Procédé de récupération des phytotoxines d’un jus de fermentation obtenu à partir de la culture de microorganismes producteurs desdites phytotoxines, caractérisé en ce qu’il comprend un premier cycle de filtration sur membrane comprenant les étapes suivantes : filtration sur membrane du jus de fermentation de la biomasse de manière à retenir les phytotoxines dans le rétentat, récupération d’un rétentat comprenant lesdites phytotoxines, et récupération d’un premier perméat appauvri en phytotoxines, ledit perméat ayant une teneur en phytotoxines inférieure à celle du jus de fermentation, suivi le cas échéant par au moins un cycle supplémentaire de filtration sur membrane du rétentat obtenu en étape c du cycle précédent avec la récupération d’au moins un deuxième rétentat comprenant lesdites phytotoxines et au moins un deuxième perméat appauvri en phytotoxines ayant une teneur en phytotoxines inférieure à celle du premier perméat. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce qu’il comprend m cycles supplémentaire de filtration sur membrane et la récupération de m+1 rétentats comprenant les phytotoxines et un m ème perméat appauvri en phytotoxines, m étant un entier d’au moins 1. Procédé selon l’une des revendications 1 ou 2, caractérisé en ce que les cycles de filtration sur membrane sont réalisées sur une même membrane ou chaque cycle de filtration sur membrane est réalisé sur une nouvelle membrane, les membranes de chaque cycle de filtration étant identiques ou différentes. Procédé selon l’une des revendications 2 ou 3, caractérisé en ce que le nombre de cycles m+1 est déterminé en fonction : de la teneur en phytotoxines du jus de fermentation, du facteur de concentration de la membrane de filtration, et de la concentration finale en phytotoxines dans le perméat récupéré après le dernier cycle. Procédé selon la revendication 4, caractérisé en ce que la concentration finale en phytotoxines dans le perméat récupéré après le dernier cycles en fonction du nombre de cycles m+1 est déterminée par l’équation : dans laquelle est le nombre de cycles m+1, X est le facteur de concentration de la membrane et R est le taux de rejet moléculaire de la membrane. Procédé selon l’une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce que les m+1 rétentats comprenant les phytotoxines récupérés du premier cycle de filtration sur membrane et des m cycles supplémentaires de filtration sur membrane sont rassemblés. Procédé selon l’une des revendications 1 à 6, caractérisé en ce que les phytotoxines sont des molécules avec un poids moléculaire compris entre 300 et 3000 Da. Procédé selon l’une des revendications 1 à 7, caractérisé en ce que les phytotoxines appartiennent aux familles des microcystines, des brevetoxines, des saxitoxines, des anatoxines α, des acides okadaïques, des amphidinols, des cylindrospermopsines, des imines cycliques et des anabaenopeptines. Procédé selon l’un des revendications 1 à 8, caractérisé en ce que le jus de fermentation est obtenu par séparation d’une biomasse de microorganismes d’un mout de fermentation obtenu par un procédé de fermentation desdits microorganismes dans un milieu de culture comprenant un milieu aqueux et des nutriments nécessaires à la croissance desdits microorganismes. Procédé selon l’une des revendications 2 à 9, caractérisé en ce que le m ème perméat obtenu après m cycles supplémentaires de filtration sur membrane est recyclé dans le milieu de culture des microorganismes. Phytotoxines obtenues selon le procédé défini à l’une des revendications 1 à 10. Utilisation de phytotoxines selon la revendication 11 en tant qu’additif dans une biomasse de microorganismes.