INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
Aucune homologie significative avec BLAST n'a été retrouvée avec les séquences référencées dans les bases de données Swissprot (version 36, dernière remise à jour du 3 mai 1999), PRODOM: (domaines homologues détectés dans Swissprot, version 34. 2, novembre 1997),Genpept: (traduction de Genbank v110 et 111, dernière remise à jour le 7 mai 1999), Swissprot (version 36, dernière remise à jour du 3 mai 1999), TrEMBL (SP-TrEMBL, version 7, novembre 1998), PIR: (SEQUENCES PIR NON REDONDANTES, VERSION 57) et PDB: (PROTEIN DATA BANK, FEVRIER 1999).
Le polypeptide de séquence SEQ ID N 88 est susceptible d'intervenir dans la régulation du flux de cholestérol, et plus particulièrement de la maladie de Tangier ou encore des déficiences familiales en HDL.
Le polypeptide de séquence SEQ ID N 88 est donc susceptible d'intervenir dans une étape importante impliquée dans le transport inverse du cholestérol par les HDL.
Gène GS946300.
Acide(s) nucléique(s) Il a été isolé selon l'invention un ARN messager correspondant à un transcrit du gène désigné ici sous le n GS946300.
La séquence nucléique de l'ADNc correspondant à ce transcrit constitue la séquence SEQ ID N 24.
La séquence SEQ ID N 24 a une longueur de 1575 nucléotides.
Cette séquence comprend un cadre ouvert de lecture (ORF) partiel allant du nucléotide en position 3 au nucléotide en position 176 de la séquence SEQ ID N 24.
Le vecteur pSPD5 a été soumis à une digestion par l'enzyme de restriction Sbfl et le fragment de 4082 pb purifié sur gel d'agarose.
Il a ensuite été procédé à une digestion du vecteur pSOS95 par l'enzyme de restriction Pstl et le fragment de 4858 pb purifié sur gel d'agarose.
Ces deux fragments ont ensuite été ligaturés afin d'obtenir le plasmide pSGD.
EXEMPLE 4 : du vecteur d'expression pPPD2 Le vecteur pPPD2 est un vecteur dérivé du plasmide pSPD5 capable d'exprimer le gène dhat (codant pour la 1,3-propanediol déshydrogénase ) et dans lequel orf11(codant pour la première sous-unité de la glycérol déshydratase) a été complètement délété ainsi que 100 pb à l'extrémité 5' de orf12 (codant pour la seconde sous-unité de la glycérol déshydratase).
Le vecteur pSPD5 a tout d'abord été digéré simultanément par les enzymes de restriction BamHl et Mfel.
Le fragment BamHI-Mfel de 6326 pb obtenu par la double digestion à l'aide des endonucléases de restriction correspondantes a subi un traitement en présence de l'ADN polymérase T4 afin d'obtenir des extrémités franches.
Le fragment a alors subi une religation sur lui-même afin d'obtenir le plasmide pPPD2.
EXEMPLE 5 : de l'opéron 1,3-propanediol dans Clostridium acetobutylicum DG1 cultivé sur glycérol.
La souche de Clostridium acétobutylicum DGI transformée avec le plasmide pSPD5 comme décrit dans la partie Matériels et Méthodes a été mise en culture en présence de glycérol pendant des temps déterminés et différents paramètres ont été suivis au cours de la fermentation : la croissance bactérienne a été suivie par mesure de la densité optique à la longueur d'onde de 620 nanomètres et est représentée sur la figure 6 par les cercles ouverts; - la concentration de glycérol a été suivie tout au long de la fermentation et est représentée sur la figure 7 par les carrés pleins; - la synthèse de 1,3-propanediol a été également suivie tout au long de la fermentation et est représentée par les cercles pleins; - de même la concentration d'acétate et de butyrate a été mesurée tout au long de la fermentation et est représentée sur la figure 7 respectivement par les triangles ouverts pointe en haut ou pointe en bas.
