FR 3085689 A1 20200313 FR 1858167 A 20180912 La présente invention a pour objet un procédé pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient, comprenant une étape de détection et/ou de quantification de l'expression, dans un échantillon biologique dudit individu, d'une ou plusieurs séquences de HERV/MaLR, ainsi que les outils pour le mettre en oeuvre et les utilisations de ceux-ci. Le système immunitaire est un système de défense de l'organisme contre ce qui est reconnu comme du non-soi, tel que des pathogènes (e.g. virus, bactéries, parasites). Chez les mammifères, on distingue deux grands types de mécanismes : un mécanisme de défense non-spécifique, appelé également immunité « innée » ou « naturelle », et un mécanisme de défense spécifique, appelé également immunité « acquise » ou « adaptative ». Ces réponses immunitaires nécessitent une régulation très fine. Chez un individu sain, la réponse immunitaire sera qualifiée de « normale » (on pourra également parler de statut immunitaire d'immunocompétence). Cependant, la réponse immunitaire peut parfois se retrouver altérée. On parlera de statut d'inflammation ou statut immunitaire hyperactif quand le système immunitaire est plus actif que la normale, comme dans le cas de maladies inflammatoires ou auto-immunes. Dans les maladies auto-immunes, le système immunitaire de l'organisme déclenche une réaction inflammatoire avec une immunisation caractérisée envers les antigènes du soi. A l'inverse, on parlera de statut d'immunosuppression (ou immunodépression ou immunodéficience ou statut immunitaire hypoactif ou paralysie immunitaire), quand le système immunitaire est moins actif que la normale. L'immunosuppression peut avoir différentes origines, prendre de nombreuses formes, et affecter l'immunité innée et/ou l'immunité adaptative. En particulier, le sepsis est un problème de santé publique majeur, qui représente la première cause de mortalité en unité de soins intensifs. On estime que 28 millions d'individus développent un sepsis chaque année à travers le monde, parmi lesquels 8 millions décèderont de la pathologie 2 (Fleischmann et al. (2016) American journal of respiratory and critical care medicine;193(3):259-72). Chez un patient atteint de sepsis (dit également, en état septique), la réponse immunitaire est dérégulée, suite à une infection, ce qui conduit à une défaillance et des dysfonctions d'organes multiples et potentiellement mortelles. 5 Cette réponse immunitaire est complexe et évolue en fonction du temps, avec des phénomènes pro-inflammatoires et anti-inflammatoires excessifs et pouvant être concomitants. L'ensemble de ces dérèglements du système immunitaire conduit aux défaillances d'organes, à la paralysie du système immunitaire et aux infections secondaires. Le choc septique est un sous-type de sepsis, dans lequel une hypotension 10 persiste, malgré un remplissage vasculaire adéquat (Singer et al (2016) JAMA; 315(8): 801-810). Au stade initial du sepsis, c'est une réponse inflammatoire, voire hyperinflammatoire, qui semble prédominer, et qui est à l'origine de dommages tissulaires et de défaillances organiques, notamment au niveau rénal. C'est pourquoi les essais cliniques dans le domaine du sepsis se sont pendant longtemps concentrés sur des 15 traitements anti-inflammatoires, mais avec des résultats peu concluants. Des études plus récentes sur la physiopathologie du sepsis ont conduit à montrer qu'une réponse anti-inflammatoire ou d'immunosuppression, survenait chez certains patients en état septique, soit de manière concomitante à l'inflammation initiale, soit plus tard. Le patient peut alors se retrouver dans un état d'immunosuppression, potentiellement 20 sévère, en fonction des degrés respectifs des réponses pro-inflammatoires et anti- inflammatoires. Ces patients immunodéprimés présentent un risque élevé de développer des infections nosocomiales (ou HAI, Health-care Associated Infections), et pourraient avantageusement bénéficier de traitements immunostimulants. Il apparaît donc important de pouvoir déterminer le statut immunitaire d'un individu, 25 et en particulier de pouvoir identifier un statut d'immunosuppression, afin de pouvoir adapter la prise en charge thérapeutique. Or, les individus ayant des dérèglements du système immunitaire ne présentent pas de signes cliniques spécifiques. Il existe donc un besoin important d'identification de biomarqueurs, permettant de déterminer le statut immunitaire d'un individu. 3 Actuellement, le test de référence pour suivre les altérations immunitaires chez les patients en soins intensifs (e.g. patients atteints de sepsis, de traumatismes, ayant subi une chirurgie lourde, brûlés, ou patients atteints de pancréatites) est la diminution de l'expression du HLA-DR (human leucocyte antigen - D related) à la surface des 5 monocytes (mHLA-DR), mesurée par cytométrie en flux. En effet, ce marqueur fournit des informations précieuses en terme de prédiction de la mortalité ou encore de l'évaluation du risque d'infections secondaires chez ces patients. Le HLA-DR est un récepteur de surface appartenant au CMH (complexe majeur d'histocompatibilité) de classe II. La mesure de l'expression du mHLA-DR représente en particulier le gold 10 standard pour identifier si un patient atteint de sepsis est immunodéprimé ou non (Monneret et Venet (2016) Cytometry Part B (Clinical Cytometry) 90B:376-386). Cependant, cette approche nécessite d'importantes manipulations pré-analytiques de l'échantillon (Monneret et Venet (2014) Monocyte HLA-DR in sepsis: shall we stop following the flow? Crit Care 18:102). Par ailleurs, l'accessibilité à un cytomètre en flux 15 n'est pas toujours possible dans tous les hôpitaux, et la mesure est difficile à standardiser d'un hôpital à un autre, voire d'un manipulateur à un autre. Pour pallier ces inconvénients, d'autres biomarqueurs, utilisant des outils de biologie moléculaire, ont été proposés, comme par exemple un biomarqueur basé sur le ratio 20 du niveau d'expression, au niveau ARNm, de CD74 au jour J3 (suivant l'admission du patient au sein d'une structure médicale) sur le niveau d'expression de CD74 au jourJ1. Le CD74 représente la chaîne invariante y du HLA-DR. Il a été montré que le ratio d'expression CD74 J3/J1 est associé avec l'apparition d'infections secondaires acquises en soins intensifs (Peronnet et al (2017) Intensive Care Medicine ;43(7):1013-20). La 25 demande de brevet W02012/101387 décrit quant à elle un procédé de détermination du statut immunitaire d'un individu, à partir de l'analyse de l'expression d'au moins deux gènes choisis parmi plusieurs groupes de gènes. Il a également été proposé, dans la demande de brevet W02013/156627, une méthode de détermination du statut immunodéprimé ou non-immunodéprimé, à partir de la détermination de la charge en anellovirus, dans un échantillon biologique. Cependant, aucun de ces biomarqueurs 4 n'est venu à ce jour remplacer l'utilisation du mHLA-DR. Ces biomarqueurs présentent notamment l'inconvénient de ne pas permettre d'identifier dans quelle phase se situe le patient (i.e. phase inflammatoire versus phase immunosuppressive), leur objectif étant essentiellement de pouvoir identifier les patients immunodéprimés, pour lesquels 5 il serait pertinent d'administrer des traitements immunostimulants. A la date de la présente invention, il demeure donc nécessaire de trouver de nouveaux biomarqueurs permettant de déterminer le statut immunitaire d'un individu. 10 Les rétrovirus endogènes, ou ERV (pour Endogenous RetroVirus) désignent des séquences stables du génome d'un organisme et ayant des analogies structurales avec certains rétrovirus exogènes infectieux (dont la présence de deux LTR, ou Long Terminal Repeats, qui encadrent les gènes codant pour les protéines putatives). Leur origine est incertaine, mais l'hypothèse la plus probable est celle de l'infection de cellules 15 germinales par un rétrovirus. Suite à des mutations du rétrovirus qui l'auraient rendu défectif, les cellules germinales infectées auraient pu survivre, et le génome du rétrovirus, intégré dans le génome de l'organisme, aurait pu être transmis à la génération suivante, et persister dans la descendance au sein du génome de l'organisme. 20 Chez l'homme, les HERV (Human Endogenous RetroVirus) n'ont été mis en évidence que depuis le séquençage du génome humain. Avec les MaLR (Mammalian apparent LTRRetrotransposons), qui possèdent une structure similaire aux HERV, ils représentent 8,3% du génome humain, avec un nombre s'élevant à plus de 400 000 éléments. A titre 25 de comparaison, les 30 000 à 40 000 gènes codant pour des protéines, représentent uniquement 2% de l'ADN humain. Les HERV sont subdivisés en trois grandes classes (I, Il et III) et plusieurs groupes (parfois appelés « familles », dans la présente demande de brevet). Les HERV sont des rétroéléments qui se transposent uniquement par un mode de copier-coller, par le biais d'un intermédiaire à ARN et d'une transcriptase inverse. Ils 30 ont longtemps été considérés comme de l'ADN « poubelle » (funk DNA). S'ils peuvent 5 être inactifs à cause de mutations ou par des mécanismes épigénétiques, leur rôle commence à apparaître, aussi bien dans des contextes physiologiques que pathologiques. Ainsi, il a été montré que HERV-W participe à un des mécanismes assurant la formation du placenta. La superfamille HERV-K est quant à elle la plus 5 étudiée en relation avec la carcinogenèse. L'expression de certains HERV a également été décrite dans certaines maladies auto-immunes, comme la sclérose en plaques ou le lupus érythémateux, et dans les interféronopathies, sans que rien n'évoque un possible lien entre réactivation des HERV et le statut immunitaire. 