A plasmid is a small, extrachromosomal DNA molecule within a cell that is physically separated from chromosomal DNA and can replicate independently.
Plasmid adalah DNA ekstrakromosomal yang dapat bereplikasi secara autonom dan dapat ditemukan pada sel bakteri.
In the laboratory, plasmids may be introduced into a cell via transformation.
Sejak saat itu, beberapa laboratorium mulai membuat plasmid yang dapat ditransfer ke sel hidup, seperti sel bakteri dan tanaman.
The term plasmid was coined in 1952 by the American molecular biologist Joshua Lederberg to refer to "any extrachromosomal hereditary determinant."
Istilah plasmid diperkenalkan pada tahun 1952 oleh ahli biologi berkebangsaan Amerika, Joshua Ledenberg yang merujuk pada "penentu keturunan herediter di luar kromosom".
The term's early usage included any bacterial genetic material that exists extrachromosomally for at least part of its replication cycle, but because that description includes bacterial viruses, the notion of plasmid was refined over time to refer to genetic elements that reproduce autonomously.
Penggunaan awal istilah "plasmid" mencakup materi genetik apa pun yang ada secara ekstrakromosomal setidaknya untuk sebagian dari siklus replikasi, termasuk materi genetik virus.
The self-replicating unit, in this case, the plasmid, is called a replicon.
Unit replikasi diri, dalam hal ini plasmid, disebut replikon.
A typical bacterial replicon may consist of a number of elements, such as the gene for plasmid-specific replication initiation protein (Rep), repeating units called iterons, DnaA boxes, and an adjacent AT-rich region.
Sebuah replikon bakteri yang khas dapat terdiri dari sejumlah elemen seperti gen untuk protein inisiasi replikasi spesifik plasmid (Rep), unit-unit berulang yang disebut iteron, kotak DnaA, dan wilayah kaya AT disebelahnya.
Smaller plasmids make use of the host replicative enzymes to make copies of themselves, while larger plasmids may carry genes specific for the replication of those plasmids.
Plasmid yang lebih kecil menggunakan enzim replikasi inang untuk membuat salinannya sendiri, sedangkan plasmid yang lebih besar dapat membawa gen spesifik untuk replikasi plasmid tersebut.
A few types of plasmids can also insert into the host chromosome, and these integrative plasmids are sometimes referred to as episomes in prokaryotes.
Beberapa jenis plasmid juga dapat menyisipkan ke dalam kromosom inang, dan ini plasmid integratif ini kadang-kadang disebut sebagai episome pada prokariota.
Another major use of plasmids is to make large amounts of proteins.
Penggunaan utama plasmid lainnya adalah membuat protein dalam jumlah besar.
In this case, researchers grow bacteria containing a plasmid harboring the gene of interest.
Dalam hal ini, para peneliti menumbuhkan bakteri yang mengandung plasmid yang menyimpan gen yang diinginkan.
Just as the bacterium produces proteins to confer its antibiotic resistance, it can also be induced to produce large amounts of proteins from the inserted gene.
Sama seperti bakteri yang menghasilkan protein untuk memberikan resistensi antibiotik, bakteri juga dapat diinduksi untuk menghasilkan sejumlah besar protein dari gen yang dimasukkan.
Plasmids may also be used for gene transfer as a potential treatment in gene therapy so that it may express the protein that is lacking in the cells.
Plasmid juga dapat digunakan untuk transfer gen ke sel manusia sebagai pengobatan potensial dalam terapi gen sehingga dapat mengekspresikan protein yang diharapkan dalam sel.
Some forms of gene therapy require the insertion of therapeutic genes at pre-selected chromosomal target sites within the human genome.
Beberapa strategi terapi gen membutuhkan penyisipan gen terapeutik di lokasi target kromosom yang telah dipilih sebelumnya dalam genom manusia.
Plasmid vectors are one of many approaches that could be used for this purpose.
Vektor plasmid merupakan salah satu dari banyak pendekatan yang dapat digunakan untuk tujuan ini.
Zinc finger nucleases (ZFNs) offer a way to cause a site-specific double-strand break to the DNA genome and cause homologous recombination.
Zinc finger nucleases (ZFNs) menawarkan cara untuk menyebabkan kerusakan untai ganda spesifik lokasi pada genom DNA dan menyebabkan rekombinasi homolog.
Plasmids encoding ZFN could help deliver a therapeutic gene to a specific site so that cell damage, cancer-causing mutations, or an immune response is avoided.
Plasmid pembawa ZFN dapat membantu mengantarkan gen terapeutik ke lokasi tertentu sehingga kerusakan sel, mutasi penyebab kanker, atau respons imun dapat dihindari.
