Brevet FR2785293A1 — publié le 20000505

La présente invention a trait à des acides nucléiques codant pour des polypeptides spécifiques des souches pathogènes du genre Neisseria, notamment utiles pour prévenir ou traiter une infection par Neisseria meningitidis. D'une manière générale, les méningites sont soit d'origine virale, soit d'origine bactérienne. Les bactéries principalement responsables sont Haemophilus influenzae de type b, Neisseria meningitidis et Streptococcus pneumoniae. L'espèce Neisseria meningitidis est subdivisée en sérogroupes selon la nature des polysaccharides capsulaires Bien qu'il existe une douzaine de sérogroupes, 90% des cas de méningites sont attribuables à trois sérogroupes A, B et C II existe des vaccins efficaces à base de polysaccharides capsulaires pour prévenir les méningites à Neisseria meningitidis sérogroupes A et C. Ces polysaccharides tels quels ne sont que peu ou pas immunogènes chez les enfants de moins de deux ans et n'induisent pas de mémoire immunitaire. Toutefois, ces inconvénients peuvent être surmontés en conjuguant ces polysaccharides à une protéine porteuse. En revanche, le polysaccharide de Neisseria meningitidis sérogroupe B n'est pas ou peu immunogène chez l'homme, qu'il soit sous forme conjuguée ou non. Ainsi il apparaît hautement souhaitable de rechercher un vaccin à l'encontre des méningites causées par Neisseria meningitidis, notamment du sérogroupe B, autre qu'un vaccin à base de polysaccharide. A cette fin, différentes protéines de la membrane externe de N. meningitidis ont déjà été proposées, telles que le récepteur membranaire de la transferrine humaine (WO 90/12591 et W093/06861). Neisseria meningitidis est génétiquement très proche de Neisseria gonorrhoeae et Neisseria lactamica. N. gonorrhoeae est surtout responsable d'infections localisées dans le tractus urogénital. Elle colonise la muqueuse génitale, puis traverse l'épithélium, envahit ensuite le sous- épithélium où elle se multiplie et est responsable d'une forte réaction inflammatoire. Par contre, N lactamica est considérée comme une espèce non pathogène La demande de brevet W098/02547 divulgue un certain nombre de séquences nucléotidiques issues de la souche de N. meningitidis Z2491 qui s'hybrident avec le génome de N. gonorrhoeae et ne s'hybrident pas avec le génome de N. lactamica. Par extension de language, ces séquences sont dites présentes chez N. meningitidis et N. gonorrhoeae (bien qu'elles ne soient pas forcément présentes à l'identique) et absentes de N lactamica. Les auteurs de cette demande PCT spéculent que les gènes des souches de Neisseria pathogènes situés aux alentours des séquences identifiées devraient également être absents de N. lactamica. Dans la mesure où ces gènes peuvent être spécifiques des souches pathogènes du genre Neisseria, les polypeptides pour lesquels ils codent ont un intérêt potentiel en tant qu'antigènes vaccinaux Néanmoins cette demande de brevet ne divulgue pas quels pourraient être ces gènes et encore moins leurs séquences, même partielles. Les auteurs de la présente invention sont maintenant parvenus à identifier certains de ces gènes en recherchant dans le génome du méningoccoque, les cadres de lecture ouverts spécifiques des souches pathogènes du genre Neisseria, en mettant en oeuvre la stratégie suivante Certaines des séquences divulguées dans la demande de brevet W098/02547 (SEQ ID n 66,67, 69, 70, 72 à 96,98, et 99), ont été positionnées sur la séquence du génome de la souche N. meningitidis de sérogroupe B (ATCC 13090), disponible à partir de la banque Pathoseq d'Incyte Pharmaceuticals ainsi que sur la séquence du génome de la souche Neisseria meningitidis Z2491 (Sanger Center) Ceci a permis d'identifier, dans le génome de N. meningitidis qui compte 2,3 Méga bases, 19 contigs représentant 220 000 paires de bases. Les auteurs de la présente invention ont ensuite analysé, pour chacun des 19 contigs, la présence de phases de lecture ouvertes (" open reading frames-ORF "), contenant au moins 100 acides aminés (et par définition, bornées par un codon d'initiation et un codon stop), à l'aide du logiciel Gene Jockey Il séquence processor# (Biosoft). Cette analyse a permis de sélectionner environ 400 ORFs candidates Les séquences de chacune de ces ORFs ont ensuite été analysées à l'aide du logiciel Codon Use# (Conrad Halling), qui tient compte de la fréquence d'utilisation des codons chez N meningitidis. N'ont été retenues que les ORFs dont les séquences présentent une fréquence d'utilisation maximale de ces codons A l'issue de cette analyse, 197 ORFs candidates ont été retenues. Les ORFs sélectionnées par cette double analyse ont été soumises à une recherche d'homologies sur l'ensemble des banques disponibles à l'aide du programme BLASTX# depuis l'accès à la banque Pathoseq d'Incyte Pharmaceuticals. Cette recherche d'homologies a permis d'exclure les ORFs codant a priori pour des protéines cytoplasmiques ou périplasmiques, en particulier des protéines du métabolisme Les ORFs ont également été soumises à une analyse des motifs protéiques éventuels, à l'aide du programme Protean# de DNA Star (Lasergene software) Les auteurs de la présente invention ont ensuite recherché si les ORFs retenues à l'issue de l'étape précédente (au nombre de 118) étaient effectivement absentes de N. lactamica, comme le prévoyait la demande de l'art antérieur WO 98/02547. A cette fin, une amplification par PCR a été mise en #uvre. Cette amplification s'est révélée inopérante pour 78 des 118 ORFs testées. Seules les ORFs pour lesquelles l'amplification chez N. lactamica était négative (séquences appelées "lactamica-") ont été retenues. Afin de vérifier que ces résultats négatifs n'étaient pas des "faux-négatifs", les séquences lactamica- retenues ont été soumises à un contrôle par dot blot A l'issue de cette étape, seules 23 ORFs ont été confirmées N. meningitidis+l N. lactamica'. Enfin, ces 23 ORFs ont été repositionnées dans leur ensemble sur le génome de N. meningitidis ATCC 13090. Ceci a permis de mettre en évidence que trois ORFs préalablement éliminées sur la base de leur fonction protéique putative, apparaissaient localisées à proximité ou même encadrées par certaines des 23 ORFs N. meningitidis+/ N. lactamica- Ces trois ORFs (SEQ ID n 29,35 et 37) ont été réintroduites dans l'étude, et il s'est avéré qu'elles étaient elles aussi N. meningitidis+/N. lactamica- Les auteurs de la présente invention ont ensuite cherché à savoir si les ORFs identifiées à partir du génome de la souche N. meningitidis de sérogroupe B ATCC 13090 étaient aussi présentes dans les génomes de N. meningitidis Z2491 (Sanger Center) de sérogroupe A et de N. gonorrhoeae FA1090 (Advanced Center of Genome Technology, Oklahoma University).Puis ils ont comparé les séquences dérivées de ces différents génomes, par alignement multiple (Clustal, Infobiogen). Ceci a permis de redéfinir pour certaines des ORFs la position la plus probable des codons d'initiation et de fin de traduction. Les séquences des cadres de lecture ouverts issues de la souche ATCC13090 sont données dans les SEQ ID N 1 - 51 (numéros impairs) et les séquences d'acides aminés qui en sont déduites, dans les SEQ ID N 2 - 52 (numéros pairs). La présente invention a donc pour objet un acide nucléique sous forme isolée codant pour un polypeptide, ou un fragment antigénique de celuici à l'exclusion des acides nucléiques divulgués dans les SEQ ID n 70,73, 74,77, 80,81, 87, 88, 89,94, 95 et 98 de la demande WO 98/02547 (séquences annexées à la présente description) , ledit polypeptide ayant une séquence d'acides aminés qui est identique ou homologue à une séquence choisie parmi celles du groupe Il ; le groupe Il étant constitué par les séquences montrées dans les SEQ ID n 2 - 52 (numéros pairs) et la séquence SEQ ID n 53. De manière préférentielle, ledit acide nucléique peut avoir une séquence nucléotidique choisie parmi celles du groupe I, le groupe I étant constitué par les séquences montrées dans les SEQ ID n 1-51 (numéros impairs). Le terme acide nucléique inclut et signifie également ORF, gène, polynucléotide, ADN et ARN Le terme acide nucléique sous forme isolée signifie un acide nucléique séparé de l'environnement biologique dans lequel il se trouve dans des conditions naturelles. Par exemple, une molécule d'ADN existe dans des conditions naturelles lorsqu'elle se trouve intégrée dans un génome ou bien lorsqu'elle fait partie d'une banque de gènes. Dans ce cas là, elle ne peut être sous forme isolée Par contre, la même molécule séparée du génome par clonage (par exemple suite à une amplification par PCR) doit être considérée comme étant sous forme isolée De manière typique, une molécule d'ADN sous forme isolée, ne contient pas les régions codantes qui lui sont contiguës en 5' et 3' dans le génome dont elle est issue. Les acides nucléiques sous forme isolée peuvent être intégrés dans des vecteurs (par exemple plasmides or vecteurs viraux ou bactériens) sans pour cela se départir de leur caractéristique d'être séparés de leur environnement naturel Les auteurs de la présente invention ont plus particulièrement trouvé que les ORFs qui, lorsqu'elles étaient issues de la souche ATCC 13090, étaient caractérisées par les séquences telles montrées dans les SEQ ID n 19,27, 39,45, 47 et 49, étaient spécifiques de Neisseria meningitidis dans la mesure où il n'a pas été possible de mettre en évidence des séquences identiques ou homologues dans le génome de N. gonorrhoeae. Ils ont aussi trouvé que l'ORF caractérisée par la séquence de souche telle que montrée dans le SEQ ID n 39 était spécifique de Neisseria meningitidis de sérogroupe B. L'invention a également pour objet un polypeptide sous forme isolée ou un fragment de celui-ci ; ledit polypeptide ayant une séquence d'acides aminés identique ou homologue à une séquence choisie parmi celles du groupe II. Les acides aminés encadrés dans la séquence SEQ ID n 8 correspondent à la séquence signal, l'acide aminé en gras représente le premier acide aminé de la forme mature. La séquence d'acides aminés de la forme protéique mature est représentée dans le SEQ ID n 53. Dans le cadre de la présente invention, les termes de " polypeptide " et " protéine " sont équivalents et interchangeables entre eux. Ils désignent n'importe quelle chaîne d'acides aminés, quelle qu'en soit sa longueur et ses modifications post-traductionnelles (par exemple, phosphorylation ou glycosylation). Par " fragments antigéniques des polypeptides spécifiques des souches pathogènes du genre Neisseria ", on entend les polypeptides dérivés des polypeptides de l'invention tels que définis précédemment, par des délétions de parties desdits polypeptides sans destruction de l'antigénicité (par exemple, sans perte notable de l'activité antigénique) desdits polypeptides. L'antigénicité spécifique peut être déterminée en utilisant diverses méthodes connues de l'homme du métier, comme expliqué plus loin. Ces fragments ont de préférence au moins 12 acides aminés de long, de préférence encore au moins 20 acides aminés de long, préférentiellement 50 acides aminés de long, de préférence encore 75 acides aminés de long, préférentiellement 100 acides aminés de long. Ces fragments