10 Ainsi, il n'a jamais été décrit ni suggéré que l'analyse de l'expression de HERV chez l'Homme pouvait permettre de déterminer le statut immunitaire d'un individu. Par ailleurs, la réactivation des HERV n'a jamais été décrite dans la pathologie du sepsis. Or, il a été découvert que, de façon tout-à-fait surprenante, parmi les quelque 420 000 15 HERV/MaLR existants, l'analyse de l'expression de certains d'entre eux permettait de déterminer le statut immunitaire d'un individu. Ainsi, la présente invention a pour objet un procédé pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient, comprenant une étape 20 de détection et/ou de quantification de l'expression, dans un échantillon biologique dudit individu (ou échantillon biologique test), d'au moins une partie, de préférence d'une taille d'au moins 10, au moins 11, au moins 12, au moins 13, au moins 14, au moins 15, au moins 16, au moins 17, au moins 18, au moins 19, au moins 20, au moins 21, au moins 22, au moins 23, au moins 24, au moins 25, au moins 26, au moins 27, au 25 moins 28, au moins 29, au moins 30 nucléotides, d'au moins une séquence de HERV/MaLR choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99%, de préférence au moins 99,1%, de préférence au moins 99,2%, de préférence au moins 99,3%, de préférence au moins 99.4%, de préférence au moins 99.5%, de préférence au moins 99.6%, de préférence au moins 6 99.7%, de préférence au moins 99.8%, de préférence au moins 99.9% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, parmi les listes suivantes : Tableau 1. Liste 1 SEQ ID NO Localisation GRCh38 Nom du probeset Nom du groupe de HERV/MaLR correspondant de la puce HERV-V3 1 chr19:54891074-54891496 190665001-H ERV0376 HERV0376 2 chr22:36153696-36154283 220247002-H ERV0797 HERV0797 3 chr17:35505737-35508365 170369402HE41env HERV-E41 4 chr12:112971073-112971451 121601801-H ERV0492 HERV0492 5 chr1:78648318-78648697 011052702-MALR1044 MALR1044 6 chr1:78623489-78623954 011052202-HERV1033 HERV1033 7 chr13:42884951-42886257 130360601-H ERV0808 HERV0808 8 chr14:91230494-91230820 141107102-MALR1019 MALR1019 9 chr2:102363654-102366601 021460102-H ERV0599uL HERV0599 10 chr2:102013616-102013971 021456001-MALR1017uL MALR1017 11 chr5:14551189-14551685 050286701-H ERV0513 HERV0513 12 chr5:14562791-14563322 050287402-MALR1022 MALR1022 Tableau 2. Liste 2 SEQ ID NO Localisation GRCh38 Nom du probeset Nom du groupe de HERV/MaLR correspondant de la puce HERV-V3 13 chr5:132453630-132454148 052182701-MALR1129 MALR1129 14 chr19:41812466-41813010 190478501-MALR1003 MALR1003 15 chr1:155637287-155637547 011790601ERV9sLU5 ERV9 16 chr5:170290289-170290812 052681601-MALR1018 MALR1018 7 17 chr16:50662453-50662912 160627301-MALR1014 MALR1014 18 chr11:122671887-122672147 111686702-HERV0861 HERV0861 8 chr14:91230494-91230820 141107102-MALR1019 MALR1019 19 chr4:15825146-15825565 040318302-MALR1134 MALR1134 20 chr4:83464568-83464963 041529101-MALR1026 MALR1026 21 chr14:91222760-91223118 141106902-MALR1133 MALR1133 Tableau 3. Liste 3 SEQ ID NO Localisation GRCh38 Nom du probeset Nom du groupe de HERV/MaLR correspondant de la puce HERV-V3 1 chr19:54891074-54891496 190665001-HERV0376 HERV0376 1 chr19:54891074-54891496 190665002-HERV0376 HERV0376 22 chr6:18403673-18404108 060281701-MALR1043 MALR1043 23 chr4:184850413-184850785 043166601-MALR1018 MALR1018 24 chr10:5856198-5856795 100090601-HERV0429 HERV0429 25 chr6:107800650-107801138 061529601-HERV0492 HERV0492 26 chr10:60410534-60411224 100871501-MALR1020 MALR1020 27 chr17:78345106-78345577 170842002-MALR1003 MALR1003 5 Tableau 4. Liste 4 SEQ ID NO Localisation GRCh38 Nom du probeset Nom du groupe de HERV/MaLR correspondant de la puce HERV-V3 28 chr8:125945973-125951030 081921103-HERV0958 HERV0958 29 chr3:167401329-167401866 032622601MR41sLU5p MR41 30 chr22:36147793-36148208 220246901-HERV0889 HERV0889 31 chr6:127790579-127792191 061827101-HERV0856 HERV0856 8 3 chr17:35505737-35508365 170369402HE41env HERV-E41 32 chr17:77462942-77463350 170828901-HERV0770 HERV0770 28 chr8:125945973-125951030 081921101-HERV0958 HERV0958 28 chr8:125945973-125951030 081921102-HERV0958 HERV0958 33 chr19:14612123-14612747 190148802-MALR1127 MALR1127 34 chr12:9038254-9038598 120093401-HERV1034 HERV1034 Dans le cadre de la présente invention : 5 « déterminer le statut immunitaire » d'un individu consiste à évaluer la capacité de l'organisme à mettre en oeuvre une réponse immunitaire et à se défendre contre des agressions ou des infections. Le statut immunitaire peut notamment être déterminé comme étant un statut immunitaire normal (ou statut d'immunocompétence), un statut d'inflammation (ou statut immunitaire 10 hyperactif) quand le système immunitaire est plus actif que la normale, ou un statut d'immunosuppression (ou immunodépression ou immunodéficience ou statut immunitaire hypoactif ou paralysie immunitaire), quand le système immunitaire est moins actif que la normale. 15 Par « HERV/MaLR », on entend les éléments de type HERV et MaLR, tels que présentés en introduction. Le terme abrégé de « HERV » pourra également parfois être utilisé, et avoir la même signification que « HERV/MaLR ». Dans la littérature, de nombreux alias ont été utilisés pour décrire un même élément HERV ou un même groupe (ou famille) de HERV, et il existe encore à ce jour un 20 besoin de standardisation. Dans la présente demande, pour éviter toute confusion, on se réfèrera en premier lieu, pour déterminer l'identité d'un élément HERV, à la localisation chromosomique de l'élément HERV en question, plus particulièrement en se basant sur le GRCh38 (Genome Reference Consortium Human Build 38). On pourra également parfois se référer aux 9 différents probesets et aux différentes sondes de la puce HERV-V3 ciblant l'élément HERV en question. Il convient également de noter que, pour un élément HERV donné, tel qu'identifié par sa localisation GRCh38, les séquences retrouvées chez différents individus peuvent différer d'avec la séquence 5 indiquée dans la base GRCh38, du fait du polymorphisme (Wildschutte et al (2016), Discovery of unfixed endogenous retrovirus insertions in diverse human populations, PNAS 113(16):E2326-34). Le terme « individu » désigne un être humain, quel que soit son état de santé. 10 Un « individu sain » au sens de la présente invention est un individu qui ne présente pas de dérèglement du système immunitaire. Le terme « patient » désigne un individu qui est entré en contact avec un professionnel de la santé, tel qu'un médecin (par exemple, un médecin généraliste) ou une structure médicale (par exemple, le service des urgences ou de réanimation d'un hôpital, 15 ou une unité de soins intensifs) Par « détection de l'expression d'une séquence », on entend la mise en évidence de l'expression de ladite séquence, sans nécessairement une mesure quantitative. Dans le cas d'un transcrit ARNm, la détection peut être réalisée par 20 une méthode directe, par tout procédé connu de l'homme du métier permettant de déterminer la présence dudit transcrit dans un échantillon, ou par détection indirecte du transcrit après transformation de ce dernier en ADN, ou après amplification dudit transcrit ou après amplification de l'ADN obtenu après transformation dudit transcrit en ADN. La « quantification de l'expression 25 d'une séquence » désigne le fait d'évaluer le niveau d'expression de la séquence, de manière quantitative. De nombreuses méthodes existent pour la détection des acides nucléiques (voir par exemple Kricka et al., Clinical Chemistry, 1999, n° 45(4), p.453-458; Relier G. H. et al., DNA Probes, 2nd Ed., Stockton Press, 1993, sections 5 et 6, p.173-249). 30 10 Par « échantillon biologique », on se réfère à tout échantillon provenant d'un individu, et pouvant être de différentes natures, comme le sang, le sérum, le plasma, les expectorations, l'urine, les selles, la peau, le liquide céphalorachidien, le liquide de lavage broncho-alvéolaire, la salive, les sécrétions 5 gastriques, le sperme, le liquide séminal, les larmes, la moelle épinière, ganglion du nerf trijumeau, tissu adipeux, tissu lymphoïde, tissu placentaire, tissu du tractus gastrointestinal, tissu du tractus génital, tissu du système nerveux central. En particulier, cet échantillon peut être un fluide biologique, de préférence choisi parmi le sang total (tel que collecté de la voie veineuse, c'est- 10 à-dire contenant les cellules blanches et rouges, les plaquettes et le plasma), le plasma et le sérum. Il peut également s'agir de tout type de cellules extraites à partir d'un échantillon de sang, telles que les cellules mononucléées sanguines périphériques (ou PBMC), des sous-populations de cellules B, des monocytes purifiés, ou des neutrophiles. 15 Afin de déterminer le « pourcentage d'identité de séquence » d'une séquence d'acides nucléiques avec une autre séquence d'acides nucléiques, les deux séquences sont d'abord alignées de manière optimale. Les deux séquences à comparer peuvent être de même taille ou de tailles différentes. Dans certains 20 cas, il peut être nécessaire d'introduire des « trous » dans l'une des séquences, afin de permettre un alignement optimal avec la seconde séquence. L'alignement optimal des séquences peut notamment être réalisé en utilisant l'algorithme de Smith et Waterman (J. Theor. Biol., 91 (2): 370-380, 1981 ), l'algorithme de Needleman and Wunsch (J. Mol. Biol, 48(3) : 443-453, 1972), ou 25 la méthode de Pearson and Lipman (Proc. Natl. Acad. Sri. U. S.A. , 85(5) : 2444- 2448, 1988). Certains logiciels permettent d'implémenter certains de ces algorithmes, tels que GAP, BESTFIT, FASTA, TFASTA (Wisconsin Genetics Software Package Release 7.0, Genetic Computer Group, 575, Science Drive, Madison, Wisconsin), BLAST ou encore CLUSTALW (Nucleic Acids Res. 1994 Nov 30 11; 22(22) :4673-80. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive 11 multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice). Le meilleur alignement (i.e. celui permettant d'obtenir le pourcentage d'identité le plus élevé sur la fenêtre de comparaison), parmi ceux générés par ces diverses méthodes, est sélectionné. 