Brevet FR3147485A1 — publié le 20241011

Procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol L’invention concerne un procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol, dans lequel un ou plusieurs miARN est appliqué au sol afin d’inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol, tels que les gènes codant l’enzyme AMO (Ammonia MonoOxygenase) et/ou l’enzyme HAO (HydroxylAmine Oxydoréductase). procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol L’invention concerne un procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol, dans lequel un ou plusieurs miARN est appliqué au sol afin d’inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol, tels que les gènes codant l’enzyme AMO (Ammonia MonoOxygenase) et/ou l’enzyme HAO (HydroxylAmine Oxydoréductase). L’invention concerne également une composition fertilisante comprenant un engrais ou un amendement, et un ou plusieurs miARN. Dans la nature, en raison des processus biogéochimiques, l'état d'oxydation de l'azote (N) varie considérablement, allant de -3 à +5, entraînant la formation de nombreuses espèces d'azote, notamment N 2 O 5 , HNO 3 , HNO 3 , NO 2 , N 2 O 4 , HNO 2 , HNO 2 , NO, N 2 O, N 2 , NH 3 , NH 4 +, NH 4 Cl, et CH 3 NH 2 [1]. La nitrification est un processus biologique par lequel les nitrates sont produits dans l'environnement. Celle-ci se fait en plusieurs étapes distinctes, chacune sous l'action de micro-organismes différents : Etape 1) Les bactéries oxydant l'ammoniaque (i.e. les AOB, telles que Nitrosomonas spp. et Nitrosococcus spp. ) initient le processus de nitrification en oxydant l'ammoniac (NH 3 ) en hydroxylamine (NH 2 OH). Cette étape est catalysée par l’enzyme AMO (Ammonia MonoOxygenase). Etape 2) Les AOB oxydent NH 2 OH en nitrite (NO 2 – ) via l’enzyme HAO (HydroxylAmine Oxydoréductase). Etape 3) Les bactéries oxydant les nitrites (i.e. les NOB, telles que Nitrobacter spp. ) complètent le processus de nitrification en produisant du nitrate (NO 3 - ) via l'enzyme HAO (HydroxylAmine Oxydoréductase). La nitrification entraine la perte d'environ un cinquième de l'azote appliqué au sol via le lessivage de NO 3 et l'émission d'oxyde nitreux (N 2 O) [2]. La nitrification entraîne une augmentation du coût de la production agricole, une pollution de l'environnement [3], des maladies humaines et animales [4], une dégradation de l'ozone et des émissions de gaz à effet de serre qui participent au changement climatique [5]. Environ 97% des émissions de N 2 O dans les systèmes de culture sont attribués au processus de nitrification [6]. Par conséquent, le contrôle du processus de nitrification est devenu un enjeu majeur en agriculture au cours des dernières décennies. Actuellement, le contrôle de la nitrification dans le sol par l’agriculteur est principalement réalisé en utilisant des inhibiteurs synthétiques de nitrification. Ces derniers comprennent une large gamme de composés tels que le dicyandiamide (DCD), le 2-chloro-6-(trichlorométhyl)-pyridine (Nitrapyrine), le phosphate de 3,4-diméthylpyrazole (DMPP) [7], l'allylthiourée [8], 2-amino-4-chloro-6-méthylpyrimidine [9], etc. Cependant, l'utilisation de ces inhibiteurs synthétiques a été limitée en raison du coût élevé qui limite leur utilisation à grande échelle, de leur disponibilité limitée [10], de leur effet non ciblé causant des effets néfastes sur les micro-organismes bénéfiques présents dans le sol [11] et en raison de la pollution de l'environnement qu’ils engendrent, en particulier sur les écosystèmes aquatiques [2][10]. Dans un contexte où la protection de l’environnement est un enjeu de société majeur, il est important de mettre au point des méthodes naturelles et respectueuses de l’environnement qui permettent d’inhiber la nitrification dans le sol. Les inventeurs ont ainsi mis au point une nouvelle stratégie d’inhibition des gènes de la nitrification en montrant que certains miARN avaient la propriété d’inhiber le processus de nitrification dans un sol. L’invention, qui trouve application dans le domaine de l’agriculture, porte sur la découverte de microARNs (miARNs) ayant la capacité d’inhiber des ARNm de différents genres bactériens responsables de la régulation du processus de nitrification dans les sols (ci-après l’invention). En particulier, il a été mis en évidence des miARNs ayant la capacité d’inhiber les ARNm codant pour les enzymes AMO et/ou HAO, ce qui permettrait d’inhiber le processus de nitrification dans les sols. Un premier objet de la présente invention concerne un procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol, dans lequel un ou plusieurs miARN de formule (I) est appliqué au sol afin d’inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8. Un deuxième objet de la présente invention concerne l’utilisation d’un miARN de formule (I) pour inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8. Un troisième objet de la présente invention concerne une composition comprenant un ou plusieurs miARN isolé(s) de formule (I) : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8. Un quatrième objet de la présente invention concerne support de culture ou une solution de culture comprenant un ou plusieurs miARN isolé(s) de formule (I) ou une composition selon l’invention Description détaillée Procédé ou utilisation pour inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification La présente invention concerne un procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol, dans lequel un ou plusieurs miARN de formule (I) est appliqué au sol afin d’inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8. La présente invention concerne également l’utilisation d’un miARN de formule (I) pour inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8. Le terme « sol » désigne le substrat exploré par les racines des plantes cultivées. Le terme sol comprend tout type de substrat sur lequel une plante peut se développer, tel que par exemple un sol artificiel, un sol agricole cultivé, un sol agricole non cultivé, de la tourbe, du terreau, de la laine de roche ou de la fibre de coco. Le terme sol couvre donc également les supports de cultures qui peuvent notamment être utilisés pour de la culture dite « hors sol », par exemple dans des pots. Le terme « inhiber le processus de nitrification » ou « inhibition du processus de nitrification » désigne au moins 2 %, au moins 3 %, au moins 4 %, au moins 5 %, au moins 10 %, au moins 15 %, au moins 20 %, au moins 25 %, au moins 30 %, au moins 35 %, au moins 40 %, au moins 45 %, ou au moins 50 %, de diminution du processus de nitrification par rapport à une condition de référence. Dans le cadre de l’invention, l’inhibition du processus de nitrification se calcule en mesurant le processus de nitrification dans un sol auquel on applique un ou plusieurs miARN de formule (I), et en le comparant avec un sol auquel on n’a pas appliqué un ou plusieurs miARN de formule (I). Une méthode permettant de mesurer l’inhibition est détaillée dans les exemples. Le terme « inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes » ou « inhibition de l’expression d’un ou de plusieurs gènes » désigne la propriété des miARNs à inhiber les ARNm dudit un ou plusieurs gènes, inhibant ainsi la synthèse des protéines codées par lesdits gènes inhibés. Avantageusement, l’inhibition est d’au moins 2 %, au moins 3 %, au moins 4 %, au moins 5 %, au moins 10 %, au moins 15 %, au moins 20 %, au moins 25 %, au moins 30 %, au moins 35 %, au moins 40 %, au moins 45 %, ou au moins 50 %, de diminution de l’expression dudit un ou plusieurs gènes par rapport à une condition de référence. Dans le cadre de l’invention, l’inhibition de l’expression d’un ou de plusieurs gènes peut se calculer en quantifiant les protéines codées par lesdits gènes inhibés et/ou les ARNm correspondants en mettant en œuvre des techniques classiques pour la personne du métier tel que la méthode ELISA pour quantifier les protéines ou la RT-qPCR pour quantifier les ARNm. Le pourcentage d’inhibition se calcule en mesurant l’inhibition de l’expression d’un ou de plusieurs gènes dans un sol auquel on applique un ou plusieurs miARN de formule (I), et en le comparant avec un sol auquel on n’a pas appliqué