Brevet FR3097560A1 — publié le 20201225

Description Titre de l'invention : Méthode de diagnostic d'une exposition chronique à la pollution [0001] La présente invention concerne le diagnostic d'expositions chroniques d'un sujet, en particulier de la peau d'un sujet, à la pollution. [0002] Certains milieux urbains sont régulièrement soumis à des pics de pollution. L'individu dans son environnement quotidien et particulièrement en zone urbaine, peut être soumis à de multiples agressions au niveau des matières kératiniques, et notamment la peau, par différents polluants aériens. [0003] Parmi les polluants connus, on citera en premier lieu les gaz d'échappement devenus un enjeu majeur dans les grandes villes, les métaux lourds mais aussi les particules fines contenant des hydrocarbures aromatiques polycycliques tels que benzo-a-pyrène ou benzoanthracène. [0004] Ces polluants vont notamment entraîner au niveau dc la peau, le dépôt de particules à la surface de l'épiderme, et entre autres conséquences, induire un vieillissement prématuré de la peau marqué par la présence de rides et/ou ridules, de macules étendues, de lentigo simplex, de rougeurs et/ou d'un aspect terne et/ou hétérogène du teint, mais aussi des imperfections au niveau de la peau et de son teint. [0005] Il est donc important de pouvoir mettre en évidence une exposition chronique à la pollution. [0006] Il existe donc un besoin important de méthodes de diagnostic de dégradations es- thétiques de la peau, en particulier liées à la pollution. [0007] La présente invention répond à cc besoin. [0008] La présente invention résulte dc la découverte inattendue par les inventeurs que l'abondance relative de certaines espèces bactériennes dans des échantillons de peau d'individus corrélaient avec l'exposition à certains polluants, en particulier certains PAHs, mise en évidence par la détection de ces polluants dans des échantillons dc cheveux des sujets étudiés. [0009] La présente invention a ainsi pour objet une méthode, en particulier in vitro, dc diagnostic d'une exposition chronique d'un sujet, en particulier de la peau d'un sujet, à la pollution, comprenant une étape (a) de détermination, dans un échantillon de peau du sujet, en particulier un échantillon de la surface de la peau du sujet, du niveau d'au moins un marqueur choisi dans le groupe constitué des bactéries des espèces Corynebacterium lipophiloflavum, Corynebacteritun durum, Corvnebacterium propinquum, Kytococcus sedentarius, Brevibacterium sp., Haemophihts parairtfluenzae, Actinomyces oris, Neisseria sp., Abiotrophia defectiva, Alicycliphilus sp., Micrococcus 2 luteus, Caulobacter 5p.. Streptococc s mitis/oralis/pneumoniae et Staphylococc epidermidis. Description détaillée de l'invention [0010] Marqueur [0011] Le marqueur utilisé dans le cadre de l'invention est choisi dans le groupe constitué des bactéries des espèces Corynebacterium lipophiloflaywn, Corynebacterium durum, Corynebacterium propinquum, Kytococcus sedentarius, Brevibacterium sp., Hatmophilus parainfluenzae, Actinontyces tais, Neisseria sp., Abiotrophia defectiva, Alicycliphilus sp., Micrococcus luteus, Caulobacter sp., Streptococcus mitis/oralis/ pneumoniae et Staphylococcus epidennidis. [0012] Par « bactéries de l'espèce Corynebacterium lipophiloflavutn », on entend ici des bactéries à Gram positif du genre Corynebacteriutn dont la souche type est la souche DSM44291 décrite dans Funkc et al. (1997) ELMS Microbiot Lett. 150 :219-224. [0013] Par « bactéries de l'espèce Corynebacterium durian », on entend ici des bactéries à Gram positif du genre Corynebacterium dont la souche type est la souche DSM45333 décrite dans Riegel et aL (1997) Int L Syst Bacteriol. 