Procédé de détermination in vitro ou ex vivo de la présence chez un sujet, d’une infection par un virus respiratoire réplicatif, comprenant une étape i) de détermination, dans un échantillon test provenant de la bouche ou du nez dudit sujet, du niveau de transcrits d’au moins un gène marqueur sélectionné parmi les gènes stimulés par les interférons, dits ISG. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce qu’à l’étape i), le niveau de transcrits de un ou de plusieurs gènes marqueurs choisis parmi : IFI27, IFI44L, IFIT1, RSAD2, ISG15, et SIGLEC1, est déterminé. Procédé selon la revendication 1 ou 2, caractérisé en ce que l’échantillon test est un échantillon oro-pharyngé ou naso-pharyngé, ou un échantillon de salive. Procédé selon l’une des revendications 1 à 3, caractérisé en ce que l’étape i) consiste en la détermination du niveau d’ARNm du ou desdits gènes marqueurs. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce que l’échantillon test provient d’un sujet qui présente des symptômes d’une infection. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce que l’échantillon test provient d’un sujet qui ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu’il comprend les étapes suivantes : i) déterminer le niveau de transcrits d’au moins un gène marqueur choisi parmi les ISG, pour ledit échantillon test du sujet, ii) comparer le niveau de transcrits dudit au moins gène marqueur obtenu, à un niveau de référence. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu’il comprend, en outre, une étape iii) qui est de conclure à la présence ou non d’une infection par un virus respiratoire réplicatif chez ledit sujet, en utilisant au moins une valeur seuil. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu’il comprend les étapes suivantes : i) déterminer le niveau de transcrits d’un seul gène marqueur sélectionné parmi les ISG, pour l’échantillon test, ii) comparer le niveau de transcrits dudit gène marqueur obtenu, à un niveau de référence, utilisé en tant que valeur seuil, ledit niveau de référence étant le niveau de transcrits dudit gène marqueur, chez un sujet non infecté par un virus respiratoire réplicatif, qui, de préférence, ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω, ou chez une population de tels sujets et iii) conclure à la présence d’une infection par un virus respiratoire réplicatif chez ledit sujet en cas de différence avec ledit niveau de référence dudit gène marqueur. Procédé selon la revendication 9 caractérisé en ce que ledit gène marqueur est l’IFIT1 ou l’IFI44L. Procédé selon l’une des revendications 1 à 8, caractérisé en ce qu’il comprend les étapes suivantes : i) déterminer les niveaux de transcrits de plusieurs gènes marqueurs sélectionnés parmi les ISG pour l’échantillon test, et ii) comparer le niveau de transcrits de chaque gène marqueur déterminé dans l’échantillon test avec un niveau de référence correspondant audit gène marqueur, utilisé en tant que valeur seuil, ledit niveau de référence étant le niveau de transcrits dudit gène marqueur, chez un sujet non infecté par un virus respiratoire réplicatif, qui, de préférence, ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω, ou chez une population de tels sujets, et iii) conclure à la présence d’une infection par un virus respiratoire réplicatif chez ledit sujet, en cas de différence avec le niveau de référence correspondant, pour au moins un des gènes marqueurs, pour lequel le niveau de transcrits a été déterminé dans l’échantillon test. Procédé selon l’une des revendications 9 à 11, caractérisé en ce que ladite différence correspond à un niveau de transcrits dudit gène marqueur déterminé pour l’échantillon test supérieur à celui dudit niveau de référence. Procédé selon l’une des revendications 1 à 8, caractérisé en ce qu’il comprend les étapes suivantes : i) déterminer les niveaux de transcrits de plusieurs gènes marqueurs sélectionnés parmi les ISG, pour l’échantillon test, ii) comparer le niveau de transcrits de chaque gène marqueur déterminé dans l’échantillon test avec un niveau de référence correspondant audit gène marqueur, avec calcul du rapport entre ledit niveau de transcrits sur ledit niveau de référence dudit gène marqueur, ledit niveau de référence étant, de préférence, le niveau de transcrits dudit gène marqueur, chez un sujet non infecté par un virus respiratoire, ou chez une population de tels sujets, iibis) calculer la médiane de tous les rapports obtenus à l’étape ii), et iii) conclure à la présence d’une infection par un virus respiratoire réplicatif chez ledit sujet, lorsque ladite médiane calculée à l’étape iibis) est supérieure à une valeur seuil, qui est, de préférence, égale à 1,5. