山手線には、深夜に当駅止まりの電車が設定されている（東京総合車両センターに引き上げ）。東海道線には、常磐線直通系統の当駅発着列車以外に早朝の当駅始発下り横浜方面への列車・朝の宇都宮線および高崎線からの当駅止まりの列車・深夜の東海道線横浜方面からの当駅止まり列車の設定もある。横須賀線は、下り始発列車が当駅始発、上り最終列車が当駅止まりとなっている。総武快速線直通は、平日朝夕方に当駅発着列車が設定されている。
のりば.
（出典：JR東日本:駅構内図）
JR東海.
駅上部のJR東海品川ビルには、JR東海東京本社が入居する。
ホーム上には売店などの店舗はない。売店等はホーム上階のコンコース・改札内に出店している。改札内の待合室を兼ねるコーナーには一部に無線LANコーナー（電源付き）がある。新幹線ホームは駅舎の内側にあるため、地下駅のようになっている。上下線とも外側が本線（通過線）となっており、転落防止のために可動式安全柵（ホームドア）が設置されている。また内側は副本線（待避線）であり、固定柵が設置されている。
当駅は東海道新幹線の駅で初めて、開業当初からフルカラーLED式発車標が設置されていた。
新幹線北乗換窓口が新幹線メンテナンス東海に委託されている他は直営である。
のりば.
（出典：JR東海:駅構内図）
国鉄・JR線地上ホームの変遷.
以下の表は当駅地上ホームの変遷を記したものである。なお、下表に示す以外に工事等によりホームが一時的に撤去されている場合もある。
京浜急行電鉄.
各ホームには「イブニング・ウィング号」の座席指定券自動券売機が設置され（改札外にも設置）、跨線橋にはJR東海のエクスプレス予約乗車券類受取機が設置されている。
のりば.
（出典：京急電鉄:駅構内図）
接近メロディ.
貨物取り扱い.
JR貨物の駅は車扱貨物の臨時取扱駅となっており、現在は定期貨物列車の発着はない。ただし、JR東日本の甲種車両輸送列車が年数回発着することがある。
駅弁.
利用状況.
年度別1日平均乗降人員.
各年度の1日平均乗降人員は下表の通り（JRを除く）。
各年度の1日平均乗車人員は下表の通り。
駅周辺.
西側（高輪口）.
東側（港南口）.