IT-ZBMED/Agriculture_NER_Dataset_for_FAIR_Metadata_Enrichment huggingface dataset:
Title : 
 Data set : blank values from heubach dustmeter - testing maize , barley and onion 

 Abstract : 
 With the Heubach method free floating dust of treated seeds can be measured . The Heubach value is used as an indicator for seed quality . One way to make the heubach results more reliable can be the definition of the limit of detection ( LOD ) and the limit of quantification ( LOQ ) . Blank measurements were conducted in several heubach labs for this data collection to allow a calculation of LOD and LOQ for the Heubach method . For the conditioning of the testing device seeds from maize , barley and onion were used . Two Tests ( Data_LOD_LOQ_barley_maize_onion.xlsx ) were performed following the EU - Code of Practise for the monitoring of floating dust of treated seeds ( Version 05.1 , published by the Seed Treatment Stewardship Steering Committee ( STICCS Group ) on 1st August 2021 ) . The material and methods used are described in Material_and_methods_maize_barley_onion.pdf and the procedure for estimation of LOD and LOQ for Heubach seed abrasion dust method is described in Procedure_for_the_estimation_of_LOD_and_LOQ_maize_barley_onion.pdf .
Title : 
 Data from : N2 and N2O mitigation potential of replacing maize with the perennial biomass crop Silphium perfoliatum – An incubation study 

 Abstract : 
 Sustainability of biogas production is strongly dependent on soil - borne greenhouse gas ( GHG ) emissions during feedstock cultivation . Maize ( Zea mays ) is the most common feedstock for biogas production in Europe . Since it is an annual crop requiring high fertilizer input , maize cropping can cause high GHG emissions on sites that , due to their hydrology , have high N2O emission potential . On such sites , cultivation of cup plant ( Silphium perfoliatum ) as a perennial crop could be a more environmentally - friendly alternative offering versatile ecosystem services . To evaluate the possible benefits of perennial cup - plant cropping on GHG emissions and nitrogen losses , an incubation study was conducted with intact soil cores from a maize field and a cup plant field . The 15N gas flux method was used to quantify N source - specific N2 and N2O fluxes . Cumulated N2O emissions and N2+N2O emissions did not differ significantly between maize and cup plant soils , but tended to be higher in maize soil . Soils from both systems exhibited relatively high and similar N2O/(N2+N2O ) ratios ( N2Oi ) . N2O emissions originating from sources other than the 15N - labelled NO3 pool were low , but were the only fluxes exhibiting a significant difference between the maize and cup plant soils . Missing differences in fluxes derived from the 15N - pool indicate that under the experimental conditions with high moisture and NO3- level , and without plants , the cropping system had little effect on N fluxes related to denitrification . Lower soil pH and higher bulk density in the cup plant soil are likely to have reduced the mitigation potential of perennial biomass cropping .
Title : 
 Self - incompatibility ( S ) genotypes of cultivated sweet cherries – An overview 2023 - Update 

 Abstract : 
 A gametophytic self - incompatibility ( GSI ) system determines fertility in sweet cherries and prevents pollination with own and genetically related pollen . This mechanism is controlled by a multi - allelic S locus coding for two genes involved in fertilization : the S allele - specific ribonuclease ( S RNase ) expressed in the female style and the S specific F - box protein ( SFB ) in the male pollen . Knowledge about the S genotype of sweet cherries is very important for cherry growers and breeders . Molecular markers have been developed to distinguish the S alleles in sweet cherries . In this new update from February 2023 , a total of 72 incompatibility groups in 1700 sweet cherry cultivars have been listed . Twenty - six sweet cherry cultivars have a unique combination of S alleles , were described as universal donors and were categorized in the incompatibility group 0 . Additionally , there exist 91 self - compatible ( SC ) sweet cherry genotypes belonging to the group SC . A total of 26 different S alleles were described in the cultivated sweet cherries up to date . These are the S alleles S1 , S2 , S3 , S4 , S5 , S6 , S7 , S9 , S10 , S12 , S13 , S14 , S16 , S17 , S18 , S19 , S21 , S22 , S24 , S27 , S30 , S37 and S38 ( S7 m ) , and the three mutated , non - functional S alleles S3 ' , S4 ' , S5 ' . This work summarizes all available data on S allele genotyping for in cultivated sweet cherries . Table 1 describes the S genotypes of all sweet cherries studied . It also contains information about the parentage , if known . Table 2 gives an overview about of all the defined incompatibility groups . The groups are sorted according to their group numbers or the S allele numbers , respectively . Table 3 lists all genotypes of the incompatibility group 0 , which exhibit a unique S genotype . Table 4 includes all known self - compatible sweet cherry genotypes of the group SC . All published data used to describe of the S genotypes are listed in the file named ' References ' . For S genotyping of sweet cherries , we have established a reference assortment including sweet cherry accessions for a large scale of S alleles ( Table 5 ) . These reference genotypes were planted in the orchard of the Julius Kühn - Institut in Dresden - Pillnitz . The present dataset will be regularly updated and improved with all new S alleles data of sweet cherries . In addition , all new information about the parentage is very important for breeding research . Please send all news or corrections regarding the S allele genotype and parentage of sweet cherries to mirko.schuster@julius-kuehn.de or susan.schroepfer@julius-kuehn.de . An update of the S allele overview will be provide in the coming years .
Title : 
 Spanplatte , roh   ( Durchschnitt DE ): ÖKOBAUDAT Version 2023 - I vom 15.06.2023 

 Abstract : 
 Repräsentativer Ökobilanzdatensatz für Spanplatte , roh gemäß EN 15804:2012+A2:2019 Methode : ISO EN 14040:2006 , EN 15804:2012+A2:2019 Dateiformat : ILCD - Format und EPD - Datenformaterweiterungen v1.2 ÖKOBAUDAT UUID : dce28570 - db4a-4997 - a05c-1fa0d75201c8 Empfohlene Zitierung : Janke S , Rüter S ( 2023 ) Spanplatte , roh ( Durchschnitt DE ) , In : ÖKOBAUDAT , Version 2023 - I vom 15.06.2023 , Bundesministerium für Wohnen , Stadtentwicklung und Bauwesen ( BMWSB ) , www.oekobaudat.de
Title : 
 Steckbriefe zu humuserhaltenden und -mehrenden Maßnahmen auf Ackerflächen : Projektbericht des Thünen - Instituts i m HumusKlimaNetz 