un ou plusieurs miARN de formule (I). Le terme « microARN » ou « miARN » (ou miRNA en anglais) désigne une courte molécule d'acide ribonucléique (ARN) qui agit comme un régulateur post-transcriptionnel en régulant des ARNm cibles. Un miARN peut avoir une longueur allant de 20 à 24 nucléotides (nt), de préférence de 20 à 22 nt, par exemple 20, 21 ou 22 nt. La préparation d’un miARN ne présente aucune difficulté particulière, par exemple par synthèse chimique classique. Dans des modes de réalisation particuliers, le miRNA de formule (I) est un miARN synthétique, c’est-à-dire qu’il a été synthétisé in vitro , par exemple par synthèse chimique. On peut citer par exemple la synthèse sur support solide par la méthode phosphoramidite. La synthèse in vitro permet d’obtenir facilement les quantités souhaitées de miARN de formule (I). Dans des modes de réalisation particuliers, le miARN de formule (I) comprend de 19 à 21 nucléotides, c’est à dire 19 nucléotides, 20 nucléotides ou 21 nucléotides. [Séquence 3’] correspond à la partie 3’ de la séquence du miARN de formule (I). Cette séquence peut comprendre 10, 11, 12 ou 13 nucléotides. Dans des modes de réalisation particuliers, [Séquence 3’] comprend au moins 80% d’homologie avec une séquence nucléotidique choisie parmi les séquence SEQ ID NO : 9-16, de préférence au moins 85% d’homologie, par exemple au moins 90% d’homologie, au moins 95% d’homologie, au moins 99% d’homologie ou même 100% d’homologie. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 1, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 9. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 2, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 10. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 3, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 11. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 4, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 12. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 5, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 13. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 6, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 14. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 7, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 15. Lorsque [Séquence cœur] est SEQ ID NO : 8, [Séquence 3’] comprend de préférence au moins 80% d’homologie avec la séquence nucléotidique SEQ ID NO : 16. Dans des modes de réalisation particuliers, le miARN de formule (I) peut être choisi parmi sbi-miR162 (SEQ ID NO : 17), sbi-miR394a (SEQ ID NO : 18), sbi-miR397-5p (SEQ ID NO : 19), sbi-miR5386 (SEQ ID NO : 20), sbi-miR5388 (SEQ ID NO : 21), sbi-miR5568d-3p (SEQ ID NO : 22), sbi-miR5568d-5p (SEQ ID NO : 23) et sbi-miR6232a-5p (SEQ ID NO : 24). Un mélange de plusieurs miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte peut être appliqué au sol. Dans des modes de réalisation particuliers, de deux à huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte est appliqué au sol, par exemple un mélange de deux, trois, quatre, cinq, six sept ou huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte est appliqué au sol. Par exemple, il peut s’agir d’un mélange comprenant sbi-miR162 (SEQ ID NO : 17), sbi-miR394a (SEQ ID NO : 18), sbi-miR397-5p (SEQ ID NO : 19), sbi-miR5386 (SEQ ID NO : 20), sbi-miR5388 (SEQ ID NO : 21), sbi-miR5568d-3p (SEQ ID NO : 22), sbi-miR5568d-5p (SEQ ID NO : 23) et sbi-miR6232a-5p (SEQ ID NO : 24). Le miARN de formule (I) inhibe l’expression d’un gène codant pour l’enzyme Ammonia MonoOxygenase (AMO) et/ou inhibe l’expression d’un gène codant pour l’enzyme HydroxylAmine Oxydoréductase (HAO). En particulier, le miARN de formule (I) est capable de cibler un ou plusieurs ARNm codant pour AMO et/ou un ou plusieurs ARNm codant pour AHO, ce qui a pour effet d’inhiber la traduction des ARNm cibles en protéines. Ainsi, dans un mode de réalisation préféré, ledit un ou plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol code pour l’enzyme Ammonia MonoOxygenase (AMO) et/ou pour l’enzyme HydroxylAmine Oxydoréductase (HAO). Dans le cadre de la présente