特定にかかる期間は半年で完了することを目処としている。だが、申請時に提出する資料が少ないと一年近く（場合によってはそれ以上）かかってしまう。
また、本制度によりある程度は筆界は特定されるが、その結論に納得出来ない場合境界確定訴訟に持ち込むことができる（境界確定訴訟により特定の結論に反する結果が出た場合、その特定は無効となる）。
しかし、既に境界確定訴訟で最高裁判決まで確定したものは却下となる。
長所.
この筆界特定制度を利用することによる長所を以下に示す。
境界確定訴訟.
境界確定訴訟は土地の境界を確定するための形式的形成訴訟である。筆界特定制度によって筆界（境界）が特定されている場合にも、境界確定訴訟を提起することが可能である。一方で、境界確定訴訟によって確定した境界に対しては筆界特定を申し立てることはできない。したがって、現時点においても、最終的に境界を確定させるためには、境界確定訴訟によるほかはない。
あらすじ.
父の形見である大切な刀と共に侮辱を受けた安兵衛は、怒りを抑え、その声の主の名を深く胸に刻み込む。
主君となった赤穂藩主浅野内匠頭からさっそくお側近くに召された安兵衛。内匠頭は、今度幕府から仰せつかった勅使饗応役について、「指南役の高家吉良上野介に挨拶にいかねばならないが、賄賂を出す気はない。武士に賄賂がはびこるような悪習は絶たねばならない。」と安兵衛にいった。安兵衛は時代の風潮に抗う内匠頭を諌めたが、内匠頭の意見はかわらなかった。
以降、安兵衛は、盟友の高田郡兵衛や奥田孫太夫と共に、仇討ち急進派と呼ばれる江戸詰め浅野家家臣の勢力の中心となり、ひたすら吉良邸討ち入りを志し、妻のほりには、今の自分は死んだも同然と離縁を言い渡して、内蔵助の住む京へ上る。
また肝心の国許の筆頭家老大石内蔵助もその気になってくれない。内蔵助は京都の色町で遊び呆けているだけだった。だんだん安兵衛率いる江戸急進派の足並みもくずれ、高田郡兵衛は脱盟したいと申し入れてきた。怒る安兵衛に対して郡兵衛は「オレはお前みたいに強うない。」と叫んだ。