当時、サリン中毒は医師にとって未知の症状であったが、信州大学医学部附属病院第三内科(神経内科)教授の柳澤信夫がテレビで被害者の症状を知り、松本サリン事件の被害者の症状に似ていることに気付き、その対処法と治療法を東京の病院にファクシミリで伝えたため、適切な治療の助けとなった。この事件は、目に見えない毒ガスが地下鉄で同時多発的に散布されるという状況の把握が非常に困難な災害であり、トリアージを含む現場での応急救護活動や負傷者の搬送、消防・救急隊員などへの二次的被害の防止といった、救急救命活動の多くの問題を浮き彫りにした。警視庁科学捜査研究所の発表により、医療機関は対NBC兵器医療を開始した。自衛隊.聖路加病院へ駆けつけた医官は直近に化学兵器対応の講習を含む幹部研修を受けており、現場派遣時にはその講習資料を持ち出していた。。先述の『対化学兵器治療マニュアル』はここから提供されており、原因の断定や治療方針の早期決定に役立った。なお当初は爆発事故として出動したため、後に日野原院長へ「毒ガス専門の医官が来た」と報告されたこの医官が専門資料を携え最も多くの被害者が運び込まれた聖路加病院に出動したことは偶然である。後にアメリカ軍とイスラエル軍は自衛隊から事件の聴取を行い、十数人の死者で済んだのは奇跡、と評している。なお、自衛隊では関東周辺の陸上自衛隊各部隊に対し非常呼集対応を行ったものの、実働は本稿に記載されているように、最小限の部隊を派遣した。報道関係.被害者.事件の目撃者は地下鉄の入り口が戦場のようであったと語った。多くの被害者は路上に寝かされ、呼吸困難状態に陥っていた。サリンの影響を受けた被害者のうち、軽度のものはその徴候にもかかわらず医療機関を受診せず仕事に行った者もおり、多くはそれによって症状を悪化させた。列車の乗客を救助したことでサリンの被害を受けた犠牲者もいる。また、その当時重度な脳中枢神経障害を負った被害者の中には、いまだに重度な後遺症・神経症状に悩まされ、苦しめられている者も数多くいる。作家の村上春樹による被害者へのインタビュー集『アンダーグラウンド』があるほか、自身も事件に巻き込まれた映画プロデューサーのさかはらあつしによる著書『サリンとおはぎ』がある。