INPI-France/Brevets-Francais-2024-Chunked huggingface dataset:
Ainsi, lorsque l'on prend les deux nceuds de commutation précédemment mentionnés, notés A et B, avec leurs valeurs respectives de fréquences d'horloge, à savoir 24,576 MHz + 100 ppm et 24,576 MHz - 50 ppm, les durées des cycles calculées pour chacun desdits noeuds, notées respectivement TA et Te, sont différentes du fait des fréquences différentes des horloges internes propres à ces noeuds. La figure 1 illustre d'ailleurs ce phénomène et montre, sur deux axes superposés, pour deux nombres entiers n;.;tA et n;n;tB tels que TA= n;,;,/FA et TB = n;,;t/FB, où F désigne la fréquence d'horloge du n#ud considéré, un cycle propre au n#ud B et de durée TB supérieure à la durée TA d'un cycle propre au n#ud A.
On notera que le cas représenté sur la figure 1 est très peu probable dans la réalité puisqu'il envisage un déphasage nul à l'origine de chacun des premiers cycles des deux noeuds.
Toutefois, la comparaison de ces deux axes fait apparaître une dérive relative des débuts de chaque cycle qui correspond en fait à une évolution du déphasage au cours du temps entre les cycles considérés.
Sur cette figure, on a représenté au-dessus des deux premiers cycles du noeud considéré les numéros 1 et 2 identifiant deux paquets de données.
Dans la négative, le procédé prévoit de se placer en attente d'une telle commande.
Dans l'affirmative, l'étape T, est suivie d'une étape T8 au cours de laquelle la valeur Crefmax au niveau du n#ud N(i+1) passe à la valeur Crefmax+(val).
On remarquera que la valeur "val" correspond à plus ou moins une impulsion d'horloge qui est déterminée lors des étapes T5 et T6 de l'algorithme de la figure 7.
Ainsi, au cours de l'étape T8, on procède à un ajustement de la durée du cycle T(;+,) par modification du nombre d'impulsions d'horloge contenues à l'intérieur de cette durée.
Au cours de l'étape T8, la valeur CorrectC,fmax est mise à la valeur "val".
On notera qu'au cours de l'étape T2 de la figure 7, lorsque la valeur CorreCtCrefmax est différente de zéro, alors. la valeur Crefmax est ajustée en fonction de la valeur CorrectCrefmax- La valeur CorrectCrefmax a pour rôle de déterminer si une correction a été effectuée lors de la période de mesure précédente.
Si c'est le cas, alors on revient à la valeur précédente de crefmax étant donné que la correction n'est effectuée que pour une période de mesure. A titre de variante, il est possible que la correction soit effectuée sur plusieurs périodes de mesure consécutives.
Les modifications qui viennent d'être décrites ici seront prises en compte lors de la prochaine mesure au niveau de ce noeud Ni+1.
La détection d'une dérive au niveau du noeud Ni+1 lors de la prochaine mesure provoquera l'émission d'une commande à destination des noeuds de niveaux inférieurs. Selon une variante de la figure 8 qui est illustrée en figure 9, le procédé selon l'invention comporte une étape T,' de test sur la réception d'une commande en provenance du noeud N(i) analogue à l'étape T, de la figure 8.
Lorsque la réception d'une telle commande a bien eu lieu, alors l'étape T; est suivie de l'étape T8' au cours de laquelle la valeur C,f est augmentée de la valeur "val" qui, rappelons-le, peut être égale à 1.
A titre de variante, cette valeur peut être égale à n.
Dans le cadre de la variante décrite en référence à la figure 9, la modification au niveau du noeud N(i+1) consiste, non pas comme précisé en référence à la figure 8, à effectuer une modification qui ne sera prise en compte que lors de la prochaine mesure, mais à modifier la valeur C#f représentée par le nombre d'impulsions d'horloge émises par l'horloge interne du noeud N(i) et reconstituées au niveau du noeud N(i+1) pendant que l'algorithme représenté à la figure 7 se déroule au niveau du noeud N(i+1).
Ainsi, la mesure en cours est perturbée par la propagation de cette modification venant du noeud N(i) et, à la suite du déroulement des étapes T, à T4 exécutées au niveau du noeud N(i+1), la comparaison des valeurs C,f et C,es va permettre de déterminer s'il est nécessaire de propager cette commande à d'autres noeuds inférieurs de l'arborescence.
