FR 2598431 A1 19871113 FR 8606703 A 19860509 La présente invention décrit des procédés permettant de faire sécréter une exo-alpha-amylase thermorésistante par différentes souches de levure du genre Saccharomyces. Les levures Saccharomyces sécrètent naturellement des protéines dans le milieu de culture, ces protéines sont synthétisées sous forme de précurseur dont la maturation en exoprotéines se fait le long du chemin de sécrétion (1). Il est possible de faire sécréter par la levure des enzymes étrangères d'intérêt industriel, comme par exemple des alpha10 amylases d'origines diverses/(levure Saccharomycopsis (2), blé (3), souris (4)/ ou des alpha-amyloglucosidases /(Aspergillus (5), Saccharomycopsis (6)7, etc. Les souches de Bacillus licheniformis produisent des exo-alpha-amylases thermostables qui sont utilisées dans 15 les procédés de liquéfaction de l'amidon ou dans ceux conduisant à l'obtention de glucose à partir d'amidon. L'objet de la présente invention est de faire produire une telle exoalpha-amylase thermostable par des levures du genre Saccharomyces. Plus particulièrement, la présente invention concerne de nouvelles souches de Saccharomyces, caractérisées en ce qu'elles comportent un bloc d'expression de l'exoalpha-amylase intégré dans un chromosome ou bien inséré sur un vecteur extrachromosomique. Parmi les exo-alpha-amylases selon l'invention, il faut citer plus particulièrement les amylases thermostables de Bacillus licheniformis. Le bloc d'expression de l'exc-alpha-amylase a, 10 de préférence, la structure suivante: Pr Pre Pro alpha-amylase I I iI Pr est un promoteur de levure, alpha-amylase est la séquence codant pour la partie mature de l'alpha-amylase, Pre Pro est la séquence pré pro du gène de la phéromone alpha-1. Le promoteur de levure peut être, par exemple, le promoteur du gène PGK, quant à l'extrémité 3' de la séquence, elle peut comporter un terminateur de levure 20 tel que le terminateur du gène PGK. Lorsque ce bloc d'expression est intégré dans un chromosome, la technique d'intégration étant une recombinaison, on intègrera de préférence le bloc d'expression dans un gène conférant un phénotype qui peut aisément être 25 mis en évidence, par exemple le gène HIS, l'intégration du bloc d'expression conduisant au phénotype his qui peut être mis en évidence. Lorsque le bloc d'expression est inséré dans un vecteur extrachromosomique, il s'agira de préférence d'un 30 plasmide comportant une origine de réplication de levure, par exemple l'origine de réplication du plasmide 2g. Ce type de vecteur comportera, en outre, de préférence un gène marqueur de sélection tel que ura3 ou + Leu2 qui assurent la complémentation pour l'uracile ou la leucine. Ces vecteurs peuvent également être des plasmides navettes et comporter une origine de réplication dans les bactéries, par exemple celle du plasmide pBR322, et un ou plusieurs gènes de sélection dans les bactéries, tels que Amp par exemple. Dans certains cas, il peut être nécessaire 10 d'utiliser, lors de la cotransformation, un vecteur conférant un phénotype dominant, comme dans le cas des souches industrielles prototrophes. Parmi les phénotypes dominants commodes, il faut citer la résistance au G418. Parmi les souches industrielles transformées, 15 il faut citer, en particulier, les souches polyploides de boulangerie telles que TGF1 ou les souches de brasserie telles que S. uvarum. Bien entendu, les souches selon l'invention permettent, tout d'abord, la préparation d'une exo-alpha20 amylase thermostable. C'est pourquoi la présente invention concerne un procédé