感情移入を拒絶する「悪の権化」を強調するため、眼は白目のみで黒目が存在しない。毛細血管を黒くすることで白目と黒目が逆転したような印象としている。これは当初から予定されていたものではなく、造型の途中で品田から発案されたものであった。富山は、映像での映り方を考慮し、目全体を白くするのではなく、白目と黒目を逆転させることを提案した。眼球は、特技監督の神谷誠からの提案により、デイシーンとナイトシーンで配色を変えている。金子は、目を白くしたことで子供は怖がるだろうと想定していたが、あまり怖がられなかったと述べている。
スーツ自体の色は茶色で、巨大感を出すためにブルーのライトを当てることにより、従来のゴジラの色を表現している。
神谷によれば、スーツが大型化したことにより、仰角の撮影でスタジオの天井が映ってしまうことが一番の難点であったといい、オープンセットを用いたり天井を合成で隠したりなど工夫したほか、ゴジラのみセットの床ではなくスタジオの床に直接立たせることもあったと証言している。
放射熱線の描写では、神谷のこだわりにより、大砲のようなバースト現象が取り入れられている。神谷は、絵コンテでゴジラの背ビレが光ってから熱線を吐くまでの間に本編シーンが挟まれていたため、間を持たせる必要があったと述べている。また、熱線の色も放射線を意識した青としている。
ゴジラが焼津で海中から姿を表すシーンでは、スーツやミニチュア、CGのほか、実物大表皮、グリーンバック撮影による本編素材、さまざまな水の映像素材など、多数の映像を組み合わせている。神谷は、それぞれ大掛かりな撮影になったが、面白いカットになったと自負している。
尾で清水中央総合病院を破壊するシーンは、尾のみの造形物を用いている。本来のイメージとは異なりミニチュアの中ほどで尾が引っかかってしまったが、その状況を利用して尾を引き抜くシーンが撮影された。
機龍二部作.
制作（機龍二部作）.
公式設定ではないものの、監督の手塚昌明や製作の富山省吾はこの個体を「初代ゴジラ（=機龍）の息子」と解釈していた。
脚本の三村渉は、生物的な匂いをゴジラに持たせたいと考え、人間を敵視して暴れるゴジラではなく、種と種の交信で惹かれ合う、という生物の本心のようなもので動いていると想定している。