Brevet FR3104905A1 — publié le 20210625

La présente invention concerne une méthode de bio-contrôle pour lutter contre la propagation de champignons ou d’oomycètes phytopathogènes sur des plantes, comprenant l’application, sur le sol et/ou sur l’appareil végétatif de plantes infectées ou susceptibles d’être infectées par des souches de champignons ou d’oomycètes endémiques pathogènes dites de type A, d’une composition comprenant un mélange d’au moins deux souches, dites de type B, de la même espèce, lesdites souches de type B étant non pathogènes pour ladite plante, sexuellement compatibles avec lesdites souches pathogènes de type A et caractérisées en ce qu’elles présentent : une reproduction sexuée, une phase sexuée initiée en mode non parasitaire, une reproduction selon un mode hétérothallique, et l’existence de formes spéciales ou populations divergentes au sein de l’espèce, capables de produire, en croisement avec les souches de type A, des descendants non pathogènes voire stériles sur ladite plante d’intérêt, et caractérisée en ce que le mélange de souches de type B non pathogènes comprend des souches de signes sexuels opposés. Méthode de bio-contrôle pour lutter contre la propagation des champignons et oomycètes phytopathogènes DOMAINE DE L'INVENTION La présente invention concerne une méthode de bio-contrôle pour lutter contre la propagation de champignons ou d’oomycètes phytopathogènes sur des plantes. ETAT DE LA TECHNIQUE Les champignons phytopathogènes sont la principale cause de maladies chez les plantes et sont responsables d'environ 70 % des maladies des plantes cultivées. Les pertes économiques dues aux maladies fongiques dans l'agriculture mondiale et le coût annuel des traitements fongicides sont par conséquent très importants. On connaît de l’état de la technique l’utilisation de fongicides ou autres alternatives par les agriculteurs pour lutter contre la prolifération des champignons et/ou oomycètes phytopathogènes sur les cultures. Dans le cas de la tavelure du pommier, due au champignon Venturia inaequalis , qui représente la principale maladie sur pommier dans le monde, une moyenne de 25 traitements fongicides sont appliqués par an en France pour lutter contre cette maladie, en vergers conduits en agriculture biologique aussi bien qu’en conventionnel ce qui représente une charge d’environ 30 millions d’euros d’achat de fongicides pour les arboriculteurs français. L’alternative la plus efficace aux pesticides est actuellement l’utilisation de variétés résistantes couplée à des méthodes culturales (prophylaxie, mélange variétal) (Didelot et al., 2016). Toutefois, la disponibilité de variétés à résistance durable (cumulant plusieurs gènes de résistance) fait défaut actuellement sur le marché. De multiples stratégies de bio-contrôle (champignons antagonistes, stimulateurs de défense des plantes, biocides d’origine naturelle, etc…) sont testées depuis plusieurs années pour lutter contre la tavelure, sans succès avéré en pratique dans les vergers. Il subsiste donc le besoin de développer de nouvelles méthodes de lutte contre la propagation des champignons ou oomycètes phytopathogènes responsables de maladies sur les cultures agricoles et arboricoles, qui soient efficaces durablement, spécifiques du champignon ou de l’oomycète phytopathogène à éradiquer, non toxiques pour l’applicateur (agriculteur), pour l’environnement et le consommateur (absence de résidus) et réduisant le nombre de passage des tracteurs dans vergers La Demanderesse a justement mis au point une nouvelle méthode de bio-contrôle répondant à ces besoins. Cette méthode permet de rompre le cycle biologique d’un champignon ou d’un oomycète phytopathogène, en croisant des souches pathogènes à des souches non-pathogènes pour produire des descendants non pathogènes voire stériles. La stratégie de bio-contrôle selon l’invention cible ainsi la phase sexuée des champignons ou des oomycètes phytopathogènes, en les contraignant à leur faire produire des descendants non pathogènes. La Demanderesse a en effet mis en évidence, dans le cas du champignon phytopathogène Venturia inaequalis, l’existence de deux formes spéciales, une forme qui infecte spécifiquement le pommier (f. sp pomi = POMI), et une autre qui infecte spécifiquement le pyracantha (f. sp pyracanthae = PYR), décrite notamment dans Le Cam et al. 2002 « Evidence of two formae speciales in Venturia inaequalis, responsible for apple and Pyracantha scab », Phytopathology 92 :314-320. Et elle a observé que le croisement de ces souches correspondant à deux formes spéciales produisait des descendants non pathogènes sur le pommier. Sachant qu’au sein d’une même espèce de champignon ou d’oomycète phytopathogène, plusieurs formes spéciales ou populations divergentes peuvent exister, la Demanderesse propose de favoriser ce type de croisements, entre des souches de deux formes spéciales –ou de populations divergentes, en introduisant massivement des souches de forme spéciale ou de population divergente non pathogène pour la plante, qui se développeront sur l’appareil végétatif contaminé par des souches résidentes ou endémiques de forme spéciale pathogène, produisant des descendants non pathogènes voire stériles, et par conséquent un effondrement de la population pathogène. Cette méthode de bio-contrôle est applicable à tout espace cultivé, que ce soit en champs ou dans les jardins. Selon un mode particulier, les descendants sont non pathogènes et en outre stériles. Cette méthode de bio-contrôle permet aux agriculteurs de limiter très fortement l’utilisation de fongicides, voire de s’en affranchir totalement après plusieurs années d’application. Cette méthode de bio-contrôle est avantageuse notamment en ce que : - il s’agit d’une nouvelle méthode de bio-contrôle chez les champignons et les oomycètes phytopathogènes; - elle est espèce spécifique, car elle cible spécifiquement le champignon ou l’oomycète phytopathogène à éradiquer ; -elle est non toxique pour l’homme et l’environnement ; - elle s’appuie sur l’utilisation de champignons ou d’oomycètes endémiques ; et - elle est durable car ne crée - a priori - pas de pression de sélection sur les populations. L’invention illustrée par le champignon phytopathogène V. inaequalis responsable de la tavelure du pommier n’est pas limitée à ce champignon phytopathogène et peut être appliquée à d’autres champignons ou des oomycètes phytopathogènes qui ont une reproduction sexuée. Un premier objet de l’invention est donc une méthode de bio-contrôle pour lutter contre la propagation de champignons ou d’oomycètes phytopathogènes sur des plantes, comprenant l’application, sur le sol et/ou sur l’appareil végétatif de plantes infectées ou susceptibles d’être infectées par des souches de champignons ou d’oomycètes endémiques pathogènes dites de type A, d’une composition comprenant un mélange d’au moins deux souches, dites de type B, de la même espèce ou d’une population divergente au sein de ladite espèce, lesdites souches de type B étant non pathogènes pour ladite plante, sexuellement compatibles avec lesdites souches pathogènes de type A et caractérisées en ce qu’elles présentent : une reproduction sexuée, une phase sexuée initiée en mode non parasitaire, une reproduction selon un mode hétérothallique, et l’existence de formes spéciales ou populations divergentes au sein de l’espèce, capables de produire, en croisement avec les souches de type A, des descendants non pathogènes voire stériles sur ladite plante d’intérêt, et caractérisée en ce que le mélange de souches de type B non pathogènes comprend des souches de signes sexuels opposés. L’invention porte également sur une composition de bio-contrôle comprenant un mélange d’au moins deux souches de type B de signes sexuels opposés d’un champignon phytopathogène ou d’oomycète non pathogène pour la plante à traiter et sexuellement compatibles en croisement avec les souches de type A de la même espèce ou apparentées mais pathogènes et endémiques de la plante à traiter. En particulier, ledit champignon phytopathogène est choisi dans le groupe constitué par : Venturia inaequalis responsable de la tavelure du pommier, Zymoseptoria tritici responsable de la septoriose du blé, Blumeria graminis responsable de l’oïdium du blé, Mycosphaerella fijiensis responsable de la cercosporiose du bananier, et Leptosphaeria maculans responsable de la nécrose du collet du colza ; et ledit oomycète est choisi dans le groupe constitué par : Plasmopara viticola responsable du mildiou de la vigne, et Phytophthora infestans responsable du mildiou de la pomme de terre et de la tomate. Selon un mode particulier et préféré, ladite composition comprend au moins un mélange de la souche V.pyra 1669 déposée à la CNCM sous le n° CNCM I-5456 et de la souche V. pyra 2507 déposée à la CNCM sous le n°CNCM I-5457. Un autre objet de l’invention est une méthode de sélection de souches