Les résultats présentés à la figure 7 montrent qu'une quantité significative de 1,3-propanediol est synthétisée par la souche de Clostridium acetobutylicum DGI transformée par le plasmide pSPD5 dès les quatre premières heures de culture. Au bout de 20 heures de fermentation, il peut être observée la production de 38 g/l de 1,3-propanediol. La production de 1,3-propanediol atteint un plateau aux environs de 18 heures après le début de la fermentation, ce plateau de production étant essentiellement dû au fait que la presque totalité du glycérol initial a été consommée par la bactérie transformée.
Il est important de noter que la souche C. acetobutylicum DG1 transformée par le plasmide de contrôle plMP1 ne contenant pas les régions codant pour la glycérol déshydratase et la 1,3-propanediol déshydrogénase (Memmerlstein, 1992) ne se développe pas sur le milieu de culture avec du
glycérol comme seule source carbonée et donc ne produit pas de 1,3-propanediol (Tableau 1).
EXEMPLE 6 : de l'opéron 1,3-propanediol dans Escherichia coli DH5a cultivé sur glycérol.
Une souche d'Escherichia coli DH5[alpha] a été transformée avec le vecteur pSPD5, comme décrit dans la partie Matériels et Méthodes.
La souche d'Escherichia coli transformée avec le plasmide pSPD5 a été mise en culture en anaérobiose sur milieu LB supplémenté en glycérol (40 g/l) et en érythromycine (300 g/ml), la production de 1,3-propanediol a été mesurée à des temps déterminés.
Les résultats sont rassemblés sur la figure 8.
De manière avantageuse, les sondes selon l'invention peuvent avoir des caractéristiques structurelles de nature à permettre une amplification du signal, telles que les sondes décrites par URDEA et al.
(1991) ou encore dans le brevet européen n EP-0 225 807 (CHIRON).
Les sondes oligonucléotides selon l'invention peuvent être utilisées notamment dans des hybridations de type Southern à l'ADN génomique ou encore dans des hybridations à l'ARN messager correspondant lorsque l'expression du transcrit correspondant est recherchée dans un échantillon.
Les sondes selon l'invention peuvent aussi être utilisées pour la détection de produits d'amplification PCR ou encore pour la détection de mésappariements.
Des sondes ou amorces nucléotidiques selon l'invention peuvent être immobilisées sur un support solide. De tels supports solides sont bien connus de l'homme du métier et comprennent des surfaces des puits de plaques de microtitration, des lits de polystyrène, des lits magnétiques, des bandes de nitrocellulose, ou encore des microparticules telles que des particules de latex.
En conséquence, la présente invention concerne également un procédé de détection de la présence d'un acide nucléique tel que décrit ciavant dans un échantillon, ladite méthode comprenant les étapes de : 1) mettre en contact une ou plusieurs sondes nucléotidiques selon l'invention avec l'échantillon à tester ; 2) détecter le complexe éventuellement formé entre la ou les sondes et l'acide nucléique présent dans l'échantillon.
Selon un mode de réalisation particulier du procédé de détection selon l'invention, la ou les sondes oligonucléotidiques sont immobilisées sur un support.
Selon un autre aspect, les sondes oligonucléotidiques comprennent un marqueur détectable.
L'invention concerne en outre un nécessaire ou kit pour la détection de la présence d'un acide nucléique selon l'invention dans un échantillon, ledit nécessaire comprenant : a) une ou plusieurs sondes nucléotidiques telles que décrites cidessus ; b) le cas échéant, les réactifs nécessaires à la réaction d'hybridation.
Selon un premier aspect, le nécessaire ou kit de détection est caractérisé en ce que la ou les sondes sont immobilisées sur un support.
Selon un second aspect, le nécessaire ou kit de détection est caractérisé en ce que les sondes oligonucléotidiques comprennent un marqueur détectable.
Selon un mode de réalisation particulier du kit de détection décrit ci-dessus, un tel kit comprendra une pluralité de sondes oligonucléotidiques conformes à l'invention qui pourront être utilisées pour détecter des séquences cibles d'intérêt ou alternativement détecter des mutations dans les régions codantes ou les régions non codantes des acides nucléiques selon l'invention, plus particulièrement des acides nucléiques de séquences SEQ ID N 1 à SEQ ID N 55 ou les acides nucléiques de séquence complémentaire.
