Brevet FR2819915A1 — publié le 20020726

Procédé pour traiter des données d'analyse biologique et système expert d'analyse biologique mettant en oeuvre ce procédé La présente invention concerne un procédé pour traiter des données d'analyse biologique. Elle vise également un système expert d'analyse biologique. Dans le domaine de l'analyse biologique, il existe déjà des méthodes de détermination du profil biologique d'une personne à partir d'un ensemble de mesures de paramètres physiologiques caractéristiques. A partir de ces profils biologiques et de données relatives à la personne concernée telles que son age, son sexe, sa condition physique, le praticien peut alors émettre un ensemble de conclusions conduisant à un diagnostic. Un profil biologique est en pratique constitué d'un ensemble de profils spécifiques, tel qu'un profil protéique ou un typage lymphocytaire. L'augmentation du nombre de paramètres entrant dans la détermination d'un profil biologique rend de plus en plus difficile l'établissement de conclusions cohérentes. Pour répondre à l'attente des praticiens prescripteurs d'analyse biologiques, des systèmes expert d'analyse biologique ont été développés. Ces systèmes experts procurent à leur utilisateur un traitement d'un ensemble d'items correspondant à des données de mesures biologiques et à des données personnelles, avec fourniture de conclusions qui peuvent être directement exploitées par le praticien prescripteur. Les procédés de traitement de données biologiques mis en oeuvre dans ces systèmes experts font appel à un ensemble de règles appliquées chacune à une combinaison déterminée d'items parmi un ensemble global d'items correspondant à un ensemble de mesures, examens, dosages effectués sur un patient ou de données personnelles. Ces règles conduisent à un ensemble de conclusions qui sont préalablement rédigées par un ou plusieurs praticiens experts. Il s'avère en pratique que le nombre de conclusions théoriques possibles dans un système expert d'analyse biologique qui aurait vocation à intégrer un profil biologique aussi complet que possible dans l'état actuel des technologies disponibles en analyse biologique est si élevé que la faisabilité d'un tel système expert et son implémentation sur des équipements informatiques conventionnels autres que des machines de grande capacité de calcul et de stockage pourrait être mise en cause. Le but de la présente invention est de proposer un procédé de traitement de données d'analyse biologique qui permette, d'une part de résoudre efficacement la question du volume de données à traiter et par conséquent rende réalisable un tel système expert, et qui, d'autre part, procure au praticien utilisateur une meilleure pertinence des conclusions d'interprétation des résultats d'analyse. Cet objectif est atteint avec un procédé de traitement de données d'analyse biologiques comprenant un traitement d'un ensemble de données relatives au profil biologique d'un sujet humain ou animal, sous la forme d'items biologiques auxquels sont appliquées un ensemble de règles fournissant des conclusions sous la forme d'énoncés en langage naturel. Ce procédé est caractérisé en ce qu'il comprend en outre comprend en outre au moins une opération de regroupement d'un ensemble de conclusions issues d'un groupe de règles, de façon à restreindre le nombre de conclusions qui sont entrées dans un groupe de règles suivant. De telles opérations de regroupement ont pour effet de rendre possible l'implémentation d'un système expert d'analyse biologique sur un équipement informatique personnel de bureau ou portable, sans pour autant affecter la précision et la rigueur des conclusions fournies à l'utilisateur. Un autre but du procédé de traitement de données selon