FR 3062133 A1 20180727 FR 1750530 A 20170123 - 1 - « Procédé et appareil de comptage de colonies » Domaine technique La présente invention se rapporte au domaine de la détection de micro-organisme dans un milieu de croissance. L'invention s'applique notamment à l'analyse microbiologique et au contrôle qualité. Elle trouve, en outre, une application dans les domaines de l'environnement, de l'agroalimentaire, de la pharmacologie, de la cosmétologie et de la recherche et du développement. La présente invention concerne en particulier un appareil et une 10 méthode pour le comptage précoce de colonies bactériennes présentes dans des milieux de culture d'un ensemble d'échantillons et pour la gestion automatique de l'analyse continue des échantillons. Etat de la technique antérieure 15 Le comptage de colonies est encore aujourd'hui réalisé, de manière non négligeable, par comptage manuel des colonies observées visuellement dans un milieu de culture ensemencé. On trouve néanmoins dans l'état de la technique, des dispositifs de comptage de colonies basés sur l'acquisition d'images d'un échantillon 20 comportant un milieu de culture préalablement ensemencé puis un traitement des images acquises afin d'en déterminer un nombre de colonies. On connaît ainsi le document EP2807484 qui décrit un dispositif de détection de micro-organismes comprenant un système de détection, de 25 type scanner, agencé pour balayer une zone dans laquelle est comprise les surfaces supérieures d'un ensemble d'échantillons ensemencés, lesdits échantillons étant positionnés côte à côte sur une surface d'un plateau. Les images sont ensuite analysées par un logiciel de traitement d'image afin que des colonies soient identifiées et comptées. Un inconvénient de ce type 30 d'appareil réside dans le fait que chacun des échantillons à analyser est soumis à un éclairage durant tout le temps nécessaire à l'acquisition. Ainsi, lors du comptage de microcolonies photosensibles ou lors de l'utilisation de 3062133 -2 marqueurs photosensibles, il n'est pas possible d'utiliser ce type de dispositif. Un autre inconvénient de ce type de dispositif réside dans le fait que s'il n'est pas doté de système optique permettant d'ajuster la distance 5 focale, il est nécessaire que les supports à milieu de culture soient identiques pour tous les échantillons. Dans le cas où le dispositif dispose d'un système optique permettant d'ajuster la distance focale, le temps nécessaire à l'acquisition de l'ensemble des échantillons va être significativement augmenté. Un but de l'invention est de proposer un appareil et une méthode ayant comme objet de répondre, au moins en partie, aux différents inconvénients précités. Un autre but de l'invention est de diminuer le temps nécessaire au comptage du nombre définitif de colonies présentes dans un milieu de culture ensemencé d'un échantillon. Un autre but de l'invention est de diminuer les taux d'erreurs de 20 comptage. Un autre but de l'invention est de proposer un appareil permettant de charger ou décharger des échantillons sans interrompre, ni interférer avec les analyses d'autres échantillons en cours. 25 Exposé de l'invention A cet effet, l'invention propose une méthode pour le comptage de colonies présentes dans un ensemble d'échantillons à analyser, chacun des 30 échantillons dudit ensemble d'échantillons à analyser étant stocké dans un emplacement d'un dispositif de stockage, chacun des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser comprenant un support à milieu de culture agencé pour recevoir un milieu de culture ensemencé, ladite méthode comprenant, pour chaque échantillon de l'ensemble d'échantillons 35 à analyser: 3062133 - 3 - -une étape de convoyage, dit convoyage aller, de l'échantillon, à partir de son emplacement vers une zone d'analyse, -une étape de convoyage, dit convoyage retour, dudit échantillon, depuis ladite zone d'analyse vers un emplacement, 5 -une étape d'acquisition, d'une pluralité d'images de la zone d'analyse ou d'une partie de la zone d'analyse dans laquelle est positionné ledit échantillon, -une étape de détection de la présence de colonies dans ledit échantillon, comportant une analyse d'image à partir de ladite pluralité 10 d'images dudit échantillon, -une étape de détermination d'un nombre de colonies présentes dans ledit échantillon par comptage de colonies dont la présence a été détectée au cours de l'étape de détection. L'ensemble des étapes du procédé selon l'invention peuvent être 15 réalisées dans une même enceinte régulée selon une consigne prédéterminée en température. Chacun des emplacements de stockage peut être référencé. Chacun des échantillons peut disposer d'un emplacement dédié dans le dispositif de stockage. Chacun des échantillons peut être identifié par la référence de son emplacement. La localisation d'un échantillon stocké dans le dispositif de stockage peut être déterminée par la référence de son emplacement. Des échantillons stockés dans le dispositif de stockage peuvent ne 25 pas être à analyser. De préférence, on entend par zone d'analyse, un volume d'espace. Une image de l'ensemble du volume d'espace que constitue la zone d'analyse peut être acquise. Une image d'une partie du volume d'espace peut être acquise. 30 Une image, de la zone d'analyse ou d'une partie de la zone d'analyse dans laquelle est positionné un échantillon, peut être acquise indépendamment du fait que le support comporte ou non un couvercle. La méthode selon l'invention peut comprendre un traitement d'image, par un logiciel de traitement d'image, peut être réalisée afin d'opérer un 35 grossissement de l'image ou d'une partie de l'image. 3062133 - 4 - Le grossissement d'une image peut être réalisé avant l'étape de détection de la présence de colonies présentes dans un échantillon ou avant l'étape de détermination d'un nombre de colonies présentes dans un échantillon. 5 De préférence, le grossissement peut être réalisé avant l'étape de détection de la présence de colonies dans un échantillon. Le logiciel de traitement d'image peut être choisi parmi l'ensemble des logiciels de traitement d'images connus de l'homme du métier. Les échantillons peuvent être imagés, de préférence, à intervalle de 10 temps régulier. Selon l'invention, une première acquisition, par le dispositif d'imagerie, d'une première image d'un échantillon à analyser positionné dans la zone d'analyse, peut être effectuée dans un intervalle de temps maximum consécutivement au chargement de l'échantillon. 15 L'intervalle de temps maximum pendant lequel peut être effectuée l'acquisition de la première image d'un échantillon peut être compris entre 10 et 120 min, de préférence entre 20 et 60min. La méthode peut comprendre une génération d'une vidéo à partir de la pluralité d'images d'un échantillon à analyser. 