 Abstract : 
 In der deutschen und europäischen Klimapolitik hat der Humusaufbau und -erhalt in den letzten Jahren immer mehr an Bedeutung gewonnen . In diesem Kontext sollen in dem HumusKlimaNetz Maßnahmen zum Humusaufbau in der Praxis erprobt werden . Um den beteiligten Betrieben mögliche Maßnahmen zur Umsetzung anbieten zu können , ist es entscheidend zu bewerten , welche Maßnahmen wie stark zum Humuserhalt und -aufbau beitragen können und welche sonstigen ackerbaulichen Effekte bzw . Umweltwirkungen die Maßnahmen mit sich bringen . Für den ggf . erforderlichen Kompensationsbedarf ist es notwendig , die Kosten die mit der Umsetzung der Maßnahmen verbunden sind , zu kennen . In diesem Bericht werden die wissenschaftlichen Erkenntnisse zu den genannten Fragen zusammengetragen und auf Basis der Ertragsstatistik regionsspezifische Pauschalen für eine Kompensation von Maßnahmen entwickelt . Somit ist der Projektbericht eine wissenschaftliche Arbeitsgrundlage für die Förderung von Humusmaßnahmen i m Rahmen des Modell- und Demonstrationsvorhabens „ HumusKlimaNetz “ .
Title : 
 Dataset : Tabellenanhang Handbuch N - Gesamtbilanz Bilanzjahr 2019 , Handbuch , 2 . überarbeitete Fassung 

 Abstract : 
 Der vorliegende Datensatz beinhaltet Werte für alle Bilanzglieder der Nationalen Stickstoff - Gesamtbilanz von 1990 bis 2019 . Der Datensatz ist komplementär zum Handbuch zur Berechnung der Nationalen Stickstoff - Bilanz ( Müller et al . , 2024 , Berechnung der Stickstoff - Bilanz für die Landwirtschaft in Deutschland - Jahre 1990 bis 2019 , 2 . Fassung , in : Berichte aus dem Julius Kühn - Institut , Julius Kühn - Institut , Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen , Quedlinburg , Deutschland . ) . Die zugeführten und abgeführten Stickstoffmengen in den einzelnen Positionen werden gegeneinander verrechnet und auf die landwirtschaftlich genutzte Fläche Deutschlands bezogen . Somit ergibt sich ein Stickstoff - Saldo je Hektar für Deutschland i m entsprechenden Bilanzjahr .
Title : 
 Workshop on the evaluation of NEA mackerel stock components ( WKEVALMAC , outputs from 2023 meeting ) 

 Abstract : 
 The objective of WKEVALMAC was to review information on stock identification of NEA Mackerel and develop a consensus understanding of the Atlantic mackerel population structure and key uncertainties . The data and studies covered the distribution and movements of different life - stages of mackerel , including changes over time . The evaluated data and studies centred on genetics , tagging , otolith approaches ; egg and larval dispersal models ; commercial landings and perceptions from the industry . The motivation was the continued consideration of the mackerel stock consisting of three ‘ components ’ and the advice sheet referring to separate recommendations for at least one of the ‘ components ’ ( the North Sea ) . The workshop found that spatial and temporal patterns in demography ( e.g. size and age ) of NEA mackerel are not due to separate components but rather are primarily related to the highly migratory and dynamic nature of a single stock . Recent directed genetics , tagging , otolith chemistry investigations ; ongoing surveys ; catch data ; fisher perspective ; and preliminary modelling studies all failed to support the three - component concept for NEA mackerel . The Workshop therefore rejected the current three - component structure and accepted a single NEA mackerel stock concept to advance towards assessment , management , and advice . The workshop therefore recommends that the current ‘ headline advice ’ based on a single - stock assumption should continue and the advice sheet should discontinue reference to components within the Northeast Atlantic Mackerel stock . The workshop also raised a number of data gaps and uncertainties which can be addressed with future research . These included : improvements to existing survey and catch data programs to enhance our understanding of the spatial and temporal dynamics of the NEA stock , investigations in to how indeterminant spawning interacts with migration behaviours in the annual egg production estimates , and exploring assessment model sensitivity to parameter values and model configuration given the non - stationarity in this stock .
Title : 
 Bestockte Holzbodenkarte 2018 

 Abstract : 
 Als Grundlage für das fernerkundungsbasierte Monitoring von Waldökosystemen muss die zu betrachtende Waldfläche eingegrenzt werden . Zu diesem Zweck wird in der Regel eine Wald- oder Holzbodenkarte hergestellt , welche auf einer Walddefinition basiert . Die hier vorgestellte bestockte Holzbodenkarte wurde auf Basis der Walddefinition der Bundeswaldinventur produziert ( https://www.bundeswaldinventur.de/service/fachbegriffe-und-abkuerzungen ) . Ziel der Karte ist die Erfassung der mit Forstpflanzen bestocken Waldfläche . Dabei werden Landnutzungs- und Landbedeckungseigenschaften berücksichtigt , zum Beispiel gehören Weihnachtsbaumkulturen , Stadtparks oder Gehölzstreifen nach dem Bundeswaldgesetzt nicht zur Waldfläche und werden nicht erfasst . Die Karte basiert auf den Klassen AX_Wald , AX_Sumpf , AX_Moor des Basis - DLM 2018 ( https://gdz.bkg.bund.de/index.php/default/digitales-basis-landschaftsmodell-ebenen-basis-dlm-ebenen.html ) , sowie den Produkten High Resolution Layer Tree Cover Density 2015/2018 ( https://land.copernicus.eu/pan-european/high-resolution-layers/forests/tree-cover-density/status-maps/tree-cover-density-2018?tab=metadata ) und Feature Additional Support Layer 2018 ( https://land.copernicus.eu/user-corner/technical-library/forest-2018-user-manual.pdf ) . Flächen mit einem Überschirmungsgrad ≤ 50 % und Gebiete mit einer Minimalen Flächeneinheit ( MMU ) ≤ 0,25 Hektar werden von der Holzbodenkarte nicht berücksichtigt . Die Genauigkeit der Karte wurde nach Stehman ( 2014 , doi.org/10.1080/01431161.2014.930207 ) basierend auf den Waldentscheiden der Kohlenstoffinventur 2017/2018 geschätzt . Dabei erreicht die Karte eine Gesamtgenauigkeit von 96,49 ± 0,05 % , ein Produzentengenauigkeit für Wald von 94,06 ± 0,12 % und eine Nutzergenauigkeit für Wald von 94,56 ± 0,11 % . Die deutschlandweite bestockte Holzbodenfläche umfasst 10.962.638,95 Hektar . Damit liegt die kartierte Fläche 0,45 % ( 97.80,91 Hektar ) unter der bestockten Holbodenfläche nach BWI3 ( https://bwi.info/ ) . Für weitere Einzelheiten wenden Sie sich bitte an niklas.langner@thuenen.de EPSG:32632
Title : 
 Governance : The reform process of the CAP post 2020 seen from an inter - institutional angle : study requested by the AGRI Committee 

