Méthode de mesure d’une matrice de transmission d’une première fibre optique, telle une fibre optique multi-modes, la fibre étant dans une conformation quelconque et guidant N modes propres, la fibre optique comprenant un tronçon proximal comprenant une extrémité proximale et une extrémité distale et un tronçon distal comprenant une extrémité proximale et une extrémité distale, où l’extrémité distale du tronçon proximal est connectée à l’extrémité proximale du tronçon distal à l’aide d’un coupleur inter-fibre, la méthode comprenant les étapes suivantes: - injecter séparément n champs pilotes au niveau de l’extrémité distale du tronçon proximal de la fibre optique, - mesurer à l’extrémité proximale du tronçon proximal de la fibre optique le champ résultant pour chacun des n champs pilotes injectés, - Estimer H est , une matrice de transmission exprimée dans la base des N modes propres de la première fibre optique. Méthode selon la revendication 1, où les champs pilotes sont injectés à travers une seconde fibre optique telle une fibre multi-cœurs connectée entre 1mm et 5 cm en amont de l’extrémité distale du tronçon distal de la première fibre optique. Méthode selon la revendication 2, où la seconde fibre optique est une fibre multi-cœurs comprenant au moins autant de cœur que de champs pilotes. Méthode selon l’une quelconque des revendications précédentes, où les champs pilotes sont choisis cohérents entre eux. Méthode selon l’une quelconque des revendications 2 à 4, où les champs pilotes sont les modes propres de la seconde fibre optique. Méthode selon l’une quelconque des revendications 2 à 5 où les champs pilotes injectés au niveau de l’extrémité distale du tronçon proximal de la première fibre optique sont les images virtuelles des champs pilotes injectés via la seconde fibre. Méthode selon l’une quelconque des revendications précédentes, où n est choisi supérieur ou égal au plus grand nombre de modes propres dégénérés entre eux de la première fibre optique. Méthode selon l’une quelconque des revendications précédentes, où l’estimation de la matrice de transmission dans la base des modes propres est réalisée d’après une méthode de maximum de vraisemblance, par exemple à l’aide d’un algorithme des moindres carrés. Méthode selon l’une quelconque des revendications précédentes, comprenant une étape préliminaire de mesure de la matrice de transmission de la première fibre optique dans une conformation de référence dans une base des modes localisées, puis une étape de changement de base de la matrice de transmission dans une base de modes propres. Méthode selon l’une quelconque des revendications précédentes où l’étape d’injection des n champs pilotes comprend en outre une injection simultanée des n champs pilote de sorte que la phase relative entre les n champs pilotes soit mesurable. Fibre optique dont la matrice de transmission est déterminée par la méthode selon l’une quelconque des revendications 1 à 10, la fibre optique comprenant un tronçon proximal comprenant une extrémité proximale et une extrémité distale et un tronçon distal comprenant une extrémité proximale et une extrémité distale, où l’extrémité distale du tronçon proximal est connectée à l’extrémité proximale du tronçon distal à l’aide d’un coupleur inter-fibre, et le moyen de couplage inter-fibre étant configuré pour recevoir une extrémité d’une seconde fibre optique, telle une fibre optique multi-coeurs. Fibre optique selon la revendication 11, où le coupleur inter-fibre est placé entre 1 mm et 5 cm de l’extrémité distale du tronçon distal de la première fibre, de préférence 2 cm. Fibre optique selon l’une quelconques des revendications 11 à 12, où la matrice de transmission du tronçon proximal de la fibre optique est connue pour une conformation de référence. Dispositif pour l’imagerie endo-microscopique comprenant : - une source de lumière pour l’émission de faisceaux lumineux, - une première fibre optique selon l’une quelconque des revendications 11 à 13, pour le transport et le contrôle de faisceaux lumineux émis par la source de lumière, où le tronçon proximal de la première fibre optique est dans une conformation quelconque, - une voie de détection destinée à la mesure du signal lumineux réfléchie par l’échantillon et passant à travers le tronçon distal et le tronçon proximal de la première fibre. Méthode d’imagerie endo-microscopique, la méthode étant mise en œuvre à l’aide d’un dispositif selon la revendication 14, la méthode comprenant les étapes suivantes : - estimer la matrice de transmission de la première fibre optique dans la base des modes localisés de la fibre, le tronçon proximal de la fibre étant dans une conformation quelconque, - calculer un masque de phase en fonction de la matrice de transmission estimée, - appliquer séquentiellement le masque de phase à un modulateur de front d’onde, afin d’obtenir un point focal à l’extrémité distale de la fibre, - mesurer le signal réfléchi du point focal par l’objet et reconstituer une image de l’échantillon pixel par pixel - répéter l’étape d’estimation de la matrice de transmission dès qu’une durée prédéterminée est écoulée et/ou à chaque fois que la conformation du tronçon proximal change sensiblement.