Archaea were initially classified as bacteria, receiving the name archaebacteria (, in the Archaebacteria kingdom), but this term has fallen out of use.
Awalnya, arkea diklasifikasikan sebagai bakteri dan diberi nama archaebacteria (di kerajaan Archaebacteria), tetapi klasifikasi ini tak lagi digunakan.
Archaea are often similar to bacteria in size and shape, although a few have very different shapes, such as the flat, square cells of Haloquadratum walsbyi.
Arkea dan bakteri umumnya memiliki ukuran dan bentuk yang serupa, meskipun beberapa arkea memiliki bentuk yang sangat aneh, misalnya sel-sel datar dan berbentuk persegi seperti Haloquadratum walsbyi.
Despite this, archaea possess genes and several metabolic pathways that are more closely related to those of eukaryotes, notably for the enzymes involved in transcription and translation.
Sebagian besar lintasan metabolisme (yang merupakan objek dari sebagian besar gen suatu organisme) sama-sama dimiliki Archaea dan Bacteria, sementara sebagian besar gen yang terlibat dalam ekspresi genom sama-sama dimiliki Archaea dan Eukarya.
Other aspects of archaeal biochemistry are unique, such as their reliance on ether lipids in their cell membranes, including archaeols.
Salah satu aspek biokimia arkea yang unik adalah ketergantungan arkea pada lipid eter di membran sel mereka.
Archaea use more diverse energy sources than eukaryotes, ranging from organic compounds such as sugars, to ammonia, metal ions or even hydrogen gas.
Arkea menggunakan lebih banyak sumber energi dibandingkan eukariota, yang berkisar dari senyawa organik seperti gula, amonia, ion logam, atau bahkan gas hidrogen.
The first observed archaea were extremophiles, living in extreme environments such as hot springs and salt lakes with no other organisms.
Arkea pertama yang diamati merupakan ekstremofil yang hidup di lingkungan ekstrem, seperti mata air panas dan danau garam tanpa organisme lain.
Archaea are particularly numerous in the oceans, and the archaea in plankton may be one of the most abundant groups of organisms on the planet.
Jumlah mereka sangat banyak di lautan, dan arkea dalam bentuk plankton mungkin merupakan salah satu kelompok organisme yang paling melimpah di planet ini.
They are part of the microbiota of all organisms.
Mereka merupakan bagian dari mikrobiota bagi semua organisme.
Their morphological, metabolic, and geographical diversity permits them to play multiple ecological roles: carbon fixation; nitrogen cycling; organic compound turnover; and maintaining microbial symbiotic and syntrophic communities, for example.
Keragaman morfologis, metabolik, dan geografis memungkinkan mereka memiliki peran ekologis yang luas, misalnya pada fiksasi karbon dalam siklus karbon, peran dalam siklus nitrogen, perputaran senyawa organik, dan memelihara komunitas simbiosis dan sintrofi mikrob.
For much of the 20th century, prokaryotes were regarded as a single group of organisms and classified based on their biochemistry, morphology and metabolism.
Pada hampir sepanjang abad ke-20, prokariota dianggap sebagai satu kelompok organisme dan diklasifikasikan berdasarkan sifat biokimia, morfologi, dan metabolisme mereka.
Microbiologists tried to classify microorganisms based on the structures of their cell walls, their shapes, and the substances they consume.
Para ahli mikrobiologi mencoba mengklasifikasikan mikroorganisme berdasarkan struktur dinding sel, bentuk, dan zat-zat yang mereka konsumsi.
In 1965, Emile Zuckerkandl and Linus Pauling instead proposed using the sequences of the genes in different prokaryotes to work out how they are related to each other.
Pada tahun 1965, Linus Pauling dan Emile Zuckerkandl mengusulkan untuk menggunakan urutan gen dalam berbagai prokariota untuk mengetahui hubungan mereka satu sama lain.
This phylogenetic approach is the main method used today.
Pendekatan ini, yang dikenal sebagai filogenetik, adalah metode utama yang digunakan saat ini.
Archaea were first classified separately from bacteria in 1977 by Carl Woese and George E. Fox, based on their ribosomal RNA (rRNA) genes.
Arkea (saat itu hanya metanogen yang diketahui) pertama kali diklasifikasikan sebagai kelompok yang terpisah dari bakteri pada pohon filogenetik berdasarkan urutan gen RNA ribosomal (rRNA) mereka oleh Carl Woese dan George E. Fox pada tahun 1977.
Extreme halophilic and hyperthermophilic microbes were also included in Archaea.
Mikrob-mikrob halofilik ekstrem dan hipertermofilik juga termasuk dalam Archaea.
For a long time, archaea were seen as extremophiles that exist only in extreme habitats such as hot springs and salt lakes, but by the end of the 20th century, archaea had been identified in non-extreme environments as well.
Untuk waktu yang lama, arkea terlihat sebagai ekstremofil yang hanya ada di habitat ekstrem seperti mata air panas dan danau garam.
Today, they are known to be a large and diverse group of organisms abundantly distributed throughout nature.
Saat ini, mereka dikenal sebagai kelompok organisme yang besar dan beragam yang tersebar luas di alam.
This new appreciation of the importance and ubiquity of archaea came from using polymerase chain reaction (PCR) to detect prokaryotes from environmental samples (such as water or soil) by multiplying their ribosomal genes.
Arkea mendapatkan apresiasi baru mengenai peranan dan keberadaan mereka sejak reaksi berantai polimerase (PCR) digunakan untuk mendeteksi prokariota dari sampel lingkungan (seperti air atau tanah) dengan melipatgandakan gen ribosom mereka.
This allows the detection and identification of organisms that have not been cultured in the laboratory.
Hal ini memungkinkan deteksi dan identifikasi organisme yang belum dibudidayakan di laboratorium.
Current classification systems aim to organize archaea into groups of organisms that share structural features and common ancestors.
Sistem klasifikasi saat ini bertujuan untuk mengatur arkea ke dalam kelompok organisme yang memiliki karakteristik struktural dan nenek moyang yang sama.
These classifications rely heavily on the use of the sequence of ribosomal RNA genes to reveal relationships among organisms (molecular phylogenetics).
Klasifikasi ini sangat bergantung pada pengurutan gen RNA ribosomal untuk mengungkapkan hubungan di antara berbagai organisme, yang dikenal sebagai filogenetik molekuler.
Other groups have been tentatively created, such as the peculiar species Nanoarchaeum equitans — discovered in 2003 and assigned its own phylum, the Nanoarchaeota (reassigned to Nanobdellota in 2023).
Misalnya, spesies aneh Nanoarchaeum equitans, yang ditemukan pada tahun 2003 dan telah diberikan filum sendiri, Nanoarchaeota.
Other detected species of archaea are only distantly related to any of these groups, such as the Archaeal Richmond Mine acidophilic nanoorganisms (ARMAN, comprising Micrarchaeota and Parvarchaeota), which were discovered in 2006 and are some of the smallest organisms known.
Spesies arkea lain ternyata berkerabat jauh dengan salah satu dari kelompok ini, seperti Archaeal Richmond Mine acidophilic nanoorganisms (ARMAN) yang ditemukan pada tahun 2006 dan merupakan salah satu organisme terkecil yang diketahui.
The classification of archaea into species is also controversial.
Klasifikasi spesies-spesies arkea juga kontroversial.
Archaea show high levels of horizontal gene transfer between lineages.
Arkea menunjukkan tingkat transfer gen horizontal yang tinggi di antara garis keturunan mereka.
Some researchers suggest that individuals can be grouped into species-like populations given highly similar genomes and infrequent gene transfer to/from cells with less-related genomes, as in the genus Ferroplasma.
