FR 3073862 A1 20190524 FR 1761116 A 20171123 AMORCES UNIVERSELLES ET LEUR UTILISATION POUR LA DÉTECTION ET/OU L'IDENTIFICATION D'ALGUES La présente invention a pour objet de nouvelles amorces universelles, ainsi que leur utilisation pour la détection et/ou l'identification d'algues. Le « DNA barcoding » est une méthode de biologie moléculaire permettant de déterminer les espèces présentes dans un échantillon grâce à leur signature génétique, unique pour chaque espèce. L'idée est d'avoir un fragment d'ADN présent chez toutes les espèces à analyser et qui constitue un marqueur génétique. Ce marqueur est un fragment d'ADN encadré par des régions très conservées et donc universelles, et qui, une fois séquencé, montre des variations de séquences génétiques entre individus d'espèces différentes et des séquences identiques entre individus d'une même espèce (HEBERT, Paul DN., CYWINSKA, Alina, BALL, Shelley L. et DEWAARD, Jeremy R. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences, 2003, vol. 270, no. 1512, p. 313-321). La délimitation des espèces, grâce au « DNA barcoding », est basée sur le ratio « divergence intraspécifique/divergence interspécifique » (HEBERT, Paul DN, STOECKLE, Mark Y., ZEMLAK, Tyler S. et FRANCIS, Charles M. Identification of birds through DNA barcodes. PLoS Biology, 2004, vol. 2, no. 10, p. e312.). Ce ratio est appelé le « barcoding gap ». Le gène mitochondrial codant pour la première sous-unité de la cytochrome c oxydase (cox/) est un exemple de marqueur génétique pouvant être utilisé chez les animaux. Chez les plantes, les analyses se font à l'aide de plusieurs marqueurs nucléaires et chloroplastiques (tels que le marqueur trnL, voir le brevet EP1797201). De façon similaire aux plantes (CBOL Plant Working Group. A DNA barcode for land plants. PNAS, 2009, vol. 106, no. 31, pp. 12794-12797), l'utilisation d'un seul marqueur génétique universel pour la détermination et/ou l'identification des espèces d'algues est impossible du fait de leurs multiples origines (LELIAERT, Frederik, VERBRUGGEN, Heroen, VANORMELINGEN, Pieter, STEEN, Frédérique, LÔPEZ-BAUTISTA, Juan M., ZUCCARELLO Giuseppe C. et DE CLERCK Olivier. DNA-based species delimitation in algae. European Journal of Phycology, 2014, vol. 49, no. 2, pp. 179-196). Plusieurs études ont montré qu'il existait des régions très conservées chez les algues. Celles-ci ont suscité un grand intérêt, notamment UPA (Universal Plastid Amplicon). Sa très grande conservation a permis de l'amplifier chez de nombreuses espèces mais il a été considéré que sa séquence manquait de variabilité pour y identifier un marqueur permettant une discrimination au niveau des espèces. D'autres régions conservées ont ainsi été étudiées : ITS (Internai Transcribed Spacer), LSU (Large SubUnit), SSU (Small Subunit), rbcL (ribulose biphosphate carboxylase large chain), tufA, ou encore COX1 (cytochrome oxydase 1). Cependant, les marqueurs identifiés à partir de ces régions manquaient de résolution, notamment pour discriminer des espèces très proches 2 (MATTIO, Lydiane et PAYRI, Claude. Assessment of five markers as potential barcodes for identifying Sargassum subgenus Sargassum species (Phaeophyceae, Fucales). Cryptogamie Algologie, 2010, vol. 31, no. 4, p. 467.). Les marqueurs pouvant être utilisés communément pour la détermination et/ou l'identification 5 des espèces d'algues restent encore à identifier. En effet, il n'existe pas, à ce jour, de marqueur suffisamment variable et possédant des amorces universelles pour permettre une bonne résolution par le « DNA barcoding » chez les algues. Ceci est d'autant plus vrai pour l'analyse par le « DNA barcoding de substrats dégradés, c'est-à-dire des produits dans lesquels l'ADN d'algue est dégradé et dont la taille est inférieure ou égale à 220 paires de bases. 10 La détermination et/ou l'identification d'algues à partir d'ADN dégradé est très importante, notamment à des fins de contrôle-qualité de produits alimentaires, de compléments alimentaires ou cosmétiques pour lesquels l'utilisation d'algues connaît un succès croissant. Néanmoins, les régions d'ADN d'algue suffisamment courtes (pour pouvoir analyser des échantillons d'ADN dégradé) et suffisamment variables (pour permettre de déterminer et/ou d'identifier les algues, notamment les 15 espèces d'algues) sont rares et à ce jour aucune n'a été caractérisée. De plus, il n'existe pas d'amorces universelles encadrant un tel fragment d'ADN d'algue (de taille inférieure ou égale à 220 paires de bases) permettant d'amplifier de l'ADN d'algue dégradé. Il existe ainsi un réel de besoin de pouvoir déterminer et/ou identifier les algues à partir d'ADN d'algue dégradé. 20 Il existe également un réel besoin de déterminer des régions d'ADN d'algue suffisamment courtes et suffisamment variables pour pouvoir être utilisées dans la détermination et/ou l'identification d'algue. Il existe aussi un réel besoin de déterminer des amorces universelles permettant d'amplifier lesdites régions d'ADN d'algue suffisamment courtes et suffisamment variables, notamment de 25 nouvelles amorces universelles permettant d'amplifier de l'ADN d'algue dégradé (de taille inférieure ou égale à 220 paires de bases). Il existe donc un réel besoin de déterminer un marqueur suffisamment variable et possédant des amorces universelles pour permettre une bonne résolution par le « DNA barcoding » chez les algues. 30 C'est pourquoi l'un des buts de l'invention est de fournir des régions d'ADN d'algue suffisamment courtes et suffisamment variables pour pouvoir être utilisées dans la détermination et/ou l'identification d' algues. L'un des buts de l'invention est également de fournir des amorces universelles permettant d'amplifier lesdites régions d'ADN d'algue suffisamment courtes et suffisamment variables. 35 L'un des buts de l'invention est ainsi de fournir un procédé de détermination et/ou d'identification d'algue à partir d'ADN d'algue dégradé. 3 La présente invention repose en effet sur la détermination, par les Inventeurs, (i) de régions d'ADN d'algue suffisamment courtes et suffisamment variables pour pouvoir être utilisées dans la détermination et/ou l'identification d'algues, et (ii) des amorces universelles permettant d'amplifier lesdites régions d'ADN d'algue. Ces courtes régions d'ADN d'algue constituent des marqueurs dits 5 « courts » et ont été identifiées dans les régions LSU des algues. La présente invention concerne ainsi l'utilisation d'une paire d'amorces d'amplification pour la détection et/ou l'identification d'une algue. La présente invention concerne aussi les amorces, les séquences cibles desdites amorces, et les régions amplifiées per se. 10 La présente invention concerne aussi l'utilisation des régions amplifiées pour la détermination et/ou l'identification d'une algue. La présente invention concerne aussi un procédé d'amplification d'au moins une région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue. La présente invention a donc pour premier objet, l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides 15 (amorces d'amplification) dans laquelle: -une première paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, choisie dans la séquence de SEQ ID NO : 1 du gène LSU d'une algue et un deuxième oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides 20 contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 2 du gène LSU d'une algue, ou -une deuxième paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 5 du gène LSU d'une algue et 25 le deuxième oligonucléotide s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 6 du gène LSU d'une algue, pour la détection et/ou l'identification d'une algue dans un échantillon susceptible d'en contenir, par amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue, ladite région variable 30 constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue. Le terme « oligonucléotide » signifie une courte séquence de nucléotides, dont le nombre varie d'une dizaine à environ 100 bases (ou 100 nucléotides en considérant la présence d'un ose et d'un, de deux ou de trois groupes phosphate; la relation base/nucléotides étant bien connue de l'homme du métier). Ainsi, l'expression « paire d'oligonucléotides » fait référence à l'association de deux 35 oligonucléotides. Les deux oligonucléotides formant la paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) n'ont pas nécessairement la même taille: par exemple le premier oligonucléotide qui s'hybride à la séquence de SEQ ID NO: 1 peut comprendre 19 nucléotides et le deuxième 4 oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 2 peut comprendre 20 nucléotides, par exemple. Les lettres « W », « M » et « R » dans les séquences SEQ ID NO: 41 ou SEQ ID NO: 71 5 représentent un nucléotide choisi parmi A, T, C ou G. Dans un aspect particulier de l'invention, la paire d'oligonucléotides correspond à une paire d'amorces d'amplification. Dans un aspect encore plus particulier de l'invention, le premier oligonucléotide correspond à une amorce sens et le deuxième oligonucléotide correspond à une amorce anti-sens. 10 L'expression «une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus» signifie 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 nucléotides et de préférence 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 nucléotides. Le terme «contigus» signifie que les oligonucléotides s'hybrident aux 18 à 24 nucléotides successifs, situés les uns à la suite des autres, sans discontinuité. 15 Le terme « SEQ ID NO: 1» doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 1 ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID NO : 1, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Le terme «SEQ ID NO: 2» doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 2 ou une 20 séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID NO : 2, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Le terme «SEQ ID NO: 5» doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 5 ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 25 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID NO : 5, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Le terme «SEQ ID NO: 6» doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 6 ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID 30 NO : 6, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Le terme «gène LSU d'une algue» fait référence au gène codant la grande sous-unité d'un ribosome (LSU pour Large Sub-Unit). Il s'agit d'un gène d'origine nucléaire. Le terme «détection» signifie que l'utilisation de la paire d'oligonucléotides susmentionnée permet de conclure quant à la présence ou à l'absence d'algue dans l'échantillon testé. 