Brevet FR3154638A1 — publié le 20250502

Appareil de manipulation, ensemble de manipulation et procédé de manipulation Appareil de manipulation (5) d’un échantillon de matière biologique par l’intermédiaire d’éléments de capture, comprenant : - un support de tube configuré pour recevoir un tube (3) ; - un organe d’agrégation (15) configuré pour générer une force d’attraction magnétique sur les éléments de capture (2), et destiné à coopérer avec une gaine d’interface (20), - un charriot de gaine d’interface (30) déplaçable entre une position haute et une position basse, - un système de sollicitation (45) configuré pour être placé en contact avec la gaine d’interface (20) et générer dans la gaine d’interface (20) des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture de la gaine d’interface (20) après que l’organe d’agrégation (15) et la gaine d’interface (20) sont passés d’un état actif dans lequel l’organe d’agrégation (15) exerce la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture à un état inactif dans lequel l’organe d’agrégation (15) n’exerce pas la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture. Figure de l’abrégé : Fig. 7 Appareil de manipulation, ensemble de manipulation et procédé de manipulation DOMAINE DE LA DIVULGATION La présente divulgation se rapporte à un appareil de manipulation d’un échantillon de matière biologique par l’intermédiaire d’éléments de capture ainsi qu’à un ensemble de manipulation et à un procédé de manipulation mettant en œuvre un tel appareil de manipulation. Sans y être limité, la présente divulgation s’applique notamment à la manipulation d’un échantillon d’acides nucléiques, de protéines, d’anticorps ou autres comme matière biologique, par l’intermédiaire d’éléments de capture, généralement sous forme de billes, magnétiques et configurés pour être solidarisés à l’échantillon de matière biologique. ÉTAT DE LA TECHNIQUE Au cours de son traitement, un échantillon de matière biologique est manipulé notamment en étant plongé successivement dans différentes solutions. C’est par exemple le cas d’un traitement de purification d’un échantillon d’acides nucléiques comme matière biologique. Pour récupérer l’échantillon de matière biologique dispersé dans chacune des solutions et pouvoir le libérer dans l’une des autres solutions, il est connu d’utiliser un appareil de manipulation du type comprenant : - un bâti s’étendant selon un axe vertical, - un support de tube monté sur le bâti et comprenant au moins un espace de réception configuré pour recevoir au moins un tube adapté pour contenir une solution comportant l’échantillon de matière biologique et les éléments de capture ; - un organe d’agrégation configuré pour générer une force d’attraction magnétique sur les éléments de capture, l’organe d’agrégation étant destiné à coopérer avec une gaine d’interface de telle manière que, dans un état actif de l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface, l’organe d’agrégation est reçu dans la gaine d’interface et exerce la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture pour agréger lesdits éléments de capture sur la gaine d’interface et, dans un état inactif de l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface, l’organe d’agrégation n’exerce pas de force d’attraction magnétique sur les éléments de capture. Un exemple d’appareil de manipulation du type précité est décrit dans le document WO 2021/056005. L’organe d’agrégation comprend un aimant permanent qui, dans l’état inactif de l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface, est placé à distance de la gaine d’interface. Même en l’absence de force d’attraction magnétique, des éléments de capture peuvent rester solidaires de la gaine d’interface. Ces éléments de capture et des résidus de matière biologique qui y sont solidarisés peuvent ne pas suivre l’une des étapes du traitement et risquer, au cours d’une étape ultérieure, de contaminer une solution ou la partie de l’échantillon de matière biologique qui a suivi toutes les étapes du traitement. Pour libérer les éléments de capture lorsque l’organe d’agrégation et la gaine d’interface sont immergés dans la solution du tube, l’appareil de manipulation du document WO 2021/056005 prévoit d’écarter l’organe d’agrégation et d’entraîner la gaine d’interface en rotation dans la solution du tube. Des éléments de capture peuvent toutefois rester solidarisés à la gaine d’interface et les turbulences générées dans la solution par la rotation de la gaine d’interface peut détériorer l’échantillon de matière biologique. RÉSUMÉ DE LA DIVULGATION L’invention vise à résoudre le problème énoncé ci-dessus. Pour ce faire, selon un premier aspect, l’invention propose un appareil de manipulation d’un échantillon de matière biologique par l’intermédiaire d’éléments de capture, les éléments de capture étant magnétiques et configurés pour être solidarisés à l’échantillon de matière biologique, l’appareil de manipulation comprenant : - un bâti s’étendant selon un axe vertical, - un support de tube monté sur le bâti et comprenant au moins un espace de réception configuré pour recevoir au moins un tube adapté pour contenir une solution comportant l’échantillon de matière biologique et les éléments de capture ; - un organe d’agrégation configuré pour générer une force d’attraction magnétique sur les éléments de capture, l’organe d’agrégation étant destiné à coopérer avec une gaine d’interface de telle manière que, dans un état actif de l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface, l’organe d’agrégation est reçu dans la gaine d’interface et exerce la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture pour agréger lesdits éléments de capture sur la gaine d’interface et, dans un état inactif de l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface, l’organe d’agrégation n’exerce pas de force d’attraction magnétique sur les éléments de capture, l’appareil de manipulation comprenant en outre : - un charriot de gaine d’interface comprenant un dispositif de maintien configuré pour maintenir la gaine d’interface en regard de l’espace de réception, le charriot de gaine d’interface étant déplaçable selon l’axe vertical par rapport au bâti entre une position haute dans laquelle ledit charriot de gaine d’interface place la gaine d’interface à distance de l’espace de réception, et une position basse dans laquelle ledit charriot de gaine d’interface place la gaine d’interface dans l’espace de réception, - un système de sollicitation configuré pour être placé en contact avec la gaine d’interface et générer dans la gaine d’interface des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture de la gaine d’interface après que l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface sont passés de l’état actif à l’état inactif. Ainsi, l’appareil de manipulation selon l’invention impose une sollicitation sur la seule gaine d’interface, ce qui permet de fiabiliser le détachement des éléments de capture tout en préservant l’échantillon de matière biologique. Selon des dispositions particulières, l’appareil de manipulation peut permettre de réaliser de manière simple et intuitive une ou plusieurs étapes d’un traitement d’un échantillon de matière biologique unitaire. Il peut être adapté à