飛び立つモスラの前に成虫となったバトラも出現。両者が横浜みなとみらいで激突しているところに丹沢山地での自衛隊迎撃ラインを突破したゴジラも現れ、再び三つ巴の戦いが始まる。モスラとバトラは共闘し、ゴジラを太平洋上へと運ぶが、バトラは力尽きゴジラとともに海中へ沈む。ゴジラを封印したモスラは、バトラに代わり地球へ迫る大隕石を破壊するためコスモスとともに宇宙へ旅立つ。制作.製作経緯.別案には、前作の続編として宇宙怪獣のキングギドラが登場する『キングギドラの逆襲』という企画も存在したが、キングギドラが連続することを避け本作品に至った。監督は、前作までの大森一樹に替わり、前年に『超少女REIKO』で監督デビューした大河原孝夫が務めた。大河原の起用は東宝の自社監督に務めさせる意図によるもので、東宝全体での決定であった。脚本作業において、大森と大河原が直接意見を交わすことはなかった。富山は、両者とも監督・脚本の経験があるため一方的に意見を受け入れることはないだろうと考え、互いに納得できるよう打ち合わせのタイミングを図っていた旨を語っている。大森は、決定稿が完成したあとに大河原の方で変更を加えることを望んでいたが、大河原はスタッフに伝達させるためには印刷物としてあった方が良いと考え大森へ意見するかたちを選んだと述懐しており、この体制は次作『ゴジラvsメカゴジラ』でも同様であった。特技監督の川北紘一によれば、「極彩色の大決戦」というキャッチコピーは東宝宣伝部の若手社員が考案したもので、東宝怪獣では単色のものが多いことからカラフルなモスラ成虫の体色そのものを売りにしようという意図であったという。配役.別所哲也、村田雄浩らは、キャスティングの田中忠雄からの推薦で起用された。手塚雅子役の小林聡美は、大河原の推薦によるもので、大森が監督した映画『恋する女たち』に出演していた縁から富山も賛同していたという。子役の米澤史織の撮影は夏休み期間中に行われたため学業への影響はなかったが、夜間の撮影が多かった。『ゴジラvsビオランテ』以来の出演となった田中好子は、自身がモスラを愛好していたことから出演を熱望し実現に至った。作曲家の本多俊之が自衛隊員役で特別出演している。大河原孝夫によると、本多が伊福部昭とゴジラ映画の大ファンだったことから依頼されてのことだという。撮影.