de préparation d'une alpha-amylase thermostable, caractérisé en ce qu'on cultive sur un milieu de culture une souche de Saccharomyces selon l'invention et on récupère 25 l'enzyme dans le milieu de culture. Mais, l'intérêt de cette expression hétérologue est multiple. Tout d'abord, les levures selon l'invention produisant l'exo-alphaamylase sont facilement identifiables 30 sur milieu solide contenant de l'amidon. En effet, l'amidon au contact de l'iode (I2) prend une coloration bleue, or les levures selon l'invention, qui produisent l'exo-alpha-amylase dans le milieu de culture, dégradent l'amidon, il s'ensuit un halo de décoloration autour des colonies exprimant cette activité amylolytique. On peut ainsi très facilement distinguer leslevures transformées des levures Saccharomyces de type sauvage qui ne sécrètent pas d'activité alpha-amylasique. D'autre part, les levures produisant l'exo-alpha10 amylase peuvent à leur tour servir comme hôte de transformation. L'introduction du bloc d'expression génétique de l'exo-alpha-amylase en un exemplaire dans un site préalablement caractérisé du génome de la cellule hôte, suivant 15 les techniques connues de l'homme de l'art sous le vocable anglais "gene disruption" (7) et précisées ci-après, permet de "marquer" la souche réceptrice. Si on veut par ces mêmes techniques introduire une nouvelle séquence d'ADN à la place du bloc d'expression de l'exo-alpha-amylae, il est possible 20 d'utiliser cette souche transformée exprimant l'exo-alphaamylase comme réceptrice pour la transformation. Les colonies issues des cellules ayant échangé les séquences d'expression d'ADN sont facilement repérables car elles ont perdu la capacité de former le halo de décoloration de l'amidon en présence d'iode. Même si la fréquence d'échange est faible et nécessite l'analyse de 100 à 1 000 clones transformés dans des expériences de cotransformation, la détection par l'absence de halo permet de repérer d'emblée les candidats intéressants et donc de limiter l'analyse aux clones 30 n'exprimant plus l'alpha-amylase. En particulier, il n'est pas nécessaire que la nouvelle séquence code pour une nouvelle activité enzymatique ni de procéder à des recherches systématiques par hybridation d'acide nucléique pour discriminer les candidats recherchés du reste des clones transformés. C'est pourquoi l'invention concerne l'application des levures selon l'invention pour l'intégration d'une séquence d'ADN déterminée dans ladite souche, caractérisée en ce que-le vecteur d'intégration comporte la séquence d'ADN à intégrer entre des séquences assurant l'échange avec le bloc d'expression de l'exo-alpha-amylase ou une partie essentielle de ce bloc, et en ce que l'on sélectionne les souches ne produisant plus de halo de décoloration en présence d'iode (I2) et d'amidon. En troisième lieu, l'activité de l'alpha-amylase de B. licheniformis se caractérise par le clivage des liaisons alphal_4 de l'amylose et de l'amylopectine libérant 15 essentiellement des dextrines. L'action conjointe de l'alphaamylase et de l'alpha-amyloglucosidase résulte dans une synergie totale conduisant à une dégradation efficace de l'amidon essentiellement en résidus glucoses directement assimilables par la levure. En dernier lieu, l'utilisation d'une levure de boulangerie Saccharomyces cerevisiae dont le patrimoine génétique contient le nouveau caractère génétique conduisant à l'expression et à la sécrétion d'une telle alphaamylase permettrait d'obtenir un produit de panification dont le 25 rassissement serait freiné par l'action bénéfique d'une activité alpha-amylase thermostable résiduelle (8). Les exemples ci-après sont destinés à illustrer d'autres caractéristiques et avantages de la présente invention. EXEMPLE 1 CLONAGE DU GENE DE L'ALPHA-AMYLASE DE BACILLUS LICHENIFORMIS DANS LE BACTERIOPHAGE X On a complètement digéré, par EcoRI, 1 gg d'ADN génomique de B. licheniformis NCIB6346 et 1 gg d'ADN du bactériophage X607, puis lié covalemment ces ADNs à l'aide de la T4 ADN ligase. 