Des sondes préférées comprendraient tout ou partie des polynucléotides de séquences SEQ ID N 56 à SEQ ID N 75.
Ainsi, les sondes selon l'invention immobilisées sur un support peuvent être ordonnées en matrices telles que les " puces à ADN ". De telles matrices ordonnées ont été en particulier décrites dans le brevet US N 5,143,854, dans les demandes PCT N WO 90/150 70 et 92/10092.
Des matrices supports sur lesquelles des sondes oligonucléotidiques ont été immobilisées à une haute densité sont par exemple décrites dans les brevets US N 5,412,087 et dans la demande PCT N WO 95/11995.
Les amorces nucléotidiques selon l'invention peuvent être utilisées pour amplifier l'un quelconque des acides nucléiques selon l'invention, et plus particulièrement tout ou partie d'un acide nucléique de séquences SEQ ID N 1 à SEQ ID N 55, ou encore un variant de celui-ci.
La séquence nucléique de l'ADNc correspondant à ce transcrit constitue la séquence SEQ ID N 22.
La séquence SEQ ID N 22 a une longueur de 4745 nucléotides.
Cette séquence comprend un cadre ouvert de lecture (ORF) partiel allant du nucléotide en position 2 au nucléotide en position 514 de la séquence SEQ ID N 22.
Homologies observées au niveau de la séquence nucléotidique: 90% d'homologie avec Genbank :AF115435, syntaxine 17 de rat sur 510 pb (position 22-531 pb).
Les analyses d'expression du transcrit de séquence SEQ ID N 22 ont été réalisées par RT PCR, comme décrit dans l'Exemple 1. Ces analyses effectuées à partir d'ARN polyA+de différents tissus ont permis de montrer que le gène GS930824 était exprimé dans le cerveau foetal, le foie, le cerveau, le c#ur, la prostate, le placenta, le foie foetal, l'utérus, le testicule, le rein et le muscle squelettique.
De plus, une analyse de l'expression du transcrit par Northern blot, selon le protocole décrit de l'Exemple 1, à l'aide respectivement des sondes de séquence SEQ ID N 69 et 70, a révélé la présence de transcrits dans le blot commercialisé par la Société Clontech (Ref. N 7759-1).
La taille des transcrits détectés avec la sonde de séquence SEQ ID N 69 est respectivement de : - 1,1 kb, 1,6 kb, 2,6 kb, 4,9 kb. et 7 kb dans le pancréas, le rein, le muscle squelettique, le foie, le cerveau et le c#ur : - 1,6 kb, 2,6 kb, 4,9 kb. et 7 kb dans le poumon et le placenta.
La taille des transcrits détectés avec la sonde de séquence SEQ ID N 70 est respectivement de : - 1,35 kb, 2,4 kb, 3,5 kb et 10 kb dans le placenta ; - 1,35 kb et 2,4 kb dans le pancréas, le rein et le foie ; - 1 ,35 kb dans le poumon ; - 2,4 kb dans le muscle squelettique, le cerveau et le c#ur.
Polypeptide codé par l'acide nucléique de séquence SEQ ID NO 22 Le cadre ouvert de lecture de la séquence d'acides nucléiques SEQ ID N 22 code potentiellement pour un polypeptide de 170 aminoacides de longueur constituant la séquence SEQ ID N 87.
Homologies observées au niveau de la séquence protéique: 72% d'homologie avec des séquences de Genpept : de Genbank v110 et 111, dernière remise à jour le 7 mai 1999) :gi4206161 sur 170 acides aminés (position 1-170 aa) gi4206161 est la traduction protéique du gène codant pour la syntaxine 17 de rat..Genpept: (traduction de Genbank v110 et 111, dernière remise à jour le 7 mai 1999) : Fonction putative : Le polypeptide de séquence SEQ ID N 87 s'apparente donc à une protéine de la famille des syntaxines impliquée dans le transport vésiculaire intracellulaire. Ce mécanisme sous-tendu par un adressage spécifique médié par ces protéines est d'intérêt par rapport à la maladie de Tangier/FHD qui est décrite par un défaut du mécanisme de transport et de translocation des pools de cholestérol intracellulaire vers les particules HDL accepteurs. Le polypeptide de séquence SEQ ID N 87 est donc susceptible d'intervenir dans une étape importante impliquée dans le transport inverse du cholestérol par les HDL.
