社長が進行役をすると良くないですか？
会議の進行役（ファシリテーター）は、可能な限り中立の立場である必要があります。社長は、社内の立場的には絶対的な権力者であるため、ファシリテーターとしては適切ではないと考えられます。詳しくはこちらをご覧ください。