peuvent être utilisés pour révéler des épitopes qui peuvent être masqués chez les polypeptides parents. Ils sont également avantageux pour induire une réponse immune protectrice dépendante des lymphocytes T. Les délétions peuvent en effet permettre d'éliminer des régions immunodominantes de haute variabilité entre différentes souches. De tels fragments peuvent être obtenus en utilisant des techniques standard connues de l'homme du métier (par exemple, Ausubel et al, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & sons Inc, 1994), par exemple par PCR, RT-PCR, traitement par enzymes de restriction des molécules d'ADN clonées, ou par la méthode de Kunkel et al (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1985) 82:448). Par " séquence d'acides aminés homologue ", on entend une séquence qui diffère d'une des séquences du groupe Il par substitution, délétion, et/ou insertion d'un ou plusieurs acides aminés, à des positions telles que ces modifications ne détruisent pas l'antigénicité spécifique du polypeptide en question. Lesdites substitutions sont de préférence des substitutions conservatives, c'est-à-dire des substitutions d'acides aminés de même classe, tels que des substitutions d'acides aminés aux chaînes latérales non chargées (tels que l'asparagine, la glutamine, la serine, la thréonine, et la tyrosine), d'acides aminés aux chaînes latérales basiques (tels que la lysine, l'arginine, et l'histidine), d'acides aminés aux chaînes latérales acides (tels que l'acide aspartique et l'acide glutamique) ; d'acides aminés aux chaînes latérales apolaires (tels que la glycine, l'alanine, la valine, la leucine, l'isoleucine, la proline, la phénylalanine, la méthionine, le tryptophane, et la cystéine). De manière avantageuse, une séquence d'acides aminés homologue possède un degré d'homologie (i.e , d'identité) d'au moins 75 % avec une des séquences du groupe Il; de préférence ce degré d'homologie est d'au moins 80 %, de manière tout à fait préférée, d'au moins 90 %. Les séquences d'acides aminés homologues incluent en particulier les séquences qui sont substantiellement identiques à une des séquences du groupe II. Par " séquence substantiellement identique " on signifie une séquence dont le degré d'homologie (Le., d'identité) avec une des séquences du groupe Il est d'au moins 90%, avantageusement d'au moins 95%, de préférence d'au moins 97%, de manière tout à fait préférée d'au moins 99% De plus, elle peut ne différer de la séquence de référence que par une majorité de substitutions conservatives Le degré d'homologie (aussi appelé degré d'identité) est généralement déterminé en utilisant un logiciel d'analyse de séquence (par exemple, Séquence Analysis Software Package of the Genetics Computer Group, University of Wisconsin Biotechnology Center, 1710 University Avenue, Madison, Wl 53705). Des séquences d'acides aminés similaires sont alignées pour obtenir le maximum de degré d'homologie (i e identité). A cette fin, il peut être nécessaire d'introduire de manière artificielle des espaces (" gaps ") dans la séquence Une fois l'alignement optimal réalisé, le degré d'homologie (i.e identité) est établi par enregistrement de toutes les positions pour lesquelles les acides aminés des deux séquences comparées sont identiques, par rapport au nombre total de positions. Par " séquences nucléotidiques homologues ", on entend des séquences qui diffèrent des séquences du groupe par substitution d'un nucléotide ou plusieurs nucléotides, ou par délétion et/ou insertion d'un ou plusieurs codons, à des positions telles que ces séquences codent (i) toujours pour des polypeptides ayant les séquences du groupe II, par effet de la dégénérescence du code génétique ; ou bien (ii) pour des polypeptides possédant des séquences homologues tels que définies précédemment. De manière avantageuse, une séquence nucléotidique homologue possède un degré d'homologie d'au moins 60 % avec une des séquences du groupe 1 ; de préférence ce degré d'homologie est d'au moins 80 %, de manière tout à fait préférée d'au moins 90 %. De manière typique, une séquence nucléotidique homologue s'hybride spécifiquement aux séquences complémentaires des séquences du groupe I dans des conditions stringentes. La température à laquelle le test d'hybridation est mis en #uvre constitue un facteur important influençant la stringence. De manière conventionnelle, cette température, dite température d'hybridation (Th), est choisie de 5 à 40 C, de préférence de 20 à 25 C au dessous de la température à laquelle 50% des brins appariés se séparent (Tm) De manière générale, on considère que des conditions de forte stringence sont remplies lorsque Th est inférieure à Tm de 5 à 25 C approximativement, par exemple de 5 à 10 C ou le plus souvent, de 20 à 25 C approximativement. Une stringence modérée s'établit lorsque Th est inférieure à Tm de 30 à 40 C Pour les séquences comprenant plus de 30 bases, la température Tm est définie par la relation: Tm = 81,5 + 0,41(%G+C) + 16,6Log(concentration en cations) - 0,63(%formamide) - (600/nombre de bases) Ainsi, la force ionique a un impact majeur sur la valeur de Tm La température Tm augmente de 16,6 C chaque fois que la concentration en cation monovalent augmente d'un facteur 10 L'addition de formamide dans le tampon d'hybridation fait par contre baisser la valeur de Tm. (Pour une référence complète voir Sambrook et al, Molecular Cloning, A laboratory manual, Cold Spring Harbor laboratory Press, 1989, pages 9.54-9.62). De manière conventionnelle, les expériences d'hybridation sont conduites à une température de 60 à 68 C, par exemple à 65 C A cette température, des conditions d'hybridation stringentes peuvent être par exemple mises en oeuvre en 6xSSC, avantageusement en 2xSSC ou 1xSSC, de préférence, en 0,5xSSC, 0,3xSSC ou 0,1 xSSC (en absence de formamide). Une solution de 1xSSC contient 0,15 M de NaCI et 0,015 de citrate de sodium. C'est pourquoi, en d'autres termes, l'invention a pour objet un polynucléotide sous forme isolée, qui est capable de s'hybrider dans des conditions stringentes avec une molécule d'ADN ayant une des séquences nucléotidiques telles que montrées dans les SEQ ID N 1 - 51 (numéros impairs) ou leurs complémentaires. Une classe particulière de séquences homologues est constituée par celles que l'on rencontre dans la nature en vertu du phénomène extrêmement fréquent de la variation allélique. Une espèce bactérienne par exemple, N. meningitidis ou N. gonorrhoeae, est constituée par une grande variété de souches qui diffèrent entre elles par des variations mineures, dites variations alléliques. Ainsi, un polypeptide qui est présent dans différentes souches et qui bien évidemment remplit dans chacune d'entre elles, la même fonction biologique, peut posséder une séquence d'acides aminés qui n'est pas identique d'une souche à l'autre. En d'autres termes, les séquences issues de la variation allélique sont purement des séquences équivalentes ou alternatives à celles du groupe II. La classe de séquences variantes alléliques de l'une des séquences du groupe Il est constituée par les séquences du polypeptide tel qu'il se trouve dans une espèce pathogène du genre Neisseria (par exemple N meningitidis ou de N. gonorrhoeae) autre que la souche de N. meningitidis ATCC 13090. La fonction biologique qui est associée aux séquences variantes allèliques est la même que celle qui est associée à la séquence de référence. Les différences (substitution, délétion ou addition d'un ou plusieurs acides aminés) qu'elles présentent entre elles (y compris la séquence de référence) n'altèrent pas la fonction biologique du polypeptide. Par " fonction biologique on entend la fonction exercée par le polypeptide dans les cellules qui le produisent de manière naturelle La variation allélique s'exprime également au niveau des séquences codantes. Un polynucléotide codant pour un polypeptide possédant une séquence qui est une variante allélique de l'une des séquences du groupe I peut être facilement clone par amplification de l'ADN génomique des souches d'espèces pathogènes du genre Neisseria , par exemple par PCR (réaction en chaîne par la polymérase), en utilisant des amorces oligonucléotidiques synthétiques capables de s'hybrider au niveau des extrémités 5' et 3' de la région codante. Les séquences de telles amorces peuvent facilement être établies par un homme du métier à partir des séquences nucléotidiques données dans les SEQ ID N 1 - 51 (numéros impairs). Les amorces ont en général de 10 à 40 nucléotides, de préférence de 15 à 25 nucléotides. C'est pourquoi, en d'autres termes, l'invention a pour objet une molécule d'ADN sous forme isolée qui peut être amplifiée et/ou clonée par PCR à partir du génome d'une souche de Neisseria pathogène en utilisant un couple d'amorces PCR 5' et 3' ; les séquences de ces amorces étant établies à partir d'une des séquences nucléotidiques telles que montrées dans les SEQ ID N 1 - 51 (numéros impairs). Un exemple est donné pour chaque couple d'amorces dans l'exemple 1.1 ci-après. Les polypeptides de l'invention peuvent être fusionnés à d'autres polypeptides, par exemple par traduction d'un gène hybride. Des vecteurs pour l'expression de polypeptides de fusion sont disponibles dans le commerce, comme les vecteurs pMal-c2 ou pMal-p2 de New England Biolabs, dans lesquels la protéine à laquelle peuvent être fusionnés les polypeptides de l'invention est une protéine de liaison au maltose, ou le système glutathionS-transférase de Pharmacia, ou le système His-Tag de Novagen De tels systèmes sont en particulier utiles pour une purification des polypeptides de l'invention. Les polypeptides de l'invention peuvent être fusionnés à des polypeptides présentant une activité d'adjuvant, comme par exemple la sousunité B de la toxine cholérique ou de la toxine thermosensible de E coli. Les acides nucléiques de la présente invention peuvent être utilisés (i) dans un procédé de production des polypeptides codés par lesdits acides nucléiques dans un système hôte recombinant, (ii) pour la construction de vecteurs vaccinaux tels que des poxvirus, destinés à être utilisés dans des méthodes et des compositions de prévention et/ou de traitement d'une infection par les souches pathogènes de Neisseria, en particulier par Neisseria meningitidis, (iii) comme agent vaccinal sous une forme nue ou en association avec un véhicule favorisant le transfert aux cellules cible et, (iv) dans la construction de souches de Neisseria atténuées qui peuvent surexprimer un acide nucléique de l'invention ou l'exprimer sous une forme non toxique, mutée. La présente invention fournit également (i) une cassette d'expression contenant un polynucléotide de l'invention placée sous le contrôle d'éléments permettant son expression, en particulier sous le contrôle d'un promoteur approprié ; un vecteur d'expression contenant ladite cassette d'expression ; (iii) une cellule hôte (procaryote ou eucaryote) transformée avec une cassette d'expression et/ou un vecteur d'expression tels que définis ci-dessus, ainsi que (iv) une méthode pour obtenir un polypeptide codé par ledit polynucléotide de l'invention, comprenant la culture de ladite cellule transformée, dans des conditions permettant