INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
l'interaction des protéines virales ou parasitaires avec une holoenzyme particulière de PP2A pourraient ainsi constituer de nouveaux agents antitumoraux, antiviraux ou antiparasitaires.
L'invention porte sur une méthode d'identification d'un peptide dont la séquence est issue d'une protéine virale, parasitaire ou cellulaire, ledit peptide liant spécifiquement une holoenzyme protéine phosphatase de type 2A ou l'une de ses sous-unités, ladite méthode comprenant les étapes consistant à : a) déposer sous forme de spots, sur un support, des peptides dont la séquence est issue d'une protéine virale, parasitaire ou cellulaire, chaque spot correspondant au dépôt d'un peptide de séquence définie, b) mettre en contact le support solide avec une solution contenant une holoenzyme protéine phosphatase 2A ou l'une de ses sous-unités dans des conditions permettant aux peptides présents sur le support, de lier l'holoenzyme ou l'une de ses sous-unités, et, c) à identifier sur le support solide, le peptide sur lequel se fixe la protéine phosphatase 2A ou l'une de ses sous-unités.
Selon l'étape a), différents peptides sont déposés sur un support solide à des positions définies ( spot ), chaque position correspondant à une séquence peptidique spécifique et l'ensemble formant ainsi un réseau de peptides ( array ) à deux dimensions. Différentes méthodes de préparation de tels réseaux ont été décrites récemment (pour revue, Figeys et Pinto, 2001 Electrophoresis 22 : 208-216 ; Walter et al., 2000 Curr Opin Microbial 3 : 298-302). L'ensemble de ces méthodes comprend en général la fixation covalente de peptides sur un support, en particulier à l'aide de lieurs (linkers) chimiques. A titre d'exemple, l'homme du métier pourra notamment se reporter à la technique des SPOT synthesis consistant à synthétiser directement sur une membrane de cellulose, des peptides comprenant jusqu'à 20 résidus (Frank et Overwing, Methods in Molecular
Biology, 1996, vol. 66 : 149-169, Epitope Mapping Protocols edited by : G. E. Morris Humana Press Inc., Totowa NJ).
De manière générale, toute méthode peut être utilisée dès lors que celle-ci permet l'obtention d'un réseau de peptides déposés sur un support solide, utilisable pour détecter des interactions spécifiques entre les peptides déposés et des composés particuliers.
De façon très préférée, l'ensemble des séquences de peptides déposés recouvre la séquence complète de la protéine virale, parasitaire ou cellulaire dont ces séquences sont issues. Ainsi, le procédé permet de tester en une seule étape la séquence complète d'une protéine donnée, celle-ci étant sectionnée en un nombre fini de peptides, de séquences généralement chevauchantes.
Dans un mode de réalisation préféré, les peptides déposés sous forme de spot sont d'une taille inférieure à 20 acides aminés, et mieux, d'une taille inférieure à 15 acides aminés.
Dans un autre mode de réalisation particulier, les peptides sont déposés sur une membrane de cellulose.
Le réseau ainsi obtenu est mis en contact à l'étape b), avec une holoenzyme protéine phosphatase de type 2A ou l'une de ses sous-unités.
Par holoenzyme protéine phosphatase de type 2A , il faut comprendre tout complexe dimérique (AC) ou hétérotrimérique (ABC), purifié d'un extrait cellulaire ou reconstitué après purification des deux sous-unités (A) et (C) d'une protéine phosphatase de type (2A) et le cas échéant d'une sous-unité (B). Les protéine phosphatases de type (2A) sont de préférence issues de mammifères.
Les supports sont incubés par exemple dans une solution tampon comprenant les protéine phosphatase purifiées ou l'une de leurs sousunités purifiées. Une solution tampon utilisable est le TBS (TRIS BORATE) contenant 5% de régilait écrémé et 3% de BSA.
L'invention concerne aussi un polypeptide comprenant le domaine HECT d'un polypeptide à domaine HECT tel que défini ci-dessus. Elle est également relative à un polypeptide consistant en le domaine HECT d'un polypeptide selon l'invention.