l'invention est de permettre la réalisation d'un système expert d'analyse biologique qui intègre des données de profil génétique dont la connaissance est désormais comme essentielle pour le diagnostic et le traitement d'un nombre croissant d'affections et de pathologies. Cet autre but est atteint avec un procédé de traitement de données selon l'invention caractérisé en ce qu'il comprend en outre un traitement de données génétiques relatives à ce patient sous la forme d'un ensemble d'items génétiques associés à un ensemble de gènes étudiés chez ce patient, ce traitement comprenant t'exécution de règles d'interprétation génétique appliquées à la fois à des items biologiques et à des items génétiques. Avec ce procédé combinant interprétation d'un profil biologique et interprétation d'un profil génétique, il devient possible de proposer des conclusions plus précises et plus pertinentes du fait de la prise en compte d'affections liées aux gènes. Suivant un autre aspect de l'invention, il est proposé un système expert d'analyse biologique mettant en oeuvre le procédé de traitement de données selon l'invention. D'autres avantages et caractéristiques de l'invention apparaîtront à l'examen de la description détaillée d'un mode de mise en oeuvre nullement limitatif, et des dessins annexés sur lesquels : - la figure 1 est un schéma fonctionnel d'un système expert d'analyse biologique selon l'invention, - la figure 2A illustre un exemple de structure interne du moteur d'un système expert selon l'invention, concernant plus particulièrement des règles de la réaction inflammatoire, et la figure 2B illustre un exemple de structure interne du moteur d'un système expert selon l'invention, concernant plus particulièrement des règles d'interprétation de l'immunoglobuline. Un système expert selon l'invention d'analyse biologique selon l'invention peut être en pratique implémenté au sein d'un ordinateur tel qu'un ordinateur de bureau ou un ordinateur portable, et accédé localement ou à distance. Son architecture interne, qui peut être conforme aux standards actuels en matière de système expert, inclut, en référence à la figure 1, un module de collecte des données de détermination des profils respectivement biologiques (notamment protéiques) et génétiques d'un patient, un module de collecte d'informations personnalisées sur le patient, des règles d'interprétation appliquées à un traitement du profil biologique réalisé avec une interprétation génétique, et une édition de conclusions utilisables par un praticien utilisateur. L'ensemble des règles contenues dans ce système expert selon l'invention est organisé en groupes de règles correspondant chacun à un groupe d'analyses spécifiques parmi plusieurs groupes d'analyses. Par exemple, on peut considérer le groupe de règles de la réaction inflammatoire ou le groupe de règles d'interprétation des immunoglobulines. On va maintenant décrire un exemple de mise en oeuvre d'un système expert selon l'invention, en référence aux figures 2A et 2B, en se limitant, pour des raisons d'ampleur de la description et de clarté, au seul profil protéique d'un patient, étant bien entendu que d'autres profils biologiques spécifiques pourraient être traités d'une façon équivalente dans le cadre de la présente invention. Un profil protéique comprend, dans ce système expert, des items facultatifs tels que Item 43= ROP ou Item 45= C4 et un ensemble d'items obligatoires tels que les items suivants : Item 2 = Age Item 39 = TRF Item 3 = Sexe 39. 1 = Normal Item 35= ORO 39. 2= Augmenté (obligatoirement > 35. 1 = Normal 119, pas en dessous) 35. 2= Augmenté 39. 3= Diminué 35. 3= Très augmenté Item 40 = ALB 35. 4= Diminué 40. 1 = Normal ou augmentée ( > 89%) Item 36 = HAPTO 40. 2= Diminuée 89%) 36. 