INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
On entend par « amorce » ou « amorce d'amplification », un oligonucléotide ou fragment nucléotidique pouvant être constitué de 5 à 100 nucléotides, de préférence de 15 à 30 nucléotides, et possédant une spécificité d'hybridation avec une séquence nucléotidique cible, dans des conditions déterminées pour l'initiation d'une polymérisation enzymatique, par exemple dans une réaction d'amplification enzymatique de la séquence nucléotidique cible. Généralement, on utilise des « couples d’amorces », constitués de deux amorces. Lorsque l’on souhaite réaliser l’amplification de plusieurs gènes différents, plusieurs couples d’amorces différentes sont de préférence utilisés, ayant préférentiellement chacun une capacité à s’hybrider spécifiquement avec un gène différent.
On entend par « sonde » ou « sonde d’hybridation », un oligonucléotide ou fragment nucléotidique constitué typiquement de 5 à 100 nucléotides, de préférence de 15 à 90 nucléotides, de manière encore plus préférée de 15 à 35 nucléotides, possédant une spécificité d'hybridation dans des conditions déterminées pour former un complexe d'hybridation avec une séquence nucléotidique cible. La sonde comporte également un rapporteur (tel qu’un fluorophore, une enzyme ou tout autre système de détection), qui va permettre la détection de la séquence nucléotidique cible. Dans la présente invention, la séquence nucléotidique cible peut être une séquence nucléotidique comprise dans un ARN messager (ARNm) ou une séquence nucléotidique comprise dans un ADN complémentaire (ADNc) obtenu par transcription inverse dudit ARNm. Lorsque l’on souhaite cibler plusieurs gènes différents, plusieurs sondes différentes sont, de préférence, utilisées, ayant préférentiellement chacune une capacité à s’hybrider spécifiquement avec un gène différent.
Des séquences d’amorce et sonde adaptées pour déterminer le niveau de transcrits de chaque gène IFI27, IFI44L, IFIT1, RSAD2, ISG15 et SIGLEC1 sont, notamment, décrites dans M. Bergallo et al. , 2020.
Par « hybridation », on entend le processus au cours duquel, dans des conditions appropriées, deux oligonucléotides ou fragments nucléotidiques, tels que, par exemple, une sonde d'hybridation et un fragment nucléotidique cible, ayant des séquences suffisamment complémentaires, sont susceptibles de former un double brin avec des liaisons hydrogène stables et spécifiques. Un fragment nucléotidique "capable de s'hybrider" avec un polynucléotide est un fragment pouvant s'hybrider avec ledit polynucléotide dans des conditions d'hybridation, qui peuvent être déterminées dans chaque cas de façon connue. Les conditions d'hybridation sont déterminées par la stringence, c'est-à-dire la rigueur des conditions opératoires. L'hybridation est d'autant plus spécifique qu'elle est effectuée à plus forte stringence. La stringence est définie notamment en fonction de la composition en bases d'un duplex sonde/cible, ainsi que par le degré de mésappariement entre deux acides nucléiques. La stringence peut également être fonction des paramètres de la réaction, tels que la concentration et le type d'espèces ioniques présentes dans la solution d'hybridation, la nature et la concentration d'agents dénaturants et/ou la température d'hybridation. La stringence des conditions dans lesquelles une réaction d'hybridation doit être réalisée dépendra principalement des sondes d'hybridation utilisées. Toutes ces données sont bien connues et les conditions appropriées peuvent être déterminées par l'homme du métier. En général, selon la longueur des sondes d'hybridation utilisées, la température pour la réaction d'hybridation est comprise entre environ 20 et 70°C, en particulier entre 35 et 65°C dans une solution saline à une concentration d'environ 0,5 à 1 M. On réalise ensuite une étape de détection de la réaction d'hybridation.