différents types de traitement de différents types d’échantillon de matière biologique. Il peut offrir une compacité et une robustesse lui permettant d’être facilement transporté. Le système de sollicitation peut être agencé pour générer les vibrations au voisinage d’une extrémité d’accès de la gaine d’interface par laquelle l’organe d’agrégation est inséré dans la gaine d’interface, et dans lequel le dispositif de maintien est configuré pour permettre une propagation des vibrations depuis l’extrémité d’accès vers une extrémité libre de la gaine d’interface opposée à l’extrémité d’accès et au voisinage de laquelle sont agrégés les éléments de capture dans l’état actif de l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface. Le dispositif de maintien peut être configuré pour maintenir la gaine d’interface au voisinage de l’extrémité d’accès. Le dispositif de maintien peut comprendre une bague selon un axe de maintien parallèle à l’axe vertical et présentant une surface intérieure destinée à être en contact périphérique avec la gaine d’interface. La bague peut être configurée pour recevoir la gaine d’interface comprenant une paroi latérale selon un axe de gaine et au moins deux ergots saillant transversalement de manière équirépartie depuis une surface extérieure de la paroi latérale, la bague comportant une gorge ménagée sur la surface intérieure autour de l’axe de maintien et configurée pour recevoir les ergots, et au moins deux rainures s’étendant axialement sur la surface intérieure depuis une extrémité de passage jusqu’à la gorge, de manière à permettre un passage des ergots de la gaine d’interface dans une position angulaire de la gaine d’interface par rapport à la bague et un maintien des ergots de la gaine d’interface dans la gorge dans d’autres positions angulaires de la gaine d’interface par rapport à la bague. Le dispositif de maintien peut comprendre en outre une bride déplaçable par rapport au charriot de gaine d’interface entre une position ouverte permettant une mise en place de la bague et une position fermée assurant un maintien en position de la bague par rapport au charriot de gaine d’interface. Le système de sollicitation peut être configuré pour réaliser au moins un choc sur la gaine d’interface. Le système de sollicitation peut comprendre une came entraînée en rotation selon un axe de pivotement et comportant une portion de contact radiale agencée pour venir en contact avec la gaine d’interface dans une plage de position angulaire de la came par rapport au bâti, la came étant à distance de la gaine d’interface en dehors de la plage de position angulaire. La came peut présenter un état de sollicitation dans lequel ladite came est entraînée en rotation et un état d’arrêt dans laquelle ladite came est fixe par rapport au bâti, et le système de sollicitation peut comprendre un dispositif de détection configuré pour arrêter la came en dehors de la plage de position angulaire lorsque la came passe de l’état de sollicitation à l’état d’arrêt. Le système de sollicitation peut être monté sur le charriot de gaine d’interface. L’appareil de manipulation peut comprendre en outre un charriot d’organe d’agrégation portant l’organe d’agrégation, le charriot d’organe d’agrégation étant déplaçable selon l’axe vertical par rapport au bâti entre une position désassemblée à distance du charriot de gaine d’interface de telle manière que l’organe d’agrégation soit écarté de la gaine d’interface, et une position assemblée à proximité du charriot de gaine d’interface de telle manière que l’organe d’agrégation soit reçu dans la gaine d’interface. L’organe d’agrégation peut comporter un aimant permanent à une extrémité distale destinée à être reçue dans la gaine d’interface, l’organe d’agrégation et la gaine d’interface étant dans l’état inactif lorsque le charriot d’organe d’agrégation est dans l’état désassemblé. Le support de tube peut comprendre un barillet comportant une pluralité d’espaces de réception autour d’un axe de barillet, le barillet étant déplaçable en rotation selon l’axe de barillet de manière à placer sélectivement l’un des espaces de réception en regard de la gaine d’interface. Selon un deuxième aspect, l’invention propose un ensemble de manipulation comprenant un appareil de manipulation tel que défini précédemment et au moins une gaine d’interface configurée pour recevoir l’organe d’agrégation et être maintenue dans le dispositif de maintien du charriot de gaine d’interface. Selon un troisième aspect, l’invention propose un procédé de manipulation de manipulation d’un échantillon de matière biologique, le procédé de manipulation mettant en œuvre un ensemble de manipulation tel que défini précédemment et prévoyant de : - placer dans l’espace de réception du support de tube un tube contenant une solution comportant l’échantillon de matière biologique et des éléments de capture, les éléments de capture étant magnétiques et configurés pour être solidarisés à l’échantillon de matière biologique, - placer la gaine d’interface dans le dispositif de maintien du charriot de gaine d’interface en position haute, - mettre le charriot de gaine d’interface dans la position basse et l’organe d’agrégation et la gaine d’interface dans l’état actif , l’organe d’agrégation étant reçu dans la gaine d’interface et exerçant la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture pour agréger lesdits éléments de capture sur la gaine d’interface, - mettre le charriot de gaine d’interface dans la position haute, l’organe d’agrégation et la gaine d’interface restant dans l’état actif, - mettre le charriot de gaine d’interface dans la position basse, l’organe d’agrégation et la gaine d’interface restant dans l’état actif, - mettre l’organe d’agrégation et la gaine d’interface dans l’état inactif, - activer le système de sollicitation pour générer dans la gaine d’interface des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture de la gaine d’interface. BREVE DESCRIPTION DES FIGURES D’autres objet et avantages de l’invention apparaîtront à la lecture de la description détaillée qui suit d’un mode de réalisation particulier de l’invention faite en relation avec les dessins annexés dans lesquels : FIG. 1 - la FIG. 1 est une représentation en perspective d’un ensemble de manipulation comprenant un appareil de manipulation et une gaine d’interface pour manipuler un échantillon de matière biologique par l’intermédiaire d’éléments de capture, les éléments de capture configurés pour être solidarisés à l’échantillon de matière biologique, la gaine d’interface étant configurée pour recevoir un organe d’agrégation de l’appareil de manipulation de telle manière que, dans un état actif de l’organe d’agrégation et de la gaine d’interface, l’organe d’agrégation est reçu dans la gaine d’interface et exerce la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture pour les agréger, FIG. 2 FIG. 3 - les figures 2 et 3 sont des représentations partielles respectivement en vue de face et latérale de l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 , illustrant l’organe d’agrégation et la gaine d’interface montés respectivement sur un charriot d’organe d’agrégation et un chariot de gaine d’interface déplaçables selon un axe vertical sur un bâti, le charriot de gaine