から指示した記憶はない。八十一号作戦ラエ輸送の全滅は「い」号作戦決行の一つの動機になったと思う」という。連合艦隊首席参謀黒島亀人や戦務参謀渡辺安次は、母艦航空兵力の南東方面陸上基地配備はかねてから構想していたが、第八十一号作戦失敗により作戦準備を促進したと回想している。
アエネーイス
内容.