Plasmids were historically used to genetically engineer the embryonic stem cells of rats to create rat genetic disease models.
Plasmid secara historis digunakan untuk merekayasa sel induk embrionik tikus untuk menciptakan model penyakit genetik tikus.
The limited efficiency of plasmid-based techniques precluded their use in the creation of more accurate human cell models.
Efisiensi terbatas teknik berbasis plasmid menghalangi penggunaannya dalam penciptaan model sel manusia yang lebih akurat.
However, developments in adeno-associated virus recombination techniques, and zinc finger nucleases, have enabled the creation of a new generation of isogenic human disease models.
Namun, perkembangan teknik rekombinasi virus Adeno-associated, dan nukleasi Zn finger, telah memungkinkan terciptanya generasi baru model penyakit manusia isogenik.
Today, some authors use episome in the context of prokaryotes to refer to a plasmid that is capable of integrating into the chromosome.
Beberapa jenis plasmid juga dapat menyisipkan ke dalam kromosom inang, dan ini plasmid integratif ini kadang-kadang disebut sebagai episome pada prokariota.
Plasmids are often used to purify a specific sequence, since they can easily be purified away from the rest of the genome.
Plasmid sering digunakan untuk memurnikan sekuens tertentu, karena mereka dapat dengan mudah dimurnikan dari sisa genom.
For their use as vectors, and for molecular cloning, plasmids often need to be isolated.
Untuk penggunaannya sebagai vektor, dan untuk kloning molekuler, plasmid sering kali perlu diisolasi.
There are several methods to isolate plasmid DNA from bacteria, ranging from the plasmid extraction kits (miniprep to the maxiprep or bulkprep), alkaline lysis, enzymatic lysis, and mechanical lysis .
Ada beberapa metode untuk mengisolasi DNA plasmid dari bakteri, di antaranya adalah miniprep (mini preparation) dan maxiprep, bulkprep atau largeprep.
The former can be used to quickly find out whether the plasmid is correct in any of several bacterial clones.
Miniprep dapat digunakan untuk dengan cepat mengetahui apakah kebenaran plasmid di salah satu klon dari beberapa klon bakteri.
The yield is a small amount of impure plasmid DNA, which is sufficient for analysis by restriction digest and for some cloning techniques.
Hasilnya adalah sejumlah kecil DNA plasmid yang tidak murni, yang cukup untuk analisis dengan enzim restriksi dan untuk beberapa teknik kloning.
This results in relatively large amounts (several hundred micrograms) of very pure plasmid DNA.
Metode ini menghasilkan DNA plasmid yang sangat murni dalam jumlah yang sangat besar (beberapa ratus mikrogram).
Many commercial kits have been created to perform plasmid extraction at various scales, purity, and levels of automation.
Belakangan ini, banyak kit komersial telah dibuat untuk melakukan ekstraksi plasmid pada berbagai skala, kemurnian, dan tingkat otomatisasi.
The use of plasmids as a technique in molecular biology is supported by bioinformatics software.
Penggunaan plasmid sebagai teknik dalam biologi molekuler didukung oleh perangkat lunak bioinformatika.
These programs record the DNA sequence of plasmid vectors, help to predict cut sites of restriction enzymes, and to plan manipulations.
Program-program ini merekam sekuens DNA dari vektor-vektor plasmid, membantu memprediksi lokasi pemotongan enzim restriksi, dan merencanakan manipulasi.
Examples of software packages that handle plasmid maps are ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, UGENE, VectorFriends, Vector NTI, and WebDSV.
Contoh paket perangkat lunak yang menangani peta plasmid adalah ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Compiler Genome, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI, dan WebDSV.
These pieces of software help conduct entire experiments in silico before doing wet experiments.
Perangkat lunak ini membantu melakukan seluruh percobaan in silico sebelum melakukan eksperimen basah.
Many plasmids have been created over the years and researchers have given out plasmids to plasmid databases such as the non-profit organisations Addgene and BCCM/GeneCorner.
Banyak plasmid telah dibuat selama bertahun-tahun dan para peneliti telah membagikan plasmid ke basis data plasmid seperti organisasi nirlaba Addgene dan BCCM/LMBP.
One can find and request plasmids from those databases for research.
Peneliti dapat menemukan dan meminta plasmid dari basis data tersebut untuk melakukan penelitian.
Researchers also often upload plasmid sequences to the NCBI database, from which sequences of specific plasmids can be retrieved.
Peneliti juga sering mengunggah urutan (sekuens) plasmid dalam basis data NCBI.