Gène GS93382.
Acide(s) nucléique(s) Il a été isolé selon l'invention un ARN messager correspondant à un transcrit du gène désigné ici sous le n GS93382.
La séquence nucléique de l'ADNc correspondant à ce transcrit constitue la séquence SEQ ID N 23.
La séquence SEQ ID N 23 a une longueur de 3014 nucléotides.
Selon un mode de réalisation, les plateaux (Pi) comportent plusieurs secteurs de forme radiale et chacun des secteurs comportent au moins une chambre de distribution (Ci) des fluides, lesdites chambres de distribution des fluides étant reliées audit mat central par lesdites lignes secondaires de transfert des fluides.
Les plateaux peuvent aussi être découpés en plusieurs secteurs de forme tangentielle et en ce que chacune des secteurs comportent au moins une chambre de distribution des fluides, lesdites chambres étant reliées audit mat central par lesdites lignes secondaires de transfert des fluides.
Le dispositif de mise en contact est avantageusement utilisé pour la séparation d'au moins un isomère aromatique à huit atomes de carbone dans un mélange de xylènes et d'éthylbenzène.
L'invention sera mieux comprise au vu des figures suivantes, illustrant de manière simplifiée et non limitative plusieurs modes de réalisation de l'élément de mat et d'un mat central formé de plusieurs éléments où # les figures 1 A et 1 R représentent respectivement une vue en coupe et selon deux plans d'un exemple d'élément de mat, # la figure 2 schématise une première variante de l'élément de la figure 1, # la figure 3 montre une variante de l'élément de la figure 1 comportant deux moyens de passage et de distribution des fluides, # la figure 4A schématise une variante d'un élément de mat de la figure 1, et la figure 4B montre une possibilité de fabrication, # la figure 5 représente une enceinte ou colonne comportant un mat central formé de plusieurs éléments de mats décrits à la figure 1, # la figure 6 schématise une enceinte comportant un mat tel que décrit à la figure 4A ainsi que ses conduits de circulation de fluide, # la figure 7 représente une colonne de séparation comportant un mat central, # la figure 8 représente une variante de réalisation de l'élément décrit à la figure 1 A, # la figure 9 montre une variante de la figure 8, # la figure 10 représente une variante de réalisation de la figure 3, # les figures 11 et 12 schématisent des variantes de réalisation du dispositif décrit à la figure 7, et # les figures 13, 14 et 15 montrent un exemple de vanne rotative utilisée dans la variante de mise en oeuvre décrite à la figure 7 ainsi qu'un exemple de positionnement des moyens de mise en communication.
Les figures 1 A et 1 B schématisent un élément de mat selon l'invention constitué d'un tube 1 ou d'une portion de tube sensiblement cylindrique ayant une épaisseur de paroi "e", une longueur " I " et un diamètre interne D;nt.
L'élément de mat est formé par exemple de trois parties : une partie supérieure 2, une partie intermédiaire 3 désignée pour la compréhension de la description " distributeur- collecteur " de fluides comportant plusieurs moyens de passage d'un ou de plusieurs fluides, et une partie inférieure 4. Les parties 2 et 3, sont séparées par un élément supérieur obturateur 5a, et les parties 3 et 4 par un élément inférieur obturateur 5b, afin que les fluides ne circulent que dans la partie 3. Dans certains cas, une fraction minime de fluide pourra éventuellement être présente à l'intérieur des parties 2 ou 4 afin d'assurer une pressurisation de l'élément de mat, par exemple.
