INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
La visualisation par interface textuelle présente plusieurs inconvénients : nombre limité de réponses présentées simultanément ; généralement seulement 10 réponses sont visualisées à la fois, ce nombre pouvant parfois être porté à 25, voire à 50) ; disponibilité limitée des réponses : les moteurs de recherche peuvent afficher un nombre limité de pages avec les résultats de la recherche (par exemple 20 pages) ; le nombre total de réponses présentées (qui est égal au nombre maximum de pages multiplié par le nombre de réponses par page) est en conséquence limité et très souvent ne dépasse pas quelques pour-cents du nombre total de réponses satisfaisant la requête ; un seul critère de pertinence (aussi appelé attribut du résultat) peut être utilisé pour visualiser les résultats. La pertinence d'un document est visualisée simplement par le rang de la réponse correspondante. Généralement, les documents placés en haut de la liste des réponses sont les plus pertinents ; absence de recherche comparée : l'utilisateur ne peut pas comparer les résultats de recherches obtenus à partir de requêtes différentes ou comparer différentes catégories pertinentes en même temps ; interaction limitée avec l'utilisateur : un utilisateur peut seulement sélectionner une adresse URL dans la liste, et en cliquant sur le lien passer au document sélectionné ; un utilisateur ne peut pas sélectionner un groupe de documents avec lesquels il souhaite travailler ; perception d'informations textuelles moins efficace que leur représentation graphique.
Dans le cas des répertoires, la visualisation par interface graphique 2D ou 3D consiste par exemple à présenter un répertoire sous la forme d'un paysage urbain, dans lequel différentes zones (centre ville, quartier commercial, etc. ) sont synonymes de catégories de répertoire, tandis que les immeubles représentent des sites Web ou des adresses URL.
Dans ce cas, les inconvénients de la visualisation par interface graphique 2D ou 3D sont notamment les suivants : nombre limité de fonctionnalité du fait que l'interface graphique est construite en haut des répertoires et hérite de tous leurs inconvénients : faible nombre de réponses stockées (en comparaison des moteurs de recherche à base d'indexation), catégorisation ambiguë et absence de mécanisme d'expiration ; faible niveau d'interaction avec l'utilisateur : comme avec une interface textuelle, un utilisateur peut seulement sélectionner un objet visuel, et en cliquant sur cet objet passer à l'adresse URL représentée par cet objet ; un utilisateur ne peut ni sélectionner un groupe d'objets, ni les manipuler (déplacement, rotation, etc.) ; non exploitation des possibilités graphiques : les interfaces graphiques sont crées plus pour un plaisir visuel que pour exploiter les avantages de la visualisation graphique de résultats de recherche (formes, couleurs, dimensions, etc.).
Dans le cas des moteurs de recherche à base d'indexation, la visualisation par interface graphique 2D ou 3D consiste à présenter à l'utilisateur un environnement 3D dans lequel chaque document des résultats de la recherche est représenté par un objet 3D.
Dans ce cas, les inconvénients de la visualisation par interface graphique 2D ou 3D sont notamment les suivants : il n'est pas offert à l'utilisateur la possibilité de choisir un modèle d'interface parmi plusieurs, en fonction des résultats à visualiser ; il n'est pas proposé ni suggéré de présenter à l'utilisateur d'abord collectivement des données, puis, en réponse à une interaction de l'utilisateur, des données plus spécifiques ;
comme pour les interfaces textuelles, le facteur de pertinence des documents retrouvés est calculé par le système, et les résultats sont présentés de façon fixe à l'utilisateur ; comme pour les interfaces textuelles, un seul facteur de pertinence est utilisé ; les interactions de l'utilisateur avec le système sont limitées au changement de point de vue et à l'ouverture d'un document souhaité. Il est impossible de manipuler les objets (déplacement, rotation, changement d'attributs, etc.) ; le mappage (ou mapping en anglais, c'est-à-dire l'association) de propriétés du résultat de la recherche avec des attributs visuels de l'environnement 3D est figé et ne peut pas être modifié par l'utilisateur ; les solutions existantes utilisent un logiciel spécialisé qui nécessite une installation complexe et n'est pas compatible avec les standards de visualisation 3D (VRML, X3D) ; les interfaces graphiques 3D permettent de visualiser des informations dans un environnement 3D universel, donc différents volumes d'informations doivent être présentés dans une même scène. Dans certains cas, ceci peut conduire à une présentation mal adaptée des informations et réduit la perception de l'utilisateur.
