3頭であれば、a pair of whalesとは言えませんよね？
「a pair」は何かが2つある事（または1組、1対）ですので、3頭であれば 「a pair」とは言えません。
例：I bought a new pair of shoes.（新しい靴を購入しました。）
例：She put on a pair of gloves to keep her hands warm.（彼女は手を暖かく保つために手袋をはめました。）