5 On compare ensuite les nucléotides respectifs se situant à la même position de chacune des séquences. Quand une position donnée est occupée par le même nucléotide dans les deux séquences, alors les séquences sont identiques pour cette position. Le pourcentage d'identité de séquence est alors déterminé en fonction du nombre de positions pour lesquelles les nucléotides respectifs sont 10 identiques, rapporté au nombre total de nucléotides des positions pour lesquelles l'alignement a été possible, au niveau de la fenêtre de comparaison. - Un « biomarqueur » ou « marqueur » est une caractéristique biologique mesurable objectivement qui représente un indicateur des processus 15 biologiques normaux ou pathologiques ou de réponse pharmacologique à une intervention thérapeutique. Il peut s'agir en particulier d'un biomarqueur moléculaire, de préférence détectable au niveau ARN m. Plus particulièrement, le biomarqueur peut être un biomarqueur endogène ou loci (tel qu'un HERV ou un gène, qui se retrouvent dans le matériel chromosomique d'un individu) ou 20 un biomarqueur exogène (tel qu'un virus). - Le « sepsis » est une pathologie dans laquelle la réponse immunitaire est dérégulée chez un individu, suite à une infection, conduisant à une défaillance et des dysfonctions d'organes multiples et potentiellement mortelles. Le « choc 25 septique » est un sous-type de sepsis, dans lequel une hypotension persiste, malgré un remplissage vasculaire adéquat. - On entend par « amorce d'amplification », un fragment nucléotidique pouvant comprendre de 5 à 100 nucléotides, de préférence de 15 à 30 nucléotides, et 30 possédant une spécificité d'hybridation avec une séquence nucléotidique cible, 12 dans des conditions déterminées pour l'initiation d'une polymérisation enzymatique, par exemple dans une réaction d'amplification enzymatique de la séquence nucléotidique cible. Généralement, on utilise des « couples d'amorces », constitués de deux amorces. Lorsque l'on souhaite réaliser 5 l'amplication de plusieurs HERV différents, plusieurs couples d'amorces différents sont de préférence utilisés, ayant préférentiellement chacun une capacité à s'hybrider spécifiquement avec un HERV différent. On entend par « sonde d'hybridation », un fragment nucléotidique comprenant 10 typiquement de 5 à 100 nucléotides, de préférence de 15 à 90 nucléotides, de manière encore plus préférée de 15 à 35 nucléotides, possédant une spécificité d'hybridation dans des conditions déterminées pour former un complexe d'hybridation avec une séquence nucléotidique cible. La sonde comporte également un rapporteur (tel qu'un fluorophore, une enzyme ou tout autre 15 système de détection), qui va permettre la détection de la séquence nucléotidique cible. Dans la présente invention, la séquence nucléotidique cible peut être une séquence nucléotidique comprise dans un ARN messager (ARNm) ou une séquence nucléotidique comprise dans un ADN complémentaire (ADNc) obtenu par transcription inverse dudit ARNm. Lorsque l'on souhaite cibler 20 plusieurs HERV différents, plusieurs sondes différentes sont de préférence utilisées, ayant préférentiellement chacune une capacité à s'hybrider spécifiquement avec un HERV différent. Par « hybridation », on entend le processus au cours duquel, dans des 25 conditions appropriées, deux fragments nucléotidiques, tels que par exemple une sonde d'hybridation et un fragment nucléotidique cible, ayant des séquences suffisamment complémentaires, sont susceptibles de former un double brin avec des liaisons hydrogènes stables et spécifiques. Un fragment nucléotidique "capable de s'hybrider" avec un polynucléotide est un fragment 30 pouvant s'hybrider avec ledit polynucléotide dans des conditions d'hybridation, 13 qui peuvent être déterminées dans chaque cas de façon connue. Les conditions d'hybridation sont déterminées par la stringence, c'est-à-dire la rigueur des conditions opératoires. L'hybridation est d'autant plus spécifique qu'elle est effectuée à plus forte stringence. La stringence est définie notamment en 5 fonction de la composition en bases d'un duplex sonde/cible, ainsi que par le degré de mésappariement entre deux acides nucléiques. La stringence peut également être fonction des paramètres de la réaction, tels que la concentration et le type d'espèces ioniques présentes dans la solution d'hybridation, la nature et la concentration d'agents dénaturants et/ou la température d'hybridation. La 10 stringence des conditions dans lesquelles une réaction d'hybridation doit être réalisée dépendra principalement des sondes d'hybridation utilisées. Toutes ces données sont bien connues et les conditions appropriées peuvent être déterminées par l'homme du métier. En général, selon la longueur des sondes d'hybridation utilisées, la température pour la réaction d'hybridation est 15 comprise entre environ 20 et 70°C, en particulier entre 35 et 65°C dans une solution saline à une concentration d'environ 0,5 à 1 M. On réalise ensuite une étape de détection de la réaction d'hybridation. Par « réaction d'amplification enzymatique », on entend un processus générant 20 de multiples copies d'un fragment nucléotidique cible, par l'action d'au moins une enzyme. De telles réactions d'amplification sont bien connues de l'homme du métier et on peut citer notamment les techniques suivantes : PCR (Polymerase Chain Reaction) , LCR (Ligase Chain Reaction), RCR (Repair Chain Reaction), 3SR (Self Sustained Séquence Replication) avec la demande de brevet 25 WO-A-90/06995, NASBA (Nucleic Acid Sequence-Based Amplification), TMA (Transcription Mediated Amplification) avec le brevet US-A-5,399,491, et LAMP (Loop mediated isothermal amplification) avec le brevet US6410278. Lorsque la réaction d'amplification enzymatique est une PCR, on parlera plus particulièrement de RT-PCR (RT pour « reverse transcription »), lorsque l'étape 30 d'amplification est précédée d'une étape de réverse-transcription d'ARN 14 messager (ARNm) en ADN complémentaire (ADNc), et de qPCR ou RT-qPCR lorsque la PCR est quantitative. A la connaissance des inventeurs, il n'a jamais été décrit ni suggéré que la détection 5 et/ou la quantification de l'expression de HERV/MaLR pouvait permettre de déterminer le statut immunitaire d'un individu. En particulier, l'implication des HERV/MaLR n'a jamais été décrite dans le domaine du sepsis. L'ensemble des HERV/MaLR de SEQ ID NO :1 à 34 ont été identifiés parmi les quelque 10 420 000 HERV/MaLR du génome. Il s'agit de HERV/MaLR qu'on arrive à cibler avec la puce HERV-V3 (Becker et al, BMC Genomics. 2017; 18: 286). Plus particulièrement, ces HERV/MaLR sont exprimés dans les jeux de données utilisés dans les Exemples. Encore plus particulièrement, ces HERV/MaLR exprimés sont modulés entre les conditions d'intérêt retenues dans les Exemples. 15 La détection et/ou la quantification de l'expression des HERV selon la présente invention, pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, peut s'effectuer au moyen d'outils moléculaires qui présentent des avantages par rapport à l'utilisation de la cytométrie en flux pour la mesure de mHLA-DR, en termes d'accessibilité au sein des 20 hôpitaux et de standardisation. Peu de manipulation des échantillons est nécessaire et les résultats sont faciles à interpréter. Par ailleurs, l'expression des HERV selon la présente invention peut être détectée et/ou quantifiée sur plusieurs types de plateformes, comme des puces à ADN ou par PCR, afin de déterminer le statut immunitaire. Certains des HERV selon la présente invention peuvent être détectés 25 précocement, dès .11, alors que la mesure de mHLA-DR s'effectue à J3 (Monneret et Venet (2014) Monocyte HLA-DR in sepsis: shall we stop following the flow? Crit Care 18:102). 15 Préférentiellement, la présente invention a pour objet un procédé pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient, comprenant : - une étape de détection et/ou de quantification de l'expression, dans un 5 échantillon biologique dudit individu (ou échantillon biologique test), d'au moins une partie d'au moins une séquence de HERV/MaLR choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, parmi les Listes 1 à 4, précédemment décrites ; 10 - une étape dans laquelle on compare l'expression dans l'échantillon biologique test, avec une expression de référence, ou avec l'expression dans un échantillon biologique de référence ; - une étape dans laquelle on détermine le statut immunitaire de l'individu à partir de cette comparaison. 15 L'échantillon biologique de référence peut être de différentes natures, mais il est de préférence de nature identique, ou au moins d'une nature proche, à la nature de l'échantillon biologique test. Par exemple, si l'échantillon biologique test est un échantillon de sang total, l'échantillon biologique de référence sera de préférence un 20 échantillon de sang total, ou éventuellement un échantillon de plasma ou de sérum. L'échantillon biologique de référence peut être une échantillon « naturel », c'est-à-dire provenant d'un individu dont le statut immunitaire est connu ou déterminé selon une méthode de référence (par exemple, par la méthode mHLA-DR). Il peut par exemple provenir d'un individu de statut immunitaire connu comme étant un statut 25 d'immunocompétence, un statut d'inflammation, ou un statut d'immunosuppression. De préférence, si l'échantillon biologique test provient d'un être humain, l'échantillon biologique de référence provient également d'un être humain. De manière encore plus préférée, l'échantillon biologique de référence provient du même individu que celui dont provient l'échantillon biologique test. L'échantillon biologique de référence peut 16 également être un échantillon « synthétique », c'est-à-dire un échantillon contenant une quantité calibrée d'au moins une des séquences SEQ ID NO :1 à 34. L'invention a préférentiellement pour objet un procédé pour déterminer le statut 5 immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel on détecte et/ou on quantifie l'expression d'au moins 2 séquences différentes choisies parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34. Les Listes 1 à 4 étant complémentaires entre elles, ces au moins deux séquences différentes sont 10 préférentiellement choisies dans deux listes différentes. L'invention a préférentiellement pour objet un procédé pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel on détecte et/ou on quantifie l'expression d'au moins 3 séquences différentes choisies parmi les 15 séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34. Ces au moins trois séquences différentes sont préférentiellement choisies dans deux listes différentes, de préférence encore dans trois listes différentes. 