前作に登場した「しんくうぎり」「すいへいぎり」は今作にも存在する。ちなみに前作で可能だった同じ技の重複習得は不可能になっている。とくせい.かしこさとグミ.また持っているタイプの多さで上がるかしこさの量に違いは出ず、グミ自体でも上がるかしこさは少なくなっている。今回はダンジョンもしくはそれ以外のフィールドでグミを食べさせるようになっているが、どちらの方法をとってもあまり違いがみられなくなっている。また、「おいしいミツ」という道具でもかしこさを上げることができるようになった。ダンジョン脱出後の措置.前作同様「あなぬけのたま」で脱出した場合は持っている道具はなくならない。ともだちきゅうじょ.ふしぎなメール.今作の「ふしぎなメール」には、「お尋ね者からアイテムを取り返す」や「依頼人が仲間になることがある」といった、前作には存在しなかったタイプの依頼も存在する。また「ふしぎなメール」を使うことで、時の探検隊でしか現れないポケモンを闇の探検隊でも、また闇の探検隊でしか現れないポケモンを時の探検隊でも現れるようにできる。前作同様、パスワードを利用することによってインターネット等で他のプレイヤーと同一の依頼を受けることが出来る。登場ポケモン.ギルドのポケモン.これらのポケモンは主人公やパートナーと特に親密に関わっていく事になり、お互い励ましあい助け合いながら物語の数々の困難に立ち向かっていく。ポケモン不思議のダンジョン空の探検隊.テレビアニメ.ポケモン不思議のダンジョン時の探検隊・闇の探検隊.ポケモン不思議のダンジョン空の探検隊時と闇をめぐる最後の冒険.一部のキャラは前作とキャストは一緒。漫画.収録曲.カバー.双愛会来歴.山口豊隆オルモック湾双愛睦高寅組飲酒検問おもいッきりイイテレビおもいッきりイイ!テレビ長井彬は、日本の小説家。エカチェリーナ海峡山口弘倉経歴.人物.生家の呉家は、学者の家系として著名な箕作家に連なり、祖父で蘭学医の呉黄石は蘭学者の箕作阮甫の弟子で娘婿にあたる。父の呉文聰は「国勢調査の父」と謳われた統計学者で、日本で初めて精神医学と精神医療を確立し「精神医学の父」と謳われた呉秀三は叔父。書家の日高秩父は義叔父。