 Abstract : 
 This study examines the inter - institutional dynamics of the post-2020 CAP reform ( European Parliament - Council - Commission ) , provides an analysis of the dynamics and the outcome of the reform process seen from a governance angle and makes recommendations on the role of Parliament in future CAP reforms and mid - term reviews .
Title : 
 Per- und Polyfluoralkylchemikalien ( PFAS ) in Fischen aus der Nord- und Ostsee ( 2022 ) 

 Abstract : 
 Per- und Polyfluoralkylchemikalien ( PFAS ) sind industriell hergestellte persistente fluorierte organische Substanzen , die z. B. zur Ausrüstung von Textilien und zur Oberflächenbehandlung verwendet werden . Sie sind weltweit verbreitet und wurden z. B. in Eisbären gefunden . Einige PFAS stehen i m Verdacht krebserregend zu sein . Die höchsten PAFS - Belastungen in Fischen findet man i m Süßwasser . Gehalte von PFAS in Meeresfisch sind oft in der Nähe der analytischen Nachweisgrenze . Die Gehalte werden i m Rahmen des Umwelt - Monitorings des Thünen - Instituts für Fischereiökologie regelmäßig überwacht , um die Höhe der Belastung zu erfassen und zu bewerten sowie regionale und zeitliche Unterschiede in dieser Belastung festzustellen . Die Ergebnisse fließen in nationale und europäische Umweltbewertungen ein .
Title : 
 Survey - Daten RHLS ( Rügen - Heringslarvensurvey ) 

 Abstract : 
 Der aus dem RHLS berechnete Index der Heringslarvenproduktion in einem Hauptlaichgebiet des Herings der westlichen Ostsee , liefert das einzige , fischreiunabhängige Maß der jährlichen Nachwuchsproduktion und geht als solches in die Bestandberechnung des ICES ( International Council for the Exploration of the Sea ) ein ( ICES HAWG , WGSINS , WGALES ) . Die für die Bestandsberechnung verwendete Zeitreihe reicht bis zum Jahr 1992 zurück . Während der gesamten Laichzeit , also von Mitte Februar bis Ende Juni , werden wöchentlich36 Stationen i m Strelasund / Greifswalder Bodden beprobt . Die Heringslarven werden dabei quantitativ mit dem Bongonetz ( Maschenweite 335 µm ) gefangen . Zusätzlich werden hydrographische Parameter wie Wassertemperatur , Salzgehalt , Secchi - Tiefe / Wassertrübung und Gehalt an gelöstem Sauerstoff aufgezeichnet . Der RHLS umfasst gewöhnlich ca . 600 Ichthyoplanktonproben , die in aufwendiger Laborarbeit aufgearbeitet werden .
Title : 
 Konstruktionsvollholz ( Durchschnitt DE ): ÖKOBAUDAT Version 2023 - I vom 15.06.2023 

 Abstract : 
 Repräsentativer Ökobilanzdatensatz für Konstruktionsvollholz gemäß EN 15804:2012+A2:2019 Methode : ISO EN 14040:2006 , EN 15804:2012+A2:2019 Dateiformat : ILCD - Format und EPD - Datenformaterweiterungen v1.2 ÖKOBAUDAT UUID : 7aba3603 - 0689 - 4da5 - 8d24 - fd92ae398d07 Empfohlene Zitierung : Janke S , Rüter S ( 2023 ) Konstruktionsvollholz ( Durchschnitt DE ) , In : ÖKOBAUDAT , Version 2023 - I vom 15.06.2023 , Bundesministerium für Wohnen , Stadtentwicklung und Bauwesen ( BMWSB ) , www.oekobaudat.de
Title : 
 Data from : The draft chromosome - level genome assembly of tetraploid ground cherry ( Prunus fruticosa Pall . ) from long reads 