35 Le terme «identification» signifie que l'utilisation de la paire d'oligonucléotides susmentionnée permet d'associer l'algue présente dans l'échantillon testé à un embranchement et/ou à une classe et/ou à un ordre et/ou à une famille et/ou à un genre et/ou à une espèce d'algue. Dans un 5 aspect préféré, le terme «identification» signifie que l'utilisation de la paire d'oligonucléotides susmentionnée permet d'associer l'algue présente dans l'échantillon testé à une espèce d'algue. Des exemples des embranchements, des classes, des ordres, des familles, des genres et des espèces d'algues sont communiqués dans le Tableau 1 ci-après. 5 L'expression «la détection et/ou l'identification» signifie «la détection» ou «l'identification» ou «la détection et l'identification», et plus particulièrement «l'identification». L'expression «échantillon susceptible d'en contenir» signifie que l'échantillon peut comprendre ou peut ne pas comprendre d'algue, et notamment peut comprendre ou peut ne pas comprendre d'ADN d'algue. 10 Le terme «hybrider» signifie que les oligonucléotides formant la paire d'oligonucléotides (les amorces d'amplification) de l'invention s'hybrident avec une séquence «marqueur» de référence du gène LSU (notamment les séquences de SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 5 et SEQ ID NO: 6) à un niveau supérieur au bruit de fond de manière significative. Le niveau du signal généré par l'interaction entre la séquence capable de s'hybrider de manière sélective (les séquences formant la 15 paire d'oligonucléotides) et les séquences de référence (les séquences cibles) est généralement 10 fois, de préférence 100 fois plus intense que celui de l'interaction des autres séquences d'ADN générant le bruit de fond. Les conditions d'hybridation stringentes permettant une hybridation sélective sont bien connues de l'homme du métier. L'expression «conditions de stringence suffisantes» signifie par exemple une température 20 d'hybridation de 40-65°C, de préférence de 50-60°C, notamment 53-58°C, et plus particulièrement 53°C, 55°C, 58°C dans un tampon d'amplification d'une concentration saline comprise de 0,001 à 0,5M notamment comprenant du MgCl2 2mM. La présente invention a pour autre objet, l'utilisation d'une paire d'amorces d'amplification, dans laquelle ledit premier oligonucléotide ou ledit deuxième oligonucléotide de la première ou de la 25 deuxième paire d'amorces d'amplification s'hybride à sa séquence cible respective choisie parmi les séquences du groupe constitué par: SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO:2 , SEQ ID NO: 5, et SEQ ID NO: 6 du gène LSU d'une algue, à une température comprise de 40 à 65°C, et plus particulièrement de 5060°C et une concentration saline comprise de 0, 001 à 0,5 M, et plus particulièrement de 0.05 à 0,1 M, et encore plus particulièrement de à 0,001 à 0,005M. 30 L'expression «amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue» fait référence à toute amplification enzymatique in vitro d'une séquence définie d'ADN du gène LSU d'une algue, par exemple par une réaction d'amplification en chaîne par polymérase (PCR). L'expression « ladite région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue » signifie que la région variable du gène LSU qui est amplifiée constitue 35 une région d'ADN d'algue suffisamment courte et suffisamment variable pour pouvoir détecter et/ou identifier une algue, notamment à partir d'un échantillon contenant de l'ADN d'algue dégradé, et plus particulièrement pour identifier l'ADN d'une algue. 6 Dans un autre aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) dans laquelle : - le premier oligonucléotide de la première paire d'amorces d'amplification a une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la 5 séquence de SEQ ID NO: 3 et le deuxième oligonucléotide a une séquence de 15 à 26 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 4, - le premier oligonucléotide de la deuxième paire d'amorces d'amplification a une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la 10 séquence de SEQ ID NO: 7 et le deuxième oligonucléotide a une séquence de 15 à 24 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 8, pour la détection et/ou l'identification d'une algue dans un échantillon susceptible d'en contenir, par amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue, ladite région variable 15 constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue, et dans laquelle ladite algue appartient à l'un des embranchements suivants : Glaucophyta, Cyanobacteria, Dinophyta, Ochrophyta, Euglenozoa Charophyta, Chlorophyta , ou Rhodophyta. Le terme « Glaucophyta » fait référence à l'embranchement des organismes caractérisés par des chloroplastes, ou « cyanelles », de couleur bleu-vert, et par la présence d'alvéoles sous la 20 membrane plasmique sous-tendues par des microtubules. Cet embranchement comporte par exemple la classe des Glaucophyceae. Le terme « Cyanobacteria » fait référence à l'embranchement des bactéries également appelées « algues bleues », ou autrefois « algues bleu-vert ». Cet embranchement comporte l'unique classe des Cyanophyceae. 25 Le terme « Dinophyta » fait référence à l'embranchement des algues qui sont notamment caractérisées par un noyau particulier : le dinocaryon. Cet embranchement comporte par exemple la classe des Dinophyceae. Le terme « Ochrophyta » fait référence à l'embranchement des algues brunes-dorées. Cet embranchement comporte par exemple la classe des Phaeophyceae. 30 Le terme « Euglenozoa » fait référence à l'embranchement des algues caractérisées par des crêtes mitochondriales discoïdes, et dont la membrane plasmique est sous-tendue par des feuillets de microtubules corticaux. Cet embranchement comporte par exemple la classe des Euglenophyceae. Le terme « Charophyta » fait référence à une division des Plantae. Elles comprennent une partie des algues dites « algues vertes ». Cet embranchement comporte par exemple la classe des 35 Charophyceae. 7 Le terme « Chlorophyta » fait référence à une division des Plantae. Elles comprennent une partie des algues dites « algues vertes ». Cet embranchement comporte par exemple la classe des Ulvophyceae. Le terme « Rodophyta », dites « algues rouges » fait référence à l'embranchement des algues 5 caractérisées par une composition pigmentaire avec un seul type de chlorophylle, la chlorophylle a, des caroténoïdes et des pigments caractéristiques, les phycobiliprotéines. Cet embranchement comporte par exemple la classe des Cyanidiophyceae. Dans un autre aspect préféré, ledit premier oligonucléotide (amorce d'amplification) s'hybride à une séquence d'au moins 15 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 1 du 10 gène LSU d'une algue et a une séquence d'au moins 15 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 3. Dans un autre aspect préféré, ledit deuxième oligonucléotide (amorce d'amplification) s'hybride à une séquence d'au moins 15 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 2 du gène LSU d'une algue et a une séquence d'au moins 15 nucléotides contigus choisie dans la 15 séquence de SEQ ID NO: 4. L'expression «15 nucléotides contigus » signifie par exemple 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ou 30 nucléotides contigus. Le terme « SEQ ID NO : 1 » doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 1 ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 20 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID NO : 1, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Le terme « SEQ ID NO : 2 » doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 2 ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID 25 NO : 2, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides dans laquelle le premier oligonucléotide (amorce d'amplification) ayant une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans une séquence du groupe constitué par: SEQ ID NO: 3 est représenté par l'une des séquences suivantes: SEQ ID NO : 30 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO : 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56 ou SEQ ID NO: 57. Bien entendu, lesdites séquences constituent des exemples non limitatifs de séquences de 18 à 24 nucléotides choisies dans la séquence de SEQ ID NO: 3 pouvant être utilisées dans le cadre de la présente invention. 35 Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides susmentionnée, dans laquelle le deuxième oligonucléotide ayant une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO : 4 est 8 représenté par l'une des séquences suivantes : SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70. Bien entendu, lesdites séquences constituent des exemples non limitatifs de séquences de 18 à 24 nucléotides choisies dans la 5 séquence de SEQ ID NO : 4 pouvant être utilisées dans le cadre de la présente invention. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) dans laquelle: - le premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO : 5 du 10 gène LSU d'une algue a une séquence complémentaire de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO : 7 et le deuxième oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO : 6 du gène LSU d'une algue a une séquence complémentaire de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO : 8, 15 pour la détection et/ou l'identification d'une algue dans un échantillon susceptible d'en contenir, par amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue, ladite région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue, et dans laquelle ladite algue appartient à l'un des embranchements suivants : Glaucophyta, Dinophyta, Charophyta, Chlorophyta, Euglenozoa, Ochrophyta ou Rhodophyta. 