眞子内親王降嫁以前の時点において仮定するならば、例えば「眞子内親王と婚約内定者の民間男性との間に産まれた子」が天皇になったり、あるいは「女性天皇となった愛子内親王が民間男性と結婚し、産まれた子」が天皇になったりすると、神武天皇からの男系血統ではない者が天皇になるという。
具体的な例.
現在の皇族女子は、いずれも父方のみを辿って初代神武天皇に行き着く「男系の皇族女子」である。しかし、旧皇族（伏見宮系皇族）や皇別摂家、源氏や平氏など天皇家から分かれた「皇別家系の男系子孫」以外の男子と婚姻した場合、当該皇族女子の子は本概念における「女系」となる。
★は天皇（括弧内数字は代）および現行皇室典範における皇位継承資格者。子の出生は全て仮想。 
現在の規定では、★印の人物のみが皇位継承の有資格者である。
万世一系との相違.
一方、過去及び現在において維持される男系継承では、従来の概念における男系（父、父の父、その父…）を辿ると、必ず天皇（最終的には初代神武天皇）にたどり着く。
過去の議論.
明治初期にも民権派・自由民権嚶鳴社の「嚶鳴社討論」にても女性天皇の賛否、さらに男系が絶えた場合の措置に関する議論があったが、島田三郎らから反対意見が出された。この討論は議長高橋庄右衛門の決により「女帝を立つべからず」と決まった。
「有識者会議」と皇室の動向.
「女系天皇」の概念や、具体的な制度検討は、このような時代背景・状況において提案され、そして撤回されたものである。
元内親王・女王.
「女系天皇」と女性天皇.
概説.
語句の類似から、単に「女子の天皇」を指す女性天皇と混同されることも多いが、皇統についての「女系天皇」と、天皇個人の性別についての「女性天皇」とは異なる概念である。
日本では男系天皇が続いてきたので、父系で系図をたどると必ず初代神武天皇にたどり着く。男系とは父系（父方祖父、その父、そのまた父…）に天皇がいることであり、歴史上の女性天皇自身も例外なく男系の皇族女子である。「女性天皇の子」は、配偶者が男系男子でない限り、男系とならない。ただし、歴史上「配偶者が男系男子以外の女性天皇」の例は皆無である。
皇族女子は非皇族男子と結婚した場合、その間に生まれた子が皇族となることはなかった。
歴史上の例.