 Abstract : 
 Cherries are among the most popular fruits among consumers and are grown for industrial processing or fresh consumption . The cultivation and breeding of cherries faces new challenges in the future , not least due to climate change . Cultivation is becoming increasingly difficult due to changing climatic conditions , diseases and pests . Therefore , the market demands new varieties with high fruit quality and adaptation to locally changing conditions . Breeding for tree fruit is a long - term task , though , and tools to facilitate this process are unfortunately not yet available to a sufficient extent . Rapid progress in third - generation sequencing technologies enables breeders to explore and exploit the genomic information underlying economical important traits . We used Oxford Nanopore Technology PromethION platform and R10.3 pore type to sequence the genome of tetraploid ground cherry ( Prunus fruticosa ) . The final sequence has been deposited at DDBJ / ENA / GenBank under the accession JAHHUK000000000 . A specific description of the work can be viewed at https://biorxiv.org/cgi/content/short/2021.06.01.446499v1 . The version described in this paper is version JAHHUK010000000 . 
  The data on this platform includes 17 files , supports the assembling and annotation procedure , and provides insights into this challenging work . 
  As a result , five assemblies ( MiniasmMinimap.fasta , medaka.fasta , raconpolished.fasta , purged.fasta , purged2.fasta ) have been processed to generate a draft genome assembly . 
  The final genome sequence was masked ( genome.fa.masked.gz , genome.fa.out , genome.fa.tbl ) and annotated using Braker 1 and Braker 2 , GeMoMa pipeline and eight reference datasets from other Prunus species . 
  The final structural annotation , coding sequences and protein predictions are provided for future studies ( GeMoMa_Annotation_filtered_predictions_8ref_RNAseq_Braker.gff , GeMoMa_Annotation_filtered_predictions_8ref_RNAseq_Braker_assignment.tabular , GeMoMa_Annotation_filtered_predictions_8ref_RNAseq_Braker_cds - parts.fasta , GeMoMa_Annotation_filtered_predictions_8ref_RNAseq_Braker_proteins.fasta ) . 
  The functional prediction was performed with InterProScan ( Results IPS.xlsx ) . 
  In addition , the sequences and annotation of the chloroplast ( Pf_chloroplast_1.0.fasta , GeSeqJob-20210201 - 124142_utg000088l_segment0_1_GFF3.gff3 ) and mitochondrion ( Pf_mitochondria_1.0 , GeSeqJob-20210202 - 114557_utg001396l_trimmed_GFF3.gff3 ) are presented .
Title : 
 Carbon sequestration potential in hedgerow soils : Results from 23 sites in Germany 

 Abstract : 
 Dataset to the manuscript : Drexler , S. & Don , A. ( 2024 ) . Carbon sequestration potential in hedgerow soils : Results from 23 sites in Germany . Geoderma . https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2024.116878 Drexler_Don_2024_Data : contains the lab data for all samples Drexler_Don_2024_SOC_Stock_Per_Core : contains the calculated SOC stocks per soil core
Title : 
 Experimental raw data from the assessment of operator exposure during the filling process - Closed Transfer Systems ( CTS ) 

 Abstract : 
 The data includes raw spectrofluorometric measurements ( Device : Kontron Instruments SFM25 ) and volume measurements from two experimental parts of the trial program ( see related resource for detailed information ) . Subject of the program was the investigation of operator exposure during the filling process of a field crop sprayer with concentrated Plant Protection Products ( PPP ) . In several experiments , the exposure of different dosimeters ( Visor , Protective Gloves , Laboratory Gloves , Overalls and Underwear ) was evaluated . The fluorescent tracer dye pyranin with a concentration of 5 g / l was used as a substitute for PPP .
Title : 
 Survey data of xylem - sap feeding Auchenorrhyncha 

 Abstract : 
 The recent outbreaks of the xylem - limited bacterium Xylella fastidiosa in Europe require the improvement of prevention measures and of integrated management strategies for the diseases caused by this destructive pathogen . These needs are adressed by the XF - ACTORS consortium . Within the workpackage 5 of this project , faunistic surveys have been carried out in various habitats of southern and central Europe and in olive groves in Brazil to monitor the presence of xylem - sap feeding Auchenorrhyncha as confirmed or potential vectors of X. fastidiosa . The metadata of the collection are reported in this database . It provides general information about the occurrence and abundance of xylem - sap feeder species in Europe .
Title : 
 [ Datensatz ] Aktualisierte Kulisse organischer Böden in Deutschland 

 Abstract : 
 Die aktualisierte Kulisse der organischen Böden in Deutschland ( 2023 ) stellt die Moor- und weiteren organischen Böden in Deutschland dar . Sie enthält harmonisierte Informationen u.a . zu verschiedenen Kategorien von organischen Böden , zur anthropogenen Überprägung durch Tiefpflügen oder der Überdeckung mit Mineralboden , zur Mächtigkeit der Torfhorizonte und zu den Substraten der unterliegenden Schichten . Sie wurde vom Thünen - Institut aus Karten der und in Abstimmung mit den zuständigen Länderbehörden erstellt und ist Open Access . Weitere Informationen befinden sich i m Thünen Working Paper 212 . Austausch des GeoPackages ( 4.8.2023 ) : Korrektur der .lyr - Dateien für die Moorbodenkategorien ( deutsch und englisch ) aufgrund fehlerhafter Darstellung ; Ergänzung um .sld - Dateien .
Title : 
 Spanplatte - melaminbeschichtet ( Durchschnitt DE ): ÖKOBAUDAT Version 2023 - I vom 15.06.2023 

 Abstract : 
 Repräsentativer Ökobilanzdatensatz für Spanplatte - melaminbeschichtet gemäß EN 15804:2012+A2:2019 Methode : ISO EN 14040:2006 , EN 15804:2012+A2:2019 Dateiformat : ILCD - Format und EPD - Datenformaterweiterungen v1.2 ÖKOBAUDAT UUID : ff5343ea - d28e-4c1c - ab30 - 6438c1df7fa8 Empfohlene Zitierung : Janke S , Rüter S ( 2023 ) Spanplatte - melaminbeschichtet ( Durchschnitt DE ) , In : ÖKOBAUDAT , Version 2023 - I vom 15.06.2023 , Bundesministerium für Wohnen , Stadtentwicklung und Bauwesen ( BMWSB ) , www.oekobaudat.de
Title : 
 Calculations of gaseous and particulate emissions from German agriculture 1990 - 2020 : Input data and emission results 

 Abstract : 
 In international conventions Germany has committed to the mitigation of emissions of greenhouse gases and air pollution . These international regulations ( protocols etc . ) are the UN Framework Convention on Climate Change ( UNFCCC ) , the UNECE Convention on Long - Range Transboundary Air Pollution ( CLRTAP ) , and within the European Union the Directive of the European Parliament and of the Council on national emission ceilings for certain atmospheric pollutants ( NEC Directive ) . These conventions require annual calculations of the emissions of the respective gases and air pollutants . The results have to be documented in an emission inventory and to be reported to the organisations in charge . The data file contains input data and results of the calculation of gas and particulate emissions from German agriculture for Germany and the federal states in the years 1990 - 2020 . In this context the sector Agriculture comprises the emissions from animal husbandry , the use of agricultural soils and anaerobic digestion of energy crops . As required by the guidelines , emissions from activities preceding agriculture , from the use of energy and from land use change are reported elsewhere in the national inventories .
Title : 
 Dataset : Differences in nutritional requirements of adult codling moth , Cydia pomonella ( L. ) from field and laboratory populations 