de champignons phytopathogènes ou d’oomycètes de type B non pathogènes pour la plante à traiter, en particulier de souches de Venturia inaequalis, susceptibles d’être mises en œuvre dans une méthode de bio-contrôle selon l’invention pour lutter contre la propagation de souches pathogènes sur une plante d’intérêt ou une composition de bio-contrôle selon l’invention, comprenant les étapes suivantes : (1) évaluation de leur capacité intrinsèque à coloniser de manière saprophytique des feuilles de pommiers, en particulier grâce à la technique de PCR voire PCR quantitative à l’aide d’amorces spécifiques de souches PYR, (2) évaluation de leur capacité à produire des pseudothèces en présence de souches de type A, en réalisant par exemple des croisements en boite de Petri sur support de feuilles mortes autoclavées, notamment selon le protocole décrit par Le Cam et al , 2002. « Evidence of two formae speciales in Venturia inaequalis, responsible for apple and Pyracantha scab », Phytopathology 92 :314-320. Selon un autre aspect, l’invention porte également sur une méthode in vitro d’identification et sélection de souches Venturia inaequalis de type B de forme spéciale spécifique du pyracantha (f. sp pyracantha ou PYR), utilisables dans une méthode de bio-contrôle selon l’invention ou d’une composition de bio-contrôle selon l’invention pour lutter contre la propagation de souches pathogènes de V inaequalis , en particulier de souches de type A de forme spéciale f. sp pomi ou POMI, comprenant : une étape d’extraction de l’ADN des souches Venturia inaequalis ; une étape d’amplification par PCR voire par qPCR de séquences nucléiques spécifiques du génome des souches PYR, en particulier de séquences nucléiques comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec l’une des séquences SEQ ID NO :4 à SEQ ID NO :8, de préférence la séquence SEQ ID NO :5, au moyen d’amorces nucléiques spécifiques, en particulier d’une amorce directe de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO :9 et d’une amorce inverse de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 10 ; et éventuellement une étape de détection desdites séquences amplifiées au moyen de sondes, de préférence marquées par des fluorophores. L’invention porte également sur un kit de détection de souches Venturia inaequalis de type A de forme spéciale spécifique du pommier (f. sp pomi ou POMI) pour utilisation d’une méthode de bio-contrôle ciblée selon l’invention ou application d’une composition de bio-contrôle selon l’invention, comprenant une amorce directe et une amorce inverse comprenant respectivement de 12 à 30 nucléotides, de préférence 15 à 25 nucléotides, et capables d’amplifier par PCR une séquence nucléique spécifique du génome POMI, en particulier une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec l’une des séquences SEQ ID NO : 1 à SEQ ID NO :3, de préférence une amorce directe de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO :11 et une amorce inverse de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO :12. Selon un mode particulier, la présente invention porte sur un kit de détection in vitro de souches PYR de signes sexuels opposés et de souches POMI, comprenant des séquences nucléiques amorces pour amplification de séquences nucléiques spécifiques de PYR et respectivement de POMI comprenant : Un couple de séquences nucléiques amorces comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 9 (amorce directe), et une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 10 (amorce inverse), pour amplifier par PCR voire par qPCR une séquence nucléique spécifique de POMI, et éventuellement en outre des sondes spécifiques, de préférence marquées par des fluorophores pour détecter lesdites séquences amplifiées, éventuellement en outre un couple de séquences nucléiques amorces comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 11 (amorce directe) une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 12 (amorce inverse), pour amplifier par PCR voire qPCR une séquence nucléique spécifique de PYR, et éventuellement en outre des sondes spécifiques, de préférence marquées par des fluorophores pour détecter lesdites séquences amplifiées, et éventuellement en outre deux couples d’amorces respectivement mat-α constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 13 (amorce directe) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 14 (amorce inverse) et mat-HMG constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 15 (amorce directe) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 16 (amorce inverse), pour amplifier des séquences spécifiques du locus sexuel et sélectionner les souches PYR de signes sexuels opposés. DEFINITIONS Par ‘bio-contrôle’, on entend un ensemble de méthodes de protection des cultures basées sur le recours à des organismes vivants (ex : macro- ou micro-organismes) ou des substances naturelles (ex : phéromones, substances naturelles d’origine minérale, végétale ou animale). Dans le cadre de la présente invention, on utilise des souches non pathogènes de champignons ou d’oomycètes. Par ‘appareil végétatif’, on entend notamment les feuilles, les tiges et/ou les fruits. Selon un mode particulier de l’invention, la composition de bio-contrôle est appliquée sur les feuilles. Selon un mode préféré, la composition de bio-contrôle est appliquée sur les feuilles sénescentes. Par ‘champignons phytopathogènes’, on entend des espèces de champignons parasites qui provoquent des maladies cryptogamiques chez les plantes. Ces champignons appartiennent aux différents groupes du règne des eumycocètes ou « champignons vrais » : ascomycètes, basidiomycètes, chytridiomycètes, zygomycètes et deutéromycètes (champignons imparfaits). Les champignons phytopathogènes sont capables d'infecter n'importe quel tissu à n'importe quel stade de croissance de la plante, en suivant un cycle biologique complexe qui peut comporter des stades de reproduction sexuée ou asexuée. L’invention s’intéresse en particulier aux champignons phytopathogènes à reproduction sexuée. On peut citer en particulier Venturia inaequalis responsable de la tavelure du pommier, Fusicladium effusum responsable de la tavelure du pécanier, Venturia pirina responsable de la tavelure du poirier, Zymoseptoria tritici responsable de la septotriose du blé, Blumeria graminis responsable de l’oidium du blé, Mycosphaerella fijiensis responsable de la cercosporiose du bananier, et Leptosphaeria maculans responsable de la nécrose du collet du colza. Par ‘oomycètes phytopathogènes’, on entend des organismes eucaryotes filamenteux parasites qui provoquent des maladies cryptogamiques chez les plantes. On peut citer en particulier Plasmopara viticola responsable du mildiou de la vigne, et Phytophthora infestans responsable du mildiou de la pomme de terre et de la tomate. Par ‘formes spéciales’ ou ‘populations divergentes’, on entend selon l’invention l’existence, au sein d’une même espèce de champignon ou d’oomycète, des formes ou populations divergentes spécifiquement pathogènes d'une plante hôte. Dans le cas de Venturia inaequalis , il existe une forme qui infecte spécifiquement le pommier (f. sp pomi = POMI), et une autre qui infecte spécifiquement le pyracantha (f. sp pyracanthae = PYR). On parlera de souche de forme spéciale POMI pathogène pour le pommier (souche ‘de type A’ ou souche pathogène selon l’invention) et de souche de forme spéciale PYR non pathogène pour le pommier (souche ‘de type B’ ou souche non pathogène selon l’invention). Par ‘phase sexuée initiée en mode saprotrophe (ou saprophyte) ou non parasitaire’, on entend que les champignons ou oomycètes sont capables de se développer sur tissus végétaux en état de sénescence avancé voire morts, cette phase n’est donc pas parasitaire. Par ‘reproduction selon un mode hétérothallique’, on entend selon l’invention une reproduction sexuée qui ne peut se faire qu’entre souches de champignons ou oomycètes portant un signe sexuel opposé au locus du « mating type ». Ces souches de signe sexuel opposé sont dites ‘compatibles’. Par ‘mélange de souches de champignons ou d’oomycètes non pathogènes’ (‘souches de type B’ ou souches non pathogènes selon l’invention), on entend un mélange de souches de type B, compatibles en croisement (‘sexuellement compatibles’) avec les souches de champignons ou oomycètes de la même espèce mais pathogènes résidentes sur lesdites plantes (‘souches de type A’). Le mélange des différentes souches permet d’augmenter les chances d’obtenir des croisements fertiles (production de zygotes, en particulier de pseudothèces dans le cas de V. inaequalis ) avec les souches de champignons ou oomycètes pathogènes résidentes sur lesdites plantes et donc l’obtention de souches descendantes non pathogènes voire non fertiles. Le mélange peut comprendre deux souches différentes ou plus. Selon un mode particulier et préféré, le mélange