Brevet FR3155829A1 — publié le 20250530

SYSTÈME ET PROCÉDÉ POUR LA MESURE DE L’ACTIVITÉ MICROBIENNE Système de mesure d’activité microbienne comprenant un support comprenant une pluralité d’emplacements, chaque emplacement étant configuré pour accueillir le bouchon d’au moins un réacteur, un dispositif d’agitation positionné sous le support, un transducteur positionné au-dessus du support et un dispositif de déplacement configuré pour déplacer le transducteur. Figure de l’abrégé : Fig. 2 SYSTÈME ET PROCÉDÉ POUR LA MESURE DE L’ACTIVITÉ MICROBIENNE DOMAINE DE L’INVENTION La présente invention concerne un système de mesure d’activité microbienne et plus spécifiquement de mesure de la biodégradabilité. ÉTAT DE LA TECHNIQUE Un des grands enjeux industriels est de produire des substances sûres ayant un bon profil écologique. Les professionnels des secteurs de la chimie, de l’agroalimentaire, du cosmétique et du médical doivent donc évaluer les risques écologiques pouvant découler de leurs substances notamment par la mesure d’activité microbienne. Ces mesures sont de plus définies par des normes. Cependant, les systèmes et les procédures connus de mesure d’activité microbienne ne sont pas satisfaisants. En effet, la plupart des mesures d’activité microbienne sont réalisées manuellement avec des dispositifs encombrants et onéreux. Quelques systèmes proposent une automatisation de la procédure de mesure. Cependant, ces systèmes nécessitent l’intervention humaine pour certaines étapes du processus. De plus, ces procédés nécessitent l’ouverture des réacteurs afin de permettre aux capteurs d’effectuer les mesures. Cela crée des échanges entre l’air extérieur et l’air contenu dans le réacteur, ce qui altère fondamentalement la cinétique de l’activité microbienne et implique des biais de mesure. Finalement, les systèmes connus ne respectent pas nécessairement les normes de test imposées dans les réglementations. Il y a donc un besoin d’un système et d’un procédé de mesure de l’activité microbienne qui soient automatisés afin d’augmenter la rapidité des tests et qui permettent une mesure fiable et précise d’activité microbienne sans en altérer la cinétique. De plus, le procédé doit respecter la réglementation en vigueur. Le but de l’invention est donc de fournir un système de mesure d’activité microbienne comprenant : au moins un support, chaque support comprenant une pluralité d’emplacements configurés pour accueillir un réacteur, au moins un dispositif d’agitation, au moins un transducteur configuré pour interagir avec un capteur ponctuel positionné à l’intérieur d’un réacteur et un dispositif de déplacement de l’au moins un transducteur. RÉSUMÉ Dans ce but, la présente invention concerne un système de mesure d’activité microbienne comprenant : Au moins un support, chaque support comprenant une pluralité d’emplacements ouverts vers le haut, chaque emplacement étant configuré pour accueillir un bouchon d’un réacteur, chaque réacteur étant apte à contenir hermétiquement un échantillon, chaque emplacement comprenant un centre définissant un axe de mesure perpendiculaire au support ; Au moins un dispositif d’agitation positionné sous le support, chaque dispositif d’agitation étant apte à agiter l’échantillon dans un réacteur ; Au moins un transducteur positionné au-dessus du support, chaque transducteur étant configuré, lorsqu’il est aligné avec l’axe de mesure d’un des emplacements du support, pour interagir avec un capteur ponctuel positionné à l’intérieur d’un réacteur placé dans ledit emplacement, le capteur ponctuel étant alors aligné sur l’axe de mesure, le capteur ponctuel étant configuré pour mesurer au moins un marqueur d’activité microbienne ; et Un dispositif de déplacement configuré pour déplacer l’au moins un transducteur afin de l’aligner successivement sur l’axe de mesure de plusieurs emplacements du support. En effet, ce système permet une mesure de l’activité microbienne sans retrait du bouchon du réacteur. Ainsi, le réacteur reste hermétique durant toute la durée de l’incubation. Par conséquent, la cinétique de l’activité microbienne n’est pas altérée pendant la mesure ce qui réduit le biais de mesure. De plus, le bouchon du réacteur n’a pas besoin d’être modifié pour permettre l’insertion des outils de mesures à l’intérieur du réacteur. Le coût de la mise en place du système est donc réduit et le réacteur reste parfaitement hermétique et sûr car l’absence de modification du bouchon entraine aussi une réduction du risque d’endommagement du bouchon ou du réacteur. En outre, l’incubation et les mesures d’activité microbienne peuvent se dérouler dans un seul et même système sans nécessité de manipulation ni de logistique pour transporter les réacteurs d’un système d’incubation à un système de mesure. Le positionnement des dispositifs d’agitation sous le support et du transducteur au-dessus du support