寒冷地仕様として戸閉機構の半自動化(次項)、客用出入口ドアレールに凍結防止ヒーターの設置、妻面の主電動機冷却風取入口に開閉カバーを設置した(夏期は外部から、冬季は室内から取り入れ)。さらにスノープラウ、耐雪ブレーキの取り付け、予備笛の追加と既存のものにカバーの追加、床下機器の防雪対策を施工した。JR東日本の改造車.国鉄から大量に継承したが、新形式の投入に伴い現在は全車両が定期運用を退いている。オールロングシート車.前面強化改造.なお、前照灯が白熱電球であった車両は改造と同時にシールドビームへの交換が行われたため、工事の完了によって白熱電球装備車も消滅している。車両更新工事.おもな施工項目はリニューアル車.房総地区向け方向転換・編入改造.トイレ部分の側面方向幕撤去.JR東海の改造車.東海道線名古屋地区向け短編成化改造.改造内容はブレーキ力増強、焼結合制輪子・ライニングの使用。小断面トンネル対応車.なお、一部文献で「身延線入線のため」とする資料が存在するが、誤りである。トイレ使用停止車.運転室背面窓拡大工事.延命工事.目立つ部分ではその他.JR西日本の改造車.おもな施工項目は高速化改造.施工車は未施工車と区別するために以下のように改番された。半自動ドアボタン設置改造.トイレ撤去車.パンタグラフ増設車.電気連結器取付と撤去による改番.塗装はクリーム色をベースに窓周りを茶色とし、窓下部に黄色と青の帯を配したもので、福知山ワンマン色と呼ばれる。車内はリニューアル工事も行われず、半自動扉も取っ手付きの手動式であり、ドアボタンも設置されていない。体質改善工事.耐寒耐雪改造車.以下の様に改番された。小浜線向け改造車.編成内容は以下のとおり。JR四国の改造車.車番対照は以下のとおり。他系列への改造車.塗装は先頭車が青とグレー、中間車が赤とグレーを基調としたものとなった。早期に落成した編成は新福知山色で登場し、七尾線電化まで福知山線系統で使用された。運用.東海道本線東京口.横須賀線・総武快速線.房総地区.東海道本線静岡口・御殿場線.中央西線名古屋口.東海道本線名古屋口.東海道・山陽本線京阪神地区.阪和線・紀勢本線.