境界科学は、多数派の意見でも尊敬される少数派の意見でもなく、主流派の広く受け入れられている学説と、誤ったバランス、誤った等価性の問題が生じることがある。メディアは、複雑なトピックを二つの側面に分類し、主流派と戦うという観点から問題を構成することがある。このような単純化は、中立性と公平性の名の下に、突飛な境界科学を主流派と同等で正当な競争相手の役割に格上げし、境界科学の普及と一般化に貢献している可能性がある。定義.科学哲学において、科学と非科学の間でどこに境界線をひくのかという問題を「線引き問題」と呼ぶ。だがややこしいことに、一部の境界科学の提唱者は、適切な科学的証拠とおかしな主張の両方を用いて議論を進めるのである。解説.境界科学という呼称は、発見についての異端的な理論やモデルを指して使われる。そういった境界科学のアイデアを生み出す人々は科学的方法を採用していることもあるが、その結果は主流のコミュニティには受け入れられない。通常、境界科学のアイデアの証拠として提出されるものを信じるのはごく少数であり、多くの専門家はそれらを証拠と認めない。査読のある学術誌に論文が掲載されたことがあるなど、ある程度認知されている科学者が境界科学的アイデアを提唱することもあるが、常にそうであるとは言えない。多くの境界科学的見解は反証を含めた科学的方法を注意深く適用することで無視または排除され、科学界に受け入れられるのはごく一部である。例えばプレートテクトニクスは、そのアイディアはもともとは境界科学に起源を持ち、数十年の間、そのアイディアに対する否定的見解を受け続けていた。なお防衛大学校の理工学研究科では「学際領域」の意味で「境界科学」という呼称を用いている。具体例.歴史的事例.主流科学によって反駁された歴史的アイデアとしては、以下のものがある。現代の事例.比較的最近の境界科学の例を以下に示す。主流科学として受け入れられた例.境界科学として追いやられていたが、やがて主流の科学に取り込まれた理論・主張もいくつか存在する。境界科学への対応.