comprend des souches de champignons ou d’oomycètes non pathogènes de la même espèce ou de populations divergentes sexuellement compatibles, de signes sexuels opposés. Par ‘populations divergentes’ au sein d’une espèce, on entend notamment des populations ayant suffisamment évolué de manière séparée pour avoir développé des caractéristiques biologiques intrinsèques, en particulier d’avoir une gamme d’hôte différent. Ainsi deux populations divergentes peuvent se spécialiser sur des hôtes différents. On parlera également selon l’invention d’inoculum de souches de champignons ou d’oomycètes non pathogènes, utilisé en agriculture pour l’inoculation de l’appareil végétatif des plantes à traiter ou des substrats de culture (sols et/ou milieux de culture des plantes à traiter). Par ‘compatibles en croisement’ ou ‘sexuellement compatibles’, on entend la capacité de deux souches à se croiser et à produire un zygote (un pseudothèce dans le cas de V. inaequalis ). Par ‘signes sexuels opposés’, on entend notamment que le mélange comprend des souches ‘ mat HMG ’ et respectivement ‘ mat Alpha Box ‘. Le locus mat est le locus d’identité sexuel chez les champignons qui contrôle l’identité sexuelle des cellules et leur développement. Les loci mat codent pour des facteurs de transcription Mat-HMG (pour ‘High mobility group box’) ou Mat-α (pour ‘alpha box’), qui coordonnent l’expression des gènes spécifiques du caractère sexuel. Chez les champignons hétérothalliques, le locus mat code l’une des deux séquences non alléliques (idiomorphes) qui occupe la même position génétique sur des chromosomes homologues de deux souches sexuellement compatibles, mat-HMG et mat -α (mat-alpha). La fécondation se produit exclusivement entre des souches mat-HMG et mat- α. Par ‘souches de champignons ou d’oomycètes pathogènes résidentes’, on entend des souches endémiques, présentes naturellement sur les plantes infectées (‘souches de type A’ ou souches pathogènes selon l’invention). DESCRIPTION DES FIGURES Figure 1: Sensibilité de plantes de la variété de pyracantha ‘Kazan’, connue pour sa sensibilité à la tavelure, inoculée par chacun des 38 descendants du croisement 1669 (PYR) x EUB04 (POMI) dans un essai conduit en cellule climatisée sur une durée de 27 jours. La notation de la maladie a été réalisée à 15, 20, 23 et 27 jours après inoculation des descendants. A chaque temps correspond la moyenne de notation des trois feuilles de plantes les plus sensibles. Les souches parentales utilisées comme témoin sont placées à chaque extrémité de la figure. D’autres caractéristiques, buts et avantages de l’invention ressortiront de la description qui suit, qui est purement illustrative et non limitative. DESCRIPTION DETAILLEE DE L'INVENTION Méthode de bio-contrôle Un premier objet de l’invention est donc une méthode de bio-contrôle pour lutter contre la propagation de champignons ou d’oomycètes phytopathogènes sur des plantes, comprenant l’application, sur le sol et/ou sur l’appareil végétatif de plantes infectées ou susceptibles d’être infectées par des souches de champignons ou d’oomycètes endémiques pathogènes dites de type A, d’une composition comprenant un mélange d’au moins deux souche, dites de type B, de la même espèce ou de populations divergentes au sein de l’espèce, lesdites souches de type B étant non pathogènes pour ladite plante et sexuellement compatibles avec lesdites souches pathogènes, et caractérisée en ce que le mélange de souches de type B non pathogènes comprend des souches de signes sexuels opposés. . Le croisement entre les souches pathogènes de type A et les souches non pathogènes de type B produit sur les plantes des descendants non pathogènes voire stériles. Les souches de type B sont en outre caractérisées en ce qu’elles présentent : une reproduction sexuée, une phase sexuée initiée en mode non parasitaire, une reproduction selon un mode hétérothallique, et l’existence de formes spéciales ou populations divergentes au sein de l’espèce, capables de produire, en croisement avec les souches de type A, des descendants non pathogènes voire stériles sur ladite plante d’intérêt. Selon un premier mode de réalisation, la composition de bio-contrôle est appliquée sur l’appareil végétatif desdites plantes à traiter. Selon un autre mode de réalisation, la composition de bio-contrôle est appliquée sur le sol en verger. Selon encore un autre mode, la composition de bio-contrôle est appliquée sur l’appareil végétatif et le sol desdites plantes à traiter. L’appareil végétatif peut être les feuilles, les tiges et/ou les fruits. Selon un mode particulier, la composition de bio-contrôle est appliquée sur les feuilles. Dans le cas de Venturia inaequalis en particulier, la composition de bio-contrôle est appliquée sur les feuilles en phase de sénescence voire mortes des pommiers à traiter. Selon un mode particulier, ledit champignon phytopathogène dont on cherche à éradiquer la propagation grâce à la méthode de biocontrôle selon l’invention est choisi dans le groupe constitué par : Venturia inaequalis responsable de la tavelure du pommier, Zymoseptoria tritici (= Mycosphaerella graminicola ) responsable de la septotriose du blé, Blumeria graminis responsable de l’oidium du blé, Mycosphaerella fijiensis responsable de la cercosporiose du bananier, et Leptosphaeria maculans responsable de la nécrose du collet du colza. Selon un autre mode particulier, ledit oomycète dont on cherche à éradiquer la propagation grâce à la méthode de bio-contrôle selon l’invention est choisi dans le groupe constitué par : Plasmopara viticola responsable du mildiou de la vigne, et Phytophthora infestans responsable du mildiou de la pomme de terre et de la tomate. Selon un mode particulier et préféré, ledit champignon phytopathogène dont on cherche à éradiquer la propagation grâce à la méthode de bio-contrôle selon l’invention est Venturia inaequalis responsable de la tavelure du pommier. Si l’on prend l’exemple du pommier, V. inaequalis boucle systématiquement son cycle biologique par une phase sexuée en hiver. La reproduction sexuée s’initie à l’automne où le champignon se développe en mode saprotrophe (ou non parasitaire) sur les feuilles sénescentes sur lesquelles la rencontre entre deux souches de signes sexuels opposés conduit à la production d’un zygote appelé pseudothèce. Au printemps, les ascospores (spores issues de la reproduction sexuée) expulsées à partir des pseudothèces sont responsables des contaminations primaires des pommiers. La méthode de bio-contrôle selon l’invention, appliquée à Venturia inaequalis , met ainsi en œuvre une composition appliquée sur l’appareil végétatif du pommier, en particulier les feuilles sénescentes, comprenant un mélange de souches Venturia inaequalis de type B de forme spéciale spécifique du pyracantha (f. sp pyracantha ou PYR) non pathogène pour le pommier et sexuellement compatibles avec les souches Venturia inaequalis de type A pathogène de forme spéciale spécifique du pommier (f. sp pomi ou POMI). L’application massive de souches PYR à l’automne en verger sur feuilles sénescentes conduirait ainsi à des croisements entre formes spéciales au sein de l’espèce qui vont générer des descendants non pathogènes voire stériles sur le pommier. Ainsi, en appliquant des souches PYR à l’automne, serait provoqué, au printemps suivant, un effondrement de la taille de la population pathogène (POMI). Selon un mode particulier de l’invention, la composition de bio-contrôle selon l’invention est appliquée par épandage, en particulier par pulvérisation sur l’appareil végétatif desdites plantes et/ou sur le sol en verger. La dose à appliquer dépendra des plantes à traiter et du champignon ou de l’oomycète phytopathogène à éradiquer. L’homme du métier ajustera ainsi la dose à utiliser en fonction de ces conditions. En particulier, la dose ou concentration efficace de souches de champignon ou d’oomycète de type B non pathogène pour la plante à traiter ira généralement de 500 à 600 000 spores/ml, en particulier 5 000 à 400 000 spores/ml de composition appliquée sur les plantes à traiter. Selon un mode particulier et préféré, la méthode de bio-contrôle de la propagation des souches pathogènes de V. inaequalis responsables de la tavelure du pommier, est mise en œuvre à l’automne, après la récolte des pommes et avant la chute des feuilles. Ainsi, les souches PYR sélectionnées selon l’invention comme décrit ci-après, sont inoculées à l’automne sur des feuilles de pommier échantillonnées en verger. Après incubation hivernale, le pourcentage de périthèces hybrides ainsi que la quantité de maladie engendrée par les ascospores produites sont évaluées, en les inoculant sur des pommiers en conditions contrôlées. On peut ainsi optimiser les modalités d’application desdites souches PYR en jouant sur différentes conditions, par exemple : A différentes dates selon les moments clé de la sénescence des