20 Les milieux de culture utilisés pour la mise en oeuvre de la méthode peuvent être, de préférence, des milieux de culture solides. Les milieux de culture utilisés pour la mise en oeuvre de la méthode peuvent être, en particulier, des milieux à base d'agar ou des milieux gélifiés. L'échantillon à analyser, lorsqu'il est positionné dans la zone d'analyse, peut occuper l'intégralité du volume d'espace que constitue la zone d'analyse. L'échantillon à analyser, lorsqu'il est positionné dans la zone d'analyse, peut n'occuper qu'une partie du volume d'espace que constitue la 30 zone d'analyse L'échantillon à analyser, lorsqu'il est positionné dans la zone d'analyse, peut ne pas être déposé dans ladite zone d'analyse ; dans ce cas, l'acquisition s'effectue alors que l'échantillon est porté par le système de manutention. 3062133 - 5 - La pluralité d'images peut, de préférence, ne pas être acquise durant une étape unique d'acquisition, mais lors de plusieurs étapes d'acquisition consécutives dans le temps. La pluralité d'images peut, de préférence, ne pas être acquise durant 5 une étape unique d'acquisition, mais lors de l'acquisition d'images consécutives de plusieurs zones d'espace. Selon l'invention, l'étape de convoyage aller d'un des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser peut être mise en oeuvre avant l'étape 10 de convoyage retour d'un autre des échantillons dudit ensemble d'échantillons à analyser. Plusieurs échantillons à analyser peuvent être disposés simultanément, ou non, dans la zone d'analyse. Plusieurs échantillons à analyser peuvent être déposés dans la zone 15 d'analyse. Plusieurs échantillons à analyser peuvent être déposés dans la zone d'analyse et un, ou plusieurs, échantillon supplémentaire à analyser peut être positionné dans la zone d'analyse sans y être déposé. Selon l'invention, le dispositif d'imagerie peut imager tout ou partie 20 de la zone d'analyse dans laquelle est positionné un, ou plusieurs, échantillon à analyser dans un laps de temps pendant lequel le système de convoyage convoie un autre des échantillons à analyser depuis la zone d'analyse vers le dispositif de stockage et/ou convoie un autre des échantillons à analyser depuis le dispositif de stockage vers la zone 25 d'analyse. Selon l'invention, la méthode peut comprendre une itération des étapes ou de chacune des étapes de ladite méthode. Un nombre d'itérations d'une des étapes peut être différent d'un 30 nombre d'itérations d'une autre desdites étapes. Un nombre d'itérations d'une des étapes peut être différent de plusieurs nombres d'itérations de plusieurs autres étapes. Un nombre d'itérations d'une des étapes peut être différent des nombres d'itérations de chacune des autres étapes. 35 Chacune des étapes peut présenter le même nombre d'itérations. 3062133 - 6 - Les étapes de la méthode peuvent se succéder selon une ou plusieurs séquences prédéterminées. Une séquence d'étapes de la méthode peut être subdivisée en plusieurs sous-séquences d'étapes. 5 Les étapes de ladite méthode peuvent être itérées de sorte que l'étape de convoyage aller, l'étape de convoyage retour et l'étape d'acquisition présentent un nombre d'itérations identique et les étapes de détection et de détermination d'un nombre de colonies présentent un nombre d'itérations identique, mais différent du nombre d'itérations des 10 étapes de convoyage aller et retour. Les étapes de ladite méthode peuvent être itérées de sorte que l'étape de convoyage aller, l'étape de convoyage retour et l'étape d'acquisition présentent un nombre d'itérations identique et les étapes de détection et de détermination d'un nombre de colonies présentent des 15 nombres d'itérations tels que : - un nombre d'itérations de l'étape de détection est identique au nombre d'itérations de l'étape de détermination, ledit nombre étant différents d'un nombre d'itérations des étapes de convoyage aller, de convoyage retour et d'acquisition, ou 20 - un nombre d'itérations de l'étape de détection et un nombre d'itérations de l'étape de détermination sont différents et un nombre d'itérations des étapes de convoyage aller, de convoyage retour et d'acquisition : o est égal au nombre d'itérations de l'étape de détection, ou 25 o est égal au nombre d'itérations de l'étape de détermination, ou o est différent des nombres d'itérations de l'étape de détection et l'étape de détermination. La méthode peut comprendre une séquence d'étapes de ladite 30 méthode. La méthode peut comprendre une itération d'une séquence d'étapes de ladite méthode. La méthode peut comprendre une itération de plusieurs séquences d'étapes de ladite méthode différentes. 3062133 - 7 - Une séquence de la méthode peut ne pas contenir toutes les étapes de ladite méthode. La méthode de comptage de colonies peut comprendre, de préférence, plusieurs itérations de l'étape de convoyage aller et plusieurs 5 itérations de l'étape de convoyage retour. Une ou plusieurs étapes d'une même séquence d'étapes peuvent être itérées au sein de la même séquence d'étapes. Chacune des étapes d'une même séquence d'étapes peut être itérée au sein de la même séquence d'étapes. 10 Un nombre d'itérations d'une étape d'une séquence d'étapes peut être différent d'un autre nombre d'itérations d'une autre étape de ladite séquence d'étapes. Un nombre d'itérations d'une étape d'une séquence d'étapes peut être différent de plusieurs autres nombres d'itérations de plusieurs autres 15 étapes de ladite séquence d'étapes. Le nombre d'itérations de chacune des étapes d'une séquence d'étapes peut être identique. Un nombre d'itérations d'une étape d'une séquence d'étapes peut être différent d'un nombre d'itérations de ladite étape d'une autre séquence 20 d'étapes. Une séquence d'étapes mise en oeuvre pour un des échantillons à analyser peut être différente d'une séquence d'étapes mise en oeuvre pour un autre des échantillons à analyser. 25 Selon l'invention, l'étape de détection de la présence de colonies peut comporter : -une première étape d'identification d'un objet sur une image de la pluralité d'images, -une deuxième étape d'analyse d'une variation d'une taille dudit objet 30 identifié sur une ou plusieurs autres images de ladite pluralité d'images, -lorsque la taille dudit objet identifié varie, une identification de la présence d'une colonie. L'étape d'identification d'objet sur une image peut être réalisée par toute technique d'analyse d'images connues de l'homme du métier. 3062133 - 8 - L'étape d'analyse de la variation de la taille d'un objet identifié sur une ou plusieurs images peut être réalisée par toute technique d'analyse d'images connues de l'homme du métier. L'analyse d'une variation d'une taille d'un objet identifié sur une ou 5 plusieurs images peut être fonction du temps. L'analyse d'une variation d'une taille d'un objet identifié sur une ou plusieurs images peut être fonction d'une variante quelconque dépendant du temps, tel que, par exemple, un nombre d'itérations d'une ou de plusieurs étapes ou un nombre d'itérations d'une ou plusieurs séquences. 10 L'analyse d'une variation d'une taille d'un objet identifié sur une ou plusieurs images peut être, de préférence, mise en oeuvre après chaque étape d'acquisition. La variation d'une taille d'un objet identifié peut être déterminée à partir de deux images consécutives d'un échantillon à analyser. 