Можно ли быть самозанятым и одновременно состоять в штате какой-либо компании?
Да, одно другому не мешает. Единственное ограничение: если вы работаете в штате определённой компании (или состояли с ней в трудовых отношениях в течение последних двух лет), то не можете оказывать ей услуги от лица самозанятого.