INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
Dans la réalisation première, l’invention utilise des données de Reality Capture qui sont générées pour être utilisées en temps réel par une unité de contrôle. L’exemple typique de ce genre de réalisation est une voiture autonome de niveau 3 et supérieur. De telles voitures utilisent largement des LIDAR et génèrent jusqu’à 3 gigaoctet par seconde de données de Reality Capture [Hein17]. Mais, dans les conditions actuelles de l’état de l’art, elles ne les valorisent pas les données au-delà de leur usage propre hormis pour des questions de recherche. Un système de transmission sans fil est rattaché au dispositif de contrôle. En fonction des conditions, le système de contrôle peut rentrer dans un mode d’évitement voir même dans un mode de repli s’il n’est plus en capacité de gérer ces conditions. Lorsque cela arrive, le système transmet l’ensemble des données de Reality Capture qu’il vient de traiter à une unité de traitement distante. Cette dernière va fusionner les données reçues suivant une des nombreuses techniques connues de l’homme de l’art. Une variante consiste à ajouter une unité de stockage continue pour pouvoir envoyer les données reçues sur une durée D juste avant le déclanchement de l’envois. Une autre variante consiste à ajouter une unité de traitement pour ne faire parvenir à l’unité de traitement à distance que des données de Reality Capture utiles à la fusion. Il est alors possible de réduire encore plus l’empreinte environnementale en fournissant des instructions de traitement et/ou des conditions de déclenchement de la transmission en exploitant un moyen de télécommunication bidirectionnel entre la partie embarquée sur l’hôte et l’unité de traitement distante.
Cette première méthode de réalisation est liée à l’hôte de manière plus ou moins forte. Dans sa version la plus liée, tout est intégré dans dispositif contrôlant l’hôte. Et dans sa version la moins liée le dispositif est branché en parallèle du flux de données de Reality Capture et le déclanchement du transfert se fait sur l’alarme d’activation de l’ABS ou de l’ESP. De manière plus générale, la version la moins liée à l’hôte utilise ses propres capteurs et n’utilise que le flux de données de Reality Capture qui sont générées par le système hôte pour son propre usage. Il se compose d’une unité de traitement avec de la mémoire, d’un moyen de transmission avec l’unité de traitement distant et d’un ou plusieurs capteurs capables de détecter des comportements anormales du système hôte. Il s’agit typiquement d’accéléromètres lorsque le système hôte est un véhicule. Toute variation d’accélération trop importante va déclencher le transfert à l’unité de traitement hôte. Un tel dispositif peut également bénéficier de l’utilisation d’un moyen de transmission bidirectionnel. L’unité de traitement à distance ou une intelligence artificielle pouvant alors fournir des conditions de validation de la transmission telle qu’une signature sur le flux de données de Reality Capture.
Dans un autre mode de réalisation, le signal y est déterminé comme décrit précédemment mais quantifié par RVQ selon le principe de codage de y dans le bloc 500 avec des dictionnaires C’ k en dimension tronquée D T . Dans ce cas, une fois les blocs 701, 702, 703, 710, 711, 712 prédéterminés, les dictionnaires peuvent être déterminés par un apprentissage selon les principes de la quantification RVQ. Dans ce cas le train binaire b est constitué des sous-indices associés à chaque dictionnaire RVQ.
Dans des variantes, on pourra également prendre comme bloc 705 une quantification scalaire uniforme suivie d’un codage entropique.
Un exemple de mise en œuvre est donné par exemple dans l’article de Johannes Ballé, Valero Laparra, Eero P. Simoncelli, End-to-end Optimized Image Compression, Proc. ICLR 2017. Au lieu de quantifier l’espace latent d’un autoencodeur (ici d’un signal d’image), on prend ici le codage de l’espace latent transformé y. On applique à y quantification scalaire uniforme d’un pas prédéterminé puis on code les indices entiers de quantification par codage arithmétique.
