コプト語はエジプト語の歴史上で唯一、母音や強勢アクセントのパターンが完全に表記されている。コプト語の、この表記体系のおかげで、他の時期のエジプト語に比べ新エジプト語の音韻は比較的正確に知ることが出来る。また、かつてのコプト語の音韻は、イスラーム侵攻初期に書かれたアラビア語のパピルス文書からも知ることが出来る。これらの文書はコプト語がまだ日常的に使用されていた時代に、アラビア文字でコプト語の発音を表記したもの(またはその逆)だからである。母音.語末の強勢のない'はとして発音されるが(サイード方言)、北部の方言ではとなる(コプト文字')。長母音のは、コプト語の時代になって新たに加わった音素である。また、は、より口を広げてた発音ので発音されることもある。はで表される。これは場合によりやとして発音されることもある。は常に強勢のない音節に現れ、初期の文献ではしばしばになっている。また二重母音もいくつかある。主な二重母音—,,,など。子音.初期のエジプト語では区別されていたとは次第にあいまいになり、消滅したが、コプト語ではギリシア語からの借用語の中で再びが現れた。例:コプト語'(')または'(')「学校」。その他、区別が明確でなくなった子音の組み合わせには、と、とがあり、いずれも無声音の前者方が普通の発音である。また、特にファイユーム方言においてはとの区別も明確ではない(これは初期のエジプト語の特徴である)。文法.名詞.代名詞.方言.コプト語期以前のエジプト語の方言については、古代エジプト社会の政治的、文化的な中央集中的な性格から、残された記録により実情を知ることができない。しかし、古エジプト語〜中エジプト語(古典エジプト語)は、古王国の首都メンフィス周辺で話されていた下エジプト地域の話し言葉が反映されたものである。また、新エジプト語期には、テーベが新王国の文化的、宗教的中心地となったため、上エジプト、特にテーベ周辺の地域の話し言葉の影響が強まった。