本誌に『爆笑戦士! SDガンダム』などを連載しつつも諸事情から編集部側とは敵対していた佐藤元は、休刊発表と同日に自身のブログでいくつかの苦言に織り交ぜて、編集側のやり方に関する非難とともに無念の意を露にしていた。
インターネットテレビ.
同チャンネルでは、講談社作品が原作となっている一部のアニメ作品の掲載も行っている。
WEB連載としての再開.
これに合わせてyoutubeにて、『サイボーグクロちゃん』と『くつだる。』のアニメ版が期間限定で全話公開された。
復活ボンボンシリーズ.
連載漫画の特徴.
ライバル誌の『コロコロ』同様にゲームメーカーや玩具メーカーとのタイアップ作品が多かったが、刊行末期は少なくなっていった。
雑誌の方針としては児童・幼年向けを対象としているが、「プラモの改造などの少々マニアックなもの」「暴力的な要素が強いもの」「哲学的なもの」「お色気要素の強いもの」など濃い内容かつインパクトが強めといった対象年齢が高めの漫画が載せられることもあり、その特殊性も読者に広く知れわたっている。想定読者年齢より背伸びした（あるいは、ませた）物の中でも少し極端な物でもあったため、「ボンボンを読むとオタク趣味に走るようになる」といった俗説が流布することもあった。
ガンダムシリーズとの関わり.
しかし、『ガンダムエース』（角川書店）の創刊以降は完全なガンダム専門誌である同誌に押され、『機動戦士ガンダムSEED』以降は完全に主導権を奪われている。
その他.
CS放送では、専門番組として『ボンボンチャンネル』が放送されていたこともあった。
再掲載は斜体で記述
未収録作品（最終話未収録含む）.
並び順は、作者の名簿順。
物言い
物言い（ものいい）とは、大相撲において、行司が下した判定（軍配）に対し、審判委員や控え力士が異議を唱えること。またそれから転じて、異議を申し立てること全般を「物言いをつける」ともいう。
概説.
また、土俵下に控えている力士も、物言いをつけるための挙手をする事ができ、審判委員は控え力士から物言いが出た場合、必ず土俵上で協議を行わなければならない。なおその控え力士自身は協議に参加することは出来ない。なお、行司は取組の状況を述べたり、勝負の流れがどちらに有利であったかと言う説明をする事以外では協議に参加できない。