Beberapa peneliti menyarankan agar sejumlah individu dikelompokkan ke dalam populasi-populasi yang menyerupai spesies, yang genom-genomnya sangat mirip dan jarang mentransfer gen atau menerima transfer gen dari sel lain yang genomnya kurang terkait, seperti dalam genus Ferroplasma.
On the other hand, studies in Halorubrum found significant genetic transfer to/from less-related populations, limiting the criterion's applicability.
Di sisi lain, studi terhadap Halorubrum menemukan adanya transfer genetik yang signifikan ke/dari populasi yang kurang terkait, sehingga penerapan kriteria ini terbatas.
Scientific evidence suggests that life began on Earth at least 3.5 billion years ago.
Bukti ilmiah menunjukkan bahwa kehidupan di Bumi dimulai setidaknya 3,5 miliar tahun yang lalu.
The earliest evidence for life on Earth is graphite found to be biogenic in 3.7-billion-year-old metasedimentary rocks discovered in Western Greenland and microbial mat fossils found in 3.48-billion-year-old sandstone discovered in Western Australia.
Bukti-bukti awal kehidupan di Bumi adalah grafit yang bersifat biogenik pada batuan metasedimentari berumur 3,7 miliar tahun yang ditemukan di Greenland Barat dan fosil tikar mikrob yang ditemukan di batu pasir setua
In 2015, possible remains of biotic matter were found in 4.1-billion-year-old rocks in Western Australia.
Pada tahun 2015, kemungkinan "sisa-sisa kehidupan biotik" ditemukan di batuan berumur 4,1 miliar tahun di Australia Barat.
Although probable prokaryotic cell fossils date to almost 3.5 billion years ago, most prokaryotes do not have distinctive morphologies, and fossil shapes cannot be used to identify them as archaea.
Meskipun fosil sel prokariota kemungkinan berasal dari hampir 3,5 miliar tahun yang lalu, sebagian besar prokariota tidak memiliki morfologi yang dapat dibedakan, dan bentuk fosil tidak dapat digunakan untuk mengidentifikasi mereka sebagai arkea.
Instead, chemical fossils of unique lipids are more informative because such compounds do not occur in other organisms.
Sebaliknya, fosil kimia lipid yang unik menjadi lebih informatif karena senyawa tersebut tidak ada pada organisme lain.
Some publications suggest that archaeal or eukaryotic lipid remains are present in shales dating from 2.7 billion years ago, though such data have since been questioned.
Beberapa publikasi menyatakan bahwa sisa-sisa lipid arkea atau eukariota yang hadir dalam batu serpih berasal dari 2,7 miliar tahun yang lalu; meskipun data tersebut dipertanyakan.
These lipids have also been detected in even older rocks from west Greenland.
Lipid tersebut juga terdeteksi di batuan yang bahkan lebih tua dari batuan di Greenland Barat.
The archaeal lineage may be the most ancient that exists on Earth.
Silsilah arkea mungkin menjadi garis keturunan yang paling kuno yang ada di Bumi.
Woese argued that the bacteria, archaea, and eukaryotes represent separate lines of descent that diverged early on from an ancestral colony of organisms.
Woese berpendapat bahwa bakteri, arkea, dan eukariota mewakili garis keturunan yang terpisah yang bercabang sejak awal dari koloni leluhur semua organisme.
One possibility is that this occurred before the evolution of cells, when the lack of a typical cell membrane allowed unrestricted lateral gene transfer, and that the common ancestors of the three domains arose by fixation of specific subsets of genes.
Salah satu kemungkinannya adalah bahwa percabangan ini terjadi sebelum evolusi sel, saat tidak adanya membran sel memungkinkan transfer gen lateral yang tak terbatas, dan bahwa nenek moyang dari tiga domain tersebut muncul dari fiksasi subset-subset gen yang spesifik.
It is possible that the last common ancestor of bacteria and archaea was a thermophile, which raises the possibility that lower temperatures are "extreme environments" for archaea, and organisms that live in cooler environments appeared only later.
Ada kemungkinan bahwa nenek moyang terakhir dari bakteri dan arkea adalah termofil, sehingga suhu yang lebih rendah mungkin saja merupakan "lingkungan yang ekstrem" bagi arkea, dan organisme-organisme yang hidup di lingkungan dingin baru muncul belakangan.
Since archaea and bacteria are no more related to each other than they are to eukaryotes, the term prokaryote may suggest a false similarity between them.
Karena kekerabatan Archaea dan Bacteria lebih berjauhan satu sama lain dibandingkan antara mereka dengan eukariota, istilah prokariota mungkin menunjukkan kesamaan yang salah antara arkea dan bakteri.
The following table compares some major characteristics of the three domains, to illustrate their similarities and differences.
Tabel berikut membandingkan beberapa karakteristik utama dari tiga domain, untuk menggambarkan persamaan dan perbedaan mereka.
Archaea were split off as a third domain because of the large differences in their ribosomal RNA structure.
Archaea dipisahkan sebagai domain ketiga karena memiliki perbedaan besar dalam struktur RNA ribosomal mereka.
Because this function is so central to life, organisms with mutations in their 16S rRNA are unlikely to survive, leading to great (but not absolute) stability in the structure of this polynucleotide over generations.
Karena fungsi ini sangat penting dalam kehidupan, organisme yang mengalami mutasi 16s rRNA tidak mungkin bertahan hidup sehingga struktur nukleotida ini menjadi sangat stabil (tetapi tidak absolut) selama beberapa generasi.
In 1977, Carl Woese, a microbiologist studying the genetic sequences of organisms, developed a new comparison method that involved splitting the RNA into fragments that could be sorted and compared with other fragments from other organisms.
Pada tahun 1977, Carl Woese, seorang ahli mikrobiologi yang mempelajari urutan genetik organisme, mengembangkan metode perbandingan baru yang melibatkan pemecahan RNA menjadi fragmen-fragmen yang bisa diurutkan dan dibandingkan dengan fragmen lain dari organisme lain.
The more similar the patterns between species, the more closely they are related.
Semakin mirip pola fragmen tersebut di antara spesies-spesies, hubungan kekerabatannya menjadi lebih dekat.
These methanogens were much more similar to each other than to other organisms, leading Woese to propose the new domain of Archaea.
Metanogen ini jauh lebih mirip satu sama lain dibandingkan dengan organisme lain yang pernah diurutkan, sehingga Woese mengusulkan domain baru, yaitu Archaea.
This led to the conclusion that Archaea and Eukarya shared a common ancestor more recent than Eukarya and Bacteria.
Hal ini menyimpulkan bahwa Archaea dan Eukarya memiliki nenek moyang bersama yang lebih baru dibandingkan dengan Eukarya dan Bacteria.
One property unique to archaea is the abundant use of ether-linked lipids in their cell membranes.
Salah satu sifat arkea yang unik adalah penggunaan lipid dengan ikatan eter secara berlimpah di membran sel mereka.
Ether linkages are more chemically stable than the ester linkages found in bacteria and eukarya, which may be a contributing factor to the ability of many archaea to survive in extreme environments that place heavy stress on cell membranes, such as extreme heat and salinity.
Secara kimiawi, ikatan eter lebih stabil dari ikatan ester yang ditemukan dalam Bacteria dan Eukarya, yang mungkin menjadi faktor yang berkontribusi terhadap kemampuan banyak arkea untuk bertahan di lingkungan ekstrem, yang memberikan stres berat pada membran sel, seperti panas ekstrem dan salinitas.
Another unique feature of archaea, found in no other organisms, is methanogenesis (the metabolic production of methane).
Sifat lain yang unik dari arkea adalah bahwa tidak ada organisme lain yang dikenal mampu melakukan metanogenesis (produksi metana melalui metabolisme).
Methanogenic archaea play a pivotal role in ecosystems with organisms that derive energy from oxidation of methane, many of which are bacteria, as they are often a major source of methane in such environments and can play a role as primary producers.
