Procédé pour corriger un artefact de reconstruction d’une image tomographique tridimensionnelle, le procédé comprenant les étapes de : - fournir une image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire, de préférence comprenant moins de 1000 cellules, - appliquer à ladite image un réseau de neurones (180) entrainé pour déterminer une image tomographique corrigée, dans lequel le réseau de neurones a été entrainé par les étapes suivantes : - fournir un modèle tridimensionnel numérique comprenant au moins un premier objet volumique (110) représentant un premier indice optique (valeurs complexes) et un deuxième objet volumique (120) représentant un deuxième indice optique différent du premier indice optique, la surface du premier et du deuxième objet volumique étant déformées par un bruit, de préférence un bruit de Perlin, - simuler une image tomographique tridimensionnelle à partir du modèle tridimensionnel, - entrainer le réseau de neurones pour corriger une différence entre le modèle et l’imagé simulé. Procédé selon la revendication 1 dans lequel le modèle comprend un seul troisième objet volumique creux(130) avec un bord déformée par un bruit, de préférence un bruit de Perlin, le bord représentant un troisième indice optique, le premier et le deuxième objet volumique étant placés à un intérieur du troisième objet volumique creux. Procédé selon la revendication 1 ou 2 dans lequel un intérieur d’au moins le premier objet volumique comprend une pluralité de mini objets volumiques (140), chaque mini objet volumique de la pluralité présentant un indice optique différent de l’indice optique du premier objet volumique, la surface de chaque mini objet volumique étant déformée par un bruit, de préférence un bruit de Perlin. Procédé selon la revendication 3 dans lequel les indices optiques de la pluralité de mini objets volumiques présentent une première variation aléatoire autour d’une première valeur moyenne. Procédé selon une ou plusieurs des revendications 1 à 4 dans lequel le modèle tridimensionnel numérique comprend une pluralité d'objets volumiques et dans lequel les indices optiques de la pluralité d'objets volumiques présentent une deuxième variation aléatoire autour d’une deuxième valeur moyenne. Procédé selon la revendication 4 et la revendication 5 dans lequel la deuxième variation aléatoire est inférieure par rapport à la première variation aléatoire et/ou dans lequel la deuxième moyenne est inférieure par rapport à la première moyenne. Procédé selon l’une des revendications 1 à 6 dans lequel l’image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire et l’image tomographique tridimensionnelle simulé à partir du modèle sont fournies sous forme de tranches dans un plan X-Y parallèle à un plan d’acquisition et dans lequel le réseau de neurones est un premier réseau de neurones est configuré pour fournir une tranche corrigée à partir d’une pluralité de tranches en entrée. Procédé selon la revendication 7 comprenant les étapes suivantes : - fournir l’image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire et l’image tomographique tridimensionnelle simulée à partir du modèle sous forme de M tranches dans un plan X-Z, - entrainer un deuxième réseau de neurones pour fournir une tranche corrigée dans le plan X-Z, - fournir l’image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire et l’image tomographique tridimensionnelle simulée à partir du modèle sous forme de M tranches dans un plan Y-Z, - continuer d’entrainer ledit deuxième réseau de neurones pour fournir une tranche corrigée dans le plan Y-Z, - appliquer ledit deuxième réseau de neurones pour corriger l’image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire fourni dans le plan X-Z pour obtenir une première image transverse, - appliquer ledit deuxième réseau de neurones pour corriger l’image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire fourni dans le plan Y-Z pour obtenir une deuxième image transverse, - créer un filtre à partir de la première et la deuxième image transverse, - multiplier le filtre avec l’image tomographique corrigée obtenue par l’application du premier réseau de neurones. Procédé selon l’une des revendications 1 à 8 dans lequel l’étape de fournir une image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire comprend fournir un volume d’initialisation formant une base pour l’image tomographique à reconstruire, dans lequel l’image tomographique corrigée par l’application du réseau de neurones est utilisée comme volume d’initialisation. Procédé selon l’une des revendications 1 à 9 dans lequel l’étape de fournir une image tomographique tridimensionnelle acquise à partir d’un groupement cellulaire comprend : acquérir une pluralité d’images élémentaires de transmission à partir du groupement cellulaire, chaque image élémentaire étant acquise avec un angle d’illumination (80) différent, de préférence une différence entre deux angles d’illumination étant de 40° ou moins.