d’interface étant en position haute dans laquelle il place la gaine d’interface à distance d’un tube adapté pour contenir une solution comportant l’échantillon de matière biologique et les éléments de capture, le charriot d’organe d’agrégation étant en position désassemblée à distance du charriot de gaine d’interface de telle manière que l’organe d’agrégation soit écarté de la gaine d’interface, FIG. 4 - la FIG. 4 est une représentation agrandie en vue latérale d’une partie de l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 , illustrant le charriot de gaine d’interface en position basse dans laquelle il place la gaine d’interface dans le tube, le charriot d’organe d’agrégation étant en position désassemblée FIG. 5 - la FIG. 5 est une représentation agrandie en vue latérale d’une partie de l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 , illustrant le charriot de gaine d’interface en position basse et le charriot d’organe d’agrégation en position assemblée à proximité du charriot de gaine d’interface de telle manière que l’organe d’agrégation soit reçu dans la gaine d’interface, FIG. 6 - la FIG. 6 est une représentation agrandie en vue latérale d’une partie de l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 , illustrant le charriot de gaine d’interface en position haute et le charriot d’organe d’agrégation en position assemblée, FIG. 7 - la FIG. 7 est une représentation agrandie en perspective d’une partie de l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 , illustrant le charriot de gaine d’interface comprenant un dispositif de maintien configuré pour maintenir la gaine d’interface en regard du tube, et un système de sollicitation configuré pour être placé en contact avec la gaine d’interface et générer dans la gaine d’interface des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture de la gaine d’interface après que l’organe d’agrégation et la gaine d’interface sont passés de l’état actif à un état inactif, FIG. 8 - la FIG. 8 est une représentation en perspective éclatée de dessus du dispositif de maintien de la FIG. 7 et de la gaine d’interface, le dispositif de maintien comprenant une bague dans laquelle la gaine d’interface est insérée et une bride configurée pour recevoir la bague, FIG. 9 - la FIG. 9 est une représentation en perspective éclatée de dessous de la bague du dispositif de maintien de la FIG. 8 , FIG. 10 - la FIG. 10 est une représentation en coupe selon l’orientation référencée X-X sur la FIG. 8 de la bague du dispositif de maintien de la FIG. 8 , FIG. 11 FIG. 12 - les figures 11 et 12 sont des représentations agrandies en vue de face du système de sollicitation de la FIG. 7 , le système de sollicitation comprenant une came entraînée en rotation pour réaliser au moins un choc sur la gaine d’interface générant les vibrations au voisinage d’une extrémité d’accès de la gaine d’interface par laquelle l’organe d’agrégation est inséré dans la gaine d’interface, FIG. 13 - la FIG. 13 est une représentation en perspective éclatée du système de sollicitation de la FIG. 7 , illustrant un dispositif de détection configuré pour arrêter la came en dehors d’une plage de position angulaire dans laquelle la came vient en contact avec la gaine d’interface, FIG. 14 - la FIG. 14 est une représentation schématique d’un exemple particulier, non-limitatif, de mise en œuvre d’un procédé de manipulation avec l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 dans une étape de liage d’un traitement de purification d’un échantillon d’acides nucléiques, [FIG.15] - les figures 15a et 15b sont des représentations schématiques d’un exemple particulier, non-limitatif, de mise en œuvre d’un procédé de manipulation avec l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 dans une étape de lavage de l’échantillon d’acides nucléiques du traitement de purification d’un échantillon d’acides nucléiques, FIG. 16 - la FIG. 16 est une représentation schématique d’un exemple particulier, non-limitatif, de mise en œuvre d’un procédé de manipulation avec l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 dans une étape de séchage du traitement de purification d’un échantillon d’acides nucléiques, FIG. 17 FIG. 17 - les figures 17a et 17b sont des représentations schématiques d’un exemple particulier, non-limitatif, de mise en œuvre d’un procédé de manipulation avec l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 dans une étape d’élution du traitement de purification d’un échantillon d’acides nucléiques, FIG. 18 - la FIG. 18 est une représentation schématique d’un exemple particulier, non-limitatif, de mise en œuvre d’un procédé de manipulation avec l’ensemble de manipulation de la FIG. 1 dans une étape de lavage des éléments de capture du traitement de purification d’un échantillon d’acides nucléiques. DESCRIPTION DÉTAILLÉE Les figures 1 à 3 représentent un mode de réalisation d’un appareil de manipulation 5 d’un échantillon de matière biologique 1. La manipulation est réalisée par l’intermédiaire d’éléments de capture 2, généralement sous forme de billes, magnétiques et configurés pour être solidarisés à l’échantillon de matière biologique 1. Dans un exemple particulier, l’appareil de manipulation 5 peut être utilisé pour manipuler un échantillon d’acides nucléiques, de protéines, d’anticorps ou autres comme matière biologique. L’appareil de manipulation 5 comprend un bâti 6 s’étendant selon un axe vertical A depuis une base 7 configurée pour reposer sur une surface d’appui. Un support de tube 8 est monté sur la base 7 du bâti 6 et comprend un ou plusieurs espaces de réception 9 présentant chacun un axe de réception R parallèle à l’axe vertical A. Chaque espace de réception 9 est configuré pour recevoir coaxialement un tube 3 adapté pour contenir une solution comportant l’échantillon de matière biologique 1 et les éléments de capture 2. Chaque tube 3 comporte une paroi latérale autour d’un axe de tube T et qui s’étend depuis un fond 3a fermé jusqu’à une ouverture supérieure 3b. Dans le mode de réalisation représenté, le support de tube 8 comprend un barillet 10 comportant plusieurs espaces de réception 9, par exemple huit, autour d’un axe de barillet B parallèle à l’axe vertical A. Le barillet 10 est entraîné en rotation selon l’axe de barillet B par un système d’entraînement, tel qu’un moteur électrique placé dans la base 7 du bâti 6. L’appareil de manipulation 5 comprend un organe d’agrégation 15 configuré pour générer une force d’attraction magnétique sur les éléments de capture 2. Dans le mode de réalisation représenté, sans y être limité, l’organe d’agrégation 15 comporte une tige 16 qui s’étend selon un axe de tige I entre une extrémité proximale et une extrémité distale. L’organe d’agrégation 15 comporte également un aimant permanent 17 s’étendant coaxialement à l’extrémité distale de la tige 16. L’organe d’agrégation 15 est configuré pour coopérer avec une gaine d’interface 20. La gaine d’interface 20 comprend une paroi latérale autour d’un axe de gaine G et qui s’étend entre une extrémité d’accès 20a par laquelle l’extrémité distale de l’organe d’agrégation 15 peut être insérée dans la gaine d’interface 20 et une extrémité libre 20b, fermée. La gaine d’interface 20 constitue un consommable évitant de souiller et de détériorer