feuilles à l’automne pour optimiser la date d’application de PYR ; Avec différents inocula de PYR (différents mélanges de PYR, chaque mélange comportant au moins une souche PYR mat-HMG et une souche PYR mat-α pour optimiser la nature de l’inoculum à appliquer ; Avec des descendants PYRxPOMI obtenus au laboratoire dont on a montré qu’ils étaient non pathogènes sur pommier et pyracantha cf Fig1, chaque mélange comportant au moins une souche mat-HMG et une souche PYR mat-α. Avec différents modes d’application pour optimiser les conditions d’applications (différentes concentrations de PYR, différentes formulations - présence de différents types d’adjuvants ou pas). L’Homme du métier sélectionne ainsi la condition qui permet d’obtenir le plus grand nombre de pseudothèces hybrides et l’absence de maladie. La méthode de bio-contrôle selon l’invention, illustrée dans les exemples décrits ci-après pour V. inaequalis est susceptible d’être transposée à d’autres champignons ou d’autres oomycètes phytopathogènes pour protéger d’autres cultures, sous réserve que lesdits champignons ou oomycètes phytopathogènes satisfassent les 4 critères suivants : une étape de reproduction sexuée, une phase sexuée initiée en mode non parasitaire, une reproduction selon un mode hétérothallique, l’existence de formes spéciales au sein de l’espèce -ou de populations divergentes sexuellement compatibles- de champignon ou d’oomycète phytopathogène, dont les croisements entre des souches de type B non pathogènes pour la plante à traiter et des souches de type A pathogènes et endémiques de la plante à traiter, produisent des descendants non pathogènes sur ladite plante, voire stériles. Composition de bio-contrôle On parle indifféremment dans la description de ‘composition de bio-contrôle’ ou ‘préparation de bio-contrôle’ selon l’invention. La présente invention porte ainsi également sur une composition de bio-contrôle comprenant au moins un mélange de souches de type B de signes sexuels opposés d’un champignon phytopathogène ou d’oomycète non pathogène pour la plante à traiter et sexuellement compatibles en croisement avec les souches de type A de la même espèce ou apparentées mais pathogènes et endémiques de la plante à traiter. Ainsi, lesdites souches de type B présentent des formes spéciales au sein de l’espèce ou des populations divergentes sexuellement compatibles, non pathogènes pour la plante mais compatibles en croisement avec les souches de type A de la même espèce mais pathogènes pour la plante, permettant la production de descendants non pathogènes pour ladite plante, voire stériles Selon un mode particulier, ladite composition de bio-contrôle comprend au moins un mélange de souches de Venturia inaequalis de type B de la forme spéciale (spécifique du) pyracantha (f. sp pyracantha ou PYR) non pathogène pour le pommier et sexuellement compatibles avec les souches de Venturia inaequalis de type A pathogène de la forme spéciale spécifique du pommier (f. sp pomi ou POMI). Des exemples de telles souches PYR utilisables dans la méthode de bio-contrôle ou la composition de bio-contrôle selon l’invention sont décrites ci-après. De préférence, ladite composition comprend un mélange de la souche V.pyra 1669 déposée à la CNCM sous le n° CNCM I-5456 et de la souche V. pyra 2507 déposée à la CNCM sous le n°CNCM I-5457. Ces deux souches de champignons filamenteux ont été déposées, aux termes du Traité de Budapest, le 21 Novembre 2019 à la Collection Nationale Des Cultures de micro-organismes (CNCM) de l’Institut Pasteur, 25 rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15), au nom de l’Institut national de la recherche agronomique - I.N.R.A, 147 rue de l'université, 75338 Paris Cedex 07. Selon un mode particulier et préféré, la composition de bio-contrôle selon l’invention comprend un mélange de souches de signes sexuels opposés d’un champignon phytopathogène ou d’oomycète de type B non pathogène pour la plante à traiter, en particulier un mélange de souches PYR de signes sexuels opposés, en une concentration allant de 500 à 600 000 spores/ml, en particulier 5000 à 400 000 spores/ml. La composition de bio-contrôle peut comprendre en outre des adjuvants classiquement utilisés dans la formulation de produits de bio-contrôle. Ces adjuvants peuvent notamment être choisis dans le groupe constitué par des agents mouillants, des agents adhésifs, des rétenteurs d’eau, des émulsifiants, et leurs mélanges. Ces adjuvants permettent de faciliter l’homogénéisation de la composition, l’adhésion des souches à l’appareil végétatif, la résistance des souches au lessivage, voire à leur germination. Selon un mode particulier, la composition contiendra au moins 2 souches PYR de signes sexuels opposés et non pathogènes pour le pommier, de concentration finale comprise entre 5 000 à 500 000 spores par millilitre (ml), en particulier 5 000 à 300 000 spores/ml de composition de bio-contrôle, et éventuellement un ou plusieurs adjuvants choisis parmi des agents mouillants, des agents adhésifs, des rétenteurs d’eau, des émulsifiants, et leurs mélanges. On peut citer comme exemple d’agents mouillants, un mélange d’ester méthylique et dioctyl sulfoccinate ou d’alkylglucoside ester citrate, des huiles végétales ou minérales estérifiées. Comme agent adhésif, on peut citer la carboxy methylcellulose. Comme agent rétenteur d’eau, on peut citer par exemple la gomme de guar. A titre d’exemple d’agent émulsifiant, on peut citer les dérivés de sorbitol. L’homme du métier adaptera le choix des adjuvants et leurs teneurs dans la composition de bio-contrôle, en fonction notamment des plantes à traiter et des modes d’application. Selon un mode particulier, la composition de bio-contrôle est appliquée par épandage, en particulier par pulvérisation sur lesdites plantes, et notamment par pulvérisation sur l’appareil végétatif desdites plantes et/ou sur le sol en verger. Selon un mode préféré, la composition de bio-contrôle sera appliquée à l’aide d’atomiseur, appareil classiquement utilisé en arboriculture qui permet une excellente dispersion des préparations sur l’ensemble du couvert végétal. Sélection de souches de champignon ou d’oomycètes utilisables comme souches non pathogènes de type B dans la méthode ou la composition de bio-contrôle selon l’invention Cette méthode de sélection selon l’invention, de souches de champignon ou d’oomycète phytopathogène de type B, qui soient non pathogènes pour la plante à traiter mais sexuellement compatibles en croisement avec des souches de type A de la même espèce mais pathogènes et endémiques pour la plante à traiter, comprend une étape de pré-sélection des souches caractérisées par : une étape de reproduction sexuée une phase sexuée initiée en mode non parasitaire, une reproduction selon un mode hétérothallique, et l’existence de formes spéciales au sein de l’espèce ou populations divergentes sexuellement compatibles, dont les croisements avec des souches pathogènes de la même espèce (souches ‘de type A’) produisent des descendants non pathogènes voire stériles sur ladite plante d’intérêt. On parlera de souches de champignon ou d’oomycète au sein d’une même espèce de champignon ou d’oomycète (ex : Venturia inaequalis), mais de forme spéciale spécifique d’une plante (ex : pommier ou respectivement pyracantha), les souches de type B et les souches de type A de la même espèce de champignon ou d’oomycète ayant des formes spéciales respectivement pour le pyracantha et pour le pommier. Méthode de sélection de souches d’intérêt et analyse de la descendance (Méthode 1) Selon une première méthode, on sélectionne des souches d’intérêt non pathogènes pour le pommier par croisement avec des souches pathogènes pour le pommier, observation des croisements fertiles (production de pseudothèces), analyse de la descendance non pathogène et sélection de descendants PYRxPOMI non pathogènes sur pommier et pyracantha. Cette sélection peut se faire par croisement entre des souches PYR et des souches POMI et observation des croisements fertiles (production de pseudothèces). Les souches PYR utilisables dans la méthode ou la composition de bio-contrôle selon l’invention, sont sélectionnées à partir de souches PYR isolées à partir de feuilles de Pyracantha infectées par V. inaequalis et nommées souches ‘PYR’ ou issues de collections de souches accessibles à la communauté scientifique. On peut citer par exemple les souches PYR listées dans le tableau 1 suivant : ID Nom Espèce Pays Année Population Hôte Référence 186 Vina_186_pyr V. inaequalis Irelande 1987 PYR Pyracantha 'Red Colum' Le Cam et al. 2002 Le Cam et al., 2019 1381 Vina-1381_pyr V. inaequalis France 1998 PYR Pyracantha Le Cam et al. 2002 1383 Vina-1383_pyr V. inaequalis France 1998 PYR Pyracantha Le Cam et al. 2002 1388 Vina-1388_pyr V. inaequalis France 1998 PYR Pyracantha Le Cam et al. 2002 1669 Vina_1669_pyr V. inaequalis USA, KY 2001 PYR Pyracantha