20 Le terme « SEQ ID NO : 5 » doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 5 ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID NO : 5, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Le terme « SEQ ID NO : 6 » doit s'entendre comme une séquence de SEQ ID NO : 6 ou une 25 séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82 %, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec ladite SEQ ID NO : 6, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides dans laquelle le premier oligonucléotide ayant une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de 30 préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO : 7 est représenté par l'une des séquences suivantes : SEQ ID NO : 20, SEQ ID NO : 21, SEQ ID NO : 22, SEQ ID NO : 23, SEQ ID NO : 24, SEQ ID NO : 25, SEQ ID NO : 26, SEQ ID NO : 27, SEQ ID NO : 28 ou SEQ ID NO : 29. Bien entendu, lesdites séquences constituent des exemples non limitatifs de séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides choisies dans la séquence de SEQ 35 ID NO : 7 pouvant être utilisées dans le cadre de la présente invention. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides dans laquelle le deuxième oligonucléotide ayant une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de 9 préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 8 est représenté par l'une des séquences suivantes: SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 41. Bien entendu, lesdites séquences constituent des exemples 5 non limitatifs de séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides choisies dans la séquence de SEQ ID NO: 8 pouvant être utilisées dans le cadre de la présente invention. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides susmentionnée, dans laquelle ladite région variable du gène LSU d'une algue qui est amplifiée a une 10 taille inférieure ou égale à 220 paires de bases, notamment inférieure ou égale à 200, 190, 180 et notamment 178 paires de bases. L'expression « une taille inférieure ou égale à 200 paires de bases » signifie une taille d'environ 100 à 200 paires de bases, notamment 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195 ou 200 paires de bases. 15 Dans un aspect encore plus particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite région variable du gène LSU d'une algue qui est amplifiée a une taille de 126 à 178 paires de bases. 20 Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides susmentionnée, dans laquelle ladite région variable du gène LSU d'une algue est représentée par une séquence choisie dans le groupe constitué par: SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ 25 ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80% avec ladite séquence et notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ledit échantillon est un produit qui est 30 susceptible de contenir au moins une molécule d'ADN d'algue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ledit échantillon est un produit qui comprend ou consiste en au moins une molécule d'ADN d'algue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides 35 (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ledit échantillon est un produit qui ne comprend pas au moins une molécule d'ADN d'algue. L'expression « 126 à 178 paires de bases » signifie 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177 ou 178 paires de bases. 10 Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite molécule d'ADN d'algue a une taille inférieure ou égale à 220 paires de bases. L'expression « inférieure ou égale à 220 paires de bases » signifie par exemple de 100 à 220 5 paires de bases, notamment 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 10 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219 ou 220. Dans un aspect encore plus particulier, lorsque ladite molécule d'ADN d'algue correspond au gène LSU d'une algue (ou un fragment dudit gène LSU), alors la molécule d'ADN possède au maximum 220 paires de bases, selon la détermination ci-après: la séquence de l'amorce sens (20 15 paires de bases par exemple) + les fragments correspondant à la région amplifiée (126 à 178 paires de bases) + la séquence de l'amorce anti-sens (18 paires de bases par exemple). Bien entendu la détermination ci-dessus peut être modifiée, pour s'adapter par exemple à l'utilisation d'amorces faisant 21 paires de bases ; dans tous les cas ladite molécule d'ADN possède au maximum 220 paires de bases. 20 Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides susmentionnée, dans laquelle ledit échantillon est choisi parmi : un produit à base d'algues, un produit qui contient au moins une algue processée, un extrait d'algue, un mélange d'algues et de plantes, un mélange d'algues, un produit à base d'algues et de plantes, un produit qui ne contient pas d'algue, un mélange qui ne contient pas d'algue, un échantillon de plante sans algue ou une algue pure. 25 L'expression «produit à base d'algues» signifie un produit contenant au moins une algue dont l'intégrité de l'ADN n'a pas été altérée. L'expression « un produit qui contient au moins une algue processée» signifie un produit contenant au moins une algue dont l'intégrité de l'ADN a été altérée. L'expression « un extrait d'algues » signifie un échantillon obtenu par extraction d'une algue, 30 c'est-à-dire un échantillon/extrait comprenant au moins de l'ADN d'une algue, l'intégrité dudit ADN étant altérée ou non altérée. L'expression « un mélange d'algues et de plantes » signifie un mélange contenant au moins de l'ADN d'une algue et au moins de l'ADN d'une plante. L'expression « un mélange d'algues » signifie un mélange contenant de l'ADN d'algue d'au 35 moins deux algues appartenant à des embranchements différents et/ou des classes différentes et/ou des ordres différents et/ou des familles différentes et/ou des genres différents et/ou des espèces d'algues différentes, notamment des algues dont l'ADN a été processé. 11 L'expression « un produit à base d'algues et de plantes » signifie un produit contenant au moins de l'ADN d'une algue (processé ou non processé) et au moins de l'ADN d'une plante. L'expression « un produit qui ne contient pas d'algue » signifie un produit contenant 0% d'ADN d'algue. 5 L'expression « un échantillon de plante sans algue » signifie un échantillon/extrait comprenant au moins de l'ADN d'une plante, mais ne contenant pas d'ADN d'algue (en d'autres termes ledit échantillon de plante contient 0% d'ADN d'algue). L'expression « algue pure » signifie un produit contenant 100% d'ADN algue d'une seule espèce. 10 Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle l'embranchement auquel appartient l'algue de ladite molécule d'ADN d'algue susceptible d'être présente dans le susdit échantillon est connu ou inconnu. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides 15 (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle la classe à laquelle appartient l'algue de ladite molécule d'ADN d'algue susceptible d'être présente dans le susdit échantillon est connue ou inconnue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle l'ordre auquel appartient l'algue de ladite 20 molécule d'ADN d'algue susceptible d'être présente dans le susdit échantillon est connue ou inconnue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle la famille à laquelle appartient l'algue de ladite molécule d'ADN d'algue susceptible d'être présente dans le susdit échantillon est connue ou 25 inconnue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle le genre auquel appartient l'algue de ladite molécule d'ADN d'algue susceptible d'être présente dans le susdit échantillon est connue ou inconnue. 30 Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle l'espèce à laquelle appartient l'algue de ladite molécule d'ADN d'algue susceptible d'être présente dans le susdit échantillon est connue ou inconnue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides 35 (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite détection et/ou identification d'une algue est effectuée par hybridation dans des conditions de stringence suffisantes pour l'amplification de ladite région variable du gène LSU d'une algue. 12 L'expression « conditions de stringence suffisantes » signifie par exemple une température d'hybridation de 50-60°C, notamment 53-58°C, et plus particulièrement 53°C, 55°C, 58°C dans un tampon d'amplification d'une concentration saline comprise de 0,001 à 0,5M notamment comprenant du MgC12 2mM. 5 Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite hybridation dans des conditions de stringence suffisantes comprend ou consiste en une hybridation des susdits premier et deuxième oligonucléotides avec: - des séquences de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides 10 contigus choisies dans les séquences de SEQ ID NO:1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 5 et SEQ ID NO: 6 du gène LSU d'une algue, à une température de 50-60°C, notamment 5358°C et plus particulièrement 53°C, 55°C ou 58°C dans un tampon d'amplification d'une concentration saline comprise de 0,001 à 0,5M notamment comprenant du MgC12 2mM. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides 15 (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite hybridation dans des conditions de stringence suffisantes comprend ou consistent en une hybridation des susdits premier et deuxième oligonucléotides avec: -des séquences de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisies dans les séquences de SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 7 20 et SEQ ID NO: 8 du gène LSU d'une algue, à une température de 50-60°C, notamment 55°C dans un tampon d'amplification d'une concentration saline comprise de 0,001 à 0,5M notamment comprenant du MgC12 2mM. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite amplification d'au moins une région 25 variable du gène LSU d'une algue comprend ou consiste en la répétition du cycle comprenant ou constitué de : - une étape d'hybridation d'au moins une molécule d'ADN simple brin d'algue, issue de la dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un échantillon susceptible de contenir au moins une algue, avec au moins une amorce constituée par un des 30 deux oligonucléotides formant la susdite paire d'oligonucléotides. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides susmentionnée, dans laquelle ladite amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue comprend ou consiste en la répétition du cycle comprenant ou constitué de : - une étape d'hybridation d'au moins une molécule d'ADN simple brin d'algue, issue de la 35 dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un échantillon susceptible de contenir au moins une algue, avec au moins une amorce constituée par un des deux oligonucléotides formant la susdite paire d'oligonucléotides, 13 - une étape d'élongation du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algues, par l'ADN polymérase, à partir de la susdite amorce, afin d'obtenir un produit d'amplification constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue. 5 Le produit d'amplification correspond ici à la région variable amplifiée du gène LSU d'une algue qui constitue un marqueur dit « court » au sens de la présente invention. Dans un aspect particulier de l'invention, l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides susmentionnée, comprenant ou consistant en la répétition dudit cycle comprenant ou étant constitué d'une étape d'hybridation et d'une étape d'élongation, doit également s'entendre comme un procédé 10 d'amplification. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides susmentionnée, dans laquelle ladite amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue comprend ou consiste en la répétition du cycle comprenant ou constitué de: - une étape de dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un 15 échantillon susceptible de contenir au moins une algue afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d'algue, - une étape d'hybridation d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algue avec au moins une amorce constituée par un des deux oligonucléotides formant la susdite paire d'oligonucléotides, 20 - une étape d'élongation du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algue, par l'ADN polymérase, à partir de la susdite amorce, afin d'obtenir un produit d'amplification constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides 25 (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue comprend ou consiste en la répétition du cycle comprenant ou constitué de: - une étape d'hybridation de deux molécules d'ADN simple brin d'algue, issues de la dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un échantillon 30 susceptible de contenir au moins une algue, avec deux amorces constituées par les deux oligonucléotides formant la susdite paire d'oligonucléotides. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue comprend ou consiste en la répétition du cycle comprenant ou 35 constitué de: - une étape d'hybridation de deux molécules d'ADN simple brin d'algue, issues de la dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un échantillon 14 susceptible de contenir au moins une algue, avec deux amorces constituées par les deux oligonucléotides formant la susdite paire d'oligonucléotides, - une étape d'élongation des brins complémentaires des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algues, par l'ADN polymérase, à partir des susdites amorces, afin d'obtenir un 5 produit d'amplification constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue comprend ou consiste en la répétition du cycle comprenant ou 10 constitué de: - une étape de dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un échantillon susceptible de contenir au moins une algue afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d'algue, - une étape d'hybridation de deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algues avec deux 15 amorces constituées par les deux oligonucléotides formant la susdite paire d' oligonucléotides, - une étape d'élongation des brins complémentaires des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algues, par l'ADN polymérase, à partir des susdites amorces, afin d'obtenir un produit d'amplification constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une 20 algue. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d' oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, dans laquelle ladite répétition du cycle est une répétition d'au moins 25 cycles, notamment 40 cycles et plus particulièrement 49, 50 ou 51 cycles. L'expression « au moins 25 cycles » signifie par exemple 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 25 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50 ou 51 cycles. Dans un aspect particulier, l'invention concerne l'utilisation d'une paire d'oligonucléotides (amorces d'amplification) susmentionnée, pour la détection et/ou l'identification d'une algue appartenant à l'embranchement des Chlorophyta, à l'exception des algues de l'ordre des Bryopsidales. La présente invention a pour autre objet un oligonucléotide (amorce d'amplification) ayant 30 une taille comprise de 15 à 45 nucléotides, notamment de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, ledit oligonucléotide comprenant ou étant constitué par une séquence complémentaire d'une séquence choisie parmi: - SEQ ID NO: 1, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 35 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 1, ou 15 - SEQ ID NO: 2, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 2, ou - SEQ ID NO: 5, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 5 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 5, ou - SEQ ID NO: 6, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 6. 10 Ces oligonucléotides correspondent aux séquences cibles des amorces de la présente invention. Dans un aspect encore plus particulier, la présente invention concerne également un oligonucléotide (amorce d'amplification) ayant une taille comprise de 15 à 45 nucléotides, notamment de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, ledit oligonucléotide 15 comprenant ou étant constitué par une séquence choisie parmi : - SEQ ID NO : 1, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80% avec ladite séquence de SEQ ID NO : 1, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%, ou - SEQ ID NO : 2, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80% avec ladite séquence de SEQ ID NO : 2, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. 20 Dans un aspect encore plus particulier, la présente invention concerne également un oligonucléotide (amorce d'amplification) ayant une taille comprise de 15 à 45 nucléotides, notamment de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, ledit oligonucléotide comprenant ou étant constitué par une séquence choisie parmi : - SEQ ID NO : 5, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80% avec 25 ladite séquence de SEQ ID NO : 5, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%, ou - SEQ ID NO : 6, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80% avec ladite séquence de SEQ ID NO : 6, notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. L'expression « une taille de 15 à 45 nucléotides » signifie une taille de 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44 ou 45 30 nucléotides. La présente invention a pour autre objet un oligonucléotide (amorce d'amplification) ayant une taille comprise de 15 à 30, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, choisi dans la séquence de SEQ ID NO: 7 ou SEQ ID NO: 8 comprenant ou étant constituée par une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 35 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 41, ou 16 choisi dans la sequence de SEQ ID NO: 3 ou SEQ ID NO: 4 comprenant ou étant constituée par une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, 5 SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec lesdites séquences. 10 La présente invention a pour autre objet une paire d'oligonucléotides ayant une taille comprise de 15 à 30, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, lesdites paires étant constituées des couples d'oligonucléotides choisis parmi les couples de séquences: - SEQ ID NO: 3 et une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 4, et notamment choisie parmi SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ 15 ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70 ou - SEQ ID NO: 4 et une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 3, et notamment choisie parmi SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO : 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO : 46, SEQ ID NO : 47, SEQ ID NO : 48, SEQ ID NO : 49, SEQ ID NO : 50, 20 SEQ ID NO : 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO : 53, SEQ ID NO : 54, SEQ ID NO : 55, SEQ ID NO : 56, SEQ ID NO : 57, ou - SEQ ID NO: 7 et une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 8, et notamment choisie parmi SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO : 36, SEQ ID NO : 37, SEQ ID NO: 38, 25 SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO : 41, ou - SEQ ID NO: 8 et une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 7, et notamment choisie parmi SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 29. 