三谷の抜擢.石原は三谷が「喜劇専門」であったことを知らずにシリアスな医療ものを依頼したため、書かれてきた脚本の喜劇調の部分を変更することになってしまったことから、「三谷さんには悪いことをした」と後に語っている。白い巨塔のオマージュ.三谷自身も公言している通り、医療ものの名作『白い巨塔』が元ネタであり、同作の影響を強く受けた一種のオマージュとなっている。三谷の発言から、当初は「白い巨塔」のパロディーとしての面が強かったと推察されるが、現場の意向からそうした要素が排除された。財前のアンチヒーローな人物像は織田裕二が演じる司馬に、里見の医師としての正義感・倫理観などは石黒賢が演じる石川に踏襲された。この二人をメインに据えて、その倫理観についての対立関係がより顕著にエスカレートした形で本作では描かれている。ストーリーの終盤、石黒賢が演じている医師の石川が病に侵され、やがて死に至る描写はキャラクターの立ち位置こそ逆だが、『白い巨塔』の財前五郎を彷彿させるものである。シナリオの変更.脚本を手がけた三谷幸喜は、本作がゴールデンタイムで初の連続ドラマ作品だったが、シナリオが現場でどんどん変えられていくことにショックを受け、その経験を元に『ラヂオの時間』の戯曲(「東京サンシャインボーイズ」のための)を書いた。また、スペシャル版は「司馬と石川が床屋の理容師」というパラレルワールドの喜劇にしようとしたが、スタッフの猛反対にあい却下された。そのかわり、この作品のヒットが元で、三谷の希望する「コロンボのような倒叙ミステリー」として『古畑任三郎』が制作されることになった。戯曲と異なり、CM等様々な制約のあるテレビドラマは勝手が違ったが、三谷は制約をむしろ逆手に取ることに快感を覚えたと回想している。たとえば、本作においてある2人の出演者の仲が悪かったことから、制作側から共演のシーンは書かないよう要請があり、それを脚本に生かしたという。ラストの展開.三谷によれば「とてもいいラストになったので感謝しているが、もうちょっと早く言ってくれれば...」ともこぼしている。天真楼病院について.白い巨塔の浪速大学病院と同様、大学の系列病院となっている市中病院であり、確固たる派閥抗争や内部権力が横行する病院である。