当初はケンタッキー州で新兵を徴兵する任務に就き、兵士達に入隊登録させる仕事に適していることが分かったので、その上官は彼をその職から外そうとはしなかった。ハンコックはこれらの戦闘における勇敢さと賞賛に値する従軍態度の故に名誉中尉に昇進した。結婚と平和な時代.ハンコックは補給係将校や副官として、大半はミネソタ州のスネリング砦やミズーリ州のセントルイスで多くの任務をこなした。ハンコックは家族も新しい勤務地に帯同し、アリーは基地では唯一の女性だった。ハンコックがフロリダに行ったときは、第三次セミノール戦争が終わるときだった。その任務は主に補給係将校であり、実戦には参加しなかった。南北戦争.ポトマック軍への参加.彼の部下達は疲れ切った南軍に対して反撃を命じられるものと思ったが、ハンコックはマクレランの命令である自隊の位置を守ることを実行した。ゲティスバーグ.ミードは夜半過ぎに到着し、全軍指揮権がミードに戻された。この連隊にとっては被害が大きかったが、この英雄的犠牲行為が時間を稼ぎ、北軍は防衛軍を組織化する事が出来て、その日の戦闘を救えた。南軍の歩兵の突撃に先立つ大砲の集中砲火の間も、ハンコックは馬に毅然と跨って辺りを睥睨しており、自軍を励まし続けた。ハンコックの部下の一人が「将軍、軍団指揮官はそのように命を危険に曝すべきではない」と抗議したとき、ハンコックは「軍団指揮官の命が顧みられない時もある」と返答したと言われている。副官によって馬から助け降ろされ、出血を止めるために止血帯を施された後で、自分で刺さっていた釘を引き抜き、その釘の拠って来たるところを誤解したか、顔をしかめて「奴らはこんなものを投げるなんて、弾薬が不足しているに違いない」と言った。バージニアおよび戦争の終結.それでも荒野の戦いでは実績を挙げ、スポットシルバニア・コートハウスの戦いでは「ブラッディアングル」でミュールシューの重大な突破攻撃を指揮し、南軍のストーンウォール師団を打ち砕いた。コールドハーバーの戦いではグラントが命じた無益な攻撃で、その軍団に大きな損失を被った。戦後の軍隊任務.リンカーン暗殺事件の裁判.大平原での任務.この処刑後、新しく組織されボルティモアに本部を置く中央方面軍の指揮を任された。