Arkea metanogen memainkan peran penting dalam ekosistem bersama dengan organisme yang memperoleh energi dari oksidasi metana (kebanyakan dari mereka adalah bakteri) karena mereka sering menjadi sumber utama metana di lingkungan tersebut dan dapat berperan sebagai
Methanogens also play a critical role in the carbon cycle, breaking down organic carbon into methane, which is also a major greenhouse gas.
Metanogen juga memainkan peran penting dalam siklus karbon, memecah karbon organik menjadi metana, yang juga merupakan gas rumah kaca utama.
The relationships among the three domains are of central importance for understanding the origin of life.
Hubungan di antara tiga domain sangat penting untuk memahami asal-usul kehidupan.
Most of the metabolic pathways, which are the object of the majority of an organism's genes, are common between Archaea and Bacteria, while most genes involved in gene expression are common between Archaea and Eukarya.
Sebagian besar lintasan metabolisme (yang merupakan objek dari sebagian besar gen suatu organisme) sama-sama dimiliki Archaea dan Bacteria, sementara sebagian besar gen yang terlibat dalam ekspresi genom sama-sama dimiliki Archaea dan Eukarya.
Within prokaryotes, archaeal cell structure is most similar to that of Gram-positive bacteria, largely because both have a single lipid bilayer and usually contain a thick sacculus (exoskeleton) of varying chemical composition.
Di antara prokariota, struktur sel arkea paling mirip dengan bakteri Gram-positif, terutama karena keduanya memiliki lipida dwilapis tunggal dan biasanya mengandung sakulus tebal (eksoskeleton) dari berbagai komposisi kimia.
In some phylogenetic trees based upon different gene / protein sequences of prokaryotic homologs, the archaeal homologs are more closely related to those of gram-positive bacteria.
Pada beberapa pohon filogenetik yang didasarkan pada urutan gen-gen (protein-protein) dari homolog prokariota, homolog arkea lebih berhubungan dekat dengan homolog bakteri Gram-positif.
Archaea and gram-positive bacteria also share conserved indels in a number of important proteins, such as Hsp70 and glutamine synthetase I; but the phylogeny of these genes was interpreted to reveal inter-domain gene transfer, and might not reflect the organismal relationship(s).
Arkea dan bakteri Gram-positif juga berbagi indel yang dilestarikan dalam sejumlah protein penting, seperti Hsp70 dan glutamin sintetase I; tetapi, ilmuwan menafsirkan filogeni dari gen-gen ini sebagai sarana untuk mentransfer gen interdomain, dan mungkin tidak mencerminkan hubungan kekerabatan organisme.
It has been proposed that the archaea evolved from Gram-positive bacteria in response to antibiotic selection pressure.
Ada pendapat bahwa arkea berevolusi dari bakteri Gram-positif sebagai respons terhadap tekanan seleksi antibiotik.
This is suggested by the observation that archaea are resistant to a wide variety of antibiotics that are produced primarily by Gram-positive bacteria, and that these antibiotics act primarily on the genes that distinguish archaea from bacteria.
Pandangan ini diajukan berdasarkan pengamatan bahwa arkea tahan terhadap berbagai antibiotik yang terutama dibuat untuk bakteri Gram-positif, dan bahwa antibiotik-antibiotik ini terutama bekerja pada gen yang membedakan arkea dari bakteri.
The proposal is that the selective pressure towards resistance generated by the gram-positive antibiotics was eventually sufficient to cause extensive changes in many of the antibiotics' target genes, and that these strains represented the common ancestors of present-day Archaea.
Pendapat ini menyatakan bahwa tekanan selektif terhadap resistansi yang dihasilkan oleh antibiotik Gram-positif akhirnya cukup untuk menyebabkan perubahan yang luas pada banyak gen target antibiotik, dan bahwa galur ini mewakili nenek moyang arkea masa kini.
The evolution of Archaea in response to antibiotic selection, or any other competitive selective pressure, could also explain their adaptation to extreme environments (such as high temperature or acidity) as the result of a search for unoccupied niches to escape from antibiotic-producing organisms; Cavalier-Smith has made a similar suggestion, the Neomura hypothesis.
Evolusi arkea dalam menanggapi pemilihan antibiotik, atau tekanan selektif kompetitif lain, juga bisa menjelaskan adaptasi mereka terhadap lingkungan yang ekstrem (seperti suhu tinggi atau keasaman) sebagai hasil dari pencarian relung kosong untuk melarikan diri dari organisme yang memproduksi antibiotik; Cavalier-Smith juga membuat usulan yang sama.
This proposal is also supported by other work investigating protein structural relationships and studies that suggest that gram-positive bacteria may constitute the earliest branching lineages within the prokaryotes.
Pendapat ini juga didukung oleh studi lainnya yang menyelidiki hubungan protein struktural dan studi yang menunjukkan bahwa bakteri Gram-positif mungkin merupakan awal garis keturunan yang bercabang paling awal dalam prokariota.
The evolutionary relationship between archaea and eukaryotes remains unclear.
Hubungan evolusi antara arkea dan eukariota masih belum jelas.
Aside from the similarities in cell structure and function that are discussed below, many genetic trees group the two.
Selain dari kesamaan dalam struktur dan fungsi sel yang dibahas di bawah, banyak pohon genetik menyatukan keduanya dalam satu kelompok.
The standard hypothesis states that the ancestor of the eukaryotes diverged early from the Archaea, and that eukaryotes arose through symbiogenesis, the fusion of an archaean and a eubacterium, which formed the mitochondria; this hypothesis explains the genetic similarities between the groups.
Hipotesis standar menyatakan bahwa nenek moyang eukariota berpisah dari Archaea sejak awal, dan bahwa eukariota muncul melalui fusi antara arkea dan bakteri, yang menjadi inti sel dan sitoplasma; hal ini menjelaskan berbagai kesamaan genetik tetapi kesulitan dalam menjelaskan struktur sel.
The eocyte hypothesis instead posits that Eukaryota emerged relatively late from the Archaea.
Sebuah hipotesis alternatif, hipotesis eosit, berpendapat bahwa Eukaryota muncul relatif terlambat dari Archaea.
A lineage of archaea discovered in 2015, Lokiarchaeum (of the proposed new phylum "Lokiarchaeota"), named for a hydrothermal vent called Loki's Castle in the Arctic Ocean, was found to be the most closely related to eukaryotes known at that time.
Sebuah garis keturunan arkea yang ditemukan pada 2015, Lokiarchaeum (dari filum baru Lokiarchaeota), yang dinamai berdasarkan sebuah ventilasi hidrotermal yang disebut Kastel Loki di Samudra Arktik, ternyata merupakan kelompok yang paling berkerabat dekat dengan eukariota.
It has been called a transitional organism between prokaryotes and eukaryotes.
Organisme ini disebut sebagai organisme peralihan antara prokariota dan eukariota.
Several sister phyla of "Lokiarchaeota" have since been found ("Thorarchaeota", "Odinarchaeota", "Heimdallarchaeota"), all together comprising a newly proposed supergroup "Asgard".
Beberapa filum saudara dari "Lokiarchaeota" telah ditemukan ("Thorarchaeota", "Odinarchaeota", "Heimdallarchaeota"), yang semuanya membentuk sebuah supergrup Asgard yang baru diajukan, yang mungkin merupakan takson saudara dari Proteoarchaeota.
Details of the relation of Promethearchaeati / "Asgard" members and eukaryotes are still under consideration, although, in January 2020, scientists reported that Promethearchaeum syntrophicum, a type of Promethearchaeati / "Asgard" archaea, may be a possible link between simple prokaryotic and complex eukaryotic microorganisms about two billion years ago.
Rincian dari hubungan anggota Asgard dan eukariota masih dalam pertimbangan, meskipun, pada Januari 2020, para ilmuwan melaporkan bahwa Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum, sejenis arkea Asgard, mungkin merupakan penghubung antara mikroorganisme prokariota yang sederhana dan mikroorganisme eukariota yang kompleks sekitar dua miliar tahun yang lalu.
