INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
Rg indépendamment l'un de l'autre désignent de préférence un groupement alkyle ayant de 1 à 4 atomes de carbone ; Y- est un anion tel que bromure, chlorure, acétate, borate, citrate, tartrate, bisulfate, bisulfite, sulfate, phosphate. Ces polymères sont notamment décrits dans le brevet français 2. 080.759 et dans son certificat d'addition 2.190.406.
(10) Le polymère de diammonium quaternaire contenant des motifs récurrents, répondant à la formule : formule (VII) dans laquelle : R10, Rll' R12 et R13, identiques ou différents, représentent des radicaux aliphatiques, alicycliques, ou arylaliphatiques contenant de 1 à 6 atomes de carbone ou des radicaux hydroxyalkylaliphatiques inférieurs, ou bien R10, R11, R12 et R13, ensemble ou séparément, constituent avec les atomes d'azote auxquels ils sont rattachés des hétérocycles contenant éventuellement un second hétéroatome autre que l'azote ou bien R10, R11, R12 et R13 représentent un radical alkyle en C1-C6 linéaire ou ramifié substitué par un groupement nitrile, ester, acyle, amide ou -CO-O- R14-D ou-CO-NH- R14-D où R14 est un alkylène et D un groupement ammonium quaternaire ;
Al et Bl représentent des groupements polyméthyléniques contenant de 2 à 6 atomes de carbone pouvant être linéaires ou ramifiés, saturés ou insaturés, et pouvant contenir, liés à ou intercalés dans la chaîne principale, un ou plusieurs cycles aromatiques, ou un ou plusieurs atomes d'oxygène, de soufre ou des groupements sulfoxyde, sulfone, disulfure, amino, alkylamino, hydroxyle, ammonium quaternaire, uréido, amide ou ester, et X- désigne un anion dérivé d'un acide minéral ou organique; Al, R10 et R12 peuvent former avec les deux atomes d'azote auxquels ils sont rattachés un cycle pipérazinique ; outre si Al désigne un radical alkylène ou hydroxyalkylène linéaire ou ramifié, saturé ou insaturé, Bl peut également désigner un groupement -(CH2)n-CO-D-OC-(CH2)n- dans lequel n est compris entre 1 et 100 et de préférence entre 1 et 50, et D désigne : a) un reste de glycol de formule : -O-Z-O-, où Z désigne un radical hydrocarboné linéaire ou ramifié ou un groupement répondant à l'une des formules suivantes : -(CH2-CH2-O)x-CH2-CH2- -[CH2-CH(CH3)-O]y-CH2-CH(CH3)- où x et y désignent un nombre entier de 1 à 4, représentant un degré de polymérisation défini et unique ou un nombre quelconque de 1 à 4 représentant un degré de polymérisation moyen ; b) un reste de diamine bis-secondaire tel qu'un dérivé de pipérazine ; c) un reste de diamine bis-primaire de formule : -NH-Y-NH-, où Y désigne un radical hydrocarboné linéaire ou ramifié, ou bien le radical bivalent -CH2-CH2-S-S-CH2-CH2- ; d) un groupement uréylène de formule : -NH-CO-NH- .
Encore une autre famille préférée de polyuréthanes amphiphiles cationiques est celle correspondant à la formule (la) ci-dessus dans laquelle
R et R' représentent tous les deux indépendamment un groupement hydrophobe, X et X' représentent tous les deux indépendamment un groupement comportant une amine quaternaire, n et p valent zéro, et L, L', Y et m ont la signification indiquée ci-dessus.
A titre d'exemple, le groupement hydrophobe peut être issu d'un alcool gras tel que l' alcool stéarylique, l'alcool dodécylique, l'alcool décylique. Il peut également désigner un polymère hydrocarboné tel que par exemple le polybutadiène.
Les groupements P et P', comprenant une fonction amine peuvent représenter au moins l'une des formules suivantes : dans lesquelles : R5 et R7 ont les mêmes significations que R2 défini précédemment; R6, R8 et R9 ont les mêmes significations que R1 et R3 définis précédemment ; R10 représente un groupe alkylène, linéaire ou ramifié, éventuellement insaturé et pouvant contenir un ou plusieurs hétéroatomes choisis parmi N, 0, S et P, et A- est un contre-ion physiologiquement acceptable.
