改造工事は、日光をイメージした専用塗装・車内化粧板・座席モケットの張替えなどのリニューアルが主でグレードアップは未施工である。運用.本項では国鉄時代とJR東日本承継後に分けて解説を行う。なお車両基地名称については、国鉄時代は当時の、JR化後は現在の名称で解説を行う。国鉄時代.以下の首都圏周辺車両基地に配置され、近距離特急列車に充当された。※括弧内は組織ならびに名称の変更を示す幕張電車区.このように千葉鉄道管理局(現在:東日本旅客鉄道千葉支社)管内特急列車と「あずさ」の定期運用ならびに首都圏周辺の臨時列車・波動輸送が主とされた。新潟運転所上沼垂支所.長野運転所.田町電車区.松本運転所.JR東日本への承継後.民営化後も長野・松本・幕張に配置され、引き続き各列車に充当された。また松本運転所所属車の一部がグレードアップ改造を施工された際に白を基調に緑と赤のラインを組み合わせたグレードアップあずさ色を経て、後に所属車全車がライトグレーとライトブルーを組み合わせたあずさ色、長野総合車両所所属車がダークグリーンとライトグリーンにライトグレーを組み合わせたあさま色と呼ばれる専用塗装も施された。長野総合車両センター.臨時列車では快速「ムーンライト信州」「ファンタジー舞浜」などのほか特急「あずさ」「かいじ」「はまかいじ」の運用へ投入実績がある。豊田車両センター.松本車両センター.高崎車両センター.小山車両センター.田町車両センター.大宮総合車両センター東大宮センター.※田町車両センター転入車の詳細については#田町車両センターを参照のこと。幕張車両センター.なお本編成はJR東日本所属の本系列で最後までグリーン車を連結していたが、以下に挙げる複数の理由によるものである。また臨時列車では「あずさ」「かいじ」といった中央東線ならびに千葉支社管内の臨時特急列車や企画列車、さらにはトラブル発生時の代走運用などに充当された。その他.「やくも」転用計画.脚注.注釈.概要.