50 Fg du produit de ligation ont été empaquetés in vitro (9) dans les particules phagiques et les phages ainsi formés ont servi à transduire la souche indicatrice E. coli POP101. Sur les bootes de transduction, on a coulé une couche de Lagar supplémenté avec 0,4 % (poids-volume) d'amidon soluble. Après incubation des boîtes une nuit à 37 C, on a exposé les boites aux vapeurs d'iode. l'amidon au contact de l'iode se colore. L'amidon dégradé 15 par l'alphaamylase fixe beaucoup moins l'iode. Un halo de décoloration présent autour d'une plage de lyse a permis de repérer des bactéries infectées qui produisent de l'alphaamylase active. L'analyse de l'ADN du phage responsable de cette plage de lyse a révélé qu'il contenait un fragment EcoRI de 3,5 kb provenant de B. licheniformis et correspondant au gène de l'alpha-amylase en entier. Ce fragment a été recloné dans un vecteur navette E. coli-B. subtilis pBD64, décrit dans la littérature (10). Après transformation de la souche B. subtilis 1A289, on a pu isoler un plasmide qui 25 dérive de l'addition du fragment EcoRI au site EcoRI de pBD64, ce plasmide a été appelé pTG443 (figure 1). EXEMPLE 2 CONSTRUCTION D'UN VECTEUR D'EXPRESSION D'EXO-ALPHA-AMYLASE POUR LA LEVURE S. CEREVISIAE Le fragment cloné dans pTG443 possède un site PstI situé au début du gène codant pour l'alpha-amylase et un autre site PstI situé en aval du signal d'arrêt de traduction de ce gène. Ce fragment PstI, portant l'essentiel de l'information pour l'alpha-amylase, a été cloné dans le site PstI unique du phage M13TG112. Ce nouveau phage est appelé M13TG1801. L'intérêt du clonage est de permettre de ressortir la séquence de l'alphaamylase sous forme d'un fragment HindIII (figure 2). Ce fragment HindIII a été cloné dans le site HindIII du phage M13TG889 dont la construction est détaillée ci-après. Le plasmide de départ est le pTG848 (identique 10 au pTG849 décrit dans le brevet français 83 15716 à l'exception du gène ura3 dont l'orientation est inversée), il est constitué des fragments d'ADN suivants (figure 3): 1) Le fragment EcoRI-HindIII d'environ 3,3 kb en provenance du plasmide pJDB207 (11). Le site HindIII correspond à la 15 coordonnée 105 du plasmide 2. forme B, le site EcoRI à la coordonnée 2243. Dans ce fragment le 21 est de la forme B (12). Ce fragment permet la réplication autonome du plasmide dans la levure et la sélection du plasmide dans les souches ura3 sur milieu dépourvu de source de 20 pyrimidine. 2) Le fragment HindIII du gène URA3 (13). 3) Le grand fragment EcoRI (coordonnée 0)-SalI (coordonnée 650) de pBR322 (14). Dans le site PvuII de ce fragment a été inséré le fragment EcoRIHindIII dont les extrémités ont 25 été préalablement rendues franches par action de la Klenow en présence des 4 désoxyribonucléotides, fragment de 510 paires de bases et correspondant à la fin du gène PGK (15). L'extrémité EcoRI arasée du gène PGK, lorsque jointe à l'extrémité PvuII de pBR322, régénère un site 30 EcoRI. 