INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
Un premier objet de l'invention consiste en un acide nucléique codant pour un polypeptide à domaine HECT choisi parmi les séquences d'acides aminés comprenant les séquences SEQ ID N01 à SEQ ID ? 11, ou pour un fragment ou un variant du polypeptide choisi parmi les séquences d'acides aminés comprenant les séquences SEQ ID N 1 à SEQ ID D ? 11.
Selon l'invention, le fragment du polypeptide à domaine HECT comprend ou consiste en le peptide définissant le domaine HECT stricto sensu d'un polypeptide choisi parmi les séquences d'acides aminés comprenant les séquences SEQ ID N01 à SEQ ID ? 11.
Selon l'invention, un fragment du polypeptide à domaine HECT comprend ou consiste en un polypeptide choisi parmi les séquences d'acides aminés comprenant les séquences SEQ ID N01 à SEQ ID N011 dans lequel a été délétée la séquence en acides aminés du domaine HECT stricto sensu.
Un acide nucléique tel que défini ci-dessus peut en outre être caractérisé en ce que le polypeptide à domaine HECT, un fragment ou un variant de ce polypeptide est fusionné avec un polypeptide hétérologue, par exemple un marqueur détectable ou la protéine GAL4.
Elle concerne aussi des cellules hôtes recombinantes dans lesquelles a été artificiellement inséré un acide nucléique ou un vecteur recombinant tel que défini ci-dessus.
L'invention a également pour objet un polypeptide à domaine HECT comprenant une séquence d'acides aminés choisie parmi les séquences SEQ ID N01 à SEQ ID ? 11, un fragment ou un variant de ce polypeptide, ainsi que des anticorps dirigés contre ce polypeptide ou encore le fragment ou le variant de celui-ci..
Elle est également relative à des procédés de criblages cellulaires ou cellulaires de composés candidats interagissant avec un polypeptide à domaine HECT tel que défini ci-dessus.
Elle concerne aussi des procédés de criblages de composés candidats modulant la force de l'interaction entre un polypeptide à domaine HECT selon l'invention et une protéine substrat, ainsi que des procédés de criblage de composés candidats capables d'inhiber ou d'activer l'activité ubiquitine ligase de la protéine à domaine HECT spécifiée par le polypeptide considéré.
Ensuite, au cours d'un test 204, la valeur a priori des pointeurs de lecture en cours d'utilisation PtRi et le pointeur d'écriture Pt W de la FIFO sont comparés.
On note que la notion de FIFO vide est associée à un pointeur de lecture PtRi : si la FIFO est vide pour un pointeur de lecture PtRi actif, une routine d'exception est lancée pour ce pointeur, les autres pointeurs de lecture ne devant pas être gênés dans leur progression. On pourra considérer que le pointeur de lecture PtRi pour lequel la FIFO est vide est perdu et devra être réinitialisé.
L'égalité de la valeur a priori du pointeur de lecture PtRi et du pointeur d'écriture PtW de la FIFO signifie que la FIFO est vide. Si les deux pointeurs sont égaux, au cours d'une étape 207, une exception de traitement quelconque de type FIFO vide est effectuée et l'étape 201 est réitérée.
Lorsque le pointeur d'écriture PtW et la valeur a priori du pointeur de lecture PtR de la FIFO ne sont pas égaux, au cours d'un test 205, la valeur a priori de l'offset (modulo la taille d'une page) correspondant à la valeur a priori du
pointeur de lecture PtRi est comparée à la valeur 0 afin de détecter un éventuel changement de page.
Si l'offset correspondant à la valeur a priori du pointeur de lecture n'est pas nul, au cours d'une étape 219, le registre PtRi est mis à jour avec la valeur a priori du pointeur de lecture.
Si au cours du test 205, l'offset correspondant à la valeur a priori du pointeur de lecture est nul, un changement de page est détecté et, au cours d'une étape 206, une valeur égale à 0 est affectée au statut (associé au pointeur PtRi) de la page correspondante (indiquant que la page vient juste d'être complètement lue) indexée par l'index courant de lecture dans la table 10 puis la valeur de l'index courant de lecture est incrémentée d'une unité. On note que lors de l'étape 206, on vérifie (selon un mode non représenté) que les pointeurs PtRi et PtW ne sont pas égaux. On effectue alors le test 208 dans l'affirmative et l'étape 207 dans la négative.
Dans l'affirmative, la fin de la FIFO n'est pas atteinte, et, au cours d'un test 213, on détermine : si le pointeur d'écriture pointe vers la page suivante de la FIFO ; ou si la page suivante a été complètement écrite mais non lue.