20 L'invention a préférentiellement pour objet un procédé pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel on détecte et/ou on quantifie l'expression d'au moins 4, au moins 5, au moins 6, au moins 7, au moins 8, au moins 9, au moins 10, au moins 11, au moins 12, au moins 13, au moins 14, au moins 15, au moins 16, au moins 17, au moins 18, au moins 19, au moins 20, au moins 21, au 25 moins 22, au moins 23, au moins 24, au moins 25, au moins 26, au moins 27, au moins 28, au moins 29, au moins 30, au moins 31, au moins 32, au moins 33, au moins 34 séquences différentes choisies parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34. Ces au moins 4, au moins 5, au moins 6, au moins 7, au 30 moins 8, au moins 9, au moins 10, au moins 11, au moins 12, au moins 13, au moins 14, 17 au moins 15, au moins 16, au moins 17, au moins 18, au moins 19, au moins 20, au moins 21, au moins 22, au moins 23, au moins 24, au moins 25, au moins 26, au moins 27, au moins 28, au moins 29, au moins 30, au moins 31, au moins 32, au moins 33, au moins 34 séquences différentes sont préférentiellement choisies dans deux listes 5 différentes, de préférence encore dans trois listes différentes, de manière encore plus préférée dans quatre listes différentes. Les HERV de SEQ ID NO : 1, 3 et 8 ont été identifiés à partir de deux stratégies différentes, tel que décrit dans les Exemples, et se retrouvent ainsi respectivement dans 10 deux Listes. Par ailleurs, les inventeurs ont attribué une note pour les différentes séquences de HERV, comme expliqué dans les Exemples 4 à 6. Dans l'Exemple 7, les HERV ont été classés par ordre d'importance. Aussi, de manière tout-à-fait préférée, l'invention a pour objet un procédé pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel on détecte et/ou on quantifie 15 l'expression d'au moins 1, au moins 2, au moins 3, au moins 4, au moins 5, au moins 6, au moins 7 séquences différentes choisies parmi les séquences identifiées en SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 3, 5E0 ID NO : 8, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, 5E0 ID NO : 13 et SEQ ID NO : 28, ou parmi les séquences qui présentent au moins 99%, au moins 99,1%, au moins 99,2%, au moins 99,3%, au moins 99.4%, au moins 99.5%, au moins 99.6%, au 20 moins 99.7%, au moins 99.8%, au moins 99.9% d'identité avec une des séquences SEQ ID NO : 1, 3, 8, 11, 12, 13 et 28. Les combinaisons préférées d'au moins 2 HERV correspondantes sont listées dans le Tableau 5 ci-dessous. Tableau 5 Nombre de HERV dans la combinaison Combinaisons préférées d'au moins 2 HERV 2 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11 18 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO: 8,SEQ ID NO : 11 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 3 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13 19 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO: 3,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 4 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO: 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO: 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 20 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 5 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13,SEQ ID NO : 28 6 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 13 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 28 21 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 1,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 28 SEQ ID NO : 3,SEQ ID NO : 8,SEQ ID NO : 11,SEQ ID NO : 12,SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 28 7 SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 8, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, SEQ ID NO : 13, SEQ ID NO : 28 Le procédé pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, selon un quelconque mode de réalisation, peut également comprendre une étape de détection et/ou de quantification de l'expression, dans 5 l'échantillon biologique test, d'au moins un, au moins 2, au moins 3, au moins 4, au moins 5, au moins 6, au moins 7, au moins 8, au moins 9, au moins 10, au moins 11, au moins 12, au moins 13, au moins 14, au moins 15, au moins 16, au moins 17, au moins 18, au moins 19, au moins 20, au moins 21, au moins 22, au moins 23, au moins 24, au moins 25, au moins 26, au moins 27, au moins 28, au moins 29, au moins 30, au moins 10 31, au moins 32, au moins 33, au moins 34, au moins 35, au moins 36, au moins 37, au moins 38, au moins 39, au moins 40, au moins 41, au moins 42, au moins 43, au moins 44, au moins 45, au moins 46, au moins 47, au moins 48, au moins 49, au moins 50, au moins 51, au moins 52, au moins 53, au moins 54, au moins 55, au moins 56, au moins 57, au moins 58, au moins 59, au moins 60, au moins 61, au moins 62, au moins 63, au 15 moins 64, au moins 65, au moins 66, au moins 67, au moins 68, au moins 69, au moins 70, au moins 71, au moins 72, au moins 73, au moins 74, au moins 75, au moins 76, au moins 77, au moins 78, au moins 79, au moins 80, au moins 81, au moins 82, au moins 83, au moins 84, au moins 85, au moins 86, au moins 87, au moins 88, au moins 89, au moins 90, au moins 91, au moins 92, au moins 93, au moins 94, au moins 95 gène(s) 20 choisi(s) parmi les gènes suivants : CD74, CX3CR1, IL-10, S100A8, S100A9, MERTK, CLEC7A, CD36, TIMP2, CCL13, PTGS2, IL-12B, IL-6, IL-1A, CCL20, MX1, OAS-1, CCL15, OAS-3, EIF2AK2, IFNy, NEFH, MMP10, SERPINB2, THBD, STAT1, CCR4, HLA-DRB1/B3, TCF7, MMES, BCL11B, ITGA7, IL-18R1, NLRC4, CYP1B1, HGF, IL-5RA, CCL5, CD3G, DPP4, CD4OLG, CD3D, CD127, ICOS, IL-1R2, 22 IL-1RN, IL-18, IL-18RAP, OX40L, PD-1, PD-L1, Zonulin (HP), BTLA, C3AR1, CD154, GMCSF, IFIH1, IL-15, MCP1, PCSK9, STAT4, LTR82B, CIITA, LILRB2, CD177, ADGRE3, FLT-1, CD64, TREM-1, TNF-a, 1L-113, ALOX5, IL-17A, NFKB, TBX21, HIF1a, RORgT, OAS-2, GNLY, CTLA-4, TIM 3, CD274, IL-2, IL-7R, GATA3, CXCL10, FAS, GSN, MDC1, DYRK2, TDRD9, 5 CNB1IP1, ZAP70 et ARL14EP. De préférence, l'invention a pour objet un procédé pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel l'expression est détectée et/ou quantifiée au niveau transcrit ARN ou ARN messager (ARNm). La 10 détection et/ou la quantification au niveau transcrit ARN ou ARNm peut être réalisée par tout moyen connu de l'homme du métier. En particulier, on peut citer à titre d'exemples : - des méthodes d'hybridation, de préférence avec une puce d'hybridation, par hybridation in situ ou par Northern blot ; 15 - des méthodes d'amplification, de préférence par RT-PCR (« Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction »), de préférence encore par RT-qPCR (RT-PCR quantitative). On peut citer en particulier la PCR emboîtée (ou PCR nichée, « nested PCR »). Les réactions de PCR peuvent également être multiplexées ; 20 - des méthodes de séquençage, de préférence par séquençage haut débit De préférence, l'invention a pour objet un procédé pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel le statut 25 immunitaire est déterminé comme étant un statut d'immunosuppression (ou statut d'immunodépression ou d'immunodéficience ou statut immunitaire hypoactif ou paralysie immunitaire), un statut immunitaire normal (ou statut d'immunocompétence), ou un statut d'inflammation (ou statut immunitaire hyperactif). Le statut d'inflammation inclut le statut d'hyper-inflammation. 30 23 De préférence, l'invention a pour objet un procédé pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel l'individu est un patient admis au sein d'une structure médicale, de préférence en unité de soins intensifs, aux urgences ou en réanimation. De préférence également, l'individu est un 5 patient atteint de traumatismes, un patient atteint de brûlures, un patient ayant reçu une chirurgie ou un patient en état septique, de préférence un patient atteint de choc septique. De manière encore plus préférée, l'échantillon biologique test provient d'un prélèvement obtenu dans les 10 jours, de préférence dans les 9 jours, de préférence dans les 8 jours, de préférence dans les 7 jours, de préférence dans les 6 jours, de 10 préférence dans les 5 jours, de préférence dans les 4 jours, de préférence dans les 3 jours, de préférence dans les 2 jours, de préférence dans les 24 heures, suivant l'admission au sein de la structure médicale. Préférentiellement, l'invention a pour objet un procédé pour déterminer le statut 15 immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel l'échantillon biologique de référence est un échantillon biologique issu d'un individu sain, de préférence un échantillon biologique issu du même individu dont est issu l'échantillon biologique test mais prélevé avant l'infection ou l'agression, ou un échantillon biologique d'un individu de statut immunitaire connu, de préférence avec un statut 20 d'inflammation, un statut immunitaire normal, ou un statut d'immunosuppression. De préférence, l'échantillon biologique test et/ou l'échantillon biologique de référence, tel qu'utilisé dans le procédé pour déterminer le statut immunitaire d'un individu, selon l'invention, tel que décrit précédemment, est un échantillon de sang, de préférence un 25 échantillon de sang total, de plasma ou de