Individual archaea range from 0.1 micrometers (μm) to over 15 μm in diameter, and occur in various shapes, commonly as spheres, rods, spirals or plates.
Satu individu arkea memiliki diameter yang berkisar dari 0,1 mikrometer (μm) sampai lebih dari 15 μm, yang hadir dalam berbagai bentuk, umumnya sebagai bola, batang, spiral, atau piring.
Other morphologies in the Thermoproteota include irregularly shaped lobed cells in Sulfolobus, needle-like filaments that are less than half a micrometer in diameter in Thermofilum, and almost perfectly rectangular rods in Thermoproteus and Pyrobaculum.
Morfologi lain ditemukan pada filum Crenarchaeota, termasuk sel berlobus yang bentuknya tidak teratur pada genus Sulfolobus, filamen seperti-jarum yang diameternya kurang dari setengah mikrometer pada genus Thermofilum, serta batang yang bentuknya hampir persegi panjang sempurna pada Thermoproteus dan Pyrobaculum.
These unusual shapes are probably maintained by both their cell walls and a prokaryotic cytoskeleton.
Bentuk yang tidak biasa ini mungkin dipertahankan dengan baik oleh dinding sel dan sitoskeleton prokariotik mereka.
Proteins related to the cytoskeleton components of other organisms exist in archaea, and filaments form within their cells, but in contrast with other organisms, these cellular structures are poorly understood.
Protein yang terkait dengan komponen sitoskeleton organisme lain ditemukan di arkea, dan filamen-filamen terbentuk dalam sel mereka, tetapi berbeda dengan organisme lain, struktur seluler ini kurang dipahami.
In Thermoplasma and Ferroplasma the lack of a cell wall means that the cells have irregular shapes, and can resemble amoebae.
Dalam Thermoplasma dan Ferroplasma, ketiadaan dinding sel berarti bahwa sel memiliki bentuk yang tidak teratur, dan dapat menyerupai ameba.
Some species form aggregates or filaments of cells up to 200 μm long.
Beberapa spesies arkea membentuk agregat atau filamen sel yang panjangnya hingga 200 μm.
These organisms can be prominent in biofilms.
Organisme-organisme ini bisa membentuk tonjolan dalam biofilm.
Notably, aggregates of Thermococcus coalescens cells fuse together in culture, forming single giant cells.
Khususnya, agregat sel-sel Thermococcus coalescens menyatu bersama dalam kultur sehingga membentuk sel-sel raksasa tunggal.
Archaea and bacteria have generally similar cell structure, but cell composition and organization set the archaea apart.
Arkea dan bakteri memiliki struktur sel yang umumnya sama, tetapi komposisi dan organisasi sel membedakan arkea dengan bakteri.
Like bacteria, archaea lack interior membranes and organelles.
Seperti bakteri, arkea tidak memiliki membran interior dan organel.
Like bacteria, the cell membranes of archaea are usually bounded by a cell wall and they swim using one or more flagella.
Membran sel arkea, juga seperti bakteri, biasanya dibatasi oleh dinding sel dan mereka "berenang" menggunakan satu flagela atau lebih.
Structurally, archaea are most similar to gram-positive bacteria.
Secara struktural, arkea paling mirip dengan bakteri Gram-positif.
Most have a single plasma membrane and cell wall, and lack a periplasmic space; the exception to this general rule is Ignicoccus, which possess a particularly large periplasm that contains membrane-bound vesicles and is enclosed by an outer membrane.
Kebanyakan arkea memiliki membran plasma dan dinding sel tunggal, tanpa ruang periplasmik; pengecualian untuk aturan umum ini adalah Ignicoccus, yang memiliki sebuah periplasma sangat besar yang berisi vesikel bermembran dan tertutup oleh membran luar.
Most archaea (but not Thermoplasma and Ferroplasma) possess a cell wall.
Kebanyakan arkea (kecuali Thermoplasma dan Ferroplasma) memiliki dinding sel.
This layer provides both chemical and physical protection, and can prevent macromolecules from contacting the cell membrane.
Lapisan ini memberi perlindungan kimia dan fisik, serta dapat mencegah makromolekul mengalami kontak dengan membran sel.
Methanobacteriales do have cell walls containing pseudopeptidoglycan, which resembles eubacterial peptidoglycan in morphology, function, and physical structure, but pseudopeptidoglycan is distinct in chemical structure; it lacks D-amino acids and N-acetylmuramic acid, substituting the latter with N-Acetyltalosaminuronic acid.
Methanobacteriales memiliki dinding sel yang mengandung pseudopeptidoglikan, yang menyerupai peptidoglikan eubacteria dalam morfologi, fungsi, dan struktur fisik, tetapi pseudopeptidoglikan berbeda dalam struktur kimia; tidak memiliki asam amino-D dan asam N-asetilmuramat.
The two types of flagella evolved from different ancestors.
Kedua jenis flagela (milik bakteri dan arkea) berevolusi dari nenek moyang yang berbeda.
The bacterial flagellum shares a common ancestor with the type III secretion system, while archaeal flagella appear to have evolved from bacterial type IV pili.
Flagela bakteri memiliki satu nenek moyang dengan sistem sekresi tipe III, sementara flagela arkea tampaknya berevolusi dari pili bakteri tipe IV.
In contrast with the bacterial flagellum, which is hollow and assembled by subunits moving up the central pore to the tip of the flagella, archaeal flagella are synthesized by adding subunits at the base.
Berbeda dengan flagela bakteri yang berongga dan dirakit oleh subunit yang bergerak naik dari pori tengah ke ujung flagela, flagela arkea disintesis dengan menambahkan subunit di pangkalnya.
In all organisms, cell membranes are made of molecules known as phospholipids.
Pada semua organisme, membran sel terbuat dari molekul yang dikenal sebagai fosfolipid.
These molecules possess both a polar part that dissolves in water (the phosphate "head"), and a "greasy" non-polar part that does not (the lipid tail).
Molekul-molekul ini memiliki bagian kutub yang larut dalam air ("kepala" fosfat) dan bagian nonpolar "berminyak" yang tidak larut dalam air (ekor lipid).
The major structure in cell membranes is a double layer of these phospholipids, which is called a lipid bilayer.
Struktur utama dalam membran sel adalah lapisan ganda fosfolipid ini, yang disebut lipida dwilapis.
The difference is the type of bond that joins the lipids to the glycerol moiety; the two types are shown in yellow in the figure at the right.
Perbedaannya adalah jenis ikatan yang menggabungkan lipid ke bagian gliserol; dua jenis ikatan ditunjukkan dengan warna kuning pada gambar di sebelah kanan.
In ester lipids, this is an ester bond, whereas in ether lipids this is an ether bond.
Pada lipid ester, ikatan ini merupakan ikatan ester, sedangkan pada lipid eter ikatan ini merupakan ikatan eter.
This suggests that archaea use entirely different enzymes for synthesizing phospholipids as compared to bacteria and eukaryotes.
Hal ini menunjukkan bahwa arkea menggunakan enzim yang sama sekali berbeda untuk sintesis fosfolipid dibandingkan bakteri dan eukariota.
By contrast, the fatty acids in the membranes of other organisms have straight chains without side branches or rings.
Hal ini kontras dengan asam lemak yang ditemukan dalam membran organisme lain, yang memiliki rantai lurus tanpa cabang atau cincin.
Although isoprenoids play an important role in the biochemistry of many organisms, only the archaea use them to make phospholipids.
Meskipun isoprenoid memainkan peran penting dalam biokimia banyak organisme, hanya arkea yang menggunakannya untuk membuat fosfolipid.
These branched chains may help prevent archaeal membranes from leaking at high temperatures.
