しかし、その後も三浦半島付近では海の怪物による被害が相次ぎ、スチュワート博士とアケミはフランケンシュタインの目撃報告をもとに谷川岳へ、間宮博士は山中湖へ、それぞれ向かう。その結果、引き上げられた漁船からは海棲生物の細胞組織が、山中では巨大な足跡がそれぞれ発見された。間宮の持ち帰った細胞組織がフランケンシュタインのものと判明した直後、曇天の羽田空港に巨大なフランケンシュタインが現れ、女性事務員を食らう。雲間から太陽が覗くと、フランケンシュタインは慌てて海へ姿を消した。スタッフ.製作.脚本ではサンダとガイラの名は決まっておらず、それぞれ「山フランケンシュタイン」「海フランケンシュタイン」と表記されている。脚本名も、第一稿では『フランケンシュタインの兄弟』と題され、以後は『フランケンシュタインの斗争』、『フランケンシュタインの決闘』と変遷している。キャスティング.戸川アケミ役の水野久美は、別役ではあるものの「幼少期のフランケンシュタインを知る研究者」という前作とほぼ同様の役柄を演じている。当初、スチュワート博士役にはタブ・ハンターが予定されていた。実際にスチュワート博士を演じたラス・タンブリンは、定時の撮影後は共に来日した妻とホテルへ直帰し、食事などの交歓の誘いも一切断わるなど、ニック・アダムスがスタッフや俳優たちと積極的に交流したのとは対照的な姿勢をとった。撮影現場でもまったく演技を合わせようとせず、土屋嘉男によれば、水野久美はタンブリンの態度に怒ってヒステリーを起こしたこともあったという。特撮.冒頭のガイラと大ダコの対決シーンは、『フランケンシュタイン対地底怪獣』の公開版では用いられなかった「大ダコ出現版」を仕切り直したものとされる。羽田空港のセットは、東宝撮影所の大プールに設けられた。管制塔も建て込まれるなど広大なセットであったが、スクリプターの鈴木桂子はカット数が少なく、完成作品でも広さを感じられなかったと述べている。鈴木は、このころより製作期間が半分に減らされるなどしたため、特撮の質が目に見えて落ちていったと証言している。崖から落ちたアケミが木に掴まるシーンは、特撮での人形とのつながりもあるため、水野が演じる部分も特撮班が撮影を担当した。海外公開版とオリジナル版との相違.