Par « réaction d'amplification enzymatique », on entend un processus générant de multiples copies d'un fragment nucléotidique cible, par l'action d'au moins une enzyme. De telles réactions d'amplification sont bien connues de l'homme du métier et on peut citer notamment les techniques suivantes : PCR ( Polymerase Chain Reaction ), LCR ( Ligase Chain Reaction ), RCR ( Repair Chain Reaction ), 3SR ( Self Sustained Séquence Replication ) avec la demande de brevet WO-A-90/06995, NASBA ( Nucleic Acid Sequence-Based Amplification ), TMA ( Transcription Mediated Amplification ) avec le brevet US-A-5,399,491, et LAMP ( Loop mediated isothermal amplification ) avec le brevet US6410278. Lorsque la réaction d’amplification enzymatique est une PCR, on parlera plus particulièrement de RT-PCR (RT pour « reverse transcription »), lorsque l’étape d’amplification est précédée d’une étape de réverse-transcription d’ARN messager (ARNm) en ADN complémentaire (ADNc), et de qPCR ou RT-qPCR lorsque la PCR est quantitative.
Les kits selon l’invention peuvent comprendre des moyens de détection d’un virus respiratoire, préférentiellement de SARS-CoV-2. En particulier, de tels moyens correspondent à un produit ou outil de détection et/ou d’amplification de l’ADN ou de l’ARN dudit virus.
Les kits selon l’invention peuvent également comprendre des moyens de contrôle positif, notamment un échantillon contrôle positif, permettant de qualifier la qualité de l’extraction de l’ARN, la qualité de tout procédé d’amplification et/ou d’hybridation.
Selon certains modes de réalisation, les kits selon l’invention, quel que soit leur mode de réalisation, sont caractérisés par le fait qu’ils comprennent un ensemble de moyens d’amplification et/ou de détection qui permettent la détection et/ou l’amplification d’au plus 100 gènes, de préférence au plus 90, de préférence au plus 80, de préférence au plus 70, de préférence au plus 60, de préférence au plus 50, de préférence au plus 40, de préférence au plus 30, de préférence au plus 20, de préférence au plus 10 gènes, notamment au plus 6, au plus 5, au plus 4, au plus 3, ou au plus 2 gènes, au total. Parmi les gènes, on trouvera les gènes de virus, notamment de virus respiratoires, ainsi que des gènes de « biomarqueur », c’est-à-dire d’une caractéristique biologique mesurable objectivement qui représente un indicateur des processus biologiques normaux ou pathologiques ou de réponse pharmacologique à une intervention thérapeutique. Les gènes de biomarqueurs incluent donc les gènes marqueurs sélectionnés parmi les ISG et les gènes de ménage décrits dans le cadre de l’invention. Le gène biomarqueur peut, en particulier, être détectable au niveau ARNm. A titre d’autres exemples de biomarqueur qui peut être également présent dans un kit selon l’invention, on peut citer un biomarqueur endogène ou loci (tel qu’un gène ou un HERV / Human Endogenous RetroVirus ) qui se retrouve dans le matériel chromosomique d’un individu, ou un biomarqueur exogène (tel qu’un virus). Selon des modes de réalisation particuliers, les kits selon l’invention comprennent, en tant que moyens d’amplification et/ou de détection de gènes, exclusivement des moyens d’amplification et/ou de détection de gènes de biomarqueur(s) consistant exclusivement en des moyens d’amplification et/ou de détection d’un ou plusieurs gènes marqueurs ISG, des moyens d’amplification et/ou de détection d’un ou plusieurs gènes de ménage et, éventuellement, des moyens d’amplification et/ou de détection d’un ou plusieurs virus respiratoires.
Lesdits produits ou moyens de détermination, plus précisément, lesdits produits d’amplification et/ou produits de détection peuvent être liés à un même support solide. Le kit peut donc comprendre un support solide comprenant un ou plusieurs oligonucléotide(s) adapté(s) à la détermination du niveau de transcrits du ou de chaque gène marqueur IGS, voire un ou plusieurs oligonucléotide(s) adapté(s) à la détermination du niveau de transcrits du gène ou de chaque gène de ménage sélectionné, voire un ou plusieurs oligonucléotide(s) adapté(s) à la détection d’un virus respiratoire tel que SARS-CoV-2, comme précédemment décrit. De tels supports solides sont bien connus de l’homme du métier, et notamment décrits dans les demandes WO2008/140568 et WO2017/093672 auxquelles on pourra se référer pour plus de détails.