15 La variation d'une taille d'un objet identifié peut être déterminée à partir de deux images non consécutives d'un échantillon à analyser. La variation d'une taille d'un objet identifié peut être déterminée à partir de plusieurs images consécutives d'un échantillon à analyser. La variation d'une taille d'un objet identifié peut être déterminée à 20 partir de plusieurs images non consécutives d'un échantillon à analyser. Avantageusement, l'étape de détection de la présence de colonies peut comporter : -une première étape d'identification d'un objet sur une image de la 25 pluralité d'images, -une deuxième étape d'analyse d'une variation d'une taille dudit objet identifié sur une ou plusieurs autres images de ladite pluralité d'images, -lorsque la taille dudit objet identifié varie d'une valeur comprise entre 51 et 1000 pm, de préférence entre 100 et 200 pm, une identification 30 de la présence d'une colonie. La taille minimale d'une colonie détectée peut être de 51 pm La méthode peut comprendre une étape de détermination d'un nombre, dit définitif, de colonies présentes dans l'échantillon, ladite étape comportant : 3062133 - 9 - -une analyse d'une variation du nombre de colonies, déterminé lors de l'étape de détermination, présentes dans ledit échantillon, -lorsque ledit nombre de colonies est constant pendant une durée supérieure à une valeur prédéterminée, une détermination dudit nombre 5 définitif de colonies. L'analyse d'une variation du nombre de colonies, déterminé lors de l'étape de détermination, peut être fonction du temps. L'analyse d'une variation du nombre de colonies, déterminé lors de l'étape de détermination, peut être fonction d'une variante quelconque 10 dépendant du temps, tel que, par exemple, un nombre d'itérations d'une ou de plusieurs étapes ou un nombre d'itérations d'une ou plusieurs séquences. L'analyse d'une variation du nombre de colonies, déterminé lors de l'étape de détermination, peut-être, de préférence mise en oeuvre après chaque étape de détermination. 15 La valeur prédéterminée durant laquelle le nombre de colonies déterminé, lors de l'étape de détermination d'un nombre de colonies présentes dans un échantillon, peut être comprise entre 6 et 72 h, de préférence entre 8 et 48 h. La détermination du nombre définitif de colonies peut être fonction du 20 temps. La détermination du nombre définitif de colonies peut être fonction d'une variante quelconque dépendant du temps, tel que, en outre, un nombre d'itérations d'une ou de plusieurs étapes ou un nombre d'itérations d'une ou plusieurs séquences. 25 La détermination du nombre définitif de colonies peut être, de préférence, déterminé lorsque le nombre de colonies déterminé lors de l'étape de détermination d'un nombre de colonies présentes dans un échantillon, est constant durant deux itérations de ladite étape, de préférence durant 4 itérations. La valeur prédéterminée de la durée pendant laquelle le nombre de colonies doit être constant pour que le caractère définitif soit attribué audit nombre de colonies peut être établie, en outre, en fonction du milieu de culture contenu dans le support de l'échantillon. La valeur prédéterminée de la durée pendant laquelle le nombre de 35 colonies doit être constant pour que le caractère définitif soit attribué audit 3062133 - 10 - nombre de colonies peut être établie, en outre, en fonction d'une souche bactérienne. Une variable quelconque dépendant du temps, tel que, par exemple, 5 un nombre d'itérations d'une ou de plusieurs étapes ou un nombre d'itérations d'une ou plusieurs séquences, peut à être substituée à la durée pendant laquelle le nombre de colonies doit être constant pour que le caractère définitif soit attribué audit nombre de colonies. 10 Selon l'invention, après que l'étape de détermination du nombre définitif de colonies a été réalisée, l'échantillon peut être retiré de l'ensemble d'échantillons à analyser. A la suite de la détermination d'un nombre définitif de colonies présentes dans un échantillon à analyser, ledit échantillon peut ne plus être 15 considéré comme un échantillon à analyser, mais peut rester stocké dans le dispositif de stockage. La détermination d'un nombre définitif de colonies présentes dans un échantillon à analyser peut correspondre à la fin de l'application de la méthode audit échantillon. 20 Lorsqu'après une durée prédéfinie, aucun objet n'a été identifié sur aucune des images de la pluralité d'images d'un échantillon, lors de l'étape de détection de la présence de colonies, le nombre définitif de colonies présentes dans ledit échantillon est défini comme nul. 25 Avantageusement, la méthode peut comprendre : -un ajout d'un échantillon à l'ensemble d'échantillons à analyser par chargement dudit échantillon dans le dispositif de stockage, et/ou -un retrait d'un échantillon dudit ensemble d'échantillons à analyser par déchargement dudit échantillon dudit dispositif de stockage ; 30 et dans laquelle l'ajout et/ou le retrait est réalisé concomitamment à l'une quelconque des étapes de ladite méthode. Le chargement et/ou le déchargement d'un échantillon dans le dispositif peut être, en outre, réalisé par un opérateur. Un chargement et un déchargement peuvent être réalisés de manière 35 concomitante. 3062133 Lors d'un chargement d'un échantillon dans un emplacement du dispositif de stockage, l'unité de traitement peut être configurée pour que le dispositif de stockage présente un emplacement libre à l'opérateur. Lors d'un déchargement d'un échantillon à partir d'un emplacement 5 du dispositif de stockage, l'unité de traitement peut être configurée pour que le dispositif de stockage présente l'emplacement dans lequel est stocké ledit échantillon à l'opérateur. Lors d'un chargement et/ou d'un déchargement d'un échantillon, si une étape est en cours de mise en oeuvre, l'unité de traitement peut 10 suspendre ladite étape pendant la durée du chargement ou du déchargement. Lors d'un chargement et/ou lors d'un déchargement d'un échantillon, l'unité de traitement peut être configurée pour : -éloigner le système de manutention du dispositif de stockage, et/ou 15 -immobiliser le système de manutention. La méthode peut comprendre : -une étape de calcul d'une séquence d'acquisition des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser, 20 -une détermination d'une séquence de convoyage dudit ensemble à partir de ladite séquence d'acquisition calculée. Pour chacun des échantillons à analyser, une séquence d'étapes de ladite méthode à appliquer audit échantillon peut être calculée, par l'unité de traitement, en fonction de la séquence d'acquisition des échantillons à 25 analyser. La séquence de convoyage est déterminée, par l'unité de traitement, de manière à appliquer la séquence d'acquisition. Une séquence d'analyse d'un échantillon peut être définie comme l'ensemble des étapes appliquées à l'échantillon depuis une première étape 30 de convoyage aller jusqu'à une dernière étape de convoyage retour. Subséquemment à la dernière étape de convoyage retour d'un échantillon, succédant à l'étape de détermination d'un nombre définitif de colonies présentes dans ledit échantillon, la séquence d'analyse dudit échantillon peut être terminée. 