 Abstract : 
 The Datafiles Data_Exp_1_pw.csv , Data_Exp_1.csv , Data_Exp_2.csv contain experimental data of a study where effects of different sugar resources on adult codling moth ( Cydia pomonella L. , Lepidoptera , Tortricidae ) was tested . The survival of moths from overwintered field populations was compared with that of a non - diapausing laboratory strain in feeding experiments with water , two sugar solutions or buckwheat flowers . Data files from Exp_1 contain data on treatment , longevity ( in days and also Accumulated Degree Days ) , fecundity ( number of eggs per female ) and weight at time of death of male and female moth from different field populations as well as the laboratory strain , obtained in a feeding experiment under laboratory conditions . In file Data_Exp_1_pw.csv the pupal weight of a group of these test individuals is given as an additional information . In file Data_Exp_2.csv , data on survival of moths from the laboratory strain in a feeding experiment under field conditions in the year 2017 are given . The file Data_explanation.csv summarizes details on the various parameters in the experiments , such as treatment factors ( diet , populations ) , levels of co - variables ( sex , year , pupal or adult moth weight ) and response variables ( fecundity determined as eggs per female ; survival measured in days or calculated as Accumulated Degree Days ) .
Title : 
 Dataset to : Greenhouse gas emissions from Silphium perfoliatum and silage maize cropping on stagnosols 

 Abstract : 
 To achieve the desired greenhouse gas ( GHG ) mitigation from bioenergy , emissions from feedstock production need to be low . These emissions mainly consist of direct soil - borne GHG emissions during feedstock cultivation and indirect emissions from land use change caused by the competition between first - generation biomass and food production . Marginal land , such as low mountain ranges , is particularly suitable for feedstock production due to the small impact on indirect land - use change . However , the most common biomass crop in Europe , maize ( Zea mays L. ) , does not achieve its full yield potential in cold , wet conditions . On such sites , cup plant ( Silphium perfoliatum L. ) could serve as an alternative to maize . As a perennial , cup plant provides soil protective benefits and many more versatile ecosystem services . To evaluate whether cup plant also provides nitrous oxide mitigation potential , a two - year field experiment was conducted to compare GHG emissions from cup plant and maize fields . GHG emissions were quantified using the closed chamber technique . Cup plant fields emitted on average 3.6±4.3 kg N2O - N ha-1 a-1 ( -85 % ) less than maize fields . This corresponded to 74.0±94.1 g CO2 - eq kWh-1 ( -78 % ) less emissions per produced electrical power . However , the area ( -34 % ) and nitrogen ( -32 % ) productivity of cup plant were significantly lower than of maize . Hence , cup plant as a feedstock reduces direct field - derived GHG emissions compared with maize but , due to lower yields cup plant increases the risk of associated emissions from land - use change . Therefore , the increased sustainability of bioenergy from biogas by replacing maize with cup plant is heavily dependent on the performance of maize at these sites and on the ecosystem services of cup plant in addition to GHG savings .
Title : 
 PhenoApp Input / Output files 

 Abstract : 
 With the ongoing cost decrease of genotyping and sequencing technologies , accurate and fast phenotyping remains the bottleneck in the utilizing of plant genetic resources for breeding and breeding research . Although cost - efficient high - throughput phenotyping platforms emerged during the last decades for specific traits and/or species , manual phenotyping is still predominant and a time- and money - consuming task . Approaches that improve data recording , processing or handling are pivotal steps towards an efficient usage of genetic resources and demanded by the research community . Therefore , we developed PhenoApp , an open source Android app for tablets and smartphones to facilitate the digital recording of phenotypical data in the field and greenhouse . It is a versatile tool , that offers the possibility to fully customize own descriptors / scales for any possible scenario or the usage of pre - integrated ready - to - use BBCH scales for apple , cereals , grapevine , maize , potato , rapeseed and rice . Additional BBCH scales can easily be added . Furthermore , the simple and adaptable structure of input and output files enables an easy data handling by either spreadsheet software or even the integration in the workflow of laboratory information management systems ( LIMS ) . The embedding in international information standards such as MIAPPE or the implementation regarding FAIR data principles is feasible . PhenoApp is a decisive contribution to increase efficiency of digital data acquisition in breeding , breeding research and genebank management by accelerating the labor intensive and time - consuming acquisition of phenotyping data .
Title : 
 LaForeT   Land cover and land use polygons from participatory mapping 

 Abstract : 
 Land use has been mapped in more than 70 community workshops in the LaForeT landscapes in 2017 - 2019 . Participatory mapping was used to produce maps at the landscape level from the perspective of individuals . Mapping was carried out in workshops assembling representatives from the research landscapes . Polygons were delineated in focus group discussions on print outs of satellite images derived from Google Earth or Bing of approximately 80 * 120 cm . All mapped information was digitized by project staff after the workshops . Classification into land use categories was based on a project specific and four - tiered land cover and land use classification scheme . For project information see www.la-foret.org .
Title : 
 Workshop on the development of a spatial database and model for eels ( WKSMEEL ) 

 Abstract : 
 WKSMEEL is part of the roadmap defined by the WKFEA ( Workshop on the future of eel advice ) . Experts from Japan , USA , Canada and Europe met to discuss modelling methods and the data necessary to support the development of a spatial assessment of the stock of European eel ( Anguilla anguilla ) . Modelling of the European eel stock is envisioned as a two - level modelling process . At the regional level , it requires the implementation of statistical extrapolation models in freshwater habitats and specific models in lakes or lagoons . At the whole - stock level , a stage - based spatial model is envisioned . The rationale for choosing a stage - based approach for the global models and the requirements and validation of different regional models are discussed . The data requirements for both regional and global stock models have been reviewed with a specific focus on spatial data . For the regional models , a common GIS data structure using broad scale river networks or national databases is proposed . This database should contain both water surface ( lake , lagoons , transitional waters ) and rivers . A database structure to store information on eel habitat , dam and electrofishing is proposed . The availability of GIS river database , dam data and electrofishing data is assessed at the European level , using survey questionnaires sent to national correspondents . For the global stock model , the data requirement , including the output of the regional models , have been defined .
Title : 
 Microsatellite / SSR dataset : pomological and molecular characterization of apple cultivars ( Malus × domestica Borkh . ) of the German Fruit Genebank 

