Procédé de détection d'une espèce cible, de type allergène, contaminante ou de nature frauduleuse dans un échantillon (ECH) pouvant comporter des inhibiteurs, caractérisé en ce qu'il comporte : Une étape (E2) d'attaque chimique par mélange dudit échantillon avec une solution corrosive (S_corr) en vue d'obtenir un extrait en solution (EX) ; Une étape (E4) d'ajout d'un premier tampon de précipitation (TP_1) audit extrait en solution obtenu pour obtenir un premier précipité (P_1) d'au moins une partie des inhibiteurs de réactions contenus dans ledit extrait en solution (EX) ; Une étape (E5) de filtration dudit extrait en solution contre un premier filtre (FT_1), en vue d'éliminer des premiers composés (C_1) autres que les acides nucléiques, issus dudit premier précipité (P_1), et de récupération d'un filtrat (F_1) après filtration, déchargé desdits premiers composés (C_1) ; Une étape (E6) d'ajout d'un deuxième tampon de précipitation (TP_2) audit filtrat (F_1) en vue d'obtenir un deuxième précipité (P_2) contenant des molécules d'ADN de l'espèces cible ; Une étape (E7) de filtration dudit filtrat contenant ledit deuxième précipité (P_2) contre un deuxième filtre (FT_2), en vue de séparer des deuxièmes composés (C_2) issus dudit deuxième précipité (P_2), ledit deuxième filtre (FT_2) étant choisi pour ne pas laisser passer lesdites molécules d'ADN précipitées de l'espèce cible ; Une étape (E9) d'élution des molécules d'ADN de l'espèce cible présente dans les deuxièmes composés issus du deuxième précipité (P_2) à travers le deuxième filtre (FT_2), par ajout d'un tampon d'élution (TE_1) choisi pour dissoudre lesdites molécules d'ADN, et de récupération d'un éluat (E_1) ; Une étape de détection des molécules d'ADN de l'espèce cible présentes dans ledit éluat (E_1) ; Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce qu'il comporte également une étape (E8) de lavage des deuxièmes composés (C_2) issus du deuxième précipité (P_2) par passage d'un tampon de lavage (TL_1) à travers le deuxième filtre (FT_2). Procédé selon la revendication 2, caractérisé en ce que le tampon de lavage (TL_1) est à base d'alcool ou d’alcool et d’eau, ou d'alcool, eau et sels. Procédé selon l'une des revendications 1 à 3, caractérisé en ce qu'il comporte une étape (E8) de séchage des deuxièmes composés (C_2) obtenus après filtration sur le deuxième filtre (FT_2). Procédé selon l'une des revendications 1 à 4, caractérisé en ce que la solution corrosive (S_corr) comporte un ou plusieurs des composants de la liste suivante : Urée, Sels de guanidine, Perchlorate ou hypochlorite de sodium, Potasse, Soude, Acide sulfurique, acide chlorhydrique, acide nitrique, Eau Oxygénée, Détergent ou Agent tensioactif (Tween, Triton, SDS, Tergitol), Chlorure de Sodium ou de Potassium. Procédé selon l'une des revendications 1 à 5, caractérisé en ce que le premier tampon de précipitation (TP_1) comporte un ou plusieurs des composants de la liste suivante : Acétate d'ammonium, Polyvinylpyrrolidone. Procédé selon l'une des revendications 1 à 6, caractérisé en ce que le deuxième tampon de précipitation (TP_2) est un alcool. Procédé selon la revendication 7, caractérisé en ce que l'alcool utilisé comme deuxième tampon de précipitation (TP_2) est l'éthanol ou l’isopropanol. Procédé selon l'une des revendications 1 à 8, caractérisé en ce que le tampon d'élution (TE_1) est choisi parmi l'eau et au moins un réactif utilisé pour la mise en œuvre d'une réaction d'amplification. Procédé selon l'une des revendications 1 à 9, caractérisé en ce que l'éluat (E_1) est injecté dans plusieurs chambres fluidiques en parallèle. Procédé selon l'une des revendications 1 à 10, caractérisé en ce que l'étape (E6) d'ajout du deuxième tampon de précipitation (TP_2) et les étapes suivantes sont mises en œuvre dans une carte microfluidique (CM).