病原体（びょうげんたい、）とは、生体（生物）に寄生して病気を起こさせる原生動物・細菌・ウイルスなどの生物。寄生する生物類のなかでも特に病原性を持つもの。
病原体によって起こされる病気のことを感染症という。
概要.
病原体という概念を理解し何が病原体で何は病原体でないかを判別するには、寄生という現象と、病原性という複雑な概念を理解する必要がある。寄生は、一方の生物（この場合は微生物）が、他方の生物の身体のしくみなどを利用して生活するという関係になる現象である。このような寄生現象を宿主側（寄生される側）から見ると、身体に入りこんでくる寄生生物のうち病原性をもつ微生物である場合があり、その場合に「病原体」と呼ばれている。寄生生物が病原性を持たない場合もあり、その場合は「病原体」ではなく、つまり、ある寄生生物が「病原体」なのかそうでないかは、それが病原性を持つかどうかの判定に依っている。
病原性とは病気をおこさせる能力を意味するが、この術語には複雑な内容が含まれており、ある微生物が病原性を持つか持たないかの判定は必ずしも容易なものではない。
病原体かどうかの判定のベースとなる病原性の判定がどうして複雑なのか説明する。寄生生物が宿主体内で生育する程度は、宿主という一種の環境が持つ生育促進因子と生育抑制因子のバランスの影響を受ける。生育促進因子とは、寄生生物が必要とする栄養素があることや寄生生物と宿主との親和性などであり、生育抑制因子とは宿主が持つ免疫システムなどの自己防御機構である。これらの因子は、宿主が植物か動物かでかなりの異なっているうえに、さらに言うとひとつひとつの種ごとにさまざまである。病気を発症するかどうかは、病原体と宿主との相関関係、相対関係（微生物種対生物種の関係、微生物種対生物個体の関係）によって結果が異なってくる。このようにして病原性の判定は複雑になっている。
病原体には次の特徴がある。
分類.