 Abstract : 
 The German Fruit Genebank ( https://www.deutsche-genbank-obst.de/ ) is a decentralized network with focus on the coordination of the different germplasm collections in Germany to conserve and utilize genetic resources of native fruit species . Here , emphasis is put on the trueness - to - type of the genetic resources based on pomological and molecular characteristics . Over the years from 2009 to 2021 , several projects were carried out to take an inventory of the germplasm collections in the apple ( Malus ×domestica ) network of the German Fruit Genebank . In a first step , at least two knowledgeable experts of the German Pomological Association characterized accessions pomologically . In a second step , a DNA fingerprint analysis was used for the molecular characterization . The DNA fingerprint analysis utilized a set of 17 simple sequence repeat ( SSR ) markers and 8 reference genotypes recommended by the European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources ( ECPGR ; http://www.ecpgr.cgiar.org/ ) Malus / Pyrus working group and was performed by Microsynth ecogenics GmbH ( Balgach , Switzerland ) . 8,184 samples ( fruits/ leaves ) of apple trees belonging to the German Fruit Genebank from eight network collections were investigated . 1,404 different fingerprints in correspondence to cultivars could be estimated for apple .
Title : 
 Erste Bodenzustandserhebung Landwirtschaft – Kerndatensatz 

 Abstract : 
 Die Bundesregierung hat sich i m Rahmen von internationalen Vereinbarungen zum Klimaschutz dazu verpflichtet , nationale anthropogene Treibhausgasemissionen zu berichten . Hierzu zählen auch Emissionen , die durch Vorratsänderungen von organischem Bodenkohlenstoff verursacht werden . Zudem ist die organische Bodensubstanz ein zentraler Indikator für Bodenfruchtbarkeit . Um die Vorräte an organsicher Bodensubstanz und erklärende Kenngrößen erstmalig flächendeckend und repräsentativ für Deutschland zu erheben , wurde das Thünen Institut für Agrarklimaschutz vom Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft mit der Durchführung der ersten Bodenzustandserhebung Landwirtschaft beauftragt . I m Projektzeitraum 2009 - 2018 ( Jacobs et al . , 2018 ) wurden 3104 Standorte in einem Raster von 8x8 km beprobt . Der hier veröffentlichte Kerndatensatz umfasst die wichtigsten in Labor und Feld erhobenen Daten der Bodenzustandserhebung Landwirtschaft ( BZE - LW ) . Der Datensatz besteht aus drei verschiedenen Teilen mit dazugehörigen readme - Dateien zur Erläuterung der Parameter : LABORDATEN.xlsx : Dieser Teildatensatz enthält alle relevanten Laborergebnisse . STANDORT.xlsx : Dieser Teildatensatz enthält die wichtigsten allgemeinen Informationen über den Beprobungszeitpunkt , den Standort , den beprobten Bodentyp und die Lage des Bodenprofils i m Relief . HORIZONTDATEN.xlsx : Dieser Teildatensatz enthält die Horizontabfolge der angetroffenen Bodenprofile , sowie einige wichtige beschreibende Parameter . Sowohl in STANDORT.xlsx , als auch in HORIZONTDATEN.xlsx entstammen zahlreiche Parameter der deutschen Bodenkundlichen Kartieranleitung ( Ad - Hoc - Ag Boden , 2005 ) und sind hier nicht näher erläutert . Einzelne Parameter , wie Bodenart oder Karbonatgehalt bzw . Karbonatklasse sind sowohl in LABORDATEN.xlsx als auch in HORIZONTDATEN.xlsx gelistet und können durch unterschiedliche Verfahren ( Kartiererschätzung / Messung ) leicht voneinander abweichen . Methodische Einzelheiten sind i m Thünen Report 64 nachzulesen . Quellenverzeichnis Ad - Hoc - Ag Boden ( 2005 ) Bodenkundliche Kartieranleitung . E.Schweizerbart'sche Verlagsbuchhandlung , Hannover . Jacobs , A. , Flessa , H. , Don , A. , Heidkamp , A. , Prietz , R. , Dechow , R. , Gensior , A. , Poeplau , C. , Riggers , C. & Schneider , F. ( 2018 ) Landwirtschaftlich genutzte Böden in Deutschland : Ergebnisse der Bodenzustandserhebung . Thünen Report 64 .
Title : 
 Durchschnittliche z - Werte der Dimensionsindices für alle Untersuchungslandkreise und -gemeinden 

 Abstract : 
 Wir analysieren sozioökonomische Unterschiede zwischen den untersuchten Landkreisen und Gemeinden , die wir als integrationsrelevant annehmen . Dabei werden die jeweiligen Ausgangsbedingungen in den acht von Ager und Strang ( 2008 ) identifizierten Integrationsdimensionen anhand von 20 Indikatoren ermittelt und verglichen . Die verwendeten Indikatoren wurden zu acht Dimensionen zusammengefasst und entsprechend den Gemeinden sowie für den angehörigen Landkreis als z - transformierte Werte dargestellt . Die Dimensionen werden farblich dargestellt .
Title : 
 Calculations of gaseous and particulate emissions from German agriculture 1990 - 2019 : Input data and emission results 

 Abstract : 
 In international conventions Germany has committed to the mitigation of emissions of greenhouse gases and air pollution . These international regulations ( protocols etc . ) are the UN Framework Convention on Climate Change ( UNFCCC ) , the UNECE Convention on Long - Range Transboundary Air Pollution ( CLRTAP ) , and within the European Union the Directive of the European Parliament and of the Council on national emission ceilings for certain atmospheric pollutants ( NEC Directive ) . These conventions require annual calculations of the emissions of the respective gases and air pollutants . The results have to be documented in an emission inventory and to be reported to the organisations in charge . The data file contains input data and results of the calculation of gas and particulate emissions from German agriculture for Germany and the federal states in the years 1990 - 2019 . In this context the sector Agriculture comprises the emissions from animal husbandry , the use of agricultural soils and anaerobic digestion of energy crops . As required by the guidelines , emissions from activities preceding agriculture , from the use of energy and from land use change are reported elsewhere in the national inventories .
Title : 
 Pkw- , fußläufige- und ÖPNV - Erreichbarkeit des nächsten Jobcenters in den Untersuchungslandkreisen 

