Brevet FR2899239A1 — publié le 20071005

Procédé de détection du cancer La présente demande concerne des méthodes et compositions utilisables pour la détection du cancer chez les mammifères, en particulier les humains. Elle décrit notamment des marqueurs sériques des cancers et leurs utilisations dans des méthodes de diagnostic. Elle concerne également des outils et/ou kits utilisables pour la mise en oeuvre de ces méthodes (réactifs, sondes, amorces, anticorps, puces, cellules, etc.), leur préparation et leurs utilisations. L'invention est utilisable pour détecter la présence ou l'évolution d'un cancer chez les mammifères, notamment du cancer du sein, y compris en phase précoce. Chez la femme, le cancer du sein est la première cause de mortalité par cancer dans les pays industrialisés. L'âge est le facteur de risque le plus important. Ainsi, le risque augmente de 0,5% par année d'âge dans les pays occidentaux. D'autres facteurs de risques sont connus tels que le nombre des grossesses et l'âge de la première grossesse, l'allaitement, l'âge de la puberté et de la ménopause, les traitements oestrogéniques après la survenue de la ménopause, le stress et la nutrition. Le diagnostic du cancer du sein est généralement effectué par mammographie. Toutefois, il est estimé que la taille minimale d'une tumeur repérable par mammographie est de 1 cm, ce qui présente un passé évolutif de 8 ans en moyenne lors du diagnostic. Les petites tumeurs sont beaucoup moins malignes que ce que l'on peut extrapoler de leurs tailles : l'agressivité des grosses tumeurs ne vient pas seulement de leurs tailles, mais aussi de leur agressivité inhérente , qui augmente avec Page d'une tumeur (Bucchi et al., Br J Cancer 2005, p. 156-161 ; Norden T, Eur J Cancer 1997, p. 624-628). Le bénéfice d'une mammographie a été démontré sur des centaines de milliers de patientes ces 30 dernières années. Toutefois, des biais existent dans ces tests, tels que une dépendance de la sensibilité à l'age, à la prise d'hormones, au nombre de mammographies effectuées, à l'expérience du médecin et autres (voir Fletcher and Elmore, NEJM 2003, p. 1672f or Baines CJ, Breast J 2005, S7-10). L'analyse de l'expression d'un panel de gènes cibles est également pertinente dans la lutte contre le cancer du sein, et on peut citer notamment l'analyse d'un panel de 176 gènes qui sont exprimés de manière différentielle entre des patientes exprimant le récepteur ER et des patientes n'exprimant pas le récepteur ER (Bertucci et al, Human Molecular Genetics, 2000 ; 9 : 2981-2991). On peut citer également l'analyse d'un panel de 37 gènes qui permet de diagnostiquer un cancer du sein d'une façon précoce (Sharma et al, , Breast cancer Research 2005, 7 : R634-R644). Toutefois, les patientes incluses dans cette étude avaient toutes des soupçons d'une maladie mammaire ( suspect initial mammogram ), et ce panel de gènes pourrait être mal adapté pour un test de routine de diagnostic du cancer du sein préalablement à toute mammographie. Il existe donc un besoin important de disposer d'outils et de tests diagnostiques capables de détecter le cancer de manière fiable, simple et à un stade précoce. La présente demande fournit un ensemble de marqueurs biologiques qui peuvent être utilisés, seuls ou en combinaison(s), de préférence en combinaison(s), pour détecter, caractériser ou suivre, de manière fiable, la présence ou l'évolution d'un cancer chez un mammifère, de préférence le cancer du sein. L'invention est particulièrement avantageuse dans la mesure où elle peut être mise en oeuvre à partir de sang total, sans nécessiter de biopsie tissulaire ni d'étapes de séparations. Plus particulièrement, la présente demande résulte de l'identification de marqueurs génétiques sériques caractéristiques de patientes humaines présentant un cancer du sein. Ces marqueurs correspondent par exemple à des variations d'épissage ou de niveaux d'expression de gènes, et peuvent permettre, seuls ou, avantageusement, en combinaison, de détecter chez des patients la présence ou le stade d'évolution d'un cancer. Ils permettent avantageusement de détecter la présence d'un cancer du sein, dès les phases précoces de celui-ci (c'est-à-dire notamment à un stade où une mammographie serait inefficace), de manière fiable et simple, à partir d'un échantillon de sang total. Un objet de la présente demande concerne une méthode pour détecter (in vitro ou ex vivo) la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, d'une, de préférence plusieurs molécules cibles choisies parmi: a) les acides nucléiques comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NOs: 1- 376 ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire d'une séquence selon a), c) les analogues fonctionnels d'acides nucléiques selon a) ou b), ou d) les polypeptides codés par les acides nucléiques selon a) à c), la présence (ou l'absence ou la quantité (relative)) de telles molécules cibles dans l'échantillon étant une indication de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. Dans une variante particulière de mise en oeuvre, la méthode comprend la détermination combinée de la présence ou absence ou quantité (relative) d'au moins 5, 10, 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70 ou plus des molécules cibles telles que définies ci-dessus. La détermination "combinée" désigne le fait qu'un profil d'hybridation (ou une signature) impliquant plusieurs marqueurs est déterminé. La détermination combinée est typiquement réalisée de manière simultanée, c'est-à-dire par mesure globale d'un profil d'expression. Néanmoins, la détermination combinée peut également être effectuée par mesures en parallèle ou séquentielle de plusieurs marqueurs, conduisant à l'identification d'un profil. L'invention permet en effet d'établir et de déterminer un profil d'hybridation (ou une signature) sur un ensemble de marqueurs, afin d'évaluer la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère. Le profil d'hybridation est typiquement réalisé en utilisant une combinaison de plusieurs marqueurs choisis par les cibles indiquées ci-dessus, par exemple contenant l'ensemble de ces cibles. Dans un mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, d'au moins 10 molécules cibles distinctes choisies parmi celles définies ci-dessus. Dans des modes préférés de mise en oeuvre, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, de sous-ensembles particuliers de molécules cibles choisies parmi celles définies ci-dessus. De tels sous-ensembles, décrits dans les exemples, sont particulièrement adaptés à la détection, notamment en phase précoce, de la présence d'un cancer du sein chez des patientes à partir d'un échantillon de sang total. Ainsi, dans un mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, des acides nucléiques de l'ensemble d'un panel de cibles (ou signatures) comprenant des marqueurs tels que définis aux éléments a) à d) ci-dessus. Ainsi, dans un mode particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, de l'ensemble des acides nucléiques du Panel 1, comprenant les séquences représentées dans le Tableau 4, colonne 1, ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, des acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 18, 19, 23, 26, 51, 52, 53, 54, 55, 69, 80, 125, 145, 148, 225, 228, 240 et 312 (PANEL 2) ou un fragment distinctif de cellesci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, des acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 18, 19, 23, 26, 27, 51, 52, 53, 54, 55, 69, 80, 125, 145, 148, 161, 188, 225, 228, 240, 280 et 312 (PANEL 3) ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, des acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 13, 16-19, 23, 26-28, 47, 51-55, 58, 69, 80, 81, 89, 116, 121, 125, 145, 148, 158, 160, 161, 164, 189, 190, 225, 229, 240, 248, 280, 281, 284, 299, 300, 310 et 312 (PANEL 4) ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, des acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 7, 13, 14, 16-19, 23-28, 47, 51-55, 58, 69, 80, 81, 89, 116, 121, 125, 137, 139, 145, 148, 158, 160, 161, 164, 189, 190, 225, 228, 229, 240, 245, 248, 252, 280, 281, 284, 290, 298-300, 310 et 312 (PANEL 5) ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, des acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 5, 7, 13, 14, 16-20, 23-28, 47, 51-55, 58, 64, 69, 80, 81, 88-90, 116, 121, 125, 137, 139, 145, 148, 158, 160, 161, 164, 188-191, 208, 222, 225, 228, 229, 236, 240, 242, 245, 248, 252, 280, 281, 284, 290, 298-300 et 309-312 (PANEL 6) ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, de l'ensemble des acides nucléiques du Panel 7, comprenant les séquences représentées dans le Tableau 4, colonne 2, ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, de l'ensemble des acides nucléiques du Panel 8, comprenant les séquences représentées dans le Tableau 4, colonne 3, ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un autre mode de mise en oeuvre particulier, la méthode de l'invention comprend la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, de l'ensemble des acides nucléiques du Panel 9, comprenant les séquences représentées dans le Tableau 4, colonne 4, ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou ayant une séquence complémentaire de celles-ci et/ou des analogues fonctionnels de ceux-ci provenant d'autres espèces, et/ou des polypeptides codés par ces acides nucléiques. Les exemples fournis dans la présente demande montrent en effet que ce panel de marqueurs permet de détecter de manière prédictive la présence, le risque de développer ou le stade d'évolution d'un cancer. Dans un mode particulier, la méthode comprend en outre la détection d'une ou plusieurs des autres molécules cibles telles que définies précédemment. Dans un mode spécifique de mise en oeuvre, la méthode de l'invention comprend la détermination de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du mammifère, des acides nucléiques comprenant respectivement les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 1-376 ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, ou des acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de celles-ci. Par ailleurs, l'analyse des différents gènes identifiés dans l'invention, dont l'expression est altérée chez les patients, montre qu'ils appartiennent à des familles de gènes impliquées dans des voies de signalisation cellulaire ou dans des mécanismes de régulation communs. Ainsi notamment, cette analyse fait apparaître de nombreux gènes impliqués dans les cascades de signalisation mises en oeuvre dans la transduction des messages initiés par la stimulation des TLRs, dans la sécrétion de cytokines ou dans l'activation des lymphocytes T. L'invention met ainsi en évidence que des altérations dans ces cascades de signalisation se produisent chez les patients atteints de cancer, et que tout gène ou ARN participant à ces cascades ou toute dérégulation dans ces gènes ou ARN peut constituer un marquer de la présence ou de la prédisposition au cancer. De telles altérations peuvent se produire lors du stress oxydatif imposé par les cellules tumorales aux monocytes, aux macrophages et aux cellules dendritiques. Ce stress fait partie des conséquences des différentes interactions cellulaires qui se produisent entre le système immunitaire et les cellules cancéreuses au niveau de la tumeur. La mise en évidence, dans la circulation sanguine, d'évènements moléculaires révélateurs des altérations des cascades de signalisation impliquées dans les réponses immunitaires représente donc un nouvel outil et une nouvelle approche permettant de mettre en évidence la présence d'une tumeur dans l'organisme à partir d'un prélèvement sanguin. Ainsi, un objet particulier de l'invention concerne une méthode pour détecter (in vitro ou ex vivo) la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence) dans un échantillon biologique du mammifère, de préférence dans un échantillon (dérivé) de sang, d'une altération dans un gène ou ARN participant à une voie de signalisation impliquée dans la réponse immunitaire (innée ou acquise), la présence d'une telle altération étant indicative de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. La voie de signalisation impliquée dans la réponse immunitaire est avantageusement choisie parmi la stimulation des TLRs, la sécrétion de cytokines, ou l'activation des lymphocytes T. La stimulation première des cellules dendritiques représente la réponse innée et se fait par l'intermédiaire des récepteurs toll-like (TLRs). De multiples TLRs réagissent à différents ligands qui peuvent être portés par des pathogènes ou des cellules tumorales et induisent la production de différentes cytokines pro-inflammatoires par les cellules dendritiques. Ce phénomène s'accompagne d'une présentation des antigènes aux cellules T naïves, initiant ainsi une réponse immunitaire acquise spécifique. Parmi les acteurs moléculaires de ces cascades de signalisation, on peut ainsi citer préférentiellement les récepteurs, les adaptateurs, les enzymes, les facteurs impliqués dans la régulation de l'expression des gènes, les chemokines, les cytokines et les interleukines. Un objet particulier de l'invention réside dans une méthode pour détecter in vitro ou ex vivo la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence) dans un échantillon biologique du mammifère, de préférence dans un échantillon (dérivé) de sang, d'une altération dans un gène ou ARN impliqué dans la régulation de la cascade de signalisation contrôlant le phénomène de l'immunité innée. Plus particulièrement, ce phénomène mobilise la cascade initiée par les TLRs et régule l'activité des cellules macrophagiques et dendritiques. Un autre objet particulier de l'invention réside dans une méthode pour détecter in vitro ou ex vivo la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence) dans un échantillon biologique du mammifère, de préférence dans un échantillon (dérivé) de sang, d'une altération dans un gène ou ARN impliqué dans la régulation de la cascade de signalisation contrôlant le phénomène de l'immunité acquise ou adaptative. Plus particulièrement, ce phénomène implique les récepteurs des lymphocytes T (TCRs). Encore un autre objet particulier de l'invention réside dans une méthode pour détecter in vitro ou ex vivo la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence) dans un échantillon biologique du mammifère, de préférence dans un échantillon (dérivé) de sang, d'une altération dans un gène ou ARN impliqué dans la transition, la coordination entre les immunités innées et acquises. Plus particulièrement ces gènes sont impliqués dans la biosynthèse de molécules lipidiques à partir de précurseurs tels que l'acide arachidonique. Un objet particulier de l'invention réside donc dans une méthode pour détecter (in vitro ou ex vivo) la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence) dans un échantillon biologique du mammifère, de préférence dans un échantillon (dérivé) de sang, d'une altération dans un gène ou ARN impliqué dans la stimulation des TLRs, dans la sécrétion de cytokines, ou dans l'activation des lymphocytes T, ledit gène ou ARN étant avantageusement sélectionné parmi les récepteurs, les adaptateurs, les enzymes, les facteurs impliqués dans la régulation de l'expression des gènes, les chemokines, les cytokines et les interleukines, la présence d'une telle altération étant indicative de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. L'altération dans un gène ou ARN désigne au sens de l'invention toute altération de l'expression, à savoir en particulier une dérégulation dans l'épissage conduisant à l'apparition de formes épissées particulières, ou à une modification de la quantité (relative) ou du rapport entre les différentes formes d'épissage. Comme il sera décrit dans la suite du texte, la présente demande décrit l'identification de dérégulations de l'épissage des acteurs des cascades de signalisation impliquées dans les immunités innées et acquises dans le sang de patients atteints de cancer (Tableau 5). Des oligonucléotides, dérivés des séquences d'ARN dont les expressions sont affectées par altération de l'épissage peuvent être déposés ou synthétisés sur tout support solide et hybridés avec des sondes nucléiques dérivées de sang contrôle et de sang de patients atteints de cancer permettant de sélectionner les oligonucléotides les plus discriminants. De façon plus large, les oligonucléotides peuvent être choisis comme représentatifs de tout ARNm codant pour toute protéine impliquée dans les immunités innées et acquises. Plus particulièrement, ces oligonucléotides peuvent dériver des gènes indiqués dans le tableau 6. Lezs altérations peuvent également être détectées au niveau de la structure ou des niveaux d'expression des polypeptides codés par ces gènes ou ARN, par exemple au moyen d'anticorps spécifiques, comme il sera décrit en détails dans la suite du texte. Un objet particulier de l'invention réside donc dans une méthode pour détecter (in vitro ou ex vivo) la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence) dans un échantillon biologique du mammifère, de préférence dans un échantillon (dérivé) de sang, d'une altération dans au moins un, de préférence au moins 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ou 10 gènes ou ARN correspondants indiqués dans le Tableau 5, en particulier d'un altération de l'épissage d'un tel gène ou ARN, la présence d'une telle altération étant une indication de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. Un autre objet particulier de l'invention réside donc dans une méthode pour détecter (in vitro ou ex vivo) la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détermination de la présence (ou de l'absence) dans un échantillon biologique du mammifère, de préférence dans un échantillon (dérivé) de sang, d'une altération dans au moins un, de préférence au moins 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ou 10 gènes ou ARN correspondants indiqués dans le Tableau 6, en particulier d'un altération de l'épissage d'un tel gène ou ARN, la présence d'une telle altération étant une indication de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. Molécule Cible La présente invention repose sur la mise en évidence et la caractérisation d'événements biologiques sériques caractéristiques de la présence d'un cancer du sein chez un patient humain. Ces événements constituent des biomarqueurs, dont la détection chez un patient permet, de préférence en combinaison, de déterminer, même à un stade précoce, le risque de développer un tel cancer ou la présence d'un tel cancer. Les événements biologiques identifiés correspondent typiquement à des modifications dans la régulation de l'expression de gènes. Il peut s'agir d'une inhibition partielle ou totale de l'expression de gènes ou d'ARN, ou de certaines formes de gènes ou d'ARN, d'une augmentation de l'expression de gènes ou de certaines formes de gènes ou d'ARN, de l'apparition ou de la disparition de formes d'épissages de gènes, etc. L'invention repose donc sur la détection, dans un échantillon, d'une ou plusieurs molécules cibles représentatives des événements biologiques ainsi identifiés. Comme indiqué précédemment, ces molécules cibles peuvent être choisies parmi : a) les acides nucléiques comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NOs: 1-20 376 ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, b)les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire d'une séquence selon a), c) les analogues fonctionnels d'acides nucléiques selon a) ou b), ou 25 d) les polypeptides codés par les acides nucléiques selon a) à c). La molécule cible peut être la séquence complète du gène ou de l'ARN ou de la protéine correspondant aux séquences SEQ ID NOs: 1-376, ou un fragment distinctif de celle-ci, c'est-à-dire un fragment dont la séquence est spécifique dudit gène ou ARN, ou de la dite 30 protéine, et/ou comporte un domaine de variabilité (épissage, délétion, polymorphisme, etc.) représentatif de l'événement biologique à détecter. La liste complète des marqueurs, ainsi que les gènes correspondants sont indiqués dans le tableau 1. 12 Le terme analogue fonctionnel désigne un analogue provenant d'une autre espèce de mammifère. En effet, les séquences SEQ ID NOs: 1-376 ont été identifiées à partir de sujets humains, et ces séquences constituent des marqueurs efficaces et adaptés à la détection du cancer chez les patients humains. Néanmoins, pour une application des méthodes de l'invention à d'autres espèces de mammifères, il est généralement préférable d'utiliser des analogues fonctionnels de ces séquences, caractérisés dans l'espèce considérée. Ces analogues peuvent être identifiés par toute technique connue de l'homme du métier, notamment en considération des séquences fournies dans la demande et des noms des gènes correspondants. Dans un mode de réalisation particulier, la méthode comprend la détermination de la présence d'au moins un acide nucléique selon a) à c). Dans un mode de réalisation tout particulier, la méthode est utilisée pour détecter un cancer chez un sujet humain et comprend la détermination de la présence d'au moins un acide nucléique selon a) ou b). Plus préférentiellement encore, la méthode comprend la détection combinée de la présence ou absence d'un panel de marqueurs cibles, tels que définis dans la présente demande (Panels 1 à 9 ou Tableaux 5 et 6). Un mode de réalisation particulier de l'invention réside dans une méthode pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer du sein chez un mammifère, comprenant la détermination combinée de la présence ou de la quantité, dans un échantillon de sang du mammifère, d'un ensemble de molécules comprenant au moins les molécules cibles suivantes: a) les acides nucléiques comprenant les séquences du PANEL 1 représentées dans le Tableau 4, colonne 1, ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, et/ou b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de séquences selon a), 30 et/ou c) les analogues fonctionnels des acides nucléiques selon a) ou b) provenant d'une autre espèce, et/ou d) les polypeptides codés par les acides nucléiques selon a) à c), la présence de telles molécules cibles dans l'échantillon étant une indication de la présence ou du risque de développer un cancer du sein chez ce mammifère. Un mode de réalisation particulier de l'invention réside dans une méthode pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer du sein chez un mammifère, comprenant la détermination combinée de la présence ou de la quantité, dans un échantillon de sang du mammifère, des molécules cibles suivantes: a) les acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 18, 19, 23, 26, 51, 52, 53, 54, 55, 69, 80, 125, 145, 148, 225, 228, 240 et 312 (PANEL 2) ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, et/ou b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de séquences selon a), et/ou c) les analogues fonctionnels des acides nucléiques selon a) ou b) provenant d'une autre espèce, et/ou d) les polypeptides codés par les acides nucléiques selon a) à c), la présence de telles molécules cibles dans l'échantillon étant une indication de la présence ou du risque de développer un cancer du sein chez ce mammifère. Un autre objet spécifique de l'invention réside dans une méthode pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer du sein chez un mammifère, comprenant la détection, dans un échantillon de sang du mammifère, des molécules cibles suivantes: a) les acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 18, 19, 23, 26, 51, 52, 53, 54, 55, 69, 80, 125, 145, 148, 225, 228, 240 et 312 (PANEL 2) ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, et/ou b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de séquences selon a), et/ou c) les analogues fonctionnels des acides nucléiques selon a) ou b) provenant d'une autre espèce, et/ou d) les polypeptides codés par les acides nucléiques selon a) à c), la présence, l'absence ou la quantité (relative) de ces molécules cibles dans l'échantillon étant une indication de la présence ou du risque de développer un cancer du sein chez ce mammifère. Détection d'un acide nucléique Différentes techniques permettant la détection d'une espèce d'acide nucléique dans un échantillon sont utilisables dans la présente invention, comme par exemple le Northern Blot, l'hybridation sélective, l'utilisation de supports revêtus d'oligonucléotides sondes, l'amplification d'acide nucléique comme par exemple par RT-PCR, PCR quantitative ou ligation-PCR, etc. Ces méthodes peuvent comprendre l'utilisation d'une sonde nucléique (par exemple un oligonucléotide) capable de détecter sélectivement ou spécifiquement l'acide nucléique cible dans l'échantillon. L'amplification peut être réalisée selon différentes méthodes connues en soi de l'homme du métier, telles que la PCR, la LCR, l'amplification médiée par transcription (TMA), l'amplification par déplacement de brin (SDA), NASBA, l'emploi d'oligonucléotides spécifiques d'allèles (ASO), l'amplification spécifique d'allèle, le Southern blot, l'analyse conformationnelle SSCA, l'hybridation in situ (e.g., FISH), la migration sur gel, l'analyse d'hétéroduplexes, etc. Selon un mode préféré de mise en oeuvre, la méthode comprend la détection de la présence ou de l'absence ou de la quantité (relative) d'un acide nucléique selon a) à c) par hybridation sélective ou amplification sélective. L'hybridation sélective est typiquement réalisée en utilisant des sondes nucléiques, de préférence immobilisées sur un support, tel qu'un support solide ou semi-solide présentant au moins une surface, plane ou non, permettant l'immobilisation de sondes nucléiques. De tels supports sont par exemple une lame, bille, membrane, filtre, colonne, plaque, etc. Ils peuvent être réalisés en tout matériau compatible, comme notamment du verre, silice, plastique, fibre, métal, polymère, etc. Les sondes nucléiques peuvent être tout acide nucléique (ADN, ARN, PNA, etc.), de préférence simple-brin, comprenant une séquence spécifique d'une molécule cible telle que définie en a) à c) ci-dessus. Les sondes comprennent typiquement de 5 à 400 bases, de préférence de 8 à 200, plus préférentiellement moins de 100, et encore plus préférentiellement moins de 75, 60, 50, 40 ou même 30 bases. Les sondes peuvent être des oligonucléotides synthétiques, produits sur la base des séquences de molécules cibles de l'invention selon des techniques de synthèse classique. De tels oligonucléotides comportent typiquement de 10 à 50 bases, de préférence de 20 à 40, par exemple 25 bases environ. Dans un mode particulièrement avantageux, on utilise plusieurs oligonucléotides (ou sondes) différents pour détecter la même molécule cible. Il peut s'agir d'oligonucléotides spécifiques de régions différentes de la même molécule cible, ou centrés différemment sur un même région. On peut également utiliser des couples de sondes, dont un membre est parfaitement apparié à la molécule cible, et un autre présente un mésappariement, permettant ainsi d'estimer le bruit de fond. Dans les exemples qui suivent, on a utilisé 6 à 11 couples d'oligonucléotides de 25 bases pour chaque molécule cible. Les sondes peuvent être synthétisées préalablement puis déposées sur le support, ou synthétisées directement in situ, sur le support, selon des méthodes connues en soi de l'homme du métier. Les sondes peuvent également être fabriquées par des techniques génétiques, par exemple par amplification, recombinaison, ligation, etc. Les sondes ainsi définies constituent un autre objet de la présente demande, ainsi que leurs utilisations (essentiellement in vitro) pour la détection d'un cancer chez un sujet. De manière particulièrement préférée, on utilise un ensemble de sondes nucléiques comprenant tout ou un fragment de 15 bases consécutives au moins, de préférence de 17, 19, 20, 22 ou 25 bases consécutives au moins, de chacune des séquences SEQ ID NO : 1-376, ou d'un brin complémentaire de celles-ci, avantageusement immobilisées sur un support. L'hybridation peut être réalisée dans des conditions classiques, connues de l'homme du métier et ajustables par celui-ci (Sambrook, Fritsch, Maniatis (1989) Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory Press). En particulier, l'hybridation peut être réalisée dans des conditions de stringence élevée, moyenne ou faible, selon le niveau de sensibilité recherché, la quantité de matériel disponible, etc. Par exemple, des conditions appropriées d'hybridation incluent une température comprise entre 55 et 63 C pendant 2 à 18 heures sur des supports de basse densité D'autres conditions d'hybridation peuvent être nécessaires pour des supports de haute densité, comme une température d'hybridation entre 45 et 55 C. Après l'hybridation, différents lavages peuvent être réalisés pour éliminer les molécules non-hybridées, typiquement dans des tampons SSC comprenant du SDS, tels que un tampon comprenant 0,1 à 10 X SSC et 0,5-0,01% SDS. D'autres tampons de lavage contenant du SSPE, du MES, du NaCl ou du EDTA peuvent également être utilisés. Dans un mode de mise en oeuvre typique, les acides nucléiques (ou les puces ou supports) sont pré-hybridés dans un tampon d'hybridation (Rapid Hybrid Buffer, Amersham) contenant typiquement 100 11g/ml d'ADN de sperme de saumon à 65 C pendant 30 min. Les acides nucléiques de l'échantillon sont ensuite mis en contact avec les sondes (typiquement appliqués sur le support ou la puce) à 65 C pendant 2 à 18 heures. De préférence, les acides nucléique de l'échantillon sont marqués au préalable, par tout marquage connu (radioactif, enzymatique, fluorescent, luminescent, etc.). Les supports sont ensuite lavés dans un tampon 5X SSC, 0,1% SDS à 65 C pendant 30 min, puis dans un tampon 0.2X SSC, 0,1% SDS. Le profil d'hybridation est analysé selon des techniques classiques, comme par exemple en mesurant le marquage sur le support au moyen d'un instrument adapté (par exemple Instantlmager, Packard Instruments). Les conditions de l'hybridation peuvent naturellement être ajustées par l'homme du métier, par exemple en modifiant la température d'hybridation et/ou la concentration saline du tampon ainsi que par ajout de substances auxiliaires comme le formamide ou de l'ADN simple brin. Un objet particulier de l'invention réside ainsi dans une méthode pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer du sein chez un mammifère, comprenant la mise en contact, dans des conditions permettant une hybridation entre séquences complémentaires, des acides nucléiques issus d'un échantillon de sang du mammifère et d'un ensemble de sondes spécifique des molécules cibles suivantes au moins: a) les acides nucléiques comprenant les séquences du PANEL 1 représentées dans le Tableau 4, colonne 1, ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, et/ou b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de séquences selon a), et/ou c) les analogues fonctionnels des acides nucléiques selon a) ou b) provenant d'une autre espèce, pour obtenir un profil d'hybridation, le profil d'hybridation étant caractéristique de la présence ou du risque de développer un cancer du sein chez ce mammifère. Un objet particulier de l'invention réside ainsi dans une méthode pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer du sein chez un mammifère, comprenant la mise en contact, dans des conditions permettant une hybridation entre séquences complémentaires, des acides nucléiques issus d'un échantillon de sang du mammifère et d'un ensemble de sondes spécifique des molécules cibles suivantes: a) les acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans l'un des PANELS 2 à 9 tels que définis ci-avant, ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, et/ou b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de séquences selon a), et/ou c) les analogues fonctionnels des acides nucléiques selon a) ou b) provenant d'une autre espèce, pour obtenir un profil d'hybridation, le profil d'hybridation étant caractéristique de la présence ou du risque de développer un cancer du sein chez ce mammifère. Dans des modes particuliers de mise en oeuvre, les procédés de l'invention utilisent en outre d'autres molécules cibles, notamment les sous-ensembles de molécules cibles mentionnés dans la présente demande. 