1 = Normal Item 41 = TRF/ALB 36. 2= Augmenté 41. 1 = Normal 36. 3= Très augmenté 41. 2= Augmenté 36. 4= Diminué Item 42 = PAB 36. 5= Très diminué 42. 1 = Normal ou augmentée ( > 84%) 36. 6 = Hapto RINF100= 35. 4+36. 5+37. 5= CINF100 Les conclusions associées à ces règles de la réaction inflammatoire sont par exemple rédigées de la façon suivante : CINFI = Pas de réaction inflammatoire car les protéines de l'inflammation (CRP, Alpha-1-glycoprotéine ou orosomucoide, haptoglobine) sont normales. CINF2 = Les protéines de la réaction inflammatoire sont toutes dans des valeurs normales. Cependant, le taux de la CRP, bien que normal, peut évoquer la présence de microinflammations (à prendre en considération dans l'appréciation du risque cardiovasculaire après élimination formelle de tout autre foyer potentiellement phlogogène). ................ CINF100= Les résultats sont en faveur d'un processus inflammatoire basé uniquement sur la forte augmentation de la CRP. Ceci peut être le début d'un phénomène inflammatoire puisque la CRP, protéine de l'inflammation aiguë, augmente plus rapidement que les autres protéines de l'inflammation. Une telle induction est en faveur d'un foyer infectieux et/ou inflammatoire actuellement récent et très actif, maintenu en activité ou en phase de réinduction. Le taux bas de l'haptoglobine est en faveur d'une hémolyse. Tout résultat de l'haptoglobine inférieur à 50% doit être considéré comme pathologique. Il peut donc être intéressant de rechercher la cause de cette hémolyse. Ici, le taux abaissé de l'alpha-1glycoprotéine ne doit pas faire évoquer en premier lieu un traitement médicamenteux, mais plutôt une fuite protéique, ou une insuffisance hépatocytaire. Un tableau des valeurs normales permet d'associer à des valeurs numériques des items ORO, HPT, CRP, des résultats tels que : 5 10 15 NORMAL AUGMENT TRES DIMINUE TRES E AUGMENT DIMINUE E ORO 70 à 151 à > 200% 149% 200%HPT 60 à 161 à > 200% 50 à 60% 160% 200% N1 N2 N3 N4 N5 CRP O à 66% 67 à 201 à 667 à > 2000% 200% 666% 2000% Pour 100% = 3 mg = 6 à 20 = 21 à 60 > 60 mg mémoire mg mg NORMAL AUGMENT TRES DIMINUE TRES E AUGMENT DIMINUE E ORO/HPT > 1.5 --------------- --------------- ------ ----- On va maintenant exposer de nouvelles règles de la réaction inflammatoire correspondant à une interprétation de l'item 38 par rapport aux conclusions des trois items 35, 36, 37. RING1 = CINF1 + 138. 1 C CINF101 RINF1 02 = CINF1 + 138. 2=CCINF102 RINF103 = CINF1 + 138. 3=C CINF103 ................................................ RINF116 = CINF7 + 138. 1 =} (CINF116) = CINF101 ................................................................. RINF165 = CINF31 +138. 2=!) IMPOSSIBLE .............. .......................................... L'ensemble de conclusions correspondant à ces règles inclut par exemple : CINF101= Aucune dissociation du couple orosomucoide/haptoglobine qui reste homogène. CINF102= Dissociation entre l'alpha-1-glycoprotéine et l'haptoglobine. La dissociation est en faveur d'une hémolyse. Cependant, vu le taux de l'haptoglobine, l'hémolyse n'est pas forcément à considérer comme pathologique. ........................... CINF107= CINF101 ........................... CINF1400= Cette diminution, avec dissociation orosomucoïdelhaptoglobine, peut résulter d'une activité désialytante affectant l'orosomucoïde tel que prise de médicaments dibasiques modifiant la structure antigénique de la protéine (antibiotiques, AINS, béta-bloquants,...), ou provenir d'une légère déperdition de la protéine par fuite d'origine urinaire, digestive, cutanée car l'orosomucoide, qui est une protéine de faible poids moléculaire, est très sensible aux pathologies de fuite. Le début du profil protéique se présente ainsi de la façon suivante : - impression de la conclusion CINF1à CINF10O - impression de la conclusion CINF101 à CINF240 On relie ensuite les conclusions CINF1 à CINF100 aux items 39, 40,41, 42. Or, bien qu'il n'existe en fait que 60 conclusions différentes, ceci conduirait un nombre beaucoup trop élevé de règles. On propose donc de remanier ces 60 conclusions pour aboutir à un nombre plus restreint de conclusions, par exemple 6, en référence à la figure 2A. Si l'on considère 6 conclusions CINF301 à CINF306 reliées aux items 39 (TRF), 40 (ALB), 41 (TRF/ALB), 42 (PAB), on doit prévoir 6x3x2x2x2, soit 144 règles complémentaires Mais la TRF élevée doit être interprétée en fonction du sexe et de l'age. Or, sur 144 règles, on observe 48 fois une TRF élevée. Il faut donc prévoir 48 x2 (sexe) x 3 (age), soit 288 règles supplémentaires. De plus, à l'intérieur du sexe et de l'age, intervient le critère de femme ménopausée ou non, ce qui conduit à 12x6, soit 72 règles complémentaires. Le nombre total de règles s'élève donc 144+288+72, soit 504 règles. Mais, en fait, 96 règles s'avèrent impossibles. Il existe donc 408 règles différentes possibles. Les 6 conclusions résultantes sont : 1) CINF301 : pas de réaction inflammatoire ou très légère : 2) CINF302 : réaction inflammatoire basée uniquement sur l'augmentation de la CRP 3) CINF303 : réaction inflammatoire avec augmentation d'une seule protéine des protéines de la réaction chronique 4) CINF304 : réaction inflammatoire franche avec CRP normale 5) CINF305 : réaction inflammatoire franche avec CRP augmentée 6) CINF306 : abaissement des protéines de l'inflammation chronique Les 408 règles différentes possibles incluent : RINF307= CINF301 +139. 1 +140. 1 +141. 1 142. 1 =CINF307 .......................................................................... RINF738= CINF306+139. 3+140. 2+141. 2+142. 2=CINF738 On va maintenant considérer l'interprétation des Ig (Immunoglobulines) dans le profil protéique. Sont concernés les items 131 (IgM), 132 ( ! gG) et) 33 ( ! gA). L'interprétation est différente s'il existe une protéine monoclonale ou non. Or, la présence d'une protéine monoclonale ne se voit pas sur le profil protéique mais sur une autre analyse qui est l'électrophorèse des protéines. Or, cette électrophorèse n'est pas toujours demandée avec un profil. De plus, si on l'exécute, on ne trouve que rarement une protéine monoclonale. Lorsqu'on trouve une protéine monoclonale, l'interprétation s'arrête là, et on ne relie pas cette conclusion à une réaction inflammatoire. De fait, l'interprétation des Ig commence par le traitement de l'item 44 Electrophorèse des protéines . La réponse peut être : - oui avec présence d'une protéine monoclonale (1ère conclusion), - oui avec absence de protéine monoclonale (nouvelle 1 ère conclusion), - non (nouvelle 1 ère conclusion). Tout individu peut présenter des taux d'zig en dehors des normes sans que cela soit pathologique. Ce qui est pathologique est la variation de ce taux dIg sur deux prélèvements, d'où le traitement de l'item 7 antériorités . Si la réponse est non, cela entraîne une 2ème conclusion d'ordre général avant le traitement proprement dit des Ig. Il faut ensuite relier les items 31,32, 33 à la réaction inflammatoire. Les conclusions de l'interprétation des Immunoglobulines ont été ramenées à 5 selon une démarche semblable à celle adoptée pour les réactions inflammatoires : pas de réaction inflammatoire - légère réaction inflammatoire - réaction inflammatoire uniquement due à la CRP - réaction inflammatoire présente (1,2 ou 3 protéines) - diminution des protéines de la réaction inflammatoire. La 3ème conclusion sera donc choisie parmi les règles suivantes : 131 x 132 x 133 x C5 5 x 3 x 5 x 5 = 375 nouvelles règles. La première conclusion peut être établie de la façon suivante : RIG1 = 144.2. 