Parmi les sels d'ammonium quaternaire de formule (VI), on préfère d'une part, les chlorures de tétraalkylammonium comme, par exemple, les chlorures de dialkyldiméthylammonium ou d'alkyltriméthylammonium dans lesquels le radical alkyle comporte environ de 12 à 22 atomes de carbone, en particulier les chlorures de béhényltriméthylammonium, de distéaryldiméthylammonium, de cétyltriméthyl- ammonium, de benzyldiméthylstéarylammonium ou encore, d'autre part, le chlorure de palmitylamidopropyltriméthylammonium ou le chlorure de stéaramidopropyldiméthyl-(myristyl acétate)-ammonium commercialisé sous la dénomination CERAPHYL 70 par la société VAN DYK.
POLYMERE FIXANT ANIONIQUE OU NON IONIQUE OU AMPHOTERE Au sens de la présente invention, on entend par "polymère fixant", un polymère capable de maintenir et/ou de fixer la coiffure dans une forme désirée.
Les polymères fixants anioniques généralement utilisés sont des polymères comportant des groupements dérivés d'acide carboxylique, d'acide sulfonique ou d'acide phosphorique et ont une masse moléculaire moyenne en nombre comprise entre environ 500 et 5 000 000.
Les groupements carboxyliques sont apportés par des monomères mono- ou diacides carboxyliques insaturés tels que ceux répondant à la formule : dans laquelle n est un nombre entier de 0 à 10, A1 désigne un groupement méthylène, éventuellement relié à l'atome de carbone du groupement insaturé ou au groupement méthylène voisin lorsque n est supérieur à 1, par l'intermédiaire d'un hétéroatome tel que oxygène ou soufre, R7 désigne un atome d'hydrogène, un groupement phényle ou benzyle, R8 désigne un atome d'hydrogène, un groupement alkyle inférieur ou carboxyle, et R9 désigne un atome d'hydrogène, un groupement alkyle inférieur, un groupement -CH2-COOH, phényle ou benzyle.
Les polymères fixants anioniques à groupements carboxyliques préférés selon l'invention sont : A) Les homo- ou copolymères d'acide acrylique ou méthacrylique ou leurs sels et en particulier les produits vendus sous les dénominations VERSICOL E ou K par la société ALLIED COLLOID et ULTRAHOLD par la société BASF, les copolymèrs d'acide acrylique et d'acrylamide vendus sous la forme de sel de sodium sous les dénominations RETEN 421,423 ou 425 par la société HERCULES, et les sels de sodium des acides polyhydroxycarboxyliques.
B) Les copolymères d'acide acrylique ou méthacrylique avec un monomère monoéthylénique tel que l'éthylène, le styrène, les esters vinyliques, les esters d'acide acrylique ou méthacrylique, éventuellement greffés sur un polyalkylène-glycol tel que le polyéthylène-glycol, et éventuellement réticulés. De tels polymères sont décrits en particulier dans le brevet français FR 1 222 944 et la demande de brevet allemand DE 2 330 956, les copolymères de ce type comportant dans leur chaîne un motif acrylamide éventuellement N-alkylé et/ou N- hydroxyalkylé tels que décrits notamment dans les demandes de brevets luxembourgeois n 75370 et 75371 et proposés sous la dénomination QUADRAMER par la société AMERICAN CYANAMID. On peut également citer les copolymères d'acide acrylique et de méthacrylate d'alkyle en C1-C4 et les terpolymères de vinylpyrrolidone, d'acide acrylique et de méthacrylate d'alkyle en C1-C20, par exemple, de lauryle, tels que celui commercialisé par la société ISP sous la dénomination ACRYLIDONE LM et les terpolymères acide méthacrylique/acrylate d'éthyle/acrylate de tertiobutyle tels que le produit commercialisé sous la dénomination LUVIMER 100 P par la société BASF.
