急激な変化には弱いものの、緩やかに変化するのであればpH（水素イオン指数）や水温が高いなどといった他の魚が生きられない悪条件でも生存できる。
人間との関わり.
飼育.
大きさを除けば、とても管理が容易であるといえる。ほとんどの魚類に比べ病気にかかりにくい。もし、ガーが生存できないのであれば、飼育者の管理や使用器具の問題が真っ先に疑われるといってもよいほどである。
琵琶湖などにおける繁殖の可能性とその影響について.
繁殖に関する疑問.
仮にアリゲーターガーが繁殖しているとすれば、成魚や若魚だけではなく、幼魚や稚魚も捕獲されるはずで、むしろ後者の方が捕獲例が多くなるはずである。しかし、幼魚や稚魚は捕獲された例がない。これまで捕獲されたものは全て成魚や若魚であり卵も発見されておらず（卵の外見も全ての在来魚とは異なる）、繁殖は確認されていない。以下の条件によりアリゲーターガーが琵琶湖で繁殖できるかは疑問がある。
水温.
原産地は温帯に属す場所も多いが、冬の気温が高いため、年間における水温差が小さい。琵琶湖などは水温差が大きく、変動も激しいため、生存に適しているとはいえない。
日本に輸入されるものは、原産地ではなく年間を通して温暖な東南アジアで養殖された個体である。当然、何世代も温暖な環境で過ごしているため、野生個体に比べ多少なりとも耐寒性が衰えている。
日本の河川における環境.
工業排水などにより年間を通して水温の高い河川もあるが、そういった場所は川底や岸部がコンクリートで覆われていることが多く、獲物である淡水魚が不十分な場合も多い。十分にいる場合であっても、アリゲーターガーは流れの速い場所に適していないことや、高く跳ねることもできないことにより堰や魚道などの高低差がある場所を上ることもできない。そのため越冬できる場所は更に限定される。在来種は低温に耐えることができるため、他の場所に避難することによって食糧不足に陥るため、生存率は低下する。