1 + 12. 1 = CIG1 ....................................... RIG13= 17. 2 = CIG13 CIG1 = L'électrophorèse et l'immunoélectrophorèse ont mis en évidence une IgM monoclonale. Vu l'age du patient, il faut d'abord penser à une infection sévère subaiguë ou chronique d'origine virale ou bactérienne. Cela suggère un déficit immunitaire associé. CIG13 = Les valeurs des Ig reflètent lensemble des défenses acquises au cours de la vie en fonction des rencontres avec les différents agents pathogènes. A l'age adulte, chez une personne saine, ce taux varie peu.//est donc tout à fait possible qu'un taux en dehors des normes ne possède aucune connotation pathologique, mais soit un taux tout à fait physiologique pour le patient. Ce qui est intéressant, c'est l'appréciation de la variation sur deux prélèvements à plusieurs mois d'intervalle. Ne possédant, pour ce patient, aucune antériorité, les différentes étiologies proposées ne le sont qu'à titre indicatif car l'interprétation doit se faire avant tout en fonction du contexte clinique. Comme indiqué ci-dessus, on ramène les 60 conclusions différentes de la réaction inflammatoire à 5, de sorte qu'on détermine les conclusions suivantes : Pas de réaction inflammatoire CINF1 ou CINF2 ou CINF3 ou CINF17 ou CINF21 ou CINF22 ou CINF23 ou CINF6 ou CINF16 ou CINF18 ou CINF26 ou CINF76 ou CINF77 ou CINF78 = CIG101 Réaction inflammatoire légère CINF7 ou CINF8 ou CINF31........... ou CINF83 = CIG102 Réaction inflammatoire due uniquement à la CRP CINF4 ou CINF5 ou CINF19 ou....... ou CINF80 = CIG103 Réaction inflammatoire présente (due à une ou plusieurs protéines) CINF9 ou CINF10 ou...... ou CINF34... ou CINF90 = CIG104 Diminution des protéines CINF91 ou CINF92 ou CINF93 ou CING94 ou CINF95 ou CINF96 ou CINF97 ou CINF98 ou CINF99 ou CINF100 = CIG105 On établit ensuite les 375 règles pour la 3ème conclusion, comme à titre d'exemple : RIG106 = CIG101 + 131. 1 + 132. 1 + 133. 1 = CIG106 ..................................................................... RIG548 = CIG105 + 131. 5 + 132. 3 + 133. 5 = CIG548 ..................................................................... Des règles complémentaires en fonction de l'age sont ajoutées pour prendre en compte les situations où, à chaque fois qu'il va y avoir une réaction inflammatoire (CIG104) sans aucune augmentation des Ig, ou avec une diminution de ngM. Pour créer ces règles complémentaires, un regroupement de certaines des conclusions ClGxxx précitées est effectué pour aboutir à 5 conclusions CIG1200, CIG1201, CIG1202, CIG1203, CIG1204 qui sont utilisées dans l'établissement de ces règles complémentaires. On va maintenant exposer un exemple de mise en oeuvre du procédé de traitement de données selon l'invention pour une interprétation combinée du profil génétique et du risque cardiovasculaire. En premier lieu, une liste non exhaustive de gènes pouvant être interprétés dans le cadre du système expert d'analyse biologique selon l'invention est fournie dans le tableau 1 ci-après. Pour chaque gène, un symbole + dans une colonne signifie que ce gène intervient dans la caractéristique correspondant à cette colonne, et à l'inverse un symbole - dans une autre colonne signifie que le même gène n'intervient pas pour la caractéristique correspondant à cette autre colonne. Ainsi, à titre d'exemple, le gène CYP1A1 intervient chez le fumeur et en matière de nutrigénétique, mais pas en matière de pharmacogénétique, en immunogénétique et pour le stress oxydatif. Ainsi, à chaque symbole + dans ce tableau, correspondent des liens et des règles qui doivent être écrites et intégrées dans le système expert. On donne ci-après, à titre d'exemple non limitatif, des extraits d'interprétation biologique fournis par un système expert selon l'invention, en ce qui concerne le risque cardio-vasculaire : au vu des résultats biologiques, il n'existe pas de risque athérogène. Il faut donc explorer les autres facteurs de risques car près de 20% des patients qui ont des problèmes cardio-vasculaires présentent une biologie normale ou subnormale. [...] 