Gladieux et al. 2010a ; Le Cam et al., 2019 2266 Vina_2266_pyr V. inaequalis France 1993 PYR Pyracantha 'Mohave' Gladieux et al. 2010a ; Le Cam et al., 2019 2269 Vina_2269_pyr V. inaequalis Suède 2003 PYR Pyracantha Gladieux et al. 2010a ; Le Cam et al., 2019 2507 Vina_2507_pyr V. inaequalis Chili 2004 PYR Pyracantha coccinea Gladieux et al. 2010a ; Le Cam et al., 2019 Selon un mode particulier de l’invention, on citera la souche Vina_1669_pyr autrement nommée V. pyra 1669 déposée à la CNCM sous le n° CNCM I-5456, la souche Vina_2507_pyr autrement nommée V.pyra 2507 déposée à la CNCM sous le n°CNCM I-5457, et leur mélange. Parmi les souches PYR disponibles, les souches PYR utilisées selon la méthode de bio-contrôle ou la composition de l’invention sont sélectionnées selon deux critères : la croissance saprotrophe (non parasitaire) sur la litière foliaire de pommier, et l’aptitude à la reproduction sexuée avec des souches POMI. Ainsi, selon un mode particulier, on sélectionne des souches PYR de Venturia inaequalis non pathogènes pour le pommier (souches dites ‘de type B’), mais sexuellement compatibles avec des souches POMI de Venturia inaequalis pathogènes pour le pommier (souches de type A’), susceptibles d’être mises en œuvre dans une méthode de bio-contrôle selon l’invention ou une composition de bio-contrôle selon l’invention. Lesdites souches PYR sont sélectionnées selon les étapes suivantes : Aptitude desdites souches PYR à la multiplication in vitro et à produire des spores, par exemple sur milieu gélosé avec ou sans dépôt d’une feuille de cellophane, Aptitude intrinsèque desdites souches PYR à coloniser des feuilles de pommier sous la forme saprophyte, en inoculant des feuilles sans tavelure non traitées par des fongicides avec des souches PYR (souche par souche) et en évaluant la colonisation de chaque souche, par exemple par PCR, voire par qPCR (quantitative PCR), Aptitude desdites souches PYR à la reproduction sexuée avec des souches POMI, notamment par la réalisation de croisement et par comptage du nombre de pseudothèces produits, Aptitude desdites souches PYR à la reproduction sexuée en situation de compétition entre des souches POMI et les souches à tester, notamment par la réalisation de mélanges de souches mat-HMG et mat- α et évaluation du nombre de pseudothèces et du pourcentage de pseudothèces hybrides, par exemple par PCR voire par qPCR ; Aptitude desdites souches PYR à produire des descendants non pathogènes résultant des croisements entre souches POMI et les souches à tester, notamment par isolement des ascospores produites et phénotypage des descendants sur des plantes greffées de pommier ou semis de pommiers en conditions contrôlées. Outre le typage du signe sexuel, l’aptitude des souches PYR à la multiplication in vitro (étape a)) est notamment réalisée comme suit : Cinétique de développement mycélien in vitro (sur milieu gélosé ou en milieu liquide) Evaluation de la sporulation in vitro (sur feuilles de cellophane posées sur une boite de Petri). L’aptitude intrinsèque des souches à coloniser des feuilles de pommier sous la forme saprophyte (étape b)) est notamment réalisée comme suit : Récolte de feuilles de verger sans tavelure non traitées par des fongicides, Inoculation des feuilles avec les souches PYR (souche par souche), Incubation en conditions contrôlées et en cage grillagées à l’extérieur (conditions climatiques automnales), et Evaluation de la colonisation de chaque souche par PCR voire qPCR. L’évaluation des souches PYR pour leur aptitude à la reproduction sexuée avec des souches POMI (étape c)) peut être réalisée comme suit : Réalisation de croisements entre chaque souche PYR et des souches POMI (mélanges de souches mat-HMG ou mélanges de souches mat– α selon le signe sexuel de la souche PYR) Comparaison du nombre de pseudothèces produits par les différentes souches PYR par méthode de comptage automatique des pseudothèces à partir de prise d’images. Les souches POMI sont issues de souches POMI isolées à partir de feuilles de pommier infectées par V. inaequalis et nommées souches ‘POMI’ ou issues de collections de souches accessibles à la communauté scientifique. On peut citer par exemple les souches POMI listées dans le tableau 2 suivant. Le génome de l’ensemble de ces souches a été publié (Le Cam et al., 2019) : ID Nom Espèce Pays Année Population Hôte Reference 104 Vina_104_domEU V. inaequalis France 1978 domEU Malus x domestica 'Golden' Bénaouf and Parisi 2000 301 Vina_301_domEU V. inaequalis Allemagne 1988 domEU Malus x domestica '81/19-53' Bénaouf and Parisi 2000 2492 Vina_2492_domEU V. inaequalis France 2003 domEU Malus x domestica 'Judor' Lemaire et al., 2016 2498 Vina_2498_domEU V. inaequalis Suède 2005 domEU Malus x domestica 'Gala' Gladieux et al. 2008 2499 Vina_2499_domEU V. inaequalis Espagne 2005 domEU Malus x domestica 'Golden' Gladieux et al. 2008 EUB04 Vina_EUB04_domEU V. inaequalis Belgique 1998 domEU Malus x domestica 'Golden' Parisi et al., 2004 1286 Vina_1286_RVI6 V. inaequalis France 1996 domRvi6 Malus x domestica 'Judeline' Guérin et al. 2007 1680 Vina_1680_RVI6 V. inaequalis France 2001 domRvi6 Malus x domestica 'Judeline' Caffier et al., 2015 2199 Vina_2199_RVI6 V. inaequalis Danemark 2003 domRvi6 Malus x domestica 'Florina' Caffier et al., 2015 EU-NL24 Vina_EUNL24_RVI6 V. inaequalis Pays bas 1998 domRvi6 Malus x domestica 'Prima' Parisi et al., 2004 Dans un second temps, l’aptitude à la reproduction sexuée en situation de compétition entre des souches POMI et PYR (étape d)) est évaluée, par exemple selon le protocole suivant : - Production d’une souche PYR GFP pour suivre l’installation du champignon dans la feuille de pommier en comparaison d’une souche POMI GFP, par microscopie à fluorescence, ou avantageusement par PCR voire par qPCR (quantitative PCR) spécifique à chaque forme spéciale pour évaluer la biomasse relative de chaque souche. - Réalisation de croisements différents impliquant chacun 4 souches en mélange (1 souche PYR mat-HMG , 1 souche PYR mat- α, 1 souche POMI mat-HMG , 1 souche POMI mat -α ) - Evaluation du nombre de pseudothèces et du pourcentage de pseudothèces hybrides par PCR. Enfin, le caractère non pathogène des descendants de croisements entre PYR et POMI (étape e)) peut être analysé sur un grand nombre de souches afin de documenter la probabilité de générer des descendants potentiellement pathogènes sur pommier, notamment par : Isolement des ascospores produites lors des croisements entre souches PYR et de souches POMI (50 ascospores par isolées par croisement), Phénotypage des descendants sur des plantes greffées de pommier en chambre climatique à 18°C pendant 21 jours en conditions contrôlées selon le protocole décrit par Le Van et al., 2012 Evolutionary applications) Ont ainsi été sélectionnées les souches PYR dont on a montré la capacité à se croiser avec des souches POMI et à permettre l’obtention d’une descendance non pathogène sur le pommier. Selon un mode particulier, on utilisera dans la méthode ou la composition de bio-contrôle de l’invention la souche PYR 1669 (Vina_1669_pyr). Selon un autre mode particulier et préféré, on utilise une souche V.pyra 1669 déposée à la CNCM sous le n° CNCM I-5456, une souche V. pyra 2507 déposée à la CNCM sous le n°CNCM I-5457, et de préférence un mélange de ces deux souches, de signes sexuels opposés. Les caractéristiques des souches V.pyra 1669 et V.pyra 2507 sont présentées dans le tableau 1. Selon un mode particulier de l’invention, les souches PYR sont cultivées à 18°C sur des membranes de cellophane disposées sur des boites de Petri contenant un milieu Agar PDA-YE (PotatoDextrose Agar, BD Difco) supplémenté à 0.3% en extrait de levure (Sigma-Aldrich) avec une alternance jour/nuit 12h/12h. Elles sont stockées à la fois sous azote liquide et à -20°C sur des membranes de cellophanes déshydratées dans la collection Venturia de l’Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS - INRA, Beaucouzé, France). Et l’on sélectionne les descendants PYRxPOMI obtenus au laboratoire dont on a montré qu’ils étaient non pathogènes sur pommier et pyracantha cf Fig1, chaque mélange comportant au moins une souche mat-HMG et une souche PYR mat-α. Méthode de sélection de souches d’intérêt non pathogènes pour le pommier par analyse PCR (Méthode 2 alternative à la méthode 1) Avantageusement et alternativement à la première méthode décrite ci-dessus, la sélection des souches PYR aptes à se croiser avec des souches POMI peut se faire par amplification spécifique de l’allèle au locus mat , par PCR. Ainsi un autre objet de l’invention est une méthode de sélection de souches de champignons phytopathogènes ou d’oomycètes de type B non pathogènes pour la plante à traiter, en particulier de souches de Venturia inaequalis, susceptibles d’être mises en œuvre dans une méthode de bio-contrôle selon l’invention pour lutter contre la propagation