30 Ces oligonucléotides correspondent aux séquences des couples des amorces de la présente invention. Dans un aspect encore plus particulier, la présente invention concerne les couples d'amorces suivants: - une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence SEQ ID NO: 3, et 35 notamment choisie parmi SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 17 57, et une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence SEQ ID NO: 4, et notamment choisie parmi SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, 5 - et notamment la paire SEQ ID NO: 42 et SEQ ID NO: 58. Dans un aspect encore plus particulier, la présente invention concerne les couples d'amorces suivants: - une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence SEQ ID NO: 7 et notamment choisie parmi SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ 10 ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO : 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO : 41, ou - SEQ ID NO: 8 et une séquence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 7, et notamment choisie parmi SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 28, 15 SEQ ID NO: 29, - et notamment la paire SEQ ID NO: 20 et SEQ ID NO: 30. Ces oligonucléotides correspondent aux séquences des couples des amorces LSU de la présente invention. La présente invention a pour autre objet un polynucléotide (un marqueur de détection et/ou 20 d'identification d'une algue) ayant une taille inférieure ou égale à 220 nucléotides, notamment inférieure ou égale à 190, 180 et notamment 178 nucléotides, ledit marqueur comprenant ou étant constitué par une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, ou 100% avec une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ 25 ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, et SEQ ID NO: 19. Ces polynucléotides correspondent aux séquences des régions amplifiées selon la présente invention. La présente invention a pour autre objet l'utilisation d'au moins une région variable du gène 30 LSU d'une algue pour la détection et/ou l'identification d'une algue, dans laquelle ladite région variable constitue un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue et est située aux positions: - 267 à 410 sur le gène LSU des algues chez Fucus vesiculosus. Les positions données sur le gène LSU s'entendent par rapport aux séquences générées: la 35 séquence SEQ ID NO: 71 pour le gène LSU chez Fucus vesiculosus (la position 1 correspond au premier nucléotide suivant l'amorce T16N). 18 Les positions d'intérêt sur le gène LSU, pour les espèces autres que Fucus vesiculosus sont communiquées dans le Tableau 3 ci-après. Dans un aspect particulier, dans ladite utilisation d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue pour la détection et/ou l'identification d'une algue, dans laquelle ladite région variable 5 constitue un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue et est un polynucléotide ayant une taille inférieure ou égale à 220 nucléotides, notamment inférieure ou égale à 178 nucléotides, ladite région variable du gène LSU d'une algue comprend ou est constituée par une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, et SEQ ID NO: 19, 10 La présente invention a pour autre objet un procédé d'amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue, ladite région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue, comprenant ou étant constitué des étapes suivantes: a) une étape d'extraction du matériel nucléique d'un produit ou échantillon susceptible de contenir une algue, 15 b) une étape d'amplification de ladite région variable du gène LSU d'une algue, en utilisant -une première paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 1 du gène LSU d'une algue et un deuxième oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides 20 contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 2 du gène LSU d'une algue, ou -une deuxième paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 5 du gène LSU d'une algue et le deuxième oligonucléotide s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie 25 dans la séquence de SEQ ID NO: 6 du gène LSU d'une algue, c) une étape de détermination ou d'identification de la présence d'une algue dans ledit produit ou échantillon par la détection d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue. L'expression « afin d'obtenir éventuellement au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue » signifie que le procédé d'amplification peut permettre d'obtenir au moins une 30 région variable amplifiée du gène LSU d'une algue, ou peut ne pas permettre d'obtenir au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue. Dans ce dernier cas, la non-obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue signifie qu'il n'y a pas d'ADN d'algue dans l'échantillon testé. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification d'au 35 moins une région variable du gène LSU d'une algue, ladite région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue, comprenant ou étant constitué des étapes suivantes : 19 a) une étape d'hybridation, dans des conditions de stringence suffisantes pour l'amplification de ladite région variable du gène LSU d'une algue, de deux molécules d'ADN simple brin d'algue, issue de la dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un échantillon susceptible de contenir au moins une algue, avec deux amorces constituées par les paires d'oligonucléotides choisies 5 parmi : - un premier oligonucléotide s'hybridant à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 1 du gène LSU d'une algue et un deuxième oligonucléotide s'hybridant à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence 10 de SEQ ID NO: 2 du gène LSU d'une algue, ou - un premier oligonucléotide s'hybridant à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 5 du gène LSU d'une algue et un deuxième oligonucléotide s'hybridant à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence 15 de SEQ ID NO: 6 du gène LSU d'une algue afin d'obtenir éventuellement au moins une région variable amplifiée du LSU d'une algue. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend après ladite étape d'hybridation une étape d'élongation du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin 20 d'algue, par l'ADN polymérase, à partir de la susdite amorce, afin d'obtenir au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend après ladite étape d'hybridation une étape d'élongation de chacun des brins complémentaires des deux susdites molécules d'ADN simple brin 25 d'algue, par l'ADN polymérase, à partir des susdites amorces, afin d'obtenir deux régions variables amplifiées du gène LSU d'une algue. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend avant ladite étape d'hybridation une étape de dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue provenant d'un échantillon susceptible de 30 contenir au moins une algue, afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d'algue. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ladite étape de dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue est effectuée à une température d'environ 95°C pendant environ 30 secondes. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification 35 susmentionné, dans lequel ladite étape d'hybridation est effectuée à une température d'environ 50- 60°C, notamment d'environ 53-55°C pendant environ 30 secondes. Le terme « 50-60°C » signifie 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60°C. 20 L'expression « environ 50-60°C » signifie que des valeurs proches de 50°C ou 60°C, telles que 49°C ou 61°C sont également comprises dans la portée de l'invention. L'expression « environ 30 secondes » signifie 30 secondes ou des valeurs proches de 30 secondes, telles que 29 secondes ou 31 secondes. 5 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ladite étape d'hybridation est effectuée à une température d'environ 5060°C, notamment environ 55°C pendant environ 30 secondes. Dans cet aspect particulier, ce sont les amorces LSU qui sont utilisées. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification 10 susmentionné, dans lequel ladite étape d'élongation est effectuée à une température d'environ 72°C pendant environ 1 minute. Bien entendu la durée d'hybridation, la durée d'élongation et les températures d'hybridation et d'élongation dépendent de la longueur du fragment à amplifier et de la vitesse de l'enzyme, et peuvent être adaptées en fonction de la polymérase utilisée. Dans le cas de la présente invention les durées et 15 températures sont données en référence à la Taq polymérase utilisée (Hot start FIREPo1; Solis). L'expression « environ 72°C» signifie 72°C ou des valeurs proches de 72°C, telles que 71°C ou 73°C. L'expression «environ 1 minute» signifie 60 secondes ou des valeurs proches de 60 secondes, telles que 59 secondes ou 61 secondes. 20 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ladite étape de dénaturation est précédée d'une étape de dénaturation initiale d'une molécule d'ADN double brin d'algue afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 95°C pendant environ 10 minutes. Cette étape de dénaturation a pour objectif d'activer l'enzyme et de dénaturer la molécule 25 d'ADN. Cette étape peut être optionnelle, en ce sens que certaines enzymes peuvent se passer de cette étape de dénaturation initiale. La durée et température de cette étape de dénaturation dépendent de la polymérase utilisée (Taq polymérase - Hot start FIREPo1; Solis dans le cas de la présente invention). L'expression « environ 95°C» signifie 95°C ou des valeurs proches de 95°C, telles que 94°C 30 ou 96°C. L'expression « environ 10 minutes » signifie 10 minutes (ou 600 secondes) ou des valeurs proches de 600 secondes, telles que 550 secondes, 559 secondes, 610 secondes ou 601 secondes. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ladite étape d'élongation est suivie d'une étape d'élongation finale du brin 35 complémentaire d'au moins une des susdites molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 72°C pendant environ 7 minutes. 21 L'expression « environ 7 minutes» signifie 7 minutes (ou 420 secondes) ou des valeurs proches de 420 secondes, telles que 410 secondes, 419 secondes, 430 secondes ou 429 secondes. La durée et température de cette étape d'élongation finale dépendent de la polymérase utilisée (Taq polymérase - Hot start FIREPo1 ; Solis dans le cas de la présente invention). 5 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ladite étape d'élongation finale est suivie d'une étape de diminution de la température au cours de laquelle la température est diminuée à une température d'environ 10°C. L'expression « environ 10°C » signifie 10°C ou des valeurs proches de 10°C, telles que 9°C ou 11°C. 10 Cette diminution de température a pour objectif de stopper la réaction enzymatique, ramener l'échantillon à une température convenable pour travailler (sans se brûler) et conserver l'échantillon si jamais nécessaire. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé d'amplification d'au moins une région variable du gène LSU 15 comprend ou est constitué des étapes suivantes : - ladite étape de dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue, à une température d'environ 95°C pendant environ 30 secondes, afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d'algue, - ladite étape d'hybridation d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin, à 20 une température d'environ 50-60°C, notamment environ 53-55°C pendant environ 30 secondes, - ladite étape d'élongation du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 72°C pendant environ 1 minute, afin d'obtenir au moins une région variable amplifiée du gène LSU. 25 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé d'amplification d'au moins une région variable du gène LSU comprend ou est constitué des étapes suivantes : - ladite étape de dénaturation initiale d'une molécule d'ADN double brin, à une température de 95°C pendant 10 minutes, suivie de ladite étape de dénaturation d'une molécule d'ADN double brin 30 d'algue, à une température d'environ 95°C pendant environ 30 secondes, afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d'algue, - ladite étape d'hybridation d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin, à une température d'environ 50-60°C, notamment environ 53-55°C pendant environ 30 secondes, - ladite étape d'élongation du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites 35 molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 72°C pendant environ 1 minute, suivie de ladite étape d'élongation finale du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites 22 molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 72°C pendant environ 7 minutes, afin d'obtenir au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue, - ladite étape de diminution de la température à une température d'environ 10°C. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification 5 susmentionné, dans lequel ledit procédé d'amplification d'au moins une région variable du gène LSU comprend ou est constitué des étapes suivantes : - ladite étape de dénaturation d'une molécule d'ADN double brin d'algue, à une température d'environ 95°C pendant environ 30 secondes, afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d' algue, 10 - ladite étape d'hybridation d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin, à une température d'environ 50-60°C, notamment environ 55°C pendant environ 30 secondes, - ladite étape d'élongation du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 72°C pendant environ 1 minute, afin d'obtenir au moins une région variable amplifiée du gène LSU. 15 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé d'amplification d'au moins une région variable du gène LSU comprend ou est constitué des étapes suivantes : - ladite étape de dénaturation initiale d'une molécule d'ADN double brin, à une température d'environ 95°C pendant environ 10 minutes, suivie de ladite étape de dénaturation d'une molécule 20 d'ADN double brin d'algue, à une température d'environ 95°C pendant environ 30 secondes, afin d'obtenir deux molécules d'ADN simple brin d'algue, - ladite étape d'hybridation d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin, à une température d'environ 50-60°C, notamment environ 55°C pendant environ 30 secondes, - ladite étape d'élongation du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites 25 molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 72°C pendant environ 1 minute, suivie de ladite étape d'élongation finale du brin complémentaire d'au moins une des deux susdites molécules d'ADN simple brin d'algue, à une température d'environ 72°C pendant environ 7 minutes, afin d'obtenir au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue, - ladite étape de diminution de la température à une température d'environ 10°C. 30 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend l'obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue. Dans un aspect encore plus particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend l'obtention d'au moins une région 35 variable amplifiée du gène LSU d'une algue. 23 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé ne permet pas l'obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue. Dans un aspect encore plus particulier, la présente invention concerne un procédé 5 d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé ne permet pas l'obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend une étape de détection de ladite obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue afin d'obtenir une région variable 10 amplifiée et détectée du gène LSU d'une algue. Dans un aspect encore plus particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend une étape de détection de ladite obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue afin d'obtenir une région variable amplifiée et détectée du gène LSU d'une algue. 15 Ladite étape de détection d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue peut se faire par diverses techniques, notamment par électrophorèse. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit procédé comprend une étape d'identification d'une algue par séquençage de ladite région variable amplifiée et détectée du gène LSU d'une algue afin d'obtenir une 20 région variable amplifiée séquencée. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit séquençage est un séquençage capillaire ou un séquençage NGS (Next Generation-Sequencing). Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification 25 susmentionné, dans lequel ledit séquençage permet d'identifier l'embranchement auquel appartient l'algue par comparaison entre ladite région variable amplifiée séquencée et une séquence de référence. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit séquençage permet d'identifier la classe à laquelle appartient l'algue par comparaison entre ladite région variable amplifiée séquencée et une séquence de référence. 30 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit séquençage permet d'identifier l'ordre auquel appartient l'algue par comparaison entre ladite région variable amplifiée séquencée et une séquence de référence. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit séquençage permet d'identifier la famille à laquelle appartient l'algue 35 par comparaison entre ladite région variable amplifiée séquencée et une séquence de référence. 24 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel ledit séquençage permet d'identifier le genre appartient l'algue par comparaison entre ladite région variable amplifiée séquencée et une séquence de référence. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification 5 susmentionné, dans lequel ledit séquençage permet d'identifier l'espèce à laquelle appartient l'algue par comparaison entre ladite région variable amplifiée séquencée et une séquence de référence. Dans un aspect particulier, ladite séquence de référence est choisie parmi les séquences suivantes SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, et SEQ ID NO: 19. 10 Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel la nature de l'échantillon est connue ou non. Dans un aspect particulier, la présente invention concerne un procédé d'amplification susmentionné, dans lequel l'échantillon est un mélange d'algues, un mélange d'algues et de plantes, un produit à base d'algues, un produit à base d'algues et de plantes, un produit qui contient au moins 15 une algue processée, un extrait d'algue, un produit qui ne contient pas d'algue, un échantillon de plante sans algue, un mélange sans algue, une algue pure ou un fragment d'algue pure ayant une molécule d'ADN dont la taille est inférieure ou égale à 220 nucléotides, notamment 200 nucléotides. Dans un aspect particulier, les marqueurs dits courts selon la présente invention sont notamment utilisés pour analyser des échantillons d'ADN contenant une molécule d'ADN dont la 20 taille est inférieure ou égale à 220 nucléotides. 25 Domaine Regne Embranchement Classe Ordre Famille Espèce Eubacteria Bacteria Cyanobacteria (Cyanobactéries) Cyaniphyceae Oscillatoriales Phormidiaceae Arthrospira sp. Eukaryota Chromista Dinophyta Dinophyceae Suessiales Suessiaceae Symiodinium microadriaticum (Dinoflagellées) Ochrophyta (Algues brunes) Phaeophyceae Fucales Fucaceae Fucus vesiculosus Excavata Euglenozoa (Euglénides) Euglenophyceae Eutreptiales Eutreptiaceae Eutreptiella gymnastica Plantae Charophyta (Charophytes) Charophyceae Charales Characeae Chara sp. Chlorophyta (Algues vertes) Trebouxiophyceae Chlorellales Chlorellaceae Chlorella vulgaris Rhodophyta (Algues rouges) Florideophyceae Palmariales Palmariaceae Palmaria palmata Tableau 1 : Exemple de classification d'algues 26 Numéro Précisions des Séquences de la espèces ou séquence Divers SEQ ID NO : 1 Cible sur le gène LSU-END GATGGTTCGATTAGTCTTTCGCCCCTATAC SEQ ID NO : 2 Cible sur le gène LSU-END CTCGACCTATTCTCAAACTTTAAATG SEQ ID NO : 3 Régions des amorces LSUEND GTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATC SEQ ID NO : 4 Régions des amorces LSUEND CATTTAAAGTTTGAGAATAGGTCGAG SEQ ID NO : 5 Cible sur le gène LSU TAGACTCCTTGGTCCGTGTTTCAAGACGGG SEQ ID NO : 6 Cible sur le gène LSU GACCCGAAAGATGGTGAACTATGC SEQ ID NO : 7 Régions des amorces LSU CCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTA SEQ ID NO : 8 Régions des amorces LSU GCATAGTTCACCATCTTTCGGGTC SEQ ID NO : 9 Symbiodinum microadriaticum GCGTTGAAAATATTCTTGTGGGAGTATTGGAGCCATTAGTGAGATACCAC TCTTCTAATGTTAGATTTCTAACTTTGAATCATTATCTGGTCAAAGAACAG TTTCAGGCGGGC SEQ ID NO : 10 Fucus vesiculosus AAGGAGTCTAGCACTACTGCGAGTCGAAAGGTTACTAAACCTAGAGGCAC AGTGAAAGCGAATATTGGGAAATCGAAAACAGATTAGGGAGGTGTTGCGA CTTTGTCAAAATATCCTACCCAGAGCAGTTGTGCTGGGA SEQ ID NO: 11 Palmaria palmata AAGGAGTCTAACATGCCCGCGAGTACAGGGGTGGCAAACCCCCGTGCGCA GTGAAAGTGAATGCAGGTGGGACGCCITCCTTTTAAAGGGAGGCTGCACC ATCGACCGACCGTGGCCCTCCGGGGTCGAGGTTTGAGTGTGAGCGCGTATG 27 TTGGGA SEQ ID NO : 12 Arthrospira platensis GCTGTGAAGAATTCCTTGTGGGGGATTCTGAGCCATCGGTGAGATACCACTCT GGCGAAGCTAGAATTCTAACCTTTTCCCGTTATCCGGGAAAGAGACAGTTTCA GGGGGGC SEQ ID NO : 13 Arthrospira platensis GCTGTGAAGAATTCCTTGTGGGGGATTCTGAGCCATCGGTGAGATACCACTCT GGCGAGGCTAGAATTCTAACCITTTCCCGTTATCCGGGAAAGAGACAGTTTCA GGGGGGC SEQ ID NO : 14 Eutreptiella gymnastica GCTTTGAAGAATTCTTTCGGGAATATCTGAGCTGTTAGTGAGATACCATTCTAG GAGAGTTAGAAATCTAAAGACAGTTCTTGAATCAGAATG FITGACAGTTTCAG GCGGGC SEQ ID NO : 15 Eutreptiella gymnastica