INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
Les bactéries ou microorganismes procaryotes sont remarquables pour l'hétérogénéité de leurs caractéristiques, en particulier en termes de forme (bacilles, coques...); habitat (sol, eau, hôtes vivants...) ; structure des enveloppes cellulaires (éventuelle présence d'une paroi, composition de ladite paroi, éventuelle présence d'une membrane externe) ; régime saprophyte, commensal ou parasite ; spectre d'hôtes dans le cas des commensaux et parasites ;profil de pathogénicité et éventuels caractères de résistance aux antibiotiques caractéristiques de certains parasites ; aptitude à transférer des séquences d'acides nucléiques au sein de l'espèce, du genre, voire vers des espèces appartenant à d'autres genres bactériens... Le plus souvent, ces propriétés présentent une spécificité au niveau du genre ou de l'espèce bactérienne. Cependant, elles peuvent
également être soumises à une extrême variabilité entre souches d'une même espèce du fait de facteurs environnementaux et conditions de stress différents orientant lesdites souches vers des voies d'évolution adaptative distinctes. Au vu d'un tel niveau d'hétérogénéité des propriétés des bactéries, l'on mesure aisément les difficultés posées par le typage et l'identification clairs et formels desdites bactéries lorsqu'elles sont contenues dans des échantillons complexes parmi d'autres composants cellulaires.
Pourtant, il n'en demeure pas moins qu'une telle identification intéresse nombre d'activités. A ce titre, elle représente un défi aux enjeux considérables.
Dans le domaine médical, il est de première nécessité de disposer de procédures et moyens d'identification des bactéries optimaux en termes de fiabilité et pouvoir discriminant, ceci eu égard aux problèmes de santé publique générés par les infections bactériennes, notamment les infections par des bactéries multirésistantes aux antibiotiques, parfois très difficiles à enrayer. Aussi l'identification précise des bactéries jusqu'au niveau de l'espèce a-t-elle pour objectif de répondre à plusieurs attentes, non seulement du public mais également du personnel médical. Pour ce dernier, il s'agit en particulier de pouvoir : (i) diagnostiquer avec exactitude les pathologies des patients ; (ii) anticiper en matière de traitements, lesquels sont dès lors plus ciblés et mieux adaptés aux pathologies en cause ; (iii) prévenir et, le cas échéant, faire face à d'éventuelles rechutes ou récidives ; et (iv) approfondir les connaissances épidémiologiques relatives aux microorganismes pathogènes, notamment via la caractérisation des facteurs favorables au développement des infections.
Dans le domaine de la veille sanitaire, il convient de s'assurer de la qualité et l'innocuité des aliments disponibles sur le marché, en particulier afin d'écarter tout risque potentiel d'épidémie par contamination de masse.
A cet égard, les consommateurs se sentent concernés par les questions relatives aux propriétés nutritionnelles des aliments, leurs saveurs, leur
caractère inoffensif, et parfois même leurs éventuelles vertus prophylactiques ou thérapeutiques, avec le concept récent des alimentsmédicaments , dits alicaments . La tendance actuelle du public vise à exiger une parfaite transparence tout au long de la chaîne alimentaire, c'est-à-dire tant au niveau de la production des matières premières ou produits finis et la fabrication des produits intermédiaires, qu'au niveau de l'acheminement desdits matières premières ou produits finis et intermédiaires vers leur site de vente, et qu'au niveau de leur commercialisation ou leur utilisation dans le cadre de la préparation de produits plus complexes, tels les plats cuisinés. C'est pourquoi des normes de sécurité et qualité ont été édictées à l'attention des producteurs, fabricants, transporteurs, distributeurs et restaurateurs, normes dont le nonrespect est sanctionné par des autorités spécialisées compétentes en matière de veille sanitaire, parmi lesquelles les experts vétérinaires et la Direction Générale de la Consommation, la Concurrence et la Répression des Fraudes. Ainsi, des contrôles sont effectués, de manière régulière ou sporadique, ponctuelle ou à plus grande échelle, afin de couvrir l'ensemble de la chaîne alimentaire, de la production jusqu'à la vente au particulier. A ce titre, il est fondamental de garantir qualité et fiabilité du contrôle microbiologique des aliments, s'agissant en particulier de la détermination du niveau zéro de contamination par des bactéries pathogènes pour l'homme et/ou les animaux.