permet au transducteur de pouvoir être déplacé dans un plan bi-dimensionnel sans être gêné par la présence des dispositifs d’agitation. Finalement, le positionnement des bouchons dans le support ouvert vers le haut implique que les réacteurs présentent leur fond vers le haut. Ainsi, le transducteur peut être déplacé au plus près du capteur ponctuel de chaque réacteur en demeurant dans un plan, sans nécessité de mouvement complexes en trois dimensions – par exemple une remontée et une descente du transducteur pour chaque réacteur pour éviter les bouchons des réacteurs à chaque déplacement. Cela implique donc une réduction du coût du système qui est d’autant plus grande que le système est automatisé. Ainsi, un système comprenant un seul transducteur ne nécessite qu’un dispositif de déplacement dans un plan (en deux dimensions). Selon un mode de réalisation, chaque dispositif d’agitation comprend un attracteur magnétique mobile positionné sous un emplacement et apte à coopérer avec un agitateur magnétique disposé à l’intérieur du réacteur placé dans cet emplacement, la mobilisation de l’attracteur magnétique permettant de mobiliser l’agitateur magnétique dans le réacteur. Le positionnement du dispositif d’agitation sous le support et du bouchon de chaque réacteur vers le bas permet, dans le cas d’une agitation par aimantation, de positionner l’agitateur magnétique totalement dans le liquide et au plus près de l’attracteur magnétique. Selon un mode de réalisation, le transducteur permet une interaction par fluorescence. Selon un mode de réalisation, au moins un des marqueurs d’activité microbienne est choisi parmi la quantité d’oxygène, la quantité de dioxyde de carbone, la quantité de méthane, la concentration d’une molécule chimique prédéterminée, et/ou la pression à l’intérieur du réacteur. Selon un mode de réalisation, le système de mesure d’activité microbienne comprend en outre une enceinte configurée pour protéger l’au moins un transducteur des perturbations extérieures. Selon un mode de réalisation, le système de mesure d’activité microbienne comprend en outre un bac de récupération des fluides entre le support et le dispositif d’agitation. Ainsi, le dispositif d’agitation est protégé en cas de fuite d’un ou plusieurs réacteurs. La présente invention concerne aussi un réacteur apte à contenir hermétiquement un échantillon, le réacteur présentant une paroi latérale, un fond et une bague sur laquelle s’ajuste un bouchon, la bague présentant un axe d’alignement, un capteur ponctuel étant disposé à l’intérieur du réacteur, sur le fond du réacteur et placé sur l’axe d’alignement, le capteur ponctuel étant configuré pour mesurer au moins un marqueur d'activité microbienne, le réacteur étant apte à être accueilli dans un emplacement d’un support du système décrit ci-dessus de manière à ce que le bouchon s’ajuste dans l’emplacement et à ce que l’axe d’alignement se superpose avec l’axe de mesure dudit emplacement. En effet, le réacteur pouvant être utilisé dans le système de l’invention est avantageusement un réacteur disponible facilement dans le commerce qui n’a besoin d’aucune adaptation structurelle. Seul le capteur ponctuel doit être fixé dans le fond du réacteur. Cela permet d’obtenir un système et une utilisation moins couteuse et facilement utilisable par rapport aux systèmes connus. Le capteur ponctuel peut par exemple être pré-étalonné ce qui permet de s’affranchir d’une étape de calibration du capteur avant l’utilisation du réacteur. Selon un mode de réalisation, le fond présente une épaisseur comprise entre 2 mm et 6 mm. Selon un mode de réalisation, le fond présente une courbure comprise entre 600 mm et 3000 mm. La présente invention concerne aussi un applicateur permettant le placement d’un capteur ponctuel sur le fond d’un réacteur afin de préparer un réacteur comme décrit ci-dessus, l’applicateur comprenant un élément de centrage ajustable sur la bague du réacteur et un élément de positionnement permettant de placer le capteur ponctuel sur le fond du réacteur et sur l’axe d’alignement. La présente invention concerne aussi un procédé d’utilisation d’un système de mesure d’activité microbienne tel que décrit ci-dessus, le procédé comprenant les étapes de : Fourniture d’au moins un réacteur, le réacteur présentant une paroi comprenant une paroi latérale, un fond et une bague sur laquelle s’ajuste un bouchon, la bague présentant un axe d’alignement ; Pour chaque réacteur : Placement d’au moins un capteur ponctuel configuré pour mesurer au moins un marqueur d'activité microbienne à l’intérieur du réacteur, sur le fond du réacteur et sur l’axe d’alignement ; Introduction d’un échantillon dans le réacteur ; Fermeture du réacteur avec un bouchon ; Placement du réacteur dans le support par ajustement du bouchon dans un des emplacements du support, de telle sorte que l’axe d’alignement se superpose