Brevet FR3021328A1 — publié le 20151127

La présente invention se rapporte à une cellule végétale comprenant une molécule d'ADN comprenant au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase choisie parmi Amb a 1, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1, et les homologues d'Amb a 1, liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort. L'invention se rapporte également un procédé de production de la pectate lyase utilisant la cellule végétale. L'ambroisie, en particulier Ambrosia artemisiifolia, est une plante annuelle, qui appartient à la famille des Composées tubuliflores (ou Astéracées). Cette plante sauvage, originaire d'Amérique du nord, fleurit de la fin de l'été jusqu'à l'automne. Son pollen a un pouvoir allergénique très élevé. Ainsi, l'ambroisie est la première cause d'allergie pollinique aux Etats-Unis, avec environ 30 millions de personnes sur 40 millions souffrant de pollinoses. Introduite involontairement en France au XIXème siècle, l'ambroisie est une plante fortement invasive qui a rapidement progressé à partir de la région Rhône-Alpes vers le nord de la France. Ainsi, en 2011, des pieds d'ambroisie ont été retrouvés dans l'Ile de France. Le pollen de cette plante provoque chez les personnes sensibles une réaction allergique caractérisée par sa sévérité. Globalement, la rhinite allergique à l'ambroisie est beaucoup plus sévère que celle causée par d'autres pollens. Les symptômes tels que prurit, anosmie (perte ou diminution de la sensibilité aux odeurs), rhinorrhée, éternuements et obstruction nasale sont plus importants. De plus, dans 50% des cas, cette allergie évolue en un asthme, souvent plus sévère que celui provoqué par d'autres pollens. Ces symptômes sont d'autant plus prononcés que le taux de pollen dans l'air est élevé. Dans la région Rhône-Alpes, l'allergie à l'ambroisie touche aujourd'hui 6 à 12% de la population entre fin août et début septembre. Ainsi, pour cette seule région, le nombre total de consommateurs de médicaments antiallergiques à l'ambroisie a fortement augmenté (+60%) entre 2008 et 2011, passant de 161 200 à 258 700 personnes, et les dépenses de santé engendrées par cette allergie représentent entre 5,6 et 8,6 millions d'euros. L'allergie à l'ambroisie représente donc aujourd'hui un véritable problème de santé publique. Le plus simple pour se protéger des risques d'allergie serait d'éviter les expositions au pollen d'ambroisie, mais une éviction totale semble d'ores et déjà impossible malgré des arrêtés préfectoraux rendant obligatoire la destruction de l'ambroisie. Ces mesures n'ont pas permis d'enrayer la propagation de cette plante invasive dans un grand nombre de régions. Les traitements dits « symptomatiques » soit par voie locale (gouttes, collyres, sprays), soit par voie générale (comprimés, gélules), permettent de soulager les symptômes pendant la période où les pollens sont présents dans l'air. Mais les symptômes reviennent rapidement dès l'arrêt du traitement. A l'inverse des traitements "symptomatiques", l'immunothérapie allergénique (ou désensibilisation) est le seul traitement susceptible de modifier l'évolution de la maladie allergique. Cette voie thérapeutique permet de traiter la cause de l'allergie contrairement aux médicaments dits « symptomatiques ». Toutefois, comme pour les autres allergies, les extraits utilisés aujourd'hui pour la désensibilisation des patients allergiques à l'ambroisie sont d'une qualité insuffisante pour que ce traitement soit efficace. Plusieurs allergènes d'ambroisie ont été caractérisés, en particulier Amb a 1 qui est responsable de plus de 80% des cas d'allergie à l'ambroisie. Différentes tentatives de production d'un Amb a 1 recombinant destiné à une désensibilisation spécifique ont échoué. En effet, Amb a 1 est une protéine végétale complexe présentant des maturations post-traductionelles typiquement végétales, et seul un système d'expression végétale sera capable de produire cet allergène sous une forme utilisable et efficace en immunothérapie allergénique. Il existe donc un besoin pour produire cet allergène Amb a 1 sous forme recombinante, avec une bonne qualité, et de façon reproductible et efficace (avec un bon rendement). Par « bonne qualité », on entend que l'allergène est très fortement similaire, dans sa séquence et sa structure, à l'allergène présent naturellement dans l'ambroisie. Il existe également un besoin pour produire cet allergène à des niveaux commercialement et économiquement acceptables. De façon surprenante, les inventeurs ont maintenant découvert que la production de l'allergène Amb a 1, bien que toxique in vivo, sous forme recombinante est possible, par expression transitoire chez les plantes. Cette production, qui se fait dans une cellule végétale, permet l'obtention de l'allergène Amb a 1 sous forme mature et active, avec un bon rendement, de façon très simple et reproductible. En outre, l'allergène Amb a 1 obtenu n'est pas contaminé par des protéases et/ou d'autres contaminants d'origine végétale. Les inventeurs ont ainsi pu obtenir