売上はすべて課税売上ですので、課税売上割合は気にしなくて良いですか？
本業の売上がすべて課税売上でも、株式などの有価証券を売却すると非課税売上が発生しますので、課税売上割合を計算する必要があります。
課税売上割合の計算上、有価証券の譲渡価格の5%だけが非課税売上に計上されますが、有価証券の譲渡価格が高い場合には、課税売上割合が95％未満になり、消費税を全額控除できなくなることもありますので、注意が必要です。