宣化天皇の崩御後、欽明天皇の時代になると物部尾輿（生没年不詳）が大連になった。欽明天皇の時代百済から贈られた仏像を巡り、大臣・蘇我稲目を中心とする崇仏派と大連・物部尾興や中臣鎌子（中臣氏は神祇を祭る氏族）を中心とする排仏派が争った（仏教公伝）。
そもそも廃仏派であったのは物部守屋の一族であり、その他同族については廃仏派であったとの記録はない。また、物部氏は『先代旧事本紀』や『元興寺縁起』には排仏運動を行った様子が記されていない上に、物部氏は積極的に百済と交流をしており、仏像を燃やし海に流したのは「罪を祓う祭祀氏族」として祓戸の神のように「仏像=神」の罪を祓い元いた場所へ送り返すためであったとする説が存在する。
天武朝.
石上氏.
枝族・末裔.
物部氏の特徴のひとつに広範な地方分布が挙げられ、無姓の物部氏も含めるとその例は枚挙にいとまがない。長門守護の厚東氏、物部神社神主家の長田氏・金子氏（石見国造）、廣瀬大社神主家の曾禰氏の他、穂積氏、采女氏をはじめ、同族枝族が非常に多いことが特徴である。
江戸幕府の幕臣・荻生徂徠は子孫といわれる。
東国の物部氏.
石上氏ら中央の物部氏族とは別に、古代東国に物部氏を名乗る人物が地方官に任ぜられている記録がある。『扶桑略記』、『陸奥話記』などには陸奥大目として物部長頼という人物が記載されている。六国史に散見する俘囚への賜姓例の中には、吉弥侯氏が物部斯波連を賜ったという記録が見え、金井沢碑や貫前神社の社家として物部君の一族が見える。
下総物部氏.
下総国匝瑳郡に本拠を持つ物部匝瑳連の祖先伝承に、布都久留の子で木蓮子の弟の物部小事が坂東に進出し征圧したというものがある。また平安中期に作られた和名類聚抄には下総国千葉郡物部郷〈四街道市物井〉の記述があり、これらについては常陸国信太郡との関連を指摘する説があり、香取神宮と物部氏の関連も指摘されている。
尾張物部氏.
古代尾張の東部に物部氏の集落があり、現在は物部神社と、武器庫であったと伝えられる高牟神社が残っている。
石見物部氏.