現駅ビル以上の開発となり国際観光都市長崎の新しいランドマークとして博多駅に次ぐ規模となる。
駅構造.
JR九州.
アミュプラザ前の広場（かもめ広場）はオープンスペースとなっており、各種イベントが行われていた。また長崎ランタンフェスティバル期間中は天井に竜のオブジェ「アミュゴン」が飾られており、さまざまな装飾が施されていた。広場の天井近くには三菱電機製の大型モニター（オーロラビジョン）も設置されていて、JR九州関連のPR映像などが流れていた。
のりば.
（出典：）
長崎電気軌道.
長崎街道かもめ市場.
長崎オフレールステーション.
駅弁.
販売されている駅弁は下記の通り。
利用状況.
長崎駅の各年度の1日平均乗車人員は以下の通り。
駅周辺.
長崎駅改装後の周辺施設.
バス路線.
高速バス.
長崎バス関連の夜行高速バスはココウォーク茂里町が始発となっており、当ターミナルには乗り入れず長崎駅前南口バス停での乗車となる。九州号は「出島道路経由」の長崎到着便は降車場所がターミナル内ではなく、国道沿いの長崎駅前高架下である。
経由地等については各系統の記事を参照のこと。
路線バス.
一般路線バス（長崎県交通局・長崎自動車）は駅前高架広場下の長崎駅前バス停、駅東口交通広場ロータリー内の長崎駅前(交通広場)バス停、駅西口広場の長崎駅西口バス停、ホテルニュー長崎前の長崎駅前南口バス停（大波止方面）、ローソン前の長崎駅前東口バス停（市役所前方面）と複数が存在する。北部・西部方面は高架広場下長崎駅前バス停に停車する。なお、大波止方面からの便は長崎駅前南口バス停（ホテルニュー長崎側）にも停車する。中心部・南部・東部方面行きの大波止経由便は長崎駅前南口バス停（ホテルニュー長崎向かい側）、市役所前経由便は長崎駅前東口バス停に停車する。行き先によって停車する場所が異なる。ながさき出島道路・長崎自動車道を経由して大村や諫早へ向かう高速シャトルバス（長崎県交通局）は、交通会館ではなく、長崎駅前東口バス停始発である。
長崎駅前（高架下）【北部・西部方面】.
高架広場の工事により現在は北部側へ仮移設されている。
長崎駅前（交通広場）【東部・南部方面】.
長崎駅東口（かもめ口）の駅前広場に設置。
長崎駅前（交通会館前）【東部・南部方面】.
降車専用のバス停のため、乗車はできない。
浦上駅