avec l’axe de mesure dudit emplacement, le fond du réacteur étant positionné au-dessus de la bague ; Agitation de l’échantillon à l’aide du dispositif d’agitation ; Alignement d’au moins un des transducteurs avec au moins un des axes de mesure à l’aide du dispositif de déplacement ; Interaction dudit transducteur avec le capteur ponctuel afin de mesurer au moins un marqueur d'activité microbienne. Selon un mode de réalisation, les étapes d’alignement et d’interaction sont répétées à intervalles de temps prédéterminés pour au moins un réacteur. Selon un mode de réalisation, le procédé comprend en outre, avant la disposition de l’échantillon dans le réacteur, une étape de calibration du capteur ponctuel. Selon un mode de réalisation, le procédé d’utilisation permet la mesure de la biodégradabilité de l’échantillon, l’échantillon comprenant un inoculum microbien. Selon un mode de réalisation du procédé d’utilisation, le capteur ponctuel est configuré pour mesurer la quantité d’oxygène à l’intérieur du réacteur. Selon un mode de réalisation du procédé d’utilisation, le transducteur interagit avec le capteur ponctuel par fluorescence. DÉFINITIONS Dans la présente invention, les termes ci-dessous sont définis de la manière suivante : « Echantillon » concerne un liquide comprenant au moins une substance pour laquelle une mesure d’activité microbienne – par exemple une mesure de biodégradabilité ou de biodégradation – est effectuée. Cette substance peut être soluble dans le liquide, dispersée dans le liquide ou volatile. « S ubstance » concerne toute molécule, polymère ou mélange de molécule et polymère. DESCRIPTION DES FIGURES D’autres caractéristiques et avantages de la présente invention ressortiront de la description faite ci-dessous, en référence aux dessins annexés qui en illustrent des exemples de réalisation dépourvus de tout caractère limitatif. FIG. 1 représente le système de mesure d’activité microbienne selon un mode de réalisation. FIG. 2 montre le système en utilisation. Le transducteur est successivement positionné au-dessus de chaque réacteur grâce au dispositif de déplacement afin d’interagir avec le capteur ponctuel correspondant. FIG. 3 montre le support de réacteurs selon un mode de réalisation comprenant six emplacements. FIG. 4 montre un ensemble de huit supports de réacteurs selon un mode de réalisation dans lequel chaque support comprend six emplacements. Des réacteurs sont placés dans six des huit supports. FIG. 5 montre un réacteur et son bouchon selon un mode de réalisation. Un capteur ponctuel est placé au fond du réacteur. FIG. 6 montre un applicateur selon un mode de réalisation. FIG. 7 montre l’application du capteur ponctuel dans le fond du réacteur en utilisant l’applicateur de la FIG. 6 . FIG. 8 montre l’agitation selon un mode de réalisation. FIG. 9 montre un ensemble de dispositifs d’agitation selon un mode de réalisation. FIG. 10 montre un réacteur placé dans un emplacement, le bouchon se trouvant en bas juste au-dessus d’un dispositif d’agitation. FIG. 11 montre l’évolution du taux d’oxygène C (en pourcent) au cours du temps T (en jours) pour chacun des six réacteurs de l’exemple. DESCRIPTION DÉTAILLÉE La présente invention concerne un système 100 de mesure d’activité microbienne. Le système 100 est apte à la mesure de tout type d’activité microbienne dans un échantillon. Par exemple, le système 100 permet de déterminer la biodégradabilité de certaines substances chimiques par la mesure de la consommation d’oxygène par l’inoculum microbien présent dans l’échantillon. Dans un autre exemple, le système 100 permet de déterminer l’activité des souches starter de fermentation (ou culture de démarrage) permettant l’accélération des procédés de fermentation dans les procédés agroalimentaires, pharmaceutiques, biotechnologique et d’énergie renouvelable. Dans un autre exemple encore, le système 100 permet de mesurer l'effet d'un principe actif – par exemple un antibiotique – ou d’une molécule sur la croissance de bactéries ou de champignons en médecine ou cosmétique. Le système 100 permet en particulier la mise en œuvre des méthodes 301 A-F de mesure de biodégradabilité facile selon les lignes directrices de l’OCDE pour les essais de produits chimiques (adoptée en 1992 et modifiée en 2013). Dans ces méthodes, l’échantillon est placé dans un flacon rempli et fermé hermétiquement. Les flacons sont mis en incubation à température constante et dans l’obscurité pendant 28 jours. Un marqueur d’activité microbienne est mesuré, par exemple le carbone organique dissous (301 A et 301 E), le CO 2 dégagé (301 B), la consommation d’oxygène (301 C et 301 F), ou l’oxygène dissous (301 D), permettant d’estimer la biodégradation qui a eu lieu dans l’échantillon. La mesure peut aussi porter sur une grandeur dérivée ou corrélée à l’un de ces marqueurs. Afin de pouvoir faire effectuer des mesures