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce que la détermination du niveau de transcrits du ou des gènes marqueurs est réalisée par hybridation, amplification ou séquençage, et, en particulier, par RT-qPCR. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce que le niveau de transcrits du ou des gènes marqueurs obtenu est une valeur normalisée par rapport au niveau de transcrits d’un ou plusieurs gènes de ménage, notamment choisi(s) parmi DECR1, HPRT1 et PPIB. Procédé selon l’une des revendications précédentes, caractérisé en ce que préalablement ou concomitamment à l’étape i), l’échantillon test est soumis à un test de diagnostic, par détection d’ADN ou d’ARN, notamment par PCR ou RT-PCR, d’un virus respiratoire, notamment choisi parmi les virus SARS-CoV-2. Procédé selon la revendication 16, caractérisé en ce que l’échantillon test est soumis à un test de diagnostic, par détection d’ADN ou d’ARN, notamment par PCR ou RT-PCR, d’un virus respiratoire choisi parmi les virus SARS-CoV-2, ledit test de diagnostic étant, de préférence, réalisé préalablement à l’étape i) et ayant donné un résultat positif. Kit de détermination in vitro ou ex vivo de la présence chez un sujet, d’une infection par un virus respiratoire réplicatif, comprenant : - au moins un moyen de détermination du niveau de transcrits d’un gène marqueur sélectionné parmi les ISG, choisi parmi les oligonucléotides, - au moins une valeur seuil stockée sur un support lisible par un ordinateur ,ladite valeur seuil correspondant au niveau de transcrits dudit gène marqueur chez un sujet ne présentant aucune infection par un virus respiratoire réplicatif et qui, de préférence, ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω, ou chez une population de sujets ne présentant aucune infection par un respiratoire réplicatif et qui, de préférence, ne possèdent pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou ne possèdent pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω. Kit selon la revendication 18, caractérisé en ce qu’il comprend, en outre, au moins un niveau de référence pour ledit gène marqueur, stocké sur un support lisible par un ordinateur, ledit niveau de référence qui étant, de préférence, le niveau de transcrits dudit gène marqueur, chez un sujet non infecté par un virus respiratoire, ou chez une population de tels sujets. Kit de détection selon la revendication 18 ou 19, caractérisé en ce qu’il comprend, en outre, au moins un moyen de détection d’un virus respiratoire. Kit de détermination in vitro ou ex vivo de la présence chez un sujet, d’une infection par un virus respiratoire réplicatif, comprenant : - au moins un moyen de détermination du niveau de transcrits d’un gène marqueur sélectionné parmi les ISG, choisi parmi les oligonucléotides, - au moins un moyen de détection et/ou d’amplification de l’ADN ou de l’ARN d’un virus respiratoire. Kit de détection selon la revendication 21, caractérisé en ce qu’il comprend, en outre, au moins une valeur seuil stockée sur un support lisible par un ordinateur. Kit de détection selon la revendication 22, caractérisé en ce que la valeur seuil correspond au niveau de transcrits dudit gène marqueur chez un sujet ne présentant aucune infection par un virus respiratoire réplicatif et qui, de préférence, ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou ne possède pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω, ou chez une population de sujets ne présentant aucune infection par un respiratoire réplicatif et qui, de préférence, ne possèdent pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron α et/ou ne possèdent pas d’auto-anticorps neutralisants dirigés contre l’interféron ω. Kit de détection selon la revendication 22, caractérisé en ce qu’il comprend, en outre, au moins un niveau de référence pour ledit gène marqueur, stocké sur un support lisible par un ordinateur ledit niveau de référence étant, de préférence, le niveau de transcrits dudit gène marqueur, chez un sujet non infecté par un virus respiratoire, ou chez une population de tels sujets. Kit de détection selon l’une des revendications 18 à 24, caractérisé en ce qu’il comprend, en outre, un échantillon contrôle négatif permettant de s’assurer de l’absence de contamination, et/ou un échantillon contrôle positif qui correspond au niveau de dudit gène marqueur à une concentration représentative du niveau de transcrits d’un sujet ayant une infection par un virus respiratoire réplicatif ou chez une population de sujets ayant une infection par un virus respiratoire réplicatif.