Rantai ini bercabang dapat membantu mencegah kebocoran membran arkea pada suhu tinggi.
In effect, the archaea fuse the tails of two phospholipid molecules into a single molecule with two polar heads (a bolaamphiphile); this fusion may make their membranes more rigid and better able to resist harsh environments.
Akibatnya, arkea menyatukan dua ekor molekul fosfolipid independen menjadi molekul tunggal dengan dua kepala polar (bolaampifil); fusi ini dapat membuat membran mereka lebih kaku dan lebih mampu menahan lingkungan yang keras.
For example, the lipids in Ferroplasma are of this type, which is thought to aid this organism's survival in its highly acidic habitat.
Sebagai contoh, lipid dalam Ferroplasma memiliki jenis lapisan ini, yang diduga untuk membantu kelangsungan hidup organisme ini di habitatnya yang sangat asam.
Archaea exhibit a great variety of chemical reactions in their metabolism and use many sources of energy.
Arkea menunjukkan berbagai macam reaksi kimia dalam metabolisme mereka dan menggunakan banyak sumber energi.
These reactions are classified into nutritional groups, depending on energy and carbon sources.
Reaksi-reaksi ini diklasifikasikan ke dalam kelompok nutrisional, tergantung pada sumber-sumber energi dan karbon.
In these reactions, one compound passes electrons to another (in a redox reaction), releasing energy to fuel the cell's activities.
Dalam reaksi ini, satu senyawa memberikan elektron kepada senyawa yang lain (dalam reaksi redoks), melepaskan energi untuk bahan bakar aktivitas sel.
One compound acts as an electron donor and one as an electron acceptor.
Satu senyawa bertindak sebagai donor elektron dan satu sebagai akseptor elektron.
The energy released is used to generate adenosine triphosphate (ATP) through chemiosmosis, the same basic process that happens in the mitochondrion of eukaryotic cells.
Energi yang dilepaskan menghasilkan adenosina trifosfat (ATP) melalui kemiosmosis, dalam proses dasar yang sama yang terjadi di mitokondria sel eukariotik.
Many basic metabolic pathways are shared among all forms of life; for example, archaea use a modified form of glycolysis (the Entner–Doudoroff pathway) and either a complete or partial citric acid cycle.
Banyak jalur metabolik dasar dimiliki bersama oleh semua bentuk kehidupan; misalnya, arkea menggunakan bentuk modifikasi dari glikolisis (jalur Entner–Doudoroff) serta salah satu dari siklus asam sitrat lengkap atau parsial.
This form of metabolism evolved early, and it is even possible that the first free-living organism was a methanogen.
Bentuk metabolisme ini berevolusi sejak awal, dan bahkan mungkin saja organisme yang pertama hidup bebas adalah metanogen.
A common reaction involves the use of carbon dioxide as an electron acceptor to oxidize hydrogen.
Umumnya, reaksi melibatkan penggunaan karbon dioksida sebagai akseptor elektron untuk mengoksidasi hidrogen.
Other organic compounds such as alcohols, acetic acid or formic acid are used as alternative electron acceptors by methanogens.
Senyawa-senyawa organik lain seperti alkohol, asam asetat, atau asam format digunakan sebagai alternatif akseptor elektron oleh metanogen.
These reactions are common in gut-dwelling archaea.
Reaksi-reaksi ini sering terjadi pada arkea yang tinggal di usus.
Acetic acid is also broken down into methane and carbon dioxide directly, by acetotrophic archaea.
Asam asetat juga dipecah menjadi metana dan karbon dioksida secara langsung oleh arkea asetotrofik.
Other archaea use CO2 in the atmosphere as a source of carbon, in a process called carbon fixation (they are autotrophs).
Arkea lainnya menggunakan CO2 di atmosfer sebagai sumber karbon dalam proses yang disebut fiksasi karbon (mereka disebut autotrof).
This process involves either a highly modified form of the Calvin cycle or another metabolic pathway called the 3-hydroxypropionate / 4-hydroxybutyrate cycle.
Proses ini melibatkan bentuk yang sangat termodifikasi dari siklus Calvin atau jalur metabolik yang baru ditemukan disebut siklus 3-hidroksipropionat/4-hidroksibutirat.
No known archaea carry out photosynthesis.
Tidak ada arkea yang diketahui melakukan fotosintesis.
Archaeal energy sources are extremely diverse, and range from the oxidation of ammonia by the Nitrosopumilales to the oxidation of hydrogen sulfide or elemental sulfur by species of Sulfolobus, using either oxygen or metal ions as electron acceptors.
Sumber energi arkea sangat beragam dan berkisar dari oksidasi amonia oleh Nitrosopumilales sampai oksidasi hidrogen sulfida atau unsur belerang oleh spesies Sulfolobus, yang menggunakan oksigen atau ion logam sebagai akseptor elektron.
Phototrophic archaea use light to produce chemical energy in the form of ATP.
Arkea fototrofik menggunakan cahaya untuk menghasilkan energi kimia dalam bentuk ATP.
In the Halobacteria, light-activated ion pumps like bacteriorhodopsin and halorhodopsin generate ion gradients by pumping ions out of and into the cell across the plasma membrane.
Pada Halobacteria, pompa ion yang diaktifkan oleh cahaya, seperti bakteriorodopsin dan halorodopsin, menghasilkan gradien ion dengan cara memompa ion keluar dari sel melintasi membran plasma.
The energy stored in these electrochemical gradients is then converted into ATP by ATP synthase.
Energi yang tersimpan dalam gradien elektrokimia kemudian diubah menjadi ATP oleh ATP sintase.
This process is a form of photophosphorylation.
Proses ini merupakan bentuk fotofosforilasi.
The ability of these light-driven pumps to move ions across membranes depends on light-driven changes in the structure of a retinol cofactor buried in the center of the protein.
Kemampuan pompa untuk menggerakkan ion melintasi membran bergantung pada perubahan yang diberdayai cahaya dalam struktur kofaktor retinol yang ada di tengah protein.
The tiny 490,885 base-pair genome of Nanoarchaeum equitans is one-tenth of this size and the smallest archaeal genome known; it is estimated to contain only 537 protein-encoding genes.
Sepersepuluh dari ukuran ini adalah genom kecil berupa 490.885 pasangan basa pada Nanoarchaeum equitans, genom arkea terkecil yang dikenal; genom ini diperkirakan hanya berisi 537 gen penyandi-protein.
Smaller independent pieces of DNA, called plasmids, are also found in archaea.
Potongan independen kecil dari DNA, yang disebut plasmid, juga ditemukan dalam arkea.
Plasmids may be transferred between cells by physical contact, in a process that may be similar to bacterial conjugation.
Plasmid dapat ditransfer antarsel dengan kontak fisik, dalam proses yang mungkin mirip dengan konjugasi bakteri.
Archaea are genetically distinct from bacteria and eukaryotes, with up to 15% of the proteins encoded by any one archaeal genome being unique to the domain, although most of these unique genes have no known function.
Arkea secara genetik berbeda dari bakteri dan eukariota; sampai dengan 15% dari protein yang disandi oleh setiap genomnya merupakan protein yang unik untuk domain Archaea, meskipun sebagian besar gen yang unik tidak memiliki fungsi yang diketahui.
The proteins that archaea, bacteria and eukaryotes share form a common core of cell function, relating mostly to transcription, translation, and nucleotide metabolism.
Protein yang sama-sama dimiliki arkea, bakteri, dan eukariota membentuk sari pati fungsi sel, yang terutama berkaitan dengan transkripsi, translasi, dan metabolisme nukleotida.
Transcription in archaea more closely resembles eukaryotic than bacterial transcription, with the archaeal RNA polymerase being very close to its equivalent in eukaryotes, while archaeal translation shows signs of both bacterial and eukaryotic equivalents.
