ミッションはゲーム購入時から発行できるものとダウンロードコンテンツなどをダウンロードして発行できるものがある。ダウンロードコンテンツはホームページやゲーム内の案内に従いダウンロードする。ミッションにはストーリーミッションとフリーミッションがあり、ストーリーミッションをクリアするとストーリー進行度が進み、ストーリーミッションは一度クリアするとフリーミッションとなる。ミッションには発行資格があり、決まった難易度までクリアしないと受けられないミッションがある。一つの難易度のストーリーミッションをある程度クリアすると次の難易度のミッションを発行できるようになる。ミッションメンバーは最大四人または八人などおり、フィールド内の移動、アイテムの使用、信号弾の使用、「神機」(本シリーズにおける携帯生体兵器)の使用、遺棄されたアイテムの回収などが行える。アクションについて.ミッションメンバーは歩行、ダッシュ、ステップ、ジャンプが行える。歩行は入力の大きさに応じて速さが変化する場合がある。ステップはいわゆる無敵時間は無い。フィールドはアルファベットで表記されるいくつかのエリアに分かれているが、エリア移動の際に画面が切り替わったりすることはない。フィールド内には一定の場所に「回収ポイント」と呼ばれる素材が落ちている地点があり、一回のミッション中それぞれ一回のみアイテムが回収できる。あらすじ.極東支部初の新型神機の適合者となった主人公は、ゴッドイーターの拠点「フェンリル極東支部」で様々な仲間と出会い、共に闘っていく内に、巨大な陰謀へと巻き込まれていく。登場人物.主人公および主要キャラクターが所属する第一部隊は「討伐班」と呼ばれており、人々の脅威となりうる大型のアラガミの討伐などに従事している。また、居住区の防壁開発などに必要不可欠な「コア」の回収も重要な任務とされている。ヨハネス・フォン・シックザールについてはフェンリル極東支部におけるヨハネス・フォン・シックザール、ペイラー・榊についてはフェンリル極東支部におけるペイラー・榊を参照。フェンリル本部.第十四部隊.ゴッドイーター.ディバイダー.スタッフ.サイード・ファールークについてはフェンリル本部本項におけるサイード・ファールークを参照。フェンリル本部直轄師団「グレイプニル」.フェンリル情報管理局.