sérum, ou un échantillon de cellules mononucléées sanguines périphériques, extraites à partir d'un échantillon de sang. De préférence, le procédé pour déterminer le statut immunitaire selon l'invention, tel que décrit précédemment, comprend une étape d'administration d'un traitement, de 30 préférence un traitement immunomodulateur, adapté au statut immunitaire de 24 l'individu. De manière préférée, le traitement immunomodulateur est un traitement immunostimulant, s'il est déterminé que l'individu a un statut d'immunosuppression, ou un traitement anti-inflammatoire, s'il est déterminé que l'individu a un statut d'inflammation. Parmi les traitements immunostimulants qui peuvent être 5 sélectionnés, on peut citer à titre d'exemple le groupe des interleukines, en particulier IL-7, IL-15 ou IL-3, des facteurs de croissance, en particulier le GM-CSF, des interférons, en particulier IFN7, des Toll agonistes, des anticorps, en particulier des anticorps antiPD1, a nti-PDL1, anti-LAG3, anti-TI M3, anti-IL-10 ou a nti-CTLA4, des transferrines et des molécules inhibitrices de l'apoptose, FLT3L, Thymosin al, des antagonistes 10 adrénergiques. Parmi les traitements anti-inflammatoires, on peut citer notamment le groupe des glucocorticoïdes, des agents cytostatiques, des molécules agissant sur les immunophilines et les cytokines, des molécules bloquant le récepteur à l'IL-1 et des traitements anti-TNF. 15 La présente invention a également pour objet l'utilisation d'au moins une, au moins 2, au moins 3, au moins 4, au moins 5, au moins 6, au moins 7, au moins 8, au moins 9, au moins 10, au moins 11, au moins 12, au moins 13, au moins 14, au moins 15, au moins 16, au moins 17, au moins 18, au moins 19, au moins 20, au moins 21, au moins 22, au moins 23, au moins 24, au moins 25, au moins 26, au moins 27, au moins 28, au moins 20 29, au moins 30, au moins 31, au moins 32, au moins 33, au moins 34 séquence(s) choisie(s) parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, telles qu'apparaissant dans les Listes 1 à 4, ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient. 25 La présente invention a également pour objet un procédé pour identifier ou sélectionner un traitement, de préférence un traitement immunomodulateur, plus particulièrement un traitement immunostimulant ou un traitement anti-inflammatoire, adapté pour traiter un individu, de préférence un patient, comprenant les étapes 30 suivantes : 25 a. On détermine le statut immunitaire dudit individu par un procédé tel que décrit précédemment b. On identifie un traitement adapté à partir du statut immunitaire déterminé à l'étape a) 5 De manière préférée, le traitement immunomodulateur est un traitement immunostimulant, s'il est déterminé que l'individu a un statut d'immunosuppression, ou un traitement anti-inflammatoire, s'il est déterminé que l'individu a un statut d'inflammation. 10 La présente invention a encore pour objet un procédé pour évaluer l'efficacité d'un traitement, de préférence un traitement immunomodulateur, plus particulièrement un traitement immunostimulant ou un traitement anti-inflammatoire, sur un individu, de préférence un patient, comprenant les étapes suivantes : 15 a. On détecte et/ou on quantifie l'expression d'au moins une partie d'une séquence choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, dans un premier échantillon biologique dudit individu, prélevé avant le traitement, et dans un deuxième 20 échantillon biologique dudit individu, prélevé après le traitement b. On compare l'expression obtenue pour les 2 échantillons biologiques à l'étape a) c. On évalue l'efficacité du traitement à partir de la comparaison de l'étape b) 25 Un autre objet de la présente invention concerne une amorce d'amplification comprenant, ou consistant en, une séquence nucléotidique complémentaire d'au moins une partie d'une séquence choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, et les 30 séquences complémentaires de ces séquences. De préférence, l'amorce 26 d'amplification selon l'invention est choisie parmi les amorces présentées dans le Tableau 6. Tableau 6 SEQ ID NO Amorce # Séquence nucléotidique 1A TGTACAAAACTCAAATGGTCTTC 36 1B ATGACCAACTTAGATTTCCTTGA 37 2A GCCAGAGAGGCATAATGAAGCA 38 2B GATTCTAAGCCTCCCCCTCATTT 39 3A TGGCTCATAGGGATTCCAGACT 3B AGCAAGTTGTCAAGAGCCAATCT 41 4A CACTCTAGGAATCTTAGGCA 42 4B TGAAACCAATAGTCCAGTG 43 SA TTCTACTGTTCACTGCTATCCTCC 44 SB CCTGTGGCAGCTTTTTGAAGTAA 6A AGAGCAGAAGAAGATGGATACT 46 6B CATGAGCTGACATCATCCAAT 47 7A TCTGTACTGGTTGCCCCAAC 48 7B CGTGCCAGGCCTCTAATACTTTT 49 8A AGGGAAGACCCCAAGATGATG 8B CATGCAAAGTCCAACGAGAGG 51 9A GGGTGGCTGCATCCTATGG 52 9B CTGGTCAGGAAAAAATTTGCCTTC 53 10A ACATGACATTGTCTGAACTTTGGG 54 10B TAGGACCATGCAGATACTAGTGAC 11A GAACTCCACAAACCTTGA 56 11B GCTAGAAGCTTTGGATATCT 57 12A TGGCTGTTACAACTTTCATG 58 12B TCTCCCTATTCTGAGCACA 5 La présente invention concerne également un couple d'amorces d'amplification, consistant en deux amorces d'amplification choisies parmi les amorces telles que décrites précédemment, et permettant d'amplifier, de préférence permettant d'amplifier spécifiquement, au moins une partie d'une séquence choisie parmi les 10 séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, et les séquences complémentaires de ces séquences. De préférence, le couple d'amorces 27 d'amplification selon l'invention est choisi parmi les couples d'amorces présentés dans le Tableau 7. Tableau 7 Couple d'amorces te Amorces 14 1 Forward : Amorce #1A Reverse : Amorce #1B 2 Forward : Amorce #2A Reverse : Amorce #2B 3 Forward : Amorce #3A Reverse : Amorce #3B 4 Forward : Amorce #4A Reverse : Amorce #4B 5 Forward : Amorce #5A Reverse : Amorce #5B 6 Forward : Amorce #6A Reverse : Amorce #6B 7 Forward : Amorce #7A Reverse : Amorce #7B 8 Forward : Amorce USA Reverse : Amorce #8B 9 Forward : Amorce #9A Reverse : Amorce #9B 10 Forward Amorce #10A Reverse : Amorce #10B 11 Forward : Amorce #11A Reverse : Amorce #11B 12 Forward : Amorce #12A Reverse : Amorce #12B Un autre objet de la présente invention concerne une sonde d'hybridation, dont la séquence nucléotidique comprend, ou consiste en, une séquence nucléotidique 28 complémentaire d'au moins une partie d'une séquence choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, et les séquences complémentaires de ces séquences. De préférence, la sonde d'hybridation selon 5 l'invention est choisie parmi les sondes d'hybridation présentées dans le Tableau 8. Tableau 8 SEQ ID NO Sonde # Nom de la sonde de la puce HERV-V3 Séquence nucléotidique 59 1A 190665001-HERV0376uLat1 ATGACCAACTTAGATTTCCTTGAGT 1B 190665001-HERV0376uLat2 GTCAAGGGTAAAGCTGTGAAAGTTT 61 1C 190665001-HERV0376uLat3 GGAAGACCATTTGAGTTTTGTACAC 62 1A' 190665001-HERV0376uLst1 ACTCAAGGAAATCTAAGTTGGTCAT 63 1B' 190665001-HERV0376uLst2 AAACTTTCACAGCTTTACCCTTGAC 64 1C' 190665001-HERV0376uLst3 GTGTACAAAACTCAAATGGTCTTCC 1D 190665002-HERV0376uLat1 GAAGATATGGGCCAGAACTTGTATA 66 1E 190665002-HERV0376uLat2 CAGGACCTGAGTTAAGCCAAGAATA 67 1F 190665002-HERV0376uLat3 ACCTGAGTTAAGCCAAGAATACAGT 68 1D' 190665002-HERV0376uLst1 TATACAAGTTCTGGCCCATATCTTC 69 1E' 190665002-HERV0376uLst2 TATTCTTGGCTTAACTCAGGTCCTG 1F' 190665002-HERV0376uLst3 ACTGTATTCTTGGCTTAACTCAGGT 71 2A 220247002-HERV0797uLat1 GTAAGATTCTAAGCCTCCCCCTCAT 72 2B 220247002-HERV0797uLat2 GATTCTAAGCCTCCCCCTCATTTAA 73 2C 220247002-HERV0797uLat3 CTAAGCCTCCCCCTCATTTAAAGGA 74 2A' 220247002-HERV0797uLst1 ATGAGGGGGAGGCTTAGAATCTTAC 2B' 220247002-HERV0797uLst2 TTAAATGAGGGGGAGGCTTAGAATC 76 2C' 220247002-HERV0797uLst3 TCCTTTAAATGAGGGGGAGGCTTAG 77 3A 170369402HE41env_at1 ATGGCTCATAGGGATTCCAGACTCC 29 78 3B 170369402HE41env_at2 GGCTCATAGGGATTCCAGACTCCCA 79 3C 170369402HE41env_at3 CTCATAGGGATTCCAGACTCCCATT 3A' 170369402HE41envst1 GGAGTCTGGAATCCCTATGAGCCAT 81 3B' 170369402H[41envst2 TGGGAGTCTGGAATCCCTATGAGCC 82 3C' 170369402HE41envst3 AATGGGAGTCTGGAATCCCTATGAG 83 4A 121601801-H ERV0492uLat1 TGAAACCAATAGTCCAGTGGTGGCC 84 4B 121601801-H E RV0492 u La t 2 TTCCAGTGATTTAGATAAAATCCCT 4C 121601801-H E RV0492 u La t 3 TTTCTGCCTAAGATTCCTAGAGTGC 86 4A' 121601801-H E RV0492 u Lst 1 GGCCACCACTGGACTATTGGTTTCA 87 4B' 121601801-H ERV0492uLst2 AGGGATTTTATCTAAATCACTGGAA 88 4C' 121601801-H ERV0492uLst3 GCACTCTAGGAATCTTAGGCAGAAA 89 SA 011052702- CTGTGGCAGCTTTTTGAAGTAAGGA MALR1044uLat1 SB 011052702- ATGGTTAGTGCAGAGTAAAGTTTGG MALR1044uLat2 91 SC 011052702- AGGATAGCAGTGAACAGTAGAATGG MALR1044uLat3 92 SA' 011052702-MALR1044u Lst1 TCCTTACTTCAAAAAGCTGCCACAG 93 SB' 011052702-MALR1044u Lst2 CCAAACTTTACTCTGCACTAACCAT 94 SC' 011052702-MALR1044u Lst3 CCATTCTACTGTTCACTGCTATCCT 6A 011052202-H E RV1033 u Lat 1 AGATCCAACATGAGCTGACATCATC 96 6A' 011052202-H E RV1033 u Lst 1 G ATGATGTCAGCTCATGTTG G ATCT 97 7A 130360601-H ERV0808cL at1 GAGGTTGGGGCAACCAGTACAGATT 98 7A' 130360601-H E RV0808cL_st 1 AATCTGTACTGGTTGCCCCAACCTC 99 8A 141107102- CCCCAAGATGATGGACTCTGGTGAT MALR1019uLat1 8B 141107102- CACTGCCATCACTTTGGGAAAGACT MALR1019uL_at2 101 8C 141107102- MALR1019uLat3 AAGCAGCCTCTCGTTGGAC I I I GCA 102 8A' 141107102-MALR1019u Lst1 ATCACCAGAGTCCATCATCTTGGGG 103 8B' 141107102-MALR1019u L_st2 AGTCTTTCCCAAAGTGATGGCAGTG 30 104 8C' 141107102-MA LR1019 u Lst3 TGCAAAGTCCAACGAGAGGCTGCTT 9A 021460102-H E RV0599 uLat 1 GAGGGCAGTTTGGAACAGTTGGAAC 106 9B 021460102-H E RV0599 u Lat 2 TGAGAGACGATTATCTG G AAGAAG A 107 9C 021460102-H E RV0599 u Lat 3 TCACAGCTTGAGAATGTGGTAG GAG 108 9D 021460102-H E RV0599 uLat4 GGAATGGGGGGCATGGAATTAAAGC 109 9A' 021460102-H E RV0599 u Lst1 GTTCCAACTGTTCCAAACTGCCCTC 9W 021460102-H E RV0599 u Lst2 TCTTCTTCCAGATAATCGTCTCTCA 111 9C' 021460102-H E RV0599 u Lst3 CTCCTACCACATTCTCAAG CTGTG A 112 9D' 021460102-H E RV0599 u Lst4 G CTTTAATTCCATGCCCCCCATTCC 113 10A 021456001- AGTCCCTAACTGTCTGCAAACCCAC MALR1017u Lat1 114 10B 021456001- ACTGTCTGCAAACCCACAATGGACC MALR1017u Lat2 10C 021456001- CAATGGACCTGTTGCATGTGTAAGA MALR1017u Lat3 116 10A' 021456001-MA LR1017 u L st1 GTGGGTTTGCAGACAGTTAGGGACT 117 10B' 021456001-MA LR1017 u Lst2 GGTCCATTGTGGGTTTGCAGACAGT 118 10C' 