L'élément distributeur-collecteur 3 est pourvu de différents moyens permettant le passage ou la circulation de fluides de l'intérieur du tronçon cylindrique vers l'extérieur et réciproquement. Ces moyens sont par exemple : un orifice 6 ayant un diamètre (D6, et plusieurs orifices 7i de diamètre (D7, répartis sur la périphérie de l'élément 1. Un élément de séparation 8, tel qu'une plaque pourvue par exemple d'un orifice 9 central délimite ainsi deux espaces annulaires 3a et 3b à l'intérieur de l'élément de distribution -collecte. L'espace supérieur 3a communique avec l'orifice 6 et l'espace inférieur 3b communique avec les orifices 7i.
Lorsque l'on considère une distribution de fluides à partir de l'élément central de poutre, le ou les fluides à distribuer s'écoulent de l'orifice 6 vers l'intérieur de l'élément puis à travers l'orifice 9, avant d'être distribués vers l'extérieur par les orifices 7i.
Sans sortir du cadre de l'invention, il est aussi possible d'inverser les fonctions des orifices 6 et 7i, le fluide passant en premier à travers les orifices 7i puis l'orifice 6.
L'élément de mat 1 est pourvu dans sa partie inférieure et/ou dans sa partie supérieure, de brides référencées respectivement 10a et 10b, ou de tout autre moyen permettant d'assurer la liaison mécanique entre les éléments de mat.
Les éléments peuvent aussi être assemblés par soudure.
L'élément de séparation 8 peut aussi être constitué d'une plaque perforée ou encore d'une grille.
Le diamètre de l'orifice central 9 est choisi de façon à obtenir une turbulence du ou des fluides suffisante à l'intérieur des espaces 3a et 3b pour assurer une distribution homogène des fluides au travers des orifices 7i et 6.
De préférence, on positionne l'orifice 9 au centre de la plaque 8 pour que le fluide introduit par l'orifice 6, atteigne la majorité des orifices 7i au même instant.
Lorsque l'élément 8 est constitué d'une plaque perforée, comportant plusieurs orifices, ou considère la somme de la surface de passage des orifices pour assurer une distribution la plus homogène possible.
Dans certaines variantes de réalisation, les parties 2 et 4 seront pressurisées en utilisant un fluide ou un solide pour obtenir la raideur suffisante par rapport à la charge à laquelle est soumise la colonne.
Selon un autre mode de réalisation d'un autre aspect supplémentaire de la présente invention, on propose un procédé pour transformer des données de source en un signal à modulation de canal ayant une pluralité de couples de données en phase (I) et en quadrature de phase (Q) dans un poste mobile, dans lequel le poste mobile utilise un nombre N de canaux où N est un entier positif, comprenant : a) le codage des données de source pour produire un nombre (N - 1) d'éléments de données et un élément de commande ; b) la production d'un nombre N de codes d'étalement à attribuer aux canaux, dans lequel chaque code d'étalement est sélectionné sur la base d'un débit de données de chaque élément de données et de l'élément de commande, et les codes d'étalement sont sélectionnés de sorte que deux couples consécutifs des données I et Q correspondent à deux points situés sur le même point ou symétriques par rapport à un point zéro sur un domaine de phase ; et c) l'étalement de l'élément de commande et des éléments de données en utilisant les codes d'étalement, pour produire de ce fait le signal à modulation de canal.
