Brevet FR3118414A1 — publié le 20220701

L’invention concerne une méthode d’identification de composés utiles pour le traitement d’un cancer, basée sur l’évaluation de la capacité du composé à moduler l’interaction entre la protéine AIF et la protéine CHCHD4. Méthode d’identification de composés utiles pour le traitement d'un cancer L’invention concerne une méthode d’identification de composés utiles pour le traitement d’un cancer, basée sur l’évaluation de la capacité du composé à moduler l’interaction entre la protéine AIF et la protéine CHCHD4. Arrière-plan technologique Lors du processus de cancérogénèse, le métabolisme des cellules cancéreuses est reprogrammé de manière à favoriser la croissance des cellules tumorales, améliorer leurs capacités de réparation, d’invasion et leur résistance aux traitements anticancéreux. Les mitochondries sont des acteurs majeurs du métabolisme cellulaire via, entre autres, leur capacité à produire de l’ATP, produire différents métabolites et macromolécules, produire et détoxifier les espèces réactives de l’oxygène et moduler la mort cellulaire. Pour cette raison, cibler l’activité mitochondriale afin d’affecter le métabolisme des cellules cancéreuses constitue une piste d’intérêt dans le traitement des cancers. Cependant, les mécanismes moléculaires mitochondriaux susceptibles de fournir un bénéfice thérapeutique restent encore à déterminer. Pour fonctionner, la mitochondrie doit importer entre 1500 et 2000 protéines codées par le génome nucléaire grâce à des machineries protéiques particulières. Ainsi, AIF (Apoptosis Inducing Factor) et CHCHD4 (coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4) sont deux protéines exprimées dans l’espace inter-membranaire qui une fois associées forment une machinerie d’import pour différentes protéines possédant des motifs à cystéine. L’interaction AIF/CHCHD4 a été décrite dans l’article Hangen et al. 2015 in vitro et in cellulo . Cet article démontre notamment que la fonction de la protéine AIF dans la biogenèse des complexes de la chaîne respiratoire mitochondriale est médiée par son interaction physique et fonctionnelle avec CHCHD4. Brève description des figures Titrage AIF103-613 et CHCHD4 par Alphascreen . Le titrage de la protéine CHCHD4 contre la protéine AIF103-613 par la technologie ALPHAscreen conduit à une réponse en forme de cloche appelée effet de Hook. Inhibition de l’interaction de AIF103-613/CHCHD4. La banque Prestwick constitué de 1280 composés a été criblée, au moyen d’un test Alphascreen à une concentration de 10µM. Les composés sélectionnés sont identifiés par des carrés blancs, les points noirs correspondent aux composés non sélectionnés. Le composé est sélectionné si le signal brut obtenu en présence du composé est inférieur à une valeur seuil TH (TH = moyenne (signal du contrôle négatif) – 5 * SD (signal du contrôle négatif). L’axe des Y correspond au signal normalisé, à savoir le signal calculé comme pourcentage de la moyenne. Analyse par SPR des composés identifiés par Alphascreen . (A) Validation par SPR de la thioridrazine et de la mitoxantrone au moyen du test Alphascreen comme inhibiteurs de l’interaction AIF103-613 / CHCHD4. Les composés à 10 µM ont été incubés pendant 20 min avec AIF dans du DPBS à pH 7,4 à température ambiante. Ensuite, le mélange a été injecté pendant 3 minutes à raison de 30 µL par minute sur la protéine CHCHD4. Le peptide N27 à 3 µM a servi de contrôle positif. (B) Sensorgrammes par résonance plasmonique de surface (SPR), permettant de suivre la liaison de AIF103-613 à CHCHD4 en présence de chlorhydrate de thioridazine ou de dichlorhydrate de mitoxantrone. Le chlorhydrate de thioridazine et le dichlorhydrate de mitoxantrone ont été testés à des concentrations croissantes allant de 0,5 µM à 50 µM. Composé capable d’inhiber l’interaction entre la protéine AIF et la protéine CHCHD4, pour son utilisation dans le traitement d’un cancer, dans lequel le composé est sélectionné dans le groupe constitué par : le chicago sky blue 6B, la rifapentine, la nisoldipine, la merbromine, la thiéthylpérazine ou un de ses sels tel que le dimalate de thiéthylpérazine, et la bénidipine ou un de ses sels tel que le chlorhydrate de bénidipine. Composé pour son utilisation selon la revendication 1, dans lequel le composé est sélectionné dans le groupe constitué par : chicago sky blue 6B, rifapentine, nisoldipine, merbromine, dimalate de thiéthylpérazine, et chlorhydrate de bénidipine. Composé capable d’inhiber l’interaction entre la protéine AIF et la protéine CHCHD4, ledit composé étant sélectionné dans le groupe constitué par : le chicago sky blue 6B, la rifapentine, la nisoldipine, la merbromine, la thiéthylpérazine ou un de ses sels tel que le dimalate de thiéthylpérazine, et la bénidipine ou un de ses sels tel que le chlorhydrate de bénidipine ; ledit composé étant combiné à un agent chimiothérapeutique, pour son utilisation dans le traitement d’un cancer. Composé capable d’inhiber l’interaction entre la protéine AIF et la protéine CHCHD4, ledit composé étant sélectionné dans le groupe constitué par : le chicago sky blue 6B, la rifapentine, la nisoldipine, la merbromine, la thiéthylpérazine ou un de ses sels tel que le dimalate de thiéthylpérazine, et la bénidipine ou un de ses sels tel que le chlorhydrate de bénidipine ; ledit composé étant combiné à un agent immunothérapeutique, pour son utilisation dans le traitement d’un cancer. Composé pour son utilisation selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le cancer est une tumeur maligne solide, en particulier un carcinome, un adénocarcinome, un sarcome, un mélanome, un mésothéliome, ou un blastome. Composé pour son utilisation selon l’une quelconque des revendications 1 à 4, dans lequel le cancer est un cancer des cellules sanguines, en particulier une leucémie, un lymphome ou un myélome.