Brevet FR3034317A1 — publié le 20161007

COMPOSITION POUR LE TRAITEMENT D'UN ETAT METABOLIQUE PATHOGENE DU MICROBIOTE INTESTINAL ET DES MALADIES DERIVEES La présente invention concerne l'utilisation d'une composition comme médicament ou produit de nutrition médicale pour le traitement d'un état métabolique pathogène du microbiote intestinal provoqué par une dysbiose pathologique d'origine métabolique et/ou pour la prévention et le traitement de maladies dérivées de cet état pathogène. Le microbiote est un ensemble de microorganismes (bactéries, archaéas, virus et eucaryotes) qui sont spécifiques à chacun des individus. Ces microorganismes se trouvent sur la peau, dans la bouche et le plus grand nombre dans le système digestif qui compte pour 1012 cellules par gramme et comme il existe 1.5 à 2 kg de microbiote, la présence d'espèces différentes se comptent par millions soit de 3.3 à 8 millions selon les experts, et la totalité des microorganismes en milliards. Ce microbiote contient plus de cent cinquante fois de gènes que le génome de l'hôte. Les microorganismes du microbiote intestinal sont classés par domaine (par exemple bactéries), phylum (par exemple Firmicutes), classe (par exemple Clostridia), ordre (par exemple Clostridiales), famille (par exemple Christensenellaceae), genre (par exemple Christensenella) et espèce (par exemple Christensenella minuta). Chaque individu a son propre microbiote qui provient de son histoire et de ses racines. Toutefois dans une cohorte, 75% des espèces se retrouvent dans 50% de la cohorte et 57% dans 90% de la cohorte. De plus 85% des espèces sont communes entre l'Europe, les USA et le Japon. Le microbiote intestinal n'est pas homogène. Pour un même individu il varie en quantité et qualité depuis l'estomac (101 avec lactobacillus, vellonella, helicobacter) au duodénum, jéjunum, iléum (103 à 107 avec bacilli, streptococcaceae, actinobacteria, actinomycinaeae, corynebacteriaeae) et enfin le colon (1012 avec lachnospiraceae, bactériodetes). Certaines bactéries (clostridium, lactobacillus, enterococcus) sont également trouvées dans le mucus qui tapisse la paroi intestinale. Les grands phyla sont relativement stables chez un individu et les différences se situent au niveau des espèces soit souvent quelques pourcents du 3034317 2 microbiote total. Ainsi les états pathogènes sont difficiles à déceler car provenant de ces espèces particulières. Les anomalies de l'hôte (génétique et environnementales) se retrouvent dans une flore déséquilibrée pathogène appelée dysbiose pathogène ; le seuil de déséquilibre est difficile à 5 fixer, de même que les variations des genres et espèces sauf s'il existe un biomarqueur de l'anomalie ou de la maladie. Depuis quelques années, on sait que le microbiote intestinal n'est pas uniquement impliqué dans la digestion et la transformation de la nourriture en énergie, mais qu'il joue un rôle majeur dans le maintien de la bonne santé et dans l'apparition de plusieurs maladies. Des 10 récentes recherches laissent penser que le comportement du cerveau, le système entéro- endocrinien ou neurovégétatif ou encore les dégénérescences sont pilotés par le microbiote. On sait également que le microbiote intestinal est un régulateur majeur de l'immunité et participe intensément à la régulation de l'expression génique de l'hôte. A travers la dysbiose, c'est-à-dire un changement dans la composition du microbiote, le 15 microbiote peut être associé à des désordres métaboliques pathologiques dérivés tels que le diabète de type 2 ou bien les maladies cardiovasculaires. Par ailleurs, certaines composantes du microbiote ont été associées à d'autres maladies comme les maladies dégénératives, intestinales et certains cancers. Le microbiote intestinal est également en corrélation directe avec le poids de l'hôte. Le 20 surpoids avec comorbidités et l'obésité, qui se définissent par un indice de masse corporelle (IMC) de 25 à 29,9 pour le surpoids et supérieur à 30 pour l'obésité, sont en effet associés à une dysbiose pathologique d'origine métabolique du microbiote intestinal. Le surpoids avec des comorbidités, l'obésité et les maladies métaboliques au sens large, créent des ravages dans nos sociétés modernes que ce soit dans les pays à développement 25 avancé, dans les pays émergents ou même les pays en voie de développement. La recherche des raisons de cette épidémie a pris une importance cruciale afin de ne pas connaître une chute de l'espérance de vie dans les 25 prochaines années et surtout pour éviter un élargissement de la plage de fin de vie en mauvaise santé et dépendance. Les causes fondamentales de la prise de poids sont un déséquilibre de la prise alimentaire en particulier de lipides saturés, de fructose et d'hydrates de carbone associés ou non à une sédentarité importante par rapport aux prises alimentaires, c'est-à-dire par rapport à la quantité d'énergie. Toutefois, chacun n'est pas égal devant la même prise alimentaire. Il 3034317 3 existe en effet des différences en particulier au niveau de l'absorption et du stockage de l'énergie sous forme de gras, et ces différences sont en lien avec l'état pathogène du microbiote intestinal. En cas de surpoids et d'obésité, on a pu constater que : 5 - la richesse et diversité du microbiote diminue - certaines familles, genres et espèces pathogènes prennent le pas sur d'autres - le microbiote pathogène a la capacité d'extraire plus d'énergie des aliments même de fibres non digestibles. En outre, chez les personnes en surpoids et obèses, une restriction calorique avec un 10 rééquilibrage alimentaire augmente la richesse totale de la flore par la perte de masse grasse mais il existe une différence de résultats du régime selon la richesse de la flore de départ. Pour les microbiotes pauvres au départ, les résultats sont inférieurs, en particulier sur la diminution de l'inflammation et de l'insulinorésistance. Par ailleurs, l'analyse du microbiote de personnes minces ou même anorexiques par rapport 15 aux obèses a établi une corrélation avec certains microorganismes. Une corrélation entre les phyla et le surpoids/obésité a été recherchée, et une relation a été trouvée entre les 2 plus grandes phyla : le rapport relatif Firmicutes sur Bactériodetes augmenterait avec l'IMC et l'effet sur la perte de poids se traduirait par la diminution