Le domaine HECT d'un polypeptide selon l'invention est considéré comme un fragment d'un tel polypeptide aux fins de la présente description.
Ainsi, fait également partie de l'invention un polypeptide comprenant ou consistant en une séquence d'acides aminés choisie parmi les séquences suivantes : a) la séquence allant de l'acide aminé en position 1248 jusqu'à l'acide aminé en position 1585 de la séquence SEQ ID Nol ; b) la séquence allant de l'acide aminé en position 1259 jusqu'à l'acide aminé en position 1624 de la séquence SEQ ID N 2 ; c) la séquence allant de l'acide aminé en position 230 jusqu'à l'acide aminé en position 567 de la séquence SEQ D ? 3 ; d) la séquence allant de l'acide aminé en position 1153 jusqu'à l'acide aminé en position 1620 de la séquence SEQ ID N 4 ; e) la séquence allant de l'acide aminé en position 742 jusqu'à l'acide aminé en position 1083 de la séquence SEQ ID N05 ; f) la séquence allant de l'acide aminé en position 481 jusqu'à l'acide aminé en position 823 de la séquence SEQ D ? 6 ; g) la séquence allant de l'acide aminé en position 1 jusqu'à l'acide aminé en position 206 de la séquence SEQ D ? 7 ; h) la séquence allant de l'acide aminé en position 48 jusqu'à l'acide aminé en position 372 de la séquence SEQ D ? 8 ; i) la séquence allant de l'acide aminé en position 618 jusqu'à l'acide aminé en position 947 de la séquence SEQ ID N'g ; j) la séquence allant de l'acide aminé en position 1235 jusqu'à l'acide aminé en position 1572 de la séquence SEQ ID N 10 ; k) la séquence allant de l'acide aminé en position 373 jusqu'à l'acide aminé en position 694 de la séquence SEQ ID N011 ;
Pour obtenir une délétion totale ou partielle de la boîte HECT, l'homme du métier peut, par exemple, mettre en oeuvre une digestion enzymatique de l'acide nucléique codant le polypeptide considéré en utilisant les sites de restriction flanquants, par exemple selon la technique décrite par MRGOTTIN et al. (Margottin F. et al., 1998, Molecular cell, 1 : 565-574).
Les acides nucléiques codant un polypeptide à domaine HECT tel que défini ci-dessus peuvent être facilement obtenus par l'homme du métier, par exemple à partir d'un échantillon d'ADN humain ou encore à partir d'une banque d'ADN humain, à l'aide d'amorces spécifiques de l'une des séquences SEQ ID ? 12 à SEQ ID N022, par exemple par amplification PCR.
Comme cela sera exposé plus loin dans la description, l'expression d'un variant d'un polypeptide à domaine HECT selon l'invention, dans lequel le domaine HECT a été complètement ou partiellement délétée, ou muté peut être recherchée dans le cas où l'on désire obtenir une diminution ou un blocage de la dégradation du substrat spécifique. Un tel variant d'un polypeptide à domaine HECT selon l'invention peut conserver sa capacité à interagir spécifiquement avec le substrat, mais n'est plus capable d'ubiquitiner ce substrat.
Selon un autre aspect, l'invention est donc aussi relative à un acide nucléique codant pour un variant d'un polypeptide à domaine HECT tel que défini ci-dessus, dans la séquence duquel tout ou partie de la séquence du domaine HECT a été délétée.
Par délétion partielle du domaine HECT, on entend la suppression d'au moins 2, de préférence d'au moins 5,6, 7,8, 9,10, 12,14, 16,18, 20, 22,24, 26,30, 40,50, 60,70, 80,90, 100110, 120,130, 140,150, 160,170, 180,190, 200,210, 220,230, 240,250, 260,270, 280,290, 300,310, 320, 330,340 ou 350 acides aminés consécutifs de la séquence du domaine HECT d'un polypeptide selon l'invention, la longueur de la délétion étant limitée par la longueur en acides aminés d'un domaine HECT dans chacun des polypeptides à domaine HECT selon l'invention.