Plus précisément, l'un des objectifs de la présente invention est de fournir une nouvelle technique (système et procédé) de visualisation des résultats de recherches effectuées par un moteur de recherche à base d'indexation.
L'invention a également pour objectif de fournir une telle technique permettant de visualiser le résultat, complet ou partiel, d'une recherche, de la manière la mieux appropriée pour l'utilisateur.
Un objectif complémentaire de l'invention est de fournir une telle technique permettant à l'utilisateur de naviguer entre plusieurs environnements représentant différents niveaux d'abstraction, de façon à permettre à l'utilisateur de passer d'une vue globale du résultat d'une recherche, jusqu'à une visualisation précise des documents individuels qui l'intéressent, en passant éventuellement entre-temps par une ou plusieurs vues groupées de résultats intermédiaires.
Un autre objectif de l'invention est de fournir une telle technique permettant d'assigner ( mapping ) de manière flexible des propriétés du résultat d'une recherche à des attributs visuels des environnements tridimensionnels.
Encore un autre objectif de l'invention est de fournir une telle technique permettant de visualiser en même temps plusieurs facteurs de pertinence des réponses trouvées.
Un autre objectif de l'invention est de fournir une telle technique permettant de visualiser et comparer les résultats de plusieurs recherches.
Encore un autre objectif de l'invention est de fournir une telle technique permettant de construire une hiérarchisation du contenu du résultat d'une recherche à visualiser.
Ces différents objectifs, ainsi que d'autres qui apparaîtront par la suite, sont atteints selon l'invention à l'aide d'un système de traitement et de visualisation des résultats de recherches effectuées par au moins un moteur de recherche à base d'indexation. Selon l'invention, ce système comprend : des moyens de gestion d'un ensemble de modèles d'interface, chaque interface de modèle étant associé à un modèle d'interface utilisateur et un modèle de scène virtuelle 3D qui sont liés, chaque modèle de scène virtuelle 3D définissant un mappage particulier entre des paramètres dudit modèle de scène virtuelle 3D et des attributs du résultat d'au moins une recherche, l'ensemble de modèles d'interface comprenant un premier sous-ensemble comprenant au moins deux modèles d'interface dont les modèles de scène virtuelle 3D associés sont distincts et permettent chacun de visualiser la totalité du résultat de la au moins une recherche ; des moyens de sélection d'un modèle d'interface, comprenant des moyens de sélection initiale d'un modèle d'interface au sein dudit premier sous-ensemble de modèles d'interface, la sélection initiale étant fonction d'au moins un attribut du résultat de la au moins une recherche et/ou d'au moins une interaction de l'utilisateur avec le système ; des moyens de génération et restitution d'une interface utilisateur, selon le modèle d'interface utilisateur sélectionné par les moyens de sélection ;
des moyens de génération et restitution d'une scène virtuelle 3D, en fonction du résultat de la au moins une recherche et selon le modèle de scène virtuelle 3D sélectionné par les moyens de sélection, la scène virtuelle 3D restituée permettant à l'utilisateur de visualiser la totalité du résultat de la au moins une recherche.
La bactérie selon la présente invention est une bactérie utilisant le méthanol qui est modifiée de sorte que l'activité EDD et/ou EDA est augmentée, et qui est capable de produire un L-aminoacide par une voie de biosynthèse dans laquelle l'acide pyruvique constitue un intermédiaire.
Le L-aminoacide peut être par exemple la L-lysine, l'acide L-glutamique, la
L-thréonine, la L-leucine, la L-isoleucine, la L-valine, la L-sérine, la Lalanine, la L-thyrosine ou la L-phénylalanine.
On peut obtenir la bactérie selon la présente invention en modifiant une bactérie utilisant le méthanol capable de produire un Laminoacide de manière à stimuler ou augmenter l'activité EDD et/ou EDA.
Il est possible aussi d'obtenir une bactérie utilisant le méthanol selon la présente invention en conférant une capacité de production d'un Laminoacide à une bactérie assimilant le méthanol modifiée de telle manière que l'activité EDD et/ou EDA est augmentée. De plus, la bactérie utilisant le méthanol selon la présente invention peut être une bactérie a laquelle a été conférée une capacité de production d'un L-aminoacide du fait d'une modification telle que l'activité EDD et/ou EDA est stimulée.