Dans ce cas, le pointeur de lecture PtRi devra pointer sur la première page de la FIFO et non sur la page suivant immédiatement la page venant d'être lue.
Si le résultat du test 213 est négatif (signifiant que la dernière page écrite de la FIFO vient d'être lue), la valeur de l'index courant est initialisée à une valeur nulle (correspondant à une boucle de retour à la première page de la FIFO)
et la valeur a priori du pointeur de lecture est mise à jour avec la valeur de l'index courant et un offset nul (première page de la FIFO) au cours d'une étape 215.
Si le résultat du test 213 est positif (signifiant que la page suivante de la FIFO n'est pas la dernière page écrite), au cours d'un test 214, on détermine : - si l'index courant est égal au contenu du registre 30 de taille de la FIFO diminuée d'une unité ; et si une requête d'accroissement de la taille de la FIFO a été effectuée (lors d'une opération décrite en regard de la figure 7) et a besoin d'être acquittée.
d'interactions du type double-hybride bien connus de l'homme du métier.
Un tel polypeptide peut être, par exemple, la protéine GAL4 ou la protéine LexA.
Selon encore un autre aspect d'un acide nucléique selon l'invention, cet acide nucléique comprend un polynucléotide régulateur contrôlant l'expression du polypeptide à domaine HECT ou de son fragment ou variant, éventuellement fusionné à un polypeptide hétérologue, dans une cellule hôte. Des exemples illustratifs de polynucléotides régulateurs préférés selon l'invention sont listés ci-dessous dans la partie descriptive des vecteurs recombinants préférés.
Vecteurs recombinants Tout acide nucléique selon l'invention peut être inséré dans un vecteur à des fins de clonage ou à des fins d'expression.
L'invention est également relative à un vecteur recombinant comprenant un acide nucléique codant pur un polypeptide à domaine HECT, un fragment ou un variant de ce polypeptide, éventuellement fusionné avec un polypeptide hétérologue et pour lequel ledit acide nucléique a été artificiellement inséré dans le vecteur.
Avantageusement, un tel vecteur recombinant comprendra un acide nucléique choisi parmi les acides nucléiques suivants : a) un acide nucléique codant pour un polypeptide ayant une séquence en acides aminés choisie dans le groupe des séquences SEQ ID N01 à SEQ ID N011 ou un fragment ou un variant de ce polypeptide, éventuellement fusionné à un polypeptide hétérologue ; b) un acide nucléique comprenant un polynucléotide choisi parmi les séquences SEQ ID ? 12 à SEQ ID N022, ou un fragment ou un variant de ce dernier
c) un acide nucléique ayant au moins 95% d'identité en nucléotides avec un acide nucléique choisi dans le groupe constitué des séquences SEQ ID N012 à SEQ ID N022 ou un fragment ou un variant de ce dernier ; d) un acide nucléique hybridant, dans des conditions d'hybridation de forte stringence, avec un acide nucléique de séquences SEQ ID ? 12 à SEQ ID N022, ou un fragment ou un variant de ce dernier.
De manière générale, pour le choix d'un promoteur adapté, l'homme du métier pourra avantageusement se référer à l'ouvrage de SAMBROOK et al. (1989) précité ou encore aux techniques décrites par FULLER et al.
Il est montré selon l'invention que, pour une diversité de composés superimmunogènes composites tels que définis ci-dessus, le niveau de réponse immunitaire obtenu in vivo est bien supérieur à la réponse immunitaire observée après administration de chacun des polypeptides (a) et (b), non liés physiquement l'un à l'autre.
Sans vouloir être liés par une quelconque théorie, les inventeurs pensent que le polypeptide (a) apporte, au sein du superimmunogène composite, des épitopes T auxiliaire qui vont stimuler un effet helper et ainsi activer, ou augmenter l'activation de la réaction immunitaire humorale à l'encontre du polypeptide (b). Cette action auxiliaire du polypeptide (a) immunogène est particulièrement nécessaire pour induire la production d'anticorps dirigés contre le polypeptide (b), lorsque le polypeptide (b) est un
facteur cytokinique autologue, comme par exemple l'IL4 humaine dans un superimmunogène composite destiné à l'administration chez l'homme.
Il est montré selon l'invention que la production d'anticorps de type IgG dirigés contre la protéine Tat native est deux fois plus importante lorsque le conjugué peptidique gp160-Tat inactivé (toxoïde) est administré in vivo qu'en réponse à l'administration de la protéine Tat inactivée (toxoïde) sous forme libre. De plus, les anticorps dont la production est induite par le superimmunogène composite gp160-Tat (toxoïde) permettent de neutraliser 100% de l'activité de la protéine Tat native, alors qu'une neutralisation maximale de 75% de l'activité de la protéine Tat native est observée avec les anticorps produits après administration de la protéine Tat (toxoïde) sous forme libre.