Dans un mode de réalisation préféré, l'acide nucléique codant pour un variant d'un polypeptide à domaine HECT dans la séquence duquel la séquence du domaine HECT a été complètement ou partiellement délétée est choisi parmi les acides nucléiques suivants :
a) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID N012 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 1248 jusqu'à l'acide aminé en position 1585 de la séquence SEQ ID N012 ; b) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID ? 13 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 1259 jusqu'à l'acide aminé en position 1624 de la séquence SEQ ID D ? 13 ; c) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID N014 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 230 jusqu'à l'acide aminé en position 567 de la séquence SEQ ID N 14 ; d) un polypeptide comprenant la séquence SEO ID N015 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 1153 jusqu'à l'acide aminé en position 1620 de la séquence SEQ ID N 15 ; e) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID N016 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 742 jusqu'à l'acide aminé en position 1083 de la séquence SEQ ID N016 ; f) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID N 17 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 481 jusqu'à l'acide aminé en position 823 de la séquence SEQ ID N017 ; g) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID N 18 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 1 jusqu'à l'acide aminé en position 206 de la séquence SEQ ID N018 ; h) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID N019 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 48 jusqu'à l'acide aminé en position 372 de la séquence SEQ ID N 19 ; i) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID N020 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé
en position 618 jusqu'à l'acide aminé en position 947 de la séquence SEQ ID ? 20 ; j) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID ? 21 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 1235 jusqu'à l'acide aminé en position 1572 de la séquence SEQ ID N021 ; k) un polypeptide comprenant la séquence SEQ ID ? 22 dans lequel a été totalement ou partiellement délétée la séquence allant de l'acide aminé en position 373 jusqu'à l'acide aminé en position 694 de la séquence SEQ ID ? 22 ; Selon un autre mode de réalisation d'un acide nucléique selon l'invention, cet acide nucléique est caractérisé en ce qu'il code pour un polypeptide à domaine HECT, ou un variant ou un fragment de ce polypeptide, qui est fusionné avec un polypeptide hétérologue.
Par polypeptide hétérologue , on entend une séquence d'acides aminés qui n'est pas exprimée naturellement par la cellule sous une forme chimiquement liée à un polypeptide à domaine HECT tel que défini cidessus.
Selon un troisième mode de réalisation, le polypeptide hétérologue consiste en un polypeptide accepteur ou donneur de fluorescence utilisable dans des systèmes de détection d'interactions par transfert d'énergie de fluorescence (ou FRET pour Fluorescence Résonance Energy Transfer ).
Selon un quatrième mode de réalisation, le polypeptide hétérologue consiste en un premier partenaire protéique lequel, lorsqu'il interagit spécifiquement avec un second partenaire protéique, a la capacité de se fixer sur un motif d'acide nucléique régulant la transcription d'un gène rapporteur, pour une utilisation dans des systèmes de détection
composant Cl 13 est lui-même réalisé sur la base d'un composant programmable de type FPGA ("Field Programmable Gate Array"en terminologie anglo-saxonne) Spartan XCS30XL, commercialisé par la société XILINX (Marque déposée).
Les trois ports externes du moyen d'interfaçage 104 sont destinés à être connectés à des ports de même type sur un autre nced de commutation du réseau commuté, permettant ainsi au dispositif 90 de communiquer avec un autre ncad de ce réseau.
Ce moyen 105 met en ouvre notamment une unité de mémorisation à double port 106 qui permet de stocker des données à destination de, ou provenant du réseau commuté 1355.
Les initiales DPRAM signifient en terminologie anglo-saxonne"Dual Port Random Access Memory"ce qui peut être traduit en langue française par "Mémoire volatile à double port".
Ces zones mémoires comportent chacune un pointeur de lecture et un
pointeur d'écriture associés.
