Annexe 1 : Amorces sélectionnées Produit: P1 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer) : 547 ATGCTCAACACCGTGTTC 564 Amorce retour (19-mer): : 669 CCCCTCTTTGTCTACCTTG 651 aller retour EGC de l'amorce: 50.0 52.6 Tm de l'amorce (degrés Celsius): : 55.3 54.8 Produit Longueur: 123 ZGC: 53.7 Tm: 76.9 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 0.5 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.4 degrés Celsius Produit: P2 Amorces 5' 3 Amorce aller (18-mer): 554 ACACCGTGTTCGACTATC 571 Amorce retour (18-mer): : 668 CCCTCTTTGTCTACCTTG 651 aller retour %GC de l'amorce: 50.0 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 51.3 50.4 Produit Longueur: 115 %GC: 53.9 Tm: 77.0 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.0 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 54.1 degrés Celsius Annexe 1 (suite 1) Produit: P3 Amorces 5' 3' Amorce aller (19-mer) : 564 CGACTATCACAACGAGAAC 582 Amorce retour (18-mer) : 667 CCTCTTTGTCTACCTTGG 650 aller retour %GC de l'amorce: 47.4 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 51.4 50.4 Produit Longueur: 104 %GC: 53.8 Tm: 76.0 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.0 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 53.4 degrés Celsius Produit: P4 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): 454 GAGAACTATTGGGAAGCC 471 Amorce retour (18-mer): 600 GATGACCTCCTCTTTTGC 583 aller retour ZGC de l'amorce: 50.0 50.0 Trn de l'amorce (degrés Celsius): 52.1 52.9 Produit Longueur: 147 %GC: 54.4 Tm: 78.2 degrés Celsius différence entre les '::m des amorces: 0.9 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.5 degrés Celsius Annexe 1 (suite 2) Produit: P5 Amorces 5' 3 Amorce aller (19-mer): : 571 CACAACGAGAACGCAAAAG 589 Amorce retour (20-mer): 686 TAGACGAGTCTGATGGTCCC 667 aller retour %GC de l'amorce: 47.4 55.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 58.0 57.6 Produit Longueur: 116 ZGC: 54 3 Tm: 77.2 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 0.4 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 56.4 degrés Celsius Produit: P6 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer) : 572 ACAACGAGAACGCAAAAG 589 Amorce retour (19-mer): 686 TAGACGAGTCTGATGGTCC 668 aller retour ZGC de l'amorce: 44.4 52.6 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 54.9 53.3 Produit Longueur: 115 %GC: 53.9 T=n: 77.0 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.6 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.0 degrés Celsius Annexe 1 (suite 3) Produit: P7 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer) : 574 AACGAGAACGCAAAAGAG 591 Amorce retour (19-mer): 686 TAGACGAGTCTGATGGTCC 668 aller retour %GC de l'amorce: 44.4 52.6 Tm de 1',Lorce (degrés Celsius): 54.1 53.3 Produit Longueur: 113 %GC: 54.0 Tm: 77.0 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 0.7 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.0 degrés Celsius ------------------------------------------------------ Produit: P8 Amorces S' 3' Amorce aller (19-mer): 573 CAACGAGAACGCAAAAGAG 591 Amorce retour (20-mer): 686 TAGACGAGTCTGATGGTCCC 667 aller retour %GC de l'amorce: 47.4 55.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 57.2 57.6 Produit Longueur: 114 GGC: 54.4 Tm: 77.2 degrés Celsius différence entre les Trn des amorces: 0.4 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 56.3 degrés Celsius Annexe 1 (suite 4) Produit: p9 Amorces 5' 3' Amorce aller (19-mer): 566 ACTATCACAACGAGAACGC 584 Amorce retour (19-mer): 673 TGGTCCCCTCTTTGTCTAC 655 aller retour %GC de l'amorce: 47.4 52.6 Tm de l'amorce (degrés Celsius): : 53.7 55.0 Produit Longueur: 108 ZGC: 53.7 Tm: 75.9 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.3 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 54.4 degrés Celsius Produit: P10 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer) : 567 CTATCACAACGAGAACGC 584 Amorce retour (21-mer) : 666 CTCTTTGTCTACCTTGGTTAC 646 aller retour ZGC de l'amorce: 50.0 42.9 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 52.5 50.9 Produit Longueur: 100 %GC: 53.0 Tm: 75.6 degrés Celsius différence entre les Ta des amorces: 1.6 degrés Celsius tampérature optimale d'hybridation: 53.3 degrés Celsius Annexe i (suite 5) Produit: Pli Amorces 5' 3' Amorce aller (19-mer): 564 CGACTATCACAACGAGAAC 582 Amorce retour (21-mer): 666 CTCTTTGTCTACCTTGGTTAC 646 aller retour %GC de l'amorce: 47.4 42.9 Tm de l'amorce (degrés Ceîsius) : 51.4 50.9 Produit Longueur: 103 ZGC: 53.4 Tm: 75.8 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 0.5 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 53.4 degrés Celsius Produit: P12 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): : 575 ACGAGAACGCAAAAGAGG 592 Amorce retour (20-mer): 686 TAGACGAGTCTGATGGTCCC 667 aller retour ZGC de l'amorce: 50.0 55.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 56.5 57.6 Produit Longueur: 112 %GC: 54.5 Tm: 76.2 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.1 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.4 degrés Celsius Annexe 1 (suite 6) Produit: P13 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer) : 352 ACAGTGTTGAAGGCAATC 369 Amorce retour (18-mer) : 594 CTCCTCTTTTGCGTTCTC 577 aller retour EGC de l'amorce: 44.4 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 51.5 53.4 Produit Longueur: 243 ZGC: 54.3 Tm: 80.2 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 2.0 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 56.7 degrés Celsius Produit: P14 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): 575 ACGAGAACGCAAAAGAGG 592 Amorce retour (20-mer): 687 GTAGACGAGTCTGATGGTCC 668 aller retour %GC de l'amorce: 50.0 55.