d’activité microbienne, notamment dans le cas des tests des méthodes OCDE 301 A-F, le système 100, représenté aux figures 1 et 2, comprend : Au moins un support 120 ; Au moins un dispositif d’agitation 140 positionné sous le support 120 ; Au moins un transducteur 160 positionné au-dessus du support 120 ; et Un dispositif de déplacement 165 configuré pour déplacer l’au moins un transducteur 160. Chaque support 120 comprend une pluralité d’emplacements 125 ouverts vers le haut comme représenté à la FIG. 3 . De préférence chaque support 120 comprend 2x3 emplacements 125. Chaque emplacement 125 comprend un centre définissant un axe de mesure A1 perpendiculaire au support 120. Chaque emplacement 125 est configuré pour accueillir un réacteur 180 comme représenté à la FIG. 4 . Cette FIG. 4 représente un système 100 comprenant huit supports 125, chaque support comprenant 2x3 emplacements 125 permettant une mesure automatique de jusqu’à 48 réacteurs 180. Les réacteurs 180 susceptibles d’être accueillis dans le système 100 peuvent être de toute nature. Par exemple, les réacteurs 180 peuvent être des flacons de laboratoire ronds avec bouchon à visser de la marque Duran Schott (marque déposée) d’un volume compris entre 50 mL et 1 L. De préférence, les réacteurs 180 ont un volume compris entre 100 mL et 250 mL. Le volume de 133 mL est un bon compromis entre le gain de place nécessaire pour 48 tests et le volume d’air nécessaire pour l’activité microbienne. Un réacteur 180 présente par définition une paroi et une bague sur laquelle s’ajuste un bouchon 182. La bague est la partie supérieure du réacteur 180 sur laquelle vient se positionner le bouchon 182. La bague peut comprendre un filet sur lequel le bouchon 182 se visse ou un anneau sur lequel le bouchon 182 se clipse. Lorsque le bouchon 182 n’est pas positionné sur la bague, cette dernière permet d’accéder à l’intérieur du réacteur 180. Un exemple de forme de réacteur 180 est présenté à la FIG. 5 . Cependant, la morphologie de la paroi du réacteur 180 importe peu. La paroi peut être transparente, de préférence en verre, par exemple en verre borosilicaté. Le verre permet de garantir une étanchéité suffisante vis-à-vis de la diffusion des gaz. La paroi comprend une paroi latérale 184a et un fond 184b. Le fond 184b peut présenter une épaisseur comprise entre 2 mm et 6 mm, de préférence entre 3,5 mm et 4,5 mm. Le fond 184b, même s’il peut être plat, peut aussi présenter un rayon de courbure compris entre 600 mm et 3000 mm, de préférence entre 900 mm et 1250 mm. La bague comprend un centre définissant un axe d’alignement A2 s’étendant entre la bague et le fond 184b. Ainsi, de manière plus précise, chaque emplacement 125 est configuré pour accueillir un bouchon 182. De préférence, chaque emplacements 125 est configuré afin que sa forme soit ajustée à la forme du bouchon 182 qui sera accueilli. Par « ajusté » il doit être entendu que le bouchon peut être inséré dans l’emplacement mais qu’il y soit placé de manière à éviter tout mouvement et donc tout changement de position du réacteur 180. Alternativement, les réacteurs 180 sont choisis de manière à ce que leurs bouchons s’ajustent dans les emplacements 125. Ainsi, cela permet de maintenir le réacteur 180 verticalement « la tête en bas » de manière à ce que le bouchon 182 soit positionné sous le fond 184b. De préférence, le bouchon 182 est ajusté dans l’emplacement 125 de manière à ce que l’axe d’alignement A2 se superpose avec l’axe de mesure A1 dudit emplacement 125. Chaque réacteur 180 est apte à contenir hermétiquement un échantillon. L’échantillon contient préférentiellement un inoculum microbien c’est-à-dire un ensemble de micro-organismes (par exemple des bactéries, des mycètes ou des protistes) dont l’activité sera mesurée au cours du temps. Mais le système 100 peut aussi utiliser une seule espèce de micro-organismes. L’activité de l’inoculum microbien est mesurée par un capteur ponctuel 150 (« spot sensor » en anglais) disposé à l’intérieur du réacteur 180, sur le fond 184b du réacteur 180. Le capteur ponctuel 150 est préférentiellement placé sur l’axe d’alignement A2. Ainsi, lorsque le bouchon 182 est accueilli dans l’emplacement 125, le capteur ponctuel 150 est aligné avec l’axe de mesure A1. Afin de faciliter la répétabilité de l’alignement du capteur ponctuel sur l’axe d’alignement A2, un applicateur 190 peut être utilisé. Un exemple d’applicateur est montré en FIG. 6 . L’applicateur 190 comprend un élément de centrage 192 ajustable sur la bague du réacteur 180. Par exemple, si la bague comprend un filetage permettant de visser le bouchon 182, l’élément de centrage 192 peut aussi comprendre un filetage afin de le visser sur la bague de la même manière que le bouchon 182. L’applicateur 190 comprend en outre un élément de positionnement 194 permettant de placer le capteur ponctuel 150 sur le fond 184b