バレンタイン祭という白咲学園の文化祭が始まる数日前。ファントムと名乗る人物から学園に脅迫状が届く。初雪はその内容から、差出人であるファントムはアキラだと考える。バレンタイン祭当日にはファントムを名乗る不審者たちが現れ、学園内で暴動を起こす。ファントムを探す初雪は、剣道場でアキラを見つける。初雪はアキラから、本当に憎いのは不良たちではなく、姉である綾だと告げられる。
綾と恋仲になった初雪は、彼女に自分の身の上話をする。綾に受け入れられて安堵した初雪は、後にアキラの正体を知る。アキラはすでに死んでおり、初雪が出会ったアキラは綾が反魂香を用いて呼び出した幽霊だった。初雪は剣で綾と戦い、綾に取り憑くアキラを消滅させる。しかし、アキラの消滅と共に、綾はアキラが取り憑いていた期間の記憶を失い、初雪のことを忘れてしまう。白咲学園の卒業式当日、初雪は自分のことを忘れてしまった綾が卒業を迎える姿を影から見届ける。
夜ルート.
アイスダンス選手である夜の周りでは、中傷などの嫌がらせや不幸な事故が続いていた。初雪は夜のことを心配し、彼女と会う回数を増やしていく。ある日、初雪は夜に呼び出され、藤枝 ミクという少女を紹介される。初雪は彼女にアプローチをかけられるが、彼女の目的が夜への嫌がらせであることを見抜く。夜にはライバルの選手に呪いをかけたという噂があり、ミクはそれを信じていた。
様々な嫌がらせから不登校になった夜を心配して、初雪は夜が通うスケートリンクを訪れる。そこで初雪は、氷上にナイトメアという幽霊を見つける。ナイトメアの正体は、反魂香によって出現した夜の生霊であり、中傷をする人々に復讐をしようと企んでいた。初雪はナイトメアを通じて夜に復讐を止めるように諭し、アイスダンス大会を目指して努力する夜を恋人として支える。
アイスダンス大会の当日も野次を飛ばされる夜は、復讐を願うナイトメアを再出現させてしまう。夜を助けるために会場に駆けつけた初雪は、藤枝ミクを唆した真犯人と対峙する。一方、氷上で滑る夜は、会場には野次だけではなく応援する声もあることを知り、復讐心の塊であるナイトメアは消滅する。復讐心を克服した夜は見事な演技を行い、野次に包まれていた会場は静まり返る。
シロクマルート.