Egalement, les résultats des exemples montrent que les splénocytes d'animaux immunisés avec le superimmunogène composite gp160- Tat (toxoïde) produisent un niveau plus élevé de chimiokines tvtiPla et MIPlss que les cellules des animaux immunisés par le Tat (toxoïde), ce qui montre qu'une stimulation optimale des cellules immunitaires est obtenue avec un superimmunogène composite conforme à l'invention.
Les splénocytes d'animaux immunisés avec le superimmunogène composite gp160-Tat (toxoïde) produisent aussi une quantité importante d'interféron-y lorsqu'elles sont activées, in vitro, par la protéine Tat native.
Des résultats similaires ont été obtenus avec d'autres superimmunogènes composites conformes à l'invention, tels que le conjugué E7-SIAB-VEGF, ou encore le conjugué Betv1a-IL4.
Ainsi, l'utilisation d'un superimmunogène composite tel que défini cidessus peut, au moins dans certains cas, potentialiser l'effet thérapeutique qui serait observé par l'utilisation séparée de chacun des polypeptides (a) et (b) ou encore par l'utilisation d'une association des polypeptides (a) et (b) non physiquement liés l'un à l'autre, ceci à au moins à deux titres : (i) l'induction d'une réponse immunitaire efficace, de type cellulaire ou humorale selon le cas, à l'encontre d'un antigène exprimé par les cellules tumorales ou d'un antigène exprimé par les cellules infectées par un virus, du fait de la réduction ou du blocage simultané d'une immunosuppression, d'une apoptose des cellules immunitaires ou d'une prolifération des cellules endothéliales vasculaires, ou encore l'induction d'une réponse immunitaire
efficace et non délétère à l'encontre d'un allergène, du fait de la réduction ou du blocage de la commutation isotypique vers la production d'anticorps igE induite par l'IL4 ; (ii) dans de nombreux cas, l'observation d'une potentialisation de la réponse immunitaire à l'encontre de l'un des polypeptides immunogènes présent dans le conjugué peptidique, du fait de la présentation conjointe du second polypeptide immunogène, porteur de nouveaux sites auxiliaires, aux cellules du système immunitaire, comme cela est observé par exemple dans le cas du superimmunogène composite gp160-Tat (toxoïde).
Superimmunogènes composites utilisés pour le traitement de certains cancers et de certaines infections virales.
Selon une première caractéristique essentielle d'un superimmunogène composite utilisé selon l'invention, le premier polypeptide (a) immunogène est choisi parmi (i) une protéine immunogène sélectivement exprimée par des cellules cancéreuses, sélectivement exprimée par des cellules infectées par un virus ou constitutive d'une structure antigénique pathogène allergène, le cas échéant détoxiquée, et (ii) une protéine dérivée de la protéine (i).
Selon une seconde caractéristique essentielle d'un superimmunogène composite utilisé selon l'invention, le polypeptide (b) immunogène est choisi parmi (i) la protéine circulante locale du stroma, le cas échéant détoxiquée, et (ii) une protéine dérivée de la protéine (i).
Lorsque la protéine immunogène sélectivement exprimée par des cellules cancéreuses, sélectivement exprimée par des cellules infectées par un virus ou constitutive d'une structure antigénique pathogène allergène est toxique , par exemple immunotoxique , ou lorsque la protéine circulante locale du stroma est toxique , par exemple immunotoxique , elle ne pourra être incluse telle quelle en tant que polypeptide (a) ou polypeptide (b) d'un superimmunogène composite selon l'invention, sans préalablement réduire ou bloquer sa toxicité, par exemple son immunotoxicité tout en conservant son immunogénicité.
La protéine immunogène est initialement toxique lorsque son administration à l'homme ou l'animal provoque des effets délétères importants sur la santé de cet homme ou de cet animal, par exemple soit en
induisant une immunotoxicité paralysant ou déviant les réactions immunitaires de défense.
La protéine immunogène est initialement immunotoxique lorsque son administration à l'homme ou l'animal provoque l'une des effets suivants : - une immunosuppression, y compris l'apoptose des cellules immunitaires, comme c'est le cas pour les protéines Tat de HIV1, E7 du papillomavirus, les facteurs cytokiniques IFNa, TGFss ou IL10, ou encore le facteur de régulation cellulaire p53, sous sa forme circulante dans le stroma ; - une déviation de la réaction immunitaire humorale, par exemple en induisant une commutation isotypique ( switch ) des lymphocytes B entraînant la production d'lgE., comme c'est le case de l'IL4.