4) Le fragment HindIII-SalI (2,15 kb) du gène PGK (15). Le plasmide pTG848 a été coupé par HindIII, les extrémités des deux fragments ainsi libérés sont rendues franches par traitement à la klenow en présence des 4 désoxyribonucléotides (16). Les deux fragments sont mis en ligation et, avant transformation, ce mélange de ligation est soumis à l'action de HindIII, ce qui permet d'éliminer toute forme de plasmide ayant conservé un (ou deux) site HindIII. On transforme la souche E. coli (pyrF) (17) et on sélectionne les transformés pour la résistance à l'ampicilline 10 et pour le caractère pyrF. On obtient ainsi le plasmide pTG874 (figure 3) o les deux sites HindIII sont supprimés, l'orientation du gène URA3 donnant lieu à une transcription dans la même orientation que celle du gène de la phosphoglycérate kinase (PGK). Le plasmide pTG874 est coupé par SmaI et SalI, le fragment de 8,6 kb est ensuite isolé à partir d'un gel d'agarose. Le plasmide pTG864, qui comprend le fragment EcoRI-SalI (environ 1,4 kb) du gène MFa1 cloné dans les mêmes sites de pBR322,est coupé par EcoRI. Les extrémités du plasmide ainsi linéarisé sont rendues franches par action de la klenow en présence des 4 nucléotides. Une digestion par l'enzyme SalI est ensuite effectuée et le fragment EcoRI (extrémité franche)-SalI correspondant au gène MFa1 est isolé. Ce dernier fragment est mis en ligation avec le morceau SmaISalI (8,6 kb) du pTG874 pour donner ainsi le plasmide pTG876 (figure 4). Afin de supprimer le site BglII situé en aval du gène MFa1, on a digéré partiellement ce plasmide pTG876 par BglII, puis on a fait agir le fragment Klenow de la DNA polymérase de E. coli en présence des 4 désoxyribonucléotides et on a lié covalemment les molécules d'ADN sur elles-mêmes grâce à l'action de la DNA ligase du phage T4. Le plasmide pTG883 ne possède plus qu'un seul site BglII, situé en amont du promoteur du gène de la phéromone (figure 5). Le plasmide pTG883(20 ag) a été linéarisé par digestion par BglII puis soumis à une digestion ménagée par la nucléase 5 Bal31 (1,4 unités, 10 minutes - Boehringer Mannheim) suivant les techniques habituelles. L'ADN ainsi traité a été purifié par extractions successives au phénol et chloroforme-alcool isoamylique, puis une fraction (5 gg) a été soumise à l'action de la polymérase Klenow afin d'obtenir un maximum d'extrémités 10 franches. L'ADN ainsi traité a été mis à "liguer" avec des "linkers" BamHI non phosphorylés (5'-CGGATCCG) en présence de la ligase du phage T4 suivant la technique décrite par Lathe et al. (18). Après transformation de E. coli 1106 pour la résistance à l'ampicilline, on a isolé un plasmide pTG892 15 (figure 6) délété pour la région 5' flanquant le gène MFa1, le linker BamHI étant localisé une base en amont de l'ATG suivant le schéma: ' - CGGGATCCCG A ATG AGA TTT...... linker BamHI partie codante MTa1 Le nouveau fragment BamHI-SalI ainsi obtenu a été cloné entre les sites BamHI et SalI du phage M13TG120 pour donner le phage M13TG889 (figure 7). Le fragment HindIII de M13TG1801 (voir figure 2) comprenant, dans l'ordre, une courte séquence provenant de 25 M13TG120 suivi de l'essentiel de la séquence de l'alphaamylase (à partir du site PstI) a été cloné dans le site HindIII de M13TG889 de façon à mettre en phase la séquence de l'alpha-amylase avec la séquence pre-pro de la phéromone alpha. Le phage ainsi constitué est appelé M13TG1802(figure 8). 