de souches pathogènes sur une plante d’intérêt ou une composition de bio-contrôle selon l’invention, comprenant les étapes suivantes : (1) évaluation de leur capacité intrinsèque à coloniser de manière saprophytique des feuilles de pommiers, en particulier grâce à la technique de PCR quantitative à l’aide d’amorces spécifiques de souches PYR, (2) évaluation de leur capacité à produire des pseudothèces en présence de souches de type A, en réalisant par exemple des croisements en boite de Petri sur support de feuilles mortes autoclavées, notamment selon le protocole décrit par Le Cam et al , 2002. « Evidence of two formae speciales in Venturia inaequalis, responsible for apple and Pyracantha scab », Phytopathology 92 :314-320. Selon une première étape, on sélectionne les souches PYR au sein de souches de V. inaequalis. Les souches PYR et POMI sont spécifiques de leurs hôtes. L’hôte d’isolement (Pommier ou Pyracantha) permet donc de préciser s’il s’agit d’une souche PYR ou POMI. Le Demandeur a identifié des séquences nucléotidiques spécifiques de chaque forme spéciale permettant de distinguer les souches PYR et les souches POMI. En particulier, il a identifié des séquences nucléiques spécifiques à POMI, non présentes chez PYR, illustrées dans le tableau suivant par les séquences SEQ ID NO : 1 à SEQ ID NO : 3, et respectivement des séquences nucléiques spécifiques à PYR, non présentes à POMI, illustrées dans le tableau suivant par les séquences SEQ ID NO : 4 à SEQ ID NO : 8. Les séquences nucléiques sont référencées dans les tableaux 3 et 4 suivants : Séquences nucléiques spécifiques respectivement à POMI ou à PYR SEQ ID NO Référence Genbank Organisme source Taille (nombre de nucléotides) SEQ ID NO : 1 Vina_EUB04.g9008 V. inaequalis sf sp pomi EUB04 625 SEQ ID NO : 2 Vina_EUB04.g12572 V. inaequalis sf sp pomi EUB04 363 SEQ ID NO : 3 Vina_EUB04.g13513 V. inaequalis sf sp pomi EUB04 419 SEQ ID NO : 4 Vina_1669.g9937 V. inaequalis sf sp pyracanthae 1669 477 SEQ ID NO : 5 Vina_1669.g9936 V. inaequalis sf sp pyracanthae 1669 191 SEQ ID NO : 6 Vina_1669.g7519 V. inaequalis sf sp pyracanthae 1669 1995 SEQ ID NO : 7 Vina_1669.g3689 V. inaequalis sf sp pyracanthae 1669 222 SEQ ID NO : 8 Vina_1669.g3422 V. inaequalis sf sp pyracanthae 1669 1239 L’homme du métier pourra ainsi définir des amorces PCR spécifiques permettant d’amplifier un fragment spécifique de POMI, ou respectivement un fragment spécifique de PYR. Selon un mode particulier et préféré, on utilisera des amorces POMI définies à partir d’une séquence identique ou présentant au moins 90% voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO :1 du gène g9008. Les amorces comprennent généralement de 12 à 30 nucléotides, en particulier de 15 à 25 nucléotides. Selon un mode particulier et préféré, on utilisera des amorces PYR définies à partir d’une séquence présentant 100% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 5 du gène Vina_1669.g9936_fragment. De telles amorces sont présentées dans le tableau 4 : Amorces pour PCR SEQ ID NO Amorce Organisme source Taille (nombre de nucléotides) SEQ ID NO : 9 sp Pomi- F V. inaequalis sf sp pomi EUB04 20 SEQ ID NO : 10 sp Pomi- R V. inaequalis sf sp pomi EUB04 20 SEQ ID NO : 11 sp Pyr- F V. inaequalis sf sp pyracanthae 1669 19 SEQ ID NO : 12 sp Pyr- R V. inaequalis sf sp pyracanthae 1669 20 SEQ ID NO : 13 mat-α-F V. inaequalis sf sp pomi MNH120 20 SEQ ID NO : 14 mat-α-R V. inaequalis sf sp pomi MNH120 20 SEQ ID NO : 15 mat-HMG-F V. inaequalis sf sp pomi 1639 20 SEQ ID NO : 16 mat-HMG-R V. inaequalis sf sp pomi 1639 20 Les pourcentages d’identité auxquels il est fait référence dans le cadre de l’exposé de la présente invention sont déterminés après alignement optimal des séquences à comparer, qui peuvent donc comprendre une ou plusieurs additions, délétions, troncatures et/ou substitutions. Ce pourcentage d’identité peut être calculé par toute méthode d’analyse de séquences bien connue de l’homme du métier. Le pourcentage d’identité peut être déterminé après alignement global des séquences à comparer prises dans leur intégralité, sur toute leur longueur. Outre manuellement, il est possible de déterminer l’alignement global de séquences au moyen de l’algorithme de Needleman et Wunsch (1970). Pour les séquences nucléotidiques, la comparaison des séquences peut être effectuée à l’aide de tout logiciel bien connu de l’homme du métier, comme par exemple le logiciel Needle. Les paramètres utilisés peuvent notamment être les suivants : « Gap Open » égal à 10,0, « Gap Extend » égal à 0,5 et la matrice EDNAFULL (Version EMBOSS du NCBI NUC4.4). De préférence, le pourcentage d’identité défini dans le cadre de la présente invention est déterminé au moyen d’un alignement global des séquences à comparer sur toute leur longueur. Des amorces PCR peuvent ainsi être définies à partir desdites séquences, permettant d’amplifier spécifiquement chacune des formes spéciales, pour une utilisation dans un outil d’identification ou de détection. Selon un mode particulier, on utilisera les amorces suivantes : Amorces spécifiques POMI (Vina_EUB04.g9008_spPomi, taille attendue de l’amplicon = 163 pb) sp Pomi- F Amorce directe GTTATGTCTGGCCGCGTTAT (SEQ ID NO:9) sp Pomi- R Amorce inverse AGAAAAGCTGGCACCTCGTA (SEQ ID NO:10) Amorces spécifiques PYR (Vina_1669.g9936_spPyr, taille attendue de l’amplicon = 157 pb) sp Pyr- F Amorce directe CAAGCGAGCTGAAATCGAG (SEQ ID NO:11) sp Pyr- R Amorce inverse GTACAACCCGATCCCTTTTG (SEQ ID NO:12) Selon un mode particulier, la méthode de détection de souches PYR ou de souches POMI au sein de souches V inaequalis comprend les étapes suivantes : extraction de l’ADN des souches V. inaequalis dénaturation dudit ADN extrait utilisation d’amorces sens (directe) et antisens (inverse) d’amplification de séquences nucléiques spécifiques de POMI telles qu’une séquence comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec l’une des séquences SEQ ID NO :1 à SEQ ID NO :3 ou un fragment de celles-ci, ou d‘amplification de séquences nucléiques spécifiques de PYR telles qu’une séquence comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec l’une des séquences SEQ ID NO :4 à SEQ ID NO :8 ou un fragment de celles-ci, et optionnellement utilisation de sondes spécifiques, avantageusement marquées par des fluorophores pour détecter lesdites séquences nucléiques amplifiées ou fragments de celles-ci, permettant de catégoriser les souches POMI et les souches PYR. Par ‘fragment de séquence nucléique’, on entend un fragment comprenant de 8 à 30 nucléotides, en particulier de 15 à 25 nucléotides. L’invention porte encore sur une méthode in vitro de sélection de souches Venturia inaequalis de type B de forme spéciale spécifique du pyracantha (f. sp pyracantha ou PYR), utilisables dans une méthode de bio-contrôle selon l’invention ou d’une composition de bio-contrôle selon l’invention pour lutter contre la propagation de souches pathogènes de V. inaequalis , en particulier de souches de type A de forme spéciale f. sp pomi ou POMI, comprenant : une étape d’extraction de l’ADN des souches Venturia inaequalis ; une étape d’amplification par PCR voire qPCR de séquences nucléiques spécifiques du génome des souches PYR, en particulier de séquences nucléiques comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec l’une des séquences SEQ ID NO :4 à SEQ ID NO :8, de préférence la séquence SEQ ID NO :5, au moyen d’amorces nucléiques spécifiques, en particulier d’une amorce directe de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO :9 et d’une amorce inverse de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 10 ; et optionnellement une étape de détection desdites séquences amplifiées au moyen de sondes, de préférence marquées par des fluorophores. L’extraction des acides nucléiques à partir d’un échantillon biologique peut se faire par les méthodes classiques connues de l’homme du métier, telles que décrites dans Maniatis T. et al . (Edition 1999). Par «dénaturation d'acide nucléique», on entend l'étape dans laquelle les brins complémentaires d'acide nucléique sont dissociés. Les molécules d'acide nucléique double brin sont formées par association non covalente à travers des liaisons hydrogène entre des nucléotides complémentaires, la dénaturation de l'acide nucléique se produit par la rupture desdites liaisons hydrogène. L'homme du métier déterminera facilement les conditions d'induction de dénaturation et de renaturation. Dans un procédé selon l'invention, l'induction de la dénaturation de molécules d'acide nucléique double brin peut être obtenue par n'importe quel procédé soumettant des acides nucléiques à tout agent physique ou chimique capable de déstabiliser les liaisons hydrogène, comme une température élevée. La dénaturation de l'acide nucléique est réversible, lorsque la dénaturation a été induite en élevant la température, une étape de refroidissement en