La figure 10 illustre une autre variante de réalisation de l'algorithme représenté à la figure 8.
Cet algorithme comporte une étape T," identique aux étapes T, et T,' précédentes.
L'étape T," est suivie d'une étape T8" au cours de laquelle la valeur C#f et incrémentée de la valeur "val"( 1) et la valeur Cn,es est également incrémentée de la même valeur.
mise en contact de l'échantillon biologique avec des anticorps selon l'invention puis de mise en évidence du complexe antigène-anticorps formé. Cette méthode peut être utilisée en immunocytochimie pour la localisation cellulaire du polypeptide selon l'invention et en immunohistochimie pour évaluer la prolifération cellulaire.
Entre également dans le cadre de l'invention, un nécessaire pour la détection et/ou le dosage d'un polypeptide selon l'invention dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comprend les éléments suivants : (i) un anticorps monoclonal ou polyclonal tel que décrit précédemment ; (ii) le cas échéant, les réactifs pour la constitution du milieu propice à la réaction immunologique ; (iii) les réactifs permettant la détection des complexes antigène-anticorps produits par la réaction immunologique. Ce kit est notamment utile à la réalisation d'expériences de Western Blotting ; celles-ci permettent d'étudier la régulation de l'expression du polypeptide selon l'invention à partir de tissus ou de cellules. Ce kit est également utile aux expériences d'immunoprécipitation pour mettre en évidence notamment les protéines interagissant avec le polypeptide selon l'invention.
Toute procédure classique peut être mise en oeuvre pour réaliser une telle détection et/ou dosage. A titre d'exemple, une méthode préférée met en jeu des processus immunoenzymatiques selon la technique ELISA, par immunofluorescence, ou radio-immunologique (RIA) ou équivalent.
L'invention comprend également une méthode de détection et/ou de dosage d'acide nucléique selon l'invention, dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comporte les étapes suivantes : (i) d'isolement de l'ADN à partir de l'échantillon biologique à analyser, ou obtention d'un ADNc à partir de l'ARN de l'échantillon biologique ; (ii) d'amplification spécifique de l'ADN codant pour le polypeptide selon l'invention à l'aide d'amorces ; (iii) d'analyse des produits d'amplification.
L'invention comprend en outre un nécessaire pour la détection et/ou le dosage d'un acide nucléique selon l'invention, dans un
échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comprend les éléments suivants : (i) un couple d'amorces nucléiques selon l'invention, (ii) les réactifs nécessaires pour effectuer une réaction d'amplification d'ADN, et éventuellement (iii) un composant permettant de vérifier la séquence du fragment amplifié, plus particulièrement une sonde selon l'invention.
L'invention comprend aussi une méthode de détection et/ou de dosage d'acide nucléique selon l'invention, dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comporte les étapes suivantes : (i) de mise en contact d'une sonde selon l'invention avec un échantillon biologique ; (ii) de détection et/ou de dosage de l'hybride formé entre ladite sonde et l'ADN de l'échantillon biologique.
L'invention comprend également un nécessaire pour la détection et/ou le dosage d'acide nucléique selon l'invention, dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comprend les éléments suivants : (i) une sonde selon l'invention, (ii) les réactifs nécessaires à la mise en oeuvre d'une réaction d'hybridation, et le cas échéant, (iii) un couple d'amorces selon l'invention, ainsi que les réactifs nécessaires à une réaction d'amplification de l'ADN.
L'invention concerne particulièrement les procédés selon l'invention et décrits ci-dessus, pour la détection et le diagnostic de prolifération cellulaire, et plus particulièrement de prolifération cellulaire d'origine cancéreuse.