invention, ledit un ou plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol est exprimé par une ou plusieurs bactéries présentes dans le sol, notamment les bactéries oxydant l'ammoniac (AOB) et/ou les bactéries oxydant les nitrites (NOB), de préférence une ou plusieurs bactéries présentes dans le sol choisie parmi Nitrosomonas spp. , Nitrosospira spp. et Nitrosococcus spp., par exemple choisie parmi Nitrosomonas europaea, Nitrosomonas eutropha C-91, Nitrosomonas communis Nm2 , Nitrosospira multiformis et Nitrosospira lacus APG3 .. Le miARN de formule (I) a donc la propriété d’inhiber l’activité de nitrification des micro-organismes impliqués dans le processus de nitrification dans le sol, notamment les bactéries oxydant l'ammoniac (AOB) et/ou les bactéries oxydant les nitrites (NOB). Le miARN de formule (I) peut être appliqué au sol dans une quantité allant de 1 g/ha à 1000 g/ha. Dans un mode de réalisation particulier, le miARN de formule (I) peut être appliqué au sol avec un fertilisant, par exemple un engrais, solide ou liquide, un amendement, et/ou un biostimulant. Il peut s’agir, par exemple, d’un engrais azoté. Le miARN de formule (I) peut inhiber la nitrification d’un engrais azoté appliqué au sol, par exemple un engrais azoté qui est appliqué audit sol avant, concomitamment ou après ledit miARN. Ainsi, le miARN de formule (I) et l’engrais azoté peuvent être appliqués au sol simultanément ou séquentiellement. Par exemple, le miARN de formule (I) peut être appliqué au sol lors d’un premier traitement, et l’engrais azoté peut être appliqué au sol lors d’un second traitement. Plusieurs traitements successifs du sol peuvent ainsi être réalisés. Généralement, la personne du métier adapte le nombre de traitements et la nature du traitement, par exemple en fonction de la nature du sol et/ou de la plante cultivée dans le sol. Le procédé ou l’utilisation selon l’invention trouve application dans le traitement d'un sol dans lequel peut être planté une très grande variété de plantes. Parmi celles-ci, on citera en particulier : - les plantes de grande culture telles que les céréales (blé, maïs, orge), - les protéagineux (pois), - les oléagineux (soja, tournesol), - les cultures de Solanacées (pomme de terre), - les cultures d’Amaranthaceae (betterave), - les cultures spécialisées telles qu'en particulier le maraîchage (laitue, épinard, oignon, échalote, tomate, melon), la vigne, l'arboriculture (poire, pomme, nectarine), ou l'horticulture. En particulier, la plante peut appartenir à l’ordre des monocotylédones, de préférence à la famille des poacées. Les poacées, communément appelés les graminées, renferment notamment la plupart des espèces appelées communément « herbes » et « céréales ». Les céréales sont largement cultivées, principalement pour leurs grains, et sont utilisées dans l’alimentation humaine et animale. Avantageusement, la plante est une poacée, de préférence choisie parmi le blé, le riz, l’orge, l’avoine, le seigle, la canne à sucre, la prairie ou le maïs, de préférence le blé. Dans des modes de réalisations particuliers, le miARN est un miARN isolé. Ainsi, dans des modes de réalisation particuliers, l’invention concerne un procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol, dans lequel un ou plusieurs miARN isolé de formule (I) est appliqué au sol afin d’inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO : 1-8. Ainsi également, dans des modes de réalisation particuliers, la présente invention concerne l’utilisation d’un miARN isolé de formule (I) pour inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO : 1-8. Un miARN isolé correspond à un miARN isolé de son environnement naturel. Par exemple, le miARN peut être isolé à partir d’un organisme vivant contenant ledit miARN, tel qu’une plante ou une algue, par exemple en mettant en œuvre un procédé d’extraction. Des procédés d'extraction de microARN sont décrits dans la littérature et leur mise en œuvre ne présente aucune difficulté particulière pour la personne du métier. On peut citer par exemple l’extraction avec par solvant, tel que l'eau, un