l’organe d’agrégation 15. La gaine d’interface 20 est montée sur un charriot de gaine d’interface 30. Le charriot de gaine d’interface 30 s’étend perpendiculairement à l’axe vertical A depuis une extrémité de guidage 31 montée coulissante sur un mât vertical 35. Le charriot de gaine d’interface 30 est déplaçable selon l’axe vertical A entre des positions haute et basse par l’intermédiaire d’un dispositif d’entraînement comprenant, dans le mode de réalisation représenté, une vis sans fin 36 s’étendant selon l’axe vertical A et entraînée en rotation par un moteur électrique placé dans la base 7 du bâti 6. Sur la FIG. 3 , le charriot de gaine d’interface 30 est dans la position haute dans laquelle il place la gaine d’interface 20 à distance et en regard de l’un des espaces de réception 9 avec l’axe de gaine G aligné avec l’axe de réception R. Lorsqu’un tube 3 est placé dans l’espace de réception 9, l’axe de gaine G est aligné avec l’axe de tube T et l’extrémité libre 20b de la gaine d’interface 20 est en regard de l’ouverture supérieure 3b du tube 3. La rotation du barillet 10 permet de placer sélectivement l’un des espaces de réception 9 et, le cas échéant, le tube 3 qu’il reçoit, en regard de la gaine d’interface 20. Sur la FIG. 4 , le charriot de gaine d’interface 30 est dans la position basse dans laquelle il place la gaine d’interface 20 dans l’espace de réception 9. La gaine d’interface 20 peut alors pénétrer coaxialement le tube 3 reçu dans l’espace de réception 9 par l’ouverture supérieure 3b jusqu’à ce que l’extrémité libre 20b de la gaine d’interface 20 soit située au voisinage du fond 3a du tube 3. De façon analogue, l’organe d’agrégation 15 est monté sur un charriot d’organe d’agrégation 40. Le charriot d’organe d’agrégation 40 s’étend perpendiculairement à l’axe vertical A depuis une extrémité de guidage 41 montée coulissante sur le mât vertical 35, au-dessus du charriot de gaine d’interface 30. Le charriot d’organe d’agrégation 40 est déplaçable selon l’axe vertical A entre des positions désassemblée et assemblée par l’intermédiaire d’un dispositif d’entraînement comprenant, comme pour le charriot de gaine d’interface 30, une autre vis sans fin 36 s’étendant selon l’axe vertical A et entraînée en rotation par un moteur électrique placé dans la base 7 du bâti 6. Sur les figures 3 et 4, le charriot d’organe d’agrégation 40 est dans la position désassemblée à distance du charriot de gaine d’interface 30 de telle manière que l’organe d’agrégation 15 soit écarté de la gaine d’interface 20, avec l’axe de tige T aligné avec l’axe de gaine G et l’extrémité distale de l’organe d’agrégation 15 en regard de l’extrémité d’accès 20a de la gaine d’interface 20. Sur les figures 5 et 6, le charriot d’organe d’agrégation 40 est dans la position assemblée à proximité du charriot de gaine d’interface 20 de telle manière que l’organe d’agrégation 15 soit reçu coaxialement dans la gaine d’interface 20, avec l’aimant permanent 17 au voisinage de l’extrémité libre 20b de la gaine d’interface 20. Sur la FIG. 5 , le charriot de gaine d’interface 30 dans la position basse et le charriot d’organe d’agrégation 40 dans la position assemblée placent l’organe d’agrégation 15 dans la gaine d’interface 20 elle-même placée dans le tube 3 au voisinage du fond 3a du tube 3. Cet agencement constitue un état actif de l’organe d’agrégation 15 et de la gaine d’interface 20 dans lequel l’organe d’agrégation 15 exerce la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture 2 pour les agréger sur la gaine d’interface 20. Sur les figures 3 et 4, la position désassemblée du charriot d’organe d’agrégation 40 place l’organe d’agrégation 15 à distance de la gaine d’interface 20 où il n’exerce pas de force d’attraction magnétique sur les éléments de capture 2. L’organe d’agrégation 15 et la gaine d’interface 20 sont alors dans un état inactif. Les figures 7 à 10 illustrent un dispositif de maintien 24 agencé sur le charriot de gaine d’interface 30, à l’opposé de l’extrémité de guidage 31, et configuré pour maintenir la gaine d’interface 20. Le dispositif de maintien 24 comprend une bague 25 selon un axe de maintien M parallèle à l’axe vertical A et présentant une surface intérieure destinée à être en contact périphérique avec la gaine d’interface 20, au voisinage de l’extrémité d’accès 20a. Dans le mode de réalisation représenté, la paroi latérale de la gaine d’interface 20 comporte des ergots 22 saillant transversalement par rapport à l’axe de gaine G depuis une surface extérieure. Sur la FIG. 8 , la gaine d’interface 20 comporte deux ergots 22 diamétralement opposés. Tout autre agencement d’ergots 22 équirépartis pourrait toutefois être prévu. La bague 25 comporte une gorge 26 ménagée sur la surface intérieure autour de l’axe de maintien M et configurée pour recevoir les ergots 22. Deux rainures 27 s’étendent selon l’axe de maintien M sur la surface intérieure depuis une extrémité de passage jusqu’à la gorge 26, de manière à permettre un passage des ergots 22 de la gaine d’interface 20 dans une position angulaire de la gaine d’interface 20 par rapport à la bague 25 et un maintien des ergots 22 de la gaine d’interface 20 dans la gorge 26 dans d’autres positions angulaires de la gaine d’interface 20 par rapport à la bague 25. Le dispositif de maintien 24 comprend en outre une bride 28 pourvu d’un logement selon un axe de logement L parallèle à l’axe vertical A et configuré pour recevoir la bague 25 avec l’axe de maintien M aligné à l’axe de logement L. La bride 28 est déplaçable par rapport au charriot de gaine d’interface 30 entre une position ouverte permettant une mise en place de la bague 25 et une position fermée assurant un maintien en position de la bague 25 par rapport au charriot de gaine d’interface 30. Les figures 11 et 12 représentent un système de sollicitation 45 configuré pour être placé en contact avec la gaine d’interface 20et générer dans la gaine d’interface 20 des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture 2 de la gaine d’interface 20 après que l’organe d’agrégation 15 et de la gaine d’interface 20 sont passés de l’état actif à l’état inactif. Dans le mode de réalisation représenté, le système de sollicitation 45 est monté sur le charriot de gaine d’interface 30 et comprend une came 46 montée pivotante selon un axe de pivotement P perpendiculaire à l’axe vertical A sur le charriot de gaine d’interface 30. La came 46 comporte une portion de contact 47 radiale agencée pour venir en contact avec la gaine d’interface 20, au voisinage de l’extrémité d’accès 20a, dans une plage de position angulaire de la came 46 par rapport au charriot de gaine d’interface 30. La came 46 est à distance de la gaine d’interface 20 en dehors de la plage de position angulaire. La came 46 présente un état d’arrêt dans laquelle elle est fixe par rapport au bâti 6 et au charriot de gaine d’interface 30. Elle présente également un état de sollicitation dans lequel elle est entraînée en rotation selon l’axe de pivotement P de manière à solliciter de manière intermittente, sous la forme de chocs, la gaine d’interface 20 et générer les vibrations au voisinage de l’extrémité d’accès 20a. Le dispositif de maintien 24 est alors configuré pour permettre une propagation des vibrations