3062133 - 12 - Selon l'invention, la méthode peut comprendre une modification de l'ensemble d'échantillons à analyser et dans laquelle les étapes de calcul de la séquence d'acquisition et de détermination de la séquence de convoyage sont mises en oeuvre après une modification dudit ensemble d'échantillons à 5 analyser. Une modification de l'ensemble d'échantillons peut désigner, par exemple : -un chargement d'un ou de plusieurs échantillons, ou -un déchargement d'un ou de plusieurs échantillons, ou 10 -une détermination d'un nombre définitif de colonies présentes dans un échantillon à analyser. Avantageusement, les étapes de calcul de la séquence d'acquisition et de détermination de la séquence de convoyage peuvent être mises en 15 oeuvre après chaque modification de l'ensemble d'échantillons à analyser. Un nombre d'itérations d'une ou de plusieurs étapes de la méthode peut être redéfini, par une unité de traitement, au cours de la mise en oeuvre de la méthode. Une ou plusieurs séquences d'étapes peuvent être redéfinies, par une 20 unité de traitement, au cours de la mise en oeuvre de la méthode. Un nombre d'itérations d'une ou de plusieurs séquences d'étapes peut être redéfini, par une unité de traitement, au cours de la mise en oeuvre de la méthode. Pour chacun des échantillons à analyser, les étapes de la méthode 25 peuvent être itérées selon une ou plusieurs séquences redéfinies par une unité de traitement au cours de la mise en oeuvre de la méthode. Selon l'invention, pour chacun des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser, une fréquence d'itération de l'étape d'acquisition 30 peut être supérieure à une fréquence prédéterminée, ladite fréquence prédéterminée étant comprise entre de préférence entre toutes les 10 min et toutes les 120 min. La fréquence d'itération de l'étape d'acquisition d'un échantillon à analyser peut être différente de la fréquence d'itération d'un autre 35 échantillon à analyser. 3062133 - 13 - La fréquence d'itération de l'étape d'acquisition d'un échantillon peut varier en fonction du temps. La fréquence d'itération de l'étape d'acquisition d'un échantillon peut, de préférence, augmenter lorsque la variation du nombre de colonies, 5 déterminé lors de l'étape de détermination, présentes dans un échantillon, décroît après avoir observé une croissance. Une vitesse de convoyage maximale du dispositif de convoyage peut nécessiter une redéfinition de la séquence de convoyage de l'ensemble d'échantillons afin que la fréquence d'itération minimale de l'étape 10 d'acquisition d'un échantillon soit respectée. Par exemple, un ou plusieurs échantillons peuvent être déposés dans la zone de manière à supprimer l'étape de convoyage retour d'une séquence ou d'une sous-séquence d'étapes à appliquer audit ou auxdits échantillons. 15 Selon un autre aspect de l'invention, il est proposé un appareil pour le comptage de colonies comprenant : -un dispositif de stockage comprenant des emplacements agencés pour recevoir des échantillons, lesdits échantillons comprenant un support à milieu de culture agencé pour recevoir un milieu de culture ensemencé, 20 -un système de manutention agencé pour convoyer un ou plusieurs échantillons à analyser depuis un ou plusieurs emplacements vers une zone d'analyse et de la zone d'analyse vers un ou plusieurs emplacements, -un dispositif d'imagerie agencé pour acquérir une pluralité d'images de tout ou partie de la zone d'analyse, laquelle est agencée pour recevoir un 25 ou plusieurs échantillons à analyser, -une unité de traitement configurée pour mettre en oeuvre, pour chacun des échantillons à analyser : - une étape de détection de la présence de colonies par une analyse d'image à partir de la pluralité d'images d'un 30 échantillon à analyser, - une étape de détermination, par comptage de colonies dont la présence a été détectée au cours de l'étape de détection, d'un nombre de colonies présentes dans un échantillon à analyser. 3062133 - 14 - Avantageusement, l'appareil peut comprendre une enceinte fermée à l'intérieur de laquelle sont agencés le dispositif de stockage, le système de manutention et le dispositif d'imagerie. Avantageusement, l'enceinte fermée peut être un incubateur 5 permettant : -une régulation de la température, et/ou -une régulation de l'hygrométrie, et/ou -une régulation du taux de CO2. Selon l'invention, l'appareil peut comprendre un dispositif d'éclairage 10 de la zone d'analyse. Le support peut être une boîte. Le support peut être une boîte munie d'un couvercle. Le support peut être tout type de support connu de l'homme du métier, tel que, en outre, une boîte de Pétri. 15 Le milieu de culture peut être tout type de milieu adapté à la multiplication d'un ou de plusieurs micro-organismes particuliers. Le milieu de culture peut être tout type de milieu adapté à la multiplication d'un ou de plusieurs micro-organismes quelconques. Le milieu de culture peut être tout type de milieu, artisanal ou 20 commercial, connu de l'homme du métier. Chaque emplacement peut, de préférence, être agencé pour recevoir un seul échantillon simultanément. Plusieurs emplacements peuvent, de préférence, être référencés. Le système de manutention peut être agencé pour convoyer plusieurs 25 échantillons successivement. Le système de manutention peut être agencé pour convoyer plusieurs échantillons simultanément. Le dispositif de stockage peut être mobile. Le dispositif de stockage peut être mis en mouvement relativement 30 au dispositif de manutention. Le dispositif d'imagerie peut comprendre tout type de capteur photosensible connu de l'homme du métier. Le dispositif d'imagerie peut comprendre un système optique. Tout ou partie du dispositif d'imagerie peut être mobile. 35 Le dispositif d'imagerie peut opérer un grossissement x32. 3062133 - 15 - Le dispositif d'imagerie peut comprendre un système optique agencé pour opérer un grossissement de tout ou partie de la zone d'analyse, tel que, par exemple, un objectif. Le dispositif d'imagerie peut être apte à imager, le cas échéant par 5 l'intermédiaire de plusieurs acquisitions, l'ensemble du volume d'espace que constitue la zone d'analyse. Le dispositif d'imagerie peut être agencé pour imager indépendamment plusieurs parties de la zone d'analyse. Une résolution d'une image numérique, acquise par le dispositif 10 d'imagerie, peut être comprise entre 500 x 500 pixels et 3000 x 3000 pixels. Selon l'invention, l'unité de traitement peut, en outre, être configurée pour mettre en oeuvre, pour chacun des échantillons à analyser : 15 -une analyse d'une variation du nombre de colonies, déterminé lors de l'étape de détermination, présentes dans l'échantillon à analyser, -lorsque ledit nombre de colonies est constant pendant une durée supérieure à une valeur prédéterminée, une détermination d'un nombre, dit définitif, de colonies présentes dans ledit échantillon à analyser. 20 L'appareil peut comprendre un moyen d'avertissement et/ou de communication agencé pour prévenir un utilisateur de la détermination du nombre définitif de colonies présentes dans un échantillon et/ou un ensemble d'échantillons. 