大型ゾイドおよび巨大ゾイドとの区別は曖昧である。本項では無動力のゾイドコレクションDXシリーズを記載する。また、『ゾイドバトルストーリー』や『ゾイドバトルカードゲーム』、アニメシリーズその他に登場しつつも、商品が発売されていない一部の移動基地型機種もここに記載する。
ゾイドコレクションDX.
アンモクラフト.
『ゾイドバトルカードゲーム』で登場。
オクトラウド.
元々はゾイドコレクションDX用のデザインアイデアのひとつ。
スターフィッシュ.
タートルシップ.
ディグ.
ドラグーンネスト.
鉄竜騎兵団（アイゼンドラグーン）の母艦であるロブスター型輸送艦ゾイド。中央大陸侵略を視野に入れたギュンター・プロイツェンが、同部隊のために開発させた機体である。両腕は切り離して揚陸艇として使用可能。陸上での活動も可能となっており、後方からの補給基地としても機能する。
ネオ・タートルシップ.
ヘリック共和国軍のカメ型ゾイド。ゾイドの積載方式は媒体によって差異があり、『ゾイドバトルカードゲーム』のイラストにおいては脚部からエレベーターを展開しているが、『ゾイドバトルストーリー』作中では背中に盛り上がった展開式のキャリアーを有している。
ゾイドシリーズで初出となる「ゾイドバトルカードゲーム」ではホエールキングと同じ効果を持つ共和国側のイベントカードとして扱われた。
ゾイドバトルカードゲームに登場するガイロス帝国の浮遊型移動要塞。元々はゾイドコレクションDX用デザインの没案の一つ。
ハンマーカイザー.
作中ではデススティンガーを内部に搭載して衛星軌道上まで浮上、そこからデススティンガーの荷電粒子砲をもって地上の主要都市を次々と狙撃し壊滅に追いやるが、大気圏外まで飛行可能に改造されたアーバインとトーマの乗るストームソーダーの攻撃を受けて撃墜された。
ゾイドバトルカードゲームに登場するガイロス帝国側移動要塞。元々はゾイドコレクションDX用デザインの没案の一つで、飛行・潜水モードへ変形可能。ゾイド格納庫は腹部に有する。
ホエールカイザー.
ホエールキング.
バリエーション.
ホエールキング・ザ・グレート.
モビーディック.
ホエールクイーン.
ホバーカーゴ.