une production, à des niveaux commercialement acceptables, de l'allergène Amb a 1. L'invention a donc pour objet une cellule végétale comprenant une molécule d'ADN comprenant au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase choisie parmi Amb a 1, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1, et les homologues d'Amb a 1, liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort, de préférence un promoteur 35S. La molécule d'ADN liée au promoteur fort permet d'exprimer de façon transitoire la pectate lyase mature et active dans la cellule. De préférence, ladite cellule végétale est une cellule de Nicotiana benthamiana. De préférence, la cellule végétale selon l'invention comprend une molécule d'ADN comprenant au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine de la pectate lyase liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort, de préférence un promoteur 35S, ladite molécule d'ADN n'étant pas intégrée dans le génome de la cellule végétale. La pectate lyase choisie parmi Amb a 1, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1, et les homologues d'Amb a 1 est appelée « pectate lyase selon l'invention » dans la présente demande. L'invention a également pour objet une plante comprenant au moins une cellule végétale selon l'invention. Un autre objet de l'invention est de fournir un procédé de production d'une pectate lyase selon l'invention, comprenant l'expression de ladite pectate lyase dans une cellule végétale selon l'invention, ou dans une plante comprenant une telle cellule. Un autre objet de l'invention se rapporte à une pectate lyase susceptible d'être obtenue par le procédé selon l'invention, avec une cellule végétale selon l'invention, ou avec une plante selon l'invention. La pectate lyase ainsi obtenue peut être utilisée comme médicament. Elle peut également être utilisée en immunothérapie allergique, seule ou en combinaison avec au moins un autre allergène d'Asteracée. Elle peut également être utilisée dans le diagnostic d'allergies, et être intégrée dans un kit de diagnostic d'allergies. La cellule végétale selon l'invention comprend une molécule d'ADN liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort, de préférence un promoteur 35S. Par « lié de manière fonctionnelle », on entend que la molécule d'ADN est fusionnée avec le promoteur fort, de telle sorte que le promoteur fort induise la transcription de la molécule d'ADN. Cela permet l'expression de ladite molécule d'ADN sous forme transitoire, i.e. sans intégration de l'ADN, notamment l'ADNc, dans le génome de la cellule végétale. En effet, l'utilisation de l'expression transitoire dans une cellule végétale ou une plante selon l'invention permet d'augmenter les rendements de production de la pectate lyase selon l'invention sous forme active jusqu'à des niveaux élevés, compatibles avec une exploitation commerciale, mais incompatibles avec la survie d'une plante qui exprimerait ces pectates lyases toxiques de façon stable. Dans le cas d'une expression transitoire, la récolte de la biomasse végétale a lieu lors du pic d'expression de la protéine recombinante, i.e. typiquement 4 à 6 jours après la transfection. De préférence, la cellule végétale selon l'invention comprend un vecteur d'expression comprenant au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase selon l'invention liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort, de préférence un promoteur 35S. Amb a 1 est une pectate lyase provenant d'Ambrosia artemisiifolia. Reconnu par plus de 80 % des patients sensibilisés à l'ambroisie, cet allergène est responsable de plus de 90 % de l'activité allergénique du pollen d'ambroisie. C'est une protéine de 38 kDa décrite comme non glycosylée appartenant à la famille des pectates lyases. Douze isoformes de Amb a 1 sont recensées, de Amb a 1.0101 à Amb a 1.0502 (d'après le site www.allergome.org). Les séquences nucléique et d'acides aminés des douze isoformes sont détaillées dans le tableau 1 ci-dessous : N° d'accession (UniProt) Séquence d'acides aminés ivim)J(10 FP e-,679650 vb9bb4 4W)561 (1Q666 Ni' d'accession (GenBank) Séquence nucléique 480558 b9bM - Isoallergènes Amb a 1.0101 Atnb a 1.0201 Amb a 1.0202 Amb a 1.0301 Amb a 1.0302 Amb a 1.0303 Amb a 1.0304 Amb a 1.0305 Amb a 1.0401 Amb a 1.0402 Amb a 1.0501 Amb a 1.0502 Tableau 1 : les douze isoformes d'A,nb a 1, leurs séquences nucléiques et protéiques Par « Amb a 1 » selon l'invention, on entend les douze isoformes précitées dans le tableau 1 20 ci-dessus. Les séquences protéiques décrites dans ce tableau 1 correspondent aux préproprotéines des différentes isoformes. Amb a 1 subit une protéolyse dans le grain de pollen et/ou au cours du processus d'extraction ou de purification résultant en deux chaînes, alpha (26 kDa) et bêta (12 kDa), associées de façon non covalente (King et al, 1974, 1981). Il a été démontré que des modifications chimiques d'Amb a 1, y compris la réduction et l'alkylation des ponts disulfures ainsi que le processus de dénaturation/renaturation par l'urée ou la succinylation des résidus