Selon un mode de réalisation alternatif ou en combinaison avec les modes de réalisation décrits ci-dessus, la méthode in vitro de stratification d'une maladie liée aux sarbecovirus, de pronostic d'une maladie liée aux sarbecovirus, de suivi d'une maladie liée aux sarbecovirus, ou d’évaluation de l'efficacité d'un traitement d'une maladie liée aux sarbecovirus chez un sujet souffrant d’une maladie liée aux sarbecovirus, comprend en outre une étape b’) réalisée entre l’étape b) et l’étape c), de détection de la présence ou l’absence (et/ou la quantification) d’au moins un sarbecovirus, dans un second échantillon biologique du sujet testé (appelé échantillon (B)). Ledit second échantillon (B) a de préférence été obtenu/prélevé postérieurement à l’échantillon (A), par exemple lors d’une seconde visite (l’échantillon (A) ayant alors lui été obtenu lors d’une première visite), de préférence ledit échantillon (B) ayant été obtenu au moins 24 heures après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 48 heures après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 72 heures après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 7 jours après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 10 jours après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 15 jours après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 1 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 2 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 3 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 4 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 5 mois après l’échantillon (A), , de préférence encore au moins 6 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 7 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 8 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 9 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 10 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 11 mois après l’échantillon (A), de préférence encore au moins 12 mois après l’échantillon (A). De préférence encore ledit échantillon (B) a été obtenu entre 7 jours et 6 mois après l’échantillon (A), de préférence encore ledit échantillon (B) ayant été obtenu entre 10 jours et 5 mois après l’échantillon (A), de préférence encore entre 15 jours et 4 mois, de préférence encore entre 21 jours et 3 mois, de préférence encore entre 30 et 60, de préférence encore entre 40 et 50 jours. Selon ce mode de réalisation, la méthode peut en outre comprendre une étape b’’) réalisée entre l’étape b’) et l’étape c), de comparaison des sarbecovirus détectés (notamment des quantités de sarbecovirus détectées), pour les étapes b) (donc pour l’échantillon (A) du sujet) et b’) (donc pour l’échantillon (B) du sujet). Dans ce cas, l’étape c) comprend la stratification de la maladie liée aux sarbecovirus, le pronostic de la maladie liée aux sarbecovirus, le suivi de la maladie liée aux sarbecovirus, l’évaluation de l'efficacité du traitement de la maladie liée aux sarbecovirus, chez le sujet, en fonction de la comparaison de l’étape b’’). Le sujet sera stratifié comme étant à un stade/niveau de stratification inchangé/comparable, ou le sujet aura un pronostic inchangé/comparable, ou la maladie liée aux sarbecovirus n’aura pas ou peu évolué chez le sujet (sera stable), ou le traitement de la maladie liée aux sarbecovirus sera raisonnablement efficace, si la comparaison de l’étape b’) montre que le résultat de l’étape b) est comparable à celui obtenu à l’étape b’).