25 Le moyen d'avertissement et/ou de communication est agencé pour signaler et/ou notifier à un utilisateur que l'échantillon et/ou l'ensemble d'échantillons peut être déchargé du dispositif de stockage. Le moyen d'avertissement peut être tout moyen technique apte à émettre un signal connu de l'homme du métier. 30 Le moyen d'avertissement peut être apte à émettre, en outre, un signal lumineux et/ou un signal sonore. Le moyen de communication peut être tout moyen technique connu de l'homme du métier apte à transmettre un signal. Le moyen de communication peut être apte à transmettre, en outre, 35 un message électronique et/ou un SMS et/ou un appel téléphonique. 3062133 - 16 - Le système de manutention peut comprendre un bras robotisé, ledit bras comprenant une pince de serrage agencée pour saisir un échantillon à analyser par préhension. 5 Le bras robotisé peut être articulé autour d'un élément central. Le bras robotisé peut pivoter autour d'un pivot. La pince de serrage peut être mobile le long du bras robotisé. Le système de manutention peut comprendre plusieurs bras robotisés. 10 Le bras de manutention peut comprendre plusieurs pinces de serrage. Avantageusement, le dispositif de stockage peut être un carrousel, ledit carrousel comprenant un ensemble d'emplacements de stockage référencés et répartis autour d'un axe central du carrousel, de préférence 15 sous forme de colonnes et/ou de rangées. Les échantillons peuvent être référencés par saisie, dans une unité de traitement, de leurs références. Un échantillon peut être identifié par l'emplacement référencé dans lequel il est stocké. 20 Un échantillon peut être localisé par l'emplacement référencé dans lequel il est stocké. On entend par carrousel, tout dispositif comprenant un axe central autour duquel sont répartis un ensemble d'emplacements de stockage. Un emplacement peut être mis en mouvement relativement à l'axe 25 central et à un autre emplacement. Un emplacement peut être mis en mouvement relativement à l'axe central et à plusieurs autres emplacements. Un emplacement peut être mis en mouvement relativement à l'axe central et à tous les autres emplacements de l'ensemble. 30 Des emplacements de stockage peuvent être mis en mouvement relativement à l'axe central du carrousel. L'ensemble des emplacements peut être mis en mouvement conjointement relativement à l'axe central du carrousel. Des emplacements de stockage peuvent être mis en mouvement de 35 rotation autour de l'axe central du carrousel. 3062133 - 17 - L'ensemble des emplacements peut être conjointement mis en mouvement de rotation autour de l'axe central du carrousel. Selon l'invention, l'unité de traitement peut, en outre, être 5 configurée pour : -calculer une séquence d'acquisition des échantillons à analyser, -calculer une séquence de convoyage des échantillons à analyser à partir de la séquence d'acquisition calculée. 10 Le dispositif de stockage peut, de préférence, présenter un nombre d'emplacements maximal adapté à une vitesse de convoyage du système de manutention de manière à ce qu'une fréquence d'analyse minimale d'un échantillon à analyser soit supérieure à 2 analyses par heure. 15 L'unité de traitement peut, en outre, être configurée pour calculer la séquence d'acquisition et la séquence de convoyage des échantillons à analyser après : -chaque ajout d'un échantillon à l'ensemble d'échantillons à analyser par chargement dudit échantillon dans le dispositif de stockage, et/ou 20 -chaque retrait d'un échantillon dudit ensemble d'échantillons à analyser par déchargement dudit échantillon à partir du dispositif de stockage, et/ou -chaque mise en oeuvre de l'étape de détermination d'un nombre de colonies présentes dans un des échantillons à analyser. 25 Selon l'invention, la pince de serrage peut comprendre un capteur de force agencé pour limiter la pression maximale exercée par ladite pince de serrage lors d'une saisie d'un échantillon de sorte que ladite pince de serrage est apte à saisir, par préhension d'une partie quelconque, un 30 échantillon, en particulier une boîte de Pétri, d'une taille comprise entre 50 et 100 mm de diamètre. Avantageusement, la pince de serrage peut être agencée pour saisir un échantillon par des bords latéraux. 3062133 - 18 - La pince de serrage peut être agencée pour saisir un échantillon par des bords latéraux situés du côté de la surface d'un l'emplacement sur lequel l'échantillon est posé. La pince de serrage peut être agencée pour saisir un échantillon par 5 des bords latéraux situés à proximité immédiate du côté de la surface d'un l'emplacement sur lequel l'échantillon est posé. Le carrousel peut comprendre des tours de stockage, lesdites tours de stockage comprenant des d'emplacements superposés et étant situées 10 autour de l'axe central du carrousel. Des tours de stockage peuvent être mises en mouvement relativement à l'axe central du carrousel. Les tours de stockage peuvent être mises conjointement en mouvement relativement à l'axe central du carrousel. 15 Des tours de stockage peuvent être mises en mouvement de rotation autour de l'axe central du carrousel. Les tours de stockage peuvent conjointement être mises en mouvement de rotation autour de l'axe central du carrousel. Le carrousel peut comprendre des casiers de stockage, lesdits casiers 20 comprenant des emplacements juxtaposés et étant situés autour de l'axe central du carrousel. Le carrousel peut comprendre des rails, lesdits rails étant agencés pour que les tours de stockage et/ou les casiers de stockage puissent, lors de leurs mises en mouvement, coulisser dans lesdits rails. 25 Description des figures et modes de réalisation D'autres avantages et particularités de l'invention apparaîtront à la lecture de la description détaillée de mises en oeuvre et de modes de 30 réalisation nullement limitatifs, et des dessins annexés suivants : - les FIGURES 1 et 2 sont des digrammes illustrant chacun une séquence d'étapes de la méthode de comptage de colonies différentes, - la FIGURE 3 est une représentation schématique d'un appareil de comptage de colonies. 35 3062133 - 19 - Les modes de réalisation décrits ci-après n'étant nullement limitatifs, on pourra notamment considérer des variantes de l'invention ne comprenant qu'une sélection de caractéristiques décrites, isolées des autres caractéristiques décrites (même si cette sélection est isolée au sein d'une 5 phrase comprenant ces autres caractéristiques), si cette sélection de caractéristiques est suffisante pour conférer un avantage technique ou pour différencier l'invention par rapport à l'état de la technique antérieure. Cette sélection comprend au moins une caractéristique, de préférence fonctionnelle sans détails structurels, ou avec seulement une partie des 10 détails structurels si cette partie uniquement est suffisante pour conférer un avantage technique ou pour différencier l'invention par rapport à l'état de la technique antérieure. En référence aux FIGURES 1 et 3, il est décrit, dans un premier mode 15 de réalisation de la méthode selon l'invention, une méthode pour le comptage de colonies présentes dans un ensemble d'échantillons à analyser, chacun des échantillons 2 dudit ensemble d'échantillons à analyser étant stocké dans un emplacement 3 d'un dispositif de stockage 4, chacun des échantillons 2 de l'ensemble d'échantillons à analyser 20 comprenant un support à milieu de culture agencé pour recevoir un milieu de culture ensemencé, ladite méthode comprenant, pour chaque échantillon 2 de l'ensemble d'échantillons à analyser la séquence d'étapes suivante : -une étape de convoyage, dit convoyage aller 101, de l'échantillon, à partir de son emplacement 3 vers une zone d'analyse 5, 25 -une étape d'acquisition 102, d'une pluralité d'images de la zone d'analyse 5 ou d'une partie de la zone d'analyse dans laquelle est positionné ledit échantillon, -une étape de convoyage, dit convoyage retour 103, dudit échantillon, depuis ladite zone d'analyse 5 vers un emplacement 3, 30 -une étape de détection 104 de la présence de colonies dans ledit échantillon, comportant une analyse d'image à partir de ladite pluralité d'images dudit échantillon, -une étape de détermination 105 d'un nombre de colonies présentes dans ledit échantillon par comptage de colonies dont la présence a été 35 détectée au cours de l'étape de détection 104. 