会衆派は、回心体験を得た人々（「目に見える聖徒」）による自治（独立）を望む派閥である。よって独立派とも呼ばれる。彼らは特別な宗教指導者を置かず、信徒（会衆）による自治が聖書に基づく理想的あるいは正当なものだと信じた。
信徒は、「神の正しい礼拝に参加し、さらなる宗教的真理の探求のために互いを養いあうことを誓う」教会契約の遵守を求められた。
会衆派の教会は、個々に独立しており、自分たちで会員の認可を行い、自分たちで規律を管理し、自分たちで牧師を選任する完全な権限を有し、自分たちだけで所属する組織（教会）が自己完結しているとみなされた。聖餐式もその教会に所属する者のみに与えられた。
会衆派（独立派）は上からの権威を否定する派閥であったものの、その多数はイングランド国教会に留まり、内部から改革することを望んでいた。これはニューイングランドの会衆派も同じであり、彼らはイングランド国教会から分離したのではないと固く信じていた。これに対して、会衆派でも完全に既成の教会から分離独立しようとしたのが分離派であり、特に初期のものは、これを率いたロバート・ブラウンの名をとってブラウン派とも呼ばれる。彼らはイングランド国教会をローマ・カトリック教会と同一視し、キリスト教の教会ではないと否定した。分離派には他にも政教分離や洗礼に関する考えの違いによる急進派もおり、彼らは初期バプテスト派を形成した。
家庭.
聖書におけるアダムとイブの描写に基づいて、ピューリタンは結婚を子孫繁栄、愛、そして最も重要なこととして「救い」に根ざしたものと信じていた。
夫は家庭における精神的な長とされ、また結婚による夫と妻の関係は、配偶者と神との関係も表すものとされていた。ピューリタンの夫は、家庭の指導と祈りを通して権威が認められるものであり、そして女性（妻と娘）は男性の権威の下で宗教的な敬虔さと服従を示すものと信じられていた。そしてこれは神との関係に擬制されたものであった。
はピューリタンの結婚について次のように説明する。
一方、公の場における女性の地位の低さと、結婚における男女間の精神的平等という矛盾は、家庭と子育てにおいて女性に非公的な権威を与える結果に繋がった。
夫の同意を得て妻は子供の労働、財産管理、夫が所有する宿屋や居酒屋の経営といった重要な決定を下した。