機体の上下から撃つものから、ボタン選択により放出して自動的に敵方向に向かって撃つものになった。またファンネルを破壊することが可能になりその際にファンネルを放出した機体にダメージが加わるようになっている。ミサイルも従来の単発のみからダブル・トリプル同時発射ミサイルが追加された。さらに、ショットランサーのように大ダメージで追加された。このようにMS・武器の種類が増えたことでより多彩なアクションバトルが出来るようになった。なお、全ての武器の弾数は戦闘が終わるたびに回復する。また従来では同じ土俵で戦っていた戦艦による砲撃、MS対艦船、艦対艦船は全て地形による支援効果の影響を加味されたシミュレーション処理による間接戦闘となった。なお間接戦闘では小型のMSとMAは反撃できない。決着のつき方はどちらかのユニットの全滅か設定で決めた規定ターンを迎えるのどちらかで、規定ターンの場合は都市などの占領で獲得したポイントによる判定で勝敗が決まる。全滅、または圧倒的なポイント差がついていた場合は完勝。ある程度のポイント差がついている場合は勝利。僅差の場合はたとえポイントで勝っていても引き分けという判定になる。両軍が同時全滅した場合も引き分けになるがゲームの特性上、対人戦で狙って起こさないと起きない。CPUの近接戦闘の実力は、ターゲットとしていた年齢層を考えると全体としてやや強めではあるものの、初期設定でハンディキャップをつけられる上、慣れれば対応できる強さという点からもほど良いものとなっている。ただし、CPUはマップにユニットが一機も存在しないとそのマップの思考操作を完全に放棄するという戦略思考的な穴がある(仮にベースを保有してても生産したり、生産完了ユニットを出撃さえもしない)。登場勢力.なお、ゲームバランスの都合により本来クロスボーンの所属では無いザクマリナーとカプールがクロスボーンに入っていたり大型MAのバランスの調整によりビグザムがアクシズの所属になっているといった若干の変更は存在する。地球連邦軍.上級MSが強い傾向にある。その傾向上、序盤は他勢力と比べると苦戦しやすいが、ガンダム系がたくさん作れる環境が整えば非常に強い力を発揮する。また、全勢力で唯一大型ユニットが作れないティターンズ.