彼の遠征は兵力、輜重、兵糧、戦略について彼が準備していた以上の問題を提起し、無残な失敗に終わった。軍を設立し、組織し、装備させるために、彼はしばしば裕福なものから私的な融通を強いていた。スペイン語を解せぬ先住民と並んで浮浪者や元受刑者をかき集めて、彼は徴兵を急いだ。彼の軍は伝統的な食事の欠如に加え、熱帯の気候にしか備えていなかったので、寒さに苦しんだ。補給路が以前より遠くに伸び、馬、ロバ、牛と車両が不足し、食糧と飼料がほとんど底をついた。医師の数は最小限しか用意しなかった。兵士の間に、もはや自分たちの死体を埋葬する神父さえいないとわかるにつれて、士気は低下していった。先住民は落伍者を攻撃した。水源は汚染されており、多くのものが病になった。彼の参謀組織が弱かったゆえに、サンタ・アナはこれらの課題があることに気づかず、軍事力の誇示と何件かの虐殺(アラモやゴリアドのような)を行えば、反乱軍が命乞いをするように追い込めるだろうとする自信があった。アラモ砦の敗北は、サム・ヒューストン将軍とその軍の時間稼ぎには貢献した。テキサス共和国大統領とサンタ・アナは「ベラスコ条約」に調印した。「メキシコ国民の代表として公式に、テキサス共和国の全面的かつ完全な独立を承認する」とし、テキサス内のメキシコ軍を撤退させた。それと引き換えにテキサス政府はサンタ・アナの生命の保障とベラクルスまでの帰還を保証した。しかし、首都メキシコシティに戻ると新政府はサンタ・アナはもはや大統領ではなく、テキサスとの条約は無効であると宣言した。と述べ、これに対しサンタ・アナは以下のように返答している。負債、独裁と亡命.メキシコがフランスからの在留フランス人が被った被害の補償の金融的請求をメキシコが拒否したあと、フランスは派兵し、ベラクルスに上陸した(菓子戦争)。メキシコ政府は彼に軍の指揮権を与え、彼に必要な手段で国民を守るよう命令した。彼はベラクルスでフランス軍と交戦した。メキシコ軍が退却の際、略奪に失敗したあと、サンタ・アナは左足と手に砲撃を受けた。彼のくるぶしは粉砕され、足の切断が必要となった。彼は切断された足を軍礼をもって埋葬するように命令した。メキシコはフランスの要求に屈したにもかかわらず、サンタ・アナは戦争を英雄としてメキシコ政界への復帰に使った。