第七皇子の具平親王の子で藤原頼通の猶子となった右大臣・源師房の子孫は多数の公卿を輩出し、栄えた。師房の子、源俊房・源顕房の兄弟はそれぞれ左大臣・右大臣に昇った。俊房流も院政期までは公卿を出したが、以後は没落した。顕房の嫡男の源雅実は源氏で初の太政大臣となり、その子孫は数多くの大臣を輩出して村上源氏の嫡流となり、殊に平安時代末期の源通親は著名である。室町時代に足利将軍家に奪われるまで源氏長者は村上源氏が独占した。雅実流からは清華家の一つである久我家をはじめ多数の堂上家が分立し、明治維新に至るまで堂上公家としての地位を保った。
堂上公家：久我家（清華家）、中院家（大臣家）、六条家（羽林家）、岩倉家（羽林家）、千種家（羽林家）、久世家（羽林家）、東久世家（羽林家）、梅渓家（羽林家）、愛宕家（羽林家）、植松家（羽林家）
氏族：北畠氏など
 村上源氏 系図
 　　　　村上天皇（成明親王）
 　　　　広平親王　　憲平親王　　致平親王　　為平親王
 　　　　師貞親王　　居貞親王　憲定　　頼定　　為定　　顕定
 　　　　村上天皇（成明親王）
 　　　　守平親王　　昌平親王
 　　　　懐仁親王
 　　　　敦康親王　　敦成親王　　　　　　　　敦良親王　 脩子内親王
 　　　　村上天皇（成明親王）
 　　　　具平親王　　永平親王
 　　　　　師房　　隆姫
 　　　　　師頼　　　　　　　　　　　　師時　　師俊　　勝覚　　仁寛　　師隆　　寛遍
 　　　　　師教　　師光　　　　　　　　師仲　　　　　　　　　　　　　　俊隆
 　　　　　具親　　 後鳥羽院宮内卿　　 雅仲　　　　　　　　　　　　皇嘉門院別当
 　〈村上源氏顕房流〉
 　　　　　顕房
 　　　　　雅実　　　　　　　　　　　　顕仲　　　雅俊　　　　　　　　　　国信　　信雅　　顕雅　　雅兼　　定海　　賢子　　師子
 　　　　　顕通　　　　　　雅定　　待賢門院堀河　憲俊　　元海　　寛雅　　信時　　成雅　　　　　　雅綱　　定房
 　　　　　雅通　　明雲　　雅通　　定房　　　　　公胤　　　　　　俊寛　　顕信　　　　　　　　　　宗雅
 　　　　　　　　　　　　　通親　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　顕兼
 　　　　　通宗　　通具　　通光　　定通　　通方　　道元
冷泉源氏.