Brevet FR3071609A1 (20190329)

REVENDICATIONS1. Procédé de détection de microorganismes (10m) dans un échantillon, l'échantillon comportant également des particules dites alimentaires (100), formées à partir d'aliments, le 5 procédé comportant les étapes suivantes : a) illumination de l'échantillon à l'aide d'une source de lumière (11), la source de lumière émettant une onde lumineuse incidente (12) se propageant vers l'échantillon (10) selon un axe de propagation (Z) ; b) acquisition, à l'aide d'un capteur d'image (16), d'une image (In) de l'échantillon (10), 10 formée dans un plan de détection (P0), l'échantillon étant disposé entre la source de lumière (11) et le capteur d'image (16), l'image acquise étant représentative d'une onde lumineuse (14) d'exposition, à laquelle est exposé le capteur d'image (16) sous l'effet de l'illumination ; le procédé étant caractérisé en ce qu'il comprend également les étapes suivantes : 15 c) obtention d'une image d'observation (I) de l'échantillon à partir de l'image acquise lors de l'étape b) et sélection, dans l'image d'observation, de régions d'intérêt (R0I1), chaque région d'intérêt correspondant à une particule d'intérêt (101), susceptible de correspondre à un microorganisme (10m) ou à une particule alimentaire (100); d) détermination de positions radiales (xi, yi), dans un plan parallèle au plan de détection, 20 des particules d'intérêt (101) correspondant aux différentes régions d'intérêt sélectionnées; e) à partir de l'image acquise (In) lors de l'étape b), application d'un opérateur de propagation (h), de façon à calculer au moins une grandeur caractéristique (M, (p) de l'onde lumineuse d'exposition (14), à chaque position radiale (xi, yi) déterminée lors de 25 l'étape d), et cela à une pluralité de distances (z) du plan de détection (P0); f) formation d'un profil (M1(z), (pi(z)), représentant une évolution de la grandeur caractéristique calculée lors de l'étape e) selon un axe parallèle à l'axe de propagation (Z) et passant par chaque position radiale (xi, yi) déterminée lors de l'étape d), chaque profil étant associé à une particule d'intérêt (101); 30 g) en fonction de chaque profil formé lors de l'étape f), identification des particules d'intérêt qui correspondent à un microorganisme (10m) parmi les particules d'intérêt (101) sélectionnées lors de l'étape c).\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 1, dans lequel l'étape c) comporte les sous-étapes suivantes : 21 ci) à partir de l'image acquise lors de l'étape b), application d'un opérateur de propagation (h), de façon à former une image complexe de l'échantillon (A10), dans un plan de reconstruction dans lequel s'étend l'échantillon ; cii) à partir de l'image complexe formée lors de la sous-étape ci), obtention de l'image d'observation (I) de l'échantillon ; ciii) application d'un critère à l'image d'observation obtenue lors de la sous-étape cii), de façon à sélectionner les régions d'intérêt (RO Ii) correspondant à des particules d'intérêt, représentatives d'un microorganisme ;\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 2, dans lequel lors de la sous-étape ciii), le critère appliqué est 10 un critère morphologique, paramétré par une forme et/ou une dimension, de telle sorte que les régions d'intérêt sélectionnées sont celles s'étendant, dans l'image d'observation, selon ladite forme et/ou selon ladite dimension.\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 3, dans lequel la sous-étape ciii) comporte, pour chaque région d'intérêt (ROI i) sélectionnée: 15 - une définition d'un seuil de niveau de bruit ; - une définition d'un voisinage (V1) autour de la région d'intérêt ; - une estimation d'un niveau de bruit (o-(Vi)) dans ledit voisinage ; de façon à retenir les régions d'intérêt sélectionnées dans le voisinage desquelles le niveau de bruit est inférieur au seuil de niveau de bruit, les autres régions d'intérêt étant rejetées. 20\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 3 ou la revendication 4, dans lequel la sous-étape ciii) comporte, pour chaque région d'intérêt (ROI i) sélectionnée : - une définition d'une plage d'acceptation de niveaux d'intensité ; - un calcul d'un niveau d'intensité représentatif de chaque région d'intérêt ; de façon à retenir les régions d'intérêt sélectionnées pour lesquelles le niveau d'intensité est 25 compris dans la plage d'acceptation, les autres régions d'intérêt étant rejetées.\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l'étape e) comporte une formation d'une pile d'images complexes (11,....Azmax), chaque image complexe correspondant à une expression complexe de l'onde lumineuse d'exposition (14), dans un plan de reconstruction, les images complexes de la pile d'images complexes étant respectivement 30 formées dans des plans de reconstruction s'étendant entre le plan de détection (P0) et le plan de l'échantillon (P10), selon lequel s'étend l'échantillon, et/ou de part et d'autre du plan de l'échantillon. 22\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l'étape g) comporte une détermination d'au moins un paramètre de chaque profil, l'identification des microorganismes étant effectuée en fonction dudit paramètre.\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 7, dans lequel le paramètre est une valeur minimale du profil. 5\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel lors de l'étape f), la propriété optique est obtenue à partir du module d'une expression complexe représentative de l'onde lumineuse d'exposition (14).\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel les microorganismes sont des levures.\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l'échantillon est obtenu par broyage d'un aliment comportant des microorganismes.\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, comportant une étape h) de comptage des microorganismes identifiés lors de l'étape g).\n<CLM>\1\tDispositif pour l'identification de microorganismes (10m) disposés dans un échantillon (10), le dispositif comportant : une source de lumière (11) apte à émettre une onde lumineuse incidente (12) se propageant vers l'échantillon (10) ; un capteur d'image (16) ; un support (10s), configuré pour maintenir l'échantillon (10) entre la source de lumière (11) et le capteur d'image (16) ; un processeur (20), configuré pour recevoir une image (In) de l'échantillon acquise par le capteur d'image (16) et à mettre en oeuvre les étapes c) à g) d'un procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 12.25