l'expression du polynucléotide de l'invention, et la récupération du polypeptide de la culture cellulaire. Parmi les hôtes eucaryotes pouvant être utilisés, on peut notamment citer les cellules de levure (par exemple, Saccharomyces cerevisiae ou Pichia Pastoris), les cellules de mammifères (par exemple, COS1, NIH3T3, ou JEG3), des cellules d'arthropodes (par exemple, Spodoptera frugiperda (SF9)), et des cellules végétales. Parmi les hôtes procaryotes pouvant être utilisés, on peut notamment citer E. coli. Le choix de la cassette d'expression dépend du système hôte choisi ainsi que des caractéristiques désirées pour le polypeptide exprimé. De manière générale, les cassettes d'expression incluent un promoteur qui est fonctionnel dans le système hôte sélectionné et qui peut être constitutif ou inductible , un site de liaison au ribosome ; codon d'initiation (ATG) ; si nécessaire une région codant pour un peptide signal ; une séquence nucléotidique de l'invention ; codon stop , éventuellement une région 3' terminale (terminateur de traduction et/ou de transcription). Le cadre de lecture ouverte ("open reading frame ORF") constitué par la séquence nucléotidique de l'invention, seule ou associée à la région codant pour le peptide signal, est placé sous le contrôle du promoteude telle sorte que la traduction et la transcription aient lieu dans le système hôte. Les promoteurs et les régions codant pour les peptides signal sont connus de l'homme du métier. Parmi ceux-ci, on peut notamment citer le promoteur de Salmonella typhimurium inductible par l'arabinose (promoteur araB) et qui est fonctionnel dans les bactéries Gram' tel que E. coli (US 5,028,530 et Cagnon et al., Protein Engineering (1991) 4 (7) : 843), le promoteur du gène du bactériophage T7 codant pour l'ARN polymérase, (US 4,952,496) , le peptide signal OspA et RlpB (Takase et al, J. Bact. (1987) 169 5692). Le polypeptide exprimé peut être recueilli sous une forme pratiquement punfiée à partir de l'extrait cellulaire ou du surnageant après centrifugation de la culture de cellules recombinantes Le polypeptide recombinant peut être notamment purifié par des méthodes de purification par affinité à l'aide d'anticorps ou par toute autre méthode connue de l'homme du métier, telle que par fusion génétique avec un petit domaine de liaison. Les acides nucléiques de l'invention peuvent également être utiles dans le domaine de la vaccination, soit en utilisant un hôte viral ou bactérien comme véhicule de libération de l'ADN, soit en administrant l'acide nucléique d'intérêt sous une forme libre. La présente invention a également pour objet (i) un vecteur vaccinal contenant un acide nucléique de l'invention, placé sous le contrôle d'éléments permettant son expression ; une composition pharmaceutique contenant une quantité thérapeutiquement ou prophylactiquement efficace dudit vecteur vaccinal ; (iii) une méthode pour induire une réponse immune contre Neisseria chez un vertébré, en particulier un mammifère, de préférence un humain, ladite méthode comprenant l'administration audit vertébré d'une quantité immunologiquement efficace dudit vecteur vaccinal pour provoquer une réponse immune, en particulier une réponse protectrice ou thérapeutique à Neisseria meningitidis ; (iv) une méthode pour prévenir et/ou traiter une infection par les souches pathogènes de Neisseria, en particulier par Neisseria meningitidis, qui comprend l'administration d'une quantité prophylactique ou thérapeutique dudit vecteur vaccinal de l'invention à un individu nécessitant un tel traitement. En association avec les polypeptides de l'invention, le vecteur vaccinal tel que défini ci-dessus peut également comprendre des séquences nucléotidiques dont l'expression permet la stimulation de la réponse immune, telles que les séquences codant pour des cytokines. Ledit vecteur vaccinal de l'invention peut être administré par n'importe quelle voie conventionnelle dans le domaine de la vaccination, en particulier par la voie parentérale (par exemple, sous-cutanée, intra-dermique, intra-musculaire, intraveineuse ou intra-péntonéale). Le dosage dépend de nombreux paramètres connus de l'homme du métier, tels que le vecteur luimême, la voie d'administration, le poids, l'âge ou le sexe de l'animal ou de l'homme à vacciner. La présente invention a également pour objet (i) une composition pharmaceutique contenant une quantité thérapeutiquement ou prophylactiquement efficace d'un polynucléotide de l'invention ; une méthode pour induire une réponse immune contre les souches pathogènes de Neisseria, en particulier par Neisseria meningitidis chez un vertébré par administration audit vertébré d'une quantité immunologiquement efficace dudit polynucléotide pour provoquer une réponse immune, en particulier une réponse immune protectrice envers les souches pathogènes de Neisseria, en particulier par Neisseria meningitidis ; et (iii) une méthode de prévention et de traitement à une infection par les souches pathogènes de Neisseria, en particulier par Neisseria meningitidis, par administration d'une quantité thérapeutique ou prophylactique dudit polynucléotide à un individu nécessitant un tel traitement. Les polynucléotides de l'invention (ADN ou ARN) peuvent être administrés en tant que tels à un vertébré Lorsqu'une molécule d'ADN de l'invention est utilisée, elle peut être sous la forme d'un plasmide incapable de se répliquer dans une cellule de vertébré et incapable d'intégrer le génome dudit vertébré. Ladite molécule d'ADN est typiquement placée sous le contrôle d'un promoteur adapté pour l'expression dans une cellule de vertébré. Ledit polynucléotide utilisé comme vaccin peut être formulé selon diverses méthodes connues de l'homme du métier. Ledit polynucléotide peut en particulier être utilisé sous une forme nue, exempt de tout véhicule favorisant le transfert à la cellule cible, tels que des liposomes anioniques, des lipides cationiques, des microparticules, par exemple des microparticules d'or, des agents de précipitation, par exemple du phosphate de calcium, ou tout autre agent facilitant la transfection. Dans ce cas, le polynucléotide peut être simplement dilué dans une solution physiologiquement acceptable, telle qu'une solution stérile ou une solution stérile tampon, en présence ou en l'absence d'un véhicule. Lorsqu'il est présent, ce véhicule peut être de préférence isotonique, hypotonique, ou faiblement hypertonique, et a une force ionique relativement faible. Il peut par exemple s'agir d'une solution de saccharose (par exemple une solution contenant 20 % de saccharose). De manière alternative, un polynucléotide de l'invention peut être associé à des agents qui facilitent la transfection. Il peut être, entre autres , (i) associé à un agent chimique qui modifie la perméabilité cellulaire tel que la bupivacaïne (WO 94/16737) ; (ii) encapsulé dans des liposomes, éventuellement en présence de substances supplémentaires facilitant la transfection (WO 93/18759, WO 93/19768, WO 94/25608 et WO 95/2397, WO 93/18759 et WO 93/19768) , ou (iii) associé à des lipides cationiques ou des microparticules de silice, d'or ou de tungstène. Lorsque les polynucléotides de l'invention recouvrent des microparticules, celles-ci peuvent être injectées par voie intradermique ou intraépidermique par la technique du canon à gènes, "gene gun" (US 4,945,050, U. S. No. 5,015,580 et WO 94/24263). La quantité d'ADN à utiliser comme vaccin dépend notamment de la force du promoteur utilisé dans la construction de l'ADN, de l'immunogénicité du produit exprimé, de l'individu auquel cet ADN est administré, du mode d'administration et du type de formulation. De manière générale, une quantité thérapeutiquement ou prophylactiquement efficace variant d'environ 1 g à environ 1 mg, de préférence d'environ 10 g à environ 800 g et, de manière préférentielle d'environ 25 g à environ 250 g, peut être administrée à des adultes humains. Le polynucléotide de l'invention peut être administré par toute voie d'administration conventionnelle telle que notamment par voie parentérale. Le choix de la voie d'administration dépend en particulier de la formulation choisie. Un polynucléotide formulé en association avec la bupivacaine est avantageusement administré au muscle. Lorsque des liposomes neutres ou anioniques ou un lipide cationique tel que DOTMA (chlorure de N-[1-(2,3-dioléyloxy)propyl]-N,N,N-triméthylammonium) ou DCChol (3 beta-(N-(N',N'-dimethyl aminomethane)-carbamoyl) cholestérol), sont utilisés, la formulation peut être avantageusement injectée par voie intraveineuse, intramusculaire, intradermique ou sous-cutanée. Un polynucléotide sous une forme nue peut de manière avantageuse être administré par voie intramusculaire, intradermique ou sous-cutanée. Les séquences nucléotidiques de l'invention permettent la construction de sondes et d'amorces nucléotidiques spécifiques utiles en diagnostic. Lesdites sondes ou amorces sont des acides nucléiques ayant des séquences identiques ou homologues à des portions des séquences du groupe 1 ou à leurs séquences complémentaires. De manière préférentielle, lesdites sondes contiennent d'environ 5 à environ 100, de préférence d'environ 10 à environ 80 nucléotides Elles peuvent contenir des bases modifiées, les résidus sucre et phosphate pouvant être également modifiés ou substitués. Les sondes de l'invention peuvent être utilisées dans des tests de diagnostic, pour capturer ou détecter des polynucléotides spécifiques des souches pathogènes de Neisseria. De telles sondes de capture peuvent être de manière conventionnelle immobilisées sur un support solide directement ou indirectement, par liaison covalente ou par adsorption passive Une sonde de détection peut être marquée notamment par un isotope radioactif, une enzyme telle que la peroxidase ou la phosphatase alcaline, ou des enzymes capables d'hydrolyser un substrat chromogène, fluorogène ou luminescent, ou encore par des composés eux-mêmes homogènes, fluorogènes ou luminescents, des analogues nucléotidiques ; ou la biotine Une amorce contient généralement d'environ 10 à environ 40 nucléotides, et peut être utilisée pour initier une polymérisation enzymatique de l'ADN dans un processus d'amplification (par exemple la PCR), dans un processus d'élongation ou dans une méthode de transcription inverse. Une amorce de l'invention peut être notamment une amorce telle que décrite dans l'exemple Il 1 ci-après. La présente invention a également pour objet . (i) un réactif contenant une sonde de l'invention pour la détection et/ou l'identification de la présence des souches pathogènes de Neisseria dans un échantillon biologique ; (ii) un procédé de détection et/ou d'identification de la présence des souches pathogènes de Neisseria dans un échantillon biologique ; méthode comprenant les étapes consistant à a) extraire l'ADN ou l'ARN d'un échantillon biologique et le dénaturer ; b) exposer ledit ADN ou ledit ARN à une sonde de l'invention, dans des conditions d'hybridation stringentes, de manière à détecter l'hybridation ; et(iii) une méthode de détection et/ou d'identification des souches pathogènes de Neisseria dans un échantillon biologique dans lequel l'ADN est extrait d'un échantillon biologique et est mis en présence d'au moins une et de préférence de deux amorces de l'invention et est amplifié par exemple par PCR. Comme mentionné précédemment, les polypeptides produits par l'expression des séquences ORF identifiées sont utiles comme agents vaccinaux. L'antigénicité spécifique des polypeptides homologues des polypeptides de séquences du groupe Il peut être évaluée en testant la réactivité croisée avec un antisérum dirigé contre les polypeptides de séquences du groupe Il. Un antisérum hyper-immun monospécifique peut être produit contre un polypeptide de séquence du groupe Il purifié ou un polypeptide de fusion, par exemple un produit d'expression des systèmes MBP, GST, ou His-tag. L'antigénicité spécifique peut être déterminée en utilisant diverses méthodes connues de l'homme du métier, en particulier les techniques de Western-Blot, Dot-Blot, et ELISA, décrites ci-dessous. Dans la technique de Western-Blot, la préparation protéique à tester est soumise à une électrophorèse sur gel SDS-PAGE. Après transfert sur une membrane de nitrocellulose, le matériel est incubé avec un antisérum hyper-immmun monospécifique obtenu après avoir immunisé un animal avec le matériel référent ; c'est-à-dire dans le cas présent, avec un polypeptide ayant une séquence d'acides aminés du groupe Il. Cet antisérum est au préalable dilué dans un domaine de dilution allant d'environ 1. 