Les kits sont destinés à être mis en œuvre de manière automatisée quant à la comparaison avec une valeur seuil et/ou valeur de référence. En particulier, les kits sont destinés à être mis en œuvre de manière automatisée quant à la comparaison du ou des niveaux de transcrit(s) du ou des gène(s) marqueur(s) ISG sélectionné(s), et la ou les valeurs seuil utilisées, ou le cas échéant en utilisant un niveau de référence pour calculer une donnée (ou un score) à partir du ou des niveaux de transcrit(s) du ou des gène(s) marqueur(s) ISG sélectionné(s) et la comparer avec une valeur seuil. Aussi, de manière avantageuse, ils comprennent, en plus de une ou plusieurs valeurs seuils, au moins un niveau de référence pour ledit (ou chaque) gène marqueur ISG sélectionné, qui est soit stocké sur un support lisible par un ordinateur, soit destiné à être utilisé sous la forme d’un code exécutable par un ordinateur, notamment configuré pour comparer le niveau de transcrits du gène marqueur ISG déterminé pour l’échantillon test, audit niveau de référence.
L’invention a également pour objet l’utilisation d’un kit tel que décrit dans le cadre de l’invention pour déterminer la présence éventuelle chez un sujet, d’une infection par un virus respiratoire réplicatif.
Selon l’invention, le niveau de transcrits du ou des gènes marqueurs obtenu peut être une valeur normalisée par rapport au niveau de transcrits d’un ou plusieurs gènes de ménage, notamment choisi(s) parmi DECR1, HPRT1 et PPIB.
La présente invention concerne également un kit de détermination in vitro ou ex vivo de la présence chez un sujet, d’une infection par un virus respiratoire réplicatif, comprenant : - au moins un moyen de détermination du niveau de transcrits d’un gène marqueur sélectionné parmi les ISG, notamment choisi parmi les oligonucléotides, - au moins une valeur seuil stockée sur un support lisible par un ordinateur et/ou utilisée sous la forme d’un code exécutable par un ordinateur configuré pour comparer le niveau de transcrits dudit gène marqueur, déterminé grâce au moyen de détermination ou une donnée obtenue à partir dudit niveau de transcrits du gène marqueur, à une valeur seuil.
Si plusieurs gènes marqueurs ISG sont utilisés, le kit comprendra, généralement, au moins un moyen de détermination du niveau de transcrits pour chacun d’entre eux.
Si plusieurs gènes marqueurs ISG sont utilisés, le kit peut comprendre une valeur seuil et/ou un niveau de référence pour chacun d’entre eux, stocké(s) sur un support lisible par un ordinateur et/ou utilisé(s) sous la forme d’un code exécutable par un ordinateur.
Si plusieurs gènes marqueurs sont utilisés, le kit peut également comprendre un code exécutable permettant de générer une donnée de référence globale, à partir de la comparaison de chaque gène marqueur à sa donnée de référence et permettant une comparaison de cette donnée globale à une valeur seuil. Dans ce cas, la comparaison du niveau de chaque gène marqueur à son niveau de référence peut prendre la forme du calcul d’un rapport, comme précédemment expliqué.
Selon certains modes de réalisation, ladite valeur seuil correspond au niveau de transcrits dudit gène marqueur chez un sujet ne présentant aucune infection par un virus respiratoire réplicatif et qui, de préférence, ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω, ou chez une population de sujets ne présentant aucune infection par un respiratoire réplicatif et qui, de préférence, ne possèdent pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou ne possèdent pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω.
