刑罰については、町奉行および遠国奉行は専決できる権限があり、これを手限（てぎり）といった。江戸の町奉行の手限は、中追放以下までで、それ以上の刑罰を科すには老中への伺いが必要であった。
白州.
裁判の行われる場所は白洲（法廷）といった。奉行が出席するのは初回の白洲と最後の判決の申し渡しの時のみで、その間の取り調べは吟味方が行なった。
町奉行は、初審で吟味方与力が用意しておいた審問事項を見ながら尋問し、判決申渡しの時も用意された判決文を読み上げるだけだった。
しかし、重要な事件では奉行は吟味場の背後にある屏風の陰から聞き耳を立て、裁判の様子を窺うこともあった。
法曹官僚.
なお、裁判に携わる法曹官僚としては、町奉行所の吟味方の他に、評定所の評定所留役や、寺社奉行所の吟味物調役、京都町奉行所の公事方などがいる。
出入筋.
民事訴訟担当である出入筋では、江戸の町人・寺社領の町・寺社門前および境内借地の者、旗本や御家人、そして諸大名家の家来の訴えを受理して裁判を行った。
出入筋は主に、「金公事」（または「金銀出入」）と、「本公事」に分かれる。金公事は、借金銀・売掛金などの利息付・無担保の金銭債権に関する給付請求で、本公事はそれ以外の出入物の総称である。不法・疵付・誘引・密通などの可罰的事案が出入筋で審議される場合も本公事となる。
訴訟の手続きから判決まで.
借家人が他の町に居住する借家人に訴訟を起こす場合を例にとると、まず訴訟人（原告）は家主と五人組に訴訟理由を述べて承諾を得てから、被告側の家主に訴訟理由を告げる。
被告側の家主は被告とその者の属する五人組とともにまず示談を推奨する。承知しなかった場合は、裁判中は旅行などはさせない旨を誓約した「預り証」を訴訟人に提出。訴訟人側の家主は預り証と目安（訴状）を名主に提出。
訴訟人側の名主は訴訟人と家主を呼び出し、示談を勧めるが、承諾しなければ被告側の名主に通知する。被告側の名主もまた、家主と被告を呼び出し示談を勧めるが、これにも承諾しなければ訴訟人側の名主にその旨を通知する。
この段階で訴訟人側の名主は目安に奥印して家主に渡し、家主は訴訟人とともに月番の奉行所に、訴訟内容である公事銘（くじめい）を記載した目安を提出。
受け付けた掛の役人は目安の形式・内容などに違法が無いか調べ、正式の目安（本目安）を提出する。