Chaque zone mémoire étant gérée comme une mémoire de type FIFO, son remplissage et son vidage peuvent s'effectuer en même temps, et de manière indépendante. Ceci permet de désynchroniser les opérations de lecture et d'écriture des données, effectuées par une unité de commutation 108, des opérations de lecture et d'écriture des données, effectuées par le module de contrôle 107.
Ce stockage est temporaire pour les paquets de données asynchrones (paquets constituant un message transmis en mode non connecté) et pour les paquets de contrôle, qui sont amenés à être transférés ensuite dans le moyen de stockage RAM 95 ou dans la mémoire flash 86 pour un stockage d'une durée plus importante.
clavier du panneau avant. Si l'identification de demandeur est disponible par l'intermédiaire du service téléphonique local, le système peut récupérer le numéro du demandeur pour permettre au résident de répondre à l'appel ultérieurement. Une fonction de validation/invalidation d'autocommutateur privé et de numérotation entrante procure une possibilité de configuration d'appel pour composer un numéro pour l'accès extérieur, par exemple le 9. Une fonction d'identification d'unité de numérotation permet l'attribution d'un numéro d'identification à 6 chiffres, de façon qu'une personne composant un numéro en relation avec l'unité puisse récupérer l'identification d'unité pour déterminer si le demandeur est entré en contact avec l'unité correcte.
Le système de commande d'accès du mode de réalisation préféré comprend la possibilité de produire des signaux audibles, par exemple des "bips", en réponse à diverses actions d'entrée. Ainsi, par exemple, le hautparleur de l'unité de commande principale peut produire un bip d'accès autorisé au moment de l'autorisation de l'accès du résident/ visiteur. De plus, des bips de temps de conversation sur le téléphone peuvent indiquer le moment auquel une communication du visiteur vers le résident approche de la fin de la période de conversation sélectionnée. Ces alertes audibles peuvent être invalidées ou validées comme on le désire.
De plus, le système de commande d'accès conforme au mode de réalisation préféré de la présente invention facilite des échanges d'information et d'autres communications entre lui-même et d'autres systèmes, tels qu'un ordinateur universel exécutant un système de gestion de personnel ou de comptabilité. De telles communications inter-systèmes comprennent deux couches de communication : une couche de données, de niveau supérieur, et une couche de transport de niveau inférieur. Des systèmes communiquent
en transmettant des paquets dans un sens et dans l'autre dans la couche de transport. Un paquet peut être soit un paquet d'ordre, soit un paquet de réponse. La couche de données de niveau supérieur contient des demandes et des réponses de messages inter-systèmes. Des messages provenant de la couche de données sont assemblés en paquets pour la transmission dans la couche de transport, dans laquelle des paquets entrants sont validés et des messages sont extraits de paquets valides. Des messages extraits sont transmis vers le haut à la couche de données. De plus, chaque système peut identifier une réception d'informations non significatives dans la couche de transport, et effectuer un acquittement négatif à leur sujet, et rediriger des paquets destinés à une autre unité. Sinon, chaque système extrait toutes les autres réponses de paquets au fur et à mesure qu'il les reçoit, et envoie les réponses à la couche de données, dans laquelle la réponse est traitée.
Chaque paquet d'ordre commence par un octet de Début de Paquet (SOP pour "Start of Packet") (Ox7E) qui est suivi par un octet de longueur indiquant la longueur du message de couche de données inclus dans le paquet. Des champs et en particulier des champs de longueur variable à l'intérieur de chaque paquet sont délimités par un octet de délimiteur de champ ou caractère séparateur Il 1 (Ox7C).
