Dictyostelium discoideum is a species of soil-dwelling amoeba belonging to the phylum Amoebozoa, infraphylum Mycetozoa.
Dictyostelium discoideum adalah spesies ameba yang hidup di tanah dalam filum Amoebozoa, infrafilum Mycetozoa.
D. discoideum is a eukaryote that transitions from a collection of unicellular amoebae into a multicellular "slug" and then into a fruiting body within its lifetime.
Umumnya disebut jamur lendir, D. discoideum adalah eukariota yang berubah dari sekelompok ameba uniseluler menjadi agregat seperti siput yang multiseluler dan kemudian menjadi tubuh buah dalam masa hidupnya.
Its unique asexual life cycle consists of four stages: vegetative, aggregation, migration, and culmination.
Siklus aseksual uniknya terdiri dari empat tahap: vegetatif, agregasi, migrasi, dan kulminasi.
The life cycle of D. discoideum is relatively short, which allows for timely viewing of all stages.
Siklus hidup D. discoideum relatif singkat, yang memungkinkan untuk melihat secara tepat semua tahap.
The cells involved in the life cycle undergo movement, chemical signaling, and development, which are applicable to human cancer research.
Sel-sel yang terlibat dalam siklus hidup mengalami pergerakan, isyarat kimia, dan perkembangan, yang berlaku untuk penelitian kanker manusia.
The simplicity of its life cycle makes D. discoideum a valuable model organism to study genetic, cellular, and biochemical processes in other organisms.
Kesederhanaan siklus hidupnya menjadikan D. discoideum sebagai organisme model yang berharga untuk mempelajari proses genetik, seluler, dan biokimia pada organisme lain.
In the wild, D. discoideum can be found in soil and moist leaf litter.
Di alam liar, D. discoideum dapat ditemukan di tanah dan serasah daun basah.
Its primary diet consists of bacteria, such as Escherichia coli, found in the soil and decaying organic matter.
Makanan utamanya terdiri dari bakteri, seperti Escherichia coli, ditemukan di tanah dan bahan organik yang membusuk.
Uninucleate amoebae of D. discoideum consume bacteria found in their natural habitat, which includes deciduous forest soil and decaying leaves.
Ameba uninukleat dari D. discoideum mengkonsumsi bakteri yang ditemukan di habitat aslinya, yang meliputi tanah hutan gugur dan daun yang membusuk.
The life cycle of D. discoideum begins when spores are released from a mature sorocarp (fruiting body).
Siklus hidup D. discoideum dimulai ketika spora dilepaskan dari sorocarp dewasa (tubuh buah).
During their vegetative stage, the myxamoebae divide by mitosis as they feed on bacteria.
Selama tahap vegetatif, myxamoebae memakan bakteri dan membelah dengan mitosis.
The bacteria secrete folic acid, which attracts the myxamoebae.
Bakteri mengeluarkan asam folat, menarik myxamoebae.
When the supply of bacteria is depleted, the myxamoebae enter the aggregation stage.
Ketika persediaan bakteri habis, myxamoebae memasuki tahap agregasi.
The glycoproteins allow for cell-cell adhesion, and adenylyl cyclase creates cyclic AMP.
Glikoprotein memungkinkan adhesi sel-sel, dan adenylyl cyclase menciptakan AMP siklik.
As they move toward the signal, they bump into each other and stick together by the use of glycoprotein adhesion molecules.
Saat mereka bergerak menuju sinyal, mereka bertemu satu sama lain dan menempel bersama dengan menggunakan molekul adhesi glikoprotein.
The migration stage begins once the amoebae have formed a tight aggregate and the elongated mound of cells tips over to lie flat on the ground.
Tahap migrasi dimulai setelah amuba membentuk agregat yang rapat dan gundukan sel yang memanjang dan menempel rata di atas tanah.
The amoebae work together as a motile pseudoplasmodium, also known as a slug.
Amuba bekerja bersama sebagai pseudoplasmodium motil atau disebut sebagai slug.
The slug is about 2–4 mm long, composed of up to 100,000 cells, and is capable of movement by producing a cellulose sheath in its anterior cells through which the slug moves.
Slug memiliki panjang sekitar 2–4 mm, terdiri dari 100.000 sel, dan mampu bergerak dengan menghasilkan selubung selulosa.
Cyclic AMP and a substance called differentiation-inducing factor, help to form different cell types.
AMP siklik dan zat yang disebut faktor pemicu diferensiasi, membantu membentuk jenis sel yang berbeda.
The slug becomes differentiated into prestalk and prespore cells that move to the anterior and posterior ends, respectively.
Slug menjadi terdiferensiasi menjadi sel pratalk dan prorespore yang masing-masing bergerak ke ujung anterior dan posterior.
The prestalk cells and prespore cells switch positions in the culmination stage to form the mature fruiting body.