L'invention concerne également une méthode de criblage de ligands susceptibles d'affecter l'activité transcriptionnelle d'un gène dont le promoteur comporte des boites CCAAT et/ou CCAAT inversées susceptibles de lier un polypeptide selon l'invention, ladite méthode étant caractérisée en ce qu'elle comporte les étapes suivantes de mise en contact dudit polypeptide et d'un ou plusieurs ligand(s) potentiel (s) en présence de réactifs nécessaires à la mise en #uvre d'une réaction de transcription ou de détection et/ou de mesure de l'activité transcriptionnelle. C'est également un des objets de l'invention de fournir un kit ou un nécessaire pour le criblage de ligands susceptibles d'affecter l'activité transcriptionnelle d'un gène dont le promoteur
comporte des boites CCAAT et/ou CCAAT inversées susceptibles de lier un polypeptide selon l'invention caractérisé en ce qu'il comprend les éléments suivants : (i) un polypeptide selon l'invention ; (ii) un ligand ; (iii) les réactifs nécessaires à la mise en #uvre d'une réaction de transcription.
Par ligand, on entend définir tous les composés susceptibles d'interagir avec le polypeptide selon l'invention pour former un complexe susceptible d'affecter l'activité transcriptionnelle, c'est-à-dire d'augmenter, de diminuer, de moduler ou d'annuler la transcription d'un gène sous le contrôle d'un promoteur contenant une séquence d'ADN à laquelle se lie le polypeptide de l'invention.
On entend définir également par ligand tout composé susceptible de se lier à la séquence d'ADN de liaison du polypeptide selon l'invention. Un tel ligand constitue un inhibiteur compétitif du polypeptide selon l'invention pour la liaison à la séquence d'ADN.
De préférence, l'échantillon biologique selon l'invention dans lequel est réalisé la détection et le dosage est constitué par un fluide corporel, par exemple un sérum humain ou animal, du sang, ou par des biopsies.
Selon un autre aspect, l'invention concerne un composé caractérisé en ce qu'il est choisi parmi un anticorps, un polypeptide, un ligand, un polynucléotide, un oligonucléotide ou un vecteur selon l'invention à titre de médicament et notamment en tant que principes actifs de médicament ; ces composés seront préférentiellement sous forme soluble, associés à un véhicule pharmaceutiquement acceptable.
Par véhicule pharmaceutiquement acceptable, on entend désigner tout type de véhicule employé habituellement dans la préparation de compositions injectables, c'est-à-dire un diluant, un agent de suspension tel une solution saline isotonique ou tamponnée. De préférence, ces composés seront administrés par voie systémique, en particulier par voie intraveineuse, par voie intramusculaire, intradermique ou par voie orale. Leurs modes d'administration, posologies et formes galéniques optimaux peuvent être déterminés selon
clonés dans le vecteur pLITMUS 29 (BIOLAB) au site de restriction PstI. Les deux clones obtenus sont dénommés CTRX3 et CTRX4. Le clone CTRX3 correspond au fragment de 1,5 kb et le clone CTRX4 au fragment de 3,8 kb.
L'analyse des séquences nucléotidiques des clones CTRX4 et CTRX3 montre qu'ils contiennent chacun une partie d'un même gène codant une thiorédoxine h de blé, tronqué lors de la digestion par PstI.
A partir des séquences nucléotidiques de ces 2 clones, les Inventeurs ont choisi deux amorces (THP8 et THM8) permettant d'amplifier un gène de thiorédoxine h sur une longueur d'environ 2,6 kb. L'ACP a été réalisée sur l'ADN non digéré du clone #4, et un fragment de la taille attendue a été cloné dans le vecteur pGEM-T (PROMEGA). Le clone obtenu contient le gène TaTrxh2 codant une thiorédoxine h de blé tendre.
Il comprend une région promotrice de 1111 pb, une région codante de 1447 pb, et une région 3' non codante de 131 pb.
La région codante du gène TaTrxh2 comprend trois exons de 120,123 et 135 pb séparés par deux introns, de 972 pb et de 93 pb. Le premier exon code un polypeptide de 40 acides aminés, le deuxième exon code un polypeptide de 41 acides aminés contenant le site actif, et le troisième exon code un polypeptide de 45 acides aminés.
La séquence nucléotidique du gène TaTrxh2 code une thiorédoxine h de blé tendre, nommée TaTrxh2, de 126 acides aminés, de masse moléculaire calculée 13435 Da et de pI calculé 5,0.