Un avantage de l’invention est ici que le codage arithmétique peut exploiter la décomposition en valeurs propres associé à la détermination de la transformation (bloc 704). On ne retient que les D T premières valeurs puisque y est ici défini après troncature. Ainsi le modèle de probabilité pour le codage entropique se dérive facilement en supposant une distribution par exemple gaussienne ou laplacienne de y avec des variances données par composante respectivement par .
La décrit un deuxième mode de réalisation d’un dispositif de décodage selon l’invention ainsi qu’un deuxième mode de réalisation d’un procédé de décodage selon l’invention.
Cette figure montre en particulier un module de décodage (800) d’une représentation latente (ou espace latent) compris dans un décodeur de signal audio tel que décrit en référence à la (bloc 110). Ainsi, le bloc de décodage de l’espace latent (bloc 111) de la est remplacé par le module de décodage de l’espace latent (bloc 800) décrit à présent.
Le train binaire I reçu pour la trame courante est démultiplexé (bloc 801).
Dans le bloc 802, on obtient le vecteur de correction de la même façon qu’au codeur dans le bloc 701. Ce vecteur de correction issu du bloc 802 peut être :
a) une moyenne prédéterminée des variables latentes de l’espace latent ; b) le vecteur latent décodé à l’issue d’un premier étage de quantification vectorielle inverse RVQ selon le bloc de décodage 301 de la pour un décodage avec K=1, ou c) de façon plus générale, le vecteur latent décodé à l’issue d’un nombre prédéterminé d’étages RVQ de quantification vectorielle inverse d’un nombre prédéterminé plus grand que 1, par exemple K=2, selon par exemple le décodage des blocs 301 et 302 de la .
Dans les cas b) et c), le bloc 802 correspond alors respectivement à un ou plusieurs étages de décodage D1, D2,… , décrits pour la méthode EnCodec et représentés à la (blocs 301, 302, …). Ces blocs de quantification inverses ne sont pas représentés ici sur la .
Ces étages de décodage utilisent le budget de bits indiqué par l’indice de quantification m sur R M bits transmis dans le bitstream et décodé en 802.
Le bloc 803 de la figure 8 décode le vecteur latent transformé à partir du train binaire b. On ne décrit pas plus en détails cette étape de décodage, elle correspond au décodage en fonction de la mise en œuvre du bloc 705, avec comme exemple de variantes : AVQ, PVQ, RVQ, ou quantification scalaire avec codage entropique.
Pour remplacer les éléments tronqués et compléter les trames de l’espace latent transformé obtenu, des 0 peuvent être ajoutés à l’étape de transformation T du bloc 805. Dans une variante de réalisation, une injection de bruit, par exemple de type noise substitution connue de l’homme de métier, du bloc 804, pourra être prévu.
On applique ensuite, dans le bloc 805, une transformation linéaire, par exemple la transformation KLT/PCA inverse au vecteur latent transformé décodé.
La matrice de rotation U stockée en 712 et obtenue par apprentissage permet d’appliquer la transformée inverse selon l’équation :
représentant un vecteur latent décodé intermédiaire et ext(.) représentant l’opération d’extension de la dimension D T à la dimension D par ajout de (D-D T ) zéros à la fin du vecteur. Ce vecteur est ensuite mis à l’échelle par composante (bloc 806), de la même façon que dans le bloc 703 de la figure 7, pour obtenir le vecteur .
La plateforme 100 comprend en outre une quatrième interface 306 apte à communiquer avec la première base de données 110.
La plateforme 100 comprend en outre une cinquième interface 307 apte à communiquer avec la deuxième base de données.
En variante, la première base de données 110 et/ou la deuxième base de données 111 peuvent être intégrées à la plateforme 100, notamment dans la mémoire 302, auquel cas la plateforme 100 ne comprend pas la quatrième interface 306 et/ou la cinquième interface 307.
La plateforme 100 comprend une sixième interface 308 agencée pour communiquer avec le registre distribué 120.