Il est possible d'obtenir une bactérie utilisant le méthanol capable de produire un L-aminoacide en conférant à une souche de type sauvage d'une bactérie utilisant le méthanol une capacité de production d'un L-aminoacide. Pour conférer une capacité de production d'un Laminoacide, il est possible d'utiliser les procédés utilisés conventionnellement pour cultiver des bactéries coryneformes et des bactéries Escherichia, par exemple l'acquisition de souches mutantes auxotrophes, de souches résistant à des analogues ou de souches mutantes concernant la régulation métabolique, la création de souches recombinées dans lesquelles une enzyme du système de biosynthèse de Laminoacides est stimulée ("Amino Acid Fermentation", the Japan Scientific Societies Press [Gakkai Shuppan Center], 1ère édition, publié le 30 mai 1986, p. 77-100). Lors de la culture de bactéries produisant un Laminoacide, les propriétés d'auxotrophie, de résistance à des analogues, de mutation concernant la régulation métabolique peuvent être conférées individuellement, ou bien deux ou plusieurs d'entre elles peuvent être conférées en combinaison. Les enzymes du système de biosynthèse peuvent être stimulées individuellement ou bien deux ou plusieurs d'entre elles peuvent être stimulées en combinaison. De plus, il est possible de conférer des propriétés incluant l'auxotrophie, la résistance à des analogues et une mutation concernant la régulation métabolique et de stimuler simultanément une enzyme du système de biosynthèse.
Par exemple, il est possible de cultiver des bactéries produisant de la L-lysine sous forme de souches mutantes présentant une
auxotrophie pour la L-homosérine ou la L-thréonine et la L-méthionine (demandes de brevet japonais publiées n 48-28078 et 56-6499), de souches mutantes présentant une auxotrophie pour l'inositol ou l'acide acétique (demandes de brevet japonais mises à la disposition du public n 55-9784 et 56-8692) ou de souches mutantes qui sont résistantes à l'oxalysine, à l'hydroxamate de lysine, à la S-(2-aminoéthyl)-cystéine, à la y-méthyllysine, à l'a-chlorocaprolactame, au DL-[alpha]-amino-#-caprolactame, à l'a-amino-lauryllactame, à un analogue de l'acide aspartique, à un médicament de type sulfonamide, à un quinoïde ou à la N-lauroylleucine.
Dans la suite, on va décrire un procédé pour conférer ou stimuler une capacité de production d'un L-aminoacide par le biais de l'augmentation de l'expression d'un gène d'une enzyme dans un système de biosynthèse de L-aminoacides.
Il est possible de conférer une capacité de production de Llysine par exemple en stimulant les activités de la dihydrodipicolinate synthase et de l'aspartokinase.
Il est possible de stimuler les activités de la dihydrodipicolinate synthase et de l'aspartokinase dans une bactérie utilisant le méthanol en transformant cette bactérie avec un ADN recombiné préparé en ligaturant un fragment de gène codant la dihydrodipicolinate synthase et un fragment de gène codant l'aspartokinase avec un vecteur fonctionnel dans cette bactérie, de préférence un vecteur de type à copies multiples. Par suite de l'augmentation du nombre de copies du gène codant la dihydrodipicolinate synthase et du gène codant l'aspartokinase dans les cellules de la souche transformante, il est possible d'augmenter ou stimuler les activités de ces enzymes. Dans la suite, la dihydrodipicolinate synthase, l'aspartokinase et l'aspartokinase III sont appelées également en abrégé DDPS, AK et AKIII, respectivement.
Il est possible d'utiliser des micro-organismes quelconques comme micro-organismes fournissant un gène codant la DDPS et un gène codant AK, à condition que les micro-organismes puissent exprimer une activité DDPS et une activité AK dans une bactérie utilisant le méthanol.
De tels micro-organismes peuvent être des souches de type sauvage ou des souches mutantes dérivées de celles-ci. Spécifiquement, il peut s'agir de la souche de E coli (Escherichia coli) K-12 et de la souche de Methylophilus methylotrophus AS1 (NCIMB10515). Comme on connaît les
séquences nucléotidiques du gène codant la DDPS provenant de bactéries Escherichia (dapA, Richaud, F. et al., J. Bacteriol., 297 (1986)) et du gène codant la AKIII provenant de bactéries Escherichia (lyse, Cassan, M., Parsot, C., Cohen, G. N. et Patte, J.C., J. Biol. Chem., 261,1052 (1986)), on peut obtenir ces gènes par PCR en utilisant des amorces synthétisées sur la base des séquences nucléotidiques de ces gènes et, comme matrice, l'ADN chromosomique d'un micro-organisme comme E coli K-12.