Aux fins de la détection et l'identification des bactéries, l'on a longtemps fait appel à des procédés basés sur des réactions biochimiques permettant de mettre en évidence in vitro les caractéristiques phénotypiques et métaboliques propres aux souches testées. Cependant, ces méthodes conventionnelles montrent souvent une capacité limitée à identifier les bactéries jusqu'au niveau de l'espèce, en ce qu'elles reposent sur le résultat de réactions souvent aléatoires de métabolisation éventuellement fermentaire de diverses sources de nutriments, par exemple des sources de carbone et d'azote. En effet, l'identification
phénotypique consiste à combiner et croiser les réponses des bactéries à une pluralité de tests biochimiques. En conséquence, lorsque certaines espèces ne répondent pas à un ou plusieurs desdits tests - ce qui est le cas de certaines espèces bactériennes qui, bien que pathogènes, sont rarement isolées en milieu hospitalier notamment - l'analyse devient hasardeuse et dépourvue d'objectivité. Aussi, pour en améliorer la spécificité et l'acuité, des tests complémentaires s'imposent, requérant alors temps, efforts et moyens parfois coûteux. En définitive, de tels procédés se révèlent longs et compliqués à mettre en #uvre, le résultat n'étant généralement obtenu qu'après 24 à 48 heures, et aléatoires en termes de spécificité et fiabilité. Certes, des systèmes commerciaux d'identification phénotypique, tels les galeries miniaturisées d'utilisation manuelle de la gamme API (bioMérieux, France) ou les cartes destinées à être ensemencées, incubées et lues au moyen d'un automate (VITEK, bioMérieux, France), restent néanmoins utilisés en clinique et dans l'industrie. Cependant, les analyses en cause concernent des espèces bactériennes couramment isolées et faciles à cultiver. De plus, elles ne sont pas effectuées pour répondre à une urgence étant donné que les temps d'incubation requis par de tels systèmes atteignent souvent 24 heures.
Dans le but de développer des procédures conduisant à une discrimination rapide et correcte des bactéries, des approches alternatives aux traditionnels tests physiologiques ont été proposées.
Certaines de ces approches demeurent dans le domaine de la caractérisation phénotypique, par exemple les méthodes fondées sur des réactions avec des anticorps ou le typage bactériophagique en fonction du profil des récepteurs bactériens. Cependant, de telles méthodes sont d'une reproductibilité discutable eu égard à la variabilité d'expression des caractéristiques phénotypiques en question, telle l'expression des facteurs de virulence et des antigènes, sporadique car influencée dans une très large mesure par l'environnement et le stress.
Quant aux autres procédures, elles ont été élaborées aux fins d'une discrimination non plus d'ordre phénotypique mais génotypique, c'est-à-dire au niveau des séquences d'acides nucléiques elles-mêmes et de leur organisation. Elles font à cet égard intervenir des techniques de biologie moléculaire (Gurtler et Mayall. 2001. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51(Pt 1) : 3-16).
- les sels de l'acide polystyrène-sulfonique tels que les sels de sodium vendus par exemple sous les dénominations FLEXAN 130 et FLEXAN 500 par la société NATIONAL STARCH. Ces composés sont décrits dans le brevet FR 2 198 719.
- les sels d'acides polyacrylamide-sulfoniques tels que ceux mentionnés dans le brevet US 4,128,631, et plus particulièrement l'acide polyacrylamidoéthylpropanesulfonique vendu sous la dénomination COSMEDIA POLYMER HSP 1180 par la société HENKEL.