GCTTTGAAGAATTCITTCGGGAATATCTGAGCTGTTAGTGAGATACCATTCTGG GAGAGITAGAAATCTAAAGACAGTTCTTGAATCAGAATGTTTGACAGITTCAG GCGGGC SEQ ID NO : 16 Chara sp. TAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCTGGAGCTGTTGAACAG T1TTATCGGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTCGGGGGTGAAACACCC SEQ ID NO : 17 Chlorella vulgaris TAGTAGCTGGTT'CCCTCCGAAGTTTCCCCCAGGATAGCTGGAGCTCGTTTCAGTC GACTCGGGTAAAGCGAATGATTAGGCGCTCAGGGGATGAAACATCC SEQ ID NO : 18 Fucus TAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAATTTCCCTCAGGATAGCTGCAATCGITGTTCAGT TTTATCAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCTGCGGGGGAGTAACTCCC vesiculosus SEQ ID NO : 19 Eutreptiella gymnastica TAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCTGGAGTTGAACAGTTTT ATCAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGAATCGGGGGCGTGTTGITC SEQ ID NO : 20 Amorce LSU CCCGTCTTGAAACACGGACC SEQ ID NO : 21 Amorce LSU CCCGTCTTGAAACACGGA SEQ ID NO : 22 Amorce LSU CCCGTCTTGAAACACGGAC SEQ ID NO : 23 Amorce LSU CCCGTCTTGAAACACGGACCA SEQ ID Amorce LSU CCCGTCTTGAAACACGGACCAA 28 NO : 24 SEQ ID NO : 25 Amorce LSU CCCGTCTTGAAACACGGACCAAG SEQ ID NO : 26 Amorce LSU CCCGTCTTGAAACACGGACCAAGG SEQ ID NO : 27 Amorce LSU CACGGACCAAGGAGTCTA SEQ ID NO : 28 Amorce LSU TTGAAACACGGACCAAGGAGTCTA SEQ ID NO : 29 Amorce LSU AACACGGACCAAGGAGTCT SEQ ID NO : 30 Amorce LSU AGTTCACCATCTTTCGGG SEQ ID NO : 31 Amorce LSU GCATAGTTCACCATCTTT SEQ ID NO : 32 Amorce LSU GCATAGTTCACCATCTTTC SEQ ID NO : 33 Amorce LSU GCATAGTTCACCATCTTTCG SEQ ID NO : 34 Amorce LSU GCATAGTTCACCATCTT'TCGG SEQ ID NO : 35 Amorce LSU GCATAGTTCACCATCTTTCGGG SEQ ID NO : 36 Amorce LSU GCATAGTTCACCATCTTTCGGGT SEQ ID NO : 37 Amorce LSU GCATAGTTCACCATCTTTCGGGTC SEQ ID NO : 38 Amorce LSU TTCACCATCTTTCGGGTC 29 SEQ ID NO : 39 Amorce LSU CATAGTTCACCATCTTTCGG SEQ ID NO : 40 Amorce LSU AMAAGTACCRYGAGGGAAAG SEQ ID NO : 41 Amorce LSU SCWCTAATCATTCGCTTTACC SEQ ID NO : 42 Amorce LSU- END GAAAGACTAATCGAACCATC SEQ ID NO : 43 Amorce LSU- END GTATAGGGGCGAAAGACTAATCGA SEQ ID NO : 44 Amorce LSU- END GTATAGGGGCGAAAGACTAATCG SEQ ID NO : 45 Amorce LSU- END GTATAGGGGCGAAAGACTAATC SEQ ID NO : 46 Amorce LSU- END GTATAGGGGCGAAAGACTAAT SEQ ID NO : 47 Amorce LSU- END GTATAGGGGCGAAAGACTA SEQ ID NO : 48 Amorce LSU- END GTATAGGGGCGAAAGACT SEQ ID NO : 49 Amorce LSU- END GTATAGGGGCGAAAGACTAA SEQ ID NO : 50 Amorce LSU- END TATAGGGGCGAAAGACTAAT SEQ ID NO : 51 Amorce LSU- END ATAGGGGCGAAAGACTAATC SEQ ID NO : 52 Amorce LSU- END TAGGGGCGAAAGACTAATCG SEQ ID Amorce LSU- AGGGGCGAAAGACTAATCGA 30 NO : 53 END SEQ ID NO : 54 Amorce LSU- END GGGCGAAAGACTAATCGAAC SEQ ID NO : 55 Amorce LSU- END GGCGAAAGACTAATCGAACC SEQ ID NO : 56 Amorce LSU- END GCGAAAGACTAATCGAACCA SEQ ID NO : 57 Amorce LSU- END CGAAAGACTAATCGAACCAT SEQ ID NO : 58 Amorce LSU- END AAAGTTTGAGAATAGGTCGA SEQ ID NO : 59 Amorce LSU- END CATTTAAAGTTTGAGAATAGGTCG SEQ ID NO : 60 Amorce LSU- END CATITAAAGTTTGAGAATAGGTC SEQ ID NO : 61 Amorce LSU- END CATTTAAAGTTTGAGAATAGGT SEQ ID NO : 62 Amorce LSU- END CATTTAAAGTTTGAGAATAGG SEQ ID NO : 63 Amorce LSU- END CATTTAAAGTTTGAGAATA SEQ ID NO : 64 Amorce LSU- END CA1-11AAAGTTTGAGAAT SEQ ID NO : 65 Amorce LSU- END CATTTAAAGTTTGAGAATAG SEQ ID NO : 66 Amorce LSU- END A'111AAAG1 1 IGAGAATAGG SEQ ID NO : 67 Amorce LSU- END TTTAAAGTTTGAGAATAGGT 31 SEQ ID NO : 68 Amorce LSU- END TTAAAGTTTGAGAATAGGTC SEQ ID NO : 69 Amorce LSU- END TAAAGTTTGAGAATAGGTCG SEQ ID NO : 70 Amorce LSU- END AAGIIIGAGAATAGGTCGAG SEQ ID NO : 71 Fucus vesiculosus ATGCAAAGATCTWWRRAAMKAGWGWGAAAGAGTGCCTGAAATTGCTGAAAGGAAGC GAAGGATTATCAGTGTCTGGCGGTTCCGCTTCTCCTGCGTTCCTCGGAACGCTGGATCGC GTTTCCGTCGTGGTCAGTGCCGGCTAGCTTTGCGGGAGCCTGCGTCACGGGAGGTACGTC TCCTCGGAGATGGAATGCCGTGGCGTGTCGTCGCGAGGCTGGCCGGTCCTGACGAAATGG TATTCTTCACCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGCCCGCGAGTACAGGG GCGAAAAACCCCCGTGCGCAGTGAAAGTGAATGCAGGTGGGAAGCGCAAGCGGCACCAT CGACCGACCATGTCTCTTCGGGGGCGAGGTTTGAGTGTGAGCGTGCATGITGGGACCCGA AAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGGGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGT AGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTGAGATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGA ACCATCTAGTAGCTGGITCCCTCCGAAATTCCCTCAGGATAGCTGCAATCGITGTTCAGTTT TATCA Tableau 2 : Tableau récapitulatif des séquences selon la présente invention 32 Espèce : Positions sur le gène LSU : Positions sur le gène LSU- END : Chara sp. 323 à 465 595 à 698 Chlorella vulgaris Eutreptiella gymnastica Fucus vesiculosus 267 à 410 541 à 643 Palmaria palmata 235 à 364 Athrospira platensis Symbiodinium microadriaticum 312 à 444 Tableau 3: Positions d'intérêt sur les gènes LSU et LSU-END 5 L'invention sera mieux illustrée par les exemples suivants. Les exemples ci-après visent à éclaircir l'objet de l'invention et illustrer des modes de réalisation avantageux, mais en aucun cas visent à restreindre la portée de l'invention. Exemple 1 : Méthode avec des produits à base d'algues 10 Extraction d'ADN: Sur produits à base d'algue : L'ADN a été extrait des produits à base d'algue en utilisant un protocole adapté du kit DNeasy Blood and Tissue kit (Qiagen). 15 Amplification PCR : Sur produits à base d'algue : Les ADNs extraits des produits à base d'algue ont été amplifiés pour deux marqueurs génétiques à l'aide des amorces correspondantes (Tableau 4). Une étiquette de 8 bases est ajoutée du côté 5' de l'amorce afin de créer un système de « multiplexage » et de permettre l'assignation des séquences à 20 leurs échantillons respectifs. Marqueur : Amorces : Température d'hybridation : Amorce sens : Amorce antisens : LSU LSU_fl SEQ ID NO : 20 LSU _r1 SEQ ID NO : 30 55°C LSU-END LSU- ENDfl SEQ ID NO : 42 LSU- END r1 SEQ ID NO : 58 60°C Tableau 4 : Liste des amorces utilisées au cours de l'étude sur les produits à base d'algue Le mélange réactionnel utilisé pour l'amplification a été préparé comme suit : tampon : 1X ; MgC12 : 2 mM ; dNTP : 0,2 mM chacun; amorces: 0,2 µM chacune; BSA: 0,16 mg.i.LL-1; Taq Polymérase (Hot 33 start FIREPol ; Solis): 2 unités; 3 lit d'ADN; pour un volume final de 25 ItL. Il a ensuite été amplifié sur un thermocycleur (T100, Biorad) en utilisant le programme défini en Tableau 5. rogramme PCR énaturation initiale 95°C I 10 min ombre de cycle 50 énaturation 95°C 30 s ybridation voir tableau 4 30 s ' longation 72°C 1 min longation finale 72°C 7 min in 10°C Tableau 5 : Programme d'amplification des marqueurs génétiques sur produits à base d'algue 5 Séquençage : Sur produits à base d'algue: Les produits d'amplification ont été analysés par électrophorèse capillaire (QTAxcel DNA Screening kit, Qiagen). Les marqueurs ayant été correctement amplifiés ont ensuite été purifiés avec le kit 10 NucleoSpin Gel and PCR Clean-up (Macherey-Nagel) et dosés au spectrophotomètre SimpliNano 4285 v2.0.0 (GE HealthCare). Les échantillons ont ensuite été poolés et normalisés. La librairie à séquencer est préparée à partir du Truseq PCR-free library preparation Kit (Illumina). Le séquençage en paired-end 2x150 bp a été réalisé sur séquenceur nouvelle génération HiSeq (Illumina). 15 34 Exemple 2 : Démarche avec les marqueurs courts Typologie de produit : Extraction : Marqueurs à utiliser : Type de séquençage : Résultats attendus : Algues en mélange Extraction avec le « protocole produit » Amplification du marqueur LSU-END court (possibilité de rajouter le marqueur LSU court) puis électrophorèse et purification Séquençage NGS Détermination de l'embranchement, de la famille, voire le genre Produits à base d'algues Extraction avec le « protocole produit » Amplification du marqueur LSU-END court (possibilité de rajouter le marqueur LSU court) puis électrophorèse et purification Séquençage NGS Détermination de l'embranchement de la famille, voire le genre Produits à base d'algues et de plantes Extraction avec le « protocole produit » Amplification du marqueur LSU-END court (possibilité de rajouter le marqueur LSU court) puis électrophorèse et purification Séquençage NGS Détermination de l'embranchement de la famille, voire le genre 5 35 Exemple 3 : Exemple avec des produits à base d'algue Extraction d'ADN : L'ADN des 13 produits à base d'algues a été extrait en utilisant un protocole adapté du kit DNeasy 5 Blood and Tissue kit (Qiagen). Amplification PCR : Les ADNs extraits des produits à base d'algues ont été amplifiés pour deux marqueurs génétiques à l'aide des amorces correspondantes (Tableau 1). Une étiquette de 8 bases nucléotidiques est ajoutée du 10 coté 5' de l'amorce afin de créer un système de « multiplexage » et de permettre l'assignation des séquences à leurs échantillons respectifs (COISSAC, Eric, RIAZ, Tiayyba et PUILLANDRE, Nicolas. Bioinformatic Challenges for DNA metabarcoding of plantes and animais. Molecular Ecology, 2012, vol. 21, pp. 1834-1847). Marqueur Amorces Température d'hybridation Amorces sens Amorces antisens LSU LSU il SEQ ID NO: 20 LSU 2.1 SEQ ID NO: 30 55°C LSU-END LSU-END_fl SEQ ID NO: 42 LSU-END r1 SEQ ID NO: 58 60°C 15 Tableau 6 : Liste des amorces utilisées au cours de l'étude sur les produits à base d'algue Le mélange réactionnel utilisé pour l'amplification a été préparé comme suit : tampon : 1X ; MgCl2 : 2 mM ; dNTP : 0,2 mM chacun ; amorces : 0,2 µM chacune ; BSA : 0,16 mg.e-i; Taq Polymérase (Hot start FIREPol ; Solis) : 2 unités ; 3 pL d'ADN ; pour un volume final de 25 pt. L'amplification 20 est ensuite réalisée sur un thermocycleur (T100, Biorad) en utilisant le programme défini en Tableau 2. Programme PCR Dénaturation initiale 95°C 10min Nombre de cycle 50 Dénaturation 95°C 30 s Hybridation voir tableau 1 30 s Élongation 72°C 1 min Élongation finale 72°C 7 min 36 Fin 10°C Tableau 7 : Programme d'amplification des marqueurs génétiques sur produits à base d'algue Séquençage sur produits à base d'algues : Les produits d'amplification ont été analysés par électrophorèse capillaire (QlAxcel, Qiagen). Les 5 marqueurs amplifiés ont ensuite été purifiés avec le kit NucleoSpin Gel and PCR Clean-up (Macherey- Nagel) et dosés par spectrophotométrie (SimpliNano, GE Health care). Les échantillons ont ensuite été poolés et normalisés. La librairie à séquencer est préparée à partir du Truseq PCR-free libraly preparation Kit (Illumina). Le séquençage des amplicons a été réalisé sur un système MiSeq (Illumina). 