de ce rapport (Damms-machado a 2015, Pekkala s 2015, Remely m 2015, eslinger aj 2014, 20 Bervoets I 2013, Fava f 2013), mais ce constat a été aussi infirmé par des résultats démontrant le contraire (Rahat-Rozenbloom, 2014 Xu P2012, Sefcikova Z 2010). On sait que la composition du microbiote d'un individu est relativement homogène dans le temps au niveau des phyla (sauf incidents passagers comme un traitement antibiotique) mais que les genres peuvent varier, et on sait également qu'entre plusieurs individus, les 25 phyla varient en fonction de l'âge, de la géolocalisation, de l'ethnie, du mode de vie, etc. Il est donc impossible d'établir un microbiote standard de bonne santé, mais il est possible de rechercher quels sont les genres et espèces qui marquent un état sans ou avec pathologie. Certains entérotypes avec assemblage de relations positives ou négatives ont été déterminés. En particulier trois entérotypes dominent dans le monde selon la primauté du 30 phylum le plus important : bactériodetes, provotella et ruminococcus, mais aucune corrélation directe n'a pu être établie entre ces entérotypes et les maladies métaboliques. 3034317 4 Pour la constitution du microbiote jusqu'en 2012, il était admis que le microbiote se construisait par l'influence externe et qu'il était entièrement acquis de 0 à 3 ans par l'environnement et la diète. Dans une étude de novembre 2014, une équipe internationale dirigée par Ruth Ley (Cornell University NY) a publié sous la direction de Julia Goodrich un 5 article (« Human genetic shape the gut microbiome » Cell november 6, 159 789-799) qui infirme le concept unique de l'acquisition en introduisant pour quelques familles, genres et espèces la notion d'héritabilité ; elle a fait cette constatation en étudiant une cohorte de vrais et faux jumeaux et des personnes témoins. Les souches du microbiote intestinal démontrées comme héritables sont : 10 - des familles de bactéries dans les Firmicutes : lachanospiraceae, ruminococcaceae et christensenellaceae, - une archéa dans les Méthanogènes: M. smithii. La famille des Christensenellaceae est la famille la plus transmissible. Elle comprend en particulier le genre Christensenella et notamment l'espèce Christensanella minuta qui a été 15 définie et cultivée récemment par Masami Morotomi à Tokyo décrite dans son étude « Description of christensenella minuta gen. nov.sp.nov. isolated from human faeces, which forms a distinct branch in the other clostridiales, and proposai of christensenellaceae » (M Morotomi 2012 inter. Jour. Of systematic and evolution microbiology 62 144-149). Chez l'enfant, à la naissance, la richesse de Christensenellaceae est de 20% dans le 20 méconium contre 8.6% pour la mère. Cette proportion baisse relativement ensuite (pour être environ de 5 %) par l'augmentation rapide des autres phyla en particulier celles qui vont devenir prépondérantes comme Firmicutes, Bactériodetes, Protéobacteria et Actinobacteria avec l'introduction des aliments (par exemple le gras animal ou les protéines) et l'environnement). 25 La présence de Christensenella est associée à un IMC bas ainsi qu'à un état de « bonne santé». Plus la quantité relative de Christensenella est importante, plus l'hôte a tendance à être maigre et en bonne santé. Christensenella deviendrait, par la faiblesse de sa présence relative, le biomarqueur de la dysbiose pathogène, état pathologique métabolique conduisant en particulier au surpoids avec comorbidités, à l'obésité et à des maladies 30 métaboliques. La famille des christensenellaceae est le chef de file d'un « consortium » composé des familles suivantes classées par ordre d'importance décroissante dans l'action métabolique : 3034317 5 deholobacteriaceoe (firmicutes), clostridiales non classées, ténericutes genres non classés ML615J-28 et RF39, méthanobacteriaceoe (euryarchaeota), firmicutes genre non classé SHA98, peptococcaceoe, verrucomicrobiaceae. La famille des Christensenellaceoe est souvent liée positivement à l'abondance de 5 Méthogènes qui est elle-même corrélée à la production de butyrate et propionate, mais Christensenella n'a pas besoin de cette liaison pour s'exprimer dans le métabolisme car elle contribue directement au phénotype de l'hôte à qui elle est associée. Julia Goodrich (« Human genetic shope the gut microbiome » Cell november 6, 159 789-799) a continué son observation chez les souris germ-free ensemencées par du microbiote 10 d'obèse en 2 groupes dont un seul reçoit une implantation de Christensenella, cette présence occasionne une prise de poids inférieure de 30%. Le genre Christensenella est donc reconnu comme marqueur de la maigreur lorsqu'il est présent en quantité suffisante dans le microbiote intestinale. D'autre part, il est le marqueur du surpoids et de l'obésité lorsqu'il est présent en faible quantité dans le microbiote 15 intestinal. L'augmentation relative de Christensenella est le garant d'une baisse de poids en particulier sur la masse maigre et le moteur d'une amélioration métabolique. Par ailleurs, ces bactéries Christensenella seraient impliquées dans d'autres maladies métaboliques comme le diabète, les maladies cardiaques et vasculaires, l'athérosclérose, les maladies dégénératives osseuses, les maladies neurodégénératives, les cancers liés au 20 métabolisme, les maladies auto-immunes et les stéatoses et stéatohépatites métaboliques. Actuellement, il existe un besoin pour un produit capable d'agir sur le microbiote intestinal pour pouvoir être utilisé pour le traitement du microbiote pathogène et par conséquent pour la prévention et le traitement de maladies métaboliques dérivées, tels que le surpoids avec comorbidités, l'obésité, etc. 25 Pour y répondre, la présente invention propose d'utiliser une composition capable d'augmenter la quantité relative de Christensenella dans le microbiote intestinal. A cet effet, l'invention vise l'utilisation d'une composition comprenant un mélange de principes actifs constitué par au moins : - un hydrolysat de lactosérum de poids moléculaire compris entre 200 et 10 000 30 daltons, - un isolat et/ou un concentrat de lactosérum, et - du caséinate de calcium, 3034317 6 pour son utilisation comme médicament ou produit de nutrition médicale chez l'homme pour le traitement d'un état pathologique du microbiote, à savoir d'une dysbiose pathologique