先生を除き生徒は十二支の名前を冠した班に分けられている。班決めは入学後に行われている。本項では主人公ツバキが所属する戌班を最初に以降十二支の順で記載。生徒の誕生日と身長と得意な術と好きなものと嫌いなものは原作公式サイトから。あかね組.生徒.戌班.卯班.卯班の班員は舞台で歌謡・演奏を行い、生徒と先生一同楽しみにしている。いわゆる鼓笛隊である。故に戦闘力は無いに等しい。巳班.得意な術は「眠鈴の術」、ケンカを観賞するのが趣味など共通点が多い。とてつもなく仲良しで常に2人で居る双子姉妹。『とても仲が良い』『すごく仲が良い』かで揉めて初めてケンカした。その際に戌班に仲直りの仕方を教えてもらう際に『とてつもなく仲良し』で両者納得した。得意な忍術は、確実に相手を眠らせる「眠鈴の術」。しかしチームワークの大切さを学ぼうとするサザンカとアサガオコンビに対しては発動がかなり遅かった様で、ウイキョウとキキョウを驚かせる。午班.申班.医療班。いわゆる医療隊である。酉班.タンポポとアザミが余りにもだらしなかったので、スミレが怒って精神を鍛え直すために山ごもりをしていた。スミレとは対照的にタンポポとアザミはステレオタイプ的なコギャルで自由奔放。亥班.あかね組.山に囲まれた男子禁制の忍者の里で暮らしているくノ一たち。「男は危険な生き物のため、交流することを禁ず」「無断で勝手な行動をとるべからず」などいくつかの掟がある。かつては男子のみの忍者集団であるあおい組と交流があったが、とある事情により互いに交流を絶っている。その敷地内には、平地の真ん中に宿舎が、両端に上級生・下級生それぞれの勉強小屋がある。さらに演習場、より離れた所に温泉と思しき広い露天風呂がある。ただし、宿舎の近隣にも風呂はあるらしく、それとは別に露天風呂は入浴可能な日時が定められており、とある事情により厳守しなければならない。班決め.コラボ.この際ツバキは「口寄せの術」を使っているが、本来口寄せとは、例えば人に対して催眠術の様に神や死者を憑依させる術の事で、神官らが扱う術であって忍術ではない。