47 :1107-1111. [0014] Par « bactéries de l'espèce Corynebacterium propinquutn », on entend ici entend ici des bactéries à Gram positif du genre Corynebacterium dont la souche type est la souche DSM44285 décrite dans Ricgel et al. (1993) FEUS Microbiot Leu. 113 :229-234. [0015] Par « bactéries de l'espèce Kywcoccu.9 sedentarius », on entend ici des bactéries à Gram positif du genre Kyurcoccus, précédemment appelées Micrococcus sedetztarius, dont la souche type est la souche DSM20547 décrite dans Stackebrandt et al. (1995) J. Syst. Bacteriot 45:682-692. [0016] Par « bactéries de l'espèce Brevibacteritan sp. », on entend ici des bactéries à Gram positif de l'ordre des Actinomycctalies, dont l'espèce type est Brevibacterium linens. [0017] Par « bactéries de l'espèce Haetnophilus parainfluetrae », on entend ici des bactéries commensales du genre Haemophilus dont la souche type est la souche DSM8978 décrite dans Rivers (1922) Johns Hopkins Hospital Bulletin33 :429-431. [0018] Par « bactéries de l'espèce Actitwmyces oris », on entend ici des bactéries à Gram positif du genre Actinomyces dont la souche type est la souche ATCC27044 décrite dans Henssge et aL (2009) Int. J. Syst. Evol. Microbiol.59 :509-516. [0019] Par REVENDICATIONSMéthode de diagnostic d'une exposition chronique d'un sujet, en particulier dc la peau d'un sujet, à la pollution, comprenant une étape (a) dc détermination, dans un échantillon de peau du sujet, du niveau d'au moins un marqueur choisi dans le groupe constitué des bactéries des espèces Cor ynebacteHum lipophilqflavwn. Corynebacterium clarain, Corynebacterium propinquutn, Kytococcus sedentarius, Brevibacterium sp., Haemophilus parainfluenzae, Actinomyces o ris, Neisseria Abiotrophia defectiva, Alicycliphilus sp., Micrococcus luteus, Catilobacter sp., Streptococcus mitis/oralis/pneumoniae et Staphylococcus epidermidis. Méthode de diagnostic selon la revendication 1, dans laquelle ledit au moins un marqueur est choisi dans le groupe constitué des bactéries des espèces Corynebacterium lipophileavam, Corynebacterium clarain, Kytococcus sedentarius, Brevibacterium sp., Haemophilus parainfluenzae, Actinomyces oris, Neisseria sp., Abiotrophia defectiva, Alicycliphilas sp., Micrococcus luteus, Caulobacter sp. et Streptococcus mitis kralis/pneamoniae. Méthode de diagnostic selon la revendication 1, dans laquelle ledit au moins un marqueur est choisi dans le groupe constitué des bactéries des espèces Corynebacterium propinquum et Staphylococcus epidermidis. Méthode de diagnostic selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, la méthode comprenant en outre les étapes consistant à : a. comparer le niveau dudit au moins un marqueur mesuré à l'étape (a) avec un contrôle, et b. sur la base de la comparaison de l'étape (b), déterminer si le sujet, en particulier la peau du sujet, a subi une exposition chronique à la pollution. [Revendication 5] Méthode dc diagnostic selon la revendication 4, dans laquelle ledit au moins un marqueur est choisi dans le groupe constitué des bactéries des espèces Corynebacterium lipophiloflavum, Corynebacterium durian, Kytocoecus sedentarius, Brevibacterium sp., Haemophilus pantinfluenzae, Actinomyces cuis, Neisseria sp., Abiotrophia dclectiva, Alleycliphilus sp., Micrococeus luteus, Caulobaeter sp. et Streptococcus mitis loralis/pneumoniae, et le sujet est diagnostiqué comme ayant subi une 25 [Revendication 6] [Revendication 7] [Revendication 8] [Revendication 9] exposition chronique à la pollution si le niveau dudit au moins un marqueur mesuré à l'étape (a) est supérieur à un contrôle. Méthode de diagnostic selon la revendication 4, dans laquelle ledit au moins un marqueur est choisi dans le groupe constitué des bactéries des espèces Corynebactentim propinquInn et Staphylococcus epidennidis, et le sujet est diagnostiqué comme ayant subi une exposition chronique à la pollution si le niveau dudit au moins un marqueur mesuré à l'étape (a) est inférieur à un contrôle. Méthode de diagnostic selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, dans laquelle le niveau dudit au moins un marqueur est déterminé par séquençage métagénomique. Méthode de diagnostic selon l'une quelconque des revendications 1 à 7, dans laquelle l'échantillon de peau est un échantillon de peau de joue ou de cuir chevelu. Méthode de diagnostic selon l'une quelconque des revendications 1 à 8, dans laquelle la pollution est une pollution aux hydrocarbures polycycliques aromatiques (PAHs).