C) Les copolymères dérivés d'acide crotonique, tels que ceux comportant dans leur chaîne des motifs acétate ou propionate de vinyle, et éventuellement d'autres monomères tels que les esters allylique ou méthallylique, éther vinylique ou ester vinylique d'un acide carboxylique saturé, linéaire ou ramifié, à longue chaîne hydrocarbonée, comme ceux comportant au moins 5 atomes de carbone, ces polymères pouvant éventuellement être greffés et réticulés, ou encore un autre monomère ester vinylique, allylique ou méthallylique d'un acide carboxylique a- ou [3-cyclique. De tels polymères sont décrits entre autres dans les brevets français FR 1 222 944, FR 1 580 545, FR 2 265 782, FR 2 265 781, FR 1 564 110 et FR 2 439 798. Des produits commerciaux entrant dans cette classe sont les résines 28- 29-30, 26-13-14 et 28-13-10 commercialisée par la société NATIONAL STARCH.
D) Les copolymères dérivés d'acides ou d'anhydrides carboxyliques monoinsaturés en C4-C8 choisis parmi : - les copolymères comprenant (i) un ou plusieurs acides ou anhydrides maléique, fumarique, itaconique et (ii) au moins un monomère choisi parmi les esters vinyliques, les éthers vinyliques, les halogénures vinyliques, les dérivés phénylvinyliques, l'acide acrylique et ses esters, les fonctions anhydrides de ces copolymères étant éventuellement monoestérifiées ou monoamidifiées. De tels polymères sont décrits en particulier dans les brevets US n 2,047,398,2,723,248
et 2,102,113, et le brevet GB 839 805. Des produits commerciaux sont notamment ceux vendus sous les dénominations GANTREZ AN ou ES par la société ISP.
Ces polymères sont par exemple décrits dans les brevets français FR 2 350 384 et FR 2 357 241 de la demanderesse.
Les polymères comprenant les groupements sulfoniques sont des polymères comportant des motifs vinylsulfonique, styrène-sulfonique, naphtalène- sulfonique ou acrylamido-alkylsulfonique.
Cette exclusivité s'entend non seulement (i) à l'égard des espèces, genres voire groupes bactériens en présence, les amorces et sondes étant choisies de manière à éviter toute hybridation avec les acides nucléiques d'autres espèces, genres ou groupes bactériens que celui effectivement recherché, mais aussi (ii) vis-à-vis des séquences nucléotidiques de l'espèce, du genre ou du groupe cible, dans la mesure où lesdites amorces
et sondes ne sont pas capables d'hybrider avec d'autres séquences que la séquence souhaitée. A ce titre, l'exclusivité des amorces pour amplification et sondes associées selon l'invention garantit l'obtention de résultats dépourvus de faux-positifs.
Les caractéristiques de spécificité et exclusivité sus-définies sont applicables non seulement aux amorces pour amplification et sondes associées, mais aussi aux séquences d'acides nucléiques cibles.
Dans le cadre de la présente description, l'on conviendra que les termes espèces ou espèces bactériennes pourront faire référence, selon les cas, à des espèces bactériennes proprement dites et conformément à l'usage taxonomique classique, ou à des genres bactériens, niveau de classification taxonomique immédiatement supérieur à l'espèce, ou encore à des groupes bactériens, lesdits groupes représentant soit des familles bactériennes telles que classiquement répertoriées dans le domaine de la systématique microbienne et correspondant au niveau de classification situé au-dessus du genre, soit des groupes de genres ou de familles de bactéries présentant un ou plusieurs caractères phénotypiques ou physiologiques communs. Par exemple, de tels groupes bactériens peuvent rassembler les bacilles par opposition aux coques, ou les organismes mésophiles (i.e., les organismes dont la température optimale de croissance se situe entre 20 et 37 C environ) par opposition aux organismes psychrophiles ou thermophiles (i.e., les organismes dont la température optimale de croissance se situe respectivement entre 4 et 10 C environ ou entre 45 et 60 C environ), ou encore les bactéries saprophytes (i.e., les bactéries vivant dans la nature de manière indépendante) par opposition aux bactéries commensales, symbiotiques ou parasites (i.e., les bactéries vivant en association étroite avec les cellules hôtes, respectivement sans bénéfice ni désavantage pour les unes et les autres, ou tirant chacune bénéfice de cette association, ou encore dont seules les bactéries tirent bénéfice, ces dernières altérant généralement le métabolisme des cellules hôtes). L'homme du métier
spécialisé en bactériologie est parfaitement à même de définir des groupes bactériens, en sus de ceux listés ci-dessus, sur la base de critères morphologiques et/ou phénotypiques et/ou physiologiques communs. Le sens à donner aux termes espèces ou espèces bactériennes ressortira clairement du contexte. En particulier, l'homme du métier pourra se référer au Tableau # infra pour savoir si les séquences nucléotidiques cibles des réactions d'amplification, et les séquences des amorces pour amplification et sondes associées selon l'invention, sont spécifiques et exclusives d'espèces, genres (Salmonella spp. par exemple) ou groupes bactériens (Escherichia coli, Shigella spp., Yersinia enterocolitica et Hafnia alvei par exemple).