77e/'/ ? o ? oc/sfe// ? e/ ? ?/e pay présentent souvent des troubles cardio-vasculaires dans les premières années de la vie./... 7 Ceci constitue une indication pour effectuer des tests génétiques afin de savoir si l'augmentation de l'homocystéine est d'origine génétique ou non. Si l'allèle E2 semble jouer un rôle dans les hyperlipoprotéinémies de type//1, l'alèle E4 est aussi plus impliqué dans les maladies cardio-vasculaires. Le génotype E2/E4, bien que peu fréquent, augmente donc de façon importante les risques de problèmes cardio-vasculaires. De façon générale, la cholestérolémie moyenne des sujets E4/E3 est supérieure à celle des sujets E3lE3, elle-même supérieure à celle des sujets E3/E2. De la même facon, la concentration moyenne en LDL cholestérol des sujets E4/E3 est supérieure à celle des s stT/e FjE'3, e//e/e7e t/pe/'/et/ye a ce//e des sets E2/E2. Par contre, les triglycérides sont significativement plus élevés chez les sujets E2lE2 ; E3lE2 ; E4lE2 que chez les sujets E3lE3 ; E4/E3)) Cette conclusion traduit une relation directe entre interprétation d'un profil génétique et interprétation d'un profil biologique (cholestérol, triglycérides). Est présenté ci-après un exemple de conclusion traduisant une relation directe entre génétique et régime alimentaire : Les sujets porteurs de l'allèle E4 sont plus sensibles aux régimes alimentaires hypolipémiants et hypocholestérolémiants. Chez ces mêmes sujets, le retour à un régime riche en graisses, en particulier en acides gras saturés, entraîne une plus forte augmentation du cholestérol plasmatique. Le système expert selon l'invention peut aussi prendre en compte dans les conclusions fournies à l'utilisateur une relation directe entre l'interprétation du profil génétique et des données sur le traitement médicamenteux obtenues à partir d'informations personnalisées sur le patient, comme l'illustre la conclusion présentée ci-dessous : Les s uje ts porteurs de l'allèle E2 et atteints d'hyperlipoprotéinémie de type lib répondent bien au traitement par gemfibrosil et par les statines (simvastatine et lovastatine). Parmi les sujets atteints d'hyperlipoprotéinémie de type lia, les porteurs de l'allèle E2 ou E3 répondent bien au traitement par les statines. Les sujets porteurs de l'allèle E4 répondraient en revanche moins bien aux traitements médicamenteux hypolipidémiants, à l'exception peut-être, du probucol. Bien sûr, l'invention n'est pas limitée aux exemples qui viennent d'être décrits et de nombreux aménagements peuvent être apportés à ces exemples sans sortir du cadre de l'invention. En particulier, on peut prévoir une automation complète des opérations des détermination du profil biologique et du profil génétique d'un patient et du traitement combiné de ces profils. Par ailleurs, on comprendra aisément qu'un système expert d'analyse biologique selon l'invention puisse aussi être couplé à des bases de données et des bases de connaissances. De plus, dans le cadre de la présente invention, le profil biologique inclut non seulement plusieurs familles de déterminations et d'analyses biologiques désormais bien établies comme le profil protéique ou le typage lymphocytaire, mais aussi d'autres profils en cours de mise en point ou qui seront proposés dans le future. De même, le système expert selon l'invention a vocation a prendre en compte des profils génétiques de plus en plus