lysine, réduit sa réactivité vis-à-vis des IgE (King, 1976; Smith et al, 1988). Les sous-chaînes alpha et bêta d'Amb a 1 ont une réactivité différente sur les IgE et les lymphocytes T. En effet, Amb a 1 bêta contient un nombre important d'épitopes fixant les IgE, tandis que Amb a 1 alpha se comporte comme un hypoallergène et stimule l'activité des cellules T. De préférence, Amb a 1 a pour séquence protéique SEQ ID NO :7 (préproprotéine). De préférence, la sous-unité bêta a pour séquence protéique SEQ ID NO :8. De préférence, la sous-unité alpha a pour séquence protéique SEQ ID NO :9. Par « homologues d'Amb a 1 », on entend des protéines de la famille des Astéracées qui présentent au moins 57% d'identité, de préférence au moins 60% d'identité, de préférence au moins 64% d'identité, avec l'une des isoformes d'Amb a 1. De préférence, l'homologue d'Amb a 1 est une protéine de plante du genre Ambrosia ou Artemisia, plus préférentiellement d'Artemisia vulgaris, d'Ambrosia psilostachya ou d'Ambrosia trifida, qui présente au moins 57% d'identité, de préférence au moins 60% d'identité, de préférence au moins 64% d'identité, avec l'une des isoformes d'Amb a 1. De préférence, l'homologue d'Amb a 1 est choisi parmi Amb p 1 (provenant d'Ambrosia psilostachya, de code d'accession 9064 sur www.allergome.org) et Art v 6 (provenant d'Artemisia vulgaris, de numéro d'accession AOPJ16 dans Uniprot). Par "pourcentage d'identité" entre deux séquences d'acides aminés au sens de la présente invention, on entend désigner un pourcentage de résidus d'acides aminés identiques entre les deux séquences à comparer, obtenu après le meilleur alignement, ce pourcentage étant purement statistique et les différences entre les deux séquences étant réparties au hasard et sur toute leur longueur. Par "meilleur alignement" ou "alignement optimal", on entend l'alignement pour lequel le pourcentage d'identité déterminé comme ci-après est le plus élevé. Les comparaisons de séquences entre deux séquences d'acides aminés sont traditionnellement réalisées en comparant ces séquences après les avoir alignées de manière optimale, ladite comparaison étant réalisée par segment ou par « fenêtre de comparaison » pour identifier et comparer les régions locales de similarité de séquence. L'alignement optimal des séquences pour la comparaison peut être réalisé, outre manuellement, au moyen de l'algorithme d'homologie locale de Smith et Waterman (1981, J. Mol Evol., 18:38-46), au moyen de l'algorithme d'homologie locale de Neddleman et Wunsch (1970), au moyen de la méthode de recherche de similarité de Pearson et Lipman (1988, PNAS, 85: 2444-2448), au moyen de logiciels informatiques utilisant ces algorithmes (GAP, BESTFIT, BLAST P, BLAST N, FASTA et TFASTA dans le Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI). Ainsi, de préférence, la pectate lyase selon l'invention est choisie parmi Amb a 1.0101, Amb a 1.0201, Amb a 1.0202, Amb a 1.0301, Amb a 1.0302, Amb a 1.0303, Amb a 1.0304, Amb a 1.0305, Amb a 1.0401, Amb a 1.0402, Amb a 1.0501, Amb a 1.0502, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1 et les protéines de la famille des Astéracées qui présentent au moins 57% d'identité, de préférence au moins 60% d'identité, de préférence au moins 64% d'identité, avec l'une des isoformes d'Amb a 1. Plus préférentiellement, la pectate lyase selon l'invention est choisie parmi Amb a 1.0101, Amb a 1.0201, Amb a 1.0202, Amb a 1.0301, Amb a 1.0302, Amb a 1.0303, Amb a 1.0304, Amb a 1.0305, Amb a 1.0401, Amb a 1.0402, Amb a 1.0501, Amb a 1.0502, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1 et les protéines d'Artemisia vulgaris, d'Ambrosia psilostachya ou d'Ambrosia trifida, qui présentent au moins 57% d'identité, de préférence au moins 60% d'identité, de préférence au moins 64% d'identité, avec l'une des isoformes d'Amb a 1. La molécule d'ADN comprend au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine de la pectate lyase selon l'invention. La préproprotéine de la pectate lyase selon l'invention comprend un peptide signal, un propeptide et la pectate lyase mature. La séquence nucléotidique hétérologue codant la préproprotéine selon l'invention comprend donc une séquence codant le peptide signal, une séquence codant le propeptide et une séquence codant la pectate lyase mature. De préférence, la séquence nucléotidique hétérologue codant la préproprotéine selon l'invention comprend une séquence codant le peptide signal, une séquence codant le propeptide de la sous-unité bêta, une séquence codant la sous-unité bêta, une séquence codant le propeptide de la sous-unité alpha et une séquence codant la sous-unité alpha. Le peptide signal est notamment tout peptide signal reconnu par la cellule végétale, provenant ou non d'une pectate lyase. Il cible notamment la pectate lyase selon l'invention dans le milieu intercellulaire. De préférence, le peptide signal est celui de la chitinase de tabac, ou le peptide signal naturel de la pectate lyase. Le propeptide est, quant à lui, le propeptide naturel d'une pectate lyase, ou