江戸時代に入ると、幕府は中禅寺を篤く保護し、中禅寺境内には多くの堂塔が建立され、筑波山は神仏共立から仏教中心の霊地へと性格を変えた。こうした中禅寺に対する庇護の一方で筑波神の影は薄く、この間の筑波神の奉斎形態は明らかでない（江戸時代の動向については中禅寺節を参照）。
明治以降.
 明治以降の変遷　　　　
明治維新後、神仏分離によって中禅寺は廃寺とされた。これにより伽藍の多くが破壊されたが、数棟のみ破壊を免れて現在に文化財として残っている。また、この神仏分離により筑波山神社が復興され、その主要部は中禅寺の跡地を踏襲して形成され、現在に至っている。
境内.
筑波山中.
拝殿周辺.
拝殿周辺には門前町が形成され、筑波山神社の主要部を成している。ただし、明治以前の当地一帯は中禅寺を主とした仏教中心の霊地で、明治維新後に中禅寺が廃されるにあたって神社として復興し、拝殿が造営された。
摂末社.
摂社.
なお、旧六所神社（つくば市臼井：筑波山神社元里宮）や六所神社（つくば市泉）では、筑波男女神二座とともに上記の摂社四座を加えた「六所」が祭神とされていた。
末社.
末社は、神社整理以前には百社以上があったという。現在も大半は山中にあり、拝殿周辺にあるのは次の六社である。
参道.
なお、参道名物としてはガマの油（軟膏）が知られる。ガマの油売りの口上はつくば市の地域無形民俗文化財に認定され、保存活動が行われている。
祭事.
御座替祭.
この祭事両日には茨城県指定文化財の神橋を渡ることが許される。
中禅寺.
この筑波山寺の開山に伴い、筑波山の男女二神は観音を本地仏とする「筑波山両部権現」として祀られるようになったという。筑波山は古くより山岳修行の場であったため、その後次第に寺勢が盛んになり、寺名も中禅寺（筑波山知足院中禅寺）と称するようになったとされる。中世には日光山（輪王寺）・相模大山（大山寺）・伊豆走湯（伊豆山三所権現）等とともに、関東では有数の修験道の霊場であったといわれる。その別当は筑波為氏（明玄）に始まる筑波氏が担った。
現地情報.
男体山・女体山本殿までの登山については「筑波山#登山」を参照。
周辺
脚注.
注釈
原典
出典
太田興業
太田興業（おおたこうぎょう）は、大阪府大阪市浪速区に本部を置いた暴力団で、神戸山口組の二次団体。
乾し葡萄
メノラー
千葉県道路愛称名