Procédé de reconstruction d’un spectre de masse, ledit procédé comprenant les étapes suivantes : - acquisition (1010) d’une pluralité de spectres de masse mesurés sur un échantillon ionisé comprenant au moins un ion précurseur et des ions fragments, - détermination (1020) d’une pluralité de séries de valeurs d’abondance de l’échantillon ionisé à partir de la pluralité de spectres de masse, chaque série de valeurs d’abondance de l’échantillon ionisé étant déterminée à partir de la pluralité de spectres de masse, chaque série de valeurs d’abondance comprenant N valeurs d’abondance où N est un nombre entier supérieur ou égal à deux ; - arrangement (1030) de la pluralité de séries de valeurs d’abondance en paires de séries de valeurs d’abondance, chaque paire de séries de valeurs d’abondance comprenant une première série de valeurs d’abondance et une deuxième série de valeurs d’abondance, - pour chaque paire de séries de valeurs d’abondance, calcul (1040) d’un score de correspondance entre la première série de valeurs d’abondance et la deuxième série de valeurs d’abondance, de façon à obtenir des scores de correspondance pour toutes les paires de séries de valeurs d’abondance, les scores de correspondance fournissant une carte de score de correspondance entre toutes les paires de séries de valeurs d’abondance, - détermination (1060), en fonction d’un ratio masse sur charge, d’au moins un ion précurseur et des ions fragments associés à chaque ion précurseur déterminé, par application d’une méthode de regroupement à la carte de score de correspondance calculée, - reconstruction (1070) d’un spectre de masse individuel de chaque ion précurseur déterminé et de chacun des ions fragment associés à partir de la carte de score de correspondance. Procédé selon la revendication 2, dans lequel l’étape de détermination d’une série de valeurs d’abondance comprend la détermination d’une série de plages de valeurs de ratio de masse sur charge pour la pluralité de spectres de masse mesurés de taille NxM avec M un entier supérieur à 1, et pour chaque spectre de masse de la pluralité de spectres de masse, une étape d’intégration de valeurs d’abondance appartenant à une même plage de valeurs de ratio masse sur charge du spectre de masse considéré, pour fournir, pour chaque plage de valeurs de ratio masse sur charge du spectre considéré, une valeur d’abondance intégrée associée à un ratio masse sur charge, les valeurs d’abondance intégrées sur la série de plages de valeurs de ratio de masse sur charge formant une série de valeurs d’abondance de l’échantillon ionisé. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 2, dans lequel le score de correspondance est basé sur au moins un des éléments suivants : - une information mutuelle entre la première série de valeurs d’abondance et la deuxième série de valeurs d’abondance, ladite information mutuelle étant basée sur une entropie de la première série de valeurs d’abondance et sur une entropie de la deuxième série de valeurs d’abondance ; et/ou - une corrélation entre la première série de valeurs d’abondance et la deuxième série de valeurs d’abondance. Procédé selon la revendication 3, dans lequel, pour l’information mutuelle, l’entropie de la première série de valeurs d’abondance est une entropie normalisée par un premier paramètre d’invariance fonction d’une première valeur médiane déterminée sur cette première série de valeurs d’abondance et l’entropie de la deuxième série de valeurs d’abondance est une entropie normalisée par un deuxième paramètre d’invariance fonction d’une deuxième valeur médiane déterminée sur cette deuxième série de valeurs d’abondance . Procédé selon l’une quelconque des revendications 3 à 4, dans lequel, le score de correspondance étant basé sur une information mutuelle, le procédé comprend une étape d’estimation de l’entropie de la première série de valeurs d’abondance et une étape d’estimation de l’entropie de la deuxième série de valeurs d’abondance en utilisant un algorithme des k plus proches voisins. Procédé selon la revendication 5, dans lequel l’algorithme des k plus proches voisins est appliqué à un seul voisin. Procédé selon l’une quelconque des revendications 3 à 6, dans lequel lorsque au moins deux scores de correspondance basés sur deux éléments différents sont calculés à l’étape de calcul, plusieurs cartes de score sont fournies à la suite de l’étape de calcul, ledit procédé comprenant en outre, pour chaque carte de score, une étape de filtrage (1050) de ladite carte de score en fonction d’un contraste de la carte de score considérée. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 7, comprenant en outre une étape de traitement (1062) de la carte de score avant application de la méthode de regroupement, ladite étape de traitement utilisant au moins un des algorithmes suivants : - algorithme de standardisation, - algorithme de traitement des éléments diagonaux de la carte de score, - application d’une fonction carrée. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 8, dans lequel la carte de score est une matrice à deux dimensions, la méthode de regroupement déterminant l’au moins un ion précurseur et ses ions fragments associés à partir des scores de correspondance situés en dehors d’une diagonale de la carte de score. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 9, dans lequel la méthode de regroupement utilise au moins un algorithme d’apprentissage non supervisé. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 10, dans lequel la méthode de regroupement est basée sur au moins un des algorithmes suivants : - un algorithme de classification ascendante hiérarchique, - un algorithme des k plus proches voisins, - un algorithme des k-moyennes, - un algorithme d’incorporation des voisins à distribution stochastique. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 11, comprenant en outre, après l’étape de reconstruction (1070), une étape d’analyse (1090) du spectre de masse individuel de l’ion précurseur déterminé et des ions fragments associés pour caractériser la composition chimique de l’ion précurseur déterminé et la composition chimique des ions fragments associés à l’ion précurseur considéré. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 12, dans lequel le procédé comprend une étape de traitement (1015) des spectres de masse acquis comprenant au moins un des calculs suivants : - un filtrage du spectre de masse considéré par un noyau gaussien ou normal, - une normalisation du spectre de masse considéré, - un lissage du spectre de masse considéré, - un retour à la ligne de base. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 13, dans lequel le procédé comprend une étape de traitement (1025) des séries de valeurs d’abondance comprenant au moins un des calculs suivants : - une filtrage de la série de valeurs d’abondance donnée par une filtre de Kalman; - un filtrage de la série de valeurs d’abondance donnée par un filtre de Fourier, - un filtrage par moyenne glissante de la série de valeurs d’abondance donnée. Procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 14 comprenant une étape d'acquisition comprimée pour réduire le nombre d’acquisition.