bien le propeptide d'une peptidase ClA. Dans un mode de réalisation préféré, le propeptide est un propeptide de peptidases ClA, notamment d'acariens ou d'origine végétale. De préférence, le propeptide de peptidase C lA est le propeptide naturel ou le propeptide muté ou non de Der pl. De préférence, le propeptide de peptidase C lA est choisi parmi le propeptide naturel de peptidase C lA et la séquence SEQ ID NO :6 (i.e. les acides aminés 19 à 98 de la séquence Uniprot p08176). Dans un mode de réalisation préférée de la présente invention, la pectate lyase selon l'invention est produite en fusion avec son propre propeptide ou en fusion avec le propeptide de peptidase C lA d'acariens ou en fusion avec un propeptide de peptidase C lA végétale, afin d'augmenter les rendements de production de la protéine. De préférence, la séquence de la préproprotéine de pectate lyase est choisie parmi les séquences protéiques listées dans le tableau 1 ci-avant et les séquences présentant au moins 57%, de préférence au moins 60%, de préférence au moins 64% d'identité avec l'une de ces dernières. De préférence, la séquence nucléotidique hétérologue codant la préproprotéine est choisie parmi SEQ ID NO :1 à 5. De préférence, elle a pour séquence SEQ ID NO :1, SEQ ID NO :2, SEQ ID NO :3, SEQ ID NO :4 ou SEQ ID NO :5. Selon l'invention, la séquence nucléotidique hétérologue codant la préproprotéine peut être obtenue à partir d'un gène connu déjà cloné codant pour une pectate lyase selon l'invention, ou bien par criblage d'une banque d'ADNc avec des anticorps anti-pectate lyase. Les méthodes utilisées sont bien connues de l'homme de l'art, et incluent notamment l'identification du gène par hybridation avec des sondes, PCR, séquençage et clonage moléculaire. Il est également possible de synthétiser le gène pour refléter l'utilisation des codons préférés chez les plantes ; dans ce cas, on parle d'optimisation de codons, souvent utile pour une forte expression des protéases sélectionnées (Murray et al, Nucleic Acid Res. 17:477 498 (1980)). Dans un mode de réalisation préféré de l'invention, la séquence nucléotidique hétérologue codant la préproprotéine comprend en outre une séquence, appelée séquence d'adressage intracellulaire. Cette séquence permet de cibler un compartiment de stockage de la pectate lyase selon l'invention, afin de contrôler sa maturation. Cette maturation est nécessaire pour l'obtention des pectates lyases sous la forme la plus adaptée pour le diagnostic d'allergie et l'immunothérapie. De préférence, cette séquence peptidique d'adressage cible la pectate lyase selon l'invention sous forme soluble ou membranaire vers le réticulum endoplasmique ou les différents compartiments constitutifs du système endomembranaire de sécrétion de la cellule végétale. Une fois que le gène d'intérêt a été isolé et modifié pour contenir tout ou partie des modifications décrites ci-dessus et obtenir la séquence nucléotidique hétérologue, cette dernière est placée dans un vecteur d'expression par des méthodes classiques. La sélection d'un vecteur d'expression approprié dépendra de la méthode d'introduction du vecteur d'expression dans des cellules hôtes. Un vecteur d'expression typique contient des éléments d'ADN procaryote codant pour une origine de réplication bactérienne et un gène de résistance à un antibiotique à fournir pour la croissance et la sélection du vecteur d'expression dans l'hôte bactérien, un site de clonage pour l'insertion d'une séquence d'ADN exogène codant pour la pectate lyase; des éléments d'ADN eucaryotes comme une séquence d'initiation de la transcription du gène exogène, comme un promoteur, et des éléments d'ADN qui contrôlent le traitement des transcrits, comme des séquences de terminaison / polyadénylation et une cassette d'expression permettant l'expression d'un inhibiteur du silencing. Il contient également des séquences telles que des t-DNA qui sont nécessaires pour l'intégration d'un morceau d'ADN dans la plante ou dans la cellule végétale. De préférence, le vecteur d'expression comprend : des éléments d'ADN procaryote codant pour une origine de réplication bactérienne et un gène de résistance à un antibiotique ; au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase selon l'invention liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort, de préférence un promoteur 35S ; une cassette d'expression permettant l'expression d'un inhibiteur du silencing, de préférence p19 ; et des éléments d'ADN qui contrôlent le traitement des transcrits, comme des séquences de terminaison / polyadénylation, de préférence la séquence Tnos (séquence de terminaison de la nopaline synthase). De préférence, le vecteur d'expression est pAG01. Les promoteurs utilisés pour contrôler l'expression de la pectate lyse sont des promoteurs forts, et peuvent être des promoteurs de gènes de plantes, tels que par exemple, le promoteur de l'ubiquitine, le promoteur de la petite sous-unité de la ribulose-1, 5-bis-phosphate carboxylase, des promoteurs d'Agrobacterium tumefaciens, les promoteurs de la