30 Le fragment BamHIBglII de M13TG1802 a été échangé avec le fragment BglII-BglII de pTG848. On obtient ainsi un nouveau plasmide appelé pTG1803 (figure 9). En résumé, le plasmide pTG1803 possède: 1) un fragment du plasmide 2g de S. cerevisiae qui permet sa réplication,dans Saccharomyces; 2) le gène URA3+ de S. cerevisiae qui permet la sélection 5 des cellules transformées à partir d'une réceptrice ura3 sur milieu dépourvu de source de pyrimidine; 3) l'origine de réplication du plasmide pBR322 et le gène de résistance à l'ampicilline qui permettent la réplication du plasmide et la sélection des transformés chez E. coli; 10 4) le promoteur et le terminateur du gène PGK de levure qui assurent respectivement l'initiation et l'arrêt de transcription du bloc d'expression de l'exo- alpha-amylase; ) un gène codant pour un précurseur de cette exo- alphaamylase constitué des séquences pre-pro du gène de la phéromone alpha-1 (MFal) de S. cerevisiae fusionné à la séquence codant pour la partie mature de l'alpha-amylase. EXEMPLE 3 TRANSFORMATION D'UNE SOUCHE DE LABORATOIRE AVEC L'ADN DE pTG1803 Ce plasmide, quand on transforme une souche ++ Saccharomyces et sélectionne pour ura ou leu +, se réplique dans les cellules et confère à la souche la capacité de sécréter l'alpha-amylase. Comme exemple, on a transformé la souche TGY2sp13b (Mata ura3-251-373-328 leu2-3-12) et + sélectionné pour ura suivant les techniques décrites (19) 25 et testé la présence d'alpha-amylase autour des colonies. La technique est la suivante: On dépose un pâté de cellules sur boîtes YNBG standard supplémenté en amidon 2 % (poids/volume) (YNBG: yeast nitrogen base w/o aminoacides (Difco) 0,67 %, casamino30 acides 0,5 %, glucose 2 % (poids/volume). Après 48 heures de croissance, on coule 1 ml de mélange aqueux iode 3 g/l, KI 15 g/l pour colorer les boîtes. Le surplus de liquide est jeté. Comme attendu, on a trouvé que tous les transformés sécrètent de l'alphaamylase active. l1 EXEMPLE 4 CONSTRUCTION D'UN PLASMIDE D'INTEGRATION POUR S. CEREVISIAE Pour ce faire, on a cloné dans le site BamHI d'un phage M13 (M13TG701) un fragment BamHI correspondant à la région du chromosome XV portant le gène HIS3 de S. cerevisiae (20). Ce nouveau phage est appelé M13TG1808. l'ADN de M13TG1808 a été digéré par HindIII ce qui libère un petit fragment d'environ 0,2 kb interne au gène His3. A la place de ce petit fragment, on a inséré 10 par "blunt-end ligation", après action de la polymérase Rlenow, le fragment SmaI-BglII de pTG1803 qui comprend la séquence du gène pre-pro-amylase sous contrôle du promoteur PGK. Ce nouveau phage, appelé M13TG1811, libère par BamHI un fragment d'ADN de levure dans lequel on a intégré le 15 système d'expression de l'alpha-amylase (figure 10). EXEMPLE 5 COTRANSFORMATION DE TGY2sp13b EN VUE D'OBTENIR DES LEVURES S. CEREVISIAE AYANT INTEGRE LE BLOC D'EXPRESSION DE L'ALPHA-AMYLASE Le fait de libérer par digestion un fragment d'ADN linéaire homologue à une région du génome de levure favorise les évènements de recombinaison entre la région chromosomique et le fragment. En particulier, si le fragment renferme des séquences étrangères, on peut obtenir 25 la substitution de la séquence chromosomique par celle du fragment linéaire et donc l'intégration des séquences étrangères dans le chromosome. On a transformé la souche TGY2sp13b (Mata ura3+ 251-373-328 leu2-3-12) en ura avec de l'ADN de pFL1 (21). 