solvant hydrophile ou une combinaison de ceux-ci. Le miARN isolé peut aussi être synthétisé chimiquement. On pourra alors parler de miARN synthétique. Des méthodes de synthèse chimique d’acides nucléiques sont largement décrites dans la littérature et leur mise en œuvre ne présente aucune difficulté particulière pour la personne du métier. Le miARN (ou miARN isolé) peut se présenter sous la forme d’une composition, par exemple une composition comprenant ledit miARN et un excipient. L’excipient peut être choisi pour ses capacités à stabiliser le miARN dans le sol, ce qui permet de diminuer la dégradation du miARN dans le sol. La composition peut comprendre de 0,01% à 99% en poids dudit miARN. Lorsque le miARN est isolé à partir d’une plante ou d’une algue, la composition peut se présenter sous la forme d’un extrait de plante ou d’un extrait d’algue. Composition et support de culture L’invention concerne également une composition comprenant un ou plusieurs miARN isolé(s) de formule (I) : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8. Dans des modes de réalisations particuliers, la composition selon l’invention comprend en outre un fertilisant. Le fertilisant peut être un engrais, un amendement et/ou un biostimulant. Dans des modes de réalisation particuliers, [Séquence 3’] comprend au moins 80% d’homologie avec une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO : 9-16, de préférence au moins 85% d’homologie, par exemple au moins 90% d’homologie, au moins 95% d’homologie, au moins 99% d’homologie ou même 100% d’homologie. Dans des modes de réalisation particuliers, le miARN est choisi parmi sbi-miR162 (SEQ ID NO : 17), sbi-miR394a (SEQ ID NO : 18), sbi-miR397-5p (SEQ ID NO : 19), sbi-miR5386 (SEQ ID NO : 20), sbi-miR5388 (SEQ ID NO : 21), sbi-miR5568d-3p (SEQ ID NO : 22), sbi-miR5568d-5p (SEQ ID NO : 23) et sbi-miR6232a-5p (SEQ ID NO : 24). La composition selon l’invention peut se présenter sous forme solide, par exemple sous forme de granules ou de poudre, ou sous forme liquide, par exemple sous forme de solution aqueuse. Par exemple, la composition selon l’invention peut se présenter sous forme de granules imprégnés ou recouverts de miARN de formule (I). Le miARN peut être un miARN extrait à partir d’un organisme vivant connu pour contenir ledit miARN ou un miARN synthétique, tels que décrits plus haut. La composition peut comprendre un excipient qui stabilise le miARN dans le sol, ce qui permet de diminuer la dégradation du miARN dans le sol. La composition peut comprendre de 0,01% à 99% en poids dudit miARN. L’engrais peut être d'origine naturelle ou synthétique. Dans un mode de réalisation, l’engrais est un azoté. Un engrais azoté doit fournir au moins de l'azote (N) comme nutriment. Dans des modes de réalisation particuliers, l’engrais azoté contient de l’ammonium, de l’ammoniac et/ou de l’urée. Des exemples d'engrais contenant de l'ammonium sont le nitrate d'ammonium calcique, le nitrate de calcium et d'ammonium, le nitrate de sulfate d'ammonium, le sulfate d'ammonium et le phosphate d'ammonium. Un exemple d'engrais contenant de d'ammoniac est le nitrate d'ammoniac. L’engrais azoté peut également fournir d'autres nutriments, par exemple, du potassium (K) et/ou du phosphore (P). Il peut s’agir d’un engrais inorganique et/ou d’un engrais organique. Dans les engrais azotés fournissant N, ainsi que P ou K, on peut citer les engrais dits « NP » ou « NK », tels que le phosphate monoammonique ou le phosphate diammonique. Dans les engrais azotés fournissant N, P et K, on peut citer les engrais dits « NPK ». L’amendement peut être un amendement organique ou un amendement minéral, tel que le carbonate de calcium. La composition selon l’invention peut également comprendre des micronutriments tels que le molybdène, le zinc, le bore et le cuivre. Ces éléments sont typiquement fournis sous forme de sels solubles dans l'eau. La composition selon l’invention peut également comprendre un solvant, un support solide, un dispersant ou un émulsifiant, un épaississant organique ou inorganique, un agent pesticide, un agent antigel, un