nopaline- synthase et de l'octopine synthase, ou encore des promoteurs viraux comme les 19S et 35S du virus de la mosaïque du chou-fleur (CaMV). De préférence, le promoteur fort est le 35S. L'expression élevée et la qualité des pectates lyases recombinantes produites dans l'invention permettent de concevoir leur production commerciale. En effet, la pectate lyase selon l'invention est typiquement exprimée en une quantité égale à au moins 0,1 % des protéines solubles totales de la plante, mais souvent en une quantité beaucoup plus élevée, pouvant atteindre 5 à 10%. La plante comprenant les cellules végétales selon l'invention peut être une plante entière, mais peut également être une partie de plante, telle que des feuilles. La plante ou les cellules végétales selon l'invention peuvent être utilisées en tant que telles, comme médicament. La plante ou les cellules végétales selon l'invention peuvent être utilisées en tant que telles, pour des applications comme biocarburant, dans la nutrition animale, ou encore dans la production de papier ou de textile (fibres de coton notamment). Dans d'autres applications, la pectate lyase recombinante est purifiée après extraction à partir de la plante ou des cellules végétales qui l'expriment. Afin de faciliter sa purification, l'enzyme pourra être exprimée en fusion avec des tags (His6, GST, MBP, FLAG etc..) qui seront localisés de préférence en position N- ou C-terminale de la protéine mature. La pectate lyase selon l'invention susceptible d'être obtenue par le procédé selon l'invention, avec une cellule végétale selon l'invention, ou avec une plante selon l'invention, peut être utilisée comme médicament. Elle peut également être utilisée en immunothérapie allergique, seule ou en combinaison avec au moins un autre allergène d'Asteracée. Cet autre allergène d'Asteracée peut être choisi parmi Amb a 11, Amb a 5 et leurs mélanges. Elle peut également être utilisée dans le diagnostic d'allergies, notamment d'allergies aux pollens. L'invention a donc également pour objet un kit de diagnostic d'allergies, comprenant la pectate lyase selon l'invention, et des moyens de mesure des anticorps dirigés contre cette protéine. L'invention a également pour objet un kit de diagnostic d'allergies, comprenant la pectate lyase selon l'invention, des moyens de mesure des anticorps dirigés contre cette protéine, et des moyens de mesure des anticorps dirigés contre un autre allergène d'Asteracée, par exemple l' allergène Amb a 11 ou Amb a 5. Les méthodes générales de culture de plantes, ainsi que les procédés pour introduire des vecteurs d'expression dans un tissu végétal, sont à la disposition de l'homme de l'art. Ils sont variés et dépendent de la plante sélectionnée. De préférence, les plantes seront cultivées selon les techniques propres à la plateforme Allergopur. Ce procédé de production de protéines recombinantes est décrit dans la demande FR1255510, et comprend une première étape de culture de la plante, en aéroponie ou en hydroponie, de préférence culture sur flotteur libre, et sous éclairage LEDs. Après cette première étape, notamment cinq semaines de culture en hydroponie sur des flotteurs libres, l'agroinfiltration des plantes est réalisée sous vide, par des agrobactéries comprenant un fragment d'ADN codant pour la pectate lyase selon l'invention. Cette étape d' agroinfiltration peut être mise en oeuvre par tout moyen permettant de faire le vide. De préférence, dans le procédé utilisé selon l'invention, elle est réalisée sous vide par effet Venturi. Parmi les agrobactéries utilisables selon l'invention, on peut citer de préférence, les souches LBA4404, GV3101, EHA 101/105 ou C58. Selon une première alternative, une fois l'étape d'agroinfiltration réalisée, les plantes sont typiquement égouttées tête en bas pendant 15 minutes, puis remises en culture, typiquement 3 à 6 jours, idéalement en assurant une brumisation fréquente de ces dernières pendant les 6 premières heures de culture qui suivent l'agroinfiltation. Enfin, la protéine est extraite et purifiée. Selon une seconde alternative, une fois l'étape d'agroinfiltration réalisée, les plantes sont directement remises en culture, typiquement 3 à 6 jours, puis la protéine est extraite et purifiée. Ainsi, de préférence, l'invention a également pour objet un procédé de production d'une pectate lyase selon l'invention dans une cellule végétale ou une plante, comprenant les étapes suivantes : a) transformation d' agrobactéries avec un vecteur d'expression comprenant une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase selon l'invention liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort ; et b) transfection de la cellule végétale ou de la plante avec les agrobactéries obtenues à l'étape a). De préférence, les agrobactéries utilisables dans l'étape a) sont choisies parmi les souches LBA4404, GV3101, EHA 101/105 et C58. De préférence, le vecteur d'expression utilisé dans l'étape a) comprend : - des éléments d'ADN procaryote codant pour une origine de réplication bactérienne et un gène de résistance