3062133 - 20 - Le temps séparant l'acquisition de deux images consécutives d'un échantillon 2 à analyser est inférieur à 30 minutes. Cette fréquence minimale d'acquisition est atteinte lorsque tous les emplacements 3 du dispositif de stockage 4 sont occupés par des échantillons 2 à analyser. La 5 fréquence d'acquisition augmente lorsque le nombre d'échantillons à analyser stockés dans le dispositif de stockage 5 diminue. Selon ce mode de réalisation, plusieurs échantillons 2 ne peuvent pas être présents de manière simultanée dans la zone d'analyse 5. Les étapes de convoyage aller 101 et de convoyage retour 103 10 présentent, dans une même itération de la séquence telle qu'illustrée sur la FIGURE 1, le même nombre d'itérations. Chacune des étapes 102, 104 et 105 est itérée, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 1, indépendamment des autres étapes. Dans un deuxième mode de réalisation de la méthode selon 15 l'invention, uniquement décrit pour ses différences avec le premier mode de réalisation, l'étape de détection 104 et l'étape de détermination 105 forment une première sous-séquence [104,105] itérée, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 1, indépendamment des autres étapes. Les étapes de convoyage aller 101 et 20 de convoyage retour 103 présentent, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 1, le même nombre d'itérations. L'étape d'acquisition 102 est itérée, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 1, indépendamment des autres étapes et de la première sous-séquence. Le nombre d'itérations 25 de l'étape d'acquisition 102 présente un nombre d'itérations : -identique au nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et identique au nombre d'itérations de la première sous-séquence [104,105], ou -identique au nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et différent du nombre d'itérations de la première sous-séquence [104,105], ou 30 -différent du nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et identique au nombre d'itérations de la première sous-séquence [104,105], ou -différent du nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et différent du nombre d'itérations de la première sous-séquence [104,105]. Dans un troisième mode de réalisation de la méthode selon 35 l'invention, uniquement décrit pour ses différences avec le premier mode de 3062133 - 21 - réalisation, les étapes 101, 102 et 103 forment une deuxième sous-séquence [101,102,103] itérée, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 1, indépendamment de la première sous-séquence [104,105]. Le nombre d'itérations de la première sous- 5 séquence [104,105] est différent du nombre d'itérations de la deuxième sous-séquence. Dans un quatrième mode de réalisation de la méthode selon l'invention, la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 1 est itérée dans son ensemble, chacune des étapes de la séquence présentant, dans 10 une même itération de ladite séquence d'étapes, un nombre d'itérations identique. En référence aux FIGURES 2 et 3, il est décrit, dans un cinquième mode de réalisation de la méthode selon l'invention, uniquement décrit pour 15 ses différences avec le premier mode de réalisation, une séquence d'étapes de la méthode de comptage de colonies selon l'invention. Pour chacun des échantillons 2 à analyser, la méthode est mise en oeuvre selon la séquence d'étapes suivante : -l'étape 101, puis 20 -l'étape 102, puis -l'étape 104, puis -l'étape 105, puis -l'étape 103. Les étapes de convoyage aller 101 et de convoyage retour 103 25 présentent, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, le même nombre d'itérations. Chacune des étapes 102, 104 et 105 est itérée, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, indépendamment des autres étapes. 30 Dans un sixième mode de réalisation de la méthode selon l'invention, uniquement décrit pour ses différences avec le premier mode de réalisation, les étapes 102 et 104 forment une première sous-séquence itérée [102,104], dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, indépendamment des autres étapes de ladite 35 séquence d'étapes. Les étapes 101 et 103 présentent, dans une même 3062133 - 22 - itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, un nombre d'itérations identiques. L'étape 105 présente un nombre d'itérations : -différent du nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et différent 5 du nombre d'itérations de la première sous-séquence [102,104], ou -différent du nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et identique au nombre d'itérations de la première sous-séquence [102,104], ou -identique au nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et différent du nombre d'itérations de la première sous-séquence [102,104], ou 10 -identique au nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et identique au nombre d'itérations de la première sous-séquence [102,104]. Dans un septième mode de réalisation de la méthode selon l'invention, uniquement décrit pour ses différences avec le premier mode de réalisation, les étapes 104 et 105 forment une deuxième sous-séquence 15 [104,105] itérée, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, indépendamment des autres étapes de ladite séquence d'étapes. Les étapes 101 et 103 présentent, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, un nombre d'itérations identiques. L'étape 102 présente un nombre 20 d'itérations : -différent du nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et différent du nombre d'itérations de la deuxième sous-séquence [104,105], ou -différent du nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et identique au nombre d'itérations de la deuxième sous-séquence [104,105], ou 25 -identique au nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et différent du nombre d'itérations de la deuxième sous-séquence [104,105], ou -identique au nombre d'itérations des étapes 101 et 103, et identique au nombre d'itérations de la deuxième sous-séquence [104,105]. Dans un huitième mode de réalisation de la méthode selon 30 l'invention, uniquement décrit pour ses différences avec le premier mode de réalisation, les étapes 102, 104 et 105 forment une troisième sous-séquence [102,104,105] itérée, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, indépendamment des étapes 101 et 103 qui présentent, dans une même itération de la séquence d'étapes 35 telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, un nombre d'itérations identiques. Dans 3062133 - 23 - une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, le nombre d'itérations de la troisième sous-séquence est différent du nombre d'itérations des étapes 101 et 103. Dans un neuvième mode de réalisation de la méthode selon 5 l'invention, uniquement décrit pour ses différences avec le premier mode de réalisation, la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2 est itérée dans son ensemble, chacune des étapes de la séquence présentant, dans une même itération de la séquence d'étapes telle qu'illustrée sur la FIGURE 2, un nombre d'itérations identique. 