A titre d'exemples spécifiques, les gènes dapA et lysC issus de E. coli seront illustrés dans la suite. Toutefois, les gènes utilisés selon la présente invention ne sont pas limités à ceux-ci.
Selon la présente invention, on préfère que DDPS et AK ne subissent pas une rétroinhibition par la L-lysine. On sait que DDPS de type sauvage provenant de E coli subit une rétroinhibition par la L-lysine et que AKIII de type sauvage provenant de E, coli subit une suppression et une rétroinhibition par la L-lysine. De ce fait, les gènes dapA et LysC qui sont introduits dans une bactérie utilisant le méthanol codent de préférence une DDPS et une AKIII comportant une mutation qui élimine la rétroinhibition par la L-lysine. Dans la suite la DDPS comportant une mutation qui élimine la rétroinhibition par la L-lysine sera appelée également "DDPS mutante", et un ADN codant la DDPS mutante peut aussi être appelé "dapA mutant ou dapA*". La AKIII provenant de E, coli comportant une mutation qui élimine la rétroinhibition par la L-lysine peut être appelée "AKIII mutante", et un ADN codant la AKIII mutante peut aussi être appelé /ysCmutant.
Dans le cadre de la présente invention, on entend par alkyle, des radicaux linéaires ou ramifiés par exemple méthyle, éthyle, n-propyle, iso-propyle, butyle, etc. Un radical alcoxy est un radical alk-O, le radical alkyle ayant la définition donnée ci dessus. Halogène désigne de préférence CI, Br, I, F.
dans laquelle # n varie de 0 à 4, étant entendu que lorsque n est supérieur ou égal à 2 alors les radicaux Ri peuvent être identiques ou différents, # R1 représente un atome d'halogène ; une chaîne hydrocarbonée en CiC6, aliphatique ou alicyclique, saturée ou insaturée, la chaîne pouvant contenir un ou plusieurs atomes d'oxygène, d'azote, de silicium, de soufre ou par un groupement SO2, et pouvant être substituée par un ou plusieurs radicaux hydroxy ou amino ; radical onium Z, le radical Ri ne comportant pas de liaison peroxyde, ni de radicaux diazo, nitro ou nitroso , R2 représente un radical onium Z ou un radical -X-C=NR8-NR9R10 dans lequel X représente un atome d'oxygène ou un radical -NR11 et Rs, R9, Rio et R11 représentent un atome d'hydrogène, un radical alkyle en C1-C4 ou un radical hydroxyalkyle en C1-C4, R3 représente un atome d'hydrogène ou un radical hydroxy.
A titre d'exemple, Ri peut être un atome de chlore, un radical méthyle, éthyle, isopropyle, vinyle, allyle, méthoxyméthyle, hydroxyéthyle, 1-carboxyméthyle, 1-aminométhyle, 2-carboxyéthyle, 2hydroxyéthyle, 3-hydroxypropyle, 1,2-dihydroxyéthyle, 1-hydroxy-2-
aminoéthyle, l-amino-2-hydroxyéthyle, 1,2- diaminoéthyle, méthoxy, éthoxy, allyloxy, 2-hydroxyéthyloxy.
Dans la formule (I), lorsque n est égal à 1, RI est de préférence un atome d'halogène ; une chaîne hydrocarbonée en CI-C6, aliphatique ou alicyclique, saturée ou insaturée, un ou plusieurs atomes de carbone pouvant être remplacés par un atome d'oxygène, d'azote, de silicium, de soufre, par un groupement SO2, le radical RI ne comportant pas de liaison peroxyde, ni de radicaux diazo, nitro ou nitroso. De préférence, RI est choisi parmi le chlore, le brome, les radicaux alkyles en Ci-C4, hydroxyalkyles en C1-C4, aminoalkyles en C1-C4, alcoxy en C1-C4, hydroxyalcoxy en C1-C4. A titre d'exemple, RI est choisi parmi un radical méthyle, hydroxyméthyle, 2-hydroxyéthyle, 1,2dihydroxyéthyle, méthoxy, isopropyloxy, 2-hydroxyéthoxy.