à un antibiotique ; au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase selon l'invention liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort, de préférence un promoteur 35S ; une cassette d'expression permettant l'expression d'un inhibiteur du silencing, de préférence p19 ; et des éléments d'ADN qui contrôlent le traitement des transcrits, comme des séquences de terminaison / polyadénylation, de préférence la séquence Tnos. La transformation de l'étape a) se fait typiquement par des méthodes connues de l'art antérieur, par exemple par chocs thermiques avec passages successifs à 4°C, -80°C et 37°C. La transfection de l'étape b) comprend de préférence les étapes suivantes : b1) culture de la cellule végétale ou de la plante, en aéroponie ou en hydroponie, et sous éclairage LEDs, de préférence pendant cinq semaines en hydroponie sur des flotteurs libres, b2) agroinfiltration de la cellule végétale ou plante obtenue en b1) sous vide, par les agrobactéries obtenues à l'étape a). Cette étape d' agroinfiltration est, de préférence, réalisée sous vide par effet Venturi. b3) remise en culture de la cellule végétale ou de la plante obtenue en b2), typiquement pendant 3 à 6 jours. Enfin, de préférence, la pectate lyase selon l'invention ainsi produite est extraite et purifiée. Les exemples qui suivent, illustrent, mais ne visent pas à limiter la portée de l'invention. Il sera évident pour l'homme de l'art que des variantes et modifications sont possibles et entrent dans le cadre et l'esprit de l'invention. Les légendes des figures sont les suivantes : Figure 1 : Représentation schématique des différentes cassettes permettant de produire une pectate lyase Amb a 1 mature et active (A, B, C, F et G) ou la sous-unité alpha (E et I) ou la sous-unité bêta (D et H), en utilisant soit le peptide signal et le propeptide naturel de la protéine (A-F), soit le peptide signal de la chitinase de tabac et un propeptide de la famille des peptidases C lA (G-I) afin d'augmenter les rendements. La pectate lyase est également produite sous forme mutée sur la lysine 180 (K180) afin de limiter la protéolyse permettant la production des sous-unités alpha et bêta (F). A (SEQ ID NO :1): ADNc codant pour la préproprotéine naturelle (de séquence SEQ ID NO :7). Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265, B (SEQ ID NO : 2): ADNc optimisé pour une utilisation chez N.benthamiana, codant pour la préproprotéine naturelle (de séquence SEQ ID NO :7). Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265, C (SEQ ID NO : 3): ADNc harmonisé codant pour la forme la préproprotéine naturelle (de séquence SEQ ID NO :7). Cet ADNc contient des codons optimisés pour une utilisation chez N.benthamiana, mais comprend également des codons rares, afin de préserver le rythme de synthèse de la protéine pour une meilleure conservation de la structure 3D. Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265, D (SEQ ID NO : 4) : ADNc natif/optimisé/harmonisé codant pour la sous-unité bêta (de séquence SEQ ID NO :8). Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265. E (SEQ ID NO : 5) : ADNc natif/optimisé/harmonisé codant pour la sous-unité alpha (de séquence SEQ ID NO :9). Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265. F : ADNc natif/optimisé/harmonisé codant pour la forme mutée (K180) de la protéine. Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265. G : ADNc natif/optimisé/harmonisé codant pour la forme mature de la protéine fusionnée à la séquence signal de la chitinase de tabac (Neuhaus, J.-M., 1996) et au propeptide Der pl (p08176 - aa 19 à 98 ou SEQ ID NO :6). Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265. H : ADNc natif/optimisé/harmonisé codant pour la sous-unité bêta de la protéine fusionnée à la séquence signal de la chitinase de tabac (Neuhaus, J.-M., 1996) et au propeptide Der pl (p08176 - aa 19 à 98 ou SEQ ID NO :6). Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265. I : ADNc natif/optimisé/harmonisé codant pour la sous-unité alpha de la protéine fusionnée à la séquence signal de la chitinase de tabac (Neuhaus, J.-M., 1996) et au propeptide Der pl (p08176 - aa 19 à 98 ou SEQ ID NO :6). Cet ADNc pourra être fusionné à des signaux d'adressage décrits dans la demande W02008/056265. Figure 2: La plateforme AllergoPur utilisée pour l'expression et la production des différentes formes de pectate lyase selon l'invention. Figure 3: Expression de la protéine Amb a 1. Les protéines extraites de plantes transfectées par l'ADNc natif (F1-F3), par l'ADNc optimisé (F4-F6) ou par l'ADNc harmonisé (F7-F9) codant la protéine Amb a 1 ont été séparées par SDS-PAGE et analysées immmuno-détection avec un anticorps dirigé contre une étiquette Flag. L'analyse par immuno-détection met en évidence la production spécifique de la protéine Amb a 1 et de la sous-unité alpha. La sous-unité bêta clivée n'est pas immunodétectée sur ce blot. Figure 4: Purification de l'allergène Amb a 1. Les protéines extraites de plantes ont été transfectées sous vide avec l'ADNc harmonisé codant la