50 à 1 5000, de préférence d'environ 1:100 à 1#500. L'antigénicité spécifique est révélée lorsqu'une bande correspondant au produit présente une réactivité à l'une des dilutions ci-dessus. Dans le test ELISA, on utilise de préférence une préparation protéique purifiée, bien qu'un extrait cellulaire entier puisse être également utilisé. Environ 100 l d'une préparation à environ 10 g/ml sont distribués dans les puits d'une plaque. La plaque est incubée pendant deux heures à 37 C puis une nuit à 4 C. La plaque est ensuite lavée avec une solution saline de tampon phosphate (PBS) comprenant 0,05 % de Tween 20 Les puits sont saturés avec 250 l de PBS contenant 1 % d'albumine de sérum bovin (BSA) pour empêcher la liaison non spécifique d'anticorps. Après une heure d'incubation à 37 C, la plaque est lavée avec le tampon PBS/Tween L'antisérum est dilué en série dans du tampon PBS/Tween contenant 0,5 % BSA 100 l de cette dilution sont ajoutés par puits La plaque est incubée pendant 90 minutes à 37 C, lavée et évaluée selon les procédures standard Par exemple, lorsque des anticorps spécifiques sont produits chez des lapins, un conjugué peroxydase de chèvre anti-lapin est ajouté au puits. L'incubation est réalisée pendant 90 minutes à 37 C et la plaque est ensuite lavée. La réaction est mesurée par colorimétrie (une réaction est positive lorsque la valeur de densité optique est de 1 si la dilution est d'au moins 1#50, de préférence d'au moins 1 500). Dans le test Dot-Blot, on utilise de préférence une protéine purifiée, étant entendu qu'il est également possible d'utiliser un extrait cellulaire entier Une solution protéique à environ 100 g/ml est diluée deux fois en série dans un tampon Tris-HCI 50mM, pH 7,5.100 l de chaque dilution sont appliqués à une membrane de nitrocellulose (appareil BioRad) Le tampon est enlevé en appliquant du vide au système. Les puits sont lavés par addition de 50 mM de tampon Tris-HCI (pH : 7,5) et la membrane est séchée à l'air. La membrane est ensuite saturée dans un tampon bloquant (50 mM Tris-HCI (pH 7,5) 0,15M NaCl, 10 g/l de lait écrémé) et incubée avec une dilution d'antisérum allant d'environ 1. 50 à 1. 5000, de préférence à environ 1:500. La réaction est révélée conformément aux procédures standard Par exemple, lorsque des anticorps spécifiques sont produits chez des lapins, un conjugué peroxydase de chèvre anti-lapin est ajouté aux puits L'incubation est réalisée pendant 90 minutes à 37 C. La réaction est développée avec le substrat approprié et mesurée, par exemple par colorimétrie, par l'apparition d'une tache colorée (une réaction est positive lorsqu'une tache colorée apparaît en association avec une dilution d'au moins 1:50, de préférence d'au moins 1:500). La présente invention a également pour objet (i) une composition pharmaceutique contenant une quantité thérapeutiquement ou prophylactiquement efficace d'un polypeptide de l'invention ; (ii) une méthode pour induire une réponse immune contre les souches pathogènes de Neisseria chez un vertébré, par administration audit vertébré d'une quantité immunogéniquement efficace d'un polypeptide de l'invention pour provoquer une réponse immune, en particulier une réponse immune protectrice contre les souches pathogènes de Neisseria ; et (iii) une méthode de prévention et/ou de traitement d'une infection par les souches pathogènes de Neisseria, par administration d'une quantité thérapeutique ou prophylactique d'un polypeptide de l'invention à un individu nécessitant un tel traitement. Les compositions immunogènes de l'invention peuvent être administrées par n'importe quelle voie conventionnelle dans le domaine de la vaccination, en particulier par la voie parentérale (par exemple, sous-cutanée, intra-dermique, intra-musculaire, intraveineuse ou intra-péritonéale). Le choix de la voie d'administration dépend d'un certain nombre de paramètres tel que l'adjuvant associé au polypeptide. Une composition de l'invention contient au moins un polypeptide tel que défini précédemment. Il peut également contenir au moins un antigène supplémentaire de Neisseria meningitidis et/ou Neissena gonorrhoeae. Les polypeptides de l'invention peuvent être formulés avec des liposomes, de préférence des liposomes neutres ou anioniques, des microsphères, des ISCOMS, des particules "virus-like" pour faciliter le transfert du polypeptide et/ou augmenter la réponse immune L'administration peut être réalisée par une dose unique ou par des doses répétées si nécessaire à des intervalles qui peuvent être déterminés par l'homme du métier. Par exemple, une dose initiale peut être suivie de trois doses de rappel à des intervalles d'une ou plusieurs semaines ou d'un ou plusieurs mois. La dose appropriée dépend de nombreux paramètres incluant l'individu traité (adulte ou enfant), l'antigène vaccinal particulier, la voie d'administration et la fréquence d'administration, la présence ou l'absence ou encore le type d'adjuvant, et l'effet désiré (par exemple, protection et/ou traitement) et peut être déterminée par l'homme du métier. Si la voie d'administration est parentérale, la dose est préférentiellement inférieure à 1 mg, de préférence d'environ 100 g Les polypeptides et polynucléotides de l'invention utilisés en tant qu'agents vaccinaux, peuvent être utilisés de manière séquentielle, dans un procédé d'immunisation en plusieurs étapes. Par exemple, un vertébré peut être initialement sensibilisé avec un vecteur vaccinal de l'invention, tel qu'un poxvirus, par exemple par la voie parentérale, puis être stimulé deux fois avec le polypeptide codé par le vecteur vaccinal. Un polypeptide de l'invention peut également être utile comme agent de diagnostic pour détecter la présence d'anticorps anti-Neisseria meningitidis et/ou anti-Neisseria gonorrhoeae dans un échantillon biologique tel qu'un échantillon de sang. La présente invention a également pour objet des anticorps monospécifiques dirigés contre les polypeptides de l'invention. Par "anticorps monospécifique" on entend un anticorps capable de réagir de manière spécifique avec un polypeptide de Neisseria de l'invention De tels anticorps peuvent être polyclonaux ou monoclonaux, et peuvent être des anticorps recombinants par exemple chiménques (par exemple, constitués par une région variable d'origine munne associée à une région constante d'origine humaine), humanisés et/ou à chaîne unique Lesdits anticorps peuvent être également sous la forme de fragments d'immunoglobuline par exemple de fragments F (ab)'2 Fab. Les anticorps de l'invention peuvent être de n'importe quel isotype par exemple IgA ou IgG, les anticorps polyclonaux pouvant être d'un isotype unique ou pouvant contenir un mélange de plusieurs isotypes. Les anticorps de l'invention dirigés contre les polypeptides de l'invention, peuvent être produits et identifiés en utilisant des méthodes immunologiques standard, par exemple l'analyse de Western-Blot, un essai Dot-Blot, un test ELISA (Coligan et al, Current Protocols in Immunology (1994) John Wiley & Sons, Inc., New York, NY). Lesdits anticorps peuvent être utilisés dans des procédés de diagnostic pour détecter la présence d'un antigène de Neissena meningitidis dans un échantillon tel que notamment un échantillon biologique (par exemple du sang). Les anticorps de l'invention peuvent également être utilisés dans des procédés de chromatographie par affinité pour purifier un polypeptide de l'invention Enfin, de tels anticorps peuvent également être utilisés dans des méthodes d'immunisation passive prophylactique ou thérapeutique. La présente invention a également pour objet une méthode de diagnostic pour la détection de la présence de souches pathogènes de Neisseria dans un échantillon biologique comprenant la mise en contact dudit échantillon biologique avec un anticorps, ou un polypeptide de l'invention, de telle sorte qu'un complexe immun soit formé, et la détection dudit complexe indicatrice de souches pathogènes de Neisseria dans l'organisme dont provient l'échantillon. L'homme du métier comprend que le complexe immun est formé entre un composant de l'échantillon et l'anticorps ou le polypeptide de l'invention, toute substance non liée pouvant être éliminée préalablement à la détection du complexe. Ainsi, un réactif de type polypeptide peut être utilisé pour la détection de la présence d'anticorps anti-Neisseria meningitidis et/ou Neisseria gonorrhoeae dans un échantillon, tandis qu'un anticorps de l'invention peut être utilisé comme réactif pour tester la présence de polypeptide de Neisseria meningitidis et/ou Neisseria gonorrhoeae dans un échantillon. Pour une utilisation dans des applications de diagnostic, le réactif (par exemple l'anticorps ou le polypeptide de l'invention) peut être à l'état libre ou immobilisé sur un support solide, par des moyens directs ou indirects. Les moyens directs incluent l'adsorption passive ou la liaison covalente entre le support et le réactif. Par moyen indirect, on entend qu'une substance qui interagit avec ledit réactif est fixée au support solide. Par exemple, si un réactif de type polypeptide est utilisé, un anticorps qui se lie à celui-ci peut servir de substance anti-réactif, étant entendu que celle-ci se lie à un anticorps qui n'est pas impliqué dans la reconnaissance des anticorps dans les échantillons biologiques. Parmi les moyens indirects pouvant être utilisés, on peut également citer le système ligand récepteur, une molécule telle qu'une vitamine pouvant être greffée sur le réactif de type polypeptide et le récepteur correspondant pouvant être immobilisé sur la phase solide. Ceci est illustré par le système biotine-streptavidine. On peut également ajouter au réactif une queue peptidique par génie chimique ou génie génétique, et immobiliser le produit greffé ou fusionné par adsorption passive ou liaison covalente avec la queue