Le radical R2 de la formule (I) est selon un mode de réalisation particulier le radical onium Z correspondant à la formule (II) dans laquelle # D est une simple liaison ou une chaîne alkylène en C1-C14, linéaire ou ramifiée pouvant contenir un ou plusieurs hétéroatomes choisis parmi l'oxygène, le soufre ou l'azote, et pouvant être substituée
par un ou plusieurs radicaux hydroxyle, alcoxy en Ci-Ce ou amino, et pouvant porter une ou plusieurs fonctions cétone ; # R4, R5 et R6, pris séparément, représentent un radical alkyle en C1-C15 ; un radical monohydroxyalkyle en C1-C6 ; un radical polyhydroxyalkyle en C2-C6 ; un radical alcoxy(Ci-Ce)alkyle en CI-C6 ; un radical aryle ; un radical benzyle ; un radical amidoalkyle en C1-C6 ; un radical trialkyl(Ci-C6)silanealkyle en Ci-Ce ; un radical aminoalkyle en Ci-Ce ; un radical aminoalkyle en Ci-Ce dont l'amine est mono- ou disubstituée par un radical alkyle en CI-C4, alkyl(CI-C6)carbonyle, amido ou alkyl(Ci-C6)sulfonyle ; ou # R4, R5 et R6 ensemble, deux à deux, forment, avec l'atome d'azote auxquels ils sont rattachés, un cycle saturé carboné à 4,5, 6 ou 7 chaînons pouvant contenir un ou plusieurs hétéroatomes tel que par exemple un cycle azétidine, un cycle pyrrolidine, un cycle pipéridine, un cycle pipérazine ou un cycle morpholine, le cycle cationique pouvant être substitué par un atome d'halogène, un radical hydroxyle, un radical alkyle en Ci-Ce, un radical monohydroxyalkyle en Ci-Ce, un radical polyhydroxyalkyle en C2-C6, un radical alcoxy en Ci-Ce, un radical trialkyl(C1-C6)silanealkyle en Ci-Ce, un radical amido, un radical carboxyle, un radical alkyl(Ci-C6)carbonyl, un radical thio (-SH), un radical thioalkyle (-R-SH) en Ci-Ce, un radical alkyl(Ci-C6)thio, un radical amino, un radical amino mono ou disubstitué par un radical alkyl(Ci-C6), alkyl(Ci-C6)carbonyle, amido ou alkyl(Ci-C6)sulfonyle ; # R7 représente un radical alkyle en Ci-Ce ; un radical monohydroxyalkyle en Ci-Ce ; un radical polyhydroxyalkyle en C2-C6 ; un radical aryle ; un radical benzyle ; un radical aminoalkyle en Ci-Ce ; un radical aminoalkyle en Ci-Ce dont l'amine est mono- ou di-subsituée par un radical alkyl(CI-C6), alkyl(Ci-C6)carbonyle, amido ou alkyl(Ci- C6)sulfonyle ; un radical carboxyalkyle en Ci-Ce ; un radical
carbamylalkyle en Ci-Ce ; un radical trifluoroalkyle en Ci-Ce ; un radical trialkyl(Ci-C6)silanealkyle en Ci-Ce ; un radical sulfonamidoalkyle en Ci-Ce ; un radical alkyl(Ci-C6)carboxyalkyle en C1-C6 ; un radical alkyl(Ci-C6)sulfinylalkyle en C1-C6; un radical alkyl(CiC6)sulfonylalkyle en C1-C6; un radical alkyl(Ci-C6)carbonylalkyle en CiC6; un radical N-alkyl(Ci-C6)carbamylalkyle en Ci-C6; un radical Nalkyl(Ci-C6)sulfonamidoalkyle en CI-C6; # x est 0 ou 1, - lorsque x = 0, alors le bras de liaison est rattaché à l'atome d'azote portant les radicaux R4 à R6, - lorsque x = 1, alors deux des radicaux R4 à R6 forment conjointement avec l'atome d'azote auquel ils sont rattachés un cycle saturé à 4,5, 6 ou 7 chaînons et D est lié à un atome de carbone du cycle saturé ; # Y est un contre ion.