protéine Amb a 1 par chromatographie IMAC. Puis les fractions retenues sur la colonne ont été analysées par électrophorèse SDS-PAGE. Compte tenu de la position C-terminale du Flag, deux polypeptides correspondant à la forme précurseur (préproprotéine) (Amb a 1p) et à la sous-unité alpha sont purifiés à partir de l'extrait transfecté par l'ADNc complet (piste 3). Ces deux polypeptides (Amb a 1 alpha et Amb a 1p) sont ensuite séparés (pistes 4 et 5 respectivement) par chromatographie de tamisage moléculaire. Les deux polypeptides produits présentent une mobilité électrophorétique légèrement plus faible que les protéines natives. Cette différence s'explique par la présence du flag en position C-terminale. Figure 5 : Expression de l'allergène Amb a 11. Les protéines extraites de 3 plantes (P1 P3) transfectées par l'ADNc codant l'allergène Amb a 11 ont été séparées par électrophorèse SDS-PAGE. Les extraits protéiques sont analysés dès leur extraction (OH) ou après une incubation de 12h (12H) à température ambiante. L'incubation à température ambiante met en évidence l'accumulation de deux polypeptides correspondant à Amb a 11, ainsi que la dégradation quasi-totale des protéines de N.benthamiana. L'allergène Amb a 11 est donc produit sous forme active selon le même procédé que celui décrit présentement pour Amb a 1. EXEMPLE : Design moléculaire et synthèse de gène Les ADNc sont synthétisés sous forme native, en optimisant l'usage des codons pour leur reconnaissance par le système végétal ou en harmonisant l'usage de codons (réintroduction de codons rares pour rythmer la synthèse de la protéine). Dans le cadre de cette invention, l'optimisation préférée est l'optimisation pour une expression chez Nicotiana benthamiana, comme indiqué en Figure 1. Préparation des plasmides Des sites de restriction Xba I/kpn I et Sal I/Sac I sont respectivement intégrés aux extrémités 5' et 3' de l'ADNc lors de la synthèse. Ces sites sont ensuite utilisés afin de cloner les ADNc dans le vecteur binaire d'expression pAGO1 (Figure 1). Les ADNc sont clonés en amont d'un promoteur 35S (35S) et en aval d'une séquence de terminaison de la nopaline synthase (Tnos) ; le vecteur pAGO1 contient en outre une cassette d'expression permettant d'exprimer l'inhibiteur de silencing p19 simultanément de la protéine recombinante afin d'augmenter les rendements de production. Les vecteurs sont ensuite utilisés pour transformer la souche LBA4404 d'Agrobacterium tumefaciens. Expression transitoire de pectates lyases selon l'invention dans des feuilles de Nicotiana 30 benthamiana - Utilisation de la plateforme AllergoPur Pour la production par expression transitoire Agobacterium tumefaciens LBA4404 est utilisé pour le transfert d'un ADNc codant la pectate lyase sans que le gène d'intérêt soit intégré dans le génome de la cellule végétale : on parle ici de transfection et non de transgenèse. Les plantes sont cultivées en condition hydroponique en présence d'un milieu nutritif (GHE, floragrow, floramicro, florabloom, 10mL/ 15mL/ 5mL pour 10 L d'eau osmosée) et sous éclairage LED. L'agrobactérie est transférée dans le tissu foliaire par agro-infiltration selon deux procédés. Pour la production de petits lots de pectates lyases destinés au criblage de prototypes, les agrobactéries sont injectées manuellement grâce à une seringue appliquée contre l'épiderme de la face inférieure de la feuille. Des disques foliaires prélevés dans les feuilles 4 à 6 jours après l'agro-infiltration sont utilisés pour l'analyse des différents prototypes de pectates lyases. Cette étape de criblage permet de définir le vecteur d'expression qui sera utilisé pour l'obtention d'une pectate lyase de qualité optimale. Le même procédé est utilisé pour la production commerciale à grande échelle mais, dans ce cas, l'agro-infiltration s'effectue sous vide, dans des enceintes contenant plusieurs litres d'une culture d' agrobactéries et où plusieurs dizaines de plantes sont infiltrées simultanément. Ces plantes sont ensuite remises en culture pendant 4 à 6 jours avant la purification des pectates lyases à partir des extraits foliaires (Figure 2). Expression de la pectate lyase Amb a 1 et de ses sous-unités L'expression des protéines ainsi que les rendements sont respectivement analysés par Western blotting et ELISA. Les résultats sont illustrés pour les 3 formes d'ADNc codant la protéine naturelle (Figure 3). Les protéines exprimées sont actives. En effet, l'expression d'Amb a 1 provoque des nécroses importantes dès le 4ème jour d'expression comparé à des plantes contrôles. Ces nécroses sont dues à une forte activité pectate lyase (Liu et al, 2010). Purification et caractérisation Comme l'illustre la figure 4, les pectates lyases sont extraites à partir de la biomasse fraîche ou congelée puis purifiées sur colonne IMAC (HisTrap Excell). Cette purification permet la production de la forme précurseur (préproprotéine) et de la sous-unité alpha. Enfin, comme le montre la figure 5, il est possible de combiner les allergènes Amb a 1 et Amb a 11 obtenus par le procédé selon l'invention, pour obtenir une composition utilisable en immunothérapie allergique. REVENDICATIONS1. Cellule végétale comprenant une molécule d'ADN comprenant au moins une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase choisie parmi Amb a 1, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1, et les homologues d'Amb a 1, liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort. 2. Cellule végétale selon la revendication 1, dans laquelle ladite molécule d'ADN n'est pas intégrée dans le génome de la cellule végétale. 