Brevet FR3047013A1 (20170728)
REVENDICATIONS1. Procédé de classification d'un échantillon biologique de mesure, comprenant : - une acquisition (9) d'au moins une courbe de fusion d'ADN de l'échantillon biologique de mesure, dite au moins une courbe de mesure, - une détermination (10) d'une appartenance de l'échantillon biologique de mesure à un groupe déterminé parmi différents groupes possibles, par une analyse de descripteurs issus de l'au moins une courbe de mesure, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs points de la dérivée première de chaque courbe de mesure et/ou comprennent un ou plusieurs points de la dérivée seconde de chaque courbe de mesure.\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 1, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs points de la dérivée première de chaque courbe de mesure et comprennent un ou plusieurs points de la dérivée seconde de chaque courbe de mesure.\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 1 ou 2, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs points de chaque courbe de mesure.\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs percentiles de chaque courbe de mesure.\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que la détermination (10) comprend une détermination par une méthode des forêts aléatoires.\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 5, caractérisé en ce qu'il comprend un apprentissage (6) comprenant : 3047013 -32- - une acquisition (1) de différentes courbes de fusion d'ADN, dites courbes de référence, à partir de différents échantillons biologiques de référence appartenant à différents groupes initiaux, puis 5 - une détermination (2,\n<CLM>\1\tdes descripteurs à partir des courbes de référence, puis - une construction (8) d'une forêt selon la méthode des forêts aléatoires, comprenant une construction de plusieurs arbres selon la méthode des forêts aléatoires, la ou les variable(s) étudiée(s) à 10 chaque noeud de chaque arbre comprenant un ou plusieurs des descripteurs, chaque feuille de chaque arbre ne correspondant qu'à un seul groupe parmi les différents groupes possibles. Procédé selon la revendication 6, caractérisé en ce que la détermination (2,\n<CLM>\1\tdes descripteurs comprend : - une détermination préliminaire (2) de descripteurs, puis - une élimination (3) de certains descripteurs redondants. Procédé selon la revendication 7, caractérisé en ce que l'élimination (3) de certains descripteurs comprend, pour chaque ensemble de descripteurs exhibant deux à deux un coefficient de corrélation de Pearson supérieur à 0,95, une conservation d'un seul descripteur. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comprend : - après l'acquisition de différentes courbes de référence, une identification de plusieurs courbes de référence correspondant au même groupe initial, dit groupe ambigu, et présentant des profils séparés en plusieurs sous-groupes, et 30 - une séparation (4) de ce groupe ambigu en plusieurs groupes possibles.\n<CLM>\1\tProcédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comprend :\n<CLM>\1\t15\n<CLM>\1\t20\n<CLM>\1\t25 3047013 -33- - après l'acquisition de différentes courbes de référence, une identification de plusieurs courbes de référence correspondant à plusieurs groupes initiaux, dit groupes confondus, et présentant des profils réunis en un seul groupe, et 5 - une unification (5) de ces groupes confondus en un unique groupe possible. 11.Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comprend en outre un calcul d'un indice de 10 confiance de l'étape de détermination d'une appartenance de l'échantillon biologique de mesure à un groupe déterminé.\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 11, caractérisé en ce que le calcul de l'indice de confiance comprend : 15 - un calcul d'une distribution de proximités moyennes entre courbes de référence appartenant au groupe déterminé, - un calcul d'une proximité moyenne de l'au moins une courbe de mesure avec les courbes de référence appartenant au groupe déterminé, et 20 - un calcul d'un taux de courbes de référence appartenant au groupe déterminé, et ayant une proximité moyenne aux autres courbes de référence appartenant au groupe déterminé inférieure à la proximité moyenne de l'au moins une courbe de mesure avec les courbes de référence appartenant au groupe déterminé. 25\n<CLM>\1\tProcédé selon la revendication 11 ou 12, caractérisé en ce qu'il comprend en outre, après l'étape de détermination d'une appartenance de l'échantillon biologique de mesure à un groupe déterminé, un refus d'affecter l'échantillon biologique de mesure à 30 quelque groupe que ce soit en fonction de la valeur de l'indice de confiance. 3047013 -34-\n<CLM>\1\tDispositif (100) de classification d'un échantillon biologique de mesure, comprenant : - des moyens (101) agencés et/ou programmés pour une 5 acquisition (9) d'au moins une courbe de fusion d'ADN de l'échantillon biologique de mesure, dite au moins une courbe de mesure, - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une détermination (10) d'une appartenance de l'échantillon biologique 10 de mesure à un groupe déterminé parmi différents groupes possibles, par une analyse de descripteurs issus de l'au moins une courbe de mesure, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs points de la dérivée première de chaque courbe de mesure et/ou 15 comprennent un ou plusieurs points de la dérivée seconde de chaque courbe de mesure.