小さな漁村に祖父ゼクスと住む少年シングは、ある日浜辺に打ち上げられた2人の兄妹ヒスイとコハクを発見する。意識を取り戻した2人は、ソーマを探しゼクスを訪ねて村にやってきたことをシングに告げる。シングは使われないように隠してあったゼクスのソーマを勝手に持ち出し、母の形見のソーマが奉られている岬の祠に向かうが、そこで謎の魔術師に襲われ、コハクはスピリアにダメージを受け、駆けつけたゼクスも大怪我を負ってしまう。ヒスイは回復術での治療を試みるが、ゼクスの容体は酷く、そのまま命を落としてしまう。システム.戦闘システム.タッチパネルに術技を設定し、タッチすることで発動時間をショートカットするだけでなく、戦闘に参加していないパーティーキャラクターの術技を設定することで援護キャラクターとして使用できるのが特徴である。また、戦闘参加キャラクターと不参加キャラクターの特定の技の組み合わせにより、強力な「合体技」が発動する。他にも、特定の条件を満たすことでシリーズ作品のパーティーキャラクターや他のナムコ製ゲームのキャラクターも援護キャラクターとして登場する。エンカウント.ソーマ.キャラクター同士には「ソーマリンク値」が設定されており、シナリオの進行などで変動する。ソーマリンク値が高くなると新たなスキルを習得できる。世界観・設定.登場人物.一部の人物の名前が鉱石の名が由来になっている。開発.キャラクターデザインはいのまたむつみが担当。オファーがあったのは『テイルズオブイノセンス』の作業中だったことから本作と平行作業となり、いのまたは「頭の切り替えが大変だった」と語っている。プロモーション.評価.GAMEWatchでは「据え置き機のシリーズの基準を満たす秀作」と評価された。DS版との違い.スピルメイズのリンクカウンターや治癒石のシステムが無くなり、新しく料理システムが追加された。後述の通りバトルシステムやソーマビルドのシステムなども大幅に変更されている。また、DS版では高度を持って飛翔していたカルセドニーがプレイヤーキャラ化したことで、地上からわずかに浮いて飛翔している形に変更されている。ゲーム中のムービーは全てアニメムービーエディション版のものであり、新たに追加されたムービーもある。ダウンロードコンテンツ.