agent anti-mousse, le cas échéant un colorant, un agent collant ou un liant. Dans des modes de réalisation particuliers, la composition selon l’invention comprend un mélange de deux à huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte, par exemple un mélange de deux, trois, quatre, cinq, six, sept ou huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte. Dans des modes de réalisations particuliers, la composition selon l’invention est destinée aux supports de culture et/ou aux solutions de culture. Ainsi, un autre objet de la présente invention concerne un support de culture ou une solution de culture comprenant un ou plusieurs miARN isolé(s) de formule (I) ou une composition selon l’invention. Au sens de la présente invention, on entend par « solution de culture » toute solution qui permet la culture d’une plante telle que par exemple eau d’irrigation, solution liquide destinée à la fertigation par aspersion ou goutte à goutte, bain d’hydroponie ou solution d’aéroponie. Le terme « support de culture » est défini ci-dessus. Exemples Exemple 1 : miARN pour inhiber le processus de nitrification biologique de Nitrosomonas europaea 25978 Matériels et méthodes Les 8 miARNs utilisés dans cet exemple ont été préparés par synthèse chimique et correspondent aux miARN présentés dans le tableau 1. SEQ ID NO : Nom du miARN Séquence 17 sbi-miR162 UCGAUAAACCUCUGCAUCCAG 18 sbi-miR394a UUGGCAUUCUGUCCACCUCC 19 sbi-miR397-5p UCAUUGAGUGCAGCGUUGAUG 20 sbi-miR5386 CGUCGCUGUCGCGCGCGCUG 21 sbi-miR5388 AUCUUUGCCGGGUGUCUCUGAC 22 sbi-miR5568d-3p AAAGUUGUGUAUCUAGAAAAG 23 sbi-miR5568d-5p UGGCUUUUCUAGAUACAUAGC 24 sbi-miR6232a-5p GUCGCUUUGACUUUUUUGG Une culture liquide dans un flacon de 500 mL contenant 150 mL de milieu de Skinner et Walker (SW) [12] a été inoculée avec Nitrosomonas europaea 25978 dans un rapport de 1:100 (V/V) et cultivée à 28°C sous agitation à 70 rpm jusqu'à ce que la DO 600nm de la culture atteigne 0,3. La suspension cellulaire a ensuite été distribuée en volumes de 20 ml dans des tubes Falcon de 50 ml. Par la suite, 1 µg de chacun des 8 miARNs dans un volume de 15 µL d’eau a été ajouté aux cultures bactériennes en trois répétitions et mélangé doucement. Toutes les suspensions cellulaires, y compris les cellules témoins (traitées avec le même volume d'eau déionisée ne contenant pas de miARN) et les cellules traitées avec les miARNs, ont été cultivées pendant 5 jours avec une agitation constante à 28°C. Un test de nitrite [13] a été effectué sur tous les échantillons à différents intervalles : 0h (juste après l'ajout des miARN ou de l’eau déionisée) et 46h. Pour cela, les cellules collectées ont été centrifugées à 8 000 tr/min pendant 10 minutes à 4°C et les surnageants ont été utilisés pour le dosage des nitrites. Les concentrations de nitrite ont été mesurées par colorimétrie à 540 nm à l'aide d'un lecteur de plaque de microtitration à travers le réactif de Griess [13]. 100 µL de sulfanilamide à 30 mM ont été ajoutés à chaque échantillon et mélangés par pipetage de haut en bas, puis 100 µL de dichlorhydrate de N-(1-naphtyl) éthylènediamine à 12 mM ont été ajoutés au mélange. En parallèle, des échantillons étalons de nitrite entre 0 et 100 µM utilisant du NaNO 2 à 1 mM ont été préparés. L'absorbance de tous les échantillons et étalons a été mesurée par un lecteur de microplaques (BMG labtech, Allemagne) à 540 nm. Résultats : Les résultats sont présentés au tableau 2. Temps (heure) 0 46 Quantité de nitrite (µM) Contrôle 12,28 ± 0,13 47,24 ± 1,35 Traité avec le mélange de miARNs 12,28 ± 0,26 42,21 ± 3,88 Les résultats montrent que les miARNs ont été capables d’inhiber la nitrification biologique de Nitrosomonas europaea 25978 d’environ 11%. Procédé pour inhiber le processus de nitrification dans un sol, dans lequel un ou plusieurs miARN de formule (I) est appliqué au sol afin d’inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8, et dans lequel ledit un ou plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol est exprimé par une ou plusieurs bactéries présentes dans ledit sol choisie parmi Nitrosomonas spp., Nitrosospira