peptidique. La présente invention a également pour objet un procédé de purification, à partir d'un échantillon biologique, d'un polypeptide de Neisseria de l'invention, par chromatographie d'affinité avec un anticorps monospécifique de l'invention. Ledit anticorps est de préférence d'isotype IgG. Selon un exemple de réalisation, un échantillon biologique, de préférence dans une solution tampon, est appliqué à un matériel chromatographique, de préférence équilibré avec le tampon utilisé pour diluer l'échantillon biologique, de telle sorte que le polypeptide de l'invention (c'est-àdire l'antigène) puisse adsorber sur le matériel. Les composants non liés sont lavés et l'antigène est ensuite élué avec un tampon d'élution approprié, tel qu'un tampon Glycine ou un tampon contenant un agent chaotropique, par exemple la guanidine HCI, ou une forte concentration en sel (par exemple, 3 M MgCl2). Les fractions éluées sont recueillies et la présence d'antigène est détectée par exemple par mesure de l'absorbance à 280 nm La présente invention a également pour objet (i) une composition pharmaceutique contenant une quantité thérapeutiquement ou prophylactiquement efficace d'un anticorps monospécifique de l'invention ; et (ii) une méthode de prévention et/ou de traitement d'une infection par les souches pathogènes de Neisseria, par administration d'une quantité thérapeutique ou prophylactique d'un anticorps monospécifique de l'invention à un individu nécessitant un tel traitement. A cette fin, l'anticorps monospécifique de l'invention est de préférence d'isotype IgG, et de préférence fixe le complément. Ledit anticorps monospécifique selon l'invention peut être administré seul ou en mélange avec au moins un autre anticorps monospécifique, spécifique d'un polypeptide de Neisseria meningitidis et/ou Neisseria gonorrhoeae différent, selon l'invention. La quantité d'anticorps peut être déterminée facilement par l'homme du métier Par exemple, une administration quotidienne d'environ 100 à 1000 mg d'anticorps sur une semaine ou trois doses quotidiennes d'environ 100 à 1000 mg d'anticorps sur deux ou troisjours, peut être une posologie efficace. L'efficacité thérapeutique ou prophylactique peut être évaluée en utilisant des méthodes standard connues de l'homme du métier, par exemple en mesurant l'induction d'une réponse immune ou l'induction d'une immunité protectrice et/ou thérapeutique (chez des souris ou des rats nouveaux-nés), par évaluation de la charge bactérienne dans le liquide céphalo-rachidien. La protection peut être déterminée en comparant le degré d'infection de Neisseria à un groupe contrôle. La protection est mise en évidence lorsque l'infection est réduite par comparaison au groupe contrôle. Une telle évaluation peut être faite avec les polynucléotides, les vecteurs vaccinaux, les polypeptides ainsi que les anticorps selon l'invention. L'efficacité thérapeutique ou prophylactique d'un produit selon l'invention (polynucléotide ou polypeptide) peut être aussi évaluée en test de bactéricidie tel que décrit par Danve et al , Vaccine (1993) 11 (12) .1214, à l'encontre de la souche méningoccoque d'origine du polynucléotide ou polypeptide utilisé. Dans le domaine des vaccins méningoccoques, le test de bactéricidie est en effet reconnu comme étant le test de référence à partir duquel on peut valablement prédire l'intérêt vaccinal d'un produit. En bref, on administre un produit selon l'invention à des animaux tels que le lapin afin d'obtenir un antisérum à l'encontre de ce produit. Puis cet antisérum est testé pour sa capacité de lyse. Le titre de bactéricidie d'un antisérum représente l'inverse de la dilution de cet antisérum pour lequel 50 % de la charge en méningoccoques est lysée. On considère que l'antisérum est bactéricide lorsque le titre est supérieur à 4 vis à vis de la souche méningoccoque d'origine du polynucléotide ou polypeptide utilisé. Dans ce cas-là, il est démontré que le produit à l'encontre duquel l'antisérum a été généré, est potentiellement intéressant d'un point de vue pharmaceutique. Les exemples suivant illustrent l'invention sans en limiter la portée. Légende de la figure La figure en annexe représente le vecteur pCAMyc-His utilisé comme vecteur de clonage. Détails de la stratégie d'identification des ORF : Afin de sélectionner les séquences ORF spécifiques des souches pathogènes du genre Neisseria, une amplification par PCR est menée sur les séquences des 118 ORFs retenues après analyse par le logiciel Gene # # Jocke , Codon Use , et la recherche d'homologies. Seules les séquences pour lesquelles l'amplification chez N. lactamica est négative (séquences appelées " lactamica- ") sont retenues. Afin de vérifier que ces résultats négatifs ne sont pas des " faux-négatifs ", les séquences lactamica- retenues sont soumises à un dot blot. A - Amplification par PCR : A.1. Extraction des ADN génomiques: Les ADN génomiques de l'ensemble des souches de Neisseria utilisées dans cette étude ont été préparés selon un protocole identique Les souches de N. meningitidis, N. lactamica, N. flava, N. subflava et N. mucosa ont été cultivées sur boite de milieu MHA (Muller Hinton Agar, Difco), les N. gonorrhoeae ont été cultivées sur boite de milieu MHA supplémenté par 10% de sang cuit de cheval (Biomérieux) et 1 % d'Isovitalex (Biomérieux). La culture se fait à 37 C pendant 18 h sous une atmosphère contenant 10% C02 une nuit à 37 C. Puis les cellules sont récoltées, lavées dans du tampon phosphate PBS (pH 7. 2) et l'ADN est extrait selon le protocole D du Kit " Rapid Prep genomic DNA isolation kit for cells and tissue " (Pharmacia Biotech) Les ADN génomiques ont alors été contrôlés sur gel d'agarose pour leur intégrité et par réaction PCR pour leur pureté A. 2. Réaction de PCR pour cribler les ORFs absentes dans N. lactamica 2314 : Une amplification PCR a été réalisée sur les ADN génomiques de la souche N. meningitidis ATCC 13090 et N. lactamica 2314 (ATCC 23970) selon le protocole suivant La réaction de PCR a été réalisée sur un volume de 50 l avec 10 ng d'ADN génomique, 250 M de chacun des dNTPs, 300 nM de chacune des amorces, Tampon Taq DNA polymerase 1X, et 2 u de Taq DNA Polymerase (Appligène). Les cycles d'amplification sont : 97 C 45 secondes 25 cycles 56 C 1 minute 25 cycles 72 C 2.30 minutes 25 cycles Pour chacune des ORFs analysées, des contrôles positifs et négatifs de la réaction PCR ont été réalisés. A ce stade, seules les ORFs N. meningitidis + et N. lactamica - sont retenues. B - Sélection des ORFs N. meningitidis+ N. lactamica- par dot blot sur ADN génomique: L'absence d'un produit d'amplification par PCR d'une ORF avec de l'ADN génomique de N. lactamica 2314 comme matrice, ne certifie pas l'absence de cette ORF dans le génome de N. lactamica 2314. En effet, une certaine variabilité dans la région où devraient s'hybrider les oligonucléotides peut être responsable de l'absence de produit amplifié pour une ORF donnée. Dans ce contexte, une vérification supplémentaire est mise en oeuvre par dot blot sur ADN génomique en utilisant comme sonde les produits d'amplification génomique sur la souche de N. meningitidis correspondant à chacune des phases de lecture identifiées. Les filtres du dot blot contiennent de l'ADN génomique des souches suivantes 2 souches de N. lactamica 8064, 2314, une souche de N. flava ATCC 30008, une souche de N mucosa ATCC 9297,3 souches de N. meningitidis de sérogroupe B ATCC13090, M982, B 16B6, une souche de N. meningitidis de sérogroupe A Z2491, une souche de N. meningitidis de sérogroupe C (souche Z4182), 2 souches de N gonorrhoeae MS11 et FA1090 Cette analyse en dot blot permet de valider l'absence de l'ORF dans N. lactamica 2314 et 8064 et elle est aussi indicatrice du degré de variabilité d'une ORF au sein des souches de Neisseria. La technique de dot blot utilisée est la suivante. Environ 50ng d'ADN génomique dénaturé 5 min à 100 C des différentes souches de Neisseria sont déposés sous vide sur une membrane de nitrocellulose Hybond N+ (Amersham) placée entre les mâchoires d'un appareil à dot blot (Bio-Rad). Puis l'ADN est fixé sur les membranes 5 min à un rayonnement UV 315nm. Les membranes sont incubées dans un tampon de préhybridation (contenant de l'ADN de sperme de saumon dénaturé) Elles sont ensuite hybridées avec une sonde correspondant au produit d'amplification de l'ORF d'intérêt, marquée selon un protocole de marquage froid, comme le système 'DIG DNA labelling and détection kit' (Boehringer Mannheim). L'ORF qui ne s'hybride pas sur l'ADN génomique de N. lactamica 2314 et 8064 est retenue définitivement comme candidat vaccinal potentiel. Exemple I: Clonage 1 Amplification par PCR Chacune des ORFs a été amplifiée par PCR à partir de l'ADN génomique de N memngitidis sérogroupe B (souche ATCC 13090), selon un protocole standard. Deux oligonucléotides, amorces du côté N-terminal et du côté CTerminal ont été définis pour chacune des séquences ORF de l'invention. L'amorce du côté N-Terminal comprend un site de restriction enzymatique pour le clonage, une séquence Kozak CCACC pour l'initiation de la traduction (M Kozak,J. Mol. Biol. 196 : 947-950), l'ATG de l'ORF potentielle et environ 17 bases spécifiques de la partie 5' de l'ORF. L'amorce du côté C-Terminal a été définie de manière à ce que l'ORF clonée soit en fusion dans sa partie 3' avec une répétition de 8 histidines et un codon stop présents dans le vecteur derrière le site multiple de clonage, d'où l'insertion d'une base "A" pour garder la bonne phase de lecture après le clonage et la disparition du codon stop de l'ORF L'amorce du côté C-Terminal comprend ainsi un site de restriction enzymatique pour le clonage, une base " A ", puis environ 20 bases spécifiques de la partie 3' du gène à partir du codon précédent le codon stop. Après recherche des sites de restriction absents chez chacune des ORFs à l'aide du sous-programme MapDraw de DNASTAR (Lasergene Software), les sites de restriction Xbal en 5' et Bglll en 3' sont utilisés pour l'ORF SEQ ID n 19. Pour l'ORF SEQ ID n 41, les sites Spel en 5' et Bglll en 3' sont utilisés Les sites de restriction Xbal en 5' et BamHI en 3' sont utilisés pour cloner les ORFs restantes. Le mélange de PCR comprend pour un volume final de 100 l, 10-50 ng ADN génomique, les amorces N-Terminale et C-Terminale à 200 nM chacun, les dNTPs à 250 uM chacun, le tampon PCR 1X (Composition du tampon PCR 10X: 200 mM Tris-HCI (pH8.8), 20 mM MgS04, 100 mM KCI, 100 mM (NH4)2S04, 1% TritonX-100, 1mg/ml de sérumalbumine de b#uf exempte de nucléase) et 2,5 U de Pfu Turbo DNA Polymerase (Stratagene) L'amplification se fait comme suit Etape Température ( C) Temps (min ) Nombre de cycles Dénaturation 97 0.45 25 Hybridation 55-65 1 25 Elongation 72 1lkb ADN 25 Les amorces utilisées sont les suivantes : N ORF SEQ ID n Amorce 5' Amorce 3' (référence interne) 22 1-2 GCT CTA GAC CAC CAT GTC TGA AGA CGG GAT CCA GAA ATG GCT GGA TTC AAA ATT GAA AAT GAG GCT ATC AG 41 3-4 GCT CTA GAC CAC CAT GAA ACA CTT CGG GAT CCA ATA CGT AGG ACT TGG ACT CAT CG GTC 42-43 5-6 GCT CTA GAC CAC CAT GAA AAA ATC CGG GAT CCA TTG CGG ATA AAC ATA CCT TTT CGT TC TTC CGC C 47 7-8 GCT CTA GAC CAC CAT GCG AAC CGG GAT CCA GAA CCG GTA GCC GAC CCC AAC CTT C TAC GCC