Sel prestalk dan sel prespore berganti posisi di tahap kulminasi untuk membentuk tubuh buah yang matang.
The anterior end of the Mexican hat forms a cellulose tube, which allows the more posterior cells to move up the outside of the tube to the top, and the prestalk cells move down.
Ujung anterior Mexican hat membentuk tabung selulosa, yang memungkinkan sel-sel yang lebih posterior bergerak ke atas bagian luar tabung, dan sel pratalk bergerak ke bawah.
This rearrangement forms the stalk of the fruiting body made up of the cells from the anterior end of the slug, and the cells from the posterior end of the slug are on the top and now form the spores of the fruiting body.
Penataan ulang ini membentuk tangkai tubuh buah yang terdiri dari sel-sel dari ujung anterior slug, dan sel-sel dari ujung posterior slug berada di atas dan membentuk spora tubuh buah.
At the end of this 8– to 10-hour process, the mature fruiting body is fully formed.
Pada akhir dari proses yang berlangsung selama 8 hingga 10 jam ini, tubuh buah yang matang akan sepenuhnya terbentuk.
This fruiting body is 1–2 mm tall and is now able to start the entire cycle over again by releasing the mature spores that become myxamoebae.
Tubuh buah memiliki tinggi 1–2 mm dan dapat memulai seluruh siklus kembali dengan melepaskan spora dewasa yang menjadi myxamoebae.
Although D. discoideum generally reproduces asexually, D. discoideum is still capable of sexual reproduction if certain conditions are met.
Secara umum, meskipun D. discoideum umumnya bereproduksi secara aseksual, D. discoideum masih mampu bereproduksi secara seksual jika kondisi tertentu terpenuhi.
D. discoideum has three different mating types and studies have identified the sex locus that specifies these three mating types.
D. discoideum memiliki tiga mating type yang berbeda dan penelitian telah mengidentifikasi lokus seks yang menentukan ketiga mating type ini.
Type I strains are specified by the gene called MatA, type III strains have two different MatS and MatT genes, and type II strains have three different genes: MatB (homologous to MatA), MatC, and MatD (which are homologous to MatS and MatT).
Strain tipe I ditentukan oleh gen yang disebut MatA, strain Tipe II memiliki tiga gen berbeda: MatB (homolog dengan Mat A), Mat C, dan Mat D, dan strain Tipe III memiliki gen Mat S dan Mat T (yang homolog Mat C dan Mat D).
Because many of its genes are homologous to human genes, yet its life cycle is simple, D. discoideum is commonly used as a model organism.
Karena banyak dari gen-gennya homolog terhadap gen-gen manusia, tetapi daur hidupnya sederhana, D. discoideum sering digunakan sebagai organisme model.
D. discoideum is closely related to higher metazoans.
D. discoideum berkerabat dengan metazoa yang lebih tinggi.
The cell differentiation process occurs when a cell becomes more specialized to develop into a multicellular organism.
Proses diferensiasi sel terjadi ketika sel menjadi lebih terspesialisasi untuk berkembang menjadi organisme multiseluler.
Therefore, the organism is an excellent model for studying cell differentiation.
Oleh karena itu, organisme ini merupakan model yang sangat baik untuk mempelajari diferensiasi sel.
These chemical emissions and amoeba movement occur every six minutes.
Emisi kimiawi dan pergerakan amuba ini terjadi setiap enam menit.
The amoebae move toward the concentration gradient for 60 seconds and stop until the next secretion is sent out.
Amuba bergerak menuju gradien konsentrasi selama 60 detik dan berhenti sampai sekresi berikutnya keluar.
This behavior of individual cells tends to cause oscillations in a group of cells, and chemical waves of varying cAMP concentration propagate through the group in spirals.
Perilaku sel individu ini cenderung menyebabkan osilasi dalam sekelompok sel, dan gelombang kimia dengan konsentrasi cAMP yang bervariasi menyebar melalui kelompok dalam bentuk spiral.
The use of cAMP as a chemotactic agent is not established in any other organism.
Penggunaan cAMP sebagai agen kemotaktik tidak ditetapkan pada organisme lain.
Apoptosis (programmed cell death) is a normal part of species development.
Apoptosis (kematian sel terprogram) adalah bagian normal dari perkembangan spesies.
Around 20% of cells in D. discoideum altruistically sacrifice themselves in the formation of the mature fruiting body.
Sekitar 20% sel dalam D. discoideum secara altruistik mengorbankan diri dalam pembentukan tubuh buah yang matang.
During the pseudoplasmodium (slug or grex) stage of its life cycle, the organism has formed three main types of cells: prestalk, prespore, and anterior-like cells.
Selama tahap pseudoplasmodium (slug atau grex) dari siklus hidupnya, organisme telah membentuk tiga jenis sel utama: pratalk, prespore, dan sel mirip anterior.
