亀岡市街地は保津川（大堰川）より低地であるうえに、保津峡でせき止められることにより逆流を原因とする水害が多発していた。この洪水は日吉ダムの開設により一応は解決しているものの、遊水池となっていたJR嵯峨野線と保津川（大堰川）の間にはほとんど建築物がない。しかし、嵯峨野線複線化と併せて新たな都市開発の構想がある。
地域.
ニュータウン.
歴史.
古代.
古代には大堰川（保津川）左岸の千歳町千歳に後期古墳で丹波最大の千歳車塚古墳が築かれており、その被葬者は『日本書紀』にみられる倭彦王とする説もある。後の時代には千歳町国分地区に国分寺が置かれている。
丹波の桑田郡、つまり現在の亀岡にいた倭彦王は、迎えの兵に驚いて逃げ行方不明となったため、その後、朝廷は、越前から継体天皇を迎えたとされている。
継体天皇元年に初めて神殿が建立された愛宕神社や出雲大神宮や養仙寺もあるなど歴史的に古い地域である。
諸説あるが、大堰川右岸の千代川町に丹波国府が置かれたとも言われている。
京都との国境の大枝には酒呑童子の鬼がいたと言われ、源頼光によって討伐されたという伝説がある。
薭田野町・曽我部町に薭田野神社、穴太寺、神蔵寺など由緒ある重要な寺社も多い。
中世.
平安末期の武将で摂津源氏の源頼政の墓がつつじヶ丘地区にある。
篠町には足利尊氏の挙兵の地となった篠村八幡宮があるなど当市域は鎌倉・南北朝時代を通じて源氏の一拠点となった。
石門心学の石田梅岩、画家・円山応挙、医者・山脇東洋も亀岡市域の出身者である。
また、摂津国福原の一ノ谷に向かう途中に通過した源義経や那須与一などのほかに安倍晴明、文覚、一遍、蓮如、明智光秀、小早川秀秋、角倉了以を始めとして亀岡にゆかりのある著名人は多い。
近世.
安土桃山時代に入って明智光秀が丹波統治のため古世地区に丹波亀山城を築き城下町を形成したことによって、亀岡は近代的な発展を遂げる。
明智滅亡後も豊臣・徳川政権下において丹波亀山城には羽柴秀勝（於次、信長四男）、豊臣秀勝（小吉、秀吉の甥）、小早川秀秋、前田玄以・岡部長盛ら信任ある人間が配置されるなど京都の西北の入り口として重要視され続けた。
。このため、たびたび重税が課せられ、亀山藩支配下の村々はみな疲弊したという。