ただしポケモンの進化は、同一個体内で起きる現象のため生物学上の進化の定義にはあてはまらず、生物学的には変態に相当する現象である。実際、「幼虫→さなぎ→成虫」という昆虫の変態を模した進化を遂げるポケモンも存在するが、種によっては「魚類→竜」「ネズミ→ウサギ」といったように、現実の生物に当てはめられないような変化を遂げる場合もある。野生では、進化後のポケモンの本来進化するレベルより低い個体で生息している場合もあるため、進化前のポケモンが進化後のポケモンの幼生である、というわけでもないようである。またイーブイの進化の場合、不安定な自身の遺伝子が外的要因を受けて変異し起こるという、生物学上の適応や突然変異に相当する現象であり、現実における進化に酷似した例も確認されている。進化をすると全体的に能力が上がり(種族によっては一部の能力が下がるものもいる)、使用可能なわざマシンやひでんマシンの数が増えるが、一方でわざを覚えるまでのレベルが高くなるというデメリットがある。種族によっては進化の前後で覚えるわざが異なるものや、進化することで新しいわざを全く覚えなくなるものもいる。能力値を優先して早めに進化させるのか、わざを優先して進化を遅らせるのかは各個人の考え方の分かれるところである。ポケモンカードゲームや一部の漫画では一度進化したポケモンが元の姿に「退化」する描写が見られるが、これらは関連作品の中でも極めて異質な表現であり、基本的に進化は不可逆である。そのため、進化をめぐる葛藤が描かれる場面も多い。特殊能力.リージョンフォーム.『サン・ムーン』以降では「リージョンフォーム」(「(地方名)のすがた」ともいう)という、通常とは異なる姿、およびタイプを持つポケモンが登場した。それぞれの地方の環境に適応するために独自の変化を遂げたものであり、姿だけでなく生態も異なっているため、むしろこちらの方が生物学上の進化に近い。進化前は通常の個体しかいないが、進化するとリージョンフォームとなるポケモンもいる。『ソード・シールド』以降では通常とは異なる進化系を持つポケモンや、通常のすがたでは進化しないが、該当リージョンフォームでは進化するというポケモンも現れた。フォルムチェンジ.