遺跡から発掘されたものの大部分は魚介類の骨や殻であり、農耕の痕跡は見つかっていないことから下田原期と同じく食料は多くを海に依存し基本的に漁撈を中心とする採集生活だったと見られているが、イノシシの骨も一定量得られており、骨が雌の個体に偏重していることからイノシシの飼育も行われていたようである。その調理法として遺跡から焼けた石やサンゴ、貝殻、木炭が含まれた黒色の砂がレンズ状に堆積する状況が確認されることから、熱した石を用いて食料を蒸し焼きにする、焼石調理法(ストーンボイリング)が行われていたことが想定されている。これらの特徴から、下田原期の文化が台湾との関連を指摘されていたのに対して無土器期はフィリピンや南太平洋など南方系文化との関連性が指摘されている。無土器期末期に近づくと、大泊浜貝塚等で、海外との交易を示す中国産白磁玉縁碗や長崎産滑石製石鍋、徳之島産カムィ焼が出土するようになる。その後本島のグスク時代開始と同じくして先島でも土器や農耕文化が出現するようになる一方、貝斧や焼石調理法は姿を消し先島先史時代は終わりを告げる起源.先島先史時代の前期である下田原期との間には出土物が確認できない空白期間があるため関連性ははっきりしておらず、無土器期の文化の担い手が下田原期の人々の生き残りの末裔なのか、それとも下田原期の人々とは起源を異にしていたのかは不明である。無土器期の特徴である貝斧はフィリピンの先史文化と、焼石調理法はポリネシア文化との関連が指摘されており、これらは下田原期の遺跡からは発見されていないため下田原期以降に南方系の人々が先島に移り住んだ可能性がある一方、同時期のフィリピンやポリネシアの文化には農耕文化や土器文化があった他、同じく先島周辺の台湾や沖縄本島でも土器文化が確認されており、それらの人々がそのまま先島に移って来たなら土器文化を持たないことはありえないという指摘もある。この空白期間には先島諸島でサンゴ礁が形成されたことが確認されており、海岸線が沖側に移動したことが可能性がある。その場合、海進・海退の影響により前期と後期の間の遺跡は海に沈んでいる可能性がある。このことから下田原期以降にサンゴ礁が発達するにつれて下田原期からの人々がその環境に適応して無土器期の文化が形成されたという説もある。