小笠原はかつて箱館奉行所勤めだった時に蝦夷地域の測量隊に加わっていた経験を買われて測量の仕事に抜擢されたが、実務を担当していたわけではなく、測量の技術をろくに持ちあわせていなかったため、満足のいく結果は出せなかった。江川は、高野長英から紹介された内田弥太郎と上田喜作に測量を行なわせた。出来上がった測量図は小笠原の物よりも優れており、江川組の地図が採用された。蛮社の獄は、この測量・視察の視察の復命書に、江川が蘭学者の渡辺崋山の意見書を添えようとしたことに対し、蘭学者に批判的な鳥居がこれを阻止し、彼らを処罰しようとしたことがきっかけとなったとも言われている。だが鳥居は単なる蘭学嫌いではなく、その実用性をある程度認めており、また崋山の意見書は最初から上申は意図されておらず、また江川の意にも沿わない書であったため江川の復命書にも全く反映されなかったとする説もある。蛮社の獄.相州備場の見分後、当時小人目付だった貢蔵は、鳥居耀蔵から老中水野忠邦の命であるとして『戊戌夢物語』とその著者と思われる渡辺崋山の身辺調査、そしてモリソン号を調べるよう命じられた。貢蔵は納戸口番の花井虎一からの情報を得て、高野長英の翻訳に基づき渡辺崋山が『戊戌夢物語』を執筆したと報告した。その際に、無人島渡航計画が江戸市中で企まれていることもあわせて報告した。渡航計画の再調査を命じられた貢蔵は、常州無量寿寺に赴き、渡航計画は寺の住職である順宣・順道父子が小笠原諸島へ行き、島にある珍しい植物や奇石を手に入れ売却しようとしたものということを突き止めた。海外渡航や外国人との接触を目的としたものではなく、また幕府にも正式に渡航許可を申請しており、渡辺が関与していたという事実も無かったが、貢蔵はこの計画に渡辺も加わっていると報告した。高島秋帆疑獄事件.長崎奉行に着任した伊沢から鳥居耀蔵に宛てた書簡の第一信によれば、貢蔵や花井虎一を伊沢の組与力に推挙したのは鳥居耀蔵であったという。疑獄事件が落着した後、貢蔵は自ら小普請入りを願い出て、許されている。花井虎一