GAC 55 9-10 GCT CTA GAC CAC CAT GAA CAC ACG CGG GAT CCA GCA ACG GCC TGC CAT CAT CGT TTC CGC TTT AAG 68 11-12 GCT CTA GAC CAC CAT GCT GAC GTT CGG GAT CCA CGG CAG AGG CAC TAT CGG ACT G GAT TCC 71 13-14 GCT CTA GAC CAC CAT GGG CAT CCA CGG GAT CCA CAA AAG TTC CAG AAA TCT CGA CTT C ATC TAA CTC N ORF SEQ ID n Amorce 5' Amorce 3' (référence interne) 72 15-16 GCT CTA GAC CAC CAT GAA TAG ACC CGG GAT CCA TGC CGC TTG GGG GAG CAA GCA ACC GC 73 17-18 GCT CTA GAC CAC CAT GAT GAA TGT CGG GAT CCA CAG TTT GCC CGA CAT CGA GGC AGA G AC 74 19-20 GCT CTA GAC CAC CAT GAA ATT TTT GAA GAT CTA GAA ACT GTA ATT CAA TCC TGC TCC GTT GAA G 98 21-22 GCT CTA GAC CAC CAT GAT TGA ATT CGG GAT CCA ACC CTG CGA CGA GTT TGT CCG AGC GCG 116 23-24 GCT CTA GAC CAC CAT GCA ATA CAG CGG GAT CCA GTC CTT TTT CGC ACC CAC ACT GGC TTG AAG 122 25-26 GCT CTA GAC CAC CAT GGA GCA GTC CGG GAT CCA AGC TGT TTG GCG ATT GGG CAA ATT C TCG GTG N ORF (référence interne) SEQ ID n Amorce S' Amorce 3' 125 27-28 GCT CTA GAC CAC CAT GCA AAA CGG CGG GAT CCA GTG CCT GCG CAG CTT CGG GGG AAA G GGA ATC 128 29-30 GCT CTA GAC CAC CAT GAC ATT GCT CGG GAT CCA TTC CGC AAA TAC CTG CAA TCT AAT GAT AAT G TTT CCA ACC 152 31-32 GCT CTA GAC CAC CAT GAA ACA ATC CGG GAT CCA TAC TTG GGC GCA ACA CGC CCG TGA C 153 33-34 GCT CTA GAC CAC CAT GAA TGT TTA CGG GAT CCA TTT TTT AGA CGT ATT CGG TTT CCC TTT AGT CG 155 35-36 GCT CTA GAC CAC CAT GAT GAG TCA CGG GAT CCA TCC AGT TTT TGC TCG ACA CTC TGC C AAG GC 156 37-38 GCT CTA GAC CAC CAT GCC TTC GAG CGG GAT CCA TCG TTC TTC AAT CTC CAA AAA CTG G CAC AAA CG 157 39-40 GCT CTA GAC CAC CAT GCA CCT ATG CGG GAT CCA TTC AAT TCG CTT CAA TGG AAA G CAA TG N ORF SEQ ID n Amorce 5' Amorce 3' (référence interne) 158 41-42 GGA CTA GTC CAC CAT GGC TGC CAA GAA GAT CTA AGC CGC GTT CCC TTC CCA ACG TTA CCG CAA AAA ATC 159 43-44 GCT CTA GAC CAC CAT GCC GCA AAT CGG GAT CCA AAA ACA ATC TTC CGG TAA AAT TCC C CAC CC 161 45-46 GCT CTA GAC CAC CAT GCG CAC GCC CGG GAT CCA TTG GGC AAC GAC GAA GTT TTG TTG GGC AC 163-1 47-48 GCT CTA GAC CAC CAT GAG AAT AGA CGG GAT CCA TGG CTC AAT CCT TTC GAT CAC ACC TGC 163-2 49-50 GCT CTA GAC CAC CAT GAT TCA CGT CGG GAT CCA ACC TGC TTC ATG GGT TTC GGC AGT G GAT TC 167-168 51-52 GCT CTA GAC CAC CAT GAA TTC GAC CGG GAT CCA AAT CCC TCT GCC GTA CGC AAG TAA AAC TTT G 2 - Clonage, transformation et sélection des recombinants Le vecteur de clonage utilisé est le vecteur pCA/Myc-His ou pM1070 de 6. 357 kb (cf figure), issu du plasmide pCDNA 3 1 (Invitrogen) Le pCA/Myc-His comprend notamment le promoteur ie1 de CMV (bases 249-902), l'intron A du gène ie1 de CMV (Chapman et al , 1991 Nucleic Acids Research, 19,3979-3986), un site multiple de clonage (bases 1792-1852) avec les sites Pmll, EcoRV, Notl, Xbal, BamHl, Kpnl et Hindlll, une séquence codant pour une polyhistidine et un codon stop (bases 1908-1928), une séquence de terminaison 3'bgh (bases 1853-2197) et le gène de résistance à l'ampicilline pour la sélection des clones recombinants dans E. coli. Après purification (Kit GeneClean Bio101), les produits d'amplification PCR sont digérés 2 heures à 37 C par les enzymes adéquates (Xbal-BamHI, Xbal-Bglll, ou Spel-Bglll) dans un volume réactionnel final de 20 l Les produits de digestion sont alors ligués avec le vecteur pCA/Myc-His préalablement digéré par Xbal et BamHl selon le protocole de "Rapid DNA Ligation Kit" (Boehringer Mannheim). 15 l de la ligature est utilisé pour transformer 100 l de cellules compétentes E. coli XLI-blue (Novagen). Les cellules sont incubées 30 minutes dans la glace, 30 secondes à 42 C et 2 minutes dans la glace. Puis on ajoute 500 l de milieu LB sans antibiotique et on incube 1 heure à 37 C Ensuite 50 et 550 l de la culture sont étalés sur des boites de milieu LB plus ampicilline (50 g/ml concentration finale) et incubés une nuit à 37 C Le lendemain 36 colonies sont mises en culture dans 2 ml de LB plus ampicilline (50 g/ml) et incubées une nuit à 37 C. Le lendemain l'ADN plasmidique est extrait selon le protocole Qiagen mini-prep (Qiagen) et les recombinants sont identifiés par restriction enzymatique suivi d'une électrophorèse sur gel d'agarose. Les jonctions de clonage sont ensuite vérifiées par séquençage. Exemple Il : Evaluation de l'activité protectrice des ORF de l'invention A. Préparation de l'ADN destiné aux expériences d'immunisations : Une colonie isolée d'un clone recombinant est utilisée pour inoculer une préculture en milieu LB+ ampicilline et 5 ml de cette préculture représente l'inoculat d'une culture de 2,5 litres en milieu LB+ ampicilline. Le protocole de purification pour préparer l'ADN plasmidique est celui décrit dans le Kit EndoFree Giga (Qiagen). L'ADN purifié est élué de la colonne de purification avec un tampon Tris-HCI 10 mM EDTA 1 mM pH 8 et conservé à - 20 C Avant l'injection, le plasmide recombinant purifié est dilué à raison de 100 g/ml avec de l'eau (de qualité pour préparation injectable) et la concentration en NaCI est amenée à 150 mM B Production d'un sérum polyclonal spécifique: B 1. Hyperimunisation dans un modèle animal - Le modèle animal utilisé est la souris ou le lapin. La voie d'administration de l'ADN injecté est la voie intramusculaire ou la voie intradermique. Les plasmides recombinants à injecter sont éventuellement appliqués sur des billes s'ils sont injectés chez l'animal avec un appareil gene gun (BioRad). Le protocole d'immunisation suit un schéma comportant deux injections à 3 semaines d'intervalles. B 2. Analyse de l'activité bactéricide des anticorps induits : Dix jours après la dernière injection, les animaux sont saignés et les sera sont analysés avec le test de bacténcidie selon le protocole de Danve et al., Vaccine (1993) 11 (12) :1214. Brièvement, les sera sont incubés à différentes dilutions (raison 2) en présence de complément de lapin et de méningococoques cultivés en présence ou en absence d'un agent chélatant du fer Le titre de bactéricidie d'un sérum représente l'inverse de la dilution de cet antisérum pour lequel 50% des bactéries sont lysées. On considère que l'antisérum n'est pas bactéricide lorsque son titre est inférieur à 4 contre la souche homologue Quand le titre de bactéricidie correspond à une séroconversion d'un facteur 4 contre la souche homologue, l'activité bactéricide de l'antisérum est analysée vis-à-vis des autres souches de Neisseria pour mesurer l'étendue de la réactivité croisée de l'antisérum d'intérêt. Exemple III Production de protéines recombinantes purifiées 1. Production recombinante de protéines a. Préparation des transformants : Le produit de PCR obtenu est ensuite digéré à 37 C pendant deux heures avec des enzymes de restriction dans 20 l de volume réactionnel. Le produit de digestion est ligaturé dans un plasmide pET28a (Novagen), clivé de manière similaire, qui est déphosphorylé avant la ligature par traitement avec la phosphatase alcaline intestinale de veau. Le gène de fusion construit de cette manière permet la purification par affinité en une étape de la protéine de fusion résultante en raison de la présence de résidus histidine à l'extrémité N-terminale de la protéine de fusion qui sont codés par ce vecteur La réaction de ligature (20 l) est effectuée à 14 C une nuit, avant transformation de 100 l de cellules compétentes fraîches E. coli XL1blue (Novagen). Les cellules sont incubées sur de la glace pendant deux heures puis soumises à un choc thermique à 42 C pendant 30 secondes avant d'être remises dans la glace pendant 90 secondes. Les échantillons sont ensuite ajoutés à 1 ml de bouillon LB en l'absence de sélection et cultivés à 37 C pendant deux heures. Les cellules sont ensuite étalées sur du milieu gélosé LB additionné de kanamycine (50 g/ml de concentration finale) à une dilution 10x, et sont incubées une nuit à 37 C. Le jour suivant, 50 colonies sont repiquées sur des boîtes secondaires et sont incubées à 37 C une nuit b. Production de la protéine : Les transformants stockés (10 NI) sont étalés sur des boîtes de sélection et cultivés une nuit à 37 C. Quelques cellules sont recueillies à partir de la boîte utilisée comme inoculum pour une culture starter une nuit (3 ml) à 37 C. Le jour suivant, un échantillon (temps T=0) est recueilli et centrifugé à 14 000 tpm pendant 3 minutes. La culture starter est ensuite utilisée pour inoculer un milieu LB contenant de la kanamycine (100 g/ml) à une dilution de 1. 50 (densité optique de départ D0600 = 0,05-0,1). Les cellules sont cultivées à une D0600 de 1,0, un échantillon est recueilli pour une SDS-PAGE (échantillon de pré-induction) et la culture restante est induite avec 1 mM d'IPTG. Les cultures sont cultivées pendant quatre heures et des échantillons sont prélevés toutes les heures. La culture est centrifugée à 600 x g pendant 20 minutes à 4 C. Le surnageant est écarté et les culots sont resuspendus dans 50 mM de Tris-HCI (pH : 8,0), 2 mM EDTA, et recentrifugé. Le surnageant est écarté et les cellules sont stockées à -70 C 2. Purification des protéines Les culots obtenus à partir d'un litre de culture préparé selon l'exemple 1.4 précédent sont séchés et resuspendus dans 20 ml de 20 mM Tris-HCI (pH 8. 0), 0. 5 M NaCI, 5 mM Imidazole, refroidis dans la glace. Du lysozyme est ajoutée à une concentration de 0,1 mg/ml et la suspension est homogénéisée en utilisant un homogénéiseur à haute vitesse (Turrax) puis traitée avec un sonicateur (Branson, Sonofier 450). De la Benzonase (Merck) est utilisée à une concentration finale de 1 U/ml pour éliminer l'ADN. La suspension est centrifugée à 40 000 x g pendant 20 minutes et le surnageant est filtré à travers une membrane de 0,45 m. Le surnageant est chargé sur une colonne IMAC (12 ml de résine) qui a été préparée en immobilisant des cations Ni++ selon les recommandations du fabricant (Pharmacia). La colonne est lavée avec 10 volumes de colonnes de 20 mM Tris-HCI (pH 8 0), 0 5 M NaCl, 60 mM Imidazole La protéine recombinante est éluée avec six volumes de 20 mM Tris-HCI (pH : 7 9), 0. 5 M NaCI, 500 mM Imidazole, 0 1 % Zwittergent 3-14. Le profil d'élution est contrôlé en mesurant l'absorbance des fractions à une densité optique de 280 nm. Une fraction aliquote est analysée sur un gel SDS-PAGE et colorée avec du bleu de Coomassie (Phast System Pharmacia), et les fractions correspondant au pic de protéine sont ensuite regroupées et concentrées. Pour éliminer le tampon d'élution, la fraction est passée sur une colonne G24 Sephadex (Pharmacia), équilibrée dans du tampon PBS (pH : 7,4).La solution protéique est stérilisée par filtration à travers une membrane de 0,45 m, et la concentration protéique est déterminée par la microméthode BCA (Pierce). La solution protéique est stockée à -70 C. Exemple IV : Production d'anticorps polvclonaux monospécifiques 1. Antisérum hyperimmun de lapin On injecte à des lapins de Nouvelle Zélande à la fois par voie cutanée et par voie intraveineuse 100 g (au total) du polypeptide purifié à l'exemple III, en présence d'adjuvant complet de Freund dans un volume total d'approximativement 2 ml. 21 et 42 jours après l'injection initiale, les doses de rappel qui sont identiques aux doses initiales, sont administrées de la même manière, à l'exception du fait que de l'adjuvant incomplet de Freund est utilisé. 