métabolique caractérisée par une baisse de Christensenella dans le microbiote intestinal. La composition peut être utilisée également pour la prévention ou le traitement 5 d'au moins une maladie métabolique dérivée, en particulier d'une maladie métabolique marquée par une déficience en Christensenella dans le microbiote intestinal, notamment une maladie métabolique marquée par une déficience en Christensenella dans le microbiote intestinal choisie parmi le surpoids avec comorbidités, l'obésité, le diabète, les maladies cardiaques et vasculaires, l'athérosclérose, les maladies dégénératives osseuses, les 10 maladies neurodégénératives, les cancers liés au métabolisme, les maladies auto-immunes, la stéatose, la stéatohépatite métabolique et les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin. La composition traite le microbiote pathologique en particulier en augmentant relativement dans l'intestin le genre bactérien Christensenella (phylum Firmicutes, classe Clos tridia, ordre Clostridiales, famille Christensenellaceae, genre Christensenella). 15 Avantageusement, une telle composition est capable d'augmenter relativement la quantité de Christensenella dans le microbiote intestinal afin de combattre une pathogénèse métabolique. Elle peut ainsi être utilisée comme médicament ou produit de nutrition médicale pour rééquilibrer le microbiote intestinal par l'augmentation du genre Christensenella et pour prévenir et lutter contre les maladies découlant de ce déséquilibre 20 pathologique du microbiote intestinal. L'invention est à présent décrite en détails, la description du dispositif étant établie en regard des dessins annexés, dessins sur lesquels les différentes figures montrent : Figure 1 : un schéma des résultats du tableau 1 relatifs à l'abondance relative en Christensenella, 25 Figure 2 : un tableau en codes à barre, réalisé par E. Prifti, des résultats obtenus sur l'étude réalisée sur le microbiote intestinal de patients traités avec un placebo et de patients traités selon l'invention. L'invention a donc pour objet une composition comprenant un mélange de principes actifs constitué par au moins : 30 - un hydrolysat de lactosérum de poids moléculaire compris entre 200 et 10 000 daltons, - un isolat et/ou un concentrat de lactosérum, et 3034317 7 - du caséinate de calcium, pour son utilisation comme médicament ou produit de nutrition médicale chez l'homme pour le traitement d'une dysbiose pathologique caractérisée par une déficience en Christensenella dans le microbiote intestinal et/ou pour la prévention ou le traitement d'au 5 moins une maladie métabolique dérivée de cet état pathologique du microbiote intestinal choisie parmi le surpoids avec comorbidités, l'obésité, le diabète, les maladies cardiaques et vasculaires, l'athérosclérose, les maladies dégénératives osseuses, les maladies neurodégénératives, les cancers liés au métabolisme, les maladies auto-immunes, la stéatose, la stéatohépatite métabolique, et les maladies inflammatoires chroniques de 10 l'intestin. La composition agit par l'augmentation relative dans l'intestin du genre bactérien Christensenella. La composition est connue, mais de façon surprenante et inattendue, elle agit sur le microbiote et en particulier elle est capable d'augmenter Christensenella. 15 Par «déficience » en Christensenella dans le microbiote intestinal, au sens de l'invention on entend un niveau de Christensenella dans le microbiote intestinal représentant moins de 0.01% du total des genres bactériens décelés dans le microbiote d'un individu donné (recueilli dans les selles, l'abondance étant mesurée de préférence par un test de séquençage Fish, ou de qPCR ou de méta analyse). 20 Par « Christensenella » on entend les bactéries du phylum Firmicutes, de la classe Clostridia, de l'ordre Clostridiales, de la famille Christensenellaceoe, et du genre Christensenella. Par « composition de nutrition médicale » ou « produit de nutrition médicale » ou « medical food » ou denrées alimentaires destinées à des fins médicales spéciales (DADFMS) ou Aliments diététiques destinés à des fins médicales spéciales (ADDFMS), au sens de 25 l'invention, on entend un aliment à vocation thérapeutique de prévention ou de traitement, utilisé seul ou associé à d'autres thérapies. Il s'agit d'un composé nutritionnel, répondant à une situation clinique particulière, susceptible de constituer l'alimentation exclusive ou partielle des patients auxquelles elle est destinée. Par « concentrat de lactosérum » au sens de l'invention on entend un extrait de lactosérum 30 obtenu par concentration d'un lactosérum. Par « dysbiose pathologique » au sens de l'invention on entend un état pathologique caractérisé par un déséquilibre dans la répartition des bactéries du microbiote intestinal au 3034317 8 niveau des phyla, classes, ordres, familles, genres ou espèces, conduisant à un risque d'autres maladies dont l'origine est d'ordre métabolique. Par « hydrolysat de lactosérum » au sens de l'invention on entend toute molécule ou mélange de molécules obtenu(e) par un procédé comprenant une étape d'hydrolyse 5 chimique ou d'hydrolyse enzymatique de lactosérum. Par « isolat de lactosérum » au sens de l'invention on entend un extrait de lactosérum qui contient moins de 1% de lactose et de matières grasses. Par « médicament » au sens de l'invention on entend un produit ayant obtenu une autorisation de mise sur le marché comme produit de traitement d'une maladie. 10 Par « microbiote » au sens de l'invention on entend le microbiote intestinal. L'hydrolysat de lactosérum de la composition selon l'invention a un poids moléculaire compris entre 200 et 10 000 Daltons, préférentiellement entre 200 et 3500 Daltons. Il est essentiellement composé de di et tri peptides. De façon préférée, il s'agit d'un hydrolysat peptidique de lactosérum comprenant au moins 15 90% de peptides en poids de matière sèche de l'hydrolysat. L'isolat et/ou le concentrat de lactosérum ont préférentiellement un poids moléculaire compris entre 15 000 et 20 000 Daltons. L'isolat de lactosérum est préférentiellement fabriqué à partir de lait frais et de fromageries qui ne pasteurisent pas le lait pour éviter la destruction des bêta-lactoglobuline et alpha- 20 lactalbumine, et qui extraient le lactosérum par ultrafiltration ou microfiltration (taille des filtres de 0,1p.m). L'isolat obtenu par échange d'ions est moins adapté en raison de sa faible teneur en bêta-lactoglobuline et alpha-lactalbumine. L'isolat contient moins de 1% de lactose et de matières grasses, et sa concentration en peptides est préférentiellement d'au moins 90% en poids de matière sèche. 