志摩鳥羽城主・九鬼守隆は家康に従軍して会津に向かったが、間隙をついて父の九鬼嘉隆が城を奪取、さらに水軍を率いて伊勢湾海上封鎖を行って安濃津城への東軍の援軍を入れず、この方面での西軍の初戦圧倒的優位に貢献した。嘉隆は秀吉の旧臣であった。しかし、関ケ原からの知らせが届くと、伊勢答志島へ逃走。守隆は父の助命を家康に懇願、当初家康は拒否したが、加増の内示を受けていた伊勢南部五郡を返上しての助命嘆願に免じこれを許した。しかし助命の報が届く直前に嘉隆は自刃していた。
論功行賞と三成の処刑.
ただし、かつてはこの一連の論功行賞で豊臣家が一大名の地位に陥落したとする学説が一般的であったが、豊臣家がなお特別の地位を保持して、徳川の支配下には編入されていなかったとする説が現在では一般的である。
輝元の大坂城退去と毛利氏の処分.
毛利輝元は、吉川広家ら毛利一族、福原広俊ら毛利家臣団の反対を押し切り、三成と彼の意を受けた安国寺恵瓊の要請によって、西軍の総大将に就任していたが、関ヶ原の敗北後もなお秀頼を擁して大坂城にあった。毛利秀元や立花宗茂、島津義弘らは大坂城に籠城しての徹底抗戦を主張しており（『立斎旧聞記』）、秀頼の命と称して篭城抗戦が行われる可能性も残されていた。
大坂には無傷で帰還した毛利勢や、本戦に参加しなかった軍勢も多数存在した。無傷のまま温存された毛利勢は、合戦で疲弊した東軍にとって大きな脅威であった。家康は輝元が秀頼を奉じて大坂城に籠城し、抵抗を続けることを恐れており、輝元を城から退去させる必要に迫られた。
そして、輝元は出家し、家督を嫡男である毛利秀就に譲り、隠居した。輝元は「近頃の世は万事逆さまで、主君が家臣に助けられるという無様なことになっている」、と自らの非力を嘆いたという。
その後、毛利氏は幕府に本拠地を周防山口として申請したが、幕府からは長門萩にするよう命じられた。
島津氏の処分.