Brevet FR3072779A1 (20190426)

REVENDICATIONS1. Procédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la costimulation des cellules lymphocytaires T chez un patient atteint de polyarthrite 5 rhumatoïde et qui a été en réponse inadéquate à au moins un traitement antérieur par biothérapie, ledit procédé comprenant : a) la mesure in vitro du niveau d'expression d'au moins deux biomarqueurs choisis dans le groupe constitué de C4b-Binding Protein (C4BP), C-Reactive Protein (CRP), Cartilage Oligomeric Matrix Protein (COMP), Fibronectine (FN) et 10 Lipopolysaccharide-Binding Protein (LBP) dans un échantillon biologique issu dudit patient, b) l'estimation de ladite efficacité de traitement par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T chez ledit patient en fonction de chaque niveau d'expression mesuré pour un biomarqueur choisi dans ledit groupe. 15\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la costimulation des cellules lymphocytaires T selon la revendication 1, ledit procédé comprenant : a) la mesure in vitro du niveau d'expression d'au moins deux biomarqueurs 20 choisis dans le groupe constitué de : C4b-Binding Protein (C4BP), C-Reactive Protein (CRP), Cartilage Oligomeric Matrix Protein (COMP), Fibronectine (EN) et Lipopolysaccharide-Binding Protein (LBP) dans un échantillon biologique issu dudit patient, b1) la comparaison du niveau d'expression mesuré à l'étape a) par rapport à 25 celui mesuré dans une pluralité d'échantillons de patients atteints de polyarthrite rhumatoïde et ayant reçu un traitement par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T pour lequel l'efficacité de traitement est connue ; ladite comparaison étant réalisée à l'aide d'un modèle d'apprentissage statistique en utilisant comme données d'entrées les niveaux d'expression d'au moins deux des 30 biomarqueurs mesurés à l'étape a), b2) l'estimation de ladite efficacité de traitement par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T chez ledit patient en fonction des résultats déterminés par le modèle défini à l'étape b1). 29\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co- stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications 1 ou 2, caractérisé en ce que les niveaux d'expression de chaque biomarqueur mesuré à l'étape a) sont utilisés pour obtenir un score relié à l'estimation de 5 l'efficacité de traitement chez ledit patient, ledit score étant comparé avec au moins un seuil prédéterminé de sorte à classifier le pronostic parmi une pluralité de classes.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la costimulation des cellules lymphocytaires T selon la revendication 3, caractérisé en ce 10 que ladite pluralité de classe comprend au moins deux classes dont une classe de non réponse au traitement par ledit agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co15 stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications 3 à 4, caractérisé en ce que l'estimation de ladite efficacité de traitement chez ledit patient comprend la comparaison dudit score avec un seuil prédéterminé au-dessous duquel une mauvaise efficacité est prédite et au-dessus duquel une bonne efficacité est prédite. 20\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co- stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications 2 à 5, dans lequel le modèle d'apprentissage est basé sur une analyse préalable d'échantillons d'une cohorte comprenant des patients traités par un agent modulateur 25 de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T présentant des bonnes réponses au traitement et des patients traités par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T présentant des mauvaises réponses au traitement.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co30 stimulation des cellules lymphocytaires T selon la revendication 6, dans lequel ladite analyse préalable comprend l'application d'une méthode d'apprentissage et de sélection de variables. 30\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co- stimulation des cellules lymphocytaires T selon la revendication 7, dans lequel ladite méthode d'apprentissage et de sélection de variables est la régression logistique.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la costimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications 6 à 8, dans lequel lesdits niveaux d'expression sont pondérés en fonction de l'analyse préalable de ladite cohorte pour dériver ledit score.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent- modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications 7 à 9, dans lequel ladite méthode d'apprentissage comprend un arbre de décision dans lequel chaque noeud correspond à une comparaison du niveau d'expression mesuré à l'étape a) à une valeur de référence.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que l'étape b) concerne l'estimation de l'efficacité de traitement par l'agent Abatacept.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que ledit échantillon biologique dans lequel la mesure in vitro du niveau d'expression d'au moins deux biomarqueurs choisis dans ledit groupe est réalisée à l'étape a) est issu d'un patient qui a été en réponse inadéquate à au moins un traitement antérieur choisi parmi Etanercept, Adalimumab, Infliximab, Tocilizumab, Rituximab, Certolizumab, et Golimumab.\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la 30 co-stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que l'échantillon biologique est constitué d'un échantillon de fluide biologique, et de préférence le sérum. 31\n<CLM>\1\tProcédé d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que le ou les biomarqueurs dont le niveau d'expression est mesuré à l'étape a) est un/sont des biomarqueur(s) 5 protéique(s).\n<CLM>\1\tSystème d'estimation de l'efficacité de traitement par un agent modulateur de la co-stimulation des cellules lymphocytaires T chez un patient atteint de polyarthrite rhumatoïde et qui a été en réponse inadéquate à au moins un traitement antérieur 10 par biothérapie, ledit système comprenant : - des moyens de mesure ou de réception des données de mesure du niveau d'expression d'au moins deux biomarqueurs choisis dans un groupe constitué de : C4b-Binding Protein (C4BP), C-Reactive Protein (CRP), Cartilage Oligomeric Matrix Protein (COMP), Fibronectine (FN) et Lipopolysaccharide-Binding Protein (LBP) dans 15 un échantillon biologique issu dudit patient, - des moyens de traitement de données de mesure configurés pour estimer ladite efficacité de traitement chez ledit patient en fonction de chaque niveau d'expression mesuré pour un biomarqueur choisi dans ce groupe.