021456001-MA LR1017 u Lst3 TCTTACACATGCAACAGGTCCATTG 119 11A 050286701-H ERV0513 u Lat 1 CTGCATCCTATGGTGTTTCTACATG 11B 050286701-H ERV0513 uLat2 ATAATC 1111 CCGGCATGTTGGTAT 121 11C 050286701-H ERV0513 u Lat 3 TAAAGATAGTGTTTCCTATTGTGTC 122 11A' 050286701-H E RV0513 u Lst 1 CATGTAGAAACACCATAG G ATG CAG 123 11B' 050286701-H ERV0513uL st2 ATACCAACATGCCGGAAAAGATTAT 124 11C' 050286701-H E RV0513 u Lst3 G ACACAATAGG AAACACTATCTTTA 12A 050287402- ACAGAGACTGCAAGAGTAATGACAT MALR1022u Lat1 126 12B 050287402- TCTG AACTTTG G GAAACAATTATGT MALR1022u Lat2 127 12C 050287402- ACTTTCCAGTTAATCGAATCAATCC MALR1022uL_at3 128 12D 050287402- TTTTAACCTAGACTAGTTCCAACTG MALR1022u Lat4 129 12E 050287402- GTCACTAGTATCTGCATGGTCCTAA MALR1022u Lat5 31 12A' 050287402-MALR1022uL st1 ATGTCATTACTCTTGCAGTCTCTGT 131 12W 050287402-MALR1022uL st2 ACATAATTGTTTCCCAAAGTTCAGA 132 12C' 050287402-MALR1022uL st3 GGATTGATTCGATTAACTGGAAAGT 133 12D' 050287402-MALR1022uL st4 CAGTTGGAACTAGTCTAGGTTAAAA 134 12E' 050287402-MA LR1022 u L st5 TTAG G ACCATG CAGATACTAGTG AC 13A 052182701- TTATTCCAGTCACCTCGAGTCATTC MALR1129uLat1 136 13B 052182701- TCATCCTAGCCGTCGTAGAGCAGAG MALR1129uL_at2 137 13C 052182701- TG CCCTTCTGACTCCTTGACAGTG G MALR1129uL_at3 138 13A' 052182701-MALR1129uL st1 GAATGACTCGAGGTGACTGGAATAA 139 13W 052182701-MALR1129uL st2 CTCTGCTCTACGACGGCTAGGATGA 13C' 052182701-MALR1129uL st3 CCACTGTCAAGGAGTCAGAAGGGCA 141 14A 190478501-MA LR1003 cL a t1 TAAGTGGGACCAAGACACAAACCAA 142 14B 190478501-MA LR1003 cL a t 3 ACCAAGACACAAACCAACATGCCTG 143 14A' 190478501-MALR1003cL st1 TTGGTTTGTGTCTTGGTCCCACTTA 144 14B' 190478501-MALR1003cL st3 CAGGCATGTTGGTTTGTGTCTTGGT 15A 011790601E RV9s LU 5 p_at1 CTGAG GTCCATG G CTTCTTTCCTTG 146 15A' 011790601E RV9s LU5 p_st1 CAAGG AAAGAAG CCATG G ACCTCAG 147 16A 052681601- MALR10t8uL_att CC I I I GTTTTCCTACTGACAGGTCC 148 16B 052681601- TTCAAAATATTTAACTCTCCAGGCT MALR1018 u L_at2 149 16C 052681601- G AGGTCACATGACTCTGTTGTGGAC MALR1018 u L_at3 16A' 052681601-MALR1018uL st1 GGACCTGTCAGTAGGAAAACAAAGG 151 16B' 052681601-MALR1018uL st2 AGCCTGGAGAGTTAAATATTTTGAA 152 16C' 052681601-MALR1018uL st3 GTCCACAACAGAGTCATGTGACCTC 153 17A 160627301- CAG CTG AGATCCGTTGACGCCAG CC MALR1014uLat1 154 17B 160627301- TCCGACATGTG G GTGAACTCAGCCA MALR1014 u L_at2 32 17C 160627301- TTCTCAGCCATGTGTTTTGTGAACT MALR1014uLat3 156 17A' 160627301-MALR1014uL st1 GGCTGGCGTCAACGGATCTCAGCTG 157 17W 160627301-MALR1014uL st2 TGGCTGAGTTCACCCACATGTCGGA 158 17C' 160627301-MALR1014uL st3 AGTTCACAAAACACATGGCTGAGAA 159 18A 111686702-H ERV0861uL at1 TTGAGGCAGGACAGAACCAGGCTCC 18B 111686702-H ERV0861uL at2 GGACAGAACCAGGCTCCTGTTAGTC 161 18C 111686702-H ERV0861uL at3 AGTTTACTGAGCAGTGACTTTGTGT 162 18A' 111686702-H ERV0861uL st1 GGAGCCTGGTTCTGTCCTGCCTCAA 163 18B' 111686702-H ERV0861uL st2 GACTAACAGGAGCCTGGTTCTGTCC 164 18C' 111686702-H E RV0861uL st3 ACACAAAGTCACTGCTCAGTAAACT 19A 040318302- ATAGGGATGATCCTGCACGAATGGC MALR1134uLat1 166 19B 040318302- GGATGATCCTGCACGAATGGCATGG MALR1134uL_at2 167 19A' 040318302-MALR1134uL st1 GCCATTCGTGCAGGATCATCCCTAT 168 19B' 040318302-MALR1134uL st2 CCATGCCATTCGTGCAGGATCATCC 169 20A 041529101- MALR1026uLat1 AGTGGACAC 1111 TAGGATGTCTGC 20B 041529101- GCCCTGACATAAGAGTTTGCCAGTT MALR1026uLat2 171 20C 041529101- CCTGTACCCACCTTTCACCAGAGCT MALR1O26uL_at3 172 20A' 041529101-MALR1026uL st1 GCAGACATCCTAAAAAGTGTCCACT 173 20W 041529101-MALR1026uL st2 AACTGGCAAACTCTTATGTCAGGGC 174 20C' 041529101-MALR1O26uL st3 AGCTCTGGTGAAAGGTGGGTACAGG 21A 141106902- AATTGTTGGAATTTGAAAGTGGGGT MALR1133uLat1 176 21A' 141106902-MALR1133u L stl ACCCCACTTTCAAATTCCAACAATT 177 22A 060281701- GTCAGCACCGTGCTTCTCTAACTTT MALR1043uLat1 178 22B 060281701- MALR1043uLat2 GCACCGTGCTTCTCTAAC I I I CCAC 179 22C 060281701- CGTGCTTCTCTAACTTTCCACCTGC MALR1043uLat3 33 22A' 060281701-MALR1043uL st1 AAAGTTAGAGAAGCACGGTGCTGAC 181 22W 060281701-MALR1043uL st2 GTGGAAAGTTAGAGAAGCACGGTGC 182 22C' 060281701-MALR1043uL st3 GCAGGTGGAAAGTTAGAGAAGCACG 183 23A 043166601- CAGCCTCGCACCTAAGAACGCCGTG MALR1018uLat1 184 23B 043166601- CAGTGAG AAATCTG CTG GG GATG CC MALR1018 u Lat2 23C 043166601- G AAAG G GACATACCTGG CAG GTG CC MALR1018 u Lat3 186 23A' 043166601-MALR1018uL st1 CACGGCGTTCTTAGGTGCGAGGCTG 187 23B' 043166601-MALR1018uL st2 GGCATCCCCAGCAGATTTCTCACTG 188 23C' 043166601-MALR1018uL st3 GGCACCTGCCAGGTATGTCCCTTTC 189 24A 100090601-H ERV0429uL at 1 G GTAG AGACCGAG GCG G ATATACAG 24B 100090601-H ERV0429uL at3 GAGACCGAGGCGGATATACAGGCCT 191 24A' 100090601-H ERV0429uL st1 CTGTATATCCGCCTCGGTCTCTACC 192 24B' 100090601-H ERV0429uL st3 AG GCCTGTATATCCGCCTCG GTCTC 193 25A 061529601-H ERV0492uL at 1 TATACTGG GG CCCAATTCTACAG AC 194 25B 061529601-H ERV0492uL at 2 CAGACATTACTTCTTTG CCAGTTG G 25C 061529601-H ERV0492uL at3 GACACATTGCAAGTCTGGAAGAGGA 196 25A' 061529601-H ERV0492uL st1 GTCTGTAGAATTG G G CCCCAGTATA 197 25W 061529601-H ERV0492uL st2 CCAACTG G CAAAGAAGTAATGTCTG 198 25C' 061529601-H ERV0492uL st3 TCCTCTTCCAGACTTGCAATGTGTC 199 26A 100871501-MALR1020cL a t1 CATGATCCTGGGTGAAGCCATGTGT 26B 100871501-MALR1020cL a t2 TGTGTCTGAGGATGAAAGGGGATGC 201 26C 100871501-MALR1020cL at3 CAGATTGATGTGACATGTGGCACCT 202 26A' 100871501-MALR1020cL st1 ACACATGGCTTCACCCAGGATCATG 203 26W 100871501-MA LR1020cL st2 G CATCCCCTTTCATCCTCAGACACA 204 26C' 100871501-MA LR1020cL st3 AG GTG CCACATGTCACATCAATCTG 27A 170842002- AGAG G GAG CACG GTCCCAGTACACC MALR1003 uLat1 34 206 27B 170842002- CACGGTCCCAGTACACCTTGAGTGT MALR1003 u L_at2 207 27C 170842002- TGTTACG G CTGTCCCAGGAAAGGAA MALR1003 u L_at3 208 27A' 170842002-MA LR1003 u L st 1 G GTGTACTGG GACCGTGCTCCCTCT 209 27W 170842002-MA LR1003 u L st2 ACACTCAAG GTGTACTG G G ACCGTG 27C' 170842002-MA LR1003 u L st3 TTCCTTTCCTG G G ACAG CCGTAACA 211 28A 081921103-H E RV0958 ul a t1 ACTAAGAGCAACAGCCTGAGGCTAA 212 28B 081921103-H E RV0958 ul a t2 GGCTCACCGGAAACAGGCTGAATGT 213 28C 081921103-H E RV0958 ul at3 G AGACACCAG ATGACCGCTTGGTCT 214 28D 081921103-H E RV0958 ul a t4 CAGCTTCCCTAGAATTATACACCAG 28E 081921103-H F RV0958 u I a t5 TACTGAACAGGTTACTTCAACTTGC 216 28F 081921103-H E RV0958 ul a t6 TTGTAAAAATATAAACGTGAGGCAA 217 28A' 081921103-H E RV0958 ul st 1 TTAGCCTCAGGCTGTTG CTCTTAGT 218 28W 081921103-H E RV0958 ul st2 ACATTCAGCCTGTTTCCGGTGAGCC 219 28C' 081921103-H E RV0958 ul st3 AGACCAAGCG GTCATCTGGTGTCTC 28D' 081921103-H E RV0958 ul st4 CTG GTGTATAATTCTAG G GAAG CTG 221 28E' 081921103-H E RV0958 ul st5 G CAAGTTGAAGTAACCTGTTCAGTA 222 28F' 081921103-H F RV0958 ul st6 TTGCCTCACGTTTATA I I 111 ACAA 223 28G 081921101-H E RV0958 ul a t1 G ATGACAGTTAAGACCCTAGGTTGC 224 28H 081921101-H E RV0958 ul a t2 CAATCTCAAGTCTGATGACTTGTTA 281 081921101-H E RV0958 ul at3 AGACCCATCATTGCTAGCAGACTAT 226 28J 081921101-H E RV0958 ul a t4 AAGGATGGGAAATGCTCAGGTCACG 227 28K 081921101-H E RV0958 ul a t5 AGGGCTCATCCACTAACCCCCTGAA 228 28L 081921101-H E RV0958 ul a t6 G AAATGGATACCCTTGGGTTCAACT 229 28G' 081921101-H F RV0958 ul st1 GCAACCTAGGGTCTTAACTGTCATC 28H' 081921101-H E RV0958 ul st2 TAACAAGTCATCAGACTTGAGATTG 231 281' 081921101-H E RV0958 ul st3 ATAGTCTGCTAGCAATGATGGGTCT 232 28J' 081921101-H E RV0958 ul st4 CGTGACCTGAGCATTTCCCATCCTT 35 233 28K' 081921101-H ERV0958u1 st5 TTCAGGGGGTTAGTGGATGAGCCCT 234 28L' 081921101-H E RV0958 ul st6 AGTTG AACCCAAG G GTATCCATTTC 28M 081921102-H ERV0958u1 a t1 GTGCCATAACGACAATTAAATTTTT 236 28N 081921102-H E RV0958 ul at2 AGTCTYTTGTTATCTATGGAGGACT 237 280 081921102-H E RV0958 ul at3 GTTGTGTTAAAGTTTCTAATTACG 238 28P 081921102-H E RV0958 ul a t4 GTAACTTTGGGACCAAAACAATGAA 239 280 081921102-H ERV0958u1 a t5 TCATAAGCCTACTAATCCGGGATCA 28R 081921102-H ERV0958u1 a t6 GGGACAAGAACTAATTCCACAGGAG 241 28M' 081921102-H E RV0958 ul stl AAAAATTTAATTGTCGTTATG G CAC 242 28N' 081921102-H E RV0958 ul st2 AGTCCTCCATAGATAACAAAAGACT 243 280' 081921102-H E RV0958 ul st3 ACGTAATTAGAAACTTTAACACAAC 244 28V 081921102-H E RV0958 ul st4 TTCATTGTTTTGGTCCCAAAGTTAC 28Q 081921102-H ERV0958u1 st5 TGATCCCGGATTAGTAGGCTTATGA 246 28R' 081921102-H ERV0958u1 st6 CTCCTGTGGAATTAGTTCTTGTCCC 247 29A 032622601M R41sLU5p_at1 GCCCTTTCTTGAGGTCTGGGTCTGC 248 29A' 032622601M R41sLU5p_stl GCAGACCCAGACCTCAAGAAAGGGC 249 30A 220246901-H ERV0889uL at 1 AG GCTGTAACCCCCCTTAAACTGCC 30B 220246901-H ERV0889uL at2 CAACTATG GG G AACTTAACTG GAGT 251 30C 220246901-H ERV0889uL at3 G GAGTCGTTTCAG ATGG GTGCTTAC 252 30A' 220246901-H ERV0889uL st1 GGCAGTTTAAGGGGGGTTACAGCC 253 30W 220246901-H ERV0889uL st2 ACTCCAGTTAAGTTCCCCATAGTTG 254 30C' 220246901-H ERV0889uL st3 GTAAGCACCCATCTGAAACGACTCC 31A 061827101-H ERV0856uL at 1 G AAGAGTTTCAG CCCTTCAGACAAC 256 31B 061827101-H ERV0856uL at2 GATCCAGGTTTGTCACGCAAGCTGA 257 31C 061827101-H E RV0856 uL at3 CCGAGTGGGCACATCAAGCACAGTG 258 31A' 061827101-H ERV0856uL st 1 GTTGTCTGAAGGGCTGAAACTCTTC 259 31W 061827101-H ERV0856uL st2 TCAGCTTGCGTGACAAACCTGGATC 31C' 061827101-H ERV0856uL st3 CACTGTG CTTG ATGTG CCCACTCG G 36 261 32A 170828901-HERV0770cL at1 CACAGGTCTTGCCGAGACCCCCACG 262 32B 170828901-HERV0770cL at2 CCACGGGCTCACTGTTCAGCTCATC 263 32C 170828901-HERV0770cL at3 GCTCTGTCACAGTTTCCCACGACTT 264 32A' 170828901-HERV0770cL st1 CGTGGGGGTCTCGGCAAGACCTGTG 32B' 170828901-HERV0770cL st2 GATGAGCTGAACAGTGAGCCCGTGG 266 32C' 170828901-HERV0770cL st3 AAGTCGTGGGAAACTGTGACAGAGC 267 33A 190148802- GGCCAAATTGTGCCACCCCTCCCAA MALR1127uLat1 268 33B 190148802- AATTCCCAGGACCTCCTAATATGGC MALR1127uL_at2 269 33C 190148802- GGTCGTTGTAGGCCCAGCACAGTGG MALR1127uL at3 33A' 190148802-MALR1127uL st1 TTGGGAGGGGTGGCACAATTTGGCC 271 33B' 190148802-MALR1127uL st2 GCCATATTAGGAGGTCCTGGGAATT 272 33C' 190148802-MALR1127uL st3 CCACTGTGCTGGGCCTACAACGACC 273 34A 120093401-HERV1034uL at1 CCTAGCCATGAGCCAATTCCTTGCA 274 34A' 120093401-HERV1034uL st1 TGCAAGGAATTGGCTCATGGCTAGG L'invention a encore pour objet l'utilisation d'au moins un, de préférence au moins 2, de préférence au moins 3, de préférence au moins 4, de préférence au moins 5, de 5 préférence au moins 6, de préférence au moins 7, de préférence au moins 8, de préférence au moins 9, de préférence au moins 10, de préférence au moins 11, de préférence au moins 12, de préférence au moins 