Dans la formule (II), lorsque x est égal à 0, alors R4, R5 et R6 séparément sont choisis de préférence parmi un radical alkyle en C1-C6, un radical monohydroxyalkyle en C1-C4, un radical polyhydroxyalkyle en C2-C4, un radical alcoxy(Ci-C6)alkyle en C1-C4, un radical amidoalkyle en C1-C6, un radical trialkyl(C1-C6)silanealkyle en Ci-C6, ou R4 avec R5 forment ensemble un cycle azétidine, un cycle pyrrolidine, pipéridine, pipérazine, morpholine, R6 étant choisi dans ce cas parmi un radical alkyle en C1-C6; un radical monohydroxyalkyle en C1-C6; un radical polyhydroxyalkyle en C2-C6; un radical aminoalkyle en C1-C6, un radical aminoalkyle mono ou disubstitué par un radical alkyl(Ci-C6), alkyl(Ci- C6)carbonyle, amido ou alkyl(C1-C6)sulfonyle ; un radical carbamylalkyle en Ci-Ce; un radical trialkyl(Ci-C6)silanealkyle en Ci- C6; un radical alkyl(C1-C6)carboxyalkyle en Ci-Ce; un radical alkyl(Ci-
C6) carbonyalkyle en Ci-C6; un radical N-alkyl(Ci-C6)carbamylalkyle en Ci-C6.
On réalise la culture dans des conditions aérobies sous agitation ou aération par agitation, à un pH de 5 à 9 et à une température de 20 à 45 C, et habituellement la culture est achevée en 24 à 120 h.
On peut recueillir la L-lysine ou la L-arginine à partir de la culture par une combinaison de procédés connus, par exemple en utilisant une résine échangeuse d'ions, la précipitation et d'autres procédés connus.
Dans la suite, la présente invention va être illustrée plus précisément à l'aide d'exemples non limitatifs dans lesquels les réactifs utilisés ont été obtenus auprès de Wako Pure Chemicals ou Nacalai Tesque, sauf indications contraires. Les compositions des milieux utilisés dans chaque exemple sont présentées ci-dessous. On a ajusté le pH avec NaOH ou HCI pour tous les milieux.
Milieu LB : Tryptone peptone (Difco) 10 g/L Extrait de levure (Difco) 5 g/L NaCl 10 g/L pH 7,0 Ces composants ont été stérilisés à la vapeur à 120 C pendant 20 min.
Milieu gélose LB : Milieu LB : Bacto gélose 15 g/L Ces composants ont été stérilisés à la vapeur à 120 C pendant 20 min.
Milieu SEII : K2HP04 1,9 g/L
NaH2P04 1,56 g/L MgS04-7H20 0,2 g/L (NH4)2S04 5 g/L CuSO4#TH2O 5 g/L MnS04-5H20 25 g/L ZnS04-7H20 23 g/L CaCl2#2H2O 72 mg/L FeCl3#6H2O 9,7 mg/L CaC03 (Kanto Kagaku) 30 g/L Méthanol 2 % (v/v) pH 7,0 Les composants différents du méthanol ont été soumis à une stérilisation à la vapeur à 121 C pendant 15 min, et le méthanol a été ajouté après un refroidissement suffisant du milieu.
Milieu gélose SE II : K2HP04 1,9 g/L NaH2P04 1,56 g/L MgS04-7H20 0,2 g/L (NH4)2S04 5 g/L CuSO4#5H2O 5 g/L MnSO4#TH2O 25 g/L ZnS04-7H20 23 g/L CaCl2#2H2O 72 mg/L FeCl3#6H2O 9,7 mg/L Méthanol 0,5 % (v/v) pH 7,0 Bacto gélose (Difco) 15 g/L Les composants différents du méthanol ont été soumis à une stérilisation à la vapeur à 121 C pendant 15 min, et le méthanol a été ajouté après un refroidissement suffisant du milieu.
Clonage de gènes d'enzymes de la voie de Entner-Doudoroff On a cloné à partir de Escherichia coli et Zymomonas mobilis les gènes edd et eda qui codent les enzymes EDD et EDA, respectivement, qui font partie de la voie de Entner-Doudoroff. Comme on sait que les gènes de Escherichia coli peuvent être exprimés dans la souche de Methylophilus methylotrophus AS1, on a décidé de cloner les gènes edd et eda provenant de Escherichia coli et de les exprimer dans une bactérie Methylophilus.