Selon certains modes de réalisation, un tel kit selon l’invention comprend, en outre, au moins un niveau de référence pour ledit gène marqueur, stocké sur un support lisible par un ordinateur et/ou utilisé sous la forme d’un code exécutable par un ordinateur configuré pour comparer le niveau de transcrits du gène marqueur déterminé grâce au moyen de détermination audit niveau de référence, avec ledit niveau de référence qui est, de préférence, le niveau de transcrits dudit gène marqueur, chez un sujet non infecté par un virus respiratoire, ou chez une population de tels sujets.
De manière avantageuse, de tels kits selon l’invention comprennent, en outre, au moins un moyen de détection d’un virus respiratoire, et notamment au moins un moyen de détection d’un virus SARS-CoV-2.
La présente invention concerne également un kit de détermination in vitro ou ex vivo de la présence chez un sujet, d’une infection par un virus respiratoire réplicatif, comprenant : - au moins un moyen de détermination du niveau de transcrits d’un gène marqueur sélectionné parmi les ISG, notamment choisi parmi les oligonucléotides, - au moins un moyen de détection d’un virus respiratoire, et notamment au moins un moyen de détection d’un virus SARS-CoV-2.
De manière avantageuse, un tel kit comprend, en outre, au moins une donnée valeur seuil stockée sur un support lisible par un ordinateur et/ou utilisée sous la forme d’un code exécutable par un ordinateur configuré pour comparer le niveau de transcrits dudit gène marqueur déterminé grâce au moyen de détermination, ou une donnée obtenue à partir dudit niveau de transcrits du gène marqueur, à ladite valeur seuil.
Selon d’autres modes de réalisation, un tel kit selon l’invention comprend, en outre, au moins un niveau de référence pour ledit gène marqueur, stocké sur un support lisible par un ordinateur et/ou utilisé sous la forme d’un code exécutable par un ordinateur configuré pour comparer le niveau de transcrits du gène marqueur déterminé grâce au moyen de détermination audit niveau de référence, avec ledit niveau de référence qui est, de préférence, le niveau de transcrits dudit gène marqueur, chez un sujet non infecté par un virus respiratoire, ou chez une population de tels sujets.
Quel que soit leur mode de réalisation, les kits de détection selon l’invention peuvent comprendre, en outre, un échantillon contrôle négatif, tel qu’un échantillon permettant de s’assurer de l’absence de contamination, et/ou un échantillon contrôle positif qui correspond au niveau de dudit gène marqueur à une concentration représentative du niveau de transcrits d’un sujet ayant une infection par un virus respiratoire réplicatif ou chez une population de sujets ayant une infection par un virus respiratoire réplicatif, et/ou un échantillon contrôle positif qui correspond au niveau de transcrits dudit gène marqueur à une concentration représentative du niveau de transcrits d’un sujet ayant une infection par un virus respiratoire réplicatif ou chez une population de sujets ayant une infection par un virus respiratoire réplicatif.
L’invention sera mieux comprise au vu de la description détaillée ci-après, en référence aux dessins.
La met en évidence la corrélation entre le score nasal ISG de type I/III obtenu à partir d’un prélèvement naso-pharyngé (NP) et le score sanguin ISG de type I/III obtenu à partir d'un échantillon de sang entier PAXgene™ (PX, n = 75 échantillons longitudinaux provenant de 23 patients). Les différents scores sont mesurés au moyen de la technologie FilmArray®. Le coefficient de corrélation de Spearman est indiqué.
La met en évidence que le score nasal (NP pour naso-pharyngé) ISG, déterminé par la technologie FilmArray® est corrélé aux niveaux d'IFN–α2 (fg/ml) dans le plasma (n = 39 échantillons ayant une valeur détectable provenant de 23 patients), mesurés par une matrice à molécule unique (SIMOA®) utilisant une trousse du commerce. Le coefficient de corrélation de Spearman est indiqué.
Mauvaise : l’émulsion est blanc-cassé avec des particules visibles.