du réacteur 180 et sur l’axe d’alignement A2. L’application du capteur ponctuel 150 à l’aide de cet applicateur 190 est montré à la FIG. 7 . L’élément de centrage 192 est ajusté sur la bague et l’élément de positionnement 194 présente une longueur permettant de fixer le capteur ponctuel 150 sur le fond 184b. La fixation du capteur ponctuel 150 peut par exemple être effectuée par collage. Après la fixation du capteur 150, l’applicateur 190 est retiré du réacteur. L’applicateur 190 peut avantageusement être réutilisé pour tous les réacteurs de même format. Le capteur ponctuel 150 est préférentiellement configuré pour mesurer au moins un marqueur d’activité microbienne, par exemple, le taux ou la quantité de dioxyde de carbone CO 2 , le taux ou la quantité de méthane CH 4 , la pression, la concentration d’une molécule chimique prédéterminée et/ou la température dans le réacteur 180. De préférence, le marqueur d’activité microbienne est le taux ou la quantité d’oxygène dissous (méthode OCDE 301 D). En effet, lors de la biodégradation de substances, l’inoculum microbien consomme de l’oxygène pour oxyder lesdites substances. Ainsi, la quantité d’oxygène dissous consommée, aussi appelée demande biochimique en oxygène (DBO) permet de quantifier la quantité de matières pouvant être dégradées et donc la biodégradabilité de l’échantillon. Ces marqueurs d’activité microbienne peuvent être mesurés directement dans l’échantillon. Ces marqueurs d’activité microbienne sont préférentiellement mesurés dans l’atmosphère du réacteur 180, c’est-à-dire au-dessus de la surface de l’échantillon. Le capteur ponctuel 150 peut avantageusement être pré-étalonné. Cela permet de s’affranchir d’une étape de calibration du capteur ponctuel 150 avant l’utilisation de chaque réacteur 180. Chaque dispositif d’agitation 140 du système 100 est apte à agiter (mélanger) l’échantillon dans un réacteur 180. Le mélange de l’échantillon est avantageux car cela permet une activité homogène de l’inoculum microbien dans l’ensemble de l’échantillon. Le dispositif d’agitation 140 est préférentiellement configuré pour agiter l’échantillon sans ouvrir le bouchon 182 du réacteur 180. Le dispositif d’agitation peut par exemple être une plateforme vibrante ou rotative sur laquelle le ou les supports sont déposés. Préférentiellement, chaque dispositif d’agitation 140 comprend un attracteur magnétique 144 mobile positionné sous un emplacement 125 et apte à coopérer avec un agitateur magnétique 148 disposé à l’intérieur du réacteur 180 accueilli dans cet emplacement 125. L’agitateur magnétique 148 peut par exemple être un barreau magnétique. La mobilisation de l’attracteur magnétique 144 permet donc de mobiliser l’agitateur magnétique 148 dans le réacteur 180. Par exemple, la mobilisation de l’attracteur magnétique 144 est un actionnement ou un mouvement de cet attracteur 144, par exemple à l’aide d’un actionneur 146 tel qu’un moteur. Dans la FIG. 8 , le moteur 146 permet par exemple de mettre en rotation dans une direction F1 une hélice 142 comprenant deux aimants formant l’attracteur magnétique 144. La rotation des deux aimants implique la rotation dans la direction F2 de l’agitateur magnétique 148 grâce à la force d’attraction magnétique. Le mouvement de l’agitateur magnétique 148 permet l’agitation de l’échantillon compris dans le réacteur 180. Un exemple d’un ensemble d’attracteurs magnétiques 144 est représenté à la FIG. 9 . Dans cette figure, les attracteurs magnétiques 144 sont positionnés dans un socle qui permet avantageusement de faire correspondre la position des attracteurs magnétiques 144 avec les emplacements 125 de support 120 tels que représentés à la FIG. 3 . Le positionnement du réacteur 180 « la tête en bas » permet avantageusement le mouvement de l’agitateur magnétique 148, qui se pose par l’attraction gravitationnelle dans le bouchon 182, sans risque de dégradation pour le capteur ponctuel 150 fixé sur le fond 184b. De plus, dans cette configuration, l’agitateur magnétique 148 peut être totalement plongé dans l’échantillon ce qui permet une meilleure efficacité de mélange. Finalement, le positionnement de l’agitateur magnétique 148 dans le bouchon du réacteur 180 qui permet de le rapprocher de l’attracteur magnétique 144 et d’améliorer d’autant plus le mélange grâce à la force d’attraction magnétique plus grande entre ces deux éléments. De manière avantageuse, le système 100 peut comprendre en outre un bac de récupération des fluides positionné entre le support 120 et les dispositifs d’agitation 140. Ceci permet de récupérer le fluide (échantillon) en cas de fuite des réacteurs 180 et de ne pas endommager les actionneurs 146. Chaque transducteur 160 du système 100 est configuré, lorsqu’il est aligné avec l’axe de mesure A1 d’un des emplacements 125, pour interagir avec un capteur ponctuel 150 d’un réacteur 180 accueilli dans cet