13, de préférence au moins 14, de préférence au moins 15, de préférence au moins 16, de préférence au moins 17, de préférence au moins 18, de préférence au moins 19, de préférence au moins 20, de 10 préférence au moins 21, de préférence au moins 22, de préférence au moins 23, de préférence au moins 24, de préférence au moins 25, de préférence au moins 26, de préférence au moins 27, de préférence au moins 28, de préférence au moins 29, de préférence au moins 30, de préférence au moins 31, de préférence au moins 32, de 37 préférence au moins 33, de préférence au moins 34 couples d'amorces selon l'invention, tels que décrits précédemment, et/ou d'au moins une, de préférence au moins 2, de préférence au moins 3, de préférence au moins 4, de préférence au moins 5, de préférence au moins 6, de 5 préférence au moins 7, de préférence au moins 8, de préférence au moins 9, de préférence au moins 10, de préférence au moins 11, de préférence au moins 12, de préférence au moins 13, de préférence au moins 14, de préférence au moins 15, de préférence au moins 16, de préférence au moins 17, de préférence au moins 18, de préférence au moins 19, de préférence au moins 20, de préférence au moins 21, de 10 préférence au moins 22, de préférence au moins 23, de préférence au moins 24, de préférence au moins 25, de préférence au moins 26, de préférence au moins 27, de préférence au moins 28, de préférence au moins 29, de préférence au moins 30, de préférence au moins 31, de préférence au moins 32, de préférence au moins 33, de préférence au moins 34 sondes d'hybridation selon l'invention, tels que décrits 15 précédemment, pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient. L'invention a également pour objet un procédé pour déterminer in vitro ou ex vivo le 20 statut immunitaire d'un individu, tel que décrit précédemment, dans lequel on utilise au moins un, de préférence au moins 2, de préférence au moins 3, de préférence au moins 4, de préférence au moins 5, de préférence au moins 6, de préférence au moins 7, de préférence au moins 8, de préférence au moins 9, de préférence au moins 10, de préférence au moins 11, de préférence au moins 12, de préférence au moins 13, de 25 préférence au moins 14, de préférence au moins 15, de préférence au moins 16, de préférence au moins 17, de préférence au moins 18, de préférence au moins 19, de préférence au moins 20, de préférence au moins 21, de préférence au moins 22, de préférence au moins 23, de préférence au moins 24, de préférence au moins 25, de préférence au moins 26, de préférence au moins 27, de préférence au moins 28, de 30 préférence au moins 29, de préférence au moins 30, de préférence au moins 31, de 38 préférence au moins 32, de préférence au moins 33, de préférence au moins 34 couples d'amorces tels que décrits précédemment ; et/ou au moins une, de préférence au moins 2, de préférence au moins 3, de préférence au moins 4, de préférence au moins 5, de préférence au moins 6, de préférence au 5 moins 7, de préférence au moins 8, de préférence au moins 9, de préférence au moins 10, de préférence au moins 11, de préférence au moins 12, de préférence au moins 13, de préférence au moins 14, de préférence au moins 15, de préférence au moins 16, de préférence au moins 17, de préférence au moins 18, de préférence au moins 19, de préférence au moins 20, de préférence au moins 21, de préférence au moins 22, de 10 préférence au moins 23, de préférence au moins 24, de préférence au moins 25, de préférence au moins 26, de préférence au moins 27, de préférence au moins 28, de préférence au moins 29, de préférence au moins 30, de préférence au moins 31, de préférence au moins 32, de préférence au moins 33, de préférence au moins 34 sondes d'hybridation telles que décrites précédemment. 15 Un autre objet de l'invention est un kit comprenant des moyens d'amplification et/ou de détection d'au moins une, de préférence au moins 2, de préférence au moins 3, de préférence au moins 4, de préférence au moins 5, de préférence au moins 6, de préférence au moins 7, de préférence au moins 8, de préférence au moins 9, de 20 préférence au moins 10, de préférence au moins 11, de préférence au moins 12, de préférence au moins 13, de préférence au moins 14, de préférence au moins 15, de préférence au moins 16, de préférence au moins 17, de préférence au moins 18, de préférence au moins 19, de préférence au moins 20, de préférence au moins 21, de préférence au moins 22, de préférence au moins 23, de préférence au moins 24, de 25 préférence au moins 25, de préférence au moins 26, de préférence au moins 27, de préférence au moins 28, de préférence au moins 29, de préférence au moins 30, de préférence au moins 31, de préférence au moins 32, de préférence au moins 33, de préférence au moins 34 séquences choisies parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des 30 séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34. 39 De manière préférée, dans le kit selon l'invention : les moyens d'amplification comprennent, de préférence consistent en au moins un, de préférence au moins 2, de préférence au moins 3, de préférence au moins 4, de 5 préférence au moins 5, de préférence au moins 6, de préférence au moins 7, de préférence au moins 8, de préférence au moins 9, de préférence au moins 10, de préférence au moins 11, de préférence au moins 12, de préférence au moins 13, de préférence au moins 14, de préférence au moins 15, de préférence au moins 16, de préférence au moins 17, de préférence au moins 18, de préférence au moins 19, de 10 préférence au moins 20, de préférence au moins 21, de préférence au moins 22, de préférence au moins 23, de préférence au moins 24, de préférence au moins 25, de préférence au moins 26, de préférence au moins 27, de préférence au moins 28, de préférence au moins 29, de préférence au moins 30, de préférence au moins 31, de préférence au moins 32, de préférence au moins 33, de préférence au moins 34 couples 15 d'amorces tels que décrits précédemment ; et/ou les moyens de détection comprennent, de préférence consistent en, au moins une, de préférence au moins 2, de préférence au moins 3, de préférence au moins 4, de préférence au moins 5, de préférence au moins 6, de préférence au moins 7, de préférence au moins 8, de préférence au moins 9, de préférence au moins 10, de 20 préférence au moins 11, de préférence au moins 12, de préférence au moins 13, de préférence au moins 14, de préférence au moins 15, de préférence au moins 16, de préférence au moins 17, de préférence au moins 18, de préférence au moins 19, de préférence au moins 20, de préférence au moins 21, de préférence au moins 22, de préférence au moins 23, de préférence au moins 24, de préférence au moins 25, de 25 préférence au moins 26, de préférence au moins 27, de préférence au moins 28, de préférence au moins 29, de préférence au moins 30, de préférence au moins 31, de préférence au moins 32, de préférence au moins 33, de préférence au moins 34 sondes d'hybridation telles que décrites précédemment. 40 Préférentiellement encore, le kit selon la présente invention comprend en outre des moyens d'amplification et/ou de détection d'autres biomarqueurs, en particulier des biomarqueurs endogènes (ou loci), tels que d'autres HERV/MaLR et/ou des gènes, de préférence des gènes impliqués dans l'inflammation et/ou l'immunité, et/ou des gènes 5 de ménage, et/ou des biomarqueurs exogènes, tels que des virus. Parmi les gènes impliqués dans l'immunité, on peut notamment citer les gènes suivants, particulièrement d'intérêt : CD74, CX3CR1, IL-10, S100A8, S100A9, MERTK, CLEC7A, CD36, TIMP2, CCL13, PTGS2, IL-12B, IL-6, IL-1A, CCL20, MX1, OAS-1, CCL15, OAS-3, EIF2AK2, IFNy, NEFH, MMP10, 10 SERPINB2, THBD, STAT1, CCR4, HLA-DRB1/B3, TCF7, EOMES, BCL11B, ITGA7, IL-18R1, NLRC4, CYP1B1, HGF, IL-5RA, CCLS, CD3G, DPP4, CD4OLG, CD3D, CD127, ICOS IL-1R2, IL-1RN, IL-18, IL-18RAP, OX4OL, PD-1, PD-L1, Zonulin (HP), BTLA, C3AR1, CD154, GMCSF, IFIH1, IL-15, MCP1, PCSK9, STAT4, LTR82B CIITA, LILRB2, CD177, ADGRE3, FLT-1, CD64, TREM-1, TNF-a, IL-113, ALOX5, IL-17A, NFKB, TBX21, HIF1a, RORgT, OAS-2, GNLY, 15 CTLA-4, TIM 3, CD274, IL-2, IL-7R, GATA3, CXCL10, FAS, GSN, MDC1, DYRK2, TDRD9, CNB1IP1, ZAP70 et ARL14EP. De manière encore plus préférée, le kit selon la présente invention comprend des moyens d'amplification et/ou de détection d'au plus 100, de préférence au plus 90, de 20 préférence au plus 80, de préférence au plus 70, de préférence au plus 60, de préférence au plus 50, de préférence au plus 40, de préférence au plus 30, de préférence au plus 20, de préférence au plus 10 biomarqueurs, au total. La présente invention concerne également l'utilisation d'un kit tel que décrit 25 précédemment, pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient. Figures 41 Figure 1 : Pipeline d'analyse de la puce HERV-V3. Ce schéma représente les différentes étapes nécessaires à l'analyse des données de la puce HERV-V3. 