 Abstract : 
 Oft wird angenommen , dass ländliche Räume über Wohnraum verfügen , um Geflüchtete dezentral unterzubringen . In Abhängigkeit vom konkreten Wohnort kann es aber sein , dass dort wichtige Infrastrukturen nur schwer erreicht werden können , was negative Auswirkungen auf die Teilhabechancen der Betroffenen haben kann . Daher haben wir für die Projektregionen die Erreichbarkeit ausgewählter Infrastrukturen mittels verschiedener Verkehrsträger mit dem Thünen - Erreichbarkeitsmodell analysiert . Die Abbildung zeigt exemplarisch , wie sich innerhalb der Untersuchungsregionen die Erreichbarkeit des nächsten Jobcenters darstellt . Je blauer , umso kürzer die Reisezeit , je oranger , umso länger . Es zeigen sich deutliche Erreichbarkeitsunterschiede in Abhängigkeit vom nutzbaren Verkehrsträger sowie innerhalb der Regionen in Abhängigkeit vom konkreten Wohnort . Die Ergebnisse für die restlichen i m Projekt untersuchten Infrastrukturen können i m Thünen Working Paper 122 ( Neumeier 2019 ) eingesehen werden , auf das über folgenden Link zugegriffen werden kann : https://literatur.thuenen.de/digbib_extern/dn061014.pdf
Title : 
 Holzfaserdämmstoffplatte Trockenverfahren ( Durchschnitt DE ): ÖKOBAUDAT Version 2023 - I vom 15.06.2023 

 Abstract : 
 Repräsentativer Ökobilanzdatensatz für Holzfaserdämmstoffplatte Trockenverfahren gemäß EN 15804:2012+A2:2019 Methode : ISO EN 14040:2006 , EN 15804:2012+A2:2019 Dateiformat : ILCD - Format und EPD - Datenformaterweiterungen v1.2 ÖKOBAUDAT UUID : 5488d3f3 - 1e39 - 4a71 - b357 - ef605b65ed9c Empfohlene Zitierung : Janke S , Möller F , Rüter S ( 2023 ) Holzfaserdämmstoffplatte Trockenverfahren ( Durchschnitt DE ) , In : ÖKOBAUDAT , Version 2023 - I vom 15.06.2023 , Bundesministerium für Wohnen , Stadtentwicklung und Bauwesen ( BMWSB ) , www.oekobaudat.de
Title : 
 Oriented Strand Board ( Durchschnitt DE ): ÖKOBAUDAT Version 2023 - I vom 15.06.2023 

 Abstract : 
 Repräsentativer Ökobilanzdatensatz für Oriented Strand Board gemäß EN 15804:2012+A2:2019 Methode : ISO EN 14040:2006 , EN 15804:2012+A2:2019 Dateiformat : ILCD - Format und EPD - Datenformaterweiterungen v1.2 ÖKOBAUDAT UUID : aab0ed28 - e5b0 - 43d6 - a932 - 4cdc4770c518 Empfohlene Zitierung : Janke S , Rüter S ( 2023 ) Oriented Strand Board ( Durchschnitt DE ) , In : ÖKOBAUDAT , Version 2023 - I vom 15.06.2023 , Bundesministerium für Wohnen , Stadtentwicklung und Bauwesen ( BMWSB ) , www.oekobaudat.de
Title : 
 Data set : Comparison of two different experimental environments for resistance screenings for leafhopper - transmitted wheat dwarf virus in wheat 

 Abstract : 
 Wheat dwarf virus is an important pathogen in wheat and other cereals . Evaluation of tolerant / resistant genotypes was previously based on inoculation with virus - bearing leafhoppers and subsequent phenotyping in gauze houses under semi - field conditions . Within an improved procedure , plants are inoculated in the greenhouse under an infection hood and subsequently planted out in gauze houses . To compare the two methods , temperature profiles were established for both variants ( 2- Temperature profile ) and the optimal inoculation time for inoculation under an infection hood in the greenhouse was determined ( 3 - Inoculation time ) . In addition , a test panel of 80 genotypes ( 1 - plant material ) was phenotyped for both variants for germination rate ( 4 - Germination rate ) , infection status , symptom score and relative virus titer ( 5- Gauze house , 6 - Inoculation hood ) . The methods used to generate the data are described within Pfrieme , A.K. et al . : Comparison of two different experimental environments for resistance screenings for leafhopper - transmitted wheat dwarf virus in wheat . J. Plant Dis . Prot . 2023 .
Title : 
 Dataset from the evaluation of resistance / susceptibility of Malus genetic resources to apple blotch disease ( Diplocarpon coronariae ) 

 Abstract : 
 The dataset contains the field evaluation data and data from two artificial inoculation experiments for the evaluation of Malus genetic resources for apple blotch disease . Apple blotch , caused by the fungus , Diplocarpon coronariae , is an economically important disease in organic apple production in Europe . The disease , which occurs worldwide , was first described on leaves of Malus coronaria in Wisconsin , USA . Symptoms of apple blotch are black spots on apple leaves followed by leaf chlorosis and finally severe defoliation before fruit harvest . This weakens the physiological condition of the host , resulting in long - term reduced tree vigour and decreased yields . Currently , apple blotch appears in apple - growing regions in South Germany , Switzerland , Southern Austria and Northern Italy . The only effective method to control the disease is the application of fungicides , which is restricted in organic production . Cultivation of apple blotch - resistant cultivars is a desirable strategy to control the disease but little is known about the resistance of Malus genetic resources . 
  We evaluated the Malus wild species accessions of the gene bank collection from the Julius Kühn - Institut for field incidence of apple blotch ( Occurence of D. coronariae JKI 2014_15_16_18.csv ) and leaf fall ( Leaf fall wild species JKI 2015_16_18.csv ) over a time period of four years . To confirm the field observations , only leaves of accessions without symptoms were tested by artificial inoculation with spores of D. coronariae in a laboratory assay . The necrotic leaf area was measured 14 days post inoculation ( dpi ) using the leaf doctor application ( Artificial inoculation D. coronariae_wild species.csv ) . Most of the evaluated cultivars were susceptible and developed symptoms after inoculation with D. coronariae . Information about the resistance / susceptibility of Malus genetic resources to apple blotch is still insufficient . The data obtained will provide insight into potential resistance donors , which can be used in future breeding programs .
Title : 
 Holzfaserdämmstoff flexible Matte ( Durchschnitt DE ): ÖKOBAUDAT Version 2023 - I vom 15.06.2023 