La comparaison des séquences des produits de traduction du gène TaTrxh2 et des gènes TaTrxhl précédemment décrite par GAUTIER et al. (1998, publication précitée) et TdTrxhl (thiorédoxine h de blé dur) montre qu'elles sont très conservées. En effet, la séquence peptidique de TaTrxh2 présente 97% de similarité
et 94% d'identité avec celle de TaTrxhl et 95% de similarité et 90% d'identité avec celle de TdTrxhl.
Le domaine N-terminal de TaTrxh2 est plus court que celui de TaTrxhl et TdTrxhl. La structure primaire de TaTrxh2 ne contient pas de peptide signal, suggérant que la protéine est localisée dans le cytoplasme. Cependant, elle présente une extension Nterminale déjà mise en évidence dans la structure primaire de TaTrxhl et TdTrxhl, pouvant correspondre à un domaine transmembranaire. L'analyse de l'extension Nterminale de TaTrxh2 avec le programme RAO ARGOS (PC/gene, RAO et al., Biochem. Biophys. Acta 869,197- 214,1986) révèle un domaine transmembranaire putatif entre les résidus 2 et 19. Le site actif, formé des 5 acides aminés suivants : WCGPC, est conservé entre les 3 thiorédoxines h de blé TaTrxh2, TaTrxhl et TdTrxhl.
Les introns ont des tailles différentes de celles des introns des gènes de thiorédoxines h de blé précédemment mis en évidence par ROBERT (1994) indiquant que le gène TaTrxh2 est différent de ceux-ci. Les introns du gène TaTrxh2 sont du type 0 et sont limités en 5' par la séquence GTA et en 3' par la séquence CAG, qui correspondent à des séquences consensus des limites intron-exon.
La région 3' non codante du gène TaTrxh2 présente le signal de polyadénylation AATAAA commun aux gènes transcrits par l'ARN polymérase II.
EXEMPLE 2 : ANALYSE STRUCTURELLE DU PROMOTEUR DU GÈNE TaTrxh2 Le promoteur du gène TaTrxh2 a été analysé pour rechercher des motifs de régulation putatifs susceptibles d'intervenir dans le contrôle de l'expression, et a notamment été comparé à celui des gènes de thiorédoxines h de C. reinhardtii (STEIN et al., Plant Mol. Biol. 28,487-503, 1995), de tabac (BRUGIDOU et al., Mol. Gen. Genet 238,285-293, 1993) et de riz
(ISHIWATARI et al., 1995), de la thiorédoxine m de C. reinhardtii (STEIN et al., 1995), et des thiorédoxines murine (MATSUI et al., Gene 152,165-171, 1995) et humaine (TONISSEN et al., Gene 102,221-228, 1992 ; KAGHAD et al., Gene 140,6643-6653, 1994).
La séquence du promoteur du gène TaTrxh2 est représentée sur la figure 1.
Le site d'initiation de la transcription (représenté sur la figure 1 en gras et souligné d'un double trait) est une adénine située à-65 pb de l'ATG.
Le promoteur du gène TaTrxh2 ne contient aucune séquence consensus correspondant à une boite TATAn ou à une boîte CAAT aux positions attendues pour les gènes transcrits par l'ARN polymérase II.
L'aménagement mme de cette (ou ces) zone (s) (3) constitue l'innovation majeure par rapport aux anciens dos numériques, tous opaques à l'oeil du photographe, car ne comportant qu'une seule ouverture sur la face Avant.
Les zones (2) et (3) seront de préférence aménagées en vis-à-vis, permettant alors de VOIR avantageusement AU TRAVERS du boitier (1), selon les besoins particuliers de chaque utilisateur. voir Figure 3.
Si une (ou quelques) Zone (s) (3) n'est (ne sont) pas en vis-à-vis de la Zone (2), un (ou plusieurs) système (s) de miroir (s) intégré (s) au dos numérique permettra (permettront) aussi de voir au travers du boitier (1) depuis une ou plusieurs de ces Zone (s) (3) en direction de la Zone (2).
Le boitier (1) peut devenir alors plus épais (NON ILLUSTRE) Dans la réalisation industrielle pratique, les Zones (2) et (3) auront la plupart du temps des tailles similaires mais rien ne s'oppose à ce qu'elles soient très différentes.
L'image (IM) d'un sujet (SU) se formera optiquement grâce à l'objectif (OB) dans le plan de netteté (P), identique à celui du verre dépoli d'origine de la chambre photographique.