25 Le concentrat de lactosérum est préférentiellement obtenu à partir d'un lactosérum de fromagerie sans pasteurisation, contenant des bêta-lactoglobuline, des alpha-lactalbumine et des glycomacropetides. La concentration en peptides du concentrat est préférentiellement d'au moins 80% en poids de matière sèche. Par ailleurs, le caséinate de calcium utilisé dans la composition selon l'invention a 30 préférentiellement un poids moléculaire compris entre 20 000 et 35 000 daltons. 3034317 9 De façon préférée, le ratio en poids entre le caséinate de calcium et le mélange constitué par l'hydrolysat et l'isolat et/ou le concentrat de lactosérum est de 0,8 à 1,2 dans la composition. Selon un mode de réalisation particulièrement adapté, le mélange de principes actifs de la 5 composition comprend également un mélange d'acides aminés. Les acides aminés présents dans la composition sont préférentiellement au moins le tryptophane, la glutamine, la leucine, l'arginine et/ou la taurine, mais la composition peut contenir d'autres acides aminés, comme l'isoleucine, la valine, la phénylalanine ou la thréonine. Très préférentiellement, la composition selon l'invention comprend au moins le 10 tryptophane, la leucine, l'arginine et la taurine. Lorsque le tryptophane est présent, il doit représenter entre 6 et 9%, préférentiellement environ 7% en poids des acides aminés neutres présents dans la composition (leucine, isoleucine, valine, phénylalanine, tyrosine et tryptophane). Lorsque l'arginine et la taurine sont présentes, le rapport du poids d'arginine sur le poids de 15 taurine est compris entre 1,5 et 2. En plus du mélange hydrolysat, isolat et/ou concentrat de lactosérum et caséinate de calcium, et des acides aminés, le mélange de principes actifs de la composition selon l'invention peut comprendre un ou plusieurs des éléments choisis parmi le calcium de lait, le magnésium, la vitamine B6, la vitamine B9, la vitamine E, la vitamine D, le zinc et le chrome. 20 De même, la composition peut contenir des acides gras essentiels, notamment des omégas 3. Préférentiellement, il s'agit d'omégas 3 d'origine végétale, avec une proportion élevée d'EPA. Selon un mode de réalisation préféré, le mélange de principes actifs de la composition selon l'invention comprend au moins : 25 - 8 à 12 % d'hydrolysat de lactosérum, - 15 à 20 % d'isolat et/ou de concentrat de lactosérum, - 20 à 25 % de caséinate de calcium. les pourcentages étant donnés en poids de matière sèche de la totalité des principes actifs présents de la composition (en dehors des éventuels excipients). 30 La composition peut également contenir des éléments ajoutés librement, tels que des acides aminés, des vitamines et des minéraux, qui viennent s'ajouter aux constituants natifs de 3034317 10 l'hydrolysat de lactosérum, de l'isolat de lactosérum, du concentrat de lactosérum et du caséinate de calcium. La composition selon l'invention est préférentiellement constituée par au moins : - 1,5 à 3% de tryptophane, 5 - 12 à 20 % d'acides aminés branchés, - 6 à 10 % d'acides aminés aromatiques, - 0,8 à 1,5% de taurine, - 1,6 à 3% d'a rginine, - 1,2 à 3% de calcium de lait, 10 - 0,5 à 1% de magnésium, - 0,4 à 1% d'omégas 3, - 1 à 2 mg de vitamine B6 pour 50g de composition sans excipients, - 5 à 15mg de zinc pour 50g de composition sans excipients, - 1 à 3u.g de vitamine D pour 50g de composition sans excipients, 15 - 75 à 150 lig de chrome pour 50g de composition sans excipients, - 100 lig de vitamine B9 pour 50g de composition sans excipients, - 10mg de vitamine E pour 50g de composition sans excipients. les pourcentages étant donnés en poids de matière sèche de la totalité des principes actifs présents de la composition (en dehors des éventuels excipients), une partie des constituants 20 provenant de l'hydrolysat de lactosérum, de l'isolat de lactosérum, du concentrat de lactosérum et du caséinate de calcium et le reste étant ajouté librement sous forme d'acides aminés, vitamines et minéraux. Les acides aminés branchés de la composition sont constitués de leucine, d'isoleucine et de valine, préférentiellement de : 25 - 50 à 60% de leucine, - de 18 à 25% d'isoleucine, et - de 20 à 28% de valine, et les acides aminés aromatiques de tryptophane, de phénylalanine et de tyrosine, préférentiellement de : 30 - 15 à 24% de tryptophane, - de 38 à 46% de phénylalanine, et - de 35 à 43% de tyrosine. 3034317 11 La composition selon l'invention peut être obtenue par un procédé tel que décrit en suivant : - un premier mélange est obtenu par mélange des constituants dans l'ordre suivant : caséinate de calcium, isolat de lactosérum, concentrat de lactosérum, hydrolysat de lactosérum, acides aminés libres, magnésium et calcium de lait. Le pH doit être aux 5 alentours de 7 et stabilisé à ce niveau. - ajout au premier mélange des vitamines, des minéraux et des acides gras. On obtient ainsi une poudre qui peut être transformée en comprimé ou liquide, ou bien utilisée dans sa forme poudre en sachets, sticks, bidons ou gélules par exemple. La composition selon l'invention, lorsqu'elle est administrée par voie orale en quantité 10 suffisante, permet de modifier la composition du microbiote intestinal en augmentant relativement la quantité de Christensenella dans le microbiote. La composition permet de rétablir la fonctionnalité métabolique par l'augmentation relative de Christensenella au sein de la population générale du microbiote soit au moins à un niveau représentant 0.01% du total des genres bactériens décelés dans le microbiote d'un individu donné (recueilli dans les 15 selles, l'abondance étant mesurée de préférence par un test de séquençage Fish, ou de qPCR ou de méta analyse). Cette augmentation permet de lutter contre les dysbioses pathologiques métaboliques causées par une déficience en Christensenella dans le microbiote intestinal. L'augmentation de la quantité relative de Christensenella permet également de prévenir ou 20 lutter contre des maladies métaboliques dont l'origine est une dysbiose pathologique métabolique