Les polymères fixants amphotères utilisables dans les compositions de la présente invention peuvent être choisis parmi les polymères comportant des motifs B et C répartis statistiquement dans la chaîne polymère où B désigne un motif dérivant d'un monomère comportant au moins un atome d'azote basique et C désigne un motif dérivant d'un monomère comportant un ou plusieurs groupements carboxyliques ou sulfoniques. Les polymères fixants amphotères peuvent
également comporter des motifs zwitterioniques de type carboxybétaïne ou sulfobétaïne.
Il peut également s'agir de polymères à chaîne principale cationique comportant des groupements amine primaire, secondaire, tertiaire ou quaternaire, parmi lesquels au moins un porte, par l'intermédiaire d'un radical hydrocarboné, un groupement acide carboxylique ou acide sulfonique. Les polymères fixants amphotères peuvent encore avoir une chaîne anionique dérivée d'acides carboxyliques a, b-insaurés don l'un des groupements carboxyle a été amené à réagir avec une polyamine comportant un ou plusieurs groupements amine primaire.
Les polymères fixants amphotères répondant à la définition donnée ci- dessus sont choisis notamment parmi les polymères suivants : (1) les polymères résultant de la copolymérisation d'un monomère dérivé d'un composé vinylique portant un groupement carboxylique tel que plus particulièrement l'acide acrylique, l'acide méthacrylique, l'acide maléïque, l'acide alpha-chloroacrylique, et d'un monomère basique dérivé d'un composé vinylique substitué contenant au moins un atome basique, tel que plus particulièrement les méthacrylate et acrylate de dialkylaminoalkyle, les dialkylaminoalkyl- méthacrylamide et acrylamide. De tels composés sont décrits dans le brevet américain US 3,836,537.
(2) les polymères comportant des motifs dérivant : (a) d'au moins un monomère choisi parmi les acrylamides ou les méthacrylamides substitués sur l'atome d'azote par un groupe alkyle, (b) d'au moins un comonomère acide contenant un ou plusieurs groupements carboxyliques réactifs, et (c) d'au moins un comonomère basique tel que des esters à substituants amine primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire des acides acrylique et méthacrylique, et le produit de quaternisation du méthacrylate de diméthylamino- éthyle avec le sulfate de diméthyle ou diéthyle.
Les acrylamides ou méthacrylamides N-substitués sont notamment les composés dont les groupes alkyle comportent de 2 à 12 atomes de carbone, et plus particulièrement le N-éthylacrylamide, le N-tertiobutylacrylamide, le N- tertiooctylacrylamide, le N-octylacrylamide, le N-décylacrylamide, le N- dodécylacrylamide ainsi que les méthacrylamides correspondants.
Les comonomères acides sont choisis plus particulièrement parmi les acides acrylique, méthacrylique, crotonique, itaconique, maléique, fumarique ainsi
que les monoesters d'alkyle ayant 1 à 4 atomes de carbone des acides ou des anhydrides maléique ou fumarique.
On utilise particulièrement les copolymères dont la dénomination CTFA (4ème Ed., 1991) est Octylacrylamide/acrylates/butylaminoethyl-methacrylate copolymer, tels que les produits vendus sous la dénomination AMPHOMER ou LOVOCRYL# 47 par la société NATIONAL STARCH.
(3) les polyaminoamides réticulés et alcoylés partiellement ou totalement dérivant de polyaminoamides de formule générale : - (CO-R10-CO-Z-)- dans laquelle R10 représente un groupe divalent dérivé d'un acide dicarboxylique saturé, d'un acide aliphatique mono ou dicarboxylique à double liaison éthylénique, d'un ester d'un alcanol inférieur ayant 1 à 6 atome de carbone de ces acides ou d'un groupe dérivant de l'addition de l'un quelconque desdits acides avec une amine bis- primaire ou bis-secondaire, et Z désigne un groupe dérivant d'une polyalkylène- polyamine bis-primaire, mono- ou bis-secondaire et de préférence représente : a) dans les proportions de 60 à 100 % en moles, le groupe -NH-[(CH2)x-NH]poù x = 2 et p = 2 ou 3, ou bien x = 3 et p = 2 ce groupe dérivant de la diéthylène-triamine, de la triéthylène-tétraamine ou de la dipropylène-triamine; b) dans les proportions de 0 à 40 % en moles, le groupe -NH- [(CH2)x-NH]p- où x = 2 et p = 1 et qui dérive de l'éthylène-diamine, ou le groupe dérivant de la pipérazine : c) dans les proportions de 0 à 20 % en moles, le groupe -NH- (CH2)6-NHdérivant de l'hexaméthylènediamine,
ces polyaminoamides étant réticulés par réaction. d'addition d'un agent réticulant bifonctionnel choisi parmi les épihalohydrines, les diépoxydes, les dianhydrides, les dérivés bis-insaturés, au moyen de 0,025 à 0,35 mole d'agent réticulant par groupement amine du polyaminoamide, et alcoylés par action d'acide acrylique, d'acide chloracétique ou d'une alcane-sultone ou de leurs sels.