température permet la renaturation, dans laquelle les brins complémentaires se réassemblent avec formation de liaisons hydrogène. Selon un mode particulier, on utilise une amorce directe comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence nucléique SEQ ID NO :9 et une amorce inverse comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence nucléique SEQ ID NO :10 pour amplifier des fragments de séquences nucléiques spécifiques de POMI. Selon un mode particulier, on utilise une amorce directe comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence nucléique SEQ ID NO :11 et une amorce inverse comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence nucléique SEQ ID NO :12 pour amplifier des fragments de séquences nucléiques spécifiques de PYR. Selon un mode particulier de réalisation, les conditions d’amplification de locus spécifique à la forme POMI et à la forme PYR sont les suivantes : 2mn de dénaturation de l’ADN de V. inaequalis à 95°C suivi de 35 cycles comprenant 30 secondes à 95°C, de 30 secondes à 60°C de 30 secondes à 72°C suivi d’une phase d’extension finale à 72°C pendant 5mn. On peut ainsi développer un outil de détection (ou d’identification) permettant de détecter des souches PYR par rapport à des souches POMI, en utilisant les séquences spécifiques de la forme spéciale PYR parmi celles décrites ci-dessus, et parmi les souches PYR, sélectionner, comme décrit ci-dessous, des souches PYR de signes sexuels opposés qui pourront être mises en œuvre dans une méthode ou une composition de bio-contrôle selon l’invention. Ainsi, selon une seconde étape de la méthode, on sélectionne les souches PYR de signes sexuels opposés. Le signe sexuel de chaque souche PYR peut être identifié grâce à une amplification spécifique de l’allèle au locus du « mating type » (« type sexuel) autrement nommé locus mat par PCR. On peut notamment utiliser les couples d’amorces ci-dessous, permettant de distinguer les deux signes sexuels (Mat Alpha et Mat HMB, autrement nommés mat -α (−) et mat-HMG (+)) dont les séquences entières sont référencées dans Genbank sous les numéros d’accession MG818328.1 et MG818329.1 respectivement. Amorces spécifiques Mat Alpha mat-alpha-F Amorce directe 5’CACCTCTTTCCAGCAGAAGG 3’ (SEQ ID NO: 13) mat-alpha-R Amorce inverse 5’ CGATTCGCAGGAACTTGTCA3’ (SEQ ID NO: 14) Amorces spécifiques Mat HMG Mat-HMG-F Amorce directe 5’CCCCTCTGACTCTGAACAGC 3’ (SEQ ID NO: 15) Mat-HMG-R Amorce inverse 5’ TGTCGAAATCGTCAATCTGC3’ (SEQ ID NO: 16) Selon un mode particulier de réalisation, les conditions d’amplification du locus de type sexuel sont les suivantes : 2mn de dénaturation de l’ADN de V. inaequalis à 95°C suivi de 35 cycles comprenant 45 secondes à 95°C, de 45 secondes à 60°C de 45 secondes à 72°C suivi d’une phase d’extension finale à 72°C pendant 5mn. La méthode de bio-contrôle selon l’invention peut ainsi comprendre, en amont, et pour s’assurer de son efficacité ciblée sur les souches POMI pathogènes endémiques du pommier, les étapes suivantes : Détection de la présence de souches POMI sur l’appareil végétatif du pommier, en particulier par PCR, comprenant l’utilisation de séquences nucléiques comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec l’une des séquences nucléiques SEQ ID NO : 1 à SEQ ID NO : 3 ou des fragments de celles-ci, en particulier l’utilisation de séquences nucléiques amorces comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 9 (amorce directe), une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 10 (amorce inverse), et leur mélange ; Sélection de souches PYR, en particulier par PCR voire qPCR, comprenant l’utilisation de séquences nucléiques comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec l’une des séquences nucléiques SEQ ID NO : 4 à SEQ ID NO : 8 ou fragments de celles-ci, en particulier l’utilisation de séquences nucléiques amorces comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 11 (amorce directe), une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 12 (amorce inverse), et leur mélange ; Sélection, parmi les souches PYR sélectionnées à l’étape b), de souches PYR de signes sexuels opposés, en particulier par PCR voire qPCR, comprenant l’utilisation de couples d’amorces respectivement un couple d’amorces mat-alpha-F et mat-alpha-R constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 13 (amorce directe, mat-α-F) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 14 (amorce inverse, mat-α-R ) et un couple mat-HMG-F et mat-HMG-R constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 15 (amorce directe, mat-HMG-F) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 16 (amorce inverse, mat-HMG-R), et Croisement des souches PYR sélectionnées à l’étape c) et des souches POMI identifiées à l’étape a), pour vérifier l’obtention d’une descendance non pathogène voire stérile. Les souches PYR résultant des étapes de sélection b), c) et d) peuvent ensuite être utilisées, de préférence en mélange constitué d’au moins deux souches PYR de signes sexuels opposés, dans une méthode de bio-contrôle ou une composition de bio-contrôle selon l’invention. La présente invention porte également sur un kit de détection (ou identification) in vitro de souches PYR de signes sexuels opposés et de souches POMI, comprenant des séquences nucléiques amorces pour amplification par PCR ou qPCR de séquences nucléiques spécifiques de PYR et respectivement de POMI comprenant : Un couple de séquences nucléiques amorces comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 9 (amorce directe sp Pomi-F ), et une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 10 (amorce inverse sp Pomi-R ), pour amplifier par PCR ou qPCR une séquence nucléique spécifique de POMI, et éventuellement des sondes spécifiques, de préférence marquées par des fluorophores, pour détecter lesdites séquences amplifiées, Eventuellement en outre un couple de séquences nucléiques amorces comprenant une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 11 (amorce directe sp Pyr-F ) une séquence identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 12 (amorce inverse sp Pyr-R ), pour amplifier par PCR ou qPCR une séquence nucléique spécifique de PYR, et éventuellement des sondes spécifiques, de préférence marquées par des fluorophores pour détecter lesdites séquences amplifiées, et Eventuellement en outre deux couples d’amorces respectivement mat-alpa constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 13 (amorce directe mat-alpha-F ) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 14 (amorce inverse mat-alpha-R ) et mat-HMG constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 15 (amorce directe mat-HMG-F ) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90%, voire au moins 95% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 16 (amorce inverse mat-HMG-F ), pour amplifier des séquences spécifiques du locus sexuel et sélectionner les souches PYR de signes sexuels opposés. Les différents couples d’amorces peuvent être présents dans un même kit de détection in vitro ou des kits séparés. La présente invention va être illustrée par les exemples non limitatifs suivants. EXEMPLES Exemple 1 : Croisement et obtention d’une descendance non pathogène Un croisement a été réalisé entre la souche PYR 1669 et la souche POMI EUB04. Ce croisement fertile a permis de générer des ascospores qui ont été mis en culture et stockés à -20°C. Les croisements entre les souches PYR et les souches POMI se réalisent en déposant du mycélium ou une concentration de spores (150 000 spores/ml) de chacune des souches, préalablement mélangé sur un support inerte, de type portion de feuilles de pommier stérilisées placées dans une boite de Pétri contenant un milieu gélosé. Après dépôt du matériel fongique, les supports inertes (ronds ou carrés de feuilles) sont incubés pendant 21 jours à 17°C dans l’obscurité puis placés à 8°C pendant 140 jours. Les pseudothèces obtenus sont alors écrasés libérant ainsi les ascospores qui sont alors dispersées dans de l’eau sur boite de Petri contenant un mélange de Malt agar. Après 48h d’incubation à 18°C, les ascospores germées sont isolées individuellement sous microscope optique puis mises en culture à 18°C en boite de Petri sur un milieu gélosé. Dans le cas présent, le pouvoir pathogène de 38 descendants d’une descendance, obtenus par croisement entre la souche PYR 1669 et la souche POMI EUB04 a été évalué sur le cultivar de pommier ‘Gala’ d’une part et sur le cultivar de pyracantha ‘Kazan’, connu pour sa sensibilité à la tavelure d’autre part selon le protocole décrit par Le Cam et al. 2002. Les plantes ont été inoculées par une suspension de spores de chaque descendant à une concentration de 150 000 spores/ml puis placées à 17°C dans une chambre climatique. Les plantes (pommier et pyracantha) ont ensuite été notées pour la présence de maladie à différentes reprises (15, 20 23, et 27 jours après l’inoculation). 