その次の日の教室の最中、レオナルドが率いるピッグの船がバードアイランドにやってきたため、皆はそこに向かったものの、船がレッドの家の隣に停止した上に、家も破壊してしまったた。レオナルドが船から降りてきてパーティーを開くようになり、怪しんだレッドはチャック、ボムとともに船の中に侵入を試みる。するとその中には大量のピッグを目撃した。レッドはそれを訴えても無視されてしまう。その後も豚たちは夜中パーティーを続け、ピッグもバードアイランドに大量に流入したため、我慢できなくなったレッドは「マイティーイーグル」が住むといわれる山の頂上にチャック・ボムと向かうことになった。長い期間を経て、丘の頂上に着いた一同は湖を目撃し、その上からマイティーイーグルが姿を現すが、彼は湖に向かって尿を発射し始めてしまう。その後、マイティーイーグルの巣に入った一同は、しばらく突き合わされた後、レッドが望遠鏡でピッグがバードアイランドの住宅地から卵を盗んで船に逃げる光景を目撃し、マイティーイーグルもそこに向かうように言われるが、拒否されてしまう。その後戻ってきたレッド達は、チャックに鳥の住民たちが住宅地から離れた場所で開いているパーティーを止めさせ、レッドとボムは卵を取り返そうとするものの、すでにピッグが退避したせいで失敗する。その次の朝、鳥たちは爆撃された町と失われたピッグで悲しんでいたものの、レッドはピッグの島に船を作って向い、ピッグが使っていたスリングショットでピギーアイランドを破壊することを提案し、皆はそれに従う。一方で帰還したレオナルドは卵を捉えたためにピッグの大衆の前でスピーチを行う。ピギーアイランドに到達した鳥たちは、スリングショットでいくつかの鳥をレッドの指揮のもとで飛ばし始め、ピギーアイランドの住宅地を破壊し始める。レッド、チャック、ボムはテレンスの手を借りてついにピギーアイランド中央部の城に到達することに成功し、三人は卵のある場所に到達するものの、卵はすでに熱湯に入れられる寸前であった。その時、マイティーイーグルがやってきたので、レッドは彼に卵を丸ごと運ぶように命じ、卵を城から追い出すことに成功する。しかし、青い卵が卵の入った袋から出て行ってしまい、レッドは城に戻って卵を取り返そうとし、ボムはピッグの空軍を止めるために飛行機の発射場を爆発で止めることになる。レッドとレオナルドは最終的にピッグの城の最下層にある爆薬庫に落下し、爆弾をすべて爆発させてピギーアイランドのすべてを爆破することに成功する。その後ほぼ全ての卵はかえってきたが、レッドと青い卵はレッドが安全な場所に隠れたことで助かり、青い卵からは三羽の双子（ブルース）が孵った。その後、レッドは英雄と皆から称され、ひな鳥たちからも歌をもらい、鳥たちがレッドの家を建築しなおす。そしてレッドはチャックとボムも家に引き入れることを宣言する。