30 Tout autre ADN plasmidique se répliquant dans la levure et comportant le gène ura3, à l'exclusion de ceux portant + HIS3, pourrait être utilisé. En même temps que cet ADN de pFL1, on a ajouté aux cellules compétentes de l'ADN de M13TG1811 préalablement coupé par BamHI. Plusieurs conditions ont été utilisées qui font 5 varier les quantités d'ADN transformant. Les résultats sont indiqués dans le tableau I. Sur les 534 clones obtenus, on a testé ceux qui étaient devenus his-. En effet, la substitution du locus HIS3 par la séquence du fragment BamHI de pTG1811 entra!ne une cassure 10 de la séquence du gène HIS3 qui ne code plus pour une À imidazole glycérate phosphate déshydratase fonctionnelle. On a obtenu deux transformés his. Ces deux clones (appelés TGY2sp1l3b amyl et TGY2spl3b amy2 respectivement) produisent un halo de décoloration au test I2-KI, ce qui indique qu'ils produisent de l'alpha-amylase. La comparaison de la taille du halo dans le cas des transformés intégrés et des transformés plasmidiques indique qu'on a une meilleure production d'alpha-amylase dans le cas de transformés plasmidiques. Tableau I M13TG1811 digéré Nombre de clones ADN de pFL1 par BamHI obtenus 0,1 gg 1 gg 180 0,5 gg 5 gg 152 1 gag 10 gg 202 TOTAL 534 EXEMPLE 6 ECHANGE INVERSE La souche TGY2spl3b amyl a été directement transformée en his+ par l'ADN de M13TG1808 découpé par BamHI. Sur 57 clones His, 38 ne faisaient plus de halo, signe qu'on avait réalisé l'expérience inverse de celle décrite dans l'exemple précédent. EXEMPLE 7 INTEGRATION DANS UNE SOUCHE POLYPLOIDE DE BOULANGERIE (TGF1) On a réalisé la même expérience que celle décrite dans l'exemple 5 en utilisant une souche utilisée dans l'industrie pour la fabrication du pain, fabriquée par la société FALA et commercialisée sous la marque "FALA". Cette souche étant polyploide et prototrophe, la cotransformation 15 avec M13TG1811 se fait en utilisant un plasmide conférant un phénotype dominant. On a utilisé la résistance au G418. Le plasmide que l'on a utilisé est un dérivé du plasmide pTG861 décrit dans le brevet français 84 04453. Le plasmide pTG825 ne diffère de pTG861 que par l'absence d'un ATG hors phase qui 20 a été délété par mutagénèse in vitro pour permettre une meilleure expression du gène de résistance au G418. Tout autre plasmide conférant un phénotype dominant dans la levure pourrait être utilisé. On a transformé la souche TGF1 avec de l'ADN 25 de pTG1825 et de l'ADN de M13TG1811 préalablement digéré par BamHI comme décrit dans l'exemple 5, mais en remplaçant l'ADN de pFL1 par celui de pTG1825. On a obtenu 143 clones, dont 1 exprime l'alpha-amylase de façon stable au cours des générations (TGF amy1). EXEMPLE 8 CONSTRUCTION D'UN VECTEUR D'INTEGRATION POUR UNE SOUCHE DE BRASSERIE (TGB1, S. UVARUM) Un fragment BamHI de l'ADN chromosomique d'une souche de brasserie (TGB1) a été isolé sur la base de la complémentation de l'auxotrophie his de la souche de levure TGYsp1 (Mata ura3-251-373-328 his3-16-15) suivant les techniques classiques d'isolement de gènes de levure. Ce fragment BamHI a été cloné au site BamHI du phage M13TG701. 5 Il présente un site XhoI unique que l'on a rendu franc par action de la polymérase klenow. Dans ce site XhoI modifié, on a intégré le bloc d'expression de l'exo-alphaamylase sous forme d'un fragment SmaI-BglII provenant de pTG1803 et dont les extrémités ont été rendues franches (exemples 2 et 4). Le phage ainsi obtenu a été nommé M13TG1817 (figure 11). EXEMPLE 9 INTEGRATION DU BLOC D'EXPRESSION DE L'EXO-AMYLASE DANS LE CHROMOSOME DE LA SOUCHE DE BRASSERIE La technique de cotransformation a été appliquée 15 à la souche TGB1. On a utilisé comme ADN plasmidique le pTG861 et l'ADN de M13TG1817 linéarisé par BamHI. La transformabilité de la souche TGB1 étant relativement mauvaise, la technique de Ito et al. est inefficace pour cette souche. On a donc utilisé une autre technique dérivée de Dickson et al. (22). 