On essaye en général de résoudre ces problèmes au mieux par l'utilisation d'algorithmes de filtrage, généralement connus sous le nom de filtrages de Kalman. Il s'agit d'un filtrage numérique effectué au cours des
calculs qui permettent de déterminer une position dite"position hybride"à partir des informations provenant de la centrale inertielle et des informations données par le récepteur de positionnement par satellites.
En cas de perte ou de dégradation des mesures de positionnement par satellites (dont il faut rappeler qu'elles peuvent facilement être perdues parce que le signal émis par les satellites est extrêmement faible et qu'elles peuvent être erronées, par exemple à cause de la présence de multitrajets entre un satellite et le récepteur), le filtrage de Kalman permet de continuer à calculer une position hybride qui est de type inertielle (c'est-àdire analogue à celle que fournirait une centrale inertielle toute seule) mais qui est corrigée des erreurs de dérive de la centrale ; en effet, le filtrage de Kalman calcule en permanence ces erreurs et peut se servir des erreurs repérées juste avant la perte des signaux satellites pour continuer à corriger la centrale après cette perte jusqu'au moment où les signaux satellites redeviennent disponibles.
Cependant, la précision et la fiabilité des centrales inertielles hybrides corrigées par récepteurs de positionnement par satellite n'est pas suffisante pour certaines applications, telles que l'atterrissage automatique des aéronefs. Pus généralement, on souhaite améliorer constamment la précision des mesures de position, de vitesse, d'attitude, etc. des véhicules, et il est en outre souvent nécessaire non seulement de donner une position avec précision, mais encore de connaître la valeur de la précision associée à une mesure, étant donné que cette valeur n'est pas fixe (elle dépend de très nombreux paramètres) et qu'elle peut être utile pour permettre de prendre des décisions. Par exemple, en cas de descente au dessous d'un certain seuil de précision, le calculateur de bord de l'aéronef peut déclencher une alarme visant à interdire de procéder à un atterrissage.
On cherche en particulier à être capable de donner une position avec précision même si l'un des satellites présente un défaut tel qu'une petite dérive d'horloge. Une dérive d'horloge de satellite est un défaut particulièrement difficile à détecter par un récepteur de positionnement par satellites et même par une centrale hybride inertielle/satellite ; en effet, les signaux émis par le satellite continuent à présenter toutes les apparences de signaux intègres. Mais ils sont erronés, et l'absence de saut de position dans les résultats fournis périodiquement par le récepteur de signaux par satellite
fait que la panne est très difficilement détectable. Il est pourtant nécessaire que l'utilisateur ou le calculateur de bord soit averti de ce type de défaut.
Un but de la présente invention est donc d'améliorer les centrales de navigation inertielle hybrides utilisant des récepteurs de positionnement par satellites, et tout particulièrement celles qui fournissent non seulement une position hybride mais aussi un rayon de protection autour de cette position, rayon à l'intérieur duquel l'intégrité de la position est garanti avec une probabilité d'erreur qui est bornée par une valeur supérieure définie. On reviendra plus en détail sur cette notion de rayon de protection.
Selon l'invention, on utilise un filtre de Kalman (c'est-à-dire un filtre à prédiction et recalage d'erreur d'estimation, basé sur un modèle de propagation dans le temps des erreurs du système à corriger et sur une comparaison avec des valeurs de mesure observées), dont la particularité est la suivante : il utilise comme valeurs de mesure observées, à comparer périodiquement avec des valeurs prédites, les différences entre d'une part les pseudo-distances mesurées par le récepteur de signaux satellites entre ce récepteur et les différents satellites et d'autre part les distances correspondantes calculées par la centrale inertielle entre la centrale et les mêmes satellites, l'incrément de distance d'une mesure à la suivante entre la pseudo-distance précédemment mesurée par le récepteur et la nouvelle pseudo-distance mesurée sur un axe satellite étant déterminé par un comptage de la variation de phase de la fréquence porteuse des signaux satellites depuis la mesure précédente et non par une mesure de pseudodistance indépendante.
Pour cela, le filtrage à prédiction et recalage d'erreur utilise, pour chaque axe satellite, une position initiale de récepteur, relativement au satellite, qui est une position obtenue par calcul à partir des positions temporelles de codes pseudo-aléatoires présents dans les signaux reçus des satellites et il mémorise la phase de la porteuse au moment de cette mesure de position ; et d'autre part, il utilise, comme nouvelle position de récepteur par rapport au satellite, lors de l'étape suivante d'observation de la position du récepteur, non pas une nouvelle mesure de position, mais une simple modification de la position précédente, par addition de la variation de phase, en nombre de tours de phase et fraction de tour, ramenée en distance le long de l'axe satellite, de la fréquence porteuse du signal satellite.