25 Ainsi, un autre objet particulier de l'invention réside dans une méthode pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la mise en contact, dans des conditions permettant une hybridation entre séquences complémentaires, des acides nucléiques issus d'un échantillon de sang du mammifère et d'un ensemble de sondes spécifique d'au moins deux molécules distinctes choisies parmi les cibles suivantes: 30 a) les acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans SEQ ID NOs: 1-376 ou un fragment distinctif de cellesci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, et/ou20 b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de séquences selon a), et/ou c) les analogues fonctionnels des acides nucléiques selon a) ou b) provenant d'une autre espèce, pour obtenir un profil d'hybridation, le profil d'hybridation étant caractéristique de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. L'amplification sélective est de préférence réalisée en utilisant une amorce ou une paire d'amorces permettant l'amplification de tout ou partie d'un des acides nucléiques cibles dans l'échantillon, lorsque celui-ci y est présent. L'amorce peut être spécifique d'une séquence cible selon SEQ ID NO : 1-376, ou d'une région flanquant la séquence cible dans un acide nucléique de l'échantillon. L'amorce comprend typiquement un acide nucléique simple-brin, d'une longueur comprise avantageusement entre 5 et 50 bases, de préférence entre 5 et 30. Une telle amorce constitue un autre objet de la présente demande, ainsi que son utilisation (essentiellement in vitro) pour la détection d'un cancer chez un sujet. A cet égard, un autre objet de l'invention réside dans l'utilisation d'une amorce nucléotidique ou d'un ensemble d'amorces nucléotidiques permettant l'amplification de tout ou partie d'un ou, de préférence plusieurs gènes ou ARN comprenant une séquence cible selon SEQ ID NO : 1-376, pour la détection d'un cancer chez un mammifère, de préférence du cancer du sein, tout particulièrement chez un être humain. Détection d'un polypeptide Dans un autre mode de réalisation, la méthode comprend la détermination de la présence d'un polypeptide selon d). La mise en évidence d'un polypeptide dans un échantillon peut être réalisée par toute technique connue en soi, comme notamment au moyen d'un ligand spécifique, par exemple un anticorps ou un fragment ou dérivé d'anticorps. De préférence, le ligand est un anticorps spécifique du polypeptide, ou un fragment d'un tel anticorps (par exemple un Fab, Fab', CDR, etc.), ou un dérivé d'un tel anticorps (par exemple un anticorps simple-chaîne, ScFv). Le ligand est typiquement immobilisé sur un support, tel qu'une lame, bille, colonne, plaque, etc. La présence du polypeptide cible dans l'échantillon peut être détectée par mise en évidence d'un complexe entre la cible et le ligand, par exemple en utilisant un ligand marqué, en utilisant un deuxième ligand de révélation marqué, etc. Des techniques immunologiques utilisables et bien connues sont les techniques ELISA, RIA, etc. Des anticorps spécifiques des polypeptides cibles peuvent être produits par des techniques conventionnelles, notamment par immunisation d'un animal non-humain avec un immunogène comprenant le polypeptide (ou un fragment immunogène de celui-ci), et récupération des anticorps (polyclonaux) ou des cellules productrices (pour produire des monoclonaux). Des techniques de production d'anticorps poly- ou monoclonaux, de fragments ScFv, d'anticorps humains ou humanisés sont décrites par exemple dans Harlow et al., Antibodies: A laboratory Manual, CSH Press, 1988 ; Ward et al., Nature 341 (1989) 544 ; Bird et al., Science 242 (1988) 423 ; WO94/02602 ; US5,223,409 ; US5,877,293 ; WO93/01288. L'immunogène peut être fabriqué par synthèse, ou par expression, dans un hôte approprié, d'un acide nucléique cible tel que défini ci-avant. Un tel anticorps, monoclonal ou polyclonal, ainsi que ses dérivés ayant la même spécificité antigénique, constituent également un objet de la présente demande, de même que leur utilisation pour détecter un cancer. Mise en oeuvre du procédé La méthode de l'invention est applicable à tout échantillon biologique du mammifère testé, en particulier tout échantillon comportant des acides nucléiques ou des polypeptides. On peut citer avantageusement un échantillon de sang, plasma, plaquette, salive, urine, selles, etc., plus généralement tout tissu, organe ou, avantageusement, fluide biologique comportant des acides nucléiques ou des polypeptides. Dans un mode de mise en oeuvre préféré et particulièrement avantageux, l'échantillon est un échantillon de sang ou plasma. L'invention découle en effet de l'identification de marqueurs sanguins du cancer, et permet donc une détection de ces pathologies sans biopsie tissulaire, mais uniquement à partir de prélèvements sanguins. L'échantillon peut être obtenu par toute technique connue en soi, par exemple par prélèvement, par des techniques non invasives, à partir de collections ou banques d'échantillons, etc. L'échantillon peut par ailleurs être pré-traité pour faciliter l'accessibilité des molécules cibles, par exemple par lyse (mécanique, chimique, enzymatique, etc.), purification, centrifugation, séparation, etc. Avantageusement, on utilise le système PaxGene (Feezor et al., Physiol Genomics 2004, : pp. 247-254). L'échantillon peut également être marqué, pour faciliter la détermination de la présence des molécules cibles (marquage fluorescent, radioactif, luminescent, chimique, enzymatique, etc.). Dans un mode de mise en oeuvre préféré, l'échantillon biologique est un échantillon de sang total, c'est-à-dire n'ayant pas subi d'étape de séparation, qui peut être éventuellement dilué. L'invention est applicable à tout mammifère, de préférence les humains. La méthode de l'invention est particulièrement utile pour la détection du cancer du sein, notamment de la présence, du risque de développement ou du stade de développement du cancer du sein chez l'être humain. Ainsi, les données fournies dans les exemples montrent que l'invention permet de détecter la présence d'un cancer du sein avec une sensibilité supérieure à 92% et une spécificité supérieure à 86%. Un objet particulier de la présente demande concerne une méthode pour détecter la présence, l'évolution ou le risque de développer un cancer du sein chez un sujet humain, comprenant la détermination combinée de la présence (ou de l'absence ou de la quantité (relative)), dans un échantillon biologique du sujet humain, de molécules cibles choisies parmi: a) les acides nucléiques comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 1-376 ou un fragment de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, b) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire d'une séquence selon 30 a), et c) les polypeptides codés par les acides nucléiques selon a) ou b). De préférence, la méthode comprend la détermination combinée de la présence, absence ou quantité de 5, 10, 20, 30, 40, 50 ou 60 molécules cibles telles que définies ci-dessus. Un autre objet particulier de la présente demande concerne une méthode pour détecter la présence, l'évolution ou le risque de développer un cancer du sein chez un sujet humain, comprenant la mise en contact d'un échantillon biologique du sujet contenant des acides nucléiques avec un produit comprenant un support sur lequel sont immobilisés des acides nucléiques comprenant une séquence complémentaire et/ou spécifique d'une ou, de préférence, plusieurs molécules cibles choisies parmi (i) les acides nucléiques comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 1-376 ou un fragment de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives et (ii) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire d'une séquence selon (i), et la détermination du profil d'hybridation, le profil indiquant la présence, le stade ou le risque de développer un cancer du sein chez ledit sujet humain. De préférence, le produit comprend des acides nucléiques distincts comprenant une séquence complémentaire et/ou spécifique d'au moins 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60 ou plus molécules cibles différentes telles que mentionnées ci-dessus. Un autre objet de la présente demande concerne un produit comprenant un support sur lequel sont immobilisés des acides nucléiques comprenant une séquence complémentaire et/ou spécifique d'une ou, de préférence, plusieurs molécules cibles choisies parmi (i) les acides nucléiques comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 1-376 ou un fragment de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives et (ii) les acides nucléiques ayant une séquence complémentaire d'une séquence selon (i). De préférence, le produit comprend des acides nucléiques distincts comprenant une séquence complémentaire et/ou spécifique d'au moins 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60 ou plus molécules cibles différentes telles que mentionnées ci-dessus. De préférence, il comprend des acides nucléiques distincts comprenant une séquence complémentaire et/ou spécifique de l'un des panels de marqueurs tels que définis dans la présente demande. Un autre objet de la présente demande concerne un produit comprenant un support sur lequel est immobilisé au moins un, de préférence plusieurs, acides nucléiques comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 1-376, ou un analogue fonctionnel de celles-ci. De préférence, le produit comprend au moins 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60 ou plus acides nucléiques différents choisis parmi les acides nucléiques mentionnés ci-dessus. Dans un mode particulier de mise en oeuvre, le produit comprend chacun des acides nucléiques de séquence SEQ ID NO: 1-376. Un autre objet de la présente demande concerne un produit comprenant un support sur lequel est immobilisé au moins un ligand d'un polypeptide codé par un acide nucléique cible tel que défini ci-dessus, c'est-à-dire un acide nucléique comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 1-376, un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, un acide nucléique ayant une séquence complémentaire de celles-ci ou un analogue fonctionnel de celles-ci. De préférence, le produit comprend au moins 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60 ou plus ligands de polypeptides différents choisis parmi les polypeptides mentionnés ci-dessus. Le support peut être tout support solide ou semi-solide présentant au moins une surface, plane ou non, permettant l'immobilisation d'acides nucléiques ou de polypeptides. De tels supports sont par exemple une lame, bille, membrane, filtre, colonne, plaque, etc. Ils peuvent être réalisés en tout matériau compatible, comme notamment du verre, silice, plastique, fibre, métal, polymère, polystyrène, téflon, etc. Les réactifs peuvent être immobilisés sur la surface du support par des techniques connues, ou, dans le cas des acides nucléiques, synthétisés directement in situ sur le support. Des techniques d'immobilisation incluent l'adsorption passive (Inouye et al., J. Clin. Microbiol. 28 (1990) 1469), la liaison covalente. Des techniques sont décrites par exemple dans WO90/03382, WO99/46403. Les réactifs immobilisés sur le support peuvent être ordonnés selon un schéma pré-établi, pour faciliter la détection et l'identification des complexes formés, et selon une densité variable et adaptable.30 Dans un mode de mise en oeuvre, le produit de l'invention comprend un pluralité d'oligonucléotides synthétiques, d'une longueur comprise entre 5 et 100 bases, spécifiques d'un ou plusieurs acides nucléiques cibles définis en a) à c). Les produits de l'invention comprennent typiquement des molécules contrôle, permettant d'étalonner et/ou normaliser les résultats. Un autre objet de la présente demande concerne un kit comprenant un compartiment ou conteneur comprenant au moins un, de préférence plusieurs, acides nucléiques comprenant une séquence complémentaire et/ou spécifique d'un acide nucléique cible tel que défini ci-dessus et/ou un, de préférence plusieurs ligands d'un polypeptide cible tel que défini précédemment. De préférence, le produit comprend au moins 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60 ou plus acides nucléiques et/ou ligands différents choisis parmi les acides nucléiques et ligands mentionnés ci-dessus. Dans un mode particulier de mise en oeuvre, le produit comprend chacun des acides nucléiques de séquence SEQ ID NO: 1-376 ou un ligand pour chacun des polypeptides cibles tels que définis ci-dessus. Le kit peut comprendre par ailleurs des réactifs pour une réaction d'hybridation ou immunologique, ainsi que, le cas échéant, des contrôles et/ou instructions. Un autre objet de l'invention concerne l'utilisation d'un produit ou kit tel que défini ci-dessus pour la détection d'un cancer chez un sujet mammifère, de préférence un sujet humain, en particulier du cancer du sein. Un autre objet de l'invention concerne un acide nucléique de séquence choisie parmi SEQ ID NO : 1-376, ou un fragment distinctif de celles-ci comprenant au moins 15 bases consécutives, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30, ou un acide nucléique ayant une séquence complémentaire de celles-ci, ou un analogue fonctionnel de celles-ci. L'invention concerne également un vecteur de clonage ou d'expression comportant ces acides nucléiques, ainsi que toute cellule recombinante comprenant un tel vecteur ou acide nucléique. Un autre objet de l'invention concerne l'utilisation d'un acide nucléique comprenant une séquence choisie parmi SEQ ID NO: 1-376, ou un fragment distinctif de celles-ci comprenant au moins 15 bases consécutives, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30, ou un acide nucléique ayant une séquence complémentaire de celles-ci, ou un analogue fonctionnel de celles-ci, pour la détection (essentiellement in vitro) d'un cancer chez un sujet mammifère. Selon un exemple particulier de mise en oeuvre de l'invention, on prélève un échantillon de sang d'un mammifère à tester. L'échantillon de sang est éventuellement traité de manière à rendre les acides nucléiques plus accessibles, et ceux-ci sont marqués. Les acides nucléiques sont ensuite appliqués sur un produit tel que défini ci-avant et le profil d'hybridation est déterminé, permettant de diagnostiquer la présence ou non d'un cancer chez le sujet. La méthode de l'invention est simple, pratiquée ex vivo, et permet la détection précoce d'un cancer à partir d'un échantillon de sang. Il est entendu que toute technique équivalente peut être utilisée dans le cadre de la présente demande pour déterminer la présence d'une molécule cible. D'autres aspects et avantages de l'invention apparaîtront à la lecture des exemples qui suivent, qui doivent être considérés comme illustratifs et non limitatifs. LEGENDE DES FIGURES Figure 1 : Amplification par PCR des cDNAs DATAS issus du profilage n 1 (PBMN) à l'aide de 10 couples d'amorces semi-dégénérées. Le profilage DATAS a été effectué dans les deux directions (cancers stade I & II contre contrôles et contrôles contre cancers stade I & II). Un contrôle positif à l'aide de cDNA issu de cellules HepG2 est inclus. Figure 2 : Amplification par PCR des cDNAs DATAS issus du profilage n 2 (PBMO) à l'aide de 10 couples d'amorces semi-dégénérées. Le profilage DATAS a été effectué dans les deux directions (cancers stade III & IV contre contrôles et contrôles contre cancers stade III & IV). Un contrôle positif à l'aide de cDNA issu de cellules HepG2 est inclus Figure 3 : Amplification par PCR des cDNAs DATAS issus du profilage n 3 (PBMP) à l'aide de 10 couples d'amorces semi-dégénérées. Le profilage DATAS a été effectué dans les deux directions (cancers stade I à IV contre contrôles et contrôles contre cancers stade I à IV). Un contrôle positif à l'aide de cDNA issu de cellules HepG2 est inclus Figure 4 : Configuration spécifique de sondes pour mesurer l'expression de variants générés par épissage alternatif. La sonde A , commune aux deux isoformes mesure l'expression des deux variants. La sonde B, spécifique de la séquence additionnelle de la forme longue, ainsi que les sondes C et D, spécifiques des séquences de jonction autour de cette séquence additionnelle mesurent l'expression de l'isoforme longue. La sonde E, spécifique de la jonction issue de l'absence de la séquence additionnelle, mesure l'expression de l'isoforme courte. Figure 5: Définition des séquences "cibles". 15 nucléotides de part et d'autre de chaque jonction et jusqu'à 500 nucléotides pour les séquences additionnelle et commune en amont sont captures. Figure 6: Séquences cibles et données associées. Description des colonnes : idn : n d'identification de l'événement d'épissage ; Description : type d'événement d'épissage ; forme longue : n d'accession de la forme longue ; forme courte : n d'accession de la forme courte ; cible A à E : Séquences des cible A à E ; long. : taille des séquences de la colonne précédente. Figure 7: Clustering hiérarchique sur 37 contrôles et 55 patientes en utilisant 100 oligonucléotides. EXEMPLES 1. Caractéristiques des échantillons biologiques Les exemples présentés ci après ont été réalisés initialement à partir de 92 échantillons sanguins (5 ml de sang total, prélevé dans deux tubes PaxGene). Ces échantillons regroupaient 37 échantillons sanguins provenant de patientes contrôles saines (S, obtenus de l'Etablissement Français du Sang) et 55 échantillons de patientes atteintes d'un cancer du sein en phase 1111(Cl/II). 2. Extraction des ARN totaux de l'échantillon sanguin Les prélèvements sanguins ont été collectés directement dans des tubes PAXGeneTm Blood RNA (PreAnalytix, Hombrechtikon, CH). Après l'étape de prélèvement de l'échantillon sanguin et afin d'obtenir une lyse totale des cellules, les tubes ont été laissés à température ambiante pendant 4 h puis conservés à -20 C jusqu'à l'extraction du matériel biologique. Plus précisément, dans ce protocole, les ARN totaux ont été extraits à l'aide des kits PAXGene Blood RNA (PreAnalytix) en respectant les recommandations du fabriquant. Brièvement, les tubes ont été centrifugés (15 min, 3000 g) afin d'obtenir un culot d'acides nucléiques. Ce culot a été lavé et repris dans un tampon contenant de la protéinase K nécessaire à la digestion des protéines (10 min à 55 C). Une nouvelle centrifugation (5 min, 19 000g) a été effectuée pour éliminer les débris cellulaires et de l'éthanol a été ajouté afin d'optimiser les conditions de fixation des acides nucléiques. Les ARN totaux ont été spécifiquement fixés sur les colonnes PAXgene RNA spin column et, avant l'élution de ceux-ci, une digestion de l'ADN contaminant a été effectuée à l'aide du RNAse free DNAse set (Qiagen, Hilden, Allemagne). La qualité des ARN totaux a été analysée par le bioanalyzer AGILENT 2100 (Agilent Technologies, Waldbronn, Allemagne). 3. Expériences de profilage DATAS Trois séries de profilage DATAS ont été effectuées entre les groupes suivants : DATAS n 1 : Cancers du sein précoces (Stade I et II) contre groupe Contrôle (étude PBMN) DATAS n 2 : Cancers du sein tardifs (Stade III et IV) contre groupe Contrôle (étude PBMO) DATAS n 3 : Cancers du sein (Stade I, II, III et IV) contre groupe Contrôle (étude PMNP) 30 DATAS est un technologie de profilage de l'expression génétique entre deux échantillons qui permet de caractériser les différences qualitatives au niveau des ARNs messagers, telles que celles générées par épissage alternatif. Cette technologie propriétaire est décrite dans le brevet US 6,251,590. Les ARNs totaux correspondant aux deux situations, l'une normale (mN) et l'autre pathologique (mP), sont isolés à partir des échantillons sanguins à l'aide du système PAXgene (PreAnalytix) décrit ci-dessus. Ces ARNs (50 g par groupe) sont convertis en ADN complémentaires (cN) et (cP) à l'aide de reverse transcriptase (RT) (Invitrogen) et d'un oligonucleotide oligodT25 biotinylé (Invitrogen). Les échantillons ayant contribué aux 50 gg par groupe sont indiqués dans les tableaux A à F. Des hybrides mN/cP et cN/mP sont ensuite réalisés en phase liquide. Après précipitation à l'éthanol de mN et cP et de cN et mP, les précipitats sont repris dans 30 l de solution d'hybridation contenant 80% formamide et 0.1% SDS pour une incubation à 40 C sur la nuit. Les hétéroduplexes sont ensuite capturés à l'aide de billes magnétiques Streptavidine (Dynal). Un aimant permet de maintenir les billes dans le tube pendant les opérations de rinçage. Les billes / hétéroduplexes sont alors reprises dans 50 l de tampon RNAseH et incubées avec la RNaseH (Invitrogen) 30 minutes à 37 C. Le surnageant est récupéré après une nouvelle application de l'aimant. L'ADN résiduel est éliminé par action de la DNAseI (Ambion). Après inactivation de l'enzyme, les fragments d'ARNs sont précipités à l'éthanol et repris dans de l'eau traitée au DEPC supplémentée de RNAse out (Ambion). Les fragments d'ARNs sont ensuite reverse transcrits (kit Reverse transcription TaqMan, Applied Biosystem) à l'aide d'oligonucléotides hexamères aléatoires. Les ADNs complémentaires obtenus sont alors amplifiés par PCR à l'aide d'amorces semidégénérées. 10 couples d'amorces sont généralement utilisés. Les amplicons obtenus peuvent être visualisés par électrophorèse sur gel d'agarose (figure 1, 2 et 3). On observe des populations amplifiées hétérogènes de nature et d'intensité qui varient selon les amorces et les échantillons utilisés. Ces populations amplifiées sont clonés dans un vecteur de clonage TOPO TA (Invitrogen) pour être transformés dans une souche de bactéries E. Coli compétentes (Invitrogen). Les colonies sont repiquées dans des plaques 96 puits et cultivées sur la nuit dans un milieu 2XTY supplémenté d'ampicilline. Un stock glycérolé (50%) est alors effectué. Généralement, on repique une plaque 96 puits par couple d'amorce pour une des deux directions. Cela fournit ainsi 96x10x2 = 1920 colonies à caractériser. 1728 clones ont été séquencés dans le cadre du profilage DATAS n 1, 1920 ont été clonés 5 et séquencés dans le cadre du profilage DATAS n 2 et 1920 ont été clones et séquencés dans le cadre du profilage DATAS n 3. 4. Analyse Bioinformatique 10 Le tableau G récapitule le nombre de clones caractérisés dans les trois banques de profilage. Un clone qualifié de singleton signifie que la séquence de ce clone n'a été identifiée qu'une seule fois dans la banque et qu'aucun autre clone ne recouvre cette séquence. Un cluster correspond à un groupe de clones dont les séquences se chevauchent. 15 Les trois profilages DATAS ont ainsi générés 1741 clones non redondants. Tableau G : Caractérisation des clones obtenus au sein des trois banques DATAS Banques DATAS Cancers I Cancers III & Tous cancers Consolidation &II vs. IV vs. vs. contrôle sur les trois contrôle contrôle banques Nombre de clones 1728 1920 1920 5568 séquencés _ Nombre de clusters 267 347 303 886 Nombre de 239 362 440 855 singletons _ Nombre de clones non 506 709 743 1741(*) redondants au sein de la banque Une analyse bioinformatique a été effectuée sur les 1741 clones afin d'identifier les gènes 20 auxquels ils sont associés et les événements d'épissage connus dans les banques publiques d'acides nucléiques correspondants. Ainsi, les 1741 clones DATAS ont pu être associés à 1170 gènes différents, certains fragments DATAS non chevauchant étant associés à différentes régions du même gène. 25 5. Sélection et dessin des événements cibles pour le dessin du microarray La détection et la quantification de l'expression de variants d'épissage par microarray nécessite l'utilisation d'une configuration de sondes particulière. Tout couple ARN messager de référence / variant d'épissage peut être modélisé en tant que Isoforme longue / Isoforme courte (Figure 4). Ainsi, un variant d'épissage associé à un saut d'exon sera l'isoforme courte par rapport au variant de référence. Un variant d'épissage comportant un nouvel exon ou une rétention d'intron sera l'isoforme longue par rapport au variant de référence. Les autres événements d'épissage alternatifs (utilisations de sites cryptiques 5' ou 3' d'épissage) peuvent également être modélisés de la même manière. Le jeu de sondes nécessaire à la mesure de l'expression de variants d'épissage est également indiqué sur la figure 4. Ce jeu est composé de deux sondes exoniques traditionnelles A et B et de trois sondes de jonction de type exon-exon ou exon-intron C, D et E. La sonde A mesure l'expression des deux isoformes, les sondes B, C et D l'expression de l'isoforme longue et la sonde E l'expression de la forme courte. Afin de concevoir toutes ces sondes, il est nécessaire d'identifier les événements d'épissage correspondant aux fragments DATAS, puis les régions cibles à partir desquelles seront dessinées les sondes. Les séquences cibles correspondant aux sondes de jonction C, D et E sont définies par une longueur de 30 nucléotides, 15 nucléotides de part et d'autre de la jonction. Il est ainsi possible de couvrir toute jonction par des sondes de 25 nucléotides de type : 10/15, 11/14, 12/13, 13/12, 14/11 et 15/10 (le signe / représentant la zone de jonction). Les contraintes sont moins fortes sur le sondes exoniques A et B. La séquence additionnelle, spécifique de la forme longue (séquence 2 de la figure 4) et la séquence commune en amont du site d'épissage (séquence 1 de la figure 4) définissent les séquences cibles pour ces sondes avec toutefois un plafond de 500 nucléotides pour les séquences pouvant dépasser cette taille. La définition des séquences cibles est résumée figure 5. Ainsi, les 1170 gènes correspondant aux 1741 clones DATAS ont été utilisés pour identifier, pour chacun d'entre eux les cDNAs et ESTs représentés dans les banques publiques de données de séquences, présentant potentiellement des différences qualitatives de séquences, source d'événements d'épissages. Les événements retenus sont localisés à moins de 100 nucléotides par rapport aux extrémités 5' ou 3' des fragments DATAS. 2108 événements ont ainsi été retenus et répertoriés dans un classeur Excel dont une partie décrivant les informations extraites est représentée sur la figure 6. Ces informations comprennent, pour un événement donné : un numéro d'identification de l'événement, la nature de l'événement, les numéros d'accès des formes longues et courtes, les séquences cibles A à E et la taille de ces séquences cibles. Un contrôle qualité strict a été appliqué pour la définition de ces séquences. Les ambiguités sur certains nucléotides ont été corrigées en les substituant par les nucléotides correspondant sur l'ARN de référence RefSeq ou à partir de l'ADN génomique. Toutes les séquences cibles ont été réalignées afin de confirmer leur appartenance aux formes courtes ou longues appropriées. 6. Dessin des sondes et de la puce Afin de pouvoir mesurer l'expression des 2108 événements décrits précédemment, une puce à ADN à façon a été conçue. Sur cette puce, chaque événement était caractérisé par ses cinq séquences cibles A-E. Pour chaque séquence A et B, 11 couples de sondes de 25 nucléotides ont été conçus, alors que les séquences cibles du type C, D, ou E ont été détectées avec 6 couples de sondes de 25 nucléotides. Par couple de sondes, on entend une première sonde qui s'hybridait parfaitement (on parle alors de sondes PM ou perfect match) avec un des ADNc issus d'un transcrit cible, et une deuxième sonde, identique à la première sonde à l'exception d'un mésappariement (on parle alors de sonde MM ou mismatched) au centre de la sonde. Chaque sonde MM servait à estimer le bruit de fond correspondant à une hybridation entre deux fragments nucléotidiques de séquence non complémentaire. (Affymetrix technical note "Statistical Algorithms Reference Guide" ; Lipshutz, et al (1999) Nat. Genet. 1 Suppl., 20-24). Si le design d'au moins 6 sondes pour les séquences A et B ou d'au moins 4 sondes pour les séquences C, D, et E était impossible, ces séquences ne figuraient pas sur la puce à façon. Une telle situation peut résulter de séquences de basse complexité, contenant des structures répétitives ou des structures hairpin consécutives ou non-consécutives. Une taille de séquences A-E inférieure à 30 nucléotides menait également à l'exclusion de ces sondes. Uniquement les séquences de bonne qualité, orientées en direction 5' -> 3', servaient pour les design des sondes effectuées selon les consignes d'Affymetrix. 7. Synthèse d'ARNc, obtention et marquage des ADNc et fragmentation Afin d'analyser l'expression des transcrits cibles selon l'invention, les ADN complémentaires (ADNc) des ARNm contenus dans les ARN totaux tels que purifiés ci dessus, ont été obtenus à partir de 400 ng d'ARN totaux par l'utilisation d'une enzyme de Klenow 3'-5'-exonuclease, de 100 unités de l'enzyme de transcription reverse SuperScript II (Invitrogen), 10 unités de l'inhibiteur de la RNAse H Superase-IN (Ambion, Huntigdon, UK) et 200 pmol d'amorce random contenant le promoteur T7 (RP-T7-primer, Eurogenetec, Seraing, Belgique). La totalité des ADNc ainsi obtenue a ensuite été engagée dans une transcription in-vitro, qui a été effectuée avec un kit MEGAscript T7 (Ambion) pendant 16h à 37 C. L'ARNc résultant a été ultérieurement purifié sur colonne avec un RNeasy Mini kit (Invitrogen), et la qualité de l'ARNc obtenu a été analysée par le bioanalyzer AGILENT 2100. Les ARNc purifiés ont ensuite été quantifiés par spectrophotométrie, et la solution d'ARNc a été ajustée à une concentration de 1,24 g/gl d'ARNc. Vingt-six microgrammes d'ARNc ont ensuite été dispatchés sur deux tubes Eppendorf, et 3 gg d'amorces random sont ajoutés à chaque tube. La transcription reverse a été effectuée avec 800 unités de SuperScriptll (Invitrogen) et 10 unités d'un inhibiteur de la RNAse H, en présence d'enzyme de Klenow, pendant 1h à 37 C. L'ADNc à double-brin résultant de cette approche a ensuite été purifié à l'aide du QIAquick PCR Purification Kit (Qiagen) et quantifié par spectrophotométrie. Seize microgrammes d'ARNc, repartis sur trois tubes Eppendorf, ont ensuite été fragmentés avec 0.6 unités de DNAse I par tube pendant 10 minutes à 37 C. L'efficacité de la fragmentation a été verifiée à l'aide du bioanalyzer 2100 (Agilent). Les ADNc fragmentés ont ensuite été marqués avec de la biotine en utilisant 330 unités du terminale transferase (Roche Molecular Biochemicals, Meylan, France) et 1 l de DNA Labeling Reagent (DLR-la, 5 mM) [Affymetrix] par microgramme de ADNc pendant 60 min à 37 C. La totalité d'ADNc fragmenté et marqué a finalement été hybridée sur la puce à ADN à 5 façon (intitulée A520138F , cf exemple 6) selon un protocole d'hybridation standard adapté à des puces 1l m. 8. Mise en évidence de profils d'expression pour le diagnostic du cancer du sein à partir d'échantillon sanguins 8.1. Mise en évidence d'un profil d'expression des transcrits permettant de discriminer les patientes Contrôles (S) des patientes atteintes d'un cancer en stade I/II L'expression d'environ 2000 variants d'ARN, représentant environ 800 gènes, a été 15 analysée et comparée entre des patientes S et C I/II. Pour cela, 16 g d'ADNc fragmentés issus de chaque échantillon ont été ajoutés à un tampon d'hybridation (Affymetrix) et 200 l de cette solution ont été mis en contact pendant 16 h à 50 C sur des puces d'expression. Afin d'enregistrer les meilleures performances d'hybridation et de lavage, des ARN qualifiés de contrôle biotinylés (bioB, bioC, bioD et cre) et des oligonucléotides (oligo 20 B2) ont également été inclus dans le tampon d'hybridation. Après l'étape d'hybridation, les ADNc biotinylés et hybridés sur la puce, ont été révélés par l'utilisation d'une solution de streptavidine-phycoerythrine et le signal a été amplifié par l'utilisation d'anticorps antistreptavidine. L'hybridation a été réalisée dans une étuve d'hybridation GeneChip Hybridisation oven (Affymetrix), et le protocole Euk GE-WS2 du protocole 25 d'Affymetrix a été suivi. Les étapes de lavage et de révélation ont été réalisées sur une station Fluidics Station 450 (Affymetrix). Chaque puce a ensuite été analysée sur un scanner Affymetrix G3000 GeneArray Scanner à une résolution de 1,5 microns afin de repérer les zones hybridées sur la puce. Ce scanner permet la détection du signal émis par les molécules fluorescentes après excitation par un laser argon en utilisant la technique du 30 microscope à épifluorescence. On obtient ainsi pour chaque position, un signal proportionnel à la quantité d'ADNc fixés. Le signal a ensuite été analysé par le logiciel GeneChip Operating Software (GCOS 1.2, Affymetrix). 10 Afin de prévenir les variations obtenues par l'utilisation de différentes puces, il a été réalisé une approche de normalisation utilisant l'outil Bioconductor , qui permet d'harmoniser la distribution moyenne des données brutes obtenues pour chaque puce. Les résultats obtenus sur une puce peuvent alors être comparés aux résultats obtenus sur une autre puce. Le logiciel GCOS 1.2 permettait aussi d'inclure un algorithme statistique pour considérer si un transcrit était exprimé ou non. A partir des 6.242 groupes de sondes, représentant environ 2.000 transcrits, de la puce, les inventeurs ont sélectionné les transcrits pertinents qui étaient corrélés au développement d'un cancer du sein. Les transcrits qui ont un niveau d'expression trop faible sur la majorité des puces ainsi que les transcrits qui ne présentent pas de variation importante entre les différentes puces ont été exclus (Li et al, 2001, Bioinformatics, 17 : 1131-1142). La recherche d'un panel de transcrits discriminant les groupes de patientes EFS et CUII a été réalisée par une technique de Data Mining, nommée random forest algorithm (http://ligarto.org/rdiaz/Papers/jornadas.bioinfo.randomForest.pdf). Outre l'analyse des données avec l'algorithme random forest, qui représente une analyse de type multivariée, une analyse dite univariée servait également à identifier des transcrits différentiellement exprimés entre les patientes EFS et CUII. Cette analyse, nommée SAM (pour Significance Analysis of Microarrays ) est principalement basée sur une version modifiée du test t de Student qui permet de prévenir le biais introduit par les gènes avec une variabilité faible. Cette approche permet de contrôler le taux de gènes faux positifs dans une analyse univariée. L'ensemble des analyses mentionnées ci-dessus a permis de mettre en évidence un premier panel de transcrits, comprenant 318 transcrits pertinents selon l'invention (cf tableau 1, SEQ ID Nos: 1-318). L'augmentation ou la diminution d'expression de chacun de ces transcrits, observée chez les patientes S par rapport aux patientes C UII est présentée dans le tableau 1. Les inventeurs ont étudié l'expression simultanée de 318 transcrits pour obtenir un profil d'expression. En utilisant la méthode de random forest, 90 % des patients étaient correctement classifiés. Plus précisément, 32 des 37 contrôles et 51 des 55 patientes ont été correctement classifiés, ce que correspond à une sensibilité de 92,7 % et une spécificité de 86,4 %. Outre l'analyse sur les 92 échantillons initiaux, une analyse supplémentaire a été effectuée afin de valider la pertinence de la signature identifié ci-dessus : une cohorte indépendante de cinq contrôles saines et 16 cancer du sein phase UII a été analysée en aveugle. L'analyse d'une cohorte indépendante est un des meilleurs moyens pour tester la valeur prédictive d'une signature de gènes ou de transcrits (cf. The SMRS working group, Nat Biotech 2005, 7 : p.833-838). Basé sur les séquences SEQ ID Nos: 1-318, l'algorithme random forest a classé correctement cinq contrôles sur cinq et 13 patientes sur seize (86% de classification). Par des expériences supplémentaires d'hybridations et d'analyses, 58 cibles supplémentaires ont pu être identifiées, correspondant aux séquences SEQ ID NO : 319- 376 (Cf Tableau 1). 8.2. Identification d'un sous-ensemble de 100 marqueurs Les inventeurs ont également étudié l'expression simultanée de 100 transcrits de séquence nucléotidique choisie parmi les séquences présentées dans le tableau 2 pour obtenir un profil d'expression. En utilisant la méthode de random forest, 89 % des patients étaient correctement classifiés. Plus précisement, 31 des 37 contrôles et 51 des 55 patientes ont été correctement classifiés, ce qui correspond à une sensibilité de 92,7 % et une spécificité de 83,7 %. Ces résultats ont été confirmés avec une autre technique d'analyse, le clustering hierarchique. Dans cette analyse non-supervisée, une Contrôle se positionne parmi les patientes (à gauche de la ligne pointillée rouge, cf. figure 7), et 10 patientes figurent parmi les contrôles saines (à droite de la ligne pointillée rouge). La figure 7 représente l'analyse de clustering hiérarchique d'échantillons de sang obtenu à partir de 55 patients atteintes d'un cancer en stade précoce (C UII, appelé également D) et 37 patients Contrôles (donneuses saines) en utilisant l'expression de 100 gènes identifiés par l'analyse algorithmique. La fonction de clustering hiérarchique du logiciel Spotfire organise les patients C UII et contrôles en colonnes, et les gènes en lignes de manière à obtenir en position adjacente les patients ou les gènes présentant des profils d'expression comparables. Le coefficient de corrélation de Pearson a été utilisé comme indice de similarité pour les gènes et les patients. Les résultats correspondent au niveau de fluorescence Affymetrix normalisé par l'outil bioconductor . Afin de tenir compte des différences constitutives d'expression entre les gènes, les niveaux d'expression de chaque gène ont été normalisés en calculant une variable centrée réduite. Le blanc représente les faibles niveaux d'expression, le gris les niveaux intermédiaires et le noir les niveaux forts. La hauteur des branches du dendrogramme indique l'indice de similarité entre les profils d'expression. Outre l'analyse sur les 92 échantillons initiaux, une analyse supplémentaire a été effectué afin de valider la pertinence de la signature identifié ci dessus : une cohorte indépendante de cinq contrôles saines et 16 cancer du sein phase 1/II a été analysée en aveugle. Basé sur les top 100, l'algorithme random forest a classé correctement cinq contrôles sur cinq et 14 patientes sur seize (90% de classification). Parmi cette combinaison de 100 gènes marqueurs, les inventeurs ont mis en évidence que des panels plus restreints permettaient également de discriminer les patients contrôles des patientes atteintes d'un cancer du sein, comme décrit dans les exemples suivants. 8.3. Identification d'un panel prédictif de 66 marqueurs (PANEL 6) Les inventeurs ont mis en évidence une combinaison de 66 marqueurs, basée sur les séquences SEQ ID Nos : 5, 7, 13, 14, 16-20, 23-28, 47, 51-55, 58, 64, 69, 80, 81, 88-90, 25 116, 121, 125, 137, 139, 145, 148, 158, 160, 161, 164, 188-191, 208, 222, 225, 228, 229, 236, 240, 242, 245, 248, 252, 280, 281, 284, 290, 298-300 et 309-312 (voir tableau 3). Cette combinaison permet de classifier correctement plus de 80 % des échantillons. 8.4. Identification d'un panel prédictif de 53 marqueurs (PANEL 5) Les inventeurs ont également mis en évidence une combinaison de 53 marqueurs, basée sur les séquences SEQ ID Nos : 7, 13, 14, 16-19, 23-28, 47, 51-55, 58, 69, 80, 81, 89, 116, 121, 125, 137, 139, 145, 148, 158, 160, 161, 164, 189, 190, 225, 228, 229, 240, 245, 248, 30 252, 280, 281, 284, 290, 298-300, 310 et 312. Cette combinaison permet également de classifier correctement plus de 80 % des échantillons. 8.5. Identification d'un panel prédictif de 42 marqueurs (PANEL 4) 5 Les inventeurs ont également mis en évidence une combinaison de 42 marqueurs, basée sur les séquences SEQ ID Nos : 13, 16-19, 23, 26-28, 47, 51-55, 58, 69, 80, 81, 89, 116, 121, 125, 145, 148, 158, 160, 161, 164, 189, 190, 225, 229, 240, 248, 280, 281, 284, 299, 300, 310 et 312. Cette combinaison permet également de classifier correctement plus de 80 % 10 des échantillons. 8.6. Identification d'un panel prédictif de 22 marqueurs (PANEL 3) Les inventeurs ont mis en évidence une combinaison de 22 marqueurs, basée sur les 15 séquences SEQ ID Nos : 18, 19, 23, 26, 27, 51, 52, 53, 54, 55, 69, 80, 125, 145, 148, 161, 188, 225, 228, 240, 280 et 312. Cette combinaison permet de classifier correctement 76 % des échantillons. 8.7. Identification d'un panel prédictif de 18 marqueurs (PANEL 2) Les inventeurs ont aussi mis en évidence une combinaison de 18 marqueurs, basée sur les séquences cibles SEQ ID NOs: 18, 19, 23, 26, 51, 52, 53, 54, 55, 69, 80, 125, 145, 148, 225, 228, 240 et 312 présentées dans le tableau 3. Cette combinaison permet de classifier correctement 76 % des échantillons. 25 Ceci confirme que l'analyse de l'expression de ces 18 marqueurs est un bon outil pour discriminer les patientes ayant un fort risque de rechute des patientes ayant un faible risque de rechute. L'utilisation de panel de gènes restreint est particulièrement adaptée pour obtenir un outil de détection et de pronostic. En effet, l'analyse de l'expression d'une 30 dizaine de marqueurs ne nécessite pas la fabrication à façon de puce à ADN, et peut être mise en oeuvre directement par des techniques de PCR ou de NASBA, ou puce de basse densité, ce qui présenteun atout économique important et une mise en oeuvre simplifiée. 20 8.8. Identification de panels prédictifs de 54, 59 et 72 marqueurs (PANELS 1 et 7-9) Les inventeurs ont mis en évidence des combinaisons de 100, 104 et 110 marqueurs, basées sur les séquences cibles SEQ ID Nos : 1-376, permettant de détecter la présence d'un cancer du sein chez des sujets. Ces panels sont décrits dans le Tableau 4. Le Panel 1 comprend l'ensemble des séquences communes aux Panels 7-9. 