spp. et Nitrosococcus spp. . Utilisation d’un miARN de formule (I) pour inhiber l’expression d’un ou de plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans un sol: [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8, et dans lequel ledit un ou plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol est exprimé par une ou plusieurs bactéries présentes dans ledit sol choisie parmi Nitrosomonas spp., Nitrosospira spp. et Nitrosococcus spp. . Procédé ou utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel ledit un ou plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol code pour l’enzyme Ammonia MonoOxygenase (AMO) et/ou pour l’enzyme HydroxylAmine Oxydoréductase (HAO). Procédé ou utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel ledit un ou plusieurs gènes qui participent au processus de nitrification dans ledit sol est exprimé par une ou plusieurs bactéries présentes dans ledit sol choisie parmi Nitrosomonas europaea, Nitrosomonas eutropha C-91, Nitrosomonas communis Nm2 , Nitrosospira multiformis et Nitrosospira lacus APG3 . Procédé ou utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le miARN comprend de 19 à 21 nucléotides. Procédé ou utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le miARN inhibe la nitrification d’un engrais azoté appliqué au sol, par exemple un engrais azoté qui est appliqué audit sol avant, concomitamment ou après ledit un ou plusieurs miARN. Procédé ou utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel [Séquence 3’] comprend au moins 80% d’homologie avec une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO : 9-16, de préférence au moins 85% d’homologie, par exemple au moins 90% d’homologie, au moins 95% d’homologie, au moins 99% d’homologie ou même 100% d’homologie. Procédé ou utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le miARN est choisi parmi sbi-miR162 (SEQ ID NO : 17), sbi-miR394a (SEQ ID NO : 18), sbi-miR397-5p (SEQ ID NO : 19), sbi-miR5386 (SEQ ID NO : 20), sbi-miR5388 (SEQ ID NO : 21), sbi-miR5568d-3p (SEQ ID NO : 22), sbi-miR5568d-5p (SEQ ID NO : 23) et sbi-miR6232a-5p (SEQ ID NO : 24). Procédé ou utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel un mélange de deux à huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte est appliqué au sol, par exemple un mélange de deux, de trois, de quatre, de cinq, de six, de sept ou de huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte. Composition comprenant un ou plusieurs miARN isolé(s) de formule (I) : [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8. Composition selon la revendication 10, dans laquelle [Séquence 3’] comprend au moins 80% d’homologie avec une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO : 9-16, de préférence au moins 85% d’homologie, par exemple au moins 90% d’homologie, au moins 95% d’homologie, au moins 99% d’homologie ou même 100% d’homologie. Composition selon la revendication 10 ou 11, dans laquelle le miARN est choisi parmi sbi-miR162 (SEQ ID NO : 17), sbi-miR394a (SEQ ID NO : 18), sbi-miR397-5p (SEQ ID NO : 19), sbi-miR5386 (SEQ ID NO : 20), sbi-miR5388 (SEQ ID NO : 21), sbi-miR5568d-3p (SEQ ID NO : 22), sbi-miR5568d-5p (SEQ ID NO : 23) et sbi-miR6232a-5p (SEQ ID NO : 24). Composition selon l’une quelconque des revendications 10 à 12, comprenant un mélange de deux à huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte, par exemple un mélange de huit miARNs de formule (I) ayant chacun une [Séquence cœur] distincte. Composition selon l’une quelconque des revendications 10 à 13, comprenant en outre un fertilisant, par exemple un engrais, un amendement et/ou un biostimulant. Support de culture ou solution de culture comprenant un ou plusieurs miARN isolé(s) de formule (I) ou une composition selon l’une quelconque des revendications 10 à 14, [Nucléotide]-[Séquence cœur]-[Séquence 3’] (I), dans laquelle : [Nucléotide] correspond à un nucléotide choisi parmi A, U, G ou C, [Séquence 3’] correspond à une séquence de 10 à 13 nucléotides, et [Séquence cœur] correspond à une séquence nucléotidique choisie parmi les séquences SEQ ID NO: 1-8.