caractérisée par une déficience relative en Christensenella dans le microbiote intestinal, et en particulier : - le surpoids avec comorbidités l'obésité 25 - le diabète (et le pré-diabète) - les maladies cardiaques et vasculaires l'athérosclérose - les maladies dégénératives osseuses - les maladies neurodégénératives, notamment maladie de Parkinson et maladie 30 d'Alzheimer - les cancers liés au métabolisme, notamment cancer de l'cesophage, du colon, de l'endomètre, du rein et du sein pour les femmes en post ménopause, 3034317 12 - les maladies auto-immunes, - la stéatose, la stéatohépatite métabolique et NASH (stéatohépatite non alcoolique), - les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin. 5 La composition selon l'invention est particulièrement utile pour des personnes présentant une proportion relative de Christensenella inférieure à 0.01% du total des genres bactériens décelés dans le microbiote (recueilli dans les selles, l'abondance étant mesurée de préférence par un test de séquençage Fish, ou de qPCR ou de méta analyse), et pour des personnes présentant une proportion relative de Christensenella minuta dans le microbiote 10 inférieure à 0.005% de l'abondance totale de la flore intestinale, c'est-à-dire du total des espèces bactériennes décelés dans le microbiote (recueilli dans les selles, l'abondance étant mesurée de préférence par un test de séquençage Fish, ou de qPCR ou de méta analyse). Différentes méthodes peuvent être utilisées pour l'analyse du microbiote (le recueil se faisant généralement dans les selles) : 15 - la culture selon les méthodes classiques de culture bactérienne connues de l'homme du métier - des méthodes biologiques à travers le marqueur 16SrRNA - le séquençage soit par la méthode SANGER avec les Operational Taxonomic Units soit par spiroséquençage au niveau du 16SrRNA (méthode utilisée dans l'étude sur la 20 composition) - l'empreinte par électrophorèse, polymorphisme et ribosomal, - ADN avec des micro aires, - FISH (hybridation in situ e fluorescence) et qPCR (réaction en chaine par polymérase quantitative) avec amplification d'un groupe, 25 - Méta analyse avec la métagénomique (composition et fonction de tous les gènes), métaprotéomique (analyse des protéines), métabolomique (profil métabolique) et métatranscriptomique (à travers l'ARN). Selon une variante, dans les cas extrêmes d'urgence médicale, il est possible, pour les personnes carencées en Christensenella d'implanter préalablement à l'administration de la 30 composition selon l'invention des bactéries du genre Christensenella dans l'intestin, par l'utilisation d'un probiotique spécifique de cette bactérie en capsule ou par implantation directe par sonde dans le jéjunum. L'implantation devra représenter 75 à 100mg de bactérie 3034317 13 Christensenella. Les bactéries implantées peuvent être des bactéries obtenues par culture de bactéries du genre Christensenella prélevées dans les selles de ladite personne traitée s'il en existe des traces ou des bactéries obtenues par culture de bactéries du genre Christensenella prélevées dans les selles de personnes maigres et en bonne santé. 5 L'utilisation de la composition selon l'invention dans des quantités adaptées permet, éventuellement avec implantation préalable, de porter la présence de Christensenella à une proportion relative minimale de 0.01 % par rapport à la totalité des taxons du microbiote recueilli dans les selles. La composition pourrait permettre également d'obtenir une quantité relative de Christensenella minuta (lorsque la méthode d'analyse permet de descendre 10 jusqu'à l'espèce) d'au moins 0.0075% (par rapport à la totalité des taxons du microbiote recueilli dans les selles). De façon surprenante la composition selon l'invention est également capable de réguler dans le microbiote les familles de bactéries connues pour leur présence relative importante dans le surpoids, l'obésité et les maladies métaboliques, choisies parmi les clostridiales, en 15 particulier les lachnospiraceae et les clostridiaceae. De manière étonnante également elle est aussi capable de réguler dans le microbiote les familles de bactéries connues pour leur capacité à augmenter la quantité d'énergie retirée des aliments, choisies parmi les bactéries qui donnent par fermentation le butyrate et le propionate mais aussi augmentent l'énergie par la digestion de fibres non digestes 20 normalement, à savoir : Roseburia, Faecalbacterium (en particulier l'espèce prausnitzii), Akkermansia (en particulier l'espèce municiphali), Eubacterium (en particulier l'espèce rectale), Méthanobrevibacter (en particulier l'espèce smithii). Cette transformation supplémentaire d'énergie est l'une des causes la plus probable de l'épidémie de surpoids et de dysfonctionnement métabolique. Il est nécessaire de faire baisser ces « énergiseurs » 25 mais sans atteindre une déficience car le microbiote est un grand consommateur de butyrate, propionate et acétate (par ordre d'importance) ; le genre Akkermansia et l'espèce Akkermansia municiphali (aussi héritables) sont particulièrement importants car ils sont les principaux producteurs de propionate qui est le garant d'un bon fonctionnement de la barrière intestinale en limitant le passage des LPS ; en effets ces derniers induits par les 30 régimes trop gras (saturés en particulier) est le premier fautif du dysfonctionnement métabolique, de la stéatose hépatite et de la constitution de tissu adipeux. La régulation par l'invention de 2 gènes héritables et difficiles à faire évoluer est essentiel pour restaurer le 3034317 14 bon fonctionnement du métabolisme et de servir de plus de marqueurs de la réussite de l'intervention du traitement par l'invention. La composition selon l'invention peut se présenter sous toute forme adaptée à une administration par voie orale. Elle peut notamment se présenter sous forme de poudre ou 5 granulés, de boissons prêtes à l'emploi, de barres ou d'extrudés, de capsules, de gélules, de comprimés dispersibles ou toute forme pharmaceutique adaptée, la composition étant additionnée d'excipients et charges classiques connues de l'homme du métier. La dose journalière de composition selon l'invention (dose de mélange de principes actifs sans les excipients) est préférentiellement comprise entre 66 et 110 g, de préférence en 10 deux prises de 33 à 55 