15 jours après la dernière injection, le sérum de l'animal est recueilli, décomplémenté, et filtré à travers une membrane de 0,45 m. 2. Liquide d'ascites hyperimmun de souris On injecte à 10 souris par voie sous-cutanée 10-50 du polypeptide de fusion purifié obtenu à l'exemple ll, en présence d'adjuvant complet de Freund, dans un volume d'approximativement 200 l. 7 et 14 jours après l'injection initiale, des doses de rappel, qui sont identiques aux doses initiales, sont administrées de la même manière, à l'exception du fait que de l'adjuvant incomplet de Freund est utilisé 21 et 28 jours après l'injection initiale, les souris reçoivent 50 g de l'antigène seul par voie intrapéritonéale Au 21ème jour, on injecte également aux souris par voie intrapéritonéale, les cellules 180/TG CM26684 de sarcome (Lennette & Schmidt, Diagnostic procedures for viral, rickettsial, and chlamydial infections, (1979) 5th Ed. Washington DC, American Public Health Association) Les liquides d'ascites sont recueillis 10 à 13 jours après la première injection Exemple V : Purification des polypeptides de l'invention par immunoaffinité 1. Purification d'IgG spécifique Un sérum immun tel que préparé à l'exemple IV est appliqué à une colonne de protéine A Sépharose 4 Fast Flow (Pharmacia) équilibrée avec 100 mM Tris-HCI (pH. 8,0). La résine est lavée en appliquant 10 volumes de colonnes de 100 mM Tris-HCI et 10 volumes de 10 mM Tris-HCI (pH : 8,0) à la colonne. Les IgG sont éluées avec un tampon glycine de 0,1M (pH : 3,0) et sont recueillies par fraction de 5 ml auxquelles on ajoute 0,25 ml de Tris-HCI 1 M (pH 8,0). La densité optique de l'éluat est mesurée à 280 nm et les fractions contenant les IgG sont regroupées et si nécessaire stockées à - 70 C. 2. Préparation de la colonne Une quantité appropriée de gel Sépharose 4B activé par CNBr (1 g de gel séché fournissant approximativement 3,5 ml de gel hydraté, et la capacité du gel allant de 5 à 10 mg d'IgG couplée par ml de gel) fabriqué par Pharmacia (17-0430-01) et suspendue dans un tampon HCI de 1 mM et lavée avec un buchner par addition de petites quantités de tampon HCI 1 mM. Le volume total du tampon est de 200 ml par gramme de gel. Les IgG purifiées sont dialysées pendant quatre heures à 205 C contre 5 volumes de tampon PBS de 500 mM (pH . 7,5). Puis elles sont diluées dans 500 mM de PBS (pH :7,5) pour une concentration finale de 3 mg/ml. Les IgG sont incubées avec le gel une nuit à 53 C, sous agitation Le gel est tassé dans une colonne de chromatographie et lavé avec 2 volumes de colonne de tampon phosphate, 500 mM (pH :7,5) puis un volume de tampon sodium 50 mM NaCI (pH 7,5) Le gel est ensuite transféré dans un tube puis incubé avec 100 mM d'éthanolamine, (pH : 7,5) pendant 4 heures à température ambiante sous agitation, puis lavé deux fois avec deux volumes de colonnes de PBS. Le gel est ensuite stocké dans du PBS merthiolate à 1/10 000. La quantité d'IgG couplé au gel est déterminée en mesurant la densité optique à 280 nm de la solution d'IgG et de l'éluat direct. 3. Adsorption et élution de l'antigène. Une solution d'antigène dans 50 mM Tris-HCI (pH : 8,0), 2 mM EDTA, par exemple, le surnageant obtenu à l'exemple 111.5 après traitement par la Benzonase, centrifugation et filtration à travers une membrane de 0,45 m, est appliquée à une colonne équilibrée avec 50 mM Tris-HCI (pH.8,0), 2 mM EDTA à une vitesse de flux d'environ 10 ml/heure. Puis, la colonne est lavée avec 20 volumes de 50 mM Tris-HCI (pH 8,0), 2 mM EDTA. De manière alternative, l'adsorption peut être réalisée en " batch " qui est laissé une nuit à 53 C, sous agitation. Le gel est lavé avec 2 à 6 volumes de tampon PBS 10 mM (pH : 6,8). L'antigène est élué avec un tampon glycine 100 mM (pH : 2,5). L'éluat est recueilli dans des fractions de 3 ml auquel on ajoute 150 l de tampon PBS 1 mM (pH 8,0). La densité optique est mesurée à 280 nm pour chaque fraction ; celles contenant l'antigène sont recueillies et stockées à -20 C. SEQ ID n 2 SEQ ID n 1 1/1 31/11 ATG TCT GAA GAA AAA TTG AAA ATG AGT TTC GAG CCA ACC GTA ATC GAA CAT TTG GGT GTA -Met ser glu glu lys leu lys met ser phe glu pro thr val île glu his leu gly val 61/21 91/31 AAG ATG TAT TCG CAC ACT GTT CCT GCG ATT GCC GAG TTG ATA GCG AAT GCC TAC GAT GCA lys met tyr ser his thr val pro ala île ala glu leu ile ala asn ala tyr asp ala 121/41 151/51 TGT GCT ACG GAA GTG GAA GTT AGG TTA TTC GAT AAA CCG GAG CAT AAA ATC GTT ATC AAA cys ala thr glu val glu val arg leu phe asp lys pro glu his lys ils val île lys 181/61 211/71 GAT AAT GGT ATA GGA ATG AGC TTC GAT GAA ATC AAT GAT TTT TAT TTG AGA ATC GGT CGG asp asn gly ile gly met ser phe asp glu ile asn asp phe tyr leu arg ile gly arg 241/81 271/91 AAC AGA AGG GAA GAA AAA CAA GCT TCC CCG TGC GGA AGA ATT CCA ACG GGT AAA AAA GGC asn arg arg glu glu lys gin ala ser pro cys gly arg ile pro thr gly lys lys gly 301/101 331/111 CTT GGT AAA TTG GCA TTA TTC GGG CTT GGC AAC AAA ATT GAA ATT TCT ACT ATC CAG GGA leu gly lys leu ala leu phe gly leu gly asn lys ile glu ile ser thr ile gin gly 361/121 391/131 AAC GAA AGG GTT ACT TTT ACT TTG GAT TAT GCA GAG ATT CGA AGA AGC AAG GGT ATT TAT asn glu arg val thr phe thr leu asp tyr ala glu ile arg arg ser lys gly ile tyr 421/141 451/151 CAA CCG GAG TTT CGA AAA GAA TCT GTT GAA TCC AAT ATC GAA AGC GGG ACA ACC ATA ACT gin pro glu phe arg lys glu ser val glu ser asn ile glu ser gly thr thr ile thr 481/161 511/171 TTA ACC GAA CTG ACG AAA AAG CAA GGA TAT CCG TTA GAT AAT TAT GTA GAG CAT CTT TCC leu thr glu leu thr lys lys gin gly tyr pro leu asp asn tyr val glu his leu ser 541/181 571/191 CGC TTG TTT GAT TTT CCG GCT CAG GAT TTT AAA ATC AAA GTA AGC TTG AAC GGC TCT GAA arg leu phe asp phe pro ala gin asp phe lys ile lys val ser leu asn gly ser glu 601/201 631/211 CCT AAA ATC ATT GAT GGA AAT CTA AAA TAT GAT CTT GTT ACC CCA CAA TTC GAA TGG GAA pro lys ile ile asp gly asn leu lys tyr asp leu val thr pro gin phe glu trp glu 661/221 691/231 TAC CAG GAT TTA GCA ACC AAT ATT TCA TCG 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841/281 871/291 ATC CGC CAA AAC AAT GGG AAA ATT GAA TAT GCA CCG TTT ACT GAA CCT AAA CCA CAG CCA ile arg gln asn asn gly lys ile glu tyr ala pro phe thr glu pro lys pro gln pro 901/301 931/311 ACG CCC AAG CAG CCT AAA AAA ACC GCA TGG GAA CCT GAT GAA ATT ATT TGG AAA AAA GTG thr pro lys gln pro lys lys thr ala trp glu pro asp glu ile ile trp lys lys val 961/321 991/331 ATT GCC GCG TTA TCG TTA AAG AAC CGT CCT AAT AAA ACC AAA ACT TTA CGC AAT ACA ATC ile ala ala leu ser leu lys asn arg pro asn lys thr lys thr leu arg asn thr ile 1021/341 1051/351 CAG GCA CTC ACA AAA TCC AAT GCA CAA GAA ACT GAC AAA CTG CTA CAA CAT TTA CAA GAT gin ala leu thr lys ser asn ala gin glu thr asp lys leu leu gin his leu gin asp 1081/361 GAC CCA AGT CCT ACG TAT TGA asp pro ser pro thr tyr OPA SEQ ID n 6 SEQ ID n 5 1/1 31/11 ATG AAA AAA TCC CTT TTC GTT CTC TTT CTG TAT TCA TCC CTA CTT ACC GCC AGC GAA ATC Met lys lys ser leu phe val leu phe leu tyr ser ser leu leu thr ala ser glu ile 61/21 91/31 GCC TAT CGC TTT GTA TTC 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GGT TTT TCC GGC TTC GTC CAC CAC GCC GGT ATC TTC ATT ACC CTG TCT GCC GTC GTC AGA gly phe ser gly phe val his his ala gly ile phe ile thr leu ser ala val val arg 961/321 991/331 GGG TTG ATT TTC CCG CTC GTA CAC CAT GTG GGT ACG GAT GGC AAC AAA TCC GGA CGA CAG gly leu ile phe pro leu val his his val gly thr asp gly asn lys ser gly arg gin 1021/341 1051/351 GTT TCC AAT GTT TAT TTC GCC AAC GTT GCC GGC AGT GCA TTG GGT CCG GTC CTT ATC GGC val ser asn val tyr phe ala asn val ala gly ser ala leu gly pro val leu ile gly 1081/361 1111/371 TTT GTG ATA CTT GAT TTC TTG TCC ACC CAA CAG ATT TAC CTG CTC ATC TGT TTG ATT TCT phe val ile leu asp phe leu ser thr gin gin ile tyr leu leu ile cys leu ile ser 1141/381 1171/391 GCT GCT GTC CCT TTG TTT TGT ACA CTG TTC CAA AAA AGT CTC CGA CTG AAT GCA GTG TCG ala ala val pro leu phe cys thr leu phe gin lys ser leu arg leu asn ala val ser 1201/401 1231/411 GTA GCA GTT TCC CTA ATG TTC GGC ATC CTC ATG TTC CTA CTG CCG GAT TCT GTC TTT CAA val ala val ser leu met phe gly ile leu met phe leu leu pro asp ser val phe gin 1261/421 1291/431 AAT ATT GCT GAC CGT CCG GAT CGG CTG ATT GAA AAC AAA CAC GGC ATT GTT GCG GTT TAC asn île ala asp arg pro asp arg leu ile glu asn lys his gly ile val ala val tyr 1321/441 1351/451 CAT AGA GAT GGT GAT AAG GTT GTT TAT GGG GCG AAT GTA TAC GAC GGC GCA TAC AAT ACC his arg asp gly asp lys val val tyr gly ala asn val tyr asp gly ala tyr asn thr 1381/461 1411/471 GAT GTA TTC AAT AGT GTC AAC GGC ATC GAA CGT GCC TAT CTG CTA CCC TCC CTG AAG TCT asp val phe asn ser val asn gly ile glu arg ala tyr leu leu pro ser leu lys ser 1441/481 1471/491 GGC ATA CGC CGC ATT TTC GTC GTT GGA TTG AGT ACA GGT TCG TGG GCG CGC GTC TTG TCT gly ile arg arg île phe val val gly leu ser thr gly ser trp ala arg val leu ser 1501/501 1531/511 GCC ATT CCG GAA ATG CAG TCG ATG ATC GTT GCG GAA ATC AAT CCG GCA TAC CGT AGC CTT ala ile pro glu met gin ser met île val ala glu ile asn pro ala tyr arg ser leu 1561/521 1591/531 ATC GCG GAC GAG CCG CAA ATC GCC CCG CTT TTG CAG GAC AAA CGT GTT GAA ATT GTA TTG île ala asp glu pro gin ile ala pro leu leu gin asp lys arg val glu ile val leu 1621/541 1651/551 GAT GAC GGT AGG AAA TGG CTG CGT CGC CAT CCT GAT GAA AAA TTC GAC CTG ATT TTG ATG asp asp gly arg lys trp leu arg arg his pro asp glu lys phe asp leu ile leu met 1681/561 1711/571 AAT ACG ACT TGG TAC TGG CGT GCC TAT TCC ACC AAC CTG TTG AGT GCG GAA TTT TTA AAA asn thr thr trp tyr trp arg ala tyr ser thr asn leu leu ser ala glu phe leu lys 1741/581 1771/591 CAG GTG CAA AGC CAC CTT ACC CCG GAT GGT ATT GTA ATG TTT AAT ACC ACG CAC AGC CCG gin val gin ser his leu thr pro asp gly ile val met phe asn thr thr his ser pro 1801/601 1831/611 CAT GCT TTT GCT ACC GCC GTA CAC AGT ATT CCC TAT GCA TAC CGC TAT GGG CAT ATG GTA his ala phe ala thr ala val his ser ile pro tyr ala tyr arg tyr gly his met val 1861/621 1891/631 GTC GGC TCG GCA ACC CCG GTA GTT TTC CCT AAT AAA GAA CTG CTC AAG CAA CGT CTC TCC val gly ser ala thr pro val val phe pro asn lys glu leu leu lys gin arg leu ser 1921/641 1951/651 CGG TTG ATT TGG CCG GAA AGC GGC AGG CAC GTA TTT GAC AGC AGC ACC GTG GAT GCT GCA arg leu ile trp pro glu ser gly arg his val phe asp ser ser thr val asp ala ala 1981/661 2011/671 GCA CAA AAG GTT GTC TCT CGT ATG CTG ATT CAG ATG ACG GAA CCT TCG GCT GGG GCG GAA ala gln lys val val ser arg met leu ile gin met thr glu pro ser ala gly ala glu 2041/681 2071/691 GTC ATT ACC GAC GAT AAT ATG ATT GTA GAA TAC AAA TAC GGC AGA GGG ATT TAA val ile thr asp asp asn met ile val glu tyr lys tyr gly arg gly ile OCH SEQ ID n 53 [SEQ nOS3 cys leu gly gly gly gly gly thr ser ala pro asp phe asn ala gly gly thr gly île gly ser asn ser arg ala thr thr ala lys ser ala ala val ser tyr ala gly île lys asn glu met cys lys asp arg ser met leu cys ala gly arg asp asp val ala val thr asp arg asp ala lys ile asn ala pro pro pro asn leu his thr gly asp phe thr asn pro asn asp ala tyr lys asn leu ile asn leu lys pro ala ile glu ala gly tyr thr gly arg gly val glu val gly ile val asp thr gly glu ser val gly ser ile ser phe pro glu leu tyr gly arg lys glu his gly tyr asn glu asn tyr lys asn tyr thr ala tyr met arg lys glu ala pro glu asp gly gly gly lys asp ile lys ala ser phe asp asp