complexes au fur et à mesure des avancées scientifiques et technologiques dans ce domaine. Tableau 1 Gènes Prédisposition @ Pharmacogénétique Inmmunogénétique Fumeur Stress O. Nutrigénétique à la maladie Phase Ide Biotransformation CYP1A1 + - - + - + CYP1A2 + + + CYP2A6 + + - + CYP3A4 + + - - - + CYP2B6 + + - - - + CYP1B1 + + - - - + CYP2D6 + + CYP2E1 + - - - - + CYP2C19 + + CYP2C9 - + MEH ±-+ ALDH ±-+ ADH2 + + Phase II de Biotransformation GSTM1 + + + + + + GSTM3 + - - - + + GSTT1 + - - + + + GSTP1 + + - - + + NAT2 + + + + - + NAT1 + + + + - + Gènes Prédisposition Pharmacogénétique Immunogénétique Fumeur Stress O. Nutrigénétique à la maladie Trigger genes Osteoporose Vit D3 + Col1A1 + ER + - - - - CTR + AIDS CCR5 + SDF1 + CCR2 + CXCR4 + Cancer du sein BRCA1 + BRCA2 + Cancer de la prostate AR + Trombophilie héritée Facteur + Hémochromatoise HFE + Asthme bronchique et allergie CC16 + AAT-locus + - - + HNMT ±-+ PAFAH ±-+ AACT + - - + Hypercholesterinémie Primaire LDLR + APOB + Risque cardiovasculaire MTHFR + ACE + Gènes efflux MDR1 - + MDR3 - + LRP - + MRP1 - + Autres gènes métabolisants NQ01 + - - - + Gènes cytokine IL-1a + - + IL-1b + - + ILRN + - + IL-2 + - + IL-4 + - + IL-6 + - + IL-9 + - + - Tableau 1 (suite) REVENDICATIONS 1. Procédé de traitement de données d'analyse biologiques comprenant un traitement d'un ensemble de données relatives au profil biologique d'un sujet humain ou animal, sous la forme d'items biologiques auxquels sont appliquées un ensemble de règles fournissant des conclusions sous la forme d'énoncés en langage naturel, caractérisé en ce que ledit ensemble de règles inclut une pluralité de groupes de règles associés chacun à un groupe d'analyses parmi une pluralité de groupes d'analyses constituant le profil biologique, et en ce qu'il comprend en outre au moins une opération de regroupement d'un ensemble de conclusions issues d'un groupe de règles, de façon à restreindre le nombre de conclusions qui sont entrées dans un groupe de règles suivant. 2. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce qu'il comprend en outre un traitement de données génétiques relatives à ce patient sous la forme d'un ensemble d'items génétiques associés à un ensemble de gènes étudiés chez ce patient, ce traitement comprenant l'exécution de règles d'interprétation génétique appliquées à la fois à des items biologiques et à des items génétiques. 3. Système expert d'analyse biologique, comprenant : - des moyens pour collecter des données issues de mesures biologiques réalisées sur un sujet humain ou animal et définissant un profil biologique, et des données personnelles relatives audit sujet humain ou animal, ces données étant représentées sous la forme d'un ensemble d'items, - un moteur comprenant plusieurs groupes de règles préétablies, chacune desdites règles portant sur certains items sélectionnés parmi l'ensemble d'items et/ou sur certaines conclusions de règles exécutées antérieurement à ladite règle, et - des moyens pour émettre des conclusions en réponse à l'exécution desdites règles, ce système mettant en oeuvre) le procédé de traitement de données selon l'une des revendications précédentes, caractérisé en ce qu'il comprend en outre des moyens pour collecter des données relatives au profil génétique dudit sujet humain ou animal sous la forme d'items génétiques, et en ce que le moteur comprend en outre des règles d'interprétation desdits items génétiques. 4. Système expert selon la revendication 3, caractérisé en ce qu'il est intégré dans un système automatisé incluant des opérations de détermination du profil biologique et du profil génétique de patients. 5. Système expert selon l'une des revendications 3 ou 4, caractérisé en ce qu'il est couplé à une base de connaissances.