DNA condensation refers to the process of compacting DNA molecules in vitro or in vivo.
Kondensasi DNA mengacu pada proses pemadatan molekul DNA secara in vitro atau in vivo.
Mechanistic details of DNA packing are essential for its functioning in the process of gene regulation in living systems.
Rincian mekanisme pengepakan DNA sangat penting bagi fungsinya dalam proses regulasi gen dalam sistem kehidupan.
Therefore, DNA condensation in vitro serves as a model system for many processes of physics, biochemistry and biology.
DNA terkondensasi sering kali memiliki sifat mengejutkan yang tidak dapat diprediksi sehingga kondensasi DNA in vitro berfungsi sebagai sistem model untuk banyak proses fisika, biokimia, dan biologi.
In addition, DNA condensation has many potential applications in medicine and biotechnology.
Selain itu, kondensasi DNA memiliki banyak potensi untuk diterapkan dalam kedokteran dan bioteknologi.
DNA diameter is about 2 nm, while the length of a stretched single molecule may be up to several dozens of centimetres depending on the organism.
Diameter DNA sekitar 2 nm, sedangkan panjang molekul tunggal yang diregangkan bisa mencapai beberapa lusin sentimeter tergantung pada jenis organisme.
DNA is one of the stiffest natural polymers, yet it is also one of the longest molecules.
DNA merupakan salah satu polimer alami terkuat, tetapi juga merupakan salah satu molekul terpanjang.
This means that at large distances DNA can be considered as a flexible rope, and on a short scale as a stiff rod.
Artinya, pada jarak yang jauh, DNA dapat dianggap sebagai tali yang fleksibel, dan dalam skala pendek sebagai batang yang kaku.
Like a garden hose, unpacked DNA would randomly occupy a much larger volume than when it is orderly packed.
Seperti selang taman, DNA yang dibongkar secara acak akan menempati volume yang jauh lebih besar dibandingkan saat dikemas secara teratur.
Mathematically, for a non-interacting flexible chain randomly diffusing in 3D, the end-to-end distance would scale as a square root of the polymer length.
Secara matematis, bagi rantai fleksibel yang tidak berinteraksi yang menyebar secara acak dalam tiga dimensi, jarak ujung ke ujung akan diskalakan sebagai akar kuadrat dari panjang polimer.
For real polymers such as DNA, this gives only a very rough estimate; what is important, is that the space available for the DNA in vivo is much smaller than the space that it would occupy in the case of a free diffusion in the solution.
Untuk polimer nyata seperti DNA, hal ini hanya memberikan perkiraan yang sangat kasar; hal yang penting adalah bahwa ruang yang tersedia untuk DNA in vivo jauh lebih kecil daripada ruang yang akan ditempati dalam kasus difusi bebas dalam larutan.
To cope with volume constraints, DNA can pack itself in the appropriate solution conditions with the help of ions and other molecules.
Untuk mengatasi kendala volume, DNA dapat mengemas dirinya sendiri dalam kondisi larutan yang sesuai dengan bantuan ion dan molekul lain.
Usually, DNA condensation is defined as "the collapse of extended DNA chains into compact, orderly particles containing only one or a few molecules".
Biasanya, kondensasi DNA didefinisikan sebagai "runtuhnya rantai DNA yang diperpanjang menjadi partikel yang padat dan teratur yang hanya mengandung satu atau beberapa molekul".
This definition applies to many situations in vitro and is also close to the definition of DNA condensation in bacteria as "adoption of relatively concentrated, compact state occupying a fraction of the volume available".
Definisi ini berlaku untuk banyak situasi in vitro dan juga dekat dengan definisi kondensasi DNA pada bakteri sebagai "adopsi dari keadaan yang relatif terkonsentrasi dan padat, yang menempati sebagian kecil dari volume yang tersedia".
In eukaryotes, the DNA size and the number of other participating players are much larger, and a DNA molecule forms millions of ordered nucleoprotein particles, the nucleosomes, which is just the first of many levels of DNA packing.
Pada eukariota, ukuran DNA dan jumlah molekul lain yang berpartisipasi jauh lebih besar, dan molekul DNA membentuk jutaan partikel nukleoprotein yang tersusun, yaitu nukleosom, yang merupakan tingkatan pertama dari banyak tingkat pengepakan DNA.