depuis l’extrémité d’accès 20a vers l’extrémité libre 20b de la gaine d’interface 20. Sur la FIG. 13 , afin d’arrêter la came 46 en dehors de la plage de position angulaire lorsque la came 46 passe de l’état de sollicitation à l’état d’arrêt, le système de sollicitation 45 comprend un dispositif de détection 50. Dans le mode de réalisation représenté, le dispositif de détection 50 met en œuvre un capteur de type REED 51 monté sur le charriot de gaine d’interface 30 en dehors de la plage de position angulaire de la came 46. La came 46 comprend un flasque 48 qui s’étend sur un secteur angulaire perpendiculairement à l’axe de pivotement P et parallèlement à la portion de contact 47 de la came 46, en étant centré sur cette portion de contact 47. Sur une surface en regard du capteur de type REED 51, le flasque 48 comprend un organe magnétique 52, sous la forme de deux aimants dans le mode de réalisation représenté. Ainsi, lorsque la came 46 passe de l’état de sollicitation à l’état d’arrêt, elle est entraînée par impulsions jusqu’à ce que l’organe magnétique 52 soit détecté par le capteur de type REED 51 et arrête la came 46 en dehors de la plage de position angulaire de la came 46. L’appareil de manipulation 5 peut être mis en œuvre dans un procédé de manipulation prévoyant de placer dans l’espace de réception 9 du support de tube 8 un tube 3 contenant une solution comportant l’échantillon de matière biologique 1 et des éléments de capture 2. Le charriot de gaine d’interface 30 est en position haute et la bride 28 du dispositif de maintien 24 est placée dans la position ouverte. La bague 25 est placée dans le logement de la bride 28. La gaine d’interface 20 est insérée dans la bague 25 du dispositif de maintien 24 dans la position angulaire mettant les ergots 22 de la gaine d’interface 20 en correspondance avec les rainures 27. Lorsque les ergots 22 atteignent la gorge 26, la gaine d’interface 20 est pivotée autour de son axe de gaine G pour verrouiller la gaine d’interface 20 dans la bague 25. La bride 28 est placée dans la position fermée. Le charriot de gaine d’interface 30 est déplacé vers la position basse puis le charriot d’organe d’agrégation 40 est placé dans la position assemblée. L’organe d’agrégation 15 et la gaine d’interface 20 sont alors dans l’état actif avec l’organe d’agrégation 15 reçu dans la gaine d’interface 20 et exerçant la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture 2 pour les agréger sur la gaine d’interface 20. L’échantillon de matière biologique 1 peut ainsi être collecté sur la gaine d’interface 20. Le charriot de gaine d’interface 30 est déplacé dans la position haute, l’organe d’agrégation 15 et la gaine d’interface 20 restant dans l’état actif pour extraire l’échantillon de matière biologique 1 de la solution contenue dans le tube 3. Le barillet 10 peut être pivoté pour mettre un autre tube 3 avec une autre solution en regard de la gaine d’interface 20. Le charriot de gaine d’interface 30 peut alors être placé dans la position basse, l’organe d’agrégation 15 et la gaine d’interface 20 restant dans l’état actif, puis le charriot d’organe d’agrégation 40 est déplacé vers la position désassemblée pour mettre l’organe d’agrégation 15 et la gaine d’interface 20 dans l’état inactif. Le système de sollicitation 45 peut alors être activé pour générer dans la gaine d’interface 20 des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture 2 de la gaine d’interface 20. En relation avec les figures 14 à 18, il est maintenant décrit un exemple particulier, non-limitatif, de mise en œuvre du procédé de manipulation au cours de différentes étapes d’un traitement de purification d’un échantillon d’ADN. L’expérimentation propose une comparaison de résultats d’une extraction « manuelle » et d’une extraction « automatisée », c’est-à-dire mettant en œuvre l’appareil de manipulation, d’ADN de Listeria monocytogenes à partir d’une culture en présence ou non d’une matrice agro-alimentaire. Les deux types d’extractions sont réalisées à partir d’un même kit d’extraction et sur le même échantillon. Protocole suivi Culture des Listeria monocytogenes Souche utilisée : Listeria monocytogenes American Type Culture Collection (ATCC) 13932 Culture hors matrice : Dépôt d’une cryobille dans 10ml d’ d’Eau Peptonée Tamponnée (EPT) Culture avec matrice : Dépôt d’une cryobille dans 9ml d’EPT + 1ml de Lait demi-écrémé Mise en incubation à 37°C (±2°C) pendant 18h. Lyse des échantillons (libération du matériel génétique) 1- Prélèvement de 200µl d’échantillon à la pipette monocanal 2- Dépôt dans 200µl de tampon de lyse. Vortexer 3- Incuber 5min à 95°C. Laisser refroidir à température ambiante. Extraction manuelle : 1- Dépôt des 400µl d’échantillon lysé dans le mélange tampon de binding + éléments de capture magnétiques 2- Homogénéiser les éléments de capture dans l’échantillon par aspiration-refoulement (10x) 3- Incuber 1min à température ambiante. 4- Placer l’organe d’agrégation + gaine d’interface dans les éléments de capture. Laisser incuber jusqu’à capture des éléments de capture (environ 1min) 5- Transférer les éléments de capture dans le premier tube de lavage (tampon de lavage n°1). 6- Retirer l’organe d’agrégation de la gaine d’interface et homogénéiser les éléments de capture dans le tampon de lavage 1. 7- Replacer l’organe d’agrégation dans la gaine d’interface jusqu’à capture de tous les éléments de capture (environ 1min). 8- Laisser les éléments de capture sécher à température ambiante pendant 5min. 9- Transférer les éléments de capture dans le tube d’élution. 10- Retirer l’organe d’agrégation de la gaine d’interface et homogénéiser les éléments de capture dans le tampon d’élution. 11- Incuber 1min à température ambiante. 12- Replacer l’organe d’agrégation dans la gaine d’interface jusqu’à capture de tous les éléments de capture (environ 1min). 13- Retirer l’organe d’agrégation de la gaine d’interface du tube d’élution. Les ADN sont dans le tube d’élution. Durée de la manipulation = 15min Temps de manipulation opérateur= 10min Extraction automatisée : Voir description ci-après. Durée de la manipulation = 8min Temps de manipulation opérateur= 2min Amplification des échantillons d’ADN extraits : Les échantillons d’ADN extraits sont amplifiés par une méthode de qPCR avec intercalants ADN et spécifique de Listeria monocytogenes . L’analyse de qPCR est réalisée sur un thermocycleur de type CFX 96. Afin de pouvoir effectuer une quantification du nombre d’unité génome présent dans chaque réaction, une gamme de quantification Listeria monocytogenes spécifique de l’amplification est lancée en même temps que les échantillons. Un témoin négatif (échantillon exempt de toute trace d’ADN de Listeria monocytogenes – ici de l’eau de qualité Biologie Moléculaire) est également analysé. Les conditions d’amplification sont les suivantes : - Dénaturation initiale : 95°C 2min - Cyclage : 40x [95°C-5s / 60°C-10s / 72°C-20] + lecture FAM - Melt : ramping de 0.3°C allant de 75°C à 95°C Un échantillon est considéré comme positif s’il présente suite à amplification une courbe de forme sigmoïdale croisant le seuil de positivité (threhsold) défini pour cette analyse. Les courbes positives sont confirmées par la valeur de melting des échantillons. Critères de conformité : La