Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel, de préférence des protéines, vitamines, minéraux, ou sucres, à partir d’une culture de microalgues vivantes comprenant les étapes de : Mise en culture des souches de microalgues jusqu’à obtenir une quantité de biomasse desdites microalgues de concentration comprise entre 1. 10 6 et 1.10 8 cellules/mL ; Séparation des microalgues obtenues à l’étape a. de leur milieu de culture, de préférence par centrifugation à entre 1500 et 4000 g durant 5 à 20 minutes et à une température comprise entre 4 et 25°C ; Mélange des microalgues obtenues à l’étape b. dans de l’eau à un ratio compris entre 5 et 20% à une conductivité comprise entre 20 et 200 µS/cm ; Application au mélange obtenu à l’étape c. de champs électriques pulsés bipolaires, de préférence au nombre de 1 à 20 impulsions avec une durée d’impulsion de 1 à 2 ms, un voltage compris entre 0,5 et 6 kV/cm, une température comprise entre 4 et 25°C, et un débit de circulation des cellules algales dans la chambre d’impulsion de 10 à 100 mL/min, Dilution du mélange obtenu à l’étape d. entre 2 et 5 fois dans de l’eau ou un tampon durant entre 1 et 12h ; Centrifugation du mélange obtenu à l’étape e., de préférence à entre 1500 et 4000 g durant 5 à 20 minutes à une température comprise entre 4 et 25°C ; Récupération du surnageant de centrifugation comprenant lesdits composés d’intérêt nutritionnel ; Obtention de composés d’intérêt nutritionnel. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel selon la revendication précédente, caractérisé en ce qu’il comprend en outre une étape i. de concentration des composés d’intérêt nutritionnel obtenus à l’étape h. par des procédés membranaires de 3 à 1000 kDa ou par l’usage de colonnes d’affinité, de préférence de type colonne à échange d’ion, de manière encore plus préférée par l’utilisation d’une filtration membranaire entre 10 et 500 kDa. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel selon l’une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce qu’il comprend en outre une étape j. de séchage des composés d’intérêt nutritionnel obtenus à l’étape h. ou i., par : lyophilisation, de préférence à une température comprise entre -20 et -80°C et une pression de 5 à 500 µbar ; ou atomisation, de préférence dans un flux d’air chaud à une température comprise entre 80°C et 300°C, de préférence entre 90°C à 220°C. : ou séchage à une température comprise entre 40 et 80°C, ou séchage sous pression, de préférence par atomisation ou lyophilisation. Procédé d’extraction biocompatible de composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel selon l’une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que lesdites microalgues sont choisies parmi : Arthrospira platensis, Arthrospira maxima, Aphanizomenon Floes-aquae, la Chlorelle, Chlorella sp., Chlorella vulgaris, Chlorella protothecoides, Chlorella sorokiniana, Chlorella pyrenoidosa, Euglena sp., Euglena gracilis, Schizochytrium sp. Composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel tel qu’obtenus par le procédé selon l’une quelconque des revendications précédentes. Utilisation des composés hydrosolubles d’intérêt nutritionnel selon la revendication précédente dans des produits alimentaires.