Les acides carboxyliques saturés sont choisis de préférence parmi les acides ayant 6 à 10 atomes de carbone tels que les acides adipique, triméthyl-2,2,4adipique et triméthyl-2,4,4-adipique, téréphtalique, les acides à double liaison éthylénique comme, par exemple, les acides acrylique, méthacrylique, itaconique.
Encore une autre famille préférée de polyuréthanes amphiphiles cationiques est celle correspondant à la formule (la) ci-dessus dans laquelle R et R' représentent tous les deux indépendamment un groupement hydrophobe, X et X' représentent tous les deux indépendamment un groupement comportant une amine quaternaire, n et p valent zéro, et L, L', Y et m ont la signification indiquée ci-dessus.
Lorsque X et/ou X' désignent un groupement comportant une amine tertiaire ou quaternaire, X et/ou X' peuvent représenter l'une des formules suivantes : dans lesquelles : R2 représente un radical alkylène ayant de 1 à 20 atomes de carbone, linéaire ou ramifié, comportant ou non un cycle saturé ou insaturé, ou un radical arylène, un ou plusieurs des atomes de carbone pouvant être remplacé par un hétéroatome choisi parmi N, S, 0, P ; R1 et R3, identiques ou différents, désignent un radical alkyle ou alcényle en C1-C30, linéaire ou ramifié, un radical aryle, l'un au moins des atomes de carbone pouvant être remplacé par un hétéroatome choisi parmi N, S, O, P ; A- est un contre-ion physiologiquement acceptable.
Les groupements L, L' et L" représentent un groupe de formule : dans laquelle : Z représente -O-, -S- ou-NH- ; et
Un premier type de composés entrant dans la préparation du polyuréthane de formule (la) est un composé comportant au moins un motif à fonction amine. Ce composé peut être multifonctionnel, mais préférentiellement le composé est difonctionnel, c'est-à-dire que selon un mode de réalisation préférentiel, ce composé comporte deux atomes d'hydrogène labile portés par exemple par une fonction hydroxyle, amine primaire, amine secondaire ou thiol. On peut également utiliser
un mélange de composés multifonctionnels et difonctionnels dans lequel le pourcentage de composés multifonctionnels est faible.
Dans une première architecture à trois niveaux : le moteur de recherche 1 est localisé sur un serveur distant ; le module 24 de gestion des relations avec le moteur de recherche 1, ainsi que la base de données intermédiaire 25 sont localisés sur un équipement intermédiaire ; tous les autres éléments du système de visualisation 2 sont localisés sur l'équipement client.
Le fait que le moteur de recherche, qui est localisé sur le serveur distant, soit séparé du système de visualisation, qui lui est réparti entre l'équipement intermédiaire et l'équipement client, fournit une flexibilité élevée de communication avec un ou plusieurs moteurs de recherche gérés par des opérateurs indépendants. La localisation sur l'équipement intermédiaire de certains éléments 24,25 permet de réduire le poids du logiciel client, donne la possibilité de travailler avec des résultats de recherche plus grands, et fournit une opportunité de gestion de l'équipement intermédiaire par une société distincte de celle gérant le moteur de recherche.