3. Cellule végétale selon l'une des revendications 1 ou 2, dans laquelle la pectate lyase est choisie parmi Amb a 1.0101, Amb a 1.0201, Amb a 1.0202, Amb a 1.0301, Amb a 1.0302, Amb a 1.0303, Amb a 1.0304, Amb a 1.0305, Amb a 1.0401, Amb a 1.0402, Amb a 1.0501, Amb a 1.0502, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1 et les protéines de la famille des Astéracées qui présentent au moins 57% d'identité, de préférence au moins 60% d'identité, de préférence au moins 64% d'identité, avec l'une des isoformes d'Amb a 1. 4. Cellule végétale selon l'une des revendications 1 à 3, dans laquelle la pectate lyase est choisie parmi Amb a 1.0101, Amb a 1.0201, Amb a 1.0202, Amb a 1.0301, Amb a 1.0302, Amb a 1.0303, Amb a 1.0304, Amb a 1.0305, Amb a 1.0401, Amb a 1.0402, Amb a 1.0501, Amb a 1.0502, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1 et les protéines d'Artemisia vulgaris, d'Ambrosia psilostachya ou d'Ambrosia trifida, qui présentent au moins 57% d'identité, de préférence au moins 60% d'identité, de préférence au moins 64% d'identité, avec l'une des isoformes d'Amb a 1. 5. Cellule végétale selon l'une des revendications 1 à 4, dans laquelle la séquence nucléotidique hétérologue comprend une séquence codant le peptide signal, une séquence codant le propeptide et une séquence codant la pectate lyase mature. 6. Cellule végétale selon la revendication 5, dans laquelle : - le peptide signal est choisi parmi le peptide signal naturel de la pectate lyase et le peptide signal de la chitinase de tabac ; et - le propeptide est choisi parmi les propeptides naturels de pectates lyases et les propeptides de peptidases ClA. 7. Cellule végétale selon l'une des revendications 1 à 6, dans laquelle la séquence nucléotidique hétérologue comprend en outre une séquence peptidique d'adressage intracellulaire qui cible la pectate lyase sous forme soluble ou membranaire vers le réticulum endoplasmique ou les différents compartiments constitutifs du système endomembranaire de sécrétion de la cellule végétale. 8. Cellule végétale selon l'une des revendications 1 à 7, qui comprend un vecteur d'expression comprenant : - des éléments d'ADN procaryote codant pour une origine de réplication bactérienne et un gène de résistance à un antibiotique ; - la séquence nucléotidique hétérologue telle que définie dans l'une des revendications précédentes ; - une cassette d'expression permettant l'expression d'un inhibiteur du silencing, de préférence p19 ; et des éléments d'ADN qui contrôlent le traitement des transcrits, comme des séquences de terminaison / polyadénylation, de préférence la séquence Tnos. 9. Plante comprenant au moins une cellule végétale selon l'une des revendications 1 à 8. 10. Procédé de production d'une pectate lyase choisie parmi Amb a 1, la sous-unité alpha d'Amb a 1, la sous-unité bêta d'Amb a 1 et les homologues d'Amb a 1, comprenant l'expression de ladite pectate lyase dans une cellule végétale selon l'une des revendications 1 à 8, ou dans une plante selon la revendication 9. 11. Procédé de production d'une pectate lyase selon la revendication 10, comprenant les étapes suivantes : a) transformation d' agrobactéries avec un vecteur d'expression comprenant une séquence nucléotidique hétérologue codant pour une préproprotéine d'une pectate lyase liée de manière fonctionnelle à un promoteur fort ; et b) transfection de la cellule végétale ou de la plante avec les agrobactéries obtenues à l'étape a). 18 3021328 12. Procédé de production d'une pectate lyase selon la revendication 11, dans lequel les agrobactéries utilisées dans l'étape a) sont choisies parmi les souches LBA4404, GV3101, EHA 101/105 et C58, et dans lequel la transfection de l'étape b) comprend de préférence les étapes suivantes : b1) culture de la cellule végétale ou de la plante, en aéroponie ou en hydroponie, et sous éclairage LEDs, de préférence pendant cinq semaines en hydroponie sur des flotteurs libres, b2) agroinfiltration de la cellule végétale ou plante obtenue en b1) sous vide, par les agrobactéries obtenues à l'étape a) ; et b3) remise en culture de la cellule végétale ou de la plante obtenue en b2), typiquement pendant 3 à 6 jours. 13. Pectate lyase susceptible d'être obtenue par le procédé selon l'une des revendications 10 à 12. 14. Pectate lyase selon la revendication 13, pour son utilisation comme médicament. 15. Pectate lyase selon la revendication 13 pour son utilisation en immunothérapie allergique, seule ou en combinaison avec au moins un autre allergène d'Astéracée.20