Brevet FR2982278A1 — publié le 20130510

REVENDICATIONS1. Procédé de classification d'un échantillon de tissu fixé et inclus en paraffine, dans lequel on détermine si ledit échantillon à tester, désigné échantillon «j », est d'une qualité suffisante pour une étude de l'expression génique par quantification de son ARN, ledit procédé comprenant la comparaison du niveau d'expression de n gènes de référence dans ledit échantillon «j » par rapport au niveau d'expression contrôle desdits n gènes de référence. 2. Procédé selon la revendication 1, ledit procédé comprenant : - la détermination du niveau d'expression desdits n gènes de référence dans 15 l'échantillon «j » à tester, et - la détermination de la déviation n si 2 20 253. 4. 30 5. où n est le nombre de gènes de références, pi et o sont respectivement la moyenne et la déviation standard pour l'expression d'un gène « i » de référence établies au préalable ou évaluées sur un jeu d'échantillons contrôles de bonne qualité ; xd est le niveau d'expression dudit gène i évaluée dans l'échantillon «j », la valeur de la déviation indiquant si l'échantillon «j » est de qualité suffisante pour une étude de l'expression génique ou une analyse transcriptomique. Procédé selon la revendication 1 ou 2, dans lequel l'échantillon de tissu est un échantillon de tissu tumoral. Procédé selon la revendication 3, dans lequel l'échantillon de tissu est un échantillon de mélanome. Procédé selon la revendication 4, dans lequel n est supérieur ou égal à 4, et lesdits n gènes de référence comprennent au moins les gènes de l'actine, HPRT, TBP et TRFC.6. Procédé selon la revendication 5, dans lequel n=4 et lesdits gènes de références sont les gènes de l'actine 13, HPRT, TBP et TRFC. 7. Procédé selon la revendication 6, dans lequel les valeurs p et a pour chacun desdits gènes de référence sont p = 8.15 et a = 1.86 pour le gène de l'actine [3 ; p = -15.06 et a= 2.03 pour le gène de HPRT ; p = -2.55 et a= 1.41 pour le gène TBP p = -14.34 et a = 1.91 pour le gène TRFC. 8. Procédé selon la revendication 3, dans lequel l'échantillon de tissu est un échantillon de tissu tumoral de sein, de rein ou de poumon, ou de cancer du colon, de la prostate, gastrique, du pancréas, de col de l'utérus, des ovaires, du foie, de la vessie, de la thyroïde, du cerveau, ou encore une hémopathie maligne. 9. Procédé selon l'une des revendications 1 à 8, dans lequel l'expression des gènes de référence est quantifiée par RT-PCR quantitative. 10. Procédé selon l'une des revendications 1 à 9, dans lequel l'échantillon de tissu fixé et inclus en paraffine est un échantillon de tissu fixé par du formol.