L'octet de longueur est suivi par un champ d'ordre d'une longueur de 1 octet. Le champ d'ordre contient un littéral sélectionné parmi des caractères ASCII compris entre 0x00 et 0x80 dans le Tableau 1, par exemple, dans lequel des littéraux d'ordre correspondent à des codes ASCII, en particulier des caractères majuscules. Des littéraux d'étape de programme (P,p) procurent une approche souple pour désigner des ordres de fonctions spéciales et, bien que le nombre maximal d'étapes de programme ou le nombre d'étapes soit limité seulement par la longueur de paquet, de façon caractéristique le nombre réel est inférieur à 1 000 000, comme désigné par un octet de délimiteur de champ
suivant # (Ox7C). De plus, une liste préférée de 103 étapes de programme est donnée dans l'Annexe I. Un champ optionnel de nombre d'unités (c'est-à-dire une adresse de destination et/ou de source avec un décalage de Ox80), ayant 1 ou 2 octets (un octet pour chacune de l'adresse de source et de destination) peut être inclus immédiatement après l'octet d'ordre. Un nombre d'octets de données déterminé par la valeur de l'octet de longueur, suit immédiatement l'octet d'ordre ou, s'il est inclus, le champ de nombre d'unités.
Chaque paquet d'ordre se termine par un octet de total de contrôle.
Littéral Remarques ! Demande de message d'identificateur, habituellement une version de microprogramme ? Demande de message d'identificateur, habituellement une version de microprogramme A [Alerte] B C D [Exécuter] E [Evénement] F Prélèvement, lecture étendue (fenêtre+bloc, décalage 16, compte 8) G Obtention du calendrier H I J K L M N 0 P Etape de programme 0-103 comme indiqué dans l'Annexe I joint Q R Lecture de mémoire (adresse, compte) S Bourrage, fil étendu (fenêtre+bloc, décalage 16, données 8, ...) T Extraction de transaction (index) U V Mode prolixe (débogage) W Ecriture en mémoire (adresse, données 8, ...) X Extraction de transaction étendue (Index long) Y Z Ox01 Utilisé seulement sur le bus maître/esclave d'actionneur de ~~~~~~~~ porte
Des paquets de réponse peuvent avoir une structure qui est pratiquement identique à celle de paquets d'ordre, avec deux différences mineures, c'est-à-dire un octet de Début de Réponse (SOR pour "Start of Response") (Ox7D) et un littéral de réponse. Ainsi, chaque paquet de réponse
commence par un octet SOR suivi dans l'ordre par un octet de longueur de données, un numéro d'unité de destination facultatif, un numéro d'unité de source facultatif, un octet de littéral de réponse, des données de paquet et, finalement, un octet de total de contrôle. Ainsi, par exemple, un littéral de réponse peut être une lettre minuscule pour un littéral d'ordre majuscule correspondant; par exemple, un littéral d'ordre d'étape de programme (P) appellerait un littéral de réponse de programme (p).
A la réception d'une séquence quelconque d'octets qu'on ne peut pas assembler en un paquet, c'est-à-dire une réponse non significative, le système réagit en émettant un paquet d'acquittement négatif (NAK) à un seul octet (Ox7F).
Dans le cas contraire, si le troisième octet d'un paquet est >Ox80, il est traité comme un numéro d'unité. Si le numéro d'unité du paquet ne concorde pas avec un numéro d'unité de réception, le paquet est émis vers l'unité de destination de paquet. Dans le cas contraire, les données de paquet sont désassemblées en un message et transmises à la couche de données.
Les valeurs de code de début sélectionnées pour NAK (Ox7F), SOP (Ox7E) et SOR (Ox7D) sont les moins susceptibles d'apparaître comme des valeurs de données.
Cependant, n'importe quelles autres valeurs appropriées peuvent être sélectionnées et substituées à ces trois valeurs. En outre, des champs de paquet sont décrits comme des champs d'une largeur d'un octet seulement pour la commodité. Des champs peuvent être plus étroits, par exemple 4 bits (largeur d'un fragment) ou plus larges, par exemple une largeur de mot (16 bits) ou une double largeur (32 bits), sans sortir de l'esprit ou du cadre de l'invention.
