ある日、闇子は恭司を連れてて二使守山まで調査に行く。その時、恭司が古井戸を見つけ、闇子はこの井戸に少女が閉じ込められた事件があったことを話す。翌日、恭司は闇子と一緒に二使守山を訪れる。安全のため、一人で古井戸を調査した恭司は、子供のような字で恨み言がいっぱい書かれた石室を見つける。古井戸の外で待機していた闇子のもとに、紫と似た姿の少女ユカがやってくるが、闇子が恭司の保護者であると理解するやその場を去る。翌日、闇子の幼馴染である由規が家に居候してくる。
ある日、恭司達は校外学習の帰りにユカと出会い、洋館に招き入れられる。それを遠くから見ていた由規は、帰宅後に恭司から事情を聴き、闇子の本名をユカに教えるなと口止めされる。
その後、由規は病院に行き、真白という精神疾患の患者から、「宗教儀式中に現れた『人形』に襲われて食われかけ、その時拾った石の一つで『人形』を追い払った。しかし、もう一つの拾った石は私の身体に取り込まれてしまい、結果として私は年を取らなくなった」という話を聞く。由規は真白からもらった石をペンダントにした。
翌日、闇子は恭司を連れて病院に行き、真白から奇妙な話を聞く。さらにその翌日、二人は井戸の底につながる防空壕を調査する。古井戸の底の石室を調べた恭司は、新しい言葉や、恨みの対象と思われる「ももね、さゆみ、ひーくん」という名前を見つける。これを目にした闇子は幼少期の自分たちがしたことを思い出し、調査を切り上げる。
翌日、学校に来た恭司は、感情を失った生徒たちや、転校生としてやってきたユカに驚愕し、由規に助けを求める。駆けつけた由規は、ユカとゴアの返り討ちに遭う。
数か月後、ユカは無邪気な様子で見舞いに来た恭司たちを出迎える。
桃音らの手により井戸に落とされた紫（ユカ）は恐怖のあまり失禁し、扉を開いた先にあった石を身体に取り込んでしまう。さらにタイミング悪く初潮が始まってしまったことでパニックに陥る。その時、謎の怪人が現れる。怪人は彼女に対して従順にふるまうことから、紫は妹と一緒に見ていたホラー映画にちなんでゴア・スクリーミングショウと名付け、二人は仲良くなる。
井戸から帰還した彼女は石の力で成長が止まっていたことに加え、ゴアと行動を共にするようになったことから、両親をはじめとする周囲の人々から気味悪がられ、彼女は桃音らに対する恨みを募らせる。