8.9. Identification de cascades de signalisation de la réponse immunitaire L'analyse des différents gènes identifiés dans l'invention, dont l'expression est altérée chez les patients, montre qu'ils appartiennent à des familles de gènes impliquées dans des voies de signalisation cellulaire ou dans des mécanismes de régulation communs. Ainsi notamment, cette analyse fait apparaître de nombreux gènes impliqués dans les cascades de signalisation mises en oeuvre dans la réponse immunitaire (innée ou acquise), et notamment dans la transduction des messages initiés par la stimulation des TLRs, dans la sécrétion de cytokines ou dans l'activation des lymphocytes T. Les demandeurs ont ainsi défini des panels de gènes, liés ou participant à des voies de signalisation de la réponse immune, qui constituent des cibles d'intérêt pour la détection du 20 cancer. Ces panels sont donnés dans les Tableaux 5 et 6. 5 Tableau A : Echantillons sélectionnés pour le groupe cancer du sein précoce pour le DATAS n 1 (PBMN) Echantillon Stade Quantité D104 Clinique utilisée I (ug) 10.0 D105 I 5.0 D106 I 2.0 D111 I 2.0 D114 I 3.0 D118 I 5.0 D123 I 6.0 D117 II 2.0 D121 II 5.0 D130 II 10.0 Tableau B : Echantillons sélectionnés pour le groupe contrôle pour le DATAS n 1 (PBMN) Echantillon Stade Quantité Dl Clinique utilisée DFS>5 (ug) 1.66 D3 DFS > 5 1.66 D9 DFS > 5 1. 66 D10 DFS > 5 1.66 _ D17 DFS>5 1.66 D28 DFS>5 1.66 D36 DFS>5 1.66 D63 DFS>5 1.66 D75 DFS>5 1.66 D76 DFS>5 1.66 D11 DFS 5 1.66 D3 DFS > 5 1.66 D9 DFS>5 1.66 D10 DFS>5 1.66 D17 DFS>5 1.66 D28 DFS>5 1.66 D36 DFS > 5 1.66 ,D63 DFS>5 1.66 D75 DFS>5 1.66 D76 DFS > 5 1.66 D11 DFS 5 (u9) 1.66 D3 DFS>5 1.66 D9 DFS>5 1.66 D10 DFS>5 1.66 D17 DFS > 5 1.66 D28 DFS>5 1.66 D36 DFS>5 1.66 D63 DFS>5 1.66 D75 DFS>5 1.66 D76 DFS>5 1.66 Dl 1 DFS CCACCCGAGGTCGCTGTGTTT chain V-D-J-beta- GAGCCATCAGAAGCAGAGATC 1.2-C-beta-1(TCRB) TCCCACACCCAAAAGGCCACA mRNA CTGGTGTGCCTGGCCACAGGT ATCTTCCCTGACCACGTGGAG CT GAG CTG GTG G G TGAATG G G AAGGAGGTGCACAGTGGGGTC AGCACGGACCCGCAGCCCCTC AAGGAGCAGCCCGCCCTCAAT GACTCCAGATACTGCCTGAGC AGCCGCCTGAGGGTCTCGGCC ACCTTCTGGCAGAACCCCCGC AACCACTTCCGCTGTCAAGTCC AGTTCTACGGGCTCTCGGAGA ATGACGAGTGGACCCAGGATA GGGCCAAACCCGTCACCCAGA TCGTCAGCGCCGAG 212 Homo sapiens T-cell K02885.1 AF317590.1 1,2 TCTGTGCCAGCAGCCttggacaga receptor active beta- tttatg chain V-D-J-beta-1.2-C-beta-1 (TCRB) mRNA 213 Homo sapiens T-cell K02885.1 AF327908.1 0,7 ATATCTCTGCAGCGTcgggggtca receptor active beta- atctgg chain D-J I.2-C -bebeta-1 (TCRB) .2 mRNA 214 Homo sapiens T-cell K02885.1 AF327022.1 0,7 CTGCAGTGCTAGAGAtccggggtc receptor active beta- ccatca chain V-D-J-beta-1.2-C-beta-1(TCRB) mRNA 215 Human T-cell M12886.1 BCO36926.1 0,8 CCAGATCGTCAGCGCcgaggcctg receptor active beta- gggtag chain mRNA 216 Human myosin-lXb U42391.1 BF948234.1 1,3 CCTCTGGCCTCACAGtgtcccagg mRNA agcaca 217 glutathione NM 002085.1 BI254515.1 0,8 TGGAACTTCACCAAGttcctcatcga peroxidase 4 caag (phospholipid hydroperoxidase) 218 Poly(A) binding NM 002568.1 AA033548.1 0,9 TTCCAACTGTTTAAAattgatcaggg protein, cytoplasmic acca 1 219 prohibitin NM 002634.2 BI261762.1 1,4 CAGTATGGTGAGGAGgtgtgagag ggtcca 220 prohibitin NM 002634.2 BM014639. 1,6 TCAGAGTGGAAGCAGgtgagaatg 1 gagggg 221 prohibitin NM 002634.2 BM014639. 1,4 CTTTGGGCGAGGAGAgtgtgagag 1 ggtcca 222 prohibitin NM 002634.2 BE536369.1 1,4 GCGAGGAGAGTGCGTgtgtgaga gggtcca 223 spermidine/spermine CD108391.1 0,8 TTCCAGAAGCCAGAGAGACCA N1-acetyltransferase NM 002970.1 AGTGTTATGTAAGAAGTAGTGT CGGCTGTGTAGAACCACTGAC TACACAGGCCGAAGTTACTGA GAACTTGGACAGAAAAAATAGC CAGCAAGTGTTCAAACTACTGA GGAAAAAAAAAAATTAGATATG CTGCACTTAAGAATACTAGGGC AGGTT 224 cysteine-rich acidic NM 003118.1 BG424815.1 1,4 GAGAATGAGAAGCGCTGGAGG secreted protein CAGGAGACACCCCG (osteonectin) 225 translationally- NM 003295.1 BG284235.1 0,6 TTCTTTATTGGTGAAAACATGA controlled ATCCAGATGGCATGGTTGCTCT controlled tumor protein 1 TGTGACCCCATATATGA I I I I C TTTAAGGATGGTTTA 226 translationally- BG284235.1 0,7 GAAATGGAAAAATGTtaacaaatgt controlled tumor ggcaa protein 1 NM 003295.1 227 translationally- CD641954.1 0,7 TTATTTTGGATCTATCACCTGT controlled tumor CATCATAACTGGCTTCTGCTTG protein 1 NM 003295.1 TCATCCACACAACACCAGGACT TAAGACAAATGGGACTGATGTC ATCTTGAGCTCTTCATTTAIIII GACTGTGATTTATTTGGAGTGG AGGCATTG 1 1 1 1 1 AAGAAAAAC ATGTCATGTAGGTTGTCTAAAA ATAAAATGCATTTAAAC 228 translationally- AV749932.1 0,6 CGTCGTCTCCCTTCAGTCGCC controlled tumor ATCATGATTATCTACC protein 1 NM 003295.1 229 translationally- AV749932.1 0, 6 GGGACCTCATCAGCCaCgatgag controlled tumor atgttct protein 1 NM 003295.1 230 vasodilator- BQ340296.1 1,5 TTTATTTCCTACCAGcaggaggag stimulated ccagag phosphoprotein NM 003370.1 231 cold shock domain 1 BG739968.1 1,2 CCCAAGGTACCGTAGcaggggac protein A NM 003651.3 CtCCtCg 232 cold shock domain BE935120.1 1,5 AATAACCCACGGAAATATCTGC protein A NM 003651.3 GCAGTGTAGGAGATGGAGAAA CTGTAGAGTTTGATGTGGTTGA AGGAGAGAA 233 cold shock domain BE935120.1 1,5 GTATTTGTACATCAGactgccatca protein A NM 003651.3 agaag 234 chromosome 22 open 1,5 GAAGCAGAAGAGGTGTGAAAG AAGGTGCTGCTGGGAGGGGA GTCTGACAACCCAGC reading frame 19_J NM 003678.2 AK122673.1 235 0,8 ACGACATCGCAGAAGGTGGCT CGGAAATTCTGGTGGAAGAAC GTGAAGATGATTGTCCTTATCT Homo sapiens BG623073.1 GCGTGATTG I I I I I ATCATCAT vesicle-associated CCTCTTCATTGTGCTCTTTGCC membrane protein 8 ACTGGTGCCTTCTCTTAAGTAA (endobrevin) NM 003761.2 CAGGGAACCTCTCCCACCTGC CCTTCTTTTCAGGGACAACCCT CCATAAATGTGTGCCAAGAGG GTCTCCTTTCCTGTCTTCCTCT ACAGAGAATGCTGCTCGGTCC TCCTACCCCTCTTCCCGAGGC CTGCTGCCACGTTGTATGCCC CAGAAGGTACCTTGGTCCCCC GGAAGGAGAGAA 236 Homo sapiens NM 00376L2 BG623073.1 0,7 GATCTGGAAGCCACAtctgagcact vesicle-associated tcaag membrane protein 8 (endobrevin) 237 CASP8 and FARD- NM 003879.3 BI871546.1 1,3 AGTACAAGCAGTCTGgtggatgga like apoptosis atggaa regulator 238 beta-2-microglobulin NM 004048.2 BM831738. 0,8 AGGTTTACTCACGTCATCCAGC 1 AGAGAATGGAAAGTCAAATTTC CTGAATTGCTATGTGTCTGGGT TTCATCCATCCGACATTGAAGT TGACTTACTGAAGAATGGAGA GAGAATTGAAAAAGTGGAGCA TTCAGACTTGTCTTTCAGCAAG GACTGGTCTTTCTATCTCTTGT ACTACACTGAATTCACCCCCAC TGAAAAAGATGAGTATGCCTGC CGTGTGAACCATGTGACTTTGT CACAGCCCAAGATAGTTAAGT _GGG 239 beta-2microglobulin NM 004048.2 BM831738. TGGAGGCTATCCAGCgtactccaa 1 0,7 agattc 240 Guanine nucleotide GTGGAGAGGATCAAGgtctctcag binding protein, gcagct gamma 10 NM 004125.2 BC015206.1 0,6 241 BCL2-associated TGACTGTCACCCACAgcaatgaga athanogene NM 004323.2 BI826041.1 1,2 agcacg 242 c-src tyrosine kinase NM 004383.1 BG953215.1 1,1 CCTCAAGTTCTCGCTagatgtctgc gaggc 243 HLA-B associated CB148695.1 I 1,4 GCCCCAGGAGGAGAGgtgagCtg transcript 1 NM 004640.3 aagatgg 244 family with sequence AA024425.1 0,8 CACGGGGGAAGAGTGgaccactct similarity 50, tcaact member A NM 004699.1 245 family with sequence AA584911.1 1,6 TCAAGAGTGAGTGTTtgcggagtca similarity 50, gacgc member A NM 004699.1 246 GNAS complex locus NM 000516.3 BU784018.1 1,5 CTACTCCTGAGGATGgtgtgtatgg CttCC 247 GNAS complex locus NM 000516.3 BG911454.1 1,4 GACGCCAGGGTTTGGgtgctggag aatctg 248 hemoglobin, alpha AA343446.1 1,7 TGCTTCTCCCCGCAGgatgttCCtgt 1 /2 NM 000517.3 CCtt 249 WD repeat domain 1 NM 005112.3 BX648190.1 1,2 AAGTTCACAATTGGCgaccacagc cgcttt 250 retinoblastoma BF475362.1 0,8 TTTATTCATGGTGGTCATACTG binding protein 4 NM 005610.1 CCAAGATATCTGATTTCTCCTG GAATCCCAATGAACCTTGGGT GATTTGTTCTGTATCAGAAGAC AATATCATG 251 small EDRK-rich NM 005770.2 BG435668.1 0,9 CCGTCGCCATGACCCgcggtaacc factor 2 agcgtg 252 putative translation NM 005801.2 BG655736.1 0,7 CCTTTGTGCTTGCAGaagtttgcctg initiation factor caat 253 membrane NM 005898.2 AA437165.1 0,8 AACAGCTTCAAACAGt99 tt99 cact composent, tacc chromosome 11, surface marker 1 254 capping protein (actin NM 006136.1 BG702980.1 0,7 filament) muscle Z- line, alpha 2 AGCAAAAAA 1 1 1 1 1 Ggaatggtcgtt ggag 255 microspherule NM 006337.3 CB110581.1 1,4 AACTCTGTGGTGGAGgtgagctgg protein 1 qgagga 256 T l acidic NM 006342.1 BM313828. 1,3 ACAGTGGAGCAGAAG t t coiled-coil containing 1 9 999 9 c9 protein 3 qgaagc 257 acidic (leucine-rich) NM 006401.1 AI446778.1 1,2 AAGACGAGGACGATGAGGATG nuclear GTGAAGAAGAGGAGTTTGATG phosphoprotein 32 AAGAAGATGATGAAGATGAAG family, member B ATGTAGAAGGGGATGAGGACG ACGATGAAGTCAGTGAGGAG 258 acidic (leucine-rich) NM 006401.1 AI446778.1 1,3 AGGAGGAGGACGAAGaaggaga nuclea r agatgagg phosphoprotein 32 phosp family, member B 259 granulysin/granulysin NM 006433.2 BI838502.1 0,8 GATAAGCCCACCCAGagaagtgttt ccaat 260 lysosomal associated NM 006762.1 BQ006415.1 1,4 agatg ctccag aaggtgagtgtggctgcag multispanning membrane protein 5 261 lysosomal associated NM 006762.1 BQ006415.1 1,5 AAGATGCTCCAGAAGgtgagtgtgg multispanning ctgca membrane protein 5 262 transforming growth NM 000660. 1 AI610679.1 1,4 CGGGCTACNANATGCGCTTGG factor, beta 1 GGGGAGCCAGGACGGAGGAA (Camurati- GAGGAGAGAGAAAGAGA Engelmann disease) 263 myosin IF NM 012335.2 BF823263.1 1,3 GTGGACAATGGGAAGctgctggaa gggcct 264 ribosomal protein NM 012423.2 BM826692. 0,8 AAGCCTACAAGAAAGtttgcctatct L13a 1 gggg 265 glutathione S NM 000852.2 N59567.1 1,4 CATGCTGTTCCTTCCTCGCCAC transferase pi CCTCTGCTTC 266 chromosome 11 open NM 014206.1 BE041814.1 0,8 TCGCGGGGCAAAATGgagctcga reading frame 10 ggccatg 267 integrin, alpha X NM 000887.3 AA251543.1 1,4 TGCGACCGCCTACAGgtgacctcc (0), CD11C aaagct (p150), alpha polypeptide) 268 ring linger protein 10 NM 014868.3 BM471027. 1,3 ACTTTCTGCTGACCCCTCTGTC 1 ACCCACTGCCAGTCAGGGCAG TCCCTCATTCTGCGTTGGGAGT CTGGAAGAAGACTCTCCCTTC 269 ribosomal protein L4 NM 000968.2 CB164625.1 0,7 G G TG CTTTTG G AAAC atg tg tcg tg gaggc 270 KIAA0690 NM 015179.2 BG506709.1 1,6 TCTCTGGGCAAGCAGaaagcaaa aggtgat 271 KIAA0690 NM 015179.2 BG506709.1 1,6 GAATACAAGGCCAAGaaagcaaa aggtgat 272 bridging integrator 2 NM 016187.1 AK093638.1 0,9 AAGGCCATCGTATGGaataatgatc tCCtt 273 ribosomal protein NM 000990.2 BG824148.1 0,8 CAACTTCGACAAATAccacccagg L27a ctactt 274 ribosomal protein NM 000990.2 BI906450.1 0,8 gccacccaggctactttgggaaagt L27a 275 ribosomal protein NM 000990.2 CB119057.1 0,7 GCCACGGCCGCATAGgcaagcac L27a cggaagc 276 ankyrin repeat NM 017664.1 BCO39715.1 0,7 GGAGCATTCCATATAGAAACTG domain 10 CTGAAACTGCCACAGGTGCTT CTCCGAAAACCTTACAGTTGTG GCATTGAATGTTCAGTATCGCT TCCTTTCTGCACACG 277 ribosomal protein NM 000992.2 BQ335217.1 0,7 CCAAGTTCCTGAGGAacatgcgctt L29 tgcca 278 ribosomal protein NM 001017.2 CA843486.1 0,8 TTCCGTCTGATTCTAATAGAGA S13 GCCGGATTCACCGTTTGGCTC GATATTATAAGACCAAGCGAGT CCTCCCTCCCAATTGGAAATA 279 CNDP dipeptidase 2 AW502844. 1,5 CACAGCAGCATCAAGgtggagtgC (metallopeptidase 1 agcaac M20 family) NM 018235.1 280 ribosomal protein 0,5 AATTATGTTCCTGAGgtctcagcCtt S17 NM 001021.2 BE731466.1 ggat 281 ribosomal protein AV752729.1 0,6 GCCGCGTTCCACCAAAACCGT S17 NM 001021.2 GAAGAAAGCGGCCCGGGTCAT CATAGAAAAGTACTACACGCG CCTGGGCAACGACTTCCACAC GAACAAGCGCGTGTGCGAGGA GATCGCCATTATCCCCAGCAAA AAGCTCCG 282 sulfatase 2 NM 018837.1 AB033073.2 1, 5 G CGAGAGTGTGTCGAgtg ag tgtg cgtctg 283 ubiquitin B NM 018955.2 BG286180.1 1,6 GAAGGCGGAAAAGAGgtcaaaatg cagatc 284 ubiquitin B NM 018955.2 BG286180. 1 1,4 GGTATCCGCTAACAGgtcaaaatg cagatc 285 glycogen synthase 1 1,3 ACTTCAGTGCTGGTGgtgagggca kinase 3 alpha NM 019884.1 BQ927367.1 _ tagcct 286 KIAA1185 protein NM 020710.1 BQ352354.1 1,1 GTGTTAGGAGCGGAGataccttca cttgct 287 peptidylprolyl AA340318.1 0,8 CGCGTCTCCTTTGAGctgtttgcag isomerase A acaag (cyclophilin A) NM 021130.1 288 peptidylprolyl AA357116.1 0,8 TCCCAAAGACAGCAGaaaattttcgt isomerase A gctc (cyclophilin A) NM 021130.1 289 peptidylprolyl BE293161.1 0,7 CGCGTCTCCTTTGAGgtacggggc isomerase A ctggat (cyclophilin A) NM 021130.1 290 hypothetical protein 1,4 ATTGTTGAACTGGATgCggCtgttg FLJ14213 NM 024841.1 BQ919225.1 aagag _ 291 hypothetical protein NM 024841.1 AK055042.1 0,8 GATCAACGTTTTCAAAGGGGG FLJ14213 TGGCTTGCAAAGCAACGAGCT CTATGCCCT 292 ring linger protein 34 NM 025126.2 NM_194271 0,9 GTCGCGGCCATGAAGgtggggga .1 gtggtac 293 t-complex 1 NM 030752.1 AA160249.1 0,7 TTCTTCTTTTCCTAGgggtctcggg aacag 294 RAB34, member NM 031934.3 W32152.1 1,6 AAGAAGGATCTGAGTgtgagtgtgc RAS oncogene cagtg family 295 zinc finger, CCHC NM 032226.1 BG530408.1 0,8 ACTGGTCCATCAGTGACAAAG domain containing 7 ACATTGAG 296 guanylate binding NM 052942.2 AA164465.1 1,5 AAAAAAAGAAGAAAGaggcacaag protein 5 tgaaag 297 ubiquitin-conjugating NM 058167.2 BG766070.1 1,4 TGCGCGGAACCCGAGatgagcag enzyme E2, J2 caccagc 298 chloride intracellular NM 001288.3 AAl26087.1 0,8 CCTGAGTCCAACACAGCTGGG channel 1 CTGGACATATTTGCCAAATTTT CTGCCTACATCAAGAATTCAAA CCCAGCACTCAATGACA 299 chloride intracellular AAl26087.1 0,7 CCCAGGTACCCCAAGctggcagct channel 1 NM 001288.3 ctgaac 300 chloride intracellular AAl26087.1 0,8 GCTGTGCCCTCCCAGgtaccccaa channel 1 NM 001288.3 gctggc 301 peptidylprolyl BU195819.1 1,4 CCCAAAACATGTGAGgctggagta isomerase caatgg (cyclophilin)-like 3 NM 130906. 1 302 cAMP responsive BI831922.1 0,8 GCCACATTAGCCCAGgtatctatgc element binding cagca protein 1 NM 134442.2 303 heat shock 70kDa CD655642.1 0,8 GCCTACCTTGGGAAGactgttacca protein 8 NM 153201.1 atgct 304 E74-like factor 1 (ets NM 172373.2 AA251399.1 0,8 GCCAAGAAGCTTGAGAGAAGA domain transcription AAAATTTCAGAAAAATTGTCTC factor) AATTTGACTAGAATATCAATGA ACCAGGAAAACTGAAGCACCT TCCCTAAAGAAAACTTGGGTAT ACAATTACTCCACAGACAGAGC TGAGGG l l ~ ~ l l ACCCAAATCA GTCACTGGATTTTGCTGCCTGA TACGTGAATCTTCTTGGAATTT TTCTCATGTGGATCTAAGGGGA ATG CTTTATTATG G CTG CTGTT GTCCAACAGAACGACCTAGTAT TTGAATTTGCTAGTAACGTCAT G 305 eukaryotic translation NM 001402.4 BX454657. 1 0,8 GGCTTCACTGCTCAGgtgattatcct elongation factor 1 gaac alpha 1 306 eukaryotic translation NM 001402.4 BQ365319.1 0,8 AGCTTCTCAGACTATccacctttggg elongation factor 1 taag alpha 1 307 arachidonate 5- NM 001629.2 BF892107.1 0,9 AAGTGGAGCACGAAAGCAGGA lipoxygenase- CCCAGAATGGGAGGAGCTTCC activating protein AGAGGACCGGAACACTTGCCT TTGAGCGGGTCTACACTGCCA A 308 ribosomal protein NM 021104.1 EXH-001 0,7 AAGAAAGATGAGGCAGAGGTC L41 CAAGTAAACCGCTAGCTTGTTG 309 ribosomal protein NM 021104.1 EXH-002 0,6 GAAGCGAATGCGCAGgctgaagc L41 gcaaaag 310 translationally- NM 003295.1 EXH-003 0,5 AATGCATATTTAAACTAAATTGA controlled tumor TCCTGTAGTGTTCCTGGAGAA protein 1 GCTAGAGCCTGATTGTAGGCT ACTACTCATCAATTAACTTCTA CAGTGGAGACTACTTCTGGGA CTGGAATATAAAAA 311 GI to S phase NM 002094.1 EXH-004 1,5 ATTACCGTTTATTCCATATCTG transition 1/G1 to S GATAATTTGCCGAACTTCAATA phase transition 1 GATCAGTTGATGGACCAATCA GGCTGCCAATTGTGG 312 cyclin T2 NM 001241.2 EXH-005 0,5 ttgtgtgagctattcaaactcttcaacccctga 313 cyclin T2 NM 001241.2 EXH-006 0,7 AGCCAGTTGTCATTTttacaggattg tg tg 314 zinc finger protein NM 133476.2 EXH-007 1,5 AGTTCAGGAGCCCTGGAAAGG 384 AGAAGGAATAAGACGGCAGGA GGAAGAGA 315 TBC1 domain NM 020773.1 EXH-008 0,7 CTACCTAATTGATTGcccggggcc family, member 14 ctgatt 316 F-box protein 7 NM 012179.2 EXH-009 1,3 GGAAGCGCGGGTGGTCGGCT GGGGTCCGGCTCCTGGAGAAC ATGGCCCGGCCTCCCGGGGG CT 317 F-box protein 7 NM 012179.2 EXH-010 1,4 CTGGTCCCCTCCTCGttctaatacc cgatt 318 maltase- NM 004668.1 EXH-011 1,4 GTAATTCAACTGCCAAGTGGTG glucoamylase (alpha GAAGAGGGAAATAGMGAACT glucosidase) ATACAACAATCCACAGAATCCA GAGAG 319 Eukaryotic translation NM 001404.3 BU783548.1 0,6 TCACCTGCCCAAGAGtacctttgtgttgga elongation factor 1 gamma 320 Eukaryotic translation NM 001404.3 BG615194.1 0,8 ACCCTGTACACGTATCCTGAAAACTGGAGG elongation factor 1 GCCTTCAAGGCTCTCATCGCTGCTCAGTAC gamma AGCGGGGCTCAGGTCCGCGTGCACTCCGC ACCAC 321 KIAA1037 AB028960.1 NM_015023. 1,1 TTGCCCCCCCGCCAGcaacgctcagtatat 2 323 integrin, beta 2 NM 000211.1 AU185877.1 1,3 GTCGCCGCCTGCCCGagtgtgtgqcaggcc 323 DKFZp586K2322 AL080113.1 AI741782.1 0, 7 CCCAGAAAGAATTTTCTGCTATTGTGTTCA CTACAACAGGATAGGGACATCAGACAGCC CCAGAAACCCCTTCCAGATCTGATATGGGA CTATTAATTTTTATGCTGTTAATTGGTATTC ATTCACAATGCAGTTGAAGGGGGAAGGCT CCACTGCATTCTTTGGCTAAGGCCTGAATG CTTGCTCATCTGTAAGATCTATACTCGAGG TTTTGTTTTCCTTTTAAAATTCTTTAGGGAG AGAGGGATGGTTTCTGAGGGGTTCTGAAA GTATGATTCAATGTGCAACATACAGGTAGG TCTTCAGCATAAGCTGAAATATATGCATGTA AAAACTTTGACATCII IIIIIIIAATTTTCCA CTTTCTTCTTAACTTTACTTCTCTTTTTGTCC CCCCCCCATCTTACAGAAGTTGAGGCCAA GGGAGAATGGTAGGCACAGAAGAAACATG GCAAACTGCTCTGTGCTTTCAAACCAAAGT GTTCCCCCCAACCCCAAA 324 calpain, small subunit NM 001749.1 BF939173.1 1,2 CAACTTCATCAGCTGccaggcccaggagga 1 325 glyceraldehyde-3- NM 002046.2 BE255095.1 0,8 GCCAAGGTCATCCATGACAACTTTGGTATC phosphate GTGGAAGGACTC dehydrogenase 326 major NM 002121.4 BG759187.1 0,7 GATCTGCATAAACAGggttcctgagctcac histocompatibility complex, class II, DP beta 1 327 lysozyme (renal NM 000239.1 BE720647.1 0,8 TCGTTGTCAAAACAGAGATGTCCGTCAGTA amyloidosis) TGTTCAAGGTTGTGGAGTGTAACTCCAGAA TTTTCCTTCTTCAGCTCATTTTGTCTCTCTC ACATTAAGGGAGTAGGAATTAAGTGAAAGG TCACACTACCATTATTTCCCCTTCAAACAAA TAATAIii IACAGAAGCAGGAGCAAAATAT GGCCTTTCTTCTAAGAGATATAATGTTCACT AATGTGGTTATTTTACATTAAGCCT 328 tumor protein, NM_003295.1 AA223997.1 0,8 GAAACTTGAAGAACAgagaccagaaagagt translationally- controlled 1 329 Homo sapiens family BC014203.1 AK093557.1 0,8 CAAACCTGCTTTGCTgaaagttgcagaaaa with sequence similarity 101, member B 330 lysozyme (renal NM 000239.1 BE549820.1 0,7 AATATGAAATTTTTAAAGGAGTAGAATACCA amyloidosis) AATGATAGAAACAGACTGCCTGAATTGAGA ATTTTGATTTCTTAAAGTGTGTTTCTTTCTAA ATTGCTGTTCCTTAATTTGATTAATTTAATTC ATGTATTATGATTAAATCTGAGGCAGATGA GCTTACAAGTATTGAAATAATTACTAATTAA TCACAAATGTGAAGTTATGCATGATGTAAA AAATACAAACATTCTAATTA 331 lysozyme (renal NM 000239.1 BE549820.1 0,7 GGAGCAAAATATGGCCTTTCTTCTAAGAGA amyloidosis) TATAATGTTCACTAATGTGGTTATTTTACAT TAAGCCTACAACATTTTTCAGTTTGCAAATA GAACTAATACTGGTGAAAATTTACCTAAAAC CTTGGTTATCAAATACATCTCCAGTACATTC CGTTCIIIIIIIIIIIIGAGACAGTCTCGCT CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGC AATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCC GGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTC CCGAGTAGCTGGGATTACGGGCGCCCGCC ACCACGCCCGGCTAAIIiii1GTATTTTTAG TAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAG GATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCC ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA TTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCA CATTCAGTTCTTATCAAAGAAATAACCCAGA CTTAATCTTGAATGATAC 332 Homo sapiens NM 004368.1 BU630244.1 1,4 TTGTGGTTTCTATGCccgcctccgcctccc calponin 2 (CNN2), transcript variant 1 333 ubiquitin specific NM 005153.1 W19112.1 0,8 GCAACAGTGCGACGGGCGGCCATTACACT peptidase 10 ACAGACGTCTTCCAGATCGGTCTGAATGGC TGGCTGCG 334 SUMO-1 activating NM 005500.1 81463391.1 1,1 GTGCTGCCGGCGGCGgctgcgggcctctcg enzyme subunit 1 335 Homo sapiens LIM NM 005569.2 BX368816.1 1,2 ATCGCCTCCGGAATGgcctatttgcactct domain kinase 2 (LIMK2), transcript variant 2a 336 actin related protein NM 005720.2 BI160852.1_ 0,9 GCGTCTGTTTCTCAGccagcggqaqccgcg 2/3 complex, subunit 1B, 41kDa 337 tubulin, alpha, NM 006082.1 BE278798.1 0,6 CTGTCAGTTGATTATGGCAAGAAATCCAAG ubiquitous CTGGAGTTCTCCATTTACC 338 mannosidase, alpha, NM 006122.1 AI480034.1 1,5 GACATCGACAGCCAGggtgcagccccqacq class 2A, member 2 339 golgi apparatus NM 012201.1 BCO31836.1 1,2 ACATCACTGAGTATCAGTGTCACCAGTACA protein 1 TTACCAAGATGACGGCCATCATTTTTAGTG ATTACCGTTTAATCTGTGGCTTCATGGATG ACTGCAAAAATGACATCAACATTCTGAAAT GTGGCAGTATTCGGCTTGGAGAAAAG 340 c-myc binding protein NM 012333.2 AI291757.1 1,4 GGCGCCAGCTACGCCGCTGCCGCTGTCAC TATGGCCCATTACAAAGCCGCCGACTCGAA GCG 341 lysosomal-associated NM 014713.2 R61059.1 0,7 CTGAGAGAATGGCTGataatgcctgtgttc protein transmembrane 4 alpha 342 eukaryotic translation NM 016091.1 CD389782.1 0,7 CGTTCCAATCCCAAAATCTGGAATGTTCAT initiation factor 3, AGTGTCCTCAATGTCCTTCATTCCCTGGTA subunit 6 interacting GACAAATCCAACATCAACCGACAGTTGGAG protein GTATACACAAGCGGAG 343 Homo sapiens NM 021038.1 BM083621.1 0,6 TTTGTAATTAGTTATTATAAGAAGATCTAGA muscleblind-like TCCTAGATATTAGAATAAAATTTATTTTCTA (Drosophila) CTGTATCCATTTCAAATGTTAAAATATTGTT (MBNL1), transcript variant 1 TAATATTTTTGAAATCCCTGAGTATCAGGCC TTGTTATAAATAAGCTGCATAATCAATAAAT AGAACAAGGGACTTTTTGTTGATAATCCAA ATACTCAAAGTTTACGTAATGAAAATTATAG CGTGTGTGCAAACTCTTGAGGGTTGATTAT GCTGCAATTTAGCATGTTGGAACGTCTAGG GAGAAGGTTGACTTTTTGCACTTCTGTATAT AGTCAAAAGAGAGAAACCTGTATAATAGTA AGATCTTATTTTGAATAAAAACGTCTATAAT TACAAGGAGTTTTGTTAAGGCTAATACAAT GACAGACTGAGCAAAATTGCTTGCAAAAGT GGCACAGAGTTAGCACTCCATACCCCTTCA AACATGTTGCTTTGCTTTCTTGTGGACAGC TTGTAGTTTGCC 344 amino-terminal NM 001130. 4 BE857026.1 1,3 ATCATCCGACAGCAGctccacgcccacctq enhancer of split (AES), transcript variant 2 345 heterogeneous NM 031314.1 BU570812.1 0,8 TTCAGGCCATTAAGAAGGAGCTGACCCAG nuclear ATAAAACAAAAAGTGGATTCTCTCCTGGAA ribonucleoprotein C . AACCTGGAAAAAATGGAAAAGGAAC (C1/C2) (HNRPC), transcript variant 1, mRNA 346 Homo sapiens plexin 1 TGTGAGAATACAGAACCAGTGGAAACTTCT domain containing 2 AK027529.1 0,9 TCTCGAACCACCACAACCATAGGAGCGAC (PLXDC2) NM 032812.6 AACCACCCAGTTCAGGGTCCTAACTACCAC CAGAAGAGCAGTGACTTCTCAGTTTCCCAC CAGCCTCCCTACAGAAG 347 Homo sapiens cDNA AA225636.1 0,7 GTAGCCTCACTGGAGGGCATTGCCCCGGA clone AGATCAAGTCGTGCTCCTGGCAGGCGCGC IMAGE:5212028, CCCTGGAGGATGAGGCCACTCTGGGCCAG partial cds BCO51834.1 TGCGGGGTGGAGGCCCTGACTACCCTGGA AGTAGCAGGCCGCATGCTTGGAGGTGAGT GAGAGAGGAATGTTCTTTGAAGTACCGGTA AGCGTCTAGTGAGTGTGGGGTGCATAGTC CTGACAGCTGAGTGTCACACCTATGGTAAT AGAGTACTTCTCACTGTCTTCAGTTCAGAGTGATTCTTCCTGTTTACATCCCTCATGTTGA ACACAGACGTCCATGGGAGACTGAGCCAG AGTGTAGTTGTATTTCAGTCACATCACGAG ATCCTAGTCTGGTTATCAGCTTCCACACTA AAATTAGGTCAGACCAGGGCCCCCAAAGT GCTCTATAAAATTAGAAGCTGGAAGATCCT GAAATGAAACTTAAGATTTCAAGGTCAAATA TCTGCAACTTTGTTCTCATTACCTAT 348 chloride intracellular AI334086.1 0,9 CTGGCTGACTGCAACctgttgccaaagtta channel 1 NM 001288.3 349 H LA-B associated BF025832.1 1,3 ATTCTGGCACACAGCCTGGTGGTGTTCCG transcript 3 (BAT3), AGTGCTCCCACTGGCCCCC transcript variant 3 NM 080703.1 350 nucleosome assembly BG110891.1 0,8 TTGCCCCTCCTGAAGttcctgagagtggag protein 1-like 1 NM 139207.1 (NAP1L1), transcript variant 1 351 enoyl Coenzyme A NM 001398.1 BG333307.1 1,4 CGGCCCAACAAGAGGtgccccaagcccgtg hydratase 1, peroxisomal 352 EST clone NM 173703.1 CB962365.1 1,1 AACACAAACTACCACctactcatgcaccta CB962365.1 353 Dicerl , Du-1 NM 177438.1 80009528.1 0,8 ACTAAAGTCCTCCTGccaggtagttcccac homolog (Drosophila) 354 Beta tubulin (TUBB) NM 178014.2 N85882.1 0,7 TCCCATCTCAGCTTCAAGGGAGGTGTCAG CAGTATTATCTCCACTTTCAATCTCCCTCCA AGCTCTACTCTGGAGGAGTCTGTCCCACTC TGTCAAGTGGAATCCTTCCCTTTCCAACTC TACCTCCCTCACTCAGCTCCTTTCCCCTGA TCAGAGAAAGGGATCAAGGGGGTTGGGAG GGGGGAAAGAGACCAGCCTTGGTCCCTAA GCCTCCAGAAACGTCTTCTTAATCCCCACC TTTTCTTACTCCCAAAAAAGAATGAACACCC CTGACTCTGGAGTGGTGTATACTGCCACAT CAGTGTTTGAGTCAGTCCCCAGAGGAGAG GGGAACCCTCCTCCATCIIIIIIGCAACAT CTCATTTCTTCCTTTTGCTGTTGCTTCCCCC CTCACACACTTGGTTTTGTTCTATCCTACAT TTGAGATTTCTATTTTATGTTGAACTTGCTG CInIIIICATATTGAAAAGATGACATCGCC CCAAGAGCCAAAAATAAA 355 Immunoglobulin BCO34142.1 BCO30813.1 1,2 GAGGAACTGCTCAGTTAGGACCCAGACGG kappa variable chain AACCATGGAAGCCCCAGCGCAGCTTCTCTT 1-5, mRNA CCTCCTGC 356 Immunoglobulin BCO34142.1 AF027158.2 1,2 ATGGAAACCCCAGCGCAGCTTCTCTTCCTC kappa variable chain CTGC 1-5, mRNA 357 Homo sapiens T-cell K02885.1 AF327294.1 0,8 CAAGGCACCAGACTCacagttgtagagqac receptor active beta- chain V-D-J-beta-1.2-C-beta 1 (TCRB 358 glutathione NM 002085.1 A1188779.1 0,8 tgccatcaagtggaacttcaccaag peroxidase 4 (phospholipid hydroperoxidase) 359 Secreted protein, NM 003118.1 BG424815.1 1,1 AAGCAGAAGCTGCGGgtgaagaagatccat acidic, cysteine-rich (osteonectin) 360 tumor protein, NM 003295.1 B1909906.1 0,7 ATGGTCAGTAGGACAGAAGGTAACATTGAT translationally- GACTCGCTCATTGGTGGAAATGCCTCCGCT controlled 1 GAAGGCCCCGAGGGCGAAGGTACCGAAA GCACAGTAATCACTGGTGTCGATATTGTCA TGAACCATCACCTGCAGGAAACAAGTTTCA CAAAAGAAGCCTACAAGAAGTACATCAA _ 361 hypothetical protein NM 004125.2 U31383.1 0,8 GCAGAGCTTCAACAGTACTGTATGCAGAAT L00552891 _ GCCTGCAAGGATGCCCTGCTGGTGGGTGT (L00552891) TCCAGCTGGAAGTAACCCCTTCCGGGAGC CTAGATCCTGTGCTTTACTCTGAAGACTC 362 sin3-associated NM 005870.3 AA346556.1 0,8 GCAGATCTACACTTGgatggatgcaacctt polypeptide, 18kDa 363 Acidic (leucine-rich) NM 006305.2 BF038728.1 1,2 TATAACGATGGAGAGGTAGATGACGAGGA nuclear AGATGAAGAAGAGCTTGGTG phosphoprotein 32 family, member A 364 syntaxin binding NM 006949.1 80002314.1 1,3 CGCCCCCGCCCACGCCTGGGTCTGTGTTA protein 2 GGTGGGCGGCCTGGCGGCGGTGAGGGCC TCCTGCCTGGACTTTCTGC 365 anaphase promoting NM 013366.2 BQ045327.1 1,4 GAGGAGGAGCTGCTGgtgcgcgtgcaggcc complex subunit 2 366 integrin, alpha X AA251543.1 1,3 CCGACCCAGGACACCCTGACCTCTGGAGT (antigen CD11C CCCCCATCCCAGGCCCCTGTCTCCCACCC (p150), alpha TGCTCATTGTCCACCCAAGGAGTTCCTGTC polypeptide) NM 000887.3 ; TCAACGCCGTCCCT 367 ring finger protein 10 NM 014868.3 BM471027.1 1,4 CCTTCCTTTGCCCAGatgctgagggttgqa 368 SERPINE1 mRNA 80003049.1 1,1 binding protein 1 NM 015640.1 I I I 1 ICACATTACAGtggcctgaagcacga (SERBP1), transcript variant 4 369 ribosomal protein NM 000990.2 BG824148.1 0,8 TGGGAAAGTTGGTATGAAGCATTACCACTT L27a AAAGAGGAACCAGAGCTTCTGCCCAACTGT CAACCTTGACAAATTGTGGACTTTGGTCAG TGAACAGACACGGGTGAATGCTGCTAAAAA CAAGACTGGGGCTGCTCCCATCATTGATGT GGTGCGATCG 370 Actinin, alpha 1 NM 001102. 2 AK098203.1 1,3 ATGGACACGGATGATTTCCGCGCCTGCCT GATCTCC 371 chromosome 6 open NM 030939.2 BE813002.1 0,8 GATGTAATTGGCTGTACTCAGGAGATGGAT reading frame 62 TTCATTCTTTGGCCTCGGAATGATATTGAAA AAATCGTCTGTCTCCTGTTTTCTAGGTGGA AAGAATCTGATGAGCCT 372 Homo sapiens BCO34141.1 BF870126.1 1,1 AGGTGGAGATCAGACgaactgtggctgcac immunoglobulin kappa constant chain (cDNA clone MGC 32713) 373 cleft lip and palate NM 001294.1 AK027698.1 1,3 GACGGGCCAGCCCGACCTCACACTGCCT associated transmembrane protein 1 374 enoyl Coenzyme A NM 001398.1 CB268506.1 1,0 GAACGCAGTAGACGAAGGCGGCGGCGTA hydratase 1, GGCGGCGGGGATAGTGGCTTCTCGCAGAC peroxisomal TCCGCG 375 membrane-associated NM 145021 EXH- 1,5 GCCACTGTGAAGGAGATGATGAGAGCCCC ring linger (C3HC4) PBMP0572- CTGATCACCCCCTGCCACTGCACAGGAAG 01 CCTCCACTTCGTGCACCAGGCCTGCCTGC AGCAGTGGATCAA 376 maltase- NM 004668 EXH-1, 3 GGGAGCAGATATCTGTGGGTTCTTTCAAGA glucoamylase (alphaPBMO1078-TGCTGAATATGAGATGTGTGTTCGCTGGAT qlucosidase) 01 GCAGCTGGGGGCCTTTTACCCCTTCTCAA GAAACCACAACACCATTGGGA Les variants SEQ ID Nos: 308-318 correspondent à de nouvelles ESTs Tableau 2 û Liste de 100 transcrits exprimés différentiellement lors du développement d'un cancer du sein SEQ Description de la N Genbank N Genbank C MI Séquence Cible ID N séquence (reference) (variant) vs. Sains cDNA DKFZp451G151 (Leucine-rich repeat GAATGAATTTTCTTGctgctatgcct 3 kinase 2) AL832453.2 BU634341.1 0,8 ttct cDNA DKFZp667I093 AL832878.1 AI223156.1 0,7 TGCAGATTTGATGGCCtaCtgtga (Guanine nucleotide agcaca binding protein, gamma 2) 7 Homo sapiens B0009917.1 BCO28225.1 1,4 ATGAAGAAAAACAAAgtgcacag hypothetical protein agacccg DKFZp761A052 12 Microtubule associated BC048206.1 AF052170.1 1,4 TGGGAGGGTCGACCTTGATC monoxygenase, ATGAAACAATACCATGAGGGG calponin and LIM GCCTCTGTCACCTTTGAAAAG domain containing 2 AACACTTTTTGAGCAGCCTCA AAAAGCTCATACATACCAGCG CCTTCTTAAATTGGCTCTAATG TAAAGATTGTTAATGTCATTTA TCAAAACCATAGGTGATTATTT G G AG G GATTTAAAAAACTTAA TTACTCTCAGGCCTCATCCCA AGCTTGACACATGCTCTGTAG GTTGAACACATAATCACAAAT ATTCTAG CAAATG CTG C CT TG GTTGCAGCCTGCACTGTAGAC CCAAGGGTTTTGCTGTGGCTC TTCTTATCTCCCTTGGCTCATA AAGCCCCAGATGATGCCAGA GCTTCAATTAGAGCCATCATC ATC C CAG G CAG G GATATCTTT GAGAAATGACTCAGTTCAGCC CCAGGCCCCTGTGACTCTGCT TAAAGCACACATTTCTGCTGA CTCTTGTACCTGGGGCAGCA GGATAATCACCAACAC 14 cellular homolog of NM 001997.2 W17004.1 0,6 GGCCGCATGCTTGGAaggtaaa the fox sequence in the gtccatgg Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus i cellular homolog of NM 001997.2 i 0,7 TGACCGGCCAGGAAAcggtcgcc 16 the fox sequence in the AA063591.1 cagatca Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 17 cellular homolog of NM 001997.2 AA094898.1 0,6 CAGGCCGCATGCTTGaggtaaa the fox sequence in the gtccatgg Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 18 cellular homolog of NM 001997.2 AA187006.1 0,7 AGGCCGCATGCTTGGaggtaaa the fox sequence in n the gtccatgg the Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 19 cellular homolog of NM 001997.2 AA225636.1 0,6 GGCCAGGAAACGGTCgcccaga the fox sequence in the tcaaggta Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 23 cellular homolog of NM 001997.2 BU603086.1 0,6 GAAGTAGCAGGCCGCatgcttgg the fox sequence in the aggtaaa Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 24 cellular homolog of NM 001997.2 BF218408.1 0,6 AGGCCGATGCTTGGAggtaaagt the fox sequence in the ccatgqt Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 25 cellular homolog of NM 001997.2 AI499403.1 0,7 CCCGCATGCTTGGAGgtaaagtc the fox sequence in the catggtt Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 26 cellular homolog of NM 001997.2 AW795076.1 0,6 CGGTCGCCCAGATCAaggctcat the fox sequence in the gtagcct Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 35 SEC14-like 1 (S. NM 003003.1 AK130317.1 1,3 TAG G G CTAGTAG G TA G G G CT cerevisiae) AGTAG GTAG G G CTAGTAG GTA G G G CTAG TAG G TAG G G CTAG TAGGTAGGGCTAGTAGGTAG G G CTAGTAG GTAG G G TT C GTA GGTAGGGTTCGTAGGTAGGG TTCGTAG GTAG G GTTAGTAG C G CGTCTGTG CTG CTTCCACCT GGTGCTTCCTGTTCCCAAATC ACAAGGGCCTGAAGGTGGTC CCTGCTTTCTCTTTCTCTTTCT CTGTGTCTCAGATGGCGATTT TG CTGACAG CTG CCAAGAAAA TGCTTCACTCAACAGTCCTCA TGTGCCCAGAGATGTTTATAG AACTGTTTGAATTG CAG CCAT CCCCTGCCCCCTCCCAGGCT GAAGATCTGTTCiiIIIAAGTT GATTCGGGAGTGGCATTCTTT TATACCCAAAGACTGTAGTGC ATCTTGAAGAGCTCAAAGCAC ATGACCGCACAAATGCTTACA GGGTTTCCTCCCGAGTAATCC AATCTCACTCCCCTTGTAAGG 43 nuclear factor 1,5 CGGGTCAGTGTACAGgaagagg (erythroid-derived 2)- caggcact like 1 NM 003204.1 BM973053.1 44 nuclear factor 1,5 TGCTGTGAGGCAGAGgaatgatg (erythroid-derived 2)- gagaatc like 1 NM 003204.1 BM973053.1 46 synuclein, alpha (non 1,4 CCACAGGAAGGAATTCTGGAA A4 component of GATATGCCTGTGGATCCTGAC amyloid precursor) NM 000345.2 NM 007308.1 AATGAGGCTTAT synuclein, alpha (non GACCAGTTGGGCAAGaatgaag A4 component of 1,5 aaggagcc A4 component 47 amyloid precursor) NM 000345.2 NM 007308.1 translationally-AGAtcgcggacgggttgtgcctggaggT controlled tumor 51 protein 1 NM 003295.1 CA848049.1 0,7 GG 52 translationally- NM 003295.1 CA848049.1 0,5 TCCGACATCTACAAGatccggga controlled tumor gatcgcg protein 1 53 e tllyNM 003295.1 BCO22436.1 0,6 CCGACATCTACAAGATCCGGG cons AGATCGCGGACGGGTTGTGC contro lled tumor CTG protein 1 54 translationally- NM 003295.1 BC040008. 1 0,5 GCGCCGCTCCGGCTGCACCG controlled tumor CGCTCGCTCCGAGTTTCAGG protein 1 CTCGTGCTAAGCTAGCGCCGT CGTCGTCTCCCTTCAGTCGCC ATCATGATTATCTACC 55 TYRO protein tyrosine BF092099.1 0,8 GAGGGGCTGCGGAGGcagcga kinase binding protein NM 003332.1 cccggaaac 60 cold shock domain BO009744.1 1,5 CCCAACAGAATACAGgCtggtga protein A NM 003651.3 gattgga 64 beta-2-microglobulin NM 004048.2 AV734235.1 0,7 ATTTG GATTG GATGAATTC CA AATTCTGCTTGCTTGC 1 I I I I A ATATTGATATGCTTATACACTT ACACTTTATGCACAAAATGTA GGGTTATAATAATGTTAACAT GGACATGATCTTCTTTATAATT CTACTTTGAGTGCTGTCTCCA TGTTTGATGTATCTGAGCAGG TTGCTCCACAGGTAGCTCTAG GAGGGCTGGCAAC 69 SEC24 related gene AW449995.1 1,8 GCAGCTGTCTGGAATgcagagg member C (S. 99 cerevisiae) NM 004922.1 cagctgga 71 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000517.3 H78334.1 1,4 CGGTCAACTTTCAAGctccttaag CCaCtg 72 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000517.3 1 1, 4 TCAAGGCCGCCTGGGgatgttcct H55830.1 gtcctt 80 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000558.3 R91899.1 1,7 ACCAAGACCTACTTCccggtcaac , ttcaag 81 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000558.3 H58664.1 1,7 GGAGGCCCTGGAGAGctcctaag ccactgc 85 CD164 antigen, AF299342.1 0,8 CTGTGACTCCAACCTCACAAC sialomucin NM 006016. 3 1CTGTGCGAAAGTCTACCTTTG ATGCAGCCAGTTTCATTGGAG GAATTGTCCTGGTCTTGGGTG ïTGCAGGCTGTAATTTTCTTTCT TTATAAATTCTGCAAATCTAAA GAACGAAATTACCACACTCTG TAAACAGACCCATTGAATTAAT AAGGACTGGTGATTCATTTGT GTAACTCACTGAAGCCAAAAT ACTATCIIIIAAGATGTCCCAC ATGGAAGACGCTATTCCAGGA TCTTTAAATTTC CATG GATG CA TATAGGATGTTTGGGAGCATC ATCCGTGAAGAAAAAATCAAT TAAATCATTGTGTTCAACAGG AATATTTAAAATATTCTGCATG AATCCTGTGGCTGTCTTATTTT AAATAG CTG CTG CTG TG G G AT TATA I111111ICCTTAACATG CCAAATATAACTTTCTGAAAGT GATGGAAAATGTTGTCTTGTG CAGACAACATCATGGCTCTTG GCAGTTTA 86 CD164 antigen, NM 006016.3 AF299343.1 0,8 CAGCCAATTCTACAGctaaaccc sialomucin acagttc CCCAGAGTATTAACGCTCCAA GAGTATTATTAACGCTGCTGT ACCTCGATCTGAATCTGCCGG GGCCCCAGCCCACTCCACCC TGCCAGCAGCTTCCAGCCAGT CCCCACAGCCTCATCAGCTCT CTTCACCGIIIIIIGATACTAT CTTCCCCCACCCCCAGCTACC CATAG G G G CTG CAG AG TTATA AGCCCCAAACAGGTCATGCTC CAATAAAAATGATTCTACCTAC 88 talin 1 NM 006289.2 AI393487.1 1,4 AA 89 talin 1 NM 006289.2 AI393487.1 1,4 TG CTTC G GAAG G AACg a g ag ctg gaagagg 90 talin 1 NM 006289.2 AI417760.1 1,4 AGGAAGAAATGCTTCggaagga acgagagc 95 acidic (leucine-rich) NM 006401.1 Y07570.1 1,5 GAAGTCAGTGAGGAG aa aa nuclea r g g g hosphoprotein 32 aatttgga phosp family, member B 102 soluble galactoside- NM 009587.1 BG698264.1 0,8 CTCCAGTGGAACCAGgtttgctgtg binding lectin 9 aactt (galectin 9) 116 Homocysteine- NM 014685.1 BG828243.1 0,7 GGAAAACATCTCAAG9 cct9 aa 9 inducible, endoplasmic ctgccca reticulum stress- inducible, ubiquitin- like domain member 1 120 ring finger protein 10 NM 014868.3 BU626650.1 1,5 CGAGAGCGCAGGATTGAGAT AGAGGAGAACA 121 ring fnger protein 10 NM 014868.3 BU626650.1 1,5 AG AAACAG GG CAAGTa ccca g a agtccaca 125 ribosomal protein L4 NM 000968.2 CHI 41160.1 0,7 GTCATCAGACTAGTGCTGAGT CTTGGGGTACTGGCAGAGCT GTGGCTCGAATTCCCAGAGTT CGAGGTGGTGGGACTCACCG CTCTGGCCAGGGTGC I I I I GG AAACatgtgtcgtg 126 ribosomal protein L4 NM 000968.2 CD686462.1 0,6 GCGTGTGCTCGCCCACTGATA TCGGTGTACTCCGAAAAGGG G GAGT CAT CT G G CAAAAAT GT CACTTTGCCTGCTGTATTCAA GGCTCCTATTCGACCAGATAT TGTGAACTTTGTTCACACCAA CTTGCGCAAAAACAACAGACA GCCCTATGCTG 137 ubiquitin B NM 018955.2 AA206538.1 1,4 CAGGTCAAAATGCAGatcttcgtg aaaacc 138 ubiquitin B NM 018955.2 AA206538. 1 1,3 CAG GTCAAAATGCAGatcttcgtg aagacc 139 ubiquitin B NM 018955.2 AA340917.1 1,4 AGATCTTCGTGAAGACCCTGA CCGGCAAGACCATCACTCTG GAGGTGGAGCCCAGTGACAC CATCGAAAATGTGAAGGCCAA GATCCAAGATAAAGAAGGCAT CCCCCCCGACCAGCAGAGGC TCATCTTTG CAGGCAAGCAG C TG GAAGATG G CCG CACTCTTT CTGACTACAACATCCAGAAAG AGTCGACCCTGCACCTGGTC CTGCGCCTGAGGGGTGGCTG TTAATTCTTCAGTCATGGCATT CGCAGTGCCCAGTGATGGCA TTACTCTGCACTATAGCCATTT GCCCCAACTTAAGTTTAGAAA TTACAAGTTTCAGTAATAGCT GAACCTGTTCAAAATGTTAATA AAGG 140 ubiquitin B NM 018955.2 BU661443.1 1,4 TCCCTGTGGGTGGACGTGGT TGGTGATTGGCAGGATCCT 141 ubiquitin B NM 018955.2 BU661443.1 1,5 G GTTGG CTTTGTTGGgtgag cttg tttgtg 145 major CD686254.1 0,7 TCAGAGACAGTCTTCCTGCCC histocompatibility AGGGAAGACCACCTTTTCCGC complex, class II, DR AAGTTCCACTATCTCCCCTTC alpha NM 019111.2 CTGCCCTCAACTGAGGACGTT TACGACTGCAGGGTGGAGCA CTGGGGCTTGGATGAGCCTC TTCTCAAGCACTGGGagtttgatg ctccaagccctctc 147 KIAAI 191 irotein NM 020444.2 BI254429.1 1,5 GCAGCAGGATCACAGaacagac cca.. aaa 148 mesoderm induction AY124186.1 0,7 ' TTTCTCACACAGGCAtactccaaa early response I NM 020948.1 ~tjC CttC 151 myelin protein zero AI693779.1 0,9 TGCCCTGGCATTCTGGCAGA like 1 NM 024569.2 GAATCCTCACCAGTTCTCACC AACCTTCCCCCCAGGCAAGG GCAGCTGCCAGCATGGTGCT CTGCCAGGACAGGTTTCCCTG AAGGAAGCTGCTCACACTGAG ATGAGCCTCTCAGGGCAGGA CCTCTTCCCAAGCCCTGCACA CCCACCCCTGCAGCCCTTTTG GCTC 152 likely ortholog of GCTTCAGTCCGCCGAgagcagta mouse limb-bud and W45195.1 1,1 ccgtgtg heart Bene NM 030915.1 155 s;s NM 033306.1 NM 001225.2 1,2 TGTTCCCTATGGCAGaaggcaac related cy steieine ne cacagaa ela protease 158 major NM 033554.2 BU621846.1 0,7 AAGGAGCCTGTGGAGctgggcca histocompatibility gcccaac IIy oplecas II, DP complex, alpha 1 159 FK506 binding protein NM 054014.1 NM 000801.2 0,8 GCTCCCTGTTCTTGGatctgccat 1A, 12kDa ggaggg 160 chloride intracellular NM 001288.3 BG491600.1 0,8 CCAGGGACGGCCACTTCCTG channel l GTCCCCGACGCAACCATGGC TGAAGAACAACCGCAGGTCG AATTGTTCGTGAAG 161 chloride intracellular NM 001288.3 AV683308.1 0,7 GGGCAGCTCCCATTCctgctgtat channel I ggcact 164 chromosome 19 open NM 138774.2 AI375989.1 1,4 ACCTCATCTCGGCCAgtgctgacc reading frame 22 tggagg 177 tropomyosin 3 NM 153649.1 BM006741.1 1,3 TGATGAGAGTGAGAGgcagaga cccgtgct 184 eukaryotic translation NM 001404.3 AA206367.1 0,7 CTGAGTCCAGATTGGCAGGT elongation factor 1 GGACTACGAGTCATACACATG gamma GCGGAAACTGGATCCTGGCA GCGAGGAGACCCAGACGCTG GTT 185 eukaryotic translation NM 001404.3 AA206367. 1 0,6 CAGCATGTGGGCAAAGCCTTC elongation factor 1 AATCAGGGCAAGATCTTCAAG gamma TGMCATCTCTTGCCATCACC TAG 187 eukaryotic translation BU783548.1 0,6 ATTTAAGCGCAAGTACTCCAA elongation factor 1 TGAGGACACACTCTCTGTGGC :amma NM 001404.3 ACTGCCATATTTCTGGGAGCA CTTTGATAAGGACGGCTGGTC CCTGTGGTACTCAGAGTATCG CTTCCCTGAAGAACTCACTCA GACCTTCATGAGCTGCAATCT CATCACTG eukaryotic translation TGGACAAGCTGAGGAAGAAT elongation factor 1 GCCTTCGCCAGTGTCATCCTT TTTGGAACCAACAATAGCAGC TCCATTTCTGGAGTCTGGGTC 188 :amma NM 001404.3 Î BE502067.1 0,6 TTCCGAGGCCAG CAGGTGGACTACGAGTCATAC ACATGGCGGAAACTGGATCCT GGCAGCGAGGAGACCCAGAC eukaryotic translation GCTGGTTCGAGAGTACTTTTC elongation factor I CTGGGAGGGGGCCTTCCAGC 189 :amma NM 001404.3 BE502067.1 0,6 ATGTGGGCAAAGCCTTCAA eukaryotic translation GAGCTTGCCTTTCCGctgagtcca elongation factor 1 190 :amma NM 001404.3 BE502067.1 0,6 gattgq eukaryotic translation AAGGAGGAGAAAAAGGCGGC TGCCCCTGCTCCTGAGGAGG elongation factor 1 AGATGGATGAATGTGAGCAG 191 :amma NM 001404.3 BG533219.1 0,8 GCGCTGGCTGCTGAGCCCAA GGCCAAGGACCCCTTCGCTC ACCTGCCCAAGAG 203 calpain, small subunit _ NM 001749.1 BE907701.1 1,4 CCTTTGAGGCAGCAGatgaaagt 1/calpain, small gggaaca subunit 1 204 Cysteinyl-tRNA NM 001751.3 AK125503.1 1,5 AAACAGGAACAAGAAgcagcaaa synthetase gctggcc 222 prohibitin NM 002634.2 BE536369.1 1,4 GCGAGGAGAGTGCGTgtgtgaga gggtcca 225 translationally- NM 003295.1 BG284235.1 0,6 TTCTTTATTGGTGAAAACATGA controlled tumor ATCCA GATG G CATG GTTG CTC protein 1 TATTGGACTACCGTGAGGATG GTGTGACCCCATATATGATTT TCTTTAAGGATGGTTTA transtationally_ TTATTTTG GATCTATCAC CTGT controlled tumor CATCATAACTG G CTTCTG CTT GTCATCCACACAACACCAGGA CTTAAGACAAATGGGACTGAT GTCATCTTGAGCTCTTCATTTA TTTTGACTGTGATTTATTTG GA GTG GAG G CATTGTTTTTAAGA AAAACATGTCATGTAGGTTGT CTAAAAATAAAATGCATTTAAA 227 protein 1 NM 003295.1 CD641954.1 0,7 C 228 translationally- NM 003295.1 AV749932.1 0,6 CGTCGTCTCCCTTCAGTCGCC controlled tumor ATCATGATTATCTACC protein 1 229 translationally- NM 003295.1 AV749932.1 0,6 GGGACCTCATCAGCCacgatgag controlled t tum tumor atgttct protein 1 232 cold shock domain NM 003651. 