A l'intérieur du boiter (1), contre la Zone (2) dans le meme plan (P) se trouve un support translucide (4) de préférence en verre dépoli-ou autre matériau, rigide ou souple-perme-ttant la matérialisation de l'image (IM) du sujet (SU).
Ce support (4) pourra tre intégré au boitier (1) dès la fabrication, ou bien a posteriori par I'tAilisateur, selon ses besoins spécifiques (verre dépoli avec ou sans quadrillage de repérage, les lignes dudit quadrillage pouvant tre plus ou moins espacées..) C'est donc grâce à I'une quelconque des Zones (3)-suffisamment transparentesque le photographe peut VOIR l'image formée sur le support (4).
Cet avantage est primordial car le photographe peut maintenant juger la composition et la netteté de l'image.
C'est pourquoi nous appelerons cette position du support (4) contre la Zone (2) position de Vision Directe.
Le photographe regardera l'image la plupart du temps selon un axe imaginaire (XY) perpendiculaire au plan (P) et traversant le centre de la Zone (2), afin d'obtenir la meilleure vision possible de cette image, sans déformation. voir Figure 3.
A côté du support (4), dans le mme plan (P) se trouvent des capteurs photosensibles (5), de type CCD ou autre, qui peuvent se déplacer à l'intérieur du boitier (1), en balayant la surface de l'image : c'est le principe mme du scanner . voir Figure 3.
La motorisation (11) permet le déplacement des capteurs (5) grâce aux guides (19) et (20). Un système (13) stocke les données numériques de façon temporaire (mémoire RAM par exemple) ou permanente (disque dur ou carte mémoire par exemple). L'unité électronique de pilotage (12) contrôle la motorisation (11) et le système (13) auxquels elle est reliée électriquement. Cette unité (12) contrôle aussi les signaux électriques en provenance des capteurs (5) par le câble électrique (17), et les transforme en données numériques. Une connectique (21) permet de relier l'unité de pilotage (12) du dos à un ordinateur avec écran-moniteur, à I'aide d'un câble électrique approprié (14). voir Figure 4.
Le support (4) matérialisant l'image (IM) est lui aussi mobile à l'intérieur du boitier, et s'escamote momentanément afin de permettre le passage des capteurs (5) pendant la phase de numérisation.
Selon différents modes de réalisation, cet escamotage du support (4) s'effectuera : -par translation latérale dans le plan (P) : voir Figures 5, 6 et 7 les capteurs (5) et le support (4) se déplacent alors de préférence ensemble et ils sont dans ce cas fixés solidairement sur le cadre (18) qui coulisse sur les guides (19) et (20), mais rien ne s'oppose à déplacer le support (4), manuellement ou de façon motorisée, indépendamment des capteurs (5), auquel cas les éléments (4) et (5) auront chacun leur propre cadre (NON ILLUSTRE), et éventuellement leurs propres guides (NON ILLUSTRES).
-par rétractation vers l'arrière : voir Figures 8, 9, 10 et 11 le support (4) est déplacé de sa position de Vision Directe contre la Zone (2) vers 1'arrière du boitier (1), de façon manuelle ou motorisée.
-par pivotement-basculement autour d'un axe, de façon manuelle ou motorisée (NON ILLUSTRE) Le support (4) et les capteurs (5) pourront avoir des tailles différentes et indépendantes, selon les fabrications ; le parallèle qualitatif avec la photo argentique est maintenu car la surface du film argentique est comparable à la taille du fichier numérique : plus la surface de l'image est grande, plus il y a d'informations, meilleure est sa qualité et ses possibilités d'agrandissement.
Un (ou plusieurs) système (s) d'occultation (7) temporaire (s), permet (tent) d'occulter la (ou les) Zone (s) (3) évitant toute entrée de lumière parasite par ces zones pendant la phase de numérisation de l'image.
Ce (s) système (s) d'occultation (7) pourra (pourront) tre fixé (s) à l'intérieur du boitier (1) ou à l'extérieur de celui-ci.
