Système électrochimique (1), comportant : un réacteur électrochimique (2), comportant un circuit de distribution cathodique, un circuit de distribution anodique et un circuit de refroidissement ; une ligne fluidique cathodique (Lc) de circulation d’un premier fluide réactif, raccordée à une entrée et à une sortie du circuit de distribution cathodique ; une ligne fluidique anodique (La) de circulation d’un deuxième fluide réactif, raccordée à une entrée et à une sortie du circuit de distribution anodique ; un dispositif de régulation thermique (10), comprenant : une ligne fluidique de circulation (Lr) d’un liquide caloporteur, raccordée à une entrée et à une sortie du circuit de refroidissement ; une pompe (11) et un échangeur de chaleur (12), situés sur la ligne fluidique de circulation (Lr) ; caractérisé en ce qu’il comporte un dispositif d’inertage (20) d’au moins l’un des fluides réactifs, comportant : une trompe à eau (21), comportant une entrée principale et une sortie raccordées à la ligne fluidique de circulation (Lr), et une entrée secondaire raccordée à la ligne fluidique cathodique (Lc) et/ou à la ligne fluidique anodique (La) ; au moins une vanne d’activation (Vic, Via), située en amont de l’entrée secondaire, de sorte que, lors de l’ouverture de la vanne d’activation (Via, Vic), la circulation du liquide caloporteur dans la ligne fluidique de circulation (Lr) provoque l’aspiration du fluide réactif hors de la ligne fluidique considérée (Lc, La) et donc hors du réacteur électrochimique (2). Système électrochimique (1) selon la revendication 1, dans lequel la ligne fluidique cathodique (Lc) comporte un conduit amont (Cc1) raccordé à l’entrée du circuit de distribution cathodique et muni d’une vanne amont (Vc1), et un conduit aval (Cc2) raccordé à la sortie du circuit de distribution cathodique et muni d’une vanne aval (Vc2), l’entrée secondaire de la trompe à eau (21) étant raccordée au conduit amont (Cc1) ou au conduit aval (Cc2) par un conduit (Cic) muni d’une vanne d’activation (Vic). Système électrochimique (1) selon la revendication 1 ou 2, dans lequel la ligne fluidique anodique (La) comporte un conduit amont (Ca1) raccordé à l’entrée du circuit de distribution anodique et muni d’une vanne amont (Va1), et un conduit aval (Ca2) raccordé à la sortie du circuit de distribution anodique et muni d’une vanne aval (Va2), l’entrée secondaire de la trompe à eau (21) étant raccordée au conduit amont (Ca1) ou au conduit aval (Ca2) par un conduit (Cia) muni d’une vanne d’activation (Via). Système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 3, dans lequel la sortie de la trompe à eau (21) est raccordée à l’entrée ou à la sortie du circuit de refroidissement. Système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 4, dans lequel la ligne fluidique de circulation (Lr) comporte un premier conduit (Cr1) et un deuxième conduit (Cr2) en parallèle l’un de l’autre et raccordés à la pompe (11), la trompe à eau (21) étant situé sur le premier conduit (Cr1), et le deuxième conduit (Cr2) étant raccordé à l’entrée du circuit de refroidissement, les premier et deuxième conduits (Cr1, Cr2) étant munis d’au moins une vanne adaptée à assurer l’écoulement du liquide caloporteur dans le deuxième conduit (Cr2) lors d’une phase de fonctionnement du réacteur électrochimique (2), et dans le premier conduit (Cr1) lors d’une phase d’inertage. Système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 5, comportant un évent (14) raccordé à la ligne fluidique de circulation (Lr) autorisant le dégazage du fluide présent dans la ligne fluidique de circulation (Lr). Système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 6, dans lequel la ligne fluidique de refroidissement (Lr) comporte un conduit de dérivation en parallèle à l’échangeur de chaleur (12) associé à au moins une vanne (Vr1, Vr2) adaptée à assurer l’écoulement du liquide caloporteur dans l’échangeur de chaleur (12) lors d’une phase de fonctionnement du réacteur électrochimique (2), et l’écoulement du liquide caloporteur dans le conduit de dérivation lors d’une phase d’inertage. Système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 7, dans lequel le réacteur électrochimique (2) est de type à membrane échangeuse de protons. Système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 8, dans lequel le réacteur électrochimique (2) est une pile à combustible. Système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 9, dans lequel les fluides réactifs sont des gaz. Procédé d’utilisation du système électrochimique (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 10, comportant une phase de fonctionnement du réacteur électrochimique (2) dans laquelle la vanne d’activation (Vic, Via) est fermée, et une phase d’inertage dans laquelle la vanne d’activation (Vic, Via) est ouverte. Procédé d’utilisation selon la revendication 11 du système électrochimique selon la revendication 2, dans lequel, lors de la phase d’inertage, les vannes (Vc1, Vc2) de la ligne fluidique cathodique (Lc) sont fermées. Procédé d’utilisation selon la revendication 11 ou 12 du système électrochimique selon la revendication 3, dans lequel, lors de la phase d’inertage, les vannes (Va1, Va2) de la ligne fluidique anodique (La) sont fermées.