5 Figure 2 : Les figures 2A et 2B représentent respectivement le niveau d'expression protéique et moléculaire (ARN,,,) de TNF-a et d'IL-10 produites par des PBMC, issues de 5 volontaires sains, stimulées par du LPS. Le dosage des protéines a été effectué par un test ELISA sur des surnageants de culture obtenus après réalisation du modèle de tolérance à l'endotoxine. Dans la figure 2A, l'axe des ordonnées représente les 10 concentrations protéiques (pg/mL) de TNF-a et d'IL-10. Dans la figure 2B, l'axe des ordonnées représente les niveaux d'expression de TNF-a et d'IL-10 (en ratio d'expression ou Fold Change (FC)). Les trois conditions sont représentées, NS pour les contrôles négatifs (sans stimulation), LPS pour les cellules stimulées une seule fois avec 100 ng/mL de LPS et ET pour les cellules soumises à deux stimulations par du LPS (2 15 ng/m L puis 100 ng/mL). Des tests appariés de Wilcoxon ont été réalisés pour l'analyse statistique des résultats : ***, signifie que la p-value 5 mg / kg de prednisolone équivalente pendant une durée> 5 5 jours) ou un traitement prolongé (0,5 mg / kg de prednisolone> 30 jours) de corticostéroïdes; - aplasie (neutrophiles circulants REVENDICATIONS1. Procédé pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient, comprenant une étape de détection et/Cu quantification de l'expression, dans un échantillon biologique dudit individu (ou échantillon biologique test), d'au moins une partie d'au moins une séquence de HERV/MaLR choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos :l 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, parmi les listes suivantes : Lis:te : r SEQ Il ID NO Il Localisation GRCh38 Nom du probeset correspondant de la puce HERV-V3 I .. chr1.9:54891074-54891496 190665001-HERV0376 a. -- --------------------------------------------------------- ----- ------------------------------------- L--------------- I chr22:36153696-36154283 220247002-HERV0797 Il 1 3 chr17:35505737 35508365 17036940211E41e0v Il 4 chr12:112971073-112971451 121601801-HERV0492 L5._______ _chrl.:78648318-78648697 011052702 MALR1044 1 6 chr1:78623489-78623954 011052202-HERV1033 i------------- ---- ------ --- - -- - -- --------- - ------- - -- --- 7 ch r1342884951-42886257 130360601-HERV0808 i------------- ------------------------------ ----- ----------------------- ------------------------------------- ----- ------ 8 chr1491230494-91230820 141107102-MALR1019 9 chr2:102363654-102366601 021460102-HERV0599uL I 10 chr2:102013616-102013971 821.456001-MALR10/7ut L--------------- -- ---:------------------------------------------------------ ----- ------------------------------------- 11 chr5.14551189-14551685 050286701-HERV0513 12 chr5:14562791.-14563322 050287402-MALR1022 - Liste 2 : SEQ ID NO Localisation GRCh38 Nom du probeset correspondant de la puce HERV-V3 1 13 chr5:132453630-132454148 052182701-MALR1129 il 14 chr19:41812466-41813010 190478501-MALR1003 I 15_ chr1:155637287-155637547 011790601ERV9sW5 16 chr5170290289-170290812 052681601-MAL81018 Il 17 chr16.50662453-50662912 160627301-IVIALR1014 i1-1"----1 -111-111-111-1--11 ----- 11-1711-111-111-11-111-111-111-111-1--11 ----- 11- I 18 chr11.122671887-122672147 111686702-HERV0861 8 chr14.91230494-91230820 141107102-MALR1019 67 68 - Liste 3 SEQ Localisation GRCh38 Nom du probeset correspondant de la 1 ID NO 1 puce HERV-V3 i---------------------------------------------- ----- ----------------------- - --------------------------------- ----- --- I 1 chr19.54891074-54891496 190665001-HERV0376 Il - chi-19:54891074-54891496 190665002-HERV0376 1 22 chr6:18403673-18404108 060281701-MALR1043 k--nj---------4-----------------: ------------------------------------------- ----- ---,--------------------------------- I 23 chr4:184850413-184850785 043166601-MALR1018 F-------------- -------------------------------------------------------------- ----- ------------------------------------- 1 24 chr1.0:5856198-5856795 100090601-HERV0429 Il 25 chr6:107800650-107801138 061529601-HERV0492 Il 26 chr10:60410534-60411224 chr17:78345106-78345577 100871501-MALR1020 27 ----- __. 170842002-MALR1003 - Liste 4: SEQ ID NO Localisation GRCh38 Nom du probeset correspondant de la puce HERV-V3 1 28 chr8:125945973-125951030 081921103-HERV0958 h----------- 1 29 ------------------------------- ----- ----------------------- chr3:167401329-167401866 ------------------------------------- ----- ----- 032622601MR41sW5p T---------------- 30 --------------------------------- ----- -------------------------------- chr22:36147793-36148208 ----------------------------------------- -- ------ 220246901-HERV0889 ,i2.. chr6.127790579-127792191 061827101-HERV0856 3 chr17:35505737-35508365 170369402HE4lenv F------------ -----------------:-------------------- --------------- --- - - - --- ---- 32 chr17:77462942-77463350 170828901-HERV0770 -- 1 28 chr8:125945973-125951030 081921101-HERV0958 28 chr8:125945973-125951030 081921102-HERV0958 33 chr19:14612123-14612747 chr12:9038254-9038598 190148802-MALR1127 1 34 120093401-HERV1034 2. Procédé selon la revendication 1, comprenant en outre les étapes suivantes - on compare l'expression dans l'échantillon biologique test, avec une expression de référence, ou avec l'expression dans un échantillon biologique de référence, puis on détermine le statut immunitaire dudit individu à partir de ladite comparaison. chr4:15325146-15825565 chr4:83464568-83464963 chr14:91222760-91223118 040318302-MALR1134 041529101-MALR1026 141106902-MALR1133 19 20 21 69 3. Procédé selon l'une des revendications 1 et 2, dans lequel l'expression est détectée et/ou quantifiée au niveau transcrit ARN ou ARNm. 4. Procédé selon la revendication 3, dans lequel l'expression est détectée et/ou quantifiée par une méthode d'hybridation, de préférence avec une puce d'hybridation, par hybridation in situ ou par Northern blot, par une méthode d'amplification, de préférence par RT-qPCR, ou par séquençage, de préférence par séquençage haut débit. 5. Procédé selon l'une des revendications 1 à 4, dans lequel l'individu est un patient atteint de traumatismes, un patient atteint de brûlures, un patient ayant reçu une chirurgie ou un patient en état septique, de préférence un patient de choc septique. 6. Procédé selon la revendication 5, dans lequel l'échantillon iologique test provient d'un prélèvement obtenu dans les 10 jours suivant l'admission au sein de la structure médicale. 7. Procédé selon l'une des revendications 2 à 6, dans lequel l'échantillon biologique de référence est un échantillon biologique issu d'un Individu sain, de préférence un échantillon biologique issu du même individu dont est issu l'échantillon biologique test mais prélevé avant l'infection ou l'agression, ou un échantillon biologique d'un individu de statut immunitaire connu, de préférence avec un statut d'inflammation, un statut immunitaire normal ou un statut d'immunosuppression. 8. Amorce d'amplification comprenant, ou consistant en, une séquence nucléctid que complémentaire d'au moins une partie d'une séquence choisie parmi les séquences identifiées en SEO. Nos 1 à 34 ou parmi les séquences qui 70 présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, et les séquences complémentaires de ces séquences. morte d'amplification selon la revendication 8, choisie parmi les amorces suivantes : SEQ ID NO i Amorce # Séquence nucléoticlique 35 11A TGTACAAAACTCAAATGGTCTTC 36 i 1B ATGACCAACTTAGATTTCCTTGA 37 12A GCCAGAGAGGCATAATGAAGCA 38 il 2B GATTCTAAGCCTCCCCCTCA I II 39 , 3A TGGCTCATAGGGATTCCAGACT 40 3B AGCAAGTTGTCAAGAGCCAATCT 41 4A CACTCTAGGAATCTTAGGCA 42 4B TGAAACCAATAGTCCAGTG 43 I SA TTCTAL I GTTCACTGCTATCCTCC 44 l 5B CCTGTGGCAGCTTTTTGAAGTAA 45 il 6A AGAGCAGAAGAAGATGGATACT 46 , 6B CATGAGCTGACATC TCCAAT 47 1 7A TCTGTACTGGTTGCCCCAAC 48 1 7B CGTGCCAGGCCTCTAATACTTIT 49 18A AGGGAAGACCCCAAGATGATG 50 8B CATGCAAAGTCCAACGAGAGG 51 9 GGGTGGCTGCATCCTATGG 1 - 52 il 9B CTGGTCAGGAAAAAA I I I GCCTTC 53 , 10A ACATGACATTGTCTGAAC I H GGG 54 1 i 10B TAGGACCATGCAGATACTAGTGAC 55 11A GAACTCCACAAACCTTGA 56 11B GCTAGAAGCTTTGGATATCT 57 12A TGGCTGTTACAAC1 I I CATG 58 l 128 TCTCCCTATTCTGAGCACA 10. Couple d'amorces d'amplification, consistant en deux amorces d'amplification choisies parmi les amorces selon la revendication 8 ou 9, et permettant d'amplifier, de préférence permettant d'amplifier spécifiquement, au moins une partie d'une séquence choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 71 Il parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos 1 à 34, et les séquences complémentaires de ces séquences. .1. Couple d'amorces d'amplification selon la revendication 10, choisi parmi les couples d'amorce d'amplification suivants Couple d'amorces # 1 Amorces # , 1 1 Forward : Amorce #1A Reverse : Amorce #18 2 Forward : Amorce #2A Reverse : Amorce #26 i 3 Forward : Amorce #3A Reverse : Amorce #38 4 Forward : Amorce #4A Reverse : Amorce #4B Forward : Amorce #5A Reverse : Amorce #5B 6 Forward : Amorce #6A Reverse : Amorce #6B 7 Forward : Amorce #7A Reverse : Amorce #7B Forward : Amorce #8A Reverse : Amorce #83 9 Forward : Amorce #9A Reverse : Amorce #9B Forward : Amorce #10A Reverse : Amorce #10B 11 Forward : Amorce #11A 1 Reverse : Amorce #11B 12 Forward : Amorce #12A Reverse : Amorce #12B 12. Sonde d'hybridation, dont la séquence nuciéoticlique comprend, ou consiste en, une séquence nucléotidique complémentaire d'au moins une partie d'une séquence choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences 72, identifiées en SEQ Nos : 1 à 34, et les séquences complémentaires de ces séquences. 13. Utilisation d'au moins un couples d'amorces selon la revendication 10 ou 11, et/ou d'au moins une sonde d'hybridation selon la revendication 12, pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient. 14. Kit comprenant des moyens d'amplification et/ou de détection d'au moins une séquence choisie parmi les séquences identifiées en SEQ Nos 1 à 34 ou parmi les séquences qui présentent au moins 99% d'identité avec une des séquences identifiées en SEQ Nos : 1 à 34. 15. Kit selon la revendication 14, dans lequel les moyens d'amplification comprennent au moins un couple d'amorces selon la revendication 10 ou 11, et/ou au moins une sonde d'hybridation selon la revendication 12. 16. Kit selon la revendication 14 ou 15, comprenant en outre des moyens d'amplification et/ou de détection d'autres biornarqueurs, en particulier des biornarqueurs endogènes, tels que d'autres HERVJMaLR et/ou des gènes, de préférence des gènes impliqués dans l'inflammation et/ou l'immunité, et/ou des gènes de ménage, et/ou des biomarqueurs exogènes, tels que des virus. 17. Kit selon l'une des revendications 14 à 16, comprenant des moyens d'amplification et/ou de détection d'au plus 100 biomarqueurs, au total. 18. Utilisation d'un kit selon l'une des revendications 14 à 17, pour déterminer in vitro ou ex vivo le statut immunitaire d'un individu, de préférence un patient.