10 En référence à la FIGURE 3, il est décrit un mode de réalisation de l'appareil 6 pour le comptage de colonies selon l'invention, ledit appareil comprenant : -un dispositif de stockage 4 comprenant des emplacements 3 agencés 15 pour recevoir des échantillons 2, lesdits échantillons comprenant un support à milieu de culture agencé pour recevoir un milieu de culture ensemencé, -un système de manutention 7 agencé pour convoyer un ou plusieurs échantillons 2 à analyser depuis un ou plusieurs emplacements 3 vers une zone d'analyse 5 et de la zone d'analyse 5 vers un ou plusieurs 20 emplacements 3, -un dispositif d'imagerie 8 agencé pour acquérir une pluralité d'images de tout ou partie de la zone d'analyse 5, laquelle est agencée pour recevoir un ou plusieurs échantillons 2 à analyser, -une unité de traitement (non représentée) configurée pour mettre 25 en oeuvre, pour chacun des échantillons à analyser : - une étape de détection de la présence de colonies par une analyse d'image à partir de la pluralité d'images d'un échantillon à analyser, - une étape de détermination, par comptage de colonies dont la 30 présence a été détectée au cours de l'étape de détection, d'un nombre de colonies présentes dans un échantillon à analyser. Le dispositif de stockage 4 est un carrousel comprenant un ensemble de tours de stockage 11 reliées à un élément central 10 comprenant un axe de révolution 12 par rapport auquel l'élément central 10 est mis en 35 mouvement de rotation 13 par l'intermédiaire d'un actionneur (non 3062133 - 24 - représenté). Des éléments de liaisons 14 relient les tours de stockage 11 à l'élément central 10 de manière à mettre en mouvement de rotation les tours de stockage 11 lors de la mise en mouvement de rotation de l'élément central 10. Chaque tour de stockage 11 comprend dix emplacements 3 5 superposés. Le dispositif de stockage 4 comprend dix tours de stockage 11 positionnées à égale distance de l'axe central 10 et réparties angulairement autour de l'axe de révolution 12. Le système de manutention 7 comprend un pivot 15 auquel est relié un bras robotisé 16. Le pivot 15 comprend un axe de révolution 17 autour 10 duquel il peut être mis en mouvement de rotation 18. Le mouvement de rotation 18 du pivot 15 est directement transféré au bras robotisé 16. Le bras robotisé 16 est mis en mouvement de translation verticale 19 relativement au pivot 15 par l'intermédiaire d'un actionneur (non représenté). Une pince de serrage 9 est située à proximité de l'extrémité 15 distale, par rapport au pivot 15, du bras robotisé 16. La pince de serrage 9 est dotée de deux branches mises en mouvement de translation l'une par rapport à l'autre selon des directions opposées. La mise en mouvement de translation des branches est réalisée de manière symétrique et coordonnée. Les mouvements de translation des branches visent à rapprocher les 20 branches de manière à enserrer un échantillon 2 ou à les éloigner de manière à libérer un échantillon 2. Chacune des branches présente une forme arrondie optimisée pour saisir des supports à milieu de culture de forme ronde, en particulier des boîtes de Pétri. L'écartement maximal des deux branches est de 15 cm. La pince de serrage 9 comprend un capteur de 25 force agencé pour limiter la pression exercée, lors du serrage, par les branches sur l'échantillon. La force exercée par les branches est de 5 newtons. Le capteur de force permet à la pince de serrage 9 de saisir tout objet de forme arrondie présentant une taille inférieure à 10 cm. Le dispositif d'imagerie 8 est fixe et il comprend une caméra CCD 20 30 de 5 Mega Pixels. Les dimensions de la zone d'analyse 5 sont de 10 cm de largeur et de 10 cm de longueur, la distance entre la caméra et l'échantillon à analyser 2 est d'environ 25 cm, en particulier de 25 cm. 3062133 - 25 - Bien sûr, l'invention n'est pas limitée aux exemples qui viennent d'être décrits et de nombreux aménagements peuvent être apportés à ces exemples sans sortir du cadre de l'invention. 5 De plus, les différentes caractéristiques, formes, variantes et modes de réalisation de l'invention peuvent être associés les uns avec les autres selon diverses combinaisons dans la mesure où ils ne sont pas incompatibles ou exclusifs les uns des autres. 10 REVENDICATIONS1. Méthode pour le comptage de colonies présentes dans un ensemble d'échantillons à analyser, chacun des échantillons dudit ensemble d'échantillons à analyser étant stockés dans un emplacement d'un dispositif de stockage, chacun des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser comprenant un support à milieu de culture agencé pour recevoir un milieu de culture ensemencé, ladite méthode comprenant, pour chaque échantillon de l'ensemble d'échantillons à analyser: -une étape de convoyage, dit convoyage aller, de l'échantillon, à 10 partir de son emplacement vers une zone d'analyse, -une étape de convoyage, dit convoyage retour, dudit échantillon, depuis ladite zone d'analyse vers un emplacement, -une étape d'acquisition, d'une pluralité d'images de la zone d'analyse ou d'une partie de la zone d'analyse dans laquelle est positionné ledit 15 échantillon, -une étape de détection de la présence de colonies dans ledit échantillon, comportant une analyse d'image à partir de ladite pluralité d'images dudit échantillon, -une étape de détermination d'un nombre de colonies présentes dans 20 ledit échantillon par comptage de colonies dont la présence a été détectée au cours de l'étape de détection, l'ensemble des étapes étant réalisées dans une même enceinte régulée selon une consigne prédéterminée en température. . 25 2. Méthode selon la revendication 1, dans laquelle l'étape de convoyage aller d'un des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser est mise en oeuvre avant l'étape de convoyage retour d'un autre des échantillons dudit ensemble d'échantillons à analyser. 30 3. Méthode selon l'une quelconque des revendications précédentes, comprenant une itération des étapes ou de chacune des étapes de ladite méthode. 