Ainsi, un mode préféré de mise en oeuvre du procédé objet de l'invention consiste à utiliser à titre de matrice un échantillon constitué d'acides nucléiques préalablement extraits et purifiés à partir des cellules de bactéries contenues dans un mélange complexe, notamment alimentaire, ou dans de l'eau, à l'aide d'un automate d'extraction. Un exemple d'un tel automate a été décrit dans la demande de brevet français N 0204424 relative à un procédé d'extraction des acides nucléiques de microorganismes contenus dans un mélange complexe, notamment alimentaire, ledit procédé comprenant au moins les étapes suivantes : 1) la clarification du mélange par filtration ; 2) la rétention des microorganismes contenus dans le filtrat sur un dispositif de type cartouche de filtration ; 3) la lyse des microorganismes in situ; 4) la récupération des acides nucléiques à partir de la cartouche de filtration ; et 5) la concentration et la purification des acides nucléiques par chromatographie d'adsorption liquide-solide, telle la chromatographie sur colonne de silice.
La demande N 0204424 concerne également un automate capable de mettre en oeuvre un tel procédé d'extraction.
Selon le procédé de détection objet de la présente invention, le terme amplification est revêtu d'un sens générique, en ce qu'il fait référence à toute technique de biologie moléculaire dont le principe consiste à amplifier ou multiplier de manière exponentielle une séquence d'acide nucléique cible. L'on peut citer à titre d'exemples non limitatifs, la PCR, l'amplification par transcription (Transcription-Mediated Amplification ; TMA), l'amplification basée sur des séquences d'acides nucléiques (Nucleic Acid Séquence Based Amplification ; NASBA), l'auto-réplication de séquences (Self-Sustained Séquence Réplication ; 3SR), l'amplification par déplacement de brin (Strand Displacement Amplification ; SDA) et la réaction de ligature en chaîne (Ligase Chain Reaction ; LCR).
Il convient de noter que l'acronyme PCR peut être utilisé dans le cadre de la présente invention pour désigner de manière spécifique la réaction de PCR, ou de manière indifférente toute réaction d'amplification telle que celles sus-citées.
Selon un mode de réalisation de l'invention, l'amplification est effectuée aux fins d'une détection purement qualitative des bactéries contenues dans un mélange complexe ou dans de l'eau.
En revanche, selon un autre mode de réalisation, l'analyse effectuée conformément au procédé objet de l'invention est quantitative, en ce qu'elle permet de déterminer la concentration initiale de la séquence cible au sein de l'échantillon d'acides nucléiques. Il est alors fait appel aux techniques d'amplification dite quantitative , cinétique ou en temps réel connues de l'homme du métier.
En particulier, ces techniques permettent de mesurer par fluorescence l'accumulation des produits au cours de la réaction d'amplification, l'intensité de la fluorescence émise étant proportionnelle à la quantité de molécules amplifiées. De nombreux systèmes de détection en temps réel des produits d'amplification PCR ont ainsi été développés, parmi lesquels l'on distingue les agents intercalants émettant un signal fluorescent lorsqu'ils sont liés à l'ADN double brin ( DNA binding dye ), les amorces fluorescentes, les sondes d'hybridation et les sondes d'hydrolyse (pour revue, voir Le Technoscope intitulé La PCR en temps réel , cahier N 139, dans la revue Biofutur N 219 de février 2002).
