どうしてここではdoではなくdoneが使われているのですか？
「How it's done」は「how to do it」を意味する慣用句です。慣用句なので、文法的には正しくありません。そのため「done」が使用されています。「how it's done」ではなく「how to do it」とすることも可能です。
例：I'll teach you how to ride a bike, let me know you how it's done. （自転車の乗り方を教えるから、どうやるのか教えて。）