glu ala val ile glu thr glu ala lys pro thr asp ile arg his val lys glu ile gly his ile asp val val ser his ile ile gly gly arg ser val asp gly arg pro ala gly gly ile ala pro asp ala thr leu his ile met asn thr his asp gly thr lys asn glu ile met ser ala ala ile arg asn ala trp val lys leu gly glu arg gly val arg ile val asn asn ser phe gly thr thr ser arg ala gly thr ala asp his phe gin ile ala asn ser glu glu gin tyr arg gin ala leu leu ala tyr ser gly gly asp lys thr asp glu gly ile arg leu met gin gin ser asp tyr gly asn leu ser tyr his ile arg asn lys asn met leu phe île phe ser ala ser asn asp ala gin ala gin pro asn thr leu thr leu leu pro phe tyr glu lys asp ala gin lys gly ile ile thr val ala gly val asp arg ser gly glu lys phe asn gly ser asn his cys gly ile thr ala met trp cys leu ser ala pro tyr glu ala ser val arg phe thr arg thr asn pro ile gin ile ala gly thr ser phe ser ala pro ile val thr gly thr ala ala leu leu leu gin lys tyr pro trp met ser asn asp asn leu arg thr thr leu leu thr thr ala gin asp ile gly ala val gly val asp ser lys phe gly trp gly leu leu asp ala gly lys ala met asn gly pro ala ser phe pro phe gly asp phe thr ala asp thr lys gly thr ser asp ile ala tyr ser phe arg asn asp ile ser gly thr gly gly leu ile lys lys gly gly ser gin leu gin leu his gly asn asn thr tyr thr gly lys thr ile ile glu gly gly ser leu val leu tyr gly asn asn lys ser asp met arg val glu thr lys gly ala leu ile tyr asn gly ala ala ser gly gly ser leu asn ser asp gly ile val tyr leu ala asp thr asp arg ser gly ala asn glu thr val his ile lys gly asp leu gin leu gly gly glu gly thr leu tyr thr arg leu gly lys leu leu lys val asp gly thr ala met thr gly gly lys leu tyr met ser ala arg gly lys gly ala gly tyr leu asn arg thr gly gin arg val pro phe leu ser ala ala lys ile gly arg asp tyr ser phe phe thr asn ile glu thr asp gly gly leu leu ala ser leu asp ser val glu lys thr ala gly ser glu gly asp thr leu ser tyr tyr val arg arg gly asn ala ala arg thr ala ser ala ala ala his ser ala pro ala gly leu lys his ala val glu gin gly gly ser asn leu glu asn leu met val glu leu asp ala ser glu ser ser ala thr pro glu thr val glu thr ala ala ala asp arg thr asp met pro gly ile arg pro tyr gly ala thr phe arg ala ala ala ala val gin his ala asn ala ala asp gly val arg ile phe asn ser leu ala ala thr val tyr ala asp ser thr ala ala his ala asp met gin gly arg arg leu lys ala val ser asp gly leu asp his asn ala thr gly leu arg val ile ala gin thr gin gin asp gly gly thr trp glu gin gly gly val glu gly lys met arg gly ser thr gin thr val gly ile ala ala lys thr gly glu asn thr thr ala ala ala thr leu gly met gly his ser thr trp ser glu asn ser ala asn ala lys thr asp ser ile ser leu phe ala gly ile arg his asp ala gly asp ile gly tyr leu lys gly leu phe ser tyr gly arg tyr lys asn ser ile ser arg ser thr gly ala asp glu his ala glu gly ser val asn gly thr leu met gin leu gly ala leu gly gly val asn val pro phe ala ala thr gly asp leu thr val glu gly gly leu arg tyr asp leu leu lys gin asp ala phe ala glu lys gly ser ala leu gly trp ser gly asn ser leu thr glu gly thr leu val gly leu ala gly leu lys leu ser gin pro leu ser asp lys ala val leu phe ala thr ala gly val glu arg asp leu asn gly arg asp tyr thr val thr gly gly phe thr gly ala thr ala ala thr gly lys thr gly ala arg asn met pro his thr arg leu val ala gly leu gly ala asp val glu phe gly asn gly trp asn gly leu ala arg tyr ser tyr ala gly ser lys gin tyr gly asn his ser gly arg val gly val gly tyr arg phe Fragments du génome de N. meningitidis Z2491 décrits dans la demande de brevetW098/02547 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 70 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 70 : GATCAGACCC ATTTTCAGCG CACCGTAAGC GCGGATTTTC TCGAATTTTT CCAAAGCTGC 60 GGCATCGTTG TTGATGTCGT CTTGCAACTC TTTGCCCGTG TAGCCCAAGT CGGCGGCATT 120 CAGGAAAACG GTCGGAATGC CCGCGTTGAT GAGCGTGGCT TTCAAACGGC CTATATTCGG 180 CACATCAATT TCATCGACCA AATTGCCGGT TGGGAACATA CTGCCTTCGC CGTCGGCTGG 240 ATC 243 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 73 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : NON (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 73 : CGGTCAGAAA CAGGCAAGGT AATGAAAATG CCTGAGGCAC GGACTGTGCT GCGAACGAAA 60 ACTCCTTACC GAAGTCTTCT ATACCCAGGC TCAATAGCCG CTCAAGGAGA GAGCTATCAT 120 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 74 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 74 : CGGTCAGAAA CAGGCAAGGT AATGAAAATG CCTGAGGCAC GGACTGTGCT GCGAACGAAA 60 ACTCCTTACC GAAGTCTTCT ATACCCAGGC TCAATAGCCG CTCAAGGAGA GAGCTATCAT 120 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 77 (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : NON (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 77 : CGGAGCATAA AATCGTTATT AAAGATAATG GTATAGGAAC GAGCTTCGAT GAAATCAATG 60 ATTTTTATTT GAGAATCGGT CGGAACAGAA GGGAAGAAAA ACAAGCCTCC CCGTGCGGAA 120 GAATTCCAAC GGGTAAAAAA GGCCTTGGTA AATTGGCATT ATTCGGGCTT GGCAACAAAA 180 TTGAAATTTC TACTATCCAG GGAAACGAAA GGGTTACTTT TACTTTGGAT TATGCAGAGA 240 TTCGAAGAAG CAAGGGTATT TATCAACCG 269 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 80 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : linéaire(ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 80 : CGGGTCGCTT TATTTTGTGC AGGCATTATT TTTCATTTTT GGCTTGACAG TTTGGAAATA 60 TTGTGTATCG GGGGGGGGTA TTTGCTGACG TAAAAAACTA TAAACGCCGC GCAAAATATG 120 GCTGACTATA TTATTGACTT TGATTTTGTC CTGCGCGGTG ATGGATAAAA TCGCCAGCGA 180 TAAAGAATTT GCGAGAACCT GATGCCG 207 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 81 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : NON(iv) ANTI-SENS : NON (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 81 : CGGCAACGAT TTGAGCTATC GCGGTTACGA CATTCTGGAT TTGGCACAAA AATGCGAGTT 60 TGAAGAAGTC GCCCACCTGC TGATTCACGG CCATCTGCCC AACAAATTCG AGCTGGCCGC 120 TTATAAAACC AAGCTCAAAT CCATGCGCGG CCTGCCTATC CGTGTGATTA AAGTTTTGGA 180 AAGCCTGCCT GCACATACCC ATCCGATGGA CGTAATGCGT ACCG 224 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 87 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 87: AATTTCCACC TATGCCCTAC GCAGCGATTA TCCGTGGTTT ACCCAAAGGG TGATTATGGC 60 AAAAGCGCGG GGTTGAGCGA CCGCCTTTTG TTGCCGGCGT TCAAACGGGT TTTGATAGGA 120 AATGCAGGCA CGAAGCCTCG GCTGATTGTG ATGCACCTGA TGGGTTCGCA CAGTGATTTT 180 TGCACACGTT TGGATAAGGA TGCGCGGCGG TTTCAGTATC AAACTGAAAA AATATCCTGC 240 TATGTTTCCA TCAATCGCGC AAACCGATAA ATT 273 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 88 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 88 : AATTCTTCCG CACGGGGAGG CTTGTTTTTC TTCCCTTCTG TTCCGACCGA TTCTCAAATA 60 AAAATCATTG ATTTCATCGA AGTTCATTCC TATACCATTA TCTTTAATAA CGATTTTATG 120 CTCCGGTTTA TCGAATAACC TAACTTCCAC TTCCGTAGCA CATGCATCGT AGGCATTCGC 180 TATCAACTCG GCAATCGCAG GAACAGTGTG CGAATACAAT CTTTACACCC AAATGTTCGA 240 TTACGGTTGG CTCGAAACTC AATTTCAATT 270 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 89 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE : (génomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 89 : AATTATGAAC ACACGCATCA TCGTTTCGGC TGCGTTCGTT GCGTTGGCAT TAGCAGGTTG 60 CGGCTCAATC AATAATGTAA CCGTTTCCGA CCAGAAACTT CAGGAACGTG CCGCGTTTGC 120 CTTGGGCGTC ACCAATGCCG TAAAAATCAG CAACCGCAGC AATGAAGGCA TACGCATCAA 180 CTTTACCGCA ACTGTGGGTA AGCGCGTGAC CAATGCTATG TTACCAGTGT AATCAGCACA 240 ATCGGCGTTA CCACTTCCGA TGCAATT 267 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 94 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 94: AATTTGTTGG GCAGATGGCC GTGAATCAGC AGGTGGGCGA CTTCTTCAAA CTCGCATTTT 60 TGTGCCAAAT CCAGAATGTC GTAACCGCGA TACGTCAAAT CGTTGCCGGT ACGCAACGGT 120 ACACAAAGCG GTATTACCGG CCGCAACGCC AGAAAGCGCA ACGGATTTTT AGGTTTGAGG 180 GTCGGGGTTT GAGTAGTTTC AGTCATGGTA TTTCTCCTTT GTGTTTTTAT GGGTTTCGGG 240 TTTTCAGACG ACCGATGCGG ATTTGTTGAA AGGCAGTCTG AAAGCGGTAA ATCATTTTTG 300 AAACAATT 308 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 95 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : linéaire(ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE: NON (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 95 : AATTCGGAGG AGCAGTACCG CCAAGCGTTG CTCGCCTATT CCGGCGGTGA TAAAACAGAC 60 GAGGGTATCC GCCTGATGCA ACAGAGCGAT TACGGCAACT TGTCCTACCA CATCCGTAAT 120 AAAAACATGC TTTTCATTTT TTCGGCAAGC AATGACGCAC AAGCTCAGCC CAACACAACT 180 GACCCTATTG CCATTTTATG AAAAAGACGC TCAAAAAGGC ATTATCACAG TTGCAGGCGT 240 AGACCGCAGT GGAGAAAAGT TCAATGGCTC CAACCATTGC GGAATT 286 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 98: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : linéaire(ii) TYPE DE MOLECULE : ADN(génomique) (iii) HYPOTHETIQUE : (iv) ANTI-SENS : (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 98 AATTTGTCGG CAATCTTCCC GGGTCGCTTT ATTTTGTGCA GGCATTATTT TTCATTTTTG 60 GCTTGACAGT TTGGAGATAT TGTGTATCGG GGGGGGGTAT TTGCTGACGT AAAAAACTAT 120 AAACGCCGCA GCAAAATATG GCTGACTATA TTATTGACTT TGATTTTGTC CTGCGCGGTG 180 ATGGATAAAA TCGCCAGCGA TAAAGATTTG CGAGAACCTG ATGCCGGCCT GTTGTTGAAT 240 ATTTTCGACC TGTAATTACG ATTTGGCTTC CGCGCCGGCA CAATATGCCG CCAAGCGGCG 300 CCCACATTTT GGAAGC 316 REVENDICATIONS 1. Acide nucléique sous forme insolée, codant pour un polypeptide spécifique des souches pathogènes du genre Neisseria, ou fragment antigénique de celui-ci à l'exclusion des séquences SEQ ID n 70,73, 74,77, 80,81, 87,88, 89,94, 95 et 98, la séquence d'acides aminés dudit polypeptide spécifique étant identique ou homologue d'une séquence choisie parmi les séquences du groupe II, le groupe Il étant constitué par les séquences SEQ ID n 2 à SEQ ID n 52 (numéros pairs) et la séquence SEQ ID n 53. 2. Acide nucléique selon la revendication 1 dont la séquence nucléotidique est identique ou homologue d'une séquence choisie parmi les séquences du groupe I, le groupe 1 étant constitué par les séquences SEQ ID n 1 à SEQ ID n 51 (numéros pairs). 3 Polypeptide spécifique des souches pathogènes du genre Neisseria, et fragments antigéniques de celui-ci, la séquence d'acides aminés dudit polypeptide spécifique étant identique ou homologue d'une séquence choisie parmi les séquences du groupe II, constitué par les séquences SEQ ID n 2 à SEQ ID n 52 (numéros pairs) et la séquence SEQ ID n 53. 4. Vecteur d'expression comprenant une cassette d'expression dans laquelle une séquence nucléotidique telle que définie dans la revendication 1 ou 2 est placée dans des conditions permettant son expression dans une cellule hôte. 5 Cellule hôte transformée par le vecteur d'expression selon la revendication 4. 6. Composition pharmaceutique comprenant : a) un acide nucléique selon la revendication 1 ou 2, sous forme nue ou en association avec au moins un agent facilitant la transfection ; b) ou un vecteur vaccinal comprenant une séquence nucléotidique telle que définie dans la revendication 1 ou 2, tel que notamment un virus ou une bactérie; c) ou un polypeptide selon la revendication 3 , éventuellement en association avec un véhicule pharmaceutiquement acceptable. 7. Anticorps monospécifique dirigé contre un polypeptide selon la revendication 3. 8. Utilisation d'un acide nucléique selon la revendication 1 ou 2 ou d'un polypeptide spécifique des souches pathogènes de Neisseria ou de fragments antigéniques de celui-ci selon la revendication 3 pour la fabrication d'une composition pharmaceutique destinée à la vaccination contre Neisseria.