ある日、半兵衛は食い逃げした客を追いかけ、木材置き場で客の死体を発見する。実はその男は北町奉行所の与力・三村敬十郎の命を狙っており、返り討ちにあっていた。現場に居合わせた半兵衛は男の仲間と疑われ三村に捕まり、酷い拷問を受ける。三村は証拠をでっち上げ無実の人間も犯人にしてしまうことから、奉行所の内部で問題視され、奉行からの命令で半兵衛は解き放ちとなる。
奉行所から出た半兵衛は謎の男、利助から「迷惑料」という名目の大金を渡された。興味を持った半兵衛は利助の後を付けその主で飛脚問屋「嶋屋」の女主人おせいに行き着く。おせいは必要とあらば殺しも行う裏の稼業「仕事屋」の元締で、三村の命を狙っていた。裏の事情を察知した半兵衛はおせいに口止め料を要求するが、おせいは半兵衛の度胸の良さを見込んで裏の稼業に請い、半兵衛はこれを受ける。
三村を殺すためその後を付ける半兵衛は政吉と何度も出会う。政吉は別口で三村の殺しの依頼を受けており半兵衛と同様に三村の命を狙っていた。互いの事情を知らない半兵衛と政吉は過去の因縁から会う度に反発し合う。
三村の命を狙っていた半兵衛と政吉は彼を同時に殺す。現場を離れた後、口封じのため互いに殺し合う半兵衛と政吉の下におせいと利助が現れる。おせいは政吉の得物の短刀を見て彼が生き別れた実の息子であると直感するが、それを隠し通し政吉に仕事屋にならないかと声をかける。政吉はこれを了承し、ここに新しい仕事屋が結成された。
腸捻転解消（ネットチェンジ）.
当時、必殺シリーズを製作する朝日放送（ABC）はTBS系列、毎日放送（MBS）はNET系列（現在のテレビ朝日系列）であった。新聞資本から見た時に、朝日放送とテレビ朝日は朝日新聞社が、毎日放送とTBSは毎日新聞社が出資していたため、系列と資本が異なり、「腸捻転」と呼ばれていた。この解消（ネットチェンジ）が番組の放映中に行われ、大きな影響を受けることとなる。
TBSは必殺シリーズがNET系列に移動することで視聴者が離れることを恐れ、毎日放送に「必殺シリーズと同様のコンセプトの番組制作」を依頼した。毎日放送は東映に依頼して『影同心』を制作し、視聴者の囲い込みに成功する。
制作スタッフは次回作に中村主水を再々登場させることを決め、『必殺仕置屋稼業』を製作。視聴率を好転させた。
ネット局.
必殺仕置屋稼業
概要.