\n<CLM>\1\tDispositif selon la revendication 14, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs points de la dérivée 20 première de chaque courbe de mesure et comprennent un ou plusieurs points de la dérivée seconde de chaque courbe de mesure.\n<CLM>\1\tDispositif selon la revendication 14 ou 15, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs points de chaque courbe 25 de mesure.\n<CLM>\1\tDispositif l'une quelconque des revendications 14 à 16, caractérisé en ce que les descripteurs comprennent un ou plusieurs percentiles de chaque courbe de mesure. 30\n<CLM>\1\tDispositif selon l'une quelconque des revendications 14 à 17, caractérisé en ce que les moyens (102) agencés et/ou programmés pour la détermination (10) comprennent des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une détermination (10) par une méthode 35 des forêts aléatoires. 3047013 -35-\n<CLM>\1\tDispositif selon la revendication 18, caractérisé en ce qu'il comprend des moyens (101,\n<CLM>\1\tagencés et/ou programmés pour un apprentissage (6) comprenant : 5 - des moyens (101) agencés et/ou programmés pour une acquisition (1) de différentes courbes de fusion d'ADN, dites courbes de référence, à partir de différents échantillons biologiques de référence appartenant à différents groupes initiaux, puis 10 - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une détermination (2,\n<CLM>\1\tdes descripteurs à partir des courbes de référence, puis - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une construction (8) d'une forêt selon la méthode des forêts 15 aléatoires, comprenant des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une construction de plusieurs arbres selon la méthode des forêts aléatoires, la ou les variable(s) étudiée(s) à chaque noeud de chaque arbre comprenant un ou plusieurs des descripteurs, chaque feuille de chaque arbre ne correspondant 20 qu'à un seul groupe parmi les différents groupes possibles.\n<CLM>\1\tDispositif selon la revendication 19, caractérisé en ce que les moyens (102) agencés et/ou programmés pour la détermination (2,\n<CLM>\1\tdes descripteurs comprennent : 25 - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une détermination préliminaire (2) de descripteurs, - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour, après la détermination préliminaire, une élimination (3) de certains descripteurs redondants. 30\n<CLM>\1\tDispositif selon la revendication 20, caractérisé en ce que les moyens (102) agencés et/ou programmés pour l'élimination (3) de certains descripteurs comprennent des moyens (102) agencés et/ou programmés pour, pour chaque ensemble de descripteurs exhibant 3047013 -36- deux à deux un coefficient de corrélation de Pearson supérieur à 0,95, une conservation d'un seul descripteur.\n<CLM>\1\tDispositif selon l'une quelconque des revendications 14 à 21, 5 caractérisé en ce qu'il comprend : - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour, après l'acquisition de différentes courbes de référence, une identification de plusieurs courbes de référence correspondant au même groupe initial, dit groupe ambigu, et présentant des profils séparés en plusieurs sous-groupes, et 10 - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une séparation (4) de ce groupe ambigu en plusieurs groupes possibles.\n<CLM>\1\tDispositif selon l'une quelconque des revendications 14 à 22, caractérisé en ce qu'il comprend : 15 - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour, après l'acquisition de différentes courbes de référence, une identification de plusieurs courbes de référence correspondant à plusieurs groupes initiaux, dit groupes confondus, et présentant des profils réunis en un seul groupe, et - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour une unification (5) de 20 ces groupes confondus en un unique groupe possible.\n<CLM>\1\tDispositif selon l'une quelconque des revendications 14 à 23, caractérisé en ce qu'il comprend en outre des moyens (102) agencés et/ou programmés pour un calcul d'un indice de confiance de l'étape 25 de détermination d'une appartenance de l'échantillon biologique de mesure à un groupe déterminé.\n<CLM>\1\tDispositif selon la revendication 24, caractérisé en ce que les moyens (102) agencés et/ou programmés pour le calcul de l'indice 30 de confiance comprennent : - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour un calcul d'une distribution de proximités moyennes entre courbes de référence appartenant au groupe déterminé, 3047013 -37- - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour un calcul d'une proximité moyenne de l'au moins une courbe de mesure avec les courbes de référence appartenant au groupe déterminé, et 5 - des moyens (102) agencés et/ou programmés pour un calcul d'un taux de courbes de référence appartenant au groupe déterminé, et ayant une proximité moyenne aux autres courbes de référence appartenant au groupe déterminé inférieure à la proximité moyenne de l'au moins une courbe de mesure avec les courbes 10 de référence appartenant au groupe déterminé.\n<CLM>\1\tDispositif selon la revendication 24 ou 25, caractérisé en ce qu'il comprend en outre des moyens (102) agencés et/ou programmés pour, après l'étape de détermination d'une appartenance de 15 l'échantillon biologique de mesure à un groupe déterminé, un refus d'affecter l'échantillon biologique de mesure à quelque groupe que ce soit en fonction de la valeur de l'indice de confiance.