真崎はうろたえる川島義之陸相と密談して、反乱部隊を解散させるのは難しいから「蹶起趣意書」、「陸軍大臣要望事項」にそって天皇から詔勅を渙発してもらい事態の解決を図るべきだと主張した。
さらに真崎は伏見宮邸に向かい、ここで加藤と会談した。大詔渙発を目論んで伏見宮博恭王、加藤とともに参内したが、伏見宮を引見した天皇は全く取り合わなかった。
軍事参議官会議において参議官の一人から、「今回の問題は我々の責任でもあるから全員揃って辞職しよう」との意見が出て、それに決まりかけていたのを荒木と真崎は強く反対しとりやめになり反乱部隊に和する「大臣告示」が出されることになった。
寺内寿一が自分よりも早く宮中に参内していることを知った真崎は寺内を怒鳴りつけている。
裁判.
反乱部隊を利した行為は明らかであるが、これが反乱部隊を利せんとする意思に基づくものであるかは認定できなかった、というのが無罪の理由であった。荒木が近衛文麿首相に無罪とするよう頼み込み、近衛は厳罰論に傾いていた杉山元陸相を説得し、これ以上の混乱を引き起こさぬように無罪とするように圧力をかけた。磯村の証言によると、最終的には大山文雄陸軍省法務局長が強硬派の小川を呼び円満解決を図るよう説得した。
杉山陸相から判決文を奏呈された天皇はこれをその場で熟読し、手元に留め置いた。
証人として出廷した磯部は真崎の態度に幻滅し、『獄中日記』において真崎を呼び捨てにして激しく非難した。
太平洋戦争.
統制派である東條英機首相が国家社会主義体制を構築していく中、反主流派の面々は真崎の元に集まってきた。その代表例が吉田茂で、吉田は対米開戦直後から「英米ト和平ノ手ヲ打ツベキ方針」を真崎に伝達している。真崎本人も、日中戦争と並行して対米戦を遂行することとなった現実を危ぶんでいた。
吉田は真崎・宇垣連立内閣を構想しており、これには真崎も積極的な態度を示していた。しかし宇垣が消極姿勢であったため、構想は立ち消えとなった。
やがて、吉田の仲介で同じく早期終戦を目指していた公爵近衛文麿元首相と接近した。近衛は自らを首班とした内閣を考えており、真崎はこれに不満であった。鈴木貫太郎内閣の成立にも落胆したが、終戦後も政権入りを目指していた。
終戦後.