Procédé de détermination de l’état d’un individu par rapport à des états de référence Le domaine technique de l’invention est le traitement de données, afin d’évaluer un état d’un individu par rapport à des états de référence définis à partir d’une population de référence. Plus précisément, le domaine technique concerne les techniques d’apprentissage de variété pour la classification d’individus à partir de données physiologiques établies pour chacun d’entre eux.
ART ANTERIEUR Les examens biologiques ou médicaux effectués sur des patients sont destinés à un praticien à des fins d’aide au diagnostic. Une pratique usuelle consiste à comparer des caractéristiques physiologiques, déterminées sur un patient, à des caractéristiques physiologiques dites de référence, établies sur une population de référence considérée comme saine.
La numérisation des examens permet la constitution d’importantes bases de données pour différents types d’examens, qu’il s’agisse de résultats d’analyse biologique ou de données obtenues par des modalités d’imagerie ou d’autres types de mesures réalisées sur un patient à des fins d’aide au diagnostic. Ces dernières peuvent être par exemple des mesures électrophysiologiques de type ECG (Electrocardiogramme) ou EEG (Electroencéphalogramme).
La constitution des bases de données permet de déterminer, avec une meilleure précision statistique, les caractéristiques physiologiques de référence. Elle permet également une meilleure individualisation des valeurs de référence : on peut prendre en compte des données contextuelles (âge, poids, taille, sexe) ou des données physiologiques résultant d’autres types d’examen pour affiner les caractéristiques physiologiques de référence.
La publication Attyé et al « Tractlearn : a geodesic learning framework for quantitative brain bundles” décrit le recours à un algorithme de réduction de dimensionnalité par apprentissage de variété, usuellement désigné par le terme « manifold learning », pour l’analyse de structures cérébrales à partir de caractéristiques résultant d’imagerie par résonnance magnétique nucléaire (IRM).
Les inventeurs ont perfectionné le procédé décrit dans cette publication, afin d’améliorer la sensibilité et la spécificité de l’analyse de données physiologiques mesurées sur un patient.
Un premier objet de l’invention est un procédé de traitement de données physiologiques d’un individu, chaque donnée physiologique résultant de mesures effectuées sur l’individu, le procédé comportant les étapes suivantes : a) en fonction des données physiologiques de l’individu, assignation de coordonnées, dites coordonnées d’origine, dans un espace d’origine, à l’individu, à chaque coordonnée d’origine étant attribué un rang; b) association de chaque coordonnée d’origine de l’individu, dans l’espace d’origine, à un espace latent de dimension inférieure à la dimension de l’espace d’origine ; c) projection de chaque coordonnée d’origine résultant de a) dans l’espace latent associé à ladite coordonnée, de façon à obtenir une coordonnée latente de l’individu dans ledit espace latent, et formation d’un vecteur latent dans l’espace latent associé à ladite coordonnée d’origine; d) application d’une fonction de régression au vecteur latent résultant de c), de façon à estimer une coordonnée d’origine, dans l’espace d’origine, pour chaque rang, la fonction de régression étant associée à l’espace latent associé à la coordonnée d’origine ; e) pour au moins un rang, comparaison des coordonnées d’origine l’individu résultant de d) et de a) et détermination d’un score de l’individu en fonction de la comparaison.
