Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel, de préférence des protéines, vitamines, minéraux, ou sucres, à partir d’une culture de microalgues vivantes comprenant les étapes de : Mise en culture des souches de microalgues jusqu’à obtenir une quantité de biomasse desdites microalgues de concentration comprise entre 1. 10 6 et 1.10 8 cellules/mL ; Séparation des microalgues obtenues à l’étape a. de leur milieu de culture ; Mélange des microalgues obtenues à l’étape b. dans de l’eau à un ratio compris entre 5% et 20% de microalgues en poids du mélange à une conductivité comprise entre 20 et 200 µS/cm ; Application au mélange obtenu à l’étape c. de champs électriques pulsés bipolaires ; Dilution du mélange obtenu à l’étape d. entre 2 et 5 fois dans de l’eau ou un tampon durant entre 1 h et 12 h ; Centrifugation du mélange obtenu à l’étape e. ; Récupération du surnageant de centrifugation comprenant lesdits composés d’intérêt nutritionnel ; Obtention de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon la revendication précédente, où les étapes b. et/ou f. sont réalisées par centrifugation à entre 1500 et 4000 g durant 5 à 20 minutes et à une température comprise entre 4 et 25°C. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon l’une quelconque des revendications précédentes, où l’étape d. est réalisée par application de 1 à 20 impulsions avec une durée d’impulsion de 1 à 2 ms, un voltage compris entre 0,5 et 6 kV/cm, une température comprise entre 4 et 25°C, et un débit de circulation des cellules algales dans la chambre d’impulsion de 10 à 100 mL/min. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon l’une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce qu’il comprend en outre une étape i. de concentration des composés d’intérêt nutritionnel obtenus à l’étape h. par des filtrations membranaires de 3 à 1000 kDa ou par l’usage de colonnes d’affinité. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon la revendication précédente, où ladite colonne d’affinité est une colonne à échange d’ion. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon la revendication 4, où l’étape i. est réalisée par utilisation d’une filtration membranaire entre 10 et 500 kDa. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon l’une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce qu’il comprend en outre une étape j. de séchage des composés d’intérêt nutritionnel obtenus à l’étape h. ou i., par lyophilisation, atomisation ou séchage, de préférence par atomisation ou lyophilisation. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon la revendication précédente, où l’étape j. est réalisée par Lyophilisation à une température comprise entre -20 et -80°C et une pression de 5 à 500 µbar ; ou Atomisation dans un flux d’air chaud à une température comprise entre 80°C et 300°C, de préférence entre 90°C à 220°C : ou Séchage à une température comprise entre 40 et 80°C, ou séchage sous pression. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel à partir d’une culture de microalgues vivantes selon l’une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que lesdites microalgues sont choisies parmi : Arthrospira platensis , Arthrospira maxima, Aphanizomenon Floes-aquae , la Chlorelle, Chlorella sp ., Chlorella vulgaris, Chlorella protothecoides , Chlorella sorokiniana , Chlorella pyrenoidosa , Euglena sp ., Euglena gracilis, Schizochytrium sp . Utilisation des composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel obtenus par le procédé selon l’une quelconque des revendications précédentes dans des produits alimentaires.