4. Méthode selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans 35 laquelle l'étape de détection de la présence de colonies comporte : 3062133 - 27 - -une première étape d'identification d'un objet sur une image de la pluralité d'images, -une deuxième étape d'analyse d'une variation d'une taille dudit objet identifié sur une ou plusieurs autres images de ladite pluralité d'images, 5 -lorsque la taille dudit objet identifié varie, une identification de la présence d'une colonie. 5. Méthode selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, dans laquelle l'étape de détection de la présence de colonies comporte : -une première étape d'identification d'un objet sur une image de la pluralité d'images, -une deuxième étape d'analyse d'une variation d'une taille dudit objet identifié sur une ou plusieurs autres images de ladite pluralité d'images, -lorsque la taille dudit objet identifié varie d'une valeur comprise 15 entre 51 et 1000 pm, de préférence entre 100 et 200 pm, une identification de la présence d'une colonie. 6. Méthode selon l'une quelconque des revendications précédentes, comportant une étape de détermination d'un nombre, dit définitif, de 20 colonies présentes dans l'échantillon, ladite étape comportant : -une analyse d'une variation du nombre de colonies, déterminé lors de l'étape de détermination, présentes dans ledit échantillon, -lorsque ledit nombre de colonies est constant pendant une durée supérieure à une valeur prédéterminée, une détermination dudit nombre 25 définitif de colonies. 7. Méthode selon la revendication 6, dans laquelle, après que l'étape de détermination du nombre définitif de colonies ait été réalisée, l'échantillon est retiré de l'ensemble d'échantillons à analyser. 30 8. Méthode selon l'une quelconque des revendications précédentes, comprenant : -un ajout d'un échantillon à l'ensemble d'échantillons à analyser par chargement dudit échantillon dans le dispositif de stockage, et/ou 35 -un retrait d'un échantillon dudit ensemble d'échantillons à analyser par déchargement dudit échantillon dudit dispositif de stockage ; 3062133 - 28 - et dans laquelle l'ajout et/ou le retrait est réalisé concomitamment à l'une quelconque des étapes de ladite méthode. 9. Méthode selon l'une quelconque des revendications précédentes, 5 comprenant : -une étape de calcul d'une séquence d'acquisition des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser, -une détermination d'une séquence de convoyage dudit ensemble à partir de ladite séquence d'acquisition calculée. 10 10. Méthode selon la revendication précédente, comprenant une modification de l'ensemble d'échantillons à analyser et dans laquelle les étapes de calcul de la séquence d'acquisition et de détermination de la séquence de convoyage sont mises en oeuvre après une modification dudit ensemble d'échantillons à analyser. 11. Méthode selon la revendication précédente, dans laquelle les étapes de calcul de la séquence d'acquisition et de détermination de la séquence de convoyage sont mises en oeuvre après chaque modification de l'ensemble 20 d'échantillons à analyser. 12. Méthode selon l'une quelconque des revendications 3 à 11, dans laquelle, pour chacun des échantillons de l'ensemble d'échantillons à analyser, une fréquence d'itération de l'étape d'acquisition est supérieure à 25 une fréquence prédéterminée, ladite fréquence prédéterminée étant comprise de préférence entre toutes les 10 min et toutes les 120 min. 13. Appareil (6) pour le comptage de colonies comprenant : -un dispositif de stockage (2) comprenant des emplacements agencés 30 pour recevoir des échantillons, lesdits échantillons comprenant un support à milieu de culture agencé pour recevoir un milieu de culture ensemencé, -un système de manutention (5) agencé pour convoyer un ou plusieurs échantillons à analyser depuis un ou plusieurs emplacements vers une zone d'analyse (5) et de la zone d'analyse vers un ou plusieurs 35 emplacements, 3062133 - 29 - -un dispositif d'imagerie (8) agencé pour acquérir une pluralité d'images de tout ou partie de la zone d'analyse, laquelle est agencée pour recevoir un ou plusieurs échantillons à analyser, -une unité de traitement configurée pour mettre en oeuvre, pour 5 chacun des échantillons à analyser : - une étape de détection de la présence de colonies par une analyse d'image à partir de la pluralité d'images d'un échantillon à analyser, - une étape de détermination, par comptage de colonies dont la 10 présence a été détectée au cours de l'étape de détection, d'un nombre de colonies présentes dans un échantillon à analyser. 14. Appareil selon la revendication 13, dans lequel l'unité de traitement est, en outre, configurée pour mettre en oeuvre, pour chacun des échantillons à 15 analyser : -une analyse d'une variation du nombre de colonies, déterminé lors de l'étape de détermination, présentes dans l'échantillon à analyser, -lorsque ledit nombre de colonies est constant pendant une durée supérieure à une valeur prédéterminée, une détermination d'un nombre, dit 20 définitif, de colonies présentes dans ledit échantillon à analyser. 15. Appareil selon la revendication 14, comprenant un moyen d'avertissement et/ou de communication agencé pour prévenir un utilisateur de la détermination du nombre définitif de colonies présentes 25 dans un échantillon et/ou un ensemble d'échantillons. 16. Appareil selon l'une quelconque des revendications 13 à 15, dans lequel le système de manutention comprend un bras robotisé, ledit bras comprenant une pince de serrage agencée pour saisir un échantillon à 30 analyser par préhension. 17. Appareil selon l'une quelconque des revendications 13 à 16, dans lequel le dispositif de stockage est un carrousel, ledit carrousel comprenant un ensemble d'emplacements de stockage identifiés et répartis autour d'un axe 3062133 - 30 - central du carrousel, de préférence sous forme de colonnes et/ou de rangées. 18. Appareil selon l'une quelconque des revendications 13 à 17, dans lequel 5 l'unité de traitement est, en outre, configurée pour : -calculer une séquence d'acquisition des échantillons à analyser, -calculer une séquence de convoyage des échantillons à analyser à partir de la séquence d'acquisition calculée. 10 19. Appareil selon la revendication 18, dans lequel l'unité de traitement est, en outre, configurée pour calculer la séquence d'acquisition et la séquence de convoyage des échantillons à analyser après : -chaque ajout d'un échantillon à l'ensemble d'échantillons à analyser par chargement dudit échantillon dans le dispositif de stockage, et/ou 15 -chaque retrait d'un échantillon dudit ensemble d'échantillons à analyser par déchargement dudit échantillon à partir du dispositif de stockage, et/ou -chaque mise en oeuvre de l'étape de détermination d'un nombre de colonies présentes dans un des échantillons à analyser. 20. Appareil selon l'une quelconque des revendications 16 à 19, dans lequel la pince de serrage comprend un capteur de force agencé pour limiter la pression maximale exercée par ladite pince de serrage lors d'une saisie d'un échantillon de sorte que ladite pince de serrage est apte à saisir, par préhension d'une partie quelconque, un échantillon, en particulier une boîte de Pétri, d'une taille comprise entre 50 et 100 mm de diamètre.