Le procédé peut être tel que dans b), l’espace latent associé à chaque coordonnée d’origine appartient à un ensemble d’espaces latents, l’association de chaque coordonnée d’origine à un espace latent étant effectuée en fonction du rang de ladite coordonnée ; dans c), les coordonnées latentes dans un même espace latent forment un vecteur latent ; d) comporte une application d’une fonction de régression dans chaque vecteur latent résultant de c) :
Le procédé peut être tel que chaque espace latent est déterminé à partir de données physiologiques établies sur des individus de référence, d’une population de référence, selon les étapes suivantes : i) assignation de coordonnées de référence à chaque individu de référence dans l’espace d’origine, chaque coordonnée de référence étant établie à partir d’une donnée physiologique résultant d’une mesure effectuée sur l’individu de référence ; ii) application d’un algorithme de réduction de dimensions aux coordonnées de référence de chaque individu de référence, de façon à définir, pour chaque individu de référence, des coordonnées latentes dans un espace latent, l’étape ii) étant mise en œuvre, lors d’une première itération, pour l’ensemble des rangs et, lors des itérations suivantes, pour les rangs non sélectionnés dans l’étape v) d’une itération précédente, les coordonnées latentes dans un même espace latent formant un vecteur latent; iii) pour chaque rang, application d’une fonction de régression à chaque vecteur latent, de façon à obtenir une estimation de la coordonnée d’origine pour ledit rang, dans l’espace d’origine; iv) comparaison des coordonnées d’origine de chaque individu de référence résultant des étapes (i) et (iii) de façon à obtenir, pour chaque rang, un indicateur de pertinence ; v) prise en compte d’une condition de sélection et sélection de rangs pour lesquels l’indicateur de pertinence satisfait à la condition de sélection ; vi) réitération des étapes ii) à v) pour les rangs non sélectionnés lors de v), la réitération étant effectuée jusqu’à l’atteinte d’un critère d’arrêt des itérations.
Selon une possibilité, l’étape c) comporte une application d’une fonction de régression à chaque vecteur latent dans l’espace latent, l’étape c) étant telle que deux fonctions de régression, appliquées à un même vecteur latent, et permettant l’estimation de deux coordonnées d’origine différentes, sont différentes.
Lors de la première itération, l’étape ii) peut comporter : ii-a) à partir des coordonnées des individus de référence dans l’espace latent, sélection des individus de référence représentatifs de la population de référence ; ii-b) répétition des étapes i) et ii) en ne prenant pas en compte les individus de référence sélectionnés lors de la sous-étape ii-b).
Il peut être nécessaire, en tant que besoin, d’ajuster le pH du milieu liquide de la biomasse brute, du lysat, du solubilisât et/ou du clarifiât pour obtenir le pH acide recherché pour l’étape de repos sur le clarifiât.
a ) Récolte de la biomasse
La biomasse selon l’invention est une biomasse d’algues rouges unicellulaires (ARU), plus particulièrement une biomasse de microalgues productrices de phycocyanines ayant une teneur élevée en glycogène.
Ces microalgues appartiennent à la classe des Cyanidiophyceae incluant les genres Galdieria , Cyanidium et Cyanidioschyzon. Préférentiellement, les microalgues sont du genre Galdieria.
Parmi les microalgues du genre Galdieria, on peut notamment citer les espèces Galdieria daedala , Galdieria maxima , Galdieria partita , Galdieria sulphuraria. Préférentiellement, la biomasse selon l’invention est une biomasse de Galdieria sulphuraria.
Les procédés de production de biomasse d’algues rouges unicellulaires (ARUs), et en particulier du genre Galdieria, sont bien connus de l’homme du métier. Dans le cadre de la présente invention, la culture des microalgues peut être réalisée par toute technique de culture connue, dans des contenants adaptés à la croissance des microorganismes aussi appelés réacteurs biologiques, bioréacteur ou fermenteur.
Selon l’invention, la biomasse d’algues rouges unicellulaires est obtenue à partir de microalgues cultivées de manière industrielle dans des réacteurs de grande capacité, de préférence à obtenir des moûts de fermentation comprenant de grandes densités de microorganismes. Dans le cadre de présente demande, on entend par « grandes densités » une quantité correspondant à plus de 50 g de matière sèche par litre de moût de fermentation, préférentiellement plus de 100 g par litre. Des exemples de cultures d’algues rouges unicellulaires sont décrits dans les demandes de brevet (WO2017/050917, WO2017/050918, WO2017/093345 et WO2019/228947). Il est entendu que l’homme du métier saura déterminer les paramètres et les conditions optimales pour la culture des microorganismes, telles que les conditions de température, éclairage, durée de culture ou encore nature et quantité des nutriments à apporter.
