機能的MRIの技術を用いて気分変調症患者群と非患者群を比較した別の研究では、この障害の神経学的指標をさらに支持する結果が得られた。具体的には、脳の複数の領域が異なる機能を示したのである。気分変調症患者では、扁桃体(恐怖などマイナスの感情の処理に関与)、島皮質(悲しみの感情に関与)および帯状回(注意と感情との橋渡し役を果たす)における活動性の亢進が観察された。健常者と気分変調症患者とを比較したある研究では、さらに他の生物学的指標が示唆された。自らの感情に関わるどのような出来事が将来予期されるか聞いたところ、健常者はネガティブな形容詞の使用がより少なかったのに対し、気分変調症患者はポジティブな形容詞の使用が少ないという結果が得られた。さらに、健常者は気分変調症患者と比べ、ポジティブ、中立、ネガティブのいずれの出来事予期に対しても神経学的により強い反応を示すことが分かった。このことは、気分変調症患者が感情鈍麻を学習することで過剰にネガティブな感情から自己防衛する神経学的な証拠となる。気分変調症を含むすべての型のうつ病における遺伝的基盤を示すエビデンスがある。それは、一卵性双生児のほうが二卵性双生児よりも、共にうつ病を有する確率が高いというもので、気分変調症が部分的には遺伝によって起こるとする考えが支持されている。診断.鑑別診断.鑑別診断として、躁はなく、気分循環性障害も満たさない。抑うつは、慢性精神病(統合失調症や妄想性障害など)の症状ではない。また、医学的疾患や乱用薬物・処方薬が原因ではない。正常な持続的な悲しみは、慢性的にストレスがあるとか、失望的な生活を送る場合に起こりうる。正常な範囲で慢性的に悲観的な人も多く、診断には重症であることが必要である。また、経済的な重圧や、介護、他の病気に対処しているといった慢性的なストレスと関連する場合には、気分変調症ではない。特に人生後期の発症は、身体疾患が疑われる。貧血や甲状腺機能低下症は長く続く抑うつ症状を生じさせる。慢性的な薬物の使用もである。予防.