27 jours après inoculation, aucun des 38 descendants du croisement ne s’est avéré pathogène sur la variété de pommier ‘Gala’, 35 se sont avérés pathogènes sur la variété de pyracantha ‘Kazan’ avec des niveaux d’agressivité variables (Figure 1) et enfin 3 descendants se sont avérés non pathogènes à la fois sur pommier ‘Gala’ et sur Pyracantha ‘Kazan’. Exemple 2 : Sélection de souches PYR par PCR Pour la sélection de souches PYR utilisables dans une méthode de bio-contrôle selon l’invention, on peut utiliser les amorces suivantes : Amorces spécifiques POMI (Vina_EUB04.g9008_spPomi, taille attendue de l’amplicon = 163 pb) sp Pomi- F, Amorce directe GTTATGTCTGGCCGCGTTAT (SEQ ID NO:9) sp Pomi- R, Amorce inverse AGAAAAGCTGGCACCTCGTA (SEQ ID NO:10) Amorces spécifiques PYR (Vina_1669.g9936_spPyr, taille attendue de l’amplicon = 157 pb) sp Pyr- RAmorce directe CAAGCGAGCTGAAATCGAG (SEQ ID NO:11) sp Pyr- FAmorce inverse GTACAACCCGATCCCTTTTG (SEQ ID NO:12) La sélection de souches PYR ou de souches POMI au sein de souches V inaequalis comprend les étapes suivantes : extraction de l’ADN des souches V. inaequalis dénaturation dudit ADN extrait utilisation d’amorces sens (directe) et antisens (indirecte) telles que décrites ci-dessus d’amplification par PCR ou qPCR de séquences nucléiques spécifiques de POMI telles que les séquences SEQ ID NO :1 à SEQ ID NO :3 ou de fragments de celles-ci, ou d‘amplification par PCR ou qPCR de séquences nucléiques spécifiques de PYR telles que les séquences SEQ ID NO :4 à SEQ ID NO :8 ou de fragments de celles-ci, et et éventuellement utilisation de sondes spécifiques, avantageusement marquées par des fluorophores pour détecter lesdites séquences nucléiques amplifiées ou fragments de celles-ci, permettant de catégoriser les souches POMI et les souches PYR. Les conditions d’amplification de locus spécifique à la forme POMI et à la forme PYR sont les suivantes : 2mn de dénaturation de l’ADN de V. inaequalis à 95°C suivi de 35 cycles comprenant 30 secondes à 95°C, de 30 secondes à 60°C de 30 secondes à 72°C suivi d’une phase d’extension finale à 72°C pendant 5mn. Les souches PYR ainsi sélectionnées peuvent être utilisées dans des croisements et obtentions d’une descendance pathogène selon l’exemple 1 décrit ci-dessus. Exemple 3 : Composition de bio-contrôle A titre d’exemple, une composition de bio-contrôle selon l’invention contient 2 souches PYR 1669 et PYR 2507 de signes sexuels opposés mat-HMG et mat-α +, de concentration finale comprise entre 500 et 600 000 spores par ml de composition. Cette composition comprend en outre avantageusement des adjuvants de type mouillant, émulsifiant, rétenteur d’eau et adhésif facilitant l’homogénéisation de la solution, l’adhésion des particules PYR au couvert végétal voire leur germination. REFERENCES Didelot F, Caffier V, Orain G, Lemarquand A, and Parisi L. 2016.Sustainable management of scab control through the integration of apple resistant cultivars in a low-fungicide input system. Agriculture ecosystems & environment 217, 41-48 Gladieux P, Caffier V, Devaux M, Le Cam B. 2010. Host-specific differentiation among populations of Venturia inaequalis causing scab on apple, pyracantha and loquat. Fungal Genetics and Biology . doi:10.1016/j.fgb.2009.12.007. Le Cam et al. 2002 « Evidence of two formae speciales in Venturia inaequalis, responsible for apple and Pyracantha scab », Phytopathology 92 :314-320 Le Cam B, Sargent D, Gouzy J, Amselem J, Bellanger MN, Bouchez O, Brown S, Caffier V, De Gracia M, Debuchy R, Duvaux L, Payen T, Sannier M, Shiller J, Collemare J, Lemaire C., 2019. Population Genome Sequencing of the Scab Fungal, Species Venturia inaequalis, Venturia pirina, Venturia aucupariae and Venturia asperata G3, 9: 2405-2414 Lê Van A., Gladieux P., Lemaire C., Cornille A., Giraud T., Durel C.E., Caffier V., Le Cam B. (2012). Evolution of pathogenicity traits in the apple scab fungal pathogen in response to the domestication of its host. Evolutionary Applications 5, 694-704 doi:10.1111/j.1752-4571.2012.00246. Méthode de bio-contrôle pour lutter contre la propagation de champignons ou d’oomycètes phytopathogènes sur des plantes, comprenant l’application, sur le sol et/ou l’appareil végétatif de plantes infectées ou susceptibles d’être infectées par des souches de champignons ou d’oomycètes endémiques pathogènes dites de type A, d’une composition comprenant un mélange d’au moins deux souches, dites de type B, de la même espèce ou d’une population divergente au sein de ladite espèce, lesdites souches de type B étant non pathogènes pour ladite plante, sexuellement compatibles avec lesdites souches pathogènes de type A et caractérisées en ce qu’elles présentent : une reproduction sexuée, une phase sexuée initiée en mode non parasitaire, une reproduction selon un mode hétérothallique, et l’existence de formes spéciales ou populations divergentes au sein de l’espèce, capables de produire, en croisement avec les souches de type A, des descendants non pathogènes voire stériles sur ladite plante d’intérêt, et caractérisée en ce que le mélange de souches de type B non pathogènes comprend des souches de signes sexuels opposés. Méthode de bio-contrôle selon la revendication 1, caractérisée en ce que : ledit champignon phytopathogène est choisi dans le groupe constitué par : Venturia inaequalis responsable de la tavelure du pommier, Zymoseptoria tritici responsable de la septotriose du blé, Blumeria graminis responsable de l’oidium du blé, Mycosphaerella fijiensis responsable de la cercosporiose du bananier, et Leptosphaeria maculans responsable de la nécrose du collet du colza ; ou ledit oomycète est choisi dans le groupe constitué par : Plasmopara viticola responsable du mildiou de la vigne, et Phytophthora infestans responsable du mildiou de la pomme de terre et de la tomate. Méthode de bio-contrôle selon la revendication 2, caractérisée en ce que ledit champignon phytopathogène est Venturia inaequalis responsable de la tavelure du pommier. Méthode de bio-contrôle selon la revendication 3, caractérisée en ce que la composition appliquée sur l’appareil végétatif du pommier, en particulier les feuilles sénescentes, comprend un mélange d’au moins deux souches de Venturia inaequalis de type B de la forme spéciale spécifique du pyracantha (f. sp pyracantha ou PYR) et de signes sexuels opposés. Méthode de bio-contrôle selon la revendication 4, caractérisée en ce que les deux souches de Venturia inaequalis de type B de la forme spéciale spécifique du pyracantha (f. sp pyracantha ou PYR) et de signes sexuels opposés, sont sélectionnées selon une méthode in vitro comprenant : une étape d’extraction de l’ADN des souches Venturia inaequalis ; une étape d’amplification par PCR voire qPCR de séquences nucléiques spécifiques du génome des souches PYR, en particulier de séquences nucléiques comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec l’une des séquences SEQ ID NO :4 à SEQ ID NO :8, de préférence la séquence SEQ ID NO :5, au moyen d’amorces nucléiques spécifiques, en particulier d’une amorce directe de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec la séquence SEQ ID NO :9 (amorce directe sp Pyr-F ) et d’une amorce inverse de séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 10 (amorce inverse sp Pyr-R ) ; une étape d’amplification par PCR voire qPCR de séquences spécifiques du locus sexuel, comprenant l’utilisation d’un couple d’amorces mat-alpha constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 13 (amorce directe mat-alpha-F ) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 14 (amorce inverse mat-alpha-R ) et d’un couple d’amorces mat-HMG constitué par les séquences comprenant une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec la séquence SEQ ID NO : 15 (amorce directe mat-HMG-F ) et une séquence nucléique identique ou présentant au moins 90% d’identité avec la séquence la séquence SEQ ID NO : 16 (amorce inverse mat-HMG-R ), et éventuellement une étape de détection desdites séquences amplifiées au moyen de sondes, de préférence marquées par des fluorophores Méthode de bio-contrôle selon l’une quelconque des revendications 1 à 5, caractérisée en ce que la composition est appliquée par épandage, en particulier par pulvérisation sur l’appareil végétatif desdites plantes et/ou sur le sol en verger. Composition de bio-contrôle comprenant un mélange d’au moins deux souches Venturia inaequalis de type B de la forme spéciale pyracantha (f. sp pyracantha ou PYR), en particulier un mélange de la souche V.pyra 1669 déposée à la CNCM sous le n° CNCM I-5456 et de la souche V. pyra 2507 déposée à la CNCM sous le n°CNCM I-5457. Composition de bio-contrôle selon la revendication 7 , caractérisée en que le mélange de souches est présent en une concentration allant de 5 00 à 600 000 spores/ml, en particulier 5000 à 400000 spores/ml de composition.