Le procédé selon l’invention comprend une étape a) de récolte de la biomasse.
Après culture des microorganismes et l’obtention d’une biomasse, celle-ci est récoltée pour obtenir une biomasse brute. La récolte des algues rouges unicellulaires peut être réalisée par toute technique connue de l’homme du métier, notamment par filtration, éventuellement gravimétrique ou sous pression réduite, décantation, précipitation suivie d’une filtration gravimétrique ou encore centrifugation.
Le procédé selon l’invention comprend une étape a) de récolte de la biomasse correspondant donc à la récupération du moût de fermentation suivie de la séparation des cellules de la biomasse d’au moins une partie du milieu de culture.
Cette étape permet l’obtention d’une biomasse brute. La biomasse brute ainsi récoltée peut en outre subir une étape de lavage, de préférence avec de l’eau, afin d’éliminer certaines impuretés solubles.
La biomasse brute obtenue après récolte et optionnellement après un ou plusieurs lavage comprend au moins 70% d’eau, et jusqu’à 90% d’eau, préférentiellement elle comprend de 75 à 88% d’eau.
Préférentiellement, la biomasse brute selon l’invention présente une teneur en matière sèche de 5 à 30% en poids par rapport au poids total de la biomasse brute, généralement encore préférentiellement de 10 à 25% en poids, plus préférentiellement de 10 à 20% en poids.
Aussi préférentiellement, la biomasse brute selon l’invention présente une concentration en C-phycocyanine comprise entre 3 et 12 %.
b ) Lyse cellulaire
Le procédé de traitement d’une biomasse d’algues rouge unicellulaires du genre Galdieria selon l’invention comprend une étape b) de lyse cellulaire de la biomasse brute de l’étape a) pour obtenir un lysat.
le procédé comprenant une étape de dégradation du glycogène par maintien au repos pendant au moins 2 heures de la biomasse brute et/ou du lysat et/ou du solubilisât et/ou du clarifiât durant laquelle le milieu liquide comprenant la glycogène est à pH acide.
La présente invention concerne aussi un extrait aqueux susceptible d’être obtenu par un procédé selon l’invention.
Avantageusement, le procédé selon la présente invention permet de diminuer voir même de supprimer l’ajout d’enzymes exogènes adaptées pour la dégradation du glycogène donc de diminuer l’ajout de substances devant être qualifiées d’additifs et/ou d’auxiliaires technologiques.
Également, le procédé selon l’invention s’applique avec des conditions de durée, température et pH des plus douces au plus drastiques et peut ainsi s’adapter à la stabilité des molécules d’intérêt à extraire.
: Concentrations en glucose libre dans des lysats de biomasse de Galdieria sulphuraria au cours du temps à pH 3,75 et à pH 6, à 37 °C sans ajout d’enzymes exogènes (SE : Sans Enzyme) et avec 1% d’enzymes exogènes dans le lysat (E : Enzyme).
: Concentrations en glucose libre dans des lysats de biomasse de Galdieria sulphuraria à température ambiante (« amb », i.e. 20°C) en absence d’enzymes exogènes et à différents pH en fonction du temps.
: Concentrations de glucose libre dans des lysats de biomasse de Galdieria sulphuraria à pH 3,75 à différentes températures, en présence ou en absence d’enzymes exogènes, en fonction du temps (SE : Sans Enzyme ; E : Enzyme).
: Concentrations de glucose libre dans des lysats de biomasse de Galdieria sulphuraria à pH 3,75 à différentes températures, en absence d’enzymes exogènes, en fonction du temps.