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 56.5 54.5 Produit Longueur: 113 EGC: 54.9 Tm: 77.4 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 2.0 degrés Celsius terpérature optimale d'hybridation: 55.6 degrés Celsius Annexe 1 (suite 7) Produit: P15 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): 424 CAGATGTGGTTCCAAGAC 441 Amorce retour (18-mer): 600 GATGACCTCCTCTTTTGC 583 aller retour ZGC de l'amorce: 50.0 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 51.7 52.9 Produit Longueur: 177 %GC: 54.2 Tm: 79.1 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.3 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 56.0 degrés Celsius Produit: P16 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): 414 CGACTACGAACAGATGTG 431 Amorce retour (18-mer): 668 CCCTCTTTGTCTACCTTG 651 aller retour EGC de l'amorce: 50.0 50.0 T:n de l'amorce (degrés Celsius): 50.3 50.4 Produit Longueur 255 %GC: 54.9 Tm: 80.4 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 0.1 degrés Celsius tenpérature optimale d'hybridation: 56.5 degrés Celsius Annexe i (suite 8) Produit: P17 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer) : 422 AACAGATGTGGTTCCAAG 439 Amorce retour (18-mer): : 584 GCGTTCTCGTTGTGATAG 567 aller retour ZGC de l'amorce: 44.4 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 51.3 52.5 Produit Longueur: 163 ZGC: 54.6 Tm: 78.3 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.2 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.3 degrés Celsius Produit: P18 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): : 419 ACGAACAGATGTGGTTCC 436 Amorce retour (18-mer): : 594 CTCCTCTTTTGCGTTCTC 577 aller retour ZGC de l'amorce: 50.0 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): : 54.0 53.4 Produit Longueur: 176 ZGC: 54.0 Tm: 79.0 degrés Celsius différence entre les T:n des amorces: 0.5 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 56.5 degrés Celsius Annexe i (suite 9) Produit: P19 Amorces 5' 3' Amorce aller (19-mer) : 577 GAGAACGCAAAAGAGGAGG 595 Amorce retour (20-mer): 686 TAGACGAGTCTGATGGTCCC 667 aller retour ZGC de l'amorce: 52.6 55.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): : 57.6 57.6 Produit Longueur: 110 %GC: 54.5 Tm: 76.3 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 0.1 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.8 degrés Celsius Produit: P20 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): 454 GAGAACTATTGGGAAGCC 471 Amorce retour (18-mer): 601 GGATGACCTCCTCTTTTG 584 aller retour ZGC de l'amorce: 50.0 50.0 de l'amorce (degrés Celsius): 52.1 52.8 Produit Longueur: 148 EGC: 54.7 Tm: 78.3 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 0.7 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.6 degrés Celsius Annexe 1 (suite 10) Produit: P2l amorces 5' 3' Amorce aller (20-mer): : 451 ATGGAGAACTATTGGGAAGC 470 Amorce retour (20-mer): : 670 TCCCCTCTTTGTCTACCTTG 651 aller retour %GC de l'amorce: 45.0 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): : 55.8 56.8 Produit Longueur: 220 %GC: 55.0 Tm: 79.5 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.0 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 57.5 degrés Celsius Produit: P22 Amorces 5' 3' Amorce aller (20-mer): 447 AGTGATGGAGAACTATTGGG 466 Amorce retour (18-mer): : 713 TTGTATGAAAACGTGGGC 696 aller retour %GC de l'amorce: 45.0 44.4 Trn de l'amorce (degrés Celsius): : 54.1 55.4 Produit Longueur: 267 %GC: i4.3 Tm: 80.2 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.3 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 57.4 degrés Celsius Annexe I (suite 11) Produit: P23 Amorces 5' 3' amorce aller (20-mer): : 563 TCGACTATCACAACGAGAAC 582 Amorce retour (19-mer): 673 TGGTCCCCTCTTTGTCTAC 655 aller retour %GC de l'amorce: 45.0 52.6 Tm de l'amorce (degrés Celsius): : 53.7 55.0 Produit Longueur: 111 %GC: 54.1 Tm: 76.1 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.3 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 54.5 degrés Celsius Produit: P24 Amorces 5' 3' Amorce aller (18-mer): 577 GAGAACGCAAAAGAGGAG 594 Anorce retour (19-mer): 689 TCGTAGACGAGTCTGATGG 671 aller retour %GC de l'amorce: 50.0 52.6 Tm de l'amorce (degrés Celsius): 53.4 54.6 Produit Longueur: 113 %GC: 54.9 Tm: 77.4 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.2 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.3 degrés Celsius Annexe i (suite 12) Produit: P25 Amorces 5' 3 Amorce aller (18-mer): 422 AACAGATGTGGTTCCAAG 439 Amorce retour (18-mer) : 601 GGATGACCTCCTCTTTTG 584 aller retour %GC de l'amorce: 44.4 50.0 Tm de l'amorce (degrés Celsius): : 51.3 52.8 Produit Longueur: 180 %GC: 53.9 Tm: 79.0 degrés Celsius différence entre les Tm des amorces: 1.5 degrés Celsius température optimale d'hybridation: 55.8 degrés Celsius Annexe 2 Carte peptidique de la proteine p27KD Digest with: Tryp.