3 BE935120.1 1,5 AATAACCCACGGAAATATCTG protein A CGCAGTGTAGGAGATGGAGA AACTGTAGAGTTTGATGTGGT TGAAGGAGAGAA 236 Homo sapiens vesicle- NM 003761.2 BG623073.1 0,7 GATCTGGAAGCCACAtctgagca associated membrane cttcaag protein 8 (endobrevin) 237 CASP8 and FADD- NM 003879.3 BI871546.1 1,3 AGTACAAGCAGTCTGgtggatgg like apoptosis aatggaa regulator 239 beta-2-microglobulin NM 004048.2 BM831738.1 0,7 TG GAG G CTATCCAG Cgta ctcca aagattc 240 Guanine nucleotide NM 004125.2 BC015206.1 0,6 GTGGAGAGGATCAAGgtctctcag binding protein, gcagct gamma 10 242 c-src tyrosine kinase NM 004383.1 BG953215.1 1,1 CCTCAAGTTCTCGCTagatgtctg cgaggc 248 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000517.3 i AA343446.1 1,7 TGCTTCTCCCCGCAGgatgttcct gtcctt 253 membrane component, NM 005898.2 AA437165.1 0,8 AACAGCTTCAAACAGtggttggca chromosome 11, cttacc surface marker 1 254 capping protein (actin 0,7 filament) muscle z- fine, alpha 2 NM 006136.1 BG702980.1 AGCAAAAAATTTTTGgaatggtcgt tggag 258 acidic (leucine-rich) 1,3 AGGAGGAGGACGAAGaaggag nuclear NM 006401.1 AI446778.1 phosphoprotein 32 aagatgagg family, member B 261 lysosomal associated ù, BQ006415.1 1,5 AAGATGCTCCAGAAGgtgagtgtg multispanning NM 006762.1 gctgca membrane protein 5 266 chromosome 11 open NM 014206.1 BE041814.1 0,8 TCGCGGGGCAAAATGgagctcga reading frame 10 ggccatg 269 ribosomal protein L4 NM 000968.2 CB164625.1 0,7 G GTG CTTTTG GAAACatgtgtcg tg gaggc 276 ankyrin repeat domain NM 017664.1 BCO39715.1 0,7 GGAGCATTCCATATAGAAACT 10 GCTGAAACTGCCACAGGTGCT TCTCCGAAAACCTTACAGTTG TGGCATTGAATGTTCAGTATC GCTTCCTTTCTGCACACG 280 ribosomal protein S17 NM 001021.2 BE731466.1 0,5 AATTATGTTCCTGAGgtctcag cct tggat 281 ribosomal protein S17 NM 001021.2 AV752729.1 0,6 GCCGCGTTCCACCAAAACCGT GAAGAAAGCGGCCCGGGTCA TCATAGAAAAGTACTACACGC GCCTGGGCAACGACTTCCAC ACGAACAAGCGCGTGTGCGA GGAGATCGCCATTATCCCCAG CAAAAAGCTCCG 282 sulfatase 2 NM 018837.1 AB033073.2 1,5 GCGAGAGTGTGTCGAgtgagtgt gcgtctg 283 ubiquitin B NM 018955.2 BG286180. 1 1,6 GAAGGCGGAAAAGAGgtcaaaat gcagatc 284 ubiquitin B NM 018955.2 BG286180. 1 1,4 GGTATCCGCTAACAGgtcaaaat gcagatc 290 hypothetical protein NM 024841.1 BQ919225.1 1,4 ATTGTTGAACTGGATgcggctgttg FLJ14213 aagag 298 chloride intracellular NM 001288.3 AAl26087.1 0,8 CCTGAGTCCAACACAGCTGG channel 1 G CTG G ACATATTTG C CAAATT TTCTGCCTACATCAAGAATTC AAACCCAGCACTCAATGACA 299 chloride intracellular AAl26087.1 0,7 CCCAGGTACCCCAAGCtggCagC channel 1 NM 001288.3 tctgaac 300 chloride intracellular AAl26087.1 0,8 GCTGTGCCCTCCCAGgtacccca channel 1 NM 001288. 3 agctggc 307 arachidonate 5 BF892107.1 0,9 AAGTGGAGCACGAAAGCAGG lipoxygenase ACCCAGAATGGGAGGAGCTT activating protein NM 001629.2 CCAGAGGACCGGAACACTTG CCTTTGAGCGGGTCTACACTG CCAA 309 ribosomal protein L41 NM 021104.1 EXH-002 0,6 GAAGCGAATGCGCAGgctgaag cgcaaaag 312 cyclin T2 NM 001241.2 EXH-005 0,5 ttgtgtgagctattcaaactcttcaacccctga 314 zinc fnger protein 384 NM 133476.2 EXH-007 1,5 AGTTCAGGAGCCCTGGAAAG GAGAAGGAATAAGACGGCAG GAGGAAGAGA Tableau 3 ù Panel de 66 marqueurs exprimés différentiellement dans les cancers du sein des patients R et NR (PANEL 6) SEQ Description de la N Genbank N Genbank C UII Séquence Cible ID N séquence (reference) (variant) vs. Sains cDNA DKFZp667I093 AL832878.1 AI223156.1 0,7 TGCAGATTTGATGGCctactgtga (Guanine nucleotide agcaca binding protein, gamma 2) 7 Homo sapiens BO009917.1 BCO28225.1 1,4 ATGAAGAAAAACAAAgtgcacag hypothetical protein agacccg DKFZp761A052 13 cellular homolog of NM 001997.2 NM 001997.2 0,5 GTCGCCCAGATCAAGgctcatgta the fox sequence in the gCctca Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 14 cellular homolog of NM 001997.2 W17004.1 0,6 GGCCGCATGCTTGGAaggtaaa the fox sequence in the gtccatgg Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 16 cellular homolog of AA063591.1 0,7 TGACCGGCCAGGAAACggtCgcc the fox sequence in the cagatca Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus NM 001997.2 17 cellular homolog of AA094898.1 0,6 CAGGCCGCATGCTTGaggtaaa the fox sequence in the gtccatgg Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus NM 001997.2 18 cellular homolog of AA187006.1 0,7 AGGCCGCATGCTTGGaggtaaa the fox sequence in the gtccatgg Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus NM 001997.2 19 cellular homolog of AA225636.1 GGCCAGGAAACGGTCgcccaga the fox sequence in the 0,6 tcaaggta Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus NM 001997.2 20 cellular homolog of I BM820687.1 GGTCGCCCAGATCAA9ctcat9ta the fox sequence in the 0,5 gCctca Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus NM 001997.2 23 cellular homolog of BU603086.1 GAAGTAGCAGGCCGCat9Ctt 99 the fox sequence in the 0,6 aggtaaa Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus NM 001997.2 24 cellular homolog of BF218408.1 AGGCCGATGCTTGGAggtaaagt the fox sequence in the 0,6 ccatggt Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus NM 001997.2 25 cellular homolog of 1 AI499403.1 ~ the fox sequence in the NM 001997.2 CCCGCATGCTTGGAGgtaaagtc Finkel-Biskis-Reilly 0,7 catggtt murine sarcoma virus 26 cellular homolog of NM 001997.2 AW795076.1 CGGTCGCCCAGATCAaggctcat the fox sequence in the 0,6 gtagcct Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus cellular homolog of D52122.1 0, 6 GGCCGCATGCTTGGggtaaagtc 27 the fox sequence in the NM 001997.2 Finkel-Biskis-Reilly catggtt murine sarcoma virus 28 cellular homolog of NM 001997.2 BE535673.1 0,6 GCCGCATGCTTGGAGgtaacagt the fox sequence in the ccatggt Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma virus 47 synuclein, alpha (non NM 000345.2 NM 007308.1 1,5 GACCAGTTGGGCAAGaatgaag A4 component of aaggagcc amyloid precursor) 51 translationally- NM 003295.1 CA848049.1 0, 7 AGAtcgcggacgggttgtgcctggaggT controlled tumor GG protein 1 52 translationally- NM 003295.1 CA848049.1 0,5 TCCGACATCTACAAGatccggga controlled tumor gatcgcg protein 1 53 translationally- NM 003295.1 BCO22436.1 0,6 CCGACATCTACAAGATCCGGG controlled tumor AGATCGCGGACGGGTTGTGC protein 1 CTG 54 translationally- NM 003295.1 BC040008.1 0,5 GCGCCGCTCCGGCTGCACCG controlled tumor CGCTCGCTCCGAGTTTCAGG protein 1 CTCGTGCTAAGCTAGCGCCGT CGTCGTCTCCCTTCAGTCGCC ATCATGATTATCTACC 55 TYRO protein tyrosine NM 003332.1 BF092099.1 0,8 GAGGGGCTGCGGAGGcagcga kinase binding protein cccggaaac 58 uroporphyrinogen NM 000374.2 BQ008745.1 1,5 GTGTGCCGCTGATTGtggaccct decarboxylase gatgaca 64 beta-2-microglobulin NM 004048.2 AV734235.1 0,7 ATTTGGATTGGATGAATTCCA AATTCTGCTTGCTTGC I I I I I A ATATTGATATGCTTATACACTT ACACTTTATGCACAAAATGTA GGGTTATAATAATGTTAACAT GGACATGATCTTCTTTATAATT CTACTTTGAGTGCTGTCTCCA TGTTTGATGTATCTGAG CAG G TTGCTCCACAGGTAGCTCTAG GAGGGCTGGCAAC 69 SEC24 related gene NM 004922.1 AW449995.1 1,8 GCAGCTGTCTGGAATgcagagg family, member C (S. cagctgga cerevisiae) 80 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000558.3 R91899.1 1,7 ACCAAGACCTACTTCccggtcaac ttcaag 81 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000558.3 H58664.1 1,7 G GAG G CCCTG GAGAG ctcctaag ccactgc 88 talin 1 NM 006289.2 AI393487.1 1,4 CCCAGAGTATTAACGCTCCAA GAGTATTATTAACGCTGCTGT ACCTCGATCTGAATCTGCCGG GGCCCCAGCCCACTCCACCC TGCCAGCAGCTTCCAGCCAGT CCCCACAGCCTCATCAGCTCT CTTCACCG I I I I I I GATACTAT CTTCCCCCACCCCCAGCTACC CATA G G G G CTG CAG AGTTATA AGCCCCAAACAGGTCATGCTC CAATAAAAATGATTCTACCTAC AA 89 talin 1 NM 006289.2 AI393487.1 1,4 TGCTTCGGAAGGAACgagagctg gaagagg 90 talin 1 _ NM 006289.2 AI417760.1 1,4 AGGAAGAAATGCTTCggaagga acgagagc 116 Homocysteine- NM 014685.1 BG828243.1 0,7 GGAAAACATCTCAAGgcctgaag inducible, endoplasmic ctgccca reticulum stress- inducible, ubiquitinlike domain member 1 121 ring fnger protein 10 NM 014868.3 BU626650.1 1,5 AGAAACAG GG CAAGTacccaga agtccaca 125 ribosomal protein L4 NM 000968.2 CB141160.1 0,7 _ GTCATCAGACTAGTGCTGAGT CTTGGGGTACTGGCAGAGCT GTGGCTCGAATTCCCAGAGTT CGAGGTGGTGGGACTCACCG CTCTG G C CAG G G T G CTTTTG G AAACatgtgtcgtg 137 ubiquitin B NM 018955.2 AA206538.1 1,4 CA G G TCAAAATG CAG atcttcg tg aaaacc 139 ubiquitin B ; NM 018955.2 AA340917.1 1,4 AGATCTTCGTGAAGACCCTGA CCGGCAAGACCATCACTCTG GAGGTGGAGCCCAGTGACAC CATCGAAAATGTGAAGGCCAA GATCCAAGATAAAGAAGGCAT CCCCCCCGACCAGCAGAGGC T CATCTTTG CA G G CAAG CAG C TGGAAGATGGCCGCACTCTTT CTGACTACAACATCCAGAAAG AGTCGACCCTGCACCTGGTC CTGCGCCTGAGGGGTGGCTG TTAATTCTTCAGTCATGGCATT CGCAGTGCCCAGTGATGGCA TTACTCTGCACTATAGCCATTT GCCCCAACTTAAGTTTAGAAA TTACAAGTTTCAGTAATAGCT GAACCTGTTCAAAATGTTAATA AAGG 145 major histocompatibiliry NM 019111.2 TCAGAGACAGTCTTCCTGCCC complex, class II, DR alpha AG G GAAGAC CACCTTTTCCG C AAGTTCCACTATCTCCCCTTC CTGCCCTCAACTGAGGACGTT TACGACTGCAGGGTGGAGCA CTGGGGCTTGGATGAGCCTC TTCTCAAGCACTGGGagtttgatg CD686254.1 0,7 ctccaagccctctc 148 mesoderm induction NM 020948.1 TTTCTCACACAGGCAtactccaaa early response 1 AY124186. 1 0,7 tgcttc 158 major NM 033554.2 AAGGAGCCTGTGGAGctgggcca histocompatibility BU621846.1 0,7 gcccaac complex, class II, DP alpha 1 160 chloride intracellular NM 001288.3 CCAGGGACGGCCACTTCCTG channel 1 GTCCCCGACGCAACCATGGC BG491600.1 0,8 TGAAGAACAACCGCAGGTCG AATTGTTCGTGAAG 161 chloride intracellular NM 001288.3 AV683308.1 0,7 GGGCAGCTCCCATTCctgctgtat channel 1 ggcact 164 chromosome 19 open NM 138774.2 AI375989.1 1,4 ACCTCATCTCGGCCAgtgctgacc reading frame 22 tggagg 188 eukaryotic translation NM 001404.3 BE502067.1 0,6 TGGACAAGCTGAGGAAGAAT elongation factor 1 GCCTTCGCCAGTGTCATCCTT gamma TTTGGAACCAACAATAGCAGC TCCATTTCTGGAGTCTGGGTC TTCCGAGGCCAG 189 eukaryotic translation NM 001404.3 BE502067.1 0,6 CAGGTGGACTACGAGTCATAC elongation factor 1 ACATGGCGGAAACTGGATCCT gamma GGCAGCGAGGAGACCCAGAC GCTGGTTCGAGAGTACTTTTC CTGGGAGGGGGCCTTCCAGC ATGTGGGCAAAGCCTTCAA 190 eukaryotic translation NM 001404.3 BE502067.1 0,6 GAGCTTGCCTTTCCGctgagtcca elongation factor 1 gattgg gamma 191 eukaryotic translation NM 001404.3 BG533219.1 0,8 AAGGAGGAGAAAAAGGCGGC elongation factor 1 TGCCCCTGCTCCTGAGGAGG gamma AGATGGATGAATGTGAGCAG GCGCTGGCTGCTGAGCCCAA GGCCAAGGACCCCTTCGCTC ACCTGCCCAAGAG 208 ferritin, heavy NM 002032.1 BG248923.1 0,6 TGTCTCTGGGGATCCCTAGTA polypeptide 1 TAACACATGCA 222 prohibitin NM 002634. 2 BE536369.1 1,4 GCGAGGAGAGTGCGTgtgtgaga gggtcca 225 translationally- NM 003295.1 BG284235.1 0,6 TTCTTTATTGGTGAAAACATGA controlled tumor ATCCAGATG G CATG GTTG CTC protein 1 TATTGGACTACCGTGAGGATG GTGTGACCCCATATATGATTT TCTTTAAGGATGGTTTA 228 translationally- NM 003295.1 AV749932.1 0,6 CGTCGTCTCCCTTCAGTCGCC controlled tumor ATCATGATTATCTACC protein 1 229 translationally- NM 003295.1 AV749932.1 0,6 GGGACCTCATCAGCCacgatgag controlled tumor atgttct protein 1 236 Homo sapiens vesicle- NM 003761.2 BG623073.1 0,7 GATCTGGAAGCCACAtctgagca associated membrane cttcaag protein 8 (endobrevin) 240 Guanine nucleotide NM 004125.2 BC015206.1 0,6 GTGGAGAGGATCAAG9tctctca 9 binding protein, , gcagct gamma 10 242 c-src tyrosine kinase NM 004383.1 BG953215.1 1,1 CCTCAAGTTCTCGCTagatgtctg cgaggc 245 family with sequence NM 004699.1 AA584911.1 1,6 TCAAGAGTGAGTGTTtgcggagtc similarity 50, member agacgc A 248 hemoglobin, alpha 1/2 NM 000517.3 AA343446.1 1,7 TG CTTCTC C C C G CAG g a tg ttcct gtcctt 252 putative translation BG655736.1 0,7 i CCTTTGTGCTTGCAGaagtttgcct initiation factor NM 005801.2 gcaat 280 ribosomal protein S17 NM 001021.2 BE731466.1 0,5 AATTATGTTCCTGAGgtctcagcct tggat 281 ribosomal protein S17 NM 001021.2 AV752729.1 0,6 GCCGCGTTCCACCAAAACCGT GAAGAAAGCGGCCCGGGTCA TCATAGAAAAGTACTACACGC GCCTGGGCAACGACTTCCAC ACGAACAAGCGCGTGTGCGA GGAGATCGCCATTATCCCCAG CAAAAAGCTCCG 284 ubiquitin B NM 018955.2 BG286180.1 1,4 G GTATCCG CTAACAGgtcaaaat gcagatc 290 hypothetical protein NM 024841. 1 BQ919225.1 1,4 ATTGTTGAACTGGATgcggctgttg FLJ14213 aagag 298 chloride intracellular NM 001288.3 AAl26087.1 0,8 CCTGAGTCCAACACAGCTGG channel 1 G CTG G ACATATTTG C CAAATT TTCTGCCTACATCAAGAATTC AAACCCAGCACTCAATGACA 299 chloride intracellular NM 001288.3 AAl26087.1 0,7 CCCAGGTACCCCAAGctggcagc channel 1 tctgaac 300 chloride intracellular NM 001288.3 AAl26087.1 0,8 GCTGTGCCCTCCCAGgtacccca channel 1 agctggc 309 ribosomal protein L41 NM 021104.1 EXH-002 0,6 GAAGCGAATGCGCAGgctgaag cgcaaaag 310 transi tionatly-EXH-003 0,5 AATGCATATTTAAACTAAATTG controlled tumor ATCCTGTAGTGTTCCTGGAGA protein 1 NM 003295.1 AGCTAGAGCCTGATTGTAGGC TACTACTCATCAATTAACTTCT ACAGTGGAGACTACTTCTGGG ACTGGAATATAAAAA 311 G1 to S phase EXH-004 1,5 ATTACCGTTTATTCCATATCTG transition 1/G1 to S GATAATTTGCCGAACTTCAAT phase transition 1 NM 002094.1 AGATCAGTTGATGGACCAATC AGGCTGCCAATTGTGG 312 cyclin T2 NM 001241.2 EXH-005 0,5 ttgtgtgagctattcaaactcttcaacccctga Tableau 4 : Panels de marqueurs (PANELS1 et 7 à 9) PANEL 1 PANEL 7 PANEL 8 PANEL 9 SEQ ID N * 1 x 2 * * 3 * * 5 * * 7 * * 12 * * 14 * x * * 16 i I * * 17 * * * 18 * * _ * * 19 * * 23 * * * * 24 * * * * 25 * * * * 26 * 33 * * 35 * 37 * 40 * 41 _ * 43 * * * * _ 44 * * 46 * * 47 _ 50 * * * 51 * * * * 52 x * * * 53 x * * * 54 * 55 * * 60 * x _ 64 * * 69 * 71 * * 72 * 75 * 79 * * 80 * * 81 * * 85 * * 86 * * 88 * * 89 * * 90 * * 95 * 102 * 104 * 107 * * 116 * * 119 * * * * 120 * * * * 121 * * 125 * * 126, * * * 135 * 136 * * * * 137 * * 138 * * * 139 * * 140 * * 141 * 144 * * * * 145 * * 147 * * * * 148 * * 151 * * 152 Î I * * 155 * * 158 * * 159 * * 160 * * 161 * 163 * * 164 * * 171 * 172 * * 177 * 178 * 182 * 184 * * 185 * * * * 187 * * 188 * * * 189 * * * * 190 * * 191 * 192 * 194 * 195 * 201 * 203 * 204 * 206 * 216 * 217 * * 222 * * * 225 * * 227 * * * 228 * * * 229 * * 232 * 235 * 236 * * 237 * * 239 * * * * 240 * * 242 * 246 * * 248 * 250 * * 253 * * * 254 * * 258 * 261 * 266 * 267 * * 269 * * * 276 * 278 * * 280 * * * 281 * * * 282 * * * * 283 * * _ 284 * * 290 * * 298 * * 299 * * 300 * 306 * * I - 307 * * 309 311 * * 312 * * 314 * 315 * * 319 * 320 * 321 * 322 * 323 * 324 * 325 * 326 * 327 * 328 329 * 330 * 331 * 332 * 333 * 334 * 335 * 336 * 337 * 338 * 339 * 340 * 341 * 342 * 343 * 344 * 345 * 346 * 347 * 348 * 349 * 350 * 351 * 352 * 353 * 354 * 355 * 356 * 357 * 358 * 359 * 360 * 361 * 362 * 363 * 364 * 365 * 366 * 367 * 368 * 369 * 370 * 371 * 372 * 373 * 374 * 375 * 3765 Tableau 5. Liste des gènes /transcrits identifiés parmi les banques DATAS issues du profilage des sangs de patientes atteintes de cancer du sein comme étant associés à des voies de signalisation de l'immunité. Transcrit Homo sapiens Bruton Nom agammaglobulinemia tyrosine représentatif kinase (BTK), du mRNA. 11/2005 NM 000061 gène _NM 002661 Homo sapiens phospholipase C, gamma 2 (phosphatidylinositol-specific) (PLCG2), m RNA. 11/2005 NM 003177 Homo sapiens spleen tyrosine kinase (SYK), mRNA. 11/2005 NM 021601 Homo sapiens CD79A antigen (immunoglobulin- associated alpha) (CD79A), transcript variant 2, mRNA. 10/2005 NM 080548 Homo sapiens protein tyrosine phosphatase, non- receptor type 6 (PTPN6), transcript variant 2, mRNA. 11/2005 AB209585 Homo sapiens mRNA for Fc fragment of IgG, low affinity Ilb, receptor for (CD32) isoform 1 variant •rotein. 3/2005 Homo sapiens leucocyte immunoglobulin-like AF025529 receptor-6b LIR-6 mRNA, com.lete cds. 9/2002 AJ001685 Homo sapiens NKG2E •ene. 4/2005 Human DNA sequence from clone RP11-447M12 on chromosome 9 Contains the FCN1 gene for ficolin (collagen/fibrinogen domain containing) 1 and a novel AL353611 •ene, corn .tete se. uence. 5/2005 AL591704 Human DNA sequence from clone RP1-128L15 on chromosome 1g21.1-21.3 Contains the 5' end of the gene for peptidoglycan recognition protein-l-alpha (PGLYRPIalpha), the PGLYRP4 gene for peptidoglycan recognition protein 4, the S100A9 gen. . . 5/2005 NM000239 Homo sapiens lysozyme (renal amyloidosis) (LYZ), mRNA. 11/2005 NM 000442 Homo sapiens platelet/endothelial cell adhesion molecule (CD31 antigen) (PECAM1), mRNA. 11/2005 NM 000566 Homo sapiens Fc fragment of IgG, high affinity la, receptor (CD64) (FCGR1A), mRNA. 10/2005 NM 000570 Homo sapiens Fc fragment of IgG, low affinity Illb, receptor (CD16b) (FCGR3B), mRNA. 11/2005 NM 000616 Homo sapiens CD4 antigen (p55) (CD4), mRNA. 10/2005 Homo sapiens interferon (alpha, beta and omega) NM 000629 receptor 1 (IFNAR1), mRNA. 11/2005 Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1B (TNFRSF1B), mRNA. NM 001066 11/2005 NM 002121 Homo sapiens major histocompatibility complex, class II, DP beta 1 (HLA-DPB1), mRNA. 11/2005 NM 002535 Homo sapiens 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2, 69/71 kDa (OAS2), transcript variant 2, mRNA. 9/2005 NM 003190 Homo sapiens TAP binding protein (tapasin) (TAPBP), transcript variant 1, mRNA. 10/2005 NM 003332 Homo sapiens TYRO protein tyrosine kinase binding protein (TYROBP), transcript variant 1, mRNA. 10/2005 NM 005514 Homo sapiens major histocompatibility complex, class I, B (HLA-B), mRNA. 11/2005 Homo sapiens killer cell lectin-like receptor subfamily NM 005810 G, member 1 (KLRG1), mRNA. 11/2005 Homo sapiens leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B (with TM and ITIM domains), NM 005874 member 2 (LILRB2), mRNA. 10/2005 Homo sapiens granulysin (GNLY), transcript variant NM 006433 NKG5, mRNA. 10/2005 Homo sapiens Fc fragment of IgG, low affinity lla, NM 021642 receptor (CD32) (FCGR2A), mRNA. 10/2005 Homo sapiens major histocompatibility complex, class NM 022555 II, DR beta 3 (HLA-DRB3), mRNA. 10/2005 Homo sapiens sialic acid binding Ig-like lectin 10 NM 033130 (SIGLECIO), mRNA. 9/2005 Homo sapiens immunoglobulin lambda-like polypeptide 1 (IGLL1), transcript variant 2, mRNA. NM 152855 9/2005 Homo sapiens interleukin 28 receptor, alpha (interferon, lambda receptor) (IL28RA), transcript NM 173065 variant 3, mRNA. 10/2005 Homo sapiens CD300 antigen like family member B NM 174892 (CD300LB), mRNA. 9/2005 NM 181985 Homo sapiens leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with TM domain), member 5 LILRA5 , transcrit variant 2, mRNA. 9/2005 NM 203458 Homo sapiens Notch homolog 2 (Drosophila) N- terminal like (NOTCH2NL), mRNA. 9/2005 X96735 H.sapiens FALL-39 gene. 9/2004 BC070085 Homo sapiens colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:87425 IMAGE:30344148), com s tete cds. 7/2005 NM 000211 Homo sapiens integrin, beta 2 (antigen CD18 (p95), lymphocyte function-associated antigen 1; macrophage antigen 1 (mac-1) beta subunit) (ITGB2), mRNA. 11/2005 NM_000560 Homo sapiens CD53 antigen (CD53), mRNA. 10/2005 NM 001838 Homo sapiens chemokine (C-C motif) receptor 7 (CCR7), mRNA. 11/2005 NM 002983 Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 3 (CCL3), mRNA. 10/2005 NM 014358 Homo sapiens C-type lectin domain family 4, member E (CLEC4E), mRNA. 9/2005 NM 173216 Homo sapiens ST6 beta-galactosamide alpha-2,6- sialyltranferase 1 (ST6GAL1), transcript variant 1, mRNA. 11/2005 AB209647 Homo sapiens mRNA for Neutrophil cytosol factor 2 variant protein. 3/2005 AB209656 Homo sapiens mRNA for colony stimulating factor 3 receptor isoform c precursor variant protein. 3/2005 AC079855 Homo sapiens BAC clone RP11-332L16 from 7, complete sequence. 1/2004 AK127905 Homo sapiens cDNA FLJ46012 fis, clone SPLEN2007689, highly similar to Neutrophil cytosol factor 1. 2/2004 AL390725 Human DNA sequence from clone RP11-373C9 on chromosome 1 Contains the 3' end of the ZNF364 gene for zinc finger protein 364, the CD160 gene for CD160 antigen, the PDZK1 gene for PDZ domain containing 1, the 3' end of the gene for put. . . 5/2005 AY131997 Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1A (TNFRSFIA) gene, corn •tete cds. 7/2002 AY692262 Homo sapiens interleukin 2 receptor, gamma (severe combined immunodeficiency) (IL2RG) gene, complete cds. 8/2004 D14041 Homo sapiens mRNA for H-2K binding factor-2, corn •Tete cds. 2/1999 NM 000246_ Homo sapiens class II, major histocompatibility complex, transactivator (CIITA), mRNA. 11/2005 NM 000295 Homo sapiens serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 1 SERPINAI , transcrit variant 1, mRNA. 11/2005 NM 000544 Homo sapiens transporter 2, ATPbinding cassette, sub-family B (MDR/TAP) (TAP2), transcript variant 1, mRNA. 11/2005 NM 000591 Homo sapiens CD14 antigen (CD14), mRNA. 11/2005 NM 000593 Homo sapiens transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDRITAP) (TAPI), mRNA. 11/2005 NM 000611 Homo sapiens CD59 antigen p1820 (antigen identified by monoclonal antibodies 16.3A5, EJ16, EJ30, EL32 and G344) (CD59), transcript variant 2, mRNA.10/2005 NM 000634 Homo sapiens interleukin 8 receptor, alpha (IL8RA), m RNA. 11/2005 NM 000660 Homo sapiens transforming growth factor, beta 1 (Camurati-Engelmann disease) (TGFB1), m RNA. 11/2005 Homo sapiens interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 (IFIT1), transcript variant NM 001001887 1, mRNA. 10/2005 NM 001008540 Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) receptor 4 (CXCR4), transcript variant 1, mRNA. 11/2005 NM 001013255 Homo sapiens lymphocyte-specific protein 1 (LSP1), transcript variant 4, mRNA. 10/2005 NM 001018076 Homo sapiens nuclear receptor subfamily 3, group C, member 1 (glucocorticoid receptor) (NR3C1), transcript variant 4, mRNA. 11/2005 NM 001157 Homo sapiens annexin A11 (ANXA11), transcript variant a, mRNA. 10/2005 NM 001175 Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) beta (ARHGDIB), mRNA. 10/2005 NM 001421 Homo sapiens E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) (ELF4), mRNA. 10/2005 NM 001465 Homo sapiens FYN binding protein (FYB-120/130) (FYB), transcript variant 1, mRNA. 11/2005 NM 001557 Homo sapiens interleukin 8 receptor, beta (IL8RB), mRNA. 11/2005 NM 001629 Homo sapiens arachidonate 5-lipoxygenase- activating protein (ALOX5AP), mRNA. 11/2005 NM001637 Homo sapiens acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) (AOAH), mRNA. 9/2005 NM 001760 Homo sapiens cyclin D3 (CCND3), mRNA. 10/2005 NM 001784 Homo sapiens CD97 antigen (CD97), transcript variant 2, mRNA. 10/2005 NM 002032 Homo sapiens ferritin, heavy polypeptide 1 (FTH1), mRNA. 11/2005 Homo sapiens inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B NM 002221 (ITPKB), mRNA. 10/2005 Homo sapiens myeloid differentiation primary NM 002468 response gene (88) (MYD88), mRNA. 11/2005 NM 002756 Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase 3 (MAP2K3), transcript variant A, mRNA. 10/2005 _NM 002985(CCL5), Homo sapiens chemokine (C-C motif) ligand 5 mRNA. 11/2005 NM 003110 Homo sapiens Sp2 transcription factor (SP2), mRNA. 10/2005 NM 003204 Homo sapiens nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 1 (NFE2L1), mRNA. 10/2005 NM 003407 Homo sapiens zinc finger protein 36, C3H type, homolog (mouse) (ZFP36), mRNA. 11/2005 NM_003820 Homo sapiens tumor necrosis factor receptor superfamily, member 14 (herpesvirus entry mediator) (TNFRSF14), mRNA. 11/2005 NM_003853 Homo sapiens interleukin 18 receptor accessory protein (IL18RAP), mRNA. 10/2005 NM 004120 ,'Homo sapiens guanylate binding protein 2, interferon- inducible (GBP2), mRNA. 9/2005 NM 004356 Homo sapiens CD81 antigen (target of antiproliferative antibody 1) (CD81), mRNA. 10/2005 NM 004688 Homo sapiens N-myc (and STAT) interactor (NMI), mRNA. 11/2005 NM 005621 Homo sapiens S100 calcium binding protein Al2 (calgranulin C) (S100Al2), mRNA. 10/2005 NM 005745 Homo sapiens B-cell receptor-associated protein 31 (BCAP31), mRNA. 10/2005 NM 005849 Homo sapiens immunoglobulin superfamily, member 6 (IGSF6), mRNA. 10/2005 NM 005902 Homo sapiens SMAD, mothers against DPP homolog 3 (Drosophila) (SMAD3), mRNA. 11/2005 NM 006263 Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) activator subunit 1 (PA28 alpha) (PSME1), transcript variant 1, mRNA. 10/2005 NM 006665 Homo sapiens heparanase (HPSE), mRNA. 11/2005 NM 012072 Homo sapiens complement component 1, q subcomponent, receptor 1 (Cl QR1), mRNA. 10/2005 NM 013237 Homo sapiens px19-like protein (PX19), mRNA. 4/2005 NM 014146 Homo sapiens linker for activation of T cells family, member 2 (LAT2), transcript variant 3, mRNA. 10/2005 NM 020980 Homo sapiens aquaporin 9 (AQP9), mRNA. 10/2005 NM_021649 Homo sapiens toll-like receptor adaptor molecule 2 (TICAM2), mRNA. 10/2005 Homo sapiens zinc finger protein 3 (A8-51) (ZNF3), _NM 032924 transcrit variant 2, mRNA. 9/2005 Homo sapiens guanylate binding protein 5 (GBP5), NM 052942 mRNA. 10/2005 NM 133437 Homo sapiens titin (UN), transcript variant novex-2, mRNA. 11/2005 _NM 145640 Homo sapiens apolipoprotein L, 3 (APOL3), transcript variant al.ha/d, mRNA. 10/2005 NM 148919 Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type, 8 (large multifunctional peptidase 7) (PSMB8), transcript variant 2, mRNA. 10/2005 NM 172373 Homo sapiens E74-like factor 1 (ets domain transcription factor) (ELF1), mRNA. 10/2005 NM 002463 Homo sapiens myxovirus (influenza virus) resistance 2 (mouse) (MX2), mRNA. 9/2005 NM 003264 Homo sapiens toll-like receptor 2 (TLR2), mRNA. 11/2005 NM 004946 Homo sapiens dedicator of cytokinesis 2 (DOCK2), mRNA. 10/2005 Homo sapiens WNK lysine deficient protein kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3445410), partial cds. BC013629 1/2005 Homo sapiens CD3E antigen, epsilon polypeptide NM 000733 (TiT3 complex) (CD3E), mRNA. 10/2005 NM 001556 Homo sapiens inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase beta (IKBKB), mRNA.11/2005 NM 001743 Homo sapiens calmodulin 2 (phosphorylase kinase, delta) (CALM2), mRNA. 10/2005 NM 002122 Homo sapiens major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1 (HLA-DQA1), mRNA. 11/2005 NM 002576 Homo sapiens p21/Cdc42/Racl-activated kinase 1 (STE20 homolog, yeast) (PAK1), mRNA. 11/2005 NM 002647 Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, class 3 (PIK3C3), mRNA. 10/2005 NM 002745 Homo sapiens mitogen-activated protein kinase 1 (MAPK1), transcript variant 1, mRNA. 11/2005 NM 002872 Homo sapiens ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2) (RAC2), m RNA. 10/2005 NM 003998 Homo sapiens nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 (p105) (NFKB1), mRNA. 11/2005 NM 004048 Homo sapiens beta-2-microglobulin (B2M), mRNA. 11/2005 Homo sapiens c-src tyrosine kinase (CSK), mRNA. NM 004383_ 11/2005 Homo sapiens phosphoinositide-3-kinase, catalytic, NM 005026 delta polypeptide (PIK3CD), mRNA. 11/2005 Homo sapiens v-fos FBJ murine osteosarcoma viral NM 005252 oncogene homolog (FOS), mRNA. 11/2005 Homo sapiens vav 1 oncogene (VAV1), mRNA. NM 005428 11/2005 Homo sapiens lymphocyte cytosolic protein 2 (SH2 domain containing leukocyte protein of 76kDa) NM 005565 (LCP2), mRNA. 10/2005 Homo sapiens CD28 antigen (Tp44) (CD28), mRNA. NM 006139 11/2005 Homo sapiens protein kinase C, theta (PRKCQ), NM 006257 mRNA. 11/2005 Homo sapiens major histocompatibility complex, class NM 019111 II, DR alpha (HLA-DRA), mRNA. 10/2005 Homo sapiens nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, alpha NM 020529 (NFKBIA), mRNA. 10/2005 Homo sapiens major histocompatibility complex, class NM 033554 ll, DP alpha 1 (HLA-DPA1), mRNA. 10/2005 Homo sapiens phospholipase C, gamma 1 (PLCG1), NM 182811 transcript variant 2, mRNA. 10/2005 Homo sapiens mRNA for HLA class histocompatibility antigen, E alpha chain precursor AB209870 variant protein. 3/2005 Homo sapiens TNF-receptor associated factor-3 AF110908 (TRAF-3) mRNA, partial cds; and 3'UTR. 5/1999 BCO25727 Homo sapiens T cell receptor alpha variable 20, mRNA (cDNA clone MGC:34712 IMAGE:5201547), complete cds. 6/2005 BCO28068 Homo sapiens Janus kinase 3 (a protein tyrosine kinase, leukocyte), mRNA (cDNA clone MGC:39993 I MAG E:5212575), com plete cds. 10/2003 K02885 Homo sapiens T-cell receptor active beta-chain V-D- J-beta-1.2-C-beta-1 (TCRB) mRNA, partial cds. 3/1999 L34703 Homo sapiens T-cell receptor alpha chain (TCRA) mRNA (HLA-A1, 24; B7, 8; DR 1, 3), complete cds. 12/2001 M12886 Human T-cell receptor active beta-chain mRNA, complete cds. 1/1995 NM 000416 Homo sapiens interferon gamma receptor 1 (IFNGR1), mRNA. 10/2005 NM 000433 Homo sapiens neutrophil cytosolic factor 2 (65kDa, chronic granulomatous disease, autosomal 2) (NCF2), mRNA. 10/2005 Homo sapiens zyxin (ZYX), transcript variant 2, NM 001010972 mRNA. 10/2005 NM 001012631 Homo sapiens interleukin 32 (IL32), transcript variant 1, mRNA. 10/2005 NM 001558 Homo sapiens interleukin 10 receptor, alpha (IL10RA), mRNA. 10/2005 NM 002227 Homo sapiens Janus kinase 1 (a protein tyrosine kinase) (JAK1), mRNA. 11/2005 NM 002298 Homo sapiens lymphocyte cytosolic protein 1 (L-plastin) (LCP1), mRNA. 10/2005 NM 002923 Homo sapiens regulator of G-protein signalling 2, 24kDa (RGS2), mRNA. 11/2005 NM 003877 Homo sapiens suppressor of cytokine signaling 2 (SOCS2), mRNA. 10/2005 NM 004117 Homo sapiens FK506 binding protein 5 (FKBP5), mRNA. 10/2005 NM 004489 Homo sapiens G protein pathway suppressor 2 (GPS2), mRNA. 10/2005 NM 006058 Homo sapiens TNFAIP3 interacting protein 1 (TNIP1), mRNA. 10/2005 NM 006449 Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (CDC42EP3), mRNA. 9/2005 Homo sapiens LPS-responsive vesicle trafficking, beach and anchor containing (LRBA), mRNA. NM 006726 10/2005 NM 006779 Homo sapiens CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 2 (CDC42EP2), mRNA. 9/2005 NM 014663 Homo sapiens jumonji domain containing 2A (JMJD2A), mRNA. 11/2005 NM 015015 Homo sapiens jumonji domain containing 2B (JMJD2B), mRNA. 10/2005 Homo sapiens FK506 binding protein 1A, 12kDa NM 054014 (FKBP1A), transcript variant 12A, mRNA. 11/2005 0 Homo sapiens colony stimulating factor 3 receptor (granulocyte) (CSF3R), transcript variant 4, mRNA. NM 172313 10/2005 Homo sapiens high density lipoprotein binding protein NM 203346 (vigilin) (HDLBP), mRNA. 10/2005 1 Tableau 6. Liste des gènes /transcrits associés à des voies de signalisation de l'immunité Référence Transcrit représentatif Nom du gène Entrez Gene 1 NM_130786 alpha-1-B glycoprotein;A1BG 12 NM_001085 Alpha-1-antichymotrypsin precursor (ACT) [Contains: Alpha- 1- antichymotrypsin His-Pro-less]. _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P01011] 23 NM_001025091 ATP-binding cassette sub-family F member 1 (ATP-binding cassette 50) (TNF-alpha-stimulated ABC protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8NE71] 100 NM_000022 Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4) (Adenosine aminohydrolase). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P00813] 103 NM 001111 Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase (EC û 3.5.4.-) (DRADA) (136 kDa double-stranded RNA binding !protein) (P136) (K88DSRBP) (Interferon-inducible protein 4) (IFI-4 protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P55265] 134 NM 000674 Adenosine Al receptor. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P30542] 135 NM_000675 Adenosine Aga receptor. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P292741 136 NM_000676 Adenosine A2b receptor. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P29275] 140 NM_020683;NM_00067 adenosine A3 receptor;ADORA3 7 143 Poly [ADP-ribose] polymerase 4 (EC 2.4.2.30) (PARP-4) NM_006437 (Vault poly(ADP- ribose) polymerase) (VPARP) (193-kDa vault protein) (PARP- related/IalphaIrelated H5/proline-rich) (PH5P). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UKK3] 174 NM 001134 Alpha-fetoprotein precursor (Alpha-fetoglobulin) (Alpha-1-fetoprotein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P02771] 177 NM_172197;NM_00113 advanced glycosylation end product-specific receptor;AGER 6 182 NM_000214 jagged 1 (Alagille syndrome);JAG1 197 NM 001622 Alpha-2-HS-glycoprotein precursor (Fetuin-A) (Alpha-2-Z- û globulin) (Ba- alpha-2-glycoprotein) [Contains: Alpha-2-HS- glycoprotein chain A; Alpha-2-HS-glycoprotein chain B]. [Source: Uniprot/SWISSPROT; Acc: P02765] 199 NM_001623 Allograft inflammatory factor 1 (AIF-1) (Ionized calcium- binding adapter molecule 1) (G1 protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P55008] 207 NM_001014431;NM_00 v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1;AKT1 1014432;NM_005163 208 NM_001626 v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 2;AKT2 214 NM_001627 CD166 antigen precursor (Activated leukocyte-cell adhesion molecule) (ALCAM). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13740] 240 NM_000698 Arachidonate 5-lipoxygenase (EC 1.13.11.34) (5- lipoxygenase) (5-LO). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P09917] 2 241 NM_001629 Arachidonate 5-lipoxygenase-activating protein (FLAP) (MK- 886-binding protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P20292] 246 NM_001140 Arachidonate 15-lipoxygenase (EC 1.13.11.33) (Arachidonate omega-6 lipoxygenase) (15-LOX). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P160501 259 NM_001633 AMBP protein precursor [Contains: Alpha-1-microglobulin (Protein HC) (Complex-forming glycoprotein heterogeneous in charge) (Alpha-1 microglycoprotein); Inter-alpha-trypsin inhibitor light chain (ITI-LC) (Bikunin) (HI-30)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P 283 NM 001145 Ribonuclease 4 precursor (EC 3.1.27.-) (RNase 4). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P34096] 301 Annexin Al (Annexin I) (Lipocortin I) (Calpactin II) NM_000700 (Chromobindin-9) (p35) (Phospholipase A2 inhibitory protein). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: PO4083] 311 Annexin Ail (Annexin XI) (Calcyclin-associated annexin 50) NM_145869 (CAP-50) (56 kDa autoantigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P50995] 313 Acyloxyacyl hydrolase precursor (EC 3.1.1.77) [Contains: NM_001637 Acyloxyacyl hydrolase small subunit; Acyloxyacyl hydrolase large subunit]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P28039] 316 NM 001159 Aldehyde oxidase (EC 1.2.3.1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q06278] 325 NM_001639 _ amyloid P component, serum;APCS 326 NM_000383 Autoimmune regulator (Autoimmune polyendocrinopathy candidiasis ectodermal dystrophy protein) (APECED protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O43918] 336 NM_001643 Apolipoprotein A-II precursor (Apo-AII) (ApoA-II) [Contains: Apolipoprotein A-II(1-76)]. [Source: Un ip rot/ SWISSPROT;Acc: P02652] 355 NM 000043 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6 precursor (FASL receptor) (Apoptosis-mediating surface antigen FAS) (Apo-1 antigen) (CD95 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P25445] 356 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 (FAS antigen ligand) (Apoptosis antigen ligand) (APTL) (CD178 NM_000639 antigen) [Contains: Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6, membrane form; Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6, solubl 366 NM 020980 Aquaporin-9 (AQP-9) (Small solute channel 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O43315] 369 NM_001654 v-raf murine sarcoma 3611 viral oncogene homolog;ARAF 397 NM 001175 Rho GDP-dissociation inhibitor 2 (Rho GDI 2) (Rho-GDI beta) (Ly-GDI). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P52566] 399 NM004310 Rho-related GTPbinding protein RhoH (GTP-binding protein _ TTF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15669] 563 NM_001185 alpha-2-glycoprotein 1, zinc;AZGP1 566 NM_001700 azurocidin 1 (cationic antimicrobial protein 37);AZU1 567 NM 004048 beta-2-microelobulin;B2M 572 NM_032989 BcI2-antagonist of cell death (BAD) (Bd-2 binding component 6) (Bcl-XL/Bcl-2-associated death promoter) (Bcl-2-like 8 protein). 3 [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: Q92934] 596 NM 000657 Apoptosis regulator Bd-2. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P104151 604 NM 001706 B-cell lymphoma 6 protein (BCL-6) (Zinc finger protein 51) (LAZ-3 protein) (BCL-5) (Zinc finger and BTB domain- containing protein 27). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P41182] 608 _ NM_001192 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17 (B- cell maturation protein) (CD269 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO2223] 623 NM000710 B1 bradykinin receptor (BK-1 receptor) (B1R). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P46663] 624 NM000623 B2 bradykinin receptor (BK-2 receptor) (B2R). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P30411] 629 NM_001710 B-factor, properdin;BF 640 NM_001715 B lymphoid tyrosine kinase;BLK 641 NM_000057 Bloom's syndrome protein (EC 3.6.1.-) (RecQ protein-like 3) (DNA helicase, RecQ-like type 2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P54132] 643 C-X-C chemokine receptor type 5 (CXC-R5) (CXCR-5) NM 032966 '(Burkitt'S lymphoma receptor 1) (Monocyte-derived receptor û 15) (MDR15) (CD185 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P323021 648 Polycomb group RING finger protein 4 (Polycomb complex NM_005180 protein BMI-1) (RING finger protein 51). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P35226] 660 NM_203281;NM_00172 BMX non-receptor tyrosine kinase;BMX 1 671 NM_001725 bactericidal/permeability-increasing protein;BPI 673 NM_004333 v-raf murine sarcoma viral oncogene homolog B1;BRAF 683 NM 004334 ADP-ribosyl cyclase 2 precursor (EC 3.2.2.5) (Cyclic ADP- û ribose hydrolase 2) (cADPr hydrolase 2) (Bone marrow stromal antigen 1) (BST- 1) (CD157 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q10588] 684 NM 004335 Bone marrow stromal antigen 2 (BST-2) (CD317 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q10589] 695 NM_000061 Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase;BTK 708 NM_001212 complement component 1, q subcomponent binding protein;C1QBP 710 NM 000062 Plasma protease Cl inhibitor precursor (Cl Inh) (ClInh). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P05155] 712 NM_015991 complement component 1, q subcomponent, alpha polypeptide;C1QA 713 NM 000491 complement component 1, q subcomponent, beta polypeptide;C1QB 714 NM 172369 complement component 1, q subcomponent, gamma polypeptide;C1QG 715 NM_001733 complement component 1, r subcomponent;C1R 716 NM_001734;NM_20144 complement component 1, s subcomponent;C1S 2 4 717 NM_000063 ù complement component 2;C2 718 NM_000064 complement component 3;C3 719 NM_004054 C3a anaphylatoxin chemotactic receptor (C3a-R) (C3AR). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q16581] 720 NM_007293 complement component 4A;C4A 721 NM_000592 complement component 4B;C4B 722 NM_000715 complement component 4 binding protein, alpha;C4BPA 725 NM_001017364; NM00 complement component 4 binding protein, beta;C4BPB 1017366;NM_00101736 5;NM_000716;NM_0010 17367 727 NM_001735 complement component 5;C5 728 NM_001736 C5a anaphylatoxin chemotactic receptor (C5a-R) (C5aR) (CD88 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P21730] 729 NM_000065 complement component 6;C6 730 NM_000587 complement component 7;C7 731 NM_000562 complement component 8, alpha polypeptide;C8A 732 NM_000066 complement component 8, beta polypeptide;C8B 733 NM_000606 Complement component C8 gamma chain precursor. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P07360] 735 NM_001737 complement component 9;C9 796 NM_001741 Calcitonin precursor [Contains: Calcitonin; Katacalcin (Calcitonin carboxyl-terminal peptide) (CCP) (PDN-21)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01258] 801 NM_006888 calmodulin 1 (phosphorylase kinase, delta);CALM1 805 NM_001743 calmodulin 2 (phosphorylase kinase, delta);CALM2 808 NM_005184 calmodulin 3 (phosphorylase kinase, delta);CALM3 810 NM_005185 calmodulin-like 3; CALML3 820 NM_004345 cathelicidin antimicrobial peptide;CAMP 836 NM_004346 Caspase-3 precursor (EC 3.4.22.-) (CASP-3) (Apopain) (Cysteine protease CPP32) (Yama protein) (CPP-32) (SREBP cleavage activity 1) (SCA-1) [Contains: Caspase-3 p17 subunit; Caspase-3 p12 subunit]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P42574] 865 NM_001755 Core-binding factor, beta subunit (CBF-beta) (Polyomavirus _ enhancer binding protein 2 beta subunit) (PEBP2-beta) (PEA2-beta) (SL3-3 enhancer factor 1 beta subunit) (SL3/AKV core-binding factor beta subunit). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13951] 896 NM 001760 G1/S-specifc cyclin-D3. _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P30281] 909 NM 001763 910 NM_001764 CD1b antigen;CD1B 911 NM_001765 CD1C antigen, c polypeptide; CD1C 912 NM_001766 CD1D antigen, d polypeptide;CD1D 913 NM_030893 CD1E antigen, e polypeptide;CD1E 914 NM_001767 CD2 antigen (p50), sheep red blood tell receptor;CD2 915 NM_000732 CD3D antigen, delta polypeptide (TiT3 complex);CD3D 916 NM_000733 CD3E antigen, epsilon polypeptide (TT3 complex);CD3E 917 NM_000073 L CD3G antigen, gamma polypeptide (TiT3 complex);CD3G 919 NM_198053;NM_00073 CD3Z antigen, zeta polypeptide (TiT3 complex);CD3Z 4 920 NM_000616 CD4 antigen (p55);CD4 922 NM_005894 CD5 antigen-like precursor (SP-alpha) (CT-2) (IgM- associated peptide). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O43866] 923 NM 006725 T-tell differentiation antigen CD6 precursor (T12) (TP120). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P30203] 924 NM_006137 CD7 antigen (p41);CD7 925 NM_001768;NM_17182 CD8 antigen, alpha polypeptide (p32);CD8A 7 926 NM_172101;NM_17221 CD8 antigen, beta polypeptide 1 (p37);CD8B1 3;NM_172099;NM_0049 31;NM_172102 929 NM_000591 Monocyte differentiation antigen CD14 precursor (Myeloid cell-specifc leucine-rich glycoprotein) [Contains: Monocyte differentiation antigen CD14, urinary form; Monocyte differentiation antigen CD14, membrane- bound form]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P 930 NM_001770 CD19 antigen;CD19 931 NM_152866 B-lymphocyte antigen CD20 (B-lymphocyte surface antigen B1) (Leu-16) (Bp35). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P11836] _ 933 NM_001771 CD22 antigen;CD22 934 NM 013230 Signal transducer CD24 precursor. _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P25063] 939 NM_001242 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 7 precursor (CD27L receptor) (T-cell activation antigen CD27) (T14). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P26842] 940 NM_006139 CD28 antigen (Tp44);CD28 941 NM_005191 CD80 antigen (CD28 antigen ligand 1, 67-1 antigen);CD80 942 NM_006889;NM_17586 CD86 antigen (CD28 antigen ligand 2, B7-2 antigen);CD86 2 944 NM_001244 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8 (CD30 ligand) (CD30- L) (CD153 antigen). [Source :U n i prot/SWISS PROT; Acc: P32971] 945 NM_001772 CD33 antigen (gp67);CD33 946 NM_198845;NM_00124 sialic acid binding Ig-likelectin 6;SIGLEC6 5;NM_198846 953 NM_001776 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 (EC 3.6.1.5) (NTPDase1) (Ecto-ATP diphosphohydrolase) (ATPDase) (Lymphoid cell activation antigen) (Ecto-apyrase) (CD39 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P49961] _ NM_001250 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 958 precursor (CD40L receptor) (B-cell surface antigen CD40) (CDw40) (Bp50). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P25942] 959 NM_000074 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 5 (CD40 ligand) (CD40- L) (TNF-related activation protein) (TRAP) (T cell antigen Gp39) (CD154 antigen) [Contains: Tumor necrosis factor ligand superfamily member 5, membrane form; Tumor necrosis factor liqa 961 NM_001777;NM_009 N CD47 antigen (Rh-related antigen, integrin-associated signal 5080; NM_00102507; N transducer);CD47 M 198793 962 NM_001778 CD48 antigen (B-cell membrane protein);CD48 6 963 NM_000560 Leukocyte surface antigen CD53 (Cell surface glycoprotein CD53) (Tetraspanin-25) (Tspan-25). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P19397] 965 NM_001779 Lymphocyte function-associated antigen 3 precursor (Ag3) (Antigen CD58) (Surface glycoprotein LFA-3). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P19256] 966 NM_203330 CD59 glycoprotein precursor (Membrane attack complex inhibition factor) (MACIF) (MAC-inhibitory protein) (MAC-IP) (Protectin) (MEM43 antigen) (Membrane inhibitor of reactive lysis) (MIRL) (20 kDa homologous restriction factor) (HRF- 20) (HRF20) (1F5 antige 969 _ NM_001781 CD69 antigen (p60, early T-cell activation antigen);CD69 970 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 7 (CD27 NM_001252 ligand) (CD27- L) (CD70 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P329701 971 NM_001782 B-cell differentiation antigen CD72 (Lyb-2). _ [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P21854] 972 NM_001025159;NM_00 CD74 antigen (invariant polypeptide of major 4355;NM_001025158 histocompatibility complex, class II antigen-associated);CD74 973 NM_001783;NM_02160 CD79A antigen (immunoglobulin-associated alpha);CD79A 1 974 NM_000626;NM_02160 CD79B antigen (immunoglobulin-associated beta);CD79B 2 975 NM_004356 CD81 antigen (26 kDa cell surface protein TAPA-1) (Target of the antiproliferative antibody 1) (Tetraspanin-28) (Tspan- 28). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P60033] 976 NM 078481 CD97 antigen precursor (Leukocyte antigen CD97). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P48960] 987 LPS-responsive vesicle trafficking, beach and anchor NM_006726 containing (LRBA) 998 NM_001791;NM_04447 cell division cycle 42 (GTP binding protein, 25kDa);CDC42 2 1026 Cyclin-dependent kinase inhibitor 1 (p21) (CDK-interacting NM_078467 protein 1) (Melanoma differentiationassociated protein 6) (MDA-6). [Sou rce: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P38936] 1051 CCAAT/enhancer binding protein beta (C/EBP beta) (Nuclear NM_005194 factor NF- IL6) (Transcription factor 5). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P17676] 1053 NM_001805 CCAAT/enhancer binding protein epsilon (C/EBP epsilon). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15744] 1075 Dipeptidyl-peptidase I precursor (EC 3.4.14.1) (DPP-I) (DPPI) (Cathepsin C) (Cathepsin J) (Dipeptidyl transferase) NM_001814 [Contains: Dipeptidyl-peptidase I exclusion domain chain; Dipeptidyl-peptidase I heavy chain; Dipeptidyl-peptidase I Iight chain]. [Source:U 1088 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 8 NM 001816 precursor (Carcinoembryonic antigen CGM6) (Nonspecific û cross-reacting antigen NCA-95) (Antigen CD67) (CD66b antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P31997] ' 1118 NM 003465 Chitotriosidase-1 precursor (EC 3.2.1.14) (Chitinase-1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13231] 7 1130 NM_001005736 Lysosomal trafficking regulator (Beige homolog). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99698] 1147 NM 001278 conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase;CHUK 1178 NM_001828 Eosinophil lysophospholipase (EC 3.1.1.5) (Charcot-Leyden crystal protein) (Lysolecithin acylhydrolase) (CLC) (Galactin- 10). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q05315] 1191 NM_203339 Clusterin precursor (Complement-associated protein SP- 40,40) (Complement cytolysis inhibitor) (CLI) (NA1/NA2) (Apolipoprotein J) (Apo-J) (Testosterone-repressed prostate message 2) (TRPM-2) [Contains: Clusterin beta chain (ApoJaipha) (Complement cytolysis 1230 NM_001295 C-C chemokine receptor type 1 (C-C CKR-1) (CC-CKR-1) (CCR-1) (CCR1) (Macrophage inflammatory protein 1-alpha receptor) (MIP-lalpha-R) (RANTES-R) (HM145) (LD78 receptor) (CD191 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P32246] 1231 NM 000647 C-C chemokine receptor type 2 (C-C CKR-2) (CC-CKR-2) û (CCR-2) (CCR2) (Monocyte chemoattractant protein 1 receptor) (MCP-1-R) (CD192 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P415971 1232 NM_001837;NM_17832 C-C chemokine receptor type 3 (C-C CKR-3) (CC-CKR-3) 9 (CCR-3) (CCR3) (CKR3) (Eosinophil eotaxin receptor) (CD193 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P51677] 1233 NM_005508 C-C chemokine receptor type 4 (C-C CKR-4) (CC-CKR-4) (CCR-4) (CCR4) (K5-5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P51679] 1234 NM_000579 C-C chemokine receptor type 5 (C-C CKR-5) (CC-CKR-5) (CCR-5) (CCR5) (HIV-1 fusion coreceptor) (CHEMR13) (CD195 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P51681] 1235 NM_031409;NM_00436 C-C chemokine receptor type 6 (C-C CKR-6) (CC-CKR-6) 7 (CCR-6) (LARC receptor) (GPR-CY4) (GPRCY4) (Chemokine receptor-like 3) (CKR-L3) (DRY6) (G-protein coupled receptor 29) (Antigen CD196). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P51684] 1236 NM 001838 C-C chemokine receptor type 7 precursor (C-C CKR-7) (CC- û CKR-7) (CCR-7) (MIP-3 beta receptor) (EBV-induced G- protein coupled receptor 1) (EBI1) (BLR2) (CD197 antigen) (CDw197). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P32248] 1237 NM_005201 C-C chemokine receptor type 8 (C-C CKR-8) (CC-CKR-8) (CCR-8) (GPR-CY6) (GPRCY6) (Chemokine receptor-like 1) (CKR-L1) (TER1) (CMKBRL2) (CC-chemokine receptor CHEMR1) (CDw198 antigen). [Sou rce: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P516851 1238 NM 001296 Chemokine-binding protein 2 (Chemokine-binding protein û D6) (C-C chemokine receptor D6) (Chemokine receptor CCR- 9) (Chemokine receptor CCR-10). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:000590] 1240 NM_004072 Chemokine receptor-like 1 (G-protein coupled receptor DEZ) (G-protein coupled receptor ChemR23). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99788] 1241 NM_181657 Leukotriene B4 receptor 1 (LTB4-R 1) (P2Y purinoceptor 7) (P2Y7) (Chemoattractant receptor-like 1) (G-protein coupled receptor 16). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15722] 8 1269 NM 001841 Cannabinoid receptor 2 (CB2) (CB-2) (CX5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P34972] 1316 NM_001008490 Core promoter element-binding protein (Kruppel-like factor 6) (B-cell derived protein 1) (Proto-oncogene BCD1) (Transcription factor Zf9) (GC-rich sites binding factor GBF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99612] _ 1378 NM_000651;NM_00057 complement component (3b/4b) receptor 1, including Knops 3 blood group system;CR1 1379 XM_114735 complement component (3b/4b) receptor 1-like;CR1L 1380 NM_ 06658;NM_00 complement component (3d/Epstein Barr virus) receptor 1877 2;CR2 1392 NM_000756 Corticoliberin precursor (Corticotropin-releasing factor) (CRF) (Corticotropin-releasing hormone). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P06850] 1396 Cysteine-rich protein 1 (Cysteinerich intestinal protein) NM_001311 (CRIP) (Cysteine-rich heart protein) (hCRHP). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P50238] 1401 NM_000567 C-reactive protein, pentraxin-related;CRP 1432 NM_139013; N M_00131 5;NM_139012;NM_1390 mitogen-activated protein kinase 14;MAPK14 14 1436 Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor precursor NM_005211 (CSF-1-R) (EC 2.7.1.112) (Fms proto-oncogene) (c-fms) (CD115 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P07333] 1437 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor precursor NM_000758 (GM-CSF) (Colonystimulating factor) (CSF) (Sargramostim) (Molgramostin). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: PO4141] 1439 Cytokine receptor common beta chain precursor (GM- NM 000395 CSF/IL-3/IL-5 receptor common beta-chain) (CD131 û antigen) (CDw131). [Source: Un i prot/SWISSPROT; Acc: P329271 1440 Granulocyte colony-stimulating factor precursor (G-CSF) NM_000759 (Pluripoietin) (Filgrastim) (Lenograstim). [Source: Uniprot/SWISSPROT; Acc: P09919] 1441 Granulocyte colony-stimulating factor receptor precursor (G-NM_156039 CSF-R) (CD114 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q990621 1445 NM_004383 c-src tyrosine kinase;CSK 1493 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 precursor (Cytotoxic T- NM_005214 lymphocyte- associated antigen 4) (CTLA-4) (CD152 antigen). [Sou rce: U niprot/SWISSPROT;Acc: P16410] 1511 NM_001911 Cathepsin G precursor (EC 3.4.21.20) (CG). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P08311] 1520 NM 004079 Cathepsin S precursor (EC 3.4.22.27). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P25774] 1521 NM 001335 Cathepsin W precursor (EC 3.4.22.-) (Lymphopain). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P56202] 1524 CX3C chemokine receptor 1 (C-X3-C CKR-1) (CX3CR1) NM_001337 (Fractalkine receptor) (G-protein coupled receptor 13) (V28) (Beta chemokine receptor-like 1) (CMK-BRL-1) (CMKBLR1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P49238] 9 1536 NM_000397 Cytochrome B-245 heavy chain (P22 phagocyte B- cytochrome) (Neutrophil cytochrome B, 91 kDa polypeptide) (CGD91-PHOX) (GP91-PHOX) (GP91-1) (Heme binding membrane glycoprotein GP91PHOX) (Cytochrome B(558) beta chain) (Superoxide-generating NADPH oxidase hea 1604 NM 000574 decay accelerating factor for complement (CD55, Cromer û blood group system);DAF 1670 NM 021010 Defensin 5 precursor (Defensin, alpha 5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q01523] 1671 NM_001926 Defensin 6 precursor (Defensin, alpha 6). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q01524] 1672 NM_005218 defensin, beta 1;DEFB1 1673 NM_004942 defensin, beta 4;DEFB4 1675 NM_001928 D component of complement (adipsin);DF _ 1755 Deleted in malignant brain tumors 1 protein precursor NM 017579 (Glycoprotein 340) (Gp-340) (Surfactant pulmonary- - associated D-binding protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UGM31 1791 NM 001017520 DNA nucleotidylexotransferase (EC 2.7.7.31) (Terminal addition enzyme) (Terminal deoxynucleotidyltransferase) (Terminal transferase). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: PO40531 1794 NM_004946 Dedicator of cytokinesis protein 2. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q92608] 1803 NM_001935 Dipeptidyl peptidase 4 (EC 3.4.14.5) (Dipeptidyl peptidase IV) (DPP IV) (T-cell activation antigen CD26) (TP103) (Adenosine deaminase complexing protein 2) (ADABP) [Contains: Dipeptidyl peptidase 4 membrane form _ (Dipeptidyl peptidase IV membrane form); Di 1880 NM 004951 EBV-induced G-protein coupled receptor 2 (EBI2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P32249] 1896 NM 001005610 Ectodysplasin A (Ectodermal dyspiasia protein) (EDA protein) [Contains: Ectodysplasin A, membrane form; Ectodysplasin A, secreted form]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q92838] ~ 1903 NM 005226 Sphingosine 1-phosphate receptor Edg-3 (S1P receptor Edg- 3) (Endothelial differentiation G-protein coupled receptor 3) (Sphingosine 1-phosphate receptor 3) (S1P3). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99500] 1947 NM_004429 Ephrin-B1 precursor (EPH-related receptor tyrosine kinase ligand 2) (LERK-2) (ELK ligand) (ELK-L). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P98172] 1958 NM_001964 Early growth response protein 1 (EGR-1) (Krox-24 protein) (Transcription factor Zif268) (Nerve growth factor-induced protein A) (NGFI-A) (Transcription factor ETR103) (Zinc finger protein 225) (AT225). [Source :Uniprot/ SWISSPROT;Acc:P181461 _ 1997 NM_172373 ETS-related transcription factor Elf-1 (E74-Iike factor 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P32519] 2000 ETS-related transcription factor Elf4 (E74-Iike factor 4) (Myeloid Elf-l-Iike factor). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O996071 0 2053 NM_001979 Epoxide hydrolase 2 (EC 3.3.2.3) (Soluble epoxide hydrolase) (SEH) (Epoxide hydratase) (Cytosolic epoxide hydrolase) (CEH). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P34913] 2113 NM 005238 C-ets-1 protein (p54). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P149211 2147 NM 000506 Prothrombin precursor (EC 3.4.21.5) (Coagulation factor II) û [Contains: Activation peptide fragment 1; Activation peptide fragment 2; Thrombin light chain; Thrombin heavy chain]. _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P00734] 2152 NM_001993 coagulation factor III (thromboplastin, tissue factor);F3 2157 NM_000132 Coagulation factor VIII precursor (Procoagulant component) (Antihemophilic factor) (AHF) [Contains: Factor VIIIa heavy chain, 200 kDa isoform; Factor VIIIa heavy chain, 92 kDa isoform; Factor VIII B chain; Factor VIIIa light chain]. [Source:Uniprot/SWISSP 2158 NM_000133 coagulation factor IX (plasma thromboplastic component, Christmas disease, hemophilia B);F9 2159 NM_000504 coagulation factor X;F10 2165 NM_001994 coagulation factor XIII, B polypeptide;F13B 2204 NM_133271;NM_13327 2;NM_133269;NM_1332 78;NM_002000;NM_133 Fc fragment of IgA, receptor for;FCAR 273; NM_133277; N M_13 3279; NM_133280; NM_1 33274 2205 NM 002001 Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polype •tide;FCERIA _ 2206 membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 2 (Fc NM_000139 fragment of IgE, high affinity I, receptor for; beta polypeptide);MS4A2 2207 NM 004106 Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma •olypeptide;FCERIG 2208 NM 002002 Fc fragment of IgE, low affinity II, receptor for (CD23A);FCER2 2209 NM_000566 Fc fragment of IgG, high affinity Ia, receptor (CD64);FCGRIA 2212 NMO21642 Fc fragment of IgG, low affinity IIa, receptor _ (CD32);FCGR2A 2213 NM_004001;NM_00100 Fc fragment of IgG, low affinity IIb, receptor 2275; NM_001002274; N (CD32);FCGR2B M_001002273 2214 NM_000569 Fc fragment of IgG, low affinity IIIa, receptor (CD16a);FCGR3A 2215 NM_000570 Fc fragment of IgG, low affinity IIIb, receptor (CD16b);FCGR3B 2217 NM_004107 Fc fragment of IgG, receptor, transporter, alpha;FCGRT 2219 NM_002003 ficolin (collagen/fibrinogen domain containing) 1;FCN1 2220 NM_015837;NM_00410 ficolin (collagen/fibrinogen domain containing lectin) 2 8 (hucolin);FCN2 2255 NM_004465 Fibroblast growth factor 10 precursor (FGF-10) (Keratinocyte growth factor 2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O15520] 2268 NM_005248 Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (v-fgr) oncogene homolog;FGR 1 2280 NM 054014 FK506 binding protein 1A, 12kDa (FKBP1A) 2289 NM 004117 FK506 binding protein 5 (FKBP5) 2322 NM 004119 FL cytokine receptor precursor (EC 2.7.1.112) (Tyrosine- protein kinase receptor FLT3) (Stem cell tyrosine kinase 1) (STK-1) (CD135 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P368881 2323 NM_001459 SL cytokine precursor (Fms-related tyrosine kinase 3 ligand) (FIt3 ligand) (FIt3L). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P49771] 2335 NM 054034 Fibronectin precursor (FN) (Cold-insoluble globulin) (CIG). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P02751] 2353 NM_005252 v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog;FOS 2357 NM_002029 fMet-Leu-Phe receptor (fMLP receptor) (N-formyl peptide receptor) (FPR) (N-formylpeptide chemoattractant receptor). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P21462] 2358 NM_001005738 FMLP-related receptor I (FMLP-R-I) (Lipoxin A4 receptor) (LXA4 receptor) (Formyl peptide receptor-like 1) (RFP) (HM63). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P25090] 2444 NM_002031 fyn-related kinase;FRK 2495 NM_002032 Ferritin heavy chain (EC 1.16.3.1) (Ferritin H subunit) (Proliferation-inducing gene 15 protein). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P02794] 2532 NM_002036 Duffy antigen/chemokine receptor (Fy glycoprotein) (GpFy) (Glycoprotein D) (Plasmodium vivax receptor) (CD234 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q16570] 2533 NM_001465 FYN-binding protein (FYN-T-binding protein) (FYB-120/130) (p120/p130) (SLP-76 associated phosphoprotein) (SLAP- 130). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:015117] 2534 NM_153048;NM_00203 FYN oncogene related to SRC, FGR, YES;FYN 7;NM_153047 2537 NM002038 Interferon-induced protein 6-16 precursor (Ifi-6-16). _ _ [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P09912] 2543 NM_001468 GAGE-1 protein (G antigen 1) (MZ2-F antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13065] 2574 NM_012196 GAGE-1 protein (G antigen 1) (MZ2-F antigen). [Source:Uni • rot/ SWISSPROT;Acc:Q13065] 2633 NM_002053 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 (GTP-binding protein 1) (Guanine nucleotide-binding protein 1) (HuGBP- 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P32455] 2634 NM_004120 Interferon-induced guanylate-binding protein 2 (GTP-binding protein 2) (Guanine nucleotide-binding protein 2) (HuGBP- 2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P32456] 2635 NM 018284 guanylate binding protein 3 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_060754] 2637 _ Homeobox protein GBX-2 (Gastrulation and brain-specific NM_001485 homeobox protein 2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P52951] 2669 GTP-binding protein GEM (GTP-binding mitogen-induced T- NM_181702 cell protein) (RAS-like protein KIR). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P55040] 2 2687 NM_004121 Gamma-glutamyltransferase 5 precursor (EC 2.3.2.2) (Gamma-glutamyltranspeptidase 5) (Gamma- glutamyltransferase-like activity 1) (GGT-rel) [Contains: Gamma-glutamyltransferase 5 heavy chain; Gamma-glutamyltransferase 5 liqht chain]. [Source:Uniprot/SWISS 2821 Glucose-6-phosphate isomerase (EC 5.3.1.9) (GPI) (Phosphoglucose isomerase) (PGI) (Phosphohexose isomerase) (PHI) (Neuroleukin) (NLK) (Sperm antigen 36) (SA-36). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P06744] 2829 NM_001024644 Chemokine XC receptor 1 (XC chemokine receptor 1) (Lymphotactin receptor) (G-protein coupled receptor 5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P46094] 2833 NM 001504 C-X-C chemokine receptor type 3 (CXC-R3) (CXCR-3) (Interferon- inducible protein 10 receptor) (IP-10 receptor) (CKR-L2) (CD183 antigen) (G protein-coupled receptor 9). [Source: U ni p rot/ SWISSPROT;Acc: P49682] 2874 _ G protein pathway suppressor 2 (GPS2) NM 004489 2885 NM_002086;NM_20350 growth factor receptor-bound protein 2;GRB2 6 2908 NM 001018076 Glucocorticoid receptor (GR). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: PO4150] 2919 NM_001511 Growth regulated protein alpha precursor (CXCL1) (Melanoma growth stimulatory activity) (MGSA) (Neutrophil- activating protein 3) (NAP-3) (GRO-alpha(1-73)) [Contains: GRO-alpha(4-73); GRO-alpha(5-73); GRO-alpha(6-73)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P09341 2920 NM_002089 Macrophage inflammatory protein 2-alpha precursor (MIP2- alpha) (CXCL2) (Growth regulated protein beta) (Gro-beta) [Contains: GRO-beta(5-73) (GRO-beta-T) (SB-251353) (Hematopoietic synergistic factor) (HSF)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P19875] 2921 NM 002090 Macrophage inflammatory protein 2-beta precursor (MIP2- beta) (CXCL3) (Growth regulated protein gamma) (GRO- gamma) (GRO-gamma(1-73)) [Contains: GRO-gamma(5- 73)]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P19876] 3001 NM 006144 Granzyme A precursor (EC 3.4.21.78) (Cytotoxic T- lymphocyte proteinase 1) (Hanukkah factor) (H factor) (HF) (Granzyme-1) (CTL tryptase) (Fragmentin-1). [Source: U nip rot/ SWISSPROT;Acc: P125441 3055 NM_002110 hemopoietic tell kinase;HCK 3069 NM 203346 High density lipoprotein binding protein (viqilin) (HDLBP) 3070 NM_018063 helicase, lymphoid-specific [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_060533] 3075 NM_000186;NM_00101 complement factor H;CFH 4975 3077 NM 139006 Hereditary hemochromatosis protein precursor (HLA-H). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q30201] 3078 NM_002113 complement factor H-related 1;CFHL1 3080 NM_005666 complement factor H-related 2;CFHL2 3082 NM_000601;NM_00101 hepatocyte growth factor (hepapoietin A; scatter 0932;NM_001010931;N factor);HGF M_001010933;NM_001 010934 3 3087 NM_002729 Homeobox protein PRH (Hematopoietically expressed homeobox) (Homeobox protein HEX). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO3014] 3105 NM_002116 major histocompatibility complex, class I, A;HLA-A 3106 NM_005514 major histocompatibility complex, class I, B;HLA-B 3107 NM_002117 major histocompatibility complex, class I, C;HLA-C 3108 NM006120 major histocompatibility complex, class II, DM alpha;HLA- _ DMA 3109 NM 002118 major histocompatibility complex, class II, DM beta;HLA- û DMB _ 3110 _ NM 005515 Homeobox protein HB9. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P50219] 3111 _ NM002119 major histocompatibility complex, class II, DO alpha;HLA- _ DOA 3112 NM002120 major histocompatibility complex, class II, DO beta;HLA- _ DOB 3113 NM_033554 major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1;HLA- DPA1 3115 NM 002121 major histocompatibility complex, class II, DP beta 1;HLA- DPB1 3117 NM002122 major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1;HLA- _ DQA1 _ 3118 NMO20056 major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 2;HLA- _ DQA2 3119 NM002123 major histocompatibility complex, class II, DQ beta 1;HLA- _ DQB1 3120 NM 182549 major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2;HLA- DQB2 3122 NM 019111 major histocompatibility complex, class II, DR alpha;HLA- DRA 3123 NM002124 major histocompatibility complex, class II, DR beta 1;HLA- _ DRB1 3124 _ NM 001037638 major histocompatibility complex, class II, DR beta 2;HLA- i DRB2 3125 NM 022555 major histocompatibility complex, class II, DR beta 3;HLA- _ DRB3 3126 NM 021983 major histocompatibility complex, class II, DR beta 4;HLA- DRB4 3127 NM 002125 major histocompatibility complex, class II, DR beta 5;HLA- DRB5 3133 NM_005516 major histocompatibility complex, class I, E;HLA-E 3134 NM_018950 major histocompatibility complex, class I, F;HLA-F 3135 NM_002127 HLA-G histocompatibility antigen, class I, G;HLA-G 3140 NM_001531 major histocompatibility complex, class I-related;MR1 3149 NM_005342 High mobility group protein 4 (HMG-4) (High mobility group protein 2a) (HMG-2a). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O 15347] 3265 NM_176795;NM_00534 v-Ha-ras Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog;HRAS 3 3269 NM000861 Histamine H1 receptor. _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P35367j 3274 NM 022304 Histamine H2 receptor (H2R) (Gastric receptor I). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P250211 4 3320 NM005348 Heat shock protein HSP 90-alpha (HSP 86). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P07900] 3324 NM 005348 Heat shock protein HSP 90-alpha (HSP 86). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P07900] 3394 NM_002163 Interferon regulatory factor 8 (IRF-8) (Interferon consensus sequence binding protein) (ICSBP). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q025561 3426 NM_000204 I factor (complement);IF 3430 NM 005533 Interferon-induced 35 kDa protein (IFP 35). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc : P80217] 3433 NM_001547 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 (IFIT-2) (Interferon-induced 54 kDa protein) (In-54K) (ISG- 54 K). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P09913] 3434 NM_001548 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 (IFIT-1) (Interferon-induced 56 kDa protein) (IFI-56K). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P09914] 3437 _ Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 NM 001549 (IFIT-3) (IFIT-4) (Interferon-induced 60 kDa protein) (IFI- - 60K) (ISG-60) (CIG49) (Retinoic acid-induced gene G 'protein) (RIG-G). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O14879] 3440 _ NM 000605 ' Interferon alpha-2 precursor (Interferon alpha-A) (LeIF A). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01563] 3454 NM_000629 interferon (alpha, beta and omega) receptor 1;IFNAR1 3456 _ NM 002176 Interferon beta precursor (IFN-beta) (Fibroblast interferon). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01574] 3458 NM 000619 Interferon gamma precursor (IFN-gamma) (Immune interferon). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P01579] 3459 NM 000416 Interferon gamma receptor 1 (IFNGR1) 3460 NM 005534 interferon gamma receptor 2 (interferon gamma transducer 1);IFNGR2 3476 NM_001551 immunoglobulin (CD79A) binding protein 1;IGBP1 3512 NM 144646 Immunoglobulin J chain. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01591] 3516 Recombining binding protein suppressor of hairless (J kappa- recombination signal binding protein) (RBP-J kappa) (RBP-J) (RBP-JK) (CBF-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO63301 3543 NM_020070;NM_15285 immunoglobulin lambda-like polypeptide 1;IGLL1 3547 NM_001555;NM_20583 immunoglobulin superfamily, member 1;IGSF1 3 3550 NM 006083 Red protein (RER protein) (IK factor) (Cytokine IK). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13123] 3551 NM 001556 inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, _ kinase beta;IKBKB 3552 NM 000575 Interleukin-1 alpha precursor (IL-1 alpha) (Hematopoietin- 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P01583] 3553 NM000576 Interleukin-1 beta precursor (IL-1 beta) (Catabolin). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01584] 3554 Interleukin-1 receptor type I precursor (IL-1R-1) (IL-1RT1) NM_000877 (IL-1R- alpha) (p80) (Antigen CD121a). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P147781 3556 NM_134470 Interleukin-1 receptor accessory protein precursor (IL-1 receptor accessory protein) (IL-1RAcP). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NPH3] 3557 NM_000577 Interleukin-1 receptor antagonist protein precursor (IL-1ra) (IRAP) (IL1 inhibitor) (IL-1RN) (ICIL-1RA). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P18510] 3558 NM 000586 Interleukin-2 precursor (IL-2) (T-cell growth factor) (TCGF) (Aldesleukin). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P60568] 3559 NM_000417 Interleukin-2 receptor alpha chain precursor (IL-2 receptor alpha subunit) (IL-2-RA) (IL2-RA) (p55) (TAC antigen) (CD25 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01589] 3560 NM_000878 Interleukin-2 receptor beta chain precursor (IL-2 receptor) (P70-75) (p75) (High affinity IL-2 receptor beta subunit) (CD122 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P14784] 3561 NM 000206 Cytokine receptor common gamma chain precursor û (Gamma-C) (Interleukin- 2 receptor gamma chain) (IL-2R gamma chain) (P64) (CD132 antigen). rSource:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P317851 3562 NM 000588 Interleukin-3 precursor (IL-3) (Multipotential colony- ù stimulating factor) (Hematopoietic growth factor) (P-cell- stimulating factor) (Mast-cell growth factor) (MCGF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P08700] 3565 NM_000589 Interleukin-4 precursor (IL-4) (B-cell stimulatory factor 1) (BSF-1) (Lymphocyte stimulatory factor 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT; Acc: P05112] 3566 NM 001008699 Interleukin-4 receptor alpha chain precursor (IL-4R-alpha) ù (CD124 antigen) [Contains: Soluble interleukin-4 receptor alpha chain (sIL4Ralpha/prot) (IL-4-binding protein) (IL4- BP)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P24394] 3567 NM_000879 Interleukin-5 precursor (IL-5) (T-cell replacing factor) (TRF) (Eosinophil differentiation factor) (B cell differentiation factor I). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P05113] 3569 NM 000600 Interleukin-6 precursor (IL-6) (B-cell stimulatory factor 2) û (BSF-2) (Interferon beta-2) (Hybridoma growth factor) (CTL differentiation factor) (CDF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P05231] 3570 NM_000565 Interleukin-6 receptor alpha chain precursor (IL-6R-alpha) (IL-6R 1) (Membrane glycoprotein 80) (gp80) (CD126 antigen). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P08887] 3572 NM 002184 Interleukin-6 receptor beta chain precursor (IL-6R-beta) û (Interleukin 6 signal transducer) (Membrane glycoprotein 130) (gp130) (Oncostatin M receptor) (CD130 antigen) (CDw130). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P40189] 3574 NM 000880 Interleukin-7 precursor (IL-7). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P13232] 3575 NM_002185 Interleukin-7 receptor alpha chain precursor (IL-7R-alpha) (CD127 antigen) (CDw127). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P168711 3576 NM_000584 Interleukin-8 precursor (IL-8) (CXCL8) (Monocyte-derived neutrophil chemotactic factor) (MDNCF) (T-cell chemotactic factor) (Neutrophil- activating protein 1) (NAP-1) (Protein 3- 10C) (Granulocyte chemotactic protein 1) (GCP-1) (Monocyte derived neutrophil 6 3577 NM_000634 High affinity interleukin-8 receptor A (IL-8R A) (IL-8 receptor type 1) (CXCR-1) (CD181 antigen) (CDw128a antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P25024] 3578 NM_000590 Interleukin-9 precursor (IL-9) (T-cell growth factor P40) (P40 cytokine). [Source: Uniprot:/SWISSPROT;Acc:P15248] 3579 NM 001557 High affinity interleukin-8 receptor B (IL-8R B) (CXCR-2) û (GRO/MGSA receptor) (IL-8 receptor type 2) (CD182 antigen) (CDw128b antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P25025] 3586 NM_000572 Interleukin-10 precursor (IL-10) (Cytokine synthesis inhibitory factor) (CSIF). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P223011 3587 NM 001558 Interleukin 10 receptor, alpha (IL10RA) 3588 NM_000628 interleukin 10 receptor, beta;IL10RB 3589 NM_000641 Interleukin-11 precursor (IL-11) (Adipogenesis inhibitory factor) (AGIF) (Oprelvekin). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P20809] 3590 Interleukin-11 receptor alpha chain precursor (IL-11R-alpha) (IL- 11RA). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q14626] 3592 NM 000882 Interleukin-12 alpha chain precursor (IL-12A) (Cytotoxic û lymphocyte maturation factor 35 kDa subunit) (CLMF p35) (NK cell stimulatory factor chain 1) (NKSF1).[Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P29459] 3593 NM 002187 Interleukin-12 beta chain precursor (IL-12B) (IL-12 p40) û (Cytotoxic lymphocyte maturation factor 40 kDa subunit) (CLMF p40) (NK cell stimulatory factor chain 2) (NKSF2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P29460] 3594 NM_153701;NM_00553 interleukin 12 receptor, beta 1;IL12RB1 3596 NM_002188 Interleukin-13 precursor (IL-13). [Source:Uni • rot/SWISSPROT;Acc:P35225] 3600 NM_000585 Interleukin-15 precursor (IL-15). [Source: Uni prot/SWISSPROT;Acc: P40933] 3603 Interleukin-16 precursor (IL-16) (Lymphocyte chemoattractant factor) (LCF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q 14005] 3604 NM 001561 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 precursor (4-1BB ligand receptor) (T-cell antigen 4-1BB homolog) (T-cell antigen ILA) (CD137 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q07011] 3605 NM_002190 Interleukin-17 precursor (IL-17) (IL-17A) (Cytotoxic T lymphocyte- associated antigen 8) (CTLA-8). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q16552] 3606 NM 001562 Interleukin-18 precursor (IL-18) (Interferon-gamma- û inducing factor) (IFN-gamma-inducing factor) (Interleukin-1 gamma) (IL-1 gamma). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q 141161 3608 Interleukin enhancer-binding factor 2 (Nuclear factor of NM_004515 activated T- cells 45 kDa). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q12905] 3614 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 1 (EC 1.1.1.205) NM_000883 (IMP dehydrogenase 1) (IMPDH-I) (IMPD 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P20839] 7 3615 NM_000884 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 (EC 1.1.1.205) (IMP dehydrogenase 2) (IMPDH-II) (IMPD 2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P12268] 3620 NM_002164 Indoleamine 2,3-dioxygenase (EC 1.13.11.42) (IDO) (Indoleamine-pyrrole 2,3-dioxygenase). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P14902] 3623 NM 002191 _ Inhibin alpha chain precursor. [Source: Unip rot/ SWISSPROT;Acc: P05111] 3624 NM_002192 _ Inhibin beta A chain precursor (Activin beta-A chain) (Erythroid differentiation protein) (EDF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P08476] 3625 NM002193 Inhibin beta B chain precursor (Activin beta-B chain). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P09529] 3627 NM 001565 Small inducible cytokine B10 precursor (CXCL10) (10 kDa û interferon- gamma-induced protein) (Gamma-IP10) (IP-10) [Contains: CXCL10(1-73)]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P02778] 3630 NM000207 Insulin precursor [Contains: Insulin B chain; Insulin A _ Chain]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01308] 3635 NM005541 SH2 containing inositol phosphatase isoform a _ [Source:RefSeq_peptide;Acc:NP_001017915] 3656 NM 001570 Interleukin-1 receptor-associated kinase-like 2 (IRAK-2). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O43187] 3659 NM 002198 _ Interferon regulatory factor 1 (IRF-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P10914] 3660 NM 002199 _ Interferon regulatory factor 2 (IRF-2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P14316] 3662 NM 002460 Interferon regulatory factor 4 (IRF-4) (Lymphocyte-specific ù interferon regulatory factor) (LSIRF) (NF-EM5) (Multiple myeloma oncogene 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15306] 3665 NM001572 Interferon regulatory factor 7 (IRF-7). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q92985] 3672 NM_181501 Pelota homolog. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BRX2] 3681 NM_005353 Integrin alpha-D precursor (Leukointegrin alpha D) (CD11d) (ADB2). [Source: Uni prot/SWISSPROT;Acc: Q13349] 3683 NM 002209 Integrin alpha-L precursor (Leukocyte adhesion glycoprotein û LFA-1 alpha chain) (LFA-1A) (Leukocyte function associated molecule 1, alpha chain) (CD11a). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P207011 3684 NM_000632 Integrin alpha-M precursor (Cell surface glycoprotein MAC-1 alpha subunit) (CR-3 alpha chain) (CD11b) (Leukocyte adhesion receptor MO1) (Neutrophil adherence receptor). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P11215] 3688 Integrin beta-1 precursor (Fibronectin receptor beta subunit) NM_002211 (Integrin VLA-4 beta subunit) (CD29 antigen). [Source: U niprot/SWISSPROT;Acc: P05556] 3689 Integrin beta-2 precursor (Cela surface adhesion NM 000211 glycoproteins LFA- 1/CR3/p150,95 beta-subunit) (CD18) û (Complement receptor C3 beta-subunit). [Sou rce : Un iprot/SWISSPROT;Acc: P05107] 8 3697 NM_002215 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H1 precursor (M heavy chain H1) (Inter-alpha-inhibitor heavy chain 1) (Inter- alpha-trypsin inhibitor complex component III) (Serum- derived hyaluronan-associated protein) (SHAP). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P19 3700 NM_002218 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 precursor (ITI heavy chain H4) (Inter-alpha-inhibitor heavy chain 4) (Inter-' alpha-trypsin inhibitor family heavy chain-related protein) (IHRP) (Plasma kallikrein sensitive glycoprotein 120) (PK- 120) (GP120) [Co 3702 NM_005546 Tyrosine-protein kinase ITK/TSK (EC 2.7.1.112) (T-cell- specific kinase) (Tyrosine-protein kinase Lyk) (Kinase EMT). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q08881] 3707 NM_002221 Inositol-trisphosphate 3-kinase B (EC 2.7.1.127) (Inositol 1,4,5- trisphosphate 3-kinase B) (IP3K B) (IP3 3-kinase B) (IP3K-B). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc : P27987] 3708 NM_002222 inositol 1,4,5-triphosphate receptor, type 1;ITPR1 3709 NM_002223 inositol 1,4,5-triphosphate receptor, type 2;ITPR2 3710 NM_002224 inositol 1,4,5-triphosphate receptor, type 3;ITPR3 3714 NM_002226;NM_14515 jagged 2;JAG2 9 3716 NM 002227 Janus kinase 1 (a protein tyrosine kinase) (JAK1) 3718 BCO28068 Janus kinase 3 (a protein tyrosine kinase, leukocyte) 3725 NM_002228 v-jun sarcoma virus 17 oncogene homolog (avian);JUN 3802 NM_014218 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL1 precursor (MHC class I NK cell receptor) (Natural killer associated transcript 1) (NKAT-1) (p58 natural killer tell receptor clones CL- 42/47.11) (p58 NK receptor) (p58.1 MHC class-I-specifc NK receptor). [Sou 3803 NM_015868 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 precursor (MHC class I NK cell receptor) (Natural killer associated transcript 6) (NKAT-6) (p58 natural killer cell receptor clone CL-43) (p58 NK receptor). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P436271 3804 NM_015868 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 precursor (MHC class I NK cell receptor) (Natural killer associated transcript 6) (NKAT-6) (p58 natural killer cell receptor clone CL-43) (p58 NK receptor). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P436271 3805 NM 002255 killer cell immunoglobulin-like receptor, two domains, long cytoplasmic tail, 4;KIR2DL4 3806 NM_012313 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DS1 precursor (MHC class I NK cell receptor Eb6 Actl). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q14954] 3807 Killer cela immunoglobulin-like receptor 3DL3 precursor (Killer cell inhibitory receptor 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8N7431 3808 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DS1 precursor NM_012313 (MHC class I NK cell receptor Eb6 Actl). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q14954] 3809 NM_178228;NM_01231 killer cela immunoglobulin-like receptor, two domains, short 4 cytoplasmic tail, 4;KIR2DS4 9 3810 Killer cell immunoglobulinlike receptor 3DL3 precursor (Killer cell inhibitory receptor 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8N743] 3811 NM 013289 killer tell immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tait, 1;KIR3DL1 3812 NM 006737 killer cela immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tail, 2;KIR3DL2 3818 NM_000892 Plasma kallikrein precursor (EC 3.4.21.34) (Plasma prekallikrein) (Kininogenin) (Fletcher factor) [Contains: Plasma kallikrein heavy chain; Plasma kallikrein light chain]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P03952] 3820 NM_002258 killer cell lectin-like receptor subfamily B, member 1;KLRB1 3821 NM_002259;NM_21365 killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 1;KLRC1 7;NM_007328;NM_2136 58 3822 NM_002260 killer cela lectin-like receptor subfamily C, member 2;KLRC2 3823 _ NM_007333;NM_00226 killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 3;KLRC3 1 3824 NM_002262; NM_00733 killer cell lectin-like receptor subfamily D, member 1;KLRD1 4 3845 NM_033360;NM_00498v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog;KRAS 3848 NM_006121 Keratin, type II cytoskeletal 1 (Cytokeratin-1) (CK-1) (Keratin-1) (Ki) (67 kDa cytokeratin) (Hair alpha protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: PO4264] 3902 NM_002286 Lymphocyte activation gene 3 protein precursor (LAG-3) (FDC protein) (CD223 antigen). [Sou rce:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P186271 3903 NM_021708;NM_00228 leukocyte-associated Ig-like receptor 1;LAIR1 7;NM_021706 3904 NM_002288;NM_02127 leukocyte-associated Ig-like receptor 2;LAIR2 0 3929 _ NM_004139 lipopolysaccharide binding protein;LBP 3932 NM_005356 lymphocyte-specific protein tyrosine kinase;LCK 3933 NM_002297 Lipocalin-1 precursor (Von Ebner gland protein) (VEG protein) (Tear prealbumin) (TP) (Tear lipocalin) (Tlc). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P31025] 3936 NM 002298 Lymphocyte cytosolic protein 1 (L-plastin) (LCP1) 3937 NM 005565 lymphocyte cytosolic protein 2 (SH2 domain containing leukocyte protein of 76kDa);LCP2 3959 NM 005567 Galectin-3 binding protein precursor (Lectin galactoside- û binding soluble 3 binding protein) (Mac2 binding protein) (Mac-2 BP) (MAC2BP) (Tumor-associated antigen 90K). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q08380] 3976 NM 002309 Leukemia inhibitory factor precursor (LIF) (Differentiation- û stimulating factor) (D factor) (Melanoma-derived LPL inhibitor) (MLPLI) (Emfilermin). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P15018] 4046 Lymphocyte-specific protein 1 (Protein pp52) (52 kDa NM 001013253 phosphoprotein) (Lymphocyte-specific antigen WP34) (47 û kDa actin binding protein). _ [Source: Un iprot/ SWISSPROT; Acc: P332411 0 4048 NM_000895 Leukotriene A-4 hydrolase (EC 3.3.2.6) (LTA-4 hydrolase) (Leukotriene A(4) hydrolase). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P09960] 4049 NM_000595 Lymphotoxin-alpha precursor (LT-alpha) (TNF-beta) (Tumor necrosis factor ligand superfamily member 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01374] 4050 NM_002341 Lymphotoxin-beta (LT-beta) (Tumor necrosis factor C) (TNF- C) (Tumor necrosis factor ligand superfamily member 3). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q06643] 4055 NM 002342 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3 precursor (Lymphotoxin-beta receptor) (Tumor necrosis factor receptor 2 related protein) (Tumor necrosis factor C receptor). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P36941] 4057 NM_002343 Lactotransferrin precursor (EC 3.4.21.-) (Lactoferrin) [Contains: Kaliocin-1; Lactoferroxin A; Lactoferroxin B; Lactoferroxin C]. [Source: Uniprot:/SWISSPROT;Acc:P02788] 4061 NM 002346 Lymphocyte antigen 6 complex, locus E (LY6E) 4062 NM002347 Lymphocyte antigen Ly-6H precursor. _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:094772] 4063 NM_001033667; NM_00 lymphocyte antigen 9;LY9 2348 4064 NM_005582 CD180 antigen precursor (Lymphocyte antigen 64) (Radioprotective 105 kDa protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99467] 4065 NM_002349 Lymphocyte antigen 75 precursor (DEC-205) (CD205 antigen) (gp200-MR6). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:060449] 4067 NM 002350 v-yes1 Yamaguchi sarcoma viral related oncogene homoloq;LYN 4068 NM 002351 SH2 domain protein lA (Signaling lymphocyte activation û molecule- associated protein) (SLAM-associated protein) (T cell signal transduction molecule SAP) (Duncan disease SH2- protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:060880] 4069 NM_000239 lysozyme (renal amyloidosis);LYZ 4088 NM_005902 Mothers against decapentaplegic homolog 3 (SMAD 3) (Mothers against DPP homolog 3) (Mad3) (hMAD-3) (JV15- 2) (hSMAD3). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P84022] 4153 NM 000242 mannose-binding lectin (protein C) 2, soluble (opsonic û defect);MBL2 4155 NM_001025090 Myelin basic protein (MBP) (Myelin Al protein) (Myelin membrane encephalitogenic protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P02686] 4179 NM_172359;NM_17235 membrane cofactor protein (CD46, trophoblast-lymphocyte 6; NM_172351; N M_1723 cross-reactive antigen);MCP 53;NM_002389;NM_172 350;NM_153826;NM_17 2361;NM_172354;NM_1 72360; NM_172355; N M_ 172358;NM_172357;NM _172352 4210 NM 000243 Pyrin (Marenostrin). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:015553] 4215 NM_203351;NM_00240 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3;MAP3K3 1 1 4258 NM_002413 Microsomal glutathione S-transferase 2 (EC 2.5.1.18) (Microsomal GST- 2) (Microsomal GST-II). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99735] 4259 NM_004528 Microsomal glutathione S-transferase 3 (EC 2.5.1.18) (Microsomal GST- 3) (Microsomal GST-III). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O14880] 4261 NM000246 MHC class II transactivator (CIITA). _ [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P33076] 4276 NM_000247 MHC class I polypeptide-related sequence A; MICA 4277 NM_005931 MHC class I polypeptide-related sequence B;MICB 4282 NM 002415 Macrophage migration inhibitory factor (MIF) û (Phenylpyruvate tautomerase) (EC 5.3.2.1) (Glycosylation- inhibiting factor) (GIF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P141741 4283 NM_002416 Small inducible cytokine B9 precursor (CXCL9) (Gamma interferon- induced monokine) (MIG). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO73251 4332 NM002432 Myeloid cell nuclear differentiation antigen. _ [Sou rce: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P41218] 4345 NM_001004196;NM_00 CD200 antigen;CD200 5944;NM_001004197 4481 NM_002445;NM_13871 macrophage scavenger receptor 1;MSR1 5; N M_138716 4485 NMO20998 macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor- _ like);MST1 4599 NM 002462 Interferon-induced GTP-binding protein Mxl (Interferon- û regulated resistance GTP-binding protein MxA) (Interferon- induced protein p78) (IFI-78K). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P20591] 4600 NM_002463 Interferon-induced GTP-binding protein Mx2 (Interferon- regulated resistance GTP-binding protein MxB) (p78-related protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P20592] 4615 NM_002468 Myeloid differentiation primary response protein MyD88. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99836] 4687 NM_000265 Neutrophil cytosol factor 1 (NCF-1) (Neutrophil NADPH oxidase factor 1) (47 kDa neutrophil oxidase factor) (p47- phox) (NCF-47K) (47 kDa autosomal chronic granulomatous disease protein) (NOXO2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P145981 4688 NM_000433 Neutrophil cytosol factor 2 (NCF-2) (Neutrophil NADPH oxidase factor 2) (67 kDa neutrophil oxidase factor) (p67- phox) (NOXA2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P19878] 4690 NM_006153 NCK adaptor protein 1;NCK1 4772 NM172387;NM _ 00616 nuclear factor of activated T-cells , cytoplasmic, calcineurin- _ dependent 1;NFATC1 2;NM_172388;NM_1723 90;NM_172389 4773 NM_173091;NM_01234 nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin- 0 dependent 2;NFATC2 4775 NM_173164;NM_00455 nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin- 5;NM_173165;NM_1731 dependent 3;NFATC3 63 2 4776 NM004554 nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin- _ dependent4;NFATC4 4779 NM_003204 Nuclear factor erythroid 2 related factor 1 (NF-E2 related factor 1) (NFE2-related factor 1) (Nuclear factor, erythroid derived 2, like 1) (Transcription factor 11) (Transcription factor HBZ17) (Transcription factor LCR-F1) (Locus control region-factor 1) 4783 NM 005384 nuclear factor, interleukin 3 regulated [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_005375] 4790 NM_ 003998 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 (p105);NFKB1 4791 NM002502 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in _ B-cells 2 (p49/p100);NFKB2 4792 NMO20529 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in _ B-cells inhibitor, alpha;NFKBIA 4793 NM_002503; NM_00100 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in 1716 B-cells inhibitor, beta;NFKBIB 4795 NM005007 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in _ B-cells inhibitor-like 1;NFKBIL1 4843 NM 000625 j Nitric oxide synthase, inducible (EC 1.14.13.39) (NOS type II) (Inducible NO synthase) (Inducible NOS) (iNOS) (Hepatocyte NOS) (HEP-NOS). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P352281 4851 NM 017617 Notch homolog 1, translocation-associated (Drosophila); NOTCH 1 4853 NM_024408 Notch homolog 2 (Drosophila);NOTCH2 4854 NM_000435 Notch homolog 3 (Drosophila);NOTCH3 4855 NM_004557 Notch homolog 4 (Drosophila);NOTCH4 4884 NM_002522 neuronal pentraxin I;NPTX1 4885 NM_002523 neuronal pentraxin II;NPTX2 4893 NM_002524 neuroblastoma RAS viral (v-ras) oncogene homolog;NRAS 4929 NM 173172 Orphan nuclear receptor NR4A2 (Orphan nuclear receptor NURR1) (Immediate-early response protein NOT) (Transcriptionally inducible nuclear receptor). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P43354] 4938 NM_001032409;NM_01 2',5'-oligoadenylate synthetase 1, 40/46kDa;OAS1 6816;NM_002534 4939 NM016817;NM00103 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2, 69/71kDa;OAS2 2731;NM_002535 4940 NM_006187 2'-5'-oligoadenylate synthetase 3, 100kDa;OAS3 4973 NM_002543 Oxidized Iow-density lipoprotein receptor 1 (Ox-LDL receptor 1) (Lectin-type oxidized LDL receptor 1) (Lectin-like oxidized LDL receptor 1) (Lectin-like oxLDL receptor 1) (LOX-1) (hLOX-1) [Contains: Oxidized low-density lipoprotein rece •tor 1 soluble for 4985 NM 000911 Delta-type opioid receptor (DOR-1). _ [Source: Uni • rot/SWISSPROT;Acc: P41143] 4986 NM 000912 Kappa-type opioid receptor (KOR-1). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P41145] 5004 Alpha-1-acid glycoprotein 2 precursor (AGP 2) NM_000607 (Orosomucoid-2) (OMD 2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P196521 3 5005 NM_000608 Alpha-1-acid glycoprotein 2 precursor (AGP 2) (Orosomucoid-2) (OMD 2). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P19652] 5008 NM 020530 Oncostatin M precursor (OSM). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P13725] 5058 NM 002576 p21/Cdc42/Racl-activated kinase 1 (STE20 homolog, _ yeast);PAK1 5062 NM_002577 p21 (CDKN1A)-activated kinase 2;PAK2 5063 NM_002578 p21 (CDKN1A)-activated kinase 3;PAK3 5068 NM_002580 Regenerating islet-derived protein 3 alpha precursor (Reg III-alpha) (Pancreatitis-associated protein 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q06141] 5074 NM_002583 PRKC apoptosis WT1 regulator protein (Prostate apoptosis response-4 protein) (Par-4). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96IZO] 5079 _ NM016734 Paired box protein Pax-5 (B-cell-specific transcription factor) _ (BSAP . [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q02548] 5133 NM_005018 Programmed cell death protein 1 precursor (Protein PD-1) (hPD-1) (CD279 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15116] 5153 AB209200 Phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent variant protein. 5175 NM000442 platelet/endothelial cell adhesion molecule (CD31 _ antigen);PECAM1 5196 NM 002619 Platelet factor 4 precursor (PF-4) (CXCL4) (Oncostatin A) (Iroplact). [Source: Un i prot/SWISSPROT;Acc : P02776] 5197 NM 002620 Platelet factor 4 variant precursor (PF4varl) (PF4alt) û (CXCL4L1) [Contains: Platelet factor 4 variant(4-74); Platelet factor 4 variant(5-74); Platelet factor 4 variant(6-74)]. [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P10720] 5199 NM_002621 Properdin precursor (Factor P). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P27918] 5265 NM_001002236 Alpha-1-antitrypsin precursor (Alpha-1 protease inhibitor) (Alpha-1- antiproteinase). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P010091 5284 NM_002644 ' polymeric immunoglobulin receptor;PIGR 5286 NM 002645 phosphoinositide-3-kinase, class 2, alpha polypeptide;PIK3C2A 5287 NM 002646 phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta û polypeptide;PIK3C2B 5288 NM 004570 phosphoinositide-3-kinase, class 2, gamma polypeptide;PIK3C2G 5289 NM_002647 .hos•hoinositide-3-kinase, class 3;PIK3C3 _ 5290 NM 006218 phosphoinositide-3-kinase, catalytic, alpha polypeptide;PIK3CA 5291 NM006219 phosphoinositide-3-kinase, catalytic, beta _ polypeptide;PIK3CB 5293 NM 005026 phosphoinositide-3-kinase, catalytic, delta polypeptide;PIK3CD 5294 _ NM 002649 phosphoinositide-3-kinase, catalytic, gamma polypeptide;PIK3CG 5295 NM_181523;NM_18150 phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 1 (p85 4;NM_181524 alpha);PIK3R1 4 5296 NM_005027 phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 2 (p85 beta);PIK3R2 5330 NM 004573 Phospholipase C, beta 2 (PLCB2) 5335 NM_002660;NM_18281 phospholipase C, gamma 1;PLCG1 1 5336 NM_002661 phospholipase C, gamma 2 (phosphatidylinositol-specific);PLCG2 5345 NM_000934 Alpha-2-antiplasmin precursor (Alpha-2-plasmin inhibitor) (Alpha-2-PI) (Alpha-2-AP). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P08697] 5360 NM_182676;NM_00622 phospholipid transfer protein;PLTP 7 5393 NM_001034194 Exosome complex exonuclease RRP45 (EC 3.1.13.-) (Exosome component 9) (Polymyositis/scleroderma autoantigen 1) (Autoantigen PM/Scl 1) (Polymyositis/scleroderma autoantigen 75 kDa) (PM/Scl-75) (P75 polymyositis-scleroderma overlap syndrome associated autoa 5408 NM_005396 Pancreatic lipase-related protein 2 precursor (EC 3.1.1.3). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P54317] 5450 NM_006235 POU domain class 2, associating factor 1 (B-cell-specific coactivator OBF-1) (OCT binding factor 1) (BOB-1) (OCA-B). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q16633] 5452 NM 002698 POU domain, class 2, transcription factor 2 (Octamer- binding transcription factor 2) (Oct-2) (OTF-2) (Lymphoid- restricted immunoglobulin octamer binding protein NF-A2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P09086] 5468 NM_005037 Peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPAR- gamma). [Source:Uniprot/S WISSPROT;Acc:P37231] 5473 NM_002704 Platelet basic protein precursor (PBP) (Small inducible cytokine B7) (CXCL7) (Leukocyte-derived growth factor) (LDGF) (Macrophage-derived growth factor) (MDGF) [Contains: Connective tissue-activating peptide III (CTAP- III) (Low-affinity platelet factor IV 5479 NM 000942 Peptidylprolyl isomerase B (cyclophilin B) (PPIB) 5530 NM_000944 protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, alpha isoform (calcineurin A alpha);PPP3CA 5532 _021132 protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, beta NMO21132 isoform (calcineurin A beta);PPP3CB 5533 _005605 protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, NM005605 gamma isoform (calcineurin A gamma);PPP3CC 5551 NM 005041 Perforin 1 precursor (P1) (Lymphocyte pore forming protein) (PFP) (Cytolysin). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P14222] 5553 NM 002728 proteoglycan 2, bone marrow (natural killer cell activator, û eosinophil granule major basic protein);PRG2 5578 NM_002737 protein kinase C, alpha;PRKCA 5579 NM_212535;NM_00273 protein kinase C, beta 1;PRKCB1 8 5580 NM_006254;NM_21253 protein kinase C, delta;PRKCD 9 5581 NM_005400 protein kinase C, epsilon;PRKCE 5582 NM_002739 protein kinase C, gamma;PRKCG 5583 NM_006255 protein kinase C, eta;PRKCH 5588 NM_006257 protein kinase C, theta;PRKCQ 5594 NM_002745;NM_13895 mitogen-activated protein kinase 1;MAPK1 7 5595 NM_002746 mitogen-activated protein kinase 3;MAPK3 5599 NM_139046; N M_00275 mitogen-activated protein kinase 8;MAPK8 0;NM_139049;NM_1390 47 5600 NM_138993;NM_00275 mitogen-activated protein kinase 11;MAPK11 1 5601 NM_139069; N M_13907 mitogen-activated protein kinase 9;MAPK9 0;NM_139068;NM_0027 52 5602 NM_138980;NM_00275 mitogen-activated protein kinase 10;MAPK10 3;NM_138982;NM_1389 81 5603 NM_002754 mitogen-activated protein kinase 13;MAPK13 5604 NM_002755 mitogen-activated protein kinase kinase 1;MAP2K1 5605 NM_030662 mitogen-activated protein kinase kinase 2;MAP2K2 5606 NM_145110 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 3 (EC 2.7.1.-) (MAP kinase kinase 3) (MAPKK 3) (MAPK/ERK kinase 3). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P46734] _ Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein 5610 NM 002759 kinase (EC 2.7.1.-) (Interferon-inducible RNA-dependent protein kinase) (p68 kinase) (P1/eIF-2A protein kinase). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P19525] 5618 NM_000949 Prolactin receptor precursor (PRL-R). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P16471] 5624 NM_000312 protein C (inactivator of coagulation factors Va and VIIIa);PROC 5648 Complement-activating component of Ra-reactive factor precursor (EC 3.4.21.-) (Ra-reactive factor serine protease NM_001879 p100) (RaRF) (Mannan-binding lectin serine protease 1) (Mannose-binding protein associated serine protease) (MASP-1) [Contains: Complement-ac 5696 Proteasome subunit beta type 8 precursor (EC 3.4.25.1) NM 148919 (Proteasome component C13) (Macropain subunit C13) (Multicatalytic endopeptidase complex subunit C13). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P28062] 5698 Proteasome subunit beta type 9 precursor (EC 3.4.25.1) (Proteasome chain 7) (Macropain chain 7) (Multicatalytic NM_002800 endopeptidase complex chain 7) (RING12 protein) (Low molecular mass protein 2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P280651 5699 Proteasome subunit beta type 10 precursor (EC 3.4.25.1) NM 002801 (Proteasome MECI-1) (Macropain subunit MECI-1) (Multicatalytic endopeptidase complex subunit MECI-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P40306] 5720 Proteasome activator complex subunit 1 (Proteasome activator 28-alpha subunit) (PA28alpha) (PA28a) (Activator NM_176783 of multicatalytic protease subunit 1) (11S regulator complex alpha subunit) (REG-alpha) (Interferon gamma up-regulated I-5111 protein) (IGUP I-51 6 5721 NM_002818 Proteasome activator complex subunit 2 (Proteasome activator 28-beta subunit) (PA28beta) (PA28b) (Activator of multicatalytic protease subunit 2) (11S regulator complex beta subunit) (REG-beta). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UL46] 5724 NM 000952 Platelet-activating factor receptor (PAF-R). [Source:Uni • rot/SWISSPROT;Acc:P25105] 5733 NM_000957 Prostaglandin E2 receptor, EP3 subtype (Prostanoid EP3 receptor) (PGE receptor, EP3 subtype) (PGE2-R). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P43115] 5734 NM_000958 Prostaglandin E2 receptor, EP4 subtype (Prostanoid EP4 receptor) (PGE receptor, EP4 subtype). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P35408] 5743 NM_000963 Prostaglandin G/H synthase 2 precursor (EC 1.14.99.1) (Cyclooxygenase- 2) (COX-2) (Prostaglandin-endoperoxide synthase 2) (Prostaglandin H2 synthase 2) (PGH synthase 2) (PGHS-2) (PHS II). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P35354] 5763 I NM_002824 Parathymosin. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P20962] 5777 NM_002831;NM_08054 protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6; PTPN6 8;NM080549 5788 NM_080921; N M_08092 2;NM_002838;NM_0809 protein tyrosine phosphatase, receptor type, C;PTPRC 23 5806 NM_002852 pentraxin-related gene, rapidly induced by IL-1 beta;PTX3 _ 5817 NM_006505 poliovirus receptor;PVR 5818 NM_002855;NM_20328 poliovirus receptor-related 1 (herpesvirus entry mediator C; 5;NM_203286 nectin);PVRL1 5819 NM 002856 poliovirus receptor-related 2 (herpesvirus entry mediator B);PVRL2 5871 NM_004579 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 2 (EC 2.7.1.37) (MAPK/ERK kinase kinase kinase 2) (MEK kinase kinase 2) (MEKKK 2) (Germinal center kinase) (GC kinase) (Rab8 interacting protein) (B lymphocyte serine/threonine- protein kinase). [Source 5879 NM_006908;NM_01889 ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 (rho family, small 0;NM_198829 GTP binding protein Racl);RAC1 5880 NM 002872 ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2);RAC2 5881 NM 005052 ras-related C3 botulinum toxin substrate 3 (rho family, small GTP binding protein Rac3);RAC3 5894 NM_002880 v-raf- 1 murine leukemia viral oncogene homolog 1;RAF1 5896 NM_000448 V(D)J recombination-activating protein 1 (RAG-1) (RING finger protein 74). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P15918] 5897 NM 000536 V(D)J recombination-activating protein 2 (RAG-2). [Source: U n iprot/ SWISSPROT;Acc: P55895] 5970 NMO21975 Transcription factor p65 (Nuclear factor NF-kappa-B p65 _ subunit). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q04206] 5971 NM 006509 Transcription factor ReIB (I-Rel). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q01201] 5989 NM 002918 MHC class II regulatory factor RFX1 (RFX) (Enhancer factor C) (EF-C). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P226701 7 5996 NM_002922 Regulator of G-protein signaling 1 (RGS1) (Early response protein 1R20) (B-cell activation protein BL34). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO8116] 5997 NM 002923 Regulator of G-protein signallinq 2, 24kDa (RGS2) 6091 NM_002941;NM_13363 roundabout, axon guidance receptor, homolog 1 1 (Drosophila);ROBO1 6092 NM 002942 roundabout, axon guidance receptor, homolog 2 (Drosophila);ROBO2 6237 NM_006270 related RAS viral (r-ras) oncogene homolog;RRAS 6279 NM_002964 Calgranulin A (Migration inhibitory factor-related protein 8) (MRP-8) (Cystic fibrosis antigen) (CFAG) (P8) (Leukocyte L1 complex light chain) (S100 calcium-binding protein A8) (Calprotectin L1L subunit) (Urinary stone protein band A). [Source: Uniprot/SWI 6280 _ NM 002965 Calgranulin B (Migration inhibitory factor-related protein 14) (MRP- 14) (P14) (Leukocyte L1 complex heavy chain) (5100 calcium-binding protein A9) (Calprotectin L1H subunit). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P06702] 6283 NM 005621 Calgranulin C (CAGC) (CGRP) (Neutrophil 5100 protein) û (Calcium-binding protein in amniotic fluid 1) (CAAF1) (p6) [Contains: Calcitermin]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P80511] 6285 NM 006272 ' S-100 calcium-binding protein beta subunit (S-100 protein, beta chain). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:PO4271] 6288 NM_199161;NM_00033 serum amyloid A1;SAA1 1 6289 NM_030754 serum amyloid A2;SAA2 6291 _ NM_006512 serum amyloid A4, constitutive;SAA4 6300 NM_002969 mitogen-activated protein kinase 12;MAPK12 6318 NM 002974 Squamous cell carcinoma antigen 1 (SCCA-1) (Protein T4-A). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P29508] 6346 NM_002981 Small inducible cytokine Al precursor (CCL1) (T lymphocyte- secreted protein I-309). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P22362] 6347 NM_002982 Small inducible cytokine A2 precursor (CCL2) (Monocyte chemotactic protein 1) (MCP-1) (Monocyte chemoattractant protein 1) (Monocyte chemotactic and activating factor) (MCAF) (Monocyte secretory protein JE) (HC11). [Source: Un iprot/SWISSPROT; Acc: P135001 6348 NM_002983 Small inducible cytokine A3 precursor (CCL3) (Macrophage inflammatory protein 1-alpha) (MIP-1-alpha) (Tonsillar lymphocyte LD78 alpha protein) (GO/G1 switch regulatory protein 19-1) (GOS19-1 protein) (SIS-beta) (PAT 464.1) [Contains: MIP-1-alpha(4-69) (LD 6349 Small inducible cytokine A3-like 1 precursor (Tonsillar lymphocyte LD78 beta protein) (LD78-beta(1-70)) (GO/G1 NM_021006 switch regulatory protein 19-2) (GOS19-2 protein) (PAT 464.2) [Contains: LD78-beta(3-70); LD78- beta(5-70)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT:Acc: P1661 8 6351 NM_002984 Small inducible cytokine A4 precursor (CCL4) (Macrophage inflammatory protein 1-beta) (MIP-1-beta) (MIP-1-beta(1- 69)) (T-cell activation protein 2) (ACT-2) (PAT 744) (H400) (SIS-gamma) (Lymphocyte activation gene 1 protein) (LAG- 1) (HC21) (G-26 T lymphocy 6352 NM 002985 Small inducible cytokine A5 precursor (CCL5) (T-cell-specifc RANTES protein) (SIS-delta) (T cell-specific protein P228) (TCP228) [Contains: RANTES(3-68); RANTES(4-68)]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P13501] 6354 NM_006273 Small inducible cytokine A7 precursor (CCL7) (Monocyte chemotactic protein 3) (MCP-3) (Monocyte chemoattractant protein 3) (NC28). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P800981 6355 NM 005623 Small inducible cytokine A8 precursor (CCL8) (Monocyte chemotactic protein 2) (MCP-2) (Monocyte chemoattractant protein 2) (HC14) [Contains: MCP-2(6-76)]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P800751 6356 NM_002986 Eotaxin precursor (Small inducible cytokine Ail) (CCL11) (Eosinophil chemotactic protein). [Source: Un iprotjSWISSPROT;Acc: P516711 _ NM_005408 Small inducible cytokine A13 precursor (CCL13) (Monocyte 6357 chemotactic protein 4) (MCP-4) (Monocyte chemoattractant protein 4) (CK-beta-10) (NCC-1) [Contains: Small inducible cytokine A13, long isoform; Small inducible cytokine A13, J medium isoform; Small in 6359 NM_004167 Small inducible cytokine A15 precursor (CCL15) (Macrophage inflammatory protein 5) (MIP-5) (Chemokine CC-2) (HCC-2) (NCC-3) (MIP- 1 delta) (Leukotactin-1) (LKN- 1) (Mrp-2b) [Contains: CCL15(22-92); CCL15(25-92); CCL15(29-92)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc 6360 NM_004590 Small inducible cytokine A16 precursor (CCL16) (IL-10- inducible chemokine) (Chemokine LEC) (Liver-expressed chemokine) (Monotactin-1) (MTN-1) (Chemokine CC-4) (HCC-4) (NCC-4) (Lymphocyte and monocyte chemoattractant) (LMC) (LCC-1). [Source: Uniprot/SWISSPR 6361 NM_002987 Small inducible cytokine A17 precursor (CCL17) (Thymus and activation- regulated chemokine) (CC chemokine TARC). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q92583] 6362 NM_002988 Small inducible cytokine A18 precursor (CCL18) (Macrophage inflammatory protein 4) (MIP-4) (Pulmonary and activation-regulated chemokine) (CC chemokine PARC) (Alternative macrophage activation- associated CC chemokine 1) (AMAC-1) (Dendritic cell chemokine 6363 NM 006274 Small inducible cytokine A19 precursor (CCL19) û (Macrophage inflammatory protein 3 beta) (MIP-3-beta) (EBI1-ligand chemokine) (ELC) (Beta chemokine exodus-3) (CK beta-11). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99731] 6364 NM_004591 Small inducible cytokine A20 precursor (CCL20) (Macrophage inflammatory protein 3 alpha) (MIP-3-alpha) (Liver and activation-regulated chemokine) (CC chemokine LARC) (Beta chemokine exodus-1) [Contains: CCL20(1-67); CCL20(1-64); CCL20(2-70)]. [Source:Uni 9 6366 NM 002989 Smala inducible cytokine A21 precursor (CCL21) (Beta chemokine exodus- 2) (6Ckine) (Secondary lymphoid-tissue chemokine) (SLC). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O00585] 6367 NM_002990 Small inducible cytokine A22 precursor (CCL22) (Macrophage-derived chemokine) (MDC(1-69)) (Stimulated T cell chemotactic protein 1) (CC chemokine STCP-1) [Contains: MDC(3-69); MDC(5-69); MDC(7-69)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O00626] 6368 NM_005064 Small inducible cytokine A23 precursor (CCL23) (Macrophage inflammatory protein 3) (MIP-3) (Myeloid progenitor inhibitory factor 1) (MPIF-1) (CK-beta-8) (CKB-8) [Contains: CCL23(19-99); CCL23(22-99); CCL23(27-99); CCL23(30-99)]. [Source:Uniprot/SWISSPROT; 6369 NM 002991 Small inducible cytokine A24 precursor (CCL24) (Myeloid û progenitor inhibitory factor 2) (MPIF-2) (CK-beta-6) (Eosinophil chemotactic protein 2) (Eotaxin-2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O00i75] 6370 NM_005624 Small inducible cytokine A25 precursor (CCL25) (Chemokine TECK) (Thymus expressed chemokine). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O15444] _ 6372 Smala inducible cytokine B6 precursor (CXCL6) (Granulocyte chemotactic protein 2) (GCP-2) (Chemokine alpha 3) (CKA- NM_002993 3) [Contains: Small inducible cytokine B6, N-processed variant 1; Small inducible cytokine B6, N-processed variant 2; Smala inducible cytoki 6373 _ Small inducible cytokine B11 precursor (CXCL11) NM_005409 (Interferon-inducible T-cell alpha chemoattractant) (I-TAC) (Interferon-gamma-inducible protein 9) (IP-9) (H174) (Beta- R1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O14625] 6374 Small inducible cytokine B5 precursor (CXCL5) (Epithelial- derived neutrophil-activating protein 78) (Neutrophil- NM_002994 activating peptide ENA- 78) (ENA-78(1-78)) [Contains: ENA- 78(8-78); ENA-78(9-78)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P428301 6375 NM 002995 Lymphotactin precursor (XCL1) (Cytokine SCM-i) (ATAC) û (Lymphotaxin) (SCM-1-alpha) (SmaII inducible cytokine Cl) (XC chemokine ligand 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P479921 6376 NM_002996 Fractalkine precursor (CX3CL1) (Neurotactin) (CX3C membrane-anchored chemokine) (Small inducible cytokine Dl). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P78423] 6383 NM 002998 syndecan 2 (heparan sulfate proteoglycan 1, tell surface- associated, fibroglycan);SDC2 6385 NM_002999 syndecan 4 (amphiglycan, ryudocan);SDC4 _ 6387 NM 000609 Stromal cell-derived factor 1 precursor (SDF-1) (CXCL12) û (Pre-B cell growth-stimulating factor) (PBSF) (hIRH) [Contains: SDF-1-beta(3-72); SDF-1-alpha(3-67)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P48061] 6398 NM_003004 Secreted and transmembrane protein 1 precursor (Protein K12). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8WVN6] 6401 E-selectin precursor (Endothelial leukocyte adhesion NM_000450 molecule 1) (ELAM-1) (Leukocyte-endothelial cell adhesion molecule 2) (LECAM2) (CD62E antigen). 0 [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P16581] 6403 NM 003005 P-selectin precursor (Granule membrane protein 140) (GMP- û 140) (PADGEM) (CD62P antigen) (Leukocyte-endothelial cell adhesion molecule 3) (LECAM3). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P161091 6435 NM 005411 surfactant, pulmonary-associated protein Al;SFTPAI 6436 NM_006926 surfactant, pulmonary-associated protein A2;SFTPA2 6441 NM_003019 surfactant, pulmonary-associated protein D;SFTPD 6461 NM 003028 SHB (Src homology 2 domain containing) adaptor protein B [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_003019] 6480 NM_173217 CM P-N-acetylneurami nate-beta-galactosamide-alpha-2,6- sialyltransferase (EC 2.4.99.1) (Beta-galactoside alpha-2,6- sialyltransferase) (Alpha 2,6-ST) (Sialyltransferase 1) (ST6GaI I) (B-cell antigen CD75). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P15907] 6504 NM 003037 signaling lymphocytic activation molecule family member 1;SLAMF1 6556 Natural resistance-associated macrophage protein 1 AF229163 (SLC11A1) _ Sialoadhesin precursor (Sialic acid-binding Ig-like lectin-1) 6614 NM_023068 (Siglec- 1) (CD169 antigen). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BZZ2] 6648 NM001024465 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial precursor (EC _ 1.15.1.1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:PO4179] 6654 NM_005633 son of sevenless homolog 1 (Drosophila);SOS1 6655 NM_006939 son of sevenless homolog 2 (Drosophila);SOS2 6668 NM 003110 Transcription factor Sp2. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: Q02086] 6670 NM 001017371 Transcription factor Sp3 (SPR-2). û [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q02447] 6688 NM 003120 Transcription factor PU.1 (31 kDa transforming protein). [Source :Uniprot/SWISSPROT;Acc:P17947] 6693 Leukosialin precursor (Leucocyte sialoglycoprotein) NM_001030288 (Sialophorin) (CD43 antigen) (Galactoglycoprotein) (GALGP). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P16150] 6696 NM 000582 secreted phosphoprotein 1 (osteopontin, bone sialoprotein I, early T-lymphocyte activation 1);SPP1 6714 NM_005417;NM_19829',v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog 1 (avian);SRC Signal transducer and activator of transcription 3 (Acute- NM_139276 phase response factor). 6774 [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P407631 NM 003152 Signal transducer and activator of transcription 5A. 6776 [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P42229] NM012448 Signal transducer and activator of transcription 5B. 6777 _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P51692] _ NM 003175 Cytokine SCM-1 beta precursor (XCL2) (XC chemokine ligand 6846 2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UBD3] 6850 NM_003177 spleen tyrosine kinase;SYK 1 6863 NM_003182 Protachykinin 1 precursor (PPT) [Contains: Substance P; Neurokinin A (NKA) (Substance K) (Neuromedin L); Neuropeptide K (NPK); Neuropeptide gamma; C-terminal flanking peptide]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P20366] 6869 NM_015727 Substance-P receptor (SPR) (NK-1 receptor) (NK-1R) (Tachykinin receptor 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P25103] 6890 NM_000593 Antigen peptide transporter 1 (APT1) (Peptide transporter TAPI) (ATP- binding cassette sub-family B member 2) (Peptide transporter PSF1) (Peptide supply factor 1) (PSF-1) (Peptide transporter involved in antigen processing 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Ac 6891 NM 018833 Antigen peptide transporter 2 (APT2) (Peptide transporter û TAP2) (Peptide transporter PSF2) (Peptide supply factor 2) (PSF-2) (Peptide transporter involved in antigen processing 2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q03519] 6892 NM_003190;NM_17220 TAP binding protein (tapasin);TAPBP 9.NM_172208 6932 Transcription factor 7 (T-cell-specifc transcription factor 1) NM_201633 (TCF- 1) (T-ceil factor 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P364021 6935 NM 030751 Transcription factor 8 (NIL-2-A zinc finger protein) (Negative regulator of IL2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P37275] 6938 NM_003205 Transcription factor 12 (Transcription factor HTF-4) (E-box- binding protein) (DNA-binding protein HTF4). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99081] 6955 BC100294 T cell receptor alpha locus 6957 K02885 T-cell receptor beta locus 7006 NM_003215 tec protein tyrosine kinase;TEC 7031 NM 003225 trefoil factor 1 (breast cancer, estrogen-inducible sequence û expressed in);TFF1 7040 NM 000660 Transforming growth factor beta-1 precursor (TGF-beta-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01137] 7096 NM_003263 Toll-like receptor 1 precursor (Toll/interleukin-1 receptor-like protein) (TIL) (CD281 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q153991 7097 NM_003264 'Tolllike receptor 2 precursor (Toll/interleukin 1 receptor-like protein 4) (CD282 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:060603] 7098 NM003265 Toll-like receptor 3 precursor (CD283 antigen). _ [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: 0 15455] 7099 NM 138554 Toll-like receptor 4 precursor (hToll) (CD284 antigen). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: 000206] 7100 NM 003268 Toll-like receptor 5 precursor (Toll/interleukin-1 receptor-like protein 3). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:060602] 7124 NM_000594 Tumor necrosis factor precursor (TNF-alpha) (Tumor necrosis factor ligand superfamily member 2) (TNF-a) (Cachectin) [Contains: Tumor necrosis factor, membrane form; Tumor necrosis factor, soluble form]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P01375] 7130 Tumor necrosis factor-inducible protein TSG-6 precursor NM_007115 (TNF- stimulated gene 6 protein) (Hyaluronate-binding protein). [Source: U niprot/SWISSPROT;Acc: P980661 2 7132 NM_001065 Tumor necrosis factor receptor superfamily member lA precursor (p60) (TNF-R1) (TNF-RI) (TNFR-I) (p55) (CD120a antigen) [Contains: Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, membrane form; Tumor necrosis factor-bindinq protein 1 (TBPI)]. [Source 7133 NM 001066 tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1B;TNFRSF1B 7177 NM 003294 Tryptase beta-1 precursor (EC 3.4.21.59) (Tryptase-1) _ (Tryptase I). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15661] 7187 AF11.0908 TNF-receptor associated factor-3 (TRAF-3) 7189 NM_145803 TNF receptor-associated factor 6 (Interleukin 1 signal transducer) (RING finger protein 85). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y4K3] 7273 NM133379 titin isoform novex-3 _ [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_596870] 7292 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4 (0X40 NM 003326 ligand) (OX40L) (Glycoprotein GP34) (TAX transcriptionally- - activated glycoprotein 1) (CD252 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P23510] 7293 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 NM_003327 precursor (OX40L receptor) (ACT35 antigen) (TAX transcriptionally-activated glycoprotein 1 receptor) (CD134 antigen). [Sou rce : Uniprot/SWISSPROT;Acc: P43489] 7294 NM_003328 TXK tyrosine kinase;TXK NM_198125;NM_00333 TYRO protein tyrosine kinase binding 2 tyg protein;TYROBP 7369 NM003361 Uromodulin precursor (Tamm-Horsfall urinary glycoprotein) _ (THP . [Source: Uni. rot/SWISSPROT;Acc: P07911] 7409 NM_005428 vav 1 oncogene;VAV1 7410 NM_003371 vav 2 oncogene;VAV2 7422 Vascular endothelial growth factor A precursor (VEGF-A) NM_001025366 (Vascular permeability factor) (VPF). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P15692] 7433 NM 004624 Vasoactive intestinal polypeptide receptor 1 precursor (VIP- ù R-1) (Pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide type II receptor) (PACAP type II receptor) (PACAP-R-2). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P32241] 7441 NM_007128 pre-B lymphocyte gene 1; VPREB1 7448 NM 000638 Vitronectin precursor (Serum spreading factor) (S-protein) (V75) [Contains: Vitronectin V65 subunit; Vitronectin V10 subunit; Somatomedin B]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:PO40041 7454 NM_000377 Wiskott-Aldrich syndrome (eczema-thrombocytopenia);WAS 7462 NM_022040 Linker for activation of T-cells family member 2 (Non-T-cell activation linker) (Linker for activation of B-cells) (Membraneassociated adapter molecule) (Williams-Beuren syndrome critical region 15 protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9GZY6] 7494 NM_005080 X box binding protein 1 (XBP-1) (Tax-responsive element- binding protein 5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P17861] 7525 NM_005433 v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral oncogene homolog 1;YES1 3 Transcriptional repressor protein YY1 (Yin and yang 1) (YY- 7528 NM_003403 1) (Delta transcription factor) (NF-E1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P25490] 7535 NM_001079;NM_20751 zeta- chain (TCR) associated protein kinase 70kDa;ZAP70 9 7538 NM 003407 Tristetraproline (TTP) (Zinc finger protein 36 homolog) (Zfp- 36) (TIS11A protein) (TIS11) (Growth factor-inducible nuclear protein NUP475) (G0/G1 switch regulatory protein 24). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P26651] 7551 NM_032924 Zinc finger protein 38 (Zinc finger protein KOX25) (Zinc finger protein HF.12) (Zinc finger protein 3) (HZF3.1 protein). [Sou rce: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P17036] 7707 NM_021964 Zinc finger protein 148 (Zinc finger DNA binding protein 89) (Transcription factor ZBP-89). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UQR1] 7716 NM007146 Zinc finger protein 161 (Putative transcription factor DB1). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q14119] 7732 NM_007148 Zinc finger protein 179 (Brain finger protein) (RING finger protein 112). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9ULX5] 7791 NM 001010972 Zyxin (ZYX) 7837 PXDN protein (Fragment). [Source:Uniprot/SPTREMBL;Acc:Q4KMG21 7850 NM_173343 Interleukin-1 receptor type II precursor (IL-1R-2) (IL-1R- beta) (Antigen CD121b) (Antigen CDw121b). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P27930] 7852 NM_001008540 C-X-C chemokine receptor type 4 (CXC-R4) (CXCR-4) (Stromal cell- derived factor 1 receptor) (SDF-1 receptor) (Fusin) (Leukocyte-derived seven transmembrane domain receptor) (LESTR) (LCR1) (FB22) (NPYRL) (HM89) (CD184 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT; Ac 7940 NM 007161 Leukocyte-specific transcript 1 protein (B144 protein). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O00453] 7941 NM_005084 Platelet-activating factor acetylhydrolase precursor (EC 3.1.1.47) (PAF acetylhydrolase) (PAF 2-acylhydrolase) (LDL- associated phospholipase A2) (LDL-PLA(2)) (2-acetyl-l- alkylglycerophosphocholine esterase) (1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase) 8061 NM005438 Fosrelated antigen 1 (FRA-1). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P15407] 8111 NM 003485 Sphingosylphosphorylcholine receptor (Ovarian cancer G- û protein coupled receptor 1) (OGR-1) (G-protein coupled receptor 68) (GPR12A). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15743] 8174 NM_130761 Mucosal addressin cell adhesion molecule 1 precursor (MAdCAM-1) (hMAdCAM-1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13477] 8227 NM_005088 B-lymphocyte antigen precursor (B-lymphocyte surface antigen) (721P) (Protein XE7). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q02040] 8302 NM_013431 killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 4;KLRC4 8440 NM_001004720;NM_00 NCK adaptor protein 2;NCK2 3581;NM_001004722 4 8455 NM139321 Attractin precursor (Mahogany homolog) (DPPT-L). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75882] 8460 NM_003596 Protein-tyrosine sulfotransferase 1 (EC 2.8.2.20) (Tyrosylprotein sulfotransferase-1) (TPST-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O60507] 8477 NM_003608 Psychosine receptor (G-protein coupled receptor 65) (T cell- death associated protein 8). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8IYL91 8482 NM 003612 Semaphorin-7A precursor (Semaphorin L) (Sema L) û (Semaphorin Ki) (Sema Ki) (John-Milton-Hargen human blood group Ag) (JMH blood group antigen) (CD108 antigen) (CDw108). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75326] 8517 NM_003639 NF-kappa-B essential modulator (NEMO) (NF-kappa-B essential modifier) (Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase gamma subunit) (IkB kinase gamma subunit) (I- kappa-B kinase gamma) (IKK-gamma) (IKKG) (IkB kinase-associated protein 1) (IKKAP1) (FIP-3). fSo 8518 NM_003640 IkappaB kinase complex-associated protein (IKK complex- associated protein) (p150). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O951631 8519 NM 003641 Interferon-induced transmembrane protein 1 (Interferon- û induced protein 17) (Interferon-inducible protein 9-27) (Leu- 13 antigen) (CD225 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P131641 8527 Diacylglycerol kinase, delta (EC 2.7.1.107) (Diglyceride NM 152879 kinase) (DGK- delta) (DAG kinase delta) (130 kDa û diacylglycerol kinase). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q167601 8530 _ NM_003650 Cystatin F precursor (Leukocystatin) (Cystatin-7) (Cystatin- like metastasis-associated protein) (CMAP). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O76096] _ 8534 NM_003654 Carbohydrate sulfotransferase 1 (EC 2.8.2.21) (Keratan sulfate Gal-6 sulfotransferase) (KSST) (KSGaI6ST) (KS6ST) (Galactose/N-acetylglucosamine/N-acetylglucosamine 6-0- sulfotransferase 1) (GST-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O439161 8546 NM_003664 Adapter-related protein complex 3 beta 1 subunit (Beta3A- adaptin) (Adaptor protein complex AP-3 beta-1 subunit) (AP- 3 complex beta-1 subunit) (Clathrin assembly protein complex 3 beta-1 large chain). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O00203] 8547 NM_173452;NM_00366 ficolin (collagen/fibrinogen domain containing) 3 (Hakata antigen);FCN3 8575 NM 003690 protein kinase, interferon-inducible double stranded RNA dependent activator;PRKRA 8600 NM_003701 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11 (Receptor activator of nuclear factor kappa B ligand) (RANKL) (TNF-related activation- induced cytokine) (TRANCE) (Osteoprotegerin ligand) (OPGL) (Osteoclast differentiation factor) (ODF) (CD254 antigen) 8605 Cytosolic phospholipase A2 gamma (EC 3.1.1.4) (cPLA2- NM_003706 gamma) (Phospholipase A2 group IVC). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UP65] 8625 NM_003721 DNA-binding protein RFXANK (Regulatory factor X subunit B) (RFX-B) (Ankyrin repeat family A protein 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O14593] 8631 NM_003726 src family associated phosphoprotein 1 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_003717] 8638 NM_003733;NM_19821 2'-5'-oligoadenylate synthetase-like;OASL 3 8639 NM 003734 Membrane copper amine oxidase (EC 1.4.3.6) (Semicarbazidesensitive amine oxidase) (SSAO) (Vascular adhesion protein 1) (VAP-1) (HPAO). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q16853] 8678 NM 003766 Beclin-1 (Coiled- coil myosin-like BCL2-interacting protein) (Protein GT197). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q14457] 8681 NM 005090 phospholipase A2, group IVB [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_005081] 8698 NM 003775 Sphingosine 1-phosphate receptor Edg-6 (S1P receptor Edg- û 6) (Endothelial differentiation G-protein coupled receptor 6) (Sphingosine 1-phosphate receptor 4) (S1P4). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95977] 8712 NM_003785 G antigen family B 1 protein (Prostate-associated gene protein 1) (PAGE-1) (GAGE-9) (AL5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75459] _ 8718 NM_148972 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25 precursor (WSL-1 protein) (Apoptosis-mediating receptor DR3) (Apoptosis-mediating receptor TRAMP) (Death domain receptor 3) (WSL protein) (Apoptosis- inducing receptor AIR) (Apo-3) (Lymphocyte associate 8740 NM_003807 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14 (Herpesvirus entry mediator-ligand) (HVEM-L) (CD258 antigen) [Contains: Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, membrane form; Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, soluble form] 8741 NM_172088 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13 precursor (A proliferation-inducing ligand) (APRIL) (TNF-and APOL-related leukocyte expressed ligand 2) (TALL-2) (TNF-related death ligand-1) (TRDL-1) (CD256 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75888 8742 NM_003809 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13 precursor (A proliferation-inducing ligand) (APRIL) (TNF-and APOL-related leukocyte expressed ligand 2) (TALL-2) (TNF- related death ligand-1) (TRDL-1) (CD256 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75888 8743 _ NM 003810 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10 (TNF- û related apoptosis-inducing ligand) (TRAIL protein) (Apo-2 ligand) (Apo-2L) (CD253 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P505911 8744 NM 003811 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9 (4-1BB ligand) (4- 1BBL). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P41273] 8764 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 14 NM 003820 precursor (Herpesvirus entry mediator A) (Tumor necrosis û factor receptor-like 2) (TR2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O929561 6 Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2 (EC 8767 NM_003821 2.7.1.37) (RIP-Iike interacting CLARP kinase) (Receptor- interacting protein 2) (RIP-2) (CARD-containing interleukin-1 beta-converting enzyme- associated kinase) (CARD- containing IL-1 beta ICE-king 8772 NM_003824 FADD protein (FAS-associating death domain-containing protein) (Mediator of receptor induced toxicity). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13158] 8778 NM_003830 sialic acid binding Ig-Iike lectin 5;SIGLEC5 • NM 003839 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A û precursor (Receptor activator of NF-KB) (Osteoclast differentiation factor receptor) (ODFR) (CD265 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y6Q6] :: Interleukin-18 receptor accessory protein precursor (IL-18 receptor accessory protein) (IL-18RAcP) (Interleukin-18 NM_003853 receptor accessory protein-like) (IL-18Rbeta) (IL-1R accessory protein like) (IL-1RAcPL) (Accessory protein-like) (AcPL) (IL-1R7) (CDw2l8b a :: Interleukin-1 receptor-like 2 precursor (IL-1Rrp2) NM_003854 (Interleukin-1 receptor-related protein 2) (IL1R-rp2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9HB29] • Interleukin-18 receptor 1 precursor (IL1 receptor-related NM_003855 protein) (IL-lRrp) (CDw218a antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13478] NM_003874 CD84 antigen (leukocyte antigen);CD84 NM 003877 Suppressor of cytokine signalinq 2 (SOCS2) :: NM 003883 Histone deacetylase 3 (HDAC3) 8862 Apelin precursor (APJ endogenous ligand) [Contains: Apelin- NM_017413 36; Apelin-31; Apelin-28; Apelin-13]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9ULZ1] 8878 Sequestosome-1 (Phosphotyrosine-independent ligand for NM 003900 the Lck SH2 domain of 62 kDa) (Ubiquitin-binding protein û p62) (EBI3-associated protein of 60 kDa) (p60) (EBIAP). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13501] 8915 B cell lymphoma/leukemia 10 (B-cell CLL/lymphoma 10) (Bd-10) (CED-3/ICH-1 prodomain homologous E10-Iike regulator) (CIPER) (CARD- containing molecule enhancing NFkappaB) (Cellular homolog of vCARMEN) (cCARMEN) (Mammalian CARD-containing adapter molecule 8976 NM_003941 Wiskott-Aldrich syndrome-Iike;WASL 8991 NM_003944 selenium binding protein 1;SELENBP1 8993 NM_005091 peptidoglycan recognition protein 1;PGLYRP1 8995 NM 005092 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18 û (Glucocorticoid- induced TNF-related ligand) (hGITRL) (Activation-inducible TNF-related ligand) (AITRL). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UNG21 9103 NM_001005411;NM_20 Fc fragment of IgG, Iow affinity IIc, receptor for 1563; NM_001005410; N (CD32); FCGR2C M_001005412 9111 NM 004688 N-myc-interactor (Nmi) (N-myc and STAT interactor). _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13287] 7 9173 NM_016232 Interleukin-1 receptor-like 1 precursor (ST2 protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q01638] 9214 NM_005449 Fas apoptotic inhibitory molecule 3 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_005440] 9235 NM 001012631 Interieukin 32 (1L32) 9240 NM_006029 paraneoplastic antigen MA1;PNMA1 9244 NM_004750 Cytokine receptor-like factor 1 precursor (Cytokine-like factor 1) (CLF-1) (ZcytoR5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75462] 9255 Multisynthetase compiex auxiliary component p43 [Contains: Endothelial monocyte-activating polypeptide II (EMAP-II) (Small inducible cytokine subfamily E member 1)]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q12904] 9308 NM_004233 CD83 antigen precursor (Cell surface protein HB15) (B-cell activation protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO11511 9332 NM_004244 CD163 antigen isoform a [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_004235] 9373 NM 001031689 Phospholipase A-2-activating protein (PLAP) (PLA2P). û [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y263] 9398 NM_004258 immunoglobulin superfamily, member 2 [Source:RefSe._•eptide;Acc:NP 004249] 9402 NM_004810 GRB2-related adaptor protein 2;GRAP2 9435 NM_004267 Carbohydrate sulfotransferase 2 (EC 2.8.2.-) (N- acetylglucosamine 6-0sulfotransferase 1) (GIcNAc6ST-1) (Gn6ST) (Galactose/N-acetylgiucosamine/N- acetylglucosamine 6-0-sulfotransferase 2) (GST-2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y4C5] 9436 NM 004828 Natural cytotoxicity triggering receptor 2 precursor (Natural û kiiler cell p44-related protein) (NKp44) (NK-p44) (NK cell- activating receptor) (Lymphocyte antigen 95 homolog) (CD336 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95944] 9437 NM_004829 natural cytotoxicity triggering receptor 1;NCR1 9447 NM_004833 Interferon-inducible protein AIM2 (Absent in melanoma 2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O14862] 9450 NM_004271 Lymphocyte antigen 86 precursor (MD-1 protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95711] 9466 NM_004843 interleukin 27 receptor, alpha;IL27RA 9536 NM 004878 Prostaglandin E synthase (EC 5.3.99.3) (Microsomal glutathione S-transferase 1-like 1) (MGST1-Ll) (p53- induced apoptosis protein 12). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O146841 9547 NM_004887 Smala inducible cytokine B14 precursor (CXCL14) (Chemokine BRAK). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O957151 _ NM 001001435 chemokine (C-C motif) ligand 4-like 2 precursor 9560 [Source:RefSeq_peptide;Acc:NP_996890] 9567 NM_004286 GTP-binding protein 1 (G-protein 1) (GP-1) (GP1). [Source: Uniprot/S WISSPROT;Acc:O00178] 9636 Interferon-induced 17 kDa protein precursor [Contains: NM_005101 Ubiquitin cross-reactive protein (Interferon-induced 15 kDa protein)]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P05161] 8 9641 NM 014002 Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase epsilon subunit û (EC 2.7.1.-) (I kappa-B kinase epsilon) (IkBKE) (IKK-epsilon) (IKK-E) (Inducible I kappa-B kinase)(IKK-i). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q14164] 9655 NM 014011 Cytokine inducible SH2-containing protein 5 (Suppressor of û cytokine signaling 5) (SOCS-5) (Cytokine-inducible SH2 protein 6) (CIS-6). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75159] 9682 NM 014663 Jumonji domain containing 2A (JMJD2A) 9734 NM 178423 Histone deacetylase 9 (HD9) (HD7B) (HD7). [Source: Uniprot:/SWISSPROT;Acc:Q9UKVO] 9759 NM 006037 Histone deacetylase 4 (HD4). [Source: Un iprot/SWISSPROT;Acc: P56524] 9966 NM 005118 tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 15 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_005109] 9976 NM_005127 C-type lectin domain family 2, member B;CLEC2B 10000 NM_181690;NM_00546 v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 3 (protein kinase B, gamma);AKT3 10005 NM_005469 Peroxisomal acyl-coenzyme A thioester hydrolase 1 (EC 3.1.2.2) (Peroxisomal long-chain acyl-coA thioesterase 1) (Acyl-CoA thioesterase 8) (HIV-Nef associated acyl coA thioesterase) (Thioesterase II) (hTE) (hACTEIII) (hACTE-III) (PTE-2). [Source:Uniprot/SW 10014 NM 001015053 Histone deacetylase 5 (HD5) (Antigen NY-CO-9). û [Source: Uniprot:/SWISSPROT;Acc:Q9UQL6] 10068 Interleukin-18-binding protein precursor (IL-18BP) (Tadekinig-alfa). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95998] 10087 NM 005713 Goodpasture antigen-binding protein (EC 2.7.1.37) (GPBP) û (Collagen type IV alpha 3 binding protein) (StAR-related Iipid transfer protein 11) (StARD11) (START domain-containing protein 11). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y5P4] 10134 NM 005745 B-cell receptor-associated protein 31 (BCR-associated û protein Bap3l) (p28 Bap3l) (CDM protein) (6C6-AG tumor- associated antigen) (DXS1357E). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P515721 10148 NM_005755 Interleukin-27 beta chain precursor (IL-27B) (Epstein-Barr virus- induced gene 3 protein) (EBV-induced gene 3 protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q14213] 10164 NM_005769 Carbohydrate sulfotransferase 4 (EC 2.8.2.-) (N- acetylglucosamine 6-0sulfotransferase 2) (GIcNAc6ST-2) (High endothelial cells N-acetylglucosamine 6-0- sulfotransferase) (HEC-GIcNAc6ST) (L-selectin ligand sulfotransferase) (LSST) (Galactose/N-acetylgluc 10175 NM 001009551 Cornichon homolog (TGAM77). û [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95406] 10178 NM 014253 odz, odd Oz/ten-m homolog 1 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_055068] 10219 NM_005810 killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 1;KLRG1 10225 NM_005816;NM_19819 CD96 antigen;CD96 6 10261 1 immunoglobulin superfamily, member 6 NM 005849 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_005840] 9 10288 NM 005874 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B (with TM and ITIM domains), member 2;LILRB2 10298 NM_001014832; NM_00 p21(CDKNIA)-activated kinase 4;PAK4 1014835;NM_00101483 3; N M_001014831; N M_0 05884;NM_001014834 10312 NM_006053 Vacuolar proton transiocating ATPase 116 kDa subunit a isoform 3 (V- ATPase 116-kDa isoform a3) (Osteoclastic ' proton pump 116 kDa subunit) (OC-116 kDa) (OC116) (T- cell immune regulator 1) (T cell immune response cDNA7 protein) (TIRC7). [Source:Uniprot/SWI 10318 NM 006058 TNFAIP3 interacting protein 1 (TNIP1) 10321 NM_006061 Cysteine-rich secretory protein 3 precursor (CRISP-3) (SGP28 protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P54108] 10332 NM_214679 CD209 antigen-like protein 1 (Dendritic cell-specifc ICAM-3- grabbing nonintegrin 2) (DC-SIGN2) (DC-SIGN-related protein) (DC-SIGNR) (Liver/lymph node-specific ICAM-3-grabbing nonintegrin) (L-SIGN). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H2X31 10333 NM_006068 Toll-like receptor 6 precursor. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y2C9] 10344 NM 006072 SmaII inducible cytokine A26 precursor (CCL26) (Eotaxin-3) û (Macrophage inflammatory protein 4-alpha) (MIP-4-alpha) (Thymic stroma chemokine- 1) (TSC-1) (CC chemokine IMAC). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y258] 10379 NM_006084 Transcriptional regulator ISGF3 gamma subunit (Interferon regulatory factor 9) (IRF-9) (IFN-alpha-responsive transcription factor subunit) (Interferon-stimulated gene factor 3 gamma) (ISGF3 p48 subunit) (ISGF- 3 gamma). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO097 10394 NM_006093 proteoglycan 3;PRG3 _10410 NM_021034 Interferon-induced transmembrane protein 3 (Interferon-inducible protein 1-8U). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q016281 10417 NM_012445 Spondin-2 precursor (Mindin) (Differentially expressed in cancerous and noncancerous lung cells 1) (DIL-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BUD6] 10421 NM_006110 CD2 antigen cytoplasmic tail-binding protein 2 (CD2 cytoplasmic domain binding protein) (CD2 tait binding protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95400] 10435 NM 006779 CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 2 (CDC42EP2) 10437 NM_006332 Gamma-interferon inducible lysosomal thiol reductase precursor (Gamma-interferon-inducible protein IP-30). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P13284] _ 10451 NM_006113 vav 3 oncogene;VAV3 10462 _ C-type lectin domain family 10 member A (C-type lectin, NM_182906 superfamily member 14) (Macrophage lectin 2) (CD301 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8IUN9] 10507 Semaphorin-4D precursor (Leukocyte activation antigen NM_006378 CD100) (BB18) (A8) (GR3). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: 0928541 0 10512 NM_006379 Semaphorin-3C precursor (Semaphorin E) (Sema E). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99985] 10537 NM_006398 Gamma-aminobutyric acid type B receptor, subunit 1 precursor (GABA-B receptor 1) (GABA-B-R1) (Gbl). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UBS5] 10538 NM_006399 ATF-like basic leucine zipper transcriptional factor B-ATF (SF-HT- activated gene 2) (SFA-2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q16520] 10544 NM 006404 Endothelial protein C receptor precursor (Endothelial cell û protein C receptor) (Activated protein C receptor) (APC receptor) (CD201 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UNN8] 10563 NM 006419 Small inducible cytokine B13 precursor (CXCL13) (B û lymphocyte chemoattractant) (CXC chemokine BLC) (B cell- attracting chemokine 1) (BCA-1) (ANGIE). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:0439271 10578 NM_006433;NM_O1248 granulysin;GNLY 3 10581 NM_006435 Interferon-induced transmembrane protein 2 (Interferon-inducible protein 1-8D). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:QO16291 10584 NM_006438 collectin sub-family member 10 (C-type lectin);COLEC10 10602 NM 006449 CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (CDC42EP3) 10666 NM_006566 CD226 antigen precursor (DNAX accessory molecule 1) (DNAM-1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15762] 10673 NM_006573 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B (TNFand APOL- related leukocyte expressed ligand 1) (TALL-1) (B lymphocyte stimulator) (BLyS) (B cell-activating factor) (BAFF) (Dendritic cellderived TNF-like molecule) (CD257 antigen) [Contains: Tum 10687 NM_007257 paraneoplastic antigen MA2;PNMA2 10746 NM_006609 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2;MAP3K2 10747 NM_006610 Mannan-binding lectin serine protease 2 precursor (EC 3.4.21.104) (Mannose-binding protein associated serine protease 2) (MASP-2) (MBL- associated serine protease 2) [Contains: Mannan-binding lectin serine protease 2 A chain; Mannan-binding lectin serine 10748 NM_006611 killer cell lectin-like receptor subfamily A, member 1 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_006602] 10750 NM_006613 GRB2-related adaptor protein;GRAP 10758 NM 147200 Adapter protein CIKS (Connection to IKK and SAPK/JNK) û (TRAF3- interacting protein 2) (Nuclear factor NF-kappa-B activator 1) (ACT1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:0437341 10803 NM 031200 C-C chemokine receptor type 9 (C-C CKR-9) (CC-CKR-9) û (CCR-9) (GPR-9-6) (G-protein coupled receptor 28) (CDw199 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P516861 10849 NM_012099 CD3E antigen, epsilon polypeptide associated protein [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_036231] 1 10850 NM 006664 Smala inducible cytokine A27 precursor (CCL27) (CC chemokine ILC) (IL- 11 R-alpha-locus chemokine) (Skinkine) (ESkine) (Cuteaneous T-cell attracting chemokine) (CTACK). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y4X3] 10855 NM 006665 Heparanase precursor (EC 3.2.-.-) (Heparanase-1) (Hpal) (Endoglucoronidase) [Contains: Heparanase 8 kDa subunit; Heparanase 50 kDa subunit]. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y2511 10859 NM006669 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B (with _ TM and ITIM domains), member 1;LILRB1 10871 NM_006678 CD300C antigen;CD300C 10877 NM_006684 complement factor H-related 4;CFHL4 10878 NM_021023 complement factor H-related 3;CFHL3 10882 NM_006688 complement component 1, q subcomponent-Iike 1;C1QL1 10912 NM_006705 Growth arrest and DNA-damage-inducible protein GADD45 gamma (Cytokine- responsive protein CR6). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95257] 10964 NM 006820 histocompatibility 28 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_006811] 10982 NM_014268 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 (APC-binding protein EB2) (End-binding protein 2) (EB2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q15555] 10990 NM 006840 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B (with TM and ITIM domains), member 5;LILRB5 11006 Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 4 precursor (Leukocyte immunoglobulin-like NM_006847 receptor 5) (LIR-5) (Immunoglobulin- like transcript 3) (ILT- 3) (Monocyte inhibitory receptor HM18) (CD85k antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:QBNH]6] 11009 Interleukin-24 precursor (Suppression of tumorigenicity 16 NM 006850 protein) (Melanoma differentiation-associated gene 7 protein) (MDA-7). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q130071 11024 NM 006863 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with TM domain), member 1; ULRA1 _11025 NM 006864 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B (with TM and ITIM domains), member 3;LILRB3 11026 NM 006865 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (without TM domain), member 3;LILRA3 11027 NM_006866 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with TM domain), member 2;LILRA2 _ NEDD4-Iike E3 ubiquitin-protein ligase WWP1 (EC 6.3.2.-) 11059 (WW domain- containing protein 1) (Atropin-1 interacting protein 5) (AIP5). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9HOMO] 11126 NM 007053 CD160 antigen precursor (Natural killer cell receptor BY55). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95971] 11146 Glomulin (FKBP-associated protein) (FK506-binding protein- NM_053274 associated protein) (FAP). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q92990] 2 11251 NM_004778 Putative Gprotein coupled receptor 44 (Chemoattractant receptor- homologous molecule expressed on Th2 cells) (CD294 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y5Y4] 11311 NM 007259 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 (h-VPS45) (hlVps45). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NRW7] 11314 NM 007261 CD300A antigen;CD300A 11343 NM_007283 Monoglyceride lipase (EC 3.1.1.23) (HU-K5) (Lysophospholipase homolog) (Lysophospholipase-like). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q99685] _ 22800 NM_012250 related RAS viral (r-ras) oncogene homolog 2;RRAS2 22914 NM_007360 killer cell lectin-like receptor subfamily K, member 1;KLRK1 22918 Complement component Clq receptor precursor NM 012072 (Complement component 1, q subcomponent, receptor 1) û (ClqRp) (C1gR(p)) (Clq/MBL/SPA receptor) (CD93 antigen) (CDw93). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NPY3] 23030 NM 015015 Jumonji domain containinq 2B (JMJD2B) _ 23075 SWAP-70 protein [Source:RefSeq_peptide;Acc:NP_055870] 23139 NM 015112 Microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 2 (EC 2.7.1.37). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q6POQ8] 23166 NM015136 Stabilin-1 precursor (FEEL-1 protein) (MS-1 antigen). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NY15] 23303 Kinesin-like protein KIF13B (Kinesin-like protein GAKIN). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NQT8] 23308 NM_015259 ICOS ligand precursor (B7 homolog 2) (B7-H2) (B7-like protein GI50) (B7-related protein 1) (B7RP-1) (CD275 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75144] 23418 NM_012076;NM_20125 crumbs homolog 1 (Drosophila);CRB1 3 23430 Tryptase delta precursor (EC 3.4.21.59) (Delta tryptase) NM_012217 (Mast cell mMCP-7-like) (Tryptase-3) (HmMCP-3-like tryptase III). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BZJ3] 23433 NM_012249 ras homolog gene family, member Q;RHOQ 23467 NM_014293;NM_05817 neuronal pentraxin receptor;NPTXR 8 23495 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B NM_012452 (Transmembrane activator and CAML interactor) (CD267 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O14836] 23529 B cell-stimulating factor 3 precursor (BSF-3) (Novel NM_013246 neurotrophin-1) (NNT-1) (Cardiotrophin-like cytokine). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UBD9] 23545 Vacuolar proton translocating ATPase 116 kDa subunit a NM_012463 isoform 2 (V- ATPase 116-kDa isoform a2) (TJ6). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y487] 23547 _ NM012276 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with _ TM domain), member 4;LILRA4 23586 Î Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 (EC 3.6.1.-) NM 014314 (DEAD-box protein 58) (Retinoic acid-inducible gene 1 û protein) (RIG-1) (RIG-I). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:O957861 23601 NM_013252 C-type lectin domain family 5, member A;CLEC5A NM 015364 Lymphocyte antigen 96 precursor (MD-2 protein) (ESOP-1). 23643 _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y6Y9] 3 23677 NM_014521 SH3-domain binding protein 4;SH3BP4 23780 NM_145637 Apolipoprotein-L2 (Apolipoprotein L-II) (ApoL-II). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BQE5] 24138 NM_012420 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 (IFIT-5) (Retinoic acid- and interferon-inducible 58 kDa protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13325] 25801 NM 012198 Grancalcin. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P28676] 25824 NM_012094 Peroxiredoxin 5, mitochondrial precursor (EC 1.11.1.15) (Pr(-V) (Peroxisomal antioxidant enzyme) (PLP) (Thioredoxin reductase) (Thioredoxin peroxidase PMP20) (Antioxidant enzyme B166) (AOEB166) (TPx type VI) (Liver tissue 2D-page spot 71B) (Alu corepresso 25923 NM_015459 atlastin-3 25939 NM_015474 SAM domain and HD domain 1;SAMHD1 25945 NM_015480 poliovirus receptor-related 3;PVRL3 25992 _ XM_059482 sushi, nidoqen and EGF-like domains 1;SNED1 26133 NM_015638 Trpc4-associated protein (Short transient receptor potential channel 4 associated protein) (Trp4-associated protein) (TAPI protein) (TNF- receptor ubiquitous scaffolding/signaling protein) (TRUSS protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8TEL61 26228 NM 012108 Signal-transducing adaptor protein 1 (STAP-1) (Stem cell û adaptor protein 1) (BCR downstream signaling protein 1) (Docking protein BRDG1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9ULZ21 26253 NM_014358 C-type lectin domain family 4 member E (C-type lectin superfamily member 9) (Macrophage-inducible C-type lectin). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9ULY5] 26279 Group IID secretory phospholipase A2 precursor (EC 3.1.1.4) (Phosphatidylcholine 2-acylhydrolase GIID) (GIID NM_012400 sPLA2) (PLA2IID) (sPLA(2)-IID) (Secretory-type PLA, stroma-associated homolog). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UNK41 26525 NM_173170 Interleukin-1 family member 5 (IL-1F5) (Interleukin-1 delta) (IL-1 delta) (FIL1 delta) (Interleukin-l-like protein 1) (IL- IL1) (Interleukin-1 HY1) (IL-1HY1) (Interleukin-1 receptor antagonist homolog 1) (IL-1ra homolog 1) (IL-1-related protein 3) (IL-1RP3 26749 NM_012196 GAGE-1 protein (G antigen 1) (MZ2-F antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q13065] 26762 NM_012206 hepatitis A virus cellular receptor 1;HAVCRI 27033 NM014383 testis zinc finger protein _ [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_055198] 27036 N M_016543; N M_01438 sialic acid bindinq Ig-like lectin 7;SIGLEC7 27040 Linker for activation of T-cells family member 1 (36 kDa phospho- tyrosine adapter protein) (pp36) (p36-38). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O43561] 27159 Acidic mammalian chitinase precursor (EC 3.2.1.14) (AMCase) (TSA1902). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BZP61 4 27166 NM_013237 Px19-like protein (25 kDa protein of relevant evolutionary and lymphoid interest) (PRELI). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y255] 27177 NM_014438 Interleukin-1 family member 8 (IL-1F8) (Interleukin-1 eta) (IL-1 eta) (FIL1 eta) (Interleukin-1 homolog 2) (IL-1H2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NZH7] 27178 NM_014439 Interleukin-1 family member 7 precursor (IL-1F7) (Interleukin-1 zeta) (IL-1 zeta) (FIL1 zeta) (Interleukin-1 homolog 4) (IL-1H4) (Interleukin-l-related protein) (IL-1RP1) (IL-iX protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NZH6] 27179 NM_014440 Interleukin-1 family member 6 (IL-1F6) (Interleukin-1 epsilon) (IL-1 epsilon) (FIL1 epsilon). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UHA71 27180 NM_014441 sialic acid binding Ig-like lectin 9;SIGLEC9 27181 NM_014442 sialic acid binding Ig-like lectin 8;SIGLEC8 27189 NM013278 Interleukin-17C precursor (IL-17C) (Cytokine CX2). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9POM4] 27190 Interleukin-17B precursor (IL-17B) (Cytokine-like protein NM_014443 Zcyto7) (Neuronal interleukin-17-related factor) (Interleukin- 20) (IL-20). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UHF5] 27240 Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1 NM 014450 precursor (Suppression-inducing transmembrane adapter 1) (SHP2interacting transmembrane adapter protein) (gp30/40). [Source: UniprotJSWISSPROT;Acc:Q9Y3P8] 28303 XM_496157 immunoglobulin heavy variable 3/OR16-13;IGHV3OR16-13 28514 NM_005618 delta-like 1 (Drosophila);DLL1 28566 BCO36926 T cell rece.tor beta variable 21-1 28619 BC070387 T cell rece.tor beta variable 3-1 28663 BCO25727 T cell receptor alpha variable 20 28988 Drebrin-like protein (SH3 domain-containing protein 7) NM 014063 (Drebrin F) (Cervical SH3P7) (HPK1-interacting protein of 55 kDa) (HIP-55) (Cervical mucin-associated protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UJU6] 29108 Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD (hASC) (PYD and CARD domain containing protein) (Target NM_013258 of methylation-induced silencing 1) (Caspase recruitment domain protein 5). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9ULZ31 29121 N M_013269; N M_00100 4419;NM_001004420 C-type lectin domain family 2, member D;CLEC2D 29126 Programmed cell death 1 ligand 1 precursor (Programmed NM 014143 death ligand 1) (PD-L1) (PDCD1 ligand 1) (CD274 antigen) û (B7-homolog 1) (B7-H1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NZQ7] 29760 NM_013314 B-cell linker;BLNK 29802 NM_013378 pre-B lymphocyte Bene 3;VPREB3 29851 Inducible T-cell co-stimulator precursor (Activation-inducible NM_012092 lymphocyte immunomediatory molecule) (CD278 antigen). [Source: Uniprot:/SWISSPROT;Acc:Q9Y6W8] 29949 Interleukin-19 precursor (IL-19) (Melanoma differentiation NM_153758 associated protein-like protein) (NG.1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UHDO] NM_013440;NM_17823 29990 8; NM_175047 paired immunoglobin-like type 2 receptor beta;PILRB 29992 NM_178273; N M_17827 paired immunoglobin-like type 2 receptor alpha;PILRA 2;NM_013439 30009 NM 013351 T-box transcription factor TBX21 (T-box protein 21) (Transcription factor TBLYM) (T-cell-specific T-box transcription factor T-bet). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UL17] 30814 _ NM_014589 Group IIE secretory phospholipase A2 precursor (EC 3.1.1.4) (Phosphatidylcholine 2-acylhydrolase GIIE) (GIIE sPLA2) (sPLA(2)-IIE). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NZK7] 30835 CD209 antigen (Dendritic cell-specifc ICAM-3-grabbing NM_021155 nonintegrin 1) (DC-SIGN1) (DC-SIGN). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NNX61 50604 NM 018724 Interleukin-20 precursor (IL-20) (Four alpha helix cytokine Zcytol0). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NYY1] 50615 NM 181078 Interleukin-21 receptor precursor (IL-21R) (Novel interleukin receptor). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9HBE5] 50616 Interleukin-22 precursor (IL-22) (IL-10-related T-cell-derived NM_020525 inducible factor) (IL-TIF). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9GZX6] 50848 Junctional adhesion molecule A precursor (JAM-A) NM 016946 (Junctional adhesion molecule 1) (JAM) (Platelet adhesion molecule 1) (PAM-1) (Platelet Fil receptor) (CD321 antigen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y624] 50852 T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1 (T-cell NM_016388 receptor-interacting molecule) (TRIM) (pp29/30). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q6PIZ9] 50856 C-type lectin domain family 4 member A (C-type lectin NM 016184 superfamily member 6) (Dendritic cell immunoreceptor) (Lectin-like immunoreceptor) (C-type lectin DDB27) (HDCGC13P). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UMR7] 50943 NM014009 Forkhead box protein P3 (Scurfin). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BZS1] 51062 Atlastin (GTP-binding protein 3) (Guanine nucleotide-binding NM_015915 protein 3) (Brain-specific GTP-binding protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8WXF7] 51110 _ NM_016027 lactamase, beta 2;LACTB2 51192 NM016951 Chemokine-like factor (C32). _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UBR5] 51206 NM_016363 glycoprotein VI (platelet);GP6 51266 NM_016509 C-type lectin domain family 1, member B;CLEC1B 51284 NM016562 Toll-like receptor 7 precursor. _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NYK1] 51297 NM_130852;NM_01658 palate, lung and nasal epithelium carcinoma 3 associated;PLUNC 51311 NM_138636 Toll-like receptor 8 precursor. _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NR97] 51348 NM_016523 killer cell lectin-like receptor subfamily F, member 1;KLRF1 51435 NM_016240;NM_18282 6 scavenger receptor class A,_member 3;SCARA3 6 51473 NM 016356 Doublecortin domain-containing protein 2 (RU2S protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9UHGO] 51554 NM_178445 C-C chemokine receptor type 11 (C-C CKR-11) (CC-CKR-11) (CCR-11) (Chemokine receptor-like 1) (CCRL1) (CO( CKR). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NPB9] 51561 NM 016584 interleukin 23, alpha subunit p19 precursor [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_0576681 51564 NM 015401 Histone deacetylase 7a (HD7a). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8WUI4] 51665 NM 016114 Ankyrin repeat and SOCS box protein 1 (ASB-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y5761 51744 NM_016382 CD244 natural killer ceil receptor 2B4;CD244 51752 NM_016442 Adipocyte-derived leucine aminopeptidase precursor (EC 3.4.11.-) (A- LAP) (ARTS-1) (Aminopeptidase PILS) (Puromycin-insensitive leucyl- specific aminopeptidase) (PILS-AP) (Type 1 tumor necrosis factor receptor shedding aminopeptidase regulator). [Source:U 53335 B-cell Iymphoma/leukemia 11A (B-cell CLL/Iymphoma 11A) (COUP-TF interacting protein 1) (Ecotropic viral integration site 9 protein) (EVI-9). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H1651 53342 NM138284 Interleukin-17D precursor (IL-17D) (Interleukin-27) (IL-27). _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8TAD21 53347 NM 018961 UBASH3A protein. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P570751 54106 NM 017442 Toll-like receptor 9 precursor (CD289 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NR961 54209 Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 precursor NM_018965 (Triggering receptor expressed on monocytes 2) (TREM-2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NZC21 54210 Triggering receptor expressed on myeloid cells 1 precursor NM_018643 (TREM-1) (Triggering receptor expressed on monocytes 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NP991 54472 NM 019009 Toll-interacting protein. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9HOE2] 54878 Dipeptidyl peptidase 8 (EC 3.4.14.5) (Dipeptidyl peptidase VIII) (DP8) (Prolyl dipeptidase DPP8) (Dipeptidyl peptidase IV-related protein 1) (DPRP-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q6V1X1] 54900 Lymphocyte transmembrane adapter 1 (Membrane- NM_017773 associated adapter protein LAX) (Linker for activation of X cells). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8IWV1] 54941 RING finger protein 125 (EC 6.3.2.-) (T-cell RING activation NM_017831 protein 1) (TRAC-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96EQ8] 55075 "m 0180 3 uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats isoform 1 [Source:RefSeq_peptide;Acc:NP_060473] 55080 NM_018009 TAP binding protein-like;TAPBPL 55611 Ubiquitin thiolesterase protein OTUB1 (EC 3.4.-.-) (Otubain 1) (OTU domain-containing ubiquitin aldehyde-binding NM_017670 protein 1) (Ubiquitin- specific processing protease OTUB1) (Deubiquitinating enzyme OTUB1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96FW1] 7 55787 NM_018360 chromosome X open reading frame 15;CXorf15 55801 NM 018402 Interleukin-26 precursor (AK155 protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NPH9] 55824 NM 018440 Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1 (Transmembrane adapter protein PAG) (Csk-binding protein) (Transmembrane phosphoprotein Cbp). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NWQ8] 55894 NM_018661 defensin, beta 103A;DEFB103A _ 56253 NM 019604 class-I MHC-restricted T cell associated molecule;CRTAM 56269 NM 019612 immunity-related GTPase family, cinema 1 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_0625581 56300 NM 019618 Interleukin-1 family member 9 (IL-1F9) (Interleukin-1 û homolog 1) (IL- 1H1) (Interleukin-1 epsilon) (IL-1 epsilon) (IL-1-related protein 2) (IL-1RP2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NZH8] 56413 NM_019839 Leukotriene B4 receptor 2 (LTB4-R2) (Seven transmembrane receptor BLTR2) (Leukotriene B4 receptor BLT2) (LTB4 receptor JULF2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NPC1] 56477 NM_148672 Small inducible cytokine A28 precursor (CCL28) (Mucosae- associated epithelial chemokine) (MEC) (CCK1 protein). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NRJ3] 56832 NMO20124 Interferon kappa precursor (IFN-kappa). _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9POW01 56833 _ NM_020125 SLAM family member 8;SLAMF8 56924 NM_020168 p21(CDKN1A)-activated kinase 6;PAK6 57105 Cysteinyl leukotriene receptor 2 (CysLTR2) (HG57) NM_020377 (HPN321) (hGPCR21). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NS75] 57115 NM_020393 peptidoglycan recognition protein 4;PGLYRP4 57144 NM_020341; NM_17799 0 p21(CDKN1A)-activated kinase 7;PAK7 57151_ NM_020426 lysozyme-Iike 6; LYZL6 57292 NM 020535 killer cell immunoglobulin-like receptor, two domains, long _ cytoplasmic tail, 5A;KIR2DL5A _ 57379 Activation-induced cytidine deaminase (EC 3.5.4.5) (Cytidine NM_020661 aminohydrolase). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9GZX7] 57381 NM_020663 ras homolog gene family, member J;RHOJ 57506 NM_020746 Mitochondrial antiviral signaling protein (Interferon-beta promoter stimulator protein 1) (IPS-1) (Virus-induced signaling adapter) (CARD adapter inducing interferon-beta) (Cardif) (Putative NF-kappa-B- activating protein 031N). [Source: Uniprot/SWISSPROT; 57580 NM_020820 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein (P-Rexl protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8TCU61 57817 NM 021175 Hepcidin precursor (Liver-expressed antimicrobial peptide) (LEAP-1) (Putative liver tumor regressor) (PLTR) [Contains: Hepcidin 25 (Hepc25); Hepcidin 20 (Hepc20)]. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P811721 57823 NM 021181 SLAM family member 7;SLAMF7 8 58191 NM 022059 Small inducible cytokine B16 precursor (Transmembrane chemokine CXCL16) (SR-PSOX) (Scavenger receptor for phosphatidylserine and oxidized low density lipoprotein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H2A7] 59067 NMO21803 Interleukin-21 precursor (IL-21) (Zall). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9HBE4] 59082 NM 021571 Caspase-1 inhibitor Iceberg. [Source: Un ip rot/ SWISSPROT;Acc: P577301 59307 NM 021805 Single Ig IL-1-related receptor (Single Ig IL-1R-related molecule) (Single immunoglobulin domain-containing IL1R-related protein) (Toll/interleukin-1 receptor 8) (TIRE). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q6IA17] 59340 NM_021624 Histamine H4 receptor (HH4R) (GPRv53) (G-protein coupled receptor 105) (GPCR105) (SP9144) (AXOR35). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H3N8] 60489 DNA dC->dU editing enzyme APOBEC-3G (EC 3.5.4.-) (APOBEC-related cytidine deaminase) (ARCD) (APOBEC-related protein) (ARP-9) (CEM15) (CEM-15). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9HC16] 64112 NM_022151 modulator of apoptosis 1;MOAP1 _64135 NM_022168 Interferon induced with helicase C domain protein 1 (EC 3.6.1.-) (Helicase with 2 CARD domains) (Helicard) (Melanoma differentiation- associated protein 5) (MDA-5) (RNA helicase-DEAD box protein 116) (Murabutide-down- regulated protein). [Source:Uniprot/SW 64167 NMO22350 leukocyte-derived arginine aminopeptidase _ [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_071745] 64221 NM 022370 roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila);ROBO3 64225 NMO22374 ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 2 _ [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_0717691 64332 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in NM_001005474 B-cells inhibitor, zeta isoform a [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_1136071 64342 NMO22460 HS1-binding protein 3 _ [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_071905] 64386 Matrix metalloproteinase-25 precursor (EC 3.4.24.-) (MMP- NM 022468 25) (Membrane-type matrix metalloproteinase 6) (MT-MMP 6) (Membrane-type-6 matrix metalloproteinase) (MT6-MMP) (Leukolysin). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9NPA21 64421 Artemis protein (EC 3.1.-.-) (DNA cross-link repair 1C NM_001033858 protein) (SNM1- like protein) (A-SCID protein) (hSNM1C). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96SD1] 64499 NM003294 Tryptase beta-1 precursor (EC 3.4.21.59) (Tryptase-1) _ (Tryptase I). [Source: Uniprot/ SWISSPROT;Acc:Q156611 64581 NM_197947;NM_02257 0;NM_197948;NM_1979 52; NM_197950; NM_197 949; NM_197954; N M_19 7953;NM_197951 C-type lectin domain family 7, member A;CLEC7A 64806 NM172314 Interleukin-17E precursor (IL-17E) (Interleukin-25) (IL-25). _ [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H293] 65125 NM_018979 WNK lysine deficient protein kinase 1;WNK1 9 65266 NM_032387 WNK lysine deficient protein kinase 4;WNK4 65267 NM_001002838; NM_02 WNK lysine deficient protein kinase 3;WNK3 0922 78989 NM_024027;NM_19923 collectin sub-family member 11;COLEC11 79168 NM 024318 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with TM domain), member 6;LILRA6 79368 N M_030764; N M_13873 Fc receptor-like 2;FCRL2 8 79400 NM_024505 NADPH oxidase, EF hand calcium-binding domain 5 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_0787811 79465 NM_024518 UL16 binding protein 3;ULBP3 79589 NM_194463 ring finger protein 128 isoform 1 [Source: RefSeq_peptide;Acc: N P_919445] 79679 NM 024626 V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 _ [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_078902] 79930 60004867 Docking protein 3 80122 NM_025052;NM_00101 Yeast Sps1/Ste20-related kinase 4 (S. cerevisiae);YSK4 8046 80274 NM_173050 signal peptide-CUB domian-EGF-related 1 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_766638] 80328 NM_025217 UL16 binding protein 2;ULBP2 80329 NM_025218 UL16 binding protein 1;ULBP1 80332 ADAM 33 precursor (EC 3.4.24.-) (A disintegrin and NM_025220 metalloproteinase domain 33). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BZ11] 80341 NM_025227 bactericidal/permeability-increasing protein-like 1;BPIL1 80380 Programmed cell death 1 ligand 2 precursor (Programmed NM_025239 death ligand 2) (PD-L2) (PD-1-ligand 2) (PDCD1 ligand 2) (Butyrophilin B7-DC) (B7-DC) (CD273 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BQ51] 80381 NM_025240 CD276 antigen isoform a [Source: RefSeq_peptide; Acc: N P_001019907] 80833 Apolipoprotein-L3 (Apolipoprotein L-III) (ApoL-III) (TNF- NM_145640 inducible protein CG12-1) (CG12_1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O95236] 80741 001002849 Lymphocyte antigen 6 complex, locus G5C (LY6G5C) _NM 81035 NM_030781;NM_13038 6 collectin sub-family member 12;COLEC12 81494 NM_030787 complement factor H-related 5;CFHL5 81542 Thioredoxin domain-containing protein 1 precursor NM 030755 (Transmembrane Trxrelated protein) (Thioredoxin-related transmembrane protein). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H3N1] _ NM_030916 poliovirus receptor-related 4;PVRL4 81607 81793 NM_030956 Toll-like receptor 10 precursor. [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9BXR5] _ NM_031281 Fc receptor-like 5;FCRL5 83416 83417 NM_031282 Fc receptor-like 4;FCRL4 83903 NM_031965 germ cell associated 2 (haspin);GSG2 83953 NM_032029 Fc receptor, IgA, IgM, high affinity;FCAMR 0 84174 Src-Iike-adapter 2 (Src-Iike adapter protein 2) (SLAP-2) (Modulator of antigen receptor signaling) (MARS). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H6Q3] 84569 NM_032517 lysozyme-like 1;LYZL1 84639 NM 032556 Interleukin-1 family member 10 (IL-1F10) (Interleukin-1 receptor antagonist-Iike FIL1 theta) (Interleukin-1 theta) (IL- 1 theta) (FIL1 theta) (Interleukin-1 HY2) (IL-1HY2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8WWZ1] 84659 NM_032572 Ribonuclease 7 precursor (EC 3.1.27.-) (RNase 7) (Skin- derived antimicrobial protein 2) (SAP-2). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H 1E1] 84663 NM_032576 chromosome Y open reading frame 15B;CYorf15B 84824 NM 032738 84868 NM_032782 hepatitis A virus cellular receptor 2;HAVCR2 84941 NM 032855 hematopoietic SH2 domain containing [Source: RefSeq_peptide; Acc: NP_1162441 84968 NM_032882 paraneoplastic antigen like 6A;PNMA6A 89790 NM_033130 sialic acid binding Ig-Iike lectin 10;SIGLEC10 89858 NM_033329;NM_05300 3 sialic acid binding Ig-Iike lectin 12;SIGLEC12 89886 _ NM_033438 SLAM family member 9;SLAMF9 90925_ NM_175870 hypothetical protein LOC90925;LOC90925 91353 NM_001013618 similar to omega protein;CTA-246H3.1 91662 NACHT-, LRR- and PYD-containing protein 12 (PYRIN- NM_144687 containing APAF1- like protein 7) (Monarch-1) (Regulated by nitric oxide). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P59046] 91937 NM 138379 T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4;TIMD4 92747 NM_033197 chromosome 20 open reading frame 114;C20orf114 112744 NM_052872 Interleukin-17F precursor (IL-17F) (Interleukin-24) (IL-24) (Cytokine ML-1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96PD4] 114132 NM_052884 sialic acid binding Ig-Iike lectin 11;SIGLEC11 114548 Cold autoinflammatory syndrome 1 protein (Cryopyrin) (NACHT-, LRR- and PYD-containing protein 3) (PYRIN-NM_004895 containing APAF1-like protein 1) (Angiotensin/vasopressin receptor AII/AVP-Iike). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96P20] 114609 Toll-interleukin 1 receptor domain-containing adapter NM 052887 protein (TIR domain-containing adapter protein) (MyD88 û adapter-like protein) (Adaptor protein Wyatt). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P58753] 114771 NM_052891 peptidoqlycan recognition protein 3;PGLYRP3 114824 NM_052926 paraneoplastic antigen like 5;PNMA5 114836 NM_052931 SLAM family member 6;SLAMF6 114897 NM_198593;NM_19859 4;NM_030968 Clq and tumor necrosis factor related protein 1;CIQTNF1 114898 NM_031908 Clq and tumor necrosis factor related protein 2;C1QTNF2 114899 NM_181435;NM_03094 Clq and tumor necrosis factor related protein 3;C1QTNF3 114900 NM_031909 Clq and tumor necrosis factor related protein 4;C1QTNF4 114902 NM_015645 Clq and tumor necrosis factor related protein 5;C1QTNF5 114904 NM_182486;NM_03191' Clq and tumor necrosis factor related protein 6;C1QTNF6 1 0 114905 NM_031911 Clq and tumor necrosis factor related protein 7;C1QTNF7 115350 NM_052938 Fc receptor-like 1;FCRL1 115352 NM_052939;NM_00102 Fc receptor-like 3;FCRL3 4667 115361 NM052941 Guanylate binding protein 4. _ [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96PP9] 115362 NM_052942 Interferon-induced guanylate-binding protein 5 (GTP-binding protein 5) (Guanine nucleotide-binding protein 5) (GBP-TA antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96PP8] 115650 NM 052945 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C (B cell- activating factor receptor) (BAFF receptor) (BAFF-R) (BLyS receptor 3) (CD268 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96R331 115653 NM_153443 killer tell immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tait, 3;KIR3DL3 116379 NM_052962;NM_18130 9;NM_181310 interleukin 22 receptor, alpha 2;IL22RA2 116449 NM 052964 mast cell immunoreceptor signal transducer [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_4431961 117285 Beta-defensin 118 precursor (Defensin, beta 118) (Beta- NM_054112 defensin 18) (DEFB-18) (Epididymal secretory protein 13.6) (ESP13.6). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q96PH6] 119180 NM_183058 lysozyme-like 2;LYZL2 124599 NM_174892 CD300 antiqen like family member B;CD300LB 124912 NM_173847 sperm acrosome associated 3;SPACA3 126014 NM_133168; N M_20681 8;NM_133169;NM_2068 17;NM_130771 osteoclast-associated receptor;OSCAR 127150 XM_497717 similar to mucosal pentraxin;LOC127150 127943 NM_001002901 Fc receptor-like and mucin-like 2;FCRLM2 128859 NM_174897 bactericidal/permeability-increasing protein-like 3;BPIL3 130120 Regenerating islet-derived protein 3 gamma precursor (Reg NM_198448 III-gamma) (Pancreatitis-associated protein 1B) (PAP IB). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q6UW15] 131375 NM_144634 lysozyme-like 4;LYZL4 133396 NM 139017 gpl30-Iike monocyte receptor [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_6205861 135250 NM_139165 retinoic acid early transcript 1E;RAETIE 140850 NM_139074 i Beta-defensin 127 precursor (Defensin, beta 127) (Beta- defensin 27) (DEFB-27). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9H1M41 146722 NM_139018 CD300 antiqen like family member F;CD300LF 146894 NM_145273 CD300 antigen like family member G;CD300LG 149954 NM_182519 chromosome 20 open reading frame 186;C20orf186 150372 NM 145912 NFAT activation molecule 1 precursor (Calcineurin/NFAT- ù activating ITAM-containing protein) (NFAT-activating protein with ITAM motif 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8NET5] 151888 B and T lymphocyte attenuator precursor (B and T NM_181780 lymphocyte-associated protein) (CD272 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q7Z6A9] 2 152028 NM_144717 fibronectin type III domain containing 6;FNDC6 154064 NM_130900 retinoic acid early transcript 1L;RAETIL 163351 NM_198460 guanylate binding protein family, member 6 [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_940862] 163702 NM_173065;NM_17306 interleukin 28 receptor, alpha (interferon, lambda 4;NM_170743 receptor);IL28RA 165257 NM_182528 complement component 1, q subcomponent-like 2;C1QL2 167838 NM_153235 taxilin beta;TXLNB 170482 NM 130441 C-type lectin domain family 4 member C (C-type lectin superfamily member 7) (Blood dendritic cell antigen 2 protein) (BDCA-2) (Dendritic lectin) (CD303 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8WTTO] 200081 NM_175852 taxilin alpha;TXLNA 201633 NM_173799 hypothetical protein FU39873;FU39873 246126 NM_001005852 chromosome Y open reading frame 15A;CYorf15A 246778 NM_145659 interleukin 27 [Source: RefSeq_peptide;Acc:NP_663634] 254240 NM_174932 bactericidal/permeability-increasing protein-like 2;BPIL2 260434 NM152901 pyrin domain containing 1 _ [Source:RefSeq_peptide;Acc:NP_6908651 284021 XM_211305 chromosome 17 open reading frame 60;Cl7orf6O 284367 XM_290822 sialic acid bindinq Ig-like lectin, pseudoqene 3;SIGLECP3 284415 NM_198481 LAIR hloq;UNQ3033 284988 XM_209429 similar to ARHQ protein;LOC284988 285830 NM_001003807 hypothetical protein FU35429;RP3-377H14.5 286204 NM_173689 crumbs homolog 2 (Drosophila);CRB2 286310 NM_002297 Lipocalin-1 precursor (Von Ebner gland protein) (VEG protein) (Tear prealbumin) (TP) (Tear lipocalin) (Tic). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc: P310251 338339 NM_080387 C-type lectin domain family 4 member D (C-type lectin superfamily member 8) (C-type lectin-like receptor 6) (CLEC- 6). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q8WXI81 338761 NM_001008223 complement component 1, q subcomponent-like 4;C1QL4 338902 XM_497405 similar to Immunoglobulin-binding protein 1 (CD79a-binding protein 1) (B cell signal transduction molecule alpha 4) (Alpha 4 protein);LOC338902 339377 XM_290866 similar to 4930572L20Rik protein;L0C339377 339390 NM_198492 C-type lectin superfamily 4, member G;CLEC4G 339562 XM_291643 similar to Ig kappa chain;LOC339562 342510 NM_181449 CD300 antigen like family member E;CD300LE 343413 NM_001004310 Fc receptor-like 6;FCRL6 346689 NM_198508 FU44186 protein;FU44186 353091 NM_001001788 retinoic acid early transcript 1G;RAET1G 353219 NM_181337 kidney associated antiqen 1 353376 NM_021649 Transmembrane emp24 domain containing protein 7 precursor. [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q9Y3B3] 353514 NM_021250;NM_18187 leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with 9;NM_181985;NM_1819 TM domain), member 5;LILRA5 86 359710 NM_182658 chromosome 20 open reading frame 185;C20orf185 378829 AF304442 B lymphocyte activation-related protein BC-1514 387836_ NM_207375 C-type lectin domain family 2, member A;CLEC2A 3 388077 XM_370834 immunoglobulin heavy variable 1/OR15-1;IGHV1OR15-1 388078 XM_370835 V-set and immunoglobulin domain containing 6;VSIG6 388372 NM 001001435 chemokine (C-C motif) ligand 4like 2 precursor [Source: RefSeq_peptide;Acc: NP_996890] 388503 NM_001013640 similar to Complement C3 precursor;LOC388503 388646 NM_207398 Interferon-induced guanylate-binding protein 2 (GTP-binding protein 2) (Guanine nucleotide-binding protein 2) (HuGBP- 2). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P32456] 388677 NM_203458 Notch homolog 2 (Drosophila) N-terminal like;NOTCH2NL 389405 XM_371829 similar to Neurogenic locus Notch protein precursor;RPl- 303F19.1 389852 NM_205856 PNPK6288;RP11-38023.2 389941 NM_001010908 complement component 1, q subcomponent-like 3;C1QL3 389950 XM372307 similar to immunoglobulin lambda-1 variable _ re •ion • LOC389950 390530 XM_372543 similar to immunoglobulin heavy-chain-2 light-chain-2 VH sel ment•LOC390530 390531 XM_496025 V-set and immunoglobulin domain containing 7;VSIG7 390667 NM 001013658 similar to Neuronal pentraxin II precursor (NP-II) (NP2);L0C390667 390712 XM_372630 similar to immunoglobulin M chain;LOC390712 390714 XM372632 similar to Ig heavy chain V-III region VH26 _ . recursor•LOC390714 391105 XM_497715 similar to dJ801G22.2 (novel protein similar to immunoglobulin gamma FC receptor 1 (FGCR1));LOC391105 391142 XM_496426 hypothetical gene supported by AJ249778; NM_001531;LOC391142 391405 XM_372941 similar to Iq kappa chain V region (Z4) - human;LOC391405 391427 XM372952 similar to Ig kappa chain precursor V region (orphon V108) - _ human (fragment);LOC391427 392217 XM373249 similar to Ig lambda light chain leader and V- _ reg ion • LOC392217 392965 XM_374637 similar to alpha-2-glycoprotein 1, zinc; Alpha-2-glycoprotein, zinc; LOC392965 400581 XM_375418 GRB2-related adaptor protein-like;LOC400581 400668 NM 214710 protease, serine-like 1;PRSSL1 400709 XM_375634 sialic acid binding Ig-like lectin, pseudogene 16;SIGLECP16 400759 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 (GTP-binding NM_002053 protein 1) (Guanine nucleotide-binding protein 1) (HuGBP- 1). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:P32455] 400760 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 (GTP-binding NM_002053 protein 1) (Guanine nucleotide-binding protein 1) (HuGBP- 1). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P324551 400792 XM_375816 similar to Slamf7 protein;LOC400792 400943 NM 207480 AILT5830 401262 NM 206922 cysteinerich protein 3 [Source: RefSeq_peptide;Acc:NP_996805] 401393 XM376658 similar to Zinc-alpha-2-glycoprotein precursor (Zn-alpha-2- _ glycoprotein) (Zn-alpha-2-GP);LOC401393 401845 XM_377426 similar to IGHV Bene product;LOC401845 401887 XM497555 similar to calmodulin - rabbit (tentative sequence);LOC401887 4 402571 XM379897 similar to Zinc-alpha-2-glycoprotein precursor (Zn-alpha-2- _ glycoprotein) (Zn-alpha-2-GP);LOC402571 404552 NM_206998 Secretoglobin family 1D member 4 precursor (IFN-gamma- inducible secretoglobin) (IIS). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:Q6XE381 407977 NM_172089 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13 precursor (A proliferation-inducing ligand) (APRIL) (TNF-and APOL-related leukocyte expressed ligand 2) (TALL-2) (TNF- related death ligand-1) (TRDL-1) (CD256 antigen). [Source: Uniprot/SWISSPROT;Acc:O75888 432395 _ NM_001002029 complement component 4B, telomeric;XXbac-BPG116M5.7 439957 XM_495805 similar to Ig kappa chain V region (Z4) - human;LOC439957 440361 XM_496145 similar to immunoglobulin M chain;LOC440361 440370 XM_496158 similar to immunoglobulin M chain;LOC440370 440508 XM496285 similar to liver and Iymph node sinusoidal endothelial cell C- _ type lectin; DTTR431;LOC440508 440607 NM_001017986; NM_00 1004340 Fc-gamma receptor I B2;LOC440607 440786 XM_496488 similar to Ig kappa chain;LOC440786 440871 XM_496558 similar to Iq kappa variable region;LOC440871 440891 XM_496578 similar to Ig kappa light chain variable region;LOC440891 441140 NM_001004349 F1145422 protein;F1145422 441800 similar to RIKEN cDNA B230315M08; polymeric XM_497557 immunoglobulin receptor 4; mast cell-derived paired immunoglobulin-like receptor 1;LOC441800 441864 XM_497642 similar to RIKEN cDNA 9930022NO3 gene;LOC441864 441868 XM_497647 similar to cSH-PTP2;LOC441868 441971 XM497790 similar to phosphoinositide 3-hydroxykinase p110-alpha _ subunit; LOC441971 442031 XM_497854 similar to immunoglobulin kappa chain; LOC442031 442032 XM_497855 similar to Iq kappa chain V region (A2) human; LOC442032 442033 XM_497856 similar to Ig kappa chain V region (A2) - human; LOC442033 442034 XM_497857 similar to immunoglobulin kappa chain;LOC442034 442043 XM_497871 similar to ARHQ protein;LOC442043 442084 XM_497926 similar to roundabout homolog 2;LOC442084 442203 XM_498087 similar to MHC HLA-SX-alpha;LOC442203 442219 XM498102 similar to Transforming protein p2lb (K-Ras 2B) (Ki-Ras) (c- _ K-ras);LOC442219 442606 XM499352 similar to alpha-2-glycoprotein 1, zinc; Alpha-2-glycoprotein, _ zinc; LOC442606 553128 NM 001018081 killer cell immunoglobulin-like receptor, two domains, long cytoplasmic tait, 5B;KIR2DL5B AB209870 HLA class I histocompatibility antigen, E alpha chain precursor L29376 Homo sapiens (clone 3.8-1) MHC class 1 REVENDICATIONS 1. Méthode pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la détection, dans un échantillon du mammifère : a) des acides nucléiques comprenant les séquences représentées dans le Tableau 4, colonne 1 ou un fragment distinctif de celles-ci ayant au moins 15, de préférence au moins 16, 17, 18, 19, 20, 25 ou 30 bases consécutives, et/ou b) des acides nucléiques ayant une séquence complémentaire de séquences selon a), et/ou c) des analogues fonctionnels des acides nucléiques selon a) ou b) provenant d'une autre espèce, et/ou d) des polypeptides codés par les acides nucléiques selon a) à c), la présence, l'absence ou la quantité (relative) de ces molécules cibles dans l'échantillon étant une indication de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. 2. Méthode selon la revendication 1, comprenant la détection de la présence ou de l'absence d'un acide nucléique selon a) à c) par hybridation sélective ou amplification sélective. 3. Méthode selon la revendication 1 ou 2 pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la mise en contact, dans des conditions permettant une hybridation entre séquences complémentaires, des acides nucléiques issus d'un échantillon de sang du mammifère et d'un ensemble de sondes spécifique des molécules d'acide nucléique selon l'un quelconque de a) à c) pour obtenir un profil d'hybridation, le profil d'hybridation étant caractéristique de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. 4. Méthode selon la revendication 3, caractérisée en ce que les sondes sont immobilisées sur un support.6 5. Méthode selon la revendication 1 pour détecter la présence ou le risque de développer un cancer chez un mammifère, comprenant la mise en contact, dans des conditions permettant une réaction d'amplification, des acides nucléiques issus d'un échantillon de sang du mammifère et d'un ensemble d'amorces spécifique des molécules d'acide nucléique selon l'un quelconque de a) à c) pour obtenir un profil d'amplification, le profil d'amplification étant caractéristique de la présence ou du risque de développer un cancer chez ce mammifère. 6. Méthode selon la revendication 1, comprenant la détection de la présence ou de l'absence d'un polypeptide selon d) au moyen d'un anticorps spécifique ou d'un fragment ou dérivé de celui-ci. 7. Méthode selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisée en ce que l'échantillon est un échantillon issu de sang, de préférence un échantillon de sang total. 8. Utilisation d'un ensemble de sondes nucléiques spécifique des acide nucléique cible tels que définis dans la revendication 1, lesdites sondes comprenant de 15 à 400 bases, pour la détection in vitro d'un cancer chez un sujet humain. 9. Utilisation d'un ensemble d'amorces nucléiques permettant l'amplification de tout ou partie des acides nucléiques cibles tels que défini dans la revendication 1, lesdites amorces étant simple-brin, d'une longueur comprise entre 5 et 50 bases, pour la détection in vitro d'un cancer chez un sujet humain. 10. Produit comprenant un support sur lequel sont immobilisées au moins un ensemble de sondes d'acides nucléiques distinctes comprenant une séquence complémentaire et/ou spécifique des acides nucléiques tels que défini dans la revendication 1. 11. Utilisation d'un produit selon la revendication 10 pour la détection in vitro ou ex vivo de la présence ou du risque de développer un cancer chez un mammifère.7 12. Utilisation selon la revendication 11 pour la détection in vitro ou ex vivo de la présence ou du risque de développer un cancer du sein chez un mammifère.