Autrement dit, les filtres de Kalman qu'on a pu proposer dans le passé, pour les centrales hybrides inertielles recalées par positionnement satellite, utilisent généralement comme mesure de position observée, pour le recalage du modèle de propagation des erreurs inertielles, une variation de position en axes géographiques, ou même une variation de pseudodistances le long des axes satellites, la variation de pseudo-distance résultant des variations de position temporelle du code pseudo-aléatoire local d'un canal du récepteur de positionnement. Ici, l'incrément de position entre deux recalages ne résulte pas de cette variation de position temporelle du code pseudo-aléatoire, elle résulte de la variation de phase de la porteuse sur chaque axe satellite/récepteur.
On rappelle qu'un récepteur de positionnement par satellite classique comprend un asservissement d'un code pseudo-aléatoire local pour chaque canal correspondant à un satellite, et un asservissement de la phase de la fréquence porteuse du signal satellite. Ce deuxième asservissement, couplé avec le premier, sert notamment à prendre en compte l'effet Doppler induit par la vitesse relative du récepteur par rapport à un satellite selon l'axe reliant le récepteur au satellite. L'asservissement de code utilise un premier oscillateur à commande numérique pour établir et synchroniser le code local qui permet la détermination de pseudo-distance, tandis que l'asservissement de porteuse utilise un deuxième oscillateur à commande numérique qui permet d'établir une variation de phase locale asservie sur la phase de la porteuse. Ces oscillateurs délivrent une valeur numérique de phase croissant par incréments contrôlés par un calculateur qui pilote les circuits d'asservissement numérique. Selon l'invention, pour observer les variations de distance entre le récepteur et un satellite dans le but de recaler une centrale inertielle par un récepteur de positionnement par satellite, on utilise la sortie numérique du deuxième oscillateur à commande numérique et on ajoute à la distance précédemment calculée par le récepteur la variation de phase observée sur le deuxième oscillateur, ramenée à une distance de propagation du signal satellite (dont la fréquence est connue).
Par conséquent, l'invention propose un système de navigation comprenant une centrale de navigation inertielle hybridée avec au moins un récepteur de positionnement par satellite, la centrale inertielle fournissant
des informations de position résultant au moins en partie de mesures accélérométriques et gyrométriques, et le récepteur fournissant des pseudodistances représentant la distance entre le récepteur et des satellites, le récepteur comprenant, pour chaque canal du récepteur, un oscillateur à commande numérique de phase asservi sur la phase de porteuse d'un signal de satellite correspondant à ce canal, et le système de navigation fournissant des valeurs de position hybrides résultant d'une combinaison de données numériques de position provenant de la centrale et de données numériques provenant du récepteur, le système comprenant un moyen d'estimation d'une nouvelle position hybride à partir d'un écart constaté entre d'une part des pseudo-distances mesurées par le récepteur entre le récepteur et les différents satellites et d'autre part des distances correspondantes calculées par la centrale inertielle entre la centrale et les mêmes satellites, ce moyen comprenant un filtre numérique, de type filtre de Kalman, permettant la prédiction d'un écart et l'adaptation du filtre en fonction de la comparaison entre les écarts constatés et des écarts prédits, caractérisé en ce que, dans le filtre numérique, l'incrément de distance d'un instant de mesure à l'instant suivant, entre la pseudo-distance précédemment mesurée par le récepteur sur un axe satellite en vue de la constatation d'un écart et la nouvelle pseudo-distance mesurée par le récepteur sur cet axe, est la variation de phase de l'oscillateur numérique entre les deux instants de mesure, cette variation étant ramenée en distance le long de l'axe satellite.
Le recalage de la centrale inertielle se fait donc en observant régulièrement l'évolution de la phase de la porteuse sur chaque canal du récepteur, cette évolution ayant pour caractéristique d'être très peu bruitée, ce qui va permettre non seulement d'obtenir une position hybride précise mais aussi d'obtenir une mesure efficace de la précision de détermination de la position hybride, sous forme d'un calcul de rayon de protection. Le calcul du rayon de protection est fait selon l'invention à partir du même filtre de Kalman, incrémenté de la manière indiquée ci-dessus.
Le calage initial du système hybride se fait en principe en donnant à la position hybride une valeur initiale qui est une position calculée par le récepteur de positionnement par satellites à partir de la position temporelle des codes pseudo-aléatoires présents dans les signaux des différents satellites.