g réparties une le matin au petit déjeuner ou à 11h en collation, et une en collation l'après-midi. Avantageusement, dans le cadre d'un objectif de perte de poids, la biodisponibilité dans l'organisme des acides aminés, peptides et protéines présents dans la composition dans l'organisme est comprise entre 10 minutes et 5 heures, ce qui permet une action à la fois 15 rapide et qui perdure dans le temps de façon à limiter la quantité de nourriture à prendre quotidiennement. Par ailleurs, la présence de calcium de lait permet d'améliorer la palabilité du produit diététique selon l'invention en masquant notamment le goût amer de l'hydrolysat de lactosérum, de sorte qu'il participe à supprimer le risque que les personnes cessent de le 20 consommer pour des raisons de goût et abandonnent leur traitement avant son terme. La composition selon l'invention s'insère dans la médecine personnalisée et constitue une grande avancée en particulier dans la médecine pharmacométabonique. La composition selon l'invention peut en effet être utilisée comme un traitement qui s'adapte au métagénome de la personne traitée. 25 Ainsi, avant le traitement par la composition selon l'invention, un test peut être réalisé pour détecter la présence ou non de Christensenella et sa proportion dans le microbiote. Ce test permet d'établir une probabilité de réussite totale ou partielle ou d'échec du traitement. Le test peut être reproduit à la fin du traitement pour analyser le niveau d'augmentation de la bactérie, puis à un an pour mesurer la pérennité du traitement et le danger de rechute avec 30 la possibilité de refaire un traitement préventif. Le test peut porter également sur d'autres bactéries en particulier sur Akkermansia. L'avantage est de ne plus traiter à l'aveugle et de suivre à vie le patient dans sa maladie chronique. 3034317 15 L'invention permet ainsi de résoudre les problèmes des échecs thérapeutiques qui sont nombreux soit par l'abandon du traitement en cours et le plus souvent au début, soit par la reprise de poids après quelques mois ou années d'une perte de poids importante. Les échecs sont mis sur le compte du manque de motivation ou de lassitude de faire des efforts 5 permanents mais le blocage peut être dû à la quasi absence ou absence de Christensenella dans le microbiote. L'invention est à présent illustrée par un exemple non limitatif de composition diététique, se présentant sous forme d'une poudre de 55 g (principes actifs et excipients) conditionnée dans un sachet. 10 Cette composition est obtenue à partir des principes actifs suivants : - 5g d'hydrolysat de lactosérum de poids moléculaire entre 200 et 3500 Daltons, - 10 g d'isolat et/ou de concentrat de lactosérum de poids moléculaire entre 15000 et 20000 Daltons, - 13 g de caséinate de calcium de poids moléculaire entre 20000 et 35000 Daltons, 15 - 1 mg de vitamine B6, - 10 mg de zinc, - 0,45 g de taurine, - 40 lig de chrome, - 10 mg de vitamine E, 20 - 100 lig de vitamine B9, - 2,5 lig de vitamine D, - 270 mg d'omégas 3 d'origine végétale, - qsp 4,2g de leucine, - qsp 0,8g de tryptophane, 25 - qsp 0,9g d'arginine, - qsp 0,75g de calcium de lait, - qsp 0,36 g de magnésium. Par « qsp Xg » d'un élément de la composition, on entend la quantité totale de cet élément dans la composition : quantité apportée par les protides (caséinate de calcium, isolat de 30 lactosérum, concentrat de lactosérum, hydrolysat de lactosérum) et complétée par un ajout de l'élément sous forme libre pour arriver jusqu'à Xg. 3034317 16 L'invention est à présent illustrée par une étude montrant l'effet de la composition sur le microbiote intestinal en particulier sur Christensenella. L'étude a porté sur 54 sujets. Il s'agit d'une étude ancillaire d'une étude clinique internationale randomisée en aveugle avec un autre produit actif comme témoin. Deux 5 études ancillaires ont été menées sur 54 sujets, l'une sur le microbiote et l'autre sur le tissu adipeux. L'étude clinique portait sur 108 patients dont la caractéristique était d'être en surpoids ou obèses avec au moins 3 facteurs de comorbidités avérés ; les sujets étaient inclus lors d'une visite comprenant les critères morphologiques, un CTscan, une DEXA, une analyse biologique 10 complète. Pour l'étude ancillaire concernant 54 sujets, un prélèvement du tissu adipeux sous cutanée et un recueil des selles étaient également réalisés. Les sujets recevaient ou la composition selon l'invention ou un témoin actif isocalorique correspondant à la composition selon l'invention mais dans laquelle le lactosérum était remplacé par une protéine de pois, connue pour son action sur le microbiote. 15 L'étude du microbiote comprenait un prélèvement à l'inclusion et l'autre au moment de la visite à la 12éme semaine à la fin du traitement du produit avec restriction calorique modérée. Les selles ont été congelées et à la fin de l'étude elles ont été analysées par piroséquence. Les analyses ont été menées par l'investigateur principal Institut du Cardiométabolisme et Nutrition de Paris. 20 Sur les 54 sujets, 27 ont été traités par la composition selon l'invention (composition de l'exemple) et 27 par le produit témoin. Les selles ont été récoltées à l'inclusion et à la fin du traitement de 12 semaines avec les 2 produits et une restriction calorique de 600 kcal. Les résultats pour l'étude du microbiote sont présentés dans le tableau 1 ci-après, et sur les 25 figures 1 et 2. Pour les résultats présentés sur la figure 2, il est à noter les éléments suivants : - le test de Wilcoxon entre genres, a été réalisé sur la base d'une abondance normalisée, - à la valeur p 99%). Selon une publication de 2013 de RajilicStrojanovic, ces genres non classifiés seraient impliqués dans l'inflammation du « inflammatory bowel disease ». On constate ici une baisse en relatif pour un traitement selon l'invention de 1.26 à 1.12 et une augmentation pour le témoin de 0.83 à 0.89. 20 Toutefois comme il devrait exister plusieurs genres dans cette partie non classifiée et qui pourraient évoluer de manière divergente il est impossible de tirer des conclusions ; il est prudent d'attendre de nouvelles découvertes dans ces genres non classifiés. + L'analyse du genre Christensenella est le noyau central de cette étude sur le microbiote. 