On peut avoir des structures de vitrage feuilleté, notamment du type : (D-Revêtement antireftets optionnel/verre 1/feuille (s) de polymère thermoplastique/système à diffusion lumineuse variable/feuitte (s) de polymère thermoplastique/verre 2/revêtement antireflets optionnel, ou encore (Z-Revêtement antireflets optionnet/verre 1/feuille (s) de polymère thermoplastique/système à diffusion lumineuse variable/feuitte (s) de polymère thermoplastique/verre 2/feuille (s) de polymère thermoplastique/ verre 3/revêtement antireflets optionnel.
Une configuration à un seul verre peut être du type : (s)-Revêtement antireftets optionnel/verre 1/feuille (s) de polymère thermoplastique/système à diffusion lumineuse variable/feuille (s) de polymère protectrice optionnelle.
Dans ces configurations, c'est te verre 1 et/ou 2 et/ou 3 qui peut être teinté dans ta masse et/ou être muni d'une couche absorbante, ou l'une des feuilles de polymère thermoplastique être teintée dans la masse.
Comme on t'a vu, une configuration favorable consiste à ce que ce soit te verre le plus proche du spectateur qui soit ce verre absorbant (par coloration dans ta masse ou par adjonction d'une couche).
Une variante préférée de cette configuration consiste à ce que ce soit ce verre absorbant qui soit muni d'un revêtement antireflets.
L'invention a pour objet l'élément dans sa globalité décrit plus haut (pouvant inclure toutes les connectiques, alimentations électriques, joints, cadre périphérique connus per se et adaptés à ce type de produit), cet élément faisant partie d'un écran de rétro-projection fonctionnant en transmission.
L'invention sera ci-après décrite plus en détails à l'aide des figures jointes qui représentent : Figure 1 : un vitrage feuilleté selon l'invention à deux verres, Figure 2 : un vitrage feuilleté selon l'invention à trois verres.
Ces figures sont extrêmement schématiques et ne sont pas à l'échelle pour en faciliter La Lecture.
Dans tous les exemples qui suivent, Le système à cristaux liquides 1 est de configuration : feuille de PET/électrode/film fonctionnel/électrode/feuille de PET, l'ensemble étant actuellement utilisé dans les vitrages Priva-Lite de SAINTGOBAIN GLASS.
Le film fonctionnel comportant l'émulsion liquide de cristaux liquides nématiques est d'une épaisseur d'environ 10 à 30 um (de préférence 20 à 25 micromètres). Les feuilles de PET ont une épaisseur d'environ 175 um. Les deux électrodes sont constituées d'ITO (oxyde d'indium dopé à l'étain) de résistivité environ 100 ohms par carré.
On donne ci-après quelques détails sur les cristaux liquides et Leur médium utilisables. En ce qui concerne les cristaux liquides, ceux-ci peuvent être du type NCAP , notamment ceux utilisés dans les vitrages Priva-Lite ou PDLC qui ont été mentionnés plus haut. En règle générale, leur biréfringence est comprise entre 0,1 et 0,2, elle est variable notamment en fonction du médium utilisé, de l'ordre de 0,1 si le polymère du médium est de type polyuréthane (PU) et de l'ordre de 0,2 s'il est de type alcool polyvinylique (PVA).
Le médium est en effet de préférence à base d'un polymère de la famille des PU (latex) et/ou des PVA, généralement préparé en phase aqueuse dans une proportion de polymères de 15 à 50% en poids par rapport à l'eau.
Les éléments actifs vis-à-vis de la diffusion lumineuse sont avantageusement sous forme de gouttelettes de diamètre moyen compris entre 0,5 et 3 um, notamment entre 1 et 2,5 pm, dispersées dans le médium. La taille des gouttelettes dépend d'un certain nombre de paramètres, dont notamment la
facilité d'émulsion des éléments actifs dans le médium considéré. De préférence, ces gouttelettes représentent entre 120 et 220% en poids du médium, notamment entre 150 et 200% en poids, hormis le solvant, généralement aqueux dudit médium.