 Abstract : 
 Repräsentativer Ökobilanzdatensatz für Holzfaserdämmstoff flexible Matte gemäß EN 15804:2012+A2:2019 Methode : ISO EN 14040:2006 , EN 15804:2012+A2:2019 Dateiformat : ILCD - Format und EPD - Datenformaterweiterungen v1.2 ÖKOBAUDAT UUID : ee0c4b18 - f9c9 - 44d1 - 8766 - 36db08856a2f Empfohlene Zitierung : Janke S , Möller F , Rüter S ( 2023 ) Holzfaserdämmstoff flexible Matte ( Durchschnitt DE ) , In : ÖKOBAUDAT , Version 2023 - I vom 15.06.2023 , Bundesministerium für Wohnen , Stadtentwicklung und Bauwesen ( BMWSB ) , www.oekobaudat.de
Title : 
 Durchschnittliche bevölkerungsgewichtete Wegezeit in den Untersuchungslandkreisen und ausgewählten kreiseigenen Gemeinden , differenziert nach Verkehrsträgern , in Minuten 

 Abstract : 
 Oft wird angenommen , dass ländliche Räume über Wohnraum verfügen , um Geflüchtete dezentral unterzubringen . In Abhängigkeit vom konkreten Wohnort kann es aber sein , dass dort wichtige Infrastrukturen nur schwer erreicht werden können , was negative Auswirkungen auf die Teilhabechancen der Betroffenen haben kann . Daher haben wir für die Projektregionen die Erreichbarkeit ausgewählter Infrastrukturen mittels verschiedener Verkehrsträger mit dem Thünen - Erreichbarkeitsmodell analysiert . Um die globale Erreichbarkeitssituation in den einzelnen Projektregionen abzuschätzen , haben wir die Erreichbarkeit folgender Infrastrukturen zu einem Index „ mittlere bevölkerungsgewichtete Erreichbarkeit “ zusammengefasst : Öffentliche Apotheken , Hausarzt , Kinderarzt , Zahnarzt , Krankenhaus , Supermärkte und Discounter , Kindergarten , allgemeinbildende Schulen ( Grundschule , Schulen mit Sekundarstufe I , und II ) , Unterzentrum , Mittel- und Oberzentrum , Haltestelle des öffentlichen Verkehrs ( ÖPNV ) . Das Ergebnis ist in der Tabelle dargestellt . Es lässt sich erkennen , dass es sowohl zwischen den Untersuchungslandkreisen als auch den Untersuchungsgemeinden nur wenige nennenswerte Erreichbarkeitsunterschiede innerhalb einer Verkehrsmittelkategorie gibt . Die besten Erreichbarkeiten ergeben sich für Bürger*innen , die einen Pkw nutzen können , gefolgt von denjenigen , die den ÖPNV nutzen können . Die Ergebnisse für die restlichen i m Projekt untersuchten Infrastrukturen können i m Thünen Working Paper 122 ( Neumeier 2019 ) eingesehen werden , auf das über folgenden Link zugegriffen werden kann : https://literatur.thuenen.de/digbib_extern/dn061014.pdf
Title : 
 Massivholzparkett ( Durchschnitt DE ): ÖKOBAUDAT Version 2023 - I vom 15.06.2023 

 Abstract : 
 Repräsentativer Ökobilanzdatensatz für Massivholzparkett gemäß EN 15804:2012+A2:2019 Methode : ISO EN 14040:2006 , EN 15804:2012+A2:2019 Dateiformat : ILCD - Format und EPD - Datenformaterweiterungen v1.2 ÖKOBAUDAT UUID : bbbae8e3 - 3023 - 42b1 - a58b-3cae9d482e10 Empfohlene Zitierung : Janke S , Rüter S ( 2023 ) Massivholzparkett ( Durchschnitt DE ) , In : ÖKOBAUDAT , Version 2023 - I vom 15.06.2023 , Bundesministerium für Wohnen , Stadtentwicklung und Bauwesen ( BMWSB ) , www.oekobaudat.de
Title : 
 Dataset : Identification and validation of QTL for WDV ( Wheat dwarf virus ) resistance in wheat ( Triticum aestivum ) Version 1 

 Abstract : 
 In this version one we added a description for chromosome numbers in the readme sheet of the xlsx - file . In addition , a correction of the the unit in the column ‘ position ’ of 3 - Genotypic data was made . Wheat dwarf virus ( WDV ) causes high yield losses in wheat and other cereals . To date , there is little known about WDV resistant / tolerant varieties and no known information about genomic regions responsible for resistance is available . To identify the relevant genes , a panel of 500 wheat accessions ( 1 - Plant material ) was phenotyped after artificial inoculation in gauze houses for virus titer , infection rate , plant height , and yield parameters compared to healthy controls ( 2 - Phenotypic data ) . In addition , 85 T. aestivum - Ae . tauschii introgression lines , containing different chromosome segments of Ae . tauschii , were tested via greenhouse inoculation tests . Accessions with low susceptibility to WDV were found in domesticated wheats and wild relatives . Genome - wide association studies ( GWAS ) of a subpanel comprising 250 hexaploid wheat cultivars genotyped with the 15k iSelect chip ( 3 - Genotypic data ) identified quantitative trait loci ( QTL ) for partial resistance . To validate the QTL , biparental SSD ( Single Seed Descent ) and DH ( Double - Haploid ) populations were screened for WDV resistance and genotyped using the 25k iSelect SNP chip ( 5 - Phenotypic and genotypic data of biparental populations ) .