Brevet FR3071615A1 (20190329)

REVENDICATIONS1. Procédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à I'IL-6 chez un patient atteint d'une polyarthrite rhumatoïde et qui a été en réponse insuffisante à au 5 moins un traitement antérieur par biothérapie, ledit procédé comprenant : a) la mesure in vitro du niveau-d'expression d'au moins deux biomarqueurs choisis dans le groupe constitué de S100A8/A9, Galectine-3-binding protein (ou LGALS3BP), C4b binding protein (ou C4BP), Complément C4 (ou C4), Sérum amyloïde A (SAA), alpha1 antitrypsine (A1AT), Protéine C-réactive (CRP), chaine beta-1 de la tubuline et alpha-énolase 10 dans un échantillon biologique issu dudit patient, b) l'estimation de ladite efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 chez ledit patient en fonction de chaque niveau d'expression mesuré pour un biomarqueur choisi dans ledit groupe. 15\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à I'IL- 6 selon la revendication 1, caractérisé en ce que l'étape b) comprend : b1) la comparaison du niveau d'expression mesuré à l'étape a) par rapport à celui mesuré dans une pluralité d'échantillons de patients atteints d'une polyarthrite rhumatoïde et ayant reçu un traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 pour lequel l'efficacité de 20 traitement est connue ; ladite comparaison étant réalisée à l'aide d'un modèle d'apprentissage statistique en utilisant comme données d'entrées les niveaux d'expression d'au moins deux des biomarqueurs mesurés à l'étape a), b2) l'estimation de ladite efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 chez ledit patient en fonction des résultats déterminés par le modèle défini à l'étape b1). 25\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications 1 ou 2, caractérisé en ce que les niveaux d'expression de chaque biomarqueur mesuré sont utilisés pour obtenir un score relié à l'estimation de l'efficacité de traitement chez ledit patient, ledit score étant comparé avec au moins un seuil 30 prédéterminé de sorte à classifier le pronostic parmi une pluralité de classes.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon la revendication 3, caractérisé en ce que ladite pluralité de classe comprend au moins deux classes dont une classe de non réponse au traitement par ledit agent anti-récepteur à l'IL-6. 26\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications 1 à 4, caractérisé en ce que l'estimation de ladite efficacité de traitement chez ledit patient comprend la comparaison dudit score avec un seuil prédéterminé au-dessous duquel une mauvaise efficacité est prédite ; et au-dessus duquel une bonne efficacité est prédite.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications 1 à 5, dans lequel le modèle d'apprentissage est basé sur une analyse préalable d'échantillons d'une cohorte comprenant des patients traités par un agent anti-récepteur à l'IL-6 présentant des bonnes réponses au traitement et des patients traités par un agent anti-récepteur à l'IL-6 présentant des mauvaises réponses au traitement.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon 15 la revendication 6, dans lequel ladite analyse préalable comprend l'application d'une méthode d'apprentissage et de sélection de variables.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon la revendication 7, dans lequel ladite méthode d'apprentissage et de sélection de variables 20 est la régression logistique.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications 6 à 8, dans lequel dans lequel lesdits niveaux d'expression sont pondérés en fonction de l'analyse préalable de ladite cohorte pour dériver 25 ledit score.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications 7 à 9, dans lequel ladite méthode d'apprentissage comprend un arbre de décision dans lequel chaque noeud correspond à une comparaison du 30 niveau d'expression mesuré à l'étape a) à une valeur de référence. 27\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que ledit agent est capable d'inhiber la voie de signalisation de l'IL-6, en particulier en bloquant la fixation de l'IL6 à son récepteur IL-6R, et de préférence ledit agent est le Tocilizumab. 5\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que ledit patient a été en réponse insuffisante à au moins un traitement antérieur par une biothérapie choisie parmi Etanercept, Adalimumab, Infliximab, Abatacept, Rituximab, Certolizumab, et 10 Golimumab.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que l'échantillon biologique est constitué d'un échantillon de fluide biologique, et de préférence le sérum.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que le ou les biomarqueurs dont le niveau d'expression est mesuré à l'étape a) est un/sont des biomarqueur(s) protéique(s).\n<CLM>\1\tSystème d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent anti-récepteur à l'IL-6 chez un patient atteint d'une polyarthrite rhumatoïde et qui a été en réponse insuffisante à au moins un traitement antérieur par biothérapie, ledit système comprenant : - des moyens de mesure ou de réception des données de mesure du niveau d'expression d'au moins deux biomarqueurs choisis dans un groupe constitué de : S100A8/A9, Galectine-3-binding protein (ou LGALS3BP), C4b binding protein (ou C4BP), Complément C4 (ou C4), Sérum amyloïde A (SAA), alphal antitrypsine (A1AT), Protéine C-réactive (CRP), chaîne beta-1 de la tubuline et alpha-énolase dans un échantillon biologique issu dudit patient, - des moyens de traitement de données de mesure configurés pour estimer ladite efficacité de traitement chez ledit patient en fonction de chaque niveau d'expression mesuré pour un biomarqueur choisi dans ce groupe.