qPCR est jugée conforme si : - Le premier point de gamme présente un CT (Cycle Threshold = Valeur du croisement de la courbe d’amplification et du seuil de positivité) égale à la valeur de référence ±1. - La gamme d’amplification utilisée présente : o Une pente comprise entre -2.8 et -4.1 o Un r² > 0.95 o Chaque point de la gamme présente une valeur de melt égale à la valeur de référence ±2. - Le témoin négatif présente un résultat négatif : o Pas de courbe d’amplification o Présence d’une courbe d’amplification mais valeur de melt en dehors de la plage acceptable. La justesse mesurée de cette analyse de qPCR est de 30%. Les deux méthodes seront donc jugées comme donnant des résultats équivalents si les valeurs d’unité génomique calculées suite à amplification de l’une par rapport à l’autre sont situées dans un écart allant de 70% à 130%. Description de la méthode d’extraction automatisée : Cette analyse est une analyse de purification des échantillons d’ADN en 4 étapes : - liage ou binding en anglais, - lavage ou washing en anglais, - séchage ou drying en anglais - élution ou elution en anglais. Pour cette analyse, le barillet contient 8 tubes répartis comme suit : Tube N°1 : Tampon de binding + billes magnétiques (600µl) Tube N°2 : Tampon de lavage 1 (1000µl) Tube N°3 : vide Tube N°4 : vide Tube N°5 : vide Tube N°6 : vide Tube N°7 : Tampon de lavage 4 (1000µl) Tube N°8 : Tampon d’élution (400µl) Préparation de l’échantillon : - Prélèvement de 200µl d’échantillon à la pipette monocanal - Dépôt dans 200µl de tampon de lyse. Vortexer - Incuber 5min à 95°C. Laisser refroidir à température ambiante. Préparation de l’appareil de manipulation : - Mise en place de la gaine d’interface dans la bague du dispositif de maintien - Dépôt de 400µl d’échantillon extrait dans l’espace de réception n°1 du barillet contenant le tampon de binding - Mise en place du barillet sur le bâti - Allumage de l’appareil de manipulation - Lancement de la séquence de purification Purification des ADN : Initialisation de la séquence : La position initiale du barillet 10 présente le tube N°3 sous l’organe d’agrégation 15. Lors de l’initialisation le barillet 10 tourne pour positionner le tube N°1 sous l’organe d’agrégation 15. Etape de liage ( Binding ) (durée 90s) Dans une phase préalable, la gaine d’interface 20 peut être hors du tube N°1 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) et l’organe d’agrégation 15 peut être hors de la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position désassemblée). La gaine d’interface 20 peut descendre seule dans le tube N°1 (charriot de gaine d’interface 30 en position basse et charriot d’organe d’agrégation 40 en position désassemblée) puis faire des mouvements de va-et-vient selon l’axe de tube T pour homogénéiser la solution. Sur la FIG. 14 , la gaine d’interface 20 est hors du tube N°1 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) et l’organe d’agrégation 15 est hors de la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position désassemblée) (a). L’organe d’agrégation 15 pénètre dans la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) (b). La gaine d’interface 20 descend dans le tube N°1 avec l’organe d’agrégation 15 à l’intérieur (charriot de gaine d’interface 30 en position basse et charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) jusqu’à ce que la gaine d’interface 20 soit à proximité du fond 3a du tube 1 avec l’organe d’agrégation 15 au voisinage de son extrémité libre 20b (c). Dans cette position, l’organe d’agrégation 15 peut exercer la force d’attraction magnétique pour agréger les éléments de capture 2 auxquels l’échantillon d’ADN 1 est lié sur la gaine d’interface 20. La gaine d’interface 20 remonte pour sortir du tube 1 avec l’organe d’agrégation 15 dans la gaine d’interface 20 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute et charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) de sorte que les éléments de capture 2 et l’échantillon d’ADN 1 sont extraits de la solution du tube N°1 (d). Transfert des éléments de capture Le barillet 10 tourne pour positionner le tube N°2 sous la gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15. Etape de l avage (washing) (durée 90s) Sur les figures 15a et 15b, l’organe d’agrégation 15 est dans la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) avec la gaine d’interface 20 hors du tube N°2 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) (a). Les éléments de capture 2 et l’échantillon d’ADN 1 sont agrégés sur la gaine d’interface 20. La gaine d’interface 20 descend dans le tube N°2 (charriot de gaine d’interface 30 en position basse) avec l’organe d’agrégation 15 à l’intérieur (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) puis l’organe d’agrégation 15 sort de la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position désassemblée) (b). Le dispositif de sollicitation 45 est activé pour que la came 46 vienne périodiquement en contact avec l’extrémité d’accès 20a de la gaine d’interface 20 (état de sollicitation) et ainsi produire des chocs générant des vibrations qui se propage jusqu’à l’extrémité libre 20b de la gaine d’interface 20 (c et d). Les éléments de capture 2 se détachent de la gaine d’interface 20 qui peut faire des mouvements de va-et-vient selon l’axe de tube T. La gaine d’interface 20 termine son mouvement en dehors du tube N°2 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) (e). L’organe d’agrégation 15 est inséré dans la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) (f) puis la gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15 descendent dans le tube N°2 (charriot de gaine d’interface 30 en position basse et charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) (g). La gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15 sont dans l’état actif. La gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15 sorte du tube 2 avec les éléments de capture 2 et l’échantillon d’ADN 1. Transfert des éléments de capture Le barillet 10 tourne pour positionner le tube N°5 sous la gaine d’interface et l’organe d’agrégation. Etape de s échage (drying) (durée 120s) Sur la FIG. 16 , l’organe d’agrégation 15 est dans la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) avec la gaine d’interface 20 hors du tube N°5 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) (a). Les éléments de capture 2 et l’échantillon d’ADN 1 sont agrégés sur la gaine d’interface 20. La gaine d’interface 20 descend dans le tube N°5, vide (charriot de gaine d’interface 30 en position basse) avec l’organe d’agrégation 15 à l’intérieur (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) (b). La came 46 du système de sollicitation 45 passe de l’état d’arrêt à l’état de sollicitation pour déplacer la gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15 dans le tube N°5 vide (c). La gaine d’interface 20 remonte pour sortir du tube N°5 avec l’organe d’agrégation 15 dans la gaine d’interface 20 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute et charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée). Transfert des éléments de capture Le barillet tourne pour positionner le tube N°8 sous la gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15. Etape d’ é lution (elution) (durée 