また、これらとは別に平安時代初期編纂の『新撰姓氏録』に記される古代氏族にも大石氏はあるが詳しいことは定かではない。
関東管領の宿老.
上杉家と共に.
北条から徳川へ.
後北条氏により両上杉氏が関東から消滅すると、大石定久は北条氏康の三男・氏照を娘・比佐の婿に迎えて、自らは戸倉に隠居した。氏照が北条氏に復すると、定久の実子大石定仲が家督を継いだ。
小田原征伐により後北条氏が没落し、氏規が河内狭山に移されると、定仲と義弟（定久の養子）大石定勝の子孫は徳川氏に仕えた。旗本や八王子千人同心、陪臣（一橋家の近習番衆）になった者もあり明治に至る。
系譜.
義仲流・信濃藤原姓（大石系図による）.
 木曾義仲
 　 基宗?（木曽系図では「義基」）
 　 宗仲（木曽系図では「義茂」）
 （数代略）以下は木曽系図とほぼ同様
 　 家教　　　　　　　　　 大石為重（信濃藤原氏?）
 　 家道　家村 家定　信重
 　 家頼　　　　　 （数代略）
 　　　　　　　 　　　定重
 　　　　　 北条氏康　定久
 　　　　　　氏照　　 定仲
米沢藩.
柳川大石氏（大石神影流）.
筑後国柳川藩の大石氏は代々、剣術を以って仕える。大石種行は柳川藩と支藩である三池藩の剣術師範役も兼ねた。
江戸へ出府して千葉周作、高柳又四郎、白井亨らと技を戦わせた。種次の次男（嗣子）種昌も通称を譲られて大石進を称したため、両者の混同がよく見られる。
赤穂大石氏.
近江国栗太郡大石庄（滋賀県大津市大石東町・大石中町）の下司だった大石氏は上記とおなじく秀郷流の小山氏の支族とされ、応仁の乱などで没落したが、大石良信は豊臣秀次に仕えた。良信の庶子大石良勝は秀次事件の処罰で、強制的に仏門に入れられたが、寺を脱走し浪人となった後は浅野長政に仕えた。大坂夏の陣での戦功が著しかったため、長政の三男・長重（長矩の曽祖父で常陸国真壁・笠間藩主）の永代家老に取り立てられる。
長重の長男・長直は播磨国赤穂に転封されたので、大石家も赤穂に移ることになる。のちに元禄赤穂事件の赤穂藩国家老・大石良雄を出す。