Une seconde architecture à trois niveaux se distingue de la première discutée cidessus en ce que les éléments suivants du système de visualisation 2 sont également localisés sur l'équipement intermédiaire : - le jeu de méta-modèles 23 ; - le module 26 de gestion des méta-modèles ; - le jeu de modèles d'interface 21 ; - le module 27 de gestion des modèles d'interface.
Une troisième architecture à trois niveaux se distingue de la seconde discutée cidessus en ce que les éléments suivants du système de visualisation 2 sont également localisés sur l'équipement intermédiaire : le module 29 de gestion de l'interface utilisateur 2D ; l'interpréteur X-VRML 210.
Une quatrième architecture à trois niveaux se distingue de la troisième discutée ci-dessus en ce que le module 28 de gestion des interactions de l'utilisateur est également localisé sur l'équipement intermédiaire. Dans ce cas, le logiciel client est très léger.
Les inconvénients des seconde, troisième et quatrième architectures sont : moindre efficacité d'exécution des interactions de l'utilisateur et nécessité d'un rafraîchissement de page fréquent, tant pour les scènes virtuelles 3D que pour les interfaces utilisateur 2D.
Une cinquième architecture à trois niveaux se distingue de la quatrième discutée ci-dessus en ce que le module 24 de gestion des relations avec le moteur de recherche 1, ainsi que la base de données intermédiaire 25 sont localisés du côté du moteur de recherche, et non plus sur l'équipement intermédiaire.
Les avantages principaux de cette cinquième architecture à trois niveaux sont : possibilité d'implémenter efficacement les éléments du serveur distant dans un système de gestion de base de données ; possibilité de gestion de l'équipement intermédiaire par une société distincte de celle gérant le moteur de recherche ; légèreté du logiciel client.
Le principal inconvénient est la nécessité d'obtenir l'accord du propriétaire du moteur de recherche pour installer les éléments du serveur de visualisation déportés sur son serveur.
On présente désormais, en relation avec la figure 3. les éléments d'un modèle d'interface 21, dans un mode de réalisation particulier de l'invention.
Dans ce mode de réalisation particulier, le modèle d'interface 21 comprend deux parties qui sont liées, à savoir : un modèle d'interface utilisateur 2D, référencé 2 la, qui est une abstraction d'interfaces utilisateur 2D. Il définit les éléments suivants : des contrôles visuels, des actions, un mappage attributs de résultat de recherche / paramètres de scène 3D, des actions initiales et des éléments d'écoute ( listeners ) ; un modèle de scène virtuelle 3D, référencé 21b, qui est une abstraction de scènes virtuelle 3D. Il définit les éléments suivants : l'apparence de scènes virtuelles 3D et des actions par des objets virtuels 3D.
La définition DTD du modèle d'interface 21 est par exemple la suivante : Dans cet exemple, le modèle d'interface comprend : une balise complémentaire , contenant une déclaration de mappage entre des attributs de résultat de recherche et des paramètres de scène 3D ; une balise complémentaire , définissant un modèle d'interface utilisateur 2D ; une balise complémentaire , définissant un modèle de scène virtuelle 3D.
On trouvera en annexe 2 une description détaillée des balises complémentaires (nouveaux tags) permettant de définir, au sein des balises complémentaires et , différents modèles d'interface
utilisateur 2D, y inclus le mappage entre les attributs du résultat d'une recherche et les paramètres d'une scène virtuelle 3D.
Il convient de noter que la balise complémentaire , décrite en annexe 2, peut également être utilisée pour définir des modèles de scène virtuelle 3D, même si (dans un seul souci de simplification) elle n'est pas décrite à nouveau en annexe 3.
La section modèle de scène virtuelle 3D du modèle d'interface est définie dans la balise complémentaire . Le contenu de cette balise complémentaire est un programme écrit dans le langage X-VRML complété (voir discussion ci-dessus). En d'autres termes, hormis pour les balises complémentaires (propres à la présente invention), la définition DTD de cette balise complémentaire est définie par la définition DTD du langage X-VRML.
monoamide d'acide maléique, polyoxyalkyléné et modifié hydrophobe par une chaîne alkyle ou alcényle en C8-C30 linéaire ou ramifiée, éventuellement en mélange avec un monoester d'acide maléique.