20 La technique quie l'on a utilisée diffère de celle de Dickson et al. dans la manière d'ajouter l'agent sélectif: environ 15 heures après la transformation, on ajoute une surcouche de milieu complet (10 ml) contenant de la généticine (DIFCO) de façon à ce que la concentration 25 finale de l'antibiotique soit 300 gg/ml dans la boîte. Cette technique a permis d'isoler 362 colonies résistantes au G418 dont 5 exprimaient l'amylase de manière stable. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES 1. Schekman R. et P. Novick in the Molecular Blology of the yeast saccharomyces. Metabolism and Gene expression CHS 1982 New York pp 361-393. 2. Yamashita I., Itoh T., Fukui S., (1985) Agric. Biol. Chem. 49 pp 30893091. 3. Rothstein S.J., Lazarus C.M., Smith W.E., Baulcombe D.C., Catenby A.H. (1984) Nature 308 pp 662-665. 4. Thomser K.K. (1983) Carslberg Res. Commun 78 pp 545-555. 5. Innis M.A., Holland, M.J., Mc Cake P.C., et al Science 228 pp 21-26. 6. Yamashita, I., Itoh, T., Fukui, S., (1985) Appl. 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REVENDICATIONS 1) Souche de Saccharomyces caractérisée en ce qu'elle comporte un bloc d'expression de l'exo-alphaamylase intégré dans un chromosome ou bien inséré sur un vecteur extrachromosomique. 2) Souche selon la revendication 1, caractérisée en ce que l'exo-alphaamylase est une exo-alpha-amylase thermostable de Bacillus licheniformis. 3) Souche selon l'une des revendications 1 et 2, caractérisée en ce que le bloc d'expression de l'exo-alpha10 amylase à la structure suivante: Pr Pre Pro alpha-amylase I I I I, Pr est un promoteur de levure, alpha-amylase est la séquence codant pour la partie mature de l'alpha-amylase, pre pro est la séquence pre-pro du gène de la phéromone alpha-1. 4) Souche selon l'une des revendications 1 à 3, caractérisée en ce que Pr est le promoteur du gène PGK. ) Souche selon l'une des revendications 1 à 4, 20 caractérisée en ce que l'extrémité 3' comporte une séquence de terminateur de levure. 6) Souche selon la revendication 5, caractérisée en ce que la séquence de terminateur de levure est celle du gène PGK. 7) Souche selon l'une des revendications 1 à 6, caractérisée en ce que le vecteur extrachromosomique est un plasmide portant une origine de réplication dans les levures. 8) Souche selon la revendication 7, caractérisée 30 en ce que l'origine de réplication est l'origine de réplication du plasmide 2g. 9) Souche de Saccharomyces selon l'une des revendications 1 à 8, caractérisée en ce que la souche est une souche de Saccharomyces sauvage. ) Souche selon l'une des revendications 1 à 8, caractérisée en ce qu'il s'agit d'une souche polyplolde de boulangerie. 11) Souche selon la revendication 10, caractérisée en ce que la souche polyploide de boulangerie est la souche TGF1. 12) Souche selon l'une des revendications 1 à 8, caractérisée en ce que la souche est une souche de brasserie. 13) Souche selon la revendication 12, caractérisée en ce que la souche est une souche de S. uvarum. 14) Procédé de préparation d'une alpha-amylase 15 thermostable, caractérisé en ce qu'on cultive sur un milieu de culture une souche de Saccharomyces selon l'une des revendications 1 à 13 et on récupère l'enzyme dans le milieu de culture. ) Application des levures selon l'une des 20 revendications 1 à 13 pour l'intégration d'une séquence d'ADN déterminée dans ladite souche, caractérisée en ce que le vecteur d'intégration comporte la séquence d'ADN à intégrer entre des séquences assurant l'échange avec le bloc d'expression de l'exo-alpha-amylase ou une partie essentielle de ce bloc, et en ce que l'on sélectionne les souches ne produisant plus de halo de décoloration en présence d'I2 et d'amidon.