emplacement 125. L’interaction permet la transmission de la mesure effectuée par le capteur ponctuel 150 vers le transducteur 160 et/ou l’envoi d’un signal d’instruction du transducteur 160 vers le capteur ponctuel 150. Ainsi, la mesure effectuée in situ est lue au travers de la paroi de chaque réacteur 180 sans ouvrir le bouchon 182. Le réacteur 180 reste alors hermétiquement fermé durant toute la durée de l’incubation et des mesures ce qui permet de ne pas altérer la cinétique de l’activité microbienne. De la même manière, cela permet de ne pas modifier le bouchon ou la paroi des réacteurs 180 pour y insérer des éléments de mesure. Ainsi, les réacteurs 180, qui sont des consommables, peuvent être des réacteurs 180 trouvés couramment dans le commerce et donc moins chers. De plus, l’absence de modification du bouchon ou de la paroi maintient la sureté d’utilisation des réacteurs 180. La paroi en verre du réacteur 180 permet avantageusement le passage du signal de mesure ou d’instruction en utilisant une longueur d’onde comprise entre 0,38 µm et 0,78 µm. Par exemple, l’interaction entre le transducteur 160 et le capteur ponctuel 150 est effectuée par fluorescence. Par exemple, le transducteur 160 utilisé est le Electro-Optical Module EOM-O2-FOM de Presens associé à des capteurs ponctuels 150 PSt3 de Presens. Dans le contexte d’une mesure par fluorescence, le capteur ponctuel 150 contient un marqueur fluorescent dont le rendement de fluorescence est lié à la concentration d’une molécule dans l’échantillon. Ainsi, après que l’équilibre a été atteint entre l’échantillon et le capteur ponctuel 150 – cet équilibre étant rapide au regard du temps caractéristique d’évolution de l’échantillon – l’intensité de fluorescence du capteur ponctuel est une mesure indirecte de la concentration de ladite molécule, par exemple un marqueur d’activité microbienne. Il faut noter que la mesure peut être très indirecte. Ainsi, le capteur ponctuel 150 peut être sensible à la concentration en oxygène dans le ciel du réacteur, cette concentration en oxygène gaz étant elle-même en équilibre avec l’oxygène dissous dont on souhaite mesurer la concentration. Un exemple de configuration du système 100 dans lequel un seul emplacement 125 est représenté est montré à la FIG. 10 avec l’attracteur magnétique 144 positionné sous l’emplacement au plus près du bouchon du réacteur 180 et le transducteur 160 positionné au-dessus du fond 184b du réacteur 180 au plus près du capteur ponctuel 150. L’axe de mesure A1 est alors aligné avec l’axe d’alignement A2. Afin d’aligner le transducteur 160 avec l’axe de mesure A1, le système 100 comprend un dispositif de déplacement 165. Le positionnement du réacteur 180 « la tête en bas » et la fixation du capteur ponctuel 150 sur le fond 184b permet avantageusement de positionner successivement le transducteur 160 au plus près de chacun des capteurs 150 dans un mouvement simple dans un plan. Le dispositif de déplacement 165 ne doit ainsi pas nécessairement être configuré pour effectuer un mouvement de haut en bas à chaque passage d’un réacteur 180 à l’autre. La précision quant au positionnement du transducteur 160 est préférentiellement de l’ordre du millimètre. Afin d’atteindre une telle précision, une technologie basée sur du CNC ( Computer Numerical Control ) peut être utilisée. Avantageusement, le système 100 peut comprendre en outre une enceinte configurée pour protéger l’au moins un transducteur des perturbations extérieures. Le système présenté ci-dessus permet avantageusement de réduire le biais de mesure. L’invention concerne également un procédé d’utilisation du système 100 de mesure d’activité microbienne présenté ci-dessus. Le procédé comprend les étapes de : Fourniture d’au moins un réacteur 180 ; Pour chaque réacteur 180 : Placement d’au moins un capteur ponctuel 150 à l’intérieur du réacteur 180, sur le fond 184b du réacteur 180 et sur l’axe d’alignement A2 ; Introduction d’un échantillon dans le réacteur 180 ; Fermeture du réacteur 180 avec le bouchon 182 ; Placement du réacteur 180 dans un des emplacements 125 du support, de telle sorte que l’axe d’alignement A2 se superpose avec l’axe de mesure A1 de l’emplacement 125, le fond 184b du réacteur 180 étant positionné au-dessus de la bague ; Agitation de l’échantillon à l’aide du dispositif d’agitation 140 ; Alignement d’au moins un des transducteurs 160 avec au moins un des axes de mesure A1 à l’aide du dispositif de déplacement 165 ; Interaction du transducteur 160 avec le capteur ponctuel 150. Les étapes d’alignement et d’interaction peuvent être répétées à intervalles de temps prédéterminés pour au moins un réacteur 180. Le procédé peut comprendre en outre, avant la disposition de l’échantillon dans le réacteur 180, une étape de calibration du capteur ponctuel 150. La calibration peut comprendre une étape de calibration du signal en