De préférence selon la présente invention, les polymères amphotères sont choisis parmi ceux comportant au moins un motif cationique non cyclique.
Et plus particulièrement encore, on préfère ceux préparés à partir ou comprenant 1 à 20 moles% de monomère comportant une chaîne grasse, et de préférence 1,5 à 15 moles% et plus particulièrement encore 1,5 à 6 moles%, par rapport au nombre total de moles de monomères.
Lesdits polymères amphotères à chaîne grasse préférés selon l'invention comprennent, ou sont préparés en copolymérisant : 1) au moins un monomère de formule (la) ou (Ib): dans lesquelles, R1 et R2, identiques ou différents, représentent un atome d'hydrogène ou un radical méthyle, R3, R4 et R5, identiques ou différents, représente un radical alkyle linéaire ou ramifié ayant de 1 à 30 atomes de carbone, Z représente un groupe NH ou un atome d'oxygène, n est un nombre entier de 2 à 5, A- est un anion issu d'un acide organique ou minéral, tel qu'un anion méthosulfate ou un halogénure tel que chlorure ou bromure; 2) au moins un monomère de formule (II) R6-CH= CR7 COOH (II) dans laquelle, R6 et R7, identiques ou différents, représentent un atome d'hydrogène ou un radical méthyle; et
Les monomères de formule (la) et (Ib) de la présente invention sont choisis, de préférence, dans le groupe constitué par : - le diméthylaminoéthylméthacrylate, le diméthylaminoéthylacrylate, - le diéthylaminoéthylméthacrylate, le diéthylaminoéthylacrylate, - le diméthylaminopropylméthacrylate, le diméthylaminopropylacrylate, - le diméthylaminopropylméthacrylamide, le diméthylaminopropylacrylamide, ces monomères étant éventuellement quaternisés, par exemple par un halogénure d'alkyle en C1-C4 ou un sulfate de dialkyle en C-C..
Les méta-modèles sont par exemple écrits dans le langage X-VRML complété (voir discussion ci-dessus). Ils permettent de coder une logique définissant des changements de modèle d'interface au sein d'un groupe prédéterminé de modèles d'interface. Cette logique utilise des mécanismes de routes, statiques ou dynamiques, entre les modèles d'interface.
Dans le cas du mécanisme de routes statiques (voir annexe 1, premier exemple), le modèle d'interface suivant dépend généralement d'une valeur de variable passée à partir du modèle d'interface précédent (c'est-à-dire passée avec la demande d'exécution du méta-modèle). Les routes statiques sont donc figées dans le méta-modèle.
Dans le cas du mécanisme de routes dynamiques (voir annexe 1, second exemple), le méta-modèle utilise des calculs algorithmiques, des accès à des bases de données et des variables d'entrée pour décider quel modèle d'interface suivant doit être chargé. Cette approche permet de sélectionner le modèle d'interface reflétant le mieux les propriétés d'un résultat de recherche. Dans le processus décisionnel, les attributs du résultat de la recherche, tels que le nombre de réponses trouvées, le niveau de détail, le nombre de catégories, etc., sont analysés.
Les paramètres d'entrée pour un méta-modèle peuvent être fournis de plusieurs façons : comme un attribut de l'action de changement de modèle d'interface ( changeModel action ) (voir description ci-après) ; comme une valeur d'une variable stockée par l'une des balises complémentaires et , permettant d'affecter une valeur donnée ou un objet donné, respectivement, à une variable de session donnée (voir description ci-après) ; comme une valeur de bouton de l'interface utilisateur 2D.
Un méta-modèle peut passer des variables au modèle d'interface suivant à charger, en utilisant les balises complémentaires et . En particulier, un méta-modèle qui retrouve des données dans une base de données en utilisant la balise complémentaire d'interrogation (voir description ciaprès), peut délivrer un résultat de recherche au modèle d'interface en utilisant la balise complémentaire , avec l'attribut VARNAME de la balise pointant