During culmination, the prestalk cells secrete a cellulose coat and extend as a tube through the grex.
Selama kulminasi, sel-sel prestalk mengeluarkan lapisan selulosa dan meluas sebagai tabung melalui grex.
The stalk cells undergo apoptosis and die as the prespore cells are lifted high above the substrate.
Sel tangkai mengalami apoptosis dan mati saat sel prespori terangkat tinggi di atas substrat.
The prespore cells then become spore cells, each one becoming a new myxamoeba upon dispersal.
Sel-sel prespori kemudian menjadi sel spora, masing-masing menjadi myxamoeba baru pada saat penyebaran.
This is an example of how apoptosis is used in the formation of a reproductive organ, the mature fruiting body.
Sehingga organisme ini adalah contoh bagaimana apoptosis digunakan dalam pembentukan organ reproduksi, tubuh buah yang matang.
This organism's ability to be easily isolated and cultivated in the laboratory adds to its appeal as a model organism.
Kemampuan organisme ini untuk mudah dikultivasi di laboratorium menambah daya tariknya sebagai organisme model.
While D. discoideum can be grown in liquid culture, it is usually grown in Petri dishes containing nutrient agar and the surfaces are kept moist.
Sementara D. discoideum dapat ditumbuhkan dalam kultur cair, biasanya ditanam di cawan Petri yang mengandung agar nutrien dan permukaannya dijaga tetap lembap.
The cultures grow best at 22–24 °C (room temperature).
Kultur tumbuh paling baik pada suhu 22-24 °C (suhu kamar).
D. discoideum feed primarily on E. coli, which is adequate for all stages of the life cycle.
D. discoideum memakan E. coli, yang cukup untuk semua tahapan siklus hidup.
When the food supply is diminished, the myxamoebae aggregate to form pseudoplasmodia.
Ketika suplai makanan berkurang, kumpulan myxamoebae membentuk pseudoplasmodia.
The cells can be harvested at any stage of development and grown quickly.
Sel-sel tersebut dapat dipanen pada setiap tahap perkembangan dan tumbuh dengan cepat.
While cultivating D. discoideum in a laboratory, it is important to take into account its behavioral responses.
Saat mengkultivasi D. discoidium di laboratorium, penting untuk mempertimbangkan respons perilakunya.
Variations of these parameters can alter the rate and viability of culture growth.
Variasi parameter ini dapat mengubah kecepatan dan kelangsungan pertumbuhan kultur.
Detailed analysis of protein expression in Dictyostelium has been hampered by large shifts in the protein expression profile between different developmental stages and a general lack of commercially available antibodies for Dictyostelium antigens.
Analisis rinci ekspresi protein pada Dictyostelium terbatasi oleh pergeseran besar dalam profil ekspresi protein antara tahap perkembangan yang berbeda dan kurangnya antibodi yang tersedia secara komersial untuk antigen Dictyostelium.
In 2013, a group at the Beatson West of Scotland Cancer Centre reported an antibody-free protein visualization standard for immunoblotting based on detection of MCCC1 using streptavidin conjugates.
Pada tahun 2013, sebuah kelompok di Beatson West of Scotland Cancer Centre melaporkan standar visualisasi protein bebas antibodi untuk imunoblot berdasarkan deteksi MCCC1 menggunakan konjugat streptavidin.
The bacterial genus Legionella includes the species that causes Legionnaires' disease in humans.
Genus bakteri Legionella termasuk spesies yang menyebabkan penyakit legiuner pada manusia.
D. discoideum is also a host for Legionella and is a suitable model for studying the infection process.
D. discoideum juga merupakan inang Legionella dan merupakan model yang cocok untuk mempelajari proses infeksi.
Specifically, D. discoideum shares with mammalian host cells a similar cytoskeleton and cellular processes relevant to Legionella infection, including phagocytosis, membrane trafficking, endocytosis, vesicle sorting, and chemotaxis.
Secara khusus, D. discoideum berbagi dengan sel inang mamalia sebuah sitoskeleton serupa dan proses seluler yang relevan dengan infeksi Legionella, termasuk fagositosis, perdagangan membran, endositosis, pemilahan vesikel, dan kemotaksis.
In older classifications, Dictyostelium was placed in the defunct polyphyletic class Acrasiomycetes.
Dalam klasifikasi sebelumnya, Dictyostelium ditempatkan di kelas Acrasiomycetes polifiletik yang sudah tidak berfungsi.
More recent genomic studies have shown that Dictyostelium has maintained more of its ancestral genome diversity than plants and animals, although proteome-based phylogeny confirms that amoebozoa diverged from the animal–fungal lineage after the plant–animal split.