Parmi les systèmes les plus utilisés, figurent notamment les sondes d'hydrolyse de type TaqManTM (ABI, Foster City, CA, Etats-Unis). Ces sondes comptent entre 25 et 35 nucléotides environ, et portent un fluorophore au niveau de leur extrémité 5' et un absorbeur de fluorescence (ci-après quencheur ) à l'extrémité 3'. Le quencheur, placé à faible distance du fluorophore, absorbe la fluorescence émise par celui-ci et émet une fluorescence qui n'est pas détectée par l'automate PCR. A titre d'exemple, le 5-TAMRA, qui ré-émet à 568 nm peut être inhibé. La Taq DNA polymérase (ci-après Taq polymérase ), de par son activité exonucléase dans le sens 5' vers 3', va dégrader la sonde hybridée à la région de la séquence cible qui lui est complémentaire. Cette dégradation est effectuée par l'enzyme de manière séquentielle, à partir de l'extrémité 5' de la sonde. C'est précisément ce processus de dégradation par hydrolyse de la sonde qui est à l'origine de la fluorescence émise, le fluorophore étant ainsi physiquement séparé du quencheur par un mécanisme impliquant directement la séquence à détecter.
Brièvement, lors de l'étape d'hybridation de la réaction PCR, les amorces pour amplification et la sonde associée reconnaissent leur séquence complémentaire. La Taq polymérase procède ensuite à l'extension des amorces dans le sens 5' vers 3' jusqu'à rencontrer la structure double brin formée par la région de la séquence cible hybridée
avec la sonde. L'activité exonucléase de 5' vers 3' de l'enzyme clive alors séquentiellement la sonde à partir de son extrémité 5'. Cette hydrolyse progressive libère le fluorophore dans le milieu réactionnel, ce qui entraîne une augmentation de la fluorescence émise. La mesure de la fluorescence au terme de chaque étape d'extension de la réaction PCR permet de suivre l'évolution de la réaction au cours du temps et de déterminer la concentration initiale en acides nucléiques cibles dans l'échantillon de départ.
(7) Les polymères répondant à la formule générale (XI) tels que ceux décrits par exemple dans le brevet français 1 400 366 : dans laquelle R29 représente un atome d'hydrogène, un radical CH30, CH3CH20, phényle, R30 désigne l'hydrogène ou un radical alkyle inférieur tel que méthyle, éthyle, R31désigne l'hydrogène ou un radical alkyle inférieur tel que méthyle, éthyle, R32 désigne un radical alkyle inférieur tel que méthyle, éthyle ou un radical répondant à la formule : R33-N(R31)2, R33 représentant un groupement -CH2-CH2- , -CH2-CH2-CH2- , -CH2-CH(CH3)- , R31 ayant les significations mentionnées ci-dessus, ainsi que les homologues supérieurs de ces radicaux et contenant jusqu'à 6 atomes de carbone,
(8) Des polymères amphotères du type-D-X-D-X- choisis parmi: a) les polymères obtenus par action de l'acide chloracétique ou le chloracétate de sodium sur les composés comportant au moins un motif de formule : -D-X-D-X-D- (XVII) où D désigne un radical et X désigne le symbole E ou E', E ou E' identiques ou différents désignent un radical bivalent qui est un radical alkylène à chaîne droite ou ramifiée comportant jusqu'à 7 atomes de carbone dans la chaîne principale non substituée ou substituée par des groupements hydroxyle et pouvant comporter en outre des atomes d'oxygène, d'azote, de soufre, 1 à 3 cycles aromatiques et/ou hétérocycliques ; atomes d'oxygène, d'azote et de soufre étant présents sous forme de groupements éther, thioéther, sulfoxyde, sulfone, sulfonium, alkylamine, alkénylamine, des groupements hydroxyle, benzylamine, oxyde d'amine, ammonium quaternaire, amide, imide, alcool, ester et/ou uréthanne ; b) les polymères de formule : -D-X-D-X- (XVIII) où D désigne un radical
(9) Les copolymères alkyl(Ci-C5)vinyléther / anhydride maléique modifié partiellement par semiamidification avec une N,Ndialkylaminoalkylamine telle que la N,N-diméthylaminopropylamine ou par semiestérification avec une N, N-dialcanolamine. Ces copolymères peuvent également comporter d'autres comonomères vinyliques tels que le vinylcaprolactame.
