社殿は海の上に建てられているため、台風・高潮の影響・被害を受けるのは宿命的であり、床の木材の隙間を空けて敷くなどの対策を取っているが、それでも大型の台風が直撃した際には倒壊などの被害を受けることがある。しかし、そのたびに大規模な修復を行っており、修復することを前提に建てられた社殿であるといえる。
社殿.
概要.
本社.
本社、客神社、廻廊など、海域部分に建つ建物の屋根はいずれも檜皮葺である。本社の社殿は、奥から手前に本殿・幣殿・拝殿・祓殿の順に並ぶ。これらの社殿の平面や配置をみると、完全な左右対称形ではなく、幣殿と祓殿は本殿から見てやや西寄り（正面から見て右寄り）の位置に建っている。また、本殿と拝殿は柱の配置が左右対称になっていない。一般に神社建築では各柱間を等間隔にするか、正面中央の柱間を広く取るのが普通だが、厳島神社本社の本殿・拝殿では、もっとも広い柱間は西寄りの位置にあり、社殿全体の中軸線が西側に寄っている（その理由は後述）。
本殿裏手の陸地部は後園（うしろその）と呼ぶ禁足地となっている。禁足地には玉垣をめぐらし、中央に不明門と呼ぶ本瓦葺の四脚門が建つ。不明門は祭神が弥山から社殿へ降りる際に通る門とされ、人が通行することはない。
平舞台は、浅い海底に立てた石柱の上に大引と根太を渡した軸組の上に床板を張ったものである。石柱は赤間石製で、毛利元就の寄進とされる。床板は、高潮時の水圧を逃がせるように、隙間をあけて張られているが、それでも台風などでたびたび破損している。平舞台の中央付近を一段高くして高欄をめぐらし、この部分を高舞台と称する。平舞台の前方は外側に左右の楽房、内側に左右の門客神社がある。楽房は切妻造の簡素な建物、門客神社は切妻造の覆屋内に流造の社殿がある。これらの舞台や建物は台風などの被害をもっとも受けやすい位置にあって、たびたび破損と修理を繰り返しており、古い部材は残っていない。
客神社.
摂社客神社は、本社と同様に本殿・幣殿・拝殿・祓殿からなるが、規模は本社より小さい。その他、細部において本社とは異なる点がある。
廻廊.
摂社、末社、附属建物.
大鳥居.
近年、大鳥居にできた亀裂の部分に、一部の観光客によって硬貨が差し込まれるケースが多発している。神社側は「鳥居の柱の老朽化が進む虞があり、止めてほしい」と呼び掛けている。