: Concentrations de glucose libre en fonction du temps dans un lysat et un solubilisât de biomasse de Galdieria sulphuraria à pH 3,75 à une température de 20°C en l’absence d’enzymes exogènes, et dans un lysat de biomasse de Galdieria sulphuraria à pH 3,75 en présence d’enzymes exogènes (SE : Sans Enzyme ; E : Enzyme).
Dans le cadre de la présente invention, le terme « biomasse » désigne un ensemble de cellules de microalgues, préférentiellement produites par fermentation dans un réacteur biologique. Ladite biomasse peut être vue comme une masse d’organismes unicellulaires.
La biomasse peut subir différent traitement et être une biomasse brute, une biomasse lysée, une biomasse décongelée et/ou une biomasse séchée.
Il est entendu dans le cadre de la présente demande que les propriétés de la biomasse correspondent à la moyenne des propriétés de l’ensemble des cellules constituant ladite biomasse, autrement dit, une biomasse lysée est une biomasse comprenant au moins 50% de cellules lysées par rapport au nombre total de cellules et une biomasse brute peut comprendre des cellules lysées en raison de l’étape de récolte sans être considérée comme une biomasse lysée tant que le nombre de cellules lysées sur le nombre de cellules non lysées reste minoritaire, i.e. inférieur à 50%.
L’expression « biomasse brute » désigne une biomasse obtenue après la récolte, i.e. après la récupération du moût de fermentation puis séparation des cellules d’au moins une partie du milieu de culture.
L’expression « biomasse lysée » ou « lysat » fait référence à une biomasse de microalgues dans laquelle au moins 50% des cellules sont lysées, préférentiellement au moins 70%, plus préférentiellement dans laquelle au moins 80%, 85%, 90%, 95%, jusqu’à 100% des cellules sont lysées.
PROCEDE DE DEGRADATION DU GLYCOGENE PRESENT DANS UNE BIOMASSE DE GALDIERIA DOMAINE DE L'INVENTION La présente invention concerne un procédé de traitement pour la dégradation du glycogène d’une biomasse d’algues rouges unicellulaires (ARU), particulièrement du genre Galdieria, et l’extrait aqueux ainsi obtenu.
Les algues rouges unicellulaires (URA), ou Rhodophytes, se caractérisent par la présence de pigments au sein de leurs cellules. En plus de la chlorophylle et des caroténoïdes, les algues rouges unicellulaires produisent des phycobiliprotéines. Ces pigments naturels issus de la photosynthèse sont divisés en quatre types : les allophycocyanines, les C-phycocyanines, les phycoérythrines et les phycoérythrocyanines.
Les phycocyanines présentent des propriétés bénéfiques pour la santé humaine et animale, et sont aujourd’hui utilisées dans de nombreux domaines comme l’industrie pharmaceutique, la cosmétique ou encore l’agroalimentaire.
Les microalgues appartenant à la classe des Cyanidiophyceae, et plus précisément aux genres Cyanidioschyzon , Cyanidium et Galdieria , sont particulièrement intéressantes pour la production de phycocyanines. La production des biomasses d’algues rouges unicellulaires est bien connue de l’homme du métier notamment pour la production de molécules d’intérêt, notamment la production de protéines comme les phycocyanines. Des procédés de production et d’extraction desdites phycocyanines sont décrits dans la littérature (WO2017/093345, WO2019/228947, WO2018/178334, WO2020/161280).
Cependant, les microalgues de cette classe, notamment du genre Galdieria, sont aussi connues pour avoir le glycogène comme sucre majeur de réserve. Ce glycogène est un polymère de glucoses α-(1 → 4) ramifié par des liaisons α-(1 → 6). Le glycogène de microalgues du genre Galdieria a la particularité de posséder une grande proportion de ces ramifications, à savoir environ de 7 à 18% de glucoses ramifiés distribués aléatoirement le long de la molécule. Cette structure moléculaire confère au glycogène une conformation globulaire le rendant alors soluble dans l’eau (Martinez-Garcia et al., Int J Biol Macromol. (2016) 89:12-8).