25 Christensenella est une bactérie « héritable » et non pas acquise non sensible à la diète, dans cette catégorie elle semble être la plus importante du groupe. Ceci implique que pour les personnes qui ont un faible taux de Christensenella il est « vital » pour rétablir un métabolisme sain d'augmenter ce genre plutôt que l'ensemble du microbiote avec des prébiotiques ou des probiotiques qui peut provoquer des augmentations de classes 30 indésirables comme les méthanogènes ou les hélicobacters. L'invention a une action ciblée sur les bactéries, utiles au métabolisme. La régulation d'Akkermansia arrive en deuxième priorité et ensuite celles sur le consortium du poids et des énergiseurs. 3034317 19 Par ailleurs, Christensenella est une bactérie marqueur d'un poids « normal » au point de vue métabolique et un marqueur de bonne santé donc d'un microbiote qui fonctionne régulièrement sans pathogénicité tant sur le plan génétique que mode de vie. De plus il a été démontré par Goodrich que l'implantation de Christensenella inversait la courbe de poids 5 par une moindre prise de poids chez la souris ce qui se traduit chez l'homme par une perte de poids. L'action de Christensenella est particulièrement essentielle pour une régulation métabolique afin de gommer les facteurs pathogènes qui se traduisent par des maladies métaboliques. 10 Le genre Christensenella est relativement sous représenté dans les 2 groupes (0.0028 et 0.002 contre 0.0097) par rapport au standard ce qui confirme la diminution de ce genre chez une population en souffrance métabolique. L'action des 2 produits fait augmenter Christensenella de 0.0028% à 0.014% pour le groupe de l'invention (380%) avec une significativité par rapport à l'initial (p=0.002), alors que le témoin passe de 0.002% à 0.0028% 15 (+60% et non significatif). Le groupe traité selon l'invention passe en 12 semaines très nettement en dessus du standard (0.014% contre 0.0097%) et il est significatif par rapport au témoin (0.004). Par ailleurs, il est à noter que de tous les genres que comportent le microbiote humain (1 500 connus à ce jour), le seul genre significatif dans l'étude sur l'invention qui sort de tous 20 les tests statistiques est le Christensenella qui apparait comme un des genres le plus significatif des états pathologiques métaboliques du microbiote et des maladies métaboliques dérivées. Par ailleurs, les résultats cliniques et de l'étude ancillaire sur le tissu adipeux sont présentés dans le tableau 2 ci-après : 3034317 20 Tableau 2: Composition selon l'invention FAS TOTAL FAS TOTAL Base Line A% ETUDE CLINIQU E POPULATION 108 MASSE GRASSE VISCERALE CTScan cne 192.3 -10.4% MASSE GRASSE TOTALE CTScan cnn2 489.7 -8.9% MASSE GRASSE DXA kg 37.0 -8.9% MASSE MAIGRE DXA kg 51.2 -0.1% TOUR DE TAILLE cm 104.5 -4.2% POIDS kg 92 -3.9% TAS mm 131.7 -2.7% TAD mm 81.6 -4.0% GLYCÉMIE nnnnol 5.5 -2.8% INSULINEMIE nnUI/1 12.6 -19.0% HOMA IR 3.1 -20.5% HOMA B 124 -9.3% HOMA S 59.9 +40.6% CHOLESTEROL TOTAL nnnnol 5.2 -7.2% HDL nnnnol 1.2 +0.2% LDL nnnnol 3.2 -7.6% TRIGLYCERIDES nnnnol 1.6 -9.6% TNF pg/nnl 1.9 -10.2% ETUDE ANCILAIRE TISSU ADIPEUX GLYCEROL pg/m1 16 -20.1% IL6 3707 -13.3% 02 CONSOMMATION ENERGIE p.M 0.002 +63% ADIPONECTINE pg/nnl 11426 +13.3% On constate que la composition utilisée selon l'invention, a une action certaine sur la fonction métabolique de l'adipocyte qui se traduit par l'augmentation de l'adiponectine dans le tissu adipeux qui reflète les deux dysfonctions de base qui sont à l'origine des nombreuses maladies métaboliques et dégénératives : 5 - l'inflammation avec une baisse de l'IL6 dans le tissu adipeux et le TNFa dans le plasma ceci est expliqué par l'activation de p105 sur les adipocytes qui régule NFKI3 le modulateur des cytokines inflammatoires - l'insulino résistance qui s'améliore par la baisse de l'insulinémie, la baisse de HOMA IR mais surtout une amélioration très sensible de la sensibilité à l'insuline par HOMA S 3034317 21 - deux autres fonctions sur le tissu adipeux sont à noter la régulation de la lipolyse des adipocytes des personnes en surpoids (glycérol) et l'augmentation de la fabrication d'énergie (consommation 02) - l'amélioration des facteurs de comorbidités : tension artérielle, glycémie, insulinémie, 5 cholestérol, LDL et triglycérides, est à la fois une conséquence de l'amélioration métabolique mais aussi de l'action directe des composés actifs de l'invention en particulier des acides aminés - enfin par ailleurs aucun effet secondaire sérieux n'a été relevé lors du traitement hormis quelques embarras digestifs passagers. 10 Selon l'invention, il est ainsi possible d'agir sur une dysbiose pathologique de la flore intestinale à travers l'augmentation relative du genre Christensenella, et par conséquent agir également sur les maladies métaboliques marquées par cette pathologie. Les actions sur d'autres familles, genres ou espèces viennent renforcer l'action de Christensenella. REVENDICATIONS1. Composition comprenant un mélange de principes actifs constitué par au moins : - un hydrolysat de lactosérum de poids moléculaire compris entre 200 et 10 000 Daltons, - un isolat et/ou un concentrat de lactosérum, et - du caséinate de calcium, pour son utilisation comme médicament ou produit de nutrition médicale chez l'homme pour le traitement d'une dysbiose pathologique du microbiote intestinal caractérisée par une déficience en Christensenella dans le microbiote intestinal. 2. Composition comprenant un mélange de principes actifs constitué par au moins : - un hydrolysat de lactosérum de poids moléculaire compris entre 200 et 10 000 Daltons, - un isolat et/ou un concentrat de lactosérum, et - du caséinate de calcium, pour son utilisation comme médicament ou produit de nutrition médicale chez l'homme pour la prévention ou le traitement d'au moins une maladie métabolique dérivée d'une dysbiose pathologique du microbiote intestinal caractérisée par une déficience en Christensenella dans le microbiote intestinal, ladite maladie étant choisie parmi le surpoids avec comorbidité, l'obésité, le diabète, les maladies cardiaques et vasculaires, l'athérosclérose, les maladies dégénératives osseuses, les maladies neurodégénératives, les cancers liés au métabolisme, les maladies auto-immunes, la stéatose, la stéatohépatite métabolique, et les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin. 3. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, chez des personnes dont le genre Christensenella représente moins de 0,01% du total des genres bactériens décelés dans le microbiote inestinal. 4. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce qu'elle agit en augmentant dans le microbiote intestinal l'espèce bactérienne Christensenella. 3034317 23 5. Composition pour son utilisation selon la revendication 4, caractérisée en ce que Christensenella est augmentée de façon à ce qu'elle représente une proportion supérieure à 0.01% du total des genres bactériens décelés dans le microbiote intestinal. 6. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, 5 caractérisée en ce qu'elle agit en augmentant dans le microbiote intestinal le genre bactérien Christensenella minuta. 7. Composition pour son utilisation selon la revendication 6, caractérisée en ce que le genre bactérien Christensenella minuta est augmentée de façon à ce qu'elle représente une proportion supérieure à 0.0075% du total de la flore intestinale. 10 8. Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 4 à 7, caractérisée en ce qu'elle régule dans le microbiote les familles de bactéries connues pour leur présence importante dans le surpoids avec comorbidités, l'obésité et les maladies métaboliques, choisies parmi les Lachnospiraceae et les Clostridiaceae. 9. Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 4 à 8, caractérisée en 15 ce qu'elle régule dans le microbiote les bactéries connues pour leur capacité à augmenter la quantité d'énergie retirée des aliments, choisies parmi les genres Roseburia, Faecalbacterium, Akkermansia, Eubacterium, Méthanobrevibacter. 10. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications pour des personnes en carence de Christensenella et chez qui ces bactéries du genre Christensenella 20 ont été préalablement implantées dans l'intestin par l'utilisation d'un probiotique spécifique de cette bactérie en capsule ou par implantation directe par sonde. 11. Composition pour son utilisation selon la revendication 10, caractérisée en ce que les bactéries implantées chez la personne traitée sont des bactéries obtenues par culture de bactéries du genre Christensenella prélevées dans l'intestin de ladite personne traitée. 25 12. Composition pour son utilisation selon la revendication 10, caractérisée en ce que les bactéries implantées chez la personne traitée sont des bactéries obtenues par culture de bactéries du genre Christensenella dont la souche a été prélevée dans l'intestin de personnes maigres et en bonne santé. 13. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, la maladie métabolique étant choisie parmi la maladie d'Alzheimer et la maladie de Parkinson. 3034317 24 14. Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 1 à 12, la maladie métabolique étant choisie parmi le cancer de l'cesophage, du colon, de l'endomètre, du rein et du sein pour les femmes en post ménopause. 15. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, 5 caractérisée en ce que l'isolat et/ou le concentrat ont un poids moléculaire compris entre 15 000 et 20 000 Daltons. 16. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que le caséinate de calcium a un poids moléculaire compris entre 20 000 et 35 000 Daltons. 10 17. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que l'hydrolysat de lactosérum a un poids moléculaire compris entre 200 et 3500 Daltons. 18. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que le ratio en poids entre le caséinate de calcium et le mélange constitué 15 par l'hydrolysat et l'isolat et/ou le concentrat de lactosérum est compris entre 0,8 et 1,2. 19. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que le mélange de principes actifs comprend également un mélange d'acides aminés. 20. Composition pour son utilisation selon la revendication 19, caractérisée en que le 20 mélange d'acides aminés est constitué par au moins un des acides aminés choisis parmi le tryptophane, la glutamine, la leucine, l'arginine et la taurine. 21. Composition pour son utilisation selon la revendication 20, caractérisée en que le tryptophane représente entre 6 et 9% en poids des acides aminés neutres présents dans la composition. 25 22. Composition pour son utilisation selon la revendication 20 ou 21, caractérisée en ce que le rapport du poids d'arginine sur le poids de taurine est compris entre 1,5 et 2. 23. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que le mélange de principes actifs comprend également au moins un des éléments choisis parmi le calcium de lait, le magnésium, la vitamine B6, la vitamine B9, la 30 vitamine E, la vitamine D, le zinc et le chrome. 3034317 25 24. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que le mélange de principes actifs comprend également des acides gras essentiels. 25. Composition pour son utilisation selon la revendication 24, caractérisée en ce que les 5 acides gras essentiels sont des omégas 3. 26. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que l'hydrolysat de lactosérum représente entre 8 et 12%, l'isolat et/ou le concentrat de lactosérum entre 15 et 20%, et le caséinate de calcium entre 20 et 25%, les pourcentages étant donnés en poids de matière sèche de la totalité des principes actifs 10 présents de la composition. 27. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce qu'elle est constituée par au moins : 1,5 à 3% de tryptophane, 12 à 20 % d'acides aminés branchés, 15 6 à 10 % d'acides aminés aromatiques, 0,8 à 1,5% de taurine, 1,6 à 3% d'a rginine, 1,2 à 3% de calcium de lait, 0,5 à 1% de magnésium, 20 0,4 à 1% d'omégas 3, 1 à 2 mg de vitamine B6 pour 50g de composition sans excipients, 5 à 15 mg de zinc pour 50g de composition sans excipients, 1 à 3 lig de vitamine D pour 50g de composition sans excipients, 75 à 150 lig de chrome pour 50g de composition sans excipients, 25 100 lig de vitamine B9 pour 50g de composition sans excipients, 10 mg de vitamine E pour 50g de composition sans excipients, les pourcentages étant donnés en poids de matière sèche de la totalité des principes actifs présents de la composition. 28. Composition pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, 30 caractérisée en ce qu'elle se présente sous forme de poudre ou granulés, de boisson prête à l'emploi, de barres alimentaires ou extrudés, de capsules ou gélules ou de comprimés dispersibles.