Les objectifs précédents et autres objectifs et particularités de la présente invention vont devenir évidents à la lecture de la description qui va suivre de modes de réalisation préférés lorsque pris en relation avec les dessins annexés, dans lesquels : la figure 1 est un schéma fonctionnel représentant un poste mobile auquel la présente invention est appliquée ; la figure 2 est un exemple de vue représentant une structure arborescente de codes d'étalement appliquée à la présente invention ; la figure 3 est un exemple de schéma fonctionnel décrivant un modulateur représenté à la figure 1 selon la présente invention ; la figure 4 est un schéma fonctionnel décrivant un générateur de code d'étalement représenté à la figure 3 ; la figure 5 est un exemple de schéma représentant un cas dans lequel un poste mobile utilise' deux canaux ; la f igure 6 est un exemple de schéma décrivant un cas dans lequel des postes mobiles multiples partagent un code de cryptage commun à valeur complexe ; #la f igure 7 est un exemple de schéma représentant un cas dans lequel un poste mobile utilise des canaux multiples ; la figure 8 est un premier exemple de vue décrivant une différence de phase souhaitable entre des points tournés sur un domaine de phase dans lequel un dispositif de rotation de Walsh tourne des points au niveau de puces consécutives ; la figure 9 est un deuxième exemple de vue décrivant une différence de phase souhaitable entre des points tournés sur un domaine de phase dans lequel un dispositif de rotation de Walsh tourne des points au niveau de puces consécutives ; la figure 10 est un premier exemple de vue décrivant une différence de phase non souhaitable entre des points tournés sur un domaine de phase dans lequel un dispositif de rotation de Walsh tourne des points au niveau de puces consécutives ; les figures 11 et 12 représentent un troisième exemple de vues décrivant une différence de phase souhaitable entre des points tournés sur un domaine de phase dans lequel un dispositif de rotation de Walsh tourne des points au niveau de puces consécutives ; les figures 13 et 14 représentent un deuxième exemple de vues décrivant une différence de phase non souhaitable entre des points tournés sur un domaine de phase dans lequel un dispositif de rotation de Walsh tourne des points au niveau de puces consécutives ; la figure 15 est un schéma graphique décrivant la probabilité de la puissance de pointe sur la puissance moyenne ; et les figures 16 à 22 sont des organigrammes représentant un procédé de modulation d'un message de données dans un poste mobile selon la présente invention.
#En se référant à la figure 1, on représente un schéma fonctionnel représentant un poste mobile auquel la présente invention est appliquée. Comme on le représente, le poste mobile comprend une interface utilisateur 20, une unité centrale de traitement (CPU) 180, un modem 12, un codec de source 30, un convertisseur de fréquence 80, un module d'identification d'utilisateur 50 et une antenne 70. Le modem 12 comprend un codec de canal 13, un modulateur 100 et un démodulateur 90. Le codec de canal 13 comprend un codeur 110 et un décodeur 127.
L'interface utilisateur 20 comprend un dispositif d'affichage, un clavier et ainsi de suite. L'interface utilisateur 20, reliée à la CPU 180, produit un message de données en réponse à une entrée d'utilisateur en provenance d'un utilisateur. L'interface utilisateur 20 envoie le message de données à la CPU 180.
Le module d'identification d'utilisateur 50, relié à la CPU 180, envoie des informations d'identification d'utilisateur en tant que message de données à la CPU 180. Le codec de source 30, relié à la CPU 180 et au modem 12, code les données de source, par exemple de la vidéo, de la voix et ainsi de suite, pour produire les données de source codées en tant que message de données. Ensuite, le codec de source 30 envoie les données de source codées en tant que message de données à la CPU 180 ou au modem 12. De plus, le codec de source 30 décode le message de données en provenance de la CPU 180 ou du modem 12 pour produire les données de source, par exemple de la vidéo, de la voix et ainsi de suite. Ensuite, le codec de source 30 envoie les données de source à la CPU 180.
Le codeur 110, contenu dans le codec de canal 13, code le message de données en provenance de la CPU 180 ou du codec de source 30 pour produire un ou plusieurs éléments de données. Ensuite, le codeur 110 produit un élément de commande. Le codeur 110 envoie l'élément ou les plusieurs éléments de données au modulateur 100. Le modulateur 100 module l'élément ou les plusieurs éléments de données et l'élément de commande pour produire des signaux I et Q en tant que signaux en bande de base. Le convertisseur de fréquence 80 transforme les signaux en bande de base en signaux à fréquence intermédiaire (FI) en réponse à un signal de commande de transformation en provenance de la CPU 180. Après transformation des signaux en bande de base en signaux FI, le convertisseur de fréquence 80 transforme les signaux FI en signaux à fréquence radio (RF). Le convertisseur de fréquence 80 envoie les signaux RF à l'antenne 70. De plus, le convertisseur de fréquence 80 commande le gain des signaux RF. L'antenne 70 envoie les signaux RF à un poste de base (non représenté).