Transkripsi pada arkea lebih menyerupai transkripsi eukariota dibandingkan transkripsi bakteri, dengan RNA polimerase arkea sangat mirip dengan enzim serupa pada eukariota; sementara translasi pada arkea menunjukkan tanda-tanda kesamaan, baik pada bakteri maupun eukariota.
Haloferax volcanii, an extreme halophilic archaeon, forms cytoplasmic bridges between cells that appear to be used for transfer of DNA from one cell to another in either direction.
Halobacterium volcanii, sebuah arkea halofilik ekstrem, membentuk jembatan sitoplasma di antara sel-sel yang sepertinya akan digunakan untuk mentransfer DNA dari satu sel ke sel lain dalam dua arah.
When the hyperthermophilic archaea Sulfolobus solfataricus and Sulfolobus acidocaldarius are exposed to DNA-damaging UV irradiation or to the agents bleomycin or mitomycin C, species-specific cellular aggregation is induced.
Ketika arkea hipertermofilik Sulfolobus solfataricus dan Sulfolobus acidocaldarius terpapar radiasi sinar ultraungu (UV) yang merusak DNA atau bleomisin atau mitomisin C, agregasi seluler yang spesifik pada spesies akan diinduksi.
Aggregation in S. solfataricus could not be induced by other physical stressors, such as pH or temperature shift, suggesting that aggregation is induced specifically by DNA damage.
Agregasi pada S. solfataricus tidak dapat diinduksi oleh stres fisik lainnya, seperti pH atau perubahan suhu, yang menunjukkan bahwa agregasi diinduksi secara khusus oleh kerusakan DNA.
Ajon et al. showed that UV-induced cellular aggregation mediates chromosomal marker exchange with high frequency in S. acidocaldarius.
menunjukkan bahwa agregasi seluler yang diinduksi sinar UV memediasi pertukaran penanda kromosom dengan frekuensi tinggi pada S. acidocaldarius.
and Ajon et al. hypothesized that cellular aggregation enhances species-specific DNA transfer between Sulfolobus cells in order to provide increased repair of damaged DNA by means of homologous recombination.
berhipotesis bahwa agregasi seluler meningkatkan transfer DNA spesifik-spesies di antara sel-sel Sulfolobus dalam rangka meningkatkan perbaikan DNA yang rusak dengan cara rekombinasi homolog.
This response may be a primitive form of sexual interaction similar to the more well-studied bacterial transformation systems that are also associated with species-specific DNA transfer between cells leading to homologous recombinational repair of DNA damage.
Tanggapan ini mungkin merupakan bentuk primitif dari interaksi seksual yang mirip dengan sistem transformasi bakteri yang dipelajari dengan lebih baik yang juga terkait dengan transfer DNA spesifik-spesies di antara sel-sel yang mengarah pada perbaikan rekombinasi homolog dari kerusakan DNA.
Archaea are the target of a number of viruses in a diverse virosphere distinct from bacterial and eukaryotic viruses.
Arkea menjadi target dari sejumlah virus yang berbeda dari virus-virus yang menyerang bakteri dan eukariota.
They have been organized into 15–18 DNA-based families so far, but multiple species remain un-isolated and await classification.
Virus-virus ini telah dikelompokkan dalam 15–18 keluarga berbasis DNA, tetapi beberapa spesies tetap tidak terisolasi dan menunggu klasifikasi.
Archaeal-specific viruses target only archaean species and currently include 12 families.
Virus spesifik arkea hanya menargetkan spesies arkea dan saat ini mencakup 12 keluarga virus.
Numerous unique, previously unidentified viral structures have been observed in this group, including: bottle-shaped, spindle-shaped, coil-shaped, and droplet-shaped viruses.
Banyak virus berstruktur unik yang sebelumnya tidak teridentifikasi telah ditemukan dalam kelompok ini, termasuk virus berbentuk botol, spindel, gulungan, dan tetesan.
While the reproductive cycles and genomic mechanisms of archaea-specific species may be similar to other viruses, they bear unique characteristics that were specifically developed due to the morphology of host cells they infect.
Meskipun siklus reproduksi dan mekanisme genom spesies virus spesifik-arkea mungkin mirip dengan virus lain, mereka memiliki karakteristik unik yang secara khusus dikembangkan karena morfologi sel inang yang mereka infeksi.
Most archaea-specific viral strains maintain a stable, somewhat lysogenic, relationship with their hosts – appearing as a chronic infection.
Sebagian besar galur virus spesifik-arkea mempertahankan hubungan yang stabil dan agak lisogenik dengan inangnya, yang tampak sebagai infeksi kronis.
This involves the gradual, and continuous, production and release of virions without killing the host cell.
Hal ini melibatkan produksi dan pelepasan virion secara bertahap dan terus-menerus tanpa membunuh sel inang.
If the hypothesis is correct, it can be concluded that other double-stranded DNA viruses that make up the rest of the archaea-specific group are their own unique group in the global viral community.
Jika hipotesisnya benar, dapat disimpulkan bahwa virus DNA berunting ganda lainnya yang menyusun sisa kelompok spesifik arkea adalah kelompok unik mereka sendiri dalam komunitas virus global.
Krupovic et al. (2018) states that the high levels of horizontal gene transfer, rapid mutation rates in viral genomes, and lack of universal gene sequences have led researchers to perceive the evolutionary pathway of archaeal viruses as a network.
(2018) menyatakan bahwa tingginya tingkat transfer gen horizontal, tingkat mutasi yang cepat pada genom virus, dan kurangnya urutan gen universal telah membuat para peneliti mempersepsikan jalur evolusi virus arkea sebagai jejaring.
The lack of similarities among phylogenetic markers in this network and the global virosphere, as well as external linkages to non-viral elements, may suggest that some species of archaea specific viruses evolved from non-viral mobile genetic elements (MGE).
Kurangnya kesamaan antara penanda filogenetik dalam jejaring ini dan virosfer global, serta hubungan eksternal dengan elemen nonvirus, mungkin menunjukkan bahwa beberapa spesies virus spesifik-arkea berevolusi dari elemen genetik seluler nonvirus (MGE).
These viruses have been studied in most detail in thermophilics, particularly the orders Sulfolobales and Thermoproteales.
Virus-virus ini telah dipelajari secara rinci pada kelompok termofil, khususnya ordo Sulfolobales dan Thermoproteales.
Two groups of single-stranded DNA viruses that infect archaea have been recently isolated.
Dua kelompok virus DNA unting tunggal yang menginfeksi arkea telah diisolasi.
One group is exemplified by the Halorubrum pleomorphic virus 1 (Pleolipoviridae) infecting halophilic archaea, and the other one by the Aeropyrum coil-shaped virus (Spiraviridae) infecting a hyperthermophilic (optimal growth at 90–95 °C) host.
Satu kelompok dicontohkan oleh Halorubrum pleomorphic virus 1 ("Pleolipoviridae") yang menginfeksi arkea halofilik dan yang lainnya oleh virus aeropyrum berbentuk spiral ("Spiraviridae") yang menginfeksi inang hipertermofilik (pertumbuhan optimal pada 90–95 °C).
Defenses against these viruses may involve RNA interference from repetitive DNA sequences that are related to the genes of the viruses.
Pertahanan terhadap virus ini mungkin melibatkan interferensi RNA dari urutan DNA repetitif yang terkait dengan gen dari virus.
Archaea reproduce asexually by binary or multiple fission, fragmentation, or budding; mitosis and meiosis do not occur, so if a species of archaea exists in more than one form, all have the same genetic material.
Arkea bereproduksi secara aseksual dengan fisi biner atau berganda, fragmentasi, atau tunas; mitosis dan meiosis tidak terjadi, jadi jika spesies arkea memiliki lebih dari satu bentuk, semua memiliki materi genetik yang sama.