Kemudian, studi genom menunjukkan bahwa Dictyostelium telah mempertahankan lebih banyak keragaman genom leluhurnya daripada tumbuhan dan hewan, meskipun filogeni berbasis proteome menegaskan bahwa amoebozoa menyimpang dari garis keturunan hewan-jamur setelah tanaman-hewan dipecah.
Subclass Dictyosteliidae, order Dictyosteliales is a monophyletic assemblage within the Mycetozoa, a group that includes the protostelid, dictyostelid, and myxogastrid slime molds.
Subclass Dictyosteliidae, ordo Dictyosteliales adalah kumpulan monofiletik dalam Mycetozoa, kelompok yang mencakup jamur lendir protostelid, dictyostelid, dan myxogastrid.
Elongation factor-1α (EF-1α) data analyses support Mycetozoa as a monophyletic group, though rRNA trees place it as a polyphyletic group.
Analisis data faktor elongasi-1α (EF-1α) mendukung Mycetozoa sebagai gugus monofiletik, meskipun pohon rRNA menempatkannya sebagai gugus polifiletik.
Further, these data support the idea that the dictyostelid and myxogastrid are more closely related to each other than they are the protostelids.
Lebih lanjut, data ini mendukung gagasan bahwa dictyostelid dan myxogastrid lebih erat kaitannya satu sama lain daripada protostelida.
EF-1α analysis also placed the Mycetozoa as the immediate outgroup for the animal-fungal clade.
Analisis EF-1α juga menempatkan Mycetozoa sebagai outgroup langsung untuk klade jamur-hewan.
Latest phylogenetic data place dictyostelids firmly within supergroup Amoebozoa, along with myxomycetes.
Data filogenetik terbaru menempatkan diktiostelida dengan kuat di dalam supergrup Amoebozoa, bersama dengan myxomycetes.
Meanwhile, protostelids have turned out to be polyphyletic, their stalked fruiting bodies a convergent feature of multiple unrelated lineages.
Sementara itu, protostelida telah berubah menjadi polifiletik, tubuh buahnya yang bertangkai merupakan ciri konvergen dari beberapa garis keturunan yang tidak berhubungan.
The D. discoideum genome sequencing project was completed and published in 2005 by an international collaboration of institutes.
Proyek sekuensing genom D. discoideum diselesaikan dan diterbitkan pada tahun 2005 oleh kolaborasi internasional berbagai institut.
D. discoideum consists of a 34-Mb haploid genome with a base composition of 77%
D. discoideum terdiri dari genom haploid 34-Mb dengan komposisi dasar 77%
[A+T] and contains six chromosomes that encode around 12,500 proteins.
[A + T] dan mengandung enam kromosom yang menyandikan sekitar 12.500 protein.
Sequencing of the D. discoideum genome provides a more intricate study of its cellular and developmental biology.
Pengurutan genom D. discoideum memberikan studi yang lebih rumit tentang biologi seluler dan perkembangannya.
The repeats correspond to repeated sequences of amino acids and are thought to be expanded by nucleotide expansion.
Pengulangan sesuai dengan urutan berulang dari asam amino dan diperkirakan akan diperluas oleh ekspansi nukleotida.
Expansion of trinucleotide repeats also occurs in humans, in general leading to many diseases.
Perluasan ulangan trinukleotida juga terjadi pada manusia, secara umum menimbulkan banyak penyakit.
Learning how D. discoideum cells endure these amino acid repeats may provide insight to allow humans to tolerate them.
Mempelajari bagaimana sel D. discoideum menahan pengulangan asam amino ini dapat memberikan wawasan yang memungkinkan manusia untuk mentolerirnya.
Every genome sequenced plays an important role in identifying genes that have been gained or lost over time.
Setiap urutan genom memainkan peran penting dalam mengidentifikasi gen yang telah diperoleh atau hilang dari waktu ke waktu.
Comparative genomic studies allow for comparison of eukaryotic genomes.
Studi genomik komparatif memungkinkan untuk perbandingan genom eukariotik.
A phylogeny based on the proteome showed that the amoebozoa deviated from the animal-fungal lineage after the plant-animal split.
Sebuah filogeni berdasarkan proteome menunjukkan bahwa amoebozoa menyimpang dari garis keturunan hewan-jamur setelah tanaman-hewan dipisah.
The D. discoideum genome is noteworthy because its many encoded proteins are commonly found in fungi, plants, and animals.
Genom D. discoideum patut diperhatikan karena banyak protein yang dikodekannya umumnya ditemukan pada jamur, tumbuhan, dan hewan.
Dictyostelium discoideum D. discoideum at MetaMicrobe: taxonomy, facts, ontologies, and references
Dictyostelium discoideum D. discoideum at MetaMicrobe: taxonomy, facts, ontologies, and references Diarsipkan 2019-04-15 di Wayback Machine.