Можно ли самостоятельно на обычном сервере развернуть защиту от DDoS атак?
Самостоятельные уровни защиты выставить конечно можно, но то, как качественно это сделают профессионалы, несравнимо. Если все же, вы решили сами позаботиться о безопасности вашего сервера, то обратите внимание на сервисы, блокирующие ip, и установите модули Apache.