ところがその後、井関らと大隈派で対立を生じ、大隈派は株を売却、甲信鉄道へ投資してしまった。
開業後.
武蔵野のルート策定経緯.
この東京都心の新宿から西へ延びて武蔵野（多摩）とを結ぶ路線は、同地域を結ぶ街道であり江戸時代には基幹道路であった甲州街道や、庶民に利用された青梅街道からは離れており、多摩地域の要衝として発展していた府中等の既存の都市を通らない経路であった。
経路策定の理由.
このような当時の主要街路とは異なる路線を建設された理由に関して、本路線を継承した東日本旅客鉄道（JR東日本）の広報部は「諸説あることは認識しているが、社内で根拠を持って話せる人はいない」と述べている。
反対運動説.
仙石貢の即断説.
この説に関してJR東日本の鉄道博物館は「豪傑伝の可能性もあり真偽は不明」としている。
効率上の理由説.
反対運動説に対して、「鉄道忌避伝説」を唱える立場からは、全国のそう言った言説を調査して『鉄道忌避伝説の謎〜汽車が来た町、来なかった町』を著した地理学者の青木栄一は「馬車鉄道から蒸気鉄道への動力変更に当たって、建設が鉄道局に委託されたため、（平坦・効率的な最短の）武蔵野台地上の一直線ルートが考えられたと思う」と指摘している。
さらに、江戸東京博物館の学芸員として中央線を研究した真下祥幸は、「蒸気機関車の能力、燃料供給、土地買収などから地理的に最も合理的なルートを選んだ」と分析した。真下は次の理由から推測した。
関連する路線.
施設.
運行状況.
車両.
電車.
客車.
リンク先は国立国会図書館デジタルコレクションの『客車略図 上巻』
貨車.
私有貨車.
日本鉄道
概要.
もともと政府では井上勝をはじめとして、鉄道は国が敷設して国が保有すべきであるという意見が強かったが、西南戦争の出費などで財政が窮乏してしまったこともあり、民間資本を取り入れて鉄道を敷設することになった。
形式的には私鉄ではあったが、路線の建設や運営には政府及び官設鉄道が関わっており、建設路線の決定も国策的要素が優先されたり、国有地の無償貸与、建設国営など、実質上は「半官半民」の会社であった。それに関して以下のような隠喩事例がある。