Selon des modes particuliers de réalisation, cette (ces) occultation (s) se fera (feront) ensemble ou séparément : -par volet opaque, coulissant suivant des guides tels que (22) : voir Figure 4 -par écran électronique à deux états-transparent ou opaque-de type à cristaux liquides par exemple (NON ILLUSTRE), relié électriquement à unité de pilotage (12) -par rideau souple en matériau opaque (NON ILLUSTRE) -par combinaison de plusieurs modes sus-énoncés dans le cas de pluralité de Zones (3) Dans un mode particulier de réalisation, la (ou les) Zone (3) matérialisée (s) par une (ou plusieurs) ouverture (s) est (ou sont) munie (s) d'une (ou plusieurs) vitre (s) (6)-en verre ou en plastique-pour protéger) le système interne sophistiqué de toute introduction de corps étranger, poussière ou autre...
Dans un mode spécial de fabrication, la (ou les) vitre (s) (6) sus-décrite (s) est (ou sont) remplacée (s) par un (ou des) écran (s) à cristaux liquides, écran (s) relié (s) électriquement à 11 unité de pilotage (12) (NON ILLUSTRE).
Cet (ces) écran (s) pouvant prendre deux états différents : -opaque, pour occulter la (ou les) zone (s) (3) où il est (sont) placé (s) -ou bien suffisamment transparent, pour permettre au photographe de continuer à voir avantageusement à l'intérieur du boitier (1) Dans ce cas particulier, il est évident que la (ou les) vitre (s) (6) remplace (ent) le (ou les) système (s) (7), ce (s) dernier (s) n'ayant plus de raison d'tre.
Dans une version encore plus sophistiquée, voir Figure 13 : un écran (8) (de type à cristaux liquides par exemple) disposé juste derrière le support (4) est reliE électriquement à l'unité de pilotage (12) et permet l'affichage d'un dessin, ou éventuellement d'une image. (NON ILLUSTRE) Ce dessin (ou image), formé (e) électroniquement sur l'écran (8), sera utile au photographe, en tant qu'indication de placement pour son sujet, dans le cas où il lui est demandé de respecter une maquette avec une perpective précise, à la manière d'un calque posé contre le verre dépoli , technique habituelle bien connue des photographes professionnels. Aux endroits où le dessin n'est pas présent, 1'6cran (8) reste suffisamment transparent, et ainsi le photographe conserve une bonne vision de l'image (IM) sur le support (4) dans le plan (P).
Cet écran (8) peut tre mobile (manuellement ou motorisé)-afin de ne pas tre en place en permanence derrière le support (4)-et peut aussi suivre le support (4) dans tous ses mouvements, via des guides communs ou non (NON ILLUSTRES) Dans une autre version de fabrication, on peut avoir une option de loupe, grossissante, inteme, mobile, pour faciliter encore plus la mise au point sur le support (4) si nécessaire (NON ILLUSTREE).
Selon un mode particulier de réalisation, l'invention peut comporter un volet de protection (NON ILLUSTRE) sur la face dite Avant, afin de masquer complètement la Zone (2), protégeant ainsi les éléments internes du dos numérique, pendant le transport ou la non-utilisation de ce dernier.
Dans sa principale configuration, ce dos s'adaptera donc sur un appareil photographique pré-existant avec son objectif (du type chambre professionnelle à soufflet), permettant l'emploi de la chambre en mode numérique, tout en conservant la possibilité de revenir-à tout moment-au mode argentique avec films à développement chimique. voir Figure 2.
Dans une autre configuration, ce nouveau Dos Numérique à Vision Directe peut recevoir un objectif photographique (OC) via un système de liaison-adaptation (25) pour former alors un appareil photographique numérique complet, mais plus compact qu'une chambre photographique à soufflet, tout en conservant la facilité et la précision de visée directe et de mise au point sur le support (4). voir Figure 12.
Dans une autre configuration, la connectique (21) est remplacée par une liaison par ondes (infrarouges, hertziennes, radio...) pour transférer les données-image vers 1'ordinateur, supprimant ainsi le câble (14). (NON ILLUSTRE).
Dans une autre configuration, le Dos Numérique à Vision Directe est : le boitier (1) comportera, en plus, tout ou partie des fonctionnalités d'un ordinateur. Cela permet une plus grande mobilité. L'emploi du dos en extérieur est ainsi grandement facilité. (NON ILLUSTRE).