Cell division is controlled in a cell cycle; after the cell's chromosome is replicated and the two daughter chromosomes separate, the cell divides.
Pembelahan sel dikendalikan dalam siklus sel; setelah kromosom sel direplikasi dan dua kromosom anak terpisah, sel akan membelah.
In the genus Sulfolobus, the cycle has characteristics that are similar to both bacterial and eukaryotic systems.
Pada genus Sulfolobus, siklus sel memiliki karakteristik yang mirip dengan sistem bakteri dan eukariota.
The chromosomes replicate from multiple starting points (origins of replication) using DNA polymerases that resemble the equivalent eukaryotic enzymes.
Kromosom bereplikasi dari beberapa titik-awal (origo replikasi) menggunakan DNA polimerase yang menyerupai enzim eukariota yang setara.
Some species of Haloarchaea undergo phenotypic switching and grow as several different cell types, including thick-walled structures that are resistant to osmotic shock and allow the archaea to survive in water at low salt concentrations, but these are not reproductive structures and may instead help them reach new habitats.
Beberapa spesies Haloarchaea menjalani peralihan fenotipik dan tumbuh sebagai beberapa jenis sel yang berbeda, termasuk struktur berdinding tebal yang tahan terhadap guncangan osmotik dan memungkinkan arkea untuk bertahan hidup dalam air pada konsentrasi garam rendah, tetapi ini bukanlah struktur reproduksi dan dapat membantu mereka mencapai habitat baru.
Indeed, some archaea survive high temperatures, often above 100 °C (212 °F), as found in geysers, black smokers, and oil wells.
Beberapa arkea mampu bertahan pada suhu tinggi, sering kali di atas 100 °C (212 °F), seperti yang ditemukan di geyser, ventilasi hidrotermal laut-dalam, dan sumur minyak.
These groups are not comprehensive or phylum-specific, nor are they mutually exclusive, since some archaea belong to several groups.
Kelompok-kelompok ini tidak komprehensif atau spesifik terhadap filum, mereka juga tidak saling eksklusif karena beberapa arkea digolongkan dalam beberapa kelompok.
Nonetheless, they are a useful starting point for classification.
Meskipun demikian, pengelompokan ini menjadi titik awal yang berguna untuk klasifikasi.
Halophiles, including the genus Halobacterium, live in extremely saline environments such as salt lakes and outnumber their bacterial counterparts at salinities greater than 20–25%.
Halofili, termasuk genus Halobacterium, hidup di lingkungan yang sangat asin seperti danau garam dan jumlahnya melebihi bakteri di lingkungan dengan salinitas yang lebih besar dari 20–25%.
Thermophiles grow best at temperatures above 45 °C (113 °F), in places such as hot springs; hyperthermophilic archaea grow optimally at temperatures greater than 80 °C (176 °F).
Termofil tumbuh paling baik pada suhu di atas 45 °C (113 °F), di tempat-tempat seperti mata air panas; arkea hipertermofil tumbuh optimal pada suhu yang lebih besar dari 80 °C (176 °F).
The archaeal Methanopyrus kandleri Strain 116 can even reproduce at 122 °C (252 °F), the highest recorded temperature of any organism.
Arkea Methanopyrus kandleri galur 116 bahkan dapat bereproduksi pada 122 °C (252 °F), suhu tertinggi yang tercatat dari organisme mana pun.
For example, one of the most extreme archaean acidophiles is Picrophilus torridus, which grows at pH 0, which is equivalent to thriving in 1.2 molar sulfuric acid.
Sebagai contoh, salah satu arkea asidofil paling ekstrem adalah Picrophilus torridus, yang tumbuh pada pH 0, yang setara dengan berkembang di 1,2 molar asam sulfat.
Some extremophile habitats are not dissimilar to those on Mars, leading to the suggestion that viable microbes could be transferred between planets in meteorites.
Beberapa habitat ekstremofil tidak berbeda dengan Mars, sehingga muncul kemungkinan bahwa mikrob yang sesuai bisa saja ditransfer ke antara planet-planet di meteorit.
Recently, several studies have shown that archaea exist not only in mesophilic and thermophilic environments but are also present, sometimes in high numbers, at low temperatures as well.
Beberapa penelitian menunjukkan bahwa arkea tidak hanya ada di lingkungan mesofilik dan termofilik tetapi juga hidup, kadang-kadang dalam jumlah yang tinggi, pada suhu rendah.
For example, archaea are common in cold oceanic environments such as polar seas.
Misalnya, arkea banyak ditemukan di lingkungan lautan dingin seperti laut kutub.
Even more significant are the large numbers of archaea found throughout the world's oceans in non-extreme habitats among the plankton community (as part of the picoplankton).
Lebih signifikan lagi adalah temuan sejumlah besar arkea di seluruh lautan di dunia pada habitat nonekstrem di antara komunitas plankton (sebagai bagian dari pikoplankton).
Although these archaea can be present in extremely high numbers (up to 40% of the microbial biomass), almost none of these species have been isolated and studied in pure culture.
Meskipun arkea ini dapat hadir dalam jumlah yang sangat tinggi (hingga 40% dari biomassa mikrob), hampir tidak ada spesies ini yang telah diisolasi dan dipelajari dalam kultur murni.
Consequently, our understanding of the role of archaea in ocean ecology is rudimentary, so their full influence on global biogeochemical cycles remains largely unexplored.
Akibatnya, pemahaman tentang peran arkea di ekologi laut masih dasar sehingga pengaruh penuh mereka pada siklus biogeokimia global sebagian besar masih belum diselidiki.
It has been demonstrated that in all oceanic surface sediments (from 1,000- to 10,000-m water depth), the impact of viral infection is higher on archaea than on bacteria and virus-induced lysis of archaea accounts for up to one-third of the total microbial biomass killed, resulting in the release of ~0.3 to 0.5 gigatons of carbon per year globally.
Telah dibuktikan bahwa di semua sedimen permukaan samudra (dari kedalaman air 1.000 sampai 10.000 m), dampak infeksi virus lebih tinggi pada arkea dibandingkan pada bakteri; sementara itu, lisis arkea yang diinduksi virus menyumbang hingga sepertiga dari total biomassa mikrob yang terbunuh, yang menghasilkan pelepasan ~0,3 hingga 0,5 gigaton karbon per tahun secara global.
Archaea recycle elements such as carbon, nitrogen, and sulfur through their various habitats.
Arkea mendaur ulang unsur-unsur seperti karbon, nitrogen, dan belerang di berbagai habitat mereka.
This includes both reactions that remove nitrogen from ecosystems (such as nitrate-based respiration and denitrification) as well as processes that introduce nitrogen (such as nitrate assimilation and nitrogen fixation).
Arkea terlibat dalam banyak langkah padasiklus nitrogen, yang meliputi reaksi yang dapat menghapus nitrogen dari ekosistem (seperti respirasi berbasis nitrat dan denitrifikasi) serta proses yang mendatangkan nitrogen (seperti asimilasi nitrat dan fiksasi nitrogen).
Researchers recently discovered archaeal involvement in ammonia oxidation reactions.
Para peneliti menemukan keterlibatan arkea pada reaksi oksidasi amonia.
These reactions are particularly important in the oceans.
Reaksi-reaksi ini sangat penting di lautan.
The archaea also appear crucial for ammonia oxidation in soils.
Arkea juga tampaknya penting untuk oksidasi amonia di tanah.
They produce nitrite, which other microbes then oxidize to nitrate.
Mereka menghasilkan nitrit, dan mikrob lainnya mengoksidasi ke nitrat.
In the sulfur cycle, archaea that grow by oxidizing sulfur compounds release this element from rocks, making it available to other organisms, but the archaea that do this, such as Sulfolobus, produce sulfuric acid as a waste product, and the growth of these organisms in abandoned mines can contribute to acid mine drainage and other environmental damage.