90s) Sur les figures 17a et 17b, l’organe d’agrégation 15 est dans la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) avec la gaine d’interface 20 hors du tube N°8 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) (a). Les éléments de capture 2 et l’échantillon d’ADN 1 sont agrégés sur la gaine d’interface 20. La gaine d’interface 20 descend dans le tube N°8 (charriot de gaine d’interface 30 en position basse) avec l’organe d’agrégation 15 à l’intérieur (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) puis l’organe d’agrégation 15 sort de la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position désassemblée) (b). Le dispositif de sollicitation 45 est activé pour que la came 46 vienne périodiquement en contact avec l’extrémité d’accès 20a de la gaine d’interface 20 (état de sollicitation) et ainsi produire des chocs générant des vibrations qui se propage jusqu’à l’extrémité libre 20b) de la gaine d’interface 20 (c et d). Les éléments de capture 2 se détachent de la gaine d’interface 20 qui peut faire des mouvements de va-et-vient selon l’axe de tube T. La gaine d’interface 20 termine son mouvement au fond 3a du tube N°8 (charriot de gaine d’interface 30 en position basse) et reste en position pour une durée déterminée (e). L’organe d’agrégation 15 est inséré dans la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) et maintenu dans cette position pour une durée déterminée (f). L’échantillon d’ADN 1 se détache des éléments de capture 2. La gaine d’interface 20 est extraite du tube N°8 avec l’organe d’agrégation 15 à l’intérieur (charriot de gaine d’interface 30 en position haute et charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée), de manière à extraire les éléments de capture 2 en laissant l’échantillon d’ADN 1 dans le tube N°8 (g). Transfert des éléments de capture Le barillet tourne pour positionner le tube N°7 sous la gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15. Etape de nettoyage du système (durée 60s) Sur la FIG. 18 , l’organe d’agrégation 15 est dans la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) avec la gaine d’interface 20 hors du tube N°7 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) (a). Les éléments de capture 2 sont agrégés sur la gaine d’interface 20. La gaine d’interface 20 descend dans le tube N°7 (charriot de gaine d’interface 30 en position basse) avec l’organe d’agrégation 15 à l’intérieur (charriot d’organe d’agrégation 40 en position assemblée) puis l’organe d’agrégation 15 sort de la gaine d’interface 20 (charriot d’organe d’agrégation 40 en position désassemblée) (b). Le dispositif de sollicitation 45 est activé pour que la came 46 vienne périodiquement en contact avec l’extrémité d’accès 20a de la gaine d’interface 20 (état de sollicitation) et ainsi produire des chocs générant des vibrations qui se propage jusqu’à l’extrémité libre 20b de la gaine d’interface 20 (c et d). Les éléments de capture 2 se détachent de la gaine d’interface 20. La gaine d’interface 20 remonte pour sortir du tube N°7 (charriot de gaine d’interface 30 en position haute) (e) Retour à la position initiale : Le barillet 10 tourne pour positionner le tube N°3 sous la gaine d’interface 20 et l’organe d’agrégation 15. Suite à la fin de la purification : L’opérateur prélève directement dans le tube 8 le volume nécessaire à l’analyse (ici 5µl). Il peut ensuite prélever la totalité du volume d’élution pour le replacer dans un tube adapté afin de conserver cet échantillon extrait. Résultats obtenus : Validation de la conformité de la qPCR Résultats obtenus avec la gamme ADN de quantification : Log charge (UG/réaction) CT melt Confirmation amplification 6 13,78 81,9 Listeria monocytogenes 5 16,36 82,2 Listeria monocytogenes 4 19,36 82,2 Listeria monocytogenes 3 22,88 82,2 Listeria monocytogenes 2 26,58 82,2 Listeria monocytogenes Négatif no ct none négatif Critères Résultat attendu Résultat observé Conformité Pente Entre -2,8 et -4,1 -3,07 OK r² >0,95 0,995 OK Valeur Ct du premier point Entre 12,6 et 14,6 13,78 OK Valeur de référence melt Entre 81,2 et 83,2 Voir tableau ci-dessus OK Valeur du négatif no ct ou melt non conforme no ct OK Conclusion : La gamme qPCR présentant des résultats conformes, les échantillons peuvent être analysés. Résultats des échantillons : Echantillon Milieu de culture Méthode d'extraction CT observé nb UG Rapport méthode automatisée / méthode manuelle Conformité Listeria monocytogenes EPT Manuelle 19,86 9524 83% OK Listeria monocytogenes EPT Automate 20,12 7905 Listeria monocytogenes EPT + lait Manuelle 20,96 4329 86% OK Listeria monocytogenes EPT + lait Automate 21,17 3724 Conclusion : La présence de Listeria monocytogenes a été détectée dans tous les échantillons. Les résultats de quantification obtenus montrent un écart se trouvant dans l’écart tolérable de justesse. Conclusion générale : L’extraction automatisée à l’aide du préparateur d’échantillon permet d’obtenir des résultats similaires à ceux obtenus par une extraction manuelle. Cependant l’extraction automatisée présente deux avantages : - un temps et une difficulté de manipulation opérateur largement réduit, - un temps global d’analyse grandement réduit. Appareil de manipulation (5) d’un échantillon de matière biologique (1) par l’intermédiaire d’éléments de capture (2), les éléments de capture (2) étant magnétiques et configurés pour être solidarisés à l’échantillon de matière biologique, l’appareil de manipulation (5) comprenant : - un bâti (6) s’étendant selon un axe vertical (A), - un support de tube (8) monté sur le bâti (6) et comprenant au moins un espace de réception (9) configuré pour recevoir au moins un tube (3) adapté pour contenir une solution comportant l’échantillon de matière biologique (1) et les éléments de capture (2) ; - un organe d’agrégation (15) configuré pour générer une force d’attraction magnétique sur les éléments de capture (2), l’organe d’agrégation (15) étant destiné à coopérer avec une gaine d’interface (20) de telle manière que, dans un état actif de l’organe d’agrégation (15) et de la gaine d’interface (20), l’organe d’agrégation (15) est reçu dans la gaine d’interface (20) et exerce la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture (2) pour agréger lesdits éléments de capture (2) sur la gaine d’interface (20) et, dans un état inactif de l’organe d’agrégation (15) et de la gaine d’interface (20), l’organe d’agrégation (15) n’exerce pas de force d’attraction magnétique sur les éléments de capture (2), l’appareil de manipulation (5) étant caractérisé en ce qu’il comprend en outre : - un charriot de gaine d’interface (30) comprenant un dispositif de maintien (24) configuré pour maintenir la gaine d’interface (20) en regard de l’espace de réception (9), le charriot de gaine d’interface (30) étant déplaçable selon l’axe vertical (A) par rapport au bâti (6) entre une position haute dans laquelle ledit charriot de gaine d’interface (30) place la gaine d’interface (20) à distance de l’espace de réception (9), et une position basse dans laquelle ledit charriot de gaine d’interface (30) place la gaine d’interface (20) dans l’espace de réception (9), - un système de sollicitation (45) configuré pour être placé en contact avec la gaine d’interface (20) et générer dans la gaine d’interface (20) des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture (2) de la gaine d’interface (20) après que l’organe d’agrégation (15) et la gaine d’interface (20) sont passés de l’état actif à l’état inactif. Appareil de manipulation (5) selon la revendication 1, dans lequel le système de sollicitation (45) est agencé pour générer les vibrations au voisinage d’une extrémité d’accès (20a) de la gaine d’interface (20) par laquelle l’organe d’agrégation (15) est inséré dans la gaine d’interface (20), et dans lequel le dispositif de maintien (24) est configuré pour permettre une propagation des vibrations depuis l’extrémité d’accès (20a) vers une extrémité libre (20b) de la gaine d’interface (20) opposée à l’extrémité d’accès (20a) et au voisinage de laquelle sont agrégés les éléments de capture (2) dans l’état actif de l’organe d’agrégation (15) et de la gaine d’interface (20). Appareil de manipulation (5) selon la revendication 2, dans lequel le dispositif de maintien (24) est configuré pour maintenir la gaine d’interface (20) au voisinage de l’extrémité d’accès (20a). Appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 1 à 3, dans lequel le dispositif de maintien (24) comprend une bague (25) selon un axe de maintien (M) parallèle à l’axe vertical (A) et présentant une surface intérieure destinée à être en contact périphérique avec la gaine d’interface (20). Appareil de manipulation (5) selon la revendication 4, dans lequel la bague (25) est configurée pour recevoir la gaine d’interface (20) comprenant une paroi latérale selon un axe de gaine (G) et au moins deux ergots (22) saillant transversalement de manière équirépartie depuis une surface extérieure de la paroi latérale, la bague (25) comportant une gorge (26) ménagée sur la surface intérieure autour de l’axe de maintien (M) et configurée pour recevoir les ergots (22), et au moins deux rainures (27) s’étendant axialement sur la surface intérieure depuis une extrémité de passage jusqu’à la gorge (26), de manière à permettre un passage des ergots (22) de la gaine d’interface (20) dans une position angulaire de la gaine d’interface (20) par rapport à la bague (25) et un maintien des ergots (22) de la gaine d’interface (20) dans la gorge (26) dans d’autres positions angulaires de la gaine d’interface (20) par rapport à la bague (25). Appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 3 et 4, dans lequel le dispositif de maintien (24) comprend en outre une bride (28) déplaçable par rapport au charriot de gaine d’interface (30) entre une position ouverte permettant une mise en place de la bague (25) et une position fermée assurant un maintien en position de la bague (25) par rapport au charriot de gaine d’interface (30). Appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 1 à 6, dans lequel le système de sollicitation (45) est configuré pour réaliser au moins un choc sur la gaine d’interface (20). Appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 1 à 7, dans lequel le système de sollicitation (45) comprend une came (46) entraînée en rotation selon un axe de pivotement (P) et comportant une portion de contact (47) radiale agencée pour venir en contact avec la gaine d’interface (20) dans une plage de position angulaire de la came (46) par rapport au bâti (6), la came (46) étant à distance de la gaine d’interface (20) en dehors de la plage de position angulaire. Appareil de manipulation (5) selon la revendication 5, dans lequel la came (46) présente un état de sollicitation dans lequel ladite came (46) est entraînée en rotation et un état d’arrêt dans laquelle ladite came (46) est fixe par rapport au bâti (6), et dans lequel le système de sollicitation (45) comprend un dispositif de détection (50) configuré pour arrêter la came (46) en dehors de la plage de position angulaire lorsque la came (46) passe de l’état de sollicitation à l’état d’arrêt. Appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 1 à 9, dans lequel le système de sollicitation (45) est monté sur le charriot de gaine d’interface (30). Appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 1 à 10, comprenant en outre un charriot d’organe d’agrégation (40) portant l’organe d’agrégation (15), le charriot d’organe d’agrégation (40) étant déplaçable selon l’axe vertical (A) par rapport au bâti (6) entre une position désassemblée à distance du charriot de gaine d’interface (30) de telle manière que l’organe d’agrégation (15) soit écarté de la gaine d’interface (20), et une position assemblée à proximité du charriot de gaine d’interface (30) de telle manière que l’organe d’agrégation (15) soit reçu dans la gaine d’interface (20). Appareil de manipulation (5) selon la revendication 11, dans lequel l’organe d’agrégation (15) comporte un aimant permanent (17) à une extrémité distale destinée à être reçue dans la gaine d’interface (20), l’organe d’agrégation (15) et la gaine d’interface (20) étant dans l’état inactif lorsque le charriot d’organe d’agrégation (40) est dans l’état désassemblé. Appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 1 à 12, dans lequel le support de tube (8) comprend un barillet (10) comportant une pluralité d’espaces de réception (9) autour d’un axe de barillet (B), le barillet (10) étant déplaçable en rotation selon l’axe de barillet (B) de manière à placer sélectivement l’un des espaces de réception (9) en regard de la gaine d’interface (20). Ensemble de manipulation comprenant un appareil de manipulation (5) selon l’une quelconque des revendications 1 à 13 et au moins une gaine d’interface (20) configurée pour recevoir l’organe d’agrégation (15) et être maintenue dans le dispositif de maintien (24) du charriot de gaine d’interface (30). Procédé de manipulation de manipulation d’un échantillon de matière biologique (1), le procédé de manipulation mettant en œuvre un ensemble de manipulation selon la revendication 14 et prévoyant de : - placer dans l’espace de réception (9) du support de tube (8) un tube (3) contenant une solution comportant l’échantillon de matière biologique (1) et des éléments de capture (2), les éléments de capture (2) étant magnétiques et configurés pour être solidarisés à l’échantillon de matière biologique (1), - placer la gaine d’interface (20) dans le dispositif de maintien (24) du charriot de gaine d’interface (30) en position haute, - mettre le charriot de gaine d’interface (30) dans la position basse et l’organe d’agrégation (15) et la gaine d’interface (20 dans l’état actif, l’organe d’agrégation (15) étant reçu dans la gaine d’interface (20) et exerçant la force d’attraction magnétique sur les éléments de capture (2) pour agréger lesdits éléments de capture (2) sur la gaine d’interface (20), - mettre le charriot de gaine d’interface (30) dans la position haute, l’organe d’agrégation (15) et la gaine d’interface (20) restant dans l’état actif, - mettre le charriot de gaine d’interface (30) dans la position basse, l’organe d’agrégation (15) et la gaine d’interface (20) restant dans l’état actif, - mettre l’organe d’agrégation (15) et la gaine d’interface (20) dans l’état inactif, - activer le système de sollicitation (45) pour générer dans la gaine d’interface (20) des vibrations adaptées pour séparer les éléments de capture (2) de la gaine d’interface (20).