3. Résultats expérimentaux
Les résultats expérimentaux sont illustrés dans le tableau 3 ci-dessous
Tableau 3 L’effet émulsionnant de différents émulsifiants Effet émulsionnant Dispersion Émulsification Stabilité Exemple de préparation 1 Excellente Bonne Qualifiée Exemple de préparation 2 Excellente Bonne Qualifiée Exemple de préparation 3 Excellente Excellente Qualifiée Exemple de préparation 4 Bonne Oui Qualifiée Exemple de préparation 5 Bonne Oui Qualifiée Exemple de comparaison 1 Oui Oui Qualifiée Exemple de comparaison 2 Bonne Oui Non qualifiée Exemple de comparaison 3 Bonne Oui Non qualifiée Exemple de comparaison 4 Bonne Mauvaise Non qualifiée
On peut voir d’après le tableau ci-dessus que lorsque l’émulsifiant composite composé de Nongru 600# et de Ningru 1600# est sélectionné, c’est-à-dire, les exemples de préparation 1-5 présentent de meilleurs effets d’émulsification que d’autres émulsionnants ou exemples de comparaison où un agent unique est sélectionné. Quant à l’émulsionnant composite lui-même, lorsque le rapport en poids des deux est de 2-5:1, il est meilleur que d’autres rapports, en particulier lorsque le rapport en poids des deux est de 4:1, c’est-à-dire, l’exemple de préparation 3 présente le meilleur effet.
La composition bactéricide de la présente invention contenant de l’oxathiapiproline et de la cyanoestrobine a été décrite par des exemples spécifiques. L’homme du métier peut apprendre à partir du contenu de la présente invention et changer de manière appropriée les matières premières, les conditions de processus et autres maillons pour réaliser d’autres objectifs correspondants. Les changements associés ne s’éloignent pas du contenu de la présente invention. Tous les remplacements et modifications similaires sont évidents pour l’homme du métier, et ainsi ils sont tous considérés pour être inclus dans la portée de la présente invention.
PROCEDE HMT DE L’AMIDON DE POIS La présente invention est relative à un procédé hydrothermique d’augmentation de la teneur en fraction lentement digestible de l’amidon de pois. Plus particulièrement ce procédé hydrothermique est un procédé par traitement à la chaleur humide, communément appelé traitement HMT, d’après le terme anglais de Heat-Moisture Treatment.
Elle est également relative aux amidons de pois ainsi obtenus et à leurs utilisations.
Contexte de l’invention D’un point de vue physiologique, chez l’homme ou les animaux, l'essentiel des glucides ingérés lors de l’alimentation est représenté par l'amidon, molécule de réserve énergétique caractéristique des végétaux et composante principale des féculents (pâtes, farine, pommes de terre).
Lors de la digestion, les molécules d'amidon se dissocient en chaînes de glucanes plus petites, elles-mêmes dissociées en glucoses simples et assimilables par le système digestif.
La digestion de l'amidon débute dans la bouche pendant la mastication grâce à une enzyme de la salive : l'amylase salivaire.
Cette première décomposition de l'amidon est stoppée par l'acidité de l'estomac mais reprend dans le duodénum (première partie de l'intestin grêle) grâce à l'action des enzymes pancréatique et intestinale.
L'action successive de toutes ces amylases conduit à l'apparition d'un disaccharide, le maltose, qui sera lui-même transformé en deux monosaccharides, des glucoses.
Synthétisé par voie biochimique, source d’hydrates de carbone, l’amidon est l’une des matières organiques les plus répandues du monde végétal, où il constitue la réserve nutritionnelle des organismes.
Il est ainsi naturellement présent dans les organes et tissus de réserve des végétaux supérieurs, en particulier dans les graines de céréales (blé, maïs…), les graines de légumineuses (pois, fèves …), les tubercules (pomme de terre, igname…), les racines (manioc, patate douce, …), les bulbes, les tiges et les fruits.
La illustre schématiquement une vue en coupe de la tête 10 du dispositif de coupe 1 selon un mode particulier de réalisation.