Namun, arkea yang melakukan hal ini, seperti Sulfolobus, menghasilkan asam sulfat sebagai produk limbah, dan pertumbuhan organisme ini di tambang yang ditinggalkan dapat berkontribusi pada air asam tambang dan kerusakan lingkungan lainnya.
In the carbon cycle, methanogen archaea remove hydrogen and play an important role in the decay of organic matter by the populations of microorganisms that act as decomposers in anaerobic ecosystems, such as sediments, marshes, and sewage-treatment works.
Dalam siklus karbon, arkea metanogen mengeliminasi hidrogen dan memainkan peran penting dalam pembusukan bahan organik dengan populasi mikroorganisme yang berperan sebagai dekomposer dalam ekosistem anaerob, seperti sedimen, rawa-rawa, dan pengolahan air limbah.
There are no clear examples of known archaeal pathogens or parasites, but some species of methanogens have been suggested to be involved in infections in the mouth, and Nanoarchaeum equitans may be a parasite of another species of archaea, since it only survives and reproduces within the cells of the Crenarchaeon Ignicoccus hospitalis, and appears to offer no benefit to its host.
Namun, beberapa spesies metanogen diperkirakan terlibat dalam infeksi di mulut, dan Nanoarchaeum equitans mungkin merupakan parasit bagi spesies arkea lain karena hanya bertahan dan bereproduksi dalam sel-sel Crenarchaeon Ignicoccus hospitalis, dan tampaknya tidak memberikan manfaat bagi inangnya.
One well-understood example of mutualism is the interaction between protozoa and methanogenic archaea in the digestive tracts of animals that digest cellulose, such as ruminants and termites.
Salah satu contoh mutualisme yang dipahami dengan baik adalah interaksi antara protozoa dan arkea metanogen dalam saluran pencernaan hewan yang mencerna selulosa, seperti ruminansia dan rayap.
In these anaerobic environments, protozoa break down plant cellulose to obtain energy.
Dalam lingkungan anaerobik ini, protozoa memecah selulosa tanaman untuk memperoleh energi.
This process releases hydrogen as a waste product, but high levels of hydrogen reduce energy production.
Proses ini melepaskan hidrogen sebagai produk limbah, tetapi hidrogen dalam tingkat tinggi mengurangi produksi energi.
When methanogens convert hydrogen to methane, protozoa benefit from more energy.
Ketika metanogen mengubah hidrogen menjadi metana, protozoa diuntungkan dengan lebih banyak energi.
In anaerobic protozoa, such as Plagiopyla frontata, Trimyema, Heterometopus and Metopus contortus, archaea reside inside the protozoa and consume hydrogen produced in their hydrogenosomes.
Dalam protozoa anaerobik, seperti Plagiopyla frontata, arkea berada di dalam protozoa dan mengonsumsi hidrogen yang diproduksi di hidrogenosom mereka.
Archaea associate with larger organisms, too.
Arkea juga berasosiasi dengan organisme yang lebih besar.
For example, the marine archaean Cenarchaeum symbiosum is an endosymbiont of the sponge Axinella mexicana.
Sebagai contoh, arkea laut Cenarchaeum symbiosum hidup dalam (merupakan endosimbion dari) spons Axinella mexicana.
For example, the methanogen Methanobrevibacter smithii is by far the most common archaean in the human flora, making up about one in ten of the prokaryotes in the human gut.
Sebagai contoh, metanogen Methanobrevibacter smithii adalah arkea paling umum dalam flora manusia, yang menyusun sekitar satu dari sepuluh dari semua prokariota dalam usus manusia.
Although Archaea do not have a historical reputation of being pathogens, Archaea are often found with similar genomes to more common pathogens like E. coli, showing metabolic links and evolutionary history with today's pathogens.
Meskipun Arkeaa secara tradisional tidak dikaitkan dengan patogenisitas, mereka sering kali memiliki genom yang memiliki kemiripan dengan patogen yang lebih umum seperti E. coli.
Extremophile archaea, particularly those resistant either to heat or to extremes of acidity and alkalinity, are a source of enzymes that function under these harsh conditions.
Arkea ekstremofili, terutama yang tahan terhadap panas atau keasaman dan alkalinitas ekstrem, merupakan sumber enzim yang berfungsi dalam kondisi yang ekstrem.
For example, thermostable DNA polymerases, such as the Pfu DNA polymerase from Pyrococcus furiosus, revolutionized molecular biology by allowing the polymerase chain reaction to be used in research as a simple and rapid technique for cloning DNA.
Misalnya, DNA polimerase termostabil, seperti Pfu DNA polimerase dari Pyrococcus furiosus, merevolusi biologi molekuler dengan memungkinkan reaksi berantai polimerase digunakan dalam penelitian sebagai teknik sederhana dan cepat untuk kloning DNA.
In industry, amylases, galactosidases and pullulanases in other species of Pyrococcus that function at over 100 °C (212 °F) allow food processing at high temperatures, such as the production of low lactose milk and whey.
Dalam industri, amilase, galaktosidase, dan pullulanase dari spesies Pyrococcus yang lain yang berfungsi pada suhu di atas 100 °C (212 °F) sehingga memungkinkan pengolahan makanan pada suhu tinggi, seperti produksi susu rendah laktosa dan whey.
Enzymes from these thermophilic archaea also tend to be very stable in organic solvents, allowing their use in environmentally friendly processes in green chemistry that synthesize organic compounds.
Enzim dari arkea termofilik ini juga cenderung sangat stabil dalam pelarut organik, sehingga dapat digunakan dalam proses ramah lingkungan dalam kimia hijau yang menyintesis senyawa organik.
This stability makes them easier to use in structural biology.
Stabilitas ini membuatnya lebih mudah untuk digunakan dalam biologi struktural.
Consequently, the counterparts of bacterial or eukaryotic enzymes from extremophile archaea are often used in structural studies.
Akibatnya, enzim dari arkea ekstremofil yang ekuivalen dengan enzim bakteri atau eukariotik sering digunakan dalam studi struktural.
In contrast with the range of applications of archaean enzymes, the use of the organisms themselves in biotechnology is less developed.
Berbeda dengan berbagai aplikasi enzim arkea, penggunaan organisme-organisme arkea sendiri di bidang bioteknologi kurang dikembangkan.
In mineral processing, acidophilic archaea display promise for the extraction of metals from ores, including gold, cobalt and copper.
Dalam pengolahan mineral, arkea asidofilik dipandang menjanjikan untuk ekstraksi logam dari bijih, termasuk emas, kobalt dan tembaga.
Archaea host a new class of potentially useful antibiotics.
Arkea menghasilkan antibiotik kelas baru yang berpotensi dapat digunakan.
These compounds differ in structure from bacterial antibiotics, so they may have novel modes of action.
Senyawa-senyawa ini memiliki struktur yang berbeda dari antibiotik asal bakteri sehingga mereka mungkin memiliki cara kerja yang baru.
Introduction to the Archaea, ecology, systematics and morphology Oceans of Archaea – E.F. DeLong, ASM News, 2003 NCBI taxonomy page on Archaea Genera of the domain Archaea – list of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature Shotgun sequencing finds nanoorganisms – discovery of the ARMAN group of archaea Browse any completed archaeal genome at UCSC Comparative Analysis of Archaeal Genomes Archived 16 February 2013 at the Wayback Machine (at DOE's IMG system)
Umum Introduction to the Archaea, ecology, systematics and morphology Oceans of Archaea – E.F. DeLong, ASM News, 2003 Klasifikasi NCBI taxonomy page on Archaea Genera of the domain Archaea – list of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature Shotgun sequencing finds nanoorganisms – discovery of the ARMAN group of archaea Genomika Browse any completed archaeal genome at UCSC Comparative Analysis of Archaeal Genomes Diarsipkan 2008-10-14 di Wayback Machine.