水谷が語る南方の島々の中で、恒藤が最も興味を持ったのが沖大東島であった。沖大東島は南鳥島と緯度的にほぼ同じであり、地形的に見てもリン鉱石を産出するのではないかと考えたのである。恒藤は水谷に対して、沖大東島に行くような機会があったらぜひ岩石や土砂を持ち帰って来るように依頼した。調査からの帰還後、水谷の甥は沖大東島の岩石を携えて全国肥料調査所に恒藤を尋ねたが、大阪出張中のため不在であった。恒藤の出張先には少量の石が送られた。送られてきた石について恒藤は良質なリン鉱石と判断し、全国肥料調査所の分析担当者に事情を説明した上できちんと分析するように指示した。分析結果は果たしてリン酸の含有量が高い良質なリン鉱石であった。その後、沖大東島のリン鉱石利権を巡って水谷を含めた泥沼の争いが始まることになる。鉱業権獲得を目指す水谷.沖大東島での有望リン鉱石発見後、全国肥料調査所職員の一人が三重県四日市市で肥料製造業を営む九鬼紋七のところへ出奔し、リン鉱石発見のニュースを伝えるとともに、自らが沖大東島へ渡るための出資をして欲しいと要請した。九鬼は要請を受け入れて早速出港したものの、船は沖大東島に辿り着くことなく失敗に終わった。もちろん沖大東島の開拓権を持っていた玉置半右衛門も黙っておらず、鉱業権の申請を行った。水谷もまた鉱業権獲得を目指して様々な画策を行った。恒藤によれば水谷の背後には大政治家や事業家らが控えていたという。沖大東島開発からの撤退.南鳥島の事業からの撤退.この水谷の南鳥島事業からの撤退については、まず水谷と市川、安達謙蔵との間に確執があり、その上、事業や経営が不得手な水谷は市川に多額の借金をしていたため、借金のかたのような形で南鳥島に関する権利を全て市川に取られてしまったとの話がある。晩年.海軍の水先案内人になる.パガン島移住.評価.前述のように横山源之助はアホウドリの捕獲で名高い人物として、鳥島のアホウドリ捕獲で名高い玉置半右衛門、尖閣諸島の開発で知られる古賀辰四郎と並んで、水谷の名を挙げている。また横山は水谷のことをカロリン諸島最初の貿易者、グランパス等の探検者、そして南鳥島、沖大東島、東沙諸島の開発に先鞭をつけた評判が高い冒険児と紹介している。