fonction du matériau, de l’épaisseur et de la courbure du fond 184b du réacteur 180. La calibration peut comprendre, alternativement ou en combinaison, une étape de calibration du capteur ponctuel 150 lui-même, par exemple si ce capteur ponctuel 150 n’est pas pré-étalonné. La présente invention se comprendra mieux à la lecture de l’exemple suivant qui illustre non-limitativement l’utilisation du système. Dans cet exemple, le système 100 comprend un support 120 comprenant 2x3 emplacements 125, six dispositifs d’agitation 140 magnétiques positionnés sous le support 120, un transducteur 160 positionné au-dessus du support 120 et un dispositif de déplacement 165. Chaque emplacement 125 accueille un réacteur 180. Les réacteurs 180 sont des flacons de laboratoire ronds en verre borosilicaté avec bouchon à visser de la marque Duran Schott (marque déposée) d’un volume de 133 mL. Les réacteurs 180 sont positionnés verticalement « la tête en bas » de manière à ce que le bouchon 182 soit positionné sous le fond 184b. Trois réacteurs 180 (R1, R2, R3) de test sont remplis d’un échantillon contenant un inoculum microbien et de l’acétate de sodium. Les trois autres réacteurs 180 servent de témoins. Deux d’entre eux (R4, R5) contiennent uniquement le même inoculum microbien que les réacteurs 180 de test tandis que le troisième (R6) contient uniquement de l’acétate de sodium (en même quantité et concentration que R1, R2 et R3) dans un milieu abiotique. Le capteur ponctuel 150 présent dans chacun des réacteurs 180 est configuré pour mesurer le taux d’oxygène O 2 . L’interaction entre le transducteur 160 et le capteur ponctuel 150 est effectuée par fluorescence. Le transducteur 160 utilisé est le Electro-Optical Module EOM-O2-FOM de Presens tandis que le capteur ponctuel 150 est le PSt3 de Presens dont l’intensité de fluorescence est reliée à la concentration en oxygène dissous. L’alignement du transducteur 160 et la lecture du taux d’oxygène par fluorescence pour chacun des réacteurs 180 sont effectués à intervalles réguliers pendant près de 4 jours. La FIG. 11 montre l’évolution du taux d’oxygène C (en pourcent) dans l’échantillon au cours du temps T (en jours) pour chacun des réacteurs 180 (R1-R6). Premièrement, on remarque que le taux d’oxygène des réacteurs 180 témoins (R4, R5, R6) reste stable (variation inférieure à 2%) au cours des mesures. Cela montre bien que le système selon présente une grande stabilité ce qui réduit le biais de mesure. Deuxièmement, on remarque que le taux d’oxygène C décroit dans les trois réacteurs 180 (R1, R2, R3) de test vers 1,5 jour, 1,7 jour et 2.3 jour respectivement. Cette décroissance dure entre 0.2 jour et 0.3 jour. Ensuite, le taux d’oxygène C reste stable. Cela montre que l’acétate de sodium est dégradé rapidement, le système selon l’invention permettant d’obtenir une mesure précise et fiable de l’évolution du taux d’oxygène C et de déduire précisément la biodégradabilité de l’échantillon d’acétate de sodium. REFERENCES NUMERIQUES 100 – Système // 120 – Support // 125 – Emplacement // 140 – Dispositif d’agitation // 142 – Hélice // 144 – Attracteur magnétique // 146 – Actionneur // 148 – Agitateur magnétique // 150 – Capteur ponctuel // 160 – Transducteur // 165 – Dispositif de déplacement // 180 – Réacteur // 182 – Bouchon // 184a – Paroi latérale // 184b – Fond // 190 – Applicateur // 192 – élément de centrage // 194 – élément de positionnement // F1 – Rotation de l’hélice // F2 – Rotation de l’attracteur magnétique // A1 – Axe de mesure // A2 – Axe d’alignement // C – Taux d’oxygène // R1-R6 – Six réacteurs différents pour une mesure de biodégradabilité // T – Temps. Un système (100) de mesure d’activité microbienne comprenant : Au moins un support (120), chaque support (120) comprenant une pluralité d’emplacements (125) ouverts vers le haut, chaque emplacement (125) étant configuré pour accueillir un bouchon (182) d’un réacteur (180), chaque réacteur (180) étant apte à contenir hermétiquement un échantillon, chaque emplacement (125) comprenant un centre définissant un axe de mesure (A1) perpendiculaire au support ; Au moins un dispositif d’agitation (140) positionné sous le support (120), chaque dispositif d’agitation (140) étant apte à agiter l’échantillon dans un réacteur (180) ; Au moins un transducteur (160) positionné au-dessus du support (120), chaque transducteur (160) étant configuré, lorsqu’il est aligné avec l’axe de mesure (A1) d’un des emplacements (125) du support, pour interagir avec un capteur ponctuel (150) positionné à l’intérieur d’un réacteur (180) placé dans ledit emplacement (125), le capteur ponctuel (150) étant alors aligné sur l’axe de mesure (A1), le capteur ponctuel (150) étant configuré pour mesurer au moins un marqueur d’activité microbienne ; et Un dispositif de déplacement (165) configuré pour déplacer l’au moins un transducteur (160) afin de