Les éléments identiques aux éléments représentés sur les Figs 1 à 3 sont identifiés sur la avec les mêmes références numériques. La base 112 de la tête 10 est fixée sur le socle 11 du dispositif de coupe 1. Le dispositif de coupe 1 comprend un système d’entraînement 130 sur lequel est fixé un outil de coupe 110. Le système d’entraînement 130 est configuré pour entraîner ledit outil de coupe 110 en rotation autour de son axe YY’ et en translation parallèlement audit axe de rotation de sorte que l’outil de coupe 110 puisse sortir de la buse d’aspiration 114 lors de la découpe afin par exemple de percer la pièce 124 en contact avec l’extrémité 116. Préférentiellement, l’outil de coupe 110 et la buse d’aspiration 114 sont coaxiaux, i.e. les axes XX’ et YY’ sont confondus.
La paroi de buse d’aspiration 114 est optionnellement percée de trous circulaires 120 traversants et d’au moins un trou oblong 122 traversant. Dans une variante non représentée, les trous circulaires 120 sont absents et la buse d’aspiration 114 ne comprend qu’un ou des trous oblongs 122.
Dans un mode de réalisation particulier, la paroi de la tête 10 comprend en outre au moins un capteur infrarouge 126. Le capteur infrarouge 126 est positionné, au niveau de la base 112 ou de la buse d’aspiration 114, soit dans un trou traversant la paroi de la tête, soit dans un trou borgne débouchant sur la zone de coupe de sorte que le capteur infrarouge ait une vue directe sur la zone de coupe. Le capteur infrarouge 126 est configuré pour capter un rayonnement infrarouge et peut ainsi détecter un départ de feu (e.g. une étincelle) se produisant dans la zone de coupe. En effet, le capteur infrarouge 126 est sensible aux radiations infrarouges émises par une étincelle ou une flamme. Un ou des capteurs infrarouge 126 peuvent optionnellement être fixés dans la paroi du connecteur 118.
Le ou les capteurs infrarouge 126 sont reliés de manière filaire à un module de détection de départ de feu 13 alimenté par une batterie. Dans un mode de réalisation, le niveau de charge de la batterie est surveillé pour remonter une alarme à un module de commande 2 en cas de niveau de charge bas, e.g. inférieur à une valeur de seuil. Ainsi, on s’assure que le module de détection est actif grâce à une batterie chargée. Le module de détection 13 peut être fixé sur le dispositif de coupe 1 ou bien posé à côté de celui-ci. Ainsi, lorsqu’un capteur infrarouge 126 capte un rayonnement infrarouge, il envoie un signal électrique via le lien filaire au module de détection 13. Sur la , seul un lien filaire est représenté pour éviter de surcharger la figure. Toutefois, tous les capteurs infrarouge 126 sont reliés au module de détection 13. Ainsi, en cas de départ de feu ou même en cas d’étincelle dans la zone de coupe, le capteur infrarouge 126 détecte la radiation infrarouge et envoie un signal analogique par le lien filaire au module de détection 13. Le signal analogique est comparé à un seuil de détection réglable sur le module de détection 13. La comparaison à un seuil de détection permet d’éviter d’indiquer un départ de feu en cas d’un rayonnement infrarouge de très faible amplitude. Dans un mode particulier de réalisation, le module de détection 13 comprend un multiplexeur qui, à partir de différents signaux analogiques reçus des différents capteurs infrarouge 126 et seuillés par le module de détection 13, génère une trame de communication sans fil RF (acronyme de radio-fréquences) qui est transmise à un module de commande 2 associé au dispositif de coupe 1 pour lui indiquer qu’un départ de feu a été détecté. Le multiplexage permet donc à partir des signaux analogiques seuillés d’envoyer un signal binaire au module de commande 2 pour lui indiquer la détection ou non d’un départ de feu dans la zone de coupe. Par exemple, si au moins un des capteurs infrarouge 126 envoie un signal analogique qui est supérieur au seuil de détection, alors la trame RF comprend une information indiquant au module de commande 2 la détection d’un départ de feu dans la zone de coupe.