性同一性が出生時に割り当てられた性別と一致する人はシスジェンダーといい、一致しない人はトランスジェンダーという。トランスジェンダーの略語として「トランス」も用いられる。トランスセクシュアルという言葉もあるが、トランスジェンダーという用語と比べると使用が避けられる傾向にある。
性同一性は自称ではなく、ある程度の一貫性や継続性があるものなので、個人で好きなように自由に性別を選択できるものではない。そのため男性が「今日から女性だ」と言えばすぐさま性同一性が女性になるといったものではない。性同一性は日本では一般的に「心の性別」と表現されることがあるが、性同一性とは自分がどの性別集団に属しているのかについての帰属意識に関係するものであり、ゆえに「心の性別」という表現は不正確である。
性同一性は性的指向とは異なる概念である。性同一性がなんであれ、どんな性別の人に惹かれるか（異性愛か、同性愛か、両性愛かなど）は個人で違ってくる。例えば、ゲイの男性は男性に惹かれるからといって「女性になりたい」というわけではない。同性愛者だったが後に性同一性を自覚してトランスジェンダーとして生きる人もごくわずかには出現するが、そうした人が大勢いるという事実はない。
人が自分のジェンダーを服装や髪形など外面的にどう表現するかはジェンダー表現（性表現）と呼ばれるが、人々の中には自分の性同一性とジェンダー表現を合わせる者もいれば、あまり気にせずに自己表現する人もいる。なので、ある女性がボーイッシュな格好をしていても性同一性が男性ということには必ずしもならない。社会における男女二元論的な規範とは異なるかたちで自分を表現したりする人の総称としてという言葉もある。
日本語の表記.
歴史.
メカニズム.
自覚.