l’aligner successivement sur l’axe de mesure (A1) de plusieurs emplacements (125) du support. Le système (100) de mesure d’activité microbienne selon la revendication 1, dans lequel chaque dispositif d’agitation (140) comprend un attracteur magnétique (144) mobile positionné sous un emplacement (125) et apte à coopérer avec un agitateur magnétique (148) disposé à l’intérieur du réacteur (180) placé dans cet emplacement (125), la mobilisation de l’attracteur magnétique (144) permettant de mobiliser l’agitateur magnétique (148) dans le réacteur (180). Le système (100) de mesure d’activité microbienne selon l’une quelconque des revendications 1 à 2, dans lequel le transducteur (160) permet une interaction par fluorescence. Le système (100) de mesure d’activité microbienne selon l’une quelconque des revendications 1 à 3, dans lequel au moins un des marqueurs d’activité microbienne est choisi parmi la quantité d’oxygène, la quantité de dioxyde de carbone, la quantité de méthane, la concentration d’une molécule chimique prédéterminée, et/ou la pression à l’intérieur du réacteur (180). Un réacteur (180) apte à contenir hermétiquement un échantillon, le réacteur (180) présentant une paroi latérale (184a), un fond (184b) et une bague sur laquelle s’ajuste un bouchon (182), la bague présentant un axe d’alignement (A2), un capteur (150) ponctuel étant disposé à l’intérieur du réacteur (180), sur le fond (184b) du réacteur (180) et placé sur l’axe d’alignement (A2), le capteur ponctuel (150) étant configuré pour mesurer au moins un marqueur d'activité microbienne, le réacteur (180) étant apte à être accueilli dans un emplacement (125) d’un support du système (100) selon l’une quelconque des revendications 1 à 4 de manière à ce que le bouchon (182) s’ajuste dans l’emplacement (125) et à ce que l’axe d’alignement (A2) se superpose avec l’axe de mesure (A1) dudit emplacement (125). Le réacteur (180) selon la revendication 5, dans lequel le fond (184b) présente une épaisseur comprise entre 2 mm et 6 mm. Le réacteur (180) selon l’une quelconque des revendications 5 à 6, dans lequel le fond (184b) présente une courbure comprise entre 600 mm et 3000 mm. Un applicateur (190) permettant le placement d’un capteur ponctuel (150) sur le fond (184b) d’un réacteur (180) afin de préparer un réacteur (180) selon l’une quelconque des revendications 5 à 7, l’applicateur (190) comprenant un élément de centrage (192) ajustable sur la bague du réacteur (180) et un élément de positionnement (194) permettant de placer le capteur ponctuel (150) sur le fond (184b) du réacteur (180) et sur l’axe d’alignement (A2). Procédé d’utilisation d’un système (100) de mesure d’activité microbienne selon l’une quelconque des revendications 1 à 4, le procédé comprenant les étapes de : Fourniture d’au moins un réacteur (180), le réacteur (180) présentant une paroi comprenant une paroi latérale (184a), un fond (184b) et une bague sur laquelle s’ajuste un bouchon (182), la bague présentant un axe d’alignement (A2) ; Pour chaque réacteur (180) : Placement d’au moins un capteur ponctuel (150) configuré pour mesurer au moins un marqueur d'activité microbienne à l’intérieur du réacteur (180), sur le fond (184b) du réacteur et sur l’axe d’alignement (A2) ; Introduction d’un échantillon dans le réacteur (180) ; Fermeture du réacteur (180) avec un bouchon (182) ; Placement du réacteur (180) dans le support (120) par ajustement du bouchon (182) dans un des emplacements (125) du support, de telle sorte que l’axe d’alignement (A2) se superpose avec l’axe de mesure (A1) dudit emplacement (125), le fond (184b) du réacteur (180) étant positionné au-dessus de la bague ; Agitation de l’échantillon à l’aide du dispositif d’agitation (140) ; Alignement d’au moins un des transducteurs (160) avec au moins un des axes de mesure (A1) à l’aide du dispositif de déplacement (165) ; Interaction dudit transducteur (160) avec le capteur ponctuel (150) afin de mesurer au moins un marqueur d'activité microbienne. Le procédé d’utilisation selon la revendication 9, dans lequel les étapes d’alignement et d’interaction sont répétées à intervalles de temps prédéterminés pour au moins un réacteur (180). Le procédé d’utilisation selon la revendication 9 ou 10, comprenant en outre, avant la disposition de l’échantillon dans le réacteur (180), une étape de calibration du capteur ponctuel (150). Le procédé d’utilisation selon l’une quelconque des revendications 9 à 11 permettant la mesure de la biodégradabilité de l’échantillon, l’échantillon comprenant un inoculum microbien. Le procédé d’utilisation selon la revendication 12, dans lequel le capteur ponctuel (150) est configuré pour mesurer la quantité d’oxygène à l’intérieur du réacteur (180). Le procédé d’utilisation selon la revendication 12 ou 13, dans lequel le transducteur (160) interagit avec le capteur ponctuel (150) par fluorescence.