Lesdits polymères amphotères à chaîne grasse préférés selon l'invention comprennent, ou sont préparés en copolymérisant : 1) au moins un monomère de formule (la) ou (Ib): dans lesquelles, R1 et R2, identiques ou différents, représentent un atome d'hydrogène ou un radical méthyle, R3, R4 et R5, identiques ou différents, représente un radical alkyle linéaire ou ramifié ayant de 1 à 30 atomes de carbone, Z représente un groupe NH ou un atome d'oxygène, n est un nombre entier de 2 à 5, A- est un anion issu d'un acide organique ou minéral, tel qu'un anion méthosulfate ou un halogénure tel que chlorure ou bromure; 2) au moins un monomère de formule (II) R6-CH= CR7-COOH (II) dans laquelle, R6 et R7, identiques ou différents, représentent un atome d'hydrogène ou un radical méthyle; et
3) au moins un monomère de formule (III) : R6 - CH=CR7-COXR8 (III) dans laquelle R6 et R7, identiques ou différents, représentent un atome d'hydrogène ou un radical méthyle, X désigne un atome d'oxygène ou d'azote et Rg désigne un radical alkyle linéaire ou ramifié ayant de 1 à 30 atomes de carbone ; l'un au moins des monomères de formule (la), (Ib) ou (III) comportant au moins une chaîne grasse.
Les monomères de formule (III) de la présente invention sont choisis, de
préférence, dans le groupe constitué par des acrylates ou méthacrylates d'alkyle en C12-C22 et plus particulièrement en C16-C18.
Les poids moléculaires moyens en poids des polymères amphotères à chaîne grasse selon l'invention peuvent varier de 500 à 50.000.000 et sont de préférence compris entre 10. 000 et 5 000 000.
Dans la composition de teinture d'oxydation selon l'invention, on préfère utiliser un polymère associatif à chaîne grasse de type cationique ou non ionique, et encore plus préférentiellement de type cationique. Encore plus préférentiellement, le polymère associatif est choisi parmi les polyuréthanes cationiques.
Le ou les polymères associatifs sont présents dans la composition à des teneurs en poids comprises de préférence entre 0,05 et 10%, et encore de préférence entre 0,1 et 5% du poids total de la composition.
(14) Les polymères réticulés de sels de méthacryloyloxyalkyl(C1-C4) trialkyl(Cl-C4)ammonium tels que les polymères obtenus par homopolymérisation du diméthylaminoéthylméthacrylate quaternisé par le chlorure de méthyle, ou par copolymérisation de l'acrylamide avec le
*On peut également utiliser un homopolymère réticulé du chlorure de méthacryloyloxyéthyl triméthylammonium contenant environ 50 % en poids de l'homopolymère dans de l'huile minérale ou dans un ester liquide.
Dans le présent texte, on parlera indifféremment de bactéries présentes dans de l'eau , en milieu aqueux , ou dans un milieu aqueux , étant entendu que cela désigne au sens large des bactéries présentes dans tout type de liquide aqueux.
La présente invention concerne un procédé pour la détection, l'identification et, le cas échéant, la quantification de bactéries contenues dans un mélange complexe ou en milieu aqueux, ledit procédé comprenant une étape d'amplifications multiples, simultanées mais séparées dans l'espace, de séquences d'acides nucléiques cibles.
L'invention a en outre pour objets des couples d'amorces pour amplification utiles à la mise en #uvre dudit procédé, ainsi que des sondes nucléotidiques pour la détection et, le cas échéant, la quantification de séquences d'acides nucléiques de bactéries contenues dans un mélange complexe ou en milieu aqueux. Dans le cadre de l'invention, les sondes nucléotidiques peuvent être associées à des couples d'amorces pour amplification, aux fins de l'amplification en temps réel de séquences d'acides nucléiques cibles. Les sondes nucléotidiques peuvent également être utilisées pour la détection de séquences cibles selon des techniques d'hybridation ADN-ADN.
La présente invention concerne enfin des outils de biologie moléculaire, à savoir un kit d'analyse et des micro-réseaux ou puces à acides nucléiques pour la détection et l'identification de bactéries contenues dans un mélange complexe ou en milieu aqueux.