10 Résultats du séquençage: Les résultats du séquençage nouvelle génération (NGS) sont constitués des différentes séquences génétiques amplifiées dans le produit d'extraction de l'échantillon analysé (Tableau 3). Ces séquences d'ADN proviennent des algues entrant dans la composition initiale du produit et/ou de tissus ou 15 pollens de plantes qui arrivent pendant ou à la fin du processus de fabrication du produit ou lors des transferts et des échantillonnages. Il est à noter que dans les colonnes 'Composition LSU', ne sont reportés que les noms de familles, de genres ou d'espèces d'algues présentes dans l'échantillon d'après la composition annoncée. Par ailleurs, pour chaque famille, genre ou espèce d'algues présentes dans le Tableau 3, plusieurs 20 séquences peuvent avoir été identifiées. Enfin, entre parenthèses sont reportés les numéros d'accessions des séquences correspondant à l'espèce assignée. Pour les assignations à la famille ou au genre, comme un grand nombre de numéros d'accession correspondent à l'assignation, les numéros d'accession ne sont pas reportés dans le tableau. Nom du produit à base d'algue Marque du vendeur Composition annoncée en algues Composition LSU (N° accession) Composition LSUEND (N° accession) Rillettes de maquereaux aux fines algues La Compagnie Bretonne du Poisson farine de kombu (Laminaria digita), algues réhydratées Dulse (Palmaria palmata), Nori (Porphyra), Laitue de mer (Ulva lactuca) CI Chlorophyta Pyropia haitanensis (JN104581) Bezhin (équilibre minéral) Thalado, Le comptoir des Algues poudre de Lithotamne, poudre de Spiruline, poudre d'ulves 0 Chlorophyta Agar-agar (stick) Thalado, Le extraits d'algues Gelidium ID 37 comptoir des rouges Algues Tableau 8 : Résultats du séquençage des produits à base d'algues pour les marqueurs LSU et LSUEND. Le caractère 0 signifie que l'analyse n'a pas été effectuée 38 Exemple 5: Détermination de l'embranchement, l'ordre, la famille, le genre ou l'espèce d'une algue L'algue à analyser avec le marqueur LSU-END est une algue verte. Dans la base de données 5 de référence issue de Genbank, les séquences de Chlorella vulgaris et de Ulva lactuca sont identiques pour le marqueur LSU-END. L'assignation de l'algue à analyser se fera donc conjointement à Chlorella vulgaris et de Ulva lactuca. L'algue Chlorella vulgaris appartient à l'ordre des chlorellales et Ulva lactuca appartient à l'ordre des Ulvales. Les deux algues appartiennent à l'embranchement Chlorophyta. L'assignation de l'algue à analyser se fera 10 donc à l'embranchement Chlorophyta. L'algue à analyser avec le marqueur LSU-END est une algue rouge. Dans la base de données de référence issue de Genbank®, la séquence de chaque espèce de Pyropia est différente pour LSU-END. L'assignation de l'algue à analyser se fera donc à l'espèce Pyropia haitanensis. L'algue à analyser avec le marqueur LSU est une algue rouge. Dans la base de données de 15 référence issue de Genbank®, les séquences de chaque espèce de Gelidium spinosum et Gelidium pulchellum sont identiques pour LSU. L'assignation de l'algue à analyser se fera donc conjointement à Gelidium spinosum et Gelidium pulchellum avec le même pourcentage d'identité. Les deux appartiennent au genre Gelidium. L'assignation de l'algue REVENDICATIONS1. Utilisation d'une paire d'amorces d'amplification pour la détection et/ou l'identification d'une algue dans un échantillon susceptible d'en contenir, par amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue, ladite région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue. 2. Utilisation d'une paire d'amorces d'amplification selon la revendication 1, dans laquelle: une première paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 1 du gène LSU d'une algue et un deuxième oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 2 du gène LSU d'une algue, ou une deuxième paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 5 du gène LSU d'une algue et le deuxième oligonucléotide s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 6 du gène LSUd'une algue. 3. Utilisation d'une paire d'amorces d'amplification selon la revendication 1, dans laquelle ledit premier oligonucléotide ou ledit deuxième oligonucléotide de la première ou de la deuxième paire d'amorces d'amplification s'hybride à sa séquence cible respective choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO:2 , SEQ ID NO: 5, et SEQ ID NO: 6 du gène LSUd'une algue, à une température comprise de 40 à 65°C, et plus particulièrement de 50-60°C et une concentration saline comprise de 0, 001 à 0,5 M, et plus particulièrement de 0.05 à 0,1 M, et encore plus particulièrement de à 0,001 à 0,005M. 4. Utilisation d'une paire d'amorces d'amplification selon la revendication 1 ou 2, dans laquelle - le premier oligonucléotide de la première paire d'amorces d'amplification a une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 3 et le deuxième oligonucléotide a une séquence de 15 à 26 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 4, 30 35 - le premier oligonucléotide de la deuxième paire d'amorces d'amplification a une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 7 et le deuxième oligonucléotide a une séquence de 15 à 24 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 8, 5 pour la détection et/ou l'identification d'une algue dans un échantillon susceptible d'en contenir, par amplification d'au moins une région variable du gène LSU d'une algue, ladite région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue, et dans laquelle ladite algue appartient à l'un des embranchements suivants: Glaucophyta, Cyanobacteria, Dinophyta, Ochrophyta, Euglenozoa, Charophyta, Chlorophyta, ou Rhodophyta. 10 5. Utilisation d'une paire d'amorces d'amplification selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle ladite région variable du gène LSU d'une algue qui est amplifiée a une taille inférieure ou égale à 220 paires de bases, notamment inférieure ou égale à 200, 190, 180 et notamment inférieure ou égale à 178 paires de bases. 15 6. Utilisation d'une paire d'amorces d'amplification selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle ladite région variable du gène LSU d'une algue est représentée par une séquence choisie dans le groupe constitué par: SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 20 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80% avec ladite séquence et notamment 95% et plus particulièrement 98% ou 99%. 7. Amorce d'amplification ayant une taille comprise de 15 à 45 nucléotides, notamment de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, ladite amorce 25 d'amplification comprenant ou étant constituée par une séquence complémentaire d'une séquence choisie parmi: - SEQ ID NO: 1, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 1, ou - SEQ ID NO: 2, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 2, ou - SEQ ID NO: 5, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 5, ou 41 5 une taille comprise de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus, choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 7 ou SEQ ID NO: 8 comprenant ou étant constituée par une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 29, 10 SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 41, OU choisie dans la sequence de SEQ ID NO: 3 ou SEQ ID NO: 4 comprenant ou étant constituée par une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 42 , SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, 15 SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 81%, 82%, 83%, 84%, 20 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% avec lesdites séquences. 9. Marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue ayant une taille inférieure ou égale à 220 nucléotides, notamment inférieure ou égale à 190, 180 et notamment 178 nucléotides, 25 ledit marqueur comprenant ou étant constitué par une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, ou 100% avec une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, et SEQ ID NO: 19. 30 10. Procédé d'amplification d'au moins une région variable du gène LSUd'une algue, ladite région variable constituant un marqueur de détection et/ou d'identification d'une algue, comprenant ou étant constitué des étapes suivantes: a) une étape d'extraction du matériel nucléique d'un produit ou échantillon susceptible de 35 contenir une algue, b) une étape d'amplification de ladite région variable du gène LSU d'une algue, en utilisant - SEQ ID NO: 6, ou une séquence ayant un pourcentage d'identité d'au moins 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 86%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% avec ladite séquence de SEQ ID NO: 6. 8. Amorce d'amplification selon la revendication 6, ladite amorce d'amplification ayant 42 -une première paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 1 du gène LSU d'une algue et un deuxième oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides 5 contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 2 du gène LSU d'une algue, ou -une deuxième paire d'amorces d'amplification consiste en un premier oligonucléotide qui s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 5 du gène LSU d'une algue et le deuxième oligonucléotide s'hybride à une séquence de 15 à 30 nucléotides contigus, de préférence de 18 à 24 nucléotides contigus 10 choisie dans la séquence de SEQ ID NO: 6 du gène LSU d'une algue, c) une étape de détermination ou d'identification de la présence d'une algue dans ledit produit ou échantillon par la détection d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue. 11. Procédé d'amplification selon la revendication 9, dans lequel ledit procédé comprend 15 l'obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue, notamment une étape de détection de ladite obtention d'au moins une région variable amplifiée du gène LSU d'une algue afin d'obtenir une région variable amplifiée et détectée du gène LSUd'une algue, et dans lequel ledit procédé comprend de préférence une étape d'identification d'une algue par séquençage de ladite région variable amplifiée et détectée du gène LSU d'une algue afin d'obtenir une région variable amplifiée séquencée. 20 25