日本でも精神医学や臨床心理学の文脈で登校拒否という語が用いられている場合には、このような学術的な定義および学説の変遷に基づいていることが多い。そのため、厳密な意味での登校拒否は、一般に幅広い意味合いで用いられている広義の登校拒否と区別して狭義の登校拒否と表現されたり、日本では神経症的登校拒否と言い換えられている場合もある。
こういった経緯もあって、本来広い範囲をさす「不登校」という言葉を、従来「登校拒否」と呼んでいた現象の言いかえとして現在使用されているため、字面だけで判断すると誤解しやすい。このように、「広義の不登校」の中に長期欠席（狭義の不登校）があり、さらにその中の一部が公式的に「不登校」と呼ばれているという三重の構造となっている。
欠席と再登校の原因.
長期欠席の原因には多くの説があるが、実際は下記のように個人によって千差万別である。また「欠席が始まる原因」と「不登校状態から復学できない原因」は同じものとは限らない。
欠席の起きる原因.
病気などの直接的な理由のない長期欠席が始まる原因については様々な例がある。代表的なものとしては、以下のようなものがある。
欠席の長期化の事由.
一方、欠席状態からなかなか復学できず、長期化することになる原因も様々ある。それらは
などである。
しかし原因が明確なことの方が珍しく、どれも全ての長期欠席者に対して当てはまるものではない。長期欠席は、あくまでも個々の異なった現象であり、全体としてはっきりと原因を定義できるものではない。
学校に復帰する事由.
長期欠席状態から学校復帰が起きる際にはさまざまな理由が存在する。それらは
などである。これも個人によって様々である。
経過.
長期欠席者がどのような経過をたどるかは個別のケースによって異なるが、ある程度定型的なパターンがある。
再登校後の出席状況.
長期欠席の経験者の場合、一度再登校を開始しても再び休みがちになる場合、全く休まないようになる場合など、さまざまなパターンがある。また、中学、高校などの上級学校に進学したり、転校をしたりしたことをきっかけに、ほとんど欠席しないようになる例も見受けられる。
学校復帰の可否と復帰学年.