Brevet FR3128117A1 — publié le 20230421

La présente invention concerne l’association d’au moins une souche bactérienne de l’espèce Enterococcus faecalis et d’un agent anti-inflammatoire, d’une composition les comprenant et de ses utilisations comme médicament, en particulier destiné à prévenir et/ou le traiter les maladies respiratoires. Combinaison d’ E . faecalis et d’un agent anti-inflammatoire et ses utilisations dans la prévention et/ou traitement des maladies respiratoires L’invention concerne l’association d’au moins une souche bactérienne de l’espèce Enterococcus faecalis et d’un agent anti-inflammatoire, d’une composition les comprenant et de ses utilisations comme médicament, en particulier pour prévenir et/ou traiter les maladies respiratoires. Etat de l’art Les maladies inflammatoires respiratoires chroniques telles que l’asthme, la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO), la rhinite allergique, l’arthrite rhumatoïde, mais encore les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) touchent des millions de personnes dans le monde. Ces maladies chroniques ont un impact fort sur la qualité de vie des patients pour lesquels aucun traitement curatif n’est disponible. La prévalence de ces maladies augmente fortement dans les pays occidentaux, ce qui constitue un problème médical, social et économique majeur. Les traitements actuels sont essentiellement symptomatiques et visent à traiter ou éventuellement prévenir les crises qui surviennent par période, permettant d’améliorer la qualité de vie des patients. Ces traitements sont notamment basés sur des modulateurs de l’immunité à large spectre, tels que les corticostéroïdes. Ces derniers sont certes, très efficaces en traitement ponctuel, mais peuvent entraîner des effets secondaires délétères lors d’une prise régulière. Par exemple, les corticoïdes inhalés peuvent causer un retard de croissance chez l’enfant, la suppression de l’axe hypothalamique pituitaire surrénalien et un risque accru d’ostéoporose. De plus, certains patients, réfractaires aux corticostéroïdes, reçoivent de fortes doses causant des effets secondaires sévères tels que des désordres métaboliques ou un risque accru de maladies cardiovasculaires (De Iudicibus et al. Molecular mechanism of glucocorticoid resistance in inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol 2011 . 17: 1095-108; Ora et al. Advances with glucocorticoids in the treatment of asthma: state of the art. Expert Opin Pharmacother 2020 . 21: 2305-2316). Alors que la résistance congénitale aux corticostéroïdes est rare, la résistance acquise est plus fréquente. La résistance congénitale résulte de mutations du gène du récepteur des glucocorticoïdes, alors que la résistance acquise est multifactorielle. Peu importe la forme, la résistance aux glucocorticoïdes est un problème thérapeutique grave limitant la réponse chez les patients atteints de maladies inflammatoires chroniques. La résistance acquise peut être attribuée à des modifications du microenvironnement cellulaire, qui seraient des conséquences d'une inflammation chronique. De multiples facteurs ont ainsi été identifiés, notamment des altérations de la signalisation en aval de l'action des cytokines, le stress oxydatif, l'hypoxie et les facteurs dérivés du sérum. Des recherches ont également été menées dans le microbiote. Une souche spécifique d’E. faecalis a ainsi été découverte et isolée pour ses propriétés anti-inflammatoires telle que décrites dans la demande de brevet FR 1650656. Celle-ci possède des propriétés tout à fait avantageuses dans le traitement et/ou la prévention de maladies respiratoires telles que l’asthme. Il existe donc un besoin médical fort pour de nouvelles solutions thérapeutiques permettant d'augmenter la réponse des tissus aux glucocorticoïdes et ainsi permettre de diminuer les doses de traitement d’agents anti-inflammatoires nécessaires et/ou d’augmenter leur efficacité. Un objectif de la présente invention est donc d’apporter une solution qui soit simple, efficace et économique pour diminuer les doses de traitement anti-inflammatoire nécessaires et/ou pour augmenter leur efficacité et ainsi prévenir et/ou traiter les maladies respiratoires. Pour répondre à cet objectif, les inventeurs ont identifié que l’association d’un principe actif basé sur des bactéries de l’espèce Enterococcus faecalis (ci-après E. faecalis ) et d’un autre principe actif basé sur des agents anti-inflammatoires, préférentiellement des glucocorticoïdes, induit un effet synergique permettant de diminuer les doses de glucocorticoïde utile administrées à un patient, y compris des patients réfractaires aux glucocorticoïdes. Les inventeurs ont ainsi observé que les souches seules à une MOI 10 (soit 10 cellules d’ E. faecalis pour 1 cellule eucaryote) ou que le budésonide à faible dose (0,1nM) n’induisaient pas d’effet, in vitro , sur la libération d’interleukine-8 (IL-8) induite par le Tumor Necrosis Factor (TNF)-α sur des cellules humaines d’origine pulmonaire BEAS-2B. En revanche, lors de la co-incubation de la même dose de budésonide (0,1nM) en combinaison avec les souches d’ E. faecalis (MOI 10), les inventeurs ont observé un effet synergique correspondant à 32% de l’inhibition de libération de l’IL-8, alors que l’inhibition de libération de l’IL-8 obtenue avec une dose 5 fois supérieure de budésonide seul (soit 0,5 nM) est de 55%. Ainsi, pour obtenir un effet similaire, il est nécessaire d’utiliser des doses extrêmement fortes de budésonide entrainant également de forts effets secondaires. L’étude de l’effet potentialisateur d’ E. faecalis sur un modèle plus complexe d’explants de poumons de souris axéniques en culture ex vivo a permis de confirmer les résultats in vitro en observant un effet anti-inflammatoire supérieur de la combinaison selon l’invention (budésonide 0,1nM + E. faecalis ) à l’effet anti-inflammatoire obtenu avec une dose 50 fois supérieure de budésonide seul (5 nM). L’association de glucocorticoïdes et de bactéries E. faecalis est ainsi particulièrement d’intérêt pour réduire la concentration utile de glucocorticoïdes utilisés en première intention. L’invention est donc particulièrement adaptée à des patients souffrant de maladies inflammatoires chroniques et présentant préférentiellement, une résistance aux corticostéroïdes. Ainsi, l’invention concerne la combinaison de deux principes actifs, soit au moins une souche bactérienne de l’espèce E . faecalis (i) et un agent anti-inflammatoire (ii) pour son utilisation comme médicament chez l’Homme ou l’animal. L’invention vise aussi le surnageant de culture obtenu à partir d’une des souches bactériennes d’ E . faecalis et combiné avec un agent anti-inflammatoire. Enfin, l’invention se rapporte particulièrement à une composition comprenant la combinaison d’au moins une souche bactérienne de l’espèce E . faecalis (et/ou son surnageant) (i) et d’un agent anti-inflammatoire (ii) et d’au moins un excipient acceptable (iii). Ledit excipient acceptable étant préférentiellement un excipient pharmaceutiquement acceptable lorsqu’il s’agit d’un produit destiné à être utilisé comme médicament pour un usage humain ou un usage vétérinaire. La composition est alors une composition pharmaceutique comprenant une souche d’ E. faecalis et d’un agent anti-inflammatoire et d’au moins un excipient pharmaceutiquement acceptable. L’invention est ainsi particulièrement adaptée pour utiliser ladite combinaison ou ladite composition selon l’invention comme médicament. En effet, la présente invention est utile dans la prévention et/ou le traitement des maladies inflammatoires, en particulier des maladies respiratoires, plus particulièrement chroniques telles que l’allergie, l’asthme, la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO), ou la rhinite allergique. D’autres pathologies inflammatoires chroniques sont également d’intérêt telles que l’arthrite rhumatoïde ou les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), telles que la maladie de Crohn ou la colite ulcéreuse ; l’inflammation excessive secondaire provoquée par une primo-infection, par exemple bactérienne, parasitaire mais également virale telle que la grippe, la bronchiolite du nourrisson, ou les SRAS (Syndrôme Aiguë Respiratoire Sévère). D’autres caractéristiques et avantages ressortiront de la description détaillée de l’invention, des exemples et des figures qui vont suivre. Brève description des Figures représente l’effet-dose du budésonide sur les cellules BEAS-2B. Des cellules BEAS-2B ont été co-incubées avec du TNF-α (1pg/ml) seul ou avec différentes doses de Budésonide (1,5 ; 0,75 ; 0,5 ; 0,1 nM). Après 6h d’incubation, la concentration d’IL-8 a été mesurée dans le surnageant. Les niveaux d’IL-8 sont exprimés en pourcentage du taux d’IL-8 induit par une stimulation de 6h par le TNF-α. Les résultats correspondent à la moyenne + SEM d’au moins 3 expériences, n=6-12 réplicats techniques. * p représente l’effet in vitro de la combinaison E. faecalis et du budésonide sur les cellules BEAS-2B. Des cellules BEAS-2B ont été co-incubées avec du TNF-α (1pg/ml) seul ou avec une souche d’ E. faecalis (CNCM I-4969 ; I-5701 ; I-5699) MOI 10:1, et/ou 0.1nM de Budésonide, ou 0.5nM de budésonide. Après 6h d’incubation, la concentration d’IL-8 a été mesurée dans le surnageant par ELISA. Les niveaux d’IL-8 sont exprimés en pourcentage du taux d’IL-8 induit par une stimulation de 6h par le TNF-α. Les résultats correspondent à la médiane de 3 expériences, n=9 réplicats techniques. * p représente l’effet ex vivo de la combinaison E. faecalis CNCM I-4969 et du budésonide sur les explants de poumons de souris. Des explants de poumons de souris ont été mis en culture seuls avec E. faecalis (CNCM I-4969) 50 CFU, et/ou 0.1nM de Budésonide, ou 0.5nM de budésonide. Après 24h d’incubation, la concentration de différentes cytokines a été mesurée dans le surnageant par dosage multiplex à technologie Luminex. Les niveaux de cytokine sont exprimés en pourcentage du taux mesuré dans la condition milieu à 24h. Les résultats correspondent à la moyenne + SEM d’une expérience, n = 3 réplicats biologiques par condition. * p Combinaison d’au moins une souche bactérienne de l’espèce Enterococcus faecalis (i) et d’un agent anti-inflammatoire (ii) pour son utilisation comme médicament chez l’Homme ou l’animal. Combinaison selon la revendication précédente, caractérisée en ce que l’agent anti-inflammatoire est un corticostéroïde. Combinaison selon l’une des revendications précédentes, caractérisée en ce que la souche comprend une séquence du gène de l’ARNr 16S ayant au moins 99% d’identité avec la séquence SEQ ID NO :1. Combinaison selon l’une des revendications précédentes, caractérisée en ce que la souche est choisie parmi la souche déposée sous le numéro CNCM I-4969, CNCM I-5701 et CNCM I-5699 et/ou le corticostéroïde est le budésonide. Combinaison selon l’une des revendications précédentes, caractérisée en ce que la souche est vivante, morte, atténuée ou inactivée. Composition pharmaceutique comprenant la combinaison selon l’une des revendications précédentes et au moins un excipient pharmaceutiquement acceptable. Composition selon la revendication précédente, caractérisée en ce que les bactéries vivantes représentent au moins 10 3 CFU. Composition selon l’une des revendications 6 ou 7, caractérisée en ce qu’elle se présente sous forme solide, liquide ou lyophilisée. Composition selon l’une des revendications 6 à 8, pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement des maladies respiratoires et/ou les maladies inflammatoires de l’intestin et/ou l’arthrite rhumatoïde et/ou les maladies inflammatoires associées à une infection virale, parasitaire ou bactérienne. Composition selon la revendication précédente, pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement d’une maladie choisie parmi l’asthme, la bronchite, la bronchiolite, la BPCO, la fibrose pulmonaire, la rhinite. Composition selon l’une des revendications 6 à 10, caractérisée en ce que l’Homme ou l’animal est résistant aux corticostéroïdes.