全身から一種の電磁波を発しているらしく、電子機器に干渉して動作障害や通信障害を発生させることがあり、接近すると「テレビが映らない」「コインのスロットが常に大当たりになる」「ゲームセンターのクレーンゲームの景品が自動で出てくる」などの現象が発生する。生命の危機を迎えると、全身が鈍い赤色に点滅する。劇中での活躍.創作経緯.特技監督の川北紘一は、作品のコンセプトを「ゴジラ対ゴジラ」であると述べている。監督の山下賢章は、初期案ではスペースゴジラのイメージがアバウトであったため、ゴジラとスペースゴジラの関係性を「母親と不良家出少年」または「不良家出少年と長男の兄弟喧嘩」と解釈している。基本設定は、小林晋一郎による企画書『ゴジラVSネオゴジラ』を元にしており、同企画書ではクリスタル・ゴジラと名付けられていた。企画段階ではSUPERゴジラやNEWゴジラなどの仮称が用いられていた。富山は、ネーミングはすんなり決まったと述べている。脚本を担当した柏原寛司による検討稿では、スペースゴジラとは別にトンボ型エイリアンが登場しており、スペースゴジラが飛来する前にバース島でリトルゴジラを襲いゴジラと戦うという役割を担っていた。しかし、予算の都合などからスペースゴジラがスペースシャトルを襲撃するシーンとともにカットされ、代わりにバース島での人間ドラマが膨らまされることとなった。福岡を舞台とすることは企画当初から決定していたが、山下はスペースゴジラが同地に出現する理由が必要であると考え、当時環境問題として話題になっていたオゾンホールを結びるけることを発想したが、決定稿には明記されなかった。また、脚本では結晶体から発する強磁界により警察車両や報道ヘリが進入を阻まれるという描写があり、山下も絵コンテでこのシーンに力を入れていたが、予算の都合などから撮影は行われなかった。デザイン.決定デザインは吉田穣。スーパーファミコンのゲーム『超ゴジラ』に登場する、ゴジラの進化型である超ゴジラがベースとなっている。特技監督の川北紘一は、色々いじるよりも「ゴジラより強いゴジラ」という設定であった超ゴジラを原型とするのが良いということになったと証言している。腹部の筋肉質なディテールはデザイン画にはなく、造型段階でのアレンジである。飛行形態にはグライダー型のデザイン案も存在したが、不採用となった。