医師国家試験、歯科医師国家試験、看護師国家試験、助産師国家試験、保健師国家試験、臨床検査技師国家試験、診療放射線技師国家試験、視能訓練士国家試験、理学療法士国家試験、作業療法士国家試験がある。薬剤師国家試験は医薬・生活衛生局が所管する。
組織.
総務課.
 （総務課の所掌事務）
 一 保健医療に関する基本的な政策の企画及び立案並びに推進に関すること。
 二 医政局の所掌事務に関する総合調整に関すること。
 三 医療を提供する体制の確保に関すること（他局及び他課の所掌に属するものを除く。）。
 四 前各号に掲げるもののほか、医政局の所掌事務で他の所掌に属しないものに関すること。
医療政策企画官.
 （医療安全推進室及び医療政策企画官）
 一 総務課に、医療安全推進室及び医療政策企画官一人を置く。
 四 医療政策企画官は、命を受けて、保健医療に関する基本的な政策に関する特定事項の企画及び立案並びに調整に関することを行う。
医事課.
 （医事課の所掌事務）
 一 医師、歯科医師その他医療関係者に関する事務（他局の所掌に属するものを除く。）の総括に関すること。
 二 医師、診療放射線技師、臨床検査技師、理学療法士、作業療法士、視能訓練士、臨床工学技士、義肢装具士、言語聴覚士、あん摩マッサージ指圧師、はり師、きゅう師及び柔道整復師に関すること。
試験免許室.
 （試験免許室及び医師臨床研修推進室）
 一 医師、診療放射線技師、臨床検査技師、理学療法士、作業療法士、視能訓練士、臨床工学技士及び義肢装具士の試験及び免許に関すること。
 二 外国医師等の臨床修練及び臨床教授等のための病院又は診療所の指定並びに臨床修練及び臨床教授等の許可に関すること（他課の所掌に属するものを除く。）。
経済課.
 （経済課の所掌事務）
 一 医薬品、医薬部外品、医療機器その他衛生用品及び再生医療等製品の生産、流通及び消費の増進、改善及び調整に関すること（他局及び研究開発振興課の所掌に属するものを除く。）。
 二 医薬品、医薬部外品、医療機器その他衛生用品及び再生医療等製品の製造販売業、製造業、販売業、貸与業及び修理業の発達、改善及び調整に関すること（研究開発振興課の所掌に属するものを除く。）。
 三 医薬品、医薬部外品、医療機器その他衛生用品及び再生医療等製品の輸出入に関すること。