円爾は帰国後も師範をはじめとして南宋禅僧との交流を積極的に行っていたが、いっぽうの南宋禅側にも円爾らをサポートして日本における影響を拡大したいという思惑があったとみられる。当時の南宋は支配域を広げる蒙古の脅威にさらされており、新たな宗教・経済基盤として日本は魅力的な土地であった。円爾とこれに集う師範の弟子らは南宋との繋がりを背景に大陸との人物交流・貿易・海外情報を掌握し、権力とのつながりを強化していった。
兼修禅から純粋禅へ.
東福寺流の密教の法流は、東福寺の伝法灌頂堂であった荘厳蔵院が南山士雲の塔頭になった鎌倉時代末期には途絶え、寺外に流出したとみられる。
他派の台頭と聖一派.
崇福寺を奪われるかたちになった聖一派と大応派の間には確執が生まれた。上田純一や橋本雄は、鎌倉後期に創出された渡唐天神説話を聖一派が崇福寺を占拠する大応派を批判するためにつくったもの、としている。
このように中世後期に劣勢に立たされた聖一派は、新たな伝承の創作して自派の正当性を強調し、室町時代の五山でも夢窓派（天龍寺・相国寺）と並ぶ有力門派の地位を維持した。
度弟院.
聖一派の特徴として、強い門派意識が挙げられる。中世禅宗では師弟関係が重視され、これが門派を構成していたが、いっぽうで官寺である五山では十方住持制が採られていた。特に鎌倉時代末期には多くの渡来僧を住持に迎えて元代禅宗にならった寺院制度が採り入れられていき、やがて純粋禅が主流になっていった。しかし東福寺住持は聖一派以外の他派を交えず、円爾の法系で継承された点に特徴がある。また九条家・一条家によって補任される点でも五山の中で異質な存在であった。
聖一派は渡来僧を迎えない代わりとして、有能な人材を次々に宋に留学させる方針を採った。円爾の高弟でも無関普門、白雲慧暁、山叟慧雲、蔵山順空、無外爾然、直翁智侃、東洲至道などが入宋している。彼らは宋で印可を受けても帰国後は聖一派の法統を継ぐことが特徴で、聖一派では師弟関係が固定化されていった。原田正俊は、聖一派にが重視したのは無準師範からの法流であったと指摘している。また康昊は、東福寺に